View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6413_low_29 (Length: 227)

Name: NF6413_low_29
Description: NF6413
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6413_low_29
NF6413_low_29
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (1-227)||(38855142-38855368)
chr8 (1-227)||(6520372-6520598)
chr8 (18-227)||(23760751-23760961)
chr8 (9-223)||(21673712-21673927)
chr8 (8-217)||(21285611-21285821)
chr8 (67-227)||(26355656-26355815)
chr8 (52-227)||(5866218-5866391)
chr8 (52-227)||(21490999-21491172)
chr8 (18-216)||(983312-983512)
chr8 (52-227)||(17140920-17141093)
chr8 (52-227)||(21249388-21249562)
chr8 (52-227)||(21255226-21255400)
chr8 (105-227)||(22626740-22626861)
chr8 (105-227)||(16092337-16092459)
chr8 (17-212)||(37116366-37116564)
chr8 (71-202)||(13508044-13508177)
chr8 (71-212)||(20498581-20498724)
chr8 (105-227)||(21918995-21919117)
chr8 (71-202)||(13597576-13597709)
chr8 (105-227)||(22875069-22875190)
chr8 (71-202)||(17612069-17612202)
chr8 (112-227)||(28649046-28649161)
chr8 (105-227)||(7372782-7372904)
chr8 (17-212)||(17266898-17267096)
chr8 (71-202)||(17439465-17439599)
chr8 (105-227)||(20536212-20536334)
chr8 (64-227)||(22001754-22001918)
chr8 (112-227)||(31971261-31971375)
chr8 (18-212)||(24353039-24353235)
chr8 (105-227)||(26219718-26219838)
chr8 (71-227)||(1484403-1484560)
chr8 (71-227)||(5853296-5853453)
chr8 (71-227)||(14409448-14409605)
chr8 (71-227)||(20046199-20046356)
chr8 (71-227)||(20403228-20403385)
chr8 (112-227)||(16199647-16199761)
chr8 (105-227)||(18818404-18818526)
chr8 (105-227)||(21923923-21924045)
chr8 (118-227)||(6759262-6759371)
chr8 (118-227)||(23406383-23406492)
chr8 (154-227)||(18879276-18879348)
chr8 (64-227)||(4483282-4483445)
chr8 (72-212)||(19801387-19801527)
chr8 (71-217)||(16413320-16413467)
chr8 (105-227)||(26225288-26225408)
chr8 (71-227)||(15203235-15203392)
chr8 (112-227)||(21395984-21396097)
chr8 (112-227)||(21790477-21790590)
chr8 (71-227)||(41598189-41598346)
chr8 (64-227)||(4542370-4542534)
chr8 (17-150)||(22364744-22364877)
chr8 (112-227)||(21389454-21389567)
chr8 (112-227)||(21778780-21778893)
chr8 (103-150)||(40492844-40492891)
chr8 (160-227)||(45131047-45131113)
chr8 (169-227)||(19896266-19896323)
chr8 (71-227)||(14823775-14823931)
chr8 (180-227)||(25484382-25484429)
chr8 (67-155)||(21383887-21383975)
chr8 (180-217)||(45290809-45290846)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (9-227)||(6539-6758)
scaffold0621 (76-216)||(8481-8623)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-227)||(19268-19495)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (1-227)||(22921759-22921986)
chr1 (67-227)||(33681011-33681172)
chr1 (68-227)||(22237631-22237791)
chr1 (77-224)||(21754052-21754198)
chr1 (70-227)||(20248283-20248438)
chr1 (67-227)||(52927938-52928087)
chr1 (54-215)||(20918620-20918779)
chr1 (67-227)||(14295510-14295671)
chr1 (67-227)||(21161720-21161878)
chr1 (1-123)||(35981578-35981700)
chr1 (1-212)||(21861459-21861672)
chr1 (1-123)||(49261448-49261570)
chr1 (18-212)||(21896162-21896358)
chr1 (71-216)||(16758664-16758812)
chr1 (109-227)||(50210212-50210330)
chr1 (105-227)||(22532273-22532395)
chr1 (1-123)||(20636957-20637079)
chr1 (118-212)||(35261086-35261180)
chr1 (71-212)||(45574846-45574989)
chr1 (1-224)||(16368176-16368401)
chr1 (71-227)||(21475091-21475248)
chr1 (112-227)||(34509784-34509899)
chr1 (17-150)||(50686694-50686828)
chr1 (71-212)||(50614075-50614219)
chr1 (71-212)||(50621903-50622047)
chr1 (71-227)||(13988867-13989024)
chr1 (71-227)||(21923295-21923452)
chr1 (54-179)||(22130853-22130976)
chr1 (105-227)||(21026684-21026806)
chr1 (105-227)||(27250724-27250846)
chr1 (17-212)||(41049941-41050138)
chr1 (109-217)||(21840778-21840885)
chr1 (71-227)||(23593739-23593896)
chr1 (71-227)||(29298138-29298294)
chr1 (71-227)||(29776689-29776846)
chr1 (71-227)||(31612314-31612471)
chr1 (71-227)||(433013-433168)
chr1 (67-163)||(51130632-51130726)
chr1 (160-227)||(20847205-20847271)
chr1 (71-212)||(16093843-16093987)
chr1 (71-227)||(22123071-22123229)
chr1 (155-227)||(38801433-38801504)
chr1 (166-217)||(20454610-20454660)
chr1 (71-210)||(26064959-26065100)
chr1 (71-217)||(16361928-16362075)
chr1 (71-227)||(13212865-13213023)
chr1 (180-227)||(21342097-21342144)
chr1 (180-227)||(21346962-21347009)
chr1 (180-227)||(21707168-21707215)
chr1 (180-227)||(21711710-21711757)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-227)||(100378-100605)
scaffold0023 (1-227)||(40064-40291)
scaffold0023 (71-227)||(94412-94569)
scaffold0023 (71-227)||(44455-44613)
scaffold0023 (154-227)||(101503-101576)
scaffold0023 (158-227)||(119879-119948)
scaffold0023 (64-217)||(17437-17591)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (1-227)||(18005650-18005877)
chr7 (1-227)||(67749-67975)
chr7 (1-227)||(811021-811248)
chr7 (1-227)||(16219607-16219834)
chr7 (1-227)||(47831811-47832038)
chr7 (9-227)||(44014182-44014398)
chr7 (1-216)||(16056343-16056558)
chr7 (1-227)||(22072917-22073146)
chr7 (52-227)||(34200790-34200963)
chr7 (52-227)||(15754831-15755004)
chr7 (1-216)||(12901338-12901555)
chr7 (67-227)||(16495406-16495564)
chr7 (52-227)||(11995971-11996144)
chr7 (52-227)||(28505242-28505415)
chr7 (105-216)||(2280114-2280225)
chr7 (108-202)||(12255789-12255885)
chr7 (105-227)||(38227485-38227606)
chr7 (109-227)||(3564363-3564481)
chr7 (64-227)||(18430713-18430877)
chr7 (45-123)||(9389631-9389709)
chr7 (105-227)||(18456408-18456529)
chr7 (71-216)||(1867954-1868101)
chr7 (105-227)||(12698835-12698958)
chr7 (71-212)||(13647344-13647487)
chr7 (71-227)||(27216861-27217018)
chr7 (105-227)||(9509193-9509315)
chr7 (64-227)||(14949119-14949283)
chr7 (71-227)||(456322-456479)
chr7 (71-227)||(11393291-11393448)
chr7 (71-227)||(11972497-11972654)
chr7 (71-227)||(15376717-15376874)
chr7 (71-227)||(16232521-16232678)
chr7 (71-227)||(18640273-18640430)
chr7 (71-227)||(20385127-20385284)
chr7 (71-227)||(21189599-21189756)
chr7 (71-227)||(24702239-24702396)
chr7 (71-227)||(32125492-32125649)
chr7 (71-227)||(41522918-41523075)
chr7 (71-227)||(41525380-41525537)
chr7 (71-227)||(17061919-17062076)
chr7 (105-215)||(26212012-26212122)
chr7 (109-227)||(48273393-48273511)
chr7 (67-216)||(14044761-14044913)
chr7 (67-216)||(14354791-14354943)
chr7 (105-202)||(10063813-10063910)
chr7 (71-202)||(19486703-19486836)
chr7 (71-227)||(16410060-16410217)
chr7 (71-227)||(24704689-24704843)
chr7 (109-217)||(24275182-24275289)
chr7 (71-227)||(44116510-44116667)
chr7 (71-202)||(15008458-15008591)
chr7 (109-227)||(15144037-15144153)
chr7 (105-227)||(16386242-16386365)
chr7 (71-212)||(20220149-20220290)
chr7 (71-227)||(3386334-3386491)
chr7 (112-215)||(10589055-10589158)
chr7 (116-227)||(16213685-16213795)
chr7 (112-227)||(40443395-40443509)
chr7 (1-65)||(16324172-16324236)
chr7 (180-227)||(13869347-13869394)
chr7 (180-227)||(20110557-20110604)
chr7 (161-227)||(27847881-27847947)
chr7 (110-146)||(16324135-16324171)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (1-227)||(25175854-25176081)
chr2 (1-226)||(28405981-28406208)
chr2 (77-227)||(22134175-22134323)
chr2 (67-227)||(7679589-7679749)
chr2 (1-201)||(7622-7824)
chr2 (1-216)||(18786792-18787009)
chr2 (52-227)||(23071893-23072066)
chr2 (71-202)||(19671859-19671991)
chr2 (71-227)||(22105413-22105571)
chr2 (105-227)||(298809-298932)
chr2 (71-216)||(23708578-23708725)
chr2 (105-227)||(23060517-23060639)
chr2 (64-227)||(23130863-23131027)
chr2 (64-227)||(23133330-23133494)
chr2 (1-212)||(23791292-23791506)
chr2 (64-227)||(34402519-34402683)
chr2 (17-212)||(23207296-23207493)
chr2 (71-227)||(18808944-18809101)
chr2 (71-227)||(23709536-23709693)
chr2 (71-227)||(23712017-23712174)
chr2 (71-227)||(32039502-32039659)
chr2 (71-227)||(39682314-39682471)
chr2 (105-227)||(22337119-22337241)
chr2 (105-227)||(23076446-23076568)
chr2 (64-227)||(23135591-23135755)
chr2 (105-227)||(23285869-23285987)
chr2 (105-227)||(23654381-23654503)
chr2 (64-227)||(26505380-26505544)
chr2 (64-227)||(26507858-26508022)
chr2 (133-227)||(38138-38231)
chr2 (105-227)||(23660027-23660148)
chr2 (71-217)||(24367785-24367932)
chr2 (71-212)||(20520152-20520295)
chr2 (71-227)||(571398-571555)
chr2 (71-227)||(6725996-6726153)
chr2 (64-227)||(24898192-24898357)
chr2 (64-227)||(24900675-24900840)
chr2 (64-227)||(24903152-24903317)
chr2 (64-227)||(24905629-24905794)
chr2 (64-227)||(24908104-24908269)
chr2 (71-227)||(28577100-28577257)
chr2 (105-227)||(22731229-22731351)
chr2 (71-217)||(21155064-21155211)
chr2 (112-227)||(20309112-20309225)
chr2 (167-227)||(23040247-23040306)
chr2 (71-150)||(24697565-24697645)
chr2 (109-227)||(23103396-23103512)
chr2 (71-217)||(32214925-32215072)
chr2 (154-227)||(8946661-8946733)
chr2 (71-212)||(22413095-22413240)
chr2 (71-227)||(45029858-45030015)
chr2 (67-202)||(23004777-23004915)
chr2 (17-212)||(25108906-25109104)
chr2 (71-226)||(43137301-43137457)
chr2 (169-217)||(24643054-24643101)
chr2 (180-227)||(22738249-22738296)
chr2 (180-227)||(38967375-38967422)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-227)||(2535-2762)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (8-220)||(5654-5867)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-227)||(39706179-39706405)
chr4 (1-216)||(12288099-12288316)
chr4 (77-227)||(12774011-12774160)
chr4 (53-227)||(15551821-15551993)
chr4 (67-227)||(8846360-8846537)
chr4 (108-216)||(52243192-52243302)
chr4 (71-212)||(13810-13953)
chr4 (1-123)||(15099457-15099579)
chr4 (1-123)||(15190424-15190546)
chr4 (71-216)||(43198512-43198661)
chr4 (52-193)||(16596686-16596825)
chr4 (109-219)||(16377522-16377630)
chr4 (64-227)||(44615289-44615453)
chr4 (17-212)||(46640361-46640558)
chr4 (105-227)||(16239965-16240086)
chr4 (112-227)||(7088881-7088996)
chr4 (105-227)||(7798778-7798900)
chr4 (105-227)||(22636439-22636561)
chr4 (17-212)||(53082057-53082254)
chr4 (105-227)||(6899895-6900016)
chr4 (105-227)||(8574864-8574984)
chr4 (105-227)||(16270231-16270352)
chr4 (106-227)||(52873363-52873484)
chr4 (71-227)||(12311-12468)
chr4 (71-227)||(15118356-15118513)
chr4 (71-227)||(18215278-18215435)
chr4 (105-224)||(23374354-23374473)
chr4 (71-227)||(44773091-44773248)
chr4 (71-227)||(52312511-52312668)
chr4 (105-227)||(12902761-12902883)
chr4 (105-227)||(14280317-14280438)
chr4 (64-227)||(50222336-50222500)
chr4 (105-227)||(54798749-54798871)
chr4 (71-217)||(19618176-19618323)
chr4 (71-227)||(44928883-44929041)
chr4 (71-227)||(51463872-51464029)
chr4 (105-227)||(7893707-7893829)
chr4 (64-227)||(18239416-18239580)
chr4 (105-227)||(44052833-44052955)
chr4 (109-226)||(14038653-14038770)
chr4 (154-227)||(3096297-3096369)
chr4 (71-227)||(1837513-1837670)
chr4 (71-227)||(19242700-19242857)
chr4 (109-217)||(14970751-14970858)
chr4 (166-227)||(17046491-17046552)
chr4 (71-227)||(3515008-3515165)
chr4 (116-227)||(23803316-23803426)
chr4 (71-217)||(15355328-15355476)
chr4 (169-227)||(7641286-7641343)
chr4 (169-227)||(12610951-12611008)
chr4 (114-227)||(14053306-14053418)
chr4 (108-149)||(15464929-15464970)
chr4 (71-227)||(44102215-44102372)
chr4 (160-202)||(17333306-17333347)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-227)||(6013-6240)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (1-227)||(15470928-15471154)
chr3 (67-227)||(16103784-16103944)
chr3 (1-227)||(14234491-14234720)
chr3 (67-227)||(16097332-16097493)
chr3 (67-227)||(12174218-12174376)
chr3 (77-224)||(32307684-32307830)
chr3 (78-227)||(49668044-49668193)
chr3 (80-227)||(9512924-9513067)
chr3 (80-227)||(9520899-9521042)
chr3 (53-227)||(13210272-13210444)
chr3 (77-224)||(1644642-1644787)
chr3 (105-227)||(27165251-27165373)
chr3 (71-212)||(52523686-52523831)
chr3 (105-227)||(12399213-12399335)
chr3 (105-227)||(53301545-53301668)
chr3 (71-202)||(24340682-24340815)
chr3 (105-202)||(23274716-23274813)
chr3 (47-123)||(1465347-1465423)
chr3 (112-227)||(18438538-18438653)
chr3 (1-201)||(37251057-37251259)
chr3 (105-224)||(14572596-14572714)
chr3 (105-227)||(14972858-14972980)
chr3 (105-227)||(17487860-17487982)
chr3 (105-227)||(17499342-17499464)
chr3 (105-227)||(36166599-36166719)
chr3 (105-213)||(42386428-42386536)
chr3 (71-212)||(43925977-43926121)
chr3 (105-217)||(21618460-21618570)
chr3 (105-227)||(13442278-13442400)
chr3 (64-227)||(34159327-34159491)
chr3 (64-227)||(55476492-55476656)
chr3 (133-227)||(11424783-11424876)
chr3 (105-227)||(14576828-14576949)
chr3 (105-227)||(24153204-24153325)
chr3 (71-202)||(37642224-37642357)
chr3 (71-227)||(7781351-7781508)
chr3 (71-227)||(17463179-17463336)
chr3 (71-227)||(17672627-17672784)
chr3 (112-227)||(20698437-20698552)
chr3 (71-227)||(29172587-29172744)
chr3 (71-227)||(45606911-45607068)
chr3 (71-226)||(16282815-16282971)
chr3 (64-227)||(16454278-16454442)
chr3 (105-227)||(23083356-23083478)
chr3 (64-227)||(28848608-28848772)
chr3 (71-217)||(38961895-38962042)
chr3 (162-227)||(28194694-28194759)
chr3 (71-212)||(43550482-43550625)
chr3 (109-202)||(606324-606418)
chr3 (71-227)||(8899095-8899252)
chr3 (71-227)||(9707611-9707768)
chr3 (64-227)||(13151787-13151952)
chr3 (64-227)||(13154252-13154417)
chr3 (71-227)||(17446659-17446815)
chr3 (109-227)||(6469178-6469295)
chr3 (109-227)||(25476384-25476502)
chr3 (105-227)||(26686891-26687013)
chr3 (109-227)||(40213720-40213837)
chr3 (105-219)||(43840944-43841058)
chr3 (71-217)||(12567571-12567718)
chr3 (71-217)||(13544036-13544183)
chr3 (109-212)||(22110349-22110454)
chr3 (114-227)||(55500943-55501055)
chr3 (71-212)||(53070657-53070799)
chr3 (71-227)||(10247727-10247884)
chr3 (71-201)||(22147484-22147616)
chr3 (67-122)||(49389586-49389642)
chr3 (71-169)||(2051158-2051260)
chr3 (109-227)||(15977516-15977633)
chr3 (71-217)||(50242833-50242980)
chr3 (169-227)||(17737237-17737294)
chr3 (71-226)||(41123892-41124045)
chr3 (180-227)||(8499519-8499566)
chr3 (180-227)||(10556986-10557033)
chr3 (180-227)||(15412430-15412477)
chr3 (180-227)||(45577952-45577999)
chr3 (120-227)||(12119780-12119886)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-216)||(10542-10758)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-227)||(21329387-21329614)
chr5 (67-227)||(21565546-21565707)
chr5 (1-227)||(21502045-21502273)
chr5 (67-227)||(22959491-22959649)
chr5 (1-216)||(26011925-26012141)
chr5 (67-227)||(19668902-19669060)
chr5 (1-212)||(20026830-20027043)
chr5 (52-227)||(19660779-19660952)
chr5 (105-227)||(21729059-21729181)
chr5 (105-227)||(21808384-21808506)
chr5 (71-212)||(22144068-22144211)
chr5 (105-227)||(23390491-23390613)
chr5 (130-227)||(36314581-36314678)
chr5 (67-123)||(21741489-21741545)
chr5 (17-212)||(22178125-22178323)
chr5 (105-227)||(24493573-24493694)
chr5 (106-227)||(8286838-8286960)
chr5 (64-227)||(39363385-39363549)
chr5 (105-227)||(13025315-13025436)
chr5 (105-227)||(13095499-13095620)
chr5 (105-227)||(22412188-22412309)
chr5 (71-227)||(264772-264929)
chr5 (105-224)||(1096474-1096593)
chr5 (71-227)||(10732944-10733101)
chr5 (71-227)||(11581203-11581360)
chr5 (112-227)||(24529224-24529339)
chr5 (71-227)||(29329935-29330092)
chr5 (109-227)||(9077956-9078074)
chr5 (64-227)||(20909013-20909177)
chr5 (125-227)||(21997549-21997651)
chr5 (105-215)||(22075035-22075145)
chr5 (105-227)||(25421536-25421658)
chr5 (64-227)||(42245362-42245526)
chr5 (77-179)||(29448054-29448159)
chr5 (71-202)||(40725882-40726015)
chr5 (71-216)||(20902012-20902159)
chr5 (71-227)||(2154617-2154775)
chr5 (71-227)||(29345981-29346138)
chr5 (107-211)||(25431414-25431518)
chr5 (74-227)||(39245137-39245291)
chr5 (71-227)||(36154787-36154941)
chr5 (169-227)||(20918052-20918109)
chr5 (105-165)||(20766115-20766175)
chr5 (71-227)||(32027394-32027551)
chr5 (180-227)||(10775790-10775837)
chr5 (71-217)||(18319037-18319185)
chr5 (160-227)||(21293020-21293086)
chr5 (180-227)||(23064512-23064559)
chr5 (161-212)||(26740697-26740747)
chr5 (159-202)||(37723932-37723975)
chr5 (180-227)||(38619435-38619482)
chr5 (171-227)||(31061069-31061124)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-227)||(12943-13170)
scaffold0138 (17-150)||(18143-18277)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-227)||(14587-14814)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (67-227)||(22626-22787)
scaffold0037 (71-227)||(82073-82230)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (8-227)||(12770-12990)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (69-227)||(133-292)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-227)||(925-1151)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-227)||(6615-6842)
scaffold0333 (1-227)||(13995-14222)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (67-227)||(10497-10658)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (67-227)||(129909-130070)
scaffold0010 (108-202)||(60713-60808)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (67-227)||(19652199-19652358)
chr6 (1-212)||(23019425-23019637)
chr6 (1-216)||(19668386-19668603)
chr6 (52-227)||(28496415-28496588)
chr6 (52-227)||(29808826-29808999)
chr6 (52-227)||(1561307-1561480)
chr6 (67-216)||(9098469-9098620)
chr6 (130-227)||(27333238-27333335)
chr6 (130-227)||(27393978-27394075)
chr6 (116-227)||(4185827-4185938)
chr6 (116-222)||(4186376-4186482)
chr6 (76-216)||(20109153-20109295)
chr6 (9-172)||(22080637-22080800)
chr6 (105-227)||(16496248-16496370)
chr6 (109-227)||(29060544-29060662)
chr6 (67-227)||(31155355-31155514)
chr6 (118-227)||(20076704-20076812)
chr6 (108-216)||(25644335-25644444)
chr6 (71-227)||(1595550-1595707)
chr6 (64-227)||(2291177-2291341)
chr6 (64-227)||(18334589-18334753)
chr6 (109-227)||(18409826-18409944)
chr6 (71-227)||(22782228-22782385)
chr6 (109-227)||(19303540-19303657)
chr6 (116-176)||(4668217-4668277)
chr6 (116-176)||(4675064-4675124)
chr6 (71-227)||(12742318-12742475)
chr6 (71-227)||(19005047-19005204)
chr6 (71-227)||(19858923-19859080)
chr6 (112-227)||(20638285-20638400)
chr6 (71-227)||(24422548-24422705)
chr6 (71-227)||(33861795-33861952)
chr6 (71-227)||(33864279-33864436)
chr6 (71-224)||(8227470-8227625)
chr6 (109-227)||(25629354-25629472)
chr6 (64-227)||(26924637-26924801)
chr6 (71-227)||(20556898-20557053)
chr6 (71-217)||(30676714-30676861)
chr6 (71-227)||(8055030-8055187)
chr6 (105-227)||(17287791-17287913)
chr6 (105-219)||(20360955-20361069)
chr6 (71-227)||(25754810-25754967)
chr6 (109-227)||(20593777-20593895)
chr6 (125-227)||(25656630-25656731)
chr6 (71-217)||(34963384-34963531)
chr6 (74-227)||(1540918-1541072)
chr6 (109-217)||(25688513-25688620)
chr6 (112-227)||(16920634-16920747)
chr6 (112-227)||(35245590-35245703)
chr6 (169-227)||(25714421-25714478)
chr6 (71-227)||(3852021-3852178)
chr6 (166-202)||(22831532-22831568)
chr6 (71-217)||(16448530-16448678)
chr6 (180-227)||(22780297-22780344)
chr6 (168-221)||(11185515-11185568)
chr6 (71-150)||(18696569-18696648)
chr6 (71-150)||(18706387-18706466)
chr6 (133-202)||(33443076-33443146)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-227)||(62202-62426)
scaffold0028 (80-227)||(132662-132809)
scaffold0028 (64-227)||(136681-136845)
scaffold0028 (64-227)||(139150-139314)
scaffold0028 (64-227)||(144088-144252)
scaffold0028 (64-227)||(134212-134376)
scaffold0028 (64-227)||(141619-141783)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-216)||(32551-32766)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (67-227)||(45748-45909)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (67-227)||(160688-160848)
scaffold0001 (71-217)||(501095-501242)
scaffold0001 (71-227)||(85583-85741)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (80-227)||(2776-2923)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-173)||(2108-2281)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (67-221)||(6822-6974)
scaffold0556 (1-149)||(8097-8246)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-217)||(1096-1313)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (52-227)||(11296-11469)
scaffold0046 (52-227)||(2001-2174)
scaffold0046 (112-227)||(28418-28533)
scaffold0046 (175-227)||(4556-4608)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (124-227)||(23897-24000)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (52-227)||(15665-15838)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (21-216)||(7983-8180)
scaffold0218 (67-184)||(29239-29354)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (67-227)||(1028-1186)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (105-227)||(38697-38819)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (80-227)||(32102-32249)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-212)||(136257-136471)
scaffold0021 (1-212)||(144965-145179)
scaffold0021 (109-212)||(174785-174886)
scaffold0021 (161-227)||(121770-121835)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (105-227)||(3146-3267)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (125-227)||(15792-15894)
scaffold0020 (1-45)||(15722-15766)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (71-201)||(53508-53640)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (105-212)||(1051-1158)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (109-227)||(3185-3303)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (17-212)||(6188-6386)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (52-227)||(34127-34300)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (105-219)||(39489-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (105-219)||(75210-75323)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (105-227)||(39862-39983)
scaffold0026 (105-219)||(25908-26021)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (17-202)||(38345-38533)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (71-216)||(25121-25268)
scaffold0123 (71-150)||(619-698)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (71-212)||(12587-12729)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (17-212)||(128875-129072)
scaffold0022 (105-227)||(116431-116551)
scaffold0022 (17-202)||(78351-78537)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (105-227)||(1855-1977)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (105-227)||(32952-33073)
scaffold0120 (105-227)||(45932-46053)
scaffold0120 (109-227)||(16117-16235)
scaffold0120 (169-227)||(17389-17446)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (71-202)||(11493-11626)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (71-202)||(38215-38348)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (112-227)||(4853-4968)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (112-212)||(13147-13247)
scaffold0357 (108-216)||(16098-16206)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (108-216)||(27747-27855)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-216)||(103528-103737)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (109-227)||(17214-17334)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (71-202)||(17986-18119)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (105-227)||(39917-40038)
scaffold0080 (110-212)||(19883-19987)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (71-212)||(97024-97168)
scaffold0006 (71-212)||(106302-106446)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (109-224)||(26064-26179)
scaffold0122 (105-227)||(44702-44824)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (105-227)||(13215-13337)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (71-200)||(8018-8151)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (105-227)||(32946-33067)
scaffold0145 (105-227)||(38765-38886)
scaffold0145 (71-227)||(9750-9908)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (147-227)||(28806-28887)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (116-176)||(9133-9193)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (71-227)||(20748-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (71-227)||(37822-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (71-227)||(158454-158611)
scaffold0003 (109-227)||(339949-340064)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (64-227)||(13393-13557)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (105-227)||(3474-3596)
