View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6438_low_2 (Length: 217)

Name: NF6438_low_2
Description: NF6438
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6438_low_2
NF6438_low_2
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (1-159)||(23507030-23507189)
chr5 (2-159)||(29188312-29188470)
chr5 (1-158)||(18531106-18531264)
chr5 (1-158)||(22053872-22054030)
chr5 (1-159)||(27182586-27182745)
chr5 (2-158)||(34939344-34939500)
chr5 (2-160)||(27009905-27010065)
chr5 (2-160)||(18778020-18778180)
chr5 (2-160)||(43443423-43443583)
chr5 (2-160)||(19499963-19500123)
chr5 (2-160)||(22366509-22366669)
chr5 (2-160)||(25426692-25426852)
chr5 (2-160)||(12438-12598)
chr5 (2-158)||(21073623-21073781)
chr5 (2-160)||(4200013-4200173)
chr5 (1-94)||(20623100-20623193)
chr5 (1-94)||(21233567-21233660)
chr5 (1-94)||(25900445-25900538)
chr5 (1-94)||(16536328-16536421)
chr5 (1-94)||(37052875-37052968)
chr5 (155-205)||(12374-12424)
chr5 (155-205)||(18778194-18778244)
chr5 (155-205)||(21073797-21073847)
chr5 (155-205)||(22366683-22366733)
chr5 (155-205)||(25426628-25426678)
chr5 (155-205)||(43443597-43443647)
chr5 (15-58)||(32950862-32950905)
chr5 (12-58)||(10778012-10778058)
chr5 (12-58)||(11212107-11212153)
chr5 (12-58)||(17471630-17471676)
chr5 (12-58)||(23514729-23514775)
chr5 (1-61)||(19862372-19862433)
chr5 (1-61)||(21310732-21310793)
chr5 (1-61)||(23981539-23981600)
chr5 (2-61)||(5450867-5450927)
chr5 (1-60)||(22885806-22885866)
chr5 (1-60)||(29918129-29918189)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (1-159)||(6103-6261)
scaffold0413 (153-205)||(6274-6326)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-205)||(10104289-10104494)
chr4 (1-158)||(15675128-15675286)
chr4 (1-159)||(13246495-13246654)
chr4 (1-158)||(31115695-31115853)
chr4 (1-158)||(54118283-54118441)
chr4 (1-122)||(121992-122113)
chr4 (2-160)||(10644283-10644443)
chr4 (1-160)||(13048260-13048421)
chr4 (2-160)||(47357718-47357878)
chr4 (2-191)||(40885594-40885784)
chr4 (1-94)||(26680331-26680424)
chr4 (1-94)||(10488693-10488786)
chr4 (1-94)||(16327965-16328058)
chr4 (2-117)||(7850107-7850223)
chr4 (14-156)||(17145701-17145845)
chr4 (155-205)||(10644219-10644269)
chr4 (12-156)||(8374576-8374722)
chr4 (12-58)||(7132107-7132153)
chr4 (12-58)||(18169138-18169184)
chr4 (12-58)||(19020654-19020700)
chr4 (12-58)||(22738437-22738483)
chr4 (1-35)||(33240890-33240924)
chr4 (1-122)||(18238180-18238302)
chr4 (2-61)||(15044991-15045051)
chr4 (2-61)||(15109373-15109433)
chr4 (1-60)||(38764873-38764933)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-159)||(3621-3780)
scaffold0266 (1-159)||(1189-1348)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-159)||(148786-148945)
scaffold0025 (1-158)||(8915-9073)
scaffold0025 (1-61)||(53509-53570)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-159)||(18253874-18254033)
chr7 (2-158)||(47481071-47481228)
chr7 (1-159)||(11580778-11580937)
chr7 (1-159)||(16211831-16211990)
chr7 (2-158)||(16478990-16479147)
chr7 (5-156)||(36052735-36052884)
chr7 (1-160)||(13037053-13037213)
chr7 (1-160)||(3060030-3060190)
chr7 (2-160)||(2437521-2437681)
chr7 (2-160)||(13572740-13572900)
chr7 (2-160)||(10989474-10989633)
chr7 (2-158)||(13321080-13321239)
chr7 (2-160)||(13911052-13911213)
chr7 (1-160)||(25292377-25292537)
chr7 (2-156)||(296006-296162)
chr7 (1-94)||(11516358-11516451)
chr7 (1-94)||(15441603-15441696)
chr7 (1-94)||(30262168-30262261)
chr7 (1-156)||(7293085-7293240)
chr7 (155-205)||(2437457-2437507)
chr7 (155-205)||(10989410-10989460)
chr7 (1-61)||(16914951-16915012)
chr7 (12-61)||(48622708-48622757)
chr7 (158-205)||(18254051-18254098)
chr7 (12-58)||(13758538-13758584)
chr7 (155-205)||(13911227-13911277)
chr7 (1-77)||(14935506-14935584)
chr7 (1-77)||(15358943-15359021)
chr7 (1-77)||(15363099-15363177)
chr7 (12-58)||(15927736-15927782)
chr7 (12-58)||(15950833-15950879)
chr7 (12-58)||(18980063-18980109)
chr7 (1-77)||(28722256-28722334)
chr7 (1-61)||(9611471-9611532)
chr7 (1-61)||(9839042-9839103)
chr7 (1-61)||(48356807-48356868)
chr7 (2-61)||(13377692-13377752)
chr7 (18-77)||(13448868-13448928)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (1-159)||(51158057-51158216)
chr3 (1-159)||(15936666-15936825)
chr3 (1-159)||(15859063-15859222)
chr3 (1-159)||(14842600-14842759)
chr3 (1-159)||(15938508-15938667)
chr3 (1-159)||(2049875-2050034)
chr3 (1-159)||(12030186-12030345)
chr3 (1-159)||(13838959-13839118)
chr3 (6-159)||(15614899-15615053)
chr3 (2-160)||(55316283-55316443)
chr3 (2-160)||(16821203-16821363)
chr3 (2-160)||(41270139-41270299)
chr3 (1-158)||(17912521-17912678)
chr3 (7-160)||(13975766-13975921)
chr3 (7-160)||(45860869-45861024)
chr3 (7-160)||(13954934-13955089)
chr3 (1-94)||(2449277-2449370)
chr3 (1-94)||(16744154-16744247)
chr3 (12-122)||(54651560-54651671)
chr3 (147-205)||(14842766-14842824)
chr3 (12-122)||(11986216-11986327)
chr3 (155-205)||(16821139-16821189)
chr3 (1-77)||(4145837-4145914)
chr3 (158-205)||(15936843-15936890)
chr3 (1-62)||(3576461-3576523)
chr3 (12-58)||(5228481-5228527)
chr3 (1-77)||(6228648-6228726)
chr3 (12-58)||(12264834-12264880)
chr3 (12-58)||(12902132-12902178)
chr3 (12-58)||(15468382-15468428)
chr3 (12-58)||(18911161-18911207)
chr3 (12-58)||(22275377-22275423)
chr3 (12-58)||(25058907-25058953)
chr3 (12-58)||(49232604-49232650)
chr3 (1-122)||(14814788-14814910)
chr3 (1-61)||(34560062-34560123)
chr3 (1-61)||(47784789-47784850)
chr3 (158-198)||(15938685-15938725)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (5-194)||(45051453-45051643)
chr1 (1-159)||(20931410-20931569)
chr1 (1-158)||(41394288-41394446)
chr1 (1-160)||(20893665-20893825)
chr1 (2-159)||(2116319-2116478)
chr1 (1-159)||(20445744-20445903)
chr1 (1-159)||(20531509-20531668)
chr1 (1-159)||(20913102-20913254)
chr1 (12-160)||(22227873-22228022)
chr1 (12-160)||(22232570-22232719)
chr1 (1-159)||(37844489-37844649)
chr1 (2-160)||(18601146-18601306)
chr1 (2-160)||(5072416-5072576)
chr1 (1-94)||(51452623-51452716)
chr1 (147-205)||(22227809-22227867)
chr1 (147-205)||(22232506-22232564)
chr1 (12-58)||(17148735-17148781)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-159)||(107812-107971)
scaffold0026 (19-160)||(64573-64716)
scaffold0026 (158-205)||(107747-107794)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (1-159)||(995-1153)
scaffold0175 (152-205)||(1165-1218)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (1-158)||(48253-48411)
scaffold0049 (158-205)||(48187-48234)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (2-158)||(6774286-6774443)
chr8 (1-159)||(16193755-16193914)
chr8 (5-159)||(43373511-43373666)
chr8 (2-159)||(24549047-24549205)
chr8 (1-158)||(16405014-16405169)
chr8 (2-158)||(17345636-17345792)
chr8 (2-160)||(21844600-21844760)
chr8 (2-160)||(21851993-21852153)
chr8 (1-120)||(24928830-24928949)
chr8 (2-160)||(30120786-30120946)
chr8 (2-160)||(16674420-16674580)
chr8 (37-160)||(222754-222879)
chr8 (37-160)||(736377-736502)
chr8 (37-160)||(860272-860397)
chr8 (1-94)||(5238218-5238311)
chr8 (1-94)||(22907253-22907346)
chr8 (1-94)||(24661287-24661380)
chr8 (1-94)||(43685677-43685770)
chr8 (155-205)||(222893-222943)
chr8 (155-205)||(736516-736566)
chr8 (155-205)||(860411-860461)
chr8 (37-95)||(691909-691967)
chr8 (1-61)||(26011657-26011718)
chr8 (147-194)||(24928996-24929043)
chr8 (12-58)||(13720970-13721016)
chr8 (12-58)||(16195399-16195445)
chr8 (12-58)||(16873093-16873139)
chr8 (12-58)||(22006300-22006346)
chr8 (1-61)||(15933461-15933522)
chr8 (1-122)||(33172330-33172452)
chr8 (161-205)||(43373687-43373731)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (2-159)||(8943-9101)
scaffold0498 (158-205)||(8878-8925)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-158)||(19272-19430)
scaffold0195 (1-158)||(21356-21514)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (1-160)||(12179-12337)
scaffold0302 (164-205)||(12115-12156)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-159)||(48663-48822)
scaffold0023 (2-160)||(36157-36317)
scaffold0023 (156-205)||(36093-36142)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-159)||(462803-462962)
chr2 (1-158)||(24341428-24341586)
chr2 (1-159)||(8891307-8891466)
chr2 (1-158)||(19794743-19794901)
chr2 (1-159)||(20627352-20627511)
chr2 (1-158)||(36982480-36982638)
chr2 (2-122)||(25265430-25265550)
chr2 (1-154)||(43642996-43643150)
chr2 (12-158)||(7507894-7508041)
chr2 (2-160)||(19886689-19886849)
chr2 (7-160)||(17396697-17396852)
chr2 (1-94)||(19689440-19689533)
chr2 (1-94)||(23820202-23820295)
chr2 (1-94)||(14906479-14906572)
chr2 (1-94)||(20015142-20015235)
chr2 (155-205)||(19886863-19886913)
chr2 (1-59)||(19669132-19669191)
chr2 (12-58)||(3798645-3798691)
chr2 (12-58)||(12635910-12635956)
chr2 (12-58)||(12728560-12728606)
chr2 (12-58)||(34824643-34824689)
chr2 (1-61)||(24884849-24884910)
chr2 (2-61)||(68155-68215)
chr2 (1-60)||(19660044-19660104)
chr2 (161-205)||(19794923-19794967)
chr2 (10-58)||(23778085-23778133)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (2-159)||(9377-9535)
scaffold0215 (2-159)||(16275-16433)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-159)||(123203-123362)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (1-159)||(23153512-23153671)
chr6 (5-158)||(1650136-1650290)
chr6 (2-159)||(14626158-14626316)
chr6 (2-158)||(1657788-1657944)
chr6 (5-122)||(35009482-35009599)
chr6 (2-147)||(15862549-15862694)
chr6 (2-160)||(25175627-25175787)
chr6 (2-160)||(27654011-27654171)
chr6 (2-160)||(16825780-16825942)
chr6 (10-198)||(29665899-29666089)
chr6 (86-155)||(27740907-27740977)
chr6 (2-47)||(27751603-27751648)
chr6 (155-205)||(16825956-16826006)
chr6 (155-205)||(25175563-25175613)
chr6 (155-205)||(27654185-27654235)
chr6 (1-60)||(29605614-29605673)
chr6 (1-77)||(17083221-17083298)
chr6 (1-61)||(18629631-18629692)
chr6 (12-58)||(1556173-1556219)
chr6 (12-58)||(16232060-16232106)
chr6 (12-58)||(18086865-18086911)
chr6 (12-58)||(23977937-23977983)
chr6 (1-61)||(16887815-16887876)
chr6 (1-61)||(25651400-25651461)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (12-160)||(5254-5403)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-159)||(5100-5259)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (1-159)||(128208-128366)
scaffold0008 (2-160)||(31703-31864)
scaffold0008 (155-205)||(31878-31928)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-159)||(26454-26613)
scaffold0162 (2-122)||(8220-8340)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-159)||(41794-41953)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (2-158)||(3028-3186)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (2-128)||(13353-13479)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-160)||(247481-247641)
scaffold0012 (12-58)||(34200-34246)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-159)||(36952-37111)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (12-160)||(3786-3936)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (2-122)||(13609-13729)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (2-122)||(41751-41871)
[»] scaffold0139 (4 HSPs)
scaffold0139 (2-160)||(14089-14248)
scaffold0139 (2-160)||(21144-21303)
scaffold0139 (149-205)||(14256-14312)
scaffold0139 (149-205)||(21311-21367)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-159)||(171970-172129)
scaffold0001 (1-159)||(177673-177832)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-159)||(573-732)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (2-158)||(34500-34658)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (2-160)||(5592-5752)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-160)||(99-259)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (2-160)||(43061-43221)
scaffold0076 (155-205)||(42997-43047)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-158)||(272091-272249)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-108)||(51221-51328)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-122)||(89493-89614)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (2-109)||(1332-1439)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (5-203)||(3210-3410)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-94)||(22671-22764)
