View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6413_low_6 (Length: 378)

Name: NF6413_low_6
Description: NF6413
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6413_low_6
NF6413_low_6
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-262)||(24674814-24675075)
chr2 (1-262)||(45676706-45676967)
chr2 (1-262)||(21326123-21326384)
chr2 (1-262)||(23188333-23188594)
chr2 (1-262)||(23599596-23599857)
chr2 (2-260)||(23061626-23061884)
chr2 (1-262)||(24709358-24709619)
chr2 (1-262)||(9609461-9609722)
chr2 (1-262)||(27370594-27370855)
chr2 (1-262)||(24261695-24261956)
chr2 (1-262)||(41609201-41609462)
chr2 (8-262)||(24878859-24879113)
chr2 (1-262)||(10868175-10868436)
chr2 (1-262)||(16981477-16981738)
chr2 (1-262)||(17063042-17063303)
chr2 (1-260)||(23138365-23138623)
chr2 (1-262)||(27217340-27217602)
chr2 (1-262)||(16924585-16924846)
chr2 (1-262)||(16998325-16998586)
chr2 (1-262)||(44379756-44380017)
chr2 (1-262)||(44386426-44386687)
chr2 (1-260)||(23550155-23550413)
chr2 (1-262)||(21145887-21146149)
chr2 (1-262)||(22325713-22325960)
chr2 (1-189)||(22757320-22757508)
chr2 (134-262)||(27385700-27385828)
chr2 (17-260)||(24833446-24833689)
chr2 (17-251)||(45528846-45529080)
chr2 (1-131)||(27377328-27377458)
chr2 (16-260)||(1063076-1063319)
chr2 (16-260)||(31829983-31830226)
chr2 (17-260)||(11358747-11358989)
chr2 (17-260)||(27365952-27366194)
chr2 (16-260)||(20832310-20832553)
chr2 (17-260)||(23086776-23087020)
chr2 (17-256)||(30211790-30212029)
chr2 (83-260)||(23265543-23265719)
chr2 (18-256)||(23293290-23293527)
chr2 (182-262)||(25962451-25962531)
chr2 (65-256)||(27787073-27787263)
chr2 (17-229)||(24653703-24653915)
chr2 (98-256)||(12573685-12573842)
chr2 (1-86)||(24708339-24708423)
chr2 (17-179)||(23276184-23276346)
chr2 (17-179)||(24944775-24944937)
chr2 (188-260)||(30800309-30800381)
chr2 (194-260)||(24944707-24944772)
chr2 (206-260)||(28350550-28350604)
chr2 (218-262)||(12830366-12830410)
chr2 (207-260)||(21240486-21240538)
chr2 (207-260)||(31504835-31504887)
chr2 (216-260)||(19802742-19802785)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (1-262)||(12497561-12497822)
chr3 (1-262)||(16370727-16370987)
chr3 (1-262)||(14877055-14877316)
chr3 (1-262)||(11297079-11297340)
chr3 (1-261)||(16807482-16807742)
chr3 (2-260)||(9522034-9522292)
chr3 (1-262)||(15725489-15725750)
chr3 (2-260)||(17489165-17489423)
chr3 (1-262)||(15348801-15349062)
chr3 (1-262)||(16635086-16635347)
chr3 (1-262)||(43162410-43162671)
chr3 (2-262)||(16691473-16691733)
chr3 (1-262)||(15403066-15403327)
chr3 (1-262)||(26792955-26793216)
chr3 (1-262)||(15338582-15338843)
chr3 (2-260)||(16492738-16492996)
chr3 (1-262)||(13252003-13252264)
chr3 (1-262)||(10004913-10005174)
chr3 (1-262)||(10905523-10905784)
chr3 (1-262)||(15589948-15590209)
chr3 (1-262)||(48424760-48425021)
chr3 (5-262)||(320546-320803)
chr3 (1-262)||(20062610-20062871)
chr3 (17-260)||(31689184-31689426)
chr3 (17-260)||(31944798-31945040)
chr3 (1-262)||(6600060-6600321)
chr3 (1-262)||(16757141-16757402)
chr3 (32-260)||(14974180-14974408)
chr3 (1-260)||(15208206-15208465)
chr3 (1-262)||(53385574-53385835)
chr3 (1-221)||(16412838-16413058)
chr3 (1-260)||(15247162-15247421)
chr3 (117-262)||(16810687-16810832)
chr3 (95-260)||(9514059-9514224)
chr3 (17-258)||(16837065-16837305)
chr3 (17-256)||(14542908-14543146)
chr3 (53-258)||(16381524-16381728)
chr3 (148-262)||(6609773-6609887)
chr3 (32-256)||(16330235-16330458)
chr3 (17-260)||(14085999-14086241)
chr3 (17-259)||(11961595-11961836)
chr3 (2-258)||(14571176-14571431)
chr3 (17-260)||(13972681-13972923)
chr3 (147-248)||(11852890-11852991)
chr3 (17-261)||(13323213-13323456)
chr3 (68-260)||(16338672-16338863)
chr3 (17-260)||(10420606-10420848)
chr3 (81-257)||(15016188-15016364)
chr3 (14-260)||(11304331-11304576)
chr3 (17-213)||(15227021-15227217)
chr3 (17-260)||(12361103-12361345)
chr3 (17-256)||(12854419-12854656)
chr3 (17-256)||(41176852-41177090)
chr3 (83-260)||(15953595-15953771)
chr3 (17-256)||(13941354-13941592)
chr3 (17-260)||(18134907-18135149)
chr3 (192-262)||(1981617-1981687)
chr3 (17-256)||(8759643-8759881)
chr3 (16-260)||(10383305-10383535)
chr3 (152-260)||(12478406-12478513)
chr3 (17-256)||(44776577-44776815)
chr3 (206-256)||(13028758-13028808)
chr3 (205-258)||(17738560-17738613)
chr3 (205-258)||(19039880-19039933)
chr3 (216-260)||(36526518-36526562)
chr3 (209-260)||(15008986-15009037)
chr3 (206-260)||(2037314-2037368)
chr3 (206-260)||(2041055-2041109)
chr3 (206-260)||(15446482-15446536)
chr3 (214-260)||(19444978-19445024)
chr3 (207-260)||(2247258-2247310)
chr3 (207-260)||(54974624-54974676)
chr3 (207-260)||(54977234-54977286)
chr3 (216-260)||(10953270-10953313)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (1-260)||(21167297-21167556)
chr8 (1-262)||(16408805-16409066)
chr8 (2-262)||(19977727-19977987)
chr8 (21-262)||(19900304-19900545)
chr8 (1-262)||(22031792-22032053)
chr8 (1-262)||(20018510-20018771)
chr8 (1-262)||(22046134-22046394)
chr8 (2-260)||(21250704-21250962)
chr8 (2-260)||(21922496-21922754)
chr8 (2-260)||(21394626-21394884)
chr8 (2-260)||(21789119-21789377)
chr8 (1-262)||(30313904-30314165)
chr8 (1-262)||(17674783-17675044)
chr8 (1-262)||(22120934-22121195)
chr8 (1-262)||(32599904-32600165)
chr8 (1-260)||(22179318-22179577)
chr8 (1-262)||(15440941-15441202)
chr8 (1-262)||(15533140-15533401)
chr8 (2-262)||(22164952-22165212)
chr8 (1-262)||(19112450-19112711)
chr8 (2-262)||(22133802-22134062)
chr8 (1-252)||(19485630-19485881)
chr8 (1-260)||(23948651-23948910)
chr8 (17-260)||(22178947-22179189)
chr8 (17-256)||(20396901-20397140)
chr8 (17-258)||(29304202-29304442)
chr8 (2-260)||(16265379-16265635)
chr8 (16-260)||(6678871-6679114)
chr8 (16-260)||(14564902-14565145)
chr8 (16-260)||(804451-804694)
chr8 (68-260)||(27346986-27347177)
chr8 (135-258)||(23649846-23649969)
chr8 (26-260)||(20387873-20388109)
chr8 (100-260)||(22433118-22433278)
chr8 (17-260)||(21325186-21325428)
chr8 (83-260)||(28982117-28982293)
chr8 (83-260)||(28987337-28987513)
chr8 (16-260)||(6603418-6603661)
chr8 (32-260)||(12304521-12304748)
chr8 (108-260)||(22062249-22062400)
chr8 (104-260)||(12912834-12912989)
chr8 (17-260)||(31417250-31417492)
chr8 (17-259)||(21682246-21682487)
chr8 (19-260)||(20010678-20010918)
chr8 (158-260)||(22984943-22985045)
chr8 (17-213)||(19851220-19851416)
chr8 (17-213)||(19857256-19857452)
chr8 (1-153)||(22987070-22987222)
chr8 (17-256)||(23654694-23654932)
chr8 (18-256)||(20007617-20007854)
chr8 (65-256)||(31571666-31571856)
chr8 (189-262)||(22029785-22029858)
chr8 (92-256)||(36799977-36800140)
chr8 (17-260)||(1266002-1266244)
chr8 (2-96)||(23649967-23650061)
chr8 (152-260)||(20972721-20972828)
chr8 (17-60)||(22062209-22062252)
chr8 (155-256)||(19867460-19867561)
chr8 (185-256)||(19862823-19862894)
chr8 (206-260)||(3274276-3274330)
chr8 (226-260)||(22423097-22423131)
chr8 (206-260)||(6607086-6607139)
chr8 (207-260)||(22004687-22004739)
chr8 (192-256)||(24818567-24818630)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-262)||(14085-14346)
scaffold0044 (1-262)||(345-606)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-262)||(64351-64612)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (1-262)||(23573368-23573629)
chr5 (2-260)||(21984805-21985063)
chr5 (1-262)||(22134294-22134555)
chr5 (1-262)||(22333386-22333647)
chr5 (1-262)||(15000238-15000499)
chr5 (1-262)||(29476572-29476833)
chr5 (1-262)||(34566120-34566381)
chr5 (1-262)||(16356128-16356389)
chr5 (1-262)||(27685899-27686159)
chr5 (1-262)||(18775403-18775664)
chr5 (1-262)||(22344732-22344993)
chr5 (1-262)||(27518033-27518294)
chr5 (1-262)||(41770468-41770729)
chr5 (1-262)||(27609980-27610241)
chr5 (1-262)||(27668989-27669250)
chr5 (1-262)||(37291995-37292256)
chr5 (1-256)||(20573153-20573408)
chr5 (1-262)||(19769586-19769847)
chr5 (2-260)||(21343858-21344116)
chr5 (1-262)||(40708406-40708667)
chr5 (2-260)||(25422828-25423075)
chr5 (1-260)||(26739204-26739463)
chr5 (87-262)||(26681866-26682041)
chr5 (87-262)||(26953473-26953648)
chr5 (1-155)||(23516274-23516428)
chr5 (2-253)||(23470864-23471115)
chr5 (17-260)||(24736126-24736368)
chr5 (17-260)||(24737300-24737542)
chr5 (17-260)||(24750069-24750311)
chr5 (17-259)||(23080604-23080845)
chr5 (3-142)||(21881562-21881701)
chr5 (2-260)||(21625147-21625404)
chr5 (2-260)||(21662539-21662797)
chr5 (16-260)||(20341890-20342133)
chr5 (17-260)||(21404464-21404707)
chr5 (81-260)||(20468673-20468852)
chr5 (17-260)||(20773371-20773613)
chr5 (83-257)||(21564533-21564708)
chr5 (17-258)||(17269848-17270088)
chr5 (16-260)||(37546014-37546257)
chr5 (17-256)||(22380814-22381052)
chr5 (17-260)||(22502290-22502532)
chr5 (17-260)||(28895457-28895699)
chr5 (17-260)||(28924283-28924525)
chr5 (83-260)||(14887575-14887751)
chr5 (19-260)||(21496244-21496484)
chr5 (20-260)||(22461563-22461802)
chr5 (16-260)||(24798914-24799157)
chr5 (16-260)||(25847683-25847926)
chr5 (140-259)||(21877639-21877757)
chr5 (17-260)||(23442808-23443050)
chr5 (83-260)||(6403129-6403305)
chr5 (46-140)||(20767718-20767812)
chr5 (17-260)||(22236435-22236677)
chr5 (1-84)||(23440029-23440112)
chr5 (17-131)||(20821192-20821306)
chr5 (206-260)||(23669590-23669644)
chr5 (206-260)||(16258392-16258446)
chr5 (206-260)||(22592111-22592165)
chr5 (206-260)||(22595666-22595720)
chr5 (206-260)||(43122426-43122479)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-262)||(5739-6000)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-262)||(1142-1403)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-262)||(179942-180203)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-262)||(27692-27953)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-262)||(40109-40370)
scaffold0042 (1-262)||(65132-65391)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (1-262)||(14332080-14332341)
chr7 (1-262)||(17642-17904)
chr7 (1-262)||(13634047-13634308)
chr7 (1-262)||(8707288-8707549)
chr7 (1-262)||(11553428-11553689)
chr7 (1-262)||(18552084-18552345)
chr7 (1-262)||(23517095-23517356)
chr7 (1-262)||(11237539-11237800)
chr7 (1-262)||(13685746-13686007)
chr7 (1-262)||(15161383-15161644)
chr7 (1-260)||(12254364-12254623)
chr7 (1-262)||(12687184-12687445)
chr7 (1-262)||(44791677-44791938)
chr7 (1-261)||(14347521-14347781)
chr7 (1-262)||(18177425-18177686)
chr7 (1-262)||(8198311-8198572)
chr7 (1-262)||(10870678-10870939)
chr7 (1-261)||(14037491-14037751)
chr7 (21-260)||(15163767-15164005)
chr7 (17-260)||(6413198-6413440)
chr7 (19-260)||(11388749-11388989)
chr7 (17-258)||(14286696-14286936)
chr7 (1-260)||(15203564-15203823)
chr7 (17-258)||(15340185-15340425)
chr7 (16-260)||(11306585-11306828)
chr7 (17-258)||(14129562-14129802)
chr7 (17-258)||(14433380-14433620)
chr7 (17-260)||(8212451-8212693)
chr7 (1-130)||(14954435-14954564)
chr7 (16-260)||(49151985-49152228)
chr7 (17-260)||(12207120-12207362)
chr7 (32-258)||(13021045-13021271)
chr7 (17-256)||(21661653-21661892)
chr7 (65-260)||(26118952-26119146)
chr7 (68-256)||(12455394-12455581)
chr7 (17-260)||(26288356-26288598)
chr7 (18-260)||(1728-1969)
chr7 (14-260)||(16950788-16951033)
chr7 (83-260)||(16072684-16072860)
chr7 (17-260)||(19146898-19147140)
chr7 (17-260)||(20746297-20746539)
chr7 (92-256)||(18054348-18054511)
chr7 (171-261)||(15624450-15624540)
chr7 (83-260)||(13665254-13665430)
chr7 (17-258)||(14264564-14264804)
chr7 (83-260)||(15102973-15103149)
chr7 (17-256)||(23200063-23200301)
chr7 (17-256)||(23506190-23506428)
chr7 (17-156)||(15479458-15479597)
chr7 (207-260)||(1493569-1493622)
chr7 (207-260)||(15114234-15114287)
chr7 (214-260)||(16928891-16928937)
chr7 (207-260)||(10306339-10306391)
chr7 (207-260)||(11311475-11311527)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (1-262)||(16355502-16355763)
chr4 (1-262)||(8053680-8053941)
chr4 (1-262)||(8386106-8386367)
chr4 (1-262)||(12523370-12523631)
chr4 (1-262)||(14304034-14304295)
chr4 (1-262)||(23955441-23955702)
chr4 (1-262)||(29039461-29039722)
chr4 (1-262)||(40472734-40472995)
chr4 (1-262)||(18227503-18227764)
chr4 (1-262)||(19778850-19779111)
chr4 (1-260)||(14927316-14927575)
chr4 (1-262)||(14266956-14267217)
chr4 (1-262)||(14680261-14680522)
chr4 (1-262)||(15364080-15364341)
chr4 (1-262)||(27711030-27711291)
chr4 (1-262)||(12476294-12476555)
chr4 (1-262)||(18296899-18297160)
chr4 (1-209)||(15351943-15352151)
chr4 (1-260)||(14159189-14159447)
chr4 (17-256)||(14851439-14851678)
chr4 (1-262)||(18607887-18608147)
chr4 (1-260)||(14652004-14652263)
chr4 (95-260)||(7090159-7090324)
chr4 (16-260)||(3265129-3265372)
chr4 (17-256)||(1649610-1649848)
chr4 (21-260)||(15415316-15415554)
chr4 (17-256)||(20890684-20890922)
chr4 (16-260)||(11207566-11207809)
chr4 (1-131)||(16252502-16252632)
chr4 (16-260)||(29453872-29454115)
chr4 (86-260)||(15319281-15319453)
chr4 (17-256)||(33222619-33222857)
chr4 (17-260)||(44662199-44662441)
chr4 (20-260)||(15326241-15326480)
chr4 (17-260)||(15003697-15003939)
chr4 (17-260)||(15245621-15245863)
chr4 (65-256)||(42702604-42702794)
chr4 (65-256)||(51606562-51606752)
chr4 (83-260)||(18164534-18164710)
chr4 (17-260)||(15359390-15359632)
chr4 (17-209)||(15070160-15070352)
chr4 (2-66)||(7090323-7090387)
chr4 (185-256)||(18550561-18550633)
chr4 (206-260)||(13879153-13879207)
chr4 (188-256)||(15293661-15293729)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (1-260)||(16963829-16964088)
chr6 (1-260)||(16928102-16928361)
chr6 (2-260)||(18408406-18408664)
chr6 (1-262)||(2875265-2875526)
chr6 (1-262)||(21833443-21833704)
chr6 (1-262)||(22433555-22433816)
chr6 (1-262)||(24313630-24313891)
chr6 (1-262)||(16550623-16550884)
chr6 (1-262)||(16627179-16627440)
chr6 (2-259)||(25610324-25610581)
chr6 (1-262)||(29592382-29592643)
chr6 (2-260)||(27331896-27332154)
chr6 (2-260)||(27392636-27392894)
chr6 (1-262)||(1543546-1543807)
chr6 (1-262)||(12497584-12497845)
chr6 (1-255)||(25765751-25766005)
chr6 (1-260)||(25112112-25112371)
chr6 (1-262)||(17032120-17032381)
chr6 (2-260)||(22762918-22763175)
chr6 (1-248)||(12511056-12511303)
chr6 (1-260)||(23078029-23078288)
chr6 (1-262)||(27186994-27187255)
chr6 (1-262)||(27261985-27262246)
chr6 (1-262)||(28263659-28263920)
chr6 (1-262)||(28342408-28342669)
chr6 (1-256)||(28292834-28293090)
chr6 (2-180)||(5839682-5839860)
chr6 (17-260)||(21564610-21564852)
chr6 (130-262)||(19864272-19864404)
chr6 (90-260)||(22079209-22079379)
chr6 (17-261)||(14131657-14131900)
chr6 (7-260)||(18198001-18198254)
chr6 (1-153)||(12505022-12505174)
chr6 (81-256)||(19167337-19167512)
chr6 (17-256)||(21471166-21471404)
chr6 (17-260)||(11288076-11288318)
chr6 (17-260)||(24363973-24364215)
chr6 (83-260)||(1640355-1640533)
chr6 (153-262)||(18932370-18932479)
chr6 (17-260)||(8766626-8766868)
chr6 (17-260)||(15458897-15459139)
chr6 (158-260)||(20595045-20595147)
chr6 (83-260)||(17025849-17026025)
chr6 (158-262)||(1537616-1537720)
chr6 (17-229)||(18794281-18794493)
chr6 (86-257)||(28949154-28949325)
chr6 (17-260)||(34646064-34646306)
chr6 (1-105)||(19864402-19864506)
chr6 (17-260)||(19878859-19879101)
chr6 (17-260)||(25750370-25750612)
chr6 (83-260)||(10469393-10469568)
chr6 (83-260)||(18787449-18787625)
chr6 (17-256)||(28283291-28283529)
chr6 (167-259)||(22797237-22797328)
chr6 (92-256)||(27561170-27561333)
chr6 (182-260)||(19428686-19428763)
chr6 (2-60)||(22079151-22079209)
chr6 (208-258)||(18659829-18659879)
chr6 (206-260)||(25959072-25959126)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-262)||(16682-16943)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (2-256)||(1014-1268)
scaffold0161 (208-261)||(35903-35956)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (2-260)||(13766-14024)
scaffold0106 (84-260)||(31138-31313)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-262)||(4725-4986)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-262)||(8321-8582)
scaffold0109 (2-262)||(33894-34154)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-262)||(302-563)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-262)||(7102-7363)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-262)||(308384-308645)
scaffold0005 (1-260)||(165029-165288)
scaffold0005 (1-180)||(279150-279329)
scaffold0005 (17-258)||(260038-260278)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (1-262)||(16079022-16079283)
chr1 (1-262)||(19106076-19106337)
chr1 (1-260)||(20136489-20136748)
chr1 (2-260)||(20249561-20249819)
chr1 (1-262)||(33391418-33391679)
chr1 (1-262)||(21836659-21836920)
chr1 (2-260)||(21747246-21747504)
chr1 (1-262)||(51333882-51334143)
chr1 (1-260)||(21162991-21163250)
chr1 (1-261)||(21830013-21830273)
chr1 (1-262)||(16350988-16351249)
chr1 (1-262)||(41354858-41355119)
chr1 (1-256)||(50612805-50613059)
chr1 (1-256)||(50620633-50620887)
chr1 (17-260)||(20243912-20244154)
chr1 (17-256)||(22433521-22433759)
chr1 (1-260)||(19761255-19761512)
chr1 (17-260)||(20294124-20294366)
chr1 (17-260)||(31550586-31550828)
chr1 (16-260)||(20395400-20395643)
chr1 (16-260)||(37676788-37677031)
chr1 (17-260)||(20857166-20857408)
chr1 (35-260)||(20075485-20075709)
chr1 (17-260)||(19665281-19665523)
chr1 (1-104)||(17045404-17045507)
chr1 (155-256)||(24476708-24476808)
chr1 (17-200)||(20940468-20940651)
chr1 (83-222)||(21736502-21736641)
chr1 (206-259)||(20921502-20921555)
chr1 (195-260)||(22465788-22465852)
chr1 (194-260)||(297723-297789)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-260)||(16785-17043)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (2-260)||(6000-6258)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (3-262)||(37068-37327)
scaffold0023 (17-260)||(19074-19316)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (2-260)||(866-1124)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (2-260)||(9070-9328)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-262)||(42879-43140)
scaffold0028 (12-262)||(8210-8460)
scaffold0028 (74-262)||(62014-62202)
scaffold0028 (21-260)||(2467-2706)
scaffold0028 (17-260)||(50850-51092)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (2-260)||(10658-10914)
scaffold0120 (2-66)||(5944-6008)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-259)||(4949-5207)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-258)||(405-662)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-262)||(33072-33333)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (1-262)||(26241-26502)
scaffold0165 (83-260)||(905-1081)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-260)||(228770-229029)
scaffold0012 (1-260)||(219737-219996)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-261)||(6664-6923)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-262)||(7536-7784)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-262)||(127519-127780)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (2-260)||(161839-162098)
scaffold0001 (1-256)||(447790-448045)
scaffold0001 (140-254)||(91386-91499)
scaffold0001 (216-260)||(154680-154723)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (2-260)||(15220-15478)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-262)||(139-400)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (20-260)||(30638-30878)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (3-260)||(732-989)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (17-260)||(18848-19090)
scaffold0058 (17-257)||(59108-59348)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-260)||(14604-14863)
[»] scaffold0114 (5 HSPs)
scaffold0114 (51-226)||(32098-32273)
scaffold0114 (17-229)||(35813-36025)
scaffold0114 (17-260)||(19850-20092)
scaffold0114 (2-259)||(43234-43490)
scaffold0114 (2-60)||(44444-44502)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-260)||(3759-4018)
[»] scaffold0379 (3 HSPs)
scaffold0379 (17-260)||(13313-13556)
scaffold0379 (216-260)||(8499-8543)
scaffold0379 (216-260)||(15691-15735)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (17-259)||(15695-15936)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (51-236)||(4979-5164)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (1-260)||(580-840)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-258)||(111750-112007)
scaffold0004 (2-256)||(203789-204042)
scaffold0004 (83-260)||(385547-385723)
scaffold0004 (32-260)||(117298-117525)
scaffold0004 (17-260)||(322432-322674)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-260)||(16714-16973)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-256)||(16736-16991)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (17-260)||(26055-26298)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (17-258)||(973-1213)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (17-258)||(49543-49783)
scaffold0071 (206-260)||(15656-15710)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (17-260)||(15415-15658)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (14-169)||(17668-17823)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (17-260)||(117241-117484)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-260)||(1949-2208)
scaffold0010 (17-260)||(42669-42911)
scaffold0010 (17-260)||(47735-47977)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (81-260)||(1024-1203)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (116-262)||(11642-11788)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (17-260)||(25407-25649)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (17-260)||(256-498)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (16-260)||(39225-39468)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (17-260)||(29105-29349)
scaffold0064 (17-260)||(41096-41340)
scaffold0064 (165-262)||(63383-63480)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (134-262)||(12764-12892)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (17-260)||(5926-6169)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (17-260)||(38533-38776)
scaffold0035 (17-260)||(43212-43455)
scaffold0035 (185-256)||(13699-13770)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (32-258)||(42513-42738)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (17-256)||(7372-7610)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (17-256)||(10556-10794)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (17-260)||(10419-10661)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (17-256)||(61549-61787)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (2-260)||(11-269)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (139-260)||(6142-6263)
scaffold0403 (2-97)||(6262-6357)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (17-229)||(13117-13329)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (17-213)||(58152-58347)
scaffold0053 (17-259)||(49369-49609)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (32-256)||(248345-248568)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (17-260)||(17049-17291)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (14-155)||(117194-117335)
scaffold0029 (17-259)||(112288-112529)
scaffold0029 (17-260)||(96338-96580)
scaffold0029 (151-262)||(124814-124925)
[»] scaffold1550 (1 HSPs)
scaffold1550 (140-260)||(1-121)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (65-260)||(2320-2514)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (17-255)||(735-972)
scaffold0124 (17-260)||(10616-10858)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (17-257)||(11075-11314)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (17-260)||(2201-2443)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-204)||(6760-6963)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (17-260)||(5338-5580)
[»] scaffold0093 (2 HSPs)
scaffold0093 (17-256)||(25993-26231)
scaffold0093 (123-256)||(36661-36793)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (17-260)||(34013-34255)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (83-260)||(36930-37106)
scaffold0026 (92-166)||(26663-26737)
[»] scaffold0947 (1 HSPs)
scaffold0947 (17-260)||(2767-3009)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (17-256)||(17526-17765)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (83-260)||(6301-6478)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (17-255)||(18582-18819)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (17-191)||(86840-87014)
scaffold0007 (205-259)||(163181-163235)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (3-260)||(135847-136103)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (167-260)||(36831-36924)
scaffold0011 (152-260)||(148323-148430)
scaffold0011 (83-260)||(196086-196262)
scaffold0011 (17-111)||(148446-148540)
scaffold0011 (1-60)||(26853-26912)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (17-260)||(4475-4717)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (17-260)||(19711-19953)
scaffold0298 (17-165)||(13697-13845)
scaffold0298 (17-165)||(17467-17615)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (17-260)||(26201-26443)
scaffold0113 (68-256)||(16408-16595)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (17-258)||(96097-96337)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (81-260)||(839-1018)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (17-260)||(52199-52441)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (83-260)||(13591-13767)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (83-260)||(60642-60818)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (17-177)||(1-161)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (83-259)||(9527-9702)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (17-260)||(9213-9455)
scaffold0203 (17-260)||(14587-14829)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (20-258)||(46857-47094)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (83-260)||(3619-3795)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (83-260)||(1151-1327)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (182-262)||(7610-7690)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (17-260)||(3691-3933)
scaffold0326 (17-260)||(18873-19115)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (17-260)||(13814-14056)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-260)||(26953-27196)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (17-260)||(45572-45814)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (17-172)||(2955-3110)
scaffold0074 (193-260)||(2892-2959)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (17-255)||(3604-3841)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (84-260)||(5321-5496)
scaffold0034 (83-260)||(14308-14484)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (21-260)||(5911-6149)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (17-260)||(1484-1726)
scaffold0139 (17-260)||(27247-27489)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (83-260)||(3629-3805)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (143-260)||(4577-4694)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (17-260)||(8947-9189)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (17-260)||(39468-39709)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (145-260)||(1662-1776)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (83-260)||(22078-22254)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (83-256)||(1141-1313)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (195-260)||(10354-10419)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (144-260)||(8621-8736)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (167-255)||(20426-20513)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (183-260)||(26807-26883)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (113-213)||(194667-194767)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (206-259)||(12211-12264)
scaffold0046 (208-259)||(6-57)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (141-260)||(8109-8227)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (188-260)||(29084-29156)
[»] scaffold1243 (1 HSPs)
scaffold1243 (113-163)||(275-325)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (206-260)||(1012-1066)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (206-256)||(1599-1649)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (17-111)||(7570-7664)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (93-229)||(1567-1703)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (207-260)||(1202-1254)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (207-260)||(25545-25597)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (216-260)||(10785-10828)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (208-260)||(17055-17107)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24675075 - 24674814
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24675075 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagaccttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgaggggc 24674976  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24674975 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 24674876  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24674875 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 24674814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 45676706 - 45676967
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45676706 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 45676805  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45676806 aaggaaataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 45676905  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45676906 ttgcatgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttataacgcccac 45676967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 21326123 - 21326384
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21326123 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactaaaccggtaaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgaggggc 21326222  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21326223 aaagtgataccccttgttagagtcgtttaggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggaatcttatccagagttgt 21326322  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326323 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 21326384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23188594 - 23188333
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23188594 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccagtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 23188495  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23188494 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagtaactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 23188395  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23188394 ttgcttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 23188333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23599857 - 23599596
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23599857 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccagtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 23599758  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23599757 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagtaactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 23599658  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23599657 ttgcttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 23599596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23061884 - 23061626
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23061884 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaatgattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 23061785  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23061784 aggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacagaacgactggtgaaagcttaacgtgggagctacagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 23061685  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23061684 tgtttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 23061626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24709619 - 24709358
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24709619 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 24709520  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24709519 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 24709420  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24709419 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 24709358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9609722 - 9609461
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9609722 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 9609623  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9609622 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 9609523  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9609522 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 9609461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27370855 - 27370594
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27370855 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaagc 27370756  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27370755 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 27370656  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27370655 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27370594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24261956 - 24261695
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24261956 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgaaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaacacgttgagaggc 24261857  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24261856 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 24261757  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24261756 tcgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 24261695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 41609201 - 41609462
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41609201 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 41609300  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41609301 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagttttatccagagttgt 41609400  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41609401 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 41609462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 262
Target Start/End: Original strand, 24878859 - 24879113
Alignment:
Q  8 atccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggaga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878859 atccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggcaaggaga 24878958  T
Q  108 taccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttg 207  Q
    |||  || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  24878959 tacatctcgtgagagtcgtttggacaggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaaaatgttggagtcttatctagagttgtttgcttg 24879058  T
Q  208 aggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24879059 aggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 24879113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10868436 - 10868175
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10868436 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttaccgttgaggattgatgatcgcaaagtgaagacgttgagaggc 10868337  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10868336 aaggagatacctctcgtgagaatcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 10868237  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10868236 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 10868175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16981738 - 16981477
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16981738 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16981639  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16981638 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16981539  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16981538 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 16981477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17063303 - 17063042
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17063303 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 17063204  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17063203 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 17063104  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17063103 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 17063042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23138623 - 23138365
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23138623 tcatgtgatccaaagtgatgatgtacaagttagagataaccttacagttgagactttaccggtaaggattgatgattgaaaagtgaagacgttgagaggc 23138524  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  23138523 aatgagatacctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcatatccagagttgt 23138424  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23138423 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttat-agttggggagagttgtaacgccc 23138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27217602 - 27217340
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27217602 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27217503  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217502 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 27217403  T
Q  201 ttgcttgaggt-aaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27217402 ttgcttgaggtaaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27217340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16924846 - 16924585
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16924846 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacagtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16924747  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16924746 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16924647  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16924646 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 16924585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16998586 - 16998325
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16998586 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacagtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16998487  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16998486 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16998387  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16998386 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 16998325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 44379756 - 44380017
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44379756 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 44379855  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44379856 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggttaggagcgactggtgaaagcttgacgtaggagcttgggagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 44379955  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44379956 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 44380017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 44386426 - 44386687
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44386426 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 44386525  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44386526 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggttaggagcgactggtgaaagcttgacgtaggagcttgggagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 44386625  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44386626 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 44386687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23550413 - 23550155
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23550413 tcatgtgatccaaagtgatgatgtacaagttagagataaccttacagttgagactttaccggtaaggattgatgattgaaaagtgaagacgttgagaggc 23550314  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  23550313 aatgagatacctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggaaatagagagtaagatgatggaatcatatccagagttgt 23550214  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23550213 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttat-agttggggagagttgtaacgccc 23550155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 21145887 - 21146149
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatga-tgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagagg 99  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21145887 tcatgtaatccagagtgacgaatgtgcaagttagggacaaccttacggtagagactttaccggtgaggatcgatgatcgtagagtgaagacgttgagagg 21145986  T
Q  100 caaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttg 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||   || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21145987 caaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggggcgactcgtgaaagctagacgtgggagcttgagagtaagatgatggagtcttatccagagttg 21146086  T
Q  200 tttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21146087 tttgcttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 21146149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 22325713 - 22325960
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22325713 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22325812  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||              |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22325813 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttgg--------------tgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 22325898  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22325899 ttgcttaaggtgaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 22325960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22757320 - 22757508
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22757320 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgaagatcggaaagtgaagacgttgagaggc 22757419  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtctta 189  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22757420 aaggagatatctcttgtgcgagtcgtttgggatggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctggagagtaagatgctggagtctta 22757508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 27385700 - 27385828
Alignment:
Q  134 ggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27385700 ggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatct 27385799  T
Q  234 tataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27385800 tttaagttggggagagttgtaacgcccac 27385828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 24833446 - 24833689
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  24833446 gatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagacctcaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagacgttgagaggcaaagagatacttcttg 24833545  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||| || |||||| | |  || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  24833546 tgaaagtcgtttgggaaggaggggctggagaaagcttaacgtgggagttgggaagcaagatgcaggattcttatccagagttgtttgcatgacgtacatt 24833645  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24833646 ttcgaggatgaaaattctataagttggggagagttgtaacgccc 24833689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45529080 - 45528846
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| | |||  ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  45529080 gatgatgtgcaagtgagagacaaccttacgatcgagaccttaccaatgaggattgaaggtcgtgaagtgaagaagctgggaggcaaggagatacctcttg 45528981  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  45528980 tgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagtttgatgtgggagttagagagtaagatgctggagtcgtatccagagttatttgaatgaggtacatt 45528881  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagtt 251  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  45528880 ttcgaggacgaaaatattctaagtgggggagagtt 45528846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27377328 - 27377458
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27377328 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 27377427  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27377428 aaggagataccccttgttagagtcgtttggg 27377458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1063319 - 1063076
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  ||||||||||  | |||||||| || |||||||| |||    
T  1063319 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaagtgaaatccttgagaggtaaagagatacctctt 1063220  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  1063219 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 1063120  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  1063119 tttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 1063076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31830226 - 31829983
