View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6548_high_10 (Length: 353)

Name: NF6548_high_10
Description: NF6548
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6548_high_10
NF6548_high_10
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (1-341)||(4266655-4266995)
chr6 (2-341)||(4457898-4458238)
chr6 (1-329)||(4574611-4574939)
chr6 (1-343)||(4489842-4490184)
chr6 (1-341)||(3172044-3172384)
chr6 (1-341)||(4560809-4561147)
chr6 (1-341)||(4514610-4514950)
chr6 (1-341)||(4461426-4461766)
chr6 (1-315)||(4480996-4481310)
chr6 (1-329)||(4503898-4504226)
chr6 (1-341)||(4470106-4470446)
chr6 (1-326)||(4506160-4506485)
chr6 (1-341)||(4613207-4613547)
chr6 (1-332)||(4598474-4598805)
chr6 (1-315)||(4516624-4516938)
chr6 (1-319)||(4564014-4564332)
chr6 (1-317)||(4579735-4580051)
chr6 (1-319)||(4602092-4602410)
chr6 (1-330)||(4585939-4586268)
chr6 (1-328)||(4626254-4626581)
chr6 (1-339)||(4571275-4571613)
chr6 (1-327)||(4617325-4617651)
chr6 (1-339)||(4622445-4622781)
chr6 (1-339)||(4299312-4299650)
chr6 (1-339)||(4557428-4557766)
chr6 (1-339)||(4259645-4259983)
chr6 (1-309)||(4592534-4592842)
chr6 (1-337)||(4256117-4256440)
chr6 (1-204)||(4568359-4568562)
chr6 (1-89)||(4493258-4493346)
chr6 (274-332)||(4835513-4835571)
chr6 (284-341)||(4568630-4568687)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-341)||(24103302-24103642)
chr5 (1-175)||(27999754-27999928)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (1-339)||(3086723-3087061)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (1-328)||(1674529-1674856)
chr8 (1-339)||(20863334-20863672)
chr8 (1-316)||(16685781-16686096)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-327)||(1281417-1281743)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (1-328)||(4188-4515)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (1-319)||(3230-3548)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (239-328)||(4-93)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (1-72)||(3443-3513)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4266995 - 4266655
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4266995 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttcttta 4266896  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4266895 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctgttggccaaaccccaagcaaact 4266796  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4266795 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 4266696  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266695 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgatttt 4266655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 4457898 - 4458238
Alignment:
Q  2 catccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttca 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||    
T  4457898 catccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattaagcctctatcagaagtttcattca 4457997  T
Q  102 aaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggtt-cttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  4457998 caaaatccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctagttatccacaaaaaaggttttcttgctgttggccaaaacccaagcaaatt 4458097  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4458098 ctaagagcttctcttgagacataactgtgatgcttccaaaatttacataaataacagactttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtata 4458197  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4458198 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgatttt 4458238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 4574611 - 4574939
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4574611 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttc 4574710  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4574711 aaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaact 4574810  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4574811 ctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaatccattcaagacatttagtatc 4574910  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatg 329  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  4574911 ttctttccaaagattagagtctaaagatg 4574939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4490184 - 4489842
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4490184 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaataccttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttc 4490085  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4490084 aaaaaatcagatgacaacacctgtgagccaccaataacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaact 4489985  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4489984 ctaatagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4489885  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgattttct 343  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||  || ||||||||||    
T  4489884 ttctttccaaagattagagtctaaagatttcaagtgattttct 4489842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 3172044 - 3172384
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3172044 ccatccgcagtgagtcaagaatccgccaattgaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattc 3172143  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3172144 acaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaataatccacaaaaagggtttcttgctgttggctaaaccccaagcaaact 3172243  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3172244 ctaataatttctcttgagacataactatgatgctgccaaaatttacataaacaacagattttgattcttttgtttcaagccattcaagacatttagtatc 3172343  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  3172344 ttctttccaaagattagaatctaaagatgccaagtgatttt 3172384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 4560809 - 4561147
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4560809 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgatgggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttc 4560908  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4560909 aaaaa-tcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaatggtttcttgctgttggccaaaccccaagcaaact 4561007  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4561008 ctaag-gcttctcttgagacttaacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4561106  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||| || ||||||||    
T  4561107 ttctttccaaagattacagtctaaagatgtcaagtgatttt 4561147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4514950 - 4514610
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  4514950 ccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattc 4514851  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4514850 acaaactcagacgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaaggttttcttgctattggccaaaccccaagcaaact 4514751  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  |||||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4514750 ctaacaatttctccggagacataatcgtgatgctaccaaaattaacataaacaacagatcctgattcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4514651  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  4514650 ttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgatttt 4514610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 4461426 - 4461766
