View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6416_low_4 (Length: 431)

Name: NF6416_low_4
Description: NF6416
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6416_low_4
NF6416_low_4
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (1-431)||(67749-68179)
chr7 (1-431)||(44014182-44014607)
chr7 (1-431)||(18005650-18006074)
chr7 (5-431)||(16219408-16219834)
chr7 (1-431)||(47831811-47832241)
chr7 (5-420)||(16056343-16056757)
chr7 (3-431)||(810819-811248)
chr7 (5-431)||(22072917-22073345)
chr7 (5-327)||(9389387-9389709)
chr7 (1-266)||(16324175-16324439)
chr7 (128-431)||(15754702-15755004)
chr7 (81-431)||(34200790-34201137)
chr7 (81-431)||(11995797-11996144)
chr7 (82-431)||(28505069-28505415)
chr7 (80-420)||(12901338-12901683)
chr7 (5-148)||(12255483-12255625)
chr7 (268-431)||(16495406-16495567)
chr7 (5-148)||(2279810-2279952)
chr7 (144-416)||(20220018-20220290)
chr7 (258-420)||(2280061-2280225)
chr7 (82-350)||(15113028-15113296)
chr7 (312-406)||(12255789-12255885)
chr7 (309-431)||(38227485-38227606)
chr7 (245-420)||(1867924-1868101)
chr7 (313-431)||(3564363-3564481)
chr7 (81-350)||(15116565-15116834)
chr7 (309-431)||(18456408-18456529)
chr7 (309-431)||(12698835-12698958)
chr7 (275-416)||(13647344-13647487)
chr7 (249-420)||(14044761-14044935)
chr7 (249-420)||(14354791-14354965)
chr7 (275-431)||(18430713-18430870)
chr7 (275-431)||(27216861-27217018)
chr7 (309-431)||(9509193-9509315)
chr7 (275-431)||(456322-456479)
chr7 (81-185)||(2832072-2832176)
chr7 (275-431)||(11393291-11393448)
chr7 (275-431)||(11972497-11972654)
chr7 (275-431)||(14949126-14949283)
chr7 (275-431)||(15376717-15376874)
chr7 (275-431)||(16232521-16232678)
chr7 (275-431)||(18640273-18640430)
chr7 (275-431)||(20385127-20385284)
chr7 (275-431)||(21189599-21189756)
chr7 (275-431)||(24702239-24702396)
chr7 (275-431)||(32125492-32125649)
chr7 (81-185)||(39267413-39267517)
chr7 (275-431)||(41522918-41523075)
chr7 (275-431)||(41525380-41525537)
chr7 (275-431)||(17061919-17062076)
chr7 (309-419)||(26212012-26212122)
chr7 (313-431)||(48273393-48273511)
chr7 (258-406)||(19486686-19486836)
chr7 (309-406)||(10063813-10063910)
chr7 (81-185)||(9751317-9751421)
chr7 (275-431)||(16410060-16410217)
chr7 (275-431)||(24704689-24704843)
chr7 (81-163)||(18302450-18302532)
chr7 (313-421)||(24275182-24275289)
chr7 (258-406)||(15008441-15008591)
chr7 (275-431)||(44116510-44116667)
chr7 (5-119)||(12756409-12756522)
chr7 (313-431)||(15144037-15144153)
chr7 (309-431)||(16386242-16386365)
chr7 (1-119)||(15143725-15143843)
chr7 (1-119)||(44116820-44116937)
chr7 (6-115)||(21064855-21064964)
chr7 (275-431)||(3386334-3386491)
chr7 (316-419)||(10589055-10589158)
chr7 (320-431)||(16213685-16213795)
chr7 (1-48)||(38227866-38227913)
chr7 (316-431)||(40443395-40443509)
chr7 (1-49)||(16385946-16385994)
chr7 (1-45)||(28504989-28505033)
chr7 (83-122)||(123961-124000)
chr7 (1-48)||(3564052-3564099)
chr7 (83-122)||(4993798-4993837)
chr7 (1-48)||(9509575-9509622)
chr7 (83-122)||(13395233-13395272)
chr7 (384-431)||(13869347-13869394)
chr7 (1-48)||(15754575-15754622)
chr7 (81-148)||(17061728-17061794)
chr7 (384-431)||(20110557-20110604)
chr7 (83-122)||(48785625-48785664)
chr7 (127-185)||(2529866-2529924)
chr7 (5-47)||(17061652-17061694)
chr7 (81-119)||(26212310-26212348)
chr7 (365-431)||(27847881-27847947)
chr7 (81-121)||(9177432-9177472)
chr7 (83-119)||(16006732-16006768)
chr7 (314-350)||(16324135-16324171)
chr7 (83-119)||(21743056-21743092)
chr7 (1-49)||(40443762-40443810)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-431)||(6539-6970)
scaffold0621 (81-420)||(8481-8823)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (1-431)||(22921555-22921986)
chr1 (1-431)||(33681011-33681442)
chr1 (1-431)||(22237631-22238062)
chr1 (10-327)||(35981383-35981700)
chr1 (1-431)||(52927669-52928087)
chr1 (1-431)||(20248283-20248710)
chr1 (5-327)||(20636957-20637279)
chr1 (1-428)||(21754052-21754468)
chr1 (85-327)||(49261448-49261690)
chr1 (134-416)||(21861389-21861672)
chr1 (134-416)||(21896078-21896358)
chr1 (81-419)||(20918620-20918955)
chr1 (144-428)||(16368115-16368401)
chr1 (10-171)||(28194145-28194306)
chr1 (80-354)||(50686694-50686968)
chr1 (144-416)||(50613945-50614219)
chr1 (144-416)||(50621773-50622047)
chr1 (268-431)||(14295507-14295671)
chr1 (144-416)||(41049864-41050138)
chr1 (257-431)||(21161720-21161892)
chr1 (246-420)||(16758664-16758841)
chr1 (313-431)||(50210212-50210330)
chr1 (309-431)||(22532273-22532395)
chr1 (81-238)||(12271744-12271901)
chr1 (322-416)||(35261086-35261180)
chr1 (275-416)||(45574846-45574989)
chr1 (275-431)||(21475091-21475248)
chr1 (316-431)||(34509784-34509899)
chr1 (275-431)||(13988867-13989024)
chr1 (275-431)||(21923295-21923452)
chr1 (309-431)||(21026684-21026806)
chr1 (309-431)||(27250724-27250846)
chr1 (268-383)||(22130863-22130976)
chr1 (313-421)||(21840778-21840885)
chr1 (275-431)||(23593739-23593896)
chr1 (275-431)||(29298138-29298294)
chr1 (275-431)||(29776689-29776846)
chr1 (275-431)||(31612314-31612471)
chr1 (275-431)||(433013-433168)
chr1 (268-367)||(51130632-51130729)
chr1 (257-416)||(16093825-16093987)
chr1 (364-431)||(20847205-20847271)
chr1 (1-119)||(433322-433440)
chr1 (1-78)||(43697716-43697793)
chr1 (275-431)||(22123071-22123229)
chr1 (359-431)||(38801433-38801504)
chr1 (370-421)||(20454610-20454660)
chr1 (275-414)||(26064959-26065100)
chr1 (81-148)||(26065226-26065293)
chr1 (1-48)||(50209901-50209948)
chr1 (275-421)||(16361928-16362075)
chr1 (275-431)||(13212865-13213023)
chr1 (1-45)||(20918990-20919034)
chr1 (1-49)||(22355873-22355921)
chr1 (1-49)||(22357559-22357607)
chr1 (83-122)||(14432123-14432162)
chr1 (83-122)||(20631628-20631667)
chr1 (384-431)||(21342097-21342144)
chr1 (384-431)||(21346962-21347009)
chr1 (384-431)||(21707168-21707215)
chr1 (384-431)||(21711710-21711757)
chr1 (5-56)||(21895924-21895975)
chr1 (1-48)||(22532655-22532702)
chr1 (83-122)||(22900022-22900061)
chr1 (83-122)||(24087727-24087766)
chr1 (1-48)||(34510166-34510213)
chr1 (83-122)||(36181887-36181926)
chr1 (83-122)||(37358780-37358819)
chr1 (83-122)||(45307602-45307641)
chr1 (81-119)||(38801160-38801198)
chr1 (81-138)||(16758947-16759004)
chr1 (82-119)||(20135502-20135539)
chr1 (83-119)||(20579779-20579815)
chr1 (1-49)||(20846918-20846966)
chr1 (1-49)||(21027054-21027102)
chr1 (84-120)||(21162079-21162115)
chr1 (1-49)||(27250428-27250476)
chr1 (1-49)||(38801090-38801138)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (4-431)||(39863-40291)
scaffold0023 (127-431)||(100378-100683)
scaffold0023 (1-227)||(101602-101827)
scaffold0023 (275-431)||(94412-94569)
scaffold0023 (275-431)||(44455-44613)
scaffold0023 (358-431)||(101503-101576)
scaffold0023 (362-431)||(119879-119948)
scaffold0023 (275-421)||(17444-17591)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-431)||(2332-2762)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-431)||(19268-19699)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (1-431)||(23760528-23760961)
chr8 (1-431)||(38854939-38855368)
chr8 (1-427)||(21673712-21674138)
chr8 (1-431)||(6520372-6520801)
chr8 (1-431)||(26355386-26355815)
chr8 (43-421)||(21285611-21285989)
chr8 (82-431)||(5866045-5866391)
chr8 (83-431)||(21490999-21491344)
chr8 (82-431)||(17140920-17141266)
chr8 (82-431)||(21249388-21249734)
chr8 (165-420)||(983252-983512)
chr8 (82-431)||(21255226-21255572)
chr8 (7-160)||(39834106-39834259)
chr8 (83-416)||(20498581-20498915)
chr8 (144-416)||(17266821-17267096)
chr8 (144-416)||(37116366-37116641)
chr8 (1-119)||(19801115-19801233)
chr8 (144-416)||(24353039-24353316)
chr8 (144-354)||(22364744-22364954)
chr8 (309-431)||(22626740-22626861)
chr8 (240-406)||(13508009-13508177)
chr8 (309-431)||(16092337-16092459)
chr8 (240-406)||(13597541-13597709)
chr8 (246-406)||(17439436-17439599)
chr8 (309-431)||(21918995-21919117)
chr8 (309-431)||(22875069-22875190)
chr8 (275-406)||(17612069-17612202)
chr8 (316-431)||(28649046-28649161)
chr8 (309-431)||(7372782-7372904)
chr8 (309-431)||(20536212-20536334)
chr8 (316-431)||(31971261-31971375)
chr8 (309-431)||(26219718-26219838)
chr8 (275-431)||(1484403-1484560)
chr8 (275-431)||(5853296-5853453)
chr8 (275-431)||(14409448-14409605)
chr8 (275-431)||(20046199-20046356)
chr8 (275-431)||(20403228-20403385)
chr8 (275-431)||(22001754-22001911)
chr8 (316-431)||(16199647-16199761)
chr8 (309-431)||(18818404-18818526)
chr8 (309-431)||(21923923-21924045)
chr8 (322-431)||(6759262-6759371)
chr8 (322-431)||(23406383-23406492)
chr8 (358-431)||(18879276-18879348)
chr8 (276-416)||(19801387-19801527)
chr8 (1-148)||(41598471-41598617)
chr8 (275-421)||(16413320-16413467)
chr8 (309-431)||(26225288-26225408)
chr8 (275-431)||(4483282-4483438)
chr8 (275-431)||(15203235-15203392)
chr8 (316-431)||(21395984-21396097)
chr8 (316-431)||(21790477-21790590)
chr8 (275-431)||(41598189-41598346)
chr8 (275-431)||(4542377-4542534)
chr8 (316-431)||(21389454-21389567)
chr8 (316-431)||(21778780-21778893)
chr8 (307-354)||(40492844-40492891)
chr8 (364-431)||(45131047-45131113)
chr8 (373-431)||(19896266-19896323)
chr8 (1-45)||(5865965-5866009)
chr8 (275-431)||(14823775-14823931)
chr8 (1-45)||(17141302-17141346)
chr8 (81-121)||(22419183-22419223)
chr8 (1-49)||(45130719-45130767)
chr8 (1-48)||(6759643-6759690)
chr8 (83-122)||(17615229-17615268)
chr8 (1-48)||(18878925-18878972)
chr8 (1-48)||(21255605-21255652)
chr8 (1-48)||(21491378-21491425)
chr8 (83-122)||(22059159-22059198)
chr8 (83-122)||(22145156-22145195)
chr8 (1-119)||(23406695-23406814)
chr8 (83-122)||(24707577-24707616)
chr8 (384-431)||(25484382-25484429)
chr8 (81-120)||(37116663-37116702)
chr8 (81-119)||(20536522-20536560)
chr8 (81-119)||(21918769-21918807)
chr8 (4-49)||(25362842-25362887)
chr8 (384-421)||(45290809-45290846)
chr8 (83-119)||(6608025-6608061)
chr8 (83-119)||(7300833-7300869)
chr8 (1-45)||(16092029-16092073)
chr8 (84-120)||(16861100-16861136)
chr8 (268-359)||(21383887-21383978)
chr8 (83-119)||(21414997-21415033)
chr8 (1-49)||(31971629-31971677)
chr8 (83-119)||(45134676-45134712)
[»] chr3 (119 HSPs)
chr3 (5-431)||(15470928-15471353)
chr3 (1-431)||(16097332-16097763)
chr3 (5-431)||(14234491-14234919)
chr3 (1-431)||(16103784-16104213)
chr3 (3-428)||(32307684-32308099)
chr3 (10-327)||(1465106-1465423)
chr3 (1-431)||(49667771-49668193)
chr3 (82-431)||(13210096-13210444)
chr3 (1-428)||(1644371-1644787)
chr3 (1-431)||(9512924-9513343)
chr3 (1-431)||(9520899-9521318)
chr3 (216-431)||(12174164-12174376)
chr3 (81-405)||(37250934-37251259)
chr3 (138-326)||(49389453-49389642)
chr3 (81-201)||(12171872-12171992)
chr3 (1-223)||(12933998-12934221)
chr3 (81-416)||(22110118-22110454)
chr3 (5-185)||(324485-324664)
chr3 (258-416)||(52523669-52523831)
chr3 (309-431)||(27165251-27165373)
chr3 (309-431)||(12399213-12399335)
chr3 (309-431)||(53301545-53301668)
chr3 (5-148)||(2050893-2051033)
chr3 (258-406)||(24340665-24340815)
chr3 (309-406)||(23274716-23274813)
chr3 (81-185)||(12340002-12340106)
chr3 (81-185)||(14669010-14669114)
chr3 (316-431)||(18438538-18438653)
chr3 (309-428)||(14572596-14572714)
chr3 (309-431)||(14972858-14972980)
chr3 (309-431)||(17487860-17487982)
chr3 (309-431)||(17499342-17499464)
chr3 (309-431)||(36166599-36166719)
chr3 (84-265)||(43927304-43927484)
chr3 (309-417)||(42386428-42386536)
chr3 (275-416)||(43925977-43926121)
chr3 (81-185)||(14665855-14665959)
chr3 (81-185)||(14735368-14735472)
chr3 (309-421)||(21618460-21618570)
chr3 (5-105)||(52523419-52523519)
chr3 (309-431)||(13442278-13442400)
chr3 (337-431)||(11424783-11424876)
chr3 (309-431)||(14576828-14576949)
chr3 (309-431)||(24153204-24153325)
chr3 (258-406)||(37642207-37642357)
chr3 (275-431)||(7781351-7781508)
chr3 (275-431)||(17463179-17463336)
chr3 (275-431)||(17672627-17672784)
chr3 (316-431)||(20698437-20698552)
chr3 (275-431)||(29172587-29172744)
chr3 (275-431)||(34159327-34159484)
chr3 (275-431)||(45606911-45607068)
chr3 (275-431)||(55476492-55476649)
chr3 (275-430)||(16282815-16282971)
chr3 (309-431)||(23083356-23083478)
chr3 (5-119)||(42386726-42386840)
chr3 (275-421)||(38961895-38962042)
chr3 (366-431)||(28194694-28194759)
chr3 (278-431)||(28848618-28848772)
chr3 (275-416)||(43550482-43550625)
chr3 (313-406)||(606324-606418)
chr3 (275-431)||(8899095-8899252)
chr3 (275-431)||(9707611-9707768)
chr3 (275-431)||(16454285-16454442)
chr3 (275-431)||(17446659-17446815)
chr3 (313-431)||(6469178-6469295)
chr3 (313-431)||(25476384-25476502)
chr3 (309-431)||(26686891-26687013)
chr3 (313-431)||(40213720-40213837)
chr3 (309-423)||(43840944-43841058)
chr3 (275-421)||(12567571-12567718)
chr3 (275-421)||(13544036-13544183)
chr3 (1-119)||(17247974-17248092)
chr3 (1-47)||(49389332-49389378)
chr3 (318-431)||(55500943-55501055)
chr3 (275-431)||(13151794-13151952)
chr3 (275-431)||(13154259-13154417)
chr3 (258-405)||(22147467-22147616)
chr3 (275-416)||(53070657-53070799)
chr3 (258-373)||(2051141-2051260)
chr3 (275-431)||(10247727-10247884)
chr3 (81-185)||(12852131-12852235)
chr3 (313-431)||(15977516-15977633)
chr3 (5-119)||(53070391-53070504)
chr3 (275-421)||(50242833-50242980)
chr3 (1-48)||(14572974-14573021)
chr3 (81-119)||(14572903-14572941)
chr3 (373-431)||(17737237-17737294)
chr3 (1-119)||(40213409-40213527)
chr3 (275-430)||(41123892-41124045)
chr3 (128-185)||(4588602-4588659)
chr3 (1-49)||(20698135-20698183)
chr3 (83-122)||(2034752-2034791)
chr3 (83-122)||(2038259-2038298)
chr3 (83-122)||(2042000-2042039)
chr3 (384-431)||(8499519-8499566)
chr3 (384-431)||(10556986-10557033)
chr3 (1-48)||(11424451-11424498)
chr3 (81-120)||(11424531-11424570)
chr3 (83-122)||(14038489-14038528)
chr3 (83-122)||(14041957-14041996)
chr3 (1-48)||(14179708-14179755)
chr3 (384-431)||(15412430-15412477)
chr3 (1-48)||(17488243-17488290)
chr3 (1-48)||(17499725-17499772)
chr3 (1-48)||(18438920-18438967)
chr3 (83-122)||(18959206-18959245)
chr3 (83-118)||(23083132-23083167)
chr3 (1-48)||(26687273-26687320)
chr3 (83-122)||(39231036-39231075)
chr3 (384-431)||(45577952-45577999)
chr3 (81-122)||(606135-606176)
chr3 (84-120)||(11855032-11855068)
chr3 (324-431)||(12119780-12119886)
chr3 (84-120)||(20723297-20723333)
chr3 (83-119)||(30030153-30030189)
chr3 (83-119)||(54973700-54973736)
chr3 (83-119)||(54976310-54976346)
chr3 (83-119)||(54978920-54978956)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (1-431)||(25175854-25176275)
chr2 (1-430)||(28405981-28406412)
chr2 (1-431)||(22133905-22134323)
chr2 (81-405)||(7499-7824)
chr2 (165-420)||(18786752-18787009)
chr2 (81-416)||(23207296-23207632)
chr2 (81-416)||(23791292-23791629)
chr2 (274-431)||(7679589-7679746)
chr2 (268-431)||(23071905-23072066)
chr2 (144-416)||(25108906-25109181)
chr2 (275-406)||(19671859-19671991)
chr2 (275-431)||(22105413-22105571)
chr2 (8-148)||(23708314-23708452)
chr2 (309-431)||(298809-298932)
chr2 (258-420)||(23708561-23708725)
chr2 (309-431)||(23060517-23060639)
chr2 (81-350)||(22459328-22459598)
chr2 (275-431)||(18808944-18809101)
chr2 (275-431)||(23130863-23131020)
chr2 (275-431)||(23133330-23133487)
chr2 (275-431)||(23709536-23709693)
chr2 (275-431)||(23712017-23712174)
chr2 (275-431)||(32039502-32039659)
chr2 (275-431)||(34402526-34402683)
chr2 (275-431)||(39682314-39682471)
chr2 (309-431)||(22337119-22337241)
chr2 (309-431)||(23076446-23076568)
chr2 (309-431)||(23285869-23285987)
chr2 (309-431)||(23654381-23654503)
chr2 (337-431)||(38138-38231)
chr2 (309-431)||(23660027-23660148)
chr2 (275-421)||(24367785-24367932)
chr2 (275-416)||(20520152-20520295)
chr2 (278-431)||(23135591-23135745)
chr2 (246-354)||(24697536-24697645)
chr2 (275-431)||(571398-571555)
chr2 (275-431)||(6725996-6726153)
chr2 (275-431)||(26505380-26505537)
chr2 (275-431)||(26507858-26508015)
chr2 (275-431)||(28577100-28577257)
chr2 (309-431)||(22731229-22731351)
chr2 (275-421)||(21155064-21155211)
chr2 (82-195)||(23071731-23071843)
chr2 (275-431)||(24898199-24898357)
chr2 (275-431)||(24900682-24900840)
chr2 (275-431)||(24903159-24903317)
chr2 (275-431)||(24905636-24905794)
chr2 (275-431)||(24908111-24908269)
chr2 (316-431)||(20309112-20309225)
chr2 (371-431)||(23040247-23040306)
chr2 (313-431)||(23103396-23103512)
chr2 (275-421)||(32214925-32215072)
chr2 (358-431)||(8946661-8946733)
chr2 (258-416)||(22413078-22413240)
chr2 (275-431)||(45029858-45030015)
chr2 (1-119)||(298503-298621)
chr2 (1-48)||(23660408-23660455)
chr2 (83-122)||(31756229-31756268)
chr2 (275-430)||(43137301-43137457)
chr2 (281-406)||(23004777-23004905)
chr2 (1-49)||(20309479-20309527)
chr2 (1-49)||(23654098-23654146)
chr2 (373-421)||(24643054-24643101)
chr2 (81-148)||(20519959-20520026)
chr2 (1-48)||(22337501-22337548)
chr2 (1-48)||(22730921-22730968)
chr2 (384-431)||(22738249-22738296)
chr2 (1-48)||(27753961-27754008)
chr2 (384-431)||(38967375-38967422)
chr2 (83-122)||(41684531-41684570)
chr2 (83-122)||(44621239-44621278)
chr2 (81-119)||(23076756-23076794)
chr2 (81-121)||(18786669-18786709)
chr2 (83-119)||(21238877-21238913)
chr2 (83-119)||(21241427-21241463)
chr2 (1-49)||(23286235-23286283)
chr2 (83-119)||(24505016-24505052)
chr2 (83-119)||(31503913-31503949)
chr2 (83-119)||(31506479-31506515)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (1-431)||(39705976-39706405)
chr4 (1-431)||(8846360-8846808)
chr4 (10-327)||(15099457-15099774)
chr4 (1-431)||(12774011-12774431)
chr4 (1-327)||(15190424-15190750)
chr4 (81-420)||(12287976-12288316)
chr4 (82-431)||(15551821-15552166)
chr4 (165-416)||(13700-13953)
chr4 (144-420)||(43198384-43198661)
chr4 (82-397)||(16596686-16596998)
chr4 (144-416)||(53081979-53082254)
chr4 (144-416)||(46640285-46640558)
chr4 (312-420)||(52243192-52243302)
chr4 (5-148)||(15464621-15464764)
chr4 (5-148)||(52242885-52243027)
chr4 (1-121)||(13844852-13844972)
chr4 (313-423)||(16377522-16377630)
chr4 (5-106)||(43198280-43198381)
chr4 (81-185)||(24028991-24029095)
chr4 (309-431)||(16239965-16240086)
chr4 (316-431)||(7088881-7088996)
chr4 (275-431)||(44615289-44615446)
chr4 (81-176)||(3332144-3332239)
chr4 (309-431)||(7798778-7798900)
chr4 (309-431)||(22636439-22636561)
chr4 (309-431)||(6899895-6900016)
chr4 (309-431)||(8574864-8574984)
chr4 (309-431)||(16270231-16270352)
chr4 (310-431)||(52873363-52873484)
chr4 (275-431)||(12311-12468)
chr4 (275-431)||(15118356-15118513)
chr4 (275-431)||(18215278-18215435)
chr4 (81-185)||(20157057-20157161)
chr4 (81-185)||(22633980-22634084)
chr4 (309-428)||(23374354-23374473)
chr4 (275-431)||(44773091-44773248)
chr4 (275-431)||(52312511-52312668)
chr4 (309-431)||(12902761-12902883)
chr4 (309-431)||(14280317-14280438)
chr4 (309-431)||(54798749-54798871)
chr4 (83-185)||(13812578-13812680)
chr4 (275-421)||(19618176-19618323)
chr4 (275-431)||(44928883-44929041)
chr4 (275-431)||(50222343-50222500)
chr4 (275-431)||(51463872-51464029)
chr4 (309-431)||(7893707-7893829)
chr4 (309-431)||(44052833-44052955)
chr4 (313-430)||(14038653-14038770)
chr4 (358-431)||(3096297-3096369)
chr4 (278-431)||(18239426-18239580)
chr4 (275-431)||(1837513-1837670)
chr4 (275-431)||(19242700-19242857)
chr4 (313-421)||(14970751-14970858)
chr4 (370-431)||(17046491-17046552)
chr4 (3-148)||(44928613-44928757)
chr4 (275-431)||(3515008-3515165)
chr4 (320-431)||(23803316-23803426)
chr4 (275-421)||(15355328-15355476)
chr4 (1-48)||(16597031-16597078)
chr4 (373-431)||(7641286-7641343)
chr4 (373-431)||(12610951-12611008)
chr4 (81-119)||(21815070-21815108)
chr4 (81-119)||(21815399-21815437)
chr4 (81-119)||(21818492-21818530)
chr4 (318-431)||(14053306-14053418)
chr4 (312-353)||(15464929-15464970)
chr4 (1-49)||(3097017-3097065)
chr4 (1-49)||(7089251-7089299)
chr4 (1-49)||(12903131-12903179)
chr4 (275-431)||(44102215-44102372)
chr4 (83-122)||(287402-287441)
chr4 (1-48)||(15091283-15091330)
chr4 (5-56)||(15868327-15868378)
chr4 (83-122)||(16359815-16359854)
chr4 (1-48)||(22636820-22636867)
chr4 (83-122)||(31116822-31116861)
chr4 (83-122)||(55502517-55502556)
chr4 (81-119)||(7089191-7089229)
chr4 (81-119)||(17047841-17047879)
chr4 (364-406)||(17333306-17333347)
chr4 (81-119)||(44102525-44102563)
chr4 (83-119)||(4171338-4171374)
chr4 (1-49)||(14053001-14053049)
chr4 (83-119)||(14699030-14699066)
chr4 (1-48)||(16239680-16239728)
chr4 (1-49)||(16377210-16377258)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (5-420)||(10542-10957)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-431)||(129909-130340)
scaffold0010 (312-406)||(60713-60808)
scaffold0010 (81-148)||(60481-60548)
[»] chr5 (87 HSPs)
chr5 (1-431)||(21329183-21329614)
chr5 (1-431)||(21565546-21565977)
chr5 (5-420)||(26011726-26012141)
chr5 (1-431)||(22959221-22959649)
chr5 (81-431)||(21501922-21502273)
chr5 (1-431)||(19668902-19669333)
chr5 (10-327)||(21741240-21741545)
chr5 (81-416)||(20026707-20027043)
chr5 (82-431)||(19660606-19660952)
chr5 (10-171)||(5888872-5889033)
chr5 (168-416)||(22178072-22178323)
chr5 (9-185)||(22144301-22144475)
chr5 (309-431)||(21729059-21729181)
chr5 (309-431)||(21808384-21808506)
chr5 (275-416)||(22144068-22144211)
chr5 (309-431)||(23390491-23390613)
chr5 (334-431)||(36314581-36314678)
chr5 (81-185)||(22119960-22120064)
chr5 (309-431)||(24493573-24493694)
chr5 (310-431)||(8286838-8286960)
chr5 (309-431)||(13025315-13025436)
chr5 (309-431)||(13095499-13095620)
chr5 (309-431)||(22412188-22412309)
chr5 (275-431)||(264772-264929)
chr5 (309-428)||(1096474-1096593)
chr5 (275-431)||(10732944-10733101)
chr5 (275-431)||(11581203-11581360)
chr5 (316-431)||(24529224-24529339)
chr5 (81-185)||(24767104-24767208)
chr5 (275-431)||(29329935-29330092)
chr5 (275-431)||(39363385-39363542)
chr5 (313-431)||(9077956-9078074)
chr5 (329-431)||(21997549-21997651)
chr5 (309-419)||(22075035-22075145)
chr5 (309-431)||(25421536-25421658)
chr5 (281-383)||(29448054-29448159)
chr5 (258-406)||(40725882-40726032)
chr5 (275-431)||(20909013-20909170)
chr5 (275-431)||(42245369-42245526)
chr5 (275-420)||(20902012-20902159)
chr5 (275-431)||(2154617-2154775)
chr5 (5-78)||(21498709-21498782)
chr5 (84-185)||(21871342-21871442)
chr5 (84-185)||(21875622-21875722)
chr5 (275-431)||(29345981-29346138)
chr5 (311-415)||(25431414-25431518)
chr5 (278-431)||(39245137-39245291)
chr5 (1-148)||(36154516-36154662)
chr5 (1-48)||(21985835-21985882)
chr5 (81-120)||(25744035-25744074)
chr5 (275-431)||(36154787-36154941)
chr5 (373-431)||(20918052-20918109)
chr5 (81-119)||(25431709-25431747)
chr5 (309-369)||(20766115-20766175)
chr5 (275-431)||(32027394-32027551)
chr5 (83-122)||(4398019-4398058)
chr5 (1-48)||(9078338-9078385)
chr5 (384-431)||(10775790-10775837)
chr5 (83-122)||(16255704-16255743)
chr5 (83-122)||(16259337-16259376)
chr5 (275-421)||(18319037-18319185)
chr5 (364-431)||(21293020-21293086)
chr5 (83-122)||(22589501-22589540)
chr5 (83-122)||(22593056-22593095)
chr5 (83-122)||(22596611-22596650)
chr5 (83-122)||(22880519-22880558)
chr5 (384-431)||(23064512-23064559)
chr5 (1-48)||(23390184-23390231)
chr5 (83-122)||(23693769-23693808)
chr5 (1-48)||(24493954-24494001)
chr5 (1-48)||(24529607-24529654)
chr5 (83-122)||(26360854-26360893)
chr5 (365-416)||(26740697-26740747)
chr5 (363-406)||(37723932-37723975)
chr5 (384-431)||(38619435-38619482)
chr5 (83-122)||(43121474-43121513)
chr5 (83-122)||(43125007-43125046)
chr5 (81-119)||(1096782-1096820)
chr5 (5-47)||(11580937-11580979)
chr5 (81-119)||(11581013-11581051)
chr5 (81-119)||(25421847-25421885)
chr5 (1-49)||(8286541-8286589)
chr5 (1-49)||(21292669-21292717)
chr5 (84-120)||(23501118-23501154)
chr5 (83-119)||(26496199-26496235)
chr5 (83-119)||(29324991-29325027)
chr5 (375-431)||(31061069-31061124)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (5-420)||(32551-32965)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-431)||(12943-13373)
scaffold0138 (81-354)||(18004-18277)
[»] chr6 (93 HSPs)
chr6 (1-431)||(19652199-19652628)
chr6 (7-416)||(23019425-23019834)
chr6 (1-376)||(22080425-22080800)
chr6 (81-420)||(19668386-19668726)
chr6 (1-431)||(29808571-29808999)
chr6 (128-431)||(1561307-1561609)
chr6 (81-431)||(28496241-28496588)
chr6 (5-268)||(27332976-27333238)
chr6 (5-268)||(27393716-27393978)
chr6 (2-431)||(4185512-4185938)
chr6 (81-420)||(9098292-9098620)
chr6 (2-380)||(4667902-4668277)
chr6 (2-380)||(4674749-4675124)
chr6 (81-420)||(20109153-20109494)
chr6 (84-431)||(31155169-31155514)
chr6 (334-431)||(27333238-27333335)
chr6 (334-431)||(27393978-27394075)
chr6 (320-426)||(4186376-4186482)
chr6 (11-119)||(25644637-25644745)
chr6 (309-431)||(16496248-16496370)
chr6 (2-185)||(4189206-4189388)
chr6 (313-431)||(29060544-29060662)
chr6 (322-431)||(20076704-20076812)
chr6 (312-420)||(25644335-25644444)
chr6 (275-431)||(1595550-1595707)
chr6 (81-185)||(21939633-21939737)
chr6 (1-121)||(25956309-25956429)
chr6 (313-431)||(18409826-18409944)
chr6 (275-431)||(22782228-22782385)
chr6 (313-431)||(19303540-19303657)
chr6 (275-431)||(2291184-2291341)
chr6 (258-428)||(8227453-8227625)
chr6 (275-431)||(12742318-12742475)
chr6 (275-431)||(18334596-18334753)
chr6 (275-431)||(19005047-19005204)
chr6 (275-431)||(19858923-19859080)
chr6 (316-431)||(20638285-20638400)
chr6 (275-431)||(24422548-24422705)
chr6 (275-431)||(33861795-33861952)
chr6 (275-431)||(33864279-33864436)
chr6 (313-431)||(25629354-25629472)
chr6 (275-431)||(20556898-20557053)
chr6 (275-421)||(30676714-30676861)
chr6 (275-431)||(8055030-8055187)
chr6 (275-431)||(26924644-26924801)
chr6 (81-304)||(35008282-35008503)
chr6 (309-431)||(17287791-17287913)
chr6 (309-423)||(20360955-20361069)
chr6 (171-416)||(23076749-23076997)
chr6 (275-431)||(25754810-25754967)
chr6 (212-304)||(28103796-28103887)
chr6 (313-431)||(20593777-20593895)
chr6 (329-431)||(25656630-25656731)
chr6 (275-421)||(34963384-34963531)
chr6 (278-431)||(1540918-1541072)
chr6 (313-421)||(25688513-25688620)
chr6 (316-431)||(16920634-16920747)
chr6 (316-431)||(35245590-35245703)
chr6 (5-119)||(18457030-18457143)
chr6 (248-354)||(18696569-18696675)
chr6 (373-431)||(25714421-25714478)
chr6 (246-354)||(18706387-18706495)
chr6 (275-431)||(3852021-3852178)
chr6 (1-45)||(19303229-19303273)
chr6 (1-49)||(20360659-20360707)
chr6 (1-49)||(20637982-20638030)
chr6 (370-406)||(22831532-22831568)
chr6 (1-48)||(1561689-1561736)
chr6 (83-122)||(12596269-12596308)
chr6 (81-120)||(15894199-15894238)
chr6 (83-122)||(16102655-16102694)
chr6 (275-421)||(16448530-16448678)
chr6 (83-122)||(16813088-16813127)
chr6 (83-122)||(16830108-16830147)
chr6 (1-48)||(18409515-18409562)
chr6 (81-120)||(18821588-18821627)
chr6 (1-48)||(22779915-22779962)
chr6 (384-431)||(22780297-22780344)
chr6 (1-48)||(28496161-28496208)
chr6 (83-122)||(29493065-29493104)
chr6 (372-425)||(11185515-11185568)
chr6 (81-122)||(17106045-17106086)
chr6 (136-354)||(18199237-18199456)
chr6 (81-122)||(25611492-25611533)
chr6 (3-48)||(25629045-25629090)
chr6 (83-119)||(2287677-2287713)
chr6 (83-119)||(8523246-8523282)
chr6 (83-119)||(15539593-15539629)
chr6 (83-119)||(15685871-15685907)
chr6 (165-354)||(18177521-18177712)
chr6 (165-354)||(18204159-18204350)
chr6 (256-304)||(18896256-18896304)
chr6 (337-406)||(33443076-33443146)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-425)||(6822-7244)
scaffold0556 (5-353)||(8097-8445)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (5-431)||(6615-7042)
scaffold0333 (5-431)||(13995-14422)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (126-424)||(5654-5952)
scaffold0278 (2-68)||(5959-6025)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-431)||(2491-2923)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-431)||(133-563)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (126-431)||(14508-14814)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-431)||(45477-45909)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-431)||(160688-161118)
scaffold0001 (275-421)||(501095-501242)
scaffold0001 (275-431)||(85583-85741)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (5-431)||(5814-6240)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (127-377)||(2030-2281)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (127-431)||(12770-13075)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (56-431)||(10283-10658)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (5-431)||(720-1151)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (134-431)||(62202-62496)
scaffold0028 (1-431)||(132662-133086)
scaffold0028 (275-431)||(136681-136838)
scaffold0028 (275-431)||(139150-139307)
scaffold0028 (275-431)||(144088-144245)
scaffold0028 (275-431)||(134212-134369)
scaffold0028 (275-431)||(141619-141776)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (5-247)||(15522-15765)
scaffold0020 (329-431)||(15792-15894)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (81-420)||(7843-8180)
scaffold0218 (82-388)||(29048-29354)
scaffold0218 (1-44)||(28968-29011)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (150-431)||(22509-22787)
scaffold0037 (81-185)||(80099-80203)
scaffold0037 (275-431)||(82073-82230)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (126-421)||(1096-1391)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (5-404)||(7749-8151)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-431)||(32102-32516)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (82-431)||(15665-16011)
scaffold0261 (1-45)||(16047-16091)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (1-171)||(3195-3365)
[»] scaffold0021 (8 HSPs)
scaffold0021 (81-416)||(136134-136471)
scaffold0021 (81-416)||(144842-145179)
scaffold0021 (313-416)||(174785-174886)
scaffold0021 (1-48)||(62947-62994)
scaffold0021 (365-431)||(121770-121835)
scaffold0021 (83-122)||(133740-133779)
scaffold0021 (5-71)||(135983-136049)
scaffold0021 (5-71)||(144691-144757)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (127-431)||(11296-11598)
scaffold0046 (268-431)||(2001-2162)
scaffold0046 (316-431)||(28418-28533)
scaffold0046 (379-431)||(4556-4608)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (86-416)||(6054-6386)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (81-416)||(12587-12922)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (81-420)||(103405-103737)
scaffold0040 (5-71)||(103275-103341)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (80-406)||(38345-38673)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (165-405)||(53398-53640)
scaffold0075 (82-178)||(8062-8158)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (2-380)||(9133-9508)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (1-223)||(28497-28720)
scaffold0211 (351-431)||(28806-28887)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (82-431)||(34127-34473)
scaffold0175 (1-45)||(34509-34553)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (81-416)||(19651-19987)
scaffold0080 (309-431)||(39917-40038)
scaffold0080 (81-119)||(40227-40265)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (81-416)||(128737-129072)
scaffold0022 (144-406)||(78351-78614)
scaffold0022 (309-431)||(116431-116551)
scaffold0022 (5-55)||(128586-128636)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-323)||(1989-2303)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (81-354)||(87-360)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (328-431)||(23897-24000)
scaffold0100 (1-48)||(20498-20545)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (165-416)||(97024-97277)
scaffold0006 (165-416)||(106302-106555)
scaffold0006 (81-120)||(97320-97359)
scaffold0006 (81-120)||(106598-106637)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (268-431)||(1025-1186)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (309-431)||(38697-38819)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-121)||(43472-43592)
scaffold0116 (1-121)||(47392-47512)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (81-354)||(1564-1836)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (82-377)||(2213-2505)
scaffold0161 (1-45)||(2133-2177)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (309-431)||(3146-3267)
scaffold0540 (1-41)||(701-741)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (84-416)||(569-900)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (309-416)||(1051-1158)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (313-431)||(3185-3303)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (309-423)||(39489-39602)
scaffold0141 (83-122)||(33458-33497)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (309-423)||(75210-75323)
scaffold0049 (83-122)||(81315-81354)
[»] scaffold0026 (6 HSPs)
scaffold0026 (309-431)||(39862-39983)
scaffold0026 (309-423)||(25908-26021)
scaffold0026 (1-48)||(40242-40289)
scaffold0026 (1-48)||(39619-39666)
scaffold0026 (82-120)||(59271-59309)
scaffold0026 (1-45)||(59191-59235)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (275-420)||(25121-25268)
scaffold0123 (246-354)||(619-727)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (309-431)||(1855-1977)
scaffold0016 (81-185)||(207286-207390)
scaffold0016 (1-48)||(2237-2284)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (258-406)||(11493-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (258-406)||(38198-38348)
scaffold0124 (81-185)||(24418-24522)
[»] scaffold0120 (6 HSPs)
scaffold0120 (309-431)||(32952-33073)
scaffold0120 (309-431)||(45932-46053)
scaffold0120 (313-431)||(16117-16235)
scaffold0120 (373-431)||(17389-17446)
scaffold0120 (1-119)||(32647-32765)
scaffold0120 (1-119)||(46240-46358)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (316-431)||(4853-4968)
scaffold0403 (1-49)||(5222-5270)
[»] scaffold0357 (5 HSPs)
scaffold0357 (316-416)||(13147-13247)
scaffold0357 (312-420)||(16098-16206)
scaffold0357 (80-148)||(15865-15933)
scaffold0357 (5-59)||(13582-13636)
scaffold0357 (83-187)||(13379-13482)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (312-420)||(27747-27855)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (258-406)||(17969-18119)
scaffold0247 (1-42)||(6516-6557)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (313-431)||(17214-17334)
scaffold0056 (1-48)||(16903-16950)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (81-175)||(288-382)
[»] scaffold0122 (4 HSPs)
scaffold0122 (313-428)||(26064-26179)
scaffold0122 (309-431)||(44702-44824)
scaffold0122 (1-48)||(33182-33229)
scaffold0122 (1-119)||(25753-25871)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (5-77)||(227849-227921)
scaffold0012 (258-377)||(225465-225585)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (309-431)||(13215-13337)
scaffold0193 (1-49)||(13585-13633)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (309-431)||(32946-33067)
scaffold0145 (309-431)||(38765-38886)
scaffold0145 (275-431)||(9750-9908)
scaffold0145 (1-48)||(39145-39192)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (5-101)||(12329-12424)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (275-431)||(20748-20905)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (81-185)||(10160-10264)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (81-185)||(9601-9705)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (275-431)||(37822-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (275-431)||(158454-158611)
scaffold0003 (313-431)||(339949-340064)
[»] scaffold0292 (3 HSPs)
scaffold0292 (309-431)||(3474-3596)
scaffold0292 (1-119)||(3784-3903)
scaffold0292 (309-431)||(347-468)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (309-431)||(51917-52039)
scaffold0011 (309-431)||(167973-168095)
scaffold0011 (1-48)||(52298-52345)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (199-416)||(267679-267898)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (313-421)||(10784-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (278-431)||(13393-13547)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (309-431)||(8528-8646)
scaffold0121 (1-48)||(8220-8267)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (275-431)||(4695-4852)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (316-431)||(10427-10540)
scaffold0456 (1-49)||(10125-10173)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (275-431)||(13948-14105)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (81-185)||(12576-12679)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (275-431)||(16785-16942)
scaffold0142 (81-119)||(17095-17133)
scaffold0142 (5-47)||(17167-17209)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (316-431)||(1293-1406)
scaffold0106 (316-431)||(7270-7383)
scaffold0106 (370-431)||(15295-15355)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (275-416)||(20383-20524)
scaffold0031 (5-116)||(20118-20228)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (309-431)||(1043-1165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (309-431)||(1956-2078)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (309-431)||(22887-23008)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (316-431)||(15466-15580)
scaffold0114 (1-50)||(15164-15213)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (316-431)||(32071-32184)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (309-417)||(24297-24406)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (309-431)||(6116-6241)
scaffold0647 (1-46)||(5809-5854)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (5-119)||(12244-12357)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (370-431)||(4890-4950)
scaffold0395 (1-46)||(650-695)
scaffold0395 (86-122)||(8265-8301)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (313-421)||(9253-9360)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (316-416)||(51601-51699)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (275-431)||(40401-40558)
[»] scaffold0427 (2 HSPs)
scaffold0427 (316-419)||(13513-13615)
scaffold0427 (1-49)||(13869-13917)
[»] scaffold0228 (6 HSPs)
scaffold0228 (309-423)||(4520-4633)
scaffold0228 (309-423)||(12102-12215)
scaffold0228 (309-423)||(22054-22167)
scaffold0228 (1-48)||(4894-4941)
scaffold0228 (1-48)||(12476-12523)
scaffold0228 (1-48)||(22428-22475)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (313-431)||(16599-16717)
scaffold0217 (1-48)||(16287-16334)
scaffold0217 (81-119)||(16368-16406)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (318-431)||(16286-16397)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (358-431)||(4716-4788)
scaffold0358 (1-49)||(310-358)
scaffold0358 (1-49)||(5086-5134)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (275-431)||(107-264)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (316-431)||(5132-5245)
scaffold0718 (1-49)||(4830-4878)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (316-431)||(8483-8598)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (1-48)||(1765-1812)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (275-418)||(29946-30090)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (5-56)||(24212-24263)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (316-417)||(20928-21030)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (275-421)||(11299-11446)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (313-421)||(4308-4415)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-120)||(20716-20836)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-46)||(28924-28969)
scaffold0130 (309-353)||(27912-27956)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (275-419)||(161093-161239)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (1-49)||(751-799)
scaffold0598 (316-431)||(1053-1166)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (1-49)||(11212-11260)
scaffold0235 (81-119)||(11282-11320)
scaffold0235 (318-429)||(11447-11558)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (83-122)||(335-374)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-48)||(2773-2820)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-48)||(290-337)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (83-122)||(10643-10682)
scaffold0525 (83-119)||(9485-9521)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-48)||(18646-18693)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (328-416)||(2694-2784)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (275-421)||(12253-12400)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-47)||(17696-17742)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (309-406)||(4553-4650)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (365-431)||(46999-47065)
scaffold0064 (1-49)||(47360-47408)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (4-49)||(1288-1333)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (84-120)||(2136-2172)
scaffold0104 (84-120)||(9818-9854)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 68179 - 67749
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  68179 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaataatttaagaacaaacttgtgggagttacagatgaactcgccatggcgagta 68080  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  68079 gaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttag 67980  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  67979 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatga 67880  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  67879 attatgttgata-ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 67781  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  67780 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 67749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44014607 - 44014182
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||| ||  |||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  44014607 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttgttagttgcacctgaactcgccatggtgagta 44014508  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||     
T  44014507 gaggctctcgcctcgcgagctaaccggttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatcattgtcgcacgaattgatgtgagttgatc--agaggttaa 44014410  T
Q  201 aaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44014409 aaactaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaa 44014310  T
Q  301 ttatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 400  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44014309 ttatgttgatatttgagat---gttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 44014213  T
Q  401 catgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44014212 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18006074 - 18005650
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  18006074 tgtctaataatgattatgaaagatt------tgagattgaacctaaaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgacta 18005981  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18005980 gaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataa-tgcgatctttgtcgcacaagttgatatgagttgatcttagaggttag 18005882  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005881 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 18005782  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18005781 attatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagct 18005682  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18005681 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 16219408 - 16219834
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16219408 taataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacgtgaactcgccatggcgagtagagg 16219507  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  16219508 ccctcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgccttg-ttaggttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaac 16219606  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16219607 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 16219705  T
Q  304 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    || ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  16219706 tgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctaca 16219805  T
Q  403 tgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16219806 tgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 47832241 - 47831811
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47832241 tgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatctggaatagtttaagaacgaattt-tgagagttacacatgaactcgccatggcgagta 47832143  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| |||||||| ||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47832142 gaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcggacgagttgatgtgagttgatcttggaggttag 47832043  T
Q  201 aaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47832042 aaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatga 47831944  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47831943 attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagc 47831844  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  47831843 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 47831811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16056757 - 16056343
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16056757 taataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatagcgagtagagg 16056658  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16056657 ctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttg-ttaggttaaatgcgatctttgtagcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaac 16056559  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16056558 taagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaa-tgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 16056460  T
Q  304 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16056459 tgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgca 16056361  T
Q  403 tgagctggtctaagttga 420  Q
    | ||  ||||||||||||    
T  16056360 tcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Original strand, 810819 - 811248
Alignment:
Q  3 tctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    || |||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||    
T  810819 tctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacctggaaagaatttagaatgaatttttgtgaactgtacctgaactcgccatggcgagtaga 810918  T
Q  103 ggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttaga 201  Q
    ||||||| ||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||    
T  810919 ggctctcgcctcgcgag-tacttatgttacaaaatgccttgtttaagttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtgagttgaccttggaagttaga 811017  T
Q  202 aactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 300  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  811018 aactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaa 811116  T
