View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6444_low_2 (Length: 370)

Name: NF6444_low_2
Description: NF6444
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6444_low_2
NF6444_low_2
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (15-356)||(10347767-10348121)
chr2 (99-307)||(10353150-10353361)
chr2 (32-307)||(9065409-9065694)
chr2 (99-307)||(10371899-10372110)
chr2 (32-307)||(9060952-9061242)
chr2 (33-307)||(9328640-9328908)
chr2 (32-307)||(10335885-10336154)
chr2 (32-307)||(12005935-12006219)
chr2 (32-307)||(16269130-16269399)
chr2 (32-307)||(9321023-9321289)
chr2 (32-307)||(8573316-8573606)
chr2 (32-307)||(9274562-9274828)
chr2 (32-307)||(12012363-12012647)
chr2 (32-307)||(9284007-9284291)
chr2 (32-273)||(9316089-9316341)
chr2 (129-305)||(11987403-11987586)
chr2 (75-307)||(7115499-7115743)
chr2 (196-307)||(9291978-9292090)
chr2 (177-300)||(9364676-9364800)
chr2 (256-307)||(12018937-12018989)
chr2 (32-161)||(9292113-9292244)
[»] scaffold0667 (1 HSPs)
scaffold0667 (32-307)||(4512-4796)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (119-307)||(26574902-26575091)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (36-307)||(29467610-29467881)
chr1 (32-307)||(29423306-29423581)
chr1 (33-307)||(29453131-29453405)
chr1 (32-307)||(29443147-29443422)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (32-307)||(41966540-41966806)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (180-304)||(37462533-37462661)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (244-307)||(45237991-45238055)
chr7 (203-307)||(45243740-45243845)
chr7 (253-307)||(45230473-45230528)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (247-300)||(36224466-36224520)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10348121 - 10347767
Alignment:
Q  15 tcaacatttatacgatttgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgttt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10348121 tcaacatttatacgatttgggggtttttgttgagaattctattcactggattatgacgaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcgcgttt 10348022  T
Q  115 aacctcac--ttgaaattttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggag 212  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10348021 aacctcacacttgaaattttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggag 10347922  T
Q  213 ggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttt----- 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  10347921 ggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttgggtcatgaaagaatatggatgtagagatagttggtgtaaactttttactat 10347822  T
Q  307 -----agtagtgtttcgatttacctttgaaattgttgaggcccatatgttattct 356  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10347821 ggctgagtcgtgtttcgatttacctttgaaattgttgaggcccatatgttattct 10347767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10353361 - 10353150
Alignment:
Q  99 tttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaattttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcat 196  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| || ||| |    
T  10353361 tttaattctcgcgtttaacctaacacttgagactttcaatgaggttcctcttcctgatgaaatagaggaagaagttaatagtaagagttttaaaattcgt 10353262  T
Q  197 gttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggt 295  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  10353261 gttgctgctttaggagggtgtctttgtatgattgtggattataaagatactaaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggatgtagagagagttggt 10353162  T
Q  296 gtaaacttttta 307  Q
    ||||||||||||    
T  10353161 gtaaacttttta 10353150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 9065409 - 9065694
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||    
T  9065409 tgggggtttttgttgagaattctattcacttgataatgacgaagaaactagatcggttacatccttctttaattgttgcatttaacctcacacttgaaat 9065508  T
Q  130 tttcaa-tgaggttcctcttcctgatgaaat---aggtgaagaagttaatgg---tgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttg 222  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||| |||||| |   |||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  9065509 tttcaattgaggttccccttcctgctgaaataagaggtgaagaggttaatagtaatgagagttttcaaatgactgttgctgttttgggagggtgtctttg 9065608  T
Q  223 tatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||| | | |  ||||| ||  |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9065609 tatgattttgaattatgaaactactaatattgatggttgggtgatgaaagaatatggatctagagatagttggtgtaaacttttta 9065694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10372110 - 10371899
Alignment:
Q  99 tttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaattttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcat 196  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| |    
T  10372110 tttaattctcgcgtttaacctatcacttgagactttcaatgaggttcctctccctgatgaactaggtgaagaagttaatagtaatagttttgaaattcgt 10372011  T
Q  197 gttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggt 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  10372010 gttgctgttttaggagggtgtctttgtatgactgtggattataaaactactaacgttgatatttgggtgatgaaagaatatggttctagagatagttggt 10371911  T
Q  296 gtaaacttttta 307  Q
    ||||||||||||    
T  10371910 gtaaacttttta 10371899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 9060952 - 9061242