scaffold0292 (105-227)||(347-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (105-227)||(51917-52039)
scaffold0011 (105-227)||(167973-168095)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (109-217)||(10784-10891)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (105-227)||(8528-8646)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (71-227)||(4695-4852)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (112-227)||(10427-10540)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (71-227)||(13948-14105)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (52-173)||(2386-2505)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (71-227)||(16785-16942)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (112-227)||(1293-1406)
scaffold0106 (112-227)||(7270-7383)
scaffold0106 (166-227)||(15295-15355)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (71-212)||(20383-20524)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (105-227)||(1043-1165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (105-227)||(1956-2078)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (105-227)||(22887-23008)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (112-227)||(15466-15580)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (112-227)||(32071-32184)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (64-227)||(40401-40565)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (105-213)||(24297-24406)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (17-150)||(87-221)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (105-227)||(6116-6241)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (166-227)||(4890-4950)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (109-217)||(9253-9360)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (112-212)||(51601-51699)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (112-215)||(13513-13615)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (105-219)||(4520-4633)
scaffold0228 (105-219)||(12102-12215)
scaffold0228 (105-219)||(22054-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (109-227)||(16599-16717)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (113-212)||(569-669)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (114-227)||(16286-16397)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (154-227)||(4716-4788)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (71-212)||(267679-267822)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (71-227)||(107-264)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (112-227)||(5132-5245)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (112-227)||(8483-8598)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (71-173)||(225465-225568)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (71-214)||(29946-30090)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (112-213)||(20928-21030)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (71-217)||(11299-11446)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (109-217)||(4308-4415)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (109-150)||(1795-1836)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (71-215)||(161093-161239)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (112-227)||(1053-1166)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (124-212)||(2694-2784)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (77-119)||(2261-2303)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (71-217)||(12253-12400)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (105-202)||(4553-4650)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (161-227)||(46999-47065)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (114-225)||(11447-11558)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (105-149)||(27912-27956)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 38855142 - 38855368
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855142 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattat 38855241  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38855242 gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 38855341  T
Q  201 agctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  38855342 agtcggtctaagttgattaagatgatg 38855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6520598 - 6520372
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6520598 taagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 6520499  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatg 200  Q
    |||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6520498 gttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 6520399  T
Q  201 agctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6520398 agtcggtctaagttgattaagatgatg 6520372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 23760751 - 23760961
Alignment:
Q  18 tgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760751 tgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 23760850  T
Q  117 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23760851 ttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T
Q  217 tgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||    
T  23760951 agatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21673927 - 21673712
Alignment:
Q  9 ttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 107  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  21673927 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaattatattgata 21673828  T
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||  |||    
T  21673827 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  208 ctaagttgatgatgat 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatgatgat 21673712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21285821 - 21285611
Alignment:
Q  8 tttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 106  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  21285821 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgat 21285722  T
Q  107 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctgg 206  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||    
T  21285721 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcgg 21285622  T
Q  207 tctaagttgat 217  Q
    |||||||||||    
T  21285621 tctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 26355656 - 26355815
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26355656 tgttatataattgtatatacattaaatggaatatgttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcc 26355754  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26355755 tatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 5866218 - 5866391
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  5866218 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 5866314  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  5866315 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5866391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21491172 - 21490999
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  21491172 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatga 21491076  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  21491075 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21490999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 983312 - 983512
Alignment:
Q  18 tgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatg 116  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||| || || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||    
T  983312 tgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatg 983410  T
Q  117 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagtt 214  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  983411 ttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 983510  T
Q  215 ga 216  Q
    ||    
T  983511 ga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17141093 - 17140920
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  17141093 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatga 17140997  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  17140996 tggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 17140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21249562 - 21249388
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  21249562 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 21249466  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  21249465 tgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21249388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21255400 - 21255226
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  21255400 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 21255304  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  21255303 tgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21255226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22626861 - 22626740
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  22626861 atatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 22626763  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  22626762 ggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092459
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatg 16092459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37116564 - 37116366
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| ||  | | |||||| |  || ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  37116564 ctgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 37116465  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37116464 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 13508044 - 13508177
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||    
T  13508044 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatattgccta 13508143  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13508144 tgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 13508177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20498724 - 20498581
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||    
T  20498724 atataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgccta 20498625  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  20498624 tgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919117
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatg 21919117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 13597576 - 13597709
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  13597576 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcattctgctta 13597675  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13597676 tgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 13597709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875069
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||||      
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtc 22875092  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  22875091 ggtctaaattgatgaagatgatg 22875069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 17612069 - 17612202
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17612069 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 17612168  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    ||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  17612169 tgttgttgattgttaattaactaagctgcatgag 17612202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649161
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28649144  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28649145 agttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372782
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 17266898 - 17267096
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||||||||    
T  17266898 ctgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagat 17266997  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   | |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17266998 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 17439465 - 17439599
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  17439465 atatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcct 17439564  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17439565 atgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 17439599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536212
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22001918 - 22001754
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  22001918 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 22001819  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22001818 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971261
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| ||| |||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatg 31971261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24353235 - 24353039
Alignment:
Q  18 tgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatg 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || | | |||||| ||||||| ||||| ||||||| | |  ||| |||||||||    
T  24353235 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatg 24353136  T
Q  117 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24353135 ttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219718
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1484560 - 1484403
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1484560 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1484462  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  1484461 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 5853296 - 5853453
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  5853296 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 5853394  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  5853395 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 14409448 - 14409605
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  14409448 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 14409546  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14409547 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 20046199 - 20046356
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20046199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 20046297  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20046298 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20403385 - 20403228
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20403385 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20403287  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20403286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199761
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||| | ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatg 16199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818526
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924045
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759262
Alignment:
Q  118 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  217 tgatgatgatg 227  Q
    ||| |||||||    
T  6759272 tgaagatgatg 6759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406383
Alignment:
Q  118 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  217 tgatgatgatg 227  Q
    ||| |||||||    
T  23406393 tgaagatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879348
Alignment:
Q  154 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4483445 - 4483282
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  4483445 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 4483346  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  4483345 actgt-tgtgttgctgttg-ttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801527
Alignment:
Q  72 tataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 169  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | |    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgt 19801485  T
Q  170 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19801486 gttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 16413320 - 16413467
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  16413320 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 16413418  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16413419 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225408
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatg 26225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 15203235 - 15203392
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15203235 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15203333  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  15203334 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396097
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  21396082 gatgttgaagatgatg 21396097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790590
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  21790575 gatgttgaagatgatg 21790590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41598346 - 41598189
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  41598346 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 41598248  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  41598247 gtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41598189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 4542370 - 4542534
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  4542370 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 4542469  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
      ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  4542470 cttgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22364877 - 22364744
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  ||  || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  22364877 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 22364778  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  22364777 gttgttgattttcttt-gatattgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389567
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  21389552 gatgttgaagatgatg 21389567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778893
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  21778878 gatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 150
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492891
Alignment:
Q  103 tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131113
Alignment:
Q  160 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 45131113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896266
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19896323 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14823931 - 14823775
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  14823931 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14823833  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  14823832 gtgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgag-tggtctaaattgattaagatgatg 14823775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Original strand, 25484382 - 25484429
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||    
T  25484382 gttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatg 25484429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21383975 - 21383887
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt 155  Q
    ||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21383975 tgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 45290809 - 45290846
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45290809 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6758 - 6539
Alignment:
Q  9 ttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6758 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 6659  T
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  6658 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6558 ctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8481
Alignment:
Q  76 attgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 173  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8623 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttg 8524  T
Q  174 ctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8523 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19495 - 19268
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495 taagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 19396  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19395 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 19296  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  19295 gagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22921759 - 22921986
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22921759 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattt 22921858  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22921859 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 22921958  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  22921959 gagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33681172 - 33681011
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33681172 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 33681073  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  33681072 ctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22237791 - 22237631
Alignment:
Q  68 gttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22237791 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcc 22237692  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22237691 tatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754052
Alignment:
Q  77 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21754198 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 21754100  T
Q  177 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21754099 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20248438 - 20248283
Alignment:
Q  70 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20248438 tatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 20248342  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20248341 tgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 52927938 - 52928087
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927938 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 52928025  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||    
T  52928026 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatggtgatg 52928087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20918779 - 20918620
Alignment:
Q  54 atgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 152  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20918779 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg 20918683  T
Q  153 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg 215  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20918682 gtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 14295510 - 14295671
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  14295510 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactac 14295606  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa---gttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||||||||||    
T  14295607 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatg 14295671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21161878 - 21161720
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21161878 tgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgt 21161781  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  21161780 -tttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 35981578 - 35981700
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  || |||||| | || ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35981578 taagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattat 35981677  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35981678 gttgatatttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21861459 - 21861672
