View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6503_low_4 (Length: 490)

Name: NF6503_low_4
Description: NF6503
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6503_low_4
NF6503_low_4
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (20-472)||(30476103-30476555)
chr1 (163-473)||(28220026-28220336)
chr1 (163-473)||(28223221-28223531)
chr1 (192-473)||(3156923-3157205)
chr1 (163-473)||(50166980-50167285)
chr1 (163-473)||(833970-834277)
chr1 (163-473)||(13137780-13138086)
chr1 (163-473)||(28265359-28265664)
chr1 (163-473)||(37559664-37559978)
chr1 (163-472)||(196710-197017)
chr1 (163-473)||(45644158-45644464)
chr1 (163-473)||(49918408-49918718)
chr1 (163-457)||(3846921-3847215)
chr1 (163-474)||(44455217-44455528)
chr1 (163-473)||(31659296-31659606)
chr1 (186-473)||(50169037-50169320)
chr1 (163-473)||(40122001-40122308)
chr1 (163-473)||(4552448-4552747)
chr1 (163-454)||(37503362-37503648)
chr1 (167-473)||(3189388-3189708)
chr1 (167-473)||(3198205-3198525)
chr1 (167-473)||(3207044-3207364)
chr1 (163-473)||(8550584-8550897)
chr1 (162-473)||(1833580-1833877)
chr1 (163-473)||(10925281-10925590)
chr1 (163-473)||(46064976-46065278)
chr1 (165-473)||(13659153-13659446)
chr1 (163-474)||(23555071-23555376)
chr1 (163-474)||(41360971-41361278)
chr1 (163-473)||(16455679-16455984)
chr1 (186-473)||(20762730-20763014)
chr1 (162-473)||(13316150-13316462)
chr1 (161-473)||(927783-928086)
chr1 (165-473)||(15820365-15820659)
chr1 (350-473)||(19754553-19754676)
chr1 (257-455)||(51765472-51765670)
chr1 (353-473)||(19752744-19752864)
chr1 (364-473)||(193669-193778)
chr1 (364-469)||(13547090-13547195)
chr1 (364-473)||(13549001-13549110)
chr1 (364-473)||(37168355-37168465)
chr1 (360-473)||(42297971-42298085)
chr1 (372-473)||(11348756-11348857)
chr1 (364-473)||(31925708-31925817)
chr1 (364-473)||(47255340-47255450)
chr1 (364-473)||(7482231-7482341)
chr1 (364-473)||(29136305-29136415)
chr1 (373-473)||(34603634-34603735)
chr1 (315-445)||(36683766-36683892)
chr1 (364-457)||(37876767-37876860)
chr1 (360-473)||(37033068-37033183)
chr1 (364-454)||(28242382-28242472)
chr1 (364-473)||(47115229-47115340)
chr1 (346-473)||(40282435-40282564)
chr1 (206-331)||(8870570-8870695)
chr1 (338-407)||(19072907-19072976)
chr1 (338-407)||(19120797-19120866)
chr1 (346-445)||(20622218-20622319)
chr1 (403-473)||(6808510-6808581)
chr1 (360-445)||(9987287-9987373)
chr1 (295-473)||(44650101-44650273)
chr1 (168-440)||(5459997-5460262)
chr1 (346-473)||(9036474-9036603)
chr1 (338-407)||(26644946-26645016)
chr1 (343-428)||(37069753-37069838)
chr1 (338-407)||(13598378-13598446)
chr1 (346-445)||(21054044-21054145)
chr1 (402-473)||(22079374-22079446)
chr1 (394-455)||(13938213-13938273)
chr1 (403-472)||(9109459-9109529)
chr1 (338-428)||(9476241-9476329)
chr1 (360-440)||(44203722-44203804)
chr1 (338-428)||(47703965-47704053)
chr1 (338-427)||(775652-775739)
chr1 (346-431)||(8871045-8871130)
chr1 (338-407)||(29651791-29651859)
chr1 (295-434)||(44646743-44646875)
chr1 (338-407)||(47098873-47098941)
chr1 (338-407)||(47102890-47102958)
chr1 (343-407)||(16124565-16124628)
chr1 (338-428)||(21536598-21536688)
chr1 (338-407)||(3281686-3281756)
chr1 (343-428)||(27104401-27104484)
chr1 (405-472)||(2263016-2263084)
chr1 (363-407)||(12302507-12302551)
chr1 (413-472)||(32471519-32471579)
chr1 (343-428)||(13604652-13604737)
chr1 (338-384)||(32889419-32889464)
chr1 (402-455)||(37282730-37282784)
chr1 (403-455)||(2926584-2926637)
chr1 (363-407)||(2510327-2510371)
chr1 (363-407)||(6823249-6823293)
chr1 (363-407)||(10399830-10399874)
chr1 (363-407)||(13358808-13358852)
chr1 (363-407)||(15294836-15294880)
chr1 (363-407)||(17324638-17324682)
chr1 (202-234)||(20622071-20622103)
chr1 (363-407)||(24325898-24325942)
chr1 (363-407)||(27336942-27336986)
chr1 (363-407)||(28207070-28207114)
chr1 (363-407)||(28840914-28840958)
chr1 (363-407)||(28998255-28998299)
chr1 (363-407)||(29003971-29004015)
chr1 (363-407)||(31735523-31735567)
chr1 (363-407)||(39462754-39462798)
chr1 (363-407)||(50307548-50307592)
chr1 (363-407)||(51750274-51750318)
chr1 (363-407)||(51752598-51752642)
chr1 (202-234)||(51765697-51765729)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (163-474)||(43036480-43036791)
chr8 (163-473)||(15212844-15213155)
chr8 (163-473)||(30143398-30143708)
chr8 (163-473)||(4731716-4732026)
chr8 (163-473)||(33352208-33352518)
chr8 (163-473)||(12702431-12702744)
chr8 (163-472)||(40321139-40321442)
chr8 (163-473)||(5689329-5689635)
chr8 (163-473)||(6599030-6599333)
chr8 (163-473)||(6674483-6674786)
chr8 (202-473)||(27811336-27811608)
chr8 (167-473)||(3303474-3303780)
chr8 (165-473)||(41366420-41366724)
chr8 (163-473)||(1345176-1345481)
chr8 (186-473)||(42498252-42498541)
chr8 (203-453)||(4733784-4734035)
chr8 (163-445)||(4743027-4743296)
chr8 (187-472)||(34254154-34254440)
chr8 (187-472)||(34256330-34256616)
chr8 (163-472)||(17982712-17983021)
chr8 (202-473)||(44303913-44304185)
chr8 (163-474)||(19491503-19491810)
chr8 (202-473)||(1746057-1746328)
chr8 (186-473)||(31218315-31218603)
chr8 (160-473)||(10015139-10015446)
chr8 (206-473)||(1292311-1292573)
chr8 (240-473)||(18141878-18142105)
chr8 (186-455)||(19945181-19945451)
chr8 (279-473)||(30291665-30291856)
chr8 (163-473)||(18105876-18106188)
chr8 (353-474)||(40221802-40221923)
chr8 (362-473)||(10930198-10930309)
chr8 (162-472)||(8965491-8965800)
chr8 (344-473)||(9765803-9765931)
chr8 (364-473)||(42434992-42435101)
chr8 (353-473)||(18655458-18655578)
chr8 (196-455)||(3073710-3073965)
chr8 (364-473)||(4283582-4283691)
chr8 (161-455)||(2627811-2628110)
chr8 (364-473)||(4162555-4162663)
chr8 (353-473)||(11384043-11384163)
chr8 (371-473)||(3772250-3772352)
chr8 (163-326)||(3050925-3051090)
chr8 (402-474)||(40328836-40328909)
chr8 (349-473)||(8153816-8153940)
chr8 (402-473)||(44353851-44353922)
chr8 (163-330)||(8153984-8154147)
chr8 (267-473)||(3439561-3439770)
chr8 (397-473)||(7597672-7597749)
chr8 (360-473)||(25690012-25690126)
chr8 (342-428)||(26403259-26403343)
chr8 (160-437)||(29796128-29796394)
chr8 (163-360)||(32901989-32902180)
chr8 (412-454)||(10929865-10929907)
chr8 (343-407)||(5702532-5702595)
chr8 (402-473)||(11712039-11712111)
chr8 (402-473)||(32902212-32902284)
chr8 (338-428)||(19175783-19175873)
chr8 (411-474)||(30909425-30909487)
chr8 (345-407)||(4696645-4696706)
chr8 (338-384)||(6813662-6813708)
chr8 (338-384)||(19752466-19752511)
chr8 (338-384)||(23799649-23799694)
chr8 (345-428)||(31071258-31071342)
chr8 (363-407)||(609025-609069)
chr8 (343-428)||(7412323-7412409)
chr8 (363-407)||(22684653-22684697)
chr8 (363-407)||(27827276-27827320)
chr8 (404-440)||(38863949-38863985)
chr8 (338-428)||(4456006-4456096)
chr8 (338-384)||(6127200-6127246)
chr8 (360-440)||(42575320-42575402)
chr8 (363-405)||(43530408-43530450)
chr8 (369-440)||(15290614-15290687)
chr8 (369-440)||(15470983-15471056)
chr8 (402-473)||(1822350-1822422)
chr8 (402-473)||(1856795-1856867)
chr8 (363-407)||(3874301-3874345)
chr8 (363-407)||(4424309-4424353)
chr8 (363-407)||(14419190-14419234)
chr8 (363-407)||(14808052-14808096)
chr8 (363-407)||(18810998-18811042)
chr8 (363-407)||(27829587-27829631)
chr8 (363-407)||(30480503-30480547)
[»] chr4 (112 HSPs)
chr4 (163-474)||(26175436-26175747)
chr4 (163-473)||(12739353-12739660)
chr4 (163-473)||(12743728-12744035)
chr4 (163-473)||(46147195-46147501)
chr4 (163-473)||(9927258-9927568)
chr4 (163-473)||(48893443-48893748)
chr4 (162-473)||(37740683-37740995)
chr4 (163-473)||(34570214-34570524)
chr4 (163-473)||(36463196-36463499)
chr4 (166-473)||(47038219-47038520)
chr4 (165-473)||(52467159-52467464)
chr4 (163-472)||(29254553-29254861)
chr4 (165-473)||(56178438-56178747)
chr4 (163-473)||(45686987-45687292)
chr4 (163-471)||(5871880-5872183)
chr4 (222-473)||(5429737-5429989)
chr4 (226-473)||(36994582-36994824)
chr4 (162-473)||(54199707-54200016)
chr4 (186-473)||(5369904-5370193)
chr4 (163-473)||(48143101-48143417)
chr4 (163-473)||(52095162-52095472)
chr4 (162-474)||(6541986-6542290)
chr4 (163-473)||(31474209-31474512)
chr4 (315-473)||(12745266-12745424)
chr4 (163-474)||(52082463-52082768)
chr4 (163-473)||(4588017-4588320)
chr4 (202-473)||(13992129-13992402)
chr4 (353-473)||(27416955-27417075)
chr4 (276-473)||(29999723-29999917)
chr4 (362-473)||(54883078-54883189)
chr4 (165-451)||(37229531-37229809)
chr4 (362-473)||(26364294-26364405)
chr4 (177-451)||(5207665-5207930)
chr4 (364-473)||(6656014-6656123)
chr4 (364-473)||(50673848-50673957)
chr4 (341-473)||(3913506-3913637)
chr4 (349-469)||(13009430-13009550)
chr4 (372-473)||(35662499-35662600)
chr4 (364-473)||(40632503-40632612)
chr4 (373-473)||(8665466-8665566)
chr4 (364-473)||(12073450-12073560)
chr4 (364-473)||(8648197-8648306)
chr4 (372-473)||(41639484-41639585)
chr4 (297-455)||(51337140-51337294)
chr4 (369-455)||(41964492-41964578)
chr4 (360-473)||(2209771-2209886)
chr4 (403-474)||(12745476-12745547)
chr4 (403-473)||(12744087-12744157)
chr4 (360-473)||(50262697-50262811)
chr4 (362-474)||(21688306-21688418)
chr4 (267-473)||(31495209-31495428)
chr4 (371-473)||(379438-379541)
chr4 (369-473)||(26699447-26699553)
chr4 (405-473)||(24969170-24969238)
chr4 (402-473)||(12747795-12747866)
chr4 (364-473)||(46703558-46703669)
chr4 (276-474)||(29056415-29056609)
chr4 (163-409)||(24969787-24970030)
chr4 (362-473)||(12119597-12119709)
chr4 (338-407)||(3796568-3796637)
chr4 (360-473)||(8393451-8393566)
chr4 (360-473)||(8395660-8395775)
chr4 (402-473)||(33989902-33989974)
chr4 (338-428)||(38152468-38152556)
chr4 (338-407)||(10047359-10047427)
chr4 (338-407)||(39245974-39246042)
chr4 (308-455)||(21703784-21703928)
chr4 (186-244)||(29999651-29999709)
chr4 (402-455)||(33089954-33090008)
chr4 (338-428)||(36315258-36315346)
chr4 (338-428)||(36329467-36329555)
chr4 (364-471)||(44967829-44967937)
chr4 (345-400)||(31985689-31985745)
chr4 (338-428)||(5396700-5396790)
chr4 (404-473)||(22882791-22882861)
chr4 (404-473)||(22934455-22934525)
chr4 (338-384)||(54867164-54867209)
chr4 (338-407)||(5269240-5269308)
chr4 (163-236)||(5350197-5350268)
chr4 (343-428)||(16623322-16623405)
chr4 (310-451)||(48142327-48142466)
chr4 (338-384)||(3777529-3777574)
chr4 (360-440)||(5136155-5136237)
chr4 (360-440)||(5138380-5138462)
chr4 (338-384)||(5147657-5147702)
chr4 (196-242)||(5280626-5280672)
chr4 (404-473)||(6677527-6677597)
chr4 (210-268)||(51338334-51338392)
chr4 (338-407)||(5143239-5143307)
chr4 (343-428)||(16630709-16630792)
chr4 (276-329)||(39593649-39593702)
chr4 (338-407)||(42599623-42599691)
chr4 (363-407)||(4215595-4215639)
chr4 (363-407)||(5635476-5635520)
chr4 (337-397)||(6743474-6743532)
chr4 (363-407)||(6765133-6765177)
chr4 (363-407)||(7941612-7941656)
chr4 (363-407)||(8631419-8631463)
chr4 (363-407)||(14789428-14789472)
chr4 (363-407)||(16455531-16455575)
chr4 (363-407)||(17662245-17662289)
chr4 (363-407)||(22800862-22800906)
chr4 (363-407)||(24879279-24879323)
chr4 (363-407)||(24880741-24880785)
chr4 (363-407)||(24889085-24889129)
chr4 (202-234)||(31495142-31495174)
chr4 (427-474)||(32091535-32091583)
chr4 (410-473)||(34112875-34112939)
chr4 (363-407)||(37089372-37089416)
chr4 (363-407)||(38928177-38928221)
chr4 (363-407)||(40637363-40637407)
chr4 (163-215)||(41639749-41639801)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (163-473)||(14069633-14069943)
chr7 (163-473)||(14379661-14379971)
chr7 (161-473)||(41317236-41317544)
chr7 (163-473)||(47675936-47676246)
chr7 (162-473)||(31732767-31733079)
chr7 (163-473)||(47673744-47674053)
chr7 (162-473)||(19502236-19502548)
chr7 (163-473)||(27347875-27348185)
chr7 (163-473)||(41648814-41649121)
chr7 (167-473)||(43864302-43864609)
chr7 (163-473)||(4586219-4586530)
chr7 (163-473)||(18126702-18127015)
chr7 (164-473)||(48489489-48489798)
chr7 (163-472)||(26417375-26417685)
chr7 (163-473)||(8153400-8153705)
chr7 (163-457)||(36146212-36146502)
chr7 (163-473)||(23555098-23555410)
chr7 (163-473)||(38671025-38671332)
chr7 (161-473)||(31105198-31105503)
chr7 (163-458)||(24525306-24525597)
chr7 (163-473)||(1113715-1114021)
chr7 (160-473)||(25615911-25616226)
chr7 (163-473)||(48491637-48491944)
chr7 (158-473)||(495783-496093)
chr7 (186-473)||(29991111-29991399)
chr7 (193-473)||(35853972-35854255)
chr7 (294-473)||(2759128-2759307)
chr7 (205-474)||(23564910-23565172)
chr7 (186-473)||(4178832-4179119)
chr7 (163-468)||(31518965-31519258)
chr7 (281-427)||(12097789-12097931)
chr7 (257-473)||(39731426-39731642)
chr7 (163-473)||(23344033-23344332)
chr7 (351-473)||(2360960-2361082)
chr7 (202-455)||(25766795-25767052)
chr7 (349-473)||(30024718-30024842)
chr7 (338-473)||(22270031-22270166)
chr7 (202-455)||(48408879-48409137)
chr7 (364-473)||(32358055-32358164)
chr7 (353-473)||(34310705-34310826)
chr7 (217-321)||(30024610-30024714)
chr7 (362-473)||(6359951-6360062)
chr7 (338-437)||(30814530-30814628)
chr7 (372-473)||(29608795-29608896)
chr7 (163-473)||(36574324-36574626)
chr7 (369-473)||(6432029-6432133)
chr7 (364-473)||(3259053-3259162)
chr7 (364-473)||(48599335-48599444)
chr7 (276-473)||(43504064-43504266)
chr7 (162-473)||(4253334-4253639)
chr7 (360-473)||(2390340-2390453)
chr7 (364-473)||(4508707-4508816)
chr7 (364-474)||(8359316-8359428)
chr7 (364-473)||(4510549-4510658)
chr7 (364-473)||(4512391-4512500)
chr7 (166-283)||(12096969-12097084)
chr7 (360-473)||(20343954-20344068)
chr7 (369-473)||(22328395-22328501)
chr7 (346-445)||(1560647-1560749)
chr7 (338-428)||(29159783-29159871)
chr7 (338-407)||(9190057-9190125)
chr7 (338-407)||(20284069-20284137)
chr7 (346-445)||(24789927-24790028)
chr7 (397-472)||(5116663-5116739)
chr7 (421-469)||(31518857-31518905)
chr7 (205-385)||(40808734-40808909)
chr7 (360-440)||(18388756-18388838)
chr7 (360-440)||(18392192-18392274)
chr7 (338-407)||(2580370-2580438)
chr7 (364-455)||(18396393-18396486)
chr7 (338-407)||(46516359-46516427)
chr7 (163-215)||(6430444-6430496)
chr7 (371-472)||(3904624-3904726)
chr7 (343-405)||(4796718-4796779)
chr7 (338-384)||(5817341-5817387)
chr7 (360-440)||(6592336-6592418)
chr7 (360-440)||(6594554-6594636)
chr7 (360-440)||(32060318-32060400)
chr7 (343-400)||(55933-55989)
chr7 (338-407)||(33332499-33332567)
chr7 (346-406)||(47263664-47263725)
chr7 (360-428)||(21983285-21983352)
chr7 (343-399)||(21988893-21988948)
chr7 (363-407)||(42330997-42331041)
chr7 (345-407)||(35960803-35960864)
chr7 (343-428)||(44848713-44848798)
chr7 (363-407)||(1049296-1049340)
chr7 (346-397)||(2479323-2479375)
chr7 (363-407)||(3035969-3036013)
chr7 (163-215)||(4510339-4510391)
chr7 (163-215)||(4512181-4512233)
chr7 (363-407)||(7471980-7472024)
chr7 (338-384)||(9185237-9185280)
chr7 (363-407)||(11759372-11759416)
chr7 (363-407)||(13099474-13099518)
chr7 (363-407)||(20299705-20299749)
chr7 (363-407)||(20626283-20626327)
chr7 (363-407)||(20630174-20630218)
chr7 (363-407)||(20642593-20642637)
chr7 (363-407)||(38394231-38394275)
chr7 (363-407)||(40836743-40836787)
chr7 (363-407)||(40946573-40946617)
chr7 (363-407)||(44724824-44724868)
chr7 (363-407)||(48457898-48457942)
[»] chr5 (90 HSPs)
chr5 (170-473)||(42428237-42428540)
chr5 (163-472)||(28750455-28750764)
chr5 (163-473)||(42426035-42426345)
chr5 (165-473)||(32636882-32637190)
chr5 (165-473)||(538083-538387)
chr5 (163-473)||(13488261-13488569)
chr5 (164-473)||(13239809-13240118)
chr5 (160-473)||(39468345-39468659)
chr5 (163-440)||(19806454-19806729)
chr5 (163-473)||(30682722-30683034)
chr5 (202-472)||(37439200-37439470)
chr5 (163-473)||(533827-534127)
chr5 (163-473)||(8565748-8566056)
chr5 (161-473)||(33831738-33832048)
chr5 (163-472)||(31183031-31183341)
chr5 (196-473)||(16452138-16452410)
chr5 (202-473)||(25412818-25413090)
chr5 (163-415)||(5887235-5887486)
chr5 (202-473)||(13343119-13343390)
chr5 (202-473)||(30182646-30182918)
chr5 (187-473)||(36073866-36074152)
chr5 (163-458)||(42926964-42927260)
chr5 (163-389)||(16649635-16649856)
chr5 (186-473)||(16409532-16409825)
chr5 (163-473)||(26177939-26178255)
chr5 (364-473)||(40147319-40147428)
chr5 (349-473)||(28278374-28278498)
chr5 (163-473)||(9789021-9789335)
chr5 (338-473)||(38747063-38747197)
chr5 (364-473)||(213523-213633)
chr5 (364-457)||(5058119-5058212)
chr5 (267-445)||(26170848-26171030)
chr5 (218-473)||(9049209-9049452)
chr5 (314-473)||(18441594-18441759)
chr5 (350-457)||(27015597-27015704)
chr5 (332-473)||(3075629-3075768)
chr5 (357-473)||(42309929-42310045)
chr5 (308-473)||(13695639-13695801)
chr5 (369-474)||(27637618-27637724)
chr5 (362-473)||(316820-316933)
chr5 (364-455)||(16640941-16641029)
chr5 (362-473)||(33906028-33906141)
chr5 (163-243)||(3075549-3075629)
chr5 (346-473)||(10593315-10593445)
chr5 (360-473)||(29751156-29751270)
chr5 (338-428)||(10281730-10281819)
chr5 (346-473)||(29720422-29720551)
chr5 (346-473)||(29722582-29722711)
chr5 (360-473)||(22536286-22536400)
chr5 (343-428)||(9353361-9353446)
chr5 (343-428)||(36932379-36932464)
chr5 (338-407)||(17004009-17004077)
chr5 (430-473)||(42926925-42926968)
chr5 (360-440)||(25078211-25078293)
chr5 (360-440)||(25136180-25136262)
chr5 (338-384)||(31300668-31300713)
chr5 (360-440)||(40380181-40380263)
chr5 (360-440)||(40382392-40382474)
chr5 (158-215)||(40147558-40147615)
chr5 (338-397)||(14520208-14520268)
chr5 (397-455)||(10054850-10054909)
chr5 (346-428)||(15464518-15464600)
chr5 (343-428)||(11917001-11917084)
chr5 (162-234)||(18441440-18441512)
chr5 (346-407)||(28832247-28832307)
chr5 (341-455)||(30793212-30793326)
chr5 (338-407)||(42127459-42127527)
chr5 (163-214)||(5058371-5058423)
chr5 (363-407)||(27910685-27910729)
chr5 (400-473)||(3325971-3326045)
chr5 (338-397)||(24553565-24553623)
chr5 (338-383)||(12084248-12084294)
chr5 (360-440)||(16544499-16544581)
chr5 (360-440)||(16546721-16546803)
chr5 (338-384)||(19588726-19588771)
chr5 (363-407)||(2175153-2175197)
chr5 (363-407)||(2724128-2724172)
chr5 (369-428)||(4160702-4160762)
chr5 (363-407)||(6747539-6747583)
chr5 (363-407)||(10529099-10529143)
chr5 (363-407)||(18466919-18466963)
chr5 (363-407)||(21684452-21684496)
chr5 (363-407)||(24127091-24127135)
chr5 (363-407)||(25921473-25921517)
chr5 (363-407)||(27912771-27912815)
chr5 (363-407)||(34477053-34477097)
chr5 (363-407)||(34479418-34479462)
chr5 (363-407)||(39798282-39798326)
chr5 (363-407)||(40221758-40221802)
chr5 (166-270)||(42309827-42309930)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (163-473)||(723547-723854)
chr2 (163-473)||(34139573-34139881)
chr2 (171-474)||(38312297-38312600)
chr2 (163-473)||(29867927-29868237)
chr2 (163-473)||(17057169-17057479)
chr2 (163-473)||(17085152-17085462)
chr2 (163-473)||(33162254-33162560)
chr2 (163-474)||(36987875-36988187)
chr2 (162-473)||(2334217-2334528)
chr2 (162-473)||(11151394-11151701)
chr2 (163-473)||(42362410-42362713)
chr2 (202-473)||(11067363-11067630)
chr2 (163-473)||(14633628-14633936)
chr2 (163-473)||(36773620-36773926)
chr2 (163-474)||(36317813-36318120)
chr2 (163-437)||(39284930-39285202)
chr2 (163-473)||(6594804-6595116)
chr2 (163-473)||(11690559-11690856)
chr2 (186-473)||(45099813-45100100)
chr2 (186-473)||(4502955-4503242)
chr2 (163-446)||(14202224-14202495)
chr2 (180-473)||(5723072-5723366)
chr2 (193-473)||(36205494-36205774)
chr2 (163-452)||(11049633-11049912)
chr2 (202-473)||(4484166-4484441)
chr2 (163-336)||(24885781-24885953)
chr2 (207-473)||(26353242-26353495)
chr2 (257-472)||(30833404-30833619)
chr2 (163-336)||(2838141-2838313)
chr2 (162-473)||(32289621-32289938)
chr2 (306-473)||(17490095-17490258)
chr2 (364-473)||(35446885-35446994)
chr2 (364-473)||(45726987-45727096)
chr2 (366-473)||(42288114-42288220)
chr2 (163-473)||(7815086-7815383)
chr2 (372-473)||(1631741-1631842)
chr2 (364-473)||(7451176-7451284)
chr2 (258-407)||(1345590-1345733)
chr2 (165-472)||(13121828-13122124)
chr2 (353-438)||(17450671-17450755)
chr2 (362-473)||(24398115-24398228)
chr2 (360-473)||(6266749-6266863)
chr2 (364-473)||(33648229-33648340)
chr2 (338-428)||(34682363-34682451)
chr2 (338-428)||(10445473-10445561)
chr2 (206-331)||(12123434-12123557)
chr2 (338-407)||(14699056-14699124)
chr2 (338-407)||(20522200-20522268)
chr2 (360-445)||(13656028-13656115)
chr2 (403-473)||(42019910-42019983)
chr2 (360-440)||(12647382-12647464)
chr2 (338-428)||(13569308-13569396)
chr2 (338-428)||(34388838-34388926)
chr2 (338-407)||(33528670-33528738)
chr2 (338-407)||(39482911-39482979)
chr2 (308-440)||(28672022-28672151)
chr2 (343-407)||(31056028-31056092)
chr2 (398-473)||(42261520-42261596)
chr2 (345-428)||(8390179-8390260)
chr2 (346-428)||(28259206-28259288)
chr2 (338-400)||(36757818-36757881)
chr2 (338-400)||(16940265-16940326)
chr2 (338-400)||(17010930-17010991)
chr2 (338-400)||(21629924-21629985)
chr2 (353-473)||(30218033-30218155)
chr2 (402-432)||(42412117-42412147)
chr2 (163-236)||(1346446-1346518)
chr2 (410-474)||(7597057-7597122)
chr2 (359-428)||(8040060-8040128)
chr2 (338-407)||(17865183-17865251)
chr2 (344-428)||(23078499-23078583)
chr2 (338-407)||(33118116-33118184)
chr2 (363-407)||(3022383-3022427)
chr2 (363-407)||(5375346-5375390)
chr2 (363-407)||(6264148-6264192)
chr2 (360-428)||(10707281-10707348)
chr2 (363-407)||(11739559-11739603)
chr2 (363-407)||(13910045-13910089)
chr2 (363-407)||(19502011-19502055)
chr2 (363-407)||(23452237-23452281)
chr2 (363-407)||(27105008-27105052)
chr2 (202-234)||(30833646-30833678)
chr2 (162-234)||(41446431-41446501)
[»] chr3 (121 HSPs)
chr3 (163-473)||(29810926-29811237)
chr3 (163-473)||(29196189-29196496)
chr3 (163-473)||(39153164-39153471)
chr3 (163-473)||(760905-761211)
chr3 (163-473)||(51398872-51399182)
chr3 (163-455)||(40735459-40735750)
chr3 (163-472)||(23391712-23392018)
chr3 (163-473)||(29813121-29813430)
chr3 (163-473)||(40734556-40734865)
chr3 (163-473)||(44700284-44700588)
chr3 (163-473)||(9666270-9666576)
chr3 (163-473)||(31314503-31314808)
chr3 (163-473)||(5236257-5236566)
chr3 (177-473)||(7762323-7762620)
chr3 (163-473)||(7764522-7764834)
chr3 (182-473)||(19683706-19683999)
chr3 (163-473)||(22834807-22835112)
chr3 (163-473)||(9581340-9581652)
chr3 (181-473)||(29682417-29682707)
chr3 (162-473)||(37408516-37408828)
chr3 (163-457)||(23410131-23410423)
chr3 (177-473)||(16499087-16499368)
chr3 (163-473)||(32891162-32891458)
chr3 (202-473)||(5257982-5258254)
chr3 (186-473)||(45095221-45095509)
chr3 (186-474)||(9635946-9636237)
chr3 (202-473)||(5260161-5260433)
chr3 (202-473)||(32744295-32744546)
chr3 (345-473)||(34491270-34491398)
chr3 (162-373)||(21350810-21351014)
chr3 (278-473)||(53921422-53921613)
chr3 (360-472)||(40913352-40913464)
chr3 (359-473)||(44331603-44331717)
chr3 (187-473)||(23197767-23198049)
chr3 (160-437)||(2074880-2075149)
chr3 (187-473)||(23199960-23200248)
chr3 (362-473)||(30236183-30236294)
chr3 (362-473)||(46173415-46173526)
chr3 (163-430)||(27305519-27305777)
chr3 (372-472)||(6095608-6095708)
chr3 (364-473)||(4570010-4570120)
chr3 (362-472)||(47304310-47304420)
chr3 (364-473)||(54593762-54593871)
chr3 (160-360)||(9634618-9634818)
chr3 (360-473)||(49199465-49199580)
chr3 (360-470)||(43403740-43403852)
chr3 (346-473)||(801148-801279)
chr3 (163-355)||(51351941-51352125)
chr3 (314-473)||(7779951-7780114)
chr3 (353-473)||(46860532-46860653)
chr3 (360-473)||(43401797-43401912)
chr3 (402-470)||(55302011-55302079)
chr3 (396-472)||(36018911-36018987)
chr3 (364-473)||(41819523-41819633)
chr3 (338-407)||(1417529-1417597)
chr3 (338-407)||(3716041-3716109)
chr3 (276-440)||(33191922-33192081)
chr3 (400-472)||(51352148-51352219)
chr3 (360-473)||(6716557-6716671)
chr3 (338-428)||(8370505-8370595)
chr3 (360-473)||(54635182-54635296)
chr3 (345-407)||(25795767-25795829)
chr3 (343-428)||(27974971-27975056)
chr3 (338-407)||(30709829-30709899)
chr3 (338-407)||(21711203-21711271)
chr3 (338-407)||(26298968-26299036)
chr3 (345-428)||(27986465-27986548)
chr3 (360-445)||(45283071-45283158)
chr3 (360-440)||(3617540-3617622)
chr3 (335-472)||(4075443-4075581)
chr3 (338-407)||(1736344-1736412)
chr3 (394-472)||(4055796-4055874)
chr3 (338-407)||(18552922-18552990)
chr3 (404-472)||(35138746-35138815)
chr3 (345-428)||(32143306-32143389)
chr3 (343-407)||(40592821-40592884)
chr3 (338-428)||(16264328-16264418)
chr3 (430-473)||(31340268-31340311)
chr3 (346-428)||(33386685-33386767)
chr3 (338-400)||(39040038-39040101)
chr3 (360-440)||(25637517-25637599)
chr3 (343-428)||(27452941-27453026)
chr3 (345-407)||(37466278-37466339)
chr3 (163-236)||(37406985-37407057)
chr3 (362-472)||(20937715-20937826)
chr3 (343-407)||(48438199-48438262)
chr3 (338-377)||(3328425-3328463)
chr3 (338-405)||(36029073-36029139)
chr3 (163-209)||(4160059-4160105)
chr3 (360-440)||(4598519-4598601)
chr3 (338-428)||(6794732-6794820)
chr3 (360-440)||(10056309-10056391)
chr3 (360-440)||(10058531-10058613)
chr3 (360-440)||(10060753-10060835)
chr3 (360-440)||(10062975-10063057)
chr3 (360-440)||(10065197-10065279)
chr3 (360-440)||(10211485-10211567)
chr3 (428-458)||(31340242-31340272)
chr3 (345-402)||(35925468-35925526)
chr3 (345-407)||(47923945-47924006)
chr3 (163-234)||(801388-801463)
chr3 (363-407)||(458499-458543)
chr3 (363-407)||(1313624-1313668)
chr3 (363-407)||(1321694-1321738)
chr3 (363-407)||(3859742-3859786)
chr3 (363-407)||(5886413-5886457)
chr3 (363-407)||(5899886-5899930)
chr3 (363-407)||(6484575-6484619)
chr3 (363-407)||(7606586-7606630)
chr3 (363-407)||(10958321-10958365)
chr3 (345-397)||(24695213-24695264)
chr3 (363-407)||(25389120-25389164)
chr3 (345-428)||(26928620-26928702)
chr3 (363-407)||(27635656-27635700)
chr3 (363-407)||(32219300-32219344)
chr3 (363-407)||(35919113-35919157)
chr3 (363-407)||(41849274-41849318)
chr3 (363-407)||(42990519-42990563)
chr3 (363-407)||(42992485-42992529)
chr3 (363-407)||(43421413-43421457)
chr3 (363-407)||(53894055-53894099)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (192-473)||(9182859-9183141)
chr6 (163-473)||(26954091-26954396)
chr6 (192-473)||(33160179-33160462)
chr6 (163-446)||(16569107-16569389)
chr6 (186-473)||(5413217-5413504)
chr6 (186-455)||(5408892-5409161)
chr6 (186-473)||(5406025-5406310)
chr6 (186-473)||(5410350-5410635)
chr6 (163-473)||(28137211-28137518)
chr6 (202-473)||(31404513-31404785)
chr6 (163-473)||(16452127-16452439)
chr6 (240-472)||(33211066-33211294)
chr6 (162-473)||(30834332-30834646)
chr6 (165-473)||(3038729-3039013)
chr6 (163-384)||(14521478-14521699)
chr6 (202-473)||(2171365-2171641)
chr6 (360-473)||(603085-603198)
chr6 (364-473)||(21588989-21589098)
chr6 (364-473)||(21593722-21593831)
chr6 (364-473)||(26830124-26830233)
chr6 (202-473)||(3072595-3072871)
chr6 (364-473)||(2972940-2973049)
chr6 (364-473)||(5043685-5043795)
chr6 (360-474)||(3808704-3808820)
chr6 (404-473)||(17758081-17758150)
chr6 (266-473)||(412158-412370)
chr6 (364-473)||(17763048-17763158)
chr6 (346-445)||(6097431-6097533)
chr6 (371-473)||(26800645-26800748)
chr6 (402-473)||(22424865-22424937)
chr6 (165-473)||(4045481-4045773)
chr6 (343-428)||(5757507-5757592)
chr6 (341-407)||(31979496-31979561)
chr6 (346-473)||(16578498-16578629)
chr6 (346-473)||(16616751-16616882)
chr6 (346-473)||(16653169-16653300)
chr6 (360-473)||(27647918-27648032)
chr6 (360-440)||(6027337-6027419)
chr6 (360-440)||(25421396-25421478)
chr6 (163-228)||(257245-257308)
chr6 (338-407)||(10077214-10077282)
chr6 (346-473)||(16554926-16555057)
chr6 (346-473)||(16631482-16631613)
chr6 (338-407)||(31936567-31936635)
chr6 (163-215)||(602903-602955)
chr6 (346-428)||(21356022-21356104)
chr6 (202-236)||(9182828-9182862)
chr6 (402-455)||(25073644-25073698)
chr6 (338-407)||(5017518-5017586)
chr6 (338-407)||(18232825-18232893)
chr6 (403-454)||(9572667-9572719)
chr6 (360-431)||(34167180-34167252)
chr6 (338-397)||(4629933-4629992)
chr6 (345-407)||(5572290-5572351)
chr6 (360-440)||(13154005-13154087)
chr6 (338-380)||(22963680-22963721)
chr6 (338-380)||(23824672-23824713)
chr6 (338-384)||(31086545-31086590)
chr6 (166-220)||(33211005-33211058)
chr6 (360-440)||(33342101-33342183)
chr6 (360-440)||(34164948-34165030)
chr6 (202-234)||(412387-412419)
chr6 (363-407)||(1230249-1230293)
chr6 (404-440)||(2908550-2908586)
chr6 (363-407)||(4816231-4816275)
chr6 (363-407)||(5273216-5273260)
chr6 (363-407)||(11983029-11983073)
chr6 (363-407)||(14458767-14458811)
chr6 (363-407)||(14507176-14507220)
chr6 (363-407)||(19704567-19704611)
chr6 (363-407)||(20915356-20915400)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (163-473)||(20216-20525)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (165-473)||(148914-149207)
scaffold0006 (338-407)||(5663-5731)
scaffold0006 (338-405)||(2472-2538)
scaffold0006 (343-428)||(133309-133394)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (202-473)||(114660-114933)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (202-473)||(434591-434864)
scaffold0002 (398-473)||(490355-490431)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (202-473)||(974-1246)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (314-473)||(11615-11777)
scaffold0286 (202-234)||(11864-11896)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (187-473)||(10982-11272)
scaffold0491 (257-473)||(8630-8846)
[»] scaffold1668 (1 HSPs)
scaffold1668 (163-367)||(1301-1502)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (163-473)||(27250-27553)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (364-473)||(7385-7494)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (364-455)||(10565-10656)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (364-473)||(18004-18113)
scaffold0176 (338-407)||(17243-17311)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (358-440)||(2598-2682)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (346-428)||(8448-8530)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (360-440)||(3722-3804)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (338-407)||(10709-10777)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (338-397)||(36891-36951)
scaffold0087 (343-384)||(44033-44075)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (345-428)||(45238-45321)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (418-473)||(80338-80393)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (363-407)||(1453-1497)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (363-407)||(29414-29458)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (363-407)||(69292-69336)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 472
Target Start/End: Original strand, 30476103 - 30476555
Alignment:
Q  20 tttaacaaataaataaggagacagagatcactcttccttctgtttctcgaaggactaaaactatatttgtcttctcccattctacatgcttttgtaagat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30476103 tttaacaaataaataaggagacagagatcactcttccttctgtttctcgaaggactaaaactatatgtgtcttctcccattctacatgcttttgtaagat 30476202  T
Q  120 gaattaggctaataagcttagattagacggaaacttacagttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaa 219  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  30476203 gaatttggcgaataagtttagattagacggaaacttacagtcccgttgtgaattcgaactcaaaactcacaccaatacaaactataatgtgtggagtaaa 30476302  T
Q  220 ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30476303 ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacttagacctaatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaag 30476402  T
Q  320 caaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctcca 419  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||||||||| ||||    
T  30476403 taaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttaacctcatatggggtagagattgatctgtcca 30476502  T
Q  420 atccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30476503 atccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaatta 30476555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 28220026 - 28220336
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||    
T  28220026 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaagaaaattagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacaacaa 28220125  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28220126 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaaga 28220225  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28220325  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  28220326 caagaaattag 28220336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 28223221 - 28223531
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28223221 tgttgtgaattcggactcaaaactcagaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaacgaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 28223320  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28223321 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaaga 28223420  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28223421 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28223520  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  28223521 caagaaattag 28223531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 192 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3157205 - 3156923
Alignment:
Q  192 caatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagt 290  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||     
T  3157205 caatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagg 3157106  T
Q  291 aaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgac 390  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3157105 aatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgac 3157006  T
Q  391 ttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3157005 ctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 3156923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 50166980 - 50167285
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  50166980 tgttgtgaactcgaactcaaaa-tcacaccaaaacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagaaacaacaa 50167078  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  50167079 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaaga 50167174  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  50167175 ttgttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtta 50167274  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  50167275 caagaaattag 50167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 833970 - 834277
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  833970 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 834068  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| |||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  834069 caataacaacaccaagatctaatctgggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacaccaaaga 834166  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 834266  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  834267 caagaaattag 834277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 13137780 - 13138086
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13137780 tgttgtaaattcggactcaaaactcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 13137879  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13137880 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaacctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacatcaaaga 13137975  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||    
T  13137976 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggtta 13138075  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  13138076 caagaaattag 13138086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 28265359 - 28265664
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28265359 tgttgggaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaaatagtagccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 28265457  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28265458 taataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaaga 28265553  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28265653  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  28265654 caagaaattag 28265664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 37559664 - 37559978
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  37559664 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 37559763  T
Q  262 ataacaacaccacttagatct-aatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    | || |||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37559764 acaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggggagagaagagaggaacaaacacaccaa 37559863  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct-gggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  37559864 agattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgg 37559963  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  37559964 gttacaagaaattag 37559978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Original strand, 196710 - 197017
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  196710 tgttgtgaattcgtactcaaat-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 196808  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  196809 taataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgagaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagagagaaaaaaacacaccaaaga 196906  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct-gggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  196907 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtt 197006  T
Q  462 acaagaaatta 472  Q
    |||||||||||    
T  197007 acaagaaatta 197017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 45644158 - 45644464
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  45644158 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 45644256  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  45644257 ataataacaacatctagatctaatctagcaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaag--agagaagaga--aacaagcacaccaaag 45644352  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45644353 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 45644452  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
     |||||||||||    
T  45644453 gcaagaaattag 45644464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 49918718 - 49918408
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  49918718 tgttgtaaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 49918620  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| || ||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49918619 acaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 49918520  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  49918519 attgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 49918420  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  49918419 acaagaaattag 49918408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 163 - 457
Target Start/End: Original strand, 3846921 - 3847215
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  3846921 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcatactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 3847019  T
Q  263 taacaa---caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    ||| ||   || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3847020 taataataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacaccaa 3847117  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatg 3847215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 44455528 - 44455217
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||    
T  44455528 tgttgtgaattcgtactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatatgtggagaaaagaaaagtggtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 44455430  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44455429 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaaggaagagaagagaggaacaaacacaccaaag 44455330  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44455329 atcgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagtt 44455230  T
Q  462 acaagaaattagt 474  Q
    |||||||||||||    
T  44455229 acaagaaattagt 44455217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31659606 - 31659296
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| || ||    
T  31659606 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatataaaatatgatgtgtggagaaaagaaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatca 31659508  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| | |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31659507 acaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaaaggagagaaaagaggaataaacacaccaaag 31659408  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31659407 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggtt 31659308  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  31659307 acaagaaattag 31659296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Original strand, 50169037 - 50169320
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaat 285  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  50169037 tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaataataacaacacctatatctaat 50169136  T
Q  286 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaac 385  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50169137 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttgatccagttcggtccaac 50169232  T
Q  386 ttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50169233 ttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattag 50169320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 40122001 - 40122308
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  40122001 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgcgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatctaagtgaacacaagcaacaacaa 40122099  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40122100 taataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 40122195  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccac--tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40122196 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagt 40122295  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    || ||||||||||    
T  40122296 tataagaaattag 40122308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 4552448 - 4552747
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4552448 tgttgcgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgcgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagtaacaacaa 4552547  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||    
T  4552548 taataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataa-----------agagaaacaaacacaccaaaga 4552636  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggtta 4552736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 454
Target Start/End: Original strand, 37503362 - 37503648
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  37503362 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtag-----aatatcaaagtgaacacaagcaataatca 37503455  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || | || ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503456 acaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 37503555  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 454  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503556 attgttgacctagttcgatccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 37503648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 167 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3189708 - 3189388
Alignment:
Q  167 gtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataac 266  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  3189708 gtgaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataat 3189610  T
Q  267 aacac--------------cacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaac 352  Q
    || ||              ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3189609 aaaacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaac 3189510  T
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 451  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3189509 acaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagata 3189410  T
Q  452 caaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  3189409 caaaagagttacaggaaattag 3189388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 167 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3198525 - 3198205
Alignment:
Q  167 gtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataac 266  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  3198525 gtgaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataat 3198427  T
Q  267 aacac--------------cacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaac 352  Q
    || ||              ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3198426 aaaacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaac 3198327  T
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 451  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3198326 acaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagata 3198227  T