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4461426 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgctattaggcctctatctgaaatttcattc 4461525  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  4461526 acaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaact 4461625  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |  ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4461626 ctaacagttgatcaggagtcataactgtgatgctgccaaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4461725  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4461726 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 4461766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 4480996 - 4481310
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4480996 ccatccgcaatgagtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatttgaaatttctttc 4481095  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||    || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  4481096 aaatactcagatgacaacaccactgagccaccaatgacaagattagacctaataatccacaaaaagttttttttgctattggcaaaaccccaagcaaact 4481195  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4481196 ctaagagtttctcttgagacataattgtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4481295  T
Q  301 ttctttccaaagatt 315  Q
    |||||||||||||||    
T  4481296 ttctttccaaagatt 4481310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4504226 - 4503898
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||| |||| |||    
T  4504226 ccatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctacaagtcctctattagaagtttcattc 4504127  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4504126 acaaaatcagatgacaacacctctgagccaccaataacaagatcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaact 4504027  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  || |||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4504026 ctaacaatttatcttaagacataactgtaatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttaattcaagccaatcaagacatttagtatc 4503927  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatg 329  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  4503926 ttctttccaaagattagagtctaaagatg 4503898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 4470106 - 4470446
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||  |  | ||||| ||||||||||||||| | ||     
T  4470106 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcagtacttgctcttgaggacaccagttcacgattaggcctctatctgaaattccattt 4470205  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||| | || |||||||||||||||||||    
T  4470206 acaatctctgatgagaaaactaccgagccgccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgccaaaccccaagcaaact 4470305  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4470306 ctaacagtttctctggagacataactgtgacgctgccgaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 4470405  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  4470406 ttctttccaaagattgaaatttaaagatgctagatgatttt 4470446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 4506160 - 4506485
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||     
T  4506160 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgatttaacactttctcttgtgaacaccagcttgctataaggcttctatctgaaatttcattt 4506259  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4506260 gcaaactctgaagacaaaaccactgagccaccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaact 4506359  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  |||||  | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4506360 ctaaaaatttctccggagacataattgtgatgcttccaaaattcacataaacaacagaagccggttcttttgattccagccattcgagacatttagtatc 4506459  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaag 326  Q
     |||||||||||||| |||| |||||    
T  4506460 ctctttccaaagatttgaatctaaag 4506485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4613547 - 4613207
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4613547 ccatccacaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggacaccagctcgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 4613448  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| | || |||||||||||||||||||    
T  4613447 acaaactctgatgacaaaacaactgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctattcgccaaaccccaagcaaact 4613348  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || || |||   | |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4613347 ctaatagtttttctgcagtcataacggtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacttcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatc 4613248  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||    
T  4613247 ttctttccaaagattggtacttaaacttgccaagtgatttt 4613207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 4598474 - 4598805
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  |||||  ||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||| |||    
T  4598474 ccatccgcaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcagacaccagcttgcaactaagcctctatctgaaatttcattc 4598573  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  4598574 acaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaagt 4598673  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| | ||| |||   | ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4598674 ctaacaacttttctgcagtcatcaccgttatgctcccaaaattcacataaacaacagaccttggttcattggattcaagccagtcaagacacttggtatc 4598773  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgcca 332  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4598774 ttctttccaaagattggtacctaaagatgcca 4598805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 4516624 - 4516938
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| |||    
T  4516624 ccatccacaatgagtcaagaatcctccaactgaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccagcttgctattacgcctctatccgaagtttcattc 4516723  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4516724 acaaaatcggatgacaaaataaccgagccaccaatgacaaggtcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctgttggccaaaccccaagcgaact 4516823  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |  ||| | | ||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| | | |||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  4516824 ctaacagttgatctggagtcatgaccgtgatgcttccaaaattcacataaactacagaaccttgttccttagattcaagccattcaagacatttcatatc 4516923  T
Q  301 ttctttccaaagatt 315  Q
    |||||||||||||||    
T  4516924 ttctttccaaagatt 4516938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 4564014 - 4564332
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  4564014 ccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaatactttctcctgtggacaccaacttgcaattaagcctctatctgaaatttcattc 4564113  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||   |||||||| ||||||||||| |    