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | ||||| || ||   ||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  31830226 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgaccgttgagactatgccattgaggatagatgacaaaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 31830127  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  31830126 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 31830027  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  31830026 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 31829983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 11358747 - 11358989
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  11358747 gatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 11358846  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  11358847 tgagagtcgtttggggtggagcggctggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 11358946  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  11358947 ttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 11358989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 27365952 - 27366194
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||| | || |||||  | |||||||| || |||||||| ||||    
T  27365952 gatgacgtgcaagttagagacaacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgataggaaggtgaaatctttgagaggtaaagagataccgcttg 27366051  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  27366052 tgagagtcgtttggggtggagcgactggagaaagtttaacttgggagctggaaagtaagatgcgggagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 27366151  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27366152 ttcgaggacg-aaatcctctaagttggggagagttgtaacgccc 27366194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20832553 - 20832310
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  | || |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  20832553 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacaggaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 20832454  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  20832453 gtgagagtcgtttggggtggagcggctggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaggatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 20832354  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20832353 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 20832310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23087020 - 23086776
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||  | || ||||| | ||   |  |||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  23087020 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacgattgagaccttaccgttgagaattgaaggtcctgagatgaagaagttgagaggcaaggagatacctctag 23086921  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa-at 215  Q
    | | |||||||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||    
T  23086920 taaaagtcgtttggggaggagcggctgatgaaagtttgacatgggagctggagagtaaaatgatggagtcttatcaagagttatttgcatgaagtaatat 23086821  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  23086820 tttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 23086776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 30211790 - 30212029
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||| | |||||||| | |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  30211790 gatgatgtgcaagtgagagacaatcttacgatcgagaccttaccactgaggattgaaggtcgtgaagtgaagaagctgagaggcaaggagatacctcttg 30211889  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||| | ||||  ||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  30211890 tgaaagtcgtttggggaggagcggctggtgaaagtttgacgtgagagttggagagcaagatgttggagttgtatccagagttatttgaatgaggtacatt 30211989  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  30211990 ttcgaggacaaaaatattctaagtgggggagagttataac 30212029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23265719 - 23265543
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  23265719 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 23265620  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  23265619 agtcttatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 23265543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23293527 - 23293290
Alignment:
Q  18 atgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgt 117  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||    
T  23293527 atgatgtgcaggttagagacaaccttaccgttgagaccttaccattgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagt 23293428  T
Q  118 gagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattt 217  Q
    ||  || ||| |||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  23293427 gaaggttgttgggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccaaagttgtttgattgaggtaagatt 23293328  T
Q  218 tcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  23293327 tcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaac 23293290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 262
Target Start/End: Original strand, 25962451 - 25962531
Alignment:
Q  182 gagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25962451 gagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacggaaatcttataagttagggagagttgtaacgcccac 25962531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27787263 - 27787073
Alignment:
Q  65 aggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagc 164  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  27787263 aggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacccttggtgagagtcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagc 27787164  T
Q  165 ttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    | || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  27787163 tggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 27787073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24653915 - 24653703
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  24653915 gatgatgtgtaggtaagagacaaccttacaatggagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 24653816  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24653815 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagat 24653716  T
Q  217 ttcgaggatgaaa 229  Q
    |||||||| ||||    
T  24653715 ttcgaggacgaaa 24653703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12573842 - 12573685
Alignment:
Q  98 ggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagt 197  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||| ||||    
T  12573842 ggcaaggaaatacccttggtgagagtagtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatcctgagt 12573743  T
Q  198 tgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  12573742 tgtttgtttgaggtaagatttcgaggacg-aaatttagtaatttggggagagttgtaac 12573685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 24708339 - 24708423
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  24708339 tcatgtgatccacagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttac-gtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtga 24708423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23276346 - 23276184
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||   | |||||||| || |   | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  23276346 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacagttgagaccttacagttgaggattgaagaccatgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 23276247  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgc 179  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23276246 tgaaggttgtttggggtggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgc 23276184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24944937 - 24944775
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||  | |||| || ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  24944937 gatgatgtgcacgttagagacaaccttacagttgagaccttaccgatgaggattgaagatcgtgaggtgatgaagtttagaggcaaggatatacctctag 24944838  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgc 179  Q
    |||  || |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24944837 tgaaggttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgc 24944775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30800381 - 30800309
Alignment:
Q  188 tatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  30800381 tatccagagttgtttgaatgaggtacattttcgaggacgaaaatattttaagtgggggagagttataacgccc 30800309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24944772 - 24944707
Alignment:
Q  194 gagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  24944772 gagttgtttgattgaggtaaaatttcgagcatgaaattctc-taagttggggagagttgtaatgccc 24944707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28350604 - 28350550
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28350604 tgaggtacattttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 28350550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12830410 - 12830366
Alignment:
Q  218 tcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12830410 tcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 12830366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 21240486 - 21240538
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  21240486 gaggtatattttcgaggacgaaaattcta-aagttggggagagttgtaacgccc 21240538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31504887 - 31504835
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31504887 gaggtatattttcgaggacgaaaattcta-aagttggggagagttgtaacgccc 31504835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19802785 - 19802742
Alignment:
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19802785 tttcgaggacgaaattctt-taagttggggagagttgtaacgccc 19802742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12497822 - 12497561
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12497822 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 12497723  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12497722 aaggaaataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 12497623  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12497622 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 12497561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16370987 - 16370727
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16370987 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccagtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgaggggc 16370888  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16370887 aaggaaataccccttgtgagagtcgtttggga-ggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctagagtcttatccagagttgt 16370789  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16370788 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttgttagttggggagagttgtaacgcccac 16370727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 14877055 - 14877316
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14877055 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttacttgtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 14877154  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14877155 aaggatatacctcttgtgagagtcgtttggaacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatctagagttgt 14877254  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14877255 ttgcttgaggtaaattttagaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 14877316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 11297079 - 11297340
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11297079 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaagcttacggtagagactttacccgtgaggattgatgatcggaaagtgaagatgttgagaggc 11297178  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  11297179 aaggagataccccttgtgagaatcgtttaggacggagcgactgatgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatctagatttgt 11297278  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11297279 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 11297340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 16807482 - 16807742
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16807482 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagatgttgagaggc 16807581  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16807582 aaggagataccccttgttagagtcgttagggctggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagaattgt 16807681  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  16807682 ttgcttgagataaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgcaatgccca 16807742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9522292 - 9522034
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522292 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 9522193  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  9522192 aggatatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgttggaatcttatccagagttgtt 9522093  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9522092 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagtttgggagagttgtaaagccc 9522034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 15725489 - 15725750
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15725489 tcatgtgatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15725588  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacg-gagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttg 199  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15725589 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttgg-acgagagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttg 15725687  T
Q  200 tttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15725688 tttgcttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 15725750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17489423 - 17489165
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489423 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 17489324  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  17489323 aggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacagagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgttggaatcttatccagagttgtt 17489224  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17489223 tgcttgaggtaaattttcgacgacgacaatcttataagttggggagagttgtaaagccc 17489165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 15348801 - 15349062
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15348801 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccagtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15348900  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15348901 aaggagatacctctcgtaagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 15349000  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15349001 ttgcttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 15349062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16635347 - 16635086
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16635347 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16635248  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16635247 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16635148  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16635147 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 16635086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43162671 - 43162410
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43162671 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 43162572  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43162571 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 43162472  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43162471 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 43162410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16691733 - 16691473
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||    
T  16691733 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagacattaccggtgaggattgatgatcgggaagtgaagacgctaagaggca 16691634  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16691633 aggagatatcccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 16691534  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16691533 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 16691473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 15403066 - 15403327
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15403066 tcatgtaatccagagtgacgatgtgcaaggtagagacaaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgacgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15403165  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15403166 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaaaatgctggagtcttatccagagttgt 15403265  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15403266 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 15403327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 26792955 - 26793216
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26792955 tcatgtaatccaaagtgtcgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 26793054  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26793055 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccatagttgt 26793154  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26793155 ttgcttgaggtaaattttcgaggaagaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 26793216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15338843 - 15338582
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15338843 tcatgtaatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgacgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15338744  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15338743 aaggagatacctctcgtgagagtcatttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaaaatgctggagtcttgtccagagttgt 15338644  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  15338643 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggagagagttgtaacgcccac 15338582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 16492738 - 16492996
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492738 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataatcttacggttgagactttaccggtaaggattaatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 16492837  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16492838 aggagatacctcttatgagagacgtttgggacgaagcgactggtgaaagcttgacgtgcgagctagagagtaagatgctggaatcatatccagagttgtt 16492937  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492938 tgcttgaggtaaattttagaggacgaaaatgttataagttggggagagttgtaacgccc 16492996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13252264 - 13252003
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13252264 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 13252165  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13252164 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttacccagagttgt 13252065  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13252064 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 13252003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10005174 - 10004913
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10005174 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgacgatcgtaaagtgaaaacgttgagaggc 10005075  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10005074 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggaacttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 10004975  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10004974 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 10004913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10905784 - 10905523
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10905784 tcatgtaatccaaagcgacgatgtacaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgacgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 10905685  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10905684 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggaacttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 10905585  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10905584 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 10905523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 15589948 - 15590209
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15589948 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15590047  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15590048 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatctagagttgt 15590147  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15590148 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaagatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 15590209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48425021 - 48424760
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48425021 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 48424922  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48424921 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 48424822  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48424821 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 48424760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 320803 - 320546
Alignment:
Q  5 gtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaagg 104  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  320803 gtgatccaaagagatgatgtccaagttagagataaccttacggttgagaccttaccggtgagaattgaagatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaag 320704  T
Q  105 agataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgc 204  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  320703 agatacctcttatgaaagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaatgtgggagatagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgc 320604  T
Q  205 ttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  320603 atgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 320546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 20062610 - 20062871
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20062610 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 20062709  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20062710 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtctaatccagagttgt 20062809  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20062810 ttgcttgaggtaaattttcgagtacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 20062871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 31689184 - 31689426
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31689184 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccctg 31689283  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  31689284 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaggatgcgggagtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaagat 31689383  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  31689384 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 31689426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31945040 - 31944798
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31945040 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaattgaagactttgagaggcaaggagataccccttg 31944941  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  31944940 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaggatgcgggagtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaagat 31944841  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  31944840 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 31944798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6600321 - 6600060
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6600321 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 6600222  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  6600221 aaagagatacctctcgtgaaagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggaatcgtatccagagttgt 6600122  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6600121 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 6600060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16757141 - 16757402
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16757141 tcatgtcattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 16757240  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16757241 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccatagttgt 16757340  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16757341 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacacccac 16757402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14974408 - 14974180
Alignment:
Q  32 agagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  14974408 agagataaccttacggttgagactttaccggtaagaattgatgatcgaaaagtgaagacgtagagaggcaaggagatacctcttgtgagagtcgtttggt 14974309  T
Q  132 acggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaat 231  Q
    ||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14974308 acggatccactggtgaaagcttcacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaat 14974209  T
Q  232 cttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14974208 cttataagttgaggagagttgttacgccc 14974180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15208465 - 15208206
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208465 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccggtgagaattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 15208366  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || ||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15208365 aaagaggtacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagtggctggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggagtcttatccggagttgt 15208266  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  15208265 ttgcaagaggtaaattttcgaggacgaaaatcctataagttggggggatttgtaacgccc 15208206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 53385574 - 53385835
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  53385574 tcatgtaattcagagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 53385673  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53385674 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggcgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 53385773  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  53385774 ttacttaaggtaaattattgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 53385835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16412838 - 16413058
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16412838 tcatgtaatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagacgttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16412937  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16412938 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggttaaagcttgacgtgggagcttgaaagtaagatgcatgagtcttatctagagttgt 16413037  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcga 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16413038 ttgcttgaggtaaattttcga 16413058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15247421 - 15247162
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15247421 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttaccgttaagaccttaccggtgagaattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 15247322  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15247321 aaagagatatctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagtggctggtgaaagcttaatgtgggagttggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 15247222  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15247221 ttgcacgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctataagttggggggagttgtaacgccc 15247162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 117 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16810832 - 16810687
Alignment:
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16810832 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctagcgtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 16810733  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16810732 ttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 16810687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9514224 - 9514059
Alignment:
Q  95 agaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccag 194  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  9514224 agaggcaaggatatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgttggaatcttatccag 9514125  T
Q  195 agttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9514124 agttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagtttgggagagttgtaaagccc 9514059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 16837065 - 16837305
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16837065 gatgatgtgcaggttagagacaatctcactgttgagactttaccggtgaggattgacgatcggaaggtgaagacgttaaggggtaaggaaataccccttg 16837164  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  16837165 tgagagtcgtttggggcggagcgattggtgaaagcttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 16837264  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16837265 ttcgaggacgaaattc-tataatttggggagagttgtaacgc 16837305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 14542908 - 14543146
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14542908 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagaccacgccggtgaggattgacgatcggaaagtgaaggctttgaggggcaaggaaataccccttg 14543007  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||| | || |  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  14543008 tgagagttgtttggaaaggtgtaacgggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgttcgcttgaggtaagat 14543107  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  14543108 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 14543146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Original strand, 16381524 - 16381728
Alignment:
Q  53 actttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagct 152  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16381524 actttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaaggcattgaggggcaaggaaataccccttgtgagagtcgtttggggcggagcgactggtgaaagct 16381623  T
Q  153 tgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttg 252  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | | | |||||||||||||    
T  16381624 tgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttg 16381722  T
Q  253 taacgc 258  Q
    ||||||    
T  16381723 taacgc 16381728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6609887 - 6609773
Alignment:
Q  148 aagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggag 247  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  6609887 aagcttgacgtgggaacttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggag 6609788  T
Q  248 agttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||    
T  6609787 agttgtaacgcccac 6609773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Original strand, 16330235 - 16330458
Alignment:
Q  32 agagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16330235 agagacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgatagaaaggtgaagtctttgagaggtaaggagatacctcttgtgagagtcgtttggg 16330334  T
Q  132 acggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaat 231  Q
      ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||    
T  16330335 gtggagcgactggtgaaggtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacg-aaat 16330433  T
Q  232 cttataagttggggagagttgtaac 256  Q
     |||||| ||||||||||| |||||    
T  16330434 tttataatttggggagagtcgtaac 16330458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14086241 - 14085999
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||  | || ||||| ||| | || |||||  | |||||||| || |||||||| ||||    
T  14086241 gatgacgtgcaagttagagacaaccttacggtggaaaccttaccgttgagaattgatgataggaaggtgaaatccttgagaggtaaagagataccgcttg 14086142  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  14086141 tgagagtcgtttggggtggagcgactggagaaagtttaacttgggagctggaaagtaagatgcgggagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 14086042  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14086041 ttcgaggacg-aaatcctctaagttggggagagttgtaacgccc 14085999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 11961595 - 11961836
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  11961595 gatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagacattaccgttgagaattgatgatcggaaggtgaagtctttgagaggtaaagagatacctcttg 11961694  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||  |||||||||||||||||||  |    
T  11961695 tgagagtcgtttggggtggagcgactagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatccgggagtcgtacccgaagttgtttgcttgaggtaagat 11961794  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11961795 ttcgaggacg-aaattttataatttggggagagttgtaacgcc 11961836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14571431 - 14571176
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| |||||||||||    
T  14571431 catgttatcccgagagatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggca 14571332  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14571331 aggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctagagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtt 14571232  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    || |||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  14571231 tgtttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgc 14571176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 13972681 - 13972923
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||  | || ||||| ||| |  | |||||  | |||||||| || |||||||| ||||    
T  13972681 gatgacgtgcaagttagagacaaccttacggtggaaaccttaccgttgagaattgatgatagggaggtgaaatccttgagaggtaaagagataccgcttg 13972780  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  13972781 tgagagtcgtttggggtggagcgactggagaaagtttaacttgggagctggaaagtaagatgcgggagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 13972880  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13972881 ttcgaggacg-aaatcctctaagttggggagagttgtaacgccc 13972923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11852991 - 11852890
Alignment:
Q  147 aaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttgggga 246  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11852991 aaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttttttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttgggga 11852892  T
Q  247 ga 248  Q
    ||    
T  11852891 ga 11852890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 13323213 - 13323456
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||  | || || |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  13323213 gatgatgtgcaggttagagacaacctgaccattgaaacattaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 13323312  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  13323313 tgagagtcgtttggggtggagcgactactgaaagtttgacttggaagctggagagtaagatgcaagaatcgtatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 13323412  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    |||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13323413 ttcgaggacgaaattc-tatattttggggagagttgtaacgccca 13323456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 260
Target Start/End: Original strand, 16338672 - 16338863
Alignment:
Q  68 attgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttg 167  Q
    ||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16338672 attgatgatcgtaaggtgaagtccttgagaggtaaggagatacctcttgtgagagtcgtctggggtggaacgactggtgaaagtttgacttgggagctgg 16338771  T
Q  168 agagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  16338772 agagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 16338863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 10420606 - 10420848
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  10420606 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgacgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagatacctcttg 10420705  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  |||||  |||||||||| || || ||||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  10420706 taagagttgtttggggtggagcatctggtgaaagtttaacttgggaactggaaagtaagatgcaagaatcgtatccggagttgtttgtttgaggtaagat 10420805  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  10420806 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 10420848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Original strand, 15016188 - 15016364
Alignment:
Q  81 aagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgct 180  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||| || |    
T  15016188 aagtgaagaagctgagaggcaaggagatacctcttgtgaaagtcgtttggggaggagcagctggtgaaagtttgacgtggaaattggagagtaagttgtt 15016287  T
Q  181 cgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
     ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  15016288 ggagtcatatccaaagttgtttgcatgaggtacattttcgaggacgaaaatattctaagtgggggagagttgtaacg 15016364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 11304331 - 11304576
Alignment:
Q  14 agtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccc 113  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || ||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  11304331 agtgatgatgttcaggttagagacaaccttacagttgagaccttacctttgagtattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctc 11304430  T
Q  114 ttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 213  Q
    | || |  || |||||||  ||||  ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11304431 tagttaaggttgtttggggtggagtaactagtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagctgtttgattgaggtaa 11304530  T
Q  214 attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
      ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  11304531 tatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 11304576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15227217 - 15227021
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||   | || ||||| | |||  | || |||| |||||||||||| |||||||| || |    
T  15227217 gatgatgtgcaagttagggacaaccttacgattgagactttactgttgagaattgaaggtcgtgaggtaaagaagttgagaggcaaagagatacctctag 15227118  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 213  Q
    | | ||| || ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227117 taaaagttgtgtggggaggagcatctggtgaaagtttgacatgggagctggagagtaagattctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 15227021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 12361103 - 12361345
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  12361103 gatgaagtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 12361202  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || ||||| |  ||||  || |  || || ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |    
T  12361203 tgaaggttgtttgtggtggagtaaccgaagagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgagagtcttatccagagttgtttgattgatgtaagat 12361302  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  12361303 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 12361345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 12854419 - 12854656
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  12854419 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgtgacattaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 12854518  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  |||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  12854519 tgatggttgtttggggaggaataactggtgaaagtttgacatgg-agctggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgatgtaatat 12854617  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||  || | || | |||||||||||||||||||||    
T  12854618 ttcgaggccgagattc-tctaagttggggagagttgtaac 12854656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41177090 - 41176852
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |    
T  41177090 gatgatgtgcaggttcgggacaatctcacagttgagactttgccgttgaggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacccttgg 41176991  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  41176990 tgagagtcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 41176891  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  41176890 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 41176852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 15953595 - 15953771
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||| ||  ||||  || | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  15953595 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttagggtggagtaaccgatgaaagtttgacttgggagctagagagtaagatgcggg 15953694  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  15953695 agtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaatgccc 15953771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13941592 - 13941354
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || ||||| || ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |    
T  13941592 gatgatgtgcaggttagggacaatctcacagttgagaccttgccgttgaggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacccttgg 13941493  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||| ||| |||||||||| |||||||||  |    
T  13941492 tgagagtcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttttcctgagttgtttgtttgaggtaagat 13941393  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  13941392 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 13941354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 18134907 - 18135149
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||| |||||  | ||||| || || ||  | |||||||  |||||||||||||| ||||| ||      
T  18134907 gatgatgtgcaggttagaggcaaccttacagttgagaccttaccgttgaggatcgaagaccgtgaggtgaagaaattgagaggcaaggatatacctctaa 18135006  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  18135007 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgagagttgtatacagagttgtttgtttgaggtaaaat 18135106  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  18135107 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 18135149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 262
Target Start/End: Original strand, 1981617 - 1981687
Alignment:
Q  192 cagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1981617 cagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 1981687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 8759643 - 8759881
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |    
T  8759643 gatgatgtgcaggttcgggacaatctcacagttgagactttgccgttgaggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacccttgg 8759742  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  8759743 tgagagtagtttggggtggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 8759842  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  8759843 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 8759881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10383535 - 10383305
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  10383535 tgatgacgtgcaggttagggacagcctgacggttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtctttgagaggtaaagagatacctctt 10383436  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||             ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  10383435 gtgagagtcgtttggggtggagcggctggtgaaagtttgacttgggagctgga-------------gagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 10383349  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  10383348 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 10383305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 12478406 - 12478513
Alignment:
Q  152 ttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagtt 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | || |||||||||||||    
T  12478406 ttgacttgggagctggagagtaaaatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggaagaaattc-tctacgttggggagagtt 12478504  T
Q  252 gtaacgccc 260  Q
    |||||||||    
T  12478505 gtaacgccc 12478513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44776815 - 44776577
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || ||||| || ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||  | |    
T  44776815 gatgatgtgcaggttagggacaatctcacagttgagaccttgccgttgaggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacctttgg 44776716  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  44776715 tgagagtagtttggggtggagcaacgggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcgtatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 44776616  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  44776615 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 44776577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Original strand, 13028758 - 13028808
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13028758 tgaggtaaattttcgaggacgaaaattctataagtgggggagagttgtaac 13028808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17738613 - 17738560
Alignment:
Q  205 ttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  17738613 ttgaggtaaattttcgaggacgataattctataagttgtggagagttgtaacgc 17738560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19039933 - 19039880
Alignment:
Q  205 ttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  19039933 ttgaggtaaattttcgaggacgataattctataagttgtggagagttgtaacgc 19039880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36526562 - 36526518
Alignment:
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36526562 tttcgaggacgaaattcttctaagttggggagagttgtaacgccc 36526518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 260
Target Start/End: Original strand, 15008986 - 15009037
Alignment:
Q  209 ggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  15008986 ggtatattttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 15009037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 2037314 - 2037368
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2037314 tgaggtatattttcgaggacgaaaattcttcaagttggggagagttgtaacgccc 2037368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 2041055 - 2041109
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2041055 tgaggtatattttcgaggacgaaaattcttcaagttggggagagttgtaacgccc 2041109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 15446482 - 15446536
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15446482 tgaggtaaattttcaaggacgaaaattctataagcgggggagagttgtaacgccc 15446536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19445024 - 19444978
Alignment:
Q  214 attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  19445024 attttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 19444978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 2247258 - 2247310
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  2247258 gaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 2247310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54974676 - 54974624
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  54974676 gaggtatattttcgaggacgaaaattcta-aagttggggagagttgtaacgccc 54974624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54977286 - 54977234
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  54977286 gaggtatattttcgaggacgaaaattcta-aagttggggagagttgtaacgccc 54977234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 10953270 - 10953313
Alignment:
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10953270 tttcgaggacgaaattctt-taagttggggagagttgtaacgccc 10953313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 21167297 - 21167556
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21167297 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagataaccttacggtagagactttaccgctgaggattgatgatcggaaggtgaagacgttgagaggc 21167396  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21167397 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccaaagttgt 21167496  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167497 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21167556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16408805 - 16409066
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  16408805 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgataggaaagtgaagacgttgagaggc 16408904  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408905 aaagaaataccccttgttagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 16409004  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16409005 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 16409066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19977987 - 19977727
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19977987 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttatcggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 19977888  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19977887 aggagatacctcttgtgagggtcgtttggaacggagcgactagtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgttggagtcttatccagagttgtt 19977788  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19977787 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 19977727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19900545 - 19900304
Alignment:
Q  21 atgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19900545 atgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctcttgtgag 19900446  T
Q  121 agtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19900445 agtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgcttgcttgaggtaaattttcg 19900346  T
Q  221 aggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19900345 aggacgaaaatattataagttggggagagttgtaacgcccac 19900304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22032053 - 22031792
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22032053 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22031954  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22031953 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgcttgagtcttatccagagttgt 22031854  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22031853 ttgcttgaggtaaattatcgaggacgaaaatcttttaagttgcggagagttgtaacgcccac 22031792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 20018510 - 20018771
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20018510 tcatgtgatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 20018609  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20018610 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 20018709  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20018710 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 20018771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22046394 - 22046134
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22046394 tcatgtgatcaa-agtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22046296  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22046295 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgcttgagtcttatccagatttgt 22046196  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22046195 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 22046134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21250962 - 21250704
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21250962 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccgatcaggattgatgatcgcaaagtgaagacgttgagaggca 21250863  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21250862 aggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcggctggtgaaagcttgacgtgggagctagaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 21250763  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21250762 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21250704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 21922496 - 21922754
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922496 catgtgatccaaagcgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 21922595  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21922596 aggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctaaagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 21922695  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922696 tgcatgaggtaaattttcgaggacaaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21922754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 21394626 - 21394884
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21394626 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacgattgagactttaccggtaaggattgatgatcgcaaagtgaagacgttgagaggca 21394725  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21394726 aagagatacctcttctgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 21394825  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394826 tgctttaggtaaattttcgaggacaaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21394884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 21789119 - 21789377
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21789119 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacgattgagactttaccggtaaggattgatgatcgcaaagtgaagacgttgagaggca 21789218  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21789219 aagagatacctcttctgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 21789318  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21789319 tgctttaggtaaattttcgaggacaaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21789377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 30313904 - 30314165
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30313904 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 30314003  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30314004 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgagagcttgagagtaagatgttggagtcttatccagagttgt 30314103  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30314104 ttgcttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 30314165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 17674783 - 17675044
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17674783 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 17674882  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17674883 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactagtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagaattgt 17674982  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17674983 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 17675044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 22120934 - 22121195
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22120934 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggcgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttaagaggc 22121033  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22121034 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 22121133  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22121134 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 22121195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32600165 - 32599904
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32600165 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtaaagacgttgagaggc 32600066  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  32600065 aagtagatatcccttgttagattcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttat 32599966  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32599965 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 32599904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 22179318 - 22179577
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179318 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22179417  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  22179418 aatgagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatctaatccagagttgt 22179517  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22179518 ttgcatgaggtaaattttctaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 22179577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15441202 - 15440941
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15441202 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagaaactctaccggtgaggatggacgatcgaaaagtgaagacgttgaggggc 15441103  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15441102 aaggagatatcccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 15441003  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15441002 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatattttaagtgggggagagttgtaatgcccac 15440941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15533401 - 15533140
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15533401 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagaaactctaccggtgaggatggacgatcgaaaagtgaagacgttgaggggc 15533302  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15533301 aaggagatatcccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 15533202  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15533201 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatattttaagtgggggagagttgtaatgcccac 15533140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Original strand, 22164952 - 22165212
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22164952 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagacacaaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggca 22165051  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22165052 aagagatttcccttgtttgagtcgtttgggttggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 22165151  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  22165152 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtcggggagagtcgtatcgcccac 22165212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19112711 - 19112450
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19112711 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 19112612  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19112611 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtaaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 19112512  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19112511 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 19112450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Original strand, 22133802 - 22134062
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22133802 catgtgatccaaagtgatgatgtgcacgtcagagacaaccatacggtagaaactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggca 22133901  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||| ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  22133902 aagagatatcccttgttaaagtcgtttaggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggaacttgagagtaagatgctgtagtcttatacagagttgtt 22134001  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22134002 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 22134062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 19485630 - 19485881
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19485630 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 19485729  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19485730 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 19485829  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttg 252  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19485830 ttacttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttg 19485881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23948910 - 23948651
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||  |||||||||| |||||||||    
T  23948910 tcatgtgatcccaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagacattgagaggc 23948811  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| || || | |||| | || ||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  23948810 aaggagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagtttaacgtcggagttggaaagtaagatgttggagtcttatccaaagttgt 23948711  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23948710 tttcttgaggtacattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgccc 23948651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22179189 - 22178947
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22179189 gatgacgtgcaagttagacacaaccttacggtggagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaaggctttgaggggcaaggaaataccccttg 22179090  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  22179089 tgagagtcgtttggggcggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgtttacttgaggtaagat 22178990  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||  |||||  | | | |||||||||||||||||||||    
T  22178989 ttcgagga-caaaattctgtgatttggggagagttgtaacgccc 22178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 20396901 - 20397140
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20396901 gatgacgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagaagttgagaggcaaggagatacctcttg 20397000  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  ||||||| ||  ||||||||||||||||| || || |||||| | || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  20397001 tgaaggtcgtttagggaggagcgactggtgaaaggttaacgtgggagttggaaagtaagatgatggagtcttatccagagttttttgcatgaggtacatt 20397100  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20397101 ttcgaggacgaaaattttataagttggggagagttgtaac 20397140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 29304202 - 29304442
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  29304202 gatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactttgccggtgagaattgacgatcggaaggtgaaggtgttgaggggcaaggaaataccccttg 29304301  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  29304302 tgagagtcgtttgggatggagcgactggtgaaagtttgacttgggaactggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 29304401  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  29304402 ttcgaggacg-aaattttgtaatttggggagagttgtaacgc 29304442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 16265379 - 16265635
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||| |    
T  16265379 catgtgattcaaagggatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgatagaaaggtgaagtctttgagaggta 16265478  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16265479 aggagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtt 16265578  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16265579 tgcttgaggtaagatttcgaggacg-aaattttataa-tttgggagagttgttacgccc 16265635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6679114 - 6678871
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  6679114 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 6679015  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  6679014 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 6678915  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| || ||||||||||||||||||    
T  6678914 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttagggagagttgtaacgccc 6678871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14565145 - 14564902
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| |  ||||||| || |||||||| |||    
T  14565145 tgatgatgtgcaggttagggacaacctaacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccctgagaggtaaagagatacctctt 14565046  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  14565045 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 14564946  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  14564945 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 14564902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 804451 - 804694
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || || ||| | || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  804451 tgatgatgtgcaggttagggataacttgactgttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 804550  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  804551 gtgagagtcgtttgggggggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 804650  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  804651 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 804694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27347177 - 27346986
Alignment:
Q  68 attgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttg 167  Q
    ||||| ||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  27347177 attgatgatagaaaggtgaagtctttgagaggtaaggagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctgg 27347078  T
Q  168 agagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  27347077 agagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 27346986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23649969 - 23649846
Alignment:
Q  135 gagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatctt 234  Q
    ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23649969 gagcgaccggtgaaatcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatctagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatctt 23649870  T
Q  235 ataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23649869 ataagttggggagagttgtaacgc 23649846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20388109 - 20387873
Alignment:
Q  26 caagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||  | || ||||| | |||  | ||||||| |||||||||||| |||||||| |  || | |||||    
T  20388109 caagttagagacaaccttacgattgagaccttaccgttgagaattgaaggtcgtgaggtgaagaagttgagaggcaacgagatacctccagtaaaagtcg 20388010  T
Q  126 tttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa-attttcgagga 224  Q
    ||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20388009 tttggggaggagcggttggtgaaagtttgacatgggaactggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtaatattttcgagga 20387910  T
Q  225 tgaaaa--tcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20387909 cgaaaaattctt-taagttggggagagttgtaacgccc 20387873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Original strand, 22433118 - 22433278
Alignment:
Q  100 caaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttg 199  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22433118 caaggagatacctctagtgaaagtcgcttggggaggagcgactggtgaaagtttgacatgggagctggagagtaagatgatggagtcttatccagagttg 22433217  T
Q  200 tttgcttgaggtaa-attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  22433218 tttgcatgaggtaatattttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 22433278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 21325186 - 21325428
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  21325186 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 21325285  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  21325286 tgaaggttgtttggggtggagtaacgggtgaaagtttgacttgggaactggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaagat 21325385  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21325386 ttcgaggacgaaattc-tataagttggggagagttgtaacgccc 21325428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28982293 - 28982117
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    |||||| | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  28982293 gtgaagtccttgagaggtaaagaaatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 28982194  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  28982193 agtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 28982117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28987513 - 28987337
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    |||||| | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  28987513 gtgaagtccttgagaggtaaagaaatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 28987414  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  28987413 agtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 28987337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6603661 - 6603418
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  | || |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  6603661 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacaggaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 6603562  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  6603561 gtgagagtcgtttggggtggagcggctggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaggatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 6603462  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| || ||||||||||||||||||    
T  6603461 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttagggagagttgtaacgccc 6603418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12304748 - 12304521
Alignment:
Q  32 agagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||  |||||||||| ||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12304748 agagacaacctgacagttgagactatgccgttaaggattgatgatagaaaggtgaagtctttgagaggtaaggagatacctcttgtgagagtcgtttgag 12304649  T
Q  132 acggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaat 231  Q
      |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||| |||| |    
T  12304648 gtggagcggctggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttttttgaggtaagatttcgaggacgaaatt 12304549  T
Q  232 cttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  12304548 c-tgtaatttggagagagttgtaacgccc 12304521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 260
Target Start/End: Original strand, 22062249 - 22062400
Alignment:
Q  108 taccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttg 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| |||    
T  22062249 taccccttgtgaaagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgagattcttatccaaagttgtttgtttg 22062348  T
Q  208 aggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  22062349 aggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 22062400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 260
Target Start/End: Original strand, 12912834 - 12912989
Alignment:
Q  104 gagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttg 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |    
T  12912834 gagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgttag 12912933  T
Q  204 cttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12912934 cttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 12912989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 31417250 - 31417492
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  31417250 gatgatgtgcaggttagagacaacctcacagttgagaccttaccgttgaggattaaggaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggacatacctctag 31417349  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||| |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  31417350 tgaaagttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctagagagtaagatgcgggagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 31417449  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31417450 ttcgagga-caaaattctataatttggggagagttgtaacgccc 31417492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 21682246 - 21682487
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |    
T  21682246 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagtggcaaggatatacctctag 21682345  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  21682346 tgaaggttgtttggggtggagtaaacggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccatagttgtttgcttgaggtaatat 21682445  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  21682446 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgcc 21682487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Original strand, 20010678 - 20010918
Alignment:
Q  19 tgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtg 118  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||  | || || ||  ||||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  20010678 tgatgtgcaggttagagacaaccttacaattgagactttaccgttgagaatcgaatatcgtgaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctagta 20010777  T
Q  119 agagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatttt 218  Q
    |  || |||| ||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20010778 aaggtggttttgggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatattt 20010877  T
Q  219 cgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  20010878 cgaggacgaagttc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 20010918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22985045 - 22984943
Alignment:
Q  158 tgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22985045 tgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagtgttgtttgcttgaggtaaatttttgacgacgaaaatcttataagttggggagagttgtaatg 22984946  T
Q  258 ccc 260  Q
    |||    
T  22984945 ccc 22984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19851416 - 19851220
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  19851416 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacggttgagacattaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 19851317  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 213  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19851316 tgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtacgatgcgggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 19851220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19857452 - 19857256
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  19857452 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacggttgagacattaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 19857353  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 213  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857352 tgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtacgatgcgggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 19857256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22987222 - 22987070
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| | |||  | ||||||  ||||||||||    
T  22987222 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacagttaagaccttaccagttagaattgaaggtcgtgaggtgaagcagttgagaggc 22987123  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagctt 153  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22987122 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagctt 22987070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23654932 - 23654694
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  || ||||||| |||  | || ||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  23654932 gatgatgtgcaatttagagacaaccttatagttgagacttcaccgttgagaattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 23654833  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||  |    
T  23654832 tgaaggttgtttggggtggagtaactgatgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccttagttgtttgcttgagataatat 23654733  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  23654732 ttcgaggacgaaattc-tataatttggggagagttgtaac 23654694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20007854 - 20007617
Alignment:
Q  18 atgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgt 117  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  20007854 atgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaaaaagtttagaggcaaggatatacctctagt 20007755  T
Q  118 gagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattt 217  Q
    ||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20007754 gaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcgtatccagagttgtttgcttgaggtaatatt 20007655  T
Q  218 tcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  20007654 tcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaac 20007617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 256
Target Start/End: Original strand, 31571666 - 31571856
Alignment:
Q  65 aggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagc 164  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31571666 aggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacccttggtgagagtcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagc 31571765  T
Q  165 ttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    | || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  31571766 tggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 31571856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22029858 - 22029785
Alignment:
Q  189 atccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22029858 atccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtttgggagagttgtaacgcccac 22029785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36800140 - 36799977
Alignment:
Q  92 ttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatc 191  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||    
T  36800140 ttgaggggcaaggaaatacccttggtgagagtagtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatc 36800041  T
Q  192 cagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    | |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  36800040 ctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 36799977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1266244 - 1266002
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||| |||  | |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||  | |    
T  1266244 gatgatgtgcaggttagagacaatctcacagttgagacttcaccgttgaggattgaagaccgagaggtgaagaagttgagaggaaaggatatacctttgg 1266145  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||   | |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  1266144 tgaaggttgtttggggtagtgtaactggtgagagcttgacttgggagctggagagtaagatgcaggattcatatcctgagttgtttgattgaggtaagat 1266045  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1266044 ttcgaggacgaaattc-tataatttggggagagttgtaatgccc 1266002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23650061 - 23649967
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgag 96  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  23650061 catgtgatccaaagtgataatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcttaaagtgaagacgttgag 23649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 20972721 - 20972828
Alignment:
Q  152 ttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagtt 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  20972721 ttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagtt 20972819  T
Q  252 gtaacgccc 260  Q
    |||||||||    
T  20972820 gtaacgccc 20972828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 22062209 - 22062252
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttacc 60  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22062209 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttacc 22062252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19867561 - 19867460
Alignment:
Q  155 acatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgta 254  Q
    ||||||||| | |||||| |||||   || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||  | ||||| |||||||||||||    
T  19867561 acatgggagttggagagtcagatgacagactcttatccagagttatttccttcaggtaaattttcgaggacaaaaattgtttaagtgggggagagttgta 19867462  T
Q  255 ac 256  Q
    ||    
T  19867461 ac 19867460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19862894 - 19862823
Alignment:
Q  185 tcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  19862894 tcttatccagagttatttccttcaggtaaattttcgaggacaaaaattgtttaagtgggggagagttgtaac 19862823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3274330 - 3274276
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3274330 tgaggtacattttcgaggacgaaaattctataagtgggggagagttgtaacgccc 3274276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 260
Target Start/End: Original strand, 22423097 - 22423131
Alignment:
Q  226 gaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22423097 gaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 22423131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 6607086 - 6607139
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  6607086 tgaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 6607139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 22004687 - 22004739
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  22004687 gaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 22004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Original strand, 24818567 - 24818630
Alignment:
Q  192 cagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  24818567 cagagttgttttcttcaggtaa-ttttcgaggacgaaaattctttaagtgggggagagttgtaac 24818630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14346 - 14085
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  14346 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatcatcggaaagtgaagacgttgagaggc 14247  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14246 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14147  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14146 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 14085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 345
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  606 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 507  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  506 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagcgtaagatgctggagtcttatccagagttgt 407  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  406 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagggttgtaacgcccac 345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 64351 - 64612
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  64351 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacattgagaggc 64450  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  64451 aaggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacagagcgaatggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatggtggagtcttatccagagttgt 64550  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64551 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 64612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23573629 - 23573368
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23573629 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 23573530  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23573529 aaggagataccccttgtgagagtcgtttggagcggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgggagtaagatgctagagtcttatctagagttgt 23573430  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573429 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 23573368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 21984805 - 21985063
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21984805 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggtcgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgtcgagaggca 21984904  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  21984905 aggagatacttcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatctagagttgtt 21985004  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21985005 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21985063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22134555 - 22134294
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22134555 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22134456  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22134455 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 22134356  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22134355 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 22134294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 22333386 - 22333647
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22333386 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22333485  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22333486 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 22333585  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22333586 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 22333647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 15000238 - 15000499
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15000238 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15000337  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15000338 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggaacgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 15000437  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15000438 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 15000499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 29476572 - 29476833
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29476572 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 29476671  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29476672 aaggagatacctatcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 29476771  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29476772 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 29476833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34566381 - 34566120
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34566381 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 34566282  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34566281 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 34566182  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34566181 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 34566120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16356389 - 16356128
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16356389 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaggacgttgagaggc 16356290  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16356289 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16356190  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16356189 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 16356128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 27685899 - 27686159
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27685899 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccagtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27685998  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27685999 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 27686098  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27686099 ttgcttgaggt-aattttcgaggacgaaaatcttttaagagggggagagttgtaacgcccac 27686159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18775664 - 18775403
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |    
T  18775664 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagacttcaccggtgaggatcgatgatcgtaaagtgaagacgttgagacac 18775565  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18775564 aaggaaataccccttgtcagaatcgtttgggctggagcgactgatgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 18775465  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18775464 ttgcttgaggtaaattttcgaagacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 18775403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22344993 - 22344732
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22344993 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgacgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22344894  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22344893 aaggagatacctctcatgagagtcgtttggacgggagcggctggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaaaatgctggagtcttatccagagttgt 22344794  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22344793 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 22344732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27518294 - 27518033
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27518294 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27518195  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27518194 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 27518095  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27518094 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27518033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41770729 - 41770468
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41770729 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 41770630  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41770629 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 41770530  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41770529 ttacttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 41770468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27610241 - 27609980
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27610241 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27610142  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27610141 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 27610042  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27610041 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27609980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 27668989 - 27669250
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27668989 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27669088  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27669089 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagtttt 27669188  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27669189 ttacttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27669250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 37291995 - 37292256
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37291995 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaacacgttgagaggc 37292094  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37292095 aaggagatacctcttgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgaaagtaagatgctggagtctcatccagagttgt 37292194  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37292195 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatctcttaagtgagggagagttgtaacgcccac 37292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20573408 - 20573153
