View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6529_low_6 (Length: 342)

Name: NF6529_low_6
Description: NF6529
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6529_low_6
NF6529_low_6
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (67-332)||(1313557-1313822)
chr3 (67-332)||(43421260-43421524)
chr3 (67-332)||(43423308-43423572)
chr3 (67-332)||(53917506-53917773)
chr3 (67-332)||(3314832-3315100)
chr3 (83-332)||(880313-880560)
chr3 (66-332)||(53915337-53915605)
chr3 (67-317)||(27635497-27635752)
chr3 (67-332)||(45883087-45883357)
chr3 (67-332)||(4308122-4308390)
chr3 (83-332)||(6484508-6484756)
chr3 (67-332)||(36011975-36012243)
chr3 (67-332)||(1626525-1626792)
chr3 (67-332)||(51674608-51674875)
chr3 (66-332)||(17795406-17795670)
chr3 (66-332)||(19103846-19104110)
chr3 (67-296)||(41849243-41849470)
chr3 (67-332)||(42990452-42990717)
chr3 (102-310)||(51943540-51943753)
chr3 (66-332)||(3306909-3307177)
chr3 (66-332)||(9604446-9604716)
chr3 (67-332)||(18096740-18097009)
chr3 (66-309)||(12267818-12268061)
chr3 (67-332)||(1321627-1321897)
chr3 (67-332)||(32219232-32219503)
chr3 (67-332)||(43226233-43226495)
chr3 (76-332)||(43228439-43228696)
chr3 (66-332)||(32263880-32264148)
chr3 (67-332)||(18099010-18099279)
chr3 (67-332)||(6231948-6232208)
chr3 (66-332)||(24979855-24980127)
chr3 (73-332)||(27101028-27101290)
chr3 (69-332)||(47701522-47701780)
chr3 (83-332)||(4666664-4666911)
chr3 (67-332)||(53468295-53468565)
chr3 (67-332)||(10955867-10956136)
chr3 (67-332)||(51726847-51727116)
chr3 (67-332)||(10958163-10958432)
chr3 (73-332)||(18162811-18163074)
chr3 (66-332)||(25687997-25688270)
chr3 (67-332)||(11168249-11168519)
chr3 (67-332)||(23633602-23633862)
chr3 (67-332)||(5899820-5900091)
chr3 (66-332)||(10084228-10084498)
chr3 (66-332)||(15781019-15781294)
chr3 (67-332)||(25533590-25533842)
chr3 (67-332)||(28101848-28102111)
chr3 (66-332)||(47148744-47149004)
chr3 (67-332)||(5886347-5886618)
chr3 (67-332)||(28761287-28761538)
chr3 (129-317)||(48361572-48361765)
chr3 (67-332)||(53591332-53591597)
chr3 (67-332)||(5522466-5522735)
chr3 (73-332)||(5926615-5926873)
chr3 (69-330)||(5191803-5192066)
chr3 (67-332)||(25634035-25634294)
chr3 (66-332)||(10191151-10191419)
chr3 (112-332)||(54691460-54691683)
chr3 (70-233)||(880087-880251)
chr3 (84-332)||(38890188-38890441)
chr3 (67-315)||(31151508-31151754)
chr3 (67-332)||(4103736-4104004)
chr3 (83-241)||(28181242-28181400)
chr3 (139-332)||(39715617-39715809)
chr3 (67-332)||(22114143-22114414)
chr3 (67-305)||(7606443-7606670)
chr3 (76-332)||(561633-561886)
chr3 (67-331)||(25389055-25389326)
chr3 (106-316)||(26720711-26720928)
chr3 (146-332)||(42992418-42992606)
chr3 (67-332)||(3859676-3859930)
chr3 (185-332)||(30005989-30006137)
chr3 (67-332)||(746906-747177)
chr3 (67-332)||(458433-458702)
chr3 (205-332)||(11170552-11170678)
chr3 (67-332)||(25635529-25635788)
chr3 (67-332)||(456056-456325)
chr3 (67-332)||(50494148-50494417)
chr3 (74-270)||(53893900-53894105)
chr3 (124-242)||(8183035-8183154)
chr3 (104-305)||(36871185-36871384)
chr3 (67-332)||(10621366-10621638)
chr3 (230-332)||(889781-889882)
chr3 (67-255)||(42992610-42992799)
chr3 (67-332)||(6065633-6065904)
chr3 (205-285)||(35919098-35919178)
chr3 (67-332)||(53597384-53597644)
chr3 (83-329)||(1620329-1620567)
chr3 (67-332)||(28412870-28413140)
chr3 (67-332)||(6063283-6063554)
chr3 (67-188)||(11170671-11170788)
chr3 (200-332)||(24181528-24181660)
chr3 (67-269)||(38210580-38210789)
chr3 (230-332)||(35917952-35918052)
chr3 (267-326)||(54884308-54884367)
chr3 (258-332)||(29956834-29956907)
chr3 (259-332)||(13420222-13420295)
chr3 (175-330)||(14634393-14634549)
chr3 (263-332)||(6561958-6562028)
chr3 (155-308)||(27420822-27420973)
chr3 (236-282)||(28181185-28181230)
chr3 (129-241)||(26763205-26763313)
chr3 (153-277)||(1674166-1674292)
chr3 (244-316)||(11007545-11007617)
chr3 (73-138)||(36957651-36957713)
chr3 (214-264)||(30236249-30236299)
chr3 (220-269)||(16264354-16264403)
chr3 (220-269)||(25795785-25795834)
chr3 (220-269)||(32143325-32143374)
chr3 (66-149)||(24181669-24181750)
[»] chr4 (107 HSPs)
chr4 (67-332)||(38928024-38928288)
chr4 (67-332)||(33415334-33415599)
chr4 (65-332)||(22800703-22800973)
chr4 (67-332)||(16453531-16453796)
chr4 (66-332)||(17662091-17662356)
chr4 (67-332)||(36921338-36921604)
chr4 (67-332)||(40091259-40091526)
chr4 (67-332)||(22802577-22802845)
chr4 (70-332)||(36919432-36919695)
chr4 (67-332)||(4215528-4215792)
chr4 (67-332)||(36378514-36378777)
chr4 (65-332)||(40637296-40637568)
chr4 (67-332)||(24889018-24889286)
chr4 (67-329)||(2891516-2891780)
chr4 (82-306)||(47563009-47563231)
chr4 (66-332)||(14633540-14633811)
chr4 (66-332)||(5635317-5635587)
chr4 (67-332)||(37312924-37313177)
chr4 (102-332)||(47274948-47275178)
chr4 (67-317)||(14787274-14787527)
chr4 (66-332)||(16455463-16455715)
chr4 (129-332)||(24879211-24879419)
chr4 (67-332)||(5101151-5101404)
chr4 (67-332)||(8631260-8631530)
chr4 (66-332)||(37089211-37089482)
chr4 (88-332)||(12395712-12395956)
chr4 (88-332)||(12400674-12400918)
chr4 (64-332)||(31849437-31849709)
chr4 (67-332)||(24348440-24348692)
chr4 (74-332)||(36380571-36380827)
chr4 (88-332)||(13547376-13547621)
chr4 (129-332)||(24880673-24880883)
chr4 (73-332)||(48486541-48486803)
chr4 (67-332)||(18409192-18409458)
chr4 (67-285)||(14789273-14789495)
chr4 (67-330)||(19096107-19096370)
chr4 (67-332)||(26085818-26086087)
chr4 (66-332)||(2484714-2484983)
chr4 (67-332)||(19322915-19323177)
chr4 (83-332)||(22046544-22046796)
chr4 (64-332)||(7941545-7941817)
chr4 (73-313)||(27499283-27499530)
chr4 (66-332)||(6765066-6765336)
chr4 (67-332)||(9148475-9148727)
chr4 (67-332)||(24446502-24446752)
chr4 (83-292)||(6133098-6133308)
chr4 (67-332)||(12102309-12102566)
chr4 (67-333)||(619298-619559)
chr4 (83-332)||(22044249-22044501)
chr4 (67-332)||(5198642-5198895)
chr4 (83-332)||(11435177-11435430)
chr4 (67-332)||(18537325-18537586)
chr4 (83-332)||(41997714-41997958)
chr4 (83-332)||(51015468-51015720)
chr4 (73-332)||(18534689-18534944)
chr4 (83-332)||(38890091-38890337)
chr4 (67-332)||(47868623-47868894)
chr4 (67-332)||(11437585-11437855)
chr4 (67-262)||(3937126-3937316)
chr4 (67-332)||(11006094-11006347)
chr4 (67-332)||(53405357-53405626)
chr4 (67-332)||(8756103-8756363)
chr4 (67-332)||(11008408-11008676)
chr4 (67-255)||(52942329-52942523)
chr4 (67-332)||(49088791-49089044)
chr4 (82-332)||(38409427-38409680)
chr4 (153-332)||(25357863-25358042)
chr4 (67-332)||(9176315-9176584)
chr4 (67-201)||(56030815-56030945)
chr4 (106-314)||(30136789-30136996)
chr4 (66-240)||(3824446-3824630)
chr4 (67-332)||(9173987-9174256)
chr4 (129-316)||(3982087-3982272)
chr4 (83-332)||(18847376-18847627)
chr4 (74-332)||(15032401-15032660)
chr4 (67-332)||(16931631-16931899)
chr4 (85-332)||(22134476-22134727)
chr4 (67-330)||(28453906-28454167)
chr4 (67-188)||(47210637-47210754)
chr4 (67-188)||(5664605-5664722)
chr4 (156-305)||(16185770-16185920)
chr4 (67-332)||(22780212-22780483)
chr4 (67-332)||(22782577-22782848)
chr4 (67-332)||(44599680-44599948)
chr4 (83-332)||(18709021-18709274)
chr4 (85-332)||(22132248-22132502)
chr4 (67-330)||(9863931-9864196)
chr4 (67-332)||(16933988-16934253)
chr4 (240-332)||(13544181-13544272)
chr4 (230-332)||(47210762-47210863)
chr4 (153-332)||(47150826-47151005)
chr4 (217-316)||(26557823-26557922)
chr4 (153-306)||(22295412-22295565)
chr4 (131-305)||(10114565-10114737)
chr4 (67-165)||(38269995-38270088)
chr4 (257-316)||(31983564-31983623)
chr4 (272-313)||(54928700-54928741)
chr4 (83-316)||(10113108-10113334)
chr4 (257-317)||(9022543-9022602)
chr4 (83-209)||(52043428-52043550)
chr4 (67-130)||(18311215-18311278)
chr4 (261-316)||(40998990-40999045)
chr4 (175-316)||(3578632-3578766)
chr4 (220-270)||(5269234-5269284)
chr4 (287-332)||(3824636-3824681)
chr4 (220-269)||(5143263-5143312)
chr4 (287-332)||(5637531-5637576)
[»] chr7 (88 HSPs)
chr7 (67-332)||(44724757-44725022)
chr7 (67-332)||(13099317-13099587)
chr7 (66-332)||(42330845-42331108)
chr7 (67-332)||(31434892-31435158)
chr7 (67-332)||(443773-444044)
chr7 (67-332)||(22393900-22394161)
chr7 (67-332)||(27306076-27306341)
chr7 (67-332)||(24748772-24749035)
chr7 (66-332)||(21591988-21592254)
chr7 (67-332)||(48457831-48458100)
chr7 (67-332)||(20626216-20626481)
chr7 (67-332)||(20630107-20630372)
chr7 (67-332)||(20642526-20642791)
chr7 (67-332)||(4295781-4296045)
chr7 (100-317)||(21990343-21990563)
chr7 (76-332)||(9679237-9679495)
chr7 (67-331)||(21678245-21678506)
chr7 (67-332)||(42223336-42223600)
chr7 (67-332)||(38394164-38394434)
chr7 (173-332)||(20137061-20137220)
chr7 (67-332)||(7092054-7092323)
chr7 (67-332)||(7094301-7094571)
chr7 (66-332)||(21680205-21680473)
chr7 (87-332)||(37411988-37412238)
chr7 (88-332)||(9680998-9681243)
chr7 (66-332)||(43253357-43253628)
chr7 (66-332)||(44742-45013)
chr7 (67-332)||(7471821-7472091)
chr7 (67-332)||(20299638-20299908)
chr7 (67-332)||(27832488-27832744)
chr7 (102-332)||(39145865-39146098)
chr7 (67-332)||(20297540-20297810)
chr7 (67-332)||(28485744-28486013)
chr7 (67-332)||(11355436-11355705)
chr7 (68-332)||(28487731-28488000)
chr7 (83-332)||(26295625-26295868)
chr7 (67-255)||(26804764-26804955)
chr7 (73-332)||(3035902-3036166)
chr7 (67-332)||(40836583-40836853)
chr7 (67-332)||(1850159-1850429)
chr7 (103-332)||(18345719-18345955)
chr7 (67-332)||(7469864-7470133)
chr7 (67-317)||(24465730-24465975)
chr7 (67-267)||(11759369-11759575)
chr7 (67-332)||(40946506-40946777)
chr7 (84-332)||(35807-36059)
chr7 (83-317)||(7188732-7188961)
chr7 (67-332)||(3878755-3879027)
chr7 (69-332)||(38396813-38397084)
chr7 (67-332)||(25542707-25542976)
chr7 (88-240)||(22251452-22251605)
chr7 (67-332)||(24813348-24813610)
chr7 (66-332)||(2935447-2935717)
chr7 (196-332)||(24258641-24258781)
chr7 (67-331)||(9027034-9027303)
chr7 (67-332)||(1049129-1049406)
chr7 (67-331)||(1606559-1606827)
chr7 (154-332)||(6332398-6332574)
chr7 (67-332)||(1046757-1047035)
chr7 (67-332)||(7351491-7351762)
chr7 (179-316)||(11081703-11081842)
chr7 (67-332)||(24817203-24817465)
chr7 (175-332)||(25276319-25276465)
chr7 (67-331)||(22137257-22137527)
chr7 (67-331)||(40552284-40552554)
chr7 (129-313)||(16296934-16297115)
chr7 (205-331)||(22108246-22108370)
chr7 (205-331)||(40550006-40550130)
chr7 (205-332)||(31155896-31156021)
chr7 (114-210)||(6349097-6349191)
chr7 (257-332)||(20091584-20091656)
chr7 (260-332)||(22828672-22828744)
chr7 (67-332)||(7349117-7349383)
chr7 (67-137)||(1502816-1502883)
chr7 (232-332)||(6046672-6046772)
chr7 (200-330)||(13290454-13290583)
chr7 (261-316)||(22280379-22280434)
chr7 (205-330)||(6067183-6067309)
chr7 (271-332)||(6348960-6349021)
chr7 (67-156)||(40550189-40550277)
chr7 (67-142)||(20136991-20137066)
chr7 (155-305)||(40281316-40281468)
chr7 (214-290)||(2075226-2075303)
chr7 (220-269)||(9190052-9190101)
chr7 (287-332)||(11757408-11757453)
chr7 (220-264)||(12097867-12097911)
chr7 (104-198)||(20091041-20091132)
chr7 (279-332)||(22251604-22251661)
[»] chr1 (98 HSPs)
chr1 (67-332)||(47906438-47906704)
chr1 (72-332)||(11457327-11457588)
chr1 (67-332)||(4131221-4131493)
chr1 (67-332)||(16429125-16429387)
chr1 (67-332)||(17185979-17186241)
chr1 (67-332)||(31424862-31425128)
chr1 (73-332)||(25251127-25251388)
chr1 (67-332)||(18839755-18840022)
chr1 (67-332)||(14097815-14098083)
chr1 (67-317)||(2949079-2949329)
chr1 (67-332)||(17319055-17319321)
chr1 (83-332)||(9240951-9241199)
chr1 (66-332)||(40134112-40134379)
chr1 (67-317)||(6995540-6995798)
chr1 (67-317)||(18307292-18307543)
chr1 (67-333)||(39462686-39462956)
chr1 (73-332)||(17324484-17324749)
chr1 (66-332)||(15294677-15294947)
chr1 (67-332)||(13215249-13215518)
chr1 (67-317)||(28206912-28207164)
chr1 (67-332)||(31490081-31490345)
chr1 (67-332)||(50307389-50307659)
chr1 (65-317)||(12302347-12302603)
chr1 (67-332)||(23816054-23816323)
chr1 (67-332)||(25248398-25248665)
chr1 (104-332)||(6114989-6115216)
chr1 (112-332)||(16428821-16429040)
chr1 (67-332)||(38925328-38925591)
chr1 (131-332)||(50076583-50076785)
chr1 (67-332)||(51750207-51750476)
chr1 (83-332)||(27336801-27337052)
chr1 (65-332)||(50248415-50248685)
chr1 (67-332)||(41647088-41647355)
chr1 (83-332)||(27338992-27339243)
chr1 (67-332)||(10399669-10399941)
chr1 (83-332)||(15823714-15823967)
chr1 (67-332)||(31735365-31735634)
chr1 (81-332)||(2510200-2510438)
chr1 (151-332)||(6756694-6756877)
chr1 (66-328)||(15916562-15916822)
chr1 (67-332)||(2617684-2617955)
chr1 (67-332)||(28842663-28842931)
chr1 (75-333)||(16432561-16432813)
chr1 (67-332)||(13762005-13762275)
chr1 (90-332)||(17324231-17324484)
chr1 (66-330)||(39932243-39932515)
chr1 (102-332)||(25128040-25128273)
chr1 (67-317)||(28998094-28998351)
chr1 (67-317)||(29003810-29004067)
chr1 (67-285)||(13358787-13359011)
chr1 (67-332)||(46431548-46431820)
chr1 (103-332)||(28840848-28841083)
chr1 (67-246)||(13447117-13447301)
chr1 (67-332)||(14183455-14183705)
chr1 (67-332)||(20302627-20302879)
chr1 (191-332)||(50078793-50078934)
chr1 (67-332)||(31422706-31422986)
chr1 (73-332)||(18800429-18800686)
chr1 (67-332)||(20291625-20291894)
chr1 (67-332)||(30790250-30790514)
chr1 (67-201)||(50078635-50078769)
chr1 (67-317)||(47451825-47452065)
chr1 (191-332)||(3579589-3579729)
chr1 (66-332)||(9459276-9459529)
chr1 (66-332)||(9463103-9463356)
chr1 (67-196)||(3579431-3579558)
chr1 (67-332)||(24325831-24326101)
chr1 (67-332)||(51757699-51757973)
chr1 (143-330)||(49495137-49495322)
chr1 (67-332)||(13125310-13125571)
chr1 (67-332)||(51752532-51752805)
chr1 (67-332)||(23786008-23786278)
chr1 (207-332)||(6823182-6823306)
chr1 (104-332)||(8347161-8347386)
chr1 (73-332)||(15669252-15669507)
chr1 (67-332)||(16226336-16226607)
chr1 (174-332)||(42922398-42922557)
chr1 (67-332)||(8348905-8349165)
chr1 (76-332)||(16561635-16561885)
chr1 (66-332)||(16231732-16232003)
chr1 (81-188)||(25860268-25860369)
chr1 (63-187)||(30780361-30780486)
chr1 (104-313)||(13127576-13127782)
chr1 (175-332)||(26613194-26613353)
chr1 (156-316)||(27916681-27916840)
chr1 (67-332)||(47177531-47177801)
chr1 (67-332)||(47179882-47180152)
chr1 (257-332)||(21948227-21948301)
chr1 (200-332)||(30738609-30738743)
chr1 (257-330)||(155877-155949)
chr1 (272-329)||(43104332-43104389)
chr1 (273-332)||(48665346-48665404)
chr1 (214-305)||(21353342-21353434)
chr1 (66-311)||(28279455-28279696)
chr1 (161-212)||(26520061-26520114)
chr1 (220-264)||(4552637-4552681)
chr1 (272-308)||(8213579-8213615)
chr1 (220-264)||(31659362-31659406)
[»] chr5 (87 HSPs)
chr5 (67-332)||(18511056-18511323)
chr5 (67-332)||(2724061-2724328)
chr5 (83-332)||(40221690-40221946)
chr5 (66-332)||(658203-658464)
chr5 (67-332)||(36208744-36209007)
chr5 (66-332)||(39854651-39854922)
chr5 (67-332)||(1189454-1189720)
chr5 (67-332)||(36402170-36402439)
chr5 (67-332)||(696045-696310)
chr5 (67-317)||(41585580-41585840)
chr5 (67-332)||(6745236-6745507)
chr5 (68-317)||(6756675-6756926)
chr5 (67-317)||(18596828-18597079)
chr5 (73-308)||(21288953-21289187)
chr5 (100-332)||(10474200-10474434)
chr5 (75-317)||(2818186-2818431)
chr5 (67-332)||(25904271-25904536)
chr5 (107-316)||(18509201-18509413)
chr5 (71-332)||(21948194-21948464)
chr5 (106-332)||(26097900-26098127)
chr5 (82-332)||(17818351-17818601)
chr5 (67-332)||(16092045-16092311)
chr5 (73-331)||(2954586-2954843)
chr5 (67-332)||(20505687-20505952)
chr5 (67-332)||(24127024-24127291)
chr5 (67-332)||(37705626-37705891)
chr5 (67-312)||(26098129-26098380)
chr5 (66-332)||(38882274-38882526)
chr5 (67-332)||(17073051-17073321)
chr5 (67-317)||(31472458-31472709)
chr5 (67-332)||(6747473-6747743)
chr5 (67-332)||(25804193-25804463)
chr5 (73-332)||(25921321-25921584)
chr5 (67-331)||(31465833-31466089)
chr5 (67-332)||(34476894-34477163)
chr5 (102-283)||(20043206-20043390)
chr5 (67-332)||(34479259-34479528)
chr5 (68-332)||(6661038-6661297)
chr5 (67-332)||(4236797-4237065)
chr5 (67-332)||(10528937-10529210)
chr5 (67-332)||(10587000-10587252)
chr5 (67-332)||(18466852-18467123)
chr5 (83-332)||(16776326-16776577)
chr5 (73-332)||(27912704-27912969)
chr5 (66-332)||(21684293-21684562)
chr5 (66-314)||(20054021-20054267)
chr5 (67-332)||(39798215-39798468)
chr5 (67-332)||(2175087-2175341)
chr5 (67-332)||(4410191-4410458)
chr5 (67-332)||(27910618-27910872)
chr5 (67-329)||(18469182-18469448)
chr5 (134-332)||(39397916-39398104)
chr5 (66-331)||(38959971-38960241)
chr5 (67-332)||(10749869-10750137)
chr5 (87-306)||(12555779-12556008)
chr5 (67-332)||(10757345-10757613)
chr5 (67-332)||(9020386-9020649)
chr5 (67-201)||(34530559-34530692)
chr5 (67-332)||(3372977-3373247)
chr5 (83-330)||(15445135-15445376)
chr5 (102-198)||(20045290-20045386)
chr5 (67-332)||(31179213-31179481)
chr5 (85-295)||(31542939-31543153)
chr5 (160-330)||(4897899-4898068)
chr5 (205-331)||(15354560-15354684)
chr5 (67-332)||(15552414-15552685)
chr5 (205-331)||(23665213-23665337)
chr5 (205-331)||(23741844-23741968)
chr5 (205-331)||(23793250-23793374)
chr5 (152-332)||(15143634-15143817)
chr5 (205-331)||(15356836-15356960)
chr5 (252-332)||(17413198-17413278)
chr5 (205-332)||(31545249-31545374)
chr5 (155-305)||(2144504-2144647)
chr5 (175-316)||(35430365-35430506)
chr5 (287-332)||(42770978-42771023)
chr5 (66-156)||(23741696-23741785)
chr5 (67-156)||(15354414-15354502)
chr5 (67-156)||(15356690-15356778)
chr5 (67-156)||(23665396-23665484)
chr5 (67-156)||(23793103-23793191)
chr5 (279-332)||(34530724-34530777)
chr5 (272-330)||(20045210-20045268)
chr5 (85-188)||(31545404-31545502)
chr5 (105-212)||(42771064-42771167)
chr5 (220-269)||(10281755-10281804)
chr5 (220-265)||(31300644-31300689)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (66-332)||(19007784-19008052)
chr2 (65-332)||(28459036-28459301)
chr2 (115-332)||(22407346-22407565)
chr2 (66-332)||(14837411-14837680)
chr2 (67-332)||(43623423-43623691)
chr2 (67-332)||(6263993-6264260)
chr2 (73-332)||(6258668-6258928)
chr2 (63-332)||(17849261-17849532)
chr2 (67-332)||(28196781-28197045)
chr2 (67-332)||(22287181-22287447)
chr2 (66-310)||(22162868-22163111)
chr2 (88-332)||(42923373-42923620)
chr2 (67-330)||(21520534-21520802)
chr2 (67-332)||(22707595-22707864)
chr2 (102-332)||(5375224-5375457)
chr2 (86-285)||(3022362-3022562)
chr2 (103-332)||(17848585-17848814)
chr2 (69-332)||(45279844-45280095)
chr2 (106-332)||(31732666-31732888)
chr2 (70-332)||(27104942-27105209)
chr2 (73-332)||(23452084-23452348)
chr2 (138-332)||(44288982-44289179)
chr2 (67-333)||(11739421-11739672)
chr2 (67-332)||(45238842-45239088)
chr2 (139-332)||(40031968-40032169)
chr2 (66-332)||(23870960-23871230)
chr2 (102-332)||(7462824-7463059)
chr2 (67-332)||(19501843-19502122)
chr2 (88-332)||(34979456-34979690)
chr2 (67-332)||(22874274-22874519)
chr2 (87-332)||(13909907-13910155)
chr2 (158-332)||(18800251-18800425)
chr2 (67-332)||(19504178-19504457)
chr2 (102-332)||(11577991-11578220)
chr2 (66-332)||(24162062-24162333)
chr2 (87-244)||(15539396-15539553)
chr2 (104-332)||(17897134-17897357)
chr2 (103-332)||(42064659-42064878)
chr2 (205-332)||(42452925-42453050)
chr2 (67-332)||(36560981-36561251)
chr2 (67-332)||(36558721-36558974)
chr2 (83-198)||(38020360-38020473)
chr2 (153-316)||(20146540-20146704)
chr2 (83-332)||(35217827-35218073)
chr2 (154-332)||(40699518-40699697)
chr2 (67-265)||(20592288-20592484)
chr2 (67-158)||(42453802-42453890)
chr2 (67-332)||(45332020-45332291)
chr2 (83-332)||(35215450-35215696)
chr2 (67-332)||(37962791-37963050)
chr2 (183-312)||(35107458-35107590)
chr2 (272-332)||(20589835-20589895)
chr2 (112-196)||(38414071-38414155)
chr2 (175-301)||(17921871-17921996)
chr2 (272-330)||(15694050-15694108)
chr2 (257-305)||(33604092-33604140)
chr2 (208-306)||(39287262-39287361)
chr2 (291-332)||(27136195-27136236)
chr2 (217-332)||(13828338-13828454)
chr2 (220-264)||(17057369-17057413)
chr2 (220-264)||(17085352-17085396)
chr2 (214-305)||(17943631-17943723)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (67-332)||(14231-14493)
scaffold0131 (156-332)||(15196-15369)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (67-332)||(15072935-15073202)
chr8 (67-332)||(14419035-14419302)
chr8 (82-332)||(30480364-30480614)
chr8 (67-317)||(41382901-41383154)
chr8 (67-332)||(25952744-25953010)
chr8 (67-332)||(15068205-15068472)
chr8 (67-332)||(15956181-15956443)
chr8 (63-313)||(13858330-13858577)
chr8 (66-317)||(33541254-33541506)
chr8 (81-332)||(36865759-36866014)
chr8 (67-332)||(28251410-28251678)
chr8 (67-332)||(27106747-27107008)
chr8 (67-331)||(15185564-15185825)
chr8 (67-332)||(2467979-2468241)
chr8 (67-332)||(14807975-14808252)
chr8 (67-332)||(21482534-21482798)
chr8 (66-332)||(27829521-27829791)
chr8 (67-332)||(27827210-27827479)
chr8 (67-332)||(3874234-3874487)
chr8 (66-332)||(15809442-15809712)
chr8 (67-317)||(41384983-41385233)
chr8 (67-332)||(32339533-32339803)
chr8 (155-332)||(1225390-1225568)
chr8 (67-332)||(4424242-4424512)
chr8 (67-332)||(43530339-43530609)
chr8 (67-332)||(35872301-35872551)
chr8 (67-275)||(37214109-37214319)
chr8 (67-332)||(3005486-3005743)
chr8 (83-332)||(5372043-5372289)
chr8 (67-332)||(21480726-21480990)
chr8 (67-332)||(28283062-28283330)
chr8 (67-332)||(608958-609230)
chr8 (66-332)||(18813106-18813377)
chr8 (67-317)||(22684491-22684749)
chr8 (67-332)||(18810932-18811202)
chr8 (80-332)||(31162433-31162686)
chr8 (67-285)||(14477520-14477740)
chr8 (134-236)||(181798-181901)
chr8 (85-332)||(44721068-44721318)
chr8 (201-332)||(27911238-27911367)
chr8 (201-332)||(27957657-27957786)
chr8 (67-332)||(31035342-31035602)
chr8 (83-332)||(43082198-43082450)
chr8 (155-330)||(31578216-31578387)
chr8 (83-332)||(43079827-43080079)
chr8 (67-188)||(3883436-3883553)
chr8 (191-316)||(6376229-6376354)
chr8 (251-328)||(16833777-16833854)
chr8 (83-196)||(27911441-27911550)
chr8 (83-196)||(27957860-27957969)
chr8 (66-188)||(24873038-24873158)
chr8 (257-315)||(3896063-3896121)
chr8 (259-313)||(14419732-14419786)
chr8 (257-332)||(181726-181797)
chr8 (74-121)||(2467887-2467932)
chr8 (67-132)||(183246-183310)
chr8 (155-241)||(31566493-31566578)
chr8 (220-269)||(19752438-19752487)
chr8 (205-249)||(28228669-28228714)
chr8 (289-330)||(31573794-31573835)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (67-332)||(9020129-9020398)
chr6 (67-332)||(24338295-24338558)
chr6 (67-332)||(11982872-11983140)
chr6 (67-332)||(3629711-3629975)
chr6 (67-332)||(3631784-3632049)
chr6 (71-310)||(30728673-30728913)
chr6 (74-332)||(15346550-15346806)
chr6 (67-332)||(15367234-15367498)
chr6 (61-332)||(1069557-1069830)
chr6 (67-332)||(28241163-28241432)
chr6 (67-332)||(13057397-13057659)
chr6 (67-331)||(15540990-15541250)
chr6 (67-332)||(1230090-1230360)
chr6 (67-332)||(14507018-14507286)
chr6 (67-332)||(2628727-2628996)
chr6 (67-332)||(30967404-30967673)
chr6 (150-332)||(12186000-12186183)
chr6 (73-331)||(14466527-14466785)
chr6 (67-332)||(32280199-32280463)
chr6 (174-332)||(13039957-13040117)
chr6 (67-332)||(26065186-26065457)
chr6 (67-332)||(26085155-26085426)
chr6 (83-332)||(4816088-4816342)
chr6 (62-332)||(14458602-14458878)
chr6 (67-332)||(3233567-3233841)
chr6 (67-332)||(30034447-30034714)
chr6 (73-332)||(15719845-15720099)
chr6 (201-332)||(3390582-3390713)
chr6 (63-332)||(19704399-19704679)
chr6 (81-332)||(19696643-19696889)
chr6 (67-331)||(33309061-33309329)
chr6 (66-332)||(29754548-29754819)
chr6 (66-331)||(33311330-33311599)
chr6 (212-332)||(15532674-15532792)
chr6 (106-332)||(3027740-3027965)
chr6 (167-332)||(12161502-12161668)
chr6 (67-332)||(26068235-26068505)
chr6 (67-316)||(25465444-25465686)
chr6 (191-303)||(10584227-10584340)
chr6 (67-332)||(26065961-26066234)
chr6 (158-305)||(22857891-22858038)
chr6 (200-332)||(25477477-25477616)
chr6 (67-196)||(3394708-3394837)
chr6 (67-332)||(26932403-26932672)
chr6 (67-332)||(17012243-17012502)
chr6 (67-198)||(25480217-25480346)
chr6 (140-317)||(26945362-26945539)
chr6 (83-332)||(20915214-20915466)
chr6 (73-232)||(22490917-22491073)
chr6 (67-332)||(5273055-5273326)
chr6 (67-332)||(12195354-12195625)
chr6 (83-316)||(28078064-28078291)
chr6 (153-330)||(12937126-12937302)
chr6 (217-332)||(16455421-16455537)
chr6 (153-332)||(28037659-28037841)
chr6 (67-153)||(18322482-18322566)
chr6 (191-332)||(25078529-25078669)
chr6 (245-330)||(12911471-12911555)
chr6 (66-212)||(22610999-22611139)
chr6 (258-330)||(30445729-30445801)
chr6 (67-142)||(8717195-8717268)
chr6 (263-332)||(15530166-15530233)
chr6 (145-213)||(15530084-15530156)
chr6 (279-332)||(22490843-22490896)
chr6 (271-330)||(3833481-3833541)
chr6 (156-239)||(17904287-17904368)
chr6 (259-330)||(20527011-20527081)
chr6 (174-290)||(30443532-30443652)
chr6 (200-316)||(11262678-11262793)
chr6 (220-269)||(31936591-31936640)
chr6 (67-149)||(6610362-6610440)
chr6 (67-121)||(13040179-13040232)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (69-332)||(85407-85671)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (67-332)||(79362-79631)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (66-332)||(183481-183752)
scaffold0005 (67-317)||(52203-52456)
scaffold0005 (67-285)||(50235-50457)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (102-332)||(4173-4403)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (67-332)||(41325-41594)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (67-317)||(80051-80305)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (68-332)||(11315-11584)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (66-332)||(69132-69402)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (69-285)||(35817-36037)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (67-332)||(1493-1754)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (83-332)||(1310-1563)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (66-332)||(29348-29617)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (67-332)||(16501-16762)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (73-254)||(1298-1485)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (67-332)||(6377-6646)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (73-332)||(3057-3319)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (174-332)||(15774-15933)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (67-332)||(219-473)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (67-188)||(12715-12832)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (205-331)||(22294-22418)
scaffold0140 (205-331)||(24569-24693)
scaffold0140 (67-156)||(24751-24839)
scaffold0140 (67-142)||(22491-22564)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (83-270)||(4535-4729)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (158-331)||(57367-57539)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (257-332)||(2218-2292)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (67-121)||(16605-16656)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1313822 - 1313557
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1313822 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 1313725  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1313724 aacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 1313625  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1313624 agcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 1313557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 43421260 - 43421524
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43421260 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aagttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 43421357  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43421358 acacaagccaaaagtataaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 43421457  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43421458 gcagccatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 43421524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 43423308 - 43423572
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43423308 tgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataaca--aagttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 43423405  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43423406 acacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagaga 43423505  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  43423506 gcagctctcagtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 43423572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 53917506 - 53917773
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  53917506 tgttgcgaaatcgatgaaaaatcacactaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 53917603  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  53917604 acacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggag 53917703  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53917704 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53917773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3315100 - 3314832
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3315100 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaattata 3315003  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  3315002 aacacaagccaaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggag 3314903  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3314902 agagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3314832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 880313 - 880560
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  880313 aaaatcacacccataaca--aacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaaaccaaaagtag 880410  T
Q  183 aaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  880411 aaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttac 880510  T
Q  282 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  880511 tata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 880560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 53915337 - 53915605
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  53915337 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaccaagtgtatgaaacaattata 53915434  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    | ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  53915435 aacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctggggga 53915534  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53915535 gagagcagccctccgtttcacta-aatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53915605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 27635497 - 27635752
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27635497 tgttgcaaattcgatgagaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 27635594  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27635595 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 27635694  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27635695 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 27635752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45883357 - 45883087
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45883357 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 45883260  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagg 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  45883259 tcacaagccagaagtagaaaacagcaagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 45883160  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  45883159 gagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 45883087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 4308122 - 4308390
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4308122 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 4308218  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  4308219 atcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 4308318  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4308319 agagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4308390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6484756 - 6484508
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    |||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  6484756 aaaatcacactaataaca--aatttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagta 6484659  T
Q  182 gaaaacagcgagaga-aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 280  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6484658 gaaaacagcgagagagaataagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttca 6484559  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  6484558 ctata-tgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaagaataa 6484508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36012243 - 36011975
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012243 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 36012146  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
     ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  36012145 acacaagcgaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaa 36012046  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36012045 gagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 36011975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 1626525 - 1626792
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgat--gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1626525 tgttgcgaattccataagaaaaccacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattata 1626622  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||| |||||||  |||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  1626623 aacacaagtcaaaagtgaaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgag 1626722  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1626723 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1626792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 51674608 - 51674875
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||    
T  51674608 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaacaagtgggtatggaacaaatata 51674705  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51674706 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggag 51674805  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51674806 agagcagccctccatttcagtata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 51674875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17795670 - 17795406
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  17795670 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttata 17795575  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  17795574 atcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggaga 17795476  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17795475 gagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17795406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19104110 - 19103846
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  19104110 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttata 19104015  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  19104014 atcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggaga 19103916  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19103915 gagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 19103846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41849470 - 41849243
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  41849470 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaa 41849376  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga----aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41849375 tacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 41849276  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 296  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41849275 gagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42990717 - 42990452
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  42990717 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgtaa--gttataaa 42990622  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42990621 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 42990522  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  42990521 agagcagccctccgattcaccata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42990452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 102 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51943753 - 51943540
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 197  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  51943753 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtttggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 51943654  T
Q  198 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 295  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51943653 agagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagta 51943555  T
Q  296 actttacaaaagaga 310  Q
    || ||||||||||||    
T  51943554 acgttacaaaagaga 51943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3307177 - 3306909
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  3307177 ctgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca-aaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaattat 3307079  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcga--gagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  3307078 aaacacaagccaaaagtagaaaacagcgaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtcta--gga 3306981  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3306980 gagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3306909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 9604446 - 9604716
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  9604446 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaccaaagtgtatgaaacaattata 9604542  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa----gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag 257  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  9604543 atcacaggccaaaaatagaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctggg 9604642  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9604643 ggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 18096740 - 18097009
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18096740 tgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattata 18096837  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    | |||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  18096838 aacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctagggg 18096937  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||||    
T  18096938 agagagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataa 18097009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 309
Target Start/End: Original strand, 12267818 - 12268061
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  || ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12267818 ctgttgtgaactcgatgaaaaattacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 12267915  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga--gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  12267916 aacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggaga 12268015  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag 309  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12268016 gagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagag 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1321897 - 1321627
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1321897 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 1321801  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  1321800 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 1321702  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1321701 gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1321627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32219503 - 32219232
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32219503 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacacaaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattat 32219406  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |     
T  32219405 aaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctggga 32219306  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  32219305 gagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataa 32219232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43226495 - 43226233
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  43226495 tgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaa-gtgtatggaacaattaaaa 43226400  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaa--acagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  43226399 t-acaagccaaaagtagaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 43226303  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43226302 agagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43226233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43228696 - 43228439
Alignment:
Q  76 ttcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcc 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  43228696 ttcgatgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaaat-acaagcc 43228601  T
Q  175 aaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    |||| |||||||||   ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43228600 aaaattagaaaacaacagcgagagtaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 43228501  T
Q  270 cttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43228500 cctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43228439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 32263880 - 32264148
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||  || ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32263880 ctgttgtgaattcgaagaaaaatcacactaataaca--aatttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 32263977  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  32263978 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaa-ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggag 32264076  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32264077 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32264148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 18099010 - 18099279
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||    
T  18099010 tgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaattgta 18099107  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    | |||||||||||||||||||||| |     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  18099108 aacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagagaaagaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctagggg 18099207  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18099208 agagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6232208 - 6231948
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||| ||    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  6232208 tgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataaca--aatttgatgtgtggagtaa----taatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaa 6232115  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||| |    
T  6232114 cacaagtcaaaaataaaaaacagcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagaca 6232015  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6232014 gcagccctccg-ttcactgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6231948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24980127 - 24979855
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24980127 ctgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattat 24980030  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag 257  Q
    || ||||||||||||||||||    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |    
T  24980029 aaacacaagccaaaagtagaaaaacaacaacgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggg 24979930  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  24979929 ggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaataa 24979855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 27101028 - 27101290
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcaca 170  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27101028 gaattcgatgaaaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcaca 27101124  T
Q  171 agccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    ||| ||||||||||||||   || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  27101125 agcaaaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagag 27101224  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27101225 cagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 27101290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 332
Target Start/End: Original strand, 47701522 - 47701780
Alignment:
Q  69 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatc 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||   | ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |    
T  47701522 ttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtg---atcaagtaataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattatgaac 47701616  T
Q  168 acaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 267  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  47701617 acaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaggaaagagaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagca 47701716  T
Q  268 gccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47701717 gccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 47701780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4666911 - 4666664
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||     
T  4666911 aaaatcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaaaacaaaccaaaagtat 4666814  T
Q  183 aaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 279  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  4666813 aaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttc 4666717  T
Q  280 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4666716 actataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 4666664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 53468295 - 53468565
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||   ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53468295 tgttgcaaattcgatgagaaaaccacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattata 53468392  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt--ctgaggg 259  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||    
T  53468393 aacacaagtcaaaagtagaaaatagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggg 53468492  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53468493 gtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53468565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 10955867 - 10956136
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10955867 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 10955962  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  10955963 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 10956061  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  10956062 tggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 10956136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 51726847 - 51727116
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  51726847 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggggcaaga-ataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aa 51726941  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51726942 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctg 51727040  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51727041 ggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51727116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 10958163 - 10958432
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  10958163 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat 10958258  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  10958259 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 10958357  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  10958358 gggagagagcagccctccgttccactata-tgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 10958432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18163074 - 18162811
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcaca 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18163074 gaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacaca 18162977  T
Q  171 agccaaaagtagaaaac---agcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18162976 agccaaaagtagaaaactgcagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagag 18162878  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  18162877 cagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataa 18162811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 25687997 - 25688270
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagtt 161  Q
    ||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25687997 ctgttgcaaattcgatgagaaaactcacaccaataaca--aactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 25688094  T
Q  162 ataatcacaagccaaaagtagaaaacagc---gagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  25688095 gtaaacacaagccaaaagtagaaaacatcaacgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 25688194  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25688195 gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25688270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11168519 - 11168249
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  11168519 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aa 11168424  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  11168423 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctg 11168325  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11168324 ggggagagagcagccctccgttccaatata-tgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11168249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23633862 - 23633602
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||   | ||| ||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  23633862 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa---atactagatgtgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat--ttataa 23633768  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  23633767 acacaagccacaagtagaaaacatcgagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctg-gggagaga 23633669  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  23633668 gcagccctccttttcactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcatcgggttacaagaataa 23633602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5900091 - 5899820