Q  452 caaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  3198226 caaaagagttacaggaaattag 3198205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 167 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3207364 - 3207044
Alignment:
Q  167 gtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataac 266  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  3207364 gtgaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataat 3207266  T
Q  267 aacac--------------cacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaac 352  Q
    || ||              ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3207265 aaaacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaac 3207166  T
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 451  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3207165 acaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagata 3207066  T
Q  452 caaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  3207065 caaaagagttacaggaaattag 3207044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 8550584 - 8550897
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  8550584 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 8550682  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga-gaagagaggaa-caaacacaccaa 359  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  8550683 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaaacaaacacaccaa 8550782  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8550783 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatga 8550882  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  8550883 gttacaagaaattag 8550897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1833877 - 1833580
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1833877 ctgttgtgaattcggactcaata-tcacaccaatacaaactatgatctgtggagtaaaggaaagtcgtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 1833779  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || |    ||||||||||||||||    
T  1833778 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaagagagaaaata----aacaaacacaccaaag 1833683  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||         ||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1833682 att---------gtttggtccaatttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 1833592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10925590 - 10925281
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  10925590 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaacaatacaaactatgttgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 10925492  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||    
T  10925491 acaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagggaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagata--aacaaacacatcaaag 10925396  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatga---gttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  10925395 attgttgacccagttcgatccaactttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatga 10925296  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  10925295 gttacaagaaattag 10925281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 46065278 - 46064976
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||  | ||||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  46065278 tgttgtgaattcggactcaaaac-caca-caatgaaaacaaagatgtgtggagcaaacgatagttgtaaccaatt-caaagtaaatacaagcaacaacaa 46065182  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46065181 taataacaacacctagatctaatctactaat-aatgtgaaaggctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaaga 46065087  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  46065086 ttgtttacccagttcgatccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagtta 46064987  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  46064986 caagaaattag 46064976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Original strand, 13659153 - 13659446
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||      ||    
T  13659153 ttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa------ta 13659245  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagatt 364  Q
    ||||||||   || ||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  13659246 acaacacc---taaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaatacaccaaagatt 13659337  T
Q  365 gttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattaca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||    
T  13659338 gttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaaca 13659437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Original strand, 23555071 - 23555376
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23555071 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcgcaccaatagaaacaatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaatcaatgtcaaagtaaacacaagcaacaacaa 23555169  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| ||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  23555170 caataacaacacctagatctaatttaggaatcatagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaacataaa--gagagaagaga--aacaaacgcaccaagaa 23555265  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
     |||| || ||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23555266 atgtttactcagttcgatccaacttgacctactatggg-gagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 23555364  T
Q  463 caagaaattagt 474  Q
     |||||||||||    
T  23555365 taagaaattagt 23555376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 41361278 - 41360971
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  41361278 tgttgtgaattcggactcaaaactctaaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaacaa 41361180  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa-ag 361  Q
     || |||| ||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    |||||||||||||| |     
T  41361179 caataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaaga----aacaaacacaccaagat 41361084  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  41361083 attgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 41360984  T
Q  462 acaagaaattagt 474  Q
    |||||||||||||    
T  41360983 acaagaaattagt 41360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16455984 - 16455679
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||  |||  | ||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16455984 tgttgtgaattcggactcaaaatt-acaccaatgaaaacaaagatttgtgtagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacgtaagcaacaacaa 16455886  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||  |    
T  16455885 taataacaacatatagatctaatctggtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagtaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaatacaccaagaa 16455790  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
     |||| || ||||| ||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  16455789 atgtttacacagtttggtccaatttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggtta 16455690  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  16455689 caagaaattag 16455679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20763014 - 20762730
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  20763014 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaaccaatatcaaagtgaattcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 20762915  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 383  Q
    ||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |    
T  20762914 tctaggaa-----gtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattggtcacctagttcggtccaa 20762820  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20762819 acttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattag 20762730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Original strand, 13316150 - 13316462
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa- 259  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||   |||||| ||     
T  13316150 ctgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacgaaatataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaataacaaagtgaatgcaagcaataat 13316248  T
Q  260 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  13316249 caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaactcactaa 13316347  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagg 13316447  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  13316448 gttacaagaaattag 13316462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 473
Target Start/End: Original strand, 927783 - 928086
Alignment:
Q  161 tctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |   ||||||    
T  927783 tctgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaata--aactatgatgtgtggagtaaagggaagtggtaaccaatatcaaagtaatcaca---aacaac 927876  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctag-taaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    || |||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  927877 aacaacaacaaaacttagatctaatatagataatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaaacaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacacaaa 927972  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
      | |||| ||||||||||||| |||||||| ||   ||||  |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |      
T  927973 gaaatgtttacccagttcggtctaacttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaaggg 928072  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  928073 ttacaagaaattag 928086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15820659 - 15820365
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||      
T  15820659 ttgtgaattcggactcaaaactcac--caata-aactta-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa-- 15820566  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagatt 364  Q
     |||||||   |||||||||| ||| || ||||  |||||||||| || |||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  | |    
T  15820565 -caacacc---tagatctaatataggaatcaaatagaaaagctcataaacacaagcaatggataa--ggagagaagaga--aacaaacacaccaataaat 15820474  T
Q  365 gttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattaca 464  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  15820473 gtttacctagttcgatccaacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttaca 15820374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 350 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19754676 - 19754553
Alignment:
Q  350 aacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 449  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754676 aacacaccaaaaattgttgacccacttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 19754577  T
Q  450 tacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||   ||||||||||||||    
T  19754576 tacaaatcggttacaagaaattag 19754553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 257 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 51765670 - 51765472
Alignment:
Q  257 caacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacac 354  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||    
T  51765670 caacaataacaacacc---tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagac 51765575  T
Q  355 accaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51765574 accaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatac 51765475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19752864 - 19752744
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 452  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19752864 acacaaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatac 19752765  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||   ||||||||||||||    
T  19752764 aaatcggttacaagaaattag 19752744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193669
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaacttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttac 193679  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  193678 aagaaattag 193669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 469
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547195
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 13547189  T
Q  464 aagaaa 469  Q
    ||||||    
T  13547190 aagaaa 13547195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549110
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 13549100  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    | ||||||||    
T  13549101 atgaaattag 13549110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168355
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaatta 462  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtta 37168366  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  37168365 caagaaattag 37168355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 42297971 - 42298085
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42297971 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 42298070  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  42298071 gttacaagaaattag 42298085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 372 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11348857 - 11348756
Alignment:
Q  372 cagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatt 471  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11348857 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 11348758  T
Q  472 ag 473  Q
    ||    
T  11348757 ag 11348756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925817
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 31925807  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  31925808 aagaaattag 31925817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255450
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  47255440 caagaaattag 47255450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482341
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaatta 462  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtta 7482330  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  7482331 caagaaattag 7482341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136305
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||     
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttc 29136316  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  29136315 caagaaattag 29136305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 373 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34603735 - 34603634
Alignment:
Q  373 agttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaatgaattacaagaaatt 471  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  34603735 agttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaatt 34603636  T
Q  472 ag 473  Q
    ||    
T  34603635 ag 34603634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 36683892 - 36683766
Alignment:
Q  315 acaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatc 413  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||     
T  36683892 acaagcaaaagataaag--agagaagaca--aacaaacacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgatt 36683798  T
Q  414 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 445  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36683797 tctacaatccactatcaatgagttcttacaaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 457
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876860
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaacttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatg 37876860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033183
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| || | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatg 37033167  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
     |||||||||||||||    
T  37033168 gattacaagaaattag 37033183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242382
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 454  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115229
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaatt 461  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  47115240 acaagaaattag 47115229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40282564 - 40282435
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 442  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40282564 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 40282465  T
Q  443 aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  40282464 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 40282435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Original strand, 8870570 - 8870695
Alignment:
Q  206 atgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag 305  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||| |||||||| || |  || |||||| ||||||| || |||||||||||     
T  8870570 atgtgtggaacaaaggaaagtagtaactagtatcaaagtaatcacaagcaaaaacaataaaaaaaaaacctagatcaaatctaggaatcaaagtgaaaaa 8870669  T
Q  306 ctcaaaaccacaagcaaaagataaag 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  8870670 tacaaaaccacaagcaaaagataaag 8870695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 19072907 - 19072976
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  19072907 aagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 19072976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 19120797 - 19120866
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  19120797 aagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 19120866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 445
Target Start/End: Original strand, 20622218 - 20622319
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 443  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20622218 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 20622317  T
Q  444 aa 445  Q
    ||    
T  20622318 aa 20622319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6808581 - 6808510
Alignment:
Q  403 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  6808581 agagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttag 6808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 9987373 - 9987287
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9987373 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaa 9987287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 473
Target Start/End: Original strand, 44650101 - 44650273
Alignment:
Q  295 aaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaa 394  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||       |||||| ||||||| | | || ||| |||||||||||| ||||| ||     
T  44650101 aaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagaaagagaa-------acaaacgcaccaaaaaatatttacctagttcggtccaaattgacctac 44650193  T
Q  395 tctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | | ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||| || |||||| |||||||    
T  44650194 ttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaattag 44650273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5460262 - 5459997
Alignment:
Q  168 tgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaa-ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataac 266  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |  || ||||||||| ||     
T  5460262 tgaatttgaactcaaaa-tcacaacaata-aactta-gatgtgtagagtaaaagggaaatagtaaccaatatcaaaataatctcaaacaacaacaacaag 5460166  T
Q  267 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgt 366  Q
    ||||  || |||||| ||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| |||  | |||    
T  5460165 aacaa-acctagatcgaatctaggaacaaaa-tgtaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaataga--aacaaacacaacaagaaatgt 5460072  T
Q  367 tgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 440  Q
    | ||| ||||| | |||||  |||  || ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5460071 ttacctagttcagcccaacaatgatctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctt 5459997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9036603 - 9036474
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 442  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |  |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  9036603 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttaca 9036504  T
Q  443 aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  9036503 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 9036474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26645016 - 26644946
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  26645016 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 26644946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Original strand, 37069753 - 37069838
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||    
T  37069753 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 13598378 - 13598446
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  13598378 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 13598446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 21054145 - 21054044
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 443  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21054145 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 21054046  T
Q  444 aa 445  Q
    ||    
T  21054045 aa 21054044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22079446 - 22079374
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  22079446 gagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattag 22079374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13938273 - 13938213
Alignment:
Q  394 atctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13938273 atctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaa 13938213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 472
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109529
Alignment:
Q  403 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaatta 9109529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Original strand, 9476241 - 9476329
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||   | ||||||||||||||||    
T  9476241 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga-gcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44203804 - 44203722
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44203804 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 44203722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 47704053 - 47703965
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  47704053 aagaaaggaaaaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 427
Target Start/End: Original strand, 775652 - 775739
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccacta 427  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  775652 aagaaaggaacaaacacatcaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagt-agctctccaatccacta 775739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Original strand, 8871045 - 8871130
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaa 431  Q
    |||||||| |||||  | |||| || || |||||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8871045 aacaaacataccaataaatgtttactcaattcggtccaacttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 29651791 - 29651859
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  29651791 aagaaaggaacaaacacaccaa-gatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 29651859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Original strand, 44646743 - 44646875
Alignment:
Q  295 aaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaa 394  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||       |||||| ||||||| | | || ||| |||||||||||| ||||| ||     
T  44646743 aaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagaaagagaa-------acaaacgcaccaaaaaatatttacctagttcggtccaaattgacctac 44646835  T
Q  395 tctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatga 434  Q
    | | ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646836 ttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47098941 - 47098873
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||    
T  47098941 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagaga 47098873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47102958 - 47102890
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||    
T  47102958 aagaaaggaacaaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 47102890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16124628 - 16124565
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  16124628 aggaacaaacacaccaa-gattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 16124565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21536688 - 21536598
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  21536688 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 21536598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 3281686 - 3281756
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  3281686 aagaaaggaacaaacacatcaaaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 3281756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27104484 - 27104401
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  27104484 aggaacaaacacaccaa-gattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27104401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 472
Target Start/End: Original strand, 2263016 - 2263084
Alignment:
Q  405 agattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||    
T  2263016 agattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaatta 2263084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 12302507 - 12302551
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  12302507 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 12302551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471519
Alignment:
Q  413 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaatta 32471519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13604737 - 13604652
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  13604737 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 13604652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 32889419 - 32889464
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  32889419 aagagaggaacaaacacacc-aagattgttgatctagttcggtccaa 32889464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 455
Target Start/End: Original strand, 37282730 - 37282784
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37282730 gagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaa 37282784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2926637 - 2926584
Alignment:
Q  403 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  2926637 agagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaa 2926584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 2510327 - 2510371
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  2510327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2510371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6823293 - 6823249
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  6823293 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6823249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 10399830 - 10399874
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  10399830 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10399874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13358852 - 13358808
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  13358852 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13358808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 15294836 - 15294880
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  15294836 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 15294880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 17324638 - 17324682
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  17324638 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17324682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 234
Target Start/End: Original strand, 20622071 - 20622103
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622071 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 20622103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24325942 - 24325898
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  24325942 ttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagaga 24325898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 27336942 - 27336986
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  27336942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27336986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 28207070 - 28207114
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  28207070 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28207114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28840958 - 28840914
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  28840958 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28840914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 28998255 - 28998299
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  28998255 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28998299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 29003971 - 29004015
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  29003971 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 29004015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 31735523 - 31735567
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  31735523 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 31735567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39462798 - 39462754
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  39462798 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 39462754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 50307548 - 50307592
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  50307548 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 50307592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 51750318 - 51750274
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  51750318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 51750274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752598
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 51752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51765729 - 51765697
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51765729 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 51765697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 43036791 - 43036480
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43036791 tgttatgaatttggactcaaaactcacaccaatacaaaaaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 43036692  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036691 taacaacaccacctagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 43036592  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 43036492  T
Q  463 caagaaattagt 474  Q
    ||||||||||||    
T  43036491 caagaaattagt 43036480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15213155 - 15212844
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||    
T  15213155 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 15213056  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15213055 acaataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 15212956  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15212955 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 15212856  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  15212855 acaagaaattag 15212844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30143708 - 30143398
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  30143708 tgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 30143610  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30143609 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 30143510  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30143509 attgttgactcagttcagttcaacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 30143410  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  30143409 acaagaaattag 30143398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4732026 - 4731716
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||| || ||    
T  4732026 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccgatatcaaagtgaacacaaacaataatca 4731928  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731927 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 4731828  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4731827 attgttgacccaattcggtccaacttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 4731728  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  4731727 acaagaaattag 4731716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33352518 - 33352208
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  33352518 tgttgtgaattcgtactcaaaa-tcacaccaatataaattatgatatgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 33352420  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33352419 acaataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtgaaaaacacaaatccacaagcaaaagataaaaggagataagagaggaacaaacacatcaaag 33352320  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  33352319 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 33352220  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  33352219 acaagaaattag 33352208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 12702431 - 12702744
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12702431 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 12702529  T
Q  263 taacaacacc---acttagatctaatctagtaac-caaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacca 358  Q
    ||| |||| |   || |||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12702530 taataacaacgacacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaacaaacatacca 12702629  T
Q  359 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  12702630 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagg 12702729  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  12702730 gttacaagaaattag 12702744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 40321442 - 40321139
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40321442 tgttgtgaattccgactcaaaa-tcaca-caatacaaactatgatatgtggagcaaaggaaagtagcaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 40321345  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40321344 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacatcaaaga 40321249  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggtta 40321149  T
Q  463 caagaaatta 472  Q
    ||||||||||    
T  40321148 caagaaatta 40321139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5689635 - 5689329
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  5689635 tgttgtgaattccgactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 5689537  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  5689536 ataataacaacatctaaatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacatcaaag 5689441  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5689440 attgttgacccagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 5689341  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  5689340 acaagaaattag 5689329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6599333 - 6599030
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||    
T  6599333 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaataa 6599235  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaa-cacaccaaag 361  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||||| ||||||||||    
T  6599234 taacaacacc---tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaccaaag 6599142  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||    
T  6599141 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtt 6599042  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  6599041 acaagaaattag 6599030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6674786 - 6674483
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||    
T  6674786 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaataa 6674688  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaa-cacaccaaag 361  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||||| ||||||||||    
T  6674687 taacaacacc---tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaccaaag 6674595  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||    
T  6674594 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtt 6674495  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  6674494 acaagaaattag 6674483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27811608 - 27811336
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  27811608 tatgatgtgtggaggaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtg 27811509  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27811508 aaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagcaagagaagaggggaaaaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 27811409  T
Q  401 agagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27811408 ggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 27811336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 167 - 473
Target Start/End: Original strand, 3303474 - 3303780
Alignment:
Q  167 gtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataac 266  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||     
T  3303474 gtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaaacaaacacaagcaacaacaataat 3303573  T
Q  267 aacaccacttagatctaatctag----taaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    |||  ||| ||||||||||||||     || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3303574 aactacacctagatctaatctaggaatcaatcaaagtgaaaagtacaaaatcacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 3303669  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3303670 ttgtttacccagttcggtccaacttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 3303769  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  3303770 caagaaattag 3303780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Original strand, 41366420 - 41366724
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |    
T  41366420 ttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaaca 41366518  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaagat 363  Q
    | |||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  41366519 ataacaacacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatgg-gagaagaga--aacaaaacacaccaaagat 41366615  T
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||     
T  41366616 tgttgtcccagttcggtccaacttgacctaatctagg-gagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaa 41366714  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  41366715 aagaaattag 41366724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 1345176 - 1345481
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||  |||| |||  || || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  1345176 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacacaaatacaaacaataatctgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 1345274  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1345275 taataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaatcacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaaga 1345370  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||    
T  1345371 ttgttgacctagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggtta 1345470  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  1345471 caagaaattag 1345481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42498541 - 42498252
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||  || || |||| ||| |||||||||    
T  42498541 tcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataattaacaataacaacacctagatctaa 42498442  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 383  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  42498441 tctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagggaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 42498342  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  42498341 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattag 42498252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 203 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4734035 - 4733784
Alignment:
Q  203 atgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtga 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||| ||| ||| || |||| |||    
T  4734035 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatcaaatgtaggaaacaaaatga 4733936  T
Q  302 aaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggga 401  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  4733935 aaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaggtagagaagagaggaacaaacacaccaaagactgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 4733836  T
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733835 gagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 445
Target Start/End: Original strand, 4743027 - 4743296
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||          
T  4743027 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaataccaaagtaaacacaagcaa------ 4743120  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4743121 taacaacacc---tagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcgaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaaga 4743213  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743214 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 4743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 187 - 472
Target Start/End: Original strand, 34254154 - 34254440
Alignment:
Q  187 cacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 285  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  34254154 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 34254253  T
Q  286 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aa 384  Q
    |||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34254254 ctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaa 34254352  T
Q  385 cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    |||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  34254353 cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaatta 34254440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 187 - 472
Target Start/End: Original strand, 34256330 - 34256616
Alignment:
Q  187 cacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 285  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  34256330 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 34256429  T
Q  286 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aa 384  Q
    |||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34256430 ctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaa 34256528  T
Q  385 cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    |||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  34256529 cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaatta 34256616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 17983021 - 17982712
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||| || |    
T  17983021 tgttgtgaattccgatctcaaa--tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaacgtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatc 17982924  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17982923 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaa 17982825  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  17982824 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaaggg 17982725  T
Q  460 ttacaagaaatta 472  Q
    |||||||||||||    
T  17982724 ttacaagaaatta 17982712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44304185 - 44303913
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  44304185 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtg 44304086  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || |||||    
T  44304085 aaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctgg 44303987  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44303986 aggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggattacaagaaattag 44303913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Original strand, 19491503 - 19491810
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19491503 tgttgtgaattcggactcaaaactctaaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaacaa 19491601  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa-ag 361  Q
     || |||| ||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    |||||||||||||| |     