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20573408 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttactagagagaattgaggatcgaaaagtgaagacgctgagaggt 20573309  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20573308 aaagatatacctcttgtgaaagtcgtctgggacggagcgactggtgaaagcttaacatgggagctagagagtacgatgctggagtcttatccagagttgt 20573209  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573208 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 20573153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19769847 - 19769586
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19769847 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 19769748  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19769747 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttaagagtaagatgatggagtcttatccagagttgt 19769648  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19769647 ttacttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 19769586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 21343858 - 21344116
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343858 catgtgatccaaagagacgatgtgtaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgagaattgaagatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 21343957  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21343958 aagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggagcgattggtgaaagcctaacgtgggagttggaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 21344057  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344058 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21344116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40708667 - 40708406
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40708667 tcatgtaatccaaagcgacgatgtacaaattagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 40708568  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40708567 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 40708468  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40708467 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 40708406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25423075 - 25422828
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423075 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggtttagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 25422976  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| ||||||           ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  25422975 aggagatacctcttgtg-----------ggacggagcgactagtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctgaaatcttatccagagttgtt 25422887  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25422886 tgcttgaggtaaattttcgacgacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 25422828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 26739204 - 26739463
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||| | || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26739204 tcatgtgatctaaagagatggtgtgcaagttagagataacctgacggttgagaccttatcagtgagaattgaagatcgaaaagtgaagacgttgagggga 26739303  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26739304 aaggaaatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggagtcttatccagaattgt 26739403  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26739404 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatattataagttggggagacttgtaacgccc 26739463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26682041 - 26681866
Alignment:
Q  87 agacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtc 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26682041 agacgttgagaggcaaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctagagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtc 26681942  T
Q  187 ttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26681941 ttatccagagttgtttgcttgagataaattttcgaggacgaatatcttttaagttggggagagttgtaacacccac 26681866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26953648 - 26953473
Alignment:
Q  87 agacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtc 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26953648 agacgttgagaggcaaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctagagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtc 26953549  T
Q  187 ttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26953548 ttatccagagttgtttgcttgagataaattttcgaggacgaatatcttttaagttggggagagttgtaacacccac 26953473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23516428 - 23516274
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23516428 tcatgtgatccagagtgatgatgtgaaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgcaaagtgaagacgttgagaggc 23516329  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttga 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23516328 aaggagataccccttgtaagagtcgtttggaacggaacgactggtgaaagcttga 23516274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23471115 - 23470864
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||   |||  | ||||||  || ||||||||    
T  23471115 catgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccagttagaattgaaagtcgtgaggtgaagtagtagagaggca 23471016  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23471015 aagacatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggagcggctggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 23470916  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgt 253  Q
    |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23470915 tgcacgaggtaaatttttgaggacgaaaatcctataagttggggagagttgt 23470864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 24736126 - 24736368
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  24736126 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtggagaccttaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 24736225  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  24736226 tgagagttgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcgtatccagagttgtttacttgaggtaatat 24736325  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  24736326 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 24736368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 24737300 - 24737542
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  24737300 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtggagaccttaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 24737399  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  24737400 tgagagttgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcgtatccagagttgtttacttgaggtaatat 24737499  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  24737500 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 24737542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 24750069 - 24750311
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  24750069 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtggagaccttaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 24750168  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  24750169 tgagagttgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcgtatccagagttgtttacttgaggtaatat 24750268  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  24750269 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 24750311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 23080604 - 23080845
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  23080604 gatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactttaccggtgaagattgatgatcggaaagtgaagaagttgagaggcaaggagatacctcttc 23080703  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  |    
T  23080704 tgagagtcgtttgggatggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgtttgaggtaagat 23080803  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  23080804 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgcc 23080845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21881701 - 21881562
Alignment:
Q  3 atgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21881701 atgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaaaagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggcaa 21881602  T
Q  103 ggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgact 142  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21881601 ggagatatcctttgtgagaatcgtttgggacggagcgact 21881562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21625404 - 21625147
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || || || |||||  | ||||||| |||||||||||    
T  21625404 catgtgattccgagagatgatgtgcaggttagagacaaccttacggttgagacgttaccgttgagaatcgaagatcgtgaggtgaagaagttgagaggca 21625305  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21625304 aggatatacctctagtgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacgtgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtt 21625205  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  21625204 tgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 21625147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 21662539 - 21662797
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| | || ||||| | |||  ||||||||| |||||||||||    
T  21662539 catgtgattccgagggatgatgtgcaagttagagataaccttaccgttgagaccttaccattgagaattgaaggtcgcgaagtgaagaagttgagaggca 21662638  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||| | || |||| ||| |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21662639 aggagatatctctagtgaaagttgtttggggaggagaaactggtgagagtttgacgtgggagttggagagtaagatgttggagtcttatccagagttgtt 21662738  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  21662739 tgattgaggtatgttttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaatgccc 21662797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20342133 - 20341890
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||  | |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  20342133 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccgttgaggattgatgatagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 20342034  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  20342033 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggaactggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 20341934  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20341933 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 20341890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21404707 - 21404464
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || | ||| |||||||| | |||  ||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||    
T  21404707 gatgatgtgcaagtgagagacaaccttacgattgagaccttcctagtgaggattgaaggtcgtgaagtgaagaagctaaaaggcaaggagatacctcttg 21404608  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||   |||||| |||    
T  21404607 tgaaagtcgtttgggaaggagcggctgatgaaagtttgacgtgggagttggagagtaagatgctggagtcgtatctagagttatttgaaagaggtacatt 21404508  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21404507 ttcaaggacgaaaatattctaagtgggggagagttgtaacgccc 21404464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 260
Target Start/End: Original strand, 20468673 - 20468852
Alignment:
Q  81 aagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || |||||||||||    
T  20468673 aagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctcttgtgaaggtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagtttaacgtgggagttggaaagtaagatgct 20468772  T
Q  181 cgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
     ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||  ||||||||||    
T  20468773 ggagtcttttccagagttgtttacatgaggtacattttcgaggacgaaaattctgtaagttgggcagaaatgtaacgccc 20468852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20773613 - 20773371
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  20773613 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagataccgcttg 20773514  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||  |    
T  20773513 taagagttgtttggggtggagcaactggtgaaagtttaacttgggaactggaaagtaagatgcaagagtcttaccctgagttgtttgtttgaggtaagat 20773414  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  20773413 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 20773371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 257
Target Start/End: Original strand, 21564533 - 21564708
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  21564533 gtgaagaagttgagaggcaaggagatacctctagtaaaagtcgtttggggaggagcggctggtgaaagtttgacatgggaactggagagtaagatgctgg 21564632  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa-attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  21564633 agtcttatccagagttgtttgcatgaggtaatatattcgagggcgaaatgtttttaagttggggagagttgtaacg 21564708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 17269848 - 17270088
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| | |    
T  17269848 gatgatgtgcaggttagggacaatctcacagttgagactttgccggtgaggatcgatgatcggaaagtgaaggcattgaggggcaaggaaatacccttgg 17269947  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  17269948 tgagagtcgtttggggcggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgagggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 17270047  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  17270048 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaacgc 17270088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 37546014 - 37546257
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  | || |||||| | |||||||| || || ||||| |||    
T  37546014 tgatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacaggaaggtgaagtccttgagaggtaaagaaatacctctt 37546113  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||      
T  37546114 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgcttgcttgaggtaaga 37546213  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  37546214 tttcaaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 37546257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22381052 - 22380814
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||  | |||| ||| ||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  22381052 gatgatgtgcaggttagagacaacctgactgttgagaccttaccgttgaggagtgatgatcggaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 22380953  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  |    
T  22380952 tgagagtcgtttggggtggagcgactagtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgtttgaggtaagat 22380853  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  22380852 ttcgagga-caaaattctataatttggggagagttgtaac 22380814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22502532 - 22502290
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || |||||| | ||  | |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  22502532 gatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactatgccgttgaggattgatgatagaaaggtgaagtctttgagaggtaagaagatacctcttg 22502433  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |    
T  22502432 tgagagtcgttttgggtggagcggctggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttacttgaggtaagat 22502333  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| | |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  22502332 ttcgagtacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 22502290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 28895457 - 28895699
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  28895457 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgacgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagatacctcttg 28895556  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  28895557 taagagttgtttggggtggagcaaccggtgaaagtttgacttgggaactggaaagtaagatgcaagaatcgtatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 28895656  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  28895657 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 28895699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 28924283 - 28924525
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  28924283 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgacgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagatacctcttg 28924382  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  28924383 taagagttgtttggggtggagcaaccggtgaaagtttgacttgggaactggaaagtaagatgcaagaatcgtatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 28924482  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  28924483 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 28924525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 14887575 - 14887751
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    |||||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  14887575 gtgaagtccttgaggggtaaagagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 14887674  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  14887675 agtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 14887751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21496484 - 21496244
Alignment:
Q  19 tgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtg 118  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  21496484 tgatgtgcatgttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtaaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctagtt 21496385  T
Q  119 agagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatttt 218  Q
    |  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  21496384 aaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccggagttgtttgcttgaggtaatattt 21496285  T
Q  219 cgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  21496284 cgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 21496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22461802 - 22461563
Alignment:
Q  20 gatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtga 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||| |    
T  22461802 gatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagatacctcttgtaa 22461703  T
Q  120 gagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttc 219  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  ||||    
T  22461702 gagttgtttggggtggagcaactggtgaaagtttgacttgggaattggaaagtaagatgcaagaatcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagatttc 22461603  T
Q  220 gaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  22461602 gaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 22461563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 24798914 - 24799157
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | ||||| || ||  |||| |||||| | ||||| || || ||||| || |||    
T  24798914 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgaccgttgagactatgccattgaggatagatgacagaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagattcctctt 24799013  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||      
T  24799014 gttagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgtttgaggtaaga 24799113  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  24799114 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 24799157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25847926 - 25847683
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||| |||| |||||  | ||||| || || |||||||| |||    
T  25847926 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgatagaaaggtgaactccttgaggggtaaagagatacctctt 25847827  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||      
T  25847826 gtgagattcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccgaagttgtttgcttgaggtaaga 25847727  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| ||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  25847726 ttttgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 25847683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 259
Target Start/End: Original strand, 21877639 - 21877757
Alignment:
Q  140 actggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataag 239  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||    
T  21877639 actggtgaaagtttgacttgggagcttgagagtaagatgcgggagtcttatcatgagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaactc-tctaag 21877737  T
Q  240 ttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21877738 ttggggagagttgtaacgcc 21877757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 23442808 - 23443050
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  23442808 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagacattaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagtttagaggtaaggatatacctctag 23442907  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |    
T  23442908 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttaggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttatttgcttgtggtaatat 23443007  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  23443008 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 23443050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 6403129 - 6403305
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  6403129 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 6403228  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  6403229 agtcgtatccggagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 6403305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20767812 - 20767718
Alignment:
Q  46 ggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcga 140  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20767812 ggtagagactttacgggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttaagaggcaaggaaataccccttgttagagtcgtttgggacggagcga 20767718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 22236435 - 22236677
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| | |||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  22236435 gatgatgtccaggttagagacaaccttacagttgagacctgaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 22236534  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  || |  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||  |    
T  22236535 tgaaggttgtttggggtggggtaaccggtgagagtttgacttgggagctagagagtaagatgcgggagtcgtattcagagttgcttgtttgaggtaagat 22236634  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  22236635 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagtagtaacgccc 22236677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23440112 - 23440029
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  23440112 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagaaaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagt 23440029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20821306 - 20821192
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  20821306 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgacgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagatacctcttg 20821207  T
Q  117 tgagagtcgtttggg 131  Q
    | ||||| |||||||    
T  20821206 taagagttgtttggg 20821192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23669644 - 23669590
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23669644 tgaggtatattttcgaggacgaaaatcctttaagttggggagagttgtaacgccc 23669590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 16258392 - 16258446
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16258392 tgaggtatattttcgaggacgaaaattcttcaagttggggagagttgtaacgccc 16258446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 22592111 - 22592165
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22592111 tgaggtatattttcgaggacgaaaattcttcaagttggggagagttgtaacgccc 22592165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 22595666 - 22595720
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22595666 tgaggtatattttcgaggacgaaaattcttcaagttggggagagttgtaacgccc 22595720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43122479 - 43122426
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  43122479 tgaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 43122426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6000 - 5739
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6000 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccgatgaggattgatgatcgtaaagtgaaaacgttgagaggc 5901  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5900 aaggagatacctcttgtgagagtcgttggggacggagcgactgttaaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 5801  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5800 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 5739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 1142 - 1403
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1142 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtatatactttaccggtaaggatcgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 1241  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1242 aaggagataccccttgtgagagtcgtttggaacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 1341  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1342 ttgcatgaggttaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 1403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 180203 - 179942
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  180203 tcatgtgatccagagtgttgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 180104  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  180103 aaggagatacctcttgtgagggtcgtttggaacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 180004  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  180003 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 179942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27953 - 27692
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27953 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 27854  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27853 aaggagatacctcttgtgagggtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgttggagtcttatccagagttgt 27754  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27753 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagtgttgtaatgcccac 27692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 40109 - 40370
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40109 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 40208  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40209 aaggagatacctcttgtgagagtcgtttgggatggagcgactagtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatactggagtcttatccagagttgt 40308  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40309 tcgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 40370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 65391 - 65132
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  65391 tcatgtgatcca-agtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtggagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 65293  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  65292 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactagagaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttgtccatagttgt 65193  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  65192 ttgcttgaggtaaattttcgagga-gaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 65132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14332341 - 14332080
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14332341 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 14332242  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14332241 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14332142  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14332141 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 14332080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 17642 - 17904
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17642 tcatgtgatccaaactgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 17741  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17742 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 17841  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagag-ttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17842 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagtttgtaacgcccac 17904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 13634047 - 13634308
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634047 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacgatagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 13634146  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13634147 aaggagataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 13634246  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  13634247 ttgcttgaggtaaatttttgaggacgaaaatcttttaagttcgggagagttgtaacccccac 13634308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8707549 - 8707288
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8707549 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgataggc 8707450  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8707449 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 8707350  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8707349 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 8707288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 11553428 - 11553689
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  11553428 tcatgtgatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttatggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgcaaagtgaagacgttgagaggt 11553527  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11553528 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 11553627  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11553628 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 11553689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 18552084 - 18552345
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18552084 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagagac 18552183  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18552184 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 18552283  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18552284 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 18552345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 23517095 - 23517356
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23517095 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 23517194  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23517195 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 23517294  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23517295 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 23517356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 11237539 - 11237800
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11237539 tcatgtaatccaaagtgacgatgtacaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 11237638  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11237639 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 11237738  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11237739 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgaaacgcccac 11237800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13686007 - 13685746
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13686007 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 13685908  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13685907 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaaacttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 13685808  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  13685807 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagagggggagagttgtaacgcccac 13685746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 15161383 - 15161644
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15161383 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15161482  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15161483 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 15161582  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  15161583 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagagggggagagttgtaacgcccac 15161644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 12254364 - 12254623
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12254364 tcatgtgatccaaagtgatgatgtacaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 12254463  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12254464 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgt 12254563  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12254564 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaaccttataagttggggagagttgtaatgccc 12254623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12687445 - 12687184
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12687445 tcatgtgatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttatggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 12687346  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12687345 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgggagtaagatgctggagtcttatccagaattgt 12687246  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12687245 tttcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 12687184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 44791677 - 44791938
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44791677 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 44791776  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44791777 aaggagatacctctcgtcagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 44791876  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44791877 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaagtcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 44791938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14347781 - 14347521
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14347781 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaaattagagataaccttacggttgagactttaccgataaggattgaagattgaaaggtgaagacgttgagaggc 14347682  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14347681 aaagagatacctcttgtgaaagtcatttgggatggagcgactgatgaaagcttaacatgggagttggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14347582  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14347581 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 14347521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18177686 - 18177425
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18177686 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 18177587  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18177586 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagaataagatgctggagtcttatccggagttgt 18177487  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18177486 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 18177425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8198572 - 8198311
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8198572 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 8198473  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8198472 aaggagatacctctcgtaagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 8198373  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8198372 tcgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 8198311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10870939 - 10870678
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10870939 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 10870840  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  10870839 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatcaagagttgt 10870740  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10870739 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 10870678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14037751 - 14037491
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14037751 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaaattagagataaccttacggttgagactttaccgataaggattgaagattgaaaggtgaagacgttgagaggc 14037652  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14037651 aaagagatacctcttgtgaaagtcatttgggaaggagcgaatgatgaaagcataacatgggagttggaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14037552  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037551 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 14037491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 15163767 - 15164005
Alignment:
Q  21 atgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgag 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15163767 atgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaagagatacctcttgtgag 15163866  T
Q  121 agtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15163867 agtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccggagttgtttgcatgaggtaaattttcg 15163966  T
Q  221 aggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15163967 aggacgaaaatcttttaagtt-gggagagttgtaacgccc 15164005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6413440 - 6413198
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6413440 gatgatgtccaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggcaaggaaataccccttg 6413341  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  6413340 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgtttgtttgaggtaagat 6413241  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6413240 ttcgaggacgaaattc-tataatttggggagagttgtaatgccc 6413198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Original strand, 11388749 - 11388989
Alignment:
Q  19 tgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  11388749 tgatgtgcaagttagagacaaccttacagtggagaccttaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttgtg 11388848  T
Q  119 agagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatttt 218  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  11388849 agagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttccttgaggtaagattt 11388948  T
Q  219 cgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  11388949 cgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 11388989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 14286696 - 14286936
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14286696 gatgatgtgcaggttagagacaatctcacagttgagactttaccggtaaggattgatgatcggaaagtgaagacattgaggggcaaggaaataccccttg 14286795  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || || || || |||||||||| |||||||||  |    
T  14286796 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcataccctgagttgtttgtttgaggtaagat 14286895  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  14286896 ttcgaggacgaaattc-tatgatttggggagagttgtaacgc 14286936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15203823 - 15203564
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||  ||||||| || ||||| | |||  ||||||||| |||| |||||    
T  15203823 tcatgtgatcgaaagagatgatgtgcaagatagagataaccttacgattgagaccataccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagaagttgggaggc 15203724  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| | || || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15203723 aaggagatacctcttgtgaaattcgtttgggaaggagcggctggtgaaagcttaacgtgggagttggaaagcaagatactagagtcttatccagagttgt 15203624  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15203623 ttgcatgaggtacattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgccc 15203564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15340425 - 15340185
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  15340425 gatgatgtgcaggttagagacaatctcaccgttgagactttaccggtgaggatcgatgattggaaagtgaagacgttaaggggcaaggaaataccccttg 15340326  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  15340325 tgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 15340226  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  15340225 ttcgaggacgaaattc-tataatttggggagagttgtaacgc 15340185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 11306585 - 11306828
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  11306585 tgatgatgtgcaggttagggacaacctaacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 11306684  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  11306685 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 11306784  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  11306785 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 11306828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14129802 - 14129562
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14129802 gatgatgtgcaggttagggacaatctcactgttgagactttaccggtgaggattgacgatcggaaagtgaaggcattgaggggcaaggaaataccccttg 14129703  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  14129702 tgagagtcatttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 14129603  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  14129602 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgc 14129562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14433620 - 14433380
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14433620 gatgatgtgcaggttagggacaatctcactgttgagactttaccggtgaggattgacgatcggaaagtgaaggcattgaggggcaaggaaataccccttg 14433521  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  14433520 tgagagtcatttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 14433421  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  14433420 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgc 14433380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 8212451 - 8212693
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  8212451 gatgatgtgcaggttagggacaacctgactgttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 8212550  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  8212551 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 8212650  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  8212651 ttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 8212693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14954564 - 14954435
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14954564 tcatgtgatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 14954465  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgg 130  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||    
T  14954464 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttgg 14954435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 49152228 - 49151985
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||| | || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  49152228 tgatgatgtgcaggttagggacaacttgactgttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 49152129  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  49152128 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaaaatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 49152029  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  49152028 tttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 49151985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 12207120 - 12207362
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||||||| | ||||| || | |||  | || |||| ||| ||||||||||||||||| || |    
T  12207120 gatgatgtgcaagttagagacaatctcacgattgagactttaccattgaggatcgaaggtcgtgaggtaaagaagttaagaggcaaggagatacctctag 12207219  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | | ||| |||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12207220 taaaagttgtttggggaggagcatctggtgaaagtttgacatgggagctgcagagtaagatgttggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaagat 12207319  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  12207320 ttcgaggacgaaattc-tctaagttagggagagttgtaaagccc 12207362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13021271 - 13021045
Alignment:
Q  32 agagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagata-ccccttgtgagagtcgtttgg 130  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  13021271 agagacaacctgacagttgagactttgccggtgaggattgacgatcggaaagtgaaggtgttgaggggcaaggaaatatcccctggtgagagtcgtttgg 13021172  T
Q  131 gacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaa 230  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  13021171 gatggagcgactagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacg-aaa 13021073  T
Q  231 tcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |  | | | |||||||||||||||||||    
T  13021072 ttatgtgatttggggagagttgtaacgc 13021045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21661892 - 21661653
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||| ||  |||||||| | |||  ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||    
T  21661892 gatgatgtgcaagtgagagacaatcttacgatcgagaccttactagggaggattgaaggtcgtgaagtgaagaagctgagaggcaaggagatgcctcttg 21661793  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||| |||||||  | || | |||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||| |||    
T  21661792 tgaaagttgtttggggagaagtggctggtgaaagtttgacgtgggagttggagagcaagatgctggagtcgtatccaaagttatttgaatgaggtacatt 21661693  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21661692 ttcgaggacgaaaatattctaagttggggagagttgtaac 21661653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Original strand, 26118952 - 26119146
Alignment:
Q  65 aggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagc 164  Q
