View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6425_low_6 (Length: 378)

Name: NF6425_low_6
Description: NF6425
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6425_low_6
NF6425_low_6
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (117-369)||(25175563-25175815)
chr6 (117-369)||(27653983-27654235)
chr6 (117-369)||(16825752-16826006)
chr6 (31-358)||(23153458-23153786)
chr6 (32-365)||(14626045-14626377)
chr6 (30-365)||(1650020-1650352)
chr6 (105-358)||(1657748-1657999)
chr6 (105-369)||(35009439-35009702)
chr6 (105-358)||(15862484-15862734)
chr6 (31-100)||(23148266-23148335)
chr6 (1-63)||(19983162-19983224)
chr6 (1-63)||(35015027-35015089)
chr6 (105-301)||(29665941-29666137)
chr6 (105-190)||(27751603-27751688)
chr6 (1-63)||(18583640-18583702)
chr6 (121-205)||(29605612-29605696)
chr6 (31-63)||(18002395-18002427)
chr6 (31-63)||(23995247-23995279)
chr6 (31-63)||(26090059-26090091)
chr6 (32-63)||(4991396-4991427)
chr6 (121-203)||(18629608-18629691)
chr6 (31-61)||(15742120-15742150)
chr6 (123-205)||(17083200-17083282)
chr6 (31-63)||(1657661-1657693)
chr6 (31-63)||(15862789-15862821)
chr6 (122-162)||(18399144-18399184)
chr6 (31-63)||(18823283-18823315)
chr6 (31-63)||(18839138-18839170)
chr6 (31-63)||(27751742-27751774)
chr6 (31-63)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (117-369)||(25426628-25426880)
chr5 (117-369)||(12374-12626)
chr5 (117-369)||(19499899-19500151)
chr5 (117-369)||(22366481-22366733)
chr5 (120-369)||(18777995-18778244)
chr5 (117-369)||(21073595-21073847)
chr5 (31-369)||(23506965-23507302)
chr5 (120-369)||(43443398-43443647)
chr5 (31-369)||(27182471-27182810)
chr5 (117-369)||(4199985-4200237)
chr5 (121-369)||(27009841-27010089)
chr5 (31-369)||(22053753-22054096)
chr5 (31-369)||(18530988-18531330)
chr5 (117-317)||(29188284-29188483)
chr5 (105-358)||(34939289-34939540)
chr5 (105-252)||(20623085-20623232)
chr5 (105-252)||(21233528-21233675)
chr5 (107-251)||(25900408-25900552)
chr5 (105-252)||(16536313-16536460)
chr5 (105-252)||(37052860-37053007)
chr5 (1-62)||(11584374-11584435)
chr5 (121-205)||(29918127-29918212)
chr5 (112-201)||(32950862-32950951)
chr5 (31-63)||(16105967-16105999)
chr5 (31-63)||(20623286-20623318)
chr5 (31-63)||(21233442-21233474)
chr5 (31-63)||(25900320-25900352)
chr5 (325-365)||(29190482-29190522)
chr5 (31-63)||(37053061-37053093)
chr5 (121-203)||(21310709-21310792)
chr5 (122-203)||(5450844-5450926)
chr5 (328-369)||(17471803-17471844)
chr5 (31-63)||(108728-108760)
chr5 (31-63)||(9730278-9730310)
chr5 (31-63)||(16536514-16536546)
chr5 (122-162)||(16595713-16595753)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-369)||(41394222-41394589)
chr1 (31-369)||(20931345-20931682)
chr1 (31-369)||(20913037-20913367)
chr1 (117-369)||(5072388-5072640)
chr1 (117-369)||(18601118-18601370)
chr1 (31-369)||(20893551-20893889)
chr1 (31-369)||(37844374-37844714)
chr1 (31-369)||(20445679-20446019)
chr1 (31-369)||(20531444-20531783)
chr1 (32-369)||(22227809-22228146)
chr1 (32-369)||(22232506-22232843)
chr1 (117-365)||(2116258-2116506)
chr1 (30-303)||(45051489-45051759)
chr1 (105-252)||(51452608-51452755)
chr1 (1-63)||(21860334-21860396)
chr1 (1-63)||(44034841-44034903)
chr1 (1-63)||(41218728-41218790)
chr1 (1-97)||(27675086-27675180)
chr1 (32-63)||(15861327-15861358)
chr1 (122-162)||(16646118-16646158)
chr1 (325-365)||(45051446-45051486)
chr1 (31-63)||(51452809-51452841)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (117-369)||(19886661-19886913)
chr2 (31-364)||(462743-463075)
chr2 (1-369)||(20627208-20627576)
chr2 (1-369)||(19794599-19794967)
chr2 (31-369)||(8891242-8891581)
chr2 (1-369)||(43642851-43643220)
chr2 (31-369)||(36982364-36982704)
chr2 (105-369)||(17396653-17396916)
chr2 (31-369)||(24341309-24341652)
chr2 (105-369)||(25265390-25265653)
chr2 (155-369)||(7507894-7508107)
chr2 (105-252)||(19689401-19689548)
chr2 (105-252)||(23820187-23820334)
chr2 (105-252)||(14906440-14906587)
chr2 (31-127)||(22863169-22863267)
chr2 (105-252)||(20015127-20015274)
chr2 (1-63)||(22275045-22275107)
chr2 (1-63)||(22284278-22284340)
chr2 (1-62)||(15633538-15633599)
chr2 (122-203)||(68156-68238)
chr2 (30-63)||(19689314-19689347)
chr2 (31-63)||(9652796-9652828)
chr2 (31-63)||(14906354-14906386)
chr2 (31-63)||(23820388-23820420)
chr2 (32-63)||(25213372-25213403)
chr2 (122-203)||(22775206-22775288)
chr2 (122-203)||(22780584-22780666)
chr2 (31-63)||(7507757-7507789)
chr2 (31-63)||(17396567-17396599)
chr2 (31-63)||(20015328-20015360)
chr2 (31-63)||(28031134-28031166)
chr2 (31-97)||(31146073-31146138)
chr2 (31-63)||(33128372-33128404)
chr2 (122-201)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (31-367)||(3508-3843)
scaffold0266 (31-369)||(1124-1462)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (117-369)||(47357654-47357906)
chr4 (1-369)||(54118138-54118507)
chr4 (31-369)||(13246430-13246769)
chr4 (121-369)||(10644219-10644467)
chr4 (31-269)||(121989-122226)
chr4 (105-361)||(13048221-13048477)
chr4 (31-369)||(15675009-15675352)
chr4 (31-301)||(10104170-10104445)
chr4 (105-369)||(26680201-26680463)
chr4 (132-369)||(31115629-31115865)
chr4 (105-252)||(10488678-10488825)
chr4 (105-252)||(16327926-16328073)
chr4 (31-168)||(33240900-33241043)
chr4 (272-369)||(111395-111492)
chr4 (1-63)||(25119077-25119139)
chr4 (31-137)||(31132545-31132657)
chr4 (121-301)||(40885570-40885749)
chr4 (1-63)||(5682398-5682460)
chr4 (122-203)||(15044992-15045074)
chr4 (325-369)||(10104450-10104494)
chr4 (31-63)||(14952085-14952117)
chr4 (31-63)||(15135907-15135939)
chr4 (31-63)||(15272211-15272243)
chr4 (31-63)||(16327840-16327872)
chr4 (31-63)||(16609013-16609045)
chr4 (31-63)||(26680517-26680549)
chr4 (122-203)||(15109350-15109432)
chr4 (31-63)||(8045272-8045304)
chr4 (31-63)||(16523146-16523178)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (31-369)||(14842487-14842824)
chr3 (117-369)||(55316219-55316471)
chr3 (117-369)||(41270075-41270327)
chr3 (31-369)||(2049810-2050147)
chr3 (31-369)||(12030073-12030410)
chr3 (31-358)||(13838905-13839232)
chr3 (1-369)||(16744011-16744377)
chr3 (142-369)||(16821139-16821366)
chr3 (105-369)||(13975722-13975985)
chr3 (68-369)||(15858986-15859287)
chr3 (105-369)||(45860805-45861068)
chr3 (95-370)||(51158008-51158282)
chr3 (105-369)||(13954890-13955153)
chr3 (112-369)||(15936634-15936890)
chr3 (112-366)||(15938476-15938729)
chr3 (1-168)||(19231981-19232151)
chr3 (30-365)||(15614838-15615170)
chr3 (105-369)||(17912483-17912744)
chr3 (31-151)||(19260749-19260869)
chr3 (105-252)||(2449238-2449385)
chr3 (1-63)||(3992873-3992935)
chr3 (1-63)||(55513193-55513255)
chr3 (1-66)||(15857133-15857198)
chr3 (8-63)||(17955861-17955916)
chr3 (1-63)||(2844514-2844576)
chr3 (2-63)||(45581954-45582016)
chr3 (1-63)||(54037994-54038056)
chr3 (1-63)||(7854305-7854367)
chr3 (256-369)||(47984650-47984763)
chr3 (256-369)||(47993937-47994050)
chr3 (256-369)||(48003224-48003337)
chr3 (256-369)||(48012510-48012623)
chr3 (112-201)||(11986173-11986262)
chr3 (121-162)||(14080715-14080756)
chr3 (328-369)||(15468555-15468596)
chr3 (31-63)||(2449152-2449184)
chr3 (121-205)||(4145814-4145898)
chr3 (31-63)||(16261777-16261809)
chr3 (31-63)||(16933869-16933901)
chr3 (31-63)||(17912398-17912430)
chr3 (31-63)||(23492696-23492728)
chr3 (31-63)||(38168237-38168269)
chr3 (31-63)||(53771365-53771397)
chr3 (122-203)||(30207380-30207462)
chr3 (121-205)||(6228625-6228710)
chr3 (328-369)||(22275209-22275250)
chr3 (31-63)||(11986080-11986112)
chr3 (31-63)||(13954804-13954836)
chr3 (122-162)||(14059214-14059254)
chr3 (31-63)||(14285289-14285321)
chr3 (31-63)||(19947026-19947058)
chr3 (31-63)||(30153265-30153297)
chr3 (31-63)||(33342204-33342236)
chr3 (31-63)||(45861122-45861154)
chr3 (31-63)||(51961031-51961063)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (31-369)||(48598-48935)
scaffold0023 (142-369)||(36093-36320)
scaffold0023 (31-63)||(61122-61154)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-369)||(3059966-3060333)
chr7 (117-369)||(10989410-10989661)
chr7 (116-369)||(2437457-2437710)
chr7 (31-367)||(16211768-16212103)
chr7 (31-369)||(13036938-13037277)
chr7 (117-369)||(13911024-13911277)
chr7 (31-364)||(11580661-11580997)
chr7 (31-369)||(36052667-36053003)
chr7 (121-369)||(13572676-13572924)
chr7 (112-369)||(18253842-18254098)
chr7 (105-363)||(25292338-25292595)
chr7 (105-369)||(47481031-47481294)
chr7 (142-369)||(16478987-16479213)
chr7 (105-369)||(7293017-7293279)
chr7 (106-369)||(13321014-13321278)
chr7 (105-252)||(11516343-11516490)
chr7 (105-252)||(15441564-15441711)
chr7 (105-252)||(30262129-30262276)
chr7 (1-63)||(32493916-32493978)
chr7 (2-63)||(126738-126799)
chr7 (33-226)||(295893-296087)
chr7 (1-63)||(1936887-1936949)
chr7 (1-63)||(111139-111201)
chr7 (31-137)||(36024372-36024485)
chr7 (122-203)||(13377693-13377775)
chr7 (1-62)||(7283926-7283987)
chr7 (1-97)||(13377819-13377913)
chr7 (31-63)||(2029244-2029276)
chr7 (31-63)||(7293333-7293365)
chr7 (31-63)||(11516544-11516576)
chr7 (31-63)||(14113903-14113935)