T  19491602 caataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaaga----aacaaacacaccaagat 19491697  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19491698 attgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 19491797  T
Q  462 acaagaaattagt 474  Q
    |||||||||||||    
T  19491798 acaagaaattagt 19491810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 1746057 - 1746328
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||     
T  1746057 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtc 1746156  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  1746157 aaaagcgcaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaacgattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatgg 1746255  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1746256 aggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattag 1746328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31218603 - 31218315
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  31218603 tcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 31218504  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31218503 tctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-ataagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 31218405  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  31218404 acttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 31218315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10015446 - 10015139
Alignment:
Q  160 ttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 259  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||  |||  | ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  10015446 ttctgttgtgaattcggatttaaaacttacaccaatgaaaacaaagatgtgtggagcagaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaaaaa 10015347  T
Q  260 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    |||||| ||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10015346 caataataacaatacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataa--ggagagaagaga--aacaaatacaccaa 10015251  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
      | || | |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  10015250 gaaatgattacccagttcggtccaacttgacctactat-ggagagagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgag 10015153  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  10015152 ttacaagaaattag 10015139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 206 - 473
Target Start/End: Original strand, 1292311 - 1292573
Alignment:
Q  206 atgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag 305  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |  ||||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1292311 atgtggggagcaaagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagtagtaacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaag 1292410  T
Q  306 ctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagaga 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  1292411 ctcaaaaccacgagcaaaagataa--ggagagaagaga--aacaaacacaccaagaaatgtttgcccagttcggtccaacttgacctactctggg-gaga 1292505  T
Q  406 gattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1292506 gatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattag 1292573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 240 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18142105 - 18141878
Alignment:
Q  240 aaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaa 339  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  18142105 aaagtaaacacaagcaacaataataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagca 18142008  T
Q  340 gagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct 439  Q
    ||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18142007 gaga--aacaagcacaccaaag--tgttggcccagtttggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttct 18141912  T
Q  440 tacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18141911 tacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattag 18141878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 455
Target Start/End: Original strand, 19945181 - 19945451
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  19945181 tcacaccaatacaaactttgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 19945280  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcgg-tcca 383  Q
    ||||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  19945281 tctaggaatcgaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaa 19945379  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    ||||||| || ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19945380 acttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaa 19945451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 279 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30291856 - 30291665
Alignment:
Q  279 atctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcg 378  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30291856 atctaatctagtaatcaaagtggaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttgattcagttcg 30291761  T
Q  379 gtccaacttgacttaatctgg-gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30291760 gtccaacttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattag 30291665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 18105876 - 18106188
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  18105876 tgttatgaattcagactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaataacaa 18105974  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagaga-------ggaacaaacaca 355  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||        || |||| | |    
T  18105975 caataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaa--gagagaagagaaacaacttgaccaaagaaa 18106072  T
Q  356 ccaa-agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 454  Q
    | || | |   ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18106073 caaacacaccattgacccagttcggtccaacttgacctattctggg-gagagattgatctctccaa-acactatcaatgagttcttacaaa-agatacaa 18106169  T
Q  455 atgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18106170 atgagttacaagaaattag 18106188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 353 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 40221923 - 40221802
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40221923 acaccaaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatac 40221824  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  40221823 aaatgggttacaagaaattagt 40221802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Original strand, 10930198 - 10930309
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  10930198 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggtt 10930297  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  10930298 acaagaaattag 10930309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 472
Target Start/End: Original strand, 8965491 - 8965800
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  8965491 ctgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgcgtggagcaa-ggaacgtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaaca 8965587  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagct--------caaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaaca 353  Q
    | || ||||  || ||||| |||||||| || ||| |||||||           ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    ||||||||    
T  8965588 acaataacaa-acctagatttaatctaggaatcaa-gtgaaaaaaaaaaaaaaacaaaaccacaaacaaaagataaagagagaaaaga----aacaaaca 8965681  T
Q  354 caccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 453  Q
    |||| |  | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8965682 caccgataaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatata 8965781  T
Q  454 aatgaattacaagaaatta 472  Q
    || |  ||| |||||||||    
T  8965782 aaagggttataagaaatta 8965800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 344 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9765931 - 9765803
Alignment:
Q  344 ggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 443  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765931 ggaacaaacacaccaatgattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttaca 9765833  T
Q  444 aagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9765832 aagagatacaaatgggttacaagaaattag 9765803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435101
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 42435091  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  42435092 aagaaattag 42435101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18655578 - 18655458
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 452  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655578 acaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 18655479  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  18655478 aaatgggttacaagaaattag 18655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 455
Target Start/End: Original strand, 3073710 - 3073965
Alignment:
Q  196 ataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataa---gcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaa 292  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||   ||| |||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  3073710 ataaactatcatatgtggagcaaaggaaagtaataaccagtatcaaagtaaccacaatgagcagcaacaacaacaacaa-acctagatttaatctaggaa 3073808  T
Q  293 ccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgactt 392  Q
      |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||  |  | |||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  3073809 t-aaagtgaagagtacaaaaccacaagcaaaagataaag--agataagaga--aacaaacacacatagaaatgtttacccagttcggcccaacttgacct 3073903  T
Q  393 aatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3073904 actatggg-gagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 3073965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283582
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4283592  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  4283591 aagaaattag 4283582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2628110 - 2627811
Alignment:
Q  161 tctgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 259  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| ||    
T  2628110 tctgttgtgaattccgatctcgaaac-cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaaaaa 2628012  T
Q  260 --caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacaca 355  Q
      ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| |||    
T  2628011 atcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaa-gtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagaca 2627914  T
Q  356 ccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatac 452  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2627913 ccaagagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatac 2627814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162555
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaacttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 4162565  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  4162564 aagaaattag 4162555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11384163 - 11384043
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 452  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11384163 acaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatac 11384064  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  11384063 aaatgagttacaagaaattag 11384043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772250
Alignment:
Q  371 ccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaat 470  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3772352 ccagtttggtccaacttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaat 3772253  T
Q  471 tag 473  Q
    |||    
T  3772252 tag 3772250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 326
Target Start/End: Original strand, 3050925 - 3051090
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat----aagcaaca 258  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || ||     ||||||||    
T  3050925 tgttgtgaattgggactcaaatctcacaccaata--aataatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccacaatcaaagcaagcaatcacaagcaaca 3051022  T
Q  259 acaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaga 326  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3051023 acaataataacaacacctagatctaatctagaaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataaga 3051090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 402 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 40328909 - 40328836
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40328909 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagt 40328836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8153940 - 8153816
Alignment:
Q  349 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 448  Q
    |||||||||||| | | || | ||| |||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8153940 aaacacaccaaaaaatatttatccatttcggtccaacttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagat 8153841  T
Q  449 atacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||    
T  8153840 atacaaaagagttacacgaatttag 8153816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44353922 - 44353851
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44353922 gagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattag 44353851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8154147 - 8153984
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  8154147 tgttgtgaattcgggctcaaaa-tcacactaata-aaactatgatgtgtgaagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaa 8154050  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa 330  Q
    ||| ||||  || ||||| |||||||| ||  |||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||    
T  8154049 taataaca-aacctagatgtaatctaggaa-taaagtgaaaaacacaaaattacatgcaaaagataaa 8153984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3439770 - 3439561
Alignment:
Q  267 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga-- 362  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  3439770 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaactcaaaac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 3439673  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaat 460  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |  |    
T  3439672 ttgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 3439574  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  3439573 tacaagaaattag 3439561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7597749 - 7597672
Alignment:
Q  397 tgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  7597749 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattag 7597672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25690126 - 25690012
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  25690126 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 25690027  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  25690026 -gttacaagaaattag 25690012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26403343 - 26403259
Alignment:
Q  342 gaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  26403343 gaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 437
Target Start/End: Original strand, 29796128 - 29796394
Alignment:
Q  160 ttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 259  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||  |||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||| | ||||||||  |   ||||||||    
T  29796128 ttctgttgtgaattcagactcaaca-tcacaccaata--aattttgatgtgtggagcaaaaggaagtaataaccagtatcaaagtattctcgagcaacaa 29796224  T
Q  260 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    |||||| ||||   ||||||| |||||||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||   |||||||| |  ||| ||||||||||    
T  29796225 caataataaca-atcttagatttaatctagtaa-ttaagtgtaaagcacaaaatcataagcaaaagataaa---agagaagata--aac-aacacaccaa 29796316  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaac-ttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 437  Q
    | | |||| ||| |||||||||||||  |||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29796317 a-aatgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtt 29796394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 360
Target Start/End: Original strand, 32901989 - 32902180
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaagga-aagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || ||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||| |||||| || |  || ||||||||    
T  32901989 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcagaccaata-aactta-gatgtgtggagcaaaagagaagtagtaactaatatcaaagcaacctcaaacaacaaca 32902085  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaag-agaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  32902086 acaacaacaa-acctagatctaatctaggaaccaa-gtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaa---agagaagaagagaaacaaacacagcaaa 32902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 412 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929865
Alignment:
Q  412 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaa 10929865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5702595 - 5702532
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  5702595 aggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 5702532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Original strand, 11712039 - 11712111
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  11712039 gagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattag 11712111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Original strand, 32902212 - 32902284
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  32902212 gagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattag 32902284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19175873 - 19175783
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  19175873 aagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcaactctccaatccactat 19175783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909425
Alignment:
Q  411 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaa-gagttacaagaaattagt 30909425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4696706 - 4696645
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  4696706 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagaga 4696645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 6813662 - 6813708
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6813662 aagaaaggaacaaacataccaaagattgttaacccagttcggtccaa 6813708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19752511 - 19752466
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19752511 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaa 19752466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23799694 - 23799649
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23799694 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaa 23799649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31071342 - 31071258
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaa--gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  31071342 gaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 31071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 609069 - 609025
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  609069 ttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagaga 609025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Original strand, 7412323 - 7412409
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacacca--aagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  7412323 aggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 7412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 22684653 - 22684697
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  22684653 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 22684697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27827320 - 27827276
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  27827320 ttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagaga 27827276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38863985 - 38863949
Alignment:
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38863985 gagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Original strand, 4456006 - 4456096
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  || | ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  4456006 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 4456096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 6127200 - 6127246
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6127200 aagagatgaacaaacacatcaaatattgttgactcagttcggtccaa 6127246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 42575320 - 42575402
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575320 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 42575402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 43530450 - 43530408
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagaga 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  43530450 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagaga 43530408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15290687 - 15290614
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15290687 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 15290614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15471056 - 15470983
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15471056 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 15470983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1822422 - 1822350
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  1822422 gagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattag 1822350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1856867 - 1856795
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  1856867 gagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattag 1856795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3874345 - 3874301
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  3874345 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3874301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4424353 - 4424309
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  4424353 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4424309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 14419190 - 14419234
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  14419190 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14419234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14808096 - 14808052
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  14808096 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14808052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18811042 - 18810998
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  18811042 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagaga 18810998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27829631 - 27829587
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  27829631 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27829587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 30480503 - 30480547
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  30480503 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 30480547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 112)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Original strand, 26175436 - 26175747
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  26175436 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaatagcaa 26175535  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175536 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 26175635  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 26175735  T
Q  463 caagaaattagt 474  Q
    ||||||||||||    
T  26175736 caagaaattagt 26175747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 12739353 - 12739660
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  12739353 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaagaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaataataa 12739452  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739453 taacaacacc---tagatctaatcaagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 12739549  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggtta 12739649  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  12739650 caagaaattag 12739660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 12743728 - 12744035
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12743728 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgttgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaataa 12743827  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12743828 taacaacacc---tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaacaaacacaccaaaga 12743924  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12743925 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 12744024  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  12744025 caagaaattag 12744035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 46147195 - 46147501
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  46147195 tgttgtgaattccgcctcaaaactcacaccaatgcaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 46147294  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46147295 taataacaatacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 46147390  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46147391 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 46147490  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  46147491 caagaaattag 46147501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 9927258 - 9927568
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||    
T  9927258 tgttgtgaattcggactcaaaactcgcaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagttaccaatatcaaagtaaacacaagcaataatca 9927357  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9927358 acaataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaagg-agagaatagaggaacaaacacaccaaag 9927456  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9927457 attgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 9927556  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  9927557 acaagaaattag 9927568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 48893443 - 48893748
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  48893443 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 48893541  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| ||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48893542 caataacagcacctagatctaatccaagaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaaga 48893637  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 48893737  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  48893738 caagaaattag 48893748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37740995 - 37740683
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||| || |    
T  37740995 ctgttgtaaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcacaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacagaatcaataatc 37740896  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    || || |||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37740895 aacaataacagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaa 37740796  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37740795 aattgttgacacagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 37740696  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  37740695 tacaagaaattag 37740683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 34570214 - 34570524
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| || ||| || ||    
T  34570214 tgttgcgaattcggattcaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaaacaataatca 34570312  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34570313 acaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 34570412  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  34570413 attgttgacccagttcgatccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggtt 34570512  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  34570513 acaagaaattag 34570524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 36463196 - 36463499
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36463196 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 36463294  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  36463295 taataacaacacctagatctaatttggtaatcaaagcgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacac--caaaga 36463388  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36463488  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  36463489 caagaaattag 36463499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 166 - 473
Target Start/End: Original strand, 47038219 - 47038520
Alignment:
Q  166 tgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataa 265  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||    
T  47038219 tgtgaatttggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataacaacaa 47038317  T
Q  266 caacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattg 365  Q
     |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47038318 taacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattg 47038413  T
Q  366 ttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaa 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47038414 ttgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatg-attacaa 47038512  T
Q  466 gaaattag 473  Q
    ||||||||    
T  47038513 gaaattag 47038520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Original strand, 52467159 - 52467464
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaa-caacaat 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||    
T  52467159 ttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaaagacaagcaatcatcaat 52467258  T
Q  264 aacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 363  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52467259 aataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagat 52467354  T
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  52467355 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttac 52467454  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    |||| |||||    
T  52467455 aagatattag 52467464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 29254861 - 29254553
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcg-aactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||| || |||| |||    
T  29254861 tgttgtgaattcggaacttaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaag-aaagtagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacgaca 29254764  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29254763 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagaggaacaaacacaccaaag 29254664  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  29254663 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggtt 29254564  T
Q  462 acaagaaatta 472  Q
     ||||||||||    
T  29254563 gcaagaaatta 29254553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Original strand, 56178438 - 56178747
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caat 263  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||  ||     
T  56178438 ttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataataaac 56178536  T
Q  264 aacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 363  Q
    || |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56178537 aataacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 56178636  T
Q  364 tgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  56178637 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 56178736  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  56178737 caagaaattag 56178747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 45686987 - 45687292
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  45686987 tgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 45687085  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    ||||||||||||||||    
T  45687086 ataataacaacacctagatc-aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaaaaga----aacaaacacaccaaag 45687180  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45687181 attgttgacccagttcggtccaacttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagtt 45687280  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    | ||||||||||    
T  45687281 ataagaaattag 45687292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 163 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5872183 - 5871880
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  5872183 tgttgtgaatccggactcaaaa-tcacaccaatacaaact--gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaa 5872087  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5872086 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccaaaagcaaaagatagag--agagaagagagaatcaaacacaccaaaga 5871989  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||  |||    
T  5871988 ttgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggtta 5871889  T
Q  463 caagaaatt 471  Q
    |||||||||    
T  5871888 caagaaatt 5871880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5429989 - 5429737
Alignment:
Q  222 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 320  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| || ||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5429989 aaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagt 5429890  T
Q  321 aaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5429889 aaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaa 5429790  T
Q  421 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5429789 tccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattag 5429737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 226 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36994824 - 36994582
Alignment:
Q  226 tagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaag 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36994824 tagtaatcaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaag 36994725  T
Q  326 ataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccac 425  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36994724 ataaag--agagaagaga--aacaaacacgccaaa-attgttgacccagttcggtccaacttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccac 36994630  T
Q  426 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  36994629 tatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattag 36994582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Original strand, 54199707 - 54200016
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| || |    
T  54199707 ctgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaacgatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccagtatcaaagtgaacacaagcaataatc 54199805  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    |  || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54199806 agcaataacatcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaatataaagg-agagaagagaggaacaaacacaccaaa 54199904  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  54199905 aattgttgacccagttcg-tccaacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 54200003  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  54200004 tacaagaaattag 54200016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Original strand, 5369904 - 5370193
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  5369904 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 5370003  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  5370004 tctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacatcaaagattgttcactcagttcggtccaa 5370103  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5370104 acttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5370193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 48143417 - 48143101
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |    
T  48143417 tgttgtgaattccggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 48143319  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa----gctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacac 356  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48143318 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacac 48143219  T
Q  357 caaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48143218 caaagattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaa 48143119  T
Q  456 tgaattacaagaaattag 473  Q
     |  ||||||||||||||    
T  48143118 agggttacaagaaattag 48143101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 52095162 - 52095472
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| || || ||    
T  52095162 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgacgtgtggaacaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagtaataatca 52095260  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  52095261 acaataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaaa 52095360  T
Q  362 attgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |    
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggt 52095459  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  52095460 tacaagaaattag 52095472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 162 - 474
Target Start/End: Original strand, 6541986 - 6542290
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  6541986 ctgttgtgaattcggacataaaactcacatcaataatactt-tgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtaatcacaagcaacaaca 6542084  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||      
T  6542085 ataacaaaacc---tagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacacaaaatcacaagaaaaagataaag--agataagaga--aacaaacacaccaaga 6542177  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |     
T  6542178 aatgtttacccagttcggtccaacttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggcta 6542277  T
Q  462 acaagaaattagt 474  Q
    |||||||||||||    
T  6542278 acaagaaattagt 6542290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31474512 - 31474209
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||  |||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  31474512 tgttgtgaattcggactcaa---tcacaccaatacaaacaatgatgtgtgtagcaaatgaaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 31474416  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||    
T  31474415 caataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaatcaaaagctaaagataaagggaga----agagaaacaaacacaccaa-ga 31474321  T
Q  363 t-tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31474320 tatgtttacccagttcggtccaacttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 31474221  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  31474220 acaagaaattag 31474209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 315 - 473
Target Start/End: Original strand, 12745266 - 12745424
Alignment:
Q  315 acaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatct 414  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  12745266 acaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatct 12745365  T
Q  415 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12745366 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 12745424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Original strand, 52082463 - 52082768
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  52082463 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggaacaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 52082561  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| ||||||| |||||| || ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52082562 acaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaag 52082661  T
Q  362 attgttgacccagttcggtc-caacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    |||||| |||||  ||||||  |||||||| || |||||  |||||| |||||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |    
T  52082662 attgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatc-------tccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggt 52082754  T
Q  461 tacaagaaattagt 474  Q
    ||||||||||||||    
T  52082755 tacaagaaattagt 52082768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4588320 - 4588017
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaa-ctcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| || || || ||||||||    
T  4588320 tgttgtgaattcggactcaaaaactcacaccaataatactt-tgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccactatcaaagcaatcacaaacaacaaca 4588222  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    ||||||| |||| |   ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    |||||||||||||       
T  4588221 ataacaaaaccaat---atctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaggaga----aacaaacacaccatga 4588129  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    | |||| |||||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  4588128 aatgtttacccagtttggtccaacttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 4588029  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  4588028 acaagaaattag 4588017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 13992129 - 13992402
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  13992129 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 13992228  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaa-gataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatct 397  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||    
T  13992229 aaaagcacaaatc-acaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactct 13992327  T
Q  398 gggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13992328 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagagttacaagaaattag 13992402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Original strand, 27416955 - 27417075
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 452  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27416955 acaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac 27417054  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  27417055 aaatgggttacaagaaattag 27417075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 276 - 473
Target Start/End: Original strand, 29999723 - 29999917
Alignment:
Q  276 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagt 375  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||    
T  29999723 tagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacacaaa-ccacaagcaaaagacaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaa----tgttcacccagt 29999817  T
Q  376 tcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  29999818 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaagaaattag 29999917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 54883189 - 54883078
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  54883189 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 54883090  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  54883089 acaagaaattag 54883078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 451
Target Start/End: Original strand, 37229531 - 37229809
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| |    
T  37229531 ttgtgaattcggactcaaaa-taaaaccaata-aaactatgttgtgtggagcaatgggaagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaataacaaca 37229628  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagatt 364  Q
    | ||| | || |||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||  | |    
T  37229629 ataac-caacctagatctaatttaggaat-aaagtgaaaagcacaaaaccataagtaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacgccaagaaat 37229722  T
Q  365 gttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 451  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| || | || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37229723 gtttacctagttcggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagata 37229809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26364405 - 26364294
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26364405 attgttgacccagttcagtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 26364306  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  26364305 acaagaaattag 26364294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 451
Target Start/End: Original strand, 5207665 - 5207930
Alignment:
Q  177 actcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccactt 276  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| |  |||||||||||||| |||    || |    
T  5207665 actcaaaa-tcacaccaatataaat-atggtgtgtggagcaaaggaaagtagtaattgatatcaaagtaacctcaagcaacaacaatatcaa----acct 5207758  T
Q  277 agatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagtt 376  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||   ||||||||||   | | |||||||||  | |||| ||||| ||    
T  5207759 agatctaatttaggaatcaa-gtgaaaagcacaaaaccacatgcaacagataaat--agagaagagaaacaaatacacaccaataaatgtttacccaatt 5207855  T
Q  377 cggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 451  Q
    | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5207856 cagtccaaattgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagata 5207930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6656014
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 6656024  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  6656023 aagaaattag 6656014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673957
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 50673947  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  50673948 aagaaattag 50673957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 341 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3913637 - 3913506
Alignment:
Q  341 agaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 440  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913637 agagaaacgaacacaccaaagattgttgacccagttcgatacaactttacatactctagg-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 3913539  T
Q  441 acaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  3913538 acaaagatatacaaatgggttaaaagaaattag 3913506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 349 - 469
Target Start/End: Original strand, 13009430 - 13009550
Alignment:
Q  349 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 448  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13009430 aaacacgccaaagattgttgacacagttcggtctaacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaggg 13009529  T
Q  449 atacaaatgaattacaagaaa 469  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  13009530 atacaaatgttttacaagaaa 13009550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 372 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662499
Alignment:
Q  372 cagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatt 471  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaacttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 35662501  T
Q  472 ag 473  Q
    ||    
T  35662500 ag 35662499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632503
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaacttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 40632513  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  40632512 aagaaattag 40632503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 373 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8665566 - 8665466
Alignment:
Q  373 agttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8665566 agtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 8665467  T
Q  473 g 473  Q
    |    
T  8665466 g 8665466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073450
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 12073461  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    ||| |||||||    
T  12073460 caataaattag 12073450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648197
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttat 8648207  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  8648206 aagaaattag 8648197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 372 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41639585 - 41639484
Alignment:
Q  372 cagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatt 471  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  41639585 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaatt 41639486  T
Q  472 ag 473  Q
    ||    
T  41639485 ag 41639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 297 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 51337294 - 51337140
Alignment:
Q  297 agtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatc 396  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||   |||||||| |  |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  51337294 agtgaagagcacaaaatcacaagcaaaagataaaa--agagaagata--aacaaacacaccacgaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatg 51337199  T
Q  397 tgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    || | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51337198 tgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaa 51337140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 41964578 - 41964492
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41964578 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa 41964492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2209886 - 2209771
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2209886 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 2209787  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  2209786 ggttacaagaaattag 2209771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 403 - 474
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745547
Alignment:
Q  403 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagt 12745547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744157
Alignment:
Q  403 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 12744157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 50262697 - 50262811
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50262697 agattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 50262796  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  50262797 gttacaagaaattag 50262811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 362 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21688418 - 21688306
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  21688418 attgttgactcaattcggtctaacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagtt 21688319  T
Q  462 acaagaaattagt 474  Q
    |||| ||||||||    
T  21688318 acaaaaaattagt 21688306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 473
Target Start/End: Original strand, 31495209 - 31495428
Alignment:
Q  267 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaag--------agaggaa--caaacacac 356  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||| | |||        |||||||  |||| ||||    
T  31495209 aacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacac 31495307  T
Q  357 caa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac- 452  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31495308 caagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagataca 31495407  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  31495408 aaaagagttacaagaaattag 31495428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 379541 - 379438
Alignment:
Q  371 ccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaa 469  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  379541 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaa 379442  T
Q  470 ttag 473  Q
    ||||    
T  379441 ttag 379438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 369 - 473
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699553
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaag 466  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  467 aaattag 473  Q
    |||||||    
T  26699547 aaattag 26699553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969170
Alignment:
Q  405 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattag 24969170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Original strand, 12747795 - 12747866
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  12747795 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattag 12747866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703558
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaatt 461  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  46703569 acaagaaattag 46703558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 29056609 - 29056415
Alignment:
Q  276 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagt 375  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||  | |||| || ||||    
T  29056609 tagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaag----agaaaagagaaacaaacacaccaagaagtgtttacacagt 29056515  T
Q  376 tcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatga-gttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    |||||| || | ||| ||  ||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  29056514 tcggtcaaaatggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataaaaggattgcaagaaattagt 29056415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24970030 - 24969787
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||  |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||    
T  24970030 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacactgatgaaaacaaagatgtgtg-agcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataatcacaaccaacaacaa 24969933  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag---ctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
     ||      ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||    |||| ||||||||||||||    
T  24969932 gaaagtagacacctagatctaatctactaatctaagtgaaaaaaaactcaaaaccataagcaaacgataaagtgaga----agagaaacaaacacaccaa 24969837  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagatt 409  Q
      | |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||    
T  24969836 gaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12119709 - 12119597
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  12119709 attgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttgg-gagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 12119611  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  12119610 ttacaagaaattag 12119597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3796637 - 3796568
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  3796637 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagaga 3796568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8393566 - 8393451
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  8393566 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa 8393467  T
Q  457 gaattacaagaaattag 473  Q
    |  ||||||||||||||    
T  8393466 g-gttacaagaaattag 8393451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8395775 - 8395660
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  8395775 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa 8395676  T
Q  457 gaattacaagaaattag 473  Q
    |  ||||||||||||||    
T  8395675 g-gttacaagaaattag 8395660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33989974 - 33989902
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33989974 gagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattag 33989902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38152556 - 38152468
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  38152556 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 38152468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 10047359 - 10047427
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  10047359 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 10047427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 39245974 - 39246042
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  39245974 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 39246042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 455
Target Start/End: Original strand, 21703784 - 21703928
Alignment:
Q  308 caaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagag 406  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| |||  |||| || | |||| || ||    
T  21703784 caaaatcacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacatcaagaaatgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatggg-gatag 21703878  T
Q  407 attgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21703879 attgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaaa 21703928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Original strand, 29999651 - 29999709
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagt 244  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29999651 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagt 29999709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 33090008 - 33089954
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33090008 gagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaa 33089954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36315346 - 36315258
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  36315346 aagaaaggaacaaacacaccaa-gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36329555 - 36329467
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  36329555 aagaaaggaacaaacacaccaa-gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 471
Target Start/End: Original strand, 44967829 - 44967937
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||  ||    
T  44967829 tgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatacaaatg-gtt 44967927  T
Q  462 acaagaaatt 471  Q
    ||||||||||    
T  44967928 acaagaaatt 44967937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31985745 - 31985689
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31985745 gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 31985689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5396790 - 5396700
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||   | ||||||||||||||||    
T  5396790 aagaaaggaagaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Original strand, 22882791 - 22882861
Alignment:
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  22882791 gagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattag 22882861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Original strand, 22934455 - 22934525
Alignment:
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  22934455 gagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattag 22934525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 54867164 - 54867209
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54867164 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaa 54867209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5269308 - 5269240
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  5269308 aagaaaggaacaaacacaacaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5269240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5350268 - 5350197
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaat 236  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5350268 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaata-aacttagg-tgtgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaat 5350197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16623405 - 16623322
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||   | ||||||||||||||||    
T  16623405 aggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 16623322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 451
Target Start/End: Original strand, 48142327 - 48142466
Alignment:
Q  310 aaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagatt 409  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||| || ||  ||||| ||||| || | | || ||||||||    
T  48142327 aaaccacaatcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaaaaatgtttacctagctctctccaaattgacctactgtagg-gagagatt 48142421  T
Q  410 gatctctccaatccac--tatcaatgagttc-ttacaaagagata 451  Q
    ||||| || |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48142422 gatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagata 48142466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 3777529 - 3777574
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3777529 aagaaaggaacaaacacaccga-gattgttgacccagttcggtccaa 3777574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5136237 - 5136155
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5136237 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 5136155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5138462 - 5138380
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5138462 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 5138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 5147657 - 5147702
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5147657 aagaaaggaacaaacacaccga-gattgttgacccagttcggtccaa 5147702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 242
Target Start/End: Original strand, 5280626 - 5280672
Alignment:
Q  196 ataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaa 242  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5280626 ataaatttagatgtgtggagtaaaggtaagtagtaaccaatatcaaa 5280672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677527
Alignment:
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattag 6677527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51338392 - 51338334
Alignment:
Q  210 gtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaa 268  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  51338392 gtggagcaaatgaaagtagtaatcaatatcaaagtagtcacaagcaacaacaataacaa 51338334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 5143239 - 5143307
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  5143239 aagaaaggaacaaacacactga-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5143307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16630792 - 16630709
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||   | ||||||||||||||||    
T  16630792 aggaacaaacacaccaagg-ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagaga-acagctctccaatccactat 16630709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Original strand, 39593649 - 39593702
Alignment:
Q  276 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataa 329  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39593649 tagatctaatctagaaaccaaatgtaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataa 39593702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42599691 - 42599623
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  42599691 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagaga 42599623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4215639 - 4215595
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  4215639 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4215595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 5635476 - 5635520
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  5635476 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5635520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6743532 - 6743474
Alignment:
Q  337 gaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  6743532 gaagaaaggaacaaacacaccaa-gat-gttgacccagttcggtccaatatgacctaatct 6743474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765133
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6765133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941612
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7941612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 8631419 - 8631463
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  8631419 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 8631463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 14789428 - 14789472
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  14789428 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14789472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16455575 - 16455531
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  16455575 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 16455531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 17662245 - 17662289
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  17662245 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17662289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 22800862 - 22800906
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  22800862 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 22800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24879323 - 24879279
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  24879323 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24879279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24880785 - 24880741
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  24880785 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24880741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24889129 - 24889085
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  24889129 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24889085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 234
Target Start/End: Original strand, 31495142 - 31495174
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31495142 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 31495174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091535
Alignment:
Q  427 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagt 32091535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 410 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34112939 - 34112875
Alignment:
Q  410 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||    
T  34112939 gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaattag 34112875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 37089372 - 37089416
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  37089372 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 37089416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 38928177 - 38928221
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  38928177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 38928221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40637407 - 40637363
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  40637407 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40637363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41639801 - 41639749
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggag 215  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41639801 tgttgtgaattcagactcaaatttcacatcaatacaaactatgatgtgtggag 41639749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 14069633 - 14069943
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14069633 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaataa 14069732  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14069733 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaaga 14069832  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14069833 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 14069932  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  14069933 caagaaattag 14069943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 14379661 - 14379971
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14379661 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaataa 14379760  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14379761 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaaga 14379860  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14379861 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 14379960  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  14379961 caagaaattag 14379971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 161 - 473
Target Start/End: Original strand, 41317236 - 41317544
Alignment:
Q  161 tctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  41317236 tctgttgtgaattcgaactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtttggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaac 41317335  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||| |||||||||||||||    
T  41317336 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagag----gagaaacaaacacaccaaa 41317431  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41317432 gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggat 41317531  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  41317532 tacaagaaattag 41317544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 47675936 - 47676246
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  47675936 tgttgtgaattcggacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 47676035  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47676036 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 47676135  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  47676136 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47676235  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  47676236 caagaaattag 47676246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Original strand, 31732767 - 31733079
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  31732767 ctgttgtgaattcggactcaaaactcacaccagtacaaactatgatgtgtggagcaaatgaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataatc 31732866  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    || || |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31732867 aacaataacaacctttagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaactcaccaaa 31732966  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31732967 gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 31733066  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  31733067 tacaagaaattag 31733079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 47673744 - 47674053
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  47673744 tgttatgaattcggacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaa 47673843  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47673844 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 47673943  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  47673944 ttgttgattcagttcggtccaacttgacttaatatggg-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47674042  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  47674043 caagaaattag 47674053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19502548 - 19502236
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19502548 ctgttgtgaattcagactcaaaactcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaaca 19502449  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19502448 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaag 19502349  T
Q  362 attgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19502348 attgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagt 19502249  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  19502248 tacaagaaattag 19502236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27348185 - 27347875
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||| || ||    
T  27348185 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacacaaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 27348087  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348086 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaacaaacacaccaaag 27347987  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27347986 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 27347887  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  27347886 acaagaaattag 27347875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 41648814 - 41649121
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  41648814 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaagcaataacaa 41648912  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || | || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41648913 caatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacaccaaaga 41649010  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  41649011 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 41649110  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  41649111 caagaaattag 41649121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 167 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43864609 - 43864302
Alignment:
Q  167 gtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataa 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| || ||| ||    
T  43864609 gtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtggtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaa 43864510  T
Q  266 caacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattg 365  Q
     |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  43864509 taacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccatctattg 43864410  T
Q  366 ttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  43864409 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttacag 43864310  T
Q  466 gaaattag 473  Q
    ||||||||    
T  43864309 gaaattag 43864302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4586530 - 4586219
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||  |    
T  4586530 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatgtaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataataa 4586431  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4586430 acaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacgaaag 4586331  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  4586330 attgtcgacccagttcggtccaagttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggtt 4586231  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||    
T  4586230 acaaaaaattag 4586219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18127015 - 18126702
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  18127015 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 18126916  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaga--gaggaacaaacacaccaa 359  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18126915 agaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagaggaacaaacacaccaa 18126816  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18126815 agattgttgacccaggtcggtcaaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg 18126716  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  18126715 ttacaagaaattag 18126702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 164 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 48489798 - 48489489
Alignment:
Q  164 gttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caa 262  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||    
T  48489798 gttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaataccaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacatgagcaataatcaa 48489700  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48489699 caataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaacaaacacaccaaaga 48489600  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  48489599 ttgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggtta 48489500  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  48489499 caagaaattag 48489489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26417685 - 26417375
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || ||    
T  26417685 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatatgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaataatca 26417586  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa-a 360  Q
    | || |||| ||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26417585 acaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaga 26417486  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  26417485 aattgttgacccagtttggtccaatttgacctaacctggg-gagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggt 26417387  T
Q  461 tacaagaaatta 472  Q
    ||||||||||||    
T  26417386 tacaagaaatta 26417375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8153705 - 8153400
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  8153705 tgttgggaattcggactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgcgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaacaacaa 8153607  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8153606 taataacaacacctagatctgatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aataaacacaccaaaga 8153511  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8153510 ttgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagtta 8153411  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  8153410 caagaaattag 8153400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 457
Target Start/End: Original strand, 36146212 - 36146502
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  36146212 tgttgtgaattcggactcaaaatt-acacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 36146310  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36146311 ataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaag 36146406  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36146407 attgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 36146502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23555410 - 23555098
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  23555410 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 23555311  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23555310 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcaaag 23555211  T
Q  362 attgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  23555210 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgt 23555111  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  23555110 tacaagaaattag 23555098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 38671025 - 38671332
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  38671025 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaacaaaaatcaaagtgaacacaagcaacgacaa 38671123  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    |||  ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38671124 taatgacaacacctagatcaaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataa--ggagagaagagagaaacaaacacaccaaaga 38671221  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  38671222 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgtta 38671321  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    ||| |||||||    
T  38671322 caataaattag 38671332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 161 - 473
Target Start/End: Original strand, 31105198 - 31105503
Alignment:
Q  161 tctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31105198 tctgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaata-aaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaac 31105296  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaa-gataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31105297 aataacaacacca---agatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaagataa--ggagagaagaga--aacaaacagaccaa 31105389  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
      | |||| |||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  31105390 gaaatgtttacccagttcggtccaacttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatggg 31105489  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  31105490 ttacaagaaattag 31105503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 163 - 458
Target Start/End: Original strand, 24525306 - 24525597
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| || |||| |||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  24525306 tgttgtgaattcaaattcaaaa-tcacatcaatacaaactatgatatgtgtagcaaagaaaagtagtaatcaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 24525404  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24525405 ataataacaacacctagatcaaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaag 24525500  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525501 attattgacccagttccgtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 24525597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1114021 - 1113715
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  1114021 tgttgtgaattccgaatcaaaactcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaactaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 1113922  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || || | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||    
T  1113921 caataataacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaaacaaacacaccaaaga 1113826  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1113825 ttgttgactcaattcggtcaaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 1113726  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
     ||||||||||    
T  1113725 taagaaattag 1113715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 160 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25616226 - 25615911
Alignment:
Q  160 ttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 259  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  25616226 ttctgttgtgaatacgtactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataa 25616128  T
Q  260 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga-gaagagaggaacaaacacacc 357  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  25616127 tcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaacaaacacacc 25616028  T
Q  358 aaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 456  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25616027 aaagattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaat 25615928  T
Q  457 gaattacaagaaattag 473  Q
    |  ||||||||||||||    
T  25615927 gggttacaagaaattag 25615911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 48491944 - 48491637
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  48491944 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacaccaataccaactataatgtgcggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 48491846  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| | | |||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  48491845 acaataacaacgcctagatctaatataggaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagag--gaacaaacacatcaaag 48491748  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  48491747 attgtttaccaagtttgg-ccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggtt 48491649  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  48491648 acaagaaattag 48491637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 158 - 473
Target Start/End: Original strand, 495783 - 496093
Alignment:
Q  158 agttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaac 257  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  495783 agttctgctgtaaatttggactcaaaa-tcacactaatacaaattatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaat 495881  T
Q  258 aacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacc 357  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    ||||||||||||    
T  495882 aacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaatagaaaatcacaagcaagagataaagagagaaaaga----aacaaacacacc 495977  T
Q  358 aaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  495978 aaagattgttgacccggttctgtccaacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatg 496077  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      || |||||||||||    
T  496078 ggttgcaagaaattag 496093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29991399 - 29991111
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||| || || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  29991399 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaa 29991300  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 383  Q
    | ||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  29991299 tataggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 29991201  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  29991200 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 29991111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35854255 - 35853972
Alignment:
Q  193 aatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagta 291  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| |    
T  35854255 aatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagga 35854156  T
Q  292 accaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttg 388  Q
    | |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35854155 agcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 35854057  T
Q  389 acttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    || || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  35854056 acctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 35853972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 294 - 473
Target Start/End: Original strand, 2759128 - 2759307
Alignment:
Q  294 caaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgactta 393  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2759128 caaagttaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaagggagagaagagagaaagaaacacaccaatgattgttgaccaagttcggtccaacttgaccta 2759227  T
Q  394 atctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2759228 atctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttacaagaaattag 2759307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 205 - 474
Target Start/End: Original strand, 23564910 - 23565172
Alignment:
Q  205 gatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa 304  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  23564910 gatgtgtggagtgaagaaaagtagtgaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaataacaaaacc---tagatctaatctagaaatcaaagtgaaaa 23565006  T
Q  305 gctc-aaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggaga 403  Q
     | | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  | || | | ||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  23565007 tcacaaaaaccacaagcaaaagataaa--tagagaagaga--aacaaacacaccaagaaatgatta-ccagttcagtccaacttgacctactctaggaga 23565101  T
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23565102 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagt 23565172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4179119 - 4178832
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  4179119 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgtaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 4179020  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcgg-tcca 383  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |    
T  4179019 tctaggaatcaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagtttggttcaa 4178921  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| |  |||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  4178920 acttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattag 4178832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 163 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31519258 - 31518965
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  ||||  |||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||||||    
T  31519258 tgttgtgaatttggactcaaaactcacgccaatgaaaataa-gatgtgtggagcaaataaaaatagtaattaatatcaatgtaatcataagcagcaacaa 31519160  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||        |||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||  |    
T  31519159 taataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagc--------acaagcaaaagataaag--aaagaagaga--aacaaacacaccaagaa 31519072  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg-agagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
     |||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31519071 atgtttatccagttcggtccaacttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 31518972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Original strand, 12097789 - 12097931
Alignment:
Q  281 ctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12097789 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggt 12097884  T
Q  381 ccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccacta 427  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12097885 ccaacttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 257 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 39731642 - 39731426
Alignment:
Q  257 caacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacac 354  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||    
T  39731642 caacaataacaacacc---tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagac 39731547  T
Q  355 accaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39731546 accaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatac 39731447  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  39731446 aaaagagttacaagaaattag 39731426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23344332 - 23344033
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||    