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||  |||  | | |||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21861459 taagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattat 21861558  T
Q  101 gt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 198  Q
     | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  21861559 atatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgca 21861658  T
Q  199 tgagctggtctaag 212  Q
    ||||  ||||||||    
T  21861659 tgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 49261570 - 49261448
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |  ||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49261570 taagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatataaattat 49261471  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  49261470 gttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 21896162 - 21896358
Alignment:
Q  18 tgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagat 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||  | | |||||| |  || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||    
T  21896162 tgttgttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagat 21896261  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21896262 gttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16758812 - 16758664
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  16758812 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcct 16758713  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16758712 atgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210330
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22532395 - 22532273
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  22532395 atatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20637079 - 20636957
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| | |||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637079 taagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattat 20636980  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    |||  |||||| |||||||||||    
T  20636979 gtttgtatttgggatgttgttga 20636957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  118 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574989
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 45574945  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45574946 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16368176 - 16368401
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16368176 taagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 16368275  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
        ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  16368276 aaacgatgtt-gagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgc 16368373  T
Q  198 atgagctggtctaagttg-atgatgatg 224  Q
    |||||  |||||||| || |||||||||    
T  16368374 atgagtcggtctaagatgaatgatgatg 16368401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 21475091 - 21475248
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21475091 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21475189  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21475190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509784
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50686828 - 50686694
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||  |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  50686828 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 50686729  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  50686728 gttgttgatttgcatttgacattgttatatcatga 50686694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 50614075 - 50614219
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  50614075 atataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcct 50614174  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50614175 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 50621903 - 50622047
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  50621903 atataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcct 50622002  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50622003 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13989024 - 13988867
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13989024 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13988926  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13988925 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 21923295 - 21923452
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21923295 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21923393  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21923394 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 22130853 - 22130976
Alignment:
Q  54 atgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 152  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22130853 atgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg 22130949  T
Q  153 atttgcatactgtctatgttgctgttg 179  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22130950 gtttggatactgcctatgttgctgttg 22130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026684
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250846
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatg 27250846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 41049941 - 41050138
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | | |||| |  || ||| ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| || |||||    
T  41049941 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtt-gagat 41050039  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  41050040 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840778
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  208 ctaagttgat 217  Q
    ||||||||||    
T  21840787 ctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 23593739 - 23593896
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23593739 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23593837  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23593838 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29298294 - 29298138
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29298294 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-t 29298197  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29298196 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29776846 - 29776689
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  29776846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-t 29776748  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29776747 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31612471 - 31612314
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  31612471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 31612373  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  31612372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31612314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 433168 - 433013
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||  |||| |||||| ||    
T  433168 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcct 433069  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  433068 gtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 433013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51130726 - 51130632
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51130726 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatact 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847271
Alignment:
Q  160 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 16093843 - 16093987
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtc 166  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |    
T  16093843 atatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttctatactgcc 16093941  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  16093942 tatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 22123071 - 22123229
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  22123071 atataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-t 22123169  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||    
T  22123170 gtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatg 22123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801504
Alignment:
Q  155 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagatgttgaagatgatg 38801504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 20454610 - 20454660
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20454610 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26065100 - 26064959
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||   ||||| ||    
T  26065100 atatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcatgaattattttatgtactgcct 26065002  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  26065001 atgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16362075 - 16361928
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |    
T  16362075 atataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-t 16361977  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16361976 gtgttgctgtcg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 13212865 - 13213023
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  13212865 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 13212963  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13212964 tgcgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21342144 - 21342097
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21342144 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21347009 - 21346962
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21347009 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21707215 - 21707168
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21707215 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21711757 - 21711710
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21711757 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 100605 - 100378
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100605 taagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatta 100506  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  100505 tgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 100406  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  100405 gagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 40064 - 40291
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40064 taagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 40163  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40164 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcat 40263  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||    
T  40264 gagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 94569 - 94412
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  94569 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 94471  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  94470 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44613 - 44455
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtc 166  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | |||||||     
T  44613 atataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt- 44515  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44514 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  154 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119879
Alignment:
Q  158 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 119879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 17437 - 17591
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  17437 tactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 17536  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    |||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17537 actg-ctgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18005877 - 18005650
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005877 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 18005778  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18005777 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 18005678  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  18005677 gagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 67975 - 67749
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67975 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatta 67876  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  67875 tgttgatatt-gagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 67777  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  67776 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 67749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 811021 - 811248
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  811021 taagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 811120  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  811121 gtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcat 811220  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  811221 gagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16219607 - 16219834
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16219607 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 16219706  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  16219707 gtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacat 16219806  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16219807 gagtcggtctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47832038 - 47831811
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47832038 taagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattat 47831939  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47831938 gtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 47831839  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  47831838 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 47831811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44014398 - 44014182
Alignment:
Q  9 ttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| |  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014398 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgttgata 44014299  T
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  44014298 tttgagatgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 44014202  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44014201 ctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16056558 - 16056343
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16056558 taagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 16056459  T
Q  101 g-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16056458 gtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcat 16056360  T
Q  200 gagctggtctaagttga 216  Q
     ||  ||||||||||||    
T  16056359 cagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22073146 - 22072917
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatga-atta 99  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||    
T  22073146 taagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagttta 22073047  T
Q  100 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22073046 tgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 22072947  T
Q  198 atgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||| |   |||||||||||| | |||||||    
T  22072946 atgggtcagtctaagttgattaagatgatg 22072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34200963 - 34200790
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  34200963 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 34200867  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  34200866 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 15754831 - 15755004
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15754831 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatga 15754927  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  15754928 tggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 15755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12901555 - 12901338
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12901555 taagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattat 12901456  T
Q  101 gt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  12901455 gtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgc 12901357  T
Q  198 atgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||  ||| ||||||||    
T  12901356 atgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16495564 - 16495406
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  16495564 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 16495468  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  16495467 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 11995971 - 11996144
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||   ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11995971 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatga 11996067  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  11996068 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11996144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 28505242 - 28505415
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  || ||||||| |||||||||||    
T  28505242 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatga 28505338  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  28505339 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Original strand, 2280114 - 2280225
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||      
T  2280114 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 2280213  T
Q  205 ggtctaagttga 216  Q
    ||||||||||||    
T  2280214 ggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Original strand, 12255789 - 12255885
Alignment:
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12255789 tttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 12255885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227485
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtc 38227508  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  38227507 ggtctaagtagatgaagatgatg 38227485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564481
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18430877 - 18430713
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-at 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||    
T  18430877 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatat 18430778  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18430777 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 123
Target Start/End: Original strand, 9389631 - 9389709
Alignment:
Q  45 tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9389631 tatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatgttgatatatgagatgttgttga 9389709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456529
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||      
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtc 18456506  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  18456507 ggtctaagttgattaagatgatg 18456529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 1867954 - 1868101
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||    
T  1867954 atatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttatatactgcct 1868052  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1868053 atgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698835
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  203 ctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
      ||||||||||||||| |||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13647487 - 13647344
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  13647487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 13647388  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13647387 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27217018 - 27216861
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  27217018 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 27216920  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  27216919 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509193
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 14949119 - 14949283
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  14949119 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 14949218  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14949219 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 456479 - 456322
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  456479 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 456381  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  456380 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 11393291 - 11393448
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11393291 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11393389  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  11393390 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11972654 - 11972497
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11972654 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11972556  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  11972555 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 15376717 - 15376874
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15376717 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15376815  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15376816 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16232678 - 16232521
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16232678 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16232580  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16232579 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18640430 - 18640273
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18640430 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18640332  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18640331 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 20385127 - 20385284
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20385127 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20385225  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20385226 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 21189599 - 21189756
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21189599 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21189697  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21189698 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24702396 - 24702239
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24702396 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 24702298  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24702297 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32125649 - 32125492
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32125649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32125551  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  32125550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41523075 - 41522918
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41523075 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41522977  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  41522976 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41525537 - 41525380
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41525537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41525439  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  41525438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062076
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||| ||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactg-ctg 17062017  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17062018 agttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26212012