Q  301 ttatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  811117 ttatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagct 811216  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  811217 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22073345 - 22072917
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22073345 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctagaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 22073246  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| ||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  22073245 ccctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgctttg-ttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaac 22073147  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-att 302  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||    
T  22073146 taagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagttt 22073048  T
Q  303 atg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 400  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22073047 atgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 22072948  T
Q  401 catgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |   |||||||||||| | |||||||    
T  22072947 catgggtcagtctaagttgattaagatgatg 22072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 327
Target Start/End: Original strand, 9389387 - 9389709
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9389387 taatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttatgtgagttacagctgaactcgccatggcgagtagagg 9389486  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9389487 ctctcgcctcgcgagctaagcagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaac 9389586  T
Q  205 taagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    |||||| |  | |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9389587 taagttatcgaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-gtatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacattgtatgaatta 9389685  T
Q  304 tgttgatatttgagatgttgttga 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9389686 tgttgatatatgagatgttgttga 9389709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16324439 - 16324175
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||||||||||||||||    
T  16324439 tgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttttgagagttagattggaactcgccatggcgagta 16324340  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16324339 gaggccctcgccttgcgaactgcccagttacagaatgccttg-ttaggttaaatgtgatccttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 16324241  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16324240 aaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 431
Target Start/End: Original strand, 15754702 - 15755004
Alignment:
Q  128 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  15754702 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaa 15754801  T
Q  227 tatttcagtaagcctgaattaatatg-atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgt 324  Q
    |||| ||||||| ||| ||  ||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||   |||||    
T  15754802 tattccagtaagactg-atgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgt 15754897  T
Q  325 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgat 424  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||     
T  15754898 tgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaa 15754997  T
Q  425 gatgatg 431  Q
    |||||||    
T  15754998 gatgatg 15755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34201137 - 34200790
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||    
T  34201137 tgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacataatgcctt-tttaggttaaatgcgatccctgtcattcgagttgatgt 34201039  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | |  ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||||||    
T  34201038 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatata 34200940  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34200939 attgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 34200843  T
Q  379 tgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  34200842 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 431
Target Start/End: Original strand, 11995797 - 11996144
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  11995797 tgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgt 11995895  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  | |  ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||||||    
T  11995896 gagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatata 11995994  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  11995995 attgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgt 11996091  T
Q  379 tgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  11996092 tgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11996144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Original strand, 28505069 - 28505415
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  28505069 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtg 28505167  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||   | || ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  28505168 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 28505266  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28505267 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 28505363  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  28505364 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12901683 - 12901338
Alignment:
Q  80 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatg 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |  | | ||||| ||  ||||| |||||||||||| ||   || ||| |||||||||||    
T  12901683 atgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacaaaacaccttg-ttaggttaaatgtgacatttgtcgtacgagttgatg 12901585  T
Q  180 tgagttaatcttagaggt---ta-gaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggt 274  Q
    |||||| ||||| |||||   || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12901584 tgagttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaatt-atatgatttaatgttgttgttaatgtt 12901486  T
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 371  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||| ||    
T  12901485 atatagttgtatatacattacatgaattatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcct 12901387  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  12901386 atgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Original strand, 12255483 - 12255625
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  12255483 taataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagagg 12255582  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||| ||||||||| |  | ||||||| |||| ||||||||||    
T  12255583 ctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatg-cttgtttagg 12255625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495406
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  367 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Original strand, 2279810 - 2279952
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2279810 taataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgtaatagtttaagaatggatttttgggtgttacacctgaactcgccatagcgagtagagg 2279909  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    | ||| ||||||||| |  ||||||| | |||| ||||||||||    
T  2279910 ccctcgcctcgcgagttgcctagttatagaatg-cttgtttagg 2279952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Original strand, 20220018 - 20220290
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    ||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||| | |||  || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20220018 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctg 20220117  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    | |||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |   ||||||| |||||    
T  20220118 atttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatat 20220213  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20220214 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 420
Target Start/End: Original strand, 2280061 - 2280225
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||| |||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2280061 atgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct 2280160  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2280161 gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15113296 - 15113028
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||       |  |||  |||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  15113296 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacaggatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 15113198  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||  | |||||  |  |||||  ||||||    
T  15113197 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg-atttatatgagttgatgttaattataatgtgatataa 15113099  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 350  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||| | |||   ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15113098 ttgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 12255789 - 12255885
Alignment:
Q  312 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12255789 tttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 12255885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227485
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtc 38227508  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  38227507 ggtctaagtagatgaagatgatg 38227485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 420
Target Start/End: Original strand, 1867924 - 1868101
Alignment:
Q  245 ttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattg 343  Q
    |||| ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  1867924 ttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattg 1868022  T
Q  344 ttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1868023 ttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564481
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15116834 - 15116565
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  15116834 tgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 15116736  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||  | ||||| ||  |||||  |||||    
T  15116735 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactg-atgtatatgagttgatgttatttataatgtgatata 15116637  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 350  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||| | |||   ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  15116636 attgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456529
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||      
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtc 18456506  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  18456507 ggtctaagttgattaagatgatg 18456529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698835
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  407 ctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
      ||||||||||||||| |||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13647487 - 13647344
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  13647487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 13647388  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13647387 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044761
Alignment:
Q  249 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 346  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  347 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354791
Alignment:
Q  249 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 346  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  347 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18430870 - 18430713
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| |    
T  18430870 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-t 18430772  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18430771 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27217018 - 27216861
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  27217018 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 27216920  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  27216919 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509193
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 456479 - 456322
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  456479 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 456381  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  456380 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 2832072 - 2832176
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  2832072 tgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgtcttgtttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgtt 2832169  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  2832170 atgagtt 2832176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 11393291 - 11393448
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11393291 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11393389  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  11393390 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11972654 - 11972497
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11972654 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11972556  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  11972555 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 14949126 - 14949283
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14949126 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14949224  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14949225 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 15376717 - 15376874
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15376717 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15376815  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15376816 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16232678 - 16232521
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16232678 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16232580  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16232579 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18640430 - 18640273
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18640430 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18640332  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18640331 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 20385127 - 20385284
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20385127 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20385225  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20385226 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 21189599 - 21189756
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21189599 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21189697  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21189698 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24702396 - 24702239
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24702396 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 24702298  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24702297 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32125649 - 32125492
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32125649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32125551  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  32125550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 39267413 - 39267517
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |    
T  39267413 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgggagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgtt 39267510  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  39267511 atgagtt 39267517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41523075 - 41522918
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41523075 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41522977  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  41522976 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41525537 - 41525380
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41525537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41525439  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  41525438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062076
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 372  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||| ||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactg-ctg 17062017  T
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17062018 agttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26212012
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  408 tggtctaagttg 419  Q
     |||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273393
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatg 48273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486836
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 19486836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 406
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063910
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgag 10063910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 9751317 - 9751421
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  9751317 tgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgagcgcttgtgttacagaatgccttgtttagtttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttat 9751416  T
Q  181 gagtt 185  Q
    |||||    
T  9751417 gagtt 9751421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16410217 - 16410060
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16410217 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16410119  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16410118 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24704843 - 24704689
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 372  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |  |||| ||||||| |     
T  24704843 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactgt-tg 24704747  T
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24704746 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18302532 - 18302450
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatcctt 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18302532 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccatgtttaggttaaatgcgatcctt 18302450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275182
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  412 ctaagttgat 421  Q
    ||||||||||    
T  24275191 ctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008591
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga-- 354  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  355 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    || |||  |||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 15008591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44116667 - 44116510
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  44116667 atataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 44116569  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44116568 gtgttgctgttg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44116510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 12756409 - 12756522
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa-tttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagag 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||| || |  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  12756409 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatta-tttaagaatgaactttttggaagct-gacctgaactcaccatggcgagtagag 12756506  T
Q  104 gctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||| |||||||||    
T  12756507 gctctcgcctcgcgag 12756522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144153
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15144135 ctaagttga-gatgatgatg 15144153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386365
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| |||| | || | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||     
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatg 16386365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 15143725 - 15143843
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||| || || || |   |  || ||||||||||||||| |    
T  15143725 tgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagca 15143824  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15143825 gaggctctcgcctcgcgag 15143843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44116937 - 44116820
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| || || |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |    
T  44116937 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccggaa-agatttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagca 44116839  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  44116838 gaggctctcgcctcgcgag 44116820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 21064855 - 21064964
Alignment:
Q  6 aataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggc 105  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||| | |||| | |||| || | |||  |  | |||||||||||||||||||||||    
T  21064855 aataatgattaggaaatattttagaatgagattgaacttggaatagtgtcagaatggatttttgagtgttttaccttaactcgccatggcgagtagaggc 21064954  T
Q  106 tctcacctcg 115  Q
    |||| |||||    
T  21064955 tctcgcctcg 21064964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3386491 - 3386334
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3386491 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3386393  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  3386392 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3386334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589055
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T
Q  415 agttg 419  Q
    |||||    
T  10589059 agttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213685
Alignment:
Q  320 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagtt 418  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  419 gatgatgatgatg 431  Q
    ||| | |||||||    
T  16213697 gattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 38227913 - 38227866
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  38227913 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 38227866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443395
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatg 40443395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 16385946 - 16385994
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  16385946 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 16385994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 28504989 - 28505033
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28504989 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 28505033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 123961 - 124000
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  123961 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 124000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 3564052 - 3564099
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  3564052 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 3564099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4993837 - 4993798
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4993837 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 4993798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 9509622 - 9509575
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  9509622 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 9509575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 13395233 - 13395272
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13395233 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 13395272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13869394 - 13869347
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13869394 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 15754575 - 15754622
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  15754575 tgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa 15754622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 17061728 - 17061794
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  17061728 tgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttagg 17061794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20110604 - 20110557
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20110604 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20110557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48785664 - 48785625
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48785664 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 48785625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Original strand, 2529866 - 2529924
Alignment:
Q  127 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagtt 185  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||    
T  2529866 gttacagaatgccttaattaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 2529924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Original strand, 17061652 - 17061694
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga 47  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  17061652 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgga 17061694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26212348 - 26212310
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26212348 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 26212310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 431
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847947
Alignment:
Q  365 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Original strand, 9177432 - 9177472
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9177432 tgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagct 9177472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16006768 - 16006732
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16006768 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 16006732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  314 tgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 350  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 21743056 - 21743092
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21743056 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21743092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 40443810 - 40443762
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  40443810 tgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctggaat 40443762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6970 - 6539
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaat-ttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  6970 tgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagt 6871  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
     ||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6870 ggaggccctcccctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggtta 6771  T
Q  200 gaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6770 aaaactaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 6671  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6670 attatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 6571  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6570 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 8823 - 8481
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  8823 tgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 8725  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  |||||  |||||    
T  8724 gaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactg-atgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatata 8626  T
Q  280 --attgtatatacattatatgaattatgt-tg-atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 375  Q
      |||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8625 atattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgt 8526  T
Q  376 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8525 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 22921555 - 22921986
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  22921555 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaaccaggaatagtttaagaacgaatttttgagagttagacttgaactcgccatggcgagta 22921654  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22921655 gaggctctcgcctcgcgaactgcctagttacagaatgccttgtttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 22921754  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22921755 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatga 22921854  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22921855 attttgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct 22921954  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  22921955 gcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33681442 - 33681011
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  33681442 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagca 33681343  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| ||||||||  || | ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33681342 gaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 33681243  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33681242 aaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 33681144  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33681143 attatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagt 33681044  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  33681043 tgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22238062 - 22237631
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||  ||| |||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22238062 tgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctggaaagattttggaatgaattt-tgtgagttgcacttgaactcgccatggcgagta 22237964  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22237963 gaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttttcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 22237864  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctg-ttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||  || |||| |  ||||||  | ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  22237863 aaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactga-tacatatgaattgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatg 22237765  T
Q  299 aattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22237764 aattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaag 22237665  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22237664 cttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 35981383 - 35981700
Alignment:
Q  10 atgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctc 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35981383 atgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgggatagtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctc 35981482  T
Q  110 acctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagt 209  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35981483 gcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgaattgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagt 35981582  T
Q  210 t-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg 308  Q
    |  |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35981583 tatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-gtatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatgttg 35981681  T
Q  309 atatttgagatgttgttga 327  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35981682 atatttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 52927669 - 52928087
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||  ||| |||||| |   ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  52927669 tgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttggaatgaattttttaaagttagacctgaactcgccatggcgagta 52927768  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| ||||||||  | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52927769 gaggccctcgcctcgcgaattgaccagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 52927867  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  52927868 aaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 52927966  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52927967 attatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagc 52928054  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| |||||    
T  52928055 tgcatgagtcggtctaagttgaagatggtgatg 52928087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20248710 - 20248283
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga-atagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| || ||  |  |  |||||||||||||||||||    
T  20248710 tgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagt 20248612  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  20248611 agaggctatcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttatttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtaaattgatcttagaggtta 20248512  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |  ||||||| |||| |  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20248511 gaaactaagttatttatcttgatgttgttgtc-cagtaagactga-tgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatg 20248414  T
Q  299 aattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    | ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  20248413 acttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaag 20248317  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20248316 ttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20637279 - 20636957
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20637279 taatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagagg 20637180  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20637179 ctctcgcctcgcgagctaatcagttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaac 20637080  T
Q  205 taagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||  ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637079 taagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaatt-gtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaatta 20636981  T
Q  304 tgttgatatttgagatgttgttga 327  Q
    ||||  |||||| |||||||||||    
T  20636980 tgtttgtatttgggatgttgttga 20636957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21754468 - 21754052
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgg-aatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||| ||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||     
T  21754468 tgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacctgggaagacttta-gaatgaattt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagc 21754371  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagtt--acataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggt 197  Q
    |||||||||| |||||||||   ||| |||  ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21754370 agaggctctcgcctcgcgagt--acttgttttacagactgccttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatctcagaggt 21754274  T
Q  198 tagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| |    
T  21754273 tagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaa 21754183  T
Q  297 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  21754182 tggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa 21754084  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 428  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21754083 gctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 49261690 - 49261448
Alignment:
Q  85 ctcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagt 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  49261690 ctcgccatggcgaatagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagt 49261591  T
Q  185 taatcttagaggttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattg 283  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||  || ||||||||| |||||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  49261590 tgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaatt-gtatattctaatgttgatgataatgttatataattg 49261492  T
Q  284 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261491 tatatacattatataaattatgttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 416
Target Start/End: Original strand, 21861389 - 21861672
Alignment:
Q  134 aatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttc 232  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  21861389 aatgccttgtt-aggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttc 21861487  T
Q  233 agtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaatt 330  Q
    ||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||    
T  21861488 agtaagcctgaat-attatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgactt 21861586  T
Q  331 gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  21861587 gcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 416
Target Start/End: Original strand, 21896078 - 21896358
Alignment:
Q  134 aatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttc 232  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||   ||    
T  21896078 aatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgtt---tc 21896173  T
Q  233 agtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaatt 330  Q
    ||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||    
T  21896174 agtaagcctgaat-attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgactt 21896272  T
Q  331 gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21896273 gcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20918955 - 20918620
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     |||| | |||||||| |||||||| ||||||||| || |||  ||| |||||||    
T  20918955 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtgttaaagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgacttgatgt 20918857  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||  | || ||||||| || | |   |||||  | |||||| |  ||||| ||||||    
T  20918856 gagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactca-tgcttatgaattgatgttgcttataatgttatata 20918758  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20918757 attgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 20918661  T
Q  379 tgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg 419  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20918660 agtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 428
Target Start/End: Original strand, 16368115 - 16368401
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16368115 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 16368214  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16368215 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatat 16368311  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg-atgatgatg 428  Q
    |||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  16368312 tgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatg 16368401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 28194145 - 28194306
Alignment:
Q  10 atgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctc 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194145 atgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgaaatagtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcaagtagaggctctc 28194244  T
Q  110 acctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacg 171  Q
     |||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28194245 gcctcgcgagctacccatttacaaaatgtcttgtttaggttacatgcgatctttgtcgcacg 28194306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50686968 - 50686694
Alignment:
Q  80 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatg 179  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||| ||||||| ||| |||||| || | || ||||||||||||| |    
T  50686968 atgagctcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccctgtgagacagaataccttgtt-aggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgacg 50686870  T
Q  180 tgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 278  Q
    |||||| ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||  ||||    
T  50686869 tgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatccgatgttgttaataatgtgatat 50686771  T
Q  279 aattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  50686770 aaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatga 50686694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Original strand, 50613945 - 50614219
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || |||   | ||| |||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  50613945 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50614043  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    |||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50614044 aatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 50614142  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50614143 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Original strand, 50621773 - 50622047
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || |||   | ||| |||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  50621773 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50621871  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    |||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50621872 aatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 50621970  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50621971 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295671
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  367 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa---gttgatgatgatgatg 431  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatg 14295671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Original strand, 41049864 - 41050138
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||| ||| || | || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41049864 ttaggttatatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 41049963  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    ||||| |||||| | | ||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41049964 aatta-tatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatat 41050061  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||  |  |||  |||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  41050062 tgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 257 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21161892 - 21161720
Alignment:
Q  257 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21161892 aatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgat 21161795  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  21161794 gatttgcatactgt-tttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16758841 - 16758664
Alignment:
Q  246 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 344  Q
    ||||||||| |  |||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16758841 taatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgt 16758742  T
Q  345 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16758741 tatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210330
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22532395 - 22532273
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  22532395 atatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12271901 - 12271744
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  12271901 tgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 12271803  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaag 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||    
T  12271802 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaag 12271744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 416
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  322 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574989
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 45574945  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45574946 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 21475091 - 21475248
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21475091 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21475189  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21475190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509784
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13989024 - 13988867
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13989024 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13988926  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13988925 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 21923295 - 21923452
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21923295 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21923393  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21923394 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026684
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250846
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatg 27250846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130976
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 366  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttggatac 22130959  T
Q  367 tgtctatgttgctgttg 383  Q
    || ||||||||||||||    
T  22130960 tgcctatgttgctgttg 22130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840778
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  412 ctaagttgat 421  Q
    ||||||||||    
T  21840787 ctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 23593739 - 23593896
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23593739 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23593837  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23593838 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29298294 - 29298138