T  23344332 tgttgtgaattcagacccaaaa-tcacatcaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatccaagtaaccacaagcaacaacaa 23344235  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    |||||| |||   ||||| |||||||  || ||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |    
T  23344234 taacaaaacc---tagatttaatctacgaatcaaagtgaaaaacacaaaaccgcaagaaagagataaa--gagagaagaga--aacatacacaccaagaa 23344142  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
     |||| |||  ||||||||||||||||| || |||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  23344141 atgtttaccttgttcggtccaacttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggtta 23344044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 351 - 473
Target Start/End: Original strand, 2360960 - 2361082
Alignment:
Q  351 acacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 450  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2360960 acacaccaaaggttattgacccagttcggttcaacttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 2361059  T
Q  451 acaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  2361060 acaaatgagttacaagaaattag 2361082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 455
Target Start/End: Original strand, 25766795 - 25767052
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| | |  |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  25766795 tatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaataacaaagtgagcgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 25766894  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaa-gataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatc 396  Q
    |||| | |||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||    
T  25766895 aaaaacacaaatc-acaagcaaaaagataaaagggagagaatagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactc 25766993  T
Q  397 tgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25766994 tggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaa 25767052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 349 - 473
Target Start/End: Original strand, 30024718 - 30024842
Alignment:
Q  349 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 448  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30024718 aaacacactaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagag 30024817  T
Q  449 atacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  30024818 atacaaatgggttacaagaaattag 30024842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 338 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22270166 - 22270031
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 436  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22270166 aagaaaggaacaaacacaccaagagat-gttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagt 22270068  T
Q  437 tcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22270067 tcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 22270031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 48409137 - 48408879
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  48409137 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 48409038  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaa-gataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatc 396  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||| || ||    
T  48409037 aaaagcacaaatc-acaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactc 48408939  T
Q  397 tgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa 455  Q
    |||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  48408938 tggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaa 48408879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358164
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 32358154  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  32358155 aagaaattag 32358164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Original strand, 34310705 - 34310826
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 451  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34310705 acaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagata 34310804  T
Q  452 caaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  34310805 caaatgtgttacaagaaattag 34310826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Original strand, 30024610 - 30024714
Alignment:
Q  217 aaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30024610 aaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccac 30024709  T
Q  317 aagca 321  Q
    |||||    
T  30024710 aagca 30024714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Original strand, 6359951 - 6360062
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6359951 attgttgacccagttcgatccaacttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 6360050  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  6360051 acaagaaattag 6360062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30814628 - 30814530
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 437  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814628 aagaaaggaacaaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 372 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29608896 - 29608795
Alignment:
Q  372 cagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatt 471  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29608896 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 29608797  T
Q  472 ag 473  Q
    ||    
T  29608796 ag 29608795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 36574324 - 36574626
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||| |  | || |||||||    
T  36574324 tgttgtgaattcagactcaattctcacaccaata-aactta-gatgtgtggatcaaaggaaaatattaaccaatatcaaagtaatctcaggccacaacaa 36574421  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |  |||||||||| |||  |    
T  36574422 caataacaa-acttagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagaaaaagataaag--agagaagaaa--aacaaacacatcaagaa 36574515  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
     |||| |||||||| ||||||| ||||| || ||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||    
T  36574516 atgtttacccagtttggtccaaattgacctactctagg-gatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtt 36574614  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  36574615 acaagaaattag 36574626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6432133 - 6432029
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6432133 acccagttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 6432034  T
Q  469 attag 473  Q
    |||||    
T  6432033 attag 6432029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3259053
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttac 3259063  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    || |||||||    
T  3259062 aataaattag 3259053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599444
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaacttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttac 48599434  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  48599435 aagaaattag 48599444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 276 - 473
Target Start/End: Original strand, 43504064 - 43504266
Alignment:
Q  276 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaa-agattgttgaccc 372  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  43504064 tagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcaccc 43504162  T
Q  373 agttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgaattacaagaaa 469  Q
    |||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  43504163 agttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaa 43504262  T
Q  470 ttag 473  Q
    ||||    
T  43504263 ttag 43504266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Original strand, 4253334 - 4253639
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaa-ctcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 260  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  | ||||||||    
T  4253334 ctgttgtaaatttgaactcaaaatctcacaccaata-aactta-gatgtgtgtagcaaaagaaagtattaaccaatatcaaagtaacctcaggcaacaac 4253431  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    ||||| || |  || |||||||||| ||| || ||| | ||||||  ||||| |||||||||| |||||||  || |||||||  ||||||||||||||     
T  4253432 aataataaaaa-acctagatctaatatagaaatcaa-gcgaaaagtacaaaagcacaagcaaacgataaag--agtgaagaga--aacaaacacaccaag 4253525  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
     | |||| ||| |||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |      
T  4253526 aaatgtttacctagttcggtccaaattgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaaggg 4253625  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||| ||||||||    
T  4253626 ttacatgaaattag 4253639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2390453 - 2390340
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||      
T  2390453 agattattcacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatggg 2390354  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  2390353 ttacaagaaattag 2390340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508816
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || ||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaacttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4508806  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  4508807 aagaaattag 4508816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 364 - 474
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359428
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaatt 461  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 8359415  T
Q  462 acaagaaattagt 474  Q
    |||||||||||||    
T  8359416 acaagaaattagt 8359428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510658
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || |||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttac 4510648  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  4510649 aagaaattag 4510658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512500
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || |||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttac 4512490  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  4512491 aagaaattag 4512500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 283
Target Start/End: Original strand, 12096969 - 12097084
Alignment:
Q  166 tgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataa 265  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  12096969 tgtgaattcggactcaaaa-tcacacca-tataaactatgatgcttggaataaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaacaataa 12097066  T
Q  266 caacaccacttagatcta 283  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  12097067 caacaacacctagatcta 12097084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20344068 - 20343954
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  20344068 agattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag 20343969  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  20343968 -gttacaagaaattag 20343954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 473
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328501
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattacaag 466  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  467 aaattag 473  Q
    |||||||    
T  22328495 aaattag 22328501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 445
Target Start/End: Original strand, 1560647 - 1560749
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 442  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1560647 aacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 1560746  T
Q  443 aaa 445  Q
    |||    
T  1560747 aaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Original strand, 29159783 - 29159871
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||   | ||||||||||||||||    
T  29159783 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga-gcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9190125 - 9190057
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||    
T  9190125 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagaga 9190057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 20284069 - 20284137
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  20284069 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 20284137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 24790028 - 24789927
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 443  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24790028 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttaca 24789929  T
Q  444 aa 445  Q
    ||    
T  24789928 aa 24789927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5116739 - 5116663
Alignment:
Q  397 tgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  5116739 tgggggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaatta 5116663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518857
Alignment:
Q  421 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaa 469  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 31518857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40808909 - 40808734
Alignment:
Q  205 gatgtgtggagtaaa-ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaa 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||||||||| ||||  || ||| | ||||||||  ||| ||||| ||    
T  40808909 gatgtgtggagcaaaaggaaagtagtaacaaatatcaaagtattctcaagcaacaacaataataaca-gacctaggtttaatctag-gacccaagtgtaa 40808812  T
Q  304 agctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaac 385  Q
    | | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||| | | || || ||||||||||||||    
T  40808811 aacacaaaaccacaagcaaaagatatagagagaaaaga----aacaaacacaccaaaaaatatttactcagttcggtccaac 40808734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 18388756 - 18388838
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18388756 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 18388838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 18392192 - 18392274
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18392192 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 18392274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 2580370 - 2580438
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||    
T  2580370 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagaga 2580438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396393
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaac-ttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaa 18396393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46516427 - 46516359
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||    
T  46516427 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 46516359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6430496 - 6430444
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggag 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  6430496 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggag 6430444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 472
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904726
Alignment:
Q  371 ccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaa 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgatc-actatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaa 3904722  T
Q  469 atta 472  Q
    ||||    
T  3904723 atta 3904726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4796779 - 4796718
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagaga 405  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  4796779 aggaacaaacacaccaa-gattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggaga 4796718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5817387 - 5817341
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5817387 aagaaaggaacaaacacaccaaagattgttaactcagttcggtccaa 5817341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 6592336 - 6592418
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6592336 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 6592418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 6594554 - 6594636
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6594554 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 6594636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 32060318 - 32060400
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32060318 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 32060400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 400
Target Start/End: Original strand, 55933 - 55989
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  55933 aggaacaaacacaccaa-gattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 55989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33332567 - 33332499
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  33332567 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagaga 33332499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 406
Target Start/End: Original strand, 47263664 - 47263725
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagag 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||    
T  47263664 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag 47263725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 428
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983352
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 399
Target Start/End: Original strand, 21988893 - 21988948
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgg 399  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  21988893 aggaacaaacacaccga-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 21988948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 42330997 - 42331041
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  42330997 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 42331041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 35960803 - 35960864
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  35960803 gaacaaacacaccaa-gattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagaga 35960864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44848798 - 44848713
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  44848798 aggaacatacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 44848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049340
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1049340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 397
Target Start/End: Original strand, 2479323 - 2479375
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct 397  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  2479323 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatct 2479375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035969
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3035969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 4510339 - 4510391
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggag 215  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  4510339 tgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggag 4510391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 4512181 - 4512233
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggag 215  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  4512181 tgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggag 4512233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 7471980 - 7472024
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  7471980 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7472024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9185280 - 9185237
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9185280 aagagaggaacaaacacc---aagattgttgacccagttcggtccaa 9185237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11759416 - 11759372
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  11759416 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11759372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 13099474 - 13099518
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  13099474 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13099518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20299749 - 20299705
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20299749 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20626327 - 20626283
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20626327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20626283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20630218 - 20630174
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20630218 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20630174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20642637 - 20642593
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20642637 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20642593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38394275 - 38394231
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  38394275 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 38394231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 40836743 - 40836787
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  40836743 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40836787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40946617 - 40946573
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  40946617 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40946573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44724868 - 44724824
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  44724868 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 44724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48457942 - 48457898
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  48457942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 48457898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 90)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 170 - 473
Target Start/End: Original strand, 42428237 - 42428540
Alignment:
Q  170 aattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaac 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||    
T  42428237 aattcgaactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaataataataac 42428336  T
Q  270 accacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttga 369  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42428337 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaagaagaacaaacacactaaagattgttga 42428436  T
Q  370 cccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaa 469  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42428437 cccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 42428536  T
Q  470 ttag 473  Q
    ||||    
T  42428537 ttag 42428540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Original strand, 28750455 - 28750764
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28750455 tgttgtgaatttggactcaaaactcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaa 28750554  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750555 taataacaacacctagatctaatctagtaatccaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaatataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 28750654  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  28750655 ttattgacccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggtta 28750754  T
Q  463 caagaaatta 472  Q
    || |||||||    
T  28750755 caggaaatta 28750764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 42426035 - 42426345
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||    
T  42426035 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacatcaa 42426134  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42426135 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaaga 42426234  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  42426235 ttgttgacctagttcagtccaacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttg 42426334  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  42426335 caagaaattag 42426345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32637190 - 32636882
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  32637190 ttgtgaattcggattcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacaaatttcacactaaacacaagcaacatcaata 32637091  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagatt 364  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32637090 ataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaagggagggaagagagaaacaaacacaccaaagatt 32636991  T
Q  365 gttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattaca 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32636990 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 32636891  T
Q  465 agaaattag 473  Q
    |||||||||    
T  32636890 agaaattag 32636882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 538387 - 538083
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  538387 ttgtgaattcagactcaaaactcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaata 538288  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagatt 364  Q
    | |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  538287 ataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aagaaacacaccaaagatt 538192  T
Q  365 gttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattaca 464  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  538191 gttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 538092  T
Q  465 agaaattag 473  Q
    |||||||||    
T  538091 agaaattag 538083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13488569 - 13488261
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| | |||    
T  13488569 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagtaaaggaaagtaataaccaatttcaaagtgaacacaatcaatagcaa 13488470  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13488469 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaaga--aagggagagaagagaggaacaaagacacaaaaga 13488372  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13488371 ttattgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 13488272  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  13488271 caagaaattag 13488261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 164 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13240118 - 13239809
Alignment:
Q  164 gttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaat 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  13240118 gttgtgaattcgaactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaac 13240020  T
Q  264 aacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 363  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13240019 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaaaat 13239920  T
Q  364 tgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  13239919 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 13239820  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  13239819 caagaaattag 13239809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 160 - 473
Target Start/End: Original strand, 39468345 - 39468659
Alignment:
Q  160 ttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||    
T  39468345 ttctgttgtgaattcgaactcaaaacttacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataa 39468444  T
Q  260 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacca 358  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39468445 tcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacgagcacaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacta 39468544  T
Q  359 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39468545 aagattgttgacccagttcagtccaatttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 39468644  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  39468645 gttacaagaaattag 39468659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 163 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19806729 - 19806454
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||    
T  19806729 tgttgtgaattcggactcaaaactcac--caatacaaactatgatgtgtggggcaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtgaacataggcaatagcaa 19806632  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19806631 taataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacaccccaaaga 19806532  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt 19806454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 30682722 - 30683034
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  30682722 tgttgtgaatacggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 30682821  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30682822 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 30682921  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |      
T  30682922 attgttga-ccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaaggg 30683020  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  30683021 ttacaagaaattag 30683034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 202 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37439470 - 37439200
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtga 301  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  37439470 tatgatgtgtggagcaaaagaa-gtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctaggtctaatctagtaatcaaaatga 37439372  T
Q  302 aaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctggg 400  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  37439371 aaagcacaaaaccacaagcataagataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgga 37439272  T
Q  401 agagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37439271 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 37439200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 534127 - 533827
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  534127 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatagaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtagacacaagcaacaataa 534028  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| |||      |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  534027 taataacaacac------ctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaaccacaagcaaaagataaaa--agagaagagaag--caaagacaccaaaga 533938  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  533937 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 533838  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    ||| |||||||    
T  533837 caaaaaattag 533827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 8565748 - 8566056
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  8565748 tgttgtgaatttggattcaaaa-tcacactaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaacaacaa 8565846  T
Q  263 taacaa---caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    ||| ||   || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  8565847 taataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagaa-aacaaacacaccaa 8565943  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||      
T  8565944 -gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatggg 8566042  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  8566043 ttacaagaaattag 8566056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 161 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33832048 - 33831738
Alignment:
Q  161 tctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||    
T  33832048 tctgttgtgaattcggactcaaaatt-acacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaacacaagcaataac 33831950  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa-gctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    || || | || ||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||    
T  33831949 aacaatagcagcacctaaatctaatctaggaatcaaagtgaaaaagctcaaagccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaaaacaccaa 33831852  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33831851 agattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg 33831752  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  33831751 ttacaagaaattag 33831738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 31183341 - 31183031
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||| ||    
T  31183341 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaccatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagggaacacaagcaacaaaaa 31183243  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaa-----aagataaagggagagaagagaggaacaaacacacc 357  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31183242 taataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaattcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacacc 31183145  T
Q  358 aaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31183144 aaagaatgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaatg 31183045  T
Q  458 aattacaagaaatta 472  Q
      |||||||||||||    
T  31183044 -gttacaagaaatta 31183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 196 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16452410 - 16452138
Alignment:
Q  196 ataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaacca 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || ||    
T  16452410 ataaatta-gatgtgtggagtaaaggaaaatagtaaccaatattaacgtaaacacaagcaacaacaataacaacag---ttagatctaatctaggaatca 16452315  T
Q  296 aagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaga-taaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaa 394  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |  ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  16452314 aattgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaaaataaaggaagagaagata--aacaaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctac 16452217  T
Q  395 tctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16452216 tctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 16452138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25413090 - 25412818
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||| | || |||||| || ||| || |||| ||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  25413090 tatgatgtgtggagcaaaggaaattagtaatcaatatccaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaagag 25412991  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||    
T  25412990 aaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctgg 25412892  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25412891 aggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 25412818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 163 - 415
Target Start/End: Original strand, 5887235 - 5887486
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  5887235 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 5887333  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccac--aagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5887334 taataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaaatgaaaaacttaaaaccacaaaagcaaaagataaa--gagagaagagagaaacaaacacaccaaa 5887431  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctc 415  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  5887432 gattgttgatccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctc 5887486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13343390 - 13343119
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  13343390 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 13343291  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||    
T  13343290 aaaagcac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcaaagattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctgg 13343192  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13343191 aggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggattacaagaaattag 13343119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30182918 - 30182646
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||   || ||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  30182918 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 30182819  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  30182818 aaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctgg 30182720  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  30182719 aggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattag 30182646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 187 - 473
Target Start/End: Original strand, 36073866 - 36074152
Alignment:
Q  187 cacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 285  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  36073866 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 36073965  T
Q  286 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aa 384  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  36073966 ctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatc-acaagcaaaacataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcatccagttcggtccaaa 36074064  T
Q  385 cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||| || | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36074065 cttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 36074152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 163 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 42927260 - 42926964
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||   |||  | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42927260 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcataccaacgaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaaagtagcaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 42927162  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag----ggagagaagagaggaacaaacacacca 358  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  42927161 caataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagcaaaagataaggagataagaga--aacaaacacacca 42927064  T
Q  359 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42927063 agaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 42926964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 389
Target Start/End: Original strand, 16649635 - 16649856
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||| |  | |||    
T  16649635 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacaatcaaagtgaacacaagtagtagcaa 16649733  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  16649734 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaacg----gaaaagagaaacaaacacaccaagga 16649829  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttga 389  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16649830 ttgttgacctagtttggtccaacttga 16649856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16409825 - 16409532
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  16409825 tcacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 16409726  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggt 380  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  16409725 tctaggaaacaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggt 16409627  T
Q  381 ccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16409626 ccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 16409532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26178255 - 26177939
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| |||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || |    
T  26178255 tgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatc 26178157  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacacca 358  Q
    ||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||    
T  26178156 aatgataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacacca 26178058  T
Q  359 aaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 454  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26178057 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaa 26177958  T
Q  455 atgaattacaagaaattag 473  Q
    | || ||||||||||||||    
T  26177957 aagagttacaagaaattag 26177939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147319
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 40147329  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  40147328 aagaaattag 40147319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 349 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28278498 - 28278374
Alignment:
Q  349 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 448  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28278498 aaacacaccaagaattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagag 28278399  T
Q  449 atacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  28278398 atacaaatgggttacaagaaattag 28278374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 9789021 - 9789335
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||      |||||| || |    
T  9789021 tgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaacaaagtgtgtgcaagcaaaaatc 9789119  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacacca 358  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| ||  || ||||||| | ||| || ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||    
T  9789120 aacaa-aacagcacctagatctaatctaggaaagaa-gtgaaaaacacaatac-acaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacacca 9789216  T
Q  359 aaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 454  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9789217 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaa 9789316  T
Q  455 atgaattacaagaaattag 473  Q
    | || ||||||||||||||    
T  9789317 aagagttacaagaaattag 9789335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38747197 - 38747063
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 437  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38747197 aagaaaggaacaaatccaccaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtt 38747099  T
Q  438 cttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     || ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38747098 tttccaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 38747063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213523
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  213533 caagaaattag 213523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058119
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 5058119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 267 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 26171030 - 26170848
Alignment:
Q  267 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga-- 362  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||||      
T  26171030 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagaga 26170932  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 445  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170931 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 26170848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 9049209 - 9049452
Alignment:
Q  218 aaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccaca 317  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| || ||||   || | ||||||| ||| ||  || ||||||| | ||||||||||    
T  9049209 aaggaaaatagtaaccaatatcaaagtaaccacaagaaacaacaacaataacaaatctaa-atctaatatagaaattaa-gtgaaaaacacaaaaccaca 9049306  T
Q  318 agcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctc 417  Q
    |||||||||||        |||||||  ||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| || || | |||| |||| |||||||||||    
T  9049307 agcaaaagata--------gaagaga--aacaaacacaccaaaaaatgtttatccatttcggtccaacttcacctactttgggggagatattgatctctc 9049396  T
Q  418 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  9049397 caatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattag 9049452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 473
Target Start/End: Original strand, 18441594 - 18441759
Alignment:
Q  314 cacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagat 408  Q
    |||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |  |||||||    
T  18441594 cacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagat 18441693  T
Q  409 tgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18441694 tgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 18441759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 350 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27015704 - 27015597
Alignment:
Q  350 aacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 449  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015704 aacacaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 27015605  T
Q  450 tacaaatg 457  Q
    ||||||||    
T  27015604 tacaaatg 27015597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 473
Target Start/End: Original strand, 3075629 - 3075768