scaffold0141 (1-94)||(26926-27019)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-94)||(1621-1714)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-94)||(37105-37198)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (12-156)||(45098-45244)
scaffold0066 (12-156)||(54484-54630)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (12-122)||(56149-56260)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (147-205)||(57-115)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (147-205)||(48514-48572)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (14-61)||(3578-3625)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-61)||(22452-22513)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (1-61)||(8173-8234)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (12-61)||(54039-54088)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (12-58)||(38-84)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (12-58)||(1617-1663)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (147-205)||(9382-9440)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (12-58)||(10381-10427)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-77)||(4751-4829)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (1-61)||(2688-2749)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-61)||(6824-6885)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-61)||(22445-22506)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-61)||(76870-76931)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (2-61)||(457-517)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (2-61)||(2340-2400)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (2-61)||(43822-43882)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23507189 - 23507030
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23507189 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 23507090  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23507089 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 23507030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 29188312 - 29188470
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29188312 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 29188411  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29188412 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatg 29188470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 18531106 - 18531264
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  18531106 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaatt 18531205  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  18531206 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 18531264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 22053872 - 22054030
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22053872 atatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 22053971  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  22053972 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 22054030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 27182586 - 27182745
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27182586 atatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 27182685  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27182686 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 27182745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34939500 - 34939344
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  34939500 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 34939401  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
     || ||||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  34939400 atggattttgctaagtcattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttat 34939344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27010065 - 27009905
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  27010065 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattg 27009966  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27009965 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 27009905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 18778020 - 18778180
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  18778020 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 18778119  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  18778120 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 18778180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 43443423 - 43443583
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  43443423 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 43443522  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| | | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  43443523 gtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatga 43443583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19500123 - 19499963
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| || ||    
T  19500123 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 19500024  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  19500023 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 19499963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 22366509 - 22366669
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  22366509 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 22366608  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22366609 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 22366669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25426852 - 25426692
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| || ||    
T  25426852 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 25426753  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  25426752 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 25426692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12598 - 12438
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| | || |||||||| || ||    
T  12598 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 12499  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  12498 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 12438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 21073623 - 21073781
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| || ||    
T  21073623 tatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 21073722  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21073723 gtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 21073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 4200013 - 4200173
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||| |||| |||||    
T  4200013 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattg 4200112  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| |  || ||||||| | | ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  4200113 gtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatga 4200173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20623193 - 20623100
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  20623193 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 21233567 - 21233660
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  21233567 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25900445 - 25900538
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  25900445 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16536421 - 16536328
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16536421 atatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 37052968 - 37052875
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  37052968 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37052875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12424 - 12374
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  12424 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 18778194 - 18778244
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  18778194 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 21073797 - 21073847
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  21073797 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 22366683 - 22366733
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22366683 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25426678 - 25426628
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  25426678 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 43443597 - 43443647
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  43443597 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 32950905 - 32950862
Alignment:
Q  15 atgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32950905 atgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 10778012 - 10778058
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10778012 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10778058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 11212107 - 11212153
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11212107 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 17471630 - 17471676
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17471630 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23514775 - 23514729
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23514775 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19862433 - 19862372
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  19862433 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 19862372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 21310732 - 21310793
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21310732 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 21310793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 23981539 - 23981600
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  23981539 atatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaa 23981600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 5450867 - 5450927
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  5450867 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 5450927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22885866 - 22885806
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22885866 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 22885806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29918189 - 29918129
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  29918189 atatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 6103 - 6261
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6103 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaatt 6202  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6203 ggtgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 6274 - 6326
Alignment:
Q  153 tgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  6274 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 10104289 - 10104494
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  10104289 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 10104388  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggattt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||     
T  10104389 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattg 10104488  T
Q  200 atgatg 205  Q
    ||||||    
T  10104489 atgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 15675128 - 15675286
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  15675128 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 15675227  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  15675228 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 15675286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13246654 - 13246495
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13246654 atatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13246555  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13246554 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 13246495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31115853 - 31115695