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29298294 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-t 29298197  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29298196 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29776846 - 29776689
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  29776846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-t 29776748  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29776747 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31612471 - 31612314
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  31612471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 31612373  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  31612372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31612314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 433168 - 433013
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||  |||| |||||| ||    
T  433168 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcct 433069  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  433068 gtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 433013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130632
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 416
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  257 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    ||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  355 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
      || |||  |||||| |||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847271
Alignment:
Q  364 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 433440 - 433322
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |    
T  433440 tgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagca 433341  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  433340 gaggctctcgcctcgcgag 433322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 43697793 - 43697716
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttaca 78  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||    
T  43697793 tgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacctggaatagtttaagaatggattttcgggagttaca 43697716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 22123071 - 22123229
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  22123071 atataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-t 22123169  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||    
T  22123170 gtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatg 22123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 431
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801504
Alignment:
Q  359 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagatgttgaagatgatg 38801504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 421
Target Start/End: Original strand, 20454610 - 20454660
Alignment:
Q  370 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20454610 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26065100 - 26064959
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 371  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||   ||||| ||    
T  26065100 atatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcatgaattattttatgtactgcct 26065002  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  26065001 atgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26065293 - 26065226
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  26065293 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaataccttgtttagg 26065226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 50209901 - 50209948
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  50209901 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 50209948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16362075 - 16361928
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |    
T  16362075 atataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-t 16361977  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16361976 gtgttgctgtcg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 13212865 - 13213023
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  13212865 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 13212963  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13212964 tgcgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 20919034 - 20918990
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  20919034 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 20918990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 22355873 - 22355921
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  22355873 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 22355921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 22357559 - 22357607
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  22357559 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 22357607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 14432123 - 14432162
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14432123 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 14432162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20631667 - 20631628
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20631667 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 20631628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21342144 - 21342097
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21342144 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21347009 - 21346962
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21347009 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21707215 - 21707168
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21707215 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21711757 - 21711710
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21711757 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 21895924 - 21895975
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaa 56  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21895924 taataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 21895975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 22532702 - 22532655
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  22532702 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22532655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 22900022 - 22900061
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22900022 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22900061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24087766 - 24087727
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24087766 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 24087727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 34510213 - 34510166
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  34510213 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 34510166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36181926 - 36181887
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36181926 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 36181887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37358819 - 37358780
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37358819 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 37358780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45307641 - 45307602
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45307641 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 45307602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 38801160 - 38801198
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38801160 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 38801198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16759004 - 16758947
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgc 138  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  16759004 tgaactcgccatagcaagtagaggccctcacctcgcgagttgcctagttacagaatgc 16758947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20135539 - 20135502
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20135539 gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgag 20135502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20579815 - 20579779
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20579815 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 20579779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 20846918 - 20846966
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  20846918 tgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20846966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21027102 - 21027054
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  21027102 tgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 21027054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21162115 - 21162079
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21162115 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 21162079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 27250428 - 27250476
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  27250428 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgggattgaacctggaat 27250476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 38801090 - 38801138
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  38801090 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgtgattgaacctggaat 38801138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 4 - 431
Target Start/End: Original strand, 39863 - 40291
Alignment:
Q  4 ctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||    
T  39863 ctaataatggttaggaaagattggagattgacattcaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaacttgccatggcaagtagag 39962  T
Q  104 gctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaa 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39963 gctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttatttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaa 40062  T
Q  204 ctaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 302  Q
    |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40063 ctaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 40162  T
Q  303 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40163 atgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgca 40262  T
Q  403 tgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  40263 tgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 127 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 100683 - 100378
Alignment:
Q  127 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 225  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  100683 gttacaaaatgccttgtctaagttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttg 100584  T
Q  226 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 325  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100583 ttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttaatatttgagatgttgtt 100484  T
Q  326 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatg 425  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  100483 gatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatg 100384  T
Q  426 atgatg 431  Q
    ||||||    
T  100383 atgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 101827 - 101602
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga-atagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||     
T  101827 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaattt-tgtgaacttgacctgaactcgccatggcgagc 101730  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||  |  |||| | | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  101729 agaggctcttgcctcgggag-tacttgtgttatagactgtcttgtttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt 101631  T
Q  199 agaaactaagttgttatcttgctgttgtt 227  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  101630 agaaactaagttgttctcttgttgttgtt 101602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 94569 - 94412
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  94569 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 94471  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  94470 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44613 - 44455
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtc 370  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | |||||||     
T  44613 atataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt- 44515  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44514 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  358 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119879
Alignment:
Q  362 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 119879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17591
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17444 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17542  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17543 gtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 2332 - 2762
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2332 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggattagtt-aagaacgtacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagta 2430  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    |||||  |  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2431 gaggccattgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttag 2530  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2531 aaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 2630  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2631 attatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagct 2730  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2731 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19699 - 19268
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||| |  | ||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  19699 tgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttatgtgttgcacctgaactcgccatggcgagca 19600  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| ||||||||   | | ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19599 gaggctctcgcctcgcgaatgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttag 19500  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499 aaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 19400  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19399 attatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 19300  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19299 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 23760528 - 23760961
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||    
T  23760528 tgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaacttgccaaggcgagta 23760627  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  23760628 gaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttg-ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaa 23760726  T
Q  201 aaactaagttgtt----atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 296  Q
    |||||||||||||     | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760727 aaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 23760826  T
Q  297 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23760827 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 23760926  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  23760927 gctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 38854939 - 38855368
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38854939 tgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacctggaatagtttaagaacgaattt-tgagagttacacctgaactcgccatggcgagta 38855037  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| ||||||||  |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||    
T  38855038 gaggccctcgcctcgcgaattgcccagttacagaatgccttgcttaggttaaacacgatctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcttggacattag 38855137  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38855138 gaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatga 38855236  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38855237 attatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 38855336  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  38855337 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21674138 - 21673712
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  21674138 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatatttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagta 21674039  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||     
T  21674038 gaggccctcgcctcgcgaattgacttgttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttaatgtgagttgatattagaggttaa 21673939  T
Q  201 aaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21673938 aaactaagttgttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaa 21673839  T
Q  301 ttatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  21673838 ttatattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatg 21673739  T
Q  401 catgagctggtctaagttgatgatgat 427  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21673738 catgagtcggtctaagttgatgatgat 21673712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6520801 - 6520372
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  6520801 tgtctaataataattaggaaagattggagattaagactgaacctgaaatagtttaagaatggatttttgagagttagacctgaattcgccatggcgagta 6520702  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| |||||| | ||  | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6520701 gaggccctcgcctcgcaaactgcccaattacagaatgctttgtt-aggttaaatgcgatctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttag 6520603  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6520602 aaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga 6520504  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6520503 attatgttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 6520404  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6520403 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6520372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 26355386 - 26355815
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| |||||| || || ||  |  |||||| |||||||||||||    
T  26355386 tgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacctggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacctgaacttgccatggcgagta 26355485  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26355486 gaggctctcgcctcacgagctaactagttacagaatgccttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttag 26355585  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| || ||  |||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  26355586 aaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgg 26355684  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    | |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  26355685 aatatgttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagct 26355783  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26355784 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21285989 - 21285611
Alignment:
Q  43 ctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttg 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |  | ||||||| ||||| |||    
T  21285989 ctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgctatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagttgcccagttacagaatgctttg 21285890  T
Q  143 tttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcct 241  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21285889 tt-aggttaaatgcgatctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcct 21285791  T
Q  242 gaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgata 340  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21285790 gaatta-tataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgata 21285692  T
Q  341 ttgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21285691 ttgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Original strand, 5866045 - 5866391
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  5866045 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtg 5866143  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  5866144 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 5866242  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5866243 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 5866339  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  5866340 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5866391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21491344 - 21490999
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || | |  |||||| ||||||    
T  21491344 aacttgccatggcgagtagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtagttcgagttaatgtga 21491246  T
Q  183 gttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  21491245 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcctatgaattaatgttgcttataatgttatataat 21491147  T
Q  282 tgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 380  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21491146 tgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctg 21491050  T
Q  381 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  21491049 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21490999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17140920
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| || ||||| |||||||| ||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcattcgagttgatgtg 17141168  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  17141167 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 17141069  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  17141068 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgct 17140972  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  17140971 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 17140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21249734 - 21249388
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||    
T  21249734 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcaagttgatgtg 21249636  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat 281  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  | | ||| |||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  21249635 agtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccctgctgttaatgtctcactaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataat 21249537  T
Q  282 tgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct- 379  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||     
T  21249536 tgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgcta 21249440  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  21249439 tttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21249388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 165 - 420
Target Start/End: Original strand, 983252 - 983512
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt----atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatg 260  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  983252 tcgcacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaatta-tatgattgaatg 983350  T
Q  261 ttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tga 357  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |      
T  983351 ttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttg 983449  T
Q  358 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21255572 - 21255226
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc-taactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |   || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  21255572 gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgagcatttgta-ttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgt 21255475  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  | | ||| |||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  21255474 gagtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccctgctgttaatgtctcactaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 21255376  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21255375 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgct 21255279  T
Q  380 -gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
      ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  21255278 atttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21255226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39834259 - 39834106
Alignment:
Q  7 ataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggct 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39834259 ataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggct 39834160  T
Q  107 ctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatc 160  Q
    ||| |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39834159 ctcgcctcgcgagctacccatttacagaataccttgtttaagttaaatgcgatc 39834106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20498915 - 20498581
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtga 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| ||  ||||||| ||||| | || || | || || |||||||||||||||    
T  20498915 aactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggtttattgtgacctttgtcacacgagttgatgtga 20498817  T
Q  183 gttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat 281  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| ||||  || |||||| | ||||||||  |||||  |||||||    
T  20498816 gttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgta-tatgatttgatgttgtttataatgtgatataat 20498718  T
Q  282 tgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||    
T  20498717 tgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgct 20498618  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  20498617 gtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Original strand, 17266821 - 17267096
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||   | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  17266821 ttaggttaaatgtgacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctg 17266920  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17266921 aatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 17267019  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||   | |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17267020 tgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37116641 - 37116366
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    ||||| |||||| || | || ||| ||||||||||||||| | ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37116641 ttaggataaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 37116542  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    | |||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37116541 atttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 37116443  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37116442 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 19801115 - 19801233
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  19801115 tgtctaataatgattaggaaagactagagaataagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagta 19801214  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||  ||| |||||||||    
T  19801215 gaggtcctcgcctcgcgag 19801233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24353316 - 24353039
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatct---tgctgttgttatttcagtaagc 239  Q
    ||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||| | | | | ||||||||||||| ||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  24353316 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagc 24353217  T
Q  240 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcga 338  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24353216 ctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-ga 24353119  T
Q  339 tattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24353118 tattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22364954 - 22364744
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||   | | | | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22364954 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 22364855  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  ||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| || | || |||||    
T  22364854 aatt-atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatat 22364757  T
Q  342 tgttatatcatga 354  Q
    |||||||||||||    
T  22364756 tgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22626861 - 22626740
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  22626861 atatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 22626763  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  22626762 ggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 406
Target Start/End: Original strand, 13508009 - 13508177
Alignment:
Q  240 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 337  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13508009 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 13508108  T
Q  338 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13508109 atattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 13508177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092459
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatg 16092459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 406
Target Start/End: Original strand, 13597541 - 13597709
Alignment:
Q  240 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 337  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||| | |||| ||||    
T  13597541 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcg 13597640  T
Q  338 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13597641 atattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 13597709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 406
Target Start/End: Original strand, 17439436 - 17439599
Alignment:
Q  246 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 344  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17439436 taatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgt 17439535  T
Q  345 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17439536 tatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 17439599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919117
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatg 21919117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875069
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||||      
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtc 22875092  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  22875091 ggtctaaattgatgaagatgatg 22875069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 406
Target Start/End: Original strand, 17612069 - 17612202
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 372  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17612069 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 17612168  T
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  17612169 tgttgttgattgttaattaactaagctgcatgag 17612202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649161
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28649144  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28649145 agttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372782
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536212
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971261
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| ||| |||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatg 31971261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219718
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1484560 - 1484403
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1484560 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1484462  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  1484461 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 5853296 - 5853453
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  5853296 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 5853394  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  5853395 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 14409448 - 14409605
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  14409448 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 14409546  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14409547 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 20046199 - 20046356
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20046199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 20046297  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20046298 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20403385 - 20403228
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20403385 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20403287  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20403286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22001911 - 22001754
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  22001911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 22001813  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22001812 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199761
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||| | ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatg 16199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818526
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924045
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759262
Alignment:
Q  322 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  421 tgatgatgatg 431  Q
    ||| |||||||    
T  6759272 tgaagatgatg 6759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406383
Alignment:
Q  322 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  421 tgatgatgatg 431  Q
    ||| |||||||    
T  23406393 tgaagatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 431
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879348
Alignment:
Q  358 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801527
Alignment:
Q  276 tataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 373  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | |    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgt 19801485  T
Q  374 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19801486 gttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41598617 - 41598471
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |    
T  41598617 tgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagca 41598518  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  41598517 gaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatg-cttgtttagg 41598471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 16413320 - 16413467
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  16413320 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 16413418  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16413419 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225408
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatg 26225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4483438 - 4483282
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  4483438 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 4483340  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  4483339 gtgttgctgttg-ttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 15203235 - 15203392
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15203235 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15203333  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  15203334 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396097
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  21396082 gatgttgaagatgatg 21396097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790590
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  21790575 gatgttgaagatgatg 21790590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41598346 - 41598189
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  41598346 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 41598248  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  41598247 gtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41598189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 4542377 - 4542534
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||  ||| |    
T  4542377 atataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-t 4542475  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  4542476 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389567
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  21389552 gatgttgaagatgatg 21389567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778893
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  21778878 gatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 354
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492891
Alignment:
Q  307 tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131113
Alignment:
Q  364 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 45131113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896266
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19896323 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 5865965 - 5866009
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  5865965 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 5866009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14823931 - 14823775
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  14823931 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14823833  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  14823832 gtgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgag-tggtctaaattgattaagatgatg 14823775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 17141346 - 17141302
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  17141346 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17141302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Original strand, 22419183 - 22419223
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22419183 tgaactcgccatagcgagtagaggccctcacctcgcgagct 22419223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 45130719 - 45130767
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  45130719 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 45130767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 6759690 - 6759643
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  6759690 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaa 6759643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17615268 - 17615229
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17615268 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 17615229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 18878925 - 18878972
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  18878925 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18878972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 21255652 - 21255605
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  21255652 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 21255605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 21491425 - 21491378
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  21491425 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaa 21491378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 22059159 - 22059198
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22059159 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22059198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 22145156 - 22145195
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22145156 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22145195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23406814 - 23406695
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaat-ttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||   ||  |||| |||  |||||||| |   |  ||||||||||| |||||||    
T  23406814 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagt 23406715  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  23406714 agaggctctcgcctcgcgag 23406695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 24707577 - 24707616
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24707577 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 24707616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Original strand, 25484382 - 25484429
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||    
T  25484382 gttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatg 25484429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37116702 - 37116663
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37116702 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 37116663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20536560 - 20536522
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20536560 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20536522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 21918769 - 21918807
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21918769 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21918807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Original strand, 25362842 - 25362887
Alignment:
Q  4 ctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  25362842 ctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 25362887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 421
Target Start/End: Original strand, 45290809 - 45290846
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45290809 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 6608025 - 6608061
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6608025 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 6608061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 7300833 - 7300869
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7300833 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 7300869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 16092029 - 16092073
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  16092029 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaacctg 16092073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Original strand, 16861100 - 16861136
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16861100 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 16861136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383887
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt 359  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 21414997 - 21415033
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21414997 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21415033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 31971677 - 31971629
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||    
T  31971677 tgtctaataatgattaggaaaggatgtaggatgagattgaacctggaat 31971629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 45134676 - 45134712
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45134676 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 45134712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 119)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15471353 - 15470928
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15471353 taatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaattt-tgagagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 15471255  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| ||||| || ||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  15471254 ccctcgcctcgtgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaac 15471155  T
Q  205 taagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15471154 taagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 15471057  T
Q  304 tgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15471056 tgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgca 15470957  T
Q  403 tgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  15470956 tgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16097763 - 16097332
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||| |||| |||||| || || ||  |  |||||||||||||| |||||    
T  16097763 tgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaatttttgtgaattggacctgaactcgccatggtgagta 16097664  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16097663 gaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagattag 16097564  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16097563 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 16097465  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16097464 attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 16097365  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16097364 tgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14234919 - 14234491
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14234919 taatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacccgaaatagtt-aagaatgaatttttgggagttgcacctgaactcgccatggcgagtagagg 14234821  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  14234820 ccctcgcctcgcaagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgaacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaac 14234721  T
Q  205 taagtt-gttatcttgctgttgttat--ttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 301  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14234720 taagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaatt-gtttaatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaat 14234622  T
Q  302 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 400  Q
    |||| ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14234621 tatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctg 14234522  T
Q  401 catgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||    |||||||||||| | |||||||    
T  14234521 catgaatcagtctaagttgattaagatgatg 14234491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16104213 - 16103784