chr7 (31-63)||(15441478-15441510)
chr7 (31-100)||(15709428-15709501)
chr7 (31-63)||(30262043-30262075)
chr7 (31-63)||(42056188-42056220)
chr7 (121-203)||(16914928-16915011)
chr7 (31-63)||(371417-371449)
chr7 (31-63)||(3049905-3049937)
chr7 (31-63)||(13321334-13321366)
chr7 (105-137)||(14113989-14114021)
chr7 (105-137)||(14423639-14423671)
chr7 (35-63)||(15516765-15516793)
chr7 (31-63)||(25124450-25124482)
chr7 (31-63)||(47480944-47480976)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (31-370)||(16193643-16193980)
chr8 (117-369)||(30120722-30120974)
chr8 (31-369)||(43373392-43373731)
chr8 (179-369)||(222753-222943)
chr8 (179-369)||(736376-736566)
chr8 (179-369)||(860271-860461)
chr8 (117-369)||(16674392-16674644)
chr8 (31-358)||(24928716-24929043)
chr8 (1-369)||(16404870-16405235)
chr8 (121-369)||(21844576-21844824)
chr8 (121-369)||(21851969-21852217)
chr8 (117-365)||(6774258-6774505)
chr8 (117-365)||(24548986-24549233)
chr8 (105-369)||(22907214-22907476)
chr8 (105-358)||(17345581-17345832)
chr8 (105-252)||(5238203-5238350)
chr8 (105-252)||(24661248-24661395)
chr8 (105-252)||(43685662-43685809)
chr8 (179-241)||(691908-691970)
chr8 (1-63)||(274766-274828)
chr8 (1-63)||(641021-641083)
chr8 (1-63)||(826827-826889)
chr8 (1-63)||(24716732-24716794)
chr8 (1-63)||(39115598-39115660)
chr8 (31-63)||(5238404-5238436)
chr8 (31-63)||(22907128-22907160)
chr8 (31-63)||(24385652-24385684)
chr8 (31-63)||(24661162-24661194)
chr8 (31-63)||(43685863-43685895)
chr8 (121-203)||(26011658-26011741)
chr8 (31-63)||(2545265-2545297)
chr8 (31-63)||(3431176-3431208)
chr8 (31-63)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (31-369)||(5990-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (31-369)||(882-1218)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (31-369)||(8878-9215)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (31-369)||(12115-12450)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (31-358)||(171916-172242)
scaffold0001 (31-358)||(177619-177945)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (142-369)||(42997-43224)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (31-365)||(41733-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (30-369)||(36836-37176)
scaffold0077 (1-62)||(15337-15398)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (31-358)||(247366-247694)
scaffold0012 (31-63)||(34075-34107)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (34-369)||(19206-19543)
scaffold0195 (105-369)||(21290-21553)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (31-369)||(26340-26678)
scaffold0162 (105-252)||(8180-8327)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (31-369)||(128095-128431)
scaffold0008 (142-369)||(31700-31928)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (41-369)||(4996-5324)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (31-369)||(123087-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (112-345)||(5552-5785)
scaffold0772 (31-63)||(5846-5878)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (121-369)||(35-283)
scaffold0116 (1-63)||(30417-30479)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (31-363)||(272031-272362)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (112-369)||(48187-48443)
scaffold0049 (2-62)||(20493-20553)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (121-369)||(64527-64780)
scaffold0026 (112-369)||(107747-108003)
scaffold0026 (120-162)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (33-251)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (116-369)||(21115-21367)
scaffold0139 (142-369)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (79-369)||(148721-149012)
scaffold0025 (31-369)||(8849-9192)
scaffold0025 (31-131)||(146838-146938)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (155-369)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (155-369)||(3722-3936)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (31-251)||(89378-89600)
scaffold0028 (31-156)||(107708-107835)
scaffold0028 (32-63)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (142-365)||(9374-9596)
scaffold0215 (142-365)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (117-263)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (105-369)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (105-369)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (105-369)||(37066-37328)
scaffold0078 (1-63)||(41632-41694)
scaffold0078 (31-63)||(36980-37012)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (105-369)||(41648-41911)
scaffold0125 (31-71)||(41957-41997)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (116-365)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (105-369)||(13506-13769)
scaffold0132 (1-63)||(42677-42736)
scaffold0132 (31-63)||(13824-13856)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (263-369)||(9-115)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (263-369)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (117-273)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (105-252)||(26911-27058)
scaffold0141 (112-252)||(22656-22796)
scaffold0141 (31-63)||(22857-22889)
scaffold0141 (31-63)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (105-252)||(1582-1729)
scaffold0124 (31-63)||(1496-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (272-369)||(9382-9479)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-63)||(80187-80249)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (1-64)||(162048-162111)
scaffold0016 (1-64)||(166134-166197)
scaffold0016 (1-63)||(116421-116483)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-63)||(5747-5809)
scaffold0686 (1-63)||(5953-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-63)||(31150-31212)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (105-198)||(3360-3453)
scaffold0361 (313-367)||(3210-3264)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-64)||(322-385)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-62)||(1701-1762)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-62)||(94-155)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-62)||(19820-19881)
scaffold0122 (2-62)||(24125-24185)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (112-201)||(56106-56195)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (121-203)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (122-203)||(2317-2399)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (1-62)||(6274-6335)
scaffold0310 (25-62)||(4-41)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (30-63)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (31-63)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (31-63)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (31-63)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (31-63)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (31-63)||(57392-57424)
scaffold0058 (121-162)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (31-63)||(55904-55936)
scaffold0032 (31-63)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (31-74)||(18015-18058)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-63)||(1374-1436)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (155-201)||(45198-45244)
scaffold0066 (31-63)||(45338-45370)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (121-162)||(1546-1587)
scaffold0456 (121-162)||(8691-8732)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (122-162)||(8011-8051)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (31-63)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (31-63)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (31-63)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (31-63)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (31-63)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (31-63)||(34308-34340)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (122-162)||(3525-3565)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (31-63)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  215 atgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  315 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153458
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttga 23153488  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153487 tgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 365
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 131  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  132 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 231  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  232 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 331  Q
    |||||   ||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  332 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650352
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 1650116  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  1650117 gctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtga 1650216  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||    