Alignment:
Q  332 ggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaa 431  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||| || ||||||||||||| || | || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3075629 ggagagaagaga--aacaaacacaccaagaaatgttcacccaatttggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaa 3075726  T
Q  432 tgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  3075727 cgaattcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattag 3075768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 357 - 473
Target Start/End: Original strand, 42309929 - 42310045
Alignment:
Q  357 caaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 456  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |  || | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42309929 caaagattgtttatccaattcggtcaaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaa 42310028  T
Q  457 gaattacaagaaattag 473  Q
    || ||||||||||||||    
T  42310029 gagttacaagaaattag 42310045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 308 - 473
Target Start/End: Original strand, 13695639 - 13695801
Alignment:
Q  308 caaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||| ||||| || | |||  ||||||    
T  13695639 caaaacaacaagcaaaggataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaagaaatgtttacctagtttggtccaagttgacctactatggaggagaga 13695734  T
Q  408 ttgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13695735 ataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 13695801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 474
Target Start/End: Original strand, 27637618 - 27637724
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaattacaag 466  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  27637618 acccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaag 27637716  T
Q  467 aaattagt 474  Q
    ||||||||    
T  27637717 aaattagt 27637724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316820
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgaa 459  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 316834  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  316833 ttacaagaaattag 316820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641029
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16640941 tgtttacccagttcggccctacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttacaaagagatacaaa 16641029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906141
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaac-ttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 33906127  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||| ||||    
T  33906128 ttacaagaagttag 33906141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Original strand, 3075549 - 3075629
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaag 243  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3075549 tgttgtgaattcggactaaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaag 3075629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10593445 - 10593315
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 442  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10593445 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 10593346  T
Q  443 -aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  10593345 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 10593315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 29751156 - 29751270
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  29751156 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 29751255  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  29751256 -gttacaagaaattag 29751270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Original strand, 10281730 - 10281819
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  10281730 aagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 10281819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29720551 - 29720422
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 442  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29720551 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 29720452  T
Q  443 aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  29720451 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 29720422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29722711 - 29722582
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaactt-gacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 442  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29722711 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 29722612  T
Q  443 aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  29722611 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 29722582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 22536286 - 22536400
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  22536286 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 22536385  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  22536386 -gttacaagaaattag 22536400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9353446 - 9353361
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  9353446 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36932464 - 36932379
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  36932464 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17004077 - 17004009
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  17004077 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 17004009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926925
Alignment:
Q  430 aatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattag 42926925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25078293 - 25078211
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25078293 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 25078211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25136262 - 25136180
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25136262 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 25136180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31300713 - 31300668
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31300713 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaa 31300668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40380263 - 40380181
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40380263 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctt 40380181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40382474 - 40382392
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40382474 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctt 40382392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40147615 - 40147558
Alignment:
Q  158 agttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggag 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  40147615 agttgtgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggag 40147558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 397
Target Start/End: Original strand, 14520208 - 14520268
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct 397  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  14520208 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct 14520268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 455
Target Start/End: Original strand, 10054850 - 10054909
Alignment:
Q  397 tgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10054850 tgggggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaa 10054909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 428
Target Start/End: Original strand, 15464518 - 15464600
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  15464518 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 15464600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11917084 - 11917001
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  11917084 aggaacaaacacaccga-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 11917001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 18441440 - 18441512
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18441440 ctgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 18441512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 407
Target Start/End: Original strand, 28832247 - 28832307
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  28832247 aacaaacacaccaa-gattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 28832307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 30793326 - 30793212
Alignment:
Q  341 agaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct 439  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||| |||  ||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  30793326 agagaaacaaacacaccaagaaatgtttaccttgttcggtccaacaatgacttactctaggggagaga--gatctctccacttcactatcaattagttct 30793229  T
Q  440 t-acaaagagatacaaa 455  Q
    | |||||||||||||||    
T  30793228 ttacaaagagatacaaa 30793212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42127527 - 42127459
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  42127527 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagaga 42127459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5058423 - 5058371
Alignment:
Q  163 tgttgtgaatt-cgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtgga 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5058423 tgttgtgaatttcgaactcaaatttcacaccaatataaattatgatgtgtgga 5058371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910685
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 27910685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3326045 - 3325971
Alignment:
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagataca-aatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3326045 gagagatattgatctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatg-gttacaagaaattag 3325971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24553623 - 24553565
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct 397  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  24553623 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatct 24553565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12084294 - 12084248
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaag-attgttgacccagttcggtcca 383  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12084294 aagaaaggaacaaacacaccaaaatattgttgacccagttcggtcca 12084248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16544581 - 16544499
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16544581 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 16544499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16546803 - 16546721
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16546803 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 16546721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 19588726 - 19588771
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19588726 aagaaaggaacaaacactc-aaagattgttgacccagttcggtccaa 19588771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2175197 - 2175153
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  2175197 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2175153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2724172 - 2724128
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  2724172 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2724128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  369 acccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6747583 - 6747539
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  6747583 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagaga 6747539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 10529099 - 10529143
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  10529099 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10529143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18466963 - 18466919
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  18466963 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 18466919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 21684452 - 21684496
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  21684452 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 21684496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24127135 - 24127091
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  24127135 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24127091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 25921473 - 25921517
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  25921473 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 25921517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27912815 - 27912771
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  27912815 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 34477053 - 34477097
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  34477053 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 34477097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 34479418 - 34479462
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  34479418 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 34479462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39798326 - 39798282
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  39798326 ttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagaga 39798282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40221802 - 40221758
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  40221802 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40221758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 270
Target Start/End: Original strand, 42309827 - 42309930
Alignment:
Q  166 tgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataa 265  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||  |||  | ||||| || || ||||||||||  ||||| || ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  42309827 tgtgaattaggactcaaaa-tcacatcaatgaaaacaaagatgtatgcagcaaaggaaagtgataacctatatcatagtaatcacaagcaacaacaataa 42309925  T
Q  266 caaca 270  Q
    |||||    
T  42309926 caaca 42309930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 723547 - 723854
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  723547 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaacaa 723645  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  723646 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacaccaaaga 723743  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 723843  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  723844 caagaaattag 723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 34139573 - 34139881
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  34139573 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 34139671  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34139672 taataacaagacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacaccaaaga 34139769  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggtt 34139869  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  34139870 acaagaaattag 34139881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 171 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 38312600 - 38312297
Alignment:
Q  171 attcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaac 269  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || |||    
T  38312600 attcggactcaaaa-tcacaccaatataaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaatcaacaataac 38312502  T
Q  270 accacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttga 369  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38312501 agcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagattgttga 38312402  T
Q  370 cccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaa 469  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38312401 cccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 38312302  T
Q  470 ttagt 474  Q
    |||||    
T  38312301 ttagt 38312297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29868237 - 29867927
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29868237 tgttgtgaattcggactcaaatttcacagcaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaatcaattttaaagtaaacacaagcaacaacaa 29868138  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29868137 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagagaagagagaaacaaacacatcaaaga 29868038  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29868037 ttattgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 29867938  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  29867937 caagaaattag 29867927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 17057169 - 17057479
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  17057169 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 17057267  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057268 acaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacaccaaag 17057367  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17057368 attgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 17057467  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||    
T  17057468 acaaaaaattag 17057479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 17085152 - 17085462
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  17085152 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 17085250  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085251 acaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacaccaaag 17085350  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17085351 attgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 17085450  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||    
T  17085451 acaaaaaattag 17085462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 33162254 - 33162560
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  33162254 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 33162352  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33162353 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaat--agagaagaga--aacaaacacaccaaag 33162448  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  33162449 attgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggtt 33162548  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  33162549 acaagaaattag 33162560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Original strand, 36987875 - 36988187
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  36987875 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaataatca 36987973  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36987974 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaag 36988073  T
Q  362 attgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  36988074 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagt 36988173  T
Q  461 tacaagaaattagt 474  Q
    ||||||||||||||    
T  36988174 tacaagaaattagt 36988187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Original strand, 2334217 - 2334528
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2334217 ctgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 2334315  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2334316 ataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaacttcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaag 2334415  T
Q  362 attgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  2334416 attgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagt 2334515  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    ||| |||||||||    
T  2334516 tactagaaattag 2334528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Original strand, 11151394 - 11151701
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  11151394 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaataaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaacaaca 11151493  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11151494 ataataacaacagctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 11151589  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  11151590 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggtt 11151689  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  11151690 acaagaaattag 11151701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42362713 - 42362410
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||    
T  42362713 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaacaacaa 42362615  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42362614 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagagagaaacaaacacaccaaaga 42362517  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  42362516 ttgttgaccca----ggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 42362421  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  42362420 caagaaattag 42362410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11067630 - 11067363
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtga 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11067630 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtga 11067531  T
Q  302 aaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  11067530 aaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggg 11067435  T
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11067434 gagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 11067363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 14633628 - 14633936
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14633628 tgttgtgatttcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 14633726  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14633727 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcaaaagataaa--gagagaatagagaaacaaacacaccaaaga 14633824  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  14633825 ttgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggtt 14633924  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  14633925 acaagaaattag 14633936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36773926 - 36773620
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  36773926 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagccaacaagaagcaacaaca 36773828  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  36773827 ataataacaacacctagatctaatctagtaataaaaaagaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--aaagaagaga--aacaaacacaccaaag 36773732  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36773731 attgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtt 36773632  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  36773631 acaagaaattag 36773620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Original strand, 36317813 - 36318120
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36317813 tgttgtgaatttggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtagaacaaatgaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacagcaa 36317912  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  36317913 taataacaacacctagatttaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaag--aaagaagata--aacaaacacaccaaaga 36318008  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36318009 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36318108  T
Q  463 caagaaattagt 474  Q
    ||| ||||||||    
T  36318109 caataaattagt 36318120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 39285202 - 39284930
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| || | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39285202 tgttgtgaattcggacttaaaactcataccaatacaact-atgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 39285104  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacc---aa 359  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||   ||    
T  39285103 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccattaa 39285008  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 6594804 - 6595116
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || || ||    
T  6594804 tgttgtgaatttggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatca 6594902  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6594903 acaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaa 6595002  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |      
T  6595003 gattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaaggg 6595102  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  6595103 ttacaagaaattag 6595116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11690856 - 11690559
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||          
T  11690856 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaa-gtgaacacaagcaa------ 11690764  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaa-cacaccaaag 361  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| ||||||||||    
T  11690763 taacaacacc---tagatctaatctaggaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaccaaag 11690671  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||    
T  11690670 attgttgatccagttcggtccaacttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggtt 11690571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45100100 - 45099813
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  45100100 tcacaccaatacgaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 45100001  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  45100000 tctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatc-acaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 45099902  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45099901 acttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 45099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Original strand, 4502955 - 4503242
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  4502955 tcacaccaatacaaactataatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 4503054  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4503055 tctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 4503153  T
Q  384 acttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4503154 acttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 4503242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 163 - 446
Target Start/End: Original strand, 14202224 - 14202495
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| | ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  14202224 tgttgtgaattcggagtcaaaa-tcataccaacacaaactatgatatgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacgcaagcaacaacaa 14202322  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14202323 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcttaaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagagataaacaaacacaccaaaga 14202420  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 446  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14202421 ttgttgacccagttcggtcc---------taatcttggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag 14202495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 473
Target Start/End: Original strand, 5723072 - 5723366
Alignment:
Q  180 caaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttag 278  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || ||| || |||| ||| |||    
T  5723072 caaaaatcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacaacacctag 5723171  T
Q  279 atctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcg 378  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5723172 atctaatctaggaatcaaaaagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcg 5723270  T
Q  379 gtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| ||||| || || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  5723271 gtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattag 5723366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 473
Target Start/End: Original strand, 36205494 - 36205774
Alignment:
Q  193 aatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagta 291  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| |    
T  36205494 aatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagga 36205593  T
Q  292 accaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgac 390  Q
    | |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36205594 atcaaagtgaaaagcagaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgac 36205692  T
Q  391 ttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     || |||||  || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36205693 ctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 36205774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11049912 - 11049633
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11049912 tgttgtgagttcggacgcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgcgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtaatcataagcaacaacaa 11049815  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| ||    || |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||| ||  |    
T  11049814 taataa----acctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacacaaagaa 11049723  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 452  Q
     |||| ||||||||| |||||| ||||| || | ||   ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11049722 atgtttacccagttcagtccaatttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagatac 11049633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 4484166 - 4484441
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  4484166 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 4484265  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga--gaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatct 397  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||    
T  4484266 aaaagc-aaaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactct 4484364  T
Q  398 gggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  4484365 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 4484441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24885953 - 24885781
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  24885953 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgtagcaaaggaaaatagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaacaa 24885855  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga 336  Q
    | | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885854 tgataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggaga 24885781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26353495 - 26353242
Alignment:
Q  207 tgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagc 306  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||   |||||||||||     || ||||||||||| |    
T  26353495 tgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaatcacaaggaacaacaataacaaaac---ttagatctaat-----aatcaaagtgaaaaac 26353404  T
Q  307 tcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagag 406  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  | |||||    
T  26353403 acaaaaccacaagcaaaagataa--ggagaggagaga--aacaaacacacaaaaaat-gtttacccggttcggtccaacttgacctactctaagggagag 26353309  T
Q  407 attgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  26353308 agtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttacaagaaattag 26353242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 257 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 30833619 - 30833404
Alignment:
Q  257 caacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacac 354  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||    
T  30833619 caacaataacaacacc---tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagac 30833524  T
Q  355 accaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30833523 accaaagattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatac 30833424  T
Q  453 aaatgaattacaagaaatta 472  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  30833423 aaaagggttacaagaaatta 30833404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2838313 - 2838141
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  2838313 tgttgtgagttcggacacaaaactcacaccaataatactt-tgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccactatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 2838215  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga 336  Q
     || |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2838214 caataacaacacctagatataatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagtgaga 2838141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32289938 - 32289621
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa- 259  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| ||     
T  32289938 ctgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataat 32289840  T
Q  260 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacacc 357  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||  |||||    
T  32289839 caacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacacc 32289741  T
Q  358 aaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataca 453  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32289740 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagataca 32289641  T
Q  454 aatgaattacaagaaattag 473  Q
    || || ||||||||||||||    
T  32289640 aaagagttacaagaaattag 32289621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 306 - 473
Target Start/End: Original strand, 17490095 - 17490258
Alignment:
Q  306 ctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagaga 405  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||| |  ||  | |||| |||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||    
T  17490095 ctcaaaaccacaagcaaatgataaag--agagaagaga--aacaaacatattaagaaatgtttacccagttcggtccaaattgacctactctaggggaga 17490190  T
Q  406 gattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17490191 gattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagttacaagaaattag 17490258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35446994
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 35446984  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  35446985 aagaaattag 35446994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726987
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 45726997  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  45726996 aagaaattag 45726987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 366 - 473
Target Start/End: Original strand, 42288114 - 42288220
Alignment:
Q  366 ttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  42288114 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg-gagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaa 42288212  T
Q  466 gaaattag 473  Q
     |||||||    
T  42288213 taaattag 42288220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 7815086 - 7815383
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaattt-caaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |  |||||||    
T  7815086 tgttgtggatttgaactcaaatctcacaccaata-aacttat-atgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaattttcaaagtaa-cttca--aacaaca 7815180  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag-ctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    |||||||  |    |||||||||||||| || ||| |||||||  | ||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||     
T  7815181 ataacaagtc----tagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaaacacaaaatcgcaagcaaaagataaag--aaagaagaga--aacaaacacaccaag 7815271  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
     | | || ||||||||| |||||| ||||  || | || | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7815272 aaatatttacccagttcagtccaatttgatatactatgtg-gagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagt 7815370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 372 - 473
Target Start/End: Original strand, 1631741 - 1631842
Alignment:
Q  372 cagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatt 471  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  1631741 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagatatt 1631840  T
Q  472 ag 473  Q
    ||    
T  1631841 ag 1631842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451176
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || | | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattac 7451186  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  7451185 aagaaattag 7451176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1345733 - 1345590
Alignment:
Q  258 aacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacc 357  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    |||| ||||||||||||    
T  1345733 aacaataacaacacc---tagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcataagataaagtgaga----agagaaacaaacacacc 1345641  T
Q  358 aa-agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||    
T  1345640 aagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 13122124 - 13121828
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaacaat 263  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||| ||| |||||  |||||     
T  13122124 ttgtgaattcggacacaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtactaatcaatatcaaaataa-catcaagcagtaacaac 13122028  T
Q  264 aacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 363  Q
    || ||||  || ||||| |||||||| || ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||  |     
T  13122027 aataacaa-acctagatgtaatctagaaatcaa-gtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaacaataaa 13121934  T
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||| |  | |||||||| || || | |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||    
T  13121933 tgtttacccaataag-tccaacttaacatagtttggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaagg--ttac 13121837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 353 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17450755 - 17450671
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 438  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17450755 acaccaaagattgttcacctagttcggtccaacttgacctactctgtg-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 17450671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398115
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 24398129  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  24398128 ttacaagaaattag 24398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6266863 - 6266749
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  6266863 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 6266764  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  6266763 -gttacaagaaattag 6266749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648229
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||| ||||||||    
T  33648240 acaggaaattag 33648229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34682451 - 34682363
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  34682451 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 34682363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10445561 - 10445473
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  10445561 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 10445473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Original strand, 12123434 - 12123557
Alignment:
Q  206 atgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| || ||||  || || ||||||||||| || | |||||||||     
T  12123434 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacctcaaacaacaacaacaataaca-aacctatatctaatctagaaatc-aagtgaaaaa 12123531  T
Q  306 ctcaaaaccacaagcaaaagataaag 331  Q
      ||||| ||||||||||||||||||    
T  12123532 tacaaaatcacaagcaaaagataaag 12123557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14699124 - 14699056
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  14699124 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 14699056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 20522200 - 20522268
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  20522200 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 20522268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 445
Target Start/End: Original strand, 13656028 - 13656115
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 445  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13656028 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 13656115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Original strand, 42019910 - 42019983
Alignment:
Q  403 agagattgatctctccaatccactatcaatgag---ttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42019910 agagattgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 42019983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 12647382 - 12647464
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12647382 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 12647464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Original strand, 13569308 - 13569396
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  13569308 aagaaaggaataaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Original strand, 34388838 - 34388926
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  34388838 aagaaaggaacaaacacaccga-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagt-agctctccaatccactat 34388926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33528738 - 33528670
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||||    
T  33528738 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagaga 33528670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 39482911 - 39482979
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  39482911 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 39482979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28672151 - 28672022
Alignment:
Q  308 caaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat-tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagaga 405  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||| | || ||| | |||||||||||  |||| || |||||  ||||    
T  28672151 caaaatcacaagcaaaggataaag--agagaagaga--aacaaacacac-aaagatatatttacctaattcggtccaacaatgacctactctggaggaga 28672057  T
Q  406 gattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28672056 gattgatctctccaatccactgtcagtgagttctt 28672022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 31056028 - 31056092
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||||| || ||||||    
T  31056028 aggaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagaga 31056092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 473
Target Start/End: Original strand, 42261520 - 42261596
Alignment:
Q  398 gggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  42261520 gggagagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattag 42261596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8390260 - 8390179
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  8390260 gaacaaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28259288 - 28259206
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  28259288 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 28259206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36757881 - 36757818
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  36757881 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctggg 36757818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16940326 - 16940265
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  16940326 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctggg 16940265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17010991 - 17010930
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  17010991 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctggg 17010930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 400
Target Start/End: Original strand, 21629924 - 21629985
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  21629924 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctggg 21629985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Original strand, 30218033 - 30218155
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagat 450  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  30218033 acaccaaaaaatgtttaccgagttcagtccaacaatgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagat 30218132  T
Q  451 acaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||    ||||||||||||||    
T  30218133 acaaaatggttacaagaaattag 30218155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42412147 - 42412117
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaat 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412147 gagagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1346518 - 1346446
