View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6507_high_10 (Length: 524)

Name: NF6507_high_10
Description: NF6507
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6507_high_10
NF6507_high_10
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (54-521)||(8929388-8929854)
chr4 (133-512)||(8900570-8900949)
chr4 (116-513)||(8914474-8914871)
chr4 (135-521)||(8979075-8979461)
chr4 (139-512)||(9000158-9000531)
chr4 (130-493)||(8966267-8966630)
chr4 (129-512)||(8954733-8955116)
chr4 (139-512)||(9030593-9030966)
chr4 (1-45)||(8929897-8929941)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (135-520)||(9400259-9400644)
chr5 (133-513)||(20074028-20074408)
chr5 (172-236)||(31072051-31072115)
chr5 (172-236)||(31039729-31039793)
chr5 (172-236)||(31053219-31053283)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 8929854 - 8929388
Alignment:
Q  54 aacttttatcttgttaatagtaagtattttacaaaatcccttaacgagtacataactactagtattctttatgttcaggacatgcttgtagccgcaacag 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8929854 aacttttatcttgttaatagtaagtattttacaaaatct-ttaaagagtacttaactactcgtattctttatgtttaggacatgcttgtagccgcaacag 8929756  T
Q  154 ataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagattaggggatcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8929755 ataccacgtctgccacgatagtgtgggctatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagattaggggatcaagagttaa 8929656  T
Q  254 aaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacctaccagctccattgcttttg 353  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8929655 aaaggattttctagacggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacctaccagctccattgcttttg 8929556  T
Q  354 ccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattcatagagactctgaaa 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8929555 ccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattcatagagactctgaaa 8929456  T
Q  454 tttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttcgacat 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8929455 tttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttggacat 8929388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 133 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8900949 - 8900570
Alignment:
Q  133 acatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaaga 232  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8900949 acatgcttgtagctgcaacggataccacatctgccacaatagtttgggctatgactgccttaataaaaaatccaagagtaatgaagaaagtgcaacaaga 8900850  T
Q  233 gattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtac 332  Q
    |||||||   |||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8900849 gattaggaattcaagagttaaaaaagaatttatagatgaagatgatatacaaaatttctcctacttgaaggcagtgataaaagagacattgagattgtac 8900750  T
Q  333 ctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggt 432  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  | || || | |||||||||||||     
T  8900749 ctaccaggcccattgcttgtgccaagagaaacaagggaaaagtgcattataagtggctaccaaattcctgcaaaggcgattgtgtttgtgaatgcttggg 8900650  T
Q  433 ctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaatttt 512  Q
    ||||||||| |||| | ||  |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8900649 ctattcatacagacccagatgtttggaaaaacccagaagagttttatcctgaaagatttttagaaagttctataaatttt 8900570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 116 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8914871 - 8914474
Alignment:
Q  116 tattctttatgttcaggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatg 215  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8914871 tattctttatatgcagaatatgcttgtagcggcaacaggtaccacgtctgccacagcagtttgggctatgactgccttaataaaaaatccaagagtaatg 8914772  T
Q  216 aagaaagtacaagaagagattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaag 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||| ||| ||||||   ||| || ||||| ||||||||||    
T  8914771 aagaaagtacaacaagagattaggaattcaagagttaaaaaagaatttatagatgaagatgatatacgaaatttgtcctacttaaaggcagtgataaaag 8914672  T
Q  316 agacattgagattgtacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagt 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| | ||  ||||| ||| ||||| |||||  | |||||    
T  8914671 agacattgagattgtacctgccagccccattgcttgcgccaagagaaacaactgaaaaatgcactataaatggcttccaaattcccgcaaaggcgatagt 8914572  T
Q  416 atatgtgaatgcttggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttc 513  Q
     | ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  8914571 gtttgtgaatgcttgggctattcatacagactcaaatgtttggaaaaacccagaagaattttatccagagagatttttagaaagttctttaaattttc 8914474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 521
Target Start/End: Original strand, 8979075 - 8979461
Alignment:
Q  135 atgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagaga 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