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgg-aatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||| ||  |||||| || || ||  |   ||||||| | |||||||     
T  16104213 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctgggaagacttta-gattgaattt-tgtgaattgaatccgaactcgtcgtggcgagc 16104116  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    |||||||||| ||||| |||       |||||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16104115 agaggctctcgcctcgtgagtactggtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgctctttgtcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 16104016  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  16104015 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagact-aatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatg 16103917  T
Q  299 aattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16103916 aattatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaag 16103818  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16103817 ctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32308099 - 32307684
Alignment:
Q  3 tctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacct-ggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||| |||||  |  |  |||||||||||||||||| ||    
T  32308099 tctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagacttta-gaatgaattt-tgggaactgaacctgaactcgccatggcgagcag 32308002  T
Q  102 aggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32308001 aggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 32307903  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||  |||||| |||| |   |||||  ||||||||||  |||||        |||||||||||||| |||     
T  32307902 aaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatgg 32307812  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32307811 attatgttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 32307713  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatg 428  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32307712 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 1465106 - 1465423
Alignment:
Q  10 atgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctc 109  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1465106 atgattatgaaagattgtagattgagattgaacctggaataatttaagaacgaatttgtgtgagttgcacctgaacttgccatggcgagtagaggctctc 1465205  T
Q  110 acctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagt 209  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1465206 gcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagtaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagt 1465305  T
Q  210 t-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg 308  Q
    |  ||| |||| || ||| ||| ||||||||||| |||  | |  |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1465306 tatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggatt-gtttattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgttg 1465404  T
Q  309 atatttgagatgttgttga 327  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1465405 atatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 49667771 - 49668193
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||| |  || ||  |  |  |||||||||||||||||| |    
T  49667771 tgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaatattgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagca 49667870  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49667871 gaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta 49667969  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat--tgtatatacattata 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||| |||| |  ||||||      |||| ||||    |||||||||  ||||||||| ||| |    
T  49667970 gaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga-tgcatatga------gttgatgtt----gtatataatgctgtatatactttaaa 49668058  T
Q  297 tgaattatgttgatatttgagatg-ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaacta 395  Q
    || ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49668059 tggattatgttgataaatgagatgtttgttg-attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 49668157  T
Q  396 agctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  49668158 agctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210444
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtg 13210195  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||| |  ||||| ||||||    
T  13210196 agttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctga-tgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatata 13210294  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13210295 attgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 13210391  T
Q  379 tgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  13210392 tatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 1644371 - 1644787
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg-gaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||     
T  1644371 tgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgagaagacttta-gaatgaattt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagc 1644468  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1644469 agaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacaaactgccttgtttaagttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt 1644567  T
Q  199 agaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||    
T  1644568 agaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaat 1644658  T
Q  298 gaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1644659 ggattatgttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaag 1644756  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 428  Q
    |  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  1644757 caacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9513343 - 9512924
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa-tttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||   ||| |||| ||| ||| || ||  || |  ||||||| ||||||||||     
T  9513343 tgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagc 9513244  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggt 197  Q
    |||||||||| ||||| ||  | ||| ||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9513243 agaggctctcgcctcgaga--ttacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggt 9513146  T
Q  198 tagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 296  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| || || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  |||||        || ||||||||||| |    
T  9513145 tagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatg--------ttttatatacattaaa 9513055  T
Q  297 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9513054 tggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaa 9512959  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9512958 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9521318 - 9520899
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa-tttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||   ||| |||| ||| ||| || ||  || |  ||||||| ||||||||||     
T  9521318 tgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagc 9521219  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggt 197  Q
    |||||||||| ||||| ||  | ||| ||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9521218 agaggctctcgcctcgaga--ttacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggt 9521121  T
Q  198 tagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 296  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| || || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  |||||        |  ||||||||||| |    
T  9521120 tagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatg--------tgttatatacattaaa 9521030  T
Q  297 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9521029 tggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaa 9520934  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9520933 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 216 - 431
Target Start/End: Original strand, 12174164 - 12174376
Alignment:
Q  216 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatattt 314  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  12174164 cttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatattt 12174262  T
Q  315 gagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12174263 gagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12174359  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||    
T  12174360 agttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 405
Target Start/End: Original strand, 37250934 - 37251259
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||  ||||||| |||||||| | || | || ||||||||||||||||    
T  37250934 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaaagtgacctttgtcgcacgagttgatgt 37251032  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||    
T  37251033 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatata 37251131  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||    
T  37251132 aatgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgtt 37251230  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatga 405  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  37251231 gctgtttgtttattaactaagctgcatga 37251259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 326
Target Start/End: Original strand, 49389453 - 49389642
Alignment:
Q  138 ccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  49389453 ccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagta 49389552  T
Q  237 agcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttg 326  Q
    || ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  49389553 agactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 201
Target Start/End: Original strand, 12171872 - 12171992
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  12171872 tgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgatctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgt 12171971  T
Q  181 gagttaatcttagaggttaga 201  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12171972 gagttgatcttagaggttaga 12171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12933998 - 12934221
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||| || || ||  |  |  |||||||||||||||||| |    
T  12933998 tgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagca 12934097  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||  |  |||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12934098 gagactctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagacttccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta 12934196  T
Q  200 gaaactaagttg-ttatcttgctgt 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  12934197 gaaactaagttgtttatcttgctgt 12934221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Original strand, 22110118 - 22110454
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| ||  ||||||| ||||| |||| || | || |||||||| |||||||    
T  22110118 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagggacagaacaccttgtt-aggtttaatgtgacctttgtcgcacgaattgatgt 22110216  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||| |   ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||  |||||  |||||    
T  22110217 gagttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtatgatttgaagttgttaataatgtgatata 22110315  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
    | ||||||  ||||| ||||||| | | ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||    
T  22110316 aatgtatacgcattacatgaattctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgtt 22110414  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22110415 gctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 324664 - 324485
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  324664 taataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaactgagaatagtttaagaatgaatttttgggagttgcacctgaactcgccatagcgagtagagg 324565  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagtt 185  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||| ||  ||||| |||||||||||| || | || ||| || ||||||||||||||    
T  324564 ctctcgcctcgcgagttaccaagttacagaacaccttg-ttaggttaaatgtgacctttgtcgtacaagttgatgtgagtt 324485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 416
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 354  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  355 -tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
     || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27165373 - 27165251
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  27165373 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 27165274  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  27165273 ggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399213
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatg 12399213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 53301545 - 53301668
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgt-tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  53301545 atatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagt 53301644  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  53301645 cggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Original strand, 2050893 - 2051033
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  2050893 taataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc--gaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactctccatagcgagtagagg 2050990  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||| ||||| ||| |  | ||||||| |||| ||||||||||    
T  2050991 ctctcgcctcgtgagttgcccagttacaaaatg-cttgtttagg 2051033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340815
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    | | |||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 24340815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 309 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23274813 - 23274716
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  23274813 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgag 23274716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12340106 - 12340002
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |    
T  12340106 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacataatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgtt 12340009  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
    | |||||    
T  12340008 gagagtt 12340002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14669114 - 14669010
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactag--ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  14669114 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaattcgatctttgtcgcacgagttgtt 14669017  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  14669016 atgagtt 14669010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438538
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatg 18438538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572596
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| |  || | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatg 428  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14572615 ggtctaagttgatgttgatg 14572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14972980 - 14972858
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14972980 atatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  14972881 cggtctaagttgatgaagatgatg 14972858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17487982 - 17487860
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17487982 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17499464 - 17499342
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17499464 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166599
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43927484 - 43927304
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgag 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||| ||||||| ||| |||||| || | || |||||||||||||||||||    
T  43927484 actcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgtgagacagaataccttgtt-aggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgag 43927386  T
Q  184 ttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 265  Q
    || ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  43927385 ttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtt 43927304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386428
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T
Q  408 tggtctaagt 417  Q
     |||||||||    
T  42386437 cggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 371  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14665959 - 14665855
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  14665959 tgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgtt 14665862  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  14665861 atgagtt 14665855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14735472 - 14735368
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  14735472 tgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgtt 14735375  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  14735374 atgagtt 14735368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  409 ggtctaagttgat 421  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Original strand, 52523419 - 52523519
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  52523419 taataattattaggaaagattctagtttgatattgaacctggaacagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagagg 52523518  T
Q  105 c 105  Q
    |    
T  52523519 c 52523519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442278
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 431
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424876
Alignment:
Q  337 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 14576828 - 14576949
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||      
T  14576828 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtc 14576926  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  14576927 ggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153325
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||      
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 24153302  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  24153303 ggtctaagttgattaagatgatg 24153325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642357
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 37642357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 7781351 - 7781508
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  7781351 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 7781449  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  7781450 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17463336 - 17463179
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17463336 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17463238  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17463237 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17672784 - 17672627
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17672784 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17672686  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17672685 atgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698552
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172744
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 29172685  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29172686 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29172744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34159484 - 34159327
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34159484 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34159386  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  34159385 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 45606911 - 45607068
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  45606911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 45607009  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  45607010 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 55476649 - 55476492
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  55476649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 55476551  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  55476550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 55476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 430
Target Start/End: Original strand, 16282815 - 16282971
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16282815 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16282913  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgat 430  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  16282914 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083478
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 42386840 - 42386726
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaat-ttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagag 103  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||  || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  42386840 taataatgattaggcaagactttagactgtgattgaacctgaaatagtt-aagaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagag 42386742  T
Q  104 gctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||    
T  42386741 gctctcacctcgcgag 42386726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 38961895 - 38962042
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38961895 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 38961993  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38961994 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28194759 - 28194694
Alignment:
Q  366 ctgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  28194759 ctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28194694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Original strand, 28848618 - 28848772
Alignment:
Q  278 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 374  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  28848618 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 28848716  T
Q  375 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  28848717 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28848772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550625
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||  |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43550582 atgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606418
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 606418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8899252 - 8899095
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  8899252 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 8899154  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||    
T  8899153 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 8899095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 9707611 - 9707768
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  9707611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 9707709  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  9707710 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 16454285 - 16454442
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16454285 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16454383  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16454384 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 17446659 - 17446815
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17446659 atataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17446757  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  17446758 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagttgattaagatgatg 17446815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469295
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 6469275  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  6469276 ctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476502
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttt-tttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatg 25476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686891
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     |||||||||||| || |||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213837
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatg 40213837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840944
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  408 tggtctaagttgatga 423  Q
     ||| |||||||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12567718 - 12567571
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  12567718 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 12567620  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12567619 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13544183 - 13544036
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  13544183 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 13544085  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13544084 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 17247974 - 17248092
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |    
T  17247974 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagca 17248073  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  17248074 gaggctctcgcctcgcgag 17248092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 49389332 - 49389378
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49389332 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctgga 49389378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500943
Alignment:
Q  318 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  417 ttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| | |||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatg 55500943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 13151794 - 13151952
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13151794 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13151892  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13151893 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13151952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 13154259 - 13154417
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13154259 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13154357  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13154358 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 405
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147616
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 405  Q
    | ||||||||| | ||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatga 22147616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 53070657 - 53070799
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| |    
T  53070657 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-t 53070755  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53070756 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 373
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 354  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  355 -tgatttgcatactgtctat 373  Q
     || ||||||||||| ||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 10247727 - 10247884
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10247727 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10247825  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10247826 gtgctgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 12852131 - 12852235
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  12852131 tgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagc--acttgtattacagaatgccatgtttaggttaaatgcgatccttgtagtacgagttgtt 12852228  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  12852229 atgagtt 12852235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977516
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 53070391 - 53070504
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa-tttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagag 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| ||| ||| || |  |  |||||||||||||||||||||||    
T  53070391 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactcgccatggcgagtagag 53070488  T
Q  104 gctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||| |||||||||    
T  53070489 gctctcgcctcgcgag 53070504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 50242980 - 50242833
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  50242980 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 50242882  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50242881 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 14573021 - 14572974
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  14573021 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 14572974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14572941 - 14572903
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14572941 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 14572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737237
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  17737294 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 40213409 - 40213527
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||   ||  |||| ||| || ||||| |   |  ||||||||||| |||||| |    
T  40213409 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagca 40213508  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  40213509 gaggctctcgcctcgcgag 40213527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 41124045 - 41123892
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41124045 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41123947  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgat 430  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  41123946 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 185
Target Start/End: Original strand, 4588602 - 4588659
Alignment:
Q  128 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagtt 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  4588602 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgagctttgtcgcacgagttgttatgagtt 4588659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 20698135 - 20698183
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  20698135 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20698183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 2034752 - 2034791
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2034752 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 2034791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 2038259 - 2038298
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2038259 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 2038298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 2042000 - 2042039
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2042000 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 2042039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8499566 - 8499519
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  8499566 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8499519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10557033 - 10556986
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10557033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 11424451 - 11424498
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  11424451 tgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacctggaa 11424498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Original strand, 11424531 - 11424570
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11424531 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 11424570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14038528 - 14038489
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14038528 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 14038489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14041996 - 14041957
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14041996 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 14041957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 14179755 - 14179708
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  14179755 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaa 14179708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15412477 - 15412430
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15412477 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 17488290 - 17488243
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  17488290 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 17488243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 17499772 - 17499725
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  17499772 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 17499725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 18438967 - 18438920
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  18438967 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaaaatgagattgaacctggaa 18438920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18959245 - 18959206
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18959245 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 18959206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 118
Target Start/End: Original strand, 23083132 - 23083167
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23083132 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 23083167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 26687320 - 26687273
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  26687320 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 26687273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39231075 - 39231036
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39231075 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 39231036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Original strand, 45577952 - 45577999
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  45577952 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Original strand, 606135 - 606176
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  606135 tgaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgagcta 606176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11855068 - 11855032
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11855068 actcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagc 11855032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 431
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119886
Alignment:
Q  324 ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatg 422  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||     
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  423 atgatgatg 431  Q
    | |||||||    
T  12119878 aagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20723333 - 20723297
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20723333 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 20723297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 30030189 - 30030153
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30030189 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 30030153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 54973736 - 54973700
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54973736 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 54973700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 54976346 - 54976310
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54976346 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 54976310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 54978956 - 54978920
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54978956 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 54978920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25176275 - 25175854
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  25176275 tgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacagatttttgagagttagacctgaactcgccatggcgagta 25176176  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| |||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||          ||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25176175 gaggccctcgcctcgcgaactgcgcagttacagaatgccttgtttag----------atctttgtcgcacgaattgatgtaagttgatcttagaggttag 25176086  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25176085 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatga 25175986  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25175985 attatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 25175886  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  25175885 gcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28406412 - 28405981
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||| ||||  || || || ||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  28406412 tgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaataaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagta 28406313  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||||||||| |||||| || ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406312 gaggctctcgcctcgcaag-tacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta 28406214  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28406213 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatg 28406114  T
Q  299 aattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28406113 aattaagttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 28406014  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgat 430  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28406013 ttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 22133905 - 22134323
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacct-ggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||| || ||  |  || ||||||||||||||||||     
T  22133905 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagacttta-gaatgaattt-tgtgaactg-aactgaactcgccatggcgagc 22134001  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134002 agaggctctcgcctcgcgaa-tacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt 22134100  T
Q  199 agaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||| |||| |  ||||||  |  |||||||  |||||        |||||||||||||| ||    
T  22134101 agaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactga-tgcatatgaattggtgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaat 22134191  T
Q  298 gaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22134192 ggattatgttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaag 22134289  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  22134290 ctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 405
Target Start/End: Original strand, 7499 - 7824
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |  ||  ||| ||| | ||| ||||||| |||| || | || ||||||||||||||||    
T  7499 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaatac-ttggttaggtttaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 7597  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  7598 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgtgatata 7696  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7697 attgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttg 7796  T
Q  378 ctgttggttatttaactaagctgcatga 405  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7797 ctgtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 420
Target Start/End: Original strand, 18786752 - 18787009
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||     
T  18786752 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaatta-tatgattgaatgtta 18786850  T
Q  264 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 360  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||  || |||    
T  18786851 ttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggttt 18786949  T
Q  361 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18786950 gcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23207632 - 23207296
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |  | ||||||| ||  ||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  23207632 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 23207534  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||    
T  23207533 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatata 23207435  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||| |  |   ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||    
T  23207434 aatgtatatgcattacatgaattatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 23207335  T
Q  378 ctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23207334 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23791629 - 23791292
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||  ||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  23791629 tgaactcgccatcgcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgtgagacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 23791531  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||    
T  23791530 gagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatata 23791432  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||   ||||| |||||||    
T  23791431 aatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgtt 23791332  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    | |||| | |  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23791331 gttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7679746 - 7679589
Alignment:
Q  274 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 372  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7679746 tatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 7679648  T
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072066
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  367 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatg 23072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25109181 - 25108906
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||| ||| | | | | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25109181 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 25109082  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||   || |||||    
T  25109081 aatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatat 25108983  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||  |  |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25108982 tgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19671991 - 19671859
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 373  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19671991 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctat 19671892  T
Q  374 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19671891 gttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 19671859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22105571 - 22105413
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  22105571 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 22105472  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22105471 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 23708314 - 23708452
Alignment:
Q  8 taatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctc 107  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708314 taatgattaggaaagttcgtagattgagattgaatc-ggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctc 23708412  T
Q  108 tcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    || ||| ||||| || | ||||||| |||| ||||||||||    
T  23708413 tcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttagg 23708452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298932
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 420
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708725
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg--atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||   || |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgtt 23708660  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23708661 gttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060517
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 350
Target Start/End: Original strand, 22459328 - 22459598
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||| || | || ||  ||||||||||||    
T  22459328 tgaactcgccatagcgagtagaggctcttgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcctacgagttgatgt 22459426  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  ||| ||  | ||||| ||  |||||  |||||    
T  22459427 gagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactg-atgtatacgagttgatgttatttataatgtgatata 22459525  T
Q  280 attgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 350  Q
    |||||||||||||||  ||| |  |||||  ||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  22459526 attgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18809101 - 18808944
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18809101 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18809003  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18809002 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23131020 - 23130863
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23131020 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23130922  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23130921 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23133487 - 23133330
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23133487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23133389  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23133388 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23133330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 23709536 - 23709693
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23709536 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23709634  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23709635 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 23712017 - 23712174