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5900091 tgttgcgaattcgacgagaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttat 5899996  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |          ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5899995 aatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 5899896  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5899895 gggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttgc-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5899820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 10084228 - 10084498
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  10084228 ctgttgcgaatccgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aa 10084323  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  10084324 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctt 10084422  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  10084423 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataa 10084498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15781294 - 15781019
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15781294 ctgttgtgaattcgatggaaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaataaagtgtatggaacagttata 15781197  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  15781196 aacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggag 15781097  T
Q  262 agagca---gccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag----atatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||   ||| | |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||    |||||||| | ||||||||||||    
T  15781096 agagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatatatcaatgggttacaagaataa 15781019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25533842 - 25533590
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25533842 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagata-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 25533748  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  25533747 t-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagag 25533656  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25533655 cagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25533590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 28101848 - 28102111
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||| |    
T  28101848 tgttgtgaattcgatgaaaaattacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattaaa 28101943  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  |||||    
T  28101944 --cacaacccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggag 28102041  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28102042 agagcagccatccgttccactata-tgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28102111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 47148744 - 47149004
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||       |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47148744 ctgttgtgaatttgatgaaaactcacaccaataaca--aacttgatgtgtgg-------gataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 47148834  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||    
T  47148835 aacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggag 47148934  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47148935 agagcagtcctctgtttcactata-tgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 47149004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5886618 - 5886347
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5886618 tgttgcgaattcgacgagaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttat 5886523  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga---------gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5886522 aatcacaagccaaaagtagaaaacaacaacagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 5886423  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| || | ||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  5886422 gggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtttc-aaagacaaatcaatgggttacaagaataa 5886347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 28761287 - 28761538
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||    
T  28761287 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaataaagtgtatggaaa--ttataa 28761382  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||           ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  28761383 tcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaa-----------acaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagaga 28761470  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28761471 gcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28761538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 317
Target Start/End: Original strand, 48361572 - 48361765
Alignment:
Q  129 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  48361572 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttg 48361671  T
Q  223 ttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  48361672 ttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactata-ttatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 48361765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 53591597 - 53591332
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||  || ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53591597 tgttgtgaattcaatgagaaaacacatcaataaca--aatttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattataa 53591500  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagaga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  53591499 acataagtcaaaagcagaaaacagcgagagaaaagaagagagaatacaaaaaaaaaattgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctg-gggaga 53591401  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53591400 gagcatcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggattagaagaataa 53591332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 5522466 - 5522735
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||    
T  5522466 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtaagaaa--gttataa 5522560  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5522561 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 5522660  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5522661 cgggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5522735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 5926615 - 5926873
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||| || |||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  5926615 gaattcgatgaaaactcacaccaataaca--aacttcatgtgtgaagtaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaa 5926712  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcag 268  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5926713 gc-aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaaagagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcag 5926810  T
Q  269 ccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  5926811 tcatccgtttcattata-tgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaagaataa 5926873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5192066 - 5191803
Alignment:
Q  69 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  5192066 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-a 5191972  T
Q  169 caagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5191971 caagccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gg 5191873  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  5191872 gagagaacagccctctgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat 5191803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25634294 - 25634035
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| || || ||||||||  ||| |||||||||||| ||||   ||  | |||| ||||||     
T  25634294 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataa---atacttaatgtggggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacaattataaa 25634201  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||    
T  25634200 cacaagc-aaaagtagaaaacaacaagagtaagaaaggagagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagaga 25634103  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25634102 gcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 25634035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 10191151 - 10191419
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  10191151 ctgttgcgaatctgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aa 10191246  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  10191247 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacac--aataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctt 10191343  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||  | ||||||||||||    
T  10191344 agggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataa 10191419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 332
Target Start/End: Original strand, 54691460 - 54691683
Alignment:
Q  112 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagaga 207  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| |    
T  54691460 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaaccgagagagaaaggaagagaaa 54691559  T
Q  208 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 307  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  54691560 acataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactata-tgatgggtaacgttacaaaag 54691658  T
Q  308 agatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||  | |||||||||||    
T  54691659 agatatcaatgaaatacaagaataa 54691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Original strand, 880087 - 880251
Alignment:
Q  70 tgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatc 167  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  880087 tgcgaattcgatgaaaaagtcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaacaaagtgtatgaaacagttataatc 880184  T
Q  168 acaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880185 acaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38890441 - 38890188
Alignment:
Q  84 aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  38890441 aaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtag 38890347  T
Q  183 aaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |    
T  38890346 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccct 38890247  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38890246 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38890188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31151754 - 31151508
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31151754 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa---atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 31151660  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggaga 262  Q
     ||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  31151659 acacaagt-aagagtagaaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggaga 31151561  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 315  Q
    |||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  31151560 gagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca 31151508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 4103736 - 4104004
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||     
T  4103736 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgcgtggagcaag-gatagtcaaacaaccgaaaaaaagtgtatggaa--gttataaa 4103830  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||| | |||||||| ||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  4103831 tacatgtcaaaagtaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 4103930  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4103931 gggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4104004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28181400 - 28181242
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28181400 aaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaag-gacaatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 28181304  T
Q  183 aaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 241  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181303 aaaacagcgacagagaaaagaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39715809 - 39715617
Alignment:
Q  139 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga--gagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 234  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39715809 aaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttt 39715710  T
Q  235 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| ||| || || |  ||| ||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  39715709 ggtccaaaatgatctagtat--gggggagagcaaccatctgtttcacta---tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 39715617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 22114143 - 22114414
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  22114143 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaatagc---aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataa 22114237  T
Q  166 tcacaagccaaaagtag----aaaacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
      |||||||||||||||    ||||| |||||      | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || |    
T  22114238 atacaagccaaaagtagaaaaaaaacggcgagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgttt 22114337  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||| || || |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22114338 gggggagagatcatccctccgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22114414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 305
Target Start/End: Original strand, 7606443 - 7606670
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  7606443 tgttgcaaattcgatgaaaaatacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aa 7606538  T
Q  166 tcacaagccaaaa-gtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    | ||| ||||||| |||||||||| |   ||  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7606539 t-acaggccaaaaagtagaaaacaac---agcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7606630  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  7606631 gcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaa 7606670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 332
Target Start/End: Original strand, 561633 - 561886
Alignment:
Q  76 ttcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  561633 ttcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-a 561726  T
Q  176 aaagtagaaaacagcgagagaa-agaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg-agggagagagcagcct 271  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||   | |||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||     
T  561727 aaagtagaaaacatcgagagaagagaaagagagaacacgtga-aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagccc 561825  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  561826 ttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaagaataa 561886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25389326 - 25389055
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  25389326 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcataccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-a 25389231  T
Q  165 atcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag-------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 252  Q
    || ||||||||||| ||||||||||   ||||||        |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25389230 at-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaatacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 25389132  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    ||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25389131 ctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 25389055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720711
Alignment:
Q  106 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa------- 197  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||           
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaagaacgacgagaagaacaca 26720831  T
Q  198 -agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 295  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  26720830 aagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactata-tgatgagta 26720732  T
Q  296 actttacaaaagagatatcaa 316  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  26720731 tcgttacaaaagagaaatcaa 26720711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42992606 - 42992418
Alignment:
Q  146 agtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 240  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42992606 agtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtcca 42992509  T
Q  241 aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  42992508 aattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactata-tgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42992418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3859930 - 3859676
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgat-gaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  3859930 tgttgtgaattcgatcgaaaagtcacaccaataaca---acttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaa 3859834  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3859833 at-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3859742  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| | || | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  3859741 gcagccctacgatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgtgttacaagaataa 3859676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30006137 - 30005989
Alignment:
Q  185 aacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 282  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  30006137 aacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccact 30006038  T
Q  283 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  30006037 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 30005989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 747177 - 746906
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  747177 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttata 747083  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  747082 aatacaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 746983  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  746982 tgggggagagagcagtcctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 746906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 458702 - 458433
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||     
T  458702 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaa 458608  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  458607 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctg 458508  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  458507 ggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 458433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170552
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaa 11170580  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11170579 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 11170552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25635788 - 25635529
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||   | ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||   ||  | |||||||||||     
T  25635788 tgttgtgaattcgatgaaaatcacactaataa---atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataaa 25635695  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag--agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||  | |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||    
T  25635694 cacaagc-aaaagtagaaaacaacgagtgaaagaaagaagagaacacacga-aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagaga 25635597  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25635596 gcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaataa 25635529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 456325 - 456056
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||     
T  456325 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaa 456231  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||    
T  456230 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctg 456131  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  456130 ggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 456056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50494417 - 50494148
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  50494417 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aa 50494322  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  50494321 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 50494223  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  50494222 ggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 50494148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 270
Target Start/End: Original strand, 53893900 - 53894105
Alignment:
Q  74 aattcgat-gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaag 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||   |||    
T  53893900 aattcgatcgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aatacaaag 53893995  T
Q  173 ccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    ||||||||||||    ||| |||||      | ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53893996 ccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 53894095  T
Q  261 gagagcagcc 270  Q
    ||||||||||    
T  53894096 gagagcagcc 53894105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Original strand, 8183035 - 8183154
Alignment:
Q  124 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttg 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8183035 gatagtcaagcaaccaaaataaggtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaactgcaagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttg 8183134  T
Q  223 ttgacctagttcggtccaaa 242  Q
    |||||| | ||||| |||||    
T  8183135 ttgacccaattcggcccaaa 8183154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Original strand, 36871185 - 36871384
Alignment:
Q  104 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aa 201  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||   ||    
T  36871185 acttgatgtgtggagcaaga-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagcaaaagatagaaaacagcgagagaaaataaa 36871280  T
Q  202 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 300  Q
    |||||||||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  36871281 gagagaacacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaacttt 36871379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 10621366 - 10621638
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||  | ||||||    
T  10621366 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatg--aaagttat 10621460  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 252  Q
    ||  |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||    
T  10621461 aaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagt 10621560  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10621561 ctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10621638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 332
Target Start/End: Original strand, 889781 - 889882
Alignment:
Q  230 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 329  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  889781 agttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaa 889879  T
Q  330 taa 332  Q
    |||    
T  889880 taa 889882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42992799 - 42992610
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  42992799 tgttgtgaattcgatgaaaatcacactaataaca--aacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaa 42992704  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga--gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     | | | |||||| ||||||||   ||||||   |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  42992703 tatatgtcaaaagcagaaaacaatggcgagaagaaaaggagagagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 42992610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 6065633 - 6065904
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  6065633 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttata 6065727  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaa-gag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||||||   |||||      | |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||    
T  6065728 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtc 6065827  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |  |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6065828 taggggagagagcagccatccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6065904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919178
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 35919178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 53597644 - 53597384
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||| |  || |||||||||||| | ||| |||   |||| | ||||||    
T  53597644 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaata--ctttatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaagaattataa 53597552  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggaga 262  Q
     ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  | |||| | | ||| | |||||||||| | |||||| || || ||||||    
T  53597551 acacaagcaaaaa-tagaaaacaacgagagaaagaaaggagagaacacacga-aattagcttacccaattcggtccaatactgacctagtttgtgggaga 53597454  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  53597453 gagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataa 53597384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 329
Target Start/End: Original strand, 1620329 - 1620567
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1620329 aaaatcacaccaataa---aaacttgatatgtggagaaaat--taatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtag 1620419  T
Q  183 aaaacagcgagagaaa-gaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 279  Q
    |||||  ||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |    
T  1620420 aaaaccacgagataaaagaatgagagaacacacaa-agtttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttcc 1620518  T
Q  280 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 329  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  1620519 actataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaagggttacaagaa 1620567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 28412870 - 28413140
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  28412870 tgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaacaa-gtgtatgaaa--gttataa 28412963  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
      ||||| |||||||||||||||   ||||||       ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||    
T  28412964 atacaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtc 28413063  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28413064 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28413140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 6063283 - 6063554
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||    
T  6063283 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccgataaca---acttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaa--gttata 6063377  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaa-gag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||||||   |||||      | |||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  6063378 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtc 6063477  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6063478 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6063554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11170788 - 11170671
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||    
T  11170788 tgttgcgaattcgatgaaaatcacattaataac---aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataatta-aa 11170693  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca 188  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  11170692 t-acaagccaaaagtagaaaaca 11170671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24181660 - 24181528
Alignment:
Q  200 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 298  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24181660 aagagagaacacacga-aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaact 24181562  T
Q  299 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  24181561 ttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaataa 24181528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38210789 - 38210580
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  38210789 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaacaaagcgtatggaataatta-aa 38210694  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||      | |||||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || |    
T  38210693 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtat 38210595  T
Q  255 gagggagagagcagc 269  Q
    | |||||||||||||    
T  38210594 gggggagagagcagc 38210580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 332
Target Start/End: Original strand, 35917952 - 35918052
Alignment:
Q  230 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 329  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  35917952 agttcggtctaaattgaccag-tctgagggagagagcagctctccgttccactata-taatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 35918049  T
Q  330 taa 332  Q
    |||    
T  35918050 taa 35918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884308
Alignment:
Q  267 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 326  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa 54884308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956834
Alignment:
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 29956834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Original strand, 13420222 - 13420295
Alignment:
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||  |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  13420222 gagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 13420295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 330
Target Start/End: Original strand, 14634393 - 14634549
Alignment:
Q  175 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||| ||||||||||||| || | | |||| |||||  |  ||||  |||| |    
T  14634393 aaaagtagaaaat-gcgagagaaagaaagagagaaaatacgaaaatttgtttacctagttcggtctaatactaacctagtctgctgatgagattagccat 14634491  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14634492 ccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaat 14634549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561958
Alignment:
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataa 6561958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27420973 - 27420822
Alignment:
Q  155 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtc 253  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |     
T  27420973 aacaattataaacacaagc-aaaagtataaaacaatgagaaaaaga-gagagaacacatg-gaatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctacta 27420877  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 308  Q
    || ||||||||||| |  |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27420876 tgggggagagagcaactctatgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 27420822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28181230 - 28181185
Alignment:
Q  236 gtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 282  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181230 gtccaaattgacctagtct-agggagagagcagccttccgtttcact 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26763313 - 26763205
Alignment:
Q  129 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 228  Q
    |||||||||||||||||  || |||  ||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||  |||    
T  26763313 tcaagcaaccaaaacaatatggatg--acacttataaacataagcaaaaaatagaaaacagcgagagaaag-agagagaacacacaa-aatttgtctacc 26763218  T
Q  229 tagttcggtccaa 241  Q
     |||||| |||||    
T  26763217 cagttcgatccaa 26763205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1674292 - 1674166
Alignment:
Q  153 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 249  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||    
T  1674292 ggaacaattataaacacaagaaaaaattagaaaacatcgagagaaaagaaagagagaatacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaatactgacct 1674194  T
Q  250 ggtctgagggagagagcagccttccgtt 277  Q
     |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1674193 agtctggtggagagagcagccatccgtt 1674166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007617
Alignment:
Q  244 tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaa 11007617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36957713 - 36957651
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc 138  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36957713 gaattcgatgaaaatcatatcaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacc 36957651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236249
Alignment:
Q  214 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 30236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264403
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 16264403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795834
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 25795834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143374
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 32143374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24181750 - 24181669
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtg 149  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||| ||   ||| |||||||||||||| ||||||    
T  24181750 ctgttgtgaattcgaagaaaatcacactaataaaat--acttgatgtgtggagaaattaataatcaagcaaccaaaataaagtg 24181669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 107)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 38928024 - 38928288
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928024 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 38928121  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga-gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38928122 tcacaagccaaaagtagaaaacaacgagataaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 38928221  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  38928222 gcagccctccgttttactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 38928288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 33415334 - 33415599
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  33415334 tgttgcgaatccgatgagaaatcacacaaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaattata 33415431  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33415432 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagag 33415531  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33415532 agcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 33415599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 332
Target Start/End: Original strand, 22800703 - 22800973
Alignment:
Q  65 cctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22800703 cctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattat 22800800  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaa---acagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22800801 aaacacaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 22800900  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22800901 gagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22800973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16453796 - 16453531
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16453796 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgaaacagttataa 16453699  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16453698 tcacaagccaaaagtagaaaacagtgagagaaaagaagagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 16453599  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16453598 gcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16453531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 17662091 - 17662356
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17662091 ctgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaccaaagtgtatggaacaattataa 17662187  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17662188 tcacatgccaaaagtagaaaacaacagcgagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 17662287  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  17662288 gagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 17662356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 36921338 - 36921604
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  36921338 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataa 36921435  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  36921436 acacaagccaaaagtagaaaacagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggaga 36921535  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36921536 gagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 36921604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 40091259 - 40091526
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  40091259 tgttgcgaattcgatgaaaaattcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaataattata 40091356  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  40091357 aacacaagccaaaagtagaaaatagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag 40091456  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40091457 agagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 40091526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 22802577 - 22802845
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22802577 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 22802674  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22802675 acacaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagatagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctggggga 22802774  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22802775 gagagaaaccctccgttccactata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22802845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Original strand, 36919432 - 36919695
Alignment:
Q  70 tgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  36919432 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaaca 36919529  T
Q  169 caagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  36919530 caagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagag 36919629  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| ||  || ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36919630 cagccatctattccactata-tgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 36919695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4215792 - 4215528
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||   ||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  4215792 tgttgcgaattcgatgagaaaactcacacaaataaca---acttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatgaaacaattat 4215696  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4215695 aatcacaagccaaaagtagaaaactgcgagagaaaagaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 4215596  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4215595 agcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 4215528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36378777 - 36378514
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  36378777 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaacaattataaa 36378681  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    ||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36378680 cacaaacgaaaagtagaaaacagcaggagaaaagaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 36378581  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  36378580 cagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaataa 36378514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40637568 - 40637296
Alignment:
Q  65 cctgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagt 160  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  40637568 cctgttgcgaattcgttgagaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaat 40637472  T
Q  161 tataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40637471 tataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 40637372  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  40637371 ggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 40637296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24889286 - 24889018
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24889286 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 24889190  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24889189 atcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggg 24889090  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  24889089 agagagcagccctccgttccactata-tgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacatgaataa 24889018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2891780 - 2891516
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2891780 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataa 2891683  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| ||||||    
T  2891682 acacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggaga 2891583  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 329  Q
    |||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2891582 gagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 2891516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47563231 - 47563009
Alignment:
Q  82 gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  47563231 gaaaaccacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacataagccaaaagta 47563134  T
Q  182 gaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||    
T  47563133 gaaaacagcgagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttca 47563034  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttacaaaa 306  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||    
T  47563033 ctata-agatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14633811 - 14633540
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  14633811 ctgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-a 14633716  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14633715 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 14633617  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14633616 gagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14633540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 5635317 - 5635587
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5635317 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 5635412  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5635413 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 5635511  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5635512 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5635587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 37312924 - 37313177
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37312924 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 37313021  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  37313022 tcataagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-----------acaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagag 37313110  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  37313111 cagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 37313177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47275178 - 47274948
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 200  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  47275178 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 47275079  T
Q  201 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47275078 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 47274981  T
Q  300 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47274980 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 47274948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 14787274 - 14787527
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14787274 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 14787371  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-- 258  Q
     |||||||||||||||||||||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||      
T  14787372 acacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggga 14787469  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14787470 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 14787527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16455715 - 16455463
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455715 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 16455618  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||             ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16455617 atcataagctaaaactagaaaacagcgagaga-------------acacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 16455531  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16455530 gcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 16455463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 129 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24879419 - 24879211
Alignment:
Q  129 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  24879419 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaatttgt 24879320  T
Q  224 tgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgatt 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||    
T  24879319 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatgggtt 24879221  T
Q  323 acaagaataa 332  Q
    ||||||||||    
T  24879220 acaagaataa 24879211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5101404 - 5101151
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5101404 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 5101307  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
     ||||||||||| | |||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  5101306 acacaagccaaagggagaaaacaccgagaga---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagatag 5101217  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  5101216 cagccctccgttttactata-tgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggttacaagaataa 5101151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 8631260 - 8631530
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8631260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 8631355  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     |||||||||||||||||||    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8631356 -acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 8631454  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8631455 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 8631530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 37089211 - 37089482
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37089211 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-a 37089307  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37089308 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 37089406  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  37089407 gggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 37089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 12395712 - 12395956
Alignment:
Q  88 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 187  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  12395712 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagac 12395809  T
Q  188 agcgaga--gaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 284  Q
    | |||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12395810 aacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactat 12395909  T
Q  285 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12395910 a-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataa 12395956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 12400674 - 12400918
Alignment:
Q  88 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 187  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  12400674 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagac 12400771  T
Q  188 agcgaga--gaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 284  Q
    | |||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12400772 aacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactat 12400871  T
Q  285 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12400872 a-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataa 12400918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 332
Target Start/End: Original strand, 31849437 - 31849709
Alignment:
Q  64 tcctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31849437 tcctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta- 31849532  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 252  Q
    ||| |||||||||||||||||    ||| |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  31849533 aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagt 31849631  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  31849632 ctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 31849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24348692 - 24348440
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  24348692 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaacta-aat 24348597  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagc 266  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24348596 -acaagccaaaaatagaaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagc 24348505  T
Q  267 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  24348504 agccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24348440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36380827 - 36380571
Alignment:
Q  74 aattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||| |||  ||  |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  36380827 aattcgatgaaaatcacaccaataaaatat--ttgatgtgtggagtaagtaatgatcaagcaatcaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaagc 36380731  T
Q  174 caaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |    
T  36380730 caaaagtagaaaacagaaggagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcact 36380631  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  36380630 cagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 36380571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13547621 - 13547376
Alignment:
Q  88 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 186  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13547621 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 13547524  T
Q  187 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 283  Q
     | ||||||| |   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13547523 gatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcacta 13547424  T
Q  284 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  13547423 ta-tgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 13547376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24880883 - 24880673
Alignment:
Q  129 tcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaattt 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24880883 tcaagcaaccaaaacacaaagtgtacggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaattt 24880784  T
Q  222 gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattga 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  24880783 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatggg 24880685  T
Q  321 ttacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||    
T  24880684 ttacaagaataa 24880673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48486803 - 48486541
Alignment:
Q  73 gaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||  ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  48486803 gaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aatttgatgcgtggaacaagcgataatcaagcaactaaaacaaagtgaatggaacaattataaacacaa 48486706  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagc 266  Q
    ||||||||||||||||| |     |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48486705 gccaaaagtagaaaacaacatcaagagaaaaggaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagc 48486606  T
Q  267 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  48486605 agccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgtgttacaagaataa 48486541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 18409192 - 18409458
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18409192 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttata 18409287  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaa----gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | | || | ||||     |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  18409288 atcacaagacaaaagtagaaaatagcgagagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacacgaaatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgaggga 18409387  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18409388 gagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18409458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Original strand, 14789273 - 14789495
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14789273 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 14789370  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-- 258  Q
     |||||||||||||||||||||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  14789371 acacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 14789468  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactata 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14789469 gagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19096370 - 19096107
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||  | |||||||||||    
T  19096370 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacactaataa--taaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataa 19096276  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  19096275 tcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaataaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggg 19096177  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19096176 agagagcagctctccgtttcactata-tgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 19096107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 26085818 - 26086087
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||    
T  26085818 tgttgcgaattcgatgagaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataa 26085912  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   |||||| |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26085913 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctg 26086012  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  26086013 agggagagagcagccttccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaaacaatgggttacaagaataa 26086087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 2484714 - 2484983
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  2484714 ctgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aa 2484809  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  2484810 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctg 2484908  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2484909 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2484983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19323177 - 19322915
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||     
T  19323177 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaataaagtgtatggaa--gttataaa 19323082  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  19323081 cacgagc-aaaagtataaaacacctggagaaagaaagagagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaga 19322983  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19322982 gcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 19322915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 22046544 - 22046796
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||    
T  22046544 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtag 22046638  T
Q  183 aaaacagcga-gagaa--------agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    |||||| ||| |||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22046639 aaaacaacgacgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 22046738  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22046739 ccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22046796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7941817 - 7941545
Alignment:
Q  64 tcctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  7941817 tcctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaacaaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatga- 7941722  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||       |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7941721 aat-acaaggcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 7941623  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7941622 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7941545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27499530 - 27499283
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  27499530 gaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaa 27499433  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga---------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  27499432 gtcaaaagtagaaaacaacgagagagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctg-gggaaa 27499334  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 313  Q
    |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27499333 gagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 27499283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6765336 - 6765066
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  6765336 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa---ttata 6765242  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-gaa-----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    |  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6765241 aatacaagccaaa-gtagaaaacaacggcgagaagaacaccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 6765143  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6765142 gggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6765066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9148727 - 9148475
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9148727 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaca---acttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 9148632  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  9148631 t-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gtgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagag 9148540  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9148539 cagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9148475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 24446502 - 24446752
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  24446502 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataa 24446599  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             ||||||||    
T  24446600 acacaagccaaaagtagaaaacaagagaga-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagaga 24446685  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24446686 gcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataa 24446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6133308 - 6133098
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  6133308 aaaattacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtag 6133211  T
Q  183 aaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 279  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||| |    
T  6133210 aaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttcc 6133111  T
Q  280 actatagtgatga 292  Q
    |||||| ||||||    
T  6133110 actataatgatga 6133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12102566 - 12102309
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  12102566 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaacta--cttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaa 12102471  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagag 265  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | || |||   |||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||    
T  12102470 cacaagc-aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-gagagcatacgaaa---tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagag 12102376  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  12102375 cagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaataa 12102309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 333
Target Start/End: Original strand, 619298 - 619559
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||   ||||||||||    
T  619298 tgttgcggattcgatgagaaaacacaccaataa--taaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtggatc--acagttataa 619392  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg--agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||||| |||||||||||||| |   ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||    
T  619393 tcacaagc-aaaagtagaaaacaacagcagagaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagag 619490  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataat 333  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  619491 agcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttataagaataat 619559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 22044249 - 22044501
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  22044249 aaaataacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtag 22044343  T
Q  183 aaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22044344 aaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 22044443  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  22044444 ccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 22044501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5198895 - 5198642
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5198895 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataata---acttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 5198800  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
     |||||||||||||||||||       | || |  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5198799 -acaagccaaaagtagaaaa-------acaacggcgagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 5198708  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5198707 cagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5198642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11435430 - 11435177
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  11435430 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagta 11435336  T
Q  182 gaaaaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    |||||||   ||||||  ||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  11435335 gaaaacaatggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 11435236  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11435235 tccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11435177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 18537325 - 18537586
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  18537325 tgttgtgaattcgatgaagttcacacctataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaa 18537420  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||  | || ||||||||    
T  18537421 cacaaac-aaaagtataaaacaacgagagaaagaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagaga 18537518  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18537519 gcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18537586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41997958 - 41997714
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  41997958 aaaaacacaccaataa--taaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaa-acaaaagtag 41997864  T
Q  183 aaaacagcgagag-aaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 280  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  41997863 aaaacagcgagagcaaagaaagagagaacttatga-aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctg-gggagagagcggccctccgtttca 41997766  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  41997765 ctatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataa 41997714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51015720 - 51015468
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  51015720 aaaaacacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtag 51015626  T
Q  183 aaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  51015625 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacct 51015526  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51015525 ccgatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51015468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 18534689 - 18534944
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaag 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||     
T  18534689 gaattcgatgaaactcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaa 18534784  T
Q  173 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagcc 270  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||||  | |||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  18534785 c-aaaagtagaaaatagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcaccc 18534882  T
Q  271 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18534883 ctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18534944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 38890091 - 38890337
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||    
T  38890091 aaaatcacaccaataaaatat--ttgatatgtggagcaaggaataatctagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaaggcaaaattag 38890185  T
Q  183 aaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 279  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||  |||  |||||||||||||| || ||| |    
T  38890186 aaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttcc 38890284  T
Q  280 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38890285 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 38890337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47868894 - 47868623
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |    
T  47868894 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataa-a 47868799  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||         | | ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |    
T  47868798 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtat 47868700  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47868699 gggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47868623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11437855 - 11437585
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  11437855 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-a 11437760  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||  ||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11437759 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 11437661  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11437660 aggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11437585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 262
Target Start/End: Original strand, 3937126 - 3937316
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||    
T  3937126 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaaga--taaaa 3937219  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3937220 tcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctgagggaga 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 11006094 - 11006347
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgat-gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11006094 tgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 11006189  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    | |||||| ||||||||||||       | || |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11006190 t-acaagcaaaaagtagaaaa-------acaacggcgagaagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11006281  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11006282 gcagccctccgatccactata-tgatgagtaccattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11006347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 53405626 - 53405357
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  53405626 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatgga--agttataa 53405531  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      ||||||||||||||||||||| ||         | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||     
T  53405530 atacaagccaaaagtagaaaacatcggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct- 53405432  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||| |||||||||  || ||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  53405431 -gggggagagcagctctctgttccactata-tgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 53405357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 8756103 - 8756363
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||     
T  8756103 tgttgtgaattcgatgaaaatcacatcaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaa 8756197  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||   ||||| |||||  |||||||    
T  8756198 cacaagc-aaaagtaaaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagaga 8756295  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  8756296 gcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 8756363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 11008408 - 11008676
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgat-gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11008408 tgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 11008503  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | |||||| ||||||||||||    | ||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11008504 t-acaagcaaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct 11008602  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | ||||||   ||| |||||| | ||||||||||||    
T  11008603 gggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccattacaa---agaaatcaatgggttacaagaataa 11008676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Original strand, 52942329 - 52942523
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||  || ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52942329 tgttgcaaattcgatgaaaaaatcacacaaataaca--aatttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattat 52942426  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  52942427 aaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagaggaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 52942523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 49089044 - 49088791
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49089044 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 49088947  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagaga 264  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| |             |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  49088946 acacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaacg------------caaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagaga 49088859  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag-agatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||   || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  49088858 gtagttctctgtttcactata-tgatgactaacattacaaaagaagatgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38409680 - 38409427
Alignment:
Q  82 gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  38409680 gaaaaacacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaattgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagta 38409586  T
Q  182 gaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    |||||||   ||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  38409585 gaaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccc 38409486  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38409485 tccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38409427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25358042 - 25357863
Alignment:
Q  153 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 251  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| |    
T  25358042 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctag 25357944  T
Q  252 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25357943 tctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 25357863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 9176315 - 9176584
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  9176315 tgttgcgaattcgacgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat 9176410  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     |||||||||||||||||    ||| |||||      | ||||||||| | ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  9176411 -acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctg 9176509  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9176510 ggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9176584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 56030945 - 56030815
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  56030945 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataa 56030850  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 201  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030849 atacaa-acaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 56030815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30136996 - 30136789
Alignment:
Q  106 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  30136996 ttgatatgtggaacaagtaataatcaaacaaccaaat-aaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacaagagaaaagaaaga 30136900  T
Q  204 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30136899 gagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttaca 30136800  T
Q  304 aaagagatatc 314  Q
    |||||||||||    
T  30136799 aaagagatatc 30136789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 240
Target Start/End: Original strand, 3824446 - 3824630
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagtt 161  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3824446 ctgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaacagtt 3824543  T
Q  162 ataatcacaagcc-aaaagtag-aaaacagc------gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 240  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||       ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3824544 ataaacacaagccaaaaagtagaaaaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 9173987 - 9174256
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||    
T  9173987 tgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat 9174082  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     |||||||||||||||||    ||| |||||      | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9174083 -acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 9174181  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     || ||||| ||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  9174182 gggcagagaacagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 9174256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 316
Target Start/End: Original strand, 3982087 - 3982272
Alignment:
Q  129 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 228  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| ||||| | ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| |||    
T  3982087 tcaagcaaccaaaaaaaagtgggtg--acagttataaacacaaacaaacgatagaaaacagcgagagaaaga-gagagaacacatgaaaaattgtttacc 3982183  T
Q  229 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3982184 ttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 3982272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18847627 - 18847376
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gta 181  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||    
T  18847627 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaaagta 18847534  T
Q  182 gaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    |||||||   ||||||       |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  18847533 gaaaacaacggcgagaagaacacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccc 18847435  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18847434 tccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18847376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 332
Target Start/End: Original strand, 15032401 - 15032660
Alignment:
Q  74 aattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || |    
T  15032401 aattcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacataaac 15032495  T
Q  174 caaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa-----gagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagag 265  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||  | |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| || || |||||||||    
T  15032496 -aaaagtagaaaaacagcgagagaaagaaagaaagaaagaacacacga-aatttgtataccctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagag 15032593  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||  | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15032594 cagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15032660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 16931631 - 16931899
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  16931631 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aa 16931726  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||     
T  16931727 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 16931825  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16931826 gggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16931899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 332
Target Start/End: Original strand, 22134476 - 22134727
Alignment:
Q  85 aatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag-- 182  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||       
T  22134476 aatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaaga 22134570  T
Q  183 aaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||   ||||||       |||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  22134571 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccct 22134669  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22134670 ccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22134727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28454167 - 28453906
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||  |||||| |||| ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||     
T  28454167 tgttgtgaattcgttgaaaatcacaccaatatatta--cttgatgtgtgaagcaaaa--taatcaagaaaccaaaacaaagtggatg--acaattataaa 28454074  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgaggga 260  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||     |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | | |||| ||||| ||||    
T  28454073 cacaagc-aaaagtagaaaacaaccggagaaagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctggggga 28453976  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  28453975 gagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagtttacaagaat 28453906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Original strand, 47210637 - 47210754
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47210637 tgttgcgaattcgttgtgaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 47210732  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca 188  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  47210733 t-acaagccaaaagtagaaaaca 47210754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5664722 - 5664605
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5664722 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataat 5664627  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca 188  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  5664626 gacaaaccaaaagtagaaaaca 5664605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 16185770 - 16185920
Alignment:
Q  156 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggt 252  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  16185770 acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaaacaaaaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagt 16185867  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16185868 ctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa 16185920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 22780212 - 22780483
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||  ||  ||||||    
T  22780212 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatcaaa--gttata 22780306  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  | |||||||||||||||||||   ||||||       ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  22780307 aatataagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 22780406  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22780407 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22780483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 22782577 - 22782848
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||  | |||||||    
T  22782577 tgttgcgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatg--aaagttata 22782671  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||  |||||| |||    
T  22782672 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtc 22782771  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22782772 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22782848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 44599680 - 44599948
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  44599680 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaag-gataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aa 44599774  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||| |||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  44599775 t-acaaggcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 44599873  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  44599874 ggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 44599948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 18709021 - 18709274
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  18709021 aaaaccacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaatagtag 18709115  T
Q  183 aaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    ||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |     
T  18709116 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcc 18709215  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18709216 tccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18709274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 332
Target Start/End: Original strand, 22132248 - 22132502
Alignment:
Q  85 aatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt-ag 182  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22132248 aatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaag 22132342  T
Q  183 aa----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaag-aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 270  Q
    ||    ||| |||||      | ||||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  22132343 aaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagcc 22132442  T
Q  271 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22132443 ctccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9864196 - 9863931
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||  |||||| ||||||  || | ||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  9864196 tgttgtgaattcgttgaaaaatcacatcaataaaata--cttgatgtgtggaagaaaaaataatcaagaaaccaaaataaagtg---ggaacagttataa 9864102  T
Q  166 --tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtct--gaggg 259  Q
      |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||| | ||||  | |||    
T  9864101 aatcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctggggggg 9864004  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactata---gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  9864003 agagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaaggttacaagaat 9863931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 16933988 - 16934253
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||| || ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||    
T  16933988 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttaatgtgtggagcaagggaa--ttaagcaaccaaaacaa-gcgtatggaataatta-aa 16934080  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag-----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||      |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||     
T  16934081 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 16934179  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16934180 gggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16934253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544181
Alignment:
Q  240 aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13544181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 332
Target Start/End: Original strand, 47210762 - 47210863
Alignment:
Q  230 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 329  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  47210762 agttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 47210860  T
Q  330 taa 332  Q
    |||    
T  47210861 taa 47210863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Original strand, 47150826 - 47151005
Alignment:
Q  153 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 250  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||     
T  47150826 ggaacaattataaacacaaac-aaaagtagaagacaacgagagaaagaaagagagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgaccta 47150923  T
Q  251 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||  |||||| | || |  || ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  47150924 gtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 47151005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557823
Alignment:
Q  217 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 26557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22295565 - 22295412
Alignment:
Q  153 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 250  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||| | || |||     
T  22295565 ggaacaattataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcgagagaaaggaagagagaacacatga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgcccta 22295468  T
Q  251 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 306  Q
    || || |||||||||||    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22295467 gtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10114737 - 10114565
Alignment:
Q  131 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacct 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||    
T  10114737 aagcaaccaaaacaaagtgggtg--atagttataaacacaaga-aaaggtagataacaacgagagaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttacct 10114642  T
Q  230 agttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | ||||  |||||| |||||||| | ||||||||    
T  10114641 aattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcgttcaactataatgatgagttaatttacaaa 10114565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 38269995 - 38270088
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  38269995 tgttgggaattcgatagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaa---gtatggaacaattataa 38270088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 316
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983623
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaa 31983623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 313
Target Start/End: Original strand, 54928700 - 54928741
Alignment:
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54928700 tccgttccactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 54928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10113334 - 10113108
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  10113334 aaaatcacaccaataaaatat--ttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaaaacaaagtgggtg--acatttataaacacaagc-aaaagtag 10113242  T
Q  183 aaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 280  Q
    | ||||  |||||| |||| || ||||||||  | | ||| || ||| |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||  ||| || ||    
T  10113241 ataacattgagagagagaaagaaagaacacatga-attttttttacccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattcca 10113143  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10113142 ctataatgattagtaacattac-aaagagatatcaa 10113108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9022602 - 9022543
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9022602 gggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaat 9022543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 52043428 - 52043550
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| | |  ||  |  |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  52043428 aaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagca-ga-ataatcaagcaaccaaaaaacaacgtgggtgacagttataaacacaagc-aaacgtag 52043522  T
Q  183 aaaacagcgagagaaag-aagagagaac 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52043523 aaaacagcgagagaaagaaagagagaac 52043550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 130
Target Start/End: Original strand, 18311215 - 18311278
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtc 130  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18311215 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgatagtc 18311278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999045
Alignment:
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    ||||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 40999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 316
Target Start/End: Original strand, 3578632 - 3578766
Alignment:
Q  175 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||| |||   |||||| ||| ||||||||| || | || ||| ||||| |||||||| ||||  ||    
T  3578632 aaaagtagaaaacaacgagagaaaga---gagtacacgaaa---tttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctc 3578724  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3578725 cattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 3578766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269234
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 270  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5269234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Original strand, 3824636 - 3824681
Alignment:
Q  287 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3824636 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3824681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143312
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 5143312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Original strand, 5637531 - 5637576
Alignment:
Q  287 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5637531 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5637576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 88)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44725022 - 44724757
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacag-ttata 164  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44725022 tgttgcgaattcgatgggaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacatattata 44724925  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44724924 aacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 44724825  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44724824 agcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 44724757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 13099317 - 13099587
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13099317 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 13099414  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
     ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13099415 acacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 13099514  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13099515 gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13099587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 42330845 - 42331108
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42330845 ctgttgcgaattcgatgagaaatcacgccaataa--taaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 42330942  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  42330943 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaga-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 42331041  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42331042 atagccctccgtttcactata-taatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 42331108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 31434892 - 31435158
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  31434892 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaataaagtgtaaggaacaattata 31434989  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  31434990 aacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagag 31435089  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31435090 agcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 31435158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 444044 - 443773
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  444044 tgttgtgaattcgatgagaaaactcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtattgaacaattat 443947  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-----aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgag 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |    
T  443946 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcggggg 443847  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  443846 ggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaagaataa 443773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22394161 - 22393900
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22394161 tgttgtgaattcgatgaaaaattccaccaataa--taaacttgat--gtggagcaagtgatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 22394068  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22394067 tcacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagaga 22393968  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22393967 acaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22393900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 27306076 - 27306341
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaa-atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27306076 tgttgcgaattcgatgagagatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 27306173  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  27306174 tcacaagccaaaagaagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggag 27306271  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  27306272 agagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 27306341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24749035 - 24748772
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24749035 tgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttata 24748940  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  24748939 atcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaataaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagag 24748841  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24748840 agcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24748772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 21591988 - 21592254
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  | |||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21591988 ctgttgcgaattcgatgagaaaacacggctataac--aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-aaagtgtatggaacaattata 21592084  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  21592085 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag 21592184  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  21592185 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 21592254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48458100 - 48457831
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48458100 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 48458005  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||| |||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  48458004 -acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 48457906  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  48457905 gggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 48457831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20626481 - 20626216
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20626481 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataa 20626387  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
      | |||||||||||||||||||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20626386 atataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 20626287  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20626286 gagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20626216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20630372 - 20630107
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20630372 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataa 20630278  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
      | |||||||||||||||||||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20630277 atataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 20630178  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20630177 gagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20630107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20642791 - 20642526
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20642791 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataa 20642697  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
      | |||||||||||||||||||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20642696 atataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 20642597  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20642596 gagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20642526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 4295781 - 4296045
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  4295781 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaataataa 4295878  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  4295879 acacaagccaaaagtagaaaatggcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagata 4295978  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  4295979 gcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 4296045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21990563 - 21990343
Alignment:
Q  100 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21990563 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagcaaacagcgagagaga 21990464  T
Q  199 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 295  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  21990463 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagta 21990365  T
Q  296 actttacaaaagagatatcaat 317  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21990364 acgttacaaaagagatatcaat 21990343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9679495 - 9679237
Alignment:
Q  76 ttcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagc 173  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  9679495 ttcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagt 9679398  T
Q  174 caaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||      
T  9679397 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagta 9679298  T