T  8979075 atgcttgtagctgcaacagatactacatcagccacatcagtttgggctatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgagaaaagtgcaagaggaaa 8979174  T
Q  235 ttaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacct 334  Q
    |||||   |   ||| |||||| | |||| |||||| ||||||| | |||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8979175 ttaggaacttgggaggtaaaaaagattttttagatgaagatgatattcaaaattctctatatttgaaggcagtgataaaagagacattaagattgtacct 8979274  T
Q  335 accagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtct 434  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |   ||||||| ||||||| ||  |||||||| | ||||| || |  ||| ||    
T  8979275 accagctccactgcttgtaccaagagaatcaagggaaacatgcattatcaatggctacaatattccagcccaaacaatattgtatgtaaacgtctgggct 8979374  T
Q  435 attcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttcgacat 521  Q
    ||||| |||||  || | | ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  8979375 attcaaagagatcctaatacttggaaaaatccagaagaattttatcccgagagattcatagaaagttctataaattttattggacat 8979461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9000531 - 9000158
Alignment:
Q  139 ttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagattag 238  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | |||||   ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  9000531 ttgtagctggaacagataccacagcagccacatcagtttgggctatgactgccttaatgaaaaacccaagagtaatgaggaaagtacaagatgaaattag 9000432  T
Q  239 gggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacctacca 338  Q
        |   ||| | |||| | |||| |||||| ||||||| | ||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||| ||||||||    
T  9000431 aaatttgggaggtgaaaaagattttttagatgaagatgatattcaaaatttaccttatttgaaggcagtgattaaagagacgctaagattgcacctacca 9000332  T
Q  339 gctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattc 438  Q
    || ||  | ||| ||| ||||||| || | ||||| |||| | || |||| ||| ||||||| || || |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9000331 gcccctctacttatgcaaagagaatcacgtgaaaattgcactataagtggatacaatattccagccaagacaatattgtatgtgaatgcttgggctattc 9000232  T
Q  439 atagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaatttt 512  Q
    | |||||| || |  |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000231 agagagaccctaatgtttggaaaaatccagaagaattttatcctgaaagattcttagaaagttctataaatttt 9000158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8966630 - 8966267
Alignment:
Q  130 aggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaaga 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||   ||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8966630 aggacatgcttgtagctgcaacagacaccacagcagccacatcagtttgggctataacctccctgataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaaga 8966531  T
Q  230 agagattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattg 329  Q
    ||| |||||    |   ||  |||||| |  ||  |||| | | ||||| | |||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8966530 agaaattagaaacttgggaagtaaaaaagaattcatagacgaaaatgatattcaaaatttcccatatttaaaggcagtgataaaagagacgttgagattg 8966431  T
Q  330 tacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgctt 429  Q
     |||||||  | ||| | ||| | ||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  8966430 cacctacctaccccactacttgttccaagagaatcaagagaaaagtgcattataagtggttacaagattccagccaacacaatagtgtatgtgaatgctt 8966331  T
Q  430 ggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattctt 493  Q
    || ||||||| |||||| |    | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8966330 gggctattcaaagagacccaagtaattggaaaaatccagaagagttttatcccgagagattctt 8966267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 512
Target Start/End: Original strand, 8954733 - 8955116
Alignment:
Q  129 caggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaag 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||  |   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||    
T  8954733 caggatatgcttgtagctgcaaccgataccacatcagcagcatcagtttgggctatgactgctctaataaaaaaccctagagtaatgagtaaagtaaaag 8954832  T
Q  229 aagagattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatt-tcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagat 327  Q
    |||| || ||    |   |||||||||| | |||| || ||| ||||||| | ||||||| || | |||||||||||  |  | ||||||||| | ||||    
T  8954833 aagaaataagaaatttgggagttaaaaaagattttttatatgaagatgatattcaaaattgtcct-tatttgaaggctatagttaaagagacactaagat 8954931  T
Q  328 tgtacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgc 427  Q
    |  |||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| | |  ||||| || |   || |||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8954932 tacacctaccagccccactacttgtgccaagggaatctattgaaaattgtaccataagtggatacaacattcctgcaaagacaatattatatgtaaatgc 8955031  T
Q  428 ttggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaatttt 512  Q
    |||| ||||||| |||||  | || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8955032 ttgggctattcagagagatccagatatttggataaacccagaagaattttatcctgagagattcttagaaagttctataaatttt 8955116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 512