    |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  26118952 aggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactgatgaaagtttgacttgggagc 26119051  T
Q  165 ttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  26119052 tggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 26119146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12455581 - 12455394
Alignment:
Q  68 attgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttg 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    
T  12455581 attgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagatgg 12455482  T
Q  168 agagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||| ||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  12455481 agaataagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 12455394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 26288356 - 26288598
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  26288356 gatgatgtgcaggttagagacaacctcacagttgagaccttaccgttgaggattgaggaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggacatacctctag 26288455  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||| |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  26288456 tgaaagttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgtgggagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 26288555  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  26288556 ttcgaggacgaaattc-tacaatttggggagagttgtaacgccc 26288598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 1728 - 1969
Alignment:
Q  18 atgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgt 117  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||    
T  1728 atgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaggaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggacatacctctagt 1827  T
Q  118 gagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattt 217  Q
    || ||| |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || | |||||||| || |||||||||  ||    
T  1828 gaaagttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtaccaagagttgtatgtttgaggtaagatt 1927  T
Q  218 tcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  1928 tcgaggaagaaattc-aataatttggggagagttgtaacgccc 1969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 16950788 - 16951033
Alignment:
Q  14 agtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccc 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||  | || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  16950788 agtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacagttgagacttcaccgttgagaattgaggaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggacatacctc 16950887  T
Q  114 ttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 213  Q
    | |||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  16950888 tagtgaaagttgtttggggtggagtaactggtgaaagtttcacttgggagctggagagtaagatacgggagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaa 16950987  T
Q  214 attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
      ||||||||| |||| || || || ||||||||| |||||||||||    
T  16950988 gatttcgaggacgaaactc-tacaatttggggagatttgtaacgccc 16951033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 16072684 - 16072860
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  16072684 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 16072783  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  16072784 aatcttatccagagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagtttgggagagttgtaacgccc 16072860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19147140 - 19146898
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||  | || ||||| || ||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  19147140 gatgatgtgcaggttagagacaaccatacagttgagaccttaccgttgagaattgaagaccgtgaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctag 19147041  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  19147040 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatcctaagttgtttgcttgaggtaatat 19146941  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  19146940 ttcaaggacgaaattc-tctaacttggggagagttgtaacgccc 19146898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20746539 - 20746297
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||  | || ||||| || ||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  20746539 gatgatgtgcaggttagagacaaccatacagttgagaccttaccgttgagaattgaagaccgtgaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctag 20746440  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  20746439 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatcctaagttgtttgcttgaggtaatat 20746340  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20746339 ttcaaggacgaaattc-tctaacttggggagagttgtaacgccc 20746297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 18054348 - 18054511
Alignment:
Q  92 ttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatc 191  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||    
T  18054348 ttgaggggcaaggaaatacccttggtgagagtcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatc 18054447  T
Q  192 cagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    | |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  18054448 ctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 18054511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15624540 - 15624450
Alignment:
Q  171 gtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15624540 gtaagatgctagagtcttatccagagttgtttgcatgaggtacattttcggggacgaaaattttataagttggggagagttgtaatgccca 15624450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13665430 - 13665254
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  13665430 gtgaagaagttgagaggcaaagatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 13665331  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  13665330 agtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagaattgtaacgccc 13665254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 14264564 - 14264804
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  14264564 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttacctttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctag 14264663  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||   | |  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |    
T  14264664 tgaaggttgtttggggaagtgtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatctcgagttgtttgcttgaggtaatat 14264763  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  14264764 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagggttgtaacgc 14264804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 15102973 - 15103149
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||   ||||  ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |    
T  15102973 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggtgtggagtaactcgtgaaagtttgacttgggaactggagagtaagatgcagg 15103072  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  15103073 agtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatatttcaaggacg-aatttttctaagttggggagagttgtaacgccc 15103149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 23200063 - 23200301
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || ||||| || ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| | |||| | |    
T  23200063 gatgatgtgcaggttagggacaatctcacagttgagaccttgccgttgaggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaacacccttgg 23200162  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  23200163 tgagaatcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 23200262  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  23200263 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 23200301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 23506190 - 23506428
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || ||||| || ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| | |||| | |    
T  23506190 gatgatgtgcaggttagggacaatctcacagttgagaccttgccgttgaggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaacacccttgg 23506289  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  23506290 tgagaatcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 23506389  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  23506390 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 23506428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 15479458 - 15479597
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  15479458 gatgatgtgcaagttagagataacctaacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgagaggtaaagagatacctcttg 15479557  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgac 156  Q
    | || || |||||||  |||||  |||||||||| |||||    
T  15479558 taagggttgtttggggtggagcatctggtgaaagtttgac 15479597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 1493569 - 1493622
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1493569 gaggtatattttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 1493622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15114287 - 15114234
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  15114287 gaggtatattttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 15114234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 16928891 - 16928937
Alignment:
Q  214 attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  16928891 attttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 16928937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 10306339 - 10306391
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  10306339 gaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 10306391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11311527 - 11311475
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  11311527 gaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 11311475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16355502 - 16355763
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16355502 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgacgattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 16355601  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  16355602 aaggaaataccccttgtgagagtcgtttgggatggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgcgggaggcttacccagagttgt 16355701  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355702 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 16355763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 8053680 - 8053941
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8053680 tcatgtgatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacagtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 8053779  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8053780 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggaacttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 8053879  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8053880 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 8053941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8386367 - 8386106
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8386367 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 8386268  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8386267 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 8386168  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8386167 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 8386106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12523631 - 12523370
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12523631 tcatgtgatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 12523532  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12523531 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatctagagttgt 12523432  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12523431 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttttaacgcccac 12523370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 14304034 - 14304295
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14304034 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 14304133  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14304134 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14304233  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14304234 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 14304295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23955702 - 23955441
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23955702 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 23955603  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23955602 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 23955503  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23955502 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 23955441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 29039461 - 29039722
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29039461 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 29039560  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29039561 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 29039660  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29039661 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 29039722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40472995 - 40472734
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40472995 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 40472896  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40472895 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaaaatgctggagtcttatccagagttgt 40472796  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40472795 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 40472734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 18227503 - 18227764
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18227503 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagatgttgagaggc 18227602  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18227603 aaggagatatcccttggtagagtcatttggcctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttaaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 18227702  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18227703 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 18227764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 19778850 - 19779111
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19778850 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagatgttgagaggc 19778949  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19778950 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 19779049  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19779050 ttacttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 19779111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 14927316 - 14927575
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14927316 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagatagccttacggttgggacgttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 14927415  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14927416 aaagagatacctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctagaatcttatccagagttgt 14927515  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14927516 ttgcatgaggtaaatttccgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 14927575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 14266956 - 14267217
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14266956 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttactggtgagaattgatgatcgtaaggtgaagacgttgagaggc 14267055  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14267056 aaggagatacccctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14267155  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14267156 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtgacgcccac 14267217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14680522 - 14680261
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14680522 tcatgtgatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgattgtaaaatgaagacgttgagaggc 14680423  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14680422 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgatgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagaattgt 14680323  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14680322 ttgcttgaggtaaattttcgtggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 14680261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15364341 - 15364080
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15364341 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 15364242  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15364241 aaggagatacctcacgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 15364142  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15364141 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 15364080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27711291 - 27711030
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27711291 tcatgtaattcaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27711192  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27711191 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 27711092  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27711091 ttacttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27711030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12476555 - 12476294
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12476555 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 12476456  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12476455 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 12476356  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12476355 ttgcttgaggtaaatttttgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaatgcccac 12476294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18297160 - 18296899
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18297160 tcatgtaatccaaagcgacgatgtacaaattagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 18297061  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18297060 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 18296961  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18296960 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 18296899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15351943 - 15352151
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15351943 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaacattacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 15352042  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15352043 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggatggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgttggagtcttatccagagttgt 15352142  T
Q  201 ttgcttgag 209  Q
    |||||||||    
T  15352143 ttgcttgag 15352151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14159447 - 14159189
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  14159447 tcatgtgattcagagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccgataaggattgaggatcggaagatgaagtcgttgagaggc 14159348  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |  ||||  ||||||||||    
T  14159347 aaagagatacccctcgtgaaagtcgtttgggacggagcgacgggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgcggggatctttcccagagttgt 14159248  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14159247 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataa-ttggggggagttgtaacgccc 14159189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 14851439 - 14851678
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14851439 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggttgagactttaccagtaataattgaagatcgtaaagtgaagacattgagaggcaaagagatacctcttg 14851538  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14851539 tgaaagtcgtttgggacggagcggctggtgaaagcctaacgtgggaattagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtaaatt 14851638  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  14851639 ttcgaggacgaaaattcaataagttcgggagagttgtaac 14851678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 18607887 - 18608147
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18607887 tcatgtgatccaaagtgaagatgtgcaagtaagagacaaccttacgatagaaacaataccggagaagattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 18607986  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  18607987 aaggagatatcccttgttagagtcgtttgggctggagcaactggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgttggactcttatccagagttat 18608086  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  18608087 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaag-tggggagagttgcaacgtccac 18608147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14652263 - 14652004
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | | |||  | ||||||   |||||||||    
T  14652263 tcatgtgattcaaagagatgatgtgcatgttagagataaccttacggttgagaccttaccagtaagaatttaaggtcgtgaggtgaagcaattgagaggc 14652164  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14652163 aaagagatacgtcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagcttaatgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14652064  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14652063 ttgcatgaggtacattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgccc 14652004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7090324 - 7090159
Alignment:
Q  95 agaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccag 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| || |||||||||     
T  7090324 agaggcaaggagatacctcttgtaagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtggaagctagaaagtaagatgctggaatcttatccaa 7090225  T
Q  195 agttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090224 agttgtttgcttgagataaatattcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 7090159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 3265129 - 3265372
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  3265129 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 3265228  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  3265229 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 3265328  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  3265329 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 3265372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 1649610 - 1649848
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||||||    
T  1649610 gatgatgttcaggttagagacaacctgacggtcgagactttaccattgagaattgatgatcgaaaggtgaagtcattgaggggtaaagagataccccttg 1649709  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  1649710 tgagagtcgtttggggtggagcgtctggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaagaatcatatccggagttgtttgtttgaggtaagat 1649809  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  1649810 ttcgaggacgaaattc-tataatttggggagacttgtaac 1649848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 15415316 - 15415554
Alignment:
Q  21 atgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgag 120  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||  | || ||||| | |||  | || |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  15415316 atgtgcaagttagagacatccttacgattgagactttaccgttgagaattgaaggtcgtgaggtaaagaagttaagaggcaaggagatacctctagtgaa 15415415  T
Q  121 agtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcg 220  Q
    ||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  15415416 agttgtttggggaggagcatctggtgaaagtttgacatgggagctggagagtaagatgctggagtcttatccaaagttgtttgcttgaggtaatatttcg 15415515  T
Q  221 aggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  15415516 aggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 15415554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20890922 - 20890684
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  20890922 gatgacgtgcaggttagagacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgatagaaaggtgaagtctttgagaggtaatgagatacctcttg 20890823  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  20890822 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgattgaggtaagat 20890723  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20890722 ttcgacgacgaaattc-tataatttggggagagttgtaac 20890684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 11207566 - 11207809
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||  | |||||||| ||| |||| |||||| | ||||| || || |||||||| |||    
T  11207566 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccgttgaggattgatgatagaaaggtgaagtccttgaggggtaaagagatacctctt 11207665  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||      
T  11207666 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgcttgaggtaaga 11207765  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  11207766 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 11207809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 16252502 - 16252632
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||     
T  16252502 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaagattgatgatcgtaaagtgaagacgctgagaggg 16252601  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16252602 aaggagataccccttgttagagtcgtttggg 16252632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 29453872 - 29454115
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  | || |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  29453872 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacaggaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 29453971  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  29453972 gtgagagtcgtttggggtggagcggctggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaggatgcaggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 29454071  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  29454072 tttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 29454115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15319453 - 15319281
Alignment:
Q  86 aagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagt 185  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  15319453 aagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacataggagctggagagtaagatgct-gagt 15319355  T
Q  186 cttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  15319354 cttatccagagttgtttgcttgaggaaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 15319281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33222857 - 33222619
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || || |||||||| || || |||||| | ||| | || ||||| ||| |||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  33222857 gatgatgtacaggttagggacaacctgacagttgagactatgccattgagaattgatgatagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 33222758  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  |    
T  33222757 taagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgtttgaggtaagat 33222658  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||    
T  33222657 ttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaac 33222619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 44662199 - 44662441
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||  | || |||||||| || || |||||| | ||  | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  44662199 gatgatgtgcagattagggacaacctgactgtggagactatgccgttgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 44662298  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  44662299 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttggaagctggagagtaggatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 44662398  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  44662399 ttcaaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 44662441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15326480 - 15326241
Alignment:
Q  20 gatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtga 119  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||||| |||  | || ||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  15326480 gatgtgcaggttagggacaaccttacagttgagacttcaccgttgagaattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtga 15326381  T
Q  120 gagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttc 219  Q
      || |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  15326380 aggttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagtcgtttgtttgaggtaagatttc 15326281  T
Q  220 gaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15326280 gaggacgaaattc-tataatttggggagagttgtaacgccc 15326241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 15003697 - 15003939
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || ||  | || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  15003697 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcaaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 15003796  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15003797 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatat 15003896  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |  |||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  15003897 ttcgaggacg-caattatctaagttgaggagagttgtaacgccc 15003939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15245863 - 15245621
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  15245863 gatgatgtgcaggttagggacaaccttacagttgagaccttacctttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 15245764  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||    ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  15245763 tgaaggttgtttggggtggtttaactagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccggagttgtttgcttgaggtaatat 15245664  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  15245663 ttcgaggacgaaattc-tctaagttcgggagagttgtaacgccc 15245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42702794 - 42702604
Alignment:
Q  65 aggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagc 164  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  42702794 aggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacccttggtgagagtcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagc 42702695  T
Q  165 ttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    | || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  42702694 tggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 42702604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 256
Target Start/End: Original strand, 51606562 - 51606752
Alignment:
Q  65 aggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagc 164  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  51606562 aggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacccttggtgagagtcgtttggggcggagcaactggtgaaagtttgacttgggagc 51606661  T
Q  165 ttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    | || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  51606662 tggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 51606752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 18164534 - 18164710
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  18164534 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctcgtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 18164633  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  18164634 agtcgtatccaaagttgttttcttgaggtaatatttcgaggaggaaattc-tctaagttggagagagttgtaacgccc 18164710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 15359390 - 15359632
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  15359390 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 15359489  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  15359490 tgaaggttgtttggggtggagtaactggtgaaattttgacttgggagctggagagtaagaagcgggagtcgaatccagagttgtttgtttgaggtaatat 15359589  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | || || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  15359590 ttcgaggacggaattc-tctaagttggggagagttgtaatgccc 15359632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15070352 - 15070160
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| |||||||||||| || ||||| || |    
T  15070352 gatgatgtgcaggttagacacaaccttagggttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaagatatacctctag 15070253  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgag 209  Q
    |||  || |||||||  ||||  |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15070252 tgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtctaacatgggaactggagagtaagatgttggagtcttatctagagttatttgcttgag 15070160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7090387 - 7090323
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaag 66  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  7090387 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactataccggtaag 7090323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Original strand, 18550561 - 18550633
Alignment:
Q  185 tcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatg-aaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  18550561 tcttatccagagttatttccttcaggtaaattttcgaggacgaaaaattgtttaagtgggggagagttgtaac 18550633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13879207 - 13879153
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  13879207 tgaggtacattttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaatgccc 13879153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Original strand, 15293661 - 15293729
Alignment:
Q  188 tatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||  |||||||||||||||    
T  15293661 tatccggagttgtttccttcaggtaaattttcgagggtgaaaattcttttagggggggagagttgtaac 15293729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 16963829 - 16964088
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16963829 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactaaatcggtaaggattgacgatcgaaaagtgaagacgttgagtggc 16963928  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16963929 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16964028  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16964029 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgccc 16964088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 16928102 - 16928361
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16928102 tcatgtgatacagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagtgactaaaccggtaaggattgacgatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 16928201  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16928202 aagaaaataccccttgttagagtcgtttgggctggagtgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16928301  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928302 ttgcttgaggtaaattttcgaggaagaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 16928361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 18408406 - 18408664
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408406 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 18408505  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18408506 aggcgatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagtgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagtgtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 18408605  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18408606 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttagggagagttgtaacgccc 18408664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 2875265 - 2875526
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2875265 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 2875364  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2875365 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 2875464  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2875465 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 2875526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 21833443 - 21833704
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21833443 tcatgtgatccaaagtgatgatgtacaagttagagacaaacttacggtagagactttacctgtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 21833542  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21833543 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggatggagcgactggtgaaagcttgacgtggaagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 21833642  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21833643 ttgcttgaggtaaattgtcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 21833704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22433816 - 22433555
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22433816 tcatgtgatccagagtgatgatgtacaagttagggacgaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 22433717  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22433716 aaggagatacctcttgtaagagtcgtttgggacggagagactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgttggagtcttatccatagttgt 22433617  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22433616 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaaggcccac 22433555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 24313630 - 24313891
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24313630 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 24313729  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24313730 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 24313829  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24313830 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 24313891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16550623 - 16550884
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16550623 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16550722  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16550723 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16550822  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16550823 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgtccac 16550884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16627179 - 16627440
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16627179 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16627278  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16627279 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16627378  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16627379 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgtccac 16627440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 25610324 - 25610581
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25610324 catgtgatccaaagtgatgatgttcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaggtgaagacgttgagaggca 25610423  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25610424 aggagatgcctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctagagtcttatccagagttgtt 25610523  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25610524 tgctcgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 25610581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 29592382 - 29592643
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29592382 tcatgtaatccaaagcgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 29592481  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29592482 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 29592581  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29592582 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 29592643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 27331896 - 27332154
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27331896 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgaagattgatgatcgaaaagtgaagacgttgaaaggca 27331995  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27331996 aggagatacctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 27332095  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27332096 tgcatgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagtatgggagagttgtaacgccc 27332154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 27392636 - 27392894
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27392636 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgaagattgatgatcgaaaagtgaagacgttgaaaggca 27392735  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27392736 aggagatacctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 27392835  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27392836 tgcatgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagtatgggagagttgtaacgccc 27392894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 1543546 - 1543807
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1543546 tcatgtaatccagagtgacgacgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgagtattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 1543645  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  1543646 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcctatccagagctgt 1543745  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1543746 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 1543807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12497845 - 12497584
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12497845 tcatgtgatccaaagtgatgatatgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagatgttgagaggc 12497746  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12497745 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgattggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatctagagttgt 12497646  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12497645 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 12497584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 25765751 - 25766005
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25765751 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtaaagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 25765850  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25765851 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagctttatgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatctagagttgt 25765950  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaa 255  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25765951 ttgcttgaggtaaacttttgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaa 25766005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25112371 - 25112112
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25112371 tcatgtaatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 25112272  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25112271 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctagtgtcttatccagagttgt 25112172  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  25112171 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtggagaagagttgtaacgccc 25112112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17032381 - 17032120
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  17032381 tcatgtgatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacagtagagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaattgaagatattgagaggc 17032282  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17032281 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgacttgtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggaatcttatccagagttgt 17032182  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17032181 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 17032120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 22762918 - 22763175
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22762918 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttaagactttaccgataaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttcagaggca 22763017  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  22763018 aagagatacctcttgtgagagtcgtttgggacagagcgacttgtgaaagcttaatgtgggagctagagagtaagatgct-gaatcttatccatagttgtt 22763116  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22763117 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 22763175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 12511056 - 12511303
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12511056 tcatgtgatccaaagtgatgatatgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagatgttgagaggc 12511155  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12511156 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgattggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatctagagttgt 12511255  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggaga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  12511256 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggaga 12511303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23078288 - 23078029
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |    