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  31115853 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaatt 31115754  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  31115753 ggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 31115695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 54118283 - 54118441
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54118283 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 54118382  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  54118383 ggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttat 54118441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 122113 - 121992
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  122113 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 122014  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  122013 ggtgaattttgctaagttgttg 121992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10644443 - 10644283
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |  |||||||| |||||    
T  10644443 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattg 10644344  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| | | ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  10644343 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatga 10644283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 13048260 - 13048421
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  13048260 atatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaatt 13048359  T
Q  101 ggtgaattt-tgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    | ||||||| | ||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13048360 gatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 13048421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 47357878 - 47357718
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  47357878 tatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 47357779  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  47357778 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 47357718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Original strand, 40885594 - 40885784
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc-aattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||| |  ||||| |||||||||    
T  40885594 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttat-gaaattatgctcaatt 40885692  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattc 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||   |||||||||||    
T  40885693 ggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgatgaatcatggcttaggtatgcatattc 40885784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26680424 - 26680331
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  26680424 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26680331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10488786 - 10488693
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  10488786 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16327965 - 16328058
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16327965 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7850223 - 7850107
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||| ||    
T  7850223 tatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaagtg 7850124  T
Q  102 gtg-aattttgctaagt 117  Q
     || |||||||||||||    
T  7850123 atgaaattttgctaagt 7850107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 17145701 - 17145845
Alignment:
Q  14 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttg 111  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  17145701 catgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgt-gaaattatactcaattagtgaattttg 17145799  T
Q  112 ctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgtt 156  Q
     || ||||||| | || |||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  17145800 atatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 17145845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10644269 - 10644219
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  10644269 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374576
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttc-aattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||| |  ||||| | ||||||| ||||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttat-gaaattatactcaattagtgaattt 8374624  T
Q  110 tgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgtt 156  Q
    |  || ||||||| | || |||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  8374623 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 8374576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 7132107 - 7132153
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7132107 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 18169184 - 18169138
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18169184 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 19020700 - 19020654
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19020700 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22738483 - 22738437
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22738483 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 33240924 - 33240890
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtat 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33240924 atatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtat 33240890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 18238180 - 18238302
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |    
T  18238180 atatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgt--gaattgtgctcta 18238277  T
Q  98 attggtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||    
T  18238278 attgttgaattgtgctatgttgttg 18238302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15045051 - 15044991
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  15045051 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 15044991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 15109373 - 15109433
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  15109373 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 15109433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38764933 - 38764873
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38764933 atatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 38764873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 3621 - 3780
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3621 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 3720  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3721 ggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 3780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1348 - 1189
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1348 atatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 1249  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1248 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 148945 - 148786
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  148945 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 148846  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  148845 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 148786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9073 - 8915
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  9073 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 8974  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  8973 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttat 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 53570 - 53509
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  53570 atatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 53509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 18253874 - 18254033
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18253874 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 18253973  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18253974 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 18254033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 47481071 - 47481228
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47481071 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattg 47481170  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  47481171 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttat 47481228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 11580778 - 11580937
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11580778 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 11580877  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11580878 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 11580937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16211990 - 16211831
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16211990 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 16211891  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16211890 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatg 16211831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 16478990 - 16479147
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16478990 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 16479089  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16479090 gtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 16479147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36052884 - 36052735
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36052884 gtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 36052785  T
Q  105 aattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgtt 156  Q
    |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36052784 aattttgctaagttgtt--aatttgagatttgattcttgttcaattgatgtt 36052735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 13037053 - 13037213
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13037053 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13037152  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  13037153 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatga 13037213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3060190 - 3060030
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  3060190 atatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaat 3060091  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3060090 ggtgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatga 3060030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2437681 - 2437521
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  2437681 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattg 2437582  T
Q  102 gtgaa-ttttgctaagttgttggtaat-tgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2437581 gtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatga 2437521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13572900 - 13572740
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  13572900 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 13572801  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13572800 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 13572740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10989633 - 10989474
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  10989633 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 10989534  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  10989533 gtgaatttctcctaagttgttgtaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 10989474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13321239 - 13321080
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||  ||||| |  ||||||||||||||    
T  13321239 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttat-gaaattgtgctcaat 13321141  T