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacctcac--ttgaaat 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  9060952 tgggggtttttgttcagaattctcttcactgggttatggccaagaaacttgatgggtcatatccttggttaattgtcgcatttaacctcacacttgaaat 9061051  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaatag---gtgaagaagttaatggtga---------gagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||   ||||||| |||||  || |         ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9061052 tttcaatgaggttcctcttcccgttgaattagaaggtgaagaggttaacagtaatagtaatgggagttttaaaattcgtgttgctgttttgggtgggtgt 9061151  T
Q  218 ctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||||| ||  ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9061152 ctttgcatgtctgtgaattatgaagctactaaaattgatgtttgggtgatgaaagactatggatctagagatagttggtgtaaacttttta 9061242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9328908 - 9328640
Alignment:
Q  33 gggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaatt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  9328908 gggggttttggttgagaattctcttcactggataatgactaagaaacttggtggattacatccttctttaattgttgcgtttaacctaacacttgaaatt 9328809  T
Q  131 ttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactg 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   | | | |      || |  | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || |||     
T  9328808 ttcaatgtggttcctcttcctgatg---ttgataa------tagtaataagagttttgaaattgatgttgatgttttgggagggtgtctttgcatgactt 9328718  T
Q  231 tcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaa-gatatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    |  ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9328717 tgaattatgaaactactgaaattgatgtttgggtgatgaaacaatatggatatagagatagttggtgtaaacttttta 9328640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10336154 - 10335885
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacc--tcacttgaaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||| |  |||||||| ||    
T  10336154 tgggtgtttttgttgagaattctcttcactggataatgactccgaaacttgatgggttacaaccttgtttaattgctgcgtttaatctatcacttgagat 10336055  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcact 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||         | ||| |  |||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  10336054 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaat---------aattagtaatgagagttttaaaatttctattgctgttttgggagggtgtctttgtttgcct 10335964  T
Q  230 gtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||  ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  10335963 gtgaattatcaaactactaaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggctgtagagatagttggtgtaaacatttta 10335885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 12005935 - 12006219
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||    ||||||| || ||||||||||  |||||||  |    
T  12005935 tgggggtttttgttgagaattctcttcactggatgatggtcaagaaacctgatgggttacatcagcgtttaattttcgcgtttaacctaacacttgaggt 12006034  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaat---aggtgaagaagttaatggtga---gagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgt 223  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||| | || |   |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12006035 tttcaacgaggttccttttcctgatgaaataagaggtgaagaggttatttgtaatcggagttttgaaattaatgttgctgatttgggagggtgtctttgt 12006134  T
Q  224 atcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
     | | |||  ||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  12006135 ttgattgtgaattatcaaactactaagattgatgtatgggtgatgaaagaatatggttgtaaagatagttggtgtaaacttttta 12006219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16269399 - 16269130
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  16269399 tgggggtttttgttgagaattctattcgctgtataatggcgaagaaacttgacgggttacatccttctttaatcgtcgcgtttaacctaacacttgagat 16269300  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcact 229  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||    |||  || ||      ||||||   | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16269299 tttcaacgaggttcctcttcctgctgaatta---caag--gtgaa----acgagtttgttaatcgatgttgctgttttgggaggatgtctttgtataact 16269209  T
Q  230 gtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||  ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16269208 gtgaattatgaaactactaaaattgatgtttgggtgatgaaagagtatggatatagagatagttggtgcaaacttttta 16269130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9321289 - 9321023
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||    
T  9321289 tgggggtttttgttgagaattctcttcactggataatgacaaagaaacttggtggattacatccttctttaattgttgcatttaacctaacacttgaaat 9321190  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcact 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       ||  | ||  || |  ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  9321189 tttcaatgtggttcctcttcctgat-------gttcataa--tagtaatgagagttttgaaattgatgttgatgttttgggagggtgtctttgcatgact 9321099  T
Q  230 gtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
        ||||  ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9321098 ---tattacgaaactacaaaagttgatgtttgggtgatgaaagaatatggttctagagatagttggtgtaaacttttta 9321023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 8573316 - 8573606
