View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6506_low_2 (Length: 605)

Name: NF6506_low_2
Description: NF6506
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6506_low_2
NF6506_low_2
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (14-599)||(9543687-9544272)
chr7 (14-599)||(5389618-5390203)
chr7 (14-599)||(16140631-16141216)
chr7 (14-599)||(26304865-26305450)
chr7 (14-599)||(26361368-26361953)
chr7 (14-599)||(32099689-32100274)
chr7 (14-599)||(46498423-46499008)
chr7 (14-599)||(6535793-6536378)
chr7 (14-599)||(8502358-8502943)
chr7 (14-599)||(44898608-44899193)
chr7 (60-599)||(13283877-13284416)
chr7 (212-584)||(42596865-42597237)
chr7 (16-176)||(42596698-42596858)
chr7 (107-506)||(7582477-7582876)
chr7 (107-461)||(15175386-15175740)
chr7 (106-547)||(14643279-14643720)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (14-599)||(27413457-27414042)
chr5 (14-599)||(18362586-18363171)
chr5 (14-599)||(26200772-26201357)
chr5 (14-599)||(33940629-33941214)
chr5 (16-584)||(20949166-20949734)
chr5 (23-583)||(23375368-23375920)
chr5 (106-455)||(5601579-5601928)
chr5 (107-506)||(30453136-30453535)
chr5 (107-506)||(30458214-30458613)
chr5 (107-506)||(24413672-24414071)
chr5 (106-461)||(24299175-24299530)
chr5 (268-531)||(22456358-22456621)
chr5 (143-547)||(20037121-20037526)
chr5 (106-221)||(24289908-24290023)
chr5 (106-325)||(21083014-21083233)
chr5 (16-89)||(19781874-19781947)
chr5 (187-319)||(15329389-15329521)
chr5 (187-319)||(18709238-18709370)
chr5 (106-178)||(22456711-22456783)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (13-599)||(14892199-14892785)
chr8 (14-599)||(21211417-21212002)
chr8 (87-597)||(22832121-22832631)
chr8 (106-461)||(25035933-25036288)
chr8 (106-461)||(25049970-25050325)
chr8 (106-461)||(18233759-18234114)
chr8 (106-461)||(18243210-18243565)
chr8 (106-531)||(33600415-33600840)
chr8 (106-461)||(12916388-12916743)
chr8 (150-325)||(23749914-23750089)
chr8 (187-319)||(45497837-45497969)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (14-599)||(18161374-18161959)
chr6 (14-599)||(31358870-31359455)
chr6 (14-599)||(16899255-16899840)
chr6 (16-584)||(34766667-34767235)
chr6 (16-599)||(18710425-18711008)
chr6 (16-599)||(18704490-18705073)
chr6 (22-405)||(29541764-29542147)
chr6 (400-599)||(29561121-29561320)
chr6 (374-461)||(25895804-25895891)
chr6 (187-289)||(11375030-11375132)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (15-599)||(16254548-16255127)
chr4 (14-599)||(6693527-6694112)
chr4 (16-599)||(17150684-17151267)
chr4 (16-584)||(520375-520943)
chr4 (16-599)||(7844905-7845488)
chr4 (107-506)||(54698311-54698710)
chr4 (115-461)||(26813342-26813688)
chr4 (187-319)||(14933550-14933682)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (14-599)||(6423616-6424201)
chr3 (14-599)||(8974155-8974740)
chr3 (14-599)||(9538444-9539029)
chr3 (14-520)||(12387297-12387802)
chr3 (106-455)||(48979673-48980022)
chr3 (115-461)||(28366656-28367002)
chr3 (106-413)||(4384222-4384529)
chr3 (115-165)||(28374773-28374823)
chr3 (115-165)||(28382595-28382645)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (22-599)||(45015670-45016247)
chr2 (14-599)||(18652527-18653112)
chr2 (14-599)||(9512211-9512796)
chr2 (16-584)||(27168448-27169016)
chr2 (60-599)||(22903494-22904033)
chr2 (106-455)||(1791955-1792304)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (14-599)||(16156192-16156777)
chr1 (16-584)||(1987651-1988219)
chr1 (74-569)||(22959697-22960190)
chr1 (106-547)||(14280551-14280992)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (14-599)||(52979-53562)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (14-599)||(148017-148602)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (16-584)||(6030-6598)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (16-584)||(7080-7648)
scaffold0313 (16-584)||(10862-11430)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-583)||(16545-17097)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (14-436)||(20084-20506)
scaffold0141 (430-599)||(27670-27839)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (181-470)||(1-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (74-569)||(189005-189498)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (388-597)||(1-210)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (430-599)||(86973-87142)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (107-506)||(102825-103224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (106-461)||(257898-258253)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (181-317)||(5060-5196)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 9544272 - 9543687
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9544272 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9544173  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9544172 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggataccctgaaaata 9544073  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544072 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9543973  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9543972 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactaagatgtcttccaag 9543873  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543872 tatgtggagacctatggtcactgcaatcacccaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatcttattggttcactgagagctcatgaagttgta 9543773  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  9543772 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaagctcatcagctgctgaagatgatgt 9543687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 5390203 - 5389618
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  5390203 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 5390104  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5390103 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 5390004  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390003 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 5389904  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5389903 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 5389804  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5389803 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 5389704  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  5389703 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 5389618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16141216 - 16140631
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16141216 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16141117  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16141116 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16141017  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141016 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16140917  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16140916 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16140817  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16140816 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16140717  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16140716 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 26304865 - 26305450
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26304865 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26304964  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26304965 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26305064  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305065 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26305164  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26305165 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26305264  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26305265 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26305364  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26305365 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26305450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 26361953 - 26361368
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26361953 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26361854  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26361853 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26361754  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361753 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26361654  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26361653 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26361554  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26361553 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26361454  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26361453 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 32099689 - 32100274
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32099689 tcatcacaaatggagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattattaaactc 32099788  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32099789 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 32099888  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099889 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 32099988  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32099989 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 32100088  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32100089 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 32100188  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  32100189 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 32100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 46498423 - 46499008
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  46498423 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 46498522  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46498523 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 46498622  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498623 catcatgagggtacatttcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 46498722  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46498723 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 46498822  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46498823 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 46498922  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  46498923 ctttaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaactccatcagttgctgatgaagatgt 46499008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 6535793 - 6536378