T  1650217 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttga 1650315  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650316 tgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 19983162 - 19983224
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983162 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 35015027 - 35015089
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015027 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 203  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  204 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 301  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 190  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18583702 - 18583640
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18583702 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 205  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629691
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18629691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 61
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742150
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 205
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083282
Alignment:
Q  123 attcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 205  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 17083282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 1657661 - 1657693
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657661 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15862821 - 15862789
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862821 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399144
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 18399144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 18823283 - 18823315
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823283 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 18839138 - 18839170
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839138 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27751774 - 27751742
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751774 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 32276659 - 32276691
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276659 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 120 - 369
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  120 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 219  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  220 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  320 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506965
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 23507004  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507003 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 120 - 369
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443647
Alignment:
Q  120 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 219  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  220 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 319  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  320 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182810
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 27182769  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182770 tgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009841
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 220  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  221 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 320  Q
    ||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  321 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054096
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  125 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 224  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  225 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 324  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 22054051  T
Q  325 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054052 ttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531330
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  126 cgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 225  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  226 tgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 325  Q
    |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  326 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 317
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  107 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  207 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 251  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11584435 - 11584374
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584435 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 205  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 365
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  325 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310792
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 21310792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450926
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 5450926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 108728 - 108760
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108728 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 9730278 - 9730310
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730278 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16536546 - 16536514
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536546 taagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16595753 - 16595713
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16595753 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16595713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41394589 - 41394222
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394589 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 41394490  T
Q  101 gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41394489 gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgt 41394390  T
Q  201 tcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 300  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  41394389 tcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgt 41394291  T
Q  301 tatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||   ||||||||||| || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394290 tattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931345
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 20931384  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931383 aataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913037
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatg 20913076  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913075 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601370
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    |||||||||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893889
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 20893848  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893849 tgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844714
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tg 227  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  228 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 327  Q
    || |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 37844672  T
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844673 atgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445679
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  128 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 227  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  228 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 327  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttg 20445721  T
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445720 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531444
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20531485  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531484 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227809
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22227848  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227847 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232506
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22232545  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232544 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 315  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 2116308  T
Q  316 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116307 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051489