T  4564114 acaaactcagatgacaaaacgactgagccaccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttattgcaattggccaacccccaagcaaatt 4564213  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    | || || |  | | ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4564214 ccaacagttgttttggtgtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacacttagtatc 4564313  T
Q  301 ttctttccaaagattggaa 319  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  4564314 ttctttccaaaggttggaa 4564332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 4579735 - 4580051
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4579735 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgttattaggcctctatctgaaatttcattc 4579834  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||| | || || |||||||| |||||||    
T  4579835 acaaactccgatgacaaaacagctgagccgccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaact 4579934  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || || |||   | ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||    
T  4579935 ctaacagtttttctgcagtcataactgtcaagctcccaaaattcacataaacaacagacctaggttccttggattcaagccaataaagacacttggtatc 4580034  T
Q  301 ttctttccaaagattgg 317  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4580035 ttctttccaaaaattgg 4580051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 4602092 - 4602410
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  4602092 ccatccacaatgagtcaagaatccgccgatcgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattt 4602191  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |   ||||||||||||||||| || |    
T  4602192 gtaaactcagatgacaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttatggcaattggccaaaccccaagcgaatt 4602291  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  |  |   ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  || || || ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  4602292 ctaataattgatggggtgtcataactgtaatgctgccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacactcagtatc 4602391  T
Q  301 ttctttccaaagattggaa 319  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  4602392 ttctttccagaggttggaa 4602410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 4585939 - 4586268
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4585939 ccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcaatacttgctcttgcgggcaccaacccgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 4586038  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| |||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4586039 ttaaactcagatgacaaaaccaaggaaccaccaatgacaagatcaggtctaatgatccataaaaaatgttgcttgctattggccaaaccccaagcaaact 4586138  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || || |||   | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4586139 ctaatagtttttctgtagtcataactgttgtgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttggtatc 4586238  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgc 330  Q
     |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  4586239 ctctttccaaagatttgtacttaaagatgc 4586268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 4626254 - 4626581
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4626254 ccatccacaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggttcagtactttctcttgcggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 4626353  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| || |||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  4626354 tcaaactcggatgacgaaataaatgagccaccaatcacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaact 4626453  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |||| | | | ||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||    
T  4626454 ctaacagtttctgtggagtcataactataacgctgccaaagttcacataaacaacagactttggttccttgaattcaagccattcaagacaattggtgtc 4626553  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagat 328  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||    
T  4626554 ttctttccaaagattggaacctaaagat 4626581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 4571275 - 4571613
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4571275 ccatccacagtgagtcaagaaaccaccaattgaaggatggttcaatactttctcttgcgagcaccaaccagcaattaggcctctatctgaaatttcattc 4571374  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | | |||| | || || |||||||| |||||||    
T  4571375 acaaactccgatgacaaaacaactgagccaccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagagttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaact 4571474  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || || |||   | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  4571475 ctaacagtttttctgaagtcataactgtcctgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttgttatc 4571574  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatt 339  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||    
T  4571575 ttctttccaaagattggtacttaaacttgccaagtgatt 4571613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 4617325 - 4617651
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||     
T  4617325 ccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgtcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattt 4617424  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  4617425 gtaaactcagatgagaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatgatttcttgcaattggccaaaccccaagcaaatt 4617524  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    | |  |  | |||  ||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |  || || || ||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  4617525 ccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatcccggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatc 4617624  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaaga 327  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4617625 ttctttccaaaggttggaatctaaaga 4617651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 4622445 - 4622781
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||    
T  4622445 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgcagggtggttaagtacttcctcttgtggacaccaacctgcgattaggcctctacctgaaatttcattc 4622544  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| ||||||||||||| ||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  4622545 tcaaactcagatgacaaaataaacgagccgcccatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaact 4622644  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |  ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| || |   ||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  4622645 ctaatagttgatctcgagtcatcactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaagagtc--aggttccttggattcaagccactcaagacacttgatatc 4622742  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatt 339  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  4622743 ttctttccaaagattggaacctagagatgccaagtgatt 4622781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4299650 - 4299312
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||| | |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||    