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6535793 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcagcagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6535892  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6535893 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6535992  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535993 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6536092  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6536093 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6536192  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6536193 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6536292  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6536293 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 8502358 - 8502943
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8502358 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8502457  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  8502458 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 8502557  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8502558 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaa 8502657  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8502658 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8502757  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8502758 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8502857  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8502858 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 44898608 - 44899193
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  44898608 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 44898707  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  44898708 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 44898807  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44898808 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtaaaaatgaaaccattgatgaga 44898907  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44898908 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 44899007  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44899008 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 44899107  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  44899108 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 44899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 13284416 - 13283877
Alignment:
Q  60 caaagataagagtgcatg-gtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaag 158  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13284416 caaagaaaagagtgcatgtgtcaacagatgaaaaatctcaagtattgttaaattctaaagctagactctttctattatgtgcactaaccatggaagaaag 13284317  T
Q  159 tgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 258  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284316 tgaaagagttgatgaatgcaagaatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 13284217  T
Q  259 ggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttg 358  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13284216 ggagtcaaaaagtttgaa-tctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaatgaaatgagatctcttg 13284118  T
Q  359 gaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagattt 458  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13284117 ggaaggcatactccactcatgagagaatcagaaaaatattaagatgccttccaagtatgtggagacctatggtcacttcaatcactcaggccaaagattt 13284018  T
Q  459 aaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttg 558  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13284017 gaaatctatgaacctggaagatctcattggttcacttagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaactagtaaagaaggtaaagtcacttgccttg 13283918  T
Q  559 aaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||    
T  13283917 aaagcctctcagtaaacttcatcagtaactgatgatgatgt 13283877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 212 - 584
Target Start/End: Original strand, 42596865 - 42597237
Alignment:
Q  212 tacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42596865 tacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactataattgacattagagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgtgaatgaaaccattgatga 42596964  T
Q  312 gatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttcca 411  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  42596965 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgccttcca 42597064  T
Q  412 agtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttg 511  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42597065 agtatgtagagacctatggtcactgcaatcactgaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcatttgttcactgagagctcatgaagttg 42597164  T
Q  512 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  42597165 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcaacaaacctcatcagt 42597237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 42596698 - 42596858
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42596698 atcacagatggagactttgttccaaagaccaaaaaaggaaccatcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaactcta 42596797  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatg 176  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42596798 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagaggtgatgaatg 42596858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 506
Target Start/End: Original strand, 7582477 - 7582876
Alignment:
Q  107 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 206  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  7582477 taaattctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtttgggacactct 7582576  T
Q  207 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 306  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  7582577 aaaaattcatcatgaaggaactagccatttaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 7582676  T
Q  307 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 406  Q
    ||||| |||||   ||||| |||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||| | ||||||| | | || ||||||||  | |||||||    
T  7582677 gatgaaatgtacttcagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgtaaaaacttataccactcatgttcggataagaaaaatcttaagatgtc 7582776  T
Q  407 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 506  Q
    || |||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  7582777 tttcaagcacatggatacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattggttcattaaaagctcatga 7582876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 461
Target Start/End: Original strand, 15175386 - 15175740
Alignment:
Q  107 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |  || ||||| || ||||| ||  |    
T  15175386 taaactctaaagcttgactttttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttacggcaaaagaggtttgggacactct 15175485  T
Q  207 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 306  Q
     ||||| |||||||| |  ||    ||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  15175486 aaaaattcatcatgaagaaactagccacataaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 15175585  T
Q  307 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 406  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  15175586 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 15175685  T
Q  407 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  15175686 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 15175740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14643720 - 14643279
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14643720 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaactatggaggaaagtgaaagaatctatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14643621  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| || ||||| || ||    ||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  14643620 taaaaattcaccatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14643521  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  14643520 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 14643421  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 505  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||  ||| || ||||| |||||  | || ||||||||||    
T  14643420 ctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggccctagaggatcttattggaacgcttagagctcatg 14643321  T
Q  506 aagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 547  Q
    || || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14643320 aaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14643279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 27413457 - 27414042
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  27413457 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaaggtcaggtattactaaattt 27413556  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27413557 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 27413656  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413657 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 27413756  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413757 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 27413856  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27413857 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 27413956  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  27413957 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 27414042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 18362586 - 18363171
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18362586 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18362685  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18362686 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18362785  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362786 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18362885  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18362886 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18362985  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18362986 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18363085  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18363086 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 26201357 - 26200772
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26201357 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26201258  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26201257 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26201158  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201157 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26201058  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26201057 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26200958  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26200957 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26200858  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26200857 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 33940629 - 33941214