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 45051663  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    | ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  45051662 gttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 45051563  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 303  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051562 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21860396 - 21860334
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860396 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 44034841 - 44034903
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034841 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 41218790 - 41218728
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41218790 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcat 41218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27675180 - 27675086
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 97  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27675180 gtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatcgt--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaat 27675086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 63
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16646158 - 16646118
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16646158 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16646118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  325 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 51452841 - 51452809
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452841 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462743
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattga 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 20627208 - 20627576
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgtatgaattt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  20627208 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaatta 20627307  T
Q  100 tgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20627308 tgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 20627407  T
Q  200 ttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatg 299  Q
    | || ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||     
T  20627408 tccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgatt 20627506  T
Q  300 ttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627507 ttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 19794599 - 19794967
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19794599 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttt 19794697  T
Q  101 g--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 198  Q
       || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19794698 tgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacat 19794797  T
Q  199 gttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgat 298  Q
    ||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19794798 gttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgat 19794896  T
Q  299 gttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794897 gttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891242
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttga 8891283  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891282 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 43642851 - 43643220
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43642851 gtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 43642950  T
Q  101 g--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 198  Q
       ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  43642951 tgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat 43643050  T
Q  199 gttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgat 298  Q
    ||||| ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  43643051 gttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgat 43643149  T
Q  299 gttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    | |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643150 gctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982704
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  128 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 227  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  228 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 327  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttg 36982662  T
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982663 atgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341652
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  125 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 224  Q
    || |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  225 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 324  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||        
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctg 24341607  T
Q  325 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341608 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 369
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  155 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 254  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  255 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 353  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  354 tcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22275107 - 22275045
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275107 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22284340 - 22284278
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284340 gtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15633599 - 15633538
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633599 gtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775288
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780666
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20015360 - 20015328
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015360 taaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 28031134 - 28031166
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031134 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146138
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgttgtatgaat 97  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 33128404 - 33128372
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128404 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 201  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3843
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagg 3806  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3807 aataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1124
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  130 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 229  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  230 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 329  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgat 1164  T
Q  330 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1163 gaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 54118138 - 54118507
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54118138 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 54118237  T
Q  101 --gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 198  Q
       || |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  54118238 tgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat 54118337  T
Q  199 gttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgat 298  Q
    ||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||    
T  54118338 gttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgat 54118436  T
Q  299 gttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118437 gttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246430
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 13246471  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246470 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 220  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  221 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 320  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  321 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 121989
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 269  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122026 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 105 - 361
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 361  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675352
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  125 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 224  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  225 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 324  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttg 15675307  T
Q  325 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675308 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 301
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104445