Q  100 tggtgaattttgctaagttgttggt--aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  13321140 tggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 13911052 - 13911213
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  13911052 tatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattg 13911151  T
Q  102 gtgaattt-tgct-aagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | || ||||||||| | | ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  13911152 gtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatga 13911213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 25292377 - 25292537
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | | || |||||||||||||    
T  25292377 atatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaatt 25292476  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||| ||||| | ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  25292477 ggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 25292537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 296006 - 296162
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |   ||| ||    
T  296006 tatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatatccaaatg 296105  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggt--aattgaggtttgattcttgttcaattgatgtt 156  Q
    |||||||||||||| ||| || |  ||||| | | |||||| |||||||||||||||    
T  296106 gtgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgtt 296162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11516451 - 11516358
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  11516451 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 15441603 - 15441696
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  15441603 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 30262168 - 30262261
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  30262168 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7293240 - 7293085
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||  |||     
T  7293240 atatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 7293141  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgtt 156  Q
    | |||| ||||  | ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7293140 gatgaa-tttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgtt 7293085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2437507 - 2437457
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  2437507 ttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10989460 - 10989410
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  10989460 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 16914951 - 16915012
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16914951 atatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 16915012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 48622708 - 48622757
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  48622708 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaa 48622757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Original strand, 18254051 - 18254098
Alignment:
Q  158 tgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  18254051 tgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 13758584 - 13758538
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13758584 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 13911227 - 13911277
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  13911227 ttatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14935584 - 14935506
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  14935584 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 14935506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15359021 - 15358943
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  15359021 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 15358943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15363177 - 15363099
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  15363177 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 15363099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15927782 - 15927736
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15927782 tgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 15950833 - 15950879
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15950833 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 18980063 - 18980109
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18980063 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 28722334 - 28722256
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  28722334 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 28722256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 9611532 - 9611471
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  9611532 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 9611471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 9839103 - 9839042
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  9839103 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 9839042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 48356868 - 48356807
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  48356868 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 48356807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13377752 - 13377692
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  13377752 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 13377692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Original strand, 13448868 - 13448928
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  13448868 aattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 13448928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 51158057 - 51158216
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51158057 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 51158156  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  51158157 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 51158216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 15936666 - 15936825
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15936666 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15936765  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15936766 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 15936825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 15859063 - 15859222
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15859063 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15859162  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15859163 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 15859222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 14842600 - 14842759
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14842600 atatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaatt 14842699  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14842700 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 14842759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 15938508 - 15938667
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15938508 atatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15938607  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15938608 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 15938667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2050034 - 2049875
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2050034 atatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaatt 2049935  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2049934 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatg 2049875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 12030186 - 12030345
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12030186 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaatt 12030285  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12030286 ggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatg 12030345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13839118 - 13838959
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13839118 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13839019  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13839018 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 13838959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614899
Alignment:
Q  6 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  106 attttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatg 15614899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 55316443 - 55316283
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  55316443 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 55316344  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  55316343 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 55316283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16821363 - 16821203
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |  |||||||| |||||    
T  16821363 tatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattg 16821264  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| | | ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  16821263 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatga 16821203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41270299 - 41270139
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  41270299 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 41270200  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  41270199 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 41270139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 17912521 - 17912678
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||    
T  17912521 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatt 17912620  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    | |||| |||| || ||||| | | ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  17912621 gatgaa-tttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttat 17912678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 13975766 - 13975921
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  13975766 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 13975865  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||| | |||||||||   ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13975866 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 13975921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45861024 - 45860869
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  45861024 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 45860925  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||| | |||||||||   ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  45860924 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 45860869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 13954934 - 13955089
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||    
T  13954934 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13955033  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||| | |||||||||   ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13955034 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 13955089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 2449277 - 2449370
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  2449277 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16744154 - 16744247
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16744154 atatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16744247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54651671 - 54651560
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||   || |||||| ||||| |||||| |  ||||| | ||||||||||||||||    
T  54651671 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttat-gaaattatactcaattggtgaattt 54651573  T
Q  110 tgctaagttgttg 122  Q
    || || |||||||    
T  54651572 tgatatgttgttg 54651560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 14842766 - 14842824
Alignment:
Q  147 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  14842766 aattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Original strand, 11986216 - 11986327
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || ||||||  ||||  ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||    
T  11986216 tgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttat-gaaattgtgctcaaatagtgaattt 11986314  T
Q  110 tgctaagttgttg 122  Q
    |||||||||||||    
T  11986315 tgctaagttgttg 11986327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16821189 - 16821139
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  16821189 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 4145837 - 4145914
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  4145837 atatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgata 4145914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Original strand, 15936843 - 15936890
Alignment:
Q  158 tgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15936843 tgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 3576461 - 3576523
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3576461 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaat 3576523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5228527 - 5228481
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5228527 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 6228648 - 6228726
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  6228648 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgata 6228726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 12264834 - 12264880
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12264834 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 12902132 - 12902178
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12902132 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 15468382 - 15468428
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15468382 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 18911207 - 18911161
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18911207 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22275423 - 22275377
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22275423 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25058953 - 25058907
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25058953 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 25058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 49232650 - 49232604
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49232650 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 49232604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 14814788 - 14814910
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |    
T  14814788 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgt--gaattgtgctcaa 14814885  T
Q  98 attggtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||    
T  14814886 attgttgaattgtgctatgttgttg 14814910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 34560123 - 34560062
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  34560123 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 34560062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 47784789 - 47784850
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  47784789 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 47784850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Original strand, 15938685 - 15938725
Alignment:
Q  158 tgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  15938685 tgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggatt 15938725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45051643 - 45051453
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45051643 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 45051544  T
Q  105 aattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatg 194  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  45051543 aattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 45051453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20931569 - 20931410
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  20931569 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaatt 20931470  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20931469 ggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 20931410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41394446 - 41394288
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41394446 atatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 41394347  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41394346 ggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 41394288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 20893665 - 20893825
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20893665 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 20893764  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20893765 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatga 20893825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2116478 - 2116319
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2116478 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 2116379  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttga-ggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2116378 gtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatg 2116319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20445903 - 20445744
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20445903 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaatt 20445804  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||    
T  20445803 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatg 20445744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20531668 - 20531509
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20531668 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaatt 20531569  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||    
T  20531568 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatg 20531509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20913254 - 20913102
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20913254 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaatt 20913155  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  20913154 ggtgaattttgcaaagttgttgttaa------tttgattcttgttcaattgatgttatg 20913102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227873
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||||||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  112 ctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatga 22227873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232570
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||||||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  112 ctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatga 22232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 37844489 - 37844649
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgat-aagttgtaaaaattgtgctcaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| || | || |||||||||||||||    
T  37844489 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgctcaat 37844588  T
Q  100 tggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |  |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37844589 taatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 37844649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 18601146 - 18601306
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  18601146 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 18601245  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18601246 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 18601306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 5072416 - 5072576
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  5072416 tatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 5072515  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  5072516 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 5072576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 51452716 - 51452623
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  51452716 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22227867 - 22227809
Alignment:
Q  147 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  22227867 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22232564 - 22232506
Alignment:
Q  147 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  22232564 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 17148781 - 17148735
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17148781 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 107971 - 107812
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107971 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 107872  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  107871 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 107812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 64573 - 64716
Alignment:
Q  19 attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  64573 attgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagt 64672  T
Q  118 tgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  64673 tgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 64716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 107794 - 107747
Alignment:
Q  158 tgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  107794 tgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 995 - 1153
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  995 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaatt 1094  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1095 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagattttattcttgttcaagtgatgttatg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 205
Target Start/End: Original strand, 1165 - 1218
Alignment:
Q  152 atgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  1165 atgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 48411 - 48253
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48411 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 48312  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48311 ggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 48253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48234 - 48187
Alignment:
Q  158 tgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  48234 tgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 6774286 - 6774443
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6774286 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 6774385  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6774386 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 6774443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 16193755 - 16193914
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16193755 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 16193854  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16193855 ggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 16193914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 43373511 - 43373666
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43373511 gtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 43373610  T
Q  105 aattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43373611 aattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatg 43373666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24549205 - 24549047
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24549205 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 24549106  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24549105 gtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatg 24549047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 16405014 - 16405169