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  33940629 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 33940728  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  33940729 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 33940828  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940829 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 33940928  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33940929 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 33941028  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33941029 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 33941128  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33941129 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 33941214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Original strand, 20949166 - 20949734
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  20949166 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 20949265  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20949266 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 20949365  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949366 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 20949465  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20949466 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 20949565  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949566 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaggatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 20949665  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20949666 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 20949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 23375920 - 23375368
Alignment:
Q  23 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctag 122  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23375920 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 23375821  T
Q  123 actatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgag 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  |||||     
T  23375820 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 23375721  T
Q  223 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 322  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  23375720 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 23375621  T
Q  323 gatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggac 422  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     ||||||||||||     
T  23375620 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 23375526  T
Q  423 acctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagga 522  Q
    ||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23375525 acctatgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 23375429  T
Q  523 gacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 583  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23375428 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 23375368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 455
Target Start/End: Original strand, 5601579 - 5601928
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  5601579 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 5601678  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5601679 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 5601778  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  5601779 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 5601878  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 455  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  5601879 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 5601928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 30453535 - 30453136
Alignment:
Q  107 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30453535 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30453436  T
Q  207 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 306  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30453435 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30453336  T
Q  307 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 406  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  30453335 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30453236  T
Q  407 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 506  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  30453235 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 30453136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 30458613 - 30458214
Alignment:
Q  107 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30458613 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30458514  T
Q  207 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 306  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30458513 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30458414  T
Q  307 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 406  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  30458413 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30458314  T
Q  407 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 506  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  30458313 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 30458214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 506
Target Start/End: Original strand, 24413672 - 24414071
Alignment:
Q  107 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  24413672 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 24413771  T
Q  207 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 306  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  24413772 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 24413871  T
Q  307 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 406  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  24413872 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgaaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 24413971  T
Q  407 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 506  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  24413972 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 24414071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 24299530 - 24299175
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24299530 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24299431  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  24299430 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 24299331  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24299330 tgatgaaatgtattcatgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 24299231  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24299230 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 24299175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22456621 - 22456358
Alignment:
Q  268 aaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcat 367  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| | | |||||||||  |||| ||  | |||||   ||    
T  22456621 aaatttgaaatcttcgaaatgaatgaagaggaaaacattgatgaaatgtatttcagatttacttctaaagtaaatgagttgaggtcattgggaaaaatat 22456522  T
Q  368 attctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctat 467  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  22456521 attctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtcttcctaatatatggagacctatggttacagaaatcactcaagccaaagatttaaattcctt 22456422  T
Q  468 gaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaacca 531  Q
    |    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22456421 ggctttagaagatctcattggaacactaagagctcatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 22456358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 547
Target Start/End: Original strand, 20037121 - 20037526
Alignment:
Q  143 taaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaa-tacatcatgagggtacatctcatgtcaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| || |||| | |||||||| || ||    ||||| ||||    
T  20037121 taaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgttaaaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaag 20037220  T
Q  242 aaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaa 341  Q
    |||| || || || |||||  |  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| ||    
T  20037221 aaacaaggatagatattggcatacgaaaattcgaaatttttgaaatgagtgaagaagaaaacattgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaa 20037320  T
Q  342 tgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatc 441  Q
    |||  | || ||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||  |||||    
T  20037321 tgagttaaggtcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaacacgtggagacctatggttacaacaatc 20037420  T
Q  442 actcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaagg 541  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||  ||    | ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  20037421 actcaagccaacgatctaaattccttggctttagaaaatctcattggaacacttagagctcatgaagttctactccaagaagataaaccggtgaaaaagg 20037520  T
Q  542 taaaaa 547  Q
     |||||    
T  20037521 gaaaaa 20037526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24290023 - 24289908
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24290023 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24289924  T
Q  206 tgaaaatacatcatga 221  Q
    | ||||| ||||||||    
T  24289923 taaaaattcatcatga 24289908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21083233 - 21083014
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||    
T  21083233 ttaaactctaaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 21083134  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||    
T  21083133 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 21083034  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagat 325  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  21083033 tgatgagatgtttgcaagat 21083014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Original strand, 19781874 - 19781947
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatga 89  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || || || ||||||||||| ||||||||    
T  19781874 atcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtaaaggaaaatagtgcatggtccacagatga 19781947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15329521 - 15329389
Alignment:
Q  187 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 286  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  15329521 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 15329422  T
Q  287 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 319  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  15329421 tgaaggaaaccgaaaccattgatgaaatgtatg 15329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Original strand, 18709238 - 18709370
Alignment:
Q  187 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 286  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  18709238 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 18709337  T
