View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6548_low_4 (Length: 601)

Name: NF6548_low_4
Description: NF6548
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6548_low_4
NF6548_low_4
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (13-587)||(6055734-6056309)
chr6 (24-551)||(607913-608445)
chr6 (24-383)||(10100026-10100385)
chr6 (24-510)||(5631572-5632064)
chr6 (184-489)||(9593769-9594080)
chr6 (90-515)||(28085196-28085623)
chr6 (24-383)||(5258315-5258678)
chr6 (24-484)||(20427703-20428164)
chr6 (24-265)||(9706530-9706771)
chr6 (127-502)||(28026877-28027250)
chr6 (102-515)||(30031088-30031503)
chr6 (29-336)||(14030565-14030875)
chr6 (199-515)||(32755848-32756168)
chr6 (16-256)||(2689402-2689642)
chr6 (361-515)||(5095927-5096081)
chr6 (15-189)||(30679219-30679393)
chr6 (58-260)||(2065048-2065250)
chr6 (401-515)||(31818664-31818778)
chr6 (140-512)||(35043479-35043853)
chr6 (394-515)||(12890701-12890822)
chr6 (397-512)||(34543-34658)
chr6 (276-503)||(24665818-24666046)
chr6 (24-381)||(26291533-26291892)
chr6 (412-511)||(1747984-1748083)
chr6 (109-264)||(33496023-33496178)
chr6 (436-553)||(3206455-3206573)
chr6 (401-515)||(8364689-8364803)
chr6 (423-509)||(14389202-14389288)
chr6 (169-336)||(33083957-33084126)
chr6 (394-511)||(34143804-34143921)
chr6 (394-511)||(34156420-34156537)
chr6 (181-290)||(5080766-5080877)
chr6 (118-206)||(11295246-11295334)
chr6 (216-336)||(21352051-21352171)
chr6 (441-515)||(31819004-31819078)
chr6 (396-489)||(6293453-6293546)
chr6 (152-221)||(25494181-25494249)
chr6 (439-515)||(9706941-9707017)
chr6 (439-515)||(34934865-34934941)
chr6 (417-483)||(43119-43185)
chr6 (426-512)||(5897615-5897701)
chr6 (396-446)||(9568820-9568870)
chr6 (421-510)||(10098936-10099023)
chr6 (421-515)||(21351872-21351966)
chr6 (423-489)||(35199684-35199749)
chr6 (269-354)||(2079341-2079426)
chr6 (245-327)||(12890559-12890643)
chr6 (469-548)||(1615224-1615304)
chr6 (275-371)||(2689647-2689743)
chr6 (395-455)||(7080467-7080527)
chr6 (430-470)||(7492551-7492591)
chr6 (427-503)||(7634531-7634607)
chr6 (411-467)||(31831942-31831998)
chr6 (394-470)||(33497085-33497161)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (24-515)||(31959849-31960342)
chr4 (31-512)||(48174131-48174614)
chr4 (24-515)||(1777052-1777543)
chr4 (32-515)||(435991-436476)
chr4 (24-515)||(33226963-33227456)
chr4 (24-512)||(23906335-23906829)
chr4 (24-515)||(56375044-56375537)
chr4 (24-511)||(43433672-43434167)
chr4 (120-513)||(45204877-45205280)
chr4 (24-486)||(50286725-50287180)
chr4 (24-374)||(27450355-27450701)
chr4 (75-515)||(52569550-52569992)
chr4 (102-515)||(4440688-4441100)
chr4 (24-548)||(46582827-46583352)
chr4 (204-513)||(51421666-51421975)
chr4 (91-470)||(7092301-7092680)
chr4 (24-503)||(53707548-53708029)
chr4 (24-515)||(48622578-48623055)
chr4 (24-290)||(35690059-35690326)
chr4 (24-374)||(1211566-1211918)
chr4 (156-515)||(39100571-39100929)
chr4 (140-515)||(33190883-33191260)
chr4 (117-338)||(31458875-31459100)