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16405014 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 16405113  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  16405114 ggtgaattttgctaagttgtt--aaattgacatatgattcttgttcaattgatgttat 16405169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17345792 - 17345636
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  17345792 tatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 17345693  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
     || ||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  17345692 atggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatattat 17345636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 21844600 - 21844760
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  21844600 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 21844699  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21844700 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatga 21844760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 21851993 - 21852153
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  21851993 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 21852092  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  21852093 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatga 21852153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 24928830 - 24928949
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24928830 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 24928929  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  24928930 ggtgaatttcgctaagttgt 24928949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30120946 - 30120786
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  30120946 tatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 30120847  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  30120846 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatga 30120786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 16674420 - 16674580
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  16674420 tatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattg 16674519  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  16674520 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 16674580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222879
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  135 tgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatga 222879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736502
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  135 tgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatga 736502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860397
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  135 tgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatga 860397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 5238311 - 5238218
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  5238311 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 22907253 - 22907346
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  22907253 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22907346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24661287 - 24661380
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  24661287 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 43685770 - 43685677
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  43685770 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 222893 - 222943
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  222893 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 736516 - 736566
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  736516 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 860411 - 860461
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  860411 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691967
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgct 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26011718 - 26011657
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26011718 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaa 26011657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 194
Target Start/End: Original strand, 24928996 - 24929043
Alignment:
Q  147 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatg 194  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  24928996 aattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 13720970 - 13721016
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13720970 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16195445 - 16195399
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16195445 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 16873093 - 16873139
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16873093 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 22006300 - 22006346
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22006300 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22006346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15933522 - 15933461
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  15933522 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 15933461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33172452 - 33172330
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |    
T  33172452 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgt--gaattgtgctcta 33172355  T
Q  98 attggtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||    
T  33172354 attgttgaattgtgctatgttgttg 33172330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 43373687 - 43373731
Alignment:
Q  161 ttgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  43373687 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9101 - 8943
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9101 tatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattg 9002  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9001 gtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 8943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8925 - 8878
Alignment:
Q  158 tgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  8925 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19430 - 19272
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19430 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 19331  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  19330 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttat 19272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21514 - 21356
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21514 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 21415  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  21414 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttat 21356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12337 - 12179
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12337 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 12238  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237 ggtgaattttgttaagttgtt-gtaattgagatttgattcttgttcaattgatgttatga 12179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12156 - 12115
Alignment:
Q  164 atgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  12156 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48822 - 48663
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  48822 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagtt 48723  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  48722 ggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 48663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36317 - 36157
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  36317 tatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 36218  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  36217 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatga 36157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36142 - 36093
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  36142 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 462962 - 462803
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  462962 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaatt 462863  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  462862 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 462803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 24341428 - 24341586
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24341428 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 24341527  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  24341528 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 24341586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8891466 - 8891307
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8891466 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 8891367  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8891366 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 8891307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 19794743 - 19794901
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19794743 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 19794842  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19794843 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttat 19794901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 20627352 - 20627511
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20627352 atatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaatt 20627451  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20627452 ggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatg 20627511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 36982480 - 36982638
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36982480 atatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 36982579  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  36982580 ggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttat 36982638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 25265430 - 25265550
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  25265430 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 25265529  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  25265530 gtgaattttgctatgttgttg 25265550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 43642996 - 43643150
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43642996 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 43643095  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatg 154  Q
    |||||||||| || |||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43643096 ggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatg 43643150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508041
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  112 ctaagttgttggtaattgaggtttgattcttg-ttcaattgatgttat 158  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||||||    
T  7507994 ctaagttgttgttaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 7508041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 19886689 - 19886849
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| | || |||||||| || ||    
T  19886689 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 19886788  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  19886789 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 19886849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 17396697 - 17396852
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  17396697 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 17396796  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||| | |||||||||   ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17396797 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 17396852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 19689440 - 19689533
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  19689440 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23820295 - 23820202
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  23820295 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14906479 - 14906572