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaat 236  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||  |||  |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1346518 tgttctgaattcgaattcaaaactcgcactaatg-aaataaagatgtgtggagtaaaggaaaatagtaaccaat 1346446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 474
Target Start/End: Original strand, 7597057 - 7597122
Alignment:
Q  410 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  7597057 gatctctccgttctacaatcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagt 7597122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 428
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040128
Alignment:
Q  359 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8040128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 17865183 - 17865251
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  17865183 aagaaaggaacaatcacaccaa-gattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagaga 17865251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23078583 - 23078499
Alignment:
Q  344 ggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  23078583 ggaacaaacacaccaaaagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagaga-acaactctccaatccactat 23078499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 33118116 - 33118184
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  33118116 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga 33118184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3022427 - 3022383
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  3022427 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3022383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 5375346 - 5375390
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  5375346 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5375390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 6264148 - 6264192
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  6264148 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6264192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707281
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-acaactctccaatccactat 10707281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 11739559 - 11739603
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  11739559 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11739603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 13910045 - 13910089
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  13910045 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13910089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 19502011 - 19502055
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  19502011 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 19502055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452281
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 23452281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27105052 - 27105008
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  27105052 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27105008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30833678 - 30833646
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30833678 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 30833646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41446501 - 41446431
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41446501 ctgttgtgaattcagactcaaaactcacaacaata-aactta-aatgtgtggagcaaaagaaagtagtaacca 41446431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 121)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29811237 - 29810926
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||    
T  29811237 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacaccaatacaaaatatgatttgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagagaacacaagcaataatca 29811138  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29811137 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagatgaacaaacacaccaaag 29811038  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29811037 attgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 29810938  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  29810937 acaagaaattag 29810926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 29196189 - 29196496
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  29196189 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 29196288  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29196289 ataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaag 29196384  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29196385 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 29196484  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
     |||||||||||    
T  29196485 ccaagaaattag 29196496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 39153164 - 39153471
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  39153164 tgttgagaattcgggctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcggcagcaa 39153263  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaag 361  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| |||||    
T  39153264 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 39153359  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  39153360 attgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagtt 39153459  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  39153460 acaagaaattag 39153471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 761211 - 760905
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||||    
T  761211 tgttgtgaattcggactcaaa--tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataacaa 761114  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || | || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  761113 caatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacaccaaaga 761016  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  761015 ttgttaacccatttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 760916  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  760915 caagaaattag 760905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 51399182 - 51398872
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||| | ||  ||||| || ||    
T  51399182 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcataccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagaaaacaatatcaaagtgagcactagcaataatca 51399084  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51399083 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 51398984  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51398983 attgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 51398884  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  51398883 acaagaaattag 51398872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 163 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 40735750 - 40735459
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||    
T  40735750 tgttgtgaattcggtatcaaaa-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 40735652  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40735651 acaataacagcacctagatctaatataggaaccaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaagg-agagaagagaggaacaaatacaccaaag 40735553  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735552 attgctgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 40735459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Original strand, 23391712 - 23392018
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  23391712 tgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagaaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaacaa 23391811  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag-ctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23391812 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaag 23391907  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  23391908 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggtt 23392007  T
Q  462 acaagaaatta 472  Q
    |||||||||||    
T  23392008 acaagaaatta 23392018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29813430 - 29813121
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||| || ||    
T  29813430 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 29813331  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  29813330 acaataacagcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaagggaga--agagaggaacaaacacatcaaag 29813233  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  29813232 attgttgacccagttcggtccaacatgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggtt 29813133  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  29813132 acaagaaattag 29813121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40734865 - 40734556
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || || ||    
T  40734865 tgttgtgaattcggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaataataa 40734767  T
Q  263 taac-aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
     ||  |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40734766 aaaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgcaaagcacaaatccacaagcaaaagataaagg-agagaagagaggaacaaacactccaaag 40734668  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  40734667 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgtt 40734568  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  40734567 acaagaaattag 40734556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 44700284 - 44700588
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44700284 tgttttgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgcatggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 44700382  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  44700383 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaggataaa--gagagaagaga--aacaaacacacgaaaga 44700478  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  44700479 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatgtggg-gagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggtta 44700577  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  44700578 caagaaattag 44700588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 9666270 - 9666576
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||| |||    
T  9666270 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatctgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaataacaagcaactaca 9666368  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9666369 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agataagaga--aacaaacacaccaaag 9666464  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||    
T  9666465 attgttgacccagttcggtccaactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagtt 9666564  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  9666565 acaagaaattag 9666576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31314808 - 31314503
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  31314808 tgttgtgaataccgactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtaataactaatattaaagtaaacacaagcaacaacaa 31314710  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31314709 taataacaacacctaaatataatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaaga 31314614  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  31314613 ttgttgactcagttcggtccaacttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggtta 31314514  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  31314513 caagaaattag 31314503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 5236257 - 5236566
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||| || ||    
T  5236257 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtacaggaaagtagtaatcgatatcaaagtgaacacaagcaataatca 5236355  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || || | | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236356 acaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 5236455  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5236456 attgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctggg-gaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 5236554  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  5236555 acaagaaattag 5236566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 177 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7762620 - 7762323
Alignment:
Q  177 actcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccact 275  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || || ||| || |||| |||     
T  7762620 actcaaaact-acaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacaacacc 7762522  T
Q  276 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagt 375  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||    
T  7762521 tagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcatagattgttcacccagt 7762422  T
Q  376 tcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7762421 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 7762323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7764834 - 7764522
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |    
T  7764834 tgttgtgaattccggactcaaaact-acaccaatacaaactatgatgtgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 7764736  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    || || |||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7764735 aacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaa 7764636  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtc-caacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7764635 gattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagag 7764536  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  7764535 ttacaagaaattag 7764522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 473
Target Start/End: Original strand, 19683706 - 19683999
Alignment:
Q  182 aaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagat 280  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||    
T  19683706 aaactcacaccaatacaaactatgatgtttggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagat 19683805  T
Q  281 ctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggt 380  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19683806 ctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggt 19683905  T
Q  381 cc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    || |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19683906 ccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 19683999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 22834807 - 22835112
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | || |||||    
T  22834807 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaggtaataacaa 22834905  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||    |||||||||||| |    
T  22834906 caataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggaagaagagaaag---aaaacacaccaaata 22835002  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  22835003 ttgttga-ccagttcggtccaacttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 22835101  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  22835102 caagaaattag 22835112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9581652 - 9581340
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || |    
T  9581652 tgttgtgaattccggactcaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatc 9581554  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9581553 aacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaacaaacacatcaaa 9581454  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  9581453 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggg 9581354  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||| ||||||||||    
T  9581353 ttaaaagaaattag 9581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29682707 - 29682417
Alignment:
Q  181 aaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagat 280  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||| || | |||||| ||||| || | || ||| |||||    
T  29682707 aaaaatcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaaaattaaagtgaatacaagcaataacaacaatagcagcacctagat 29682608  T
Q  281 ctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggt 380  Q
    |||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29682607 ctaacctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagagaaacatacacaccaaagattgttgacccagttcggt 29682510  T
Q  381 ccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  29682509 ccaacttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgacaagaaattag 29682417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37408828 - 37408516
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || || ||| || |    
T  37408828 ctgttgtgaattcggcctcaaag-tcacatcaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaaacaataatc 37408730  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37408729 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaa 37408630  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  37408629 gattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaggg 37408530  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  37408529 ttacaagaaattag 37408516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 163 - 457
Target Start/End: Original strand, 23410131 - 23410423
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  23410131 tgttgtgaattcggacacaaaactcacatcaatacaaactatgatgtgtggatcaaaggaaagtagtaacatatatcaaagtgaacacaagcaacaaaaa 23410230  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag--ctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||    
T  23410231 tattaacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaatata--aacaaacacaccaaa 23410326  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23410327 gattgttgacccaattcgttccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatg 23410423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16499368 - 16499087
Alignment:
Q  177 actcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccactt 276  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||      ||||||||||   |    
T  16499368 actcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa------taacaacacc---t 16499279  T
Q  277 agatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagtt 376  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16499278 aaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaatacaccaaagattgttgacccagtt 16499184  T
Q  377 cggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  16499183 cggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattag 16499087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32891458 - 32891162
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  32891458 tgttgtgacttcggactcaaaactcacaccaatg-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaacaacaa 32891360  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
             ||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  32891359 ---------cacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataa--ggagagaagaga--aacaaacacaccaagaa 32891273  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
     || | | ||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32891272 atgattatccagttcggtccaacatgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 32891173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 5257982 - 5258254
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  5257982 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 5258081  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  5258082 aaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctgg 5258180  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5258181 agaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5258254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45095509 - 45095221
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  45095509 tcacatcaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacatagatctaa 45095410  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    ||||  || ||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45095409 tctatgaatcaaagagtaaaacacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaacaaatacgccaaagattgttcacccagttcggtccaa 45095311  T
Q  385 -cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     |||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  45095310 acttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 45095221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 186 - 474
Target Start/End: Original strand, 9635946 - 9636237
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  9635946 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 9636045  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc 382  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  9636046 tctaggaatcaaagtgaaaagcataaatc-acaagcacaagataaaagggagagcagagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttc 9636144  T
Q  383 aa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 474  Q
    || |||||| || | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9636145 aaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagt 9636237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 5260161 - 5260433
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  5260161 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtg 5260260  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || | |||    
T  5260261 aaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttgg 5260359  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5260360 agaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5260433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 32744295 - 32744546
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtga 301  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||         |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  32744295 tatgatgtatggagcaatagaaagtagtaaccaatttcaaa---------agcaacaacaatgataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtga 32744385  T
Q  302 aaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggga 401  Q
    |||       ||||||||||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  32744386 aaa-------accacaagcaaaagataaag--agatatgaga--aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 32744474  T
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32744475 gatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattag 32744546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 345 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34491398 - 34491270
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491398 gaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 34491299  T
Q  445 agagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34491298 agagatacaaatgagttacaagaaattag 34491270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Original strand, 21350810 - 21351014
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  21350810 ctgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatg-aaataaagatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaaca 21350908  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa-a 360  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    |||| |||||||||||||| |    
T  21350909 ataacaacac---ttagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcataaccacaagcataagataaagtgaga----agagaaacaaacacaccaaga 21351001  T
Q  361 gattgttgaccca 373  Q
     ||||||||||||    
T  21351002 aattgttgaccca 21351014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 278 - 473
Target Start/End: Original strand, 53921422 - 53921613
Alignment:
Q  278 gatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||  | |||| | |||||||    
T  53921422 gatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacactaagaaatgtttatccagttc 53921517  T
Q  378 ggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| |||||||  || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  53921518 ggtcaaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaattag 53921613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 360 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 40913464 - 40913352
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40913464 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgag 40913365  T
Q  460 ttacaagaaatta 472  Q
    |||||||||||||    
T  40913364 ttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44331717 - 44331603
Alignment:
Q  359 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44331717 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgg 44331618  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  44331617 cttacaagaaattag 44331603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 473
Target Start/End: Original strand, 23197767 - 23198049
Alignment:
Q  187 cacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatc 286  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||  |  | ||||||||| |    ||| |||||||||||    
T  23197767 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataataaagcaagcaata--atcaacaataaaa----cacatagatctaatc 23197860  T
Q  287 tagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    ||| || |||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23197861 taggaaacaaaatgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 23197959  T
Q  385 -cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     |||||| || |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23197960 acttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattag 23198049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 437
Target Start/End: Original strand, 2074880 - 2075149
Alignment:
Q  160 ttctgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 259  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  2074880 ttctgttgtgaattcggacccaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataaccacaagcaacaa 2074977  T
Q  260 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
     || || || |  ||  |||| |||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||| |    
T  2074978 taacaataataa-acccagatttaatctaggaaacaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aataaacacaccca 2075071  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 437  Q
      | |||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2075072 gaaatgtttacccagttcgatccaacttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt 2075149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 187 - 473
Target Start/End: Original strand, 23199960 - 23200248
Alignment:
Q  187 cacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 285  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || || || || ||||||||||    
T  23199960 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataaaac-acctagatctaat 23200058  T
Q  286 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga--gaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc- 382  Q
    |||| || |||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23200059 ctaggaaacaaaatgaaaaacacaaa-ccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcca 23200157  T
Q  383 aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23200158 aacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattag 23200248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30236294 - 30236183
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  30236294 attgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtt 30236195  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  30236194 acaagaaattag 30236183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 46173526 - 46173415
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  46173526 attgttgatctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggtt 46173427  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  46173426 acaagaaattag 46173415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 430
Target Start/End: Original strand, 27305519 - 27305777
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  27305519 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaata--aactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaacaacaa 27305615  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || ||| | || ||||||||||||||  |  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||  ||||||||||| ||  |    
T  27305616 caataac-caacctagatctaatctag-gagtaaagtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaa--tagagaagaga--aacaaacacacaaagaa 27305709  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatca 430  Q
     |||  || ||||||||||||| ||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305710 atgtatacacagttcggtccaaattgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 372 - 472
Target Start/End: Original strand, 6095608 - 6095708
Alignment:
Q  372 cagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatt 471  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6095608 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 6095707  T
Q  472 a 472  Q
    |    
T  6095708 a 6095708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4570010
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 4570021  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  4570020 caagaaattag 4570010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 362 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 47304420 - 47304310
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||    
T  47304420 attgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggtt 47304321  T
Q  462 acaagaaatta 472  Q
    |||||| ||||    
T  47304320 acaagatatta 47304310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593762
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaacttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 54593772  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    || |||||||    
T  54593771 aataaattag 54593762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 360
Target Start/End: Original strand, 9634618 - 9634818
Alignment:
Q  160 ttctgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaaca 258  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |    
T  9634618 ttctgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgat-tgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaata 9634715  T
Q  259 a-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagat-aaagggagagaagagaggaacaaacacac 356  Q
    | ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||   | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9634716 atcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagc-atagatcacaagcacaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaa 9634814  T
Q  357 caaa 360  Q
    ||||    
T  9634815 caaa 9634818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 49199465 - 49199580
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49199465 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 49199564  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  49199565 ggttacaagaaattag 49199580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 470
Target Start/End: Original strand, 43403740 - 43403852
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa-atg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  43403740 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatg 43403839  T
Q  458 aattacaagaaat 470  Q
    | |||||||||||    
T  43403840 agttacaagaaat 43403852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 801279 - 801148
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 442  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  801279 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttaca 801180  T
Q  443 aaagagatac-aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  801179 aaagagatacaaaaagagttacaagaaattag 801148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 51351941 - 51352125
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||    
T  51351941 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaata-atactacgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaatcacaagcagcagcaa 51352038  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacaca 355  Q
     || ||||  || |||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  51352039 caataaca-aacctagatctaatctaggaatcaaa-tgaaaaacacaaaaccacaagtaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacaca 51352125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 473
Target Start/End: Original strand, 7779951 - 7780114
Alignment:
Q  314 cacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagatt 409  Q
    |||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||| || |||||  ||||||||    
T  7779951 cacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 7780050  T
Q  410 gatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  7780051 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag-gttacaagaaattag 7780114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 46860653 - 46860532
Alignment:
Q  353 acaccaaagattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 451  Q
    |||||||| | |||| | ||| |||||||||||  |||| || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46860653 acaccaaaaaatgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagata 46860554  T
Q  452 caaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  46860553 caaatgggttacaagaaattag 46860532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 43401797 - 43401912
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  43401797 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatg 43401896  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  43401897 cgttacaagaaattag 43401912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 402 - 470
Target Start/End: Original strand, 55302011 - 55302079
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaat 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  55302011 gagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 396 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018911
Alignment:
Q  396 ctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaattacaagaaatta 472  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaatta 36018911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819633
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaatt 461  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  41819622 acaagaaattag 41819633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1417597 - 1417529
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  1417597 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 1417529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3716109 - 3716041
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  3716109 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagaga 3716041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33192081 - 33191922
Alignment:
Q  276 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagt 375  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||    ||||||||||||||| | |||| ||| |||    
T  33192081 tagatctaatgtaggaaccag-gtgtaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatcgagaaaaga----aacaaacacaccaaaaaatgtttaccaagt 33191987  T
Q  376 tcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 440  Q
    |  |||||||  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33191986 tttgtccaacaatgacctcctctgg-agagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctt 33191922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 472
Target Start/End: Original strand, 51352148 - 51352219
Alignment:
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  51352148 gagagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatg-gttacaagaaatta 51352219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6716671 - 6716557
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  6716671 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 6716572  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  6716571 -gttacaagaaattag 6716557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8370595 - 8370505
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  8370595 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 54635296 - 54635182
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  54635296 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 54635197  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  54635196 -gttacaagaaattag 54635182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 25795767 - 25795829
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  25795767 gaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 25795829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27975056 - 27974971
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  27975056 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30709899 - 30709829
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  30709899 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 30709829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 21711203 - 21711271
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  21711203 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 21711271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 26298968 - 26299036
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  26298968 aagagaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagaga 26299036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27986548 - 27986465
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  27986548 gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 45283158 - 45283071
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 445  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45283158 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 45283071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3617622 - 3617540
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3617622 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 3617540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 472
Target Start/End: Original strand, 4075443 - 4075581
Alignment:
Q  335 gagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaact-tgactta-atctgggagagagattgatctctccaatccactatcaat 432  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||     
T  4075443 gagaatagagaaacaaacacac-aaagtttggttacccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaa 4075539  T
Q  433 gag-ttcttacaaagagatacaaatga-attacaagaaatta 472  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  4075540 gagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttacaagaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1736412 - 1736344
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  1736412 aagaaaggaacaaacacaccaat-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 1736344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 472
Target Start/End: Original strand, 4055796 - 4055874
Alignment:
Q  394 atctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatga-attacaagaaatta 472  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  4055796 atctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaatta 4055874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18552990 - 18552922
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  18552990 aagaaaggaacaaatacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 18552922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 472
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35138815
Alignment:
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaatta 35138815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Original strand, 32143306 - 32143389
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  32143306 gaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 32143389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40592884 - 40592821
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||    
T  40592884 aggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagaga 40592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Original strand, 16264328 - 16264418
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  16264328 aagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 16264418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 430 - 473
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340311
Alignment:
Q  430 aatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattag 31340311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33386767 - 33386685
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  33386767 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 33386685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39040101 - 39040038
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggg 400  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  39040101 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggg 39040038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25637599 - 25637517
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25637599 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 25637517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Original strand, 27452941 - 27453026
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  27452941 aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27453026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 37466278 - 37466339
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  37466278 gaacaaacacaccaa-gattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 37466339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37407057 - 37406985
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaat 236  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37407057 tgttgtgaattcggcctcaaag-tcacaccactacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaat 37406985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 20937826 - 20937715
Alignment:
Q  362 attgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaatgaa 459  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| |||| || | |||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |      
T  20937826 attgtttacctagttctgtccaactatgacatactttgggggaacgattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaaggg 20937728  T
Q  460 ttacaagaaatta 472  Q
    |||||||||||||    
T  20937727 ttacaagaaatta 20937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 48438199 - 48438262
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  48438199 aggaacaaacacaccaa-gattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 48438262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3328463 - 3328425
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttc 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3328463 aagagaggaacaaacacacc-aagattgttgacccagttc 3328425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 36029073 - 36029139
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagaga 405  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  36029073 aagaaaggaacaaacacaccga-gattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggaga 36029139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Original strand, 4160059 - 4160105
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgt 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  4160059 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgt 4160105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 4598519 - 4598601
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4598519 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 4598601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6794820 - 6794732
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  6794820 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 6794732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10056391 - 10056309
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10056391 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10056309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10058613 - 10058531
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10058613 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10058531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10060835 - 10060753
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10060835 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10060753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10063057 - 10062975
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10063057 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10062975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10065279 - 10065197