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  204 tggtctaagttg 215  Q
     |||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273393
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatg 48273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14044913 - 14044761
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatac 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||  || |||   |||    
T  14044913 tgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcaggagctgttttatgtac 14044815  T
Q  163 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    || |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14044814 tgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14354943 - 14354791
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatac 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||  || |||   |||    
T  14354943 tgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcaggagctgttttatgtac 14354845  T
Q  163 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    || |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14354844 tgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063910
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgag 10063910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 19486703 - 19486836
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19486703 atataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 19486802  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  19486803 tgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 19486836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16410217 - 16410060
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16410217 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16410119  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16410118 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24704843 - 24704689
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |  |||| ||||||| |     
T  24704843 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactgt-tg 24704747  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24704746 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275182
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  208 ctaagttgat 217  Q
    ||||||||||    
T  24275191 ctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44116667 - 44116510
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  44116667 atataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 44116569  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44116568 gtgttgctgttg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44116510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 15008458 - 15008591
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  ||    
T  15008458 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatactacct 15008556  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  15008557 atgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 15008591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144153
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15144135 ctaagttga-gatgatgatg 15144153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386365
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| |||| | || | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||     
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatg 16386365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 20220149 - 20220290
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  20220149 atataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcct 20220245  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20220246 atgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3386491 - 3386334
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3386491 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3386393  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  3386392 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3386334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589055
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T
Q  211 agttg 215  Q
    |||||    
T  10589059 agttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213685
Alignment:
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagtt 214  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  215 gatgatgatgatg 227  Q
    ||| | |||||||    
T  16213697 gattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443395
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatg 40443395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16324236 - 16324172
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgcta 65  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  16324236 taagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 16324172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13869394 - 13869347
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13869394 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20110604 - 20110557
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20110604 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20110557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847947
Alignment:
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  110 tgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 146  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25176081 - 25175854
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25176081 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaatta 25175982  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25175981 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 25175882  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||    
T  25175881 gaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28406208 - 28405981
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | | | ||| |||  |||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28406208 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta 28406109  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 198  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28406108 agttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgca 28406009  T
Q  199 tgagctggtctaagttgatgatgatgat 226  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28406008 tgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Original strand, 22134175 - 22134323
Alignment:
Q  77 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22134175 ttgtatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 22134273  T
Q  177 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || | |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  22134274 tt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7679749 - 7679589
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7679749 tgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 7679651  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||    
T  7679650 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7622 - 7824
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7622 taagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattat 7721  T
Q  101 gt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 198  Q
     | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  7722 atatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 7821  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  7822 tga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 18786792 - 18787009
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||  |  ||||||  || || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18786792 taagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattat 18786891  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
    ||| ||| || | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18786892 gtttgatgtt-gtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgc 18786990  T
Q  198 atgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  18786991 atgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 23071893 - 23072066
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  23071893 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcatga 23071989  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||    
T  23071990 tggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatg 23072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19671991 - 19671859
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19671991 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctat 19671892  T
Q  170 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19671891 gttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 19671859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22105571 - 22105413
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  22105571 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 22105472  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22105471 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298932
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 23708578 - 23708725
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgttg--atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| ||   || |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  23708578 atataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgccta 23708677  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23708678 tgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060517
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23131027 - 23130863
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  23131027 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 23130928  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23130927 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23133494 - 23133330
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  23133494 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 23133395  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23133394 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23133330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23791506 - 23791292
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  23791506 taagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 23791407  T
Q  101 gt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
     | | || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| | |  ||||||||||| |    
T  23791406 atataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctac 23791307  T
Q  198 atgagctggtctaag 212  Q
    |||||  ||||||||    
T  23791306 atgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 34402519 - 34402683
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  34402519 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 34402618  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  34402619 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34402683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23207493 - 23207296
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 116  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |   ||||||||    
T  23207493 ctgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatgttgagatg 23207394  T
Q  117 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23207393 tcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18809101 - 18808944
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18809101 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18809003  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18809002 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 23709536 - 23709693
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23709536 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23709634  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23709635 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 23712017 - 23712174
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23712017 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23712115  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23712116 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 32039502 - 32039659
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32039502 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32039600  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32039601 gtgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatg 32039659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39682471 - 39682314
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39682471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39682373  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39682372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22337241 - 22337119
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22337241 atatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076446
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||| ||||| |||||||    
T  23076469 cggtctaagtggatgaagatgatg 23076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23135755 - 23135591
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  23135755 tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 23135656  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23135655 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285869
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654503
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatg 23654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26505544 - 26505380
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||    
T  26505544 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtat 26505445  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26505444 actg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26508022 - 26507858
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||    
T  26508022 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtat 26507923  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26507922 actg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 227
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38231
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 38231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23660148 - 23660027
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||      
T  23660148 atatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtc 23660050  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23660049 ggtctaagttgatgaagatgatg 23660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24367932 - 24367785
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24367932 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24367834  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24367833 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 20520152 - 20520295
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |    
T  20520152 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcat 20520250  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20520251 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 571555 - 571398
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  571555 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 571457  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  571456 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6726153 - 6725996
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6726153 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6726055  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6726054 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24898192 - 24898357
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||    
T  24898192 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 24898291  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24898292 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24898357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24900675 - 24900840
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||    
T  24900675 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 24900774  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24900775 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24903152 - 24903317
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||    
T  24903152 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 24903251  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24903252 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24903317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24905629 - 24905794
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||    
T  24905629 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 24905728  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24905729 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24908104 - 24908269
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||    
T  24908104 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 24908203  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24908204 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24908269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28577257 - 28577100
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  28577257 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-t 28577159  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  28577158 gcgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28577100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731351
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||| ||||||| |||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 21155064 - 21155211
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21155064 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21155162  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21155163 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309112
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  20309127 gatgttgaagatgatg 20309112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 227
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23040247 tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Original strand, 24697565 - 24697645
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24697565 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103512
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 208  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||  | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  209 taagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| || ||| |||||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatg 23103512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 32214925 - 32215072
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  32214925 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 32215023  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32215024 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946661
Alignment:
Q  154 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctattg-ttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 22413095 - 22413240
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcg--atattgttatatcatga--tgatttgcatactgt 165  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  || |||  ||||||     
T  22413095 atataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatgagctgttttatatactgc 22413193  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22413194 ctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 45029858 - 45030015
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  45029858 atataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-t 45029956  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  45029957 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23004915 - 23004777
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatact 163  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   ||||    
T  23004915 tgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtact 23004816  T
Q  164 gtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
      ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23004815 acctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 23004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25109104 - 25108906
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || | | |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  25109104 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 25109005  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
     ||||||| ||   || ||||||||||||||||||  |  |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25109004 attgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43137457 - 43137301
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |  ||    
T  43137457 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatta-ct 43137359  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgat 226  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  43137358 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Original strand, 22738249 - 22738296
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22738249 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38967422 - 38967375
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  38967422 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 2535 - 2762
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2535 taagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 2634  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2635 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcat 2734  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  2735 gagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5654
Alignment:
Q  8 tttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgat 106  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5867 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat 5768  T
Q  107 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctgg 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  5767 atttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcgg 5668  T
Q  207 tctaagttgatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  5667 tctaagttgatgat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 39706179 - 39706405
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39706179 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 39706278  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatg 200  Q
    |||||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39706279 gttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatg 39706378  T
Q  201 agctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39706379 agtcggtctaagttgattaagatgatg 39706405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 12288099 - 12288316
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12288099 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaattat 12288198  T
Q  101 g-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
    | |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12288199 gtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 12288297  T
Q  198 atgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  12288298 atgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12774160 - 12774011
Alignment:
Q  77 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12774160 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 12774062  T
Q  177 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12774061 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15551993 - 15551821
Alignment:
Q  53 aatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 151  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  15551993 aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgat 15551897  T