Q  287 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 319  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  18709338 tgaaggaaaccgaaaccattgatgaaatgtatg 18709370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22456783 - 22456711
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgta 178  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22456783 ttaaattccaaagctcaactctttttacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgta 22456711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 471; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 14892785 - 14892199
Alignment:
Q  13 atcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892785 atcatcacatatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 14892686  T
Q  113 ctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaat 212  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  14892685 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgataaagaggtatgggataccttaaaaat 14892586  T
Q  213 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14892585 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgag 14892486  T
Q  313 atgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaa 412  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14892485 atgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggtatattctactcatgatagaattagaaaaatattgagatgtcttccaa 14892386  T
Q  413 gtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgt 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892385 gtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggcagaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgt 14892286  T
Q  513 acttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14892285 acttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 14892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 21212002 - 21211417
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  21212002 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 21211903  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  21211902 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 21211803  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211802 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 21211703  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21211702 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 21211603  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21211602 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 21211503  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  21211502 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgatgatgaagatgt 21211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 87 - 597
Target Start/End: Original strand, 22832121 - 22832631
Alignment:
Q  87 tgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgct 186  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  22832121 tgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatgaaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgcc 22832220  T
Q  187 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 286  Q
    ||||| |||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22832221 aaagaggtatgggacactttgagagtacatcatgaaggtacatctcatatcaaagaaactagaattgataatggagtcagaaagtttaaggtctttgaaa 22832320  T
Q  287 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaat 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22832321 tgagtgagaatgaaaccatttatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattccactcatgaaagaat 22832420  T
Q  387 tagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcatt 486  Q
      |||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22832421 cggaaagattccgagatgtcttccaattatgtggagacctatcgtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaaccttgaagatctcatt 22832520  T
Q  487 ggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttg 586  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  22832521 ggttcactgagagctcctgaagtagtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagtag 22832620  T
Q  587 ttgatgatgat 597  Q
     ||||||||||    
T  22832621 ctgatgatgat 22832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25036288 - 25035933
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25036288 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25036189  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25036188 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25036089  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  25036088 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25035989  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
     | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25035988 ttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25035933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25050325 - 25049970
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25050325 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25050226  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25050225 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25050126  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  25050125 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25050026  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
     | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25050025 ttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25049970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Original strand, 18233759 - 18234114
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18233759 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18233858  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18233859 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18233958  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18233959 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18234058  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18234059 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18234114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Original strand, 18243210 - 18243565
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18243210 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18243309  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18243310 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18243409  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18243410 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18243509  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18243510 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18243565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33600840 - 33600415
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| |||||| | ||||| || |    
T  33600840 ttaaattccaaagctcaactctttctacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaaggatttatgaatgtagtactgcaaaagaaatttgggacacat 33600741  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||||||  | || || ||||| ||  ||||||||||| | || ||||||| |||| | |||| |||    
T  33600740 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacacggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgaatgaagaagaaaacat 33600641  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||  | |||||||||||| | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  33600640 tgatgaaatgtattccagatttacctctatagtaaatgaattaaggtcattgggaaaaatatactctcctcatgacagaatcagaaaaatcctcagatgt 33600541  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 505  Q
    ||||| |  || |||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||  ||    | ||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  33600540 cttcctaaaatatggagacctatggttacagcaatcactcaatccaaagacttaaattccttggctttagaagatctcattggaacactaagagcccatg 33600441  T
Q  506 aagttgtacttcaaggagacaaacca 531  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33600440 aagttttgcttcaagaagacaaacca 33600415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Original strand, 12916388 - 12916743
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  12916388 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 12916487  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  12916488 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttagaaatgagtgatgaagaaaacat 12916587  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  12916588 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcctctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 12916687  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  12916688 ctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagacaaagatctaaa 12916743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23750089 - 23749914
Alignment:
Q  150 ggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactaga 249  Q
    |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   |||    
T  23750089 ggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagccttaaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaaga 23749990  T
Q  250 attgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagat 325  Q
    || ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23749989 atagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccattgatgagatgtttgcaagat 23749914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45497969 - 45497837
Alignment:
Q  187 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 286  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  45497969 aaagaaatttgggatgctttgaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 45497870  T
Q  287 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 319  Q
    |||  ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  45497869 tgaaggaaaccgaaaccatagatgaaatgtatg 45497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 18161374 - 18161959
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18161374 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18161473  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18161474 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18161573  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161574 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18161673  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18161674 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18161773  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18161774 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18161873  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18161874 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18161959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 31358870 - 31359455