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10065279 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10065197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10211567 - 10211485
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10211567 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10211485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 428 - 458
Target Start/End: Original strand, 31340242 - 31340272
Alignment:
Q  428 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340242 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 31340272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 402
Target Start/End: Original strand, 35925468 - 35925526
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggag 402  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  35925468 gaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatttgggag 35925526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47924006 - 47923945
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| || ||||||    
T  47924006 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagaga 47923945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 801463 - 801388
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaac---tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  801463 tgttgtgaattccgatctcaaaacgtgtcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 801388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458499
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagaga 458499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1313668 - 1313624
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  1313668 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1313624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1321738 - 1321694
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  1321738 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1321694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3859786 - 3859742
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  3859786 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3859742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5886457 - 5886413
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  5886457 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5886413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5899930 - 5899886
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  5899930 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5899886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6484619 - 6484575
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  6484619 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6484575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 7606586 - 7606630
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  7606586 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7606630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 10958321 - 10958365
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  10958321 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10958365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24695264 - 24695213
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  24695264 gaacaaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatct 24695213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25389164 - 25389120
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  25389164 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 25389120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26928702 - 26928620
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  26928702 gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgggggagaga-gcaactctccaatccactat 26928620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 27635656 - 27635700
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  27635656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27635700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32219344 - 32219300
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  32219344 ttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagaga 32219300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 35919113 - 35919157
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  35919113 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 35919157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41849318 - 41849274
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  41849318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 41849274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42990563 - 42990519
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  42990563 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 42990519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42992529 - 42992485
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  42992529 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 42992485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 43421413 - 43421457
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  43421413 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 43421457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894099
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 53894099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 192 - 473
Target Start/End: Original strand, 9182859 - 9183141
Alignment:
Q  192 caatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagt 290  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||     
T  9182859 caatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagg 9182958  T
Q  291 aaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgac 390  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9182959 aatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgac 9183058  T
Q  391 ttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9183059 ataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 9183141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 26954091 - 26954396
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26954091 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagaaataacaa 26954189  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  26954190 caataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaatgtaaag--agagaagaga--aacaaagtcaccaaaga 26954285  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26954286 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagtta 26954385  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  26954386 caagaaattag 26954396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 192 - 473
Target Start/End: Original strand, 33160179 - 33160462
Alignment:
Q  192 caatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagta 291  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33160179 caatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaacaatattaacaacacctagatctaatctagta 33160278  T
Q  292 accaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagat-aaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttga 389  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  33160279 atcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagtttggtccaaacttga 33160378  T
Q  390 cttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33160379 aatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 33160462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 163 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16569389 - 16569107
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatata-aattatgatgtgtggagtaaa-ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 260  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  16569389 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatattcaactatgatgtgtggagcaaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataac 16569291  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 360  Q
    || || | || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16569290 aacaatagcagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagagagaaacaaacacaccaaa 16569193  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16569192 gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 16569107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Original strand, 5413217 - 5413504
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  5413217 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 5413316  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5413317 tctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc-agttcggtccaa 5413414  T
Q  385 -cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5413415 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5413504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 186 - 455
Target Start/End: Original strand, 5408892 - 5409161
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  5408892 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 5408991  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5408992 tctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc-agttcggtccaa 5409089  T
Q  385 -cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
     |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409090 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 5409161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Original strand, 5406025 - 5406310
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || |||||| | ||||   |||||||||    
T  5406025 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaataatagcacc---tagatctaa 5406121  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5406122 tctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaa 5406220  T
Q  385 -cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5406221 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5406310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 473
Target Start/End: Original strand, 5410350 - 5410635
Alignment:
Q  186 tcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 284  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || |||||| | ||||   |||||||||    
T  5410350 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaataatagcacc---tagatctaa 5410446  T
Q  285 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5410447 tctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaa 5410545  T
Q  385 -cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
     |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5410546 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5410635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 28137211 - 28137518
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  28137211 tgttgtgaattcggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgacgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacga 28137309  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
     || |||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |  ||||| |||||  |    
T  28137310 caataacaacacatagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacataaccacaagcaaaagataaagg--gagaagataaaacaaaacataccaagaa 28137407  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
     |||| || || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  28137408 atgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggtta 28137507  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  28137508 caagaaattag 28137518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 31404513 - 31404785
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  31404513 tatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagag 31404612  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgg 399  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||    
T  31404613 gaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctgg 31404711  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  31404712 aggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 31404785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 16452127 - 16452439
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattc-gaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 260  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||| || |    
T  16452127 tgttgtgaattccgatctcaaaa-tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatacaagcaataatc 16452225  T
Q  261 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaag-ataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 359  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16452226 aacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaa 16452324  T
Q  360 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 458  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |     
T  16452325 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagg 16452424  T
Q  459 attacaagaaattag 473  Q
     ||||||||||||||    
T  16452425 gttacaagaaattag 16452439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 240 - 472
Target Start/End: Original strand, 33211066 - 33211294
Alignment:
Q  240 aaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaa 339  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33211066 aaagtaaacacaagcaataacaacaataataacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaatcacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaa 33211163  T
Q  340 gagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct 439  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33211164 gaga--aacaaacataccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttct 33211261  T
Q  440 tacaaagagatacaaatgaattacaagaaatta 472  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33211262 tacaaagagatacaaatgagctacaagaaatta 33211294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 473
Target Start/End: Original strand, 30834332 - 30834646
Alignment:
Q  162 ctgttgtgaatt-cgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa- 259  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||   |||||| ||     
T  30834332 ctgttgtgaatttcggtctcaaaa-tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataat 30834430  T
Q  260 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctca-aaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacca 358  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  30834431 caacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagataaacaaacacacca 30834530  T
Q  359 aagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 457  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  30834531 aagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaag 30834630  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  30834631 ggttacaagaaattag 30834646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Original strand, 3038729 - 3039013
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaacaat 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||    
T  3038729 ttgtgaattcgaactcaaaa-tcagaccaatacaaactatgatgtgtcgagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagcaaacaacaagtaacaacaat 3038827  T
Q  264 aacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 363  Q
    || |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||||||||||||||    
T  3038828 aataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaaaaga----aacaaacacaccaaagat 3038923  T
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    ||||||||                    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3038924 tgttgacc--------------------taatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttac 3039003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 163 - 384
Target Start/End: Original strand, 14521478 - 14521699
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagta----gtaaccaatttcaaagtaaacataagcaaca 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14521478 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatg-aaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtacgtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaaca 14521576  T
Q  259 acaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacca 358  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    || ||||||||||    
T  14521577 acaataacaacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataagataaagtgagaaaaga----aataaacacacca 14521672  T
Q  359 a-agattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    | | | |||||||| ||||||||||||    
T  14521673 agaaaatgttgacctagttcggtccaa 14521699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 2171365 - 2171641
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  2171365 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 2171464  T
Q  301 aaaagct-ca-aaaccacaagcaaaagataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaat 395  Q
    ||||    || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |    
T  2171465 aaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaaagggagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 2171564  T
Q  396 ctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2171565 ctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-gggttacaagaaattag 2171641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Original strand, 603085 - 603198
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaa 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  603085 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatggg 603184  T
Q  460 ttacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||    
T  603185 ttacaagaaattag 603198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588989
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 21588999  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  21588998 aagaaattag 21588989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593722
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 21593732  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  21593731 aagaaattag 21593722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830233
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtcaaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattac 26830223  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  26830224 aagaaattag 26830233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Original strand, 3072595 - 3072871
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || ||| || || | ||| |||||||||||||| || ||| |||    
T  3072595 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaa-gtg 3072693  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatc 396  Q
    ||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3072694 aaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 3072792  T
Q  397 tgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  3072793 tggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattag 3072871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973049
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaacttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 2973039  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  2973040 aagaaattag 2973049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043685
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || | |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 5043696  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  5043695 caagaaattag 5043685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 360 - 474
Target Start/End: Original strand, 3808704 - 3808820
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatg 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3808704 agattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 3808803  T
Q  458 aattacaagaaattagt 474  Q
      |||||||||||||||    
T  3808804 ggttacaagaaattagt 3808820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17758150 - 17758081
Alignment:
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17758150 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 17758081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 412370 - 412158
Alignment:
Q  266 caacaccacttagatctaatcta-gtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga--gaagagaggaacaaacacaccaa--a 360  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||    |||||| |||||||  |    
T  412370 caacagcacctagatctaatctaggtaac--aagtgaaaaacacaata-cacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaaga 412274  T
Q  361 gattgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatg 457  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  412273 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaag 412174  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
    | ||||||||||||||    
T  412173 agttacaagaaattag 412158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17763048
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||  || |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagtta 17763059  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  17763058 caagaaattag 17763048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 445
Target Start/End: Original strand, 6097431 - 6097533
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 442  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097431 aacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac 6097530  T
Q  443 aaa 445  Q
    |||    
T  6097531 aaa 6097533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26800748 - 26800645
Alignment:
Q  371 ccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgaattacaagaa 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  26800748 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaa 26800650  T
Q  469 attag 473  Q
    |||||    
T  26800649 attag 26800645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 402 - 473
Target Start/End: Original strand, 22424865 - 22424937
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac--aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  22424865 gagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggttacaagaaattag 22424937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4045773 - 4045481
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||    || ||| |||| ||    
T  4045773 ttgtgaatttggactcaaaattcacaccaata-atcttat-atgtgtgaagttaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtaacttcaaacaataacacta 4045676  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagatt 364  Q
     |||    || |||||||||||||  || ||| |||||||   ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  | |    
T  4045675 gcaa----acctagatctaatctaagaatcaa-gtgaaaaaaacaaaaccacgagtaaaagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaagaaat 4045585  T
Q  365 gttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    | | ||| ||||||||||| ||  ||||    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   |||||    
T  4045584 gcttacctagttcggtccacct--actt----tggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattac 4045491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5757592 - 5757507
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  5757592 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 407
Target Start/End: Original strand, 31979496 - 31979561
Alignment:
Q  341 agaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  31979496 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga 31979561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Original strand, 16578498 - 16578629
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 441  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16578498 aacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctta 16578597  T
Q  442 c-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16578598 caaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 16578629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16616882 - 16616751
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 441  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16616882 aacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctta 16616783  T
Q  442 c-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16616782 caaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 16616751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16653300 - 16653169
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 441  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16653300 aacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctta 16653201  T
Q  442 c-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16653200 caaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 16653169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27648032 - 27647918
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  27648032 agattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 27647933  T
Q  458 aattacaagaaattag 473  Q
      ||||||||||||||    
T  27647932 -gttacaagaaattag 27647918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6027419 - 6027337
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6027419 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 6027337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25421478 - 25421396
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25421478 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 25421396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 257245 - 257308
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtag 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  257245 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaatat-aattataatgtgtggagcaaaggaaagtag 257308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10077282 - 10077214
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  10077282 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 10077214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16555057 - 16554926
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 441  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16555057 aacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctta 16554958  T
Q  442 c-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16554957 caaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 16554926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16631613 - 16631482
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtcc-aacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 441  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16631613 aacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctta 16631514  T
Q  442 c-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16631513 caaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 16631482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 31936567 - 31936635
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  31936567 aagataggaacaaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagaga 31936635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 602903 - 602955
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggag 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  602903 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggag 602955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 428
Target Start/End: Original strand, 21356022 - 21356104
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||   | ||||||||||||||||    
T  21356022 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 236
Target Start/End: Original strand, 9182828 - 9182862
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9182828 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaat 9182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25073698 - 25073644
Alignment:
Q  402 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 455  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaa 25073644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5017586 - 5017518
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| || ||||||    
T  5017586 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagaga 5017518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 18232825 - 18232893
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  18232825 aagagaggaacaaacacacc-aagattgttgactcaaatcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 18232893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9572719 - 9572667
Alignment:
Q  403 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 454  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  9572719 agagattgatctctgcaatccactatcaatgggttcttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34167252 - 34167180
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaa 431  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  34167252 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 34167180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 397
Target Start/End: Original strand, 4629933 - 4629992
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct 397  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||    
T  4629933 aagaaaggaacaaacacatcaaagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatct 4629992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5572351 - 5572290
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| || ||||||    
T  5572351 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 5572290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13154087 - 13154005
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13154087 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 13154005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Original strand, 22963680 - 22963721
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggt 380  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22963680 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggt 22963721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23824713 - 23824672
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggt 380  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23824713 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggt 23824672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31086590 - 31086545
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31086590 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcagtccaa 31086545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 33211005 - 33211058
Alignment:
Q  166 tgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaag 220  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33211005 tgtgaattcga-ctcaaaattcacaccaatataaactataatgtgtggagtaaag 33211058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 33342101 - 33342183
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33342101 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 33342183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34165030 - 34164948
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34165030 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 34164948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 412419 - 412387
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  412419 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 412387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 1230249 - 1230293
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  1230249 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1230293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908550
Alignment:
Q  404 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 440  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctt 2908550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816275
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4816275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273260
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5273260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 11983029 - 11983073
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  11983029 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11983073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 14458767 - 14458811
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  14458767 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14458811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 14507176 - 14507220
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  14507176 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14507220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704611
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 19704611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915400
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20915400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 20216 - 20525
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac-a 261  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||  |    
T  20216 tgttgtgaattcggactcaa--ctcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaggtagtaaccaatgtcaaagtgaacacaagcaataatta 20313  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20314 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaa 20413  T
Q  362 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20414 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtt 20513  T
Q  462 acaagaaattag 473  Q
    ||||||||||||    
T  20514 acaagaaattag 20525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 473
Target Start/End: Original strand, 148914 - 149207
Alignment:
Q  165 ttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaata 264  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||      ||    
T  148914 ttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa------ta 149006  T
Q  265 acaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagatt 364  Q
    ||||||||   || ||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  149007 acaacacc---taaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaag--agagaagaga--aacaaatacaccaaagatt 149098  T
Q  365 gttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattaca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||    
T  149099 gttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaaca 149198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 5663 - 5731
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  5663 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 2472 - 2538
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagaga 405  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||    
T  2472 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggaga 2538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 133394 - 133309
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  133394 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 114933 - 114660
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||| || ||| || |||| ||| || ||||||||||| || |||||||    
T  114933 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaatcaataatcaacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtg 114834  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtc-caacttgacttaatctgg 399  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| || || |||||    
T  114833 aaaagcacaaaacaacaagaaaaagataaaaggagagaagagagaaacaagcacaccaaagattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctgg 114734  T
Q  400 gagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  114733 aggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgttacaagaaattag 114660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 434864 - 434591
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||      || ||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  434864 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattattaaagtgttttcaatcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 434765  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctg 398  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  434764 aaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaatattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 434666  T
Q  399 ggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  434665 gaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 434591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 473
Target Start/End: Original strand, 490355 - 490431
Alignment:
Q  398 gggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  490355 gggagagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattag 490431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1246 - 974
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg 300  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||| || ||   |||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  1246 tatgatgtgtggaacaaaggatagtagtaaccaatgacaatgtgaatgcaagcaataatcaacaataacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtg 1147  T
Q  301 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaa-cacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctg 398  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  1146 aaaagcacaaa-ccacaagcaaagtataaaaggagagaagagagaaacaaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 1048  T
Q  399 ggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1047 gaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattag 974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 314 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11777 - 11615
Alignment:
Q  314 cacaagcaaaagataaa-gggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattg 410  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||    
T  11777 cacaagcacaagataaaagggagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattg 11678  T
Q  411 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11677 aactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattag 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11896 - 11864
Alignment:
Q  202 tatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacca 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11896 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 11864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 473
Target Start/End: Original strand, 10982 - 11272
Alignment:
Q  187 cacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 285  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||      |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  10982 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatgactaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaat 11081  T
Q  286 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcca 383  Q
    |||| || ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11082 ctaggaaacaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcca 11180  T
Q  384 a-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    | |||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11181 aacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 11272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 257 - 473
Target Start/End: Original strand, 8630 - 8846
Alignment:
Q  257 caacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacac 354  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||   |||||||  |||| ||    
T  8630 caacaataacaacacc---tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagac 8725  T
Q  355 accaaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8726 accaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatac 8825  T
Q  453 aaatgaattacaagaaattag 473  Q
    ||| |  ||||||||||||||    
T  8826 aaaagggttacaagaaattag 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1668 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1668
Description:

Target: scaffold1668; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 1301 - 1502
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaag-taaacataagcaacaaca 261  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||| || ||||    
T  1301 tgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaatacaatctatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatattaaagttaaacacaagtaataaca 1400  T
Q  262 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 361  Q
    |  | |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1401 acgataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 1496  T
Q  362 attgtt 367  Q
    ||||||    
T  1497 attgtt 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 473
Target Start/End: Original strand, 27250 - 27553
Alignment:
Q  163 tgttgtgaattcgaactcaaaactcacatcaatataaattatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||| |  ||||| ||| ||    
T  27250 tgttgtgaattcggactcaaatctcacatcaata-aactta-gaagtgtggagaaaaggaa-gtagtaaccaatatgaaagtaacctcaagcagcaaaaa 27346  T
Q  263 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 362  Q
    ||| ||||  |||||||   ||||||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  || ||||||| |||  |    
T  27347 taataacaa-acttagaagaaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaaggtaaag--agagaagaga--aataaacacatcaataa 27440  T
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaact-tgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgaat 460  Q
     |||| ||| | |||||||||||  |||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  27441 atgtttacctaattcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagt 27540  T
Q  461 tacaagaaattag 473  Q
    |||||||||||||    
T  27541 tacaagaaattag 27553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7385
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 463  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaacttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 7395  T
Q  464 aagaaattag 473  Q
    ||||||||||    
T  7394 aagaaattag 7385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10565
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 455  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa 10565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18113
Alignment:
Q  364 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 462  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagtta 18102  T
Q  463 caagaaattag 473  Q
    |||||||||||    
T  18103 caagaaattag 18113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 17243 - 17311
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||| |||||    
T  17243 aagaaaggagcaaacacaccaaa-attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagaga 17311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 440
Target Start/End: Original strand, 2598 - 2682
Alignment:
Q  358 aaagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2598 aaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 2682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8530 - 8448
Alignment:
Q  346 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  8530 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 440
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3804
Alignment:
Q  360 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3722 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctt 3804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 10709 - 10777
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  10709 aagagaggaacaaacacaccaa-gattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36951 - 36891
Alignment:
Q  338 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatct 397  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  36951 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44075 - 44033
Alignment:
Q  343 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaa 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44075 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 44033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Original strand, 45238 - 45321
Alignment:
Q  345 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 428  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  45238 gaacaaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 45321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 473
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80393
Alignment:
Q  418 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattag 473  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattag 80393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1497
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  1453 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29458 - 29414
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  29458 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 29414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 407
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69336
Alignment:
Q  363 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctgggagagaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 69336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University