Q  271 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9679297 ctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9679237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21678506 - 21678245
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21678506 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccgataaca--aacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataa 21678409  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  21678408 acacaagccaaaagtagaaaacagcgggagaaaagaagagagaacac--aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagaga 21678311  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21678310 gcagcccactgtttcactata-tgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaata 21678245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42223600 - 42223336
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  42223600 tgttgcgaattcgataaaaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtataaaacaattataa 42223503  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || || ||||||||    
T  42223502 acacaaggcaaaagtagaaaacaatgagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagaga 42223403  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  42223402 gcagccatccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaataa 42223336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38394434 - 38394164
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38394434 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 38394339  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38394338 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 38394240  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38394239 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38394164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Original strand, 20137061 - 20137220
Alignment:
Q  173 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  20137061 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccc 20137159  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20137160 tccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 20137220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 7092054 - 7092323
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  7092054 tgttgcaaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat 7092150  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     | ||| |||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  7092151 -ataagtcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg- 7092248  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7092249 gggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7092323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 7094301 - 7094571
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  7094301 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat 7094397  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||| |||||||||||||||   ||||||       |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  7094398 -acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgg 7094496  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7094497 gggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7094571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21680473 - 21680205
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatc-acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| |||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21680473 ctgttgtgaattcgatgaaaacccacaccaataaca--agcttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattata 21680376  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc---tagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  21680375 aacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctggggga 21680276  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  21680275 gagagcagctctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaataa 21680205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 37411988 - 37412238
Alignment:
Q  87 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 186  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37411988 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaactagaaaa 37412085  T
Q  187 cagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 280  Q
    || ||||||||      ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  37412086 caacgagagaaaagaagagaagggagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttcca 37412185  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  37412186 ctataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 37412238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9681243 - 9680998
Alignment:
Q  88 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 186  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9681243 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 9681146  T
Q  187 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 283  Q
     | ||||||| |   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9681145 gatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcacta 9681046  T
Q  284 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  9681045 ta-tgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 9680998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 43253357 - 43253628
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43253357 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---atttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 43253452  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | ||||| |||||||||||    |||||||||      | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  43253453 t-acaagtcaaaagtagaaaaacaacagcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtct 43253551  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  43253552 gagggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 43253628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45013 - 44742
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  45013 ctgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-a 44918  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||| ||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  44917 at-acaagcaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 44819  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  44818 gggggagaaagcagctatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 44742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 7471821 - 7472091
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7471821 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 7471916  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||         | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7471917 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 7472015  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7472016 ggggagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7472091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20299908 - 20299638
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20299908 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 20299813  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20299812 t-acaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 20299714  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20299713 ggggagagagcaaccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20299638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 27832488 - 27832744
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27832488 tgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataaca--aacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 27832583  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||| |||||     |||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832584 tcacaaaccaaaagtagaaaacagtgagagaaagaa-agagataacacaagaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagag 27832677  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27832678 aagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataa 27832744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 39145865 - 39146098
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 198  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||   ||     
T  39145865 aaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaacaaattgtattaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 39145964  T
Q  199 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  || | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  39145965 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaacc 39146064  T
Q  299 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  39146065 ttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 39146098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20297810 - 20297540
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20297810 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 20297715  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20297714 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 20297616  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20297615 ggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20297540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28486013 - 28485744
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  28486013 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaatta-aa 28485918  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||         | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28485917 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggatagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 28485819  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||| || || | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28485818 a-ggagagagcaaccctctgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataa 28485744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11355705 - 11355436
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11355705 tgttgggaattcgatgaaaaaatcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattat 11355608  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||    
T  11355607 aaacacaagccaaaagtagaaaacaacaagagagagaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctagggg 11355508  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  11355507 agagagcagctctctgttccactata-tgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataa 11355436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28488000 - 28487731
Alignment:
Q  68 gttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28488000 gttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 28487905  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||         | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||     
T  28487904 -acaagtcaaaagtagaaaacaacggctagaagaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgg 28487806  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28487805 gggagagagcaaccctctgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28487731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26295868 - 26295625
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
T  26295868 aaaatcacaccaataa---atacttgatgtatggagcacgtgataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgaaaa--ttataaacacaagccaaaagtag 26295774  T
Q  183 aaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 282  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | || ||||||||    
T  26295773 aaaacaacgaaagaaagaa-agagataacacaagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcact 26295675  T
Q  283 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26295674 ataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 26295625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26804955 - 26804764
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26804955 tgttgcgaatttgatgagaaatcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 26804858  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     |||||| |||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  26804857 acacaagtcaaaagtagaaaacaacatcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctg 26804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3036166 - 3035902
Alignment:
Q  73 gaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  3036166 gaattcgatgagaaatcacaccaataaca---atttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaa 3036072  T
Q  172 gccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    |||||||||||||||||   ||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3036071 gccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 3035972  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3035971 agagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3035902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 40836583 - 40836853
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatg--aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  40836583 tgttgcgaattcgatcgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-a 40836678  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40836679 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 40836777  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  40836778 gggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 40836853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1850429 - 1850159
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  1850429 tgttgcgaattcgatttgaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aa 1850334  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||||||||||||||||||| |          | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  1850333 t-acaagccaaaagtagaaaacaacagtgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg 1850235  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1850234 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1850159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18345955 - 18345719
Alignment:
Q  103 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 195  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  18345955 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 18345858  T
Q  196 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 292  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  18345857 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactata-tgatga 18345759  T
Q  293 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18345758 gtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18345719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 7469864 - 7470133
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7469864 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---atttgatgtgtggagcagg-gataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 7469958  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||         | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7469959 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 7470057  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7470058 ggggagggagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7470133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24465975 - 24465730
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24465975 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 24465880  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |   |||||||| ||  |||||||| || ||||| || ||||| |||||||    
T  24465879 tcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacga---aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagag 24465783  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24465782 agcagtcacccgtttcattataatgatgagt-actttacaaaagacatatcaat 24465730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11759575 - 11759369
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11759575 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 11759480  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||      | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11759479 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 11759381  T
Q  256 agggagagagca 267  Q
     |||||||||||    
T  11759380 ggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40946777 - 40946506
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  40946777 tgttgtgaattcgatgagaatcacatcaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat 40946682  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca-----gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
     ||||||||||| ||||||| |     ||||||       |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40946681 -acaagccaaaaatagaaaaaaaaacggcgagaagaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 40946583  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  40946582 gggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataa 40946506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36059 - 35807
Alignment:
Q  84 aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtaga 183  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  36059 aaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaaaccaaaagtaga 35965  T
Q  184 aaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 273  Q
    |||||   ||||||       |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||  ||    
T  35964 aaacaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctc 35865  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  35864 cgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 35807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7188961 - 7188732
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  7188961 aaaatcacatcaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtag 7188867  T
Q  183 aaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 281  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||||  |||| | | ||| || |||||||||||||||||| |||    
T  7188866 aaaacagcgagagaaaagaaagagaacacgcaa-aatttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttccac 7188768  T
Q  282 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7188767 tataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaat 7188732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3879027 - 3878755
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaag-tgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  3879027 tgttgcgaattcgatgagaaatcacatcaataata---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaatta-a 3878932  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    || |||| ||||||||||||||    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||    
T  3878931 at-acaaaccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtc 3878833  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3878832 tgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3878755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38397084 - 38396813
Alignment:
Q  69 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |    
T  38397084 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat-a 38396990  T
Q  169 caagccaaaagtagaaaaca--------gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |||||||||||||||||| |        ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38396989 caagccaaaagtagaaaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 38396890  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  38396889 tgagggagagagaagccctccgatccactata-tgatgagtaaagttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 38396813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25542976 - 25542707
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  25542976 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaaatgtatggaacaatta-aa 25542881  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||         | | |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||     
T  25542880 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtcta 25542782  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25542781 ggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25542707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Original strand, 22251452 - 22251605
Alignment:
Q  88 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 187  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22251452 cacaccaataaca--aacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 22251549  T
Q  188 agc--gagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 240  Q
    |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22251550 agcaagagagaaaggaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 24813348 - 24813610
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| |||   | |||| ||||||    
T  24813348 tgttgtgagttcgatgaaaatcacatcaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatatcaacgtg---gtaacaattataa 24813442  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggaga 262  Q
     || || | |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||    
T  24813443 acataaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaaggaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggaga 24813540  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24813541 aagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaataa 24813610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2935717 - 2935447
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  2935717 ctgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aa 2935622  T
Q  166 tcacaagcc-aaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | ||||||| ||||||||||||||   ||||||      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  2935621 t-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 2935523  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2935522 gggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2935447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24258781 - 24258641
Alignment:
Q  196 aaagaagagagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt---gatg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| |   ||||    
T  24258781 aaagaagagagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatg 24258682  T
Q  292 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24258681 agtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24258641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Original strand, 9027034 - 9027303
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  9027034 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataa 9027128  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag-aga--------aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
      |||||||||||||||||||||   || || |||        || |||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  9027129 atacaagccaaaagtagaaaacaacggctagaagaacataattaataaga-agaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 9027227  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  9027228 tgggggagagagcagccctcctatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 9027303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 1049129 - 1049406
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||    
T  1049129 tgttgcgaattcgaagaaaaattcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaa--gtta 1049223  T
Q  163 taatcacaagccaaaa--gtagaaaaca-----gcgagag------aaagaagagagaa--cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgac 247  Q
    |||  |||||||||||  |||||||| |     || |||       |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1049224 taaatacaagccaaaaaggtagaaaaaacaacggcaagaagaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgac 1049323  T
Q  248 ctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1049324 ctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1049406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1606827 - 1606559
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  1606827 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aa 1606732  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||    
T  1606731 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctg 1606633  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  1606632 ggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 1606559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6332574 - 6332398
Alignment:
Q  154 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 252  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  6332574 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaatagcgacagaaaga-gagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagt 6332478  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||  |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  6332477 ctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataa 6332398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 1046757 - 1047035
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgta-tggaacagtt 161  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||    
T  1046757 tgttgcgaattcgaagaaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtaatggaa--gtt 1046851  T
Q  162 ataatcacaagccaaaa--gtagaaaaca-----gcgagag------aaagaagagagaa--cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 246  Q
    ||||  |||||||||||  |||||||| |     ||||||       |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1046852 ataaatacaagccaaaaaggtagaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 1046951  T
Q  247 cctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1046952 cctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1047035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 7351491 - 7351762
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  7351491 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttata 7351585  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||     
T  7351586 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagta 7351685  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7351686 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7351762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11081842 - 11081703
Alignment:
Q  179 gtagaaaacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccg 275  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  11081842 gtagaaaacagcgagaggaaaaaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccg 11081744  T
Q  276 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    || || | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11081743 ttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaa 11081703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 24817203 - 24817465
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||  ||| ||||| || ||| | ||| |||   | |||||||||||    
T  24817203 tgttgcaaattcaatgaaaatcacaccaataaaata--cttaatgtgtggagcaagtaataatcaagaaaacaatatcaacgtg---gtaacagttataa 24817297  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggaga 262  Q
     ||||| | |||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  | || | ||| ||| |||||||||||||  |||||| || || ||||||    
T  24817298 acacaaac-aaaattagaaaacaacgagagaaaagaaagacagaacacacga-aactcgtttaccaagttcggtccaaaactgacctagtatgggggaga 24817395  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  24817396 gagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataa 24817465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25276465 - 25276319
Alignment:
Q  175 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | ||||| |||||           |    
T  25276465 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctg-gggag-----------c 25276378  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25276377 cgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataa 25276319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22137527 - 22137257
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| | | | |    
T  22137527 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa-a 22137432  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    || || ||||||||||||||||    | | ||||      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  22137431 at-acgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 22137333  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  22137332 tgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 22137257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40552554 - 40552284
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| | | | |    
T  40552554 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa-a 40552459  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    || || ||||||||||||||||    | | ||||      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  40552458 at-acgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 40552360  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  40552359 tgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 40552284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Original strand, 16296934 - 16297115
Alignment:
Q  129 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 228  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||     
T  16296934 tcaagcaaccaaaacaaagtggctg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacgacgagagaaaga-gagagaacacacggaaatttgtttaca 16297029  T
Q  229 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 313  Q
     |||||||||||| | |||| | ||||  |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16297030 cagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatat 16297115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22108370 - 22108246
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  22108370 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 22108273  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  22108272 aagagaaatcaatgggttacaagaata 22108246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40550130 - 40550006
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  40550130 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 40550033  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  40550032 aagagaaatcaatgggttacaagaata 40550006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 332
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31156021
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||| | |||| |    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatag-gatgagtaccgttac-a 31155993  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  31155994 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 31156021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6349191 - 6349097
Alignment:
Q  114 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaaca 210  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6349191 tggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtacgga--agttataaacacaag-caaaagtagaaaatagcgagagaaagaaagagagaaca 6349097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 20091584 - 20091656
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20091584 gggagagagcagccctccgttccactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 20091656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 332
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828744
Alignment:
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22828744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 7349117 - 7349383
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||  | |||||||    
T  7349117 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaataaagtgtatg--aaagttata 7349211  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaa--aacagcgaga------gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    |  |||||||||||||| ||  ||| ||||||       ||||||||   ||||||||||  |||||||||||    ||||||||||  |||||| ||||    
T  7349212 aatacaagccaaaagtaaaaacaacggcgagaagaacgcaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgac----ttcggtccaatctgacctagtct 7349307  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7349308 gggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7349383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 137
Target Start/End: Original strand, 1502816 - 1502883
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaac 137  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1502816 tgttgtgaattcaatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaac 1502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046672
Alignment:
Q  232 ttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaggtttacaagaat 6046674  T
Q  331 aa 332  Q
    ||    
T  6046673 aa 6046672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 330
Target Start/End: Original strand, 13290454 - 13290583
Alignment:
Q  200 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 298  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| | |||  || ||| | ||||| ||||||||||||    
T  13290454 aagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaact 13290552  T
Q  299 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  13290553 ttac-aaagagatatcaaaaggttacaagaat 13290583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 22280379 - 22280434
Alignment:
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22280379 gagagcagctttctgtttcactataatgatcaataactttacaaaagagatatcaa 22280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 330
Target Start/End: Original strand, 6067183 - 6067309
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 303  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  ||||       
T  6067183 agaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttttac 6067282  T
Q  304 aaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||    
T  6067283 aaagagatatcagaggattacaagaat 6067309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6349021 - 6348960
Alignment:
Q  271 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  6349021 ttccgttccactgtaatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataa 6348960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40550277 - 40550189
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 156  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40550277 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 40550189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 20136991 - 20137066
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa 142  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20136991 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcatacgaataa--taaatttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa 20137066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 40281316 - 40281468
Alignment:
Q  155 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 251  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| |||||| | ||| || |    
T  40281316 aacaattataaatacaagcaaaaattagaaaacagctagagaaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacacagttctgtccaatactgaactag 40281414  T
Q  252 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    |||| ||||||||||| || | |||| ||| | |  ||||||||||||||||||    
T  40281415 tctgggggagagagcatcccttcgttccacaacaacgatgagtaactttacaaa 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075226
Alignment:
Q  214 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactataatgat 2075226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190052
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagc 9190052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11757453 - 11757408
Alignment:
Q  287 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11757453 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11757408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12097911
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Original strand, 20091041 - 20091132
Alignment:
Q  104 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaa-acaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 198  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  20091041 acttgatgtgttgagcaagtaataatcaagcaaccagatacaaagtgtatggaa--gttataa-cacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagaaa 20091132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 332
Target Start/End: Original strand, 22251604 - 22251661
Alignment:
Q  279 cactatagtgatgagtaactttacaaaag----agatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||    
T  22251604 cactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataa 22251661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 98)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47906704 - 47906438
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  47906704 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaccaaagtgtatggaacaattataa 47906608  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  47906607 tcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggag 47906508  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47906507 agagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47906438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Original strand, 11457327 - 11457588
Alignment:
Q  72 cgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcaca 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  11457327 cgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtatatggaacaattttaaacaca 11457424  T
Q  171 agccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11457425 agccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11457524  T
Q  268 gccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11457525 gacatccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 11457588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 4131221 - 4131493
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4131221 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataaca--aacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 4131318  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  4131319 aacacaagccaaaaatagaaaacaacgagagagaaaagaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggag 4131418  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag----agatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||    
T  4131419 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataa 4131493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16429387 - 16429125
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16429387 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 16429292  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16429291 acacaaaccaaaagt-gaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 16429193  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16429192 gcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16429125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 17185979 - 17186241
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17185979 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 17186074  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17186075 tcacaaac-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17186173  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  17186174 gcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 17186241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 31424862 - 31425128
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  31424862 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataacaaaatgtatgggacaattataa 31424959  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31424960 acacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggaga 31425058  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  31425059 gagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31425128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 25251127 - 25251388
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25251127 gaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaa 25251224  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcag 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||     
T  25251225 gccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaa 25251324  T
Q  269 ccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  25251325 ccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataa 25251388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18840022 - 18839755
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18840022 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaacaaagtgtatggaacaattataa 18839925  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |    
T  18839924 acacaagccaaaactagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaa 18839825  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18839824 gagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18839755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 14097815 - 14098083
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14097815 tgttgcgaattcgaagaaaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattata 14097912  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  14097913 aacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggag 14098012  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14098013 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 14098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 2949079 - 2949329
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2949079 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataa 2949176  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  2949177 acacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggaga 2949275  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2949276 gagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 2949329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17319321 - 17319055
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||  || ||||| ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17319321 tgttgtgaattcgatgaaaaatcgcaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaatagttataa 17319224  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17319223 acacaagccaaaagtagaaaatagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-agggaga 17319125  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17319124 gagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataagttacaagaataa 17319055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 9240951 - 9241199
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  9240951 aaaatcacaccaataaca--aacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaaaccaaaagtag 9241048  T
Q  183 aaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||    
T  9241049 aaaacagcgagagaaagaaagagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccac 9241148  T
Q  282 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  9241149 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 9241199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40134379 - 40134112
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatag--tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagtta 162  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40134379 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgatataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gtta 40134284  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || ||||    
T  40134283 taatctcaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttggggga 40134184  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  40134183 gagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 40134112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 6995540 - 6995798
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  6995540 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaactataa 6995637  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-------gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
     ||||||||||||||||||||||   ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6995638 acacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctg 6995737  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  6995738 gaggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttataaaagagatgtcaat 6995798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18307543 - 18307292
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18307543 tgttgcgaattcgatgagaaaatacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 18307446  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18307445 acacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctg-gggaga 18307347  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307346 gagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 18307292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39462956 - 39462686
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39462956 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattata 39462859  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    | |||||||||||| |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  39462858 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggg 39462759  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataat 333  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  39462758 agagagcagctctccgtttcactata-tgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataat 39462686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 17324484 - 17324749
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcaca 170  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |    
T  17324484 gaattcgatgaaaaactcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataacaaagtgaatagaacaattataatcata 17324581  T
Q  171 agcca-aaagtagaaaacagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17324582 agccagaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 17324681  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17324682 agcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17324749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 15294677 - 15294947
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15294677 ctgttgcgatttcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 15294772  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15294773 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 15294871  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15294872 ggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15294947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13215518 - 13215249
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13215518 tgttgtgaattcgttgagaaaacacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 13215421  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13215420 acacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagaga--acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 13215323  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag----atatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    |||||||| | ||||||||||||    
T  13215322 gagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaagaataa 13215249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 28206912 - 28207164
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28206912 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattata 28207009  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28207010 aacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggg 28207109  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28207110 agagagcagccctccgtttcacta---tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 28207164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31490345 - 31490081
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  31490345 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaatac---aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataa 31490249  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  31490248 acacaagtcaaaagtagaaaacagggagagagaaaataagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctg-ggggga 31490150  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  31490149 gagcagccctccgtttcaccata-tgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31490081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 50307389 - 50307659
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  50307389 tgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattata 50307486  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaga--agagagaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50307487 aacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaataagagagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 50307586  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  50307587 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 50307659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 317
Target Start/End: Original strand, 12302347 - 12302603
Alignment:
Q  65 cctgttgcgaattcgatgaaaat---cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagt 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |    
T  12302347 cctgttgcgaattcgataaaaaaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 12302444  T
Q  161 tataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag 257  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  12302445 tataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctggg 12302544  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12302545 ggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 12302603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23816323 - 23816054
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23816323 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 23816227  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag----aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  23816226 tcacaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg 23816127  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| || |||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  23816126 gagagagcatccctccgatccattata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23816054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 25248398 - 25248665
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25248398 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataaca--aacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 25248495  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  25248496 acaaaagtcaaaagtagaaaacagcgagagacaccggaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagg 25248595  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25248596 gagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25248665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 6114989 - 6115216