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  125 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 224  Q
     |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  225 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 301  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  132 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 231  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  232 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 331  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  332 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240900
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  125 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 168  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  272 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 25119077 - 25119139
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25119077 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  125 tcgtgctccaact 137  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgat 219  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  220 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 301  Q
    |||||||||| ||| |||| ||  |||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885670 aagttatgaa-attatgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 5682398 - 5682460
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5682398 gtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  325 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109432
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15109432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 8045304 - 8045272
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045304 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842824
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||     
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatg 14842785  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842786 aataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049810
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||     
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatg 2049849  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049848 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030410
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||     
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
     ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatg 12030371  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030372 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  130 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 229  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  230 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 329  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13838934  T
Q  330 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838933 gaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 16744011 - 16744377
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744011 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 16744110  T
Q  101 gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  16744111 gattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacattt 16744210  T
Q  201 tcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 300  Q
    | | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  16744211 ttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgt 16744308  T
Q  301 tatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    | |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744309 tgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  242 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 341  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  342 gggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  68 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 165  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  166 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgtt 265  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  266 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15859283  T
Q  366 gatg 369  Q
    ||||    
T  15859284 gatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 95 - 370
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  95 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 194  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  195 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaa 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  295 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 370  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 112 - 369
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  212 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 311  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  312 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 112 - 366
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 211  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  212 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 311  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  312 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 366  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19232151 - 19231981
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattt 99  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232151 gtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattt 19232052  T
Q  100 t--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 168  Q
    |   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232051 ttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15614838
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| ||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgt 15615074  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  15615073 gctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 15614974  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  15614973 atatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttga 15614875  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614874 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  131 tccaactatgttgttatgttt 151  Q
    || || |||| || |||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 3992935 - 3992873
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992935 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 55513255 - 55513193
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513255 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 15857133 - 15857198
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 66  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857133 gtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  8 tagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2844576 - 2844514
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844576 gtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 54037994 - 54038056
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54037994 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 7854367 - 7854305
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7854367 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  256 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 355  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  356 atggattgatgatg 369  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  256 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 355  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  356 atggattgatgatg 369  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  256 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 355  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  356 atggattgatgatg 369  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  256 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 355  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  356 atggattgatgatg 369  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 205
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 205  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207380
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 30207380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 205
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228710
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 205  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| || |||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 6228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 11986080 - 11986112
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986080 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Original strand, 14059214 - 14059254
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  14059214 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 14059254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14285321 - 14285289