Q  152 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  15551896 ggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 15551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8846537 - 8846360
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta----------------tatcatg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||                | |||||    
T  8846537 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatg 8846438  T
Q  150 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||    
T  8846437 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 52243192 - 52243302
Alignment:
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctg 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  52243192 tttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52243291  T
Q  206 gtctaagttga 216  Q
    |||||||||||    
T  52243292 gtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 13810 - 13953
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  13810 atataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgccta 13909  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13910 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15099579 - 15099457
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| | || ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099579 taagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattat 15099480  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15099479 gttgatatttgagatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15190546 - 15190424
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| | || ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190546 taagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattat 15190447  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15190446 gttgatatttgagatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 43198512 - 43198661
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtc 166  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  43198512 atataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtc 43198611  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43198612 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16596825 - 16596686
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16596825 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatatcatga 16596729  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 193  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16596728 tggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 219
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377630
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T
Q  209 taagttgatga 219  Q
    |||||||||||    
T  16377620 taagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44615453 - 44615289
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  44615453 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtat 44615354  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44615353 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 46640361 - 46640558
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | |||||| |  |  ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||    
T  46640361 ctgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagat 46640459  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46640460 gttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240086
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctattg-ttatttaattaagttgcatgagtt 16240063  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16240064 ggtctaagttgatgaagatgatg 16240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088881
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798778
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7798801 cggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22636561 - 22636439
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22636561 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22636462 cggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 53082057 - 53082254
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  53082057 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 53082156  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53082157 gttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6900016 - 6899895
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||      
T  6900016 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagatgcatgagtc 6899918  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6899917 ggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574984
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||| || | |||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatg 8574984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270352
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||      
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 16270329  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  16270330 ggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873484
Alignment:
Q  106 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12468
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12311 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12409  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  12410 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 15118356 - 15118513
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15118356 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15118454  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15118455 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 18215278 - 18215435
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  18215278 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 18215376  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18215377 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374473
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatg 224  Q
     | ||||||||| ||| ||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 44773091 - 44773248
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44773091 atataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 44773189  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44773190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52312668 - 52312511
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  52312668 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 52312570  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  52312569 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902761
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatg 12902761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280317
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatg 14280317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 50222336 - 50222500
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  50222336 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 50222435  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  50222436 aatgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798871
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatg 54798871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 19618176 - 19618323
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| ||    
T  19618176 atataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ct 19618274  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19618275 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 44928883 - 44929041
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  44928883 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgctt 44928982  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44928983 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 51463872 - 51464029
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  51463872 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 51463970  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  51463971 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 51464029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893707
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||      
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatg 7893707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 18239416 - 18239580
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  18239416 tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 18239515  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18239516 actgt-tgtgctgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052833
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||     
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttg-ttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     || |||||||||||| |||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatg 44052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgat 226  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096297
Alignment:
Q  154 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 3096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 1837513 - 1837670
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1837513 atataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1837611  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  1837612 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19242857 - 19242700
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19242857 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19242759  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19242758 gtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970858
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  208 ctaagttgat 217  Q
    ||||||||||    
T  14970849 ctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17046552 - 17046491
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  17046552 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 17046491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3515165 - 3515008
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | |||||| ||    
T  3515165 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg-ct 3515067  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  3515066 gtgttgctgttgttt-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803426
Alignment:
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagtt 214  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  215 gatgatgatgatg 227  Q
    ||| | |||||||    
T  23803414 gattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 15355328 - 15355476
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  15355328 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 15355426  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15355427 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641343
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  7641286 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610951
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  12611008 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053418
Alignment:
Q  114 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagt 213  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  214 tgatgatgatgatg 227  Q
    || ||| |||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatg 14053418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Original strand, 15464929 - 15464970
Alignment:
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15464929 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44102372 - 44102215
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  44102372 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 44102274  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44102273 gtgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333306
Alignment:
Q  160 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgag 17333306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 6013 - 6240
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6013 taagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 6112  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6113 gtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcat 6212  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6213 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15471154 - 15470928
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15471154 taagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 15471056  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15471055 gtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcat 15470956  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  15470955 gagtcggtctaagttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16103944 - 16103784
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16103944 tgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 16103846  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16103845 ctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14234720 - 14234491
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtt--tcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatt 98  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| | |||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14234720 taagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaatt 14234621  T
Q  99 atgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
    ||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14234620 atgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgc 14234521  T
Q  198 atgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||    |||||||||||| | |||||||    
T  14234520 atgaatcagtctaagttgattaagatgatg 14234491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16097493 - 16097332
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  16097493 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgc 16097394  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16097393 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 12174218 - 12174376
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12174218 tgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 12174314  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12174315 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307684
Alignment:
Q  77 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 32307732  T
Q  177 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32307731 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 227
Target Start/End: Original strand, 49668044 - 49668193
Alignment:
Q  78 tgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg-ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49668044 tgtatatactttaaatggattatgttgataaatgagatgtttgttg-attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 49668142  T
Q  177 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  49668143 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9513067 - 9512924
Alignment:
Q  80 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 179  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9513067 tatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttt 9512972  T
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9512971 gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9521042 - 9520899
Alignment:
Q  80 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 179  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9521042 tatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttt 9520947  T
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9520946 gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 227
Target Start/End: Original strand, 13210272 - 13210444
Alignment:
Q  53 aatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 151  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13210272 aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgat 13210368  T
Q  152 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    | ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  13210369 ggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Original strand, 1644642 - 1644787
Alignment:
Q  77 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1644642 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 1644740  T
Q  177 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 224  Q
    || |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  1644741 tt-gttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27165373 - 27165251
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  27165373 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 27165274  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  27165273 ggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 52523686 - 52523831
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  52523686 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcc 52523785  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52523786 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399213
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatg 12399213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 53301545 - 53301668
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgt-tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  53301545 atatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagt 53301644  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  53301645 cggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 24340682 - 24340815
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||    
T  24340682 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatactgcata 24340781  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  24340782 tgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 24340815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23274813 - 23274716
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  23274813 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgag 23274716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 1465347 - 1465423
Alignment:
Q  47 tattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1465347 tattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438538
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatg 18438538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37251057 - 37251259
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||   ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  37251057 taagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 37251156  T
Q  101 gt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
     | |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  37251157 ttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgc 37251255  T
Q  198 atga 201  Q
    ||||    
T  37251256 atga 37251259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572596
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| |  || | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14572615 ggtctaagttgatgttgatg 14572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14972980 - 14972858
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14972980 atatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  14972881 cggtctaagttgatgaagatgatg 14972858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17487982 - 17487860
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17487982 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17499464 - 17499342
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17499464 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166599
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386428
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T
Q  204 tggtctaagt 213  Q
     |||||||||    
T  42386437 cggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  205 ggtctaagttgat 217  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442278
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34159491 - 34159327
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  34159491 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 34159392  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  34159391 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55476656 - 55476492
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  55476656 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 55476557  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  55476556 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 55476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 227
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424876
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 14576828 - 14576949
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||      
T  14576828 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtc 14576926  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  14576927 ggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153325
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||      
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 24153302  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  24153303 ggtctaagttgattaagatgatg 24153325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 37642224 - 37642357
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37642224 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 37642323  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  37642324 tgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 37642357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 7781351 - 7781508
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  7781351 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 7781449  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  7781450 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17463336 - 17463179
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17463336 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17463238  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17463237 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17672784 - 17672627
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17672784 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17672686  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17672685 atgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698552
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172744
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 29172685  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29172686 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29172744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 45606911 - 45607068
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  45606911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 45607009  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  45607010 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 16282815 - 16282971
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16282815 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16282913  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgat 226  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  16282914 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 16454278 - 16454442
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  16454278 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 16454377  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16454378 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083478
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 28848608 - 28848772
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  28848608 tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 28848707  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  28848708 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28848772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 38961895 - 38962042
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38961895 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 38961993  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38961994 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28194759 - 28194694