chr4 (85-458)||(55578846-55579222)
chr4 (24-336)||(47265416-47265733)
chr4 (129-515)||(1793319-1793709)
chr4 (200-509)||(56224995-56225309)
chr4 (60-226)||(39708248-39708414)
chr4 (140-290)||(12494620-12494772)
chr4 (200-515)||(28236115-28236429)
chr4 (201-555)||(37797783-37798139)
chr4 (300-508)||(53518365-53518570)
chr4 (144-336)||(54470081-54470275)
chr4 (394-515)||(35690397-35690518)
chr4 (258-515)||(26037540-26037797)
chr4 (102-487)||(41009413-41009800)
chr4 (300-511)||(39708465-39708676)
chr4 (326-515)||(28351617-28351806)
chr4 (258-374)||(28497480-28497595)
chr4 (32-263)||(16002690-16002920)
chr4 (167-290)||(17900377-17900502)
chr4 (144-345)||(50662263-50662465)
chr4 (199-503)||(20591353-20591653)
chr4 (394-470)||(55809070-55809146)
chr4 (274-458)||(26356625-26356809)
chr4 (260-503)||(20192025-20192268)
chr4 (201-503)||(37773498-37773801)
chr4 (394-514)||(8286565-8286685)
chr4 (312-513)||(37488135-37488336)
chr4 (396-515)||(6957726-6957845)
chr4 (419-470)||(28550535-28550586)
chr4 (143-230)||(49739116-49739203)
chr4 (87-290)||(10775682-10775887)
chr4 (429-515)||(55007907-55007993)
chr4 (394-513)||(2557708-2557828)
chr4 (396-512)||(12494791-12494907)
chr4 (202-374)||(25257757-25257929)
chr4 (95-230)||(11389545-11389680)
chr4 (394-513)||(21236984-21237103)
chr4 (262-458)||(46372018-46372214)
chr4 (430-512)||(28486083-28486165)
chr4 (420-470)||(31043224-31043274)
chr4 (258-368)||(31339527-31339636)
chr4 (174-510)||(20601692-20602024)
chr4 (400-485)||(21107124-21107209)
chr4 (74-230)||(27991737-27991893)
chr4 (397-513)||(53540419-53540535)
chr4 (412-515)||(26024885-26024988)
chr4 (178-290)||(27983108-27983222)
chr4 (419-509)||(40420255-40420343)
chr4 (394-489)||(42639081-42639176)
chr4 (401-515)||(8598976-8599090)
chr4 (130-184)||(26037850-26037904)
chr4 (425-515)||(31459151-31459241)
chr4 (419-512)||(33225873-33225964)
chr4 (200-290)||(33709849-33709946)
chr4 (428-510)||(34208309-34208390)
chr4 (397-515)||(34233059-34233177)
chr4 (88-230)||(44860672-44860814)
chr4 (394-515)||(45184168-45184287)
chr4 (254-336)||(51252675-51252757)
chr4 (411-489)||(56439632-56439710)
chr4 (258-371)||(1380357-1380470)
chr4 (421-510)||(30621241-30621330)
chr4 (312-458)||(31961358-31961504)
chr4 (422-515)||(32479192-32479285)
chr4 (411-492)||(42293323-42293404)
chr4 (199-259)||(2588910-2588970)
chr4 (418-470)||(7544603-7544655)
chr4 (398-458)||(31403126-31403186)
chr4 (258-354)||(45175997-45176092)
chr4 (58-110)||(54914631-54914683)
chr4 (24-115)||(3273176-3273267)
chr4 (313-368)||(38903902-38903957)
chr4 (397-500)||(49987537-49987640)
chr4 (419-489)||(6843766-6843836)
chr4 (465-503)||(20918267-20918305)
chr4 (258-336)||(35555861-35555939)
chr4 (394-515)||(47265230-47265351)
chr4 (394-468)||(50679630-50679704)
chr4 (144-230)||(21106856-21106944)
chr4 (181-230)||(25967589-25967638)
chr4 (199-345)||(41192763-41192913)
chr4 (201-289)||(43070029-43070115)
chr4 (397-458)||(47147502-47147563)
chr4 (282-383)||(47611741-47611842)