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  31358870 tcatcacaaatgaagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 31358969  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31358970 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 31359069  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359070 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 31359169  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31359170 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 31359269  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31359270 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 31359369  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  31359370 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 31359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 16899255 - 16899840
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16899255 tcatcacagatggagactatgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16899354  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  16899355 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgagatactctgaaaata 16899454  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899455 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16899554  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16899555 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattcaactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16899654  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16899655 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16899754  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16899755 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Original strand, 34766667 - 34767235
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  34766667 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 34766766  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34766767 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 34766866  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766867 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 34766966  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34766967 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 34767066  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34767067 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 34767166  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34767167 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 34767235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 18711008 - 18710425
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||    
T  18711008 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18710909  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | ||||    
T  18710908 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18710809  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710808 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 18710709  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18710708 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18710609  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18710608 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18710509  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18710508 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18710425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 18705073 - 18704490
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||    
T  18705073 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18704974  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | ||||    
T  18704973 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18704874  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18704873 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaattttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatt 18704774  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18704773 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18704674  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18704673 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18704574  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18704573 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18704490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 405
Target Start/End: Original strand, 29541764 - 29542147
Alignment:
Q  22 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagcta 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29541764 gatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagcta 29541863  T
Q  122 gactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541864 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 29541963  T
Q  222 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 321  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29541964 gggtcaatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttaaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 29542063  T
Q  322 agatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  29542064 agatttactacaatagtaaatgaaatgaaatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 29542147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 400 - 599
Target Start/End: Original strand, 29561121 - 29561320
Alignment:
Q  400 agatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagag 499  Q
    ||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29561121 agatgtctttcaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 29561220  T
Q  500 ctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  29561221 ctcatgaagtcgtacttcaaggagataaaccagtgaagaatgtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 29561320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 461
Target Start/End: Original strand, 25895804 - 25895891
Alignment:
Q  374 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25895804 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 25895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 289
Target Start/End: Original strand, 11375030 - 11375132
Alignment:
Q  187 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 286  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||    
T  11375030 aaagaaatttgggatacattaaaaatacatcatgaaggaactagtcatgtgaaagaaacaagaattgacataggtgtacgaaaatttgaattattcgaaa 11375129  T
Q  287 tga 289  Q
    |||    
T  11375130 tga 11375132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 599
Target Start/End: Original strand, 16254548 - 16255127
Alignment:
Q  15 catcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattct 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16254548 catcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtcacagaaaagagtacatggtcaacagatgaaaaagctcaagtattgttaaactct 16254647  T
Q  115 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 214  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  16254648 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaaga-----gggataccttgaaaatac 16254742  T
Q  215 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254743 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 16254842  T
Q  315 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 414  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16254843 gtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagt 16254942  T
Q  415 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtac 514  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254943 atgtggagacctatggtcactgtaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtac 16255042  T
Q  515 ttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255043 ttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgctgatgatgatgt 16255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 6693527 - 6694112
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6693527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6693626  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6693627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6693726  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6693826  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6693827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6693926  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6693927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6694026  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6694027 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 599
Target Start/End: Original strand, 17150684 - 17151267
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  17150684 atcacagatggagactttgttccaacaaccaacgaaggaactgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaatgctcaggtattgttaaacttta 17150783  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17150784 aagctagactctttctatcatttgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 17150883  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150884 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 17150983  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  17150984 tatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagatatcttgaaaaggcatattctactcatgtttgaattagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 17151083  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17151084 tttggagacctatggtcaatgcaattactcaggccaaagatttataatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 17151183  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  17151184 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 17151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 520943 - 520375
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  520943 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 520844  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  520843 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 520744  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520743 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 520644  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  520643 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaaacatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 520544  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520543 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 520444  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  520443 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 7845488 - 7844905
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||   || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||    
T  7845488 atcacagatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctataaaggaaaagaaggcatggtcaacagatgaaaaggctcatgtattactaaactcta 7845389  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  7845388 aagctagactttttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgggacactctgaaaatata 7845289  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845288 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgatattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7845189  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||     