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23712017 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23712115  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23712116 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 32039502 - 32039659
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32039502 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32039600  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32039601 gtgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatg 32039659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 34402526 - 34402683
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34402526 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34402624  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  34402625 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34402683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39682471 - 39682314
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39682471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39682373  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39682372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22337241 - 22337119
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22337241 atatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076446
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||| ||||| |||||||    
T  23076469 cggtctaagtggatgaagatgatg 23076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285869
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654503
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatg 23654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 431
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38231
Alignment:
Q  337 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 38231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23660148 - 23660027
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||      
T  23660148 atatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtc 23660050  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23660049 ggtctaagttgatgaagatgatg 23660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24367932 - 24367785
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24367932 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24367834  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24367833 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 20520152 - 20520295
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 371  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |    
T  20520152 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcat 20520250  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20520251 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23135745 - 23135591
Alignment:
Q  278 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 374  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  23135745 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 23135647  T
Q  375 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23135646 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 354
Target Start/End: Original strand, 24697536 - 24697645
Alignment:
Q  246 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 344  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24697536 taatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgt 24697635  T
Q  345 tatatcatga 354  Q
    ||||||||||    
T  24697636 tatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 571555 - 571398
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  571555 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 571457  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  571456 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6726153 - 6725996
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6726153 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6726055  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6726054 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26505537 - 26505380
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| ||    
T  26505537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ct 26505439  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26505438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26508015 - 26507858
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| ||    
T  26508015 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ct 26507917  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26507916 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28577257 - 28577100
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  28577257 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-t 28577159  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  28577158 gcgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28577100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731351
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||| ||||||| |||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 21155064 - 21155211
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21155064 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21155162  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21155163 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Original strand, 23071731 - 23071843
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||| |||| |||| || |||  ||||||||||||    
T  23071731 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacaaaatgcctt-tttaggttgaatgagatctttttcgttcgagttgatgtg 23071829  T
Q  182 agttaatcttagag 195  Q
    |||| |||||||||    
T  23071830 agttgatcttagag 23071843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 24898199 - 24898357
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24898199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24898297  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24898298 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24898357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 24900682 - 24900840
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24900682 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24900780  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24900781 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 24903159 - 24903317
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24903159 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24903257  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24903258 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24903317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 24905636 - 24905794
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24905636 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24905734  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24905735 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 24908111 - 24908269
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24908111 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24908209  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24908210 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24908269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309112
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  20309127 gatgttgaagatgatg 20309112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 431
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23040247 tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103512
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 412  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||  | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  413 taagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| || ||| |||||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatg 23103512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 32214925 - 32215072
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  32214925 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 32215023  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32215024 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946661
Alignment:
Q  358 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctattg-ttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 416
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcg--atattgttatatcatga 354  Q
    ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  355 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
      || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 45029858 - 45030015
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  45029858 atataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-t 45029956  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  45029957 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 298503 - 298621
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaat-ttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| || || |||| |||  |||||||| |   |  ||||||||||| |||||||    
T  298503 tgtctaataatgattaggaaagaatataggatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagt 298601  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  298602 agaggctctcgcctcgcgag 298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 23660455 - 23660408
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  23660455 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 23660408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756229
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 31756229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 43137457 - 43137301
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |  ||    
T  43137457 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatta-ct 43137359  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgat 430  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  43137358 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004777
Alignment:
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    |||||||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   ||||  ||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttg 23004806  T
Q  378 ctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23004805 ctgtttgtttattaactaagctgcatgag 23004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 20309527 - 20309479
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  20309527 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20309479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 23654098 - 23654146
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  23654098 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 23654146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 421
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 20519959 - 20520026
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  20519959 tgaagtcgccatagcgtgtagaggctctcgcctcgcgagttgcctagttacagaataccttgtttagg 20520026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 22337548 - 22337501
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  22337548 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22337501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 22730921 - 22730968
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  22730921 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22730968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Original strand, 22738249 - 22738296
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22738249 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 27754008 - 27753961
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  27754008 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 27753961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38967422 - 38967375
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  38967422 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 41684531 - 41684570
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41684531 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 41684570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44621278 - 44621239
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44621278 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 44621239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23076794 - 23076756
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23076794 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 23076756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Original strand, 18786669 - 18786709
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 121  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18786669 tgaacttgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagct 18786709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 21238877 - 21238913
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21238877 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21238913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 21241427 - 21241463
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21241427 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21241463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 23286283 - 23286235
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  23286283 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacatggaat 23286235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24505052 - 24505016
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24505052 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 24505016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31503949 - 31503913
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31503949 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 31503913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31506515 - 31506479
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31506515 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 31506479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 39705976 - 39706405
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39705976 tgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaattt-tgagagttacacctgaactcgccatggcgagta 39706074  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| |||||||| ||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  39706075 gaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattag 39706174  T
Q  201 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
     || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39706175 gaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga 39706273  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    ||||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39706274 attatgttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct 39706373  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39706374 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39706405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8846808 - 8846360
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||| | | ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  8846808 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaattttttgtgagttgcaccttaactcgccatggcgagt 8846709  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  8846708 agaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttagagatta 8846609  T
Q  200 gaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8846608 gaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 8846510  T
Q  299 aattatg-ttgatatttgagatgttgttgaatt----------------gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgt 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||                ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8846509 aattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgt 8846410  T
Q  382 tggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||    
T  8846409 ttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15099774 - 15099457
Alignment:
Q  10 atgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctc 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099774 atgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctc 15099675  T
Q  110 acctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagt 209  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15099674 gcctcgcgagctaaccagttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagt 15099575  T
Q  210 t-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg 308  Q
    |  ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099574 tatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-gtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttg 15099476  T
Q  309 atatttgagatgttgttga 327  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15099475 atatttgagatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12774431 - 12774011
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga-atagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||| ||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||     
T  12774431 tgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacctggagagacgtta-gaatgaattt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagc 12774334  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12774333 agaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt 12774235  T
Q  199 agaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||    
T  12774234 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaat 12774144  T
Q  298 gaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12774143 ggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 12774045  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12774044 ctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15190750 - 15190424
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  15190750 tgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaatagtttaagaatggatttttgggcgttacatctgtactcgccatggcgagta 15190651  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  15190650 gaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttag 15190551  T
Q  201 aaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15190550 aaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-gtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga 15190452  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190451 attatgttgatatttgagatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Original strand, 12287976 - 12288316
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||  ||||||  | ||||| ||||| |||| ||   || |||||  |||||||||    
T  12287976 tgaactcgccatagcgagtagaagctctcgcctcgcgagctcaagagagacataacactttgtt-aggtttaatgtgacttttgtcgcataagttgatgt 12288074  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  12288075 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttggtaatgttatata 12288173  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||    
T  12288174 gttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgtt 12288272  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12288273 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15552166 - 15551821
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||      |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  15552166 gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgagcattggtgttacaaaatgtctt-tttaggtaaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtg 15552068  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |  ||||||| |||| |   |||||   ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  15552067 agttgatcttagaggttagaaactaagttgttaccctgctgttaatgtcccagtaagactga-tgcttatgaatcaatgttgcttataatgttatataat 15551969  T
Q  282 tgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 380  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  15551968 tgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctg 15551872  T
Q  381 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  15551871 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 15551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 165 - 416
Target Start/End: Original strand, 13700 - 13953
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | || ||||||| ||||  |  |||||| | ||||||    
T  13700 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtt-tatgatttgatgttg 13798  T
Q  264 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 361  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  13799 tttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttg 13898  T
Q  362 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13899 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 420
Target Start/End: Original strand, 43198384 - 43198661
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |   |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||| ||     
T  43198384 ttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagact- 43198479  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgata 340  Q
    |||  ||||||  | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  43198480 aatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgata 43198579  T
Q  341 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    | ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43198580 tggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16596998 - 16596686
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||      |||||| |||||||| |||||||| |||| |||| || |||  ||||||||||||    
T  16596998 gaactcgccatggcgagtagaggttctcgccccgcgggcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgtgatctttgtcgttcgagttgatgtg 16596900  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||  |||||| |||| |   ||| |  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  16596899 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactga-tgcttataaattaatgttgcttataatgttatataa 16596801  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16596800 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgct 16596704  T
Q  380 gttggttatttaactaag 397  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16596703 gtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Original strand, 53081979 - 53082254
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta-gaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcct 241  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53081979 ttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcct 53082078  T
Q  242 gaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgata 340  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  53082079 gaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgata 53082176  T
Q  341 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||||||||||  || |||   |||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53082177 ttgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 416
Target Start/End: Original strand, 46640285 - 46640558
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  46640285 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctg 46640383  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  | |||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||||| |||| || |||| |||||    
T  46640384 aatta-tatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagatgttattgattttcatttgatat 46640481  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46640482 tgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 312 - 420
Target Start/End: Original strand, 52243192 - 52243302
Alignment:
Q  312 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctg 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  52243192 tttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52243291  T
Q  410 gtctaagttga 420  Q
    |||||||||||    
T  52243292 gtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Original strand, 15464621 - 15464764
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  15464621 taataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgaaatagtttaagaatggatttttgggtgttacacctgaactcaccatagcgagtagagg 15464720  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||| ||||||||| |  | ||||||| |||| ||||||||||    
T  15464721 ctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttagg 15464764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Original strand, 52242885 - 52243027
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  52242885 taataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagagg 52242984  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||| ||||||||| |  | ||||||| |||| ||||||||||    
T  52242985 ctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttagg 52243027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 13844972 - 13844852
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  13844972 tgtctaattatgattagaaaagattctagatcaagatttaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgtacttgccatggcgagta 13844873  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagct 121  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  13844872 gaggctctcgcctcgcgagct 13844852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 313 - 423
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377630
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T
Q  413 taagttgatga 423  Q
    |||||||||||    
T  16377620 taagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Original strand, 43198280 - 43198381
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  43198280 taataatgattaggaaagattttagattgagattgaacatggaatagtttaagaattgatttttgggagttacacctgaactcaccatagcgagtagagg 43198379  T
Q  105 ct 106  Q
    ||    
T  43198380 ct 43198381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24029095 - 24028991
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  24029095 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgtt 24028998  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  24028997 atgagtt 24028991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240086
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctattg-ttatttaattaagttgcatgagtt 16240063  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16240064 ggtctaagttgatgaagatgatg 16240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088881
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44615446 - 44615289
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  44615446 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 44615348  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44615347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3332239 - 3332144
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttg 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  3332239 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcatgagttg 3332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798778
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7798801 cggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22636561 - 22636439
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22636561 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22636462 cggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6900016 - 6899895
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||      
T  6900016 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagatgcatgagtc 6899918  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6899917 ggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574984
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| || | |||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatg 8574984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270352
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||      
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 16270329  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  16270330 ggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 431
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873484
Alignment:
Q  310 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12468
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12311 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12409  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  12410 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 15118356 - 15118513
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15118356 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15118454  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15118455 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 18215278 - 18215435
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  18215278 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 18215376  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18215377 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 20157057 - 20157161
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  20157057 tgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagagtgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgtt 20157154  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  20157155 atgagtt 20157161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 22633980 - 22634084
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |    
T  22633980 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgatttgttat 22634079  T
Q  181 gagtt 185  Q
    |||||    
T  22634080 gagtt 22634084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 428
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374473
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatg 428  Q
     | ||||||||| ||| ||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 44773091 - 44773248
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44773091 atataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 44773189  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44773190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 52312668 - 52312511
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  52312668 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 52312570  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  52312569 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902761
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatg 12902761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280317
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatg 14280317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798871
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatg 54798871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 185
Target Start/End: Original strand, 13812578 - 13812680
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactag--ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |    
T  13812578 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttat 13812675  T
Q  181 gagtt 185  Q
    |||||    
T  13812676 gagtt 13812680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 19618176 - 19618323
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| ||    
T  19618176 atataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ct 19618274  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19618275 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 44928883 - 44929041
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  44928883 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgctt 44928982  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44928983 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 50222343 - 50222500
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  50222343 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-t 50222441  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  50222442 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 51463872 - 51464029
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  51463872 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 51463970  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  51463971 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 51464029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893707
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||      
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatg 7893707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052833
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||     
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttg-ttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     || |||||||||||| |||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatg 44052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgat 430  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096297
Alignment:
Q  358 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 3096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Original strand, 18239426 - 18239580
Alignment:
Q  278 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 374  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  18239426 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 18239524  T
Q  375 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18239525 ctgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 1837513 - 1837670
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1837513 atataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1837611  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  1837612 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19242857 - 19242700
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19242857 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19242759  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19242758 gtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970858
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  412 ctaagttgat 421  Q
    ||||||||||    
T  14970849 ctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17046552 - 17046491
Alignment:
Q  370 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  17046552 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 17046491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Original strand, 44928613 - 44928757
Alignment:
Q  3 tctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |   ||||||||||||||||| |||    
T  44928613 tctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcaga 44928712  T
Q  103 ggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||| |||| ||||||||||    
T  44928713 ggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttagg 44928757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3515165 - 3515008
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | |||||| ||    
T  3515165 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg-ct 3515067  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  3515066 gtgttgctgttgttt-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 431
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803426
Alignment:
Q  320 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagtt 418  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  419 gatgatgatgatg 431  Q
    ||| | |||||||    
T  23803414 gattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 15355328 - 15355476
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  15355328 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 15355426  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15355427 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 16597078 - 16597031
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16597078 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 16597031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641343
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  7641286 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610951
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  12611008 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 21815070 - 21815108
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21815070 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 21815399 - 21815437
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21815399 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 21818492 - 21818530
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21818492 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053418
Alignment:
Q  318 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagt 417  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  418 tgatgatgatgatg 431  Q
    || ||| |||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatg 14053418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 353
Target Start/End: Original strand, 15464929 - 15464970
Alignment:
Q  312 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15464929 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 3097065 - 3097017
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  3097065 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 3097017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 7089299 - 7089251
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  7089299 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 7089251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 12903179 - 12903131
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  12903179 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 12903131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44102372 - 44102215
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  44102372 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 44102274  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  44102273 gtgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 287441 - 287402
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  287441 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 287402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 15091330 - 15091283
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  15091330 tgtctaatattgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 15091283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 15868327 - 15868378
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaa 56  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15868327 taataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 15868378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16359854 - 16359815
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16359854 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16359815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 22636867 - 22636820
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  22636867 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22636820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 31116822 - 31116861
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31116822 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 31116861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 55502517 - 55502556
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55502517 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 55502556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7089229 - 7089191
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7089229 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 7089191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 17047841 - 17047879
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17047841 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17047879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333306
Alignment:
Q  364 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgag 17333306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44102563 - 44102525
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44102563 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44102525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4171374 - 4171338
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4171374 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 4171338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 14053001 - 14053049
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  14053001 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacttggaat 14053049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14699066 - 14699030
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14699066 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 14699030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 16239680 - 16239728
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaag-attggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  16239680 tgtctaataatgattaggaaagaaatgtagaatgagattgaacctggaa 16239728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 16377210 - 16377258
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||    
T  16377210 tgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctggaat 16377258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10957 - 10542
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  10957 taataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgtgagttacacctgaactcgccatagcgagtagagg 10858  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10857 ctctcgcctcgcgagttacctagttccaaaatgccttg-ttaggttaaatgcgatctctgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaac 10759  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10758 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatgaatta 10660  T
Q  304 tgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  10659 tgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgca 10560  T
Q  403 tgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  10559 tgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 130340 - 129909
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  | |||||||||||||||| |    
T  130340 tgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctaaactcgccatggcgagca 130241  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  130240 gaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 130141  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  130140 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatga 130042  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||     
T  130041 attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaaga 129942  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  129941 tgcatgagtcggtctaagttgatgatgaagatg 129909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 60713 - 60808
Alignment:
Q  312 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  60713 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 60808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 60481 - 60548
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||| | |||||||||    
T  60481 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatacattgtttagg 60548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 87)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 21329183 - 21329614
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  21329183 tgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaggaatgaatttttgggagttgcacttgaactcgccatagcgagta 21329282  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21329283 gaggctctcgcctcgcgaattacctagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaag 21329382  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21329383 aaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga 21329481  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21329482 attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 21329581  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21329582 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21565977 - 21565546
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||||||  | || ||  |  |||||||||||||||||| |    
T  21565977 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaattttcgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagca 21565878  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21565877 gaggctctcgcctcgtgagctaactagttacagaatgacttgtttatgtaaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 21565778  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21565777 aaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 21565679  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21565678 attatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagc 21565579  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21565578 tgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 420
Target Start/End: Original strand, 26011726 - 26012141
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26011726 taataatgattaagaaagattctaaattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 26011825  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    |  || ||||||||| |  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26011826 ccttcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgctttg-ttaggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaac 26011924  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26011925 taagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaact-atataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatgaatta 26012023  T
Q  304 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  26012024 tgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 26012123  T
Q  403 tgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  26012124 tgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 22959221 - 22959649
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga-atagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| || ||  |  |  |||||||||||||||||||    
T  22959221 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagt 22959319  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22959320 agaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgttgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggtta 22959419  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
     |||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||| |||| |  ||||||   ||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22959420 aaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactga-tgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatg 22959518  T
Q  299 aattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    | ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22959519 acttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 22959615  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22959616 ctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 81 - 431