Target Start/End: Original strand, 9030593 - 9030966
Alignment:
Q  139 ttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagattag 238  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |   ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||    
T  9030593 ttgtagccgcaacagataccacatcagccgcatcagtttgggctatgaccgccctaatgaaaaacccaagagtattggataaagtacaagaagaaatcag 9030692  T
Q  239 gggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacctacca 338  Q
        |   ||| |  ||| | || | |||||| || |||||| ||||||||    |||||||| || ||||| |||||||| || |||||| | ||||||    
T  9030693 aaacttgggaggtgcaaaagattatttagatgaaggtgatcttcaaaatttaccttatttgaatgcagtgattaaagagacgttaagattgcatctacca 9030792  T
Q  339 gctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattc 438  Q
    || ||||||||  || | |||||| || | ||||| |||| | ||  ||| ||| ||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9030793 gccccattgctcctgtctagagaatcacgtgaaaattgcactataaatggatacaatattccagccaggacaatattgtatgtgaatgcttgggctattc 9030892  T
Q  439 atagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaatttt 512  Q
    | ||||||  | |  ||||| || |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9030893 agagagaccataatgtttgggaaaacgcagaagaattttatcctgaaagattcttagaaagttctataaatttt 9030966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 8929941 - 8929897
Alignment:
Q  1 ttttcgaatttgatattttttactcaatttaaatccactatatca 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8929941 ttttcgaatttgatattttttactcactttaaatccactatatca 8929897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9400644 - 9400259
Alignment:
Q  135 atgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagaga 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9400644 atgcttgtagctgcaacagatacaacatcagctacattagtttgggcaatgactgtcctaataaagaaccctgcagtaatgaagaaagtacaacaagaga 9400545  T
Q  235 ttaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacct 334  Q
    ||||| | |||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | |||    
T  9400544 ttaggagttcaagagttaaaaaagactttttagatgaagatgatatacaaaatttctcctacttgaaggcagtcataaaagagacattgagattattcct 9400445  T
Q  335 accagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtct 434  Q
    ||||  |||||||||  ||||||| ||  ||| ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9400444 accaaatccattgctactgccaagggagtcaatggaaatgtgcactataggtggttaccagattccagcaaagacaatagtgtatgtgaatgcttgggct 9400345  T
Q  435 attcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttcgaca 520  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9400344 attcatagagactctaatgtttggaaagatccagaagagttttatccagagagattcttagaaagttctataaattttcttggaca 9400259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 133 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20074408 - 20074028
Alignment:
Q  133 acatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaaga 232  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20074408 acatgcttgttgctgcaacagataccacatcagccacaacagtatgggctatgactgcattaataaaaaatccaagagtaatgaagaaagtacaacaaga 20074309  T
Q  233 gattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtac 332  Q
    ||||||    |||| ||||||||| |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20074308 gattagaaattcaaaagttaaaaaagaatttatagatgaagatgatatacaaaatttctcctacttgaaggcagtgataaaagagacactgagattgtac 20074209  T
Q  333 ctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggt 432  Q
     | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||  |  |||| | |||||||||||||     
T  20074208 ttgccagccccattgcttgtgccaagagaaacaagggaaaagtgcactataggtggctaccaaattccggcaaaggcggtagtgtttgtgaatgcttggg 20074109  T
Q  433 ctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttc 513  Q
    ||||||||| |||| || |  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  20074108 ctattcatacagaccctaatgtttggaaaaatccagaagaattttatcctgagagatttttagaaagttcgataaattttc 20074028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31072115 - 31072051
Alignment:
Q  172 tagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagatt 236  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31072115 tagtttgggctatgactgcactaatgaagaatccaagagtgatgcagaaagtacaagaagagatt 31072051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31039793 - 31039729
Alignment:
Q  172 tagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagatt 236  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31039793 tagtctgggctatgactgcgctaatgaagaatccaagagcgatgcagaaagtacaagaagagatt 31039729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31053283 - 31053219
Alignment:
Q  172 tagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagatt 236  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31053283 tagtctgggctatgactgcactaatgaagaatccaagagcgatgcagaaagtacaagaagagatt 31053219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University