T  7845188 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcttattctacttatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 7845089  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7845088 tatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaatctagaagatctcattggctcattgagagctcatgaagttgtact 7844989  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  7844988 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgcattgaaagcatctcaacaaagctcattagtagctgatgatgatgt 7844905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 54698710 - 54698311
Alignment:
Q  107 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  54698710 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 54698611  T
Q  207 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 306  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  54698610 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 54698511  T
Q  307 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 406  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  54698510 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 54698411  T
Q  407 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 506  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  54698410 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 54698311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 461
Target Start/End: Original strand, 26813342 - 26813688
Alignment:
Q  115 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 214  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  26813342 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 26813441  T
Q  215 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 314  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  26813442 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 26813541  T
Q  315 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 414  Q
    |||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||| | ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||     
T  26813542 gtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcgaataagaaaaattttaagatgtcttccaagc 26813641  T
Q  415 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  26813642 acatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 26813688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Original strand, 14933550 - 14933682
Alignment:
Q  187 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 286  Q
    |||||| | |||||| | || |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  14933550 aaagaaatttgggatgctttcaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 14933649  T
Q  287 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 319  Q
    |||  ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  14933650 tgaaggaaaccgaaaccatagatgaaatgtatg 14933682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 6423616 - 6424201
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6423616 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaaatgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6423715  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6423716 taaagctagactctttctatcgtgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 6423815  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423816 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6423915  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6423916 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgaggtgtcttccaag 6424015  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6424016 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctataaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6424115  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  6424116 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 6424201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 8974155 - 8974740
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8974155 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8974254  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8974255 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 8974354  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974355 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 8974454  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8974455 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8974554  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8974555 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8974654  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  8974655 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 8974740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 9538444 - 9539029
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9538444 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9538543  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  9538544 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaacaagtatgggatactctgaaaata 9538643  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538644 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9538743  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9538744 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9538843  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9538844 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9538943  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  9538944 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 9539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 12387297 - 12387802
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||    
T  12387297 tcatcacagatggagactttgttccaaaaaccaaagaaggaactgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaagtattaataaactc 12387396  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  12387397 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaactgaaagagtttatgaatttaagaatgc-aaagaggtatgggataccttgatagta 12387495  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12387496 catcatgaagttacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattgaagtcataaagttggaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 12387595  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12387596 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatcttttggaaaggcatattccacttatgagagagtcagaaaaatattgagatgccttccaag 12387695  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12387696 tatgcgaagacctatggtcactgcaattactcaggctaaatatttacaatatatgaacttggaagatctcattgattcactgatagctcatgaagttgta 12387795  T
Q  514 cttcaag 520  Q
    |||||||    
T  12387796 cttcaag 12387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 455
Target Start/End: Original strand, 48979673 - 48980022
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  48979673 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 48979772  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  48979773 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 48979872  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  48979873 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 48979972  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 455  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  48979973 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 48980022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 28367002 - 28366656
Alignment:
Q  115 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 214  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  28367002 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtcactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 28366903  T
Q  215 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 314  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  28366902 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 28366803  T
Q  315 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 414  Q
    |||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||     
T  28366802 gtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaattttaagatgtcttccaagc 28366703  T
Q  415 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  28366702 acatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 28366656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4384529 - 4384222
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||||||||||||| || | | | |||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || || ||||| |    
T  4384529 ttaaattctaaagctcgagtctatctatcatgcagattaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtttgagatactt 4384430  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | |||||  ||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||| |||| |  | | |||    
T  4384429 taaaaatcaatcatgaaggaacaaggcacgtaaaagaaacaagaatagatatcggtgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaatgaataaaataacat 4384330  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||| ||  | |||||| |  |||| | ||||| ||||||| | | ||||    
T  4384329 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaattaagatcacttgggaaaacttattctgccgatgacataattaaaaaaatattaaaatgt 4384230  T
Q  406 cttccaag 413  Q
    ||||||||    
T  4384229 cttccaag 4384222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28374823 - 28374773
Alignment:
Q  115 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 165  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28374823 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28374773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28382645 - 28382595
Alignment:
Q  115 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 165  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28382645 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28382595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 599
Target Start/End: Original strand, 45015670 - 45016247
Alignment:
Q  22 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagcta 121  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  45015670 gatgaagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactatactctaaagcta 45015769  T
Q  122 gactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatga 221  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015770 gagtctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 45015869  T
Q  222 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45015870 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 45015969  T
Q  322 agatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtgga 421  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015970 agatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtgga 45016069  T
Q  422 cacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagg 521  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45016070 gacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagg 45016169  T
Q  522 agacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45016170 agacaaaccagtaaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagtcaagctcatcagttgctgatgatgatgt 45016247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 18652527 - 18653112