Target Start/End: Original strand, 21501922 - 21502273
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||| || |||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21501922 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagtt-cagaatgccttgttg-ggttaaatgcgatatttgtcgcacgagttgatgt 21502019  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaa-ctaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 278  Q
     |||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21502020 tagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatat 21502119  T
Q  279 aattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  21502120 aattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttg 21502219  T
Q  378 ctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  21502220 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19669333 - 19668902
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    || |||| |||||| | | || ||  |  |||||||||||||||| ||    
T  19669333 tgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacgtggaaagactttagaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgtgt 19669234  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19669233 agaggctctcgcctcaccagctaactagttacagaatgccttgtttaggataaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggtta 19669134  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatc--taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 296  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19669133 gaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 19669035  T
Q  297 tgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaacta 395  Q
     || ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  19669034 ggacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactg 19668938  T
Q  396 agctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  19668937 agctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 21741240 - 21741545
Alignment:
Q  10 atgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctc 109  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741240 atgaataggaaagattatagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctc 21741339  T
Q  110 acctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagt 209  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21741340 gcctcgtgagctaaccagttacataatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagt 21741439  T
Q  210 t-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg 308  Q
    |  ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741440 taattaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-gtatattctaatgt------------tatataattgtatatacattatatgaattatgttg 21741526  T
Q  309 atatttgagatgttgttga 327  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21741527 atatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Original strand, 20026707 - 20027043
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| || ||||||| || | || |||||||||| |||||    
T  20026707 tgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-agcttaaatgtgaccgttgtcgcacgagtcgatgt 20026805  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20026806 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaatta-tatgttttaatgttgttgataatgctatata 20026904  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||| |||||||    
T  20026905 gttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgtt 20027003  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20027004 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19660952
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| || |||  ||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-tttaggttgaatgcaatctttgtcgttcgagttgatgtg 19660704  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  19660705 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 19660803  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| ||  |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19660804 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgct 19660900  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  19660901 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 19660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 5888872 - 5889033
Alignment:
Q  10 atgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctc 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5888872 atgattaggaaagattgtagattgagattgaacatggaatagtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctc 5888971  T
Q  110 acctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacg 171  Q
     |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5888972 gcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacg 5889033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 416
Target Start/End: Original strand, 22178072 - 22178323
Alignment:
Q  168 cacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 266  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||     
T  22178072 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaatta-tatgattggatgttgtta 22178170  T
Q  267 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 363  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |    
T  22178171 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttata 22178270  T
Q  364 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22178271 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22144475 - 22144301
Alignment:
Q  9 aatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctct 108  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22144475 aatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctct 22144376  T
Q  109 cacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagtt 185  Q
    | ||||||||| |  | ||||||| |||| |||||||||| |   ||||||| || |||||||||||| || |||||    
T  22144375 cgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagtt 22144301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729181
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808506
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatg 21808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22144211 - 22144068
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 372  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  22144211 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactaccta 22144112  T
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22144111 tgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390613
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 334 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314581
Alignment:
Q  334 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 22119960 - 22120064
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  22119960 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgtt 22120057  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  22120058 atgagtt 22120064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493573
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||      
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtc 24493596  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24493595 ggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 431
Target Start/End: Original strand, 8286838 - 8286960
Alignment:
Q  310 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8286838 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 8286936  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  8286937 cggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025315
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||      
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13025338  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13025337 ggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095499
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||      
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13095522  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13095521 ggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412188
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||      
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatg 22412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 264772 - 264929
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  264772 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 264870  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  264871 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1096593 - 1096474
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1096593 atatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatg 428  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  1096494 cggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733101
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10733043 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 11581203 - 11581360
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11581203 atataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 11581301  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  11581302 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529224
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 24767104 - 24767208
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |    
T  24767104 tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgtt 24767201  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  24767202 atgagtt 24767208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29330092 - 29329935
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29330092 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 29329994  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29329993 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39363542 - 39363385
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39363542 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39363444  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39363443 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39363385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077956
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatg 9077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 431
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997651
Alignment:
Q  329 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgat 427  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 21997647  T
Q  428 gatg 431  Q
    ||||    
T  21997648 gatg 21997651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075035
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  408 tggtctaagttg 419  Q
     |||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421536
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448054
Alignment:
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  378 ctgttg 383  Q
    ||||||    
T  29448059 ctgttg 29448054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725882
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 40725882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20909170 - 20909013
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20909170 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20909072  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20909071 gtgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 42245369 - 42245526
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  42245369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 42245467  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  42245468 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 420
Target Start/End: Original strand, 20902012 - 20902159
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  20902012 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 20902110  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20902111 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 2154617 - 2154775
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  2154617 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 2154715  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  2154716 tgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 21498709 - 21498782
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttaca 78  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||    
T  21498709 taataattattaggagagattgtagattgagattgaacctggaatagttgaagaataaatttttgagagttaca 21498782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 21871342 - 21871442
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgag 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||    
T  21871342 actcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttg-ctaggttaaacgcgatccttgtcgcatgagttgttatgag 21871440  T
Q  184 tt 185  Q
    ||    
T  21871441 tt 21871442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 21875622 - 21875722
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgag 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||    
T  21875622 actcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttg-ctaggttaaacgcgatccttgtcgcatgagttgttatgag 21875720  T
Q  184 tt 185  Q
    ||    
T  21875721 tt 21875722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29346138 - 29345981
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29346138 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29346040  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  29346039 gtgatgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431414
Alignment:
Q  311 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctg 409  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagatgcatgagtcg 25431420  T
Q  410 gtctaa 415  Q
    ||||||    
T  25431419 gtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39245291 - 39245137
Alignment:
Q  278 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 374  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||| || ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  39245291 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 39245193  T
Q  375 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  39245192 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 36154516 - 36154662
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatag-tttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||  | || || |   |  |||||||||||||||||||    
T  36154516 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctgga-tagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagt 36154614  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    |||||||||| |||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  36154615 agaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttagg 36154662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 21985835 - 21985882
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21985835 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 21985882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744035
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 25744035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 36154787 - 36154941
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  36154787 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 36154885  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  36154886 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918109
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20918052 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25431747 - 25431709
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25431747 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgag 25431709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766175
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt 20766175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32027551 - 32027394
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32027551 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32027453  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  32027452 gtgttgttgttg-ttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32027394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4398058 - 4398019
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4398058 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 4398019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 9078385 - 9078338
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  9078385 tgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacctggaa 9078338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775837
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 16255704 - 16255743
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255704 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16255743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 16259337 - 16259376
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16259337 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16259376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 18319037 - 18319185
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 18319135  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18319136 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293086
Alignment:
Q  364 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 21293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 22589501 - 22589540
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22589501 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22589540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 22593056 - 22593095
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22593056 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22593095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 22596611 - 22596650
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22596611 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22596650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22880558 - 22880519
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22880558 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22880519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23064559 - 23064512
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  23064559 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 23390184 - 23390231
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  23390184 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 23390231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23693808 - 23693769
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23693808 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 23693769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 24494001 - 24493954
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  24494001 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 24493954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 24529654 - 24529607
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  24529654 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 24529607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 26360854 - 26360893
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26360854 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 26360893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 416
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  365 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723932
Alignment:
Q  363 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgag 37723932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38619482 - 38619435
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  38619482 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43121513 - 43121474
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43121513 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 43121474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43125046 - 43125007
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43125046 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 43125007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1096820 - 1096782
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1096820 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1096782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Original strand, 11580937 - 11580979
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga 47  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11580937 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgga 11580979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 11581013 - 11581051
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11581013 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 11581051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25421885 - 25421847
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25421885 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25421847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 8286541 - 8286589
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  8286541 tgtctaataatgattaagaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 8286589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 21292669 - 21292717
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  21292669 tgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 21292717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Original strand, 23501118 - 23501154
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23501118 actcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagc 23501154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26496235 - 26496199
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26496235 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 26496199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 29324991 - 29325027
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29324991 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 29325027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31061124 - 31061069
Alignment:
Q  375 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  31061124 ttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 32965 - 32551
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32965 taataatgattaggaaagattctagattgagattgaacttggaatagtctaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 32866  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32865 ccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttg-ttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaac 32767  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32766 taagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaatta 32668  T
Q  304 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  32667 tgtttgatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 32569  T
Q  403 tgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  32568 tgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13373 - 12943
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  13373 tgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagta 13274  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  13273 gaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttg-ttaggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatggagattag 13175  T
Q  201 aaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  13174 aaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-ggataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacga 13076  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  13075 attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagc 12976  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     |||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  12975 agcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18277
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta--cataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||   ||||| |  || ||| ||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||    
T  18004 tgaactcgccatagcgagtggaggctctcgcctcgcgagcc--ctagtgagacagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgat 18100  T
Q  179 gtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 277  Q
    ||||| | ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  |||    
T  18101 gtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgttttgatgttgttattaatgtgata 18199  T
Q  278 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18200 taaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 93)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19652628 - 19652199
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    || |||| |||||| || || ||  |  ||||||||||||||||||||    
T  19652628 tgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagta 19652529  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19652528 gaggctctcgcctcgcgggctaactagttacaaaataccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 19652429  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  19652428 aaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatgg 19652330  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  19652329 attatgttgatgtttgagatgttgttg-attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagct 19652231  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19652230 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23019834 - 23019425
Alignment:
Q  7 ataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggct 106  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  23019834 ataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaatattttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcc 23019735  T
Q  107 ctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaacta 206  Q
    ||  ||||||||| |  | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23019734 cttgcctcgcgagttgtccaattacaaaatg-cttggttaggttaaatgcgatctttgtcgaacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaacta 23019636  T
Q  207 agttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg 305  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019635 agttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaact-atataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatg 23019537  T
Q  306 -ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatg 404  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||     
T  23019536 tttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcata 23019437  T
Q  405 agctggtctaag 416  Q
    ||  ||||||||    
T  23019436 agtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 22080425 - 22080800
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  22080425 tgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttatgggagttatacctgaactcgccatggcgagta 22080524  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||      | ||| ||  |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22080525 gaggctctcgcctcgcgagcttgtgtctgacagaacaccttgtttaggaataatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 22080624  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  22080625 aaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatatta 22080724  T
Q  300 attatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22080725 attatgacgatgtttgagatgttgtt-ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 19668726 - 19668386
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||| ||  ||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  19668726 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgtccaattacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 19668628  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19668627 gagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgta-tatgatgtagtgttgttgataatgttatata 19668529  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  19668528 gttgtatatacattacatgaattacgtatgatgtt-gtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgtt 19668430  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19668429 gctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 29808571 - 29808999
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat-agtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||  | ||| |||| |||  | ||||| |   |  ||||||||||||||||||     
T  29808571 tgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagc 29808670  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  29808671 agaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagttt 29808768  T
Q  199 agaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |  ||||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29808769 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 29808867  T
Q  298 gaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    || ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  29808868 gacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaa 29808964  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  29808965 gctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 29808999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1561609 - 1561307
Alignment:
Q  128 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  1561609 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaa 1561510  T
Q  227 tatttcagtaagcctgaattaatatg-atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgt 324  Q
    |||| ||||||| ||| ||  ||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||   |||||    
T  1561509 tattccagtaagactg-atgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgt 1561414  T
Q  325 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgat 424  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||     
T  1561413 tgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaa 1561314  T
Q  425 gatgatg 431  Q
    |||||||    
T  1561313 gatgatg 1561307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 431
Target Start/End: Original strand, 28496241 - 28496588
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatg 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  28496241 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatg 28496338  T
Q  180 tgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 278  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |  ||||||  |||||||| |  ||||| |||||    
T  28496339 tgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgcttataatgttatat 28496437  T
Q  279 aattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28496438 aattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 28496534  T
Q  378 ctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  28496535 ctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 28496588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 27332976 - 27333238
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||   ||| |||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27332976 taatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattttagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagagg 27333075  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    ||||| |||||||| ||  | | ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27333076 ctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaac 27333174  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgtt 268  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  27333175 taaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaatt-gtataatccaatgttgttgtt 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 27393716 - 27393978
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||   ||| |||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27393716 taatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattttagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagagg 27393815  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    ||||| |||||||| ||  | | ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27393816 ctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaac 27393914  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgtt 268  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  27393915 taaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaatt-gtataatccaatgttgttgtt 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 431
Target Start/End: Original strand, 4185512 - 4185938
Alignment:
Q  2 gtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat-agtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  4185512 gtctaataacgattatgaaagaatgtagagtgagattgaacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagta 4185610  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  4185611 gaggctctcgcctcgcgagctacccatttatagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgccgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaa 4185709  T
Q  201 aaactaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
     ||||||||||  || | || ||||| | || |||| || || ||||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  ||||    
T  4185710 gaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccagtgagtct-aattgtt-taatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatga 4185807  T
Q  300 attatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
     |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  4185808 tttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgc 4185905  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  4185906 tgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatg 4185938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Original strand, 9098292 - 9098620
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |  ||  ||| ||  ||||||| ||||| | ||  | | || ||||||||||||||||    
T  9098292 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggtttattgtcacctttgtcgcacgagttgatgt 9098390  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||            |||||    
T  9098391 gagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgtt------------atata 9098477  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||    
T  9098478 attatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgtt 9098576  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9098577 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 380
Target Start/End: Original strand, 4667902 - 4668277
Alignment:
Q  2 gtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat-agtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  4667902 gtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagta 4668000  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  4668001 gaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaa 4668099  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
     ||||||||||  || | |||||||| | || |||| || || ||||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  ||||    
T  4668100 gaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aatt-gtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatga 4668197  T
Q  300 attatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 380  Q
     |||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4668198 tttatgttgatgatat--gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 380
Target Start/End: Original strand, 4674749 - 4675124
Alignment:
Q  2 gtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat-agtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| || ||  |  |  | |||||| |||||||||||    
T  4674749 gtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaaccttaactcgtcatggcgagta 4674847  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  4674848 gaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaa 4674946  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
     ||||||||||  || | |||||||| | || |||| || || ||||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  ||||    
T  4674947 gaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aatt-gtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatga 4675044  T
Q  300 attatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 380  Q
     |||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4675045 tttatgttgatgatat--gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 20109494 - 20109153
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |  ||  ||| ||  ||||| ||| ||| | || || | || ||||||||||||||||    
T  20109494 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaa-cccttg-ttaagtttattgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 20109397  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||  |||||| ||| ||  |||| |  | ||||||||  |||||  |||||    
T  20109396 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactg-atgtatatcaattgatgttgtttataatgtgatata 20109298  T
Q  280 --attgtatatacattatatgaattatgt-tg-atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 375  Q
      |||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  20109297 atattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgt 20109198  T
Q  376 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20109197 tgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 431
Target Start/End: Original strand, 31155169 - 31155514
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgag 183  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |   |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  31155169 actctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctacccctttacaacatgccttgtt-aggttaaatgcggtccttgtcgcacgagttgttgtgag 31155267  T
Q  184 ttaatcttagaggttagaaactaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataatt 282  Q
     | || ||||| ||||  ||||||||||  || |||||||||| | || |||| || || ||||  | | |||  ||| ||||||| ||| ||||||| |    
T  31155268 atgattttagatgttaagaactaagttgcctagcttgctgttgatgttccagtgagtctaaattttt-taatccgatgatgttgttgatgttatataaat 31155366  T
Q  283 gtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg- 380  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||     
T  31155367 gtataaacattgcatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgt 31155463  T
Q  381 ttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || |||||||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||||||    
T  31155464 tttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 334 - 431
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333335
Alignment:
Q  334 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 334 - 431
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394075
Alignment:
Q  334 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 320 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186376
Alignment:
Q  320 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg 419  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  420 atgatga 426  Q
    |||||||    
T  4186382 atgatga 4186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25644745 - 25644637
Alignment:
Q  11 tgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctca 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||     
T  25644745 tgattaggaaagattttagattgagattgaacctgaaatagtttaagaatggatttttgggagttacacccgaactcgccatagcgagtagaggccctcg 25644646  T
Q  111 cctcgcgag 119  Q
    |||||||||    
T  25644645 cctcgcgag 25644637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496248
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4189388 - 4189206
Alignment:
Q  2 gtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat-agtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| || ||  |  |  | |||||| |||||||||||    
T  4189388 gtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctaaactcgtcatggcgagta 4189290  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagtt 185  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  4189289 gaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttg-ctaggttaaatgcgatcgttgtcgcacgagttgttgtgagtt 4189206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060544
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatg 29060544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076704
Alignment:
Q  322 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  422 gatgatgatg 431  Q
    || |||||||    
T  20076713 gaagatgatg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25644444 - 25644335
Alignment:
Q  312 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctgg 410  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  25644444 tttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcgg 25644345  T
Q  411 tctaagttga 420  Q
    ||||||||||    
T  25644344 tctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1595707 - 1595550
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1595707 atataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 1595609  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||    
T  1595608 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21939737 - 21939633
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  21939737 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgtcttgtttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgtt 21939640  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  21939639 atgagtt 21939633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 25956309 - 25956429
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||| | |||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||  || | |||||||||||||||    
T  25956309 tgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacctggaatagtttaagaatggattttttggagttacacctgtattcgccatggcgagta 25956408  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagct 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  25956409 gaggctctcgcctcgcaagct 25956429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409944
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782228
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 22782287  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22782286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303657
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  413 taagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatg 19303657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 2291184 - 2291341
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  2291184 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 2291282  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  2291283 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 428
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227625
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 428  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12742475 - 12742318
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12742475 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12742377  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  12742376 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 18334596 - 18334753
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18334596 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18334694  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18334695 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19005204 - 19005047
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19005204 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19005106  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19005105 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 19858923 - 19859080
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19858923 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19859021  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  19859022 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638400
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24422705 - 24422548
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24422705 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24422607  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  24422606 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33861952 - 33861795
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33861952 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33861854  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  33861853 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33864436 - 33864279
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33864436 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33864338  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  33864337 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629472
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttg-taatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 20556898 - 20557053
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtcta 372  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| |     
T  20556898 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tg 20556995  T
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20556996 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 30676714 - 30676861
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| ||    
T  30676714 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ct 30676812  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30676813 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8055187 - 8055030
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  8055187 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-t 8055089  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  8055088 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 26924644 - 26924801
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  26924644 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 26924742  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26924743 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35008503 - 35008282
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     |  ||| | ||| ||||| ||| |||||| || | || | ||||||||||||||    
T  35008503 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgttgtgagacagactgc-ttgtt-aggataaatgtgacctttgttgcacgagttgatgt 35008406  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||||  |||||  |||||    
T  35008405 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctg-atatagatgatttgatgttgttaataatgtgatata 35008307  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattat 304  Q
     |||||||| ||||| |||||||||    
T  35008306 tttgtatattcattacatgaattat 35008282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287913
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatg 17287913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Original strand, 20360955 - 20361069