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14906479 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20015235 - 20015142
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  20015235 atatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 19886863 - 19886913
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19886863 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 19669132 - 19669191
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  19669132 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttc 19669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 3798645 - 3798691
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3798645 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 12635910 - 12635956
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12635910 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 12728606 - 12728560
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12728606 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 34824689 - 34824643
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34824689 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24884910 - 24884849
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  24884910 atatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 24884849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 68215 - 68155
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  68215 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 68155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19660104 - 19660044
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  19660104 atatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 19660044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 19794923 - 19794967
Alignment:
Q  161 ttgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19794923 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 23778085 - 23778133
Alignment:
Q  10 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  23778085 tatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 9377 - 9535
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9377 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 9476  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9477 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatg 9535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 16275 - 16433
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16275 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 16374  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16375 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatg 16433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 123203 - 123362
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  123203 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 123302  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  123303 ggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatg 123362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23153671 - 23153512
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23153671 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 23153572  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23153571 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatg 23153512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 1650136 - 1650290
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1650136 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 1650235  T
Q  105 aattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1650236 aattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 1650290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 14626158 - 14626316
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||    
T  14626158 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattg 14626257  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14626258 gtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatg 14626316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 1657788 - 1657944
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  1657788 tatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 1657887  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
     || ||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  1657888 atggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttat 1657944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 35009482 - 35009599
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35009482 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtg 35009581  T
Q  105 aattttgctaagttgttg 122  Q
    |||||||||| |||||||    
T  35009582 aattttgctatgttgttg 35009599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15862694 - 15862549
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  15862694 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 15862595  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttca 147  Q
     || ||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||    
T  15862594 atggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttca 15862549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175627
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 25175627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 27654011 - 27654171
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  27654011 tatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 27654110  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  27654111 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatga 27654171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 16825780 - 16825942
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgta--tgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||| |||    
T  16825780 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaat 16825879  T
Q  100 tggtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||| |||| | |||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  16825880 tggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 16825942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29666089 - 29665899
Alignment:
Q  10 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaat 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||| | |||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  29666089 tatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttat-gaaattgtactcaattggtgaat 29665991  T
Q  108 tttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatt 198  Q
    ||||||||||||||| | || |||| | |||||| ||||||||||||||| |  | | ||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  29665990 tttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatgcatattcatggatt 29665899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27740977 - 27740907
Alignment:
Q  86 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  27740977 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 27740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27751648 - 27751603
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27751648 tatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 16825956 - 16826006
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16825956 ttatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25175613 - 25175563
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  25175613 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 27654185 - 27654235
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  27654185 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29605673 - 29605614
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  29605673 atatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 29605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 17083221 - 17083298
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||    
T  17083221 atatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgata 17083298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 18629631 - 18629692
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  18629631 atatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 18629692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 1556219 - 1556173
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1556219 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16232106 - 16232060
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16232106 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 18086865 - 18086911
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18086865 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23977983 - 23977937
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23977983 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 16887815 - 16887876
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||    
T  16887815 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaa 16887876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25651461 - 25651400
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  25651461 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 25651400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5403
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  112 ctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatga 5403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 5100 - 5259
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5100 atatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 5199  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5200 ggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 5259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 128208 - 128366
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  128208 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 128307  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggtaattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  128308 ggcgaattttgttaggttgttgttaattgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 128366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 31703 - 31864
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  31703 tatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattg 31802  T
Q  102 gtgaattt-tgct-aagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | || ||||||||| | | ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  31803 gtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatga 31864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 31878 - 31928
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  31878 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 26454 - 26613
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26454 atatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaatt 26553  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26554 ggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 26613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 8220 - 8340
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8220 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 8319  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  8320 gtgaattttgctatgttgttg 8340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41953 - 41794
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41953 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaatt 41854  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  41853 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatg 41794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3186 - 3028
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  3186 tatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 3087  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttg-ttcaattgatgttat 158  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || || ||||||||||||    
T  3086 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 3028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 13353 - 13479