Alignment:
Q  162 ctgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  28194759 ctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28194694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550625
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||  |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43550582 atgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 202
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606418
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 606418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8899252 - 8899095
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  8899252 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 8899154  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||    
T  8899153 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 8899095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 9707611 - 9707768
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  9707611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 9707709  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  9707710 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 13151787 - 13151952
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||    
T  13151787 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 13151886  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13151887 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13151952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 13154252 - 13154417
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||    
T  13154252 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 13154351  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13154352 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 17446659 - 17446815
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17446659 atataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17446757  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  17446758 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagttgattaagatgatg 17446815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469295
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 6469275  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  6469276 ctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476502
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttt-tttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatg 25476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686891
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     |||||||||||| || |||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213837
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatg 40213837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840944
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  204 tggtctaagttgatga 219  Q
     ||| |||||||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12567718 - 12567571
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  12567718 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 12567620  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12567619 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13544183 - 13544036
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  13544183 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 13544085  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13544084 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Original strand, 22110349 - 22110454
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctgg 206  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||    
T  22110349 ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 22110448  T
Q  207 tctaag 212  Q
    ||||||    
T  22110449 tctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500943
Alignment:
Q  114 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  213 ttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | |||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatg 55500943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 53070657 - 53070799
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| |    
T  53070657 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-t 53070755  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53070756 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 10247727 - 10247884
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10247727 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10247825  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10247826 gtgctgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 201
Target Start/End: Original strand, 22147484 - 22147616
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  22147484 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcataccgccta 22147583  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 201  Q
     ||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22147584 cgttgctgatcattaactaactaagctgcatga 22147616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 122
Target Start/End: Original strand, 49389586 - 49389642
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  49389586 tgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 169
Target Start/End: Original strand, 2051158 - 2051260
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  2051158 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcc 2051257  T
Q  167 tat 169  Q
    |||    
T  2051258 tat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977516
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50242980 - 50242833
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  50242980 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 50242882  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50242881 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737237
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17737294 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41124045 - 41123892
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41124045 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41123947  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgat 226  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  41123946 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8499566 - 8499519
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  8499566 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8499519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10557033 - 10556986
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10557033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15412477 - 15412430
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15412477 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Original strand, 45577952 - 45577999
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  45577952 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119886
Alignment:
Q  120 ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatg 218  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||     
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  219 atgatgatg 227  Q
    | |||||||    
T  12119878 aagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10758 - 10542
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10758 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatgaattat 10659  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  10658 gttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcat 10559  T
Q  200 gagctggtctaagttga 216  Q
    |||  ||||||||||||    
T  10558 gagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21329387 - 21329614
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21329387 taagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 21329486  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21329487 gtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 21329586  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21329587 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21565707 - 21565546
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  21565707 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgc 21565608  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21565607 ctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21502045 - 21502273
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21502045 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 21502144  T
Q  100 tgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 198  Q
    |||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  21502145 tgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 21502244  T
Q  199 tgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21502245 tgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 22959491 - 22959649
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22959491 tgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 22959587  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22959588 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 26011925 - 26012141
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26011925 taagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatgaattat 26012024  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  26012025 gtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 26012124  T
Q  200 gagctggtctaagttga 216  Q
    |||  ||||||||||||    
T  26012125 gagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19669060 - 19668902
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19669060 tgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgt 19668964  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  19668963 ctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20026830 - 20027043
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || || || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20026830 taagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattat 20026929  T
Q  101 g-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
    | |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20026930 gtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 20027028  T
Q  198 atgagctggtctaag 212  Q
    |||||  ||||||||    
T  20027029 atgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 19660779 - 19660952
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||    
T  19660779 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttatattcgatatcattatatcaaga 19660875  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  19660876 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 19660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729181
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808506
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatg 21808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22144211 - 22144068
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  22144211 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactaccta 22144112  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22144111 tgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390613
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314581
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 21741489 - 21741545
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741489 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 22178125 - 22178323
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  |   |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  22178125 ctgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 22178224  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22178225 gttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493573
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||      
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtc 24493596  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24493595 ggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Original strand, 8286838 - 8286960
Alignment:
Q  106 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8286838 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 8286936  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  8286937 cggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39363549 - 39363385
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  39363549 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 39363450  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39363449 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39363385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025315
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||      
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13025338  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13025337 ggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095499
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||      
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13095522  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13095521 ggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412188
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||      
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatg 22412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 264772 - 264929
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  264772 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 264870  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  264871 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1096593 - 1096474
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1096593 atatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatg 224  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  1096494 cggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733101
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10733043 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 11581203 - 11581360
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11581203 atataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 11581301  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  11581302 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529224
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29330092 - 29329935
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29330092 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 29329994  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29329993 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077956
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatg 9077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20909177 - 20909013
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  20909177 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 20909078  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20909077 actgt-tgtgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997651
Alignment:
Q  125 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgat 223  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 21997647  T
Q  224 gatg 227  Q
    ||||    
T  21997648 gatg 21997651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075035
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  204 tggtctaagttg 215  Q
     |||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421536
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 42245362 - 42245526
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  42245362 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 42245461  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  42245462 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448054
Alignment:
Q  77 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 173  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  174 ctgttg 179  Q
    ||||||    
T  29448059 ctgttg 29448054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40726015 - 40725882
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  40726015 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgctttgcatactgccta 40725916  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
     ||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  40725915 cgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 40725882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 20902012 - 20902159
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  20902012 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 20902110  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20902111 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 2154617 - 2154775
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  2154617 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 2154715  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  2154716 tgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29346138 - 29345981
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29346138 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29346040  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29346039 gtgatgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431414
Alignment:
Q  107 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagatgcatgagtcg 25431420  T
Q  206 gtctaa 211  Q
    ||||||    
T  25431419 gtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39245291 - 39245137
Alignment:
Q  74 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 170  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||| || ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  39245291 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 39245193  T
Q  171 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39245192 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 36154787 - 36154941
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  36154787 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 36154885  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  36154886 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918109
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20918052 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 165
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766175
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt 20766175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32027551 - 32027394
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32027551 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32027453  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  32027452 gtgttgttgttg-ttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32027394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775837
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 18319037 - 18319185
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 18319135  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18319136 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293086
Alignment:
Q  160 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 21293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23064559 - 23064512
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23064559 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723932
Alignment:
Q  159 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgag 37723932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38619482 - 38619435
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  38619482 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31061124 - 31061069
Alignment:
Q  171 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  31061124 ttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13170 - 12943
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13170 taagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattat 13071  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  13070 gtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcat 12971  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  12970 gagtcggtctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 18143 - 18277
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  18143 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 18242  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18243 gttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 14587 - 14814
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  |||||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14587 taagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaatta 14686  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14687 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcat 14786  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  14787 gagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 22626 - 22787
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 22725  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22726 ctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatg 22787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 82230 - 82073
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  82230 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 82132  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  82131 gtgttgctgttg-ttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 82073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12990 - 12770
Alignment:
Q  8 tttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 106  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12990 tttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 12891  T
Q  107 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctgg 206  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  12890 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  207 tctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 292 - 133
Alignment:
Q  69 ttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  292 ttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcct 193  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 925 - 1151
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  925 taagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtaaat-ctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 1023  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1024 gtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 1123  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  1124 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6842 - 6615
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6842 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 6743  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6742 gtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 6643  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6642 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14222 - 13995
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14222 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 14123  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14122 gtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 14023  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14022 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 13995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 10497 - 10658
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10497 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 10596  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||    
T  10597 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatggtgatg 10658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 130070 - 129909
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  130070 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 129971  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  129970 ctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgatgaagatg 129909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Original strand, 60713 - 60808