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  8573316 tgggggtttttgttcagaattctcttcactgggttatggccaagaaacttgatgggtcatatccttggttaattgtcgcatttaacctcacacttgaaat 8573415  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaat---aggtgaagaagttaa---------tggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgt 217  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||| |   ||||||||| |||||         |  || ||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  8573416 tttctacgaggttcctcttcctgttgaattagaaggtgaagaggttaacagtaatagtaatgggagttttaaatttcgtcttgctgttttgggtgggtgt 8573515  T
Q  218 ctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||||||||  ||||  ||||| ||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  8573516 ctttgtatgtctgtgaattatgaaaccactgaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggttctagagatagttggtgtaaacttttta 8573606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9274828 - 9274562
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||| | || |||||| || ||| |||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||    
T  9274828 tggggatttttgttgagaattctcttcactgggtaatgactagggaaattgatgagtcacacccttgtttaattgttgcgtttaacctaacacttgatat 9274729  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcact 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||            |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9274728 tttcaatgtggttcctcttcctga------------agaagtcaatagtgagagttttgaaattaatgttgttgttttggaagggtgtctttgtatgact 9274641  T
Q  230 gtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
     |  |||||  | ||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  9274640 ttgaattatcgaaatactgaatttgaagtttgggtgatgaaagaatatggttctacagatagttggtgtaaacttttta 9274562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 12012363 - 12012647
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |     ||||| | |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||  |    
T  12012363 tgggagtttttgttgagaattctcttcattggataacggtgaagaatcctgatgggttacatccccgtttaattgtcgcgtttaacctaacacttgagct 12012462  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaata---ggtgaagaagttaatggtgagagt---tttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgt 223  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||| |||| | || | |||   |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12012463 tttcaatgaggttccatttcctgatgaaatatgaggtgaagaggttatttgtaatagtagttttgaaatttctgttgctgatttgggagggtgtctttgt 12012562  T
Q  224 atcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    || | |||  || || ||  |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  12012563 atgattgtgaatcatcaaactactaagattgatgtattggtgatgaaagaatatggttgtaaagatagttggtgtaaacttttta 12012647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 9284007 - 9284291
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | | | || |||||||||| ||||||||||  |||| ||  |    
T  9284007 tgggggtttttgttgagaattctattcactggataatggaaaagaatcttgatgggtcagacctttgtttaattgtcgcgtttaacctaacactagaggt 9284106  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatg---aaataggtgaagaagt---taatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgt 223  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||    || |||||| || ||   ||||  | ||||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  9284107 tttcaaagaggttcctcttcctgctgttataagaggtgaggaggtaaataataatcagagttttgaccttgaggttgctgttttaggaggttgtcttagt 9284206  T
Q  224 atcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    || | |||  ||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  9284207 atgattgtgaattatcaaactactaaaattgacgtttgggtgatgaaagaatatggttctagagatagttggtgtaaaattttta 9284291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9316341 - 9316089
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||| || ||  ||| | || ||| |||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  9316341 tgggggtttttgttcagaattctcttcactgggtaatgactcagcaaagtgaagagtcacacccttgtttcattgtcgcgtttaacctaacacttgagat 9316242  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaatag---gtgaagaagttaat------ggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctt 220  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||  ||| ||||||       ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9316241 tttcaatgtggttcctcttcctgctgaaatagaaagtatagaggttaatagtgagtgtgagagttttcaaattgctgttgctgttttgggagggtgtctt 9316142  T
Q  221 tgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga 273  Q
    ||||| | | |  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9316141 tgtatgattttgaattatcaaactactaaaactgatgtttgggtgatgaaaga 9316089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 11987403 - 11987586
Alignment:
Q  129 ttttcaatgaggttcctcttcctgatgaaatagg------tgaagaagtta---atggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtct 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||      |||||| ||||   || |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11987403 ttttcaatgaggttccttttcctcatgaaataggaggaggtgaagaggttactaatagtgcaagttttgaaattgatgttgctgttttgggagggtgtct 11987502  T
Q  220 ttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaactttt 305  Q