T  23078288 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgaggattgaagatcgaaaagtgaagacattgaaagac 23078189  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  23078188 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttaagacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggaatcttatcctgagttgt 23078089  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078088 ttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 23078029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27187255 - 27186994
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27187255 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27187156  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || || ||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27187155 aaagatatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggcgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 27187056  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27187055 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27186994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 27261985 - 27262246
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27261985 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 27262084  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || || ||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27262085 aaagatatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggcgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 27262184  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27262185 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 27262246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 28263659 - 28263920
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28263659 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagacgttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 28263758  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28263759 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggcgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 28263858  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28263859 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 28263920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 28342408 - 28342669
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28342408 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagacgttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 28342507  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28342508 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggcgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 28342607  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28342608 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 28342669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 28292834 - 28293090
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28292834 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagacgttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 28292933  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28292934 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggcgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 28293033  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattt-tcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    || ||| ||||||||||  | | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28293034 ttacttaaggtaaatttccccacgacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaac 28293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Original strand, 5839682 - 5839860
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  5839682 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaagatgaagacgttgagaggca 5839781  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgct 180  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5839782 aggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgct 5839860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 21564610 - 21564852
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||  | |||||||| || |||||||| ||||    
T  21564610 gatgatgtgtaagttagagacaaccttacggtggagaccttaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaattccttgagaggtaaagagatacctcttg 21564709  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21564710 tgagagtcgtttgggatggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaagat 21564809  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  21564810 ttcgaggacgaaattc-tctaagttagggagagttgtaatgccc 21564852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19864404 - 19864272
Alignment:
Q  130 ggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19864404 ggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaa 19864305  T
Q  230 atcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19864304 atcttataagttggggagaattgtaacgcccac 19864272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Original strand, 22079209 - 22079379
Alignment:
Q  90 cgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtctta 189  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  |  | |||||    
T  22079209 cgttgagaggcaaagagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagaaagtaagatattgaaatctta 22079308  T
Q  190 tccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22079309 tccaaagttgtttgcataaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 22079379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 14131657 - 14131900
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  | || || || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  14131657 gatgatgtgcaagttagagacaatcttacggtggagacgttaccgttgagaatcgatgatcgtaaggtgaagaagttgagaggcaaggagatacctctag 14131756  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14131757 tgagagttgtttggggtggagaaactggtgaaagtctgacttgggagctggaaagtaagatgtgggagtcttatccagagttgtttacttgaggtaatat 14131856  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14131857 ttcgaggacgaaaatc-tctaagttggggagagttgtaacgccca 14131900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 260
Target Start/End: Original strand, 18198001 - 18198254
Alignment:
Q  7 gatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggag 106  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| || ||||| | |||  | ||||||   |||||||||||||||    
T  18198001 gatccaaagagatgatgtgcaacttagaaataaccttacggttgaaaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaggtgaagcaattgagaggcaaggag 18198100  T
Q  107 ataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgctt 206  Q
    ||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||       
T  18198101 atacctctaatgaaagttgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaatgttggagctagagagtaagatgctggtgtcttatccagagttgtttgtgc 18198200  T
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18198201 gaggtaaatttttgaagacgaaaatcttataagttgggtagagttgtaacgccc 18198254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12505174 - 12505022
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12505174 tcatgtgatccaaagtgatgatatgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagatgttgagaggc 12505075  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagctt 153  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12505074 aaggaaataccccttgttagagtcgtttgggctggagcgattggtgaaagctt 12505022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 256
Target Start/End: Original strand, 19167337 - 19167512
Alignment:
Q  81 aagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgct 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| | || |||||||||||    
T  19167337 aagtgaagaagttgagaggcaaggagatacctcttgtgaaaatcgtttggggaggagcgactggtgaaagtttaacgtgggagttggaaagtaagatgct 19167436  T
Q  181 cgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19167437 ggagtcttatccagagttgattgcatgaggtacattttcgaggacgacaattttataagttggggagagttgtaac 19167512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21471404 - 21471166
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||  | || ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  21471404 gatgatgtacaggttagagacaaccttacggttgagactgtaccattgagaatcaaagaccgagaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 21471305  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21471304 tgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacatgggagctggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatat 21471205  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  21471204 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaac 21471166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 11288076 - 11288318
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  11288076 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgagaggcaaggagatacctcttg 11288175  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | || |||||| | |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  |    
T  11288176 taagagttgtttggggtggagcaactggtgaaagtctaacttgggagttggagagtaagatgcaagagtcgtaccctgagttgtttgtttgaggtaagat 11288275  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11288276 ttcgaggacg-aaatcctctaagttggggagagttgtaacgccc 11288318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24364215 - 24363973
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || || ||| ||||  | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  24364215 gatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgaaactatacctttgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 24364116  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  24364115 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttatttgcttgaggtaagat 24364016  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  24364015 ttcgaggaggaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 24363973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1640533 - 1640355
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || | | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  1640533 gtgaagaagttaagaggcaaggagatacctctagtaaaattcgtttggggaggagcgactggtgaaagtttgacatgggaactggagagtaagatgctgg 1640434  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa-attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  1640433 agtcttatccagagttgtttgcataaggtaatattttcgaggacgaaaattctttgagttggggagagttgtaacgccc 1640355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18932479 - 18932370
Alignment:
Q  153 tgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttg 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18932479 tgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttg 18932380  T
Q  253 taacgcccac 262  Q
    ||||||||||    
T  18932379 taacgcccac 18932370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 8766626 - 8766868
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||| ||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  8766626 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggaatgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctgg 8766725  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8766726 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgcttgaggtaagat 8766825  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  8766826 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 8766868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15459139 - 15458897
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  15459139 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttaccgttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgagaggtaaagagatacctcttg 15459040  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  |||||  |||||||||| || || ||||| || || ||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  15459039 taagagttgtttggggtggagcatctggtgaaagtttaacttgggaactggaaagtaagatgcaagaatcttatccggagttgtttgtttgaggtaagat 15458940  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  15458939 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 15458897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20595147 - 20595045
Alignment:
Q  158 tgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595147 tgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 20595048  T
Q  258 ccc 260  Q
    |||    
T  20595047 ccc 20595045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 17025849 - 17026025
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  17025849 gtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagttggagagtaagatgctgg 17025948  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  17025949 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggatgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 17026025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 262
Target Start/End: Original strand, 1537616 - 1537720
Alignment:
Q  158 tgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1537616 tgggagcttgagagtaagatgctggagtcctatccagagctgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacg 1537715  T
Q  258 cccac 262  Q
    |||||    
T  1537716 cccac 1537720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18794493 - 18794281
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  18794493 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtggagaccttaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgaggggtaaagagatacctcttg 18794394  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || | |||| | |||||||||||||   |||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  18794393 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttaacttaggagttggagagtaagatgcggcagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 18794294  T
Q  217 ttcgaggatgaaa 229  Q
    |||||||| ||||    
T  18794293 ttcgaggacgaaa 18794281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28949325 - 28949154
Alignment:
Q  86 aagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||   |||||||  |||||||| || || || ||||  || ||||||||||| ||||    
T  28949325 aagacgttgagaggcaaggagatatctcttgtgaaggtcgtttggagaggagcgatcggtgaaagtttaacgtgagagcgagaaagtaagatgctagagt 28949226  T
Q  186 cttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28949225 cttattcagagttgtttgcatgaggtatattttcgaggacgaaaattttataagttggggagagttgtaacg 28949154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 34646064 - 34646306
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| || |||||||||||||    
T  34646064 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttaaggattgatgatcgtaaggtgaagtctttaagaggtaaagagataccccttg 34646163  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  || || ||||| |||||| | || |||||| | |||||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  34646164 taagagttgtttggggtggtgcaactggcgaaagcctaacttgggagttggagagtaagatgcaagaatcgtatccggagttgtttgtttgaggtaagat 34646263  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34646264 ttcgaggacg-aaatcctctaagttggggagagttgtaacgccc 34646306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19864506 - 19864402
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19864506 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacagtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 19864407  T
Q  101 aagga 105  Q
    |||||    
T  19864406 aagga 19864402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19879101 - 19878859
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  19879101 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccgtaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtctttgagaggtaaagagatacctcttg 19879002  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | || |||||| | |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  |    
T  19879001 taagagttgtttggggtggagcaactggtgaaagtctaacttgggagttggagagtaagatgcaagagtcgtaccccgagttgtttgtttgaggtaagat 19878902  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19878901 ttcgaggacg-aaatcctctaagttggggagagttgtatcgccc 19878859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25750612 - 25750370
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||  | || || || |||||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  25750612 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacggttgagactgtaccgttgagaatcgaagatcgtgaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctag 25750513  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  ||  |||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |    
T  25750512 tgaaggttttttgaggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggggagtaagatgctggagtcgtatcaagagttgtttgcttgaggtaatat 25750413  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  25750412 ttcgagga-caaaattctctaagttggggagagttgtaacgccc 25750370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 10469393 - 10469568
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  10469393 gtgaagtccttgagaggtaaggagatacctcttgtgagagtcgtctggggtgga-cgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 10469491  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| || ||  ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  10469492 agtcgtacccgaagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttgaggagagttgtaacgccc 10469568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18787625 - 18787449
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||  |    
T  18787625 gtgaagaagtttagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgcaagtttgacttgggagctagaaagtaagatgcggg 18787526  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  18787525 agtcgtatccagagttatttgtttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 18787449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 28283291 - 28283529
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||  | |    
T  28283291 gatgatgtgcaggttagggacaatctcacagttgagactttgccgttgaggatcgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaatacctttgg 28283390  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  28283391 tgagagtagtttggggtggagcaactagtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggactcttatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 28283490  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  28283491 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaac 28283529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 259
Target Start/End: Original strand, 22797237 - 22797328
Alignment:
Q  167 gagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22797237 gagagtaagatgcgggagtcttatccagaattgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgcc 22797328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 27561170 - 27561333
Alignment:
Q  92 ttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatc 191  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  |||| ||||| || || |||||||||   || |||||||    
T  27561170 ttgaggggcaaggaaatacccttagtgagagtagtttggggtggagcaactggtgaaagtctgacttgggaactggaaagtaagatgagggactcttatc 27561269  T
Q  192 cagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    | |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  27561270 ctgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 27561333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19428763 - 19428686
Alignment:
Q  182 gagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19428763 gagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 19428686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 22079151 - 22079209
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttacc 60  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22079151 catgtgatccaaagtgatgatgtacaagttagagataaccttacggttgagactttacc 22079209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18659879 - 18659829
Alignment:
Q  208 aggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18659879 aggtacattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgc 18659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 25959072 - 25959126
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||   |||||||||||||||||||    
T  25959072 tgaggtaaattttcgaggacgaaaattctataaaagggggagagttgtaacgccc 25959126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16943 - 16682
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16943 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagataaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 16844  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16843 aatgagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgattggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgcaggaatcttatccagagttgt 16744  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16743 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataaattggggtgagttgtaacgcccac 16682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 1014 - 1268
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014 catgtgatccaaagtggtgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaagattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 1113  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1114 aggagatacctctggtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatggaagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 1213  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1214 tgcttgaggtaaattttttaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35956 - 35903
Alignment:
Q  208 aggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35956 aggtaaattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgccca 35903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14024 - 13766
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14024 catgtgatccaaactgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 13925  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13924 aagagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaaaatgctggagtcttatccagagttgtt 13825  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13824 tgcttgaggtaaattttcgaggacaaaaatcttataagttagggagagttgtaacgccc 13766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31313 - 31138
Alignment:
Q  84 tgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcga 183  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||| | | |||||||||||||   |    
T  31313 tgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggtggtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggggttagagagtaagatgcggaa 31214  T
Q  184 gtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  31213 gtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatatttcaaggatgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 31138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 4725 - 4986
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4725 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 4824  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4825 aaggaaataccccttgttagagttgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 4924  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  4925 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatctttttagtaggggagagttgtaacgcccac 4986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8582 - 8321
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8582 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 8483  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8482 aaggaaataccccttgttagagttgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 8383  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  8382 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatctttttagtaggggagagttgtaacgcccac 8321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Original strand, 33894 - 34154
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33894 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagaaaatttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggca 33993  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33994 aggagataccccttgttatagtcgtttgggctagagcgactggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 34093  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34094 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 34154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 302 - 563
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  302 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagaaaaccttacggttgagactttaccggtgaggatcgaagatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 401  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  402 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgttggaatcttatccagagttgt 501  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  502 tcgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7363 - 7102
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7363 tcatgtaatccagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 7264  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7263 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaggatgctggagtcttatccagagttgt 7164  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7163 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 308645 - 308384
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  308645 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 308546  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  308545 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 308446  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  308445 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 308384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 165029 - 165288
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | | |||  | ||||||   |||||||||    
T  165029 tcatgtgattcaaagagatgatgtgcatgttagagataaccttacggttgagaccttaccagtaagaatttaaggtcgtgaggtgaagcaattgagaggc 165128  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  165129 aaagagatacgtcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagcttaatgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 165228  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  165229 ttgcatgaggtacattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgccc 165288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 279150 - 279329
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  279150 tcatgtgattcagagtgatgatatgcaagttaaagacaaccttacggtacagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 279249  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  279250 aaggaaataccccttgtgaaagtcgtttgggacaaagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgct 279329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 260278 - 260038
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  260278 gatgatgtgcaggttagagacaatctcactgttgagactttaccggtgaggatcgatgatcggaaagtgaagacgttaaggggcaaggaaataccccttg 260179  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  260178 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 260079  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  260078 ttcgaggacgaaattc-tatgatttggggagagttgtaacgc 260038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16079022 - 16079283
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16079022 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattggtgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 16079121  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16079122 aaggagatacctctcgttagagtcgtttgggctggagcgactggtgaaagcttgacatgggagctagaaagtaagttgctggagtcttatccagagttgt 16079221  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16079222 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgcccac 16079283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19106337 - 19106076
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19106337 tcatgtgatctagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 19106238  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19106237 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 19106138  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19106137 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 19106076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20136748 - 20136489
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20136748 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttaaggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagatgttgagaggc 20136649  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20136648 aaagagatacctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 20136549  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20136548 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 20136489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20249819 - 20249561
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249819 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 20249720  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20249719 aggatatacctcttgtgagagtcgtttgggacggaacgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 20249620  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249619 tgattgaggttaattttctaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 20249561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 33391418 - 33391679
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33391418 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 33391517  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33391518 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 33391617  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33391618 ttgcttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 33391679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21836920 - 21836659
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21836920 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 21836821  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21836820 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 21836721  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  21836720 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggggagttgtaacggccac 21836659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21747504 - 21747246
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747504 catgtaatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacagttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 21747405  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  21747404 aagagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagaaagtaagatgctggaatcttatctagagttgtt 21747305  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21747304 tgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttgggtagagttgtaacgccc 21747246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 51333882 - 51334143
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51333882 tcatgtgatccaaagtgacgatgtgcaaattagagacaaccttacggtagagactttgccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 51333981  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51333982 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 51334081  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51334082 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 51334143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21163250 - 21162991
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21163250 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagataaccttactgttgagactttgccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 21163151  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21163150 aaggatatacctctcgtgatagtcgttttggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 21163051  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163050 ttaaacgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 21162991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21830273 - 21830013
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21830273 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagatagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacattgagaggc 21830174  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacgga-gcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttg 199  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21830173 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttgg-acggaagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttg 21830075  T
Q  200 tttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21830074 ttcgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgccca 21830013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16350988 - 16351249
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16350988 tcatgtaattcagaatgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16351087  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16351088 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 16351187  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16351188 ttacttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 16351249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 41354858 - 41355119
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41354858 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgaggggc 41354957  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41354958 aaagagatacctctcgtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcgtatccagagttgt 41355057  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41355058 ttacttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 41355119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 50612805 - 50613059
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612805 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgagaattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 50612904  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50612905 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttggaacagagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggaatcttatccagagttgt 50613004  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50613005 ttgcatgaggt-aattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 50613059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 50620633 - 50620887
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620633 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgagaattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 50620732  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50620733 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttggaacagagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggaatcttatccagagttgt 50620832  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620833 ttgcatgaggt-aattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 50620887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20244154 - 20243912
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20244154 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagaccttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaaggcattgaggggcaaggaaataccccttg 20244055  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  20244054 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgtttgtttgaggtaagat 20243955  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20243954 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 20243912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 22433521 - 22433759
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22433521 gatgatgtgcaagttagagataaccttacggtagagactataccggtgaggattgatgatcggaaagtaaaggcattgaggggcaaggaaataccccttg 22433620  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  22433621 tgagagtcgtttggggcggagcggctggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggaattcttatccagagttgtttacttgaggtaagat 22433720  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  22433721 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 22433759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 19761255 - 19761512
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  19761255 tcatgtgatcccaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagacgttgagaggc 19761354  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| || || |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19761355 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggatggtgaaagtttaacgtgggagttagaaagtaaaatgctggagtcttatccagagttgt 19761454  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |  |  |||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19761455 t--cacgaggtacattttccaggacgaaaattctataagttgaggagagttgtaacgccc 19761512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20294366 - 20294124
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || || |||||| | ||| | ||||||||  || |||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20294366 gatgatgtacaggttagagacaacttgacagttgagactatgccattgaggattgataatagaaaggtgaagtctttgagaggtaaggagatacctcttg 20294267  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  20294266 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 20294167  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20294166 ttcgaggatgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 20294124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 31550586 - 31550828
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || ||||| || ||||    
T  31550586 gatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtctttgagaggtaaagagattcctcttg 31550685  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  31550686 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 31550785  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  31550786 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 31550828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 20395400 - 20395643
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  20395400 tgatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 20395499  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| |||||||||||      
T  20395500 gtgagagtcgtttggggtggagcgactagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagttgtatccggagttgttcgcttgaggtaaga 20395599  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20395600 tttcgaggatgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 20395643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37677031 - 37676788
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  37677031 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacaattgagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 37676932  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  37676931 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaggatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaaga 37676832  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  37676831 tttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 37676788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 20857166 - 20857408
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  20857166 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagatacctcttg 20857265  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  20857266 taagagttgtttggggtggagcaactggtgaaagtttgacttgggaattggaaagtaagatgcaagaatcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 20857365  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  20857366 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 20857408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 260
Target Start/End: Original strand, 20075485 - 20075709
Alignment:
Q  35 gacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacg 134  Q
    |||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||| |||| |||||| | ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||   |    
T  20075485 gacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgatagaaaggtgaagtctttgaggggtaaggagatacatcttgtgagagtcgtttggagtg 20075584  T
Q  135 gagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatctt 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |    
T  20075585 gagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-t 20075683  T
Q  235 ataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
     ||| || ||||||||||||| ||||    
T  20075684 gtaatttagggagagttgtaaggccc 20075709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 19665281 - 19665523
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  19665281 gatgacgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 19665380  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |    
T  19665381 tgaaggttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaagtaagat 19665480  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19665481 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 19665523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 17045404 - 17045507
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17045404 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagtcagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaaatgaagacgttgagaggc 17045503  T
Q  101 aagg 104  Q
    ||||    
T  17045504 aagg 17045507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24476808 - 24476708
Alignment:
Q  155 acatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgta 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||    
T  24476808 acatgggagctggagagtaagatgctagagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgta 24476710  T
Q  255 ac 256  Q
    ||    
T  24476709 ac 24476708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 20940468 - 20940651
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| |||||  | |||||||| || ||  |  |||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  20940468 gatgatgtgcaggttagagacaaccttatagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgagttgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 20940567  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  20940568 tgaaggttgtttggggtggagtaactagtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgt 20940651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21736641 - 21736502
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  | |   || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  21736641 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggagaaataaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 21736542  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgag 222  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  21736541 agtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaagatttcgag 21736502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20921555 - 20921502
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20921555 tgaggtaaattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgcc 20921502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 22465788 - 22465852
Alignment:
Q  195 agttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22465788 agttgtttgcttgaggtaatatttcaaggaagaaattctc-taagttggggagagttgtaacgccc 22465852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 297789 - 297723
Alignment:
Q  194 gagttgtttgcttgaggtaa-attttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  297789 gagttgtttgcatgaggtaatattttcgaggacgaaaattctttaagttggg-agagttgtaacgccc 297723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 16785 - 17043
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16785 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccagtaaggattgaggatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 16884  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16885 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggactgagcgactagtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 16984  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16985 ttgcttgaggtaaa-tttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 17043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6258 - 6000
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6258 catgtgatccaaagtgatgatatgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtcaggattgatgatcgcaaagtgaagacgttgagaggca 6159  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6158 tggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctgaagtcttatccagagttgtt 6059  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6058 cgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaatgccc 6000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 262
Target Start/End: Original strand, 37068 - 37327
Alignment:
Q  3 atgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  37068 atgtgatccagaatgatgatgtgcaagtaagatataaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgatgaacggaaagtgaagacgttgagaggcag 37167  T
Q  103 ggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgttt 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37168 ggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactagtgaaagcttgacgtgggggcttgagagtaagatgttggagtcttatccagagttgttt 37267  T
Q  203 gcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37268 gcttgaggtaaatttttgaggacaaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 37327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 19074 - 19316