chr4 (247-336)||(50471505-50471594)
chr4 (428-509)||(55388252-55388333)
chr4 (469-513)||(3979121-3979165)
chr4 (424-512)||(5306452-5306540)
chr4 (397-489)||(7681971-7682063)
chr4 (396-515)||(7947065-7947184)
chr4 (397-513)||(13805302-13805418)
chr4 (402-514)||(20131025-20131137)
chr4 (430-510)||(28485844-28485924)
chr4 (436-512)||(36198983-36199059)
chr4 (258-290)||(44047608-44047640)
chr4 (258-290)||(44360077-44360109)
chr4 (451-515)||(51811313-51811377)
[»] chr5 (83 HSPs)
chr5 (24-515)||(1275019-1275511)
chr5 (24-515)||(28976894-28977385)
chr5 (24-515)||(12492419-12492915)
chr5 (24-513)||(2075510-2076002)
chr5 (24-515)||(1287614-1288117)
chr5 (24-548)||(27648-28163)
chr5 (24-515)||(24178278-24178757)
chr5 (24-515)||(10639051-10639549)
chr5 (24-515)||(3301603-3302091)
chr5 (70-515)||(16347415-16347860)
chr5 (24-265)||(34272776-34273012)
chr5 (199-515)||(4496311-4496631)
chr5 (201-515)||(26884724-26885040)
chr5 (199-489)||(17340497-17340790)
chr5 (25-252)||(36200537-36200764)
chr5 (239-515)||(38684936-38685214)
chr5 (24-262)||(20318745-20318974)
chr5 (200-539)||(32516488-32516826)
chr5 (147-458)||(31636012-31636319)
chr5 (208-517)||(6888931-6889242)
chr5 (258-512)||(7359299-7359551)
chr5 (412-515)||(2090557-2090660)
chr5 (24-183)||(17340841-17341000)
chr5 (275-515)||(20456780-20457020)
chr5 (399-515)||(30588578-30588694)
chr5 (397-515)||(9235178-9235294)
chr5 (426-515)||(418069-418158)
chr5 (397-515)||(11675658-11675777)
chr5 (394-513)||(29922410-29922529)
chr5 (394-513)||(34273139-34273258)
chr5 (397-515)||(7678607-7678724)
chr5 (258-485)||(14665704-14665931)
chr5 (24-148)||(3394464-3394591)
chr5 (394-499)||(14725644-14725749)
chr5 (157-230)||(21093663-21093736)
chr5 (411-515)||(14667914-14668018)
chr5 (258-503)||(14749297-14749542)
chr5 (399-515)||(29816513-29816629)
chr5 (127-261)||(7678338-7678471)
chr5 (246-336)||(33667194-33667284)
chr5 (148-354)||(10082935-10083141)
chr5 (199-328)||(11002645-11002774)
chr5 (313-455)||(15489587-15489729)
chr5 (100-205)||(32516165-32516270)
chr5 (422-523)||(35615437-35615538)
chr5 (239-308)||(15168761-15168832)
chr5 (394-462)||(27998567-27998635)
chr5 (407-458)||(28186867-28186919)
chr5 (394-462)||(28676721-28676789)
chr5 (439-503)||(42504294-42504358)
chr5 (85-227)||(1525457-1525597)
chr5 (199-282)||(34194766-34194849)
chr5 (360-515)||(2915531-2915685)
chr5 (24-290)||(3096930-3097195)
chr5 (394-484)||(15168897-15168987)
chr5 (217-290)||(1174549-1174622)
chr5 (422-515)||(13561421-13561514)
chr5 (422-515)||(14911326-14911419)
chr5 (424-513)||(20367049-20367138)
chr5 (321-374)||(27799896-27799949)
chr5 (425-470)||(36200886-36200931)
chr5 (246-290)||(418247-418291)
chr5 (411-515)||(16913918-16914022)
chr5 (117-169)||(32759424-32759476)
chr5 (275-383)||(43475247-43475355)
chr5 (397-444)||(6859510-6859557)
chr5 (441-515)||(5558314-5558388)
chr5 (397-515)||(12576895-12577013)
chr5 (419-465)||(15986578-15986624)
chr5 (264-345)||(18351112-18351194)
chr5 (279-458)||(27553842-27554020)