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20360955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  408 tggtctaagttgatga 423  Q
     | |||||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23076997 - 23076749
Alignment:
Q  171 gagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgtta 269  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||||  ||    
T  23076997 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg-atatagatgatttgatgttgttaata 23076899  T
Q  270 atggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg--atgatttgcatac 366  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| || ||||||||| |  || | |||||| |||||||  |  ||| |||   |||    
T  23076898 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtac 23076799  T
Q  367 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    || |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23076798 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25754967 - 25754810
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  25754967 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 25754869  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  25754868 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25754810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 304
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103887
Alignment:
Q  212 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 304  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattat 28103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593777
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatg 20593777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656630
Alignment:
Q  329 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgat 427  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 25656634  T
Q  428 gatg 431  Q
    ||||    
T  25656633 gatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 34963531 - 34963384
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34963531 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34963433  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  34963432 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Original strand, 1540918 - 1541072
Alignment:
Q  278 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 374  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||    
T  1540918 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtg 1541016  T
Q  375 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  1541017 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688513
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  412 ctaagttgat 421  Q
    ||||||||||    
T  25688522 ctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920747
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  16920732 gatgttgaagatgatg 16920747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245590
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatg 35245590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18457143 - 18457030
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa-tttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagag 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| ||| ||| || |  |  |||||| ||||||||||||||||    
T  18457143 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactagccatggcgagtagag 18457046  T
Q  104 gctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||| |||||||||    
T  18457045 gctctcgcctcgcgag 18457030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696569
Alignment:
Q  248 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 346  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtta 18696577  T
Q  347 tatcatga 354  Q
    ||||||||    
T  18696576 tatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714421
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  25714478 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18706495 - 18706387
Alignment:
Q  246 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 344  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  18706495 taatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgcttt-gatattgt 18706397  T
Q  345 tatatcatga 354  Q
    ||||||||||    
T  18706396 tatatcatga 18706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 3852021 - 3852178
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3852021 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3852119  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  3852120 gtgttgctgttg-ttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3852178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 19303229 - 19303273
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  19303229 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 19303273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 20360659 - 20360707
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  20360659 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20360707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 20637982 - 20638030
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  20637982 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20638030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22831568 - 22831532
Alignment:
Q  370 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22831568 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 22831532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 1561736 - 1561689
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  1561736 tgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa 1561689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12596308 - 12596269
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12596308 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 12596269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Original strand, 15894199 - 15894238
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15894199 tgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgagc 15894238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16102694 - 16102655
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16102694 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16102655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 16448530 - 16448678
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 16448628  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  16448629 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16813127 - 16813088
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16813127 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16813088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16830147 - 16830108
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16830147 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16830108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 18409515 - 18409562
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  18409515 tgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 18409562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Original strand, 18821588 - 18821627
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18821588 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 18821627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 22779915 - 22779962
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  22779915 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22779962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 431
Target Start/End: Original strand, 22780297 - 22780344
Alignment:
Q  384 gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  22780297 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 22780344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 28496161 - 28496208
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  28496161 tgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 28496208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29493104 - 29493065
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29493104 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 29493065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185515
Alignment:
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatg 425  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17106086 - 17106045
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  17106086 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgactcgcgagcta 17106045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 354
Target Start/End: Original strand, 18199237 - 18199456
Alignment:
Q  136 tgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcag 234  Q
    ||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||| |||||||| ||| | | |||  ||||  |||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  18199237 tgccttgtttagggtctatgcgatt-ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcag 18199335  T
Q  235 taagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat-gttgttgaattgc 332  Q
    |||| ||||  ||| ||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||| ||| |||| | |||||| |  |    
T  18199336 taagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatc 18199434  T
Q  333 attcgatattgttatatcatga 354  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  18199435 atttgatattgttatatcatga 18199456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Original strand, 25611492 - 25611533
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25611492 tgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgagcta 25611533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 25629045 - 25629090
Alignment:
Q  3 tctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  25629045 tctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattgaacctggaa 25629090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 2287677 - 2287713
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2287677 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 2287713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8523282 - 8523246
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8523282 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 8523246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15539629 - 15539593
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15539629 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15539593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 15685871 - 15685907
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15685871 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 15685907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 354
Target Start/End: Original strand, 18177521 - 18177712
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 263  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | | |||  ||||  |||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| | ||||||    
T  18177521 tcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttg 18177619  T
Q  264 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat-gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    ||  |||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||| ||| |||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18177620 ttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatga 18177712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18204350 - 18204159
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 263  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | | |||  ||||  |||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| | ||||||    
T  18204350 tcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaa-atgatttgatgttg 18204252  T
Q  264 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat-gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    ||  |||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||| ||| |||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18204251 ttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatga 18204159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Original strand, 18896256 - 18896304
Alignment:
Q  256 taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 304  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18896256 taatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattat 18896304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443076
Alignment:
Q  337 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgag 33443076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7244 - 6822
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  7244 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagta 7145  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7144 gaggctctcgccttgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttag 7045  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7044 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 6946  T
Q  300 attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 398  Q
     ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6945 cttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagc 6849  T
Q  399 tgcatgagctggtctaagttgatgatg 425  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  6848 tgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8445 - 8097
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  8445 taataatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtggagg 8346  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  8345 ccctcgcctcgcgagttgtccagttacataatgctttg-ttaggtataatgtgatctttgtctcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaac 8247  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8246 taagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 8148  T
Q  304 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 353  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8147 tgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7042 - 6615
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7042 taatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagagg 6943  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |    
T  6942 ccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatc 6843  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6842 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatt-atatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 6744  T
Q  304 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    || ||||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6743 tgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 6644  T
Q  403 tgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6643 tgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14422 - 13995
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14422 taatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagagg 14323  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |    
T  14322 ccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatc 14223  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14222 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatt-atatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 14124  T
Q  304 tg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    || ||||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14123 tgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 14024  T
Q  403 tgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14023 tgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 126 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5952 - 5654
Alignment:
Q  126 agttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgttatcttgctgttg 225  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  5952 agttacagaatgccttatttaggctaaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtttttatcttgttgttg 5853  T
Q  226 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 325  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852 ttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 5753  T
Q  326 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgat 424  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5752 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 6025 - 5959
Alignment:
Q  2 gtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgt 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  6025 gtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacttggaatagtttaagaatgaacttgt 5959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2923
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||   ||| |||| ||| || || ||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  2491 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacctgtaaagattttagaatgaaatt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagta 2589  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2590 gaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttgtttaggaaaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta 2688  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatata----catta 294  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    ||||     
T  2689 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata--attgtatatatatacattt 2786  T
Q  295 tatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaact 394  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  2787 tatgaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaact 2886  T
Q  395 aagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  2887 aagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 563 - 133
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||| |||| |||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  563 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacttggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagca 464  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||  | | ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  463 gaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttagaggttag 364  T
Q  201 aaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  363 aaactgagttgttatcttgctgttgttgttctagtgagactg-atacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaa 265  T
Q  301 ttatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  264 ttatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagct 165  T
Q  400 gcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  164 gcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 126 - 431
Target Start/End: Original strand, 14508 - 14814
Alignment:
Q  126 agttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgt-tatcttgctgtt 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14508 agttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatcttggtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgtt 14607  T
Q  225 gttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgt 324  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14608 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgt 14707  T
Q  325 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgat 424  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14708 tgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 14807  T
Q  425 gatgatg 431  Q
    |||||||    
T  14808 gatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 45477 - 45909
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgg-aatagtttaagaacgaatttgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||| ||| |||||| | | || ||  |  ||||||||||||||||||    
T  45477 tgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacctggtaagacttta-gaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgag 45575  T
Q  99 tagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45576 tagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt 45675  T
Q  199 agaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  || || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  45676 agaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacat 45774  T
Q  298 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  45775 gaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaa 45874  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45875 gctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 161118 - 160688
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga-atagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| || ||  |  |  |||| ||||||||||||||    
T  161118 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaagtcgccatggcgagt 161020  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  161019 agaggctctcacctcacgaggtaactagttacagaatgtcttggttaggataaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta 160920  T
Q  200 gaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  160919 gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatg 160821  T
Q  299 aattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  160820 acttatgtttgatatttgacatgttgttg-attgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaag 160722  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  160721 ctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 501242 - 501095
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || ||    
T  501242 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ct 501144  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  501143 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 85583 - 85741
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| || ||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  85583 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 85681  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  85682 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 5814 - 6240
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| || || || ||  |||||||||| | |||||||||||    
T  5814 taataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaaccagtaatagtttaaggatggattt-tgtgatttgcacctgaactcgccttagcgagtagagg 5912  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  5913 ccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaggttaaaaac 6012  T
Q  205 taagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6013 taagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaatta 6111  T
Q  304 tgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 402  Q
    |||| ||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6112 tgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgca 6211  T
Q  403 tgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  6212 tgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 127 - 377
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2281
Alignment:
Q  127 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2030 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttg 2129  T
Q  226 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 325  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2130 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgctgatatttgagatgttgtt 2229  T
Q  326 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2230 gatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 127 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13075 - 12770
Alignment:
Q  127 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13075 gttacaaaatgccttgtttaggttaaatgcaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttg 12976  T
Q  226 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgt 324  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||     
T  12975 ttgttccagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttga 12877  T
Q  325 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgat 424  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12876 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 12777  T
Q  425 gatgatg 431  Q
     ||||||    
T  12776 tatgatg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 56 - 431
Target Start/End: Original strand, 10283 - 10658
Alignment:
Q  56 agaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatg 155  Q
    |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |  |  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10283 agaatgaatttttgtgagttacacctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtcctgttacatactgccttgtt-aggttaaatg 10381  T
Q  156 cgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 254  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||     
T  10382 cgatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaa 10480  T
Q  255 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 353  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 10580  T
Q  354 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||    
T  10581 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatggtgatg 10658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 720 - 1151
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattg------gagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| || ||||| ||  |||||||||| | |||||    
T  720 taataatgattaggaaagattgtagattgagattgagattgaacctgtaatagtttaaggatggattt-tgtgagttgcacctgaactcgccttagcgag 818  T
Q  99 tagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    ||||||| ||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| |||| ||||| || |||    
T  819 tagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaagtt 918  T
Q  199 agaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  919 agaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtaa--atctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacat 1016  T
Q  298 gaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  1017 gaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 1116  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  1117 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 134 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 62496 - 62202
Alignment:
Q  134 aatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttc 232  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  62496 aatgccttgtttatgttaa-tgcgatccttgtcgcccgattcgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttc 62398  T
Q  233 agtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgc 332  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  62397 agtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttg---tgc 62301  T
Q  333 attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||    
T  62300 attcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 133086 - 132662
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    || |||| ||| || || ||  |  |  |||||||||||||||||| |    
T  133086 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagca 132987  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    ||||||||| |||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  132986 gaggctctcgcctcgcgagt--acttgtcttacataatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt 132889  T
Q  199 agaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| | ||      ||||||||||| ||    
T  132888 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 132796  T
Q  298 gaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 396  Q
    | |||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||    
T  132795 ggattatgttgataattgagacgttgatg-attacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaa 132697  T
Q  397 gctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  132696 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 136838 - 136681
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  136838 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 136740  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  136739 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 136681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 139307 - 139150
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  139307 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 139209  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  139208 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 144245 - 144088
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  144245 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 144147  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  144146 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 144088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 134369 - 134212
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  134369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 134271  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||    
T  134270 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 141776 - 141619
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  141776 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 141678  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  141677 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 141619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 15522 - 15765
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522 taatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttcggaattacacatgaactcgccatggcgagtagagg 15621  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15622 ccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttatgttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaac 15721  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15722 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta 15765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 431
Target Start/End: Original strand, 15792 - 15894
Alignment:
Q  329 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatg 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||    
T  15792 ttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15891  T
Q  429 atg 431  Q
    |||    
T  15892 atg 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Original strand, 7843 - 8180
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7843 tgaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacaaaatgccttgtt-agggtaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgt 7941  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  7942 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttg---tttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttgataatgttatata 8037  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
     |||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||    
T  8038 gttgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgtt 8136  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8137 gctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 388
Target Start/End: Original strand, 29048 - 29354
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||      |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  29048 gaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtg 29146  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgtta---atggtata 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | || ||||||| ||| ||   |||||  |||||||| |  ||   ||| ||||    
T  29147 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactg-atgcttatgaattaatgttgcttataattatgttata 29245  T
Q  278 taattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| | |||||| ||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  |||||||    
T  29246 taattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgtt 29342  T
Q  377 gctgttggttat 388  Q
    |||||| |||||    
T  29343 gctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 28968 - 29011
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacct 44  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  28968 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 29011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 431
Target Start/End: Original strand, 22509 - 22787
Alignment:
Q  150 taaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | || ||||||| |||| |  |    
T  22509 taaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactga-tgca 22607  T
Q  249 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttat 347  Q
    |||    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22608 tat----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 22703  T
Q  348 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22704 atcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatg 22787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 80099 - 80203
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta-actagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatg 179  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |     
T  80099 tgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcaatagta-ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatcttcgtcgcacgagttgtta 80197  T
Q  180 tgagtt 185  Q
    ||||||    
T  80198 tgagtt 80203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 82230 - 82073
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  82230 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 82132  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  82131 gtgttgctgttg-ttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 82073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 126 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1096
Alignment:
Q  126 agttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgtt 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||    
T  1391 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgtt 1293  T
Q  225 gttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttg 323  Q
    ||| || ||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  1292 gttgttccagtaagactgatgta-tatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttg 1194  T
Q  324 ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1193 atgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Original strand, 7749 - 8151
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  7749 taataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaatagtttaagaatgaatttttgggggttacacctgaactcgccatagcgagtagagg 7848  T
Q  105 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaac 204  Q
    ||||| ||||||||| || || ||| || |||||||||  |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  7849 ctctcgcctcgcgagttaccttgttccagaatgccttg-ctaggttaaatgcgatctttgtcgcaagaattgatgtgagttgatcttagaggtatgaaac 7947  T
Q  205 taagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 303  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || |||| || ||| ||  ||||||| | ||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  7948 taagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactg-atgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaatta 8046  T
Q  304 tgt-tg-atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 399  Q
    | | || || ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  8047 tatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagct 8146  T
Q  400 gcatg 404  Q
    |||||    
T  8147 gcatg 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32516 - 32102
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    || |||| ||| || || ||  |  |  |||||||||||||||||| |    
T  32516 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagca 32417  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||          |||||||||||    
T  32416 gaggctctcacctcgcgag-tacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcactagttgat----------cttagaggtta 32328  T
Q  200 gaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| | ||||      ||||||||| |||    
T  32327 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 32235  T
Q  299 aattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 397  Q
     |||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  32234 gattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaag 32136  T
Q  398 ctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32135 ctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15665
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  16011 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttttgtgttacagaatgcctt-tttaggtggaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtg 15913  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||| |||| ||  |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  15912 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactga-ttcttatgaaataatgttgcttataatgttatataa 15814  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  15813 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgct 15717  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  15716 gtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 16091 - 16047
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  16091 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3365 - 3195
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  3365 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagta 3266  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacg 171  Q
    ||||| ||| ||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3265 gaggccctcgcctcgtgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacg 3195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 8)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Original strand, 136134 - 136471
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | | ||| | ||  ||||||| |||||||||| || | || ||| ||||||||||||    
T  136134 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgt 136232  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatat 278  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  136233 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttatat 136331  T
Q  279 aattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgt 375  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| ||||||    
T  136332 agttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgt 136430  T
Q  376 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
     |||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  136431 cgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Original strand, 144842 - 145179
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | | ||| | ||  ||||||| |||||||||| || | || ||| ||||||||||||    
T  144842 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgt 144940  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatat 278  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  144941 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttatat 145039  T
Q  279 aattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgt 375  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| ||||||    
T  145040 agttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgt 145138  T
Q  376 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
     |||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  145139 cgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174785
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  | || ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 174789  T
Q  413 taag 416  Q
    ||||    
T  174788 taag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 62994 - 62947
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  62994 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 62947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121770
Alignment:
Q  365 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 133740 - 133779
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  133740 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 133779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Original strand, 135983 - 136049
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtggg 71  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||    
T  135983 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatgaatttttggg 136049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Original strand, 144691 - 144757
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtggg 71  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||    
T  144691 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatgaatttttggg 144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 127 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11296
Alignment:
Q  127 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 225  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||     
T  11598 gttacagaatgccctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgtta 11499  T
Q  226 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgt 324  Q
     | ||  |||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  11498 atgttcaagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 11403  T
Q  325 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgat 424  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||     
T  11402 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 11303  T
Q  425 gatgatg 431  Q
    |||||||    
T  11302 gatgatg 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2001
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2066  T
Q  367 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  2065 tgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28418
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4556
Alignment:
Q  379 tgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 416
Target Start/End: Original strand, 6054 - 6386
Alignment:
Q  86 tcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacata--atgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgag 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||  || ||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||||    
T  6054 tcgccaaggcgagtagaggctctcacctcgcgagcc--ctagtgagatagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgag 6150  T
Q  184 ttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataatt 282  Q
     | ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||| |    
T  6151 atgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttattaatgtgatataaat 6249  T
Q  283 gtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||    
T  6250 gtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgct 6349  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  6350 gtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12922 - 12587
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| ||  ||||||| |||||||||| || | || |||||||||| |||||    
T  12922 tgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagtggatgt 12824  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||   ||| || | ||||||||  |||||  |||||    
T  12823 gagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtct-aatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatata 12725  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgttga--tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12724 attgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttg 12626  T
Q  378 ctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12625 ctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Original strand, 103405 - 103737
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |  | | ||||| ||  ||||| |||||||||||| || | || ||| ||||||||||||    
T  103405 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacagaacaccttg-ttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgt 103503  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  103504 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttgttaatgttatgta 103602  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
     |||||||||||||| |||||||||||  ||      ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  ||||||||    
T  103603 gttgtatatacattacatgaattatgt--at------gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttg 103694  T
Q  378 ctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    |||||  ||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  103695 ctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Original strand, 103275 - 103341
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtggg 71  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||    
T  103275 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatgaatttttggg 103341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38673 - 38345
Alignment:
Q  80 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatg 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||| |||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||||    
T  38673 atgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgtgagacagaataccttgttg-ggttaaatgagacctttatcgcacgagttgatg 38575  T
Q  180 tgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 278  Q
    |||||| |||   | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||   ||||||  ||||    
T  38574 tgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgagattaatgtgatat 38476  T
Q  279 aattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgt 375  Q
    |  ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||    
T  38475 atatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgt 38376  T
Q  376 tgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  38375 tgctgtttgttcattaactaagctgcatgag 38345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 405
Target Start/End: Original strand, 53398 - 53640
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | || ||||||| ||||  |  |||||| | ||||||    
T  53398 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtt-tatgatttgatgttg 53496  T
Q  264 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 361  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  53497 tttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttg 53596  T
Q  362 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 405  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  53597 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 178
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8158
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8062 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgat 8158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9508 - 9133
Alignment:
Q  2 gtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat-agtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| || ||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  9508 gtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagta 9410  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  9409 gaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaa 9311  T
Q  201 aaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 299  Q