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285321 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19947058 - 19947026
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153265
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33342204
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961063
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48598
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||     
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatg 48637  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48636 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  242 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 341  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  342 gggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3060333 - 3059966
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3060333 gtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaatttt 3060234  T
Q  101 gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||    
T  3060233 gcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgt 3060134  T
Q  201 tcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3060133 tcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 3060035  T
Q  301 tatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060034 tatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437457
Alignment:
Q  116 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  216 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  316 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211768
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16211805  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 367  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211804 attcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037277
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttga 13037236  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037237 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911277
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 315  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  316 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580997
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  127 gtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 226  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  227 gaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 326  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggtt 11580959  T
Q  327 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 364  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580960 gatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052667
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
     |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || ||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttga 36052708  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052707 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572676
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 220  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  221 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 320  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  321 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 112 - 369
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  212 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 311  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  312 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 363
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 363  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  242 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 341  Q
      ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  342 gggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  106 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  205 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 302  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  303 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 32493916 - 32493978
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493916 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 126799 - 126738
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126799 tgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 226
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  33 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||     
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 226  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 1936887 - 1936949
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1936887 gtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 111139 - 111201
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  111139 gtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36024485 - 36024372
Alignment:
Q  31 taaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaa 123  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| |||||    
T  36024485 taaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaa 36024386  T
Q  124 ttcgtgctccaact 137  Q
    ||||||||||||||    
T  36024385 ttcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 7283926 - 7283987
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7283926 gtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13377913 - 13377819
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 97  Q
    |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13377913 gtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaat 13377819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915011
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 16915011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 371449 - 371417
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371449 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049905
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321334
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321366 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114021
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14114021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423671
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14423671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 63
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  35 gtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124450
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 47480944 - 47480976
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480944 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 370
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193980
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16193940  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 370  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193941 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373731
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttga 43373690  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373691 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 179 - 369
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  179 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  279 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 179 - 369
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  179 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  279 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 179 - 369
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  179 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  279 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 358
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  130 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 229  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  230 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 329  Q
     |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgat 24929014  T
Q  330 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929015 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 16404870 - 16405235
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404870 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 16404968  T
Q  101 g--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 198  Q
       || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  16404969 tgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat 16405068  T
Q  199 gttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgat 298  Q
    ||||| ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||    
T  16405069 gttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgat 16405164  T
Q  299 gttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405165 gttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844824
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 220  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  221 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 320  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  321 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852217