T  4299650 ccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacactagcttgcggttaggcctctatttgaaatttcattc 4299551  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| ||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| ||   ||||||||||||||||||| ||    
T  4299550 tcaaactcagatgacaaaataaacaagccgccaatgacaaggtctggcctaatgatccacaaaaatggtttcctgcaattggccaaaccccaagcaatct 4299451  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || | |||| | | ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || |  || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4299450 ctaacagttgctctggagtcataactgtaacgctgccaaaattcacataaacaaccgatcccggctccttggattcaagccattcaagacatttggtatc 4299351  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatt 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  4299350 ttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgatt 4299312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 4557428 - 4557766
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| ||     
T  4557428 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagcccgcgattaggcctctatctgaaatttcattg 4557527  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||| | || || |||||||| |||||||    
T  4557528 acaaactccgatgacaaaacaactgagccaccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaact 4557627  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || || |||   | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||  ||||    
T  4557628 ctaacagtttttctgccgtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttccttggattcaagccaaccaagacacttgttatc 4557727  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatt 339  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||    
T  4557728 ttctttccaaagattggtacttaaacttgccaagtgatt 4557766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4259983 - 4259645
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  ||    
T  4259983 ccatccgcaatgagttaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgcgattaggcctctatccgaaatttcactc 4259884  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4259883 tcaaactcagatgacaaaataaaggagccaccaataatgaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaatccccaagcaaact 4259784  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  |  ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4259783 ctaaaaattgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttaaattcaagccattcaagacatttggtatc 4259684  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatt 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  4259683 ttctttccaaagattggaacctaacgatgccaggtgatt 4259645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 4592534 - 4592842
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  4592534 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggacaccagctcgcgattacgcctctatctgaaatttcattc 4592633  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||    
T  4592634 acaaactccgatgacaaaacaattgtgccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaaaggtttattgcaattggccaaaccccaagcaaact 4592733  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  ||||||     ||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| || |  | ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  4592734 ctaacattttctcttcattcataactgtaaggctgccgaaattcacataaacaacggaacccgattccttcgattcaagccatttaagacactcagtatc 4592833  T
Q  301 ttctttcca 309  Q
    |||||||||    
T  4592834 ttctttcca 4592842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4256440 - 4256117
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| |||| |          
T  4256440 ccatcctcaatgagtcaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccaactctcgattagtcctctatccgaaact------ 4256347  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
           |||||||||||| ||  ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4256346 -------cagatgacaaaataaaggagccaccaatgacgaggtcaggcctaatgatacacaaaaatggtttcttgctattggccaatccccaagcaaact 4256254  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |  ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4256253 ctaacagttgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttggattcaagccattcaagacacttggtatc 4256154  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtga 337  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  4256153 ttctttccaaagattggaacctaacgatgccaagtga 4256117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 4568359 - 4568562
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || | |||    
T  4568359 ccatccacaatgagtcaagaatcgtccaactgaagggtggttcaacacttgctcttgcggacaccagcttgctatttggcctctatccgaagttccattc 4568458  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||    
T  4568459 acaaactcggatgacaaaataactgagccaccaatgacaagctaaggcctaatgatccacaaaaaaggtttcttgctgttggcaaaacctcaagagaact 4568558  T
Q  201 ctaa 204  Q
    ||||    
T  4568559 ctaa 4568562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 4493258 - 4493346
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctg 89  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4493258 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaatcgaatggtggttcagcagtttctcttgtggacaccaactagcaattaggcctctatctg 4493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4835571 - 4835513
Alignment:
Q  274 ttcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgcca 332  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4835571 ttcaagccattcaagacattttgtatcttccttccaaagatcggaacctaaagatgcca 4835513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Original strand, 4568630 - 4568687
Alignment:
Q  284 tcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||    
T  4568630 tcaagacatttcatatcttctttccaaagattggaacctaaagaagccaagtgctttt 4568687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 24103302 - 24103642
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  24103302 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggtttaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaacttcttta 24103401  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24103402 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctattggccaaaccccaagcaaact 24103501  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24103502 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaactgatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 24103601  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24103602 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgatttt 24103642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27999928 - 27999754
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27999928 ccatccgcagtgagtcaagaacccgctgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttc 27999829  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttg 175  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  27999828 ctaaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagattaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttg 27999754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 3086723 - 3087061