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18652527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18652626  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18652627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 18652726  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18652826  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18652827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18652926  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18652927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18653026  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18653027 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 18653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 9512796 - 9512211
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9512796 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9512697  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  9512696 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 9512597  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512596 catcatgagggtacatctcatgtcagagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9512497  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9512496 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9512397  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9512396 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9512297  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  9512296 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 9512211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 27169016 - 27168448
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27169016 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 27168917  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27168916 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 27168817  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168816 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagagaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 27168717  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27168716 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 27168617  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168616 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 27168517  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27168516 tcaaggagacaaaccagtaaagaaagtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 599
Target Start/End: Original strand, 22903494 - 22904033
Alignment:
Q  60 caaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903494 caaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaaactcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 22903593  T
Q  160 gaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 259  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903594 gaaagagttgatgaatgtattaatgctaaagatgtatgggatattttgatattacatcatgatggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 22903693  T
Q  260 gagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttgg 359  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22903694 gagttagaaagtttcaagtctttgaaatgagtgagaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatctcttgg 22903793  T
Q  360 aaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagattta 459  Q
    |||| ||||||  |||||||| | ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  22903794 aaagacatatttcactcatgagataatcagaaaaatattgagttgccttccaagtatgtggagacctatggtaactgcaattactcaggccaaagatttg 22903893  T
Q  460 aaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttga 559  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |    
T  22903894 aaatctatgaacttggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccaatgaagaaggtaaagtcacttgccttaa 22903993  T
Q  560 aagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||    
T  22903994 aagcctctcagcaaacctcatcagtagctgaagatgatgt 22904033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 455
Target Start/End: Original strand, 1791955 - 1792304
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  1791955 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 1792054  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  1792055 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 1792154  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  1792155 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 1792254  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 455  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1792255 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 1792304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 16156192 - 16156777
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16156192 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16156291  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16156292 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16156391  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156392 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16156491  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156492 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgataaaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 16156591  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16156592 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggcaaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16156691  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16156692 cttcaacgagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacctgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16156777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 1988219 - 1987651
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1988219 atcacagatggagactttgttccattaaccaaagaaggaatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 1988120  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1988119 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 1988020  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988019 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 1987920  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1987919 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgacttccaagta 1987820  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1987819 tgtggagacctatggtcactgaaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaatctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 1987720  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1987719 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaatctcatcagt 1987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 74 - 569
Target Start/End: Original strand, 22959697 - 22960190
Alignment:
Q  74 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 173  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22959697 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcattaaccttggaagaaagtgaaagggttgatga 22959796  T
Q  174 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 273  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22959797 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaaccactcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 22959895  T
Q  274 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattcta 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | |||| | |    
T  22959896 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatacca 22959995  T
Q  374 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 473  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   |    
T  22959996 ctcatgatagaatcaggaagatactaagatgtcttccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 22960095  T
Q  474 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 569  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  22960096 ggaagaactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccagtgaggaaggtaaaatcacttaccttaaaagcttctca 22960190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14280992 - 14280551
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| ||||||||   ||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14280992 ttaaactctaaagcccaactctttttacaatgttcaataaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14280893  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  14280892 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14280793  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| ||||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  14280792 tgatgatatgtattcacgattcacttcaatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaattttaagatgt 14280693  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 505  Q
    || ||||  |  |||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||    | || |||||||||||  | || ||||||||||    
T  14280692 ctcccaaacacatggagacccatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggctttagaggatctcattggaacgcttagagctcatg 14280593  T
Q  506 aagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 547  Q
    || || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14280592 aaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14280551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 53562 - 52979
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53562 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaatagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 53463  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53462 taaagctagactctttctatcatgtgcattaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttaaaaata 53363  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53362 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 53263  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  53262 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaata--gagatgtcttccaag 53165  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53164 tatatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctcgaagatctcattggatcactgagagctcatgaagttata 53065  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  53064 cttcaaggagacaaactagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcatcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 52979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Original strand, 148017 - 148602
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  148017 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaggtattactaaactc 148116  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  148117 ttaagctagactctttctatcatgtgcacttaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgtgataccttaaaaata 148216  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  148217 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgaga 148316  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  148317 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattatactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 148416  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  148417 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctagaggatctcattggttcactgagagctcatgacgttgta 148516  T