Alignment:
Q  104 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaag 202  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  6114989 acttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaagacaacgagagaaaagaag 6115086  T
Q  203 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 302  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6115087 agagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttac 6115186  T
Q  303 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6115187 aaaagagatatcaattggttacaagaataa 6115216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 112 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16429040 - 16428821
Alignment:
Q  112 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaaca 210  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16429040 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacatcgagagaaaagaagagagaaca 16428943  T
Q  211 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 310  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16428942 caaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagaga 16428843  T
Q  311 tatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  16428842 tatcaatgggttacaagaataa 16428821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 38925328 - 38925591
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  38925328 tgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataa--taaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacatttat 38925425  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38925426 aaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg-gggaga 38925524  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38925525 gagcagccctccgttttacta---tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 38925591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 332
Target Start/End: Original strand, 50076583 - 50076785
Alignment:
Q  131 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076583 aagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagttaaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 50076682  T
Q  229 tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaaga 328  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50076683 cagttcggtccaaattgacatagtctg-gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaaga 50076781  T
Q  329 ataa 332  Q
    ||||    
T  50076782 ataa 50076785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51750476 - 51750207
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  51750476 tgttgcgaattcgataaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 51750381  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  51750380 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 51750282  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51750281 gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51750207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 27336801 - 27337052
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27336801 aaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27336898  T
Q  182 gaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 276  Q
    |||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  27336899 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccga 27336998  T
Q  277 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27336999 tccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27337052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 332
Target Start/End: Original strand, 50248415 - 50248685
Alignment:
Q  65 cctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50248415 cctgttgtgaattcgatgataaatcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattat 50248512  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||  ||||    
T  50248513 aaccacaagccaaaagttgaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctagggga 50248612  T
Q  261 gagag--cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||  || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  50248613 gagagaacaaccatctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataa 50248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41647355 - 41647088
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  41647355 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataattata 41647258  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  41647257 aacacaagtcaaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggag 41647158  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41647157 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 41647088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 27338992 - 27339243
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27338992 aaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27339089  T
Q  182 gaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 276  Q
    |||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||     
T  27339090 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccga 27339189  T
Q  277 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27339190 tccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27339243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 10399669 - 10399941
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  10399669 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta- 10399764  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10399765 aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 10399863  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10399864 tgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10399941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15823967 - 15823714
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15823967 aaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaaggcaaaagta 15823870  T
Q  182 gaaaacagcga---gagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 275  Q
    ||||||| | |   ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  15823869 gaaaacaacaacaagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctg 15823770  T
Q  276 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15823769 ttccactata-tgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataa 15823714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 31735365 - 31735634
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31735365 tgttgcgaattcgatgagaaattacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 31735460  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||||||||| |||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31735461 t-acaagccaaaa-tagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 31735558  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31735559 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataa 31735634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 2510200 - 2510438
Alignment:
Q  81 tgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt 180  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |    
T  2510200 tgaaaatcacaccaataaca---acttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattaaaa--acaagtcaaaaat 2510294  T
Q  181 agaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 280  Q
    |||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2510295 agaaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttca 2510387  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2510388 ctata-tgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggttacaagaataa 2510438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6756877 - 6756694
Alignment:
Q  151 atggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacct 249  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6756877 atggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagaggaaagaagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacct 6756778  T
Q  250 ggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6756777 agtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataa 6756694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15916822 - 15916562
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15916822 ctgttgtgaattcgatgaaaagtcacaccaataa---atacttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttata 15916728  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  15916727 aacacaagccaaaagtagaaaaacagcgagaaaaagaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggag 15916629  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaaga 328  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15916628 agagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaatgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2617955 - 2617684
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  2617955 tgttgcgaattcgatgaaaaccacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aa 2617860  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-------gaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||||||       ||||||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  2617859 t-acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaacacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtct 2617761  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2617760 gagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2617684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28842931 - 28842663
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  28842931 tgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaa 28842837  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  28842836 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgg 28842737  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28842736 gggagagattagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28842663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16432813 - 16432561
Alignment:
Q  75 attcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagc 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| || || |    
T  16432813 attcgatgaaaaatcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaatcaaaacacagtgtatgaaa--gttataaacataaac 16432718  T
Q  174 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgagggagagagcagcctt 272  Q
    |||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |      
T  16432717 caaaagtagaaaaac---aga-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccg 16432622  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataat 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16432621 ccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataat 16432561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13762275 - 13762005
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13762275 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-a 13762180  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  13762179 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtct 13762081  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  13762080 gggggagagagaagccctccggtccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13762005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17324484 - 17324231
Alignment:
Q  90 caccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacag 189  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17324484 caccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataacaaagtgtatgaaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 17324387  T
Q  190 cgagagaaaga---agagagaac----------acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 276  Q
     |||||| |||   ||||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  17324386 tgagagagagagagagagagaaaggaagagagaacacaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgt 17324287  T
Q  277 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17324286 ttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17324231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39932515 - 39932243
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39932515 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttata 39932420  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||    ||| |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||     
T  39932419 aatacaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagta 39932320  T
Q  254 tgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    || ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  39932319 tgggggaagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 39932243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25128273 - 25128040
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25128273 aaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattataatcacaaat-aaaagtagaaaacagcgagagaaaga 25128177  T
Q  201 a-----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 295  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  25128176 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagta 25128077  T
Q  296 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25128076 accttacaaaagagatatcaatgaattacaagaataa 25128040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 28998094 - 28998351
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||    
T  28998094 tgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaatta 28998191  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  28998192 taaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 28998291  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  28998292 gggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 28998351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 29003810 - 29004067
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||    
T  29003810 tgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaatta 29003907  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  29003908 taaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 29004007  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  29004008 gggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 29004067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13359011 - 13358787
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  13359011 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataa 13358917  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13358916 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 13358817  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactata 285  Q
     |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13358816 ggggagagagcagccctccgatccactata 13358787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 46431548 - 46431820
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  46431548 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aa 46431643  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-------gaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46431644 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 46431742  T
Q  255 --gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      | |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  46431743 gggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 46431820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28841083 - 28840848
Alignment:
Q  103 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 195  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28841083 aacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28840986  T
Q  196 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 292  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  28840985 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 28840887  T
Q  293 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28840886 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28840848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 246
Target Start/End: Original strand, 13447117 - 13447301
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13447117 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 13447212  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 246  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13447213 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 14183455 - 14183705
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  14183455 tgttgtgaattcgataaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaa 14183550  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagag 265  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||            ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  14183551 cacaagc-aaaagaagaaaacaacgagagac-----------cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagag 14183638  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  14183639 cagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 14183705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20302879 - 20302627
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  20302879 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aa 20302784  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    | ||||||||||||||||||||| || | || |      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20302783 t-acaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga------agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 20302692  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     || | |||| | ||||||  ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20302691 tagtcctccgatccactat-ctgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20302627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 50078793 - 50078934
Alignment:
Q  191 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  50078793 gagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgat 50078892  T
Q  291 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  50078893 gaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 50078934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 31422706 - 31422986
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| |||| |||||||| |||| | ||||||    
T  31422706 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaataaagtgtacggaataattataa 31422803  T
Q  166 t-cacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  31422804 aacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggag 31422903  T
Q  262 agagcagccttccg------------tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| || |            |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  31422904 agagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataa 31422986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 18800429 - 18800686
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||| ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18800429 gaattcgatgaaaatcacaccaacaaaata--cttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaag 18800524  T
Q  173 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||  | |||||||| |||  ||| ||||| ||| | |||| || || ||||||||||||     
T  18800525 ccaaaagtagaaaacaacgagagaaaacaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgtttggtccaaaactaacctagtttgggggagagagcagt 18800623  T
Q  270 cttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18800624 tctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataa 18800686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20291894 - 20291625
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  20291894 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aa 20291799  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  20291798 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtg 20291700  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||| || || |||| | ||||||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20291699 ggggagagaacaaccctccgatccactata-tgatgagaatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20291625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 30790250 - 30790514
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  30790250 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaata--cctgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaa 30790345  T
Q  167 cacaagccaaaa--gtagaaa-acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggag 261  Q
    ||||| | ||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| || ||    
T  30790346 cacaaacaaaaatagtaaaaagacagcgagagaaagaa-agagagcacacacgaattttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctg-ggaag 30790443  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30790444 agagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 30790514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Original strand, 50078635 - 50078769
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50078635 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 50078732  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 201  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50078733 aacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagagaa 50078769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47452065 - 47451825
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47452065 tgttgtgaattcaatgaaaaatcacatcaataaca--aatttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 47451968  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
     ||||||||||||||||||   |||| |||||||||  ||||||||             | ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  47451967 acacaagccaaaagtagaaagcaacaacgagagaaaaggaagagag-------------tggttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggga 47451881  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  47451880 gagagcagtcattcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 47451825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 3579589 - 3579729
Alignment:
Q  191 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 289  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||  || |||    
T  3579589 gagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcac--taatga 3579686  T
Q  290 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3579687 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3579729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 9459276 - 9459529
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  9459276 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttata 9459370  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |  ||||||||||||||||||||| || | || |      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  9459371 aatacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 9459463  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  9459464 gcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9459529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 9463103 - 9463356
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  9463103 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttata 9463197  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |  ||||||||||||||||||||| || | || |      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  9463198 aatacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 9463290  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  9463291 gcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9463356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 196
Target Start/End: Original strand, 3579431 - 3579558
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  3579431 tgttgtgaattcgatgaaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaa 3579528  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3579529 cacaagccaaaagtagaaaacagagagaga 3579558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24326101 - 24325831
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  24326101 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagtaaagtgtatggaacaatta-aa 24326006  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||| |||| ||| |||||| ||         | | |||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||    
T  24326005 t-acaagtcaaaggtaaaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctg 24325907  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  24325906 ggggagagagcagccattcgattcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24325831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51757973 - 51757699
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  51757973 tgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattg-aa 51757878  T
Q  166 tcacaagccaaaagtag-----aaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctg 250  Q
    | |||||||||||||||     ||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51757877 t-acaagccaaaagtagggaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaccta 51757779  T
Q  251 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| || |||||| | |||| ||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  51757778 gtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttac-aaagagaaatcgataggttacaagaataa 51757699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 330
Target Start/End: Original strand, 49495137 - 49495322
Alignment:
Q  143 caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 241  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  49495137 caaagtgtatggaaga--tataatcacaaac-aaaagtaaaaaacagtgagagaaagaaagagggaatacataagaatttctttacctagttcggtctaa 49495233  T
Q  242 attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||| | ||||  ||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  49495234 attgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 49495322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 13125310 - 13125571
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||  |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||    
T  13125310 tgttgcgaattcgttcaaaaatcacaccaataaatta--cttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataa 13125403  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggaga 262  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||  | ||| ||    
T  13125404 acacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaaagagagaacacatga-aatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaaggggggga 13125501  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13125502 gagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 13125571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51752805 - 51752532
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  51752805 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataata---actt-atgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattg-aat 51752711  T
Q  167 cacaagccaaaagtag------aaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctg 250  Q
     |||||||||||||||      ||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  51752710 -acaagccaaaagtaggaaaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccta 51752612  T
Q  251 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| || |||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51752611 gtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51752532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23786278 - 23786008
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  23786278 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aa 23786183  T
Q  166 tcacaagcc-aaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | ||||||| ||||||||||||||   ||||||      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  23786182 t-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 23786084  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  23786083 gggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23786008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823182
Alignment:
Q  207 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 6823208  T
Q  307 gagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||   ||||||||||||    
T  6823207 gagaaatcaatgagttacaagaataa 6823182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 8347161 - 8347386
Alignment:
Q  104 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 202  Q
    |||||||  |||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8347161 acttgatgcgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtatatgaaa--gttataaacataagc-aaaagtagaaaacagcgatagaaagaaag 8347256  T
Q  203 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 301  Q
    ||||||||||  | ||||||||  ||| ||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8347257 agagaacacacga-aatttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaacttta 8347355  T
Q  302 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8347356 caaaagagatatcaatgggttacaagaataa 8347386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 15669252 - 15669507
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaag 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||    ||||| |||| |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||     
T  15669252 gaattcgatgaaaatcacacctaaaatat----ttgatgtgtgaagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatcgaa--gttataaacacaaa 15669345  T
Q  173 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    | ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||| |||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  15669346 c-aaaagtataacacagcgagagaaaagaaagagagaacacaacaaaatttgtttacacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagc 15669444  T
Q  270 cttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15669445 catccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataa 15669507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16226607 - 16226336
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  16226607 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttata 16226513  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  16226512 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 16226413  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16226412 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16226336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42922557 - 42922398
Alignment:
Q  174 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  42922557 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 42922459  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42922458 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 42922398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 8348905 - 8349165
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  8348905 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa---aaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataa 8348998  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagag 263  Q
     ||||| | ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||  |||| | ||||  |||||||    
T  8348999 acacaaac-aaaagtagaaaacaattagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagag 8349096  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | || || ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  8349097 aacaaccctctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataa 8349165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16561885 - 16561635
Alignment:
Q  76 ttcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagcc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| || |  || |||||||||||| | ||| |||    ||||| |||||| |||||||     
T  16561885 ttcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagaaaaa--taatcaagcaaccaatatcaacgtga---gaacaattataaacacaagc- 16561794  T
Q  175 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||| || |    
T  16561793 aaaagtagaaaacggcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccct 16561695  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16561694 ttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 16561635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16232003 - 16231732
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  16232003 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttat 16231909  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 252  Q
    ||  |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||    
T  16231908 aaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagt 16231810  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16231809 ctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16231732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Original strand, 25860268 - 25860369
Alignment:
Q  81 tgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt 180  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25860268 tgaaaaccacaccaatatca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa----ccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagt 25860361  T
Q  181 agaaaaca 188  Q
    ||||||||    
T  25860362 agaaaaca 25860369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30780486 - 30780361
Alignment:
Q  63 atcctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtg--gagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacag 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30780486 atcctgttgtgaattcgatgaaaactcacaccaataaca--aacttgatgtgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaa 30780389  T
Q  160 ttataatcacaagccaaaagtagaaaac 187  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30780388 ttataaacacaaatcaaaagtagaaaac 30780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 313
Target Start/End: Original strand, 13127576 - 13127782
Alignment:
Q  104 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-- 201  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||      
T  13127576 acttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaaggagaaaacaatgagataaagaaaa 13127670  T
Q  202 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 300  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | | |||| |||||  ||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  13127671 gagagaacacatga-aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaacttt 13127769  T
Q  301 acaaaagagatat 313  Q
    |||||||||||||    
T  13127770 acaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 332
Target Start/End: Original strand, 26613194 - 26613353
Alignment:
Q  175 aaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||  |||| ||||||||| |||      
T  26613194 aaaagtagaaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctc 26613292  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  26613293 tctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 26613353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27916840 - 27916681
Alignment:
Q  156 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga-aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 253  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    | |||||||| ||| | |||||||||| | |||||| |||    
T  27916840 acagttataaacacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagagaaaaaaagagaacatgtga-aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtc 27916743  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27916742 tgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 27916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47177801 - 47177531
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |    
T  47177801 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataatta-a 47177706  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    || |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||    
T  47177705 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtc 47177607  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47177606 tg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47177531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47180152 - 47179882
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| |    
T  47180152 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataatta-a 47180057  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    || |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  47180056 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 47179958  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47179957 tg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47179882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 21948227 - 21948301
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  21948227 gggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 21948301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Original strand, 30738609 - 30738743
Alignment:
Q  200 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt--gatgagtaa 296  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||    
T  30738609 aagagagaacacacga-aatttgtttaccaagtttggtccaatactgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaa 30738707  T
Q  297 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  30738708 ctttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataa 30738743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 155949 - 155877
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  155949 gggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagataacaaaaggttacaagaat 155877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43104389 - 43104332
Alignment:
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 329  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  43104389 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 43104332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665346
Alignment:
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48665404 ccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 48665346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 305
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353434
Alignment:
Q  214 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa 21353434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28279696 - 28279455
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  | |  ||| |||||||| ||| |||  ||  ||| ||||||    
T  28279696 ctgttgtgaattcgttaaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagttaaa--caaacaaccaaatcaacgtgggtg--acaattataa 28279603  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga-agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtct-gagggaga 262  Q
     ||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||  |||||||||||| || |||||||| ||| |||||| || || | |||||| |||| | |||| |    
T  28279602 acacaagcgaaa-gtagaaaacaacgaaaaaaagggagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttcgatctaatactgacctagtctagggggaaa 28279504  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 311  Q
    || || |  ||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28279503 gaacaactctcaattccactataatgatgagtaactttacaaaagagat 28279455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 26520061 - 26520114
Alignment:
Q  161 tataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacaca 212  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26520061 tataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaacaca 26520114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 4552637 - 4552681
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagaga 4552681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 308
Target Start/End: Original strand, 8213579 - 8213615
Alignment:
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 308  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8213579 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 8213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31659406 - 31659362
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31659406 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagaga 31659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 87)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 18511056 - 18511323
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18511056 tgttgcgaattcgatgataaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 18511153  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
     ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  18511154 acacaagcaaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 18511253  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18511254 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 18511323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2724328 - 2724061
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2724328 tgttgcgaatttgatgaaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 2724231  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2724230 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgaaagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 2724131  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2724130 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 2724061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40221946 - 40221690
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40221946 aaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 40221849  T
Q  183 aaaacagcgagagaaaga---------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 273  Q
    |||||||||||||| |||         ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  40221848 aaaacagcgagagagagagagaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 40221749  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40221748 cgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 40221690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 658203 - 658464
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  658203 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtacggaacaataataa 658300  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||||    
T  658301 acataagccaaaagtagaaaacagcaagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct---ggggaga 658397  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  658398 gcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 658464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36209007 - 36208744
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36209007 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataa--taaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataa 36208910  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||    
T  36208909 tcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaa-acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggaaaga 36208812  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36208811 gcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 36208744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39854922 - 39854651
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  39854922 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaattat 39854825  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag 257  Q
    || ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  39854824 aaacacaagccaaaagtaaaaaacaacagcgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctggg 39854725  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39854724 ggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 39854651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 1189454 - 1189720
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  1189454 tgttgtgaattcgatgaaaa-cacaccaatatca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaa 1189550  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag-ggaga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  1189551 cacaagccaaaagtagaaaactgcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggaga 1189650  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1189651 gagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 1189720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 36402170 - 36402439
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  36402170 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaattata 36402267  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||    
T  36402268 aacacaagctaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctggggg 36402367  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36402368 agagagcagacatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaataataa 36402439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 696310 - 696045
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaa-ccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  696310 tgttgtgaattcgatgagaaaatcataccaataacaga--cttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaataaagtgtatggaacagttat 696213  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    || ||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  696212 aaacacaaac-aaaagtagaaaacaac-agagaaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggaga 696115  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  696114 gagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 696045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 41585580 - 41585840
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41585580 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 41585677  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga------aaga------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||      ||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  41585678 acacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagatagaacagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtt 41585777  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41585778 tgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaat 41585840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6745507 - 6745236
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||    
T  6745507 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaatta 6745410  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag 257  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6745409 taaacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagagaaaagaataagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctggg 6745310  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6745309 ggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6745236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6756926 - 6756675
Alignment:
Q  68 gttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||     
T  6756926 gttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaca-aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataaa 6756828  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  6756827 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagag 6756728  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6756727 agcagccct-cgtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaat 6756675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18597079 - 18596828
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18597079 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaataaagtgtatggaacaattataa 18596982  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  18596981 acacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagag 18596882  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596881 agcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 18596828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21289187 - 21288953
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  21289187 gaattcgatgaaaaatcacaccaatatca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaagaataataaacacaa 21289090  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagcgagagaa-agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21289089 gccaaaagtagaaaacaacgagagaacaaaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 21288990  T
Q  271 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 308  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  21288989 ctccgtttcactata-agatgagtaacgttacaaaaga 21288953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 332
Target Start/End: Original strand, 10474200 - 10474434
Alignment:
Q  100 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |     
T  10474200 ataaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaattagcgagagagaa 10474299  T
Q  199 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 296  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10474300 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaa 10474398  T
Q  297 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  10474399 ccttagaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 10474434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 317
Target Start/End: Original strand, 2818186 - 2818431
Alignment:
Q  75 attcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagc 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2818186 attcgatgaaaaacacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagc 2818283  T
Q  174 caaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcag 268  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2818284 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 2818383  T
Q  269 ccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2818384 tcctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 2818431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25904536 - 25904271
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25904536 tgttgcgaattcgatgagaaaacacacca-taa--taaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaacaaagtgtatggaacaattataa 25904440  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25904439 acacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 25904340  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  25904339 gagcagtcatccgtttcactata-tgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaataa 25904271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 316
Target Start/End: Original strand, 18509201 - 18509413
Alignment:
Q  107 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaag 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  18509201 tgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaag 18509300  T
Q  203 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18509301 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactata-tgatgagtaactttac 18509399  T
Q  303 aaaagagatatcaa 316  Q
    |||| |||||||||    
T  18509400 aaaatagatatcaa 18509413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21948464 - 21948194
Alignment:
Q  71 gcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatc 167  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |    
T  21948464 gcgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaattataaac 21948367  T
Q  168 acaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag---------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  21948366 acaagccaaaagtagaaaatagcgagagagagggagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggg 21948267  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21948266 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaataa 21948194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26097900
Alignment:
Q  106 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgag--agaaa-gaag 202  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacactagccaaaagtagaaaacagcgagatagaaaggaag 26098028  T
Q  203 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26098027 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactata-tgatgagtaacgttac 26097930  T
Q  303 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  26097929 aaaagagatatcaatgagttacaagaataa 26097900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 332
Target Start/End: Original strand, 17818351 - 17818601
Alignment:
Q  82 gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17818351 gaaaaccacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 17818448  T
Q  182 gaaaacagcgagagaaagaag-----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 276  Q
    ||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| || ||    
T  17818449 gaaaacagcgagagagagaaaggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgt 17818546  T
Q  277 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17818547 tccactgta-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17818601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 16092045 - 16092311
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||    
T  16092045 tgttgtgaattcgatgagaaaacgcaccaataaca--aacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa-caaagtatatggaacaattgtaa 16092141  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||   |||||    
T  16092142 acgcaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggaga 16092241  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16092242 gagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataa 16092311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2954843 - 2954586
Alignment:
Q  73 gaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata-atcaca 170  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||    
T  2954843 gaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatgtaacaca 2954746  T
Q  171 agccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |    
T  2954745 agccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatc 2954646  T
Q  270 cttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  2954645 cctccgcttcactata-tgatgagtaactttac-aaagagatatcaatgggttacaagaata 2954586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 20505687 - 20505952
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||    
T  20505687 tgttgtgaattcaatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaatta 20505784  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  20505785 taaacacaagccaaaactagaaaacaacgagagaaaataagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggg 20505882  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  20505883 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 20505952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24127291 - 24127024
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||| |||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  24127291 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacacaaataaca--aacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaattata 24127194  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24127193 aacataagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 24127094  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24127093 agagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 24127024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 37705626 - 37705891
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  37705626 tgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaacaaagtatatggaataattaaa 37705723  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37705724 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 37705821  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||  |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37705822 agaatagccattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 37705891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 312
Target Start/End: Original strand, 26098129 - 26098380
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26098129 tgttgcgaattcgatgagaaaactcacaccaatatca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattat 26098226  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-----aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gag 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | | |    
T  26098227 aaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatgggg 26098326  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagata 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26098327 ggagagagcagccctccgtttcaccata-tgatgagtaacgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38882526 - 38882274
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38882526 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 38882431  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    | ||||||||||||||||||||| || | || |      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  38882430 t-acaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagag 38882339  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38882338 cagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38882274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17073321 - 17073051
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgat--gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17073321 tgttgtgaattcgatccgaaaat-acaccaataa--taaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattata 17073225  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaga---agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    | |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |   ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  17073224 aacacaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggg 17073125  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17073124 gagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17073051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 31472458 - 31472709
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||  |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||    
T  31472458 tgttgcgaattcgatgaaaaatacacaccgataaca--aacttgatgtgtgaagtaagagatactcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttata 31472552  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa----gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    || |||| |||||| |||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  31472553 attacaaaccaaaattagaaaacaatgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatggggga 31472652  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472653 gagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 31472709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6747743 - 6747473
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||    
T  6747743 tgttgcgaattggatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaatta 6747646  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag 257  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6747645 taaacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgag 6747546  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||   ||||||||||||    
T  6747545 agagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatgagttacaagaataa 6747473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25804463 - 25804193
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25804463 tgttgcgtattcgatgaaaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-a 25804368  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25804367 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtct 25804269  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25804268 g-gggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25804193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 25921321 - 25921584
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaag 172  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25921321 gaattcgttgagaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aat-acaag 25921415  T
Q  173 ccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    ||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25921416 ccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 25921515  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25921516 gagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Original strand, 31465833 - 31466089
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31465833 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataaca--aatttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattata 31465930  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  31465931 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtg 31466030  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||||||          ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  31466031 agagcagcc----------ctata-tgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaata 31466089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 34476894 - 34477163
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  34476894 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aa 34476989  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34476990 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 34477088  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  34477089 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34477163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20043390 - 20043206
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatag-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 198  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20043390 aaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaag 20043291  T
Q  199 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 283  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  20043290 aaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcaaccattcgtttcacta 20043206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 34479259 - 34479528
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  34479259 tgttgcgaatttgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aa 34479354  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    |  ||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34479355 tg-caagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 34479453  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  34479454 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34479528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 68 - 332
Target Start/End: Original strand, 6661038 - 6661297
Alignment:
Q  68 gttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  6661038 gttgtgaattcgatgaaaatcacaccaattaaatat--ttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaac 6661133  T
Q  168 acaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagc 266  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||  | |||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6661134 acaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagaacacacga-aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagc 6661231  T
Q  267 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || | |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6661232 agtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6661297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4237065 - 4236797
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4237065 tgttgtgaattcgttgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 4236970  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||||||||||||||||||| ||         | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  4236969 -acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgg 4236872  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4236871 gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4236797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 10528937 - 10529210
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  10528937 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta- 10529032  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 252  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10529033 aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 10529131  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10529132 ctgggggagagagcagccttccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10529210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10587252 - 10587000
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  10587252 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataac--aaacttgatgtgtggagcaag-gataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaa 10587158  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagag 265  Q
     ||||| ||||||||||||||| || | || |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  10587157 tacaagtcaaaagtagaaaacaacg-gcgaga------agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagag 10587065  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  10587064 cagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttaaaagaataa 10587000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18467123 - 18466852
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  18467123 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacactaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 18467028  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18467027 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 18466928  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18466927 ggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18466852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16776577 - 16776326
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16776577 aaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataat-acaagccaaaagtag 16776481  T
Q  183 aaaaca---gcgagagaaa--gaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 275  Q
    ||||||   ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  16776480 aaaacaacagcgagagaaaaagaagagcgagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccg 16776381  T
Q  276 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     | ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16776380 atccactata-tgataagtaacgttacaaaagagaaatcaa-tggttacaagaataa 16776326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27912969 - 27912704
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||    
T  27912969 gaattcgatgaaaaatcccaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaa 27912874  T
Q  172 gccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    || ||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27912873 gctaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 27912774  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||   || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27912773 agagcagttctctgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27912704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 21684293 - 21684562
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21684293 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 21684388  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagc-gagag--------aaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||        ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21684389 t-aaaagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 21684487  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  21684488 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 21684562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20054267 - 20054021
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  20054267 ctgttgtgaattcgataaaaatcacactaataaaata--cttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataa 20054172  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggaga 262  Q
     ||||| | |||||||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| || ||  |||||    
T  20054171 acacaaac-aaaagtagaaaacgaagagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggaga 20054073  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatc 314  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054072 gagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc 20054021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39798468 - 39798215
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  39798468 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---atttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataa 39798374  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
      ||||||||||||||||||||| || | || |      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  39798373 atacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagag 39798281  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||||||| | ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  39798280 cagccctccgatccactata-cgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 39798215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2175341 - 2175087
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  2175341 tgttgtgaattcgatcaaaaaagtcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta- 2175246  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2175245 aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 2175154  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2175153 agcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2175087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4410458 - 4410191
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||     
T  4410458 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-aaggtgtatgga--agttataaa 4410365  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcg------agag---aaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||||||||||||||||||||||      ||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||     
T  4410364 tacaagccaaaagtagaaaacagcggcgaaaagagcacaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 4410265  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4410264 gggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaataggttacaagaataa 4410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27910872 - 27910618
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  27910872 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataa 27910777  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
      |||||| ||||||| |||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  27910776 atacaagctaaaagtataaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagag 27910684  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||  |||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27910683 cagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27910618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18469448 - 18469182
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18469448 tgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataa 18469353  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||     
T  18469352 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtct- 18469254  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 329  Q
     |||||||||||||  | |||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  18469253 -gggagagagcagctcttcgttccactaga-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 18469182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 332
Target Start/End: Original strand, 39397916 - 39398104
Alignment:
Q  134 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39397916 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaactcaagccaaaagtagaaaacagtgagag---------agaacacaaaagaatgttttgacctagtt 39398006  T
Q  234 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39398007 cggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactata-taattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 39398104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 331
Target Start/End: Original strand, 38959971 - 38960241
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  38959971 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttata 38960065  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcg------------agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 252  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||            | ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||    
T  38960066 aatacaagccaaaagtagaaaacaacgacaagaagaacaaaagaaaaaaga-agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagt 38960164  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
     || |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  38960165 ttgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 38960241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10750137 - 10749869
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  10750137 tgttgtgaattcgatcaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aa 10750042  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  10750041 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacac-aaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 10749944  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10749943 ggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10749869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 306
Target Start/End: Original strand, 12555779 - 12556008
Alignment:
Q  87 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 186  Q
    ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12555779 tcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaa 12555876  T
Q  187 cagcgagag-------------aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 273  Q
    || ||||||             | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||| ||||||| ||    
T  12555877 caacgagagagaaaagaagagaagagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctc 12555976  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 306  Q
    |||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  12555977 cgtttcgcttta-agatgagtaacgttacaaaa 12556008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10757613 - 10757345
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  10757613 tgttgtgaattcgatcaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aa 10757518  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||    
T  10757517 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacac-aaagaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctg 10757420  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  10757419 ggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagaaaaatcaatgggttacaagaataa 10757345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9020649 - 9020386
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||     
T  9020649 tgttgtgaattcaatgaaaatcacacgaataaaatat--ttgatctgtggagcaattaataatcaagcaaccaaat-aaagtgtattgaa--gttataaa 9020555  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagaga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggaga 262  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||   |||||  | ||  |||||    
T  9020554 cacaagc-aaaagtagaaaataacgatagaaaagaagagagagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggaga 9020456  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9020455 gagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9020386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Original strand, 34530559 - 34530692
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34530559 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattataa 34530656  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 201  Q
     |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  34530657 acacaagtcaaaagtagacaacagcaacagaaagaa 34530692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 3372977 - 3373247
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |    
T  3372977 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-a 3373072  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  3373073 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagagcaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 3373171  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||||||| || |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3373172 gggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3373247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 330
Target Start/End: Original strand, 15445135 - 15445376
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||| ||| ||   |||||| ||||||| |||  |||    
T  15445135 aaaaacacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaatcaaaacaacgtggatgaaaa--ttataaacacaagcaaaagatag 15445228  T
Q  183 aaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 280  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| | |||| ||    
T  15445229 aaaacatcgagagaaagaa-agagaaaacacacgaaatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctg-ggaagagagcagcccttcgttcca 15445326  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15445327 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 15445376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20045386 - 20045290
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 198  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20045386 aaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacgagagaaa 20045290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 31179213 - 31179481
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  31179213 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataat--taa 31179307  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
     ||||||||||||||||||    ||| |||||      | ||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  31179308 acacaagccaaaagtagaagaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaga--aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 31179405  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  31179406 gggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatgaatgggttacaagaataa 31179481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31543153 - 31542939
Alignment:
Q  85 aatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 184  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  31543153 aatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaa 31543059  T
Q  185 aaca---gcga-gag----aaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 274  Q
    ||||   |||| |||    ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  31543058 aacaacggcgaggagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 31542959  T
Q  275 gtttcactatagtgatgagta 295  Q
      | ||||||| |||||||||    
T  31542958 aatccactata-tgatgagta 31542939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4898068 - 4897899
Alignment:
Q  160 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgag 257  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || | |||||| || || |    
T  4898068 ttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa-agaggaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatggg 4897972  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||| |||||||  | ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  4897971 ggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaat 4897899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Original strand, 15354560 - 15354684
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| |||| |    
T  15354560 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-a 15354657  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  15354658 aagagaaatcaatgggttacaagaata 15354684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15552685 - 15552414
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||  ||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  15552685 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaca---acttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaa--gttata 15552591  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||| |||||||||||| |   ||||||       ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  15552590 aatacaagctaaaagtagaaaataatggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 15552491  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15552490 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15552414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23665337 - 23665213
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23665337 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23665240  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  23665239 aagagaaatcaatgggttacaagaata 23665213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Original strand, 23741844 - 23741968
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23741844 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23741941  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  23741942 aagagaaatcaatgggttacaagaata 23741968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Original strand, 23793250 - 23793374
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23793250 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23793347  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  23793348 aagagaaatcaatgggttacaagaata 23793374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15143817 - 15143634
Alignment:
Q  152 tggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgac 247  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||| || | ||||    
T  15143817 tggaacaattataaacacaaacaaaaagtagaaaaaatagcgagagaaaagtagagagaacacacga-aatttgtttacccatttcggtcaaatactgac 15143719  T
Q  248 ctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || ||||  |||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15143718 ctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 15143634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Original strand, 15356836 - 15356960
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| |||| |    
T  15356836 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-a 15356933  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  15356934 aagagaaatcaatgggttacaagaata 15356960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 332
Target Start/End: Original strand, 17413198 - 17413278
Alignment:
Q  252 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17413198 tctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 17413278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31545374 - 31545249
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||   |||| |    
T  31545374 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttac-a 31545277  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  31545276 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 31545249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 2144504 - 2144647
Alignment:
Q  155 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 252  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||        |||||||||||| | ||   | ||    
T  2144504 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttc-------agttcggtccaatactggtttagt 2144594  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2144595 ttgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 2144647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35430506 - 35430365
Alignment:
Q  175 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 273  Q
    |||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||| | ||||||  ||| | ||||| || ||| |||    
T  35430506 aaaattagaaaacaacgagggagaagagaaagaacacaagagaatttgtttatccagttcagtccaatactgacctactctaaaggagataggagctttc 35430407  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35430406 cgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 35430365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42771023 - 42770978
Alignment:
Q  287 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42771023 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataa 42770978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 156
Target Start/End: Original strand, 23741696 - 23741785
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 156  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23741696 ctgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 23741785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Original strand, 15354414 - 15354502
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 156  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15354414 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 15354502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Original strand, 15356690 - 15356778
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 156  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15356690 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 15356778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23665484 - 23665396
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 156  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23665484 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 23665396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Original strand, 23793103 - 23793191
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 156  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23793103 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 23793191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 332
Target Start/End: Original strand, 34530724 - 34530777
Alignment:
Q  279 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  34530724 cactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 34530777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20045268 - 20045210
Alignment:
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  20045268 tccgtttctctataatgataagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttaaaagaat 20045210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31545502 - 31545404
Alignment:
Q  85 aatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 184  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| | || ||||||||  |||| |||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  31545502 aatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggttaatcaagcaattaaaataaagcgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaa 31545408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42771167 - 42771064
Alignment:
Q  105 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaaga 203  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||  ||  |||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  42771167 cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagtaaccaaataaa--tgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcaagagaaatgaaga 42771073  T
Q  204 gagaacaca 212  Q
    |||||||||    
T  42771072 gagaacaca 42771064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281804
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagc 10281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300644
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagag 31300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19008052 - 19007784
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19008052 ctgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattat 19007955  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19007954 aaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaatgaatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 19007855  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19007854 gagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 19007784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 332
Target Start/End: Original strand, 28459036 - 28459301
Alignment:
Q  65 cctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28459036 cctgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaaca--cttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 28459133  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  28459134 aacacaaaccaaaagtagaaaacagggagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtct-aggtagag 28459232  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28459233 agaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28459301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 115 - 332
Target Start/End: Original strand, 22407346 - 22407565
Alignment:
Q  115 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||    
T  22407346 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagagaaaggaagagagaacac 22407445  T
Q  212 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22407446 aaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 22407544  T
Q  312 atcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  22407545 atcaatgggttacaagaataa 22407565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14837680 - 14837411
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14837680 ctgttgtgaattcgatgagaaatcacatcaataaca-atacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattata 14837582  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14837581 aacacaagccaaaagtataaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 14837482  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14837481 agagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 14837411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 43623423 - 43623691
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  43623423 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataact--aacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattata 43623520  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  43623521 atcataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttggggga 43623620  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43623621 gagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 43623691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 6263993 - 6264260
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  6263993 tgttgtgaattcgatgagaaaacacactaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatta 6264090  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6264091 acacaagccgaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 6264190  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6264191 gagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6264260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 6258668 - 6258928
Alignment:
Q  73 gaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6258668 gaattcgatgagaaaacataccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtctggaacaattataaacacaa 6258765  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcag 268  Q
    || |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  6258766 gctaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcag 6258864  T
Q  269 ccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6258865 ccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6258928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17849532 - 17849261
Alignment:
Q  63 atcctgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagt 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17849532 atcctgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat 17849435  T
Q  161 tataatcacaagccaaaagtagaaaaca--gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag 257  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || || |    
T  17849434 tttaaacacaagccaaaagtagaaaacaacgggagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtg 17849335  T
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  17849334 ggagagagcagcc-cccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 17849261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28197045 - 28196781
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28197045 tgttgtgagttcgatgaaaaatcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 28196948  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  28196947 acacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggaga 28196850  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28196849 gagcagccattcgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28196781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 22287181 - 22287447
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22287181 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacatagtgtatggaacaattataa 22287278  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
      ||||| |||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  22287279 aaacaagtcaaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 22287378  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22287379 gagcagccctccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 22287447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 66 - 310
Target Start/End: Original strand, 22162868 - 22163111
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |  ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22162868 ctgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--attttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaattgtatggaacagttata 22162965  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22162966 agcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagag 22163065  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 310  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22163066 agcagctctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 42923373 - 42923620
Alignment:
Q  88 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 186  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  42923373 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 42923470  T
Q  187 cagcgagaga-----aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 281  Q
    || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  42923471 caacgagagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcac 42923570  T
Q  282 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42923571 tata-tgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 42923620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 330
Target Start/End: Original strand, 21520534 - 21520802
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  21520534 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattata 21520631  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    | |||||||||||||||||||||| |     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21520632 aacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagagaaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggg 21520731  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21520732 gagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 21520802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 22707595 - 22707864
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22707595 tgttgcgaattcgatgagaaaaccacaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaaggaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 22707692  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagg-g 259  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  22707693 aacacaaggcagaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggag 22707792  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22707793 agagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 5375224 - 5375457
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagaga---a 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |||| |||| |||||   |    
T  5375224 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtaaaaaaacagcaagagagaaa 5375323  T
Q  198 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  5375324 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaat 5375422  T
Q  298 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5375423 gttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 5375457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3022562 - 3022362
Alignment:
Q  86 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 185  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  3022562 atcacacaaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagcagaaa 3022465  T
Q  186 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 282  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  3022464 acaacgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcatt 3022365  T
Q  283 ata 285  Q
    |||    
T  3022364 ata 3022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17848814 - 17848585
Alignment:
Q  103 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 200  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17848814 aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaattataaacgcaaacaaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 17848715  T
Q  201 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17848714 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgtt 17848616  T
Q  301 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17848615 acaaaagagatatcaa-tggttacaagaataa 17848585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 332
Target Start/End: Original strand, 45279844 - 45280095
Alignment:
Q  69 ttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  45279844 ttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat- 45279938  T
Q  168 acaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45279939 acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 45280031  T
Q  268 gccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  45280032 gccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 45280095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 106 - 332
Target Start/End: Original strand, 31732666 - 31732888
Alignment:
Q  106 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 205  Q
    ||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  31732666 ttgatgtgtgaagcaagttataatcaagcaaccaaaacagagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagataga 31732763  T
Q  206 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    |||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31732764 gaacacac--gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaa 31732861  T
Q  306 agagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    
T  31732862 agagatatcaatgggttacaagaataa 31732888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27105209 - 27104942
Alignment:
Q  70 tgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||      
T  27105209 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aatg- 27105114  T
Q  169 caagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27105113 caagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 27105014  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27105013 gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaatgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27104942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 23452084 - 23452348
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  23452084 gaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaa 23452178  T
Q  172 gccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    || ||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23452179 gctaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 23452278  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  23452279 agagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23452348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 138 - 332
Target Start/End: Original strand, 44288982 - 44289179
Alignment:
Q  138 caaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 234  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44288982 caaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaacagtagaaaacagcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 44289081  T
Q  235 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  44289082 ggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 44289179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 333
Target Start/End: Original strand, 11739421 - 11739672
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11739421 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtagagcaagggatagtcaagaaataaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 11739518  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
      ||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11739519 atacaagtcaaaagg--------------gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 11739604  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataat 333  Q
    ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11739605 cagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaataat 11739672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 45238842 - 45239088
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgg-aacagttat 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||    
T  45238842 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtggatatcaacagttat 45238939  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||                    ||||| ||||||    
T  45238940 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgaccta--------------------gtctgggggaga 45239019  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45239020 gagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 45239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 332
Target Start/End: Original strand, 40031968 - 40032169
Alignment:
Q  139 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 233  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40031968 aaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagc-aaatgtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagtt 40032066  T