     ||||||||||  || | |||||||| | || |||| || || ||||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  ||||    
T  9310 gaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aatt-gtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatga 9213  T
Q  300 attatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 380  Q
     |||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9212 tttatgttgatgatat--gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28497 - 28720
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg-gaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||| ||| ||| || || ||  |  |  ||||||||||||||||||     
T  28497 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctacgaagacttta-gaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagc 28595  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28596 agaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt 28694  T
Q  199 agaaactaagttg-ttatcttgctgt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28695 agaaactaagttgtttatcttgctgt 28720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 431
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28887
Alignment:
Q  351 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg-gttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34473 - 34127
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |     |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || | |  | ||||||||||    
T  34473 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgattttttgtgttacataattcctt-tttaggttgaatgcgatctttgttgttctagttgatgtg 34375  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  34374 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 34276  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||| | |||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |    
T  34275 ttgtatatatattacttgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgtt 34179  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  34178 gtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 34553 - 34509
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  34553 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 34509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Original strand, 19651 - 19987
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||| ||  ||||||| |||||||||| || | || ||||||| |||||| |    
T  19651 tgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgggttgatat 19749  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||  |||||  |||||    
T  19750 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaatt-atatgatttgatgttattaataatgtgatata 19848  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
    | ||||||| ||||| |||| |||| | ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||    
T  19849 aatgtatatgcattacatgagttatttatgat-gctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgtt 19947  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||  ||||||||    
T  19948 gctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39917
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtt 39940  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39939 ggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 40265 - 40227
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40265 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 40227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Original strand, 128737 - 129072
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||        ||| ||| |||||||||||||   ||||||| || ||||||||| || | |    
T  128737 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcctgtaagacagaataccttgtttaggttgt-tgcgatctttgtcgcacgagatgttat 128835  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||    
T  128836 gagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatata 128933  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 376  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||    
T  128934 tttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgtt 129033  T
Q  377 gctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  129034 gctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 78614 - 78351
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 242  Q
    |||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||| ||| | | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  78614 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 78515  T
Q  243 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 341  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  78514 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatat 78418  T
Q  342 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  78417 tgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 78351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116431
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 128586 - 128636
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagttta 55  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  128586 taataatgattaggcaagttatgagattgagattgaacctggaaaagttta 128636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 1989 - 2303
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    || |||| ||| || || ||  |  |  ||||||||||||||| || |    
T  1989 tgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacataaaaagactttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcaagca 2088  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggtta 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2089 gaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagtggatgtgagttaatcttagaggtta 2187  T
Q  200 gaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 298  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| |||    
T  2188 gaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatg 2278  T
Q  299 aattatgttgatatttgagatgttg 323  Q
     |||||||||||||| |||||||||    
T  2279 gattatgttgatattcgagatgttg 2303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 360 - 87
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||      |  ||| ||| ||||||| |||||||||| || | || |||||| |||||||||    
T  360 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagcccttgtgagacagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacaagttgatgt 262  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| ||| | | ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||    
T  261 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaa-atgatttgatgttgttaataatgttatata 163  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  162 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatga 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 328 - 431
Target Start/End: Original strand, 23897 - 24000
Alignment:
Q  328 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgat 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  23897 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T
Q  428 gatg 431  Q
    ||||    
T  23997 gatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 20545 - 20498
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  20545 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaataagattgaacctggaa 20498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 97277 - 97024
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||    
T  97277 tcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttg 97180  T
Q  264 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 360  Q
    ||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  97179 ttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt 97080  T
Q  361 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
       ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  97079 atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 106555 - 106302
Alignment:
Q  165 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||    
T  106555 tcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttg 106458  T
Q  264 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 360  Q
    ||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  106457 ttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt 106358  T
Q  361 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
       ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  106357 atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 97359 - 97320
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  97359 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 97320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 106637 - 106598
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  106637 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 106598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1186
Alignment:
Q  268 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  367 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 38697 - 38819
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  38697 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagta 38796  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  38797 ggtctaagttgattaagatgatg 38819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 43472 - 43592
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  43472 tgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgtactcgccatgacgagta 43571  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagct 121  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  43572 gaggctctcgcctcgcgagct 43592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 47392 - 47512
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || ||| |||||| ||||||    
T  47392 tgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgtactagccatgacgagta 47491  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgagct 121  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  47492 gaggctctcgcctcgcgagct 47512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Original strand, 1564 - 1836
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||| ||  ||||| |||||||| ||| || | || ||||||||||||||||    
T  1564 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagatgcccaattacagaacaccttg-ttaggttacatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 1662  T
Q  181 gagttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 279  Q
    ||||| |||||   ||| |||||||||||||  |||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||  |||||  |||||    
T  1663 gagttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaatt-atatgatttgacgttgttaataatgtgatata 1761  T
Q  280 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 354  Q
    | ||||||| ||||| || |||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1762 aatgtatatgcattacataaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 377
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2505
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  |||||| |||||    
T  2213 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtgtgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgccgttcgagtttatgtg 2311  T
Q  182 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||  | || ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||    
T  2312 agttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 2410  T
Q  281 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2411 ttgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatacggtctaagttg 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 2133 - 2177
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  2133 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 2177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 3146 - 3267
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  3146 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 3244  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  3245 ggtctaagttgatgaagatgatg 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 701 - 741
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaa 41  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  701 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaa 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 900 - 569
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtgag 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||| ||  ||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||||    
T  900 actcgccatggcgagtagaggccctcacctcgcgagctagtgttagacagaacaccttgtt-aggttaaatgagacctttgtcgcacgagttgatgtgag 802  T
Q  184 ttaatcttagaggttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataatt 282  Q
    || ||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || || |   ||||   |||| | |    
T  801 ttgatcata-tggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatcttttaaataatatgatattaat 704  T
Q  283 gtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgct 379  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||    
T  703 gtatatgcattacatgaattatatatgat-gttgggatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgct 606  T
Q  380 gttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  605 gtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 309 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  409 ggtctaag 416  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3303
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39489
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 39504  T
Q  409 ggtctaagttgatga 423  Q
    |||||||||||||||    
T  39503 ggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33497 - 33458
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33497 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 33458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75323
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 75308  T
Q  409 ggtctaagttgatga 423  Q
    |||||||||||||||    
T  75309 ggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 81315 - 81354
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  81315 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 81354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 6)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39862
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25908
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||      
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  409 ggtctaagttgatga 423  Q
    |||||||||||||||    
T  25922 ggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 40289 - 40242
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  40289 tgtctaataatgattaggaaagaatggaggatgagattgaacctggaa 40242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 39619 - 39666
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  39619 tgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 120
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59309
Alignment:
Q  82 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 59309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 59191 - 59235
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 45  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  59191 tgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctg 59235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25268 - 25121
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 371  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||| ||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcct 25170  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttga 420  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25169 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 619
Alignment:
Q  246 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 344  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  727 taatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgt 629  T
Q  345 tatatcatga 354  Q
    ||||||||||    
T  628 tatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1855
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 207286 - 207390
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  207286 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacacaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgtt 207383  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  207384 atgagtt 207390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 2284 - 2237
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  2284 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 2237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11493
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 11493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38348
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 38348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 24418 - 24522
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | |    
T  24418 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgtcatgtttaggttaaatgcgatccttgtagtacgagttgttat 24517  T
Q  181 gagtt 185  Q
    |||||    
T  24518 gagtt 24522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 6)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33073
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 33050  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  33051 ggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45932
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 45955  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  45954 ggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16117
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||| || || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatg 16117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17446
Alignment:
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17389 tgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 32647 - 32765
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||   ||| |||| |||||| || ||||| ||    |||||||||  ||||| |    
T  32647 tgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgagga 32746  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  32747 gaggctcccgcctcgcgag 32765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 46358 - 46240
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||   ||| |||| |||||| || ||||| ||    |||||||||  ||||| |    
T  46358 tgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgagga 46259  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  46258 gaggctcccgcctcgcgag 46240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4853
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatg 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 5270 - 5222
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  5270 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 5222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13147
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  416 g 416  Q
    |    
T  13147 g 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 420
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16206
Alignment:
Q  312 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||    
T  16098 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 16197  T
Q  412 ctaagttga 420  Q
    |||||||||    
T  16198 ctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 148
Target Start/End: Original strand, 15865 - 15933
Alignment:
Q  80 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||    
T  15865 atgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttagg 15933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 13636 - 13582
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaa 59  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13636 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaagaa 13582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13482 - 13379
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgtga 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||  ||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||| || |||||||||||| | |||    
T  13482 aactcgccatagcgagtataggccctcgcctcatgagttgcctagttacagaatgccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttatga 13384  T
Q  183 gttaa 187  Q
    |||||    
T  13383 gttaa 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 420
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27855
Alignment:
Q  312 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||    
T  27747 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 27846  T
Q  412 ctaagttga 420  Q
    |||||||||    
T  27847 ctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18119
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    | | |||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 18119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 6516 - 6557
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaac 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6516 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17334
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctg 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  410 gtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 16903 - 16950
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16903 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 16950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 288
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagtt 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  382 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagtt 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 313 - 428
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  412 ctaagttgatgatgatg 428  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44824
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
      |||||||||||| | |||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatg 44824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 33182 - 33229
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  33182 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 25753 - 25871
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||   ||  |||| |||||| ||| | |   |  ||||||||||| |||||| |    
T  25753 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagattgtagaatgaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagca 25852  T
Q  101 gaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  25853 gaggctctcgcctcgcgag 25871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 227921 - 227849
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttac 77  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  227921 taataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttac 227849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  258 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 355  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgct 225487  T
Q  356 gatttgcatactgtctatgttg 377  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  225486 gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13215
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13337 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 13633 - 13585
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||    
T  13633 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaat 13585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32946
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||      
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 32969  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  32968 ggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38765
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||       
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgactc 38788  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  38787 ggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9750
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||||     
T  9908 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt- 9810  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  9809 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 39192 - 39145
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  39192 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 39145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12424 - 12329
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtag 101  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  12424 taataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaatag-ttaagaatggattttttggagttacaactgaatttgccatagcgagtag 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20905 - 20748
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20905 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20807  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  20806 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10264 - 10160
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgatgt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |    
T  10264 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgttat 10165  T
Q  181 gagtt 185  Q
    |||||    
T  10164 gagtt 10160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 9601 - 9705
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |    
T  9601 tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgtt 9698  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  9699 atgagtt 9705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37979 - 37822
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  37979 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 37881  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  37880 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 158454 - 158611
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  158454 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 158552  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  158553 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 158611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340064
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtc 412  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 340045  T
Q  413 taagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||| || |||||||    
T  340046 taagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3474
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||     
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3903 - 3784
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaa-cgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||  ||  |||| | || |||||||| |   |  ||||||||||| ||||||     
T  3903 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagc 3804  T
Q  100 agaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  3803 agaggctctcgcctcgcgag 3784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 347
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||  ||||| |  |||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||      
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 370  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||| | |||||||    
T  369 ggtctaagtcgataaagatgatg 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51917
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168095
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatg 168095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 52345 - 52298
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  52345 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 52298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 267898 - 267679
Alignment:
Q  199 agaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 297  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| ||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||    
T  267898 agaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatga-tatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacat 267800  T
Q  298 gaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaact 394  Q
    ||||||| | |||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||  ||||||| |||| |||  ||||||    
T  267799 gaattatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaact 267701  T
Q  395 aagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||| ||||||||  ||||||||    
T  267700 aagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10784
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  412 ctaagttgat 421  Q
    ||||||||||    
T  10793 ctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13547 - 13393
Alignment:
Q  278 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 374  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  13547 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 13449  T
Q  375 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  13448 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8646
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagct 408  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  |||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||      
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtc 8623  T
Q  409 ggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  8624 ggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 8220 - 8267
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  8220 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4852 - 4695
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  4852 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 4754  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  4753 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10540
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaa 10524  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| ||| |||||||    
T  10525 gttgttgaagatgatg 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 10125 - 10173
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  10125 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 10173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13948
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14105 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14007  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  14006 gtgttgctgttg-ttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 12576 - 12679
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttctcgcacgagttgat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  12576 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagc--actagtattacagaatgc-ttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacgagttgtt 12672  T
Q  179 gtgagtt 185  Q
     ||||||    
T  12673 atgagtt 12679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16785
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  16942 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 16844  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  16843 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 17133 - 17095
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17133 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 17209 - 17167
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga 47  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  17209 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgga 17167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1293
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  1308 gatgttgaagatgatg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7270
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 431
Target Start/End: Original strand, 15295 - 15355
Alignment:
Q  370 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||    
T  15295 ctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatg 15355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20524
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 372  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  |     
T  20383 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tg 20481  T
Q  373 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20482 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 20118 - 20228
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa-tttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagag 103  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| ||| ||| || |  |  |||||||||||||||||||||||    
T  20118 taataatgagtaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactcgccatggcgagtagag 20215  T
Q  104 gctctcacctcgc 116  Q
    |||||| ||||||    
T  20216 gctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1165
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatg 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1956
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2078 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     |||||||| || ||| |||||||    
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatg 1956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23008 - 22887
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23008 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  408 tggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15580
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| ||| |||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatg 15580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 15164 - 15213
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaata 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  15164 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaata 15213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32071
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| ||| |||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatg 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 417
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  407 ctggtctaagt 417  Q
      |||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6241
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttg--gttatttaactaagctgcatga 405  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  406 gctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||    
T  6216 gtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 5809 - 5854
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgg 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  5809 tgtctaataatgattaggaaagattgtaggatgagattgaacctgg 5854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12357 - 12244
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| || | |||     |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12357 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagagg 12259  T
Q  105 ctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||    
T  12258 ctctcacctcgcgag 12244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 431
Target Start/End: Original strand, 4890 - 4950
Alignment:
Q  370 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4890 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 650 - 695
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgg 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  650 tgtctaataatgattaggaaagattgtagaacgagattgaacctgg 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Original strand, 8265 - 8301
Alignment:
Q  86 tcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8265 tcgccgtggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 8301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9253
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  412 ctaagttgat 421  Q
    ||||||||||    
T  9262 ctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40558 - 40401
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaatt--atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  40558 atataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-t 40460  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  40459 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13513
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||| | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  416 gttg 419  Q
    ||||    
T  13516 gttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 13917 - 13869
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||    
T  13917 tgtctaataatgattaggaaaggatgtagcatgagattgaacctggaat 13869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 6)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4520
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  408 tggtctaagttgatga 423  Q
     |||||||||||||||    
T  4535 cggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12102
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  408 tggtctaagttgatga 423  Q
     |||||||||||||||    
T  12117 cggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22054
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagc 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  408 tggtctaagttgatga 423  Q
     |||||||||||||||    
T  22069 cggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 4941 - 4894
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  4941 tgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 4894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 12523 - 12476
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12523 tgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 12476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 22475 - 22428
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  22475 tgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 22428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16717
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  412 ctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatg 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 16287 - 16334
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  16287 tgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacctggaa 16334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 16368 - 16406
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16368 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 16406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16286
Alignment:
Q  318 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagt 417  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  418 tgatgatgatgatg 431  Q
    || ||| |||||||    
T  16299 tgttgaagatgatg 16286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4716
Alignment:
Q  358 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 358 - 310
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  358 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaat 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 5134 - 5086
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  5134 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 107
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  264 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-t 166  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  165 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5245
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  5230 gatgttgaagatgatg 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 4830 - 4878
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  4830 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 4878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8483
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  415 agttgatgatgatgatg 431  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8499 agttgatgaagatgatg 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 1765 - 1812
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  1765 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 1812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30090 - 29946
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  30090 atataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29992  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagtt 418  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29991 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 24212 - 24263
Alignment:
Q  5 taataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaa 56  Q
    |||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212 taataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaatagtttaa 24263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20928
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtcta 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||  ||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  415 agt 417  Q
    |||    
T  20930 agt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11446 - 11299
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  11446 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 11348  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  11347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4308
Alignment:
Q  313 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggt 411  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 4318  T
Q  412 ctaagttgat 421  Q
    ||||||||||    
T  4317 ctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20836 - 20716
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagttta-agaacg-aatttgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| || ||| |||| | || |||||||| |   |  ||||||||||| ||||||    
T  20836 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 20738  T
Q  99 tagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  20737 cagaggctctcgcctcgcgagc 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 28969 - 28924
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgg 46  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  28969 tgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27912
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||    
T  27956 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Original strand, 161093 - 161239
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 370  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| |    
T  161093 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-c 161191  T
Q  371 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttg 419  Q
    | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  161192 tgtgtcgctgttgat-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 751 - 799
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  751 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1166
Alignment:
Q  316 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaa 415  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  416 gttgatgatgatgatg 431  Q
    | || ||| |||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatg 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 11212 - 11260
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  11212 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 11260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 11282 - 11320
Alignment:
Q  81 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11282 tgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgag 11320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11558
Alignment:
Q  318 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  417 ttgatgatgatga 429  Q
    ||| ||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 335
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  374 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagcta 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 2773 - 2820
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  2773 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 337 - 290
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  337 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 10643 - 10682
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10643 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 10682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9521 - 9485
Alignment:
Q  83 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9521 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 9485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 18646 - 18693
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  18646 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2694
Alignment:
Q  328 attgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaag 416  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||  ||||||||    
T  2784 attgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 12253 - 12400
Alignment:
Q  275 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 371  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||  |||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || | ||||| || ||| | || ||| ||    
T  12253 atataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ct 12351  T
Q  372 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgat 421  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  12352 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 17696 - 17742
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga 47  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  17696 tgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 17742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4650 - 4553
Alignment:
Q  309 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 406  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||| || || | |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4650 atatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagttgcatgag 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46999
Alignment:
Q  365 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagctggtctaagttgatgatgatgatg 431  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 46999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 47408 - 47360
Alignment:
Q  1 tgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||    
T  47408 tgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaat 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1288
Alignment:
Q  4 ctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 49  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  1333 ctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2172 - 2136
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2172 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 2136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9854 - 9818
Alignment:
Q  84 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9854 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 9818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University