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3086723 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaatacttgctcttgcggacaccagcttgcgattagacctctatctgaaatttctttc 3086822  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3086823 tcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaact 3086922  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || | |||| | | ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    || | |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  3086923 ctaatagttgctcttgagtcataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagactcaagtccctttgattcaagccattcaagacacttggtatc 3087022  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatt 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  3087023 ttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgatt 3087061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 1674529 - 1674856
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1674529 ccatccgcagtgtgtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttc 1674628  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  1674629 ataaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaatcggccaaaccccaagcaaact 1674728  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    | || || |  ||| | | ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  1674729 ccaatagttgatctggagtcataacaataatgctaccgaaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatc 1674828  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagat 328  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1674829 ttctttccaaaggttggaacctaaagat 1674856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20863672 - 20863334
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20863672 ccatccacaatgagttagaaatccaccaattgaaggatggttcaacaccttctcttgtggacaccaactcgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 20863573  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
    | |||  ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20863572 acaaacgcagatgaaaaaatcaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaact 20863473  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| |  || |||   ||||| |||||| | || |||||||||||||| |||| ||| |  |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||    
T  20863472 ctaacaatttttctacagacatgactgtggtactgccaaaatttacatatacaatagatcccggttctttcgattcaagccatgcaagacattcagtgtc 20863373  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgatt 339  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||    
T  20863372 ttctttccaaagacttgaatctaaagacgccaagtgatt 20863334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16686096 - 16685781
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| |||    
T  16686096 ccatccacaatgagttaagaatccaccgattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagctcgcgattaggcttctatctgagatttcattc 16685997  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| |||||||||||||| || || || | |||||||||||||| |||||| |||||   |||| | | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  16685996 ttaaactcagatgacaaaaccacggaaccgcaaatgacaagatcagacctaatgatccattgaaaatgttgcttgctattggtcaaaccccaagcaaact 16685897  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || || |||   | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  16685896 ctaatagtttttctgcagtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggaactcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatc 16685797  T
Q  301 ttctttccaaagattg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  16685796 ttatttccaaagattg 16685781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 1281417 - 1281743
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1281417 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattc 1281516  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| | || |||| |||||||||||| |    
T  1281517 gcaaagtcagatgacaaaatcactgagccgccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaatggtttcttgctattagccagaccccaagcaaatt 1281616  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |    || | |||| | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||| |   ||||    
T  1281617 cctgaagttgctctggagtcataactgtaatgcttccgaaattcacataaacaacagatctcggttccttcgattcaagccattgaagacactcgatatc 1281716  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaaga 327  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1281717 ttctttccaaaggttggaatctaaaga 1281743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4515 - 4188
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4515 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgtggacaccagctcgcaattaggcctctatctgaaatttcattc 4416  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||    |||| |||| ||||||||||||    
T  4415 tcaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaaggatttcttacaattggtcaaaacccaagcaaact 4316  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |  ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  4315 ctaacagttgatctggagtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaaccgactcaggttccttggatgcaagccactcaagacacttggtatc 4216  T
Q  301 ttctttccaaagattggaatttaaagat 328  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||    
T  4215 ttctttccaaagattggaacctaaagat 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3548 - 3230
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagccctctatctgaaatttctttc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||  |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3548 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggatcagtacttgctcttgtggacaccagcttgtgattaggcctctatctgaaatttcattc 3449  T
Q  101 aaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgttgttggccaaaccccaagcaaact 200  Q
      ||| || |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||| |    
T  3448 tcaaattctgatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaacggtttcttgctatcggccaaaccccaagcaaatt 3349  T
Q  201 ctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatc 300  Q
    |||| || |  | | | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||   ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  3348 ctaacagttgatttggagtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 3249  T
Q  301 ttctttccaaagattggaa 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3248 ttctttccaaagattggaa 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 328
Target Start/End: Original strand, 4 - 93
Alignment:
Q  239 aaatttacataaacaacagaccttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagat 328  Q
    ||||| ||||||||||| || |  ||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  4 aaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagat 93  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3513 - 3443
Alignment:
Q  1 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgc 72  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  3513 ccatccacaatgagttaagaatccaccaa-ctaagggtggttcaacacttgctcttacggacaccatcttgc 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University