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||     
T  19074 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagaccttaccgaagaggattgatgatcgaaaagtgaaggcgttgaggggcaaggaaataccccttt 19173  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  19174 tgagagtcgtttgggacggagcgacttgtgaaagtttgacttaggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgtttgtttgaggtaagat 19273  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  19274 ttcgaggatgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 19316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1124 - 866
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  1124 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagttgttgagaggca 1025  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1024 atgagatacctcttgtgagagtcgtttgagacggagcgactggtaaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 925  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  924 tgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9328 - 9070
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9328 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttatcggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 9229  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9228 aggagatacctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactgatgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggtgtcttatccagagttgtt 9129  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9128 tgcattaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 9070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43140 - 42879
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43140 tcatgtaatccagagtgacgacgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacattgagaggc 43041  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  43040 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcctatccagagctgt 42941  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42940 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 42879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8460 - 8210
Alignment:
Q  12 agagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacc 111  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8460 agagtgacgatgtacaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacc 8361  T
Q  112 ccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggt 211  Q
     || |||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8360 tctcgtgagattcgtttggacgggaacgactggtgagagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctagagtcttatccagagttatttgcttgaggt 8261  T
Q  212 aaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  8260 aaattttcgaggacgaaaatcttttaattgggggagagttgtaacgcccac 8210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 62202 - 62014
Alignment:
Q  74 gatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagta 173  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  62202 gatcgtaaagtgaagacattgagaggcaaggagatacctctcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagta 62103  T
Q  174 agatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  62102 agatgctggagtcctatccagagctgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 62014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 2467 - 2706
Alignment:
Q  21 atgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgag 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2467 atgtgcaagttagagataacctcacggttgagattttaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctcttgtgaa 2566  T
Q  121 agtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcg 220  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  2567 ggtcgtttaggaaggagcgactggtgagagtttaacgtgggagctggaaagtaagatgctagagtcttatccagagtcgtttgcatgaggtgcattttcg 2666  T
Q  221 aggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2667 aggacaaaaattttataagttggggagagttgtaacgccc 2706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 50850 - 51092
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||  | || ||||| ||| | || |||||  | |||||||| || |||||||| ||||    
T  50850 gatgacgtgcaagttagagacaaccttacggtggaaaccttaccgttgagaattgatgataggaaggtgaaatccttgagaggtaaagagataccacttg 50949  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | ||||| || || |||||||| || ||||||||||  ||||  || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  50950 tgagagtcgtttggggtggagcgactagagaaagtttaacttgggagctggaaagtaagatgcgggagttgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 51049  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  51050 ttcgaggatg-aaatcctctaagttggggagagttgtaacgccc 51092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10914 - 10658
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10914 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacattgagaggca 10815  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  10814 aagaga--cctcttgtgagagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatacaaagttgtt 10717  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10716 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 10658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 6008 - 5944
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaag 66  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  6008 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttatggttgacactttaccggtaag 5944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5207 - 4949
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  5207 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaggtgaagacgtagagaggc 5108  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5107 aaggagatacctcttgtgatagtcgtgtgggacggagcgactggtgaaagcttaccgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgt 5008  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5007 ttgcatgaggtaaattttcgaggacggaaattttataagttggggagagttgtaacgcc 4949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 662 - 405
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  662 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagaaaaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtaaagacgttgaaaggc 563  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  562 aaagagatacctcttgtgagagtcgtttgggaatgagcgactggtgaaagcctaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagatgt 463  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  462 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagttggggagagttgtaacgc 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 33072 - 33333
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33072 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgaggattgaagatcgaaaagtgaagacattgagaggc 33171  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33172 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttaagacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaagatgctggaatcttatccagagttgt 33271  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33272 ttgcacgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 33333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 26241 - 26502
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  26241 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgaagattgaagatcgaaaggtgaaggtgttgagaggc 26340  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  26341 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggggcgactggtgaaagcttgacgtgggagttggagagtaagatgttggagtcttatctagagttgt 26440  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441 ttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 26502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1081 - 905
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| ||||| || || |  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  1081 gtgaagaagttaagagtcaaggatatacctctagtaaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 982  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  981 aatcttatcccgagttgtttgcttaaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttttaacgccc 905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 229029 - 228770
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  229029 tcatgtgatccaaagtgatgatgttcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 228930  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  228929 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagccagagagtaagatactggagtcttatccagagttgt 228830  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  228829 ttgcatgaggtaaattctcaaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 228770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 219737 - 219996
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||  | ||||||   || ||||||    
T  219737 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttactagtaagaattgaaggtcgtgaggtgaagtaattaagaggc 219836  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  219837 aaggagatacctcatgtgcaagtcgtatgggacggagcggctggtgaaagcttaacgtgggagatggaaagcaaaatgctggagtcttatccagagttgt 219936  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  219937 ttgcacgagataaattttcgaggacaaaaatcctataagttggggagagttgtaacgccc 219996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6923 - 6664
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  6923 tcatgtaatccaaagtgacgatgtgcaagatagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcgtaa-gtgaagacattgagaggc 6825  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacgga-gcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttg 199  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6824 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttgg-acggaagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttg 6726  T
Q  200 tttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccca 261  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6725 ttcgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgccca 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 7536 - 7784
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7536 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggc 7635  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7636 aaggagatacctcttgtgagagtcgtttggaacggagcgattgatgaa-------------agcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 7722  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7723 ttgcatgaagtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 7784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 127519 - 127780
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  127519 tcatgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtgaggattgaagatcgaaaagtgaagacgttgaaagac 127618  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  127619 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttggagagtaatatgttggaatcttatccagagttgt 127718  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  127719 ttgcaagaggtaaattttcgaggacgaaaatgttataagttggggagagttgtaacgcccac 127780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 162098 - 161839
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  162098 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttacttgtaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaagca 161999  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||| |    
T  161998 aggagataccacttgtgagagttgtttggaaaggagcgactggtgaacgcttaacgtgggagctagagcgtaagatgctggaatcctatccagagttggt 161899  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagtt-ggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  161898 tgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttgggggagagttgtaacgccc 161839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 448045 - 447790
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||  ||||||||  ||||||||||    
T  448045 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccagttagaattgaaggtcgtgaagtgaagcagttgagaggc 447946  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  447945 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtaaaagcttaatgtgggagctagagagtaagatgctgaagtcttatccagagttgt 447846  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  447845 ttgcacgaggtaaattttcgaggacaaaaatcctataagttggggagagttgtaac 447790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 91386 - 91499
Alignment:
Q  140 actggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataag 239  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||  | ||||    
T  91386 actggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatatttcgagga-caaaattctctaag 91484  T
Q  240 ttggggagagttgta 254  Q
    |||||||||||||||    
T  91485 ttggggagagttgta 91499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 154680 - 154723
Alignment:
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154680 tttcgaggacgaaattctt-taagttggggagagttgtaacgccc 154723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15478 - 15220
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15478 catgtgatccaaagtgatgatgtgcaagttagagatatccttacggttgagactttaccggtgaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggaa 15379  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    | |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15378 aagagatacctcctgtgaaagtcgtttgggaaggagcgactagcgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtt 15279  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15278 tgcatgaggtaaattttcgaggatgaatatcttataagttggggagagttgtaatgccc 15220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 139
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  400 tcatgtaattcagagtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccgttgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 301  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  300 aaggagatacctctcgtgagagtcgtttggttaggagcgactggtgaaagcttgacgtaggagcttgggagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 201  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  200 ttacttaaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaaatgggggagagttgtaacgcccac 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30878 - 30638
Alignment:
Q  20 gatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtga 119  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  30878 gatgtgcaagttagagataaccttactgttgagactttgccggtaaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctctcgtga 30779  T
Q  120 gagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttc 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  30778 gagtcgtttcggacggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgaacgaggtaaactttc 30679  T
Q  220 gaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30678 gaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 30638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 732
Alignment:
Q  3 atgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaa 102  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  989 atgtgatccaaggtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaacgattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaa 890  T
Q  103 ggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgttt 202  Q
     || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  889 agaaatacctcttgtgaaagtcgtttgggatggagcgactggtgcaagattgaagtgggagctagagagtaagatgctagaatcttatccacagttgttt 790  T
Q  203 gcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  789 gcatgaggtaaattttttaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19090 - 18848
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19090 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgaagatcggaaagtgaagacgttgaggggcaaggaaataccccttg 18991  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| | || ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18990 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttaacttgggagatggatagtaagatgcgggattcttatccagagttgtttgtttgaggtaagat 18891  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  18890 ttcgaggacgaaattc-cctaatttggggagagttgtaacgccc 18848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 59108 - 59348
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| | |||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  59108 gatgatgtgcaagtgagagacaaccttacgattgagaccttaccagtgaggattgaaggtcgtgaagtgaagaagctgagaggcaaggatatacctcttg 59207  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||  |||| |  |||    
T  59208 tgaaaatcgtttgggaaggagcggctggtgaaagtttgaagtgggaattggagagtaagatgctggagtcgtatccgtagttatttgaatgagatgtatt 59307  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
    ||| |||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||    
T  59308 ttcaaggacgaaaatattctaagtggggggaagttgtaacg 59348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14863 - 14604
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | | |||  | ||||||| ||||||||||    
T  14863 tcatgtgatccagagagatgatgtgcaagtcagagataaccttacggttgagaccttaccagtgagaatttaaggtcgtgaggtgaagaagttgagaggc 14764  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14763 aaggagatacctcttgtgaaggtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagtttatcgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 14664  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14663 ttgcttaaggtaaattttctaggactaaaatcctataagttggagagagttgtaacgccc 14604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 226
Target Start/End: Original strand, 32098 - 32273
Alignment:
Q  51 agactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaag 150  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32098 agactttaccgttaaggattgatgatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtaaaag 32197  T
Q  151 cttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatg 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32198 cttgacgtgggagctagagagtaagatgatggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgatgatg 32273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36025 - 35813
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  36025 gatgacgtgcaagttagagacagccttacggtggagactttaccgataaggattgatgatcggaaagtgaaggctttgaggggcaaggaaataccccttg 35926  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  35925 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgtttacttgaggtaagat 35826  T
Q  217 ttcgaggatgaaa 229  Q
    |||||||| ||||    
T  35825 ttcgaggacgaaa 35813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20092 - 19850
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20092 gatgacgtgcaagttagagacaaccatacggtggagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaaggctttgaggggcaaggaaataccccttg 19993  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||| || |||||||  |    
T  19992 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagtttgaattgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccaaagttgtttactagaggtaagat 19893  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||    
T  19892 ttcgaggatgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaacgccc 19850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43490 - 43234
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||    
T  43490 catgttattcagagagatgacgtgcaagttagagacaaccttacggcggagactttaccggtgaggattgatgatcggaaggtgaaggctttgaggggca 43391  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  43390 aggaaataccccttgtgagagtcgtttgggacggaacgactggtgaaagtttgacttaggagctggagagtaagatgcgagattcttatccagagttgtt 43291  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    | ||||||||||  | ||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43290 tacttgaggtaagatatcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgcc 43234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 44502 - 44444
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttacc 60  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44502 catgttattcagagagatgacgtgcaagttagagacaaccttacggcggagactttacc 44444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4018 - 3759
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||  | ||||||   |||||||||    
T  4018 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaggtgaagcaattgagaggc 3919  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  3918 aaggagatacctcttgtgaaagttgtttggcacggagcggctagtgaaagcttaacgtgggagctagagagaaagatactggagtcttatccagagttgt 3819  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3818 ttgcatgaggtacattttcgagaatgaaaatcctataagttggggagagttgtaacgccc 3759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 13313 - 13556
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13313 gatgatgtgcaagtcagagataaccttacggttgagactttaccagtgagaattgaagatcgtaaagtgaagacgttgagaggcaagaagatacctcttg 13412  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||| |||    
T  13413 tgaaagtcgtttgggaaggatcggctggtgaaagcttaacgtgggagttggaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcacgaagtacatt 13512  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13513 ttcgaggacgaaaattctataagttggggagaattgtaatgccc 13556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8543 - 8499
Alignment:
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8543 tttcgaggatgaaattcttttaagtgggggagagttgtaacgccc 8499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15735 - 15691
Alignment:
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15735 tttcgaggatgaaattcttttaagtgggggagagttgtaacgccc 15691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15936 - 15695
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15936 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtggagactctaccggtaaggattgatgatcggaaagtgaaggcgttgaggggcaaggagataccccttg 15837  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |  || |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  15836 tgagagtcgtttgcaacggagcgactagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagaaacgggattcttatccagagttgtttacttgaggtaagat 15737  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  15736 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgcc 15695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 51 - 236
Target Start/End: Original strand, 4979 - 5164
Alignment:
Q  51 agactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaag 150  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4979 agacgttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagatgttgagaggcaaggagatacctctcgtgagagtcgtttggagcggagcgactggtgaaag 5078  T
Q  151 cttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttat 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5079 cttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttat 5164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 580 - 840
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  580 tcatgtgatcccaagagacgatgtgcaagttagagataatcttacggttgagtctttaccggtgagaattgaagatcgtaaagtgaagacgttgagaggc 679  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  680 aacgagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagcttaacgtggaagttggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 779  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaa-tcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||  |||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  780 ttgcacgaggtacattttcgaggacgaaaatttttgtaagttggggagagttgtaacgccc 840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 112007 - 111750
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  112007 tcatgtgatcccaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacagttgagaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagacgttgagaggc 111908  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  111907 aaggagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagtttaacgtgggagttggaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 111808  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||| ||||||| |||||  |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  111807 ttgcatgaggtacattttttaggacgaaaattctataagttgggaagagttgtaacgc 111750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 203789 - 204042
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| | || ||||| | |||  ||||||| | |||||||||||    
T  203789 catgtgattccgagggatgatgtgcaagttagagataatcttacgatagagaccttaccattgagaattgaaggtcgcgaagtgaataagttgagaggca 203888  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||  ||||| |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  203889 aggagatacctctagtgaaagttgtttggggaggagcaactggtgagagtttgacgtgggagttggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtt 203988  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    || ||||||||  |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  203989 tgattgaggtatgttttcgaggacgaaaat-tcttaagttggggagagttgtaac 204042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 385723 - 385547
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||| ||  || |  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  385723 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttagggaggtgtaactagtgaaagtttgacatgggagctggagagtaagatgctgg 385624  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  385623 agtcttatccagagttgtttgcttgagataatatttcgaggatgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 385547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 117525 - 117298
Alignment:
Q  32 agagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||    
T  117525 agagacaaccttacagttgagaccttatcgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggg 117426  T
Q  132 acggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaat 231  Q
      ||||  | |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |    
T  117425 gtggagtaattggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaatt 117326  T
Q  232 cttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  117325 c-tctaagttggggagagttgtaacgccc 117298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 322674 - 322432
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||   | |||||||| || ||  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||      
T  322674 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttactgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgaaaggcaaggatatacctctaa 322575  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   | || ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  322574 tgaaggttgtttggggtggagtaaccagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggtactcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 322475  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  322474 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 322432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16973 - 16714
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| | |||  | ||||||   |||||||||    
T  16973 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttatcagtaagaattgaaggtcgtgaggtgaagcaattgagaggc 16874  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16873 aaggagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgttggagtcttatccagagttgt 16774  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | || ||||||| |||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16773 tcgcatgaggtacattttttaggacgaaaaatctataagttggggagagttgtaacgccc 16714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16736 - 16991
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | |||  | ||||||   |||||||||    
T  16736 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacagttgagaccttaccagtaagaattgaaggtcgtgaggtgaagcaattgagaggc 16835  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  16836 aaggagatacctcttgtgaaagtcgtttgggaaggagccgctggtgaaagcttaacttgggagctagaaagtaagatactggagtcttttccagagttgt 16935  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16936 ttgcatgaggtaaattttcgaggacaaaaatcctataagttagggagagttgtaac 16991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 26055 - 26298
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26055 gatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagaagttgagagacaaggagatacctcttg 26154  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  ||| ||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26155 tgaaggtcatttggggaggagggactggtgaaagtttaacatgggagttggaaagtaagatgttggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtacatt 26254  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26255 ttcgaggacgaaaattttataagttggggagagttgtaacgccc 26298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 973 - 1213
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  973 gatgacgtgcaagttagagacaaccttacggtggagactttaccggtgaggattgacgatcggaaagtgaagacgttgaggggcaaggaaataccccttg 1072  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  1073 tgagagtcgttcgggacagagcgactggtgaaaatttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaatat 1172  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1173 ttcgagga-caaaattctataatttggggagagttgtaacgc 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 49543 - 49783
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  49543 gatgacgtgcaagttagagacaaccttacggtggagactttaccggtgaggattgacgatcgtaaagtgaagacattgaggggcaaggaaataccccttg 49642  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || || || || |||||||||| |||||||||  |    
T  49643 tgagagtcgtttgggacggagcgactagtgaaagcttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcataccctgagttgtttgtttgaggtaagat 49742  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    || ||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  49743 ttagaggaagaaattc-tatgatttggggagagttgtaacgc 49783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15710 - 15656
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15710 tgaggtaaattttcaaggacgaaaattctataagcgggggagagttgtaacgccc 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 15415 - 15658
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | | |  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15415 gatgatgtgcaagttagagataaccttacggtcgagaccttaccagtgagaattgaaggttgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggagatacctcttg 15514  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15515 taaaagtcgtttgggaaggagcaactggtgaaagtttaacgtgggagttggaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtacatt 15614  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15615 ttcgaggacgaaaattctataagttggagagagttgtaatgccc 15658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Original strand, 17668 - 17823
Alignment:
Q  14 agtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17668 agtgatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagactttaccggtgaggattgatgatcggaaagtgaagacgttgagaggcaaggagttacctc 17767  T
Q  114 ttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgag 169  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17768 tcgtgagagtcgtttgggagggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgag 17823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 117241 - 117484
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  117241 gatgatgtgcaagttagagataacctttcggttgagaccttaccagtaagaattgaaggtcgtgaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctcttg 117340  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||| || || |  ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  117341 tgaaagtcgtttgaggaggagcgattggtgaaagtttaacgtaagagttggaaagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtacatt 117440  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  117441 ttcgaggacaaaaagtttataaattggggagagttgtaacgccc 117484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2208 - 1949
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||||| | |||  | ||||||  ||||||||||    
T  2208 tcatgtgatctaaagagatgatgtgcaacttagagataaccttaaggttgagaccttaccagtttgaattgaaggtcgcgaggtgaagcagttgagaggc 2109  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2108 aaagagatacctcttgtgaaagtcgtttgggacggagcggctggtgaaagcttaacgtgggaaatggagagtaagatgttggagtcttatccagagttgt 2009  T
Q  201 ttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2008 ttgtgtgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctataagttcgggagcgttgtaacgccc 1949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 42669 - 42911
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  42669 gatgatgtgcaagttagatacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 42768  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  42769 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagttttacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagat 42868  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  42869 tttgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 42911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 47735 - 47977
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  47735 gatgatgtgcaagttagatacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 47834  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  47835 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagttttacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagat 47934  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  47935 tttgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 47977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1203 - 1024
Alignment:
Q  81 aagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||    
T  1203 aagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctcttgtgaaggtcgtttggggaggagcgactggtgaaagtttaacgtgggagctggaaagtaggatgct 1104  T
Q  181 cgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1103 agagtcttatccagagttgtttgcatgaggtacattttcgaggacgaaaattttataagttggggagacttgtaacgccc 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11788 - 11642
Alignment:
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11788 gtgagagtcgtttggtcgggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 11689  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11688 tttcgaggacgaaaatcctttaagtgggggagagttgtaacgcccac 11642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 25407 - 25649
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||| | |||||||| | |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| | || |    
T  25407 gatgatgtgcaagttagagataaccttacagttgagatcttaccattgaggattgaaggtcgtgaagcgaagaagttgagaggcaaggagatatctctag 25506  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||| |||||||  ||||| |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25507 tgaaagttgtttggggaggagcaactggtgagagtttgacgtgggagttggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgattgaggtatatt 25606  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  25607 ttcgaggatgaaaat-tcctaagttggggagagttgtaacgccc 25649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 498 - 256
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  498 gatgatgtgcaagatagagacaaccttacggtggagaccttaccgttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaatgagatacctcttg 399  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| || || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  398 tgagagtcgtttggagtggagcgactagtgaaagtttaacttgggagctggaaagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatat 299  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  298 ttcgaggacggaattc-tataacttggggagagttgtaacgccc 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 39225 - 39468
Alignment:
Q  16 tgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccctt 115  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||  ||||| | ||| | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  39225 tgatgatgtgcaggttagggacaacctgacagtttagactatgccattgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctctt 39324  T
Q  116 gtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaat 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  39325 gtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttccttgaggtaaga 39424  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  39425 tttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 39468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 29105 - 29349
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||  | || ||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  29105 gatgatgtgcaagttagagataaccttacagttgagaccttaccgttgagaattgaaggtcgcgaagtgaagaagttgagaggcaaggagatacctctag 29204  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa-at 215  Q
    ||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||    
T  29205 tgaaagttgtttggggaggagcaactggtgaaagtttggcatgggagctggagagtaagatgctggagtcttatccgaagttgtttgtttgaggtaatat 29304  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  29305 tttcgaggacgaaaattctttaagttgcggagagttgtaacgccc 29349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 41096 - 41340
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||  | || ||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  41096 gatgatgtgcaagttagagataaccttacagttgagaccttaccgttgagaattgaaggtcgcgaagtgaagaagttgagaggcaaggagatacctctag 41195  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa-at 215  Q
    ||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||    
T  41196 tgaaagttgtttggggaggagcaactggtgaaagtttggcatgggagctggagagtaagatgctggagtcttatccgaagttgtttgtttgaggtaatat 41295  T
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  41296 tttcgaggacgaaaattctttaagttgcggagagttgtaacgccc 41340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 262
Target Start/End: Original strand, 63383 - 63480
Alignment:
Q  165 ttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63383 ttgagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcatgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 63480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 12764 - 12892
Alignment:
Q  134 ggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12764 ggagcgactggtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgttggagtcttatccagagttgtttgcttgagataaattttcgaggacgaaaatct 12863  T
Q  234 tataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12864 tataagttggggagagttgtaacgcccac 12892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 5926 - 6169
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || | |||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  5926 gatgatgtgcaagtaagagataaccttacgattgagaccttaccagtgaggatcgaaggtcgtgaagtgaagaagctgaaaggcaaggagatacctcttg 6025  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||| |||||||  ||||||  ||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6026 tgaaagtagtttggggaggagcggttggcgaaaatttgacgtgggagttggagagtaagatgctggagtcatatccagagttgtttgcatgaggtacatt 6125  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  6126 ttcgaggacgaaaatattctaagtgggggagagttgtaatgccc 6169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 38533 - 38776
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38533 gatgatgtgcaagtgagagacaaccttacgattaagaccttaccagtgaggattgaaagtcgtgaagtgaagaagttgagaggcaaggagatacctcttg 38632  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  38633 tgaaagttgtttgggaaggagcggctggtgaaagtttgacatgggaattggaaagtaagatgctggaatcgtatccagagttgtttgaatgaggtacatt 38732  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||  ||||| || | |||  ||||||||||||||||||    
T  38733 ttcgaggactaaaatattcttagtgtgggagagttgtaacgccc 38776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 43212 - 43455
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||   |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  43212 gatgatgtgcaagtgagagacaacctcacgattaagaccttaccagtgaggattgaaagtcgtgaagtgaagaagttgaggggcaaggagatacctcttg 43311  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| |||||||| ||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  43312 tgaaagtcgttttggaagaagcggttggtgaaagtttgacgtgggaattggaaagtaagatgctggaatcgtatccagagttgtttgaatgaggtacata 43411  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  43412 ttcgaggacaaaaatattctaagtgggggagagttgtaacgccc 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Original strand, 13699 - 13770
Alignment:
Q  185 tcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||    
T  13699 tcttatccagagttatttccttcaggtaaattttcgaggatgaaaattgtttaagtgagggagagttgtaac 13770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42738 - 42513
Alignment:
Q  32 agagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  42738 agagacaacctgacagttgagactttaccagtgaagattgatgatcagaaggtgaagaggttgagaggcaaggaaatacctcttgtgtgagtcgtttggg 42639  T
Q  132 acggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaat 231  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| |    
T  42638 atggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcgtatccggagttgtttgtttgaggtaagatttcaaggacgaaatt 42539  T
Q  232 cttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||    
T  42538 c-tgtaatttggggagagttgtaacgc 42513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7610
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  | || || || |||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |    
T  7372 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacggttgagactttaccgttgagaatcgaagatcgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatataactctag 7471  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7472 tgaaggttgtttggggaggagtaacaggtgaaagtttgacatgggagctggagagtaagatgttggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatat 7571  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  7572 ttcgaggatgaaattc-tctaagttggggagagttgtaac 7610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10794 - 10556
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||  ||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||    
T  10794 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagaccatatcagtgaggattgatgatcagaaagtgaaggctttgaggggaaaggaaataccccttg 10695  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||   || |||||||||||| | ||| || |||||||  |    
T  10694 tgagagtcttttgggacggagcgactggtgaaagtttgacttgggagttggagagtaagatgtgggattcttatccagagctttttactcgaggtaagat 10595  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||    
T  10594 ttcgaggacgaaattc-tgtgatttggggagagttgtaac 10556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 10419 - 10661
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  10419 gatgatgtgcaagttagagacaacctgacggtggagtccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 10518  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  10519 tgagagttgtttggggtggatcgactggtgaaagtttgacatgggagctggaaagtaagatgcaagaatcgtatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 10618  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| || | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  10619 ttcgaggacgatattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 61549 - 61787
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  61549 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagagaccacgccggtgaggattgacgatcggaaagtgaaggctttgaggggcaaggaaataccccttg 61648  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||| |||||| | || |  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  61649 tgagagttgtttggaaaggtgtaacgggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgttcgcttgaggtaagat 61748  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  61749 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 61787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 11 - 269
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggca 101  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| | || ||||| | |||  ||||||||| |||||||||||    
T  11 catgtgattccgagggatgatgtgcaagttagagataaccttaccgttgagaccttaccattgagaattgaaggtcgcgaagtgaagaagttgagaggca 110  T
Q  102 aggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtt 201  Q
    |||||||| | || |||| ||| |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  111 aggagatatctctagtgaaagttgtttggggaggagaaactggtgagagtttgacgtgggagttggagagtaagatgttggagtcttatccagagttgtt 210  T
Q  202 tgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  211 tgattgaggtatgttttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaatgccc 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6263 - 6142
Alignment:
Q  139 gactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataa 238  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6263 gacttgtgaaagcttgacgtgggagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatttttgaggacgaaaatcttataa 6164  T
Q  239 gttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6163 gttggggagagttgtaacgccc 6142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6357 - 6262
Alignment:
Q  2 catgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgaga 97  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6357 catgtgatcctaggtgatgatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttaccggtaaggattgatgatcgaaaagtgtagacgttgaga 6262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 13117 - 13329