Alignment:
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  60713 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 60808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19652358 - 19652199
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19652358 tgttatataattgtatatactttaaatggattatgttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcc 19652260  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19652259 tatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23019637 - 23019425
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23019637 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 23019538  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  23019537 gtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 23019438  T
Q  200 gagctggtctaag 212  Q
     ||  ||||||||    
T  23019437 aagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19668603 - 19668386
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||  |||||  | || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  19668603 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattac 19668504  T
Q  101 gt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 197  Q
    || |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19668503 gtatgatgtt-gtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 19668405  T
Q  198 atgagctggtctaagttga 216  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  19668404 atgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 28496415 - 28496588
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  28496415 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 28496511  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  28496512 tggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 28496588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 29808826 - 29808999
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  29808826 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 29808922  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  29808923 tggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 29808999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1561480 - 1561307
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1561480 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatga 1561384  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  1561383 tggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 1561307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 9098469 - 9098620
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatact 163  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  9098469 tgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatact 9098567  T
Q  164 gtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9098568 gcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333335
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394075
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185938
Alignment:
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T
Q  216 atgatgatgatg 227  Q
    ||||||| ||||    
T  4185927 atgatgacgatg 4185938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186376
Alignment:
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  216 atgatga 222  Q
    |||||||    
T  4186382 atgatga 4186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109153
Alignment:
Q  76 attgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 173  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttg 20109196  T
Q  174 ctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20109195 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 22080637 - 22080800
Alignment:
Q  9 ttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatt-atatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 107  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||   |||||| || || || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||     
T  22080637 ttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaattatgacgatg 22080736  T
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 172  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22080737 tttgagatgttgtt-ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496248
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060544
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatg 29060544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 31155355 - 31155514
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31155355 tgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgt 31155452  T
Q  166 ctatgttgctg-ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||||||    
T  31155453 tta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076704
Alignment:
Q  118 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  218 gatgatgatg 227  Q
    || |||||||    
T  20076713 gaagatgatg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25644444 - 25644335
Alignment:
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctgg 206  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  25644444 tttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcgg 25644345  T
Q  207 tctaagttga 216  Q
    ||||||||||    
T  25644344 tctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1595707 - 1595550
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1595707 atataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 1595609  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||    
T  1595608 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 2291177 - 2291341
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  2291177 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtat 2291276  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  2291277 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 18334589 - 18334753
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  18334589 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 18334688  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18334689 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409944
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782228
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 22782287  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22782286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303657
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  209 taagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatg 19303657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Original strand, 4668217 - 4668277
Alignment:
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4668217 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Original strand, 4675064 - 4675124
Alignment:
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4675064 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12742475 - 12742318
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12742475 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12742377  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  12742376 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19005204 - 19005047
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19005204 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19005106  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19005105 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 19858923 - 19859080
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19858923 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19859021  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19859022 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638400
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24422705 - 24422548
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24422705 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24422607  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24422606 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33861952 - 33861795
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33861952 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33861854  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  33861853 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33864436 - 33864279
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33864436 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33864338  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  33864337 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Original strand, 8227470 - 8227625
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8227470 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 8227569  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 224  Q
     ||||||| |  |||  |||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||||    
T  8227570 cgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629472
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttg-taatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 26924637 - 26924801
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  26924637 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 26924736  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26924737 actat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 20556898 - 20557053
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| |     
T  20556898 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tg 20556995  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20556996 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 30676714 - 30676861
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| ||    
T  30676714 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ct 30676812  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30676813 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8055187 - 8055030
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  8055187 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-t 8055089  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  8055088 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287913
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatg 17287913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 20360955 - 20361069
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20360955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  204 tggtctaagttgatga 219  Q
     | |||||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25754967 - 25754810
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  25754967 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 25754869  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  25754868 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25754810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593777
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatg 20593777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656630
Alignment:
Q  125 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgat 223  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 25656634  T
Q  224 gatg 227  Q
    ||||    
T  25656633 gatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34963531 - 34963384
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34963531 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34963433  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  34963432 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 227
Target Start/End: Original strand, 1540918 - 1541072
Alignment:
Q  74 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 170  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||    
T  1540918 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtg 1541016  T
Q  171 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  1541017 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688513
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  208 ctaagttgat 217  Q
    ||||||||||    
T  25688522 ctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920747
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  16920732 gatgttgaagatgatg 16920747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245590
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatg 35245590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714421
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  25714478 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 3852021 - 3852178
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3852021 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3852119  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  3852120 gtgttgctgttg-ttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3852178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22831568 - 22831532
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22831568 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 22831532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 16448530 - 16448678
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 16448628  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  16448629 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Original strand, 22780297 - 22780344
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  22780297 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 22780344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185515
Alignment:
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatg 221  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18696648 - 18696569
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  18696648 atataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18706466 - 18706387
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  18706466 atataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatga 18706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443076
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgag 33443076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 62426 - 62202
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattat-atattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||   |||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62426 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatta 62327  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  62326 tgttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcat 62230  T
Q  200 gagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||  ||| ||||| || ||||||||||    
T  62229 gagtcggtttaagtcgaagatgatgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 132809 - 132662
Alignment:
Q  80 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgtt 178  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  132809 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 132711  T
Q  179 ggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  132710 tgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 136845 - 136681
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  136845 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtat 136746  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  136745 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 136681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 139314 - 139150
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  139314 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtat 139215  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  139214 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 144252 - 144088
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  144252 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtat 144153  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  144152 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 144088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 134376 - 134212
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  134376 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtat 134277  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||    
T  134276 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 141783 - 141619
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  141783 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtat 141684  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  141683 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 141619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32766 - 32551
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32766 taagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattat 32667  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  32666 gtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 32568  T
Q  200 gagctggtctaagttga 216  Q
    |||  ||||||||||||    
T  32567 gagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 45748 - 45909
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45748 tgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 45847  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45848 ctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 160848 - 160688
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  160848 tgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 160750  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  160749 ctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 501242 - 501095
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || ||    
T  501242 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ct 501144  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  501143 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 85583 - 85741
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| || ||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  85583 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 85681  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  85682 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 2776 - 2923
Alignment:
Q  80 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 179  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  2776 tatatacattttatgaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgttt 2875  T
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  2876 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2281
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaatta-tatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  || ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 2207  T
Q  100 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 173  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2208 tgctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6974 - 6822
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6974 tgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 6878  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  6877 ctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8246 - 8097
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8246 taagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 8147  T
Q  101 g-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 149  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8146 gtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1313 - 1096
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||   |||  |||||  | | |||||| || || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  1313 taagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattat 1214  T
Q  101 gtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1213 gtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 1114  T
Q  200 gagctggtctaagttgat 217  Q
    |||  |||||||||||||    
T  1113 gagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11469 - 11296
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  11469 taatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 11373  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  11372 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2174 - 2001
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  2174 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 2078  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  2077 tggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28418
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4556
Alignment:
Q  175 tgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Original strand, 23897 - 24000
Alignment:
Q  124 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  23897 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T
Q  224 gatg 227  Q
    ||||    
T  23997 gatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15838 - 15665
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15838 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga 15742  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15741 tggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8180
Alignment:
Q  21 tgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||| |||||||    
T  7983 tgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttg 8081  T
Q  120 ttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8082 ttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 29239 - 29354
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||      
T  29239 tgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactac 29335  T
Q  166 ctatgttgctgttggttat 184  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  29336 ctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1186
Alignment:
Q  67 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  1028 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 1124  T
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  1125 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 38697 - 38819
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  38697 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagta 38796  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  38797 ggtctaagttgattaagatgatg 38819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32249 - 32102
Alignment:
Q  80 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgtt 178  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||    
T  32249 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtt 32151  T
Q  179 ggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32150 tgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 136257 - 136471
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatat-attctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  136257 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaatta 136356  T
Q  100 tgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 196  Q
    |||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |||||| |||  ||||||||| ||    
T  136357 tgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttg 136455  T
Q  197 catgagctggtctaag 212  Q
    ||||||  ||||||||    
T  136456 catgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 144965 - 145179
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatat-attctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaatta 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  144965 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaatta 145064  T
Q  100 tgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 196  Q
    |||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |||||| |||  ||||||||| ||    
T  145065 tgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttg 145163  T
Q  197 catgagctggtctaag 212  Q
    ||||||  ||||||||    
T  145164 catgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174785
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  | || ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 174789  T
Q  209 taag 212  Q
    ||||    
T  174788 taag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121770
Alignment:
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 3146 - 3267
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  3146 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 3244  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  3245 ggtctaagttgatgaagatgatg 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Original strand, 15792 - 15894