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 220  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  221 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 320  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  321 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 117 - 365
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 117 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 316  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  317 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  179 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 274828 - 274766
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274828 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 641021 - 641083
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641021 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 826827 - 826889
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826827 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 24716732 - 24716794
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716732 gtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 39115660 - 39115598
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  39115660 gtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011658
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 26011658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 3431176 - 3431208
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431176 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22886686 - 22886654
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886686 taaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6326
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||     
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatg 6287  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6288 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 882 - 1218
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||     
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 1179  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1180 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8878
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||     
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 8917  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8916 aataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12115
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  130 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 229  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  230 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 329  Q
     |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcat 12155  T
Q  330 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12154 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 171944  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171943 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 177647  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177646 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  242 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 341  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  342 gggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41733
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||     
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   |||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatg 41768  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41767 aatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 369
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37176
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  128 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 227  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  228 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 327  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttg 37134  T
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37135 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15337 - 15398
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15337 gtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 358
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247694
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 328  Q
    | |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 247664  T
Q  329 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247665 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 34075 - 34107
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34075 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  34 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26678
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  130 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 229  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  230 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 329  Q
     ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgat 26638  T
Q  330 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26639 gaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128431
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| ||||     
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||| ||  || |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatg 128392  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128393 aataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  242 ggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 340  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  341 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  41 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  140 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 239  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  240 aaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 339  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  340 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123427
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  128 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 227  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  228 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 327  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 123385  T
Q  328 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123386 atgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 112 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  212 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 311  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  312 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 345  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 35
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 220  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  221 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 320  Q
    ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  321 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 30479 - 30417
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  30479 gtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcat 30417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  131 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 230  Q
    ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  231 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 330  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatg 272064  T
Q  331 aataattgcttgggtatgcatattcatggattg 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272063 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 112 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  212 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 311  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  312 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20553 - 20493
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20553 tgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64780
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 215  Q
    ||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  216 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 315  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  316 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 112 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  212 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 311  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  312 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 162
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  120 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 251
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51328
Alignment:
Q  33 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctc 132  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  133 caactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 232  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  233 tgtgctaaaggggtgaatt 251  Q