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13353 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 13452  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaatt 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13453 gtgaattttgctaagttattgttaatt 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 247481 - 247641
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  247481 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 247580  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  247581 ggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatga 247641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 34200 - 34246
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34200 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 36952 - 37111
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36952 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 37051  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  37052 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatg 37111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3786
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgt-aaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaatttt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  111 gctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatga 3786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13729 - 13609
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  13729 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 13630  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttg 122  Q
     |||||||||||| |||||||    
T  13629 atgaattttgctatgttgttg 13609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41751
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  41871 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattg 41772  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  41771 gtgaattttgctatgttgttg 41751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 14089 - 14248
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  14089 tatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaattg 14188  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  14189 gtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatga 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 21144 - 21303
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||    
T  21144 tatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaattg 21243  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21244 gtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatga 21303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 205
Target Start/End: Original strand, 14256 - 14312
Alignment:
Q  149 ttgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  14256 ttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 205
Target Start/End: Original strand, 21311 - 21367
Alignment:
Q  149 ttgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  21311 ttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 172129 - 171970
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  172129 atatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 172030  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  172029 ggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatg 171970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 177832 - 177673
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  177832 atatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 177733  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  177732 ggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatg 177673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 573 - 732
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  573 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaatt 672  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggta-attgaggtttgattcttgttcaattgatgttatg 159  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  673 ggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 34500 - 34658
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |    
T  34500 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaatag 34599  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttg-ttcaattgatgttat 158  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || || ||||||||||||    
T  34600 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5752 - 5592
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  5752 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattg 5653  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  5652 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 5592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 99
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  259 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattg 160  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  159 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 99  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43221 - 43061
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||    
T  43221 tatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattg 43122  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgttggtaa-ttgaggtttgattcttgttcaattgatgttatga 160  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  43121 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatga 43061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43047 - 42997
Alignment:
Q  155 ttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  43047 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 272249 - 272091
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  272249 atatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 272150  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgttat 158  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  272149 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttat 272091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 51221 - 51328
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 51320  T
Q  101 ggtgaatt 108  Q
    ||||||||    
T  51321 ggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 89493 - 89614
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  89493 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctcaatt 89592  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgttg 122  Q
    |||||||| ||||  |||||||    
T  89593 ggtgaattatgctttgttgttg 89614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1439
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1332 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 1431  T
Q  102 gtgaattt 109  Q
    ||||||||    
T  1432 gtgaattt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3410 - 3210
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattgg 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||| ||||   ||||| |  ||||||| ||||| |||    
T  3410 gtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataaatatcaagttat-gaaattgtactcaaatgg 3312  T
Q  103 tgaattttgctaagttgttggtaattgagg---tttgattcttgttcaattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggattt 199  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||   | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  || ||||||||||| |||     
T  3311 tgaattttgctaagttgttgttga--gaggatatgtgattattgttcaattgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattg 3214  T
Q  200 atga 203  Q
    ||||    
T  3213 atga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22764 - 22671
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  22764 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27019 - 26926
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27019 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 1621 - 1714
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  1621 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 37105 - 37198
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  37105 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45098
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagtt-ttgaaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  110 tgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgtt 156  Q
    || || ||||||| | || |||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 45098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54484
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || |||||| |||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttat-gaaattgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  110 tgctaagttgttggt-aattgaggtttgattcttgttcaattgatgtt 156  Q
    || || ||||||| | || |||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Original strand, 56149 - 56260
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaattatgtaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || |||||| |||||  ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  56149 tgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagttat-gaaattgtgctcaaatggtgaattt 56247  T
Q  110 tgctaagttgttg 122  Q
    |||||||||||||    
T  56248 tgctaagttgttg 56260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 57 - 115
Alignment:
Q  147 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  57 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48572 - 48514
Alignment:
Q  147 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  48572 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3578
Alignment:
Q  14 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3625 catgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaa 3578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 22452 - 22513
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  22452 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaa 22513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8234 - 8173
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  8234 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaa 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 54088 - 54039
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  54088 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaa 54039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 38 - 84
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 1617 - 1663
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1617 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9440 - 9382
Alignment:
Q  147 aattgatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 205  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9440 aattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10427
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10381 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 4829 - 4751
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  4829 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 4751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2749 - 2688
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  2749 atatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 2688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6885 - 6824
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  6885 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 22445 - 22506
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  22445 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaa 22506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 76870 - 76931
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  76870 atatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 76931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 457
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||    
T  517 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2400
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  2340 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 2400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 43822 - 43882
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  43822 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 43882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University