Alignment:
Q  125 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||    
T  15792 ttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15891  T
Q  225 atg 227  Q
    |||    
T  15892 atg 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 15722 - 15766
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattat 45  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15722 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattat 15766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 201
Target Start/End: Original strand, 53508 - 53640
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  53508 atataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgccta 53607  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 201  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  53608 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  205 ggtctaag 212  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3303
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 6188 - 6386
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  6188 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 6287  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  6288 gttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34300 - 34127
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| | |||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  34300 taatgttgcttataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatga 34204  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||  ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  34203 tgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39489
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 39504  T
Q  205 ggtctaagttgatga 219  Q
    |||||||||||||||    
T  39503 ggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75323
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 75308  T
Q  205 ggtctaagttgatga 219  Q
    |||||||||||||||    
T  75309 ggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39862
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25908
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||      
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  205 ggtctaagttgatga 219  Q
    |||||||||||||||    
T  25922 ggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38533 - 38345
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | ||||||    || ||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  38533 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 38434  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  38433 gttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgag 38345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25268 - 25121
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||| ||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcct 25170  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 216  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25169 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 698 - 619
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  698 atataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12729 - 12587
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgttga--tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  12729 atataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgccta 12631  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12630 tgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 128875 - 129072
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| ||  | | |||||| |  || ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  128875 ctgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagat 128974  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  128975 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116431
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 78537 - 78351
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | | |||||| |  || ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| || |||||    
T  78537 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatgtt-gagat 78439  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  78438 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 78351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1855
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33073
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 33050  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  33051 ggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45932
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 45955  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  45954 ggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16117
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||| || || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatg 16117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17446
Alignment:
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17389 tgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11626 - 11493
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11626 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 11527  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  11526 tgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 11493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 38215 - 38348
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38215 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 38314  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  38315 tgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 38348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4853
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatg 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13147
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  13147 g 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16206
Alignment:
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||    
T  16098 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 16197  T
Q  208 ctaagttga 216  Q
    |||||||||    
T  16198 ctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27855
Alignment:
Q  108 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||    
T  27747 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 27846  T
Q  208 ctaagttga 216  Q
    |||||||||    
T  27847 ctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 103528 - 103737
Alignment:
Q  1 taagttatttattttgctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattat 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||| || || |||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  103528 taagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatgaattat 103627  T
Q  101 gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 198  Q
    ||  ||      ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  103628 gt--at------gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgca 103719  T
Q  199 tgagctggtctaagttga 216  Q
    | ||  ||||||||||||    
T  103720 ttagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17334
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctg 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  206 gtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Original strand, 17986 - 18119
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||  ||    
T  17986 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataatgcata 18085  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  18086 tgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 18119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39917
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtt 39940  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39939 ggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 212
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  110 tgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||  |||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggt 19982  T
Q  208 ctaag 212  Q
    |||||    
T  19983 ctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 97168 - 97024
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  97168 atatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcct 97069  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  97068 atgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 106446 - 106302
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  106446 atatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcct 106347  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  106346 atgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  208 ctaagttgatgatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44824
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
      |||||||||||| | |||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatg 44824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13215
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13337 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Original strand, 8018 - 8151
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtc 166  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8018 atataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcc 8117  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatg 200  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  8118 tatgctgctatttgttatttaattaagctgcatg 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32946
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||      
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 32969  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  32968 ggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38765
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||       
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgactc 38788  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  38787 ggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9750
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||||     
T  9908 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt- 9810  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  9809 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28887
Alignment:
Q  147 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg-gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9193 - 9133
Alignment:
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9193 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20905 - 20748
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20905 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20807  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20806 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37979 - 37822
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  37979 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 37881  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  37880 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 158454 - 158611
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  158454 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 158552  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  158553 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 158611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340064
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 208  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 340045  T
Q  209 taagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||| || |||||||    
T  340046 taagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13557 - 13393
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  13557 tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 13458  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13457 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3474
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||     
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 347
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||  ||||| |  |||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||      
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 370  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| ||| | |||||||    
T  369 ggtctaagtcgataaagatgatg 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51917
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168095
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatg 168095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10784
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  208 ctaagttgat 217  Q
    ||||||||||    
T  10793 ctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8646
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  |||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||      
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtc 8623  T
Q  205 ggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  8624 ggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4852 - 4695
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  4852 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 4754  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  4753 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10540
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaa 10524  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| ||| |||||||    
T  10525 gttgttgaagatgatg 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13948
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14105 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14007  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14006 gtgttgctgttg-ttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Original strand, 2386 - 2505
Alignment:
Q  52 taatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  2386 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttacattcgatattattatatcatga 2482  T
Q  151 tgatttgcatactgtctatgttg 173  Q
    || ||||||||| ||||| ||||    
T  2483 tggtttgcatacggtctaagttg 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16785
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  16942 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 16844  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16843 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1293
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  1308 gatgttgaagatgatg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7270
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 227
Target Start/End: Original strand, 15295 - 15355
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||    
T  15295 ctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatg 15355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20524
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  |     
T  20383 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tg 20481  T
Q  169 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20482 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1165
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatg 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1956
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2078 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     |||||||| || ||| |||||||    
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatg 1956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23008 - 22887
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23008 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  204 tggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15580
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| ||| |||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatg 15580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32071
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| ||| |||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatg 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40565 - 40401
Alignment:
Q  64 tactgttatataattgtatatacattatatgaatt--atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||    
T  40565 tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtat 40466  T
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  40465 actgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  203 ctggtctaagt 213  Q
      |||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 221 - 87
Alignment:
Q  17 ctgttgttgtttcagtaaacttgaattatatattctaatgttgctgctactgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 115  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| ||  | | |||||| |  || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  221 ctgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 122  T
Q  116 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  121 gttattgatttgcatctgatattgttatatcatga 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6241
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttg--gttatttaactaagctgcatga 201  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  202 gctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||    
T  6216 gtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 227
Target Start/End: Original strand, 4890 - 4950
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4890 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9253
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  208 ctaagttgat 217  Q
    ||||||||||    
T  9262 ctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13513
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||| | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  212 gttg 215  Q
    ||||    
T  13516 gttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4520
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  204 tggtctaagttgatga 219  Q
     |||||||||||||||    
T  4535 cggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12102
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  204 tggtctaagttgatga 219  Q
     |||||||||||||||    
T  12117 cggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22054
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  204 tggtctaagttgatga 219  Q
     |||||||||||||||    
T  22069 cggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16717
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  208 ctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatg 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  113 gatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  669 gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 571  T
Q  211 ag 212  Q
    ||    
T  570 ag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16286
Alignment:
Q  114 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagt 213  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  214 tgatgatgatgatg 227  Q
    || ||| |||||||    
T  16299 tgttgaagatgatg 16286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4716
Alignment:
Q  154 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 267822 - 267679
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 167  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||  |    
T  267822 atataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcat 267724  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  267723 atgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 107
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  264 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-t 166  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  165 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5245
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  5230 gatgttgaagatgatg 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8483
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  211 agttgatgatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8499 agttgatgaagatgatg 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 225568 - 225465
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 168  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||| |||    
T  225568 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgttttgcatactgacta 225470  T
Q  169 tgttg 173  Q
    |||||    
T  225469 tgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30090 - 29946
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  30090 atataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29992  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagtt 214  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29991 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20928
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 210  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||  ||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  211 agt 213  Q
    |||    
T  20930 agt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11446 - 11299
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  11446 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 11348  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  11347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4308
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 4318  T
Q  208 ctaagttgat 217  Q
    ||||||||||    
T  4317 ctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 150
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1836
Alignment:
Q  109 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1795 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 161093 - 161239
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 166  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| |    
T  161093 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-c 161191  T
Q  167 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg 215  Q
    | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  161192 tgtgtcgctgttgat-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1166
Alignment:
Q  112 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  212 gttgatgatgatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatg 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2694
Alignment:
Q  124 attgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||  ||||||||    
T  2784 attgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2303
Alignment:
Q  77 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttg 119  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2261 ttgtatatacattaaatggattatgttgatattcgagatgttg 2303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 12253 - 12400
Alignment:
Q  71 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 167  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||  |||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || | ||||| || ||| | || ||| ||    
T  12253 atataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ct 12351  T
Q  168 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  12352 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4650 - 4553
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 202  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||| || || | |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4650 atatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagttgcatgag 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46999
Alignment:
Q  161 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 227  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 46999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 225
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11558
Alignment:
Q  114 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 212  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  213 ttgatgatgatga 225  Q
    ||| ||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27912
Alignment:
Q  105 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||    
T  27956 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University