    |||| | |||||  || || |   |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11987503 ttgtttgactgtgaatcatca---tactaagattgatatttgggtgatgaaagaatatggatgtagagatagttggtgtaaactttt 11987586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Original strand, 7115499 - 7115743
Alignment:
Q  75 gaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaattttcaatgaggttcctcttcctgatgaaatagg---tgaagaa 169  Q
    ||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||    
T  7115499 gaaacttgatgagtcacacccttgtttaattgtcgcgtttaacctaacacttgagcgtttcattgaggttcctcttcctgatgaattaggaggtgaaaaa 7115598  T
Q  170 gttaa------tggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttagg 263  Q
    |||||      |||| |  || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |  ||||||||  ||||||| ||    
T  7115599 gttaacagtgatggtaatggtattgaactttctattgctgttttgggagggtgtctttgtatgattgtgaattatagaactactaaaacagatgtttggg 7115698  T
Q  264 tgatgaaa-gatatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  7115699 tgatgaaacaatatggatctagagacagctggtgtaaacttttta 7115743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9292090 - 9291978
Alignment:
Q  196 tgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaa-gatatggatgcagagatagttgg 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  9292090 tgttgctgttttaggagagtgtctttgtatgactgtgaattatgaaactactaaaattgatgtttgggtgatgaaacaatatggttctagagatagttgg 9291991  T
Q  295 tgtaaacttttta 307  Q
    |||||||||||||    
T  9291990 tgtaaacttttta 9291978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9364800 - 9364676
Alignment:
Q  177 gtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-ata 275  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9364800 gtgagagttttgaaatcgatgttgcggttttgggagggtgtcttagtatgattgtgaattatcaaactactcaaattgatgtttgggtgatgaaagaata 9364701  T
Q  276 tggatgcagagatagttggtgtaaa 300  Q
    |||||  | ||||||||||||||||    
T  9364700 tggattaaaagatagttggtgtaaa 9364676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 12018937 - 12018989
Alignment:
Q  256 tgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12018937 tgtttgggtgatgaaagaatatggatgtagagatagttggtgtaaacttttta 12018989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9292244 - 9292113
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||  || | ||| || || ||| |||| ||| |||||| | ||||||||  ||||||| |     
T  9292244 tgggggtttttgttcagaattctatccactgggtaatgactcggacaattgttgagtcacacccttgtttcattgtcgcttttaacctaacacttgagac 9292145  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaatag 161  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  9292144 tttcaatgtggttccttttcctgctgaaatag 9292113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0667 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0667
Description:

Target: scaffold0667; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4796 - 4512
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  4796 tgggggttttggttgaggattctattcactggataatggcaaagaaacttgatgggttacatccttctctaattgtcgcttttaacctaacacttgaaat 4697  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaa---gttaat---ggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||     ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4696 tttcaatgaggttcctcttcctgacgaaataggtgaagaagaggttaattcaaatgacagtgttgaaattgatgttgctgctttgggaggatgtctttgt 4597  T
Q  224 atcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaa-gatatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    || |||||  ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  4596 atgactgtgaattatgaaactactaaaattgatgtttgggtgatgaaacaatatggattaaaagatagttggtgtaaacttttta 4512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26575091 - 26574902
Alignment:
Q  119 tcacttgaaattttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtc 218  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  26575091 tcacttgagactttcaacgaggttcctcttcctgatgaaataggggaacaagttaatagtaagagttttaaaattcgtgttgctgatttaggagggtgtc 26574992  T
Q  219 tttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26574991 tttgtatgactgtggattataaagatactaaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggatgtagagatagttggtgtaaacttttta 26574902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Original strand, 29467610 - 29467881
Alignment:
Q  36 ggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacctca--cttgaaattttc 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||| |  ||||| ||||||    
T  29467610 ggtttttgttgagaattctcttcattggataatgaagaagaaacttgatgggttacaatcttgtttaattatcgcgtttaacctaaagcttgagattttc 29467709  T
Q  134 aatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactgtcg 233  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||   | | |||      
T  29467710 aatgaggttcctcttcc---tgaaataggttatgaagttaatgttgagagttttaaaattgatgttgcggttttgggagggtgtctttagttgattgtga 29467806  T
Q  234 attataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||||| ||  || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29467807 attatcaaactagtaaaattgatgtttggttgatgaaagaatatggatgtagagatagttggcgtaaacttttta 29467881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29423581 - 29423306
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||  |||  | |||  | |||||||  ||||||||||  ||| ||| ||    