Q  514 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  148517 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaagtaaaaacacttaccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 148602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 6598 - 6030
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  6598 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 6499  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6498 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 6399  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6398 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 6299  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6298 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 6199  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6198 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 6099  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6098 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Original strand, 7080 - 7648
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  7080 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 7179  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7180 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 7279  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7280 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7379  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7380 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 7479  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 7579  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7580 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 584
Target Start/End: Original strand, 10862 - 11430
Alignment:
Q  16 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  10862 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 10961  T
Q  116 aagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10962 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 11061  T
Q  216 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 11161  T
Q  316 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 415  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11162 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 11261  T
Q  416 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 515  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11262 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 11361  T
Q  516 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11362 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 11430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 583
Target Start/End: Original strand, 16545 - 17097
Alignment:
Q  23 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctag 122  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16545 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 16644  T
Q  123 actatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgag 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  |||||     
T  16645 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 16744  T
Q  223 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 322  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  16745 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 16844  T
Q  323 gatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggac 422  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     ||||||||||||     
T  16845 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 16939  T
Q  423 acctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagga 522  Q
    ||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16940 acctatgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 17036  T
Q  523 gacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 583  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17037 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20506
Alignment:
Q  14 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||    
T  20084 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaatctcaggtattactaaactc 20183  T
Q  114 taaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 213  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  ||| | ||    
T  20184 caaagctagactctttctatcatgtgcactgactagggaagaaagtgaaagagttgatgtgtgtaaaaatgccaaagatgtatgggacactctgagagta 20283  T
Q  214 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 313  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284 catcataaaggtacatctcatgtcaaaggaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaactctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 20383  T
Q  314 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  20384 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaag 20483  T
Q  414 tatgtggacacctatggtcactg 436  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  20484 aatgtggagacctatggtcactg 20506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 430 - 599
Target Start/End: Original strand, 27670 - 27839
Alignment:
Q  430 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 529  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27670 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 27769  T
Q  530 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  27770 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 27839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 181 - 470
Target Start/End: Original strand, 1 - 290
Alignment:
Q  181 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1 aatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaagtttgaagtct 100  T
Q  281 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatga 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  101 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttagaaaagcatattccactcatga 200  T
Q  381 tagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaa 470  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 aagaataagaaaaataatgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 74 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 189498 - 189005
Alignment:
Q  74 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 173  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  189498 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcactaaccttggaagaaattgaaagggttgatga 189399  T
Q  174 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 273  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  189398 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaacctctcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 189300  T
Q  274 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattcta 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | ||||   |    
T  189299 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgataaaatatatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatagca 189200  T
Q  374 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 473  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   |    
T  189199 ctcatgatagaattaggaagatactaagatgtcttccaagtacatggaggcctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 189100  T
Q  474 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 569  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  189099 ggaagtactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccaatgagaaaggtaaaatcacttgccttaaaagcttctca 189005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 388 - 597
Target Start/End: Original strand, 1 - 210
Alignment:
Q  388 agaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agaaaaatattgagatgtcttccaagtatttggagacctatggtcactgcaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 100  T
Q  488 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgt 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacactttccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgc 200  T
Q  588 tgatgatgat 597  Q
    ||||||||||    
T  201 tgatgatgat 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 430 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 87142 - 86973
Alignment:
Q  430 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 529  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  87142 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 87043  T
Q  530 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 599  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  87042 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 86973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 103224 - 102825
Alignment:
Q  107 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  103224 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 103125  T
Q  207 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 306  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  103124 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 103025  T
Q  307 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 406  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  103024 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 102925  T
Q  407 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 506  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  102924 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 102825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Original strand, 257898 - 258253
Alignment:
Q  106 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 205  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| |||||||||| |    
T  257898 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatatgggatacgt 257997  T
Q  206 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 305  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  257998 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 258097  T
Q  306 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 405  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  258098 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 258197  T
Q  406 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 461  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  258198 ctcccaaaaacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 258253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 317
Target Start/End: Original strand, 5060 - 5196
Alignment:
Q  181 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 280  Q
    ||||| |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| | |    
T  5060 aatgccaaagaaatttgggatacattaaaggtacatcatgaaggcaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaaatttgaactat 5159  T
Q  281 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgta 317  Q
    |||||||||  ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  5160 ttgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatgaaatgta 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University