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  |||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  13117 gatgatgtgcaggttagagacaatctcactgttaagactttaccggtgagaatcgatgatcggaaagtgaagacgttaaggggcaaggaaataccccttg 13216  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  13217 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacttgcgagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 13316  T
Q  217 ttcgaggatgaaa 229  Q
    |||||||| ||||    
T  13317 ttcgaggacgaaa 13329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 58152 - 58347
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  58152 gatgatgtgcaggttagagacaatcttactgttgagactttaccggtgaggatcgatgatcggaaagtgaagacgttaaggggcaaggaaataccccttg 58251  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaa 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  58252 tgagagtc-tttgggacggagcgactagtgaaagcttgacttgggagctggaaagtaagatgcgggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaa 58347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 49369 - 49609
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||| | ||| |||||||| || ||||| || |    
T  49369 gatgatgtgcaggtcagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaataagttaagaggcaaagatatacctctag 49468  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  49469 tgaaggt-gtttggggaggagtaactggtgaaagtttgagttgggagctggagagtaagatgcgagagtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatat 49567  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  49568 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgcc 49609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 248568 - 248345
Alignment:
Q  32 agagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttggg 131  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || | |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  248568 agagacaacctgacagttgagactttaccggtgaagattgatgatcagaaagtgaagaggttgagaggcaaggagatacctcttgtgagagtcgtttggg 248469  T
Q  132 acggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaat 231  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  248468 atggagcgactagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgattgatgtaagatttcgaggacgaaatt 248369  T
Q  232 cttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |   ||| |||||||||||||||||    
T  248368 c-agtaatttggggagagttgtaac 248345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 17049 - 17291
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||  | |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  17049 gatgatgtgcaggttagggacaacctgacagttgagactatgccgttgaggattgatgacagaaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 17148  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  17149 tgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccggagttgtttgcttgaggtaagat 17248  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  17249 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 17291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 117194 - 117335
Alignment:
Q  14 agtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacccc 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  117194 agtgacgatgtgcaagttagagacaaccttacggtagaaactttaccggtgaggattgatgatcgtaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacctc 117293  T
Q  114 ttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttga 155  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  117294 tcgtgagagtcgtttggacgggagcgactggtgaaagcttga 117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 112529 - 112288
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  112529 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgagaggtaaagagatacctcttg 112430  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| |||||||||  |    
T  112429 taagagttgtttggggtggagcaactggtgaaagtctaacttgggagttggagagtaagatgctagagtcgtaccctaagttgtttgtttgaggtaagat 112330  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  112329 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgcc 112288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 96338 - 96580
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  96338 gatgatgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgacgatcgaaaggtgaagtctttgaggggtaaagagatacctcttg 96437  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | ||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||  |  || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  96438 taagagttgtttggggtggagcaaccggtgaaagcttgacttgggaactggaaagtaagatgcaagtatcgtatccggagttgtttgtttgaggtaagat 96537  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  96538 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 96580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 262
Target Start/End: Original strand, 124814 - 124925
Alignment:
Q  151 cttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagt 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  124814 cttgacgtgggagcttgagagtaagatgctggagtcttatccatagatgtttgcttgaggtaaatttttgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagt 124913  T
Q  251 tgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||    
T  124914 tgtaacgcccac 124925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1550 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1550
Description:

Target: scaffold1550; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 1 - 121
Alignment:
Q  140 actggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataag 239  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  1 actggtgaaagcttaacgtgggagctagagagtaagatgctggaatcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttataat 100  T
Q  240 ttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  101 ttggggagagttgtaacgccc 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2514 - 2320
Alignment:
Q  65 aggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagc 164  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  2514 aggattgatgatagaaaggtgaagtctttgagaggtaaggagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggtgaaattttgacttgggagc 2415  T
Q  165 ttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | |||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  2414 tggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 2320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 735 - 972
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  735 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 834  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  835 tgaaggttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgattgaggtaagat 934  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaa 255  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  935 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaa 972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10858 - 10616
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |    
T  10858 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaaaaagttgagaggcaaggatatacctctag 10759  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  10758 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgagagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagat 10659  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10658 ttcgaggacgaaattc-tctaagttgggaagagttgtaacgccc 10616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 11075 - 11314
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||||  | |||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |    
T  11075 gatgatgtgcaagttagagacaatcttacaattgagaccttaccgttgaggattgaagatcgtgaggtgaagaagttaagaggtaaggagatatctctag 11174  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | | ||| |||||||  |||||  || ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  11175 taaaagttgtttggggaggagcatctagtgaatgtttgacatgggagctggagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatat 11274  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacg 257  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  11275 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacg 11314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 2201 - 2443
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||   | || ||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  2201 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacagttgagaccttacggttgagaattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 2300  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  2301 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatat 2400  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2401 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6963 - 6760
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| | |||  | ||||||   |||||||||    
T  6963 tcatgtgatccaaagagatgatgtgcaagttagagataaccttacgtttgagactttaccagtgagaattgaaggtcgtgaggtgaagcaattgagaggc 6864  T
Q  101 aaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgt 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6863 aaagagatacctcttgtgaaagttgtttaggacggagtggctggtgaaagtttaacgtgagagctagagagtaagatgctggagtcttatccagagttgt 6764  T
Q  201 ttgc 204  Q
    ||||    
T  6763 ttgc 6760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 5338 - 5580
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  5338 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 5437  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5438 tgaaagttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagacatatccagagttgtttgcttgaggtaatat 5537  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  5538 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 5580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26231 - 25993
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||| ||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  26231 gatgatgtacaggttagagacaacctgacagttgagactatgccattgaggattgatgatcgtaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttg 26132  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  |    
T  26131 tgagattcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgtttgaggtaagat 26032  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  26031 ttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 25993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36793 - 36661
Alignment:
Q  123 tcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgag 222  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36793 tcgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtacccggagttgtttgtttgaggtaagatttcgag 36694  T
Q  223 gatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    || |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  36693 gacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 36661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 34013 - 34255
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||  | || ||||| ||| | || |||||  | |||||||| || |||||||| ||||    
T  34013 gatgacgtgcaagttagagacaaccttacggtggaaaccttaccgttgagaattgatgataggaaggtgaaatccttgagaggtaaagagataccgcttg 34112  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
T  34113 tgagagtcgtttggggtggagcgactggagaaagtttaacttgggagctggaaagtaagatgcgggagtcgtacccagagttgtttgtttgaggtaagat 34212  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34213 ttcgaggacg-aaatcctctaagttggggagagttgtaacgccc 34255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37106 - 36930
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  37106 gtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacatgggagctggagagtaagatgcggg 37007  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  37006 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatatttcgagcatgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 36930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26737 - 26663
Alignment:
Q  92 ttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagctt 166  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  26737 ttgagaagcaaggagatacctcttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgtaagcttatcgtgggagctt 26663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0947 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0947
Description:

Target: scaffold0947; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 2767 - 3009
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  2767 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgataccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 2866  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  2867 tgaaggttgtttggggtggagtcacctgtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaagat 2966  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2967 ttcgaggatgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 3009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 17526 - 17765
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||| | |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  17526 gatgatgtgcaagtgagagacaatcttacgattgagaccttaccagtgaggattgaaggtcgtgaagtgaagaagctgagaggcaaggagatacctcttg 17625  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||| | |||||||||  ||||   |||||||||| ||||| |||||| |  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  ||||||| |||    
T  17626 tgaaaatcgtttggggaggagttgctggtgaaagtttgacgtgggagttgaagagcaagatgctggagtcgtattcagagttatttgaatgaggtacatt 17725  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||| |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  17726 ttcaaggacgaaaatattctaagtgggggagaattgtaac 17765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 6301 - 6478
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  6301 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggaggagtaacgggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcttg 6400  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttg-aggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  6401 agtcttatccagagttgtttgcttgaaggtaaaatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 6478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18819 - 18582
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||| ||||    
T  18819 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacggtggagaccttacctttgagaattgatgatcgaaaggtgaagtccttgtggggtaaagagataccgcttg 18720  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||| || |||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||  |||||  | || |||||||||| |||||||||  |    
T  18719 tgagggttgtttggggtggagcgactggagaaagtttaacttgggagctggagagtaagatgcgagagtcgaacccggagttgtttgtttgaggtaagat 18620  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaa 255  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18619 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaa 18582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Original strand, 86840 - 87014
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  86840 gatgatgtgcaagtgagagacagccttacgattgagaccttaccagtgaggattgaaagtcgtgaagtgaagaagttgagaggcaaggagatacctcttg 86939  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatc 191  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||| ||||    
T  86940 tgaaagtcgtttgggaaggagcggctggtgaaagtttgacgtgggagttggaaagtaagatgctggagtcgtatc 87014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 259
Target Start/End: Original strand, 163181 - 163235
Alignment:
Q  205 ttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  163181 ttgaggtaaattttcgaggacgaaaattctataagttgtggagagttgtaacgcc 163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 136103 - 135847
Alignment:
Q  3 atgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaa 102  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  |  |||||| ||||||||||||    
T  136103 atgttatcccgagagatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgagatgaagaagttgagaggcaa 136004  T
Q  103 ggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgttt 202  Q
    ||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||   |||| ||||| |||||||||    
T  136003 ggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagcaagatgcggcagtcgtatccggagttgttt 135904  T
Q  203 gcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  135903 gcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 135847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 36831 - 36924
Alignment:
Q  167 gagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36831 gagagtaagatgctggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcctataagttggggagagttgtaacgccc 36924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 148430 - 148323
Alignment:
Q  152 ttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagtt 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  148430 ttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagtt 148332  T
Q  252 gtaacgccc 260  Q
    |||||||||    
T  148331 gtaacgccc 148323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 196086 - 196262
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||  || |||||||  ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  196086 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctactgaaggttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 196185  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||  | ||| || ||||||||||||||||||    
T  196186 attcgtatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgagga-caaaattctctaaattagggagagttgtaacgccc 196262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 148540 - 148446
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacc 111  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  148540 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagactttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacc 148446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 26853 - 26912
Alignment:
Q  1 tcatgtgatccagagtgatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttacc 60  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26853 tcatgtgatccaaagagataatgtgcaagttagagataaccttacggttgagactttacc 26912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 4475 - 4717
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||| |||  | || ||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  4475 gatgatgtgtaggttagagacaaccttacagttgagacttcaccgttgagaattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 4574  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  || |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  4575 tgaaggttgtttggggaggtgtaactggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggattcttatccagagttgtttgattgaggtaagat 4674  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4675 ttcgaggatgaaattc-tataatttggggagagttgtaacgccc 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19953 - 19711
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |    
T  19953 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaaaaagttgagaggcaaggatatacctctag 19854  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  19853 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgagagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagat 19754  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  19753 ttcgaggacgaaattc-tctaagttgggaagagttgtaacgccc 19711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 13697 - 13845
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  13697 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctag 13796  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagct 165  Q
    |||  || |||||||  ||||  |||||||| || ||||| ||||||||    
T  13797 tgaaggttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagct 13845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 17467 - 17615
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  17467 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctag 17566  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagct 165  Q
    |||  || |||||||  ||||  |||||||| || ||||| ||||||||    
T  17567 tgaaggttgtttggggtggagtaactggtgagagtttgacttgggagct 17615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 26201 - 26443
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  26201 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 26300  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  26301 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgtcttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaagat 26400  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  26401 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 26443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16595 - 16408
Alignment:
Q  68 attgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttg 167  Q
    ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  16595 attgatgatcgtaaggtgaagtccttgagaggtaaagagatacctcttgtgagagtcgtttggggtggagcgactggagaaagttttacttgggagctgg 16496  T
Q  168 agagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  16495 agagtaagatgcgggagtcgtatccaaagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaac 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 96337 - 96097
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || || |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| | |    
T  96337 gatgatgtgcaggttagggacaatctcacagttgagactttgccggtgaggatcgatgatcggaaagttaaggcattgaggggcaaggaaatacccttgg 96238  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || || ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  96237 tgagagtcgtttggggcggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgagggattcatatcctgagttgtttgtttgaggtaagat 96138  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  96137 ttcgaggacgaaattc-agtaatttggggagagttgtaacgc 96097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 260
Target Start/End: Original strand, 839 - 1018
Alignment:
Q  81 aagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgct 180  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||||||    
T  839 aagtgaagaagctgagaggcaaggagatacctcttgtgaaagtcgtttggggaggagcggctggtgaaagtttgacgtaggagttggagagaaagatgct 938  T
Q  181 cgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
     ||||  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  939 ggagttgtatccagagttatttgaatgaggtacattttcgaggacgaaaatattctaagtgggggagaattgttacgccc 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 52199 - 52441
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || |||||  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |    
T  52199 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagatcgtgaggtgaagaagttgaaaggcaaggatatacctctag 52298  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  || |  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  52299 tgaaggttgtttggggaggtgtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcaggagtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatat 52398  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  52399 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggagagagttgtaacgccc 52441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 13591 - 13767
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||  |    
T  13591 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacatctagtgaaggttgtttggggtggagtaactggtgaaagtttaacttgggagctggagagtaagatgcggg 13690  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  13691 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatatttcgacgacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 13767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 60642 - 60818
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  |    
T  60642 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgcggg 60741  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  60742 agtcttatccagagttgtatgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 161 - 1
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  161 gatgatgtgcaagttagagacaacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgagaggtaaagagatacctcttg 62  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagat 177  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  61 taagagttgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9702 - 9527
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||| || ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  9702 gtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggcgaagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 9603  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  9602 agtcttatccggagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgcc 9527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 9213 - 9455
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  9213 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagtagagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 9312  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||   |||||||||  |    
T  9313 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttaacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgttcaattgaggtaagat 9412  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  9413 ttcaaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 9455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 14587 - 14829
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  14587 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagtcgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 14686  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||   |||||||||  |    
T  14687 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgttcaattgaggtaagat 14786  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  14787 ttcaaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 14829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47094 - 46857
Alignment:
Q  20 gatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtga 119  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||| | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  47094 gatgtgcaggttagagacaactttacagttgagaccttaccattgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtga 46995  T
Q  120 gagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttc 219  Q
      || |||||||  ||||  || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||     
T  46994 aggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgactcgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatatttt 46895  T
Q  220 gaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgc 258  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  46894 gaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgc 46857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3795 - 3619
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  3795 gtgaagaagtttagaggtaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcagg 3696  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  3695 agtcttatccagagttgtttgattgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 3619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1151
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  1327 gtgaagaaattgagaggcaaggacatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 1228  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  1227 agtcttatccggagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tccaagttggggagagttgtaacgccc 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 262
Target Start/End: Original strand, 7610 - 7690
Alignment:
Q  182 gagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcccac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7610 gagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggacgaaaatcttttaagtgggggagagttgtaacgcccac 7690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 3691 - 3933
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  3691 gatgatgtgcaggttagagacaaccatacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 3790  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  |   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  3791 tgaaggttgtttggggtggagtaatcagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagttttatcctgagttgtttgcttgaggtaatat 3890  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  3891 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 3933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 18873 - 19115
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  18873 gatgatgtgcaggttagagacaaccatacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 18972  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  |   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  18973 tgaaggttgtttggggtggagtaatcagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagttttatcctgagttgtttgcttgaggtaatat 19072  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19073 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 19115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14056 - 13814
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  14056 gatgatgtgcaagttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctag 13957  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  || |  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||  ||||||||||| ||||| ||  |    
T  13956 tgaaggttgtttggggaggtgtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcagaagtcttatcatgagttgtttgcatgaggaaatat 13857  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  13856 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 13814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27196 - 26953
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||| | || |   | ||||||| ||||||||||||||| ||||  || |    
T  27196 gatgacgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgaggattaaagaccatgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacttctag 27097  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || ||||||   ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  27096 tgaaggttgtttggagtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgtttgaggtaagat 26997  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  26996 ttcgaggacgaaattctctaaagttgggaagagttgtaacgccc 26953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45814 - 45572
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |  || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||  | |    
T  45814 gatgatgtgcaggttagagataacctgatagttgagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacctttag 45715  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  45714 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagat 45615  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45614 ttcgaggacgaaattctt-taatttggggagagttgtaacgccc 45572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3110 - 2955
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| | |||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3110 gatgatgtgcaagttagagataaccttacagttgagaccttaccagtgagaattgaaggtcgtgaagtgaagaagttcagaggcaaagagatacctcttg 3011  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagt 172  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  3010 tgaaagtcatttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggagttggagagt 2955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2959 - 2892
Alignment:
Q  193 agagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  2959 agagttgtttgcatgaggtatattttcgaggacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 2892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 3604 - 3841
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || || |||||  | |||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |    
T  3604 gatgatgtacaggttagagacaaccttacagttgaaaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaagtgaagaagttgagaggcaatgatatacctctag 3703  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||  |    
T  3704 tgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccatagttgttcgtttgaggtaagat 3803  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaa 255  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  3804 ttcgaggacgaaattctt-taagttgggtagagttgtaa 3841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 260
Target Start/End: Original strand, 5321 - 5496
Alignment:
Q  84 tgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcga 183  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  ||  ||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  ||    
T  5321 tgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttttttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcagga 5420  T
Q  184 gtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  5421 gtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 5496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 14308 - 14484
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  |||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  14308 gtgaagaagttaagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggaggagtaactggttagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 14407  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  14408 attcttatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttggggagagttgtaacgccc 14484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6149 - 5911
Alignment:
Q  21 atgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgag 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||| ||    
T  6149 atgtgcaagttagagataacctgacggtggagaccttacctttgaggattgatgatcgaaaggtgaagtctttgagtggtaaagagatacctcttgtaag 6050  T
Q  121 agtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcg 220  Q
    ||| |||||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  6049 agttgtttggggtggatcaactggtgaaagtttgacttgggaactggaaagtaagatgcaagaatcgtatcctgagttgtttgtgtgaggtaagattttg 5950  T
Q  221 aggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||  |||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  5949 agga-caaaattctctaagttggggagagttgtaatgccc 5911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 1484 - 1726
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |  | || || || || ||  | ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||      
T  1484 gatgatgtgcaggttagagacaaccttactgttgagaccttaacgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttaagaagcaaggatatacctctaa 1583  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||  || |||||||  ||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |    
T  1584 tgaaggttgtttggggaggagtaactagtgaaagtttgacttgggagcttgagagtaagatgcgagagtcttatcccgagttgtttgcttgtggtaatat 1683  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  1684 ttcgaggacgaaattc-tccaagttggggagagttgtaacgccc 1726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27489 - 27247
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||| || ||  | ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |    
T  27489 gatgatgtgaaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccattgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgaggggcaaggatatacctctag 27390  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    |||   | || ||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |    
T  27389 tgaagattgtctggggtggagtaaccggtgagagtttgacttgggagctagagagtaagattcgagagtcgtatccagagttgtttgattgagataagat 27290  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||  || |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  27289 ttcggagacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 27247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3805
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  || ||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||  |    
T  3629 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaaccggtgagagtttgacttaggagctggagagtaagatgcggg 3728  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| || |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  3729 agtcgtatccagagttgtttgtttgaggtaatatttcgatgacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 3805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4577
Alignment:
Q  143 ggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttg 242  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||   ||||||    
T  4694 ggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgagagtcttatccagagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattctctaaagttg 4595  T
Q  243 gggagagttgtaacgccc 260  Q
    || |||||||||||||||    
T  4594 ggaagagttgtaacgccc 4577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9189 - 8947
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || || ||  | ||||||| |||||||||||| || ||||| || |    
T  9189 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagttgagaccttaccgttgataatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaagatatacctctag 9090  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
     ||  || |||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  9089 agaaggttgtttggggtggagtaaccagtgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgtgggagtcttatccggagttgtttgcttgaggtaatat 8990  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  8989 ttcgagga-caaaattctctaagttggggagagttgtaacgccc 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39709 - 39468
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||  | || || || || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |    
T  39709 gatgatgtgcaggttagagacaatcttacaatagagaccttaccgttgagaatcgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatatctctag 39610  T
Q  117 tgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaatt 216  Q
    | |  || |||||||  ||||  || |||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39609 taaaggttgtttggggtggagt-accggtgaaagtttgactagagagctggagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaatat 39511  T
Q  217 ttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||||    
T  39510 ttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaccgccc 39468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 1662 - 1776
Alignment:
Q  145 tgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggg 244  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | || ||||||    
T  1662 tgaaagtttgacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcttatcctgagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctatgttggg 1760  T
Q  245 gagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||    
T  1761 gagagttgtaacgccc 1776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 22078 - 22254
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||   |||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  22078 gtgaagaagttgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtcgagtaaccggtgagagtttgacttgggagctggagagtaagatgcggg 22177  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  22178 agtcgtatccggagttatttgcttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagatttgtaacgccc 22254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1313 - 1141
Alignment:
Q  83 gtgaagacgttgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcg 182  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |  |    
T  1313 gtgaagaagttaaggggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggaggagtaactggtgaaagtttgacttgggagctggagagtaggatacggg 1214  T
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || | |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  1213 agtcttatccggagttgtttgcttgaggtaatatttcaagaacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaac 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 10354 - 10419
Alignment:
Q  195 agttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10354 agttgtttgcatgaggtacattttcgaggatgaaaattctataagttggggagagttgtaacgccc 10419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8736 - 8621
Alignment:
Q  144 gtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttgg 243  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||| ||||    
T  8736 gtgaaagtttaacttgggagctggagagtaagatgcgggagtcgtatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tgtaatttgg 8638  T
Q  244 ggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||| ||||    
T  8637 ggagagttgtaatgccc 8621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Original strand, 20426 - 20513
Alignment:
Q  167 gagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaa 255  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  20426 gagagtaagatgcgggagtcttatccagagttgtttgattgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaa 20513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26883 - 26807
Alignment:
Q  183 agtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  26883 agtcttatcccgagttgtttgcttgaggtaatatttcgaggacgaaattc-tctaagttggggagagttgtaacgccc 26807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 194767 - 194667
Alignment:
Q  113 cttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggta 212  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  194767 cttgtaagagttgtttggggtggagcgactggtgaaagtttgacttgggagctggaaagtaagatgcaagaatcgtatcctgagttgtttgtttgaggta 194668  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  194667 a 194667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12264 - 12211
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12264 tgaggtaaattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaacgcc 12211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 57 - 6
Alignment:
Q  208 aggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgcc 259  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  57 aggtaaattttcgaggacaaaaattctataagttggggagagttgtaacgcc 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Original strand, 8109 - 8227
Alignment:
Q  141 ctggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagt 240  Q
    ||||||||||  | || |||||| | |||||||||||||  ||||| || |  |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || | |||||    
T  8109 ctggtgaaagtctaacttgggagttggagagtaagatgcaagagtcgtaccttgagttgtttgtttgaggtaagatttcgaggacgaaattc-tctaagt 8207  T
Q  241 tggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8208 tggggagagttgtaacgccc 8227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29156 - 29084
Alignment:
Q  188 tatccagagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  29156 tatccagagttattttaatgaggtacattttcgaggacgaaaatattctaagtgggggagagttgtaacgccc 29084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1243
Description:

Target: scaffold1243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Original strand, 275 - 325
Alignment:
Q  113 cttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggag 163  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  275 cttgtgaaagtcgtttgggaaggagcgactggtgaaagcttaacgtgggag 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1066 - 1012
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1066 tgaggtaaattttcgaagacgaaaattctttaagttggggagagttgtaacgccc 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Original strand, 1599 - 1649
Alignment:
Q  206 tgaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaac 256  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1599 tgaggtatattttcgaggacgaaaattctataagttggggagagttgtaac 1649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 7570 - 7664
Alignment:
Q  17 gatgatgtgcaagtaagagacaaccttacggtagagactttaccagtaaggattgaggatcgaaaagtgaagacgttgagaggcaaggagatacc 111  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7570 gatgatgtgcaggttagagacaaccttacagtggagaccttaccgttgaggattgaagaccgtgaggtgaagaagttgagaggcaaggatatacc 7664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 229
Target Start/End: Original strand, 1567 - 1703
Alignment:
Q  93 tgagaggcaaggagataccccttgtgagagtcgtttgggacggagcgactggtgaaagcttgacatgggagcttgagagtaagatgctcgagtcttatcc 192  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||  ||||  ||||| ||||| ||||| |||  | | |||||||||| ||  ||||||||||     
T  1567 tgagaggcaaggatatacctctagtgaaggttgtttggggtggagtaactggcgaaagtttgacttggatgttggagagtaagaggcatgagtcttatca 1666  T
Q  193 agagttgtttgcttgaggtaaattttcgaggatgaaa 229  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  1667 tgagttgtttacttgaggtaatgtttcgaggacgaaa 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 1202 - 1254
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1202 gaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25597 - 25545
Alignment:
Q  207 gaggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  25597 gaggtatattttcgaggacgaaaattct-taagttggggagagttgtaacgccc 25545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 10785 - 10828
Alignment:
Q  216 tttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10785 tttcgaggacgaaattctt-taagttggggagagttgtaacgccc 10828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 260
Target Start/End: Original strand, 17055 - 17107
Alignment:
Q  208 aggtaaattttcgaggatgaaaatcttataagttggggagagttgtaacgccc 260  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17055 aggtaaatttttgaggacgaaaattctataagttggggaaagttgtaccgccc 17107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University