    |||||| ||  ||||||||    
T  51310 tgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 369
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21367
Alignment:
Q  116 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||    | || |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  216 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttg 21313  T
Q  316 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21314 atgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  242 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 341  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  342 gggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  79 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  177 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgag 276  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  277 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8849
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 124  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  125 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 224  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  225 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 324  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |      
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttg 8894  T
Q  325 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8893 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  131 t 131  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 369
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  155 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 254  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  255 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 354  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  355 catggattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 155 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  155 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttc 253  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  254 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 353  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  354 tcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89600
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 228  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  229 agattgtgctaaaggggtgaatt 251  Q
    | |||||||| ||  ||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  129 gctccaactatgttgttatgtttgtatg 156  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 365
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  242 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 341  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  342 gggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 365
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  142 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  242 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 341  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  342 gggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 263
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 263  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 303  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  304 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 41694 - 41632
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41694 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41957
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 71  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41997 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  116 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  216 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 314  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  315 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 365  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 304  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 13571  T
Q  305 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13570 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 42736 - 42677
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42736 gtgaagctagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13824
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13856 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 263 - 369
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  263 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 362  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  363 gatgatg 369  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 263 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  263 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 362  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  363 gatgatg 369  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 273
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13480
Alignment:
Q  117 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 216  Q
    ||||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  217 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 273  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  212 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  205 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  272 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 369  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 80249 - 80187
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80249 gtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 162048 - 162111
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  162048 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 166134 - 166197
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  166134 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 116421 - 116483
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  116421 gtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcat 116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 5747 - 5809
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5747 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 5953 - 6015
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5953 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 31150 - 31212
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31150 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  105 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 198  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  313 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 367  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 322 - 385
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 64  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  322 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1762 - 1701
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1762 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 94
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  155 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19820 - 19881
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19820 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 24125 - 24185
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24125 tgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56195
Alignment:
Q  112 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 6274 - 6335
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6274 gtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  25 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18058 - 18015
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 74  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 1374 - 1436
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  1374 gtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcat 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  155 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 201  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45370 - 45338
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  121 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 8011
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8051 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 5476 - 5508
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5476 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4378
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17336
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5549
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5581 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 34308 - 34340
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34308 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3525
Alignment:
Q  122 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  3565 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University