Q  234 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag----agatatcaattgattacaagaa 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||| | |||||||||    
T  40032067 cggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaa 40032166  T
Q  330 taa 332  Q
    |||    
T  40032167 taa 40032169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23871230 - 23870960
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--cagtt 161  Q
    ||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||  || ||||| |||||||||||  | | | ||  ||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  23871230 ctgttgcaaattcgatgagaaaactacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaaggaacaattaaataaccaaaacaaagtgtatgaaaaacaatt 23871133  T
Q  162 ataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--agagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  23871132 ataaacacaaggcaaaagtagaaaacagcgggagagaaatgaagagagaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagg 23871033  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  23871032 gagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataa 23870960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 7462824 - 7463059
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagaa- 197  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||     
T  7462824 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 7462923  T
Q  198 -agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 295  Q
     ||||||||||||||||     ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||    
T  7462924 gagaagagagaacacaatttttttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-taatgggta 7463022  T
Q  296 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  7463023 acgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 7463059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 19501843 - 19502122
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  19501843 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 19501937  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca------------gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 246  Q
      ||||||||||||||||||| |            || |||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19501938 atacaagccaaaagtagaaaaaaaaaaaaacaacggcaagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 19502037  T
Q  247 cctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19502038 cctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 19502122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 34979456 - 34979690
Alignment:
Q  88 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 187  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  34979456 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacataagtcaaaagtagaaaac 34979553  T
Q  188 agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatag 286  Q
    ||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  34979554 agcgagag---------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataa 34979644  T
Q  287 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34979645 tgatgaggaaccttacaaaagagatataaatggattacaagaataa 34979690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22874519 - 22874274
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  22874519 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 22874424  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
                       |||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22874423 -------------------aacaacgagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagag 22874343  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  22874342 agcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 22874274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 13909907 - 13910155
Alignment:
Q  87 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 186  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13909907 tcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa 13910001  T
Q  187 ca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 276  Q
    ||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |     
T  13910002 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctga 13910101  T
Q  277 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  13910102 tccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13910155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 332
Target Start/End: Original strand, 18800251 - 18800425
Alignment:
Q  158 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg 255  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18800251 agttataatcgcaagc-aaaagtagaaaacagcagaagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctg 18800349  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18800350 -gggagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18800425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 19504178 - 19504457
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  19504178 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 19504272  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa------------aacagcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 246  Q
      |||||||||||||||||            ||| || ||| |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19504273 atacaagccaaaagtagaagaaaaaaaaaacaacggcaagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 19504372  T
Q  247 cctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19504373 cctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 19504457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 11577991 - 11578220
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11577991 aaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtatatggaa--gtt-taaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 11578087  T
Q  202 gagagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 299  Q
     |||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  11578088 aagagaaaacacacgaaatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaacct 11578187  T
Q  300 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11578188 tacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 11578220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 24162062 - 24162333
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||     
T  24162062 ctgttgtgaatacgatgaaaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaaaaaagtgtatgaaacaatta- 24162157  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  24162158 aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtc 24162256  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     | |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  24162257 cgggggagagagcagccatccaatccactata-tgatgagtagcattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24162333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Original strand, 15539396 - 15539553
Alignment:
Q  87 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 186  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15539396 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaag-gattatcaagcaatcaaaacaaagtgtattgaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaa 15539492  T
Q  187 cagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt 244  Q
    || ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15539493 caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 17897134 - 17897357
Alignment:
Q  104 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 202  Q
    ||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17897134 acttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaaaacaaagttgatg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaag 17897228  T
Q  203 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 301  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17897229 agagaacacacga-aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaacttta 17897326  T
Q  302 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  17897327 caaaatagatatcaaagggttacaagaataa 17897357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42064878 - 42064659
Alignment:
Q  103 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 202  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||   | ||||||    
T  42064878 aacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaacaacg---gcaagaag 42064784  T
Q  203 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 301  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||   |||    
T  42064783 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgtta 42064689  T
Q  302 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  42064688 c-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 42064659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452925
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 42452953  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  42452952 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 42452925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 36560981 - 36561251
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  36560981 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aa 36561076  T
Q  166 tcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | || |||||||| ||||||||||   ||||||      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  36561077 t-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 36561175  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  36561176 gggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36561251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 36558721 - 36558974
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  36558721 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataata---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aa 36558816  T
Q  166 tcacaagccaaaa-gtagaaaacagc-gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    | || |||||||| |||||||||| | | |||||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  36558817 t-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaa--------gaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 36558907  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  36558908 agcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36558974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38020473 - 38020360
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38020473 aaaatcacaccaataaca--aatttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagctaaaagtag 38020376  T
Q  183 aaaacagcgagagaaa 198  Q
    |||||||||| |||||    
T  38020375 aaaacagcgaaagaaa 38020360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Original strand, 20146540 - 20146704
Alignment:
Q  153 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 249  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||| |    
T  20146540 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagatcacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgactt 20146637  T
Q  250 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146638 agtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 20146704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 35217827 - 35218073
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||    
T  35217827 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtag 35217921  T
Q  183 aaaaca---gcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 278  Q
    ||||||   ||||||  || || || ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  |     
T  35217922 aaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35218021  T
Q  279 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  35218022 cactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaacgggttacaagaataa 35218073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40699697 - 40699518
Alignment:
Q  154 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 250  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||     
T  40699697 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaaatagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaatactgaccta 40699600  T
Q  251 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||| |||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  40699599 gtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataa 40699518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20592484 - 20592288
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||  | |||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20592484 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaaata--cgtgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttata 20592389  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggaga 262  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||  | |||||||| | | | |||||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  20592388 atcacaag-caaaagtagaaaatatcaagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttatccaattcggtccaatactgacctagtctgggggaga 20592291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 42453890 - 42453802
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaaca 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42453890 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaaca 42453802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 45332020 - 45332291
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || || |||| ||| ||    
T  45332020 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtttgtaacaatta-aa 45332115  T
Q  166 tcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    | ||||||||||| ||||||||||   ||||||       ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  45332116 t-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 45332214  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  45332215 tgggggagagagcagccctccaattcactata-tgatgagtacctttac-aaagagaaatcaatgggttacaataataa 45332291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 35215450 - 35215696
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||| || | ||| ||| ||||| |||||||||    
T  35215450 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcatatgaaataatta-aat-acaagtcaaaagtag 35215544  T
Q  183 aaaaca---gcgagagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 278  Q
    ||||||   ||||||  || || ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  |     
T  35215545 aaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35215644  T
Q  279 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  35215645 cactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 35215696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 37962791 - 37963050
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| || ||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  37962791 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataa--taaacttgatgtgtggagtaagtgataattaagtaatcaaaacagagtgtatagaa--gttataa 37962886  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    ||||||   |||||||||||||| |  ||||||   || ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || || | |||||    
T  37962887 tcacaaat-aaaagtagaaaacaacttgagaaaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagag 37962984  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||| |  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||    
T  37962985 atcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaatggattacaagaataa 37963050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35107590 - 35107458
Alignment:
Q  183 aaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 279  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||| |  ||||| || || |||||| |    
T  35107590 aaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttcc 35107491  T
Q  280 actatagtgatgagtaactttacaaaagagata 312  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35107490 actataatgatgagtaacattacaaaagagata 35107458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20589895 - 20589835
Alignment:
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  20589895 tccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataa 20589835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Original strand, 38414071 - 38414155
Alignment:
Q  112 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 196  Q
    ||||||||| | |||| | | ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  38414071 tgtggagcacgtgataattaggcaacgaaaacaaagtgtatggaataattataaacacaaggtaaaagtagaaaacaacgagaga 38414155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17921996 - 17921871
Alignment:
Q  175 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 273  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||||||| || || ||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  17921996 aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-gagagaacatacgaaaatttgtttacttaattcggtcaaatactgacctagtctg-ggtagagagcagccctc 17921899  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaacttta 301  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17921898 cgttccactataatgatgactaacttta 17921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15694108 - 15694050
Alignment:
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15694108 tccgttccactaaaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaat 15694050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33604140 - 33604092
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33604140 gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 33604092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39287361 - 39287262
Alignment:
Q  208 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 306  Q
    |||||||| || ||||| | | |||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39287361 acacaaaataacttgtttaacaagtttggtccaacactgacctagtatgagggagagagcagctcttcgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 332
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136236
Alignment:
Q  291 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 27136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 332
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828454
Alignment:
Q  217 aatttgttgacctagttcggtcca-aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 315  Q
    |||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||   | ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  316 attgattacaagaataa 332  Q
    |  |  |||||||||||    
T  13828438 aagggctacaagaataa 13828454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17943723 - 17943631
Alignment:
Q  214 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  17943723 aagaatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa 17943631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 14231 - 14493
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14231 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 14327  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  14328 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagag 14425  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14426 agcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 14493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15369 - 15196
Alignment:
Q  156 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga-gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  |    
T  15369 acagttataatcacaa-acaaaagtagaaaacaacatgataaaagaagagagaacac--aagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcat 15273  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15272 gggggagacagcagccttccgttccactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15073202 - 15072935
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15073202 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataa 15073105  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  15073104 acacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggag 15073005  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15073004 agagcagccctccgttccactgta-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15072935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 14419035 - 14419302
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14419035 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 14419132  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14419133 acacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 14419232  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  14419233 gagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaataa 14419302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 332
Target Start/End: Original strand, 30480364 - 30480614
Alignment:
Q  82 gaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  30480364 gaaaatgacaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagta 30480461  T
Q  182 gaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 278  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  30480462 gaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccattt 30480561  T
Q  279 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30480562 cactata-tgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 30480614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41383154 - 41382901
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatc-acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41383154 tgttgcgagttcgatgaaaaaccacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtttatggaacaattataa 41383057  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
     ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41383056 acacaagccagaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 41382957  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41382956 gagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 41382901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25953010 - 25952744
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||    
T  25953010 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaagcaattataa 25952913  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25952912 acacaatccaaaagtagaaaacggcgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagag 25952813  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25952812 agcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 25952744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15068472 - 15068205
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15068472 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaacaaca--aacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaa 15068375  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  15068374 acacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggag 15068275  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15068274 agagcagccctccgttccattata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15068205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15956443 - 15956181
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  15956443 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataa 15956348  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15956347 tcacaaacgaaa-gtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagaga 15956249  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15956248 gaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15956181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 313
Target Start/End: Original strand, 13858330 - 13858577
Alignment:
Q  63 atcctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagtt 161  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13858330 atcctgttgtaaattcgatgaaaaatcacaccaataaga--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gtt 13858425  T
Q  162 ataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggga 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13858426 ataaacacaagccaaaagtagaaaacagtgagagaaagaaagggagaacacaaa-gaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctggggga 13858524  T
Q  261 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 313  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13858525 gagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 13858577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 317
Target Start/End: Original strand, 33541254 - 33541506
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33541254 ctgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaataaagtgtatggaacaattata 33541351  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33541352 aacacaagccaaaagtagaaatcagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggag 33541451  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33541452 agagcagccttccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 33541506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36866014 - 36865759
Alignment:
Q  81 tgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  36866014 tgaaaaccacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacaaaagccaaaagt 36865917  T
Q  181 agaaaacagcgagagaaagaa-----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttcc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||     || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  36865916 agaaaacaacgagagaaagaaaaaaagacagaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattcc 36865817  T
Q  275 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  36865816 gtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 36865759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 28251410 - 28251678
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28251410 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattata 28251506  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||    
T  28251507 atcacaagccacaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg 28251606  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  28251607 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttataagaataa 28251678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 27106747 - 27107008
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27106747 tgttgcaaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 27106842  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |    
T  27106843 tcaca-gacaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagata 27106941  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  27106942 gcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggttacaagaataa 27107008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Original strand, 15185564 - 15185825
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15185564 tgttgtgaattcggtgaaaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataa 15185659  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    ||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15185660 tcataaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 15185758  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
     ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15185759 acagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15185825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 2467979 - 2468241
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2467979 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtagggaa--gttataat 2468074  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||    
T  2468075 cacaaaacaaaattagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagaga 2468173  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  2468174 gcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaataa 2468241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14808252 - 14807975
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14808252 tgttgcgcattcgatgaaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattata 14808155  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct------- 254  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||           
T  14808154 aacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 14808055  T
Q  255 ---gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
       | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14808054 agagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14807975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21482798 - 21482534
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||    
T  21482798 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaa--gttat 21482703  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  21482702 aatcacaaac-aaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggag 21482605  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21482604 agagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 21482534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27829791 - 27829521
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27829791 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 27829695  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | | ||| |||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27829694 t-ataagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 27829596  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27829595 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27829521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27827479 - 27827210
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27827479 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 27827383  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||| |||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  27827382 -acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgg 27827284  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27827283 gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27827210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3874487 - 3874234
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3874487 tgttgtgaattcgttgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 3874392  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3874391 t-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 3874300  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3874299 cagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3874234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15809712 - 15809442
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  15809712 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aa 15809617  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||| ||||| |||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15809616 t-acaaggcaaaaatagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 15809518  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     || ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15809517 gggaagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15809442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41385233 - 41384983
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaa-gtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41385233 tgttgcgaattccatgaaaaatcacacaaataaca--aacttg----gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaattata 41385140  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    | ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||    
T  41385139 aacacaagccaaaagtataaaacaacagcgagagaaatggaagagagaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg 41385040  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41385039 agagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 41384983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32339803 - 32339533
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  32339803 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aa 32339708  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||| |   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32339707 t-acaagtcaaaagtagaaaataacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctg 32339609  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32339608 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32339533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1225568 - 1225390
Alignment:
Q  155 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1225568 aacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagta 1225469  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  1225468 tgagggagagagcggccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 1225390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4424512 - 4424242
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  4424512 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 4424417  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4424416 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 4424318  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  4424317 ggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataa 4424242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43530609 - 43530339
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43530609 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 43530514  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   || ||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43530513 t-acaagccaaaagtagaaaacaatggcaagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 43530415  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     | |||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  43530414 ggagagacagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataa 43530339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 35872301 - 35872551
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  35872301 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataa 35872398  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             ||||||||    
T  35872399 acacaagccaaaagtagaaaacaagagaga-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagaga 35872484  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  35872485 gcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataa 35872551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 37214109 - 37214319
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37214109 tgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataa 37214206  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  37214207 acacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtaga 37214306  T
Q  263 gagcagccttccg 275  Q
    |||||||| ||||    
T  37214307 gagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 3005486 - 3005743
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  3005486 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaa 3005580  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagag 265  Q
     |||||  |||||    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  3005581 tacaag--aaaaggtacaaacaacgagagaagaaagggagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagag 3005676  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3005677 cacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 3005743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 5372043 - 5372289
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5372043 aaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaacagttataaactcaagccaaaagta 5372140  T
Q  182 gaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttca 280  Q
    |||||||  |||||||||||   |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||||    
T  5372141 gaaaacaatgagagaaagaa---agaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttca 5372237  T
Q  281 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  5372238 ctataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataa 5372289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21480990 - 21480726
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| || | |||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||    
T  21480990 tgttgtgaattcgatgaaaaataacaccaataa--taaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaa--gttat 21480895  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||  | | ||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  21480894 aatcacaaac-aaaagaagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacacga-attttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctgggggag 21480797  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21480796 agagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 21480726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 28283062 - 28283330
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |   ||||    
T  28283062 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaaaaa--ataa 28283156  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28283157 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 28283256  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | || |||||||||    
T  28283257 -gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttgcaagaataa 28283330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 609230 - 608958
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |    
T  609230 tgttgtgaattcgatgaaaatcgcaccaataaca---acttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaatta-a 609135  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||         | | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  609134 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcaagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtc 609036  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  609035 tgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 608958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18813377 - 18813106
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  18813377 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta- 18813282  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaa---acagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||   || |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  18813281 aat-acaagccaaaagtagaaaacgacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaata 18813183  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18813182 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18813106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Original strand, 22684491 - 22684749
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatg---aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  22684491 tgttgcgaattcgatggaaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaatta 22684587  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 252  Q
     ||| |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  22684588 -aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaat 22684685  T
Q  253 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22684686 ctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaatagagaaatcaat 22684749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18811202 - 18810932
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  18811202 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-a 18811107  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaa---acagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || ||||||||||||||||||   ||||||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||    
T  18811106 at-acaagccaaaagtagaaaacgacagcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatct 18811008  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18811007 gggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18810932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31162686 - 31162433
Alignment:
Q  80 atgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaag 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  31162686 atgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaag 31162591  T
Q  180 tagaaaacagcgagagaaag---aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgaggg--agagagcagccttc 273  Q
    ||||||||| |||||||||    || ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||||| ||    
T  31162590 tagaaaacaacgagagaaaagaaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctc 31162492  T
Q  274 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  31162491 tgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31162433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14477740 - 14477520
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  14477740 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatcataa 14477643  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
     ||||||||||||  | |||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| || |     
T  14477642 acacaagccaaaa-aaaaaaaaagcgagagagaaaagaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaa 14477544  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactata 285  Q
    |||| |||| ||||||||||||||    
T  14477543 agagtagccatccgtttcactata 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 181901 - 181798
Alignment:
Q  134 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  181901 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagt 181802  T
Q  233 tcgg 236  Q
    ||||    
T  181801 tcgg 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44721318 - 44721068
Alignment:
Q  85 aatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 184  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  44721318 aatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaa 44721224  T
Q  185 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 274  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  44721223 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctcc 44721124  T
Q  275 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  44721123 aatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 44721068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27911367 - 27911238
Alignment:
Q  201 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27911367 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27911270  T
Q  301 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  27911269 acaatagagatatcaatgagttacaagaataa 27911238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27957786 - 27957657
Alignment:
Q  201 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27957786 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27957689  T
Q  301 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  27957688 acaatagagatatcaatgagttacaagaataa 27957657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31035602 - 31035342
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||    ||||||||||||||| | ||| |||   |||||| ||| ||    
T  31035602 tgttgtgaattcgttaaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggaggaaat--tagtcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaacaattaaaa 31035510  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg--gtctgagggag 261  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||   ||||| |||||    
T  31035509 acacaagc-aaaactagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggag 31035412  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  31035411 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaagggttacaagaataa 31035342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43082450 - 43082198
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||    
T  43082450 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtag 43082356  T
Q  183 aaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||    |||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  43082355 aaaacaacgtcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 43082256  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43082255 ccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43082198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 31578216 - 31578387
Alignment:
Q  155 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 253  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||| |||||||||| | | |||||| |||    
T  31578216 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaga-gagagcacacaaaa---tttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtc 31578310  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |  ||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  31578311 taggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaat 31578387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43080079 - 43079827
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  43080079 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagtcaaaagtag 43079985  T
Q  183 aaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 272  Q
    ||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  43079984 aaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 43079885  T
Q  273 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43079884 ccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43079827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Original strand, 3883436 - 3883553
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3883436 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataaca---acttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 3883531  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca 188  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  3883532 t-acaagccaaaagtagaaaaca 3883553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6376354 - 6376229
Alignment:
Q  191 gagagaaaga-agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  6376354 gagagaaagagagagagaacacacaa-aatttgtttactaagttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatg 6376256  T
Q  289 atgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6376255 atgagtaactttac-aaagagatatcaa 6376229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16833854 - 16833777
Alignment:
Q  251 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaaga 328  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16833854 gtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaaatgattacaaga 16833777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27911550 - 27911441
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27911550 aaaatcacaccaataaaa--aacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtag 27911455  T
Q  183 aaaacagcgagaga 196  Q
    |||||| |||||||    
T  27911454 aaaacaacgagaga 27911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27957969 - 27957860
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27957969 aaaatcacaccaataaaa--aacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtag 27957874  T
Q  183 aaaacagcgagaga 196  Q
    |||||| |||||||    
T  27957873 aaaacaacgagaga 27957860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 188
Target Start/End: Original strand, 24873038 - 24873158
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttat 163  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||  | ||||||    
T  24873038 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatg--aaagttat 24873132  T
Q  164 aatcacaagccaaaa-gtagaaaaca 188  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24873133 aaatacaagccaaaaggtagaaaaca 24873158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3896121 - 3896063
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 315  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3896121 gggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 3896063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 313  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 181797 - 181726
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  181797 gggagagagcagtcatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataa 181726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 121
Target Start/End: Original strand, 2467887 - 2467932
Alignment:
Q  74 aattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  2467887 aattcgatgaaaatcacaccaata--ataaacttgatgtgtggagcaa 2467932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 183310 - 183246
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  183310 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa 183246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Original strand, 31566493 - 31566578
Alignment:
Q  155 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 241  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  31566493 aacaattataaacacaagc-agaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaactcacga-aatttgtttacccagttcggtccaa 31566578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752438
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagc 19752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28228714 - 28228669
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 249  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28228714 agaacacaaaagaatgtgtttacctagttcggtccaatattgacct 28228669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573835
Alignment:
Q  289 atgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaat 31573835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9020398 - 9020129
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9020398 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 9020301  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
      |||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||    
T  9020300 atacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttggggg 9020201  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9020200 agagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9020129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 24338295 - 24338558
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24338295 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 24338392  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 264  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||    
T  24338393 acacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtct--gggggaga 24338490  T
Q  265 gcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24338491 gcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24338558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 11982872 - 11983140
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11982872 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaa 11982968  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11982969 tcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggg 11983068  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11983069 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11983140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 3629711 - 3629975