T  29423581 tgggggtttttgttgagaattctcttcactggataatgacggagaaacttgatccgttgaaacctcgtgtaattgttgcgtttaacctaacacatgagat 29423482  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcact 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||    
T  29423481 tttcaatgaggttccttttcctga---aattggtgaagaagtgaatagtgagagttttgaaattggtgttgcggttctggaagggtgcctttgtatgact 29423385  T
Q  230 gtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||  ||||| ||  |  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29423384 gtgaattatcaaactgttaaaattgatgtttggctgatgaaagaatatggatgtagagatagctggtgtaaacttttta 29423306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 307
Target Start/End: Original strand, 29453131 - 29453405
Alignment:
Q  33 gggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  |||||||| |  ||| ||  ||  | |||||||  ||||||||||  |||  || |||    
T  29453131 gggggtttttgttgagaattctcttcactggataatgactcggaaacttggtcagttgcaatctcgtgtaattgttgcgtttaacctaacacacgagatt 29453230  T
Q  131 ttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  29453231 ttcaatgaggttccttttcctga---aataggtgaagaagtgaatagtgagagttttgaaattggtgttgcggttttggaagggtgtctttgtatgattg 29453327  T
Q  231 tcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-atatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    |  ||||| ||  |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  29453328 tgaattatcaaactgttaaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggatgtagagatagctggtgtgaacttttta 29453405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 29443147 - 29443422
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||  ||| || |||  |  ||||||| ||||||||||  |||| || ||    
T  29443147 tgggggattttgttgagaattcccttcactgggtaatgactcggaaacttgatctgttgcaacctcgtgcaattgtcgcgtttaacctaacactcgagat 29443246  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcact 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | || | ||| ||| ||||||||||||||| | |    
T  29443247 tttcaatgaggttccttttcctga---aataggtgaagatgttaatagtgagagttttcaaattggtatttcggttctggaagggtgtctttgtatgatt 29443343  T
Q  230 gtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    ||  ||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29443344 gtgaattatcaaactgctaaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggatgtagagatagctggtgtaaacttttta 29443422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 307
Target Start/End: Original strand, 41966540 - 41966806
Alignment:
Q  32 tgggggtttttgttgagaattctattcactggattattactaagaaacttgatgggttacatccttctttaattgtcacgtttaacct--cacttgaaat 129  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  41966540 tgggggtttttgttcacaattctcttcactggataatgaccaaggaacttgatggattacacccttgtttaattgtcgcgtttaacctaacacttgagat 41966639  T
Q  130 tttcaatgaggttcctcttcctgatgaaataggtgaagaagttaatggtgagagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcact 229  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || |            || ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||   |    
T  41966640 tttcaaccaggttcctcttcctgctgaaataggtcaaaa------------gaattttgaaatttctgtttctgttttgggagggtgtctttgtatggtt 41966727  T
Q  230 gtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    || |||||| ||  ||   |  ||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  41966728 gtggattatcaaactagcgatgttgatgtttgggtgatgaaagaatatcgatctagagatagctggtgtaaacttttta 41966806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37462661 - 37462533
Alignment:
Q  180 agagttttgaagttcatgttgctgttttgggagggtgtctttgtatcactgtcgattataaaga---tactaaaattgatgtttaggtgatgaaag-ata 275  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |   ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  37462661 agagttttggacttgatgttgctgttttgggaggctgtctttgtatgactgtgaattataaaaaaactactaaatttgatgtttgggtgatgaaagaata 37462562  T
Q  276 tggatgcagagatagttggtgtaaacttt 304  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37462561 tggatctagagatagttggtgtaaacttt 37462533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45238055 - 45237991
Alignment:
Q  244 tactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45238055 tactcaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggatctagagatagttggtgtaaacttttta 45237991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45243845 - 45243740
Alignment:
Q  203 gttttgggagggtgtctttgtatcactgtcgattataaagatactaaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaac 301  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||  ||||| ||  || | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  45243845 gttttgggagagtgtctttgtatgattgtgaattatcaaactaatgaaattgatgtttgggtgatgaaagaatatggttctagagatatttggtgtaaac 45243746  T
Q  302 ttttta 307  Q
    ||||||    
T  45243745 ttttta 45243740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45230528 - 45230473
Alignment:
Q  253 tgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaacttttta 307  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  45230528 tgatgtttgggtgatgaaagaatatggttctagagatagttggtgtaaacttttta 45230473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36224520 - 36224466
Alignment:
Q  247 taaaattgatgtttaggtgatgaaaga-tatggatgcagagatagttggtgtaaa 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  36224520 taaatttgatgtttgggtgatgaaagaatatggatttagagatagttggtgtaaa 36224466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University