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3629711 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 3629808  T
Q  166 tcacaagcc-aaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  3629809 acacaagccaaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagag 3629907  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3629908 agcagccctcagtttcactata-ttattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3629975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 3631784 - 3632049
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3631784 tgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataaca--aacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 3631881  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  3631882 acacaagccaaaagtagaaaacatcgagagaaaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggaca 3631979  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3631980 gagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3632049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 310
Target Start/End: Original strand, 30728673 - 30728913
Alignment:
Q  71 gcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcac 169  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  30728673 gcgaattcgttgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatac 30728770  T
Q  170 aagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30728771 aagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagc 30728870  T
Q  267 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 310  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30728871 agccttccgttccactataat-atgagtaactttacaaaagaga 30728913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15346806 - 15346550
Alignment:
Q  74 aattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaag 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  15346806 aattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaag 15346709  T
Q  173 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  15346708 ccaaaagtagaaaacaacaagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctt 15346610  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15346609 tccgtttcactata-tgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaagaataa 15346550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15367498 - 15367234
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15367498 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 15367401  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-gagag 263  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15367400 acacaagccaaaagtagaaaaatacgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagag 15367302  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  15367301 agcagccttccgtttcactata-tgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaagaataa 15367234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 332
Target Start/End: Original strand, 1069557 - 1069830
Alignment:
Q  61 ttatcctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacag 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||  || | ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  1069557 ttatcctgttgtgaattcgatgagaaaatataccaataaca--aattcgatgtatggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaa 1069654  T
Q  160 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||     
T  1069655 ttataaacacaagcaaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatgg 1069754  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1069755 ggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 28241163 - 28241432
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28241163 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 28241258  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||||||||||||||||||| ||         | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||     
T  28241259 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgg 28241357  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28241358 gggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28241432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13057659 - 13057397
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||   | |||| ||||||    
T  13057659 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaata-aaagtgg--gcaacaattataa 13057565  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  13057564 tcacaaac-aaaagtagaaaacagatagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagag 13057466  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13057465 agtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13057397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Original strand, 15540990 - 15541250
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||   | |||||||||||    
T  15540990 tgttgcgacttcgatgaaaaatcaaaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaacaagttg---gtaacagttataa 15541084  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||| | |||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||    
T  15541085 tcacaaac-aaaattagaaaacaacgagagagaaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagag 15541183  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15541184 agcagctttctgtttcactata-tgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15541250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 1230090 - 1230360
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |      
T  1230090 tgttgcgaattcgataaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattaaata 1230186  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
    || |||||||||||| ||||||   ||||||  ||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  1230187 ca-aagccaaaagtataaaacaacggcgagaagaacacaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 1230285  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1230286 gggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1230360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 14507018 - 14507286
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14507018 tgttgcaaattcgatgaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 14507113  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  14507114 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 14507212  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14507213 gggagagagcagccctccgattcactata-tgataagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14507286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 2628727 - 2628996
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2628727 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgga--agttataa 2628821  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2628822 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctg 2628921  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2628922 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2628996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30967673 - 30967404
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |||    
T  30967673 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaacaaagtgcatggaataatta-aat 30967578  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||| |||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  30967577 -acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgg 30967479  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  30967478 gggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 30967404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 332
Target Start/End: Original strand, 12186000 - 12186183
Alignment:
Q  150 tatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacc 248  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  12186000 tatggaacaattataaacacaaggaaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacc 12186099  T
Q  249 tggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12186100 tagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 12186183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14466785 - 14466527
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  14466785 gaattcgatgaaaaatcacaccaataa--taaatttgatgtgtgcagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaaatgtatgaaa--gttataatcacaa 14466690  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagc---gagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 267  Q
     | ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||| | ||||    
T  14466689 ac-aaaagtagaaaacagcagcgagagaaagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagca 14466591  T
Q  268 gccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    | | |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  14466590 gtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 14466527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32280463 - 32280199
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||   ||  | |||| ||||||    
T  32280463 tgttgtgaattcgataaaaaatcacacaaataaca--aacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacaattataa 32280369  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
      ||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32280368 atacaagccaaaagtagaaaataacatgagagaaaggaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 32280269  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32280268 gagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32280199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13040117 - 13039957
Alignment:
Q  174 caaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  13040117 caaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 13040018  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13040017 tccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13039957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26065457 - 26065186
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26065457 tgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagtta 26065361  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgaga-----gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| |||      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26065360 taatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 26065261  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||| | | ||||||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  26065260 g-gggagagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttac-aaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26065186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26085426 - 26085155
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagtta 162  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26085426 tgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagtta 26085330  T
Q  163 taatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgaga-----gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| |||      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26085329 taatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 26085230  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||| | | ||||||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  26085229 g-gggagagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttac-aaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26085155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 4816088 - 4816342
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||    
T  4816088 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtag 4816182  T
Q  183 aaaa----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    ||||    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4816183 aaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 4816282  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||  | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4816283 tccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4816342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 332
Target Start/End: Original strand, 14458602 - 14458878
Alignment:
Q  62 tatcctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacag 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    |||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  14458602 tatcttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataatag---cttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaa 14458698  T
Q  160 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa--------agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacct 249  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14458699 tta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacct 14458796  T
Q  250 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14458797 agtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14458878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 3233567 - 3233841
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  3233567 tgttgcgaattcgatgagaaaacacatcaataaca--aatttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaattata 3233664  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc-----tagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| || |    
T  3233665 aacacaaaccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgt 3233764  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  3233765 gggggagagagcagccctccgtttcactata-cggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 3233841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 30034447 - 30034714
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||     
T  30034447 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtatggagcaag-gataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaa--gttataaa 30034539  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     |||||| ||||||||||||||   ||||||       |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  30034540 tacaagctaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgg 30034639  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  30034640 gggagagagcagccctccgatccgctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 30034714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15720099 - 15719845
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||   || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  15720099 gaattcgatgaaaatcacgtcaataa--taaacttgatgtgtgga---agtgatagtcaagcaatcaaaaataaagtgtatggaa--gttataatcacaa 15720007  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcag 268  Q
     | |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||     
T  15720006 acaaaaa-tagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaa 15719909  T
Q  269 ccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15719908 ctctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15719845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3390713 - 3390582
Alignment:
Q  201 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3390713 agagagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaacttt 3390614  T
Q  301 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3390613 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3390582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 332
Target Start/End: Original strand, 19704399 - 19704679
Alignment:
Q  63 atcctgttgcgaattcgat-ga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaaca 158  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19704399 atcctgttgtgaattcgatcgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaaca 19704495  T
Q  159 gttataatcacaagccaaaagtagaaaaca-----gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 246  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||| |     ||||||       |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19704496 atta-aat-acaagccaaaagtagaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattga 19704593  T
Q  247 cctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa-agagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19704594 cctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataa 19704679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19696889 - 19696643
Alignment:
Q  81 tgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||| ||||| | ||||||    
T  19696889 tgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaa-ag-taatcaagcaaccgaaacaaagtgggtg--acagttataaacacaaac-aaaagt 19696797  T
Q  181 agaaaa-cagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtt 277  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  || |||    
T  19696796 agaaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgtt 19696698  T
Q  278 tcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19696697 ccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaaggattacaagaataa 19696643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33309329 - 33309061
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  33309329 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aa 33309234  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  33309233 t-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 33309135  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33309134 ggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 33309061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 29754548 - 29754819
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  29754548 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-a 29754643  T
Q  165 atcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    || || |||||||| ||||||||||   ||||||      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  29754644 at-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 29754742  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  29754743 tgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 29754819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33311599 - 33311330
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |    
T  33311599 ctgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-a 33311504  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  33311503 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 33311405  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    | |||||| ||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33311404 gggggagaaagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 33311330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532792
Alignment:
Q  212 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtct-agggatagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagat 15532771  T
Q  312 atcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  15532772 atcaatgggttacaagaataa 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 332
Target Start/End: Original strand, 3027740 - 3027965
Alignment:
Q  106 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gag 204  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||  |||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3027740 ttgatgtgtggagcaagtaataatcgagcaaccaaat-aaagtgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagag 3027836  T
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 302  Q
    ||||||||  | |||||||| | | ||||||||| |||  |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3027837 agaacacacga-aatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 3027935  T
Q  303 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3027936 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 3027965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Original strand, 12161502 - 12161668
Alignment:
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| || | ||||||||    
T  12161502 cacaagacaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagttt-agggagag 12161600  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12161601 aacagccatccattttactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 12161668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 26068235 - 26068505
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  26068235 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aa 26068330  T
Q  166 tcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26068331 t-acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 26068429  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
      |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26068430 aggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagcaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26068505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Original strand, 25465444 - 25465686
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||| |  || |||||||||||| | ||| |||   |||||| ||||||    
T  25465444 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaata--cttgatgtatggagcaaaa--taatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaacaattataa 25465536  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagag 263  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||| | || || | |||||    
T  25465537 actcaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagag 25465634  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25465635 agcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 25465686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10584340 - 10584227
Alignment:
Q  191 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10584340 gagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatga 10584241  T
Q  290 tgagtaactttaca 303  Q
    |||||||| |||||    
T  10584240 tgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 26065961 - 26066234
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  26065961 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aa 26066056  T
Q  166 tcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag-----aaagaagag-----agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctgg 251  Q
    | ||||||||||| ||||||||||   ||||||      ||||||||      ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26066057 t-acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctag 26066155  T
Q  252 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||  |||||||||||||| |||| | ||||||  |||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26066156 tctaggggagagagcagccctccgatccactat-ttgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26066234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 22857891 - 22858038
Alignment:
Q  158 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 255  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| |||||    
T  22857891 agttataaacacaagc-aaaagtacaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctg 22857988  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 305  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22857989 ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 22858038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25477616 - 25477477
Alignment:
Q  200 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag------ 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||          
T  25477616 aagagagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacga 25477517  T
Q  294 -taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25477516 gtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25477477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3394837 - 3394708
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3394837 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaaa--atcttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattata 3394740  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394739 aacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 3394708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 26932403 - 26932672
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  26932403 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataa 26932497  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag------agaaagaagagagaacacaaaag-aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
      |||||||||| ||||||    ||| |||||      | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  26932498 atacaagccaaaggtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaga-agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 26932596  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||||||| || |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26932597 gggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26932672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17012502 - 17012243
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  17012502 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataaaata--cttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaac-gtta-aa 17012408  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagag 263  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |  |   |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  17012407 acacaagccaaaagtagaaaatagtgagagaaagaaagagagaatatga---aatttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagag 17012311  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |  | |  |  | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17012310 atgatctctatg-ttccctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17012243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25480346 - 25480217
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||   | | ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  25480346 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa---atatttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataa 25480250  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25480249 tcacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaa 25480217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26945539 - 26945362
Alignment:
Q  140 aaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggt 237  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||    
T  26945539 aaacaaagtgtaaggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaagacacga-aatttgtttacccagttcggt 26945443  T
Q  238 ccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||  |||| |  |||| ||| |||||| ||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26945442 ccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 26945362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 20915214 - 20915466
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||    
T  20915214 aaaatcacaccaataata---acttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat-acaagccaaaagtag 20915308  T
Q  183 aaaa-cagcga-gagaa--------agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    |||| || ||| |||||        |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  20915309 aaaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 20915407  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20915408 tccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20915466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22491073 - 22490917
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||| |  |||| |||||||||||||||||   ||  | |||| |||||| || |     
T  22491073 gaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaacaa---gtgggtaacaattataaacatag 22490979  T
Q  172 gccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22490978 gccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagagcacaaaagaatttgttgacctagt 22490917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 5273055 - 5273326
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||   || |    
T  5273055 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgtaat--tttt 5273149  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    ||  |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   |||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5273150 aaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 5273249  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | |||||||  |||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5273250 tgggggagagagcagccctccaatccactata-agatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5273326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 12195354 - 12195625
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||  | |||||||    
T  12195354 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatg--aaagttata 12195448  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 253  Q
    |  |||||||||||||||||||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  12195449 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 12195548  T
Q  254 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  12195549 tgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 12195625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 316
Target Start/End: Original strand, 28078064 - 28078291
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 181  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| | ||| |||   |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  28078064 aaaatcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaagaattataaacacaagc-aaaagta 28078156  T
Q  182 gaaaacagcgagagaaagaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 279  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||    | |    
T  28078157 gaaa-cagcgagagaaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatcc 28078254  T
Q  280 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078255 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28078291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 330
Target Start/End: Original strand, 12937126 - 12937302
Alignment:
Q  153 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacct 249  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||| || |||||||| |||  ||||| ||||||   |||||    
T  12937126 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacct 12937223  T
Q  250 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  12937224 agtctg-gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12937302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 332
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455537
Alignment:
Q  217 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 315  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  316 attgattacaagaataa 332  Q
    |  | ||||||||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataa 16455537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Original strand, 28037659 - 28037841
Alignment:
Q  153 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaa-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctg 250  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||| | |||||||| ||| || ||||||||||  ||||||     
T  28037659 ggaacaattataaacacaaga-aaaagtagaaa-cagcgagagaaagaaaagaaaaaaaaaacacaatttgtttacccagctcggtccaaaactgaccta 28037756  T
Q  251 gtctgagggagagagcagccttccgt---ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  28037757 gactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 28037841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18322566 - 18322482
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 153  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18322566 tgttgcgaattctatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 25078529 - 25078669
Alignment:
Q  191 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| | ||| || ||| ||||| | |||||| |||| || |||    
T  25078529 gagaaaaagaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactg-ggaagaaagcagtcctccgttccactgtaatga 25078626  T
Q  290 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25078627 cgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 25078669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 330
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911555
Alignment:
Q  245 gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12911555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22611139 - 22610999
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaa-aacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||| | |||||||   |||||| |||||    
T  22611139 ctgttgcgagttcgatgaaaatcacaccaataaaat--acttgatgtgtggagca--aaataatcaagcaaccaatatcaaagtg---ggaacaattata 22611047  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacaca 212  Q
    | |||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  22611046 aacacaag-caaaagtagaaaacaatgagaaaaagaaagagagaacaca 22610999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30445801 - 30445729
Alignment:
Q  258 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  30445801 ggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 30445729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 8717195 - 8717268
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8717195 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 8717268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 332
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530233
Alignment:
Q  263 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaa-tggttacaagaataa 15530233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 15530084 - 15530156
Alignment:
Q  145 aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc----gagagaaagaagagagaacacaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||    
T  15530084 aagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacaacagcagagaaaaagaagagagaacacaa 15530156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22490896 - 22490843
Alignment:
Q  279 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22490896 cactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22490843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3833541 - 3833481
Alignment:
Q  271 ttccgtttcactatagtgatgagt-aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  3833541 ttccgttccactataatgatgagttaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 3833481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 239
Target Start/End: Original strand, 17904287 - 17904368
Alignment:
Q  156 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc 239  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17904287 acagttataaacacaagc-aaaattagaaaacaacgagagaga-atgaaagaacacaaaataatttgtttacctagttctgtcc 17904368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20527011
Alignment:
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 330  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttac-aaagagatatcaaaaggttacaagaat 20527011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30443652 - 30443532
Alignment:
Q  174 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa---gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||    
T  30443652 caaaaatagaaaacaacgaaagaaagaaagagagaaaacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttacctagtctcggggagagagcagc 30443553  T
Q  270 cttccgtttcactatagtgat 290  Q
      |||||| ||||||| ||||    
T  30443552 tctccgttacactataatgat 30443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11262793 - 11262678
Alignment:
Q  200 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 298  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||   |||||| || |||| ||||||||  ||    
T  11262793 aagagagaacacacga-aatttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttct 11262695  T
Q  299 ttacaaaagagatatcaa 316  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11262694 ttac-aaagagatatcaa 11262678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936640
Alignment:
Q  220 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagc 31936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 149
Target Start/End: Original strand, 6610362 - 6610440
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtg 149  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  6610362 tgttgtgaattctttgaaaatcacaccaataaaata--cttaatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaaaacaaagtg 6610440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 13040232 - 13040179
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  13040232 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacactaataac--aaacttgatgtgtggagcaa 13040179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 85671 - 85407
Alignment:
Q  69 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  85671 ttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--atcttaatgtgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaa 85574  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 265  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  85573 cacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagag 85474  T
Q  266 cagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  85473 cagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataa 85407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 79631 - 79362
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  79631 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattata 79534  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  79533 atcacaagccaaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggg 79434  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  79433 agagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 79362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 183481 - 183752
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  183481 ctgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-a 183576  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  183577 at-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 183675  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  183676 gagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 183752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 52456 - 52203
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52456 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 52359  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-- 258  Q
     |||||||||||||||||||||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||      
T  52358 acacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggga 52261  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52260 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 52203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 50457 - 50235
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50457 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 50360  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-- 258  Q
     |||||||||||||||||||||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||      
T  50359 acacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctggggga 50262  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactata 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  50261 gagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4403 - 4173
Alignment:
Q  102 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 200  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4403 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 4304  T
Q  201 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4303 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 4206  T
Q  300 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4205 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 41325 - 41594
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  41325 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat 41420  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctga 256  Q
     ||||||||||||||||||||| ||         | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||     
T  41421 -acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgg 41519  T
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  41520 gggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 41594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 80305 - 80051
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||    
T  80305 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaattata 80208  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  80207 aacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctggggg 80108  T
Q  260 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  80107 agagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 80051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 332
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11584
Alignment:
Q  68 gttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttat 163  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||  ||| | ||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||    
T  11315 gttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaaggaataattaagcaacgaaaaaataaagtgtatggaacaattat 11411  T
Q  164 aatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11412 aatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg 11511  T
Q  259 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11512 gagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 69132 - 69402
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  69132 ctgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatggaa--gttataa 69227  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
      |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  69228 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 69327  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  69328 ggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 69402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36037 - 35817
Alignment:
Q  69 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  36037 ttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaa 35940  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 262  Q
    |||||||||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  35939 cacaagccaaaactcgaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaaga 35840  T
Q  263 gagcagccttccgtttcactata 285  Q
    |||||||| |||||| |||||||    
T  35839 gagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1754
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||   | | ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  1493 tgttgtgaattcaatgaaaatcacaccaataa---atatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaa 1586  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| || || |||||||    
T  1587 cacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagag 1685  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1686 agcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Original strand, 1310 - 1563
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  1310 aaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgtaacaatta-aat-acaagccaaaagtag 1404  T
Q  183 aaaa----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    ||||    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1405 aaaaacaacggcgagaagatcacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 1504  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1505 tccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29617 - 29348
Alignment:
Q  66 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29617 ctgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aa 29522  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaacagc-gagag--------aaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 255  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||        ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29521 t-aaaagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 29423  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  29422 ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 29348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Original strand, 16501 - 16762
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 166  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||     
T  16501 tgttgtgaattcgataaaaattataccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaa-ctaaacaaagtgcatgga--agttataaa 16595  T
Q  167 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagag 263  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  16596 tacaag-caaaaatagaaaacaacgagagaaaagaaagagaaaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagag 16693  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |  | || |  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16694 ataaaccctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1485
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  1298 gaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaa 1392  T
Q  172 gccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaag-agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    |||||||||||||||||   |||||      | ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1393 gccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6646 - 6377
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |   |||    
T  6646 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaata---ata 6553  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 254  Q
    |  |||||||||||||||||||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||    
T  6552 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtct 6453  T
Q  255 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6452 gggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3319 - 3057
Alignment:
Q  73 gaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaag 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||||    
T  3319 gaattcgatgaaaatcacaccaataac---aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacc-aaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaag 3226  T
Q  173 -ccaaaagtagaaaaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggag 261  Q
     | ||||||||||||||   |||||      | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  3225 tcaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggag 3126  T
Q  262 agagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    | ||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3125 atagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 332
Target Start/End: Original strand, 15774 - 15933
Alignment:
Q  174 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 271  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  15774 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 15872  T
Q  272 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15873 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 219
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttata 164  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |    
T  473 tgttgtgaattcgttgagaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-a 378  T
Q  165 atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 263  Q
    || |||||||||||||||||||       | || |  ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  377 at-acaagccaaaagtagaaaa-------acaacggcgagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 286  T
Q  264 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  285 agcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Original strand, 12715 - 12832
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  12715 tgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataa 12809  T
Q  166 tcacaagccaaaagtagaaaaca 188  Q
      |||||||||||||||| ||||    
T  12810 atacaagccaaaagtagacaaca 12832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22418 - 22294
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  22418 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 22321  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||    
T  22320 aagagaaatcaatgagttacaagaata 22294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24693 - 24569
Alignment:
Q  205 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  24693 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 24596  T
Q  305 aagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||    
T  24595 aagagaaatcaatgagttacaagaata 24569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24839 - 24751
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 156  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24839 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 24751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22564 - 22491
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  22564 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 22491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 270
Target Start/End: Original strand, 4535 - 4729
Alignment:
Q  83 aaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 182  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  4535 aaaatcacaccaataaca---atttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaacaaagtcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtag 4629  T
Q  183 aaaaca---gcgagag-------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 270  Q
    ||||||   ||||||        ||||||||   | |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4630 aaaacaatggcgagaagaacaaaaaagaagaagaacaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 57367 - 57539
Alignment:
Q  158 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatt-tgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 255  Q
    |||||||| ||||| | |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||   || || | || ||||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  57367 agttataaacacaatcaaaagatagaaaacagtgagagaaaga-gagagaacacac--gatttgtttttacctagttccgtccaatactgacctagtctg 57463  T
Q  256 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 331  Q
     |||||||||||||  || ||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  57464 ggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaata 57539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2292 - 2218
Alignment:
Q  257 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 332  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  2292 gggagagagtagccctccgattcactata-tgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataa 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16656 - 16605
Alignment:
Q  67 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||    
T  16656 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataa---aaacttgatgcgtggagcaa 16605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University