chr5 (449-515)||(32442160-32442226)
chr5 (145-230)||(21952226-21952311)
chr5 (145-230)||(27998298-27998383)
chr5 (258-371)||(43558006-43558119)
chr5 (145-230)||(43558136-43558221)
chr5 (201-290)||(219713-219804)
chr5 (436-484)||(2393045-2393093)
chr5 (411-471)||(5303587-5303647)
chr5 (258-290)||(14667753-14667785)
chr5 (451-515)||(30213758-30213822)
chr5 (399-511)||(38684611-38684723)
chr5 (312-384)||(41109906-41109978)
[»] chr7 (107 HSPs)
chr7 (24-515)||(35906236-35906729)
chr7 (24-515)||(33349841-33350334)
chr7 (24-515)||(34869174-34869667)
chr7 (24-515)||(11593714-11594207)
chr7 (24-515)||(36651748-36652239)
chr7 (24-468)||(31004977-31005423)
chr7 (24-384)||(33072708-33073068)
chr7 (24-515)||(43281430-43281921)
chr7 (24-515)||(46355891-46356379)
chr7 (53-515)||(12841310-12841774)
chr7 (33-515)||(39906407-39906894)
chr7 (33-513)||(49029044-49029521)
chr7 (24-383)||(38606759-38607119)
chr7 (33-290)||(23404181-23404440)
chr7 (201-489)||(36136695-36136985)
chr7 (24-290)||(32630349-32630616)
chr7 (140-515)||(37617814-37618192)
chr7 (85-486)||(13859072-13859473)
chr7 (24-265)||(36869576-36869817)
chr7 (145-515)||(28627968-28628337)
chr7 (87-386)||(25579241-25579536)
chr7 (143-489)||(47848547-47848894)
chr7 (27-458)||(7189311-7189757)
chr7 (174-515)||(43491212-43491555)
chr7 (164-515)||(45836517-45836868)
chr7 (239-515)||(6374837-6375115)
chr7 (69-380)||(7272838-7273151)
chr7 (205-374)||(8492409-8492580)
chr7 (174-552)||(35558990-35559372)
chr7 (154-384)||(36514373-36514603)
chr7 (259-515)||(2885757-2886013)
chr7 (199-468)||(44855254-44855525)
chr7 (315-503)||(1569063-1569251)
chr7 (394-515)||(40979963-40980084)
chr7 (246-374)||(19262610-19262737)
chr7 (398-512)||(9210742-9210856)
chr7 (25-230)||(24425846-24426048)
chr7 (239-515)||(29650353-29650631)
chr7 (324-470)||(1531441-1531587)
chr7 (24-144)||(37616670-37616790)
chr7 (324-515)||(1011103-1011293)
chr7 (419-513)||(14057629-14057723)
chr7 (419-513)||(14367657-14367751)
chr7 (411-513)||(36239833-36239935)
chr7 (401-489)||(37976368-37976456)
chr7 (394-517)||(45601602-45601725)
chr7 (421-515)||(21078070-21078164)
chr7 (429-511)||(36101816-36101898)
chr7 (394-515)||(7273226-7273347)
chr7 (398-513)||(44401164-44401277)
chr7 (199-386)||(5335851-5336038)
chr7 (394-553)||(38900083-38900242)
chr7 (182-374)||(39811869-39812063)
chr7 (401-503)||(21517427-21517529)
chr7 (269-515)||(31682637-31682883)
chr7 (422-503)||(35922407-35922488)
chr7 (446-515)||(47852265-47852334)
chr7 (394-470)||(28562446-28562522)
chr7 (199-290)||(30200223-30200312)
chr7 (300-512)||(38135251-38135462)
chr7 (179-335)||(42187380-42187537)
chr7 (398-515)||(42187572-42187688)
chr7 (24-118)||(48919142-48919236)
chr7 (303-433)||(6420607-6420737)
chr7 (199-485)||(43282334-43282626)
chr7 (396-455)||(12966144-12966203)
chr7 (436-515)||(27648948-27649027)
chr7 (411-462)||(29653634-29653685)
chr7 (444-515)||(33073105-33073176)
chr7 (147-290)||(40139179-40139321)
chr7 (207-386)||(44681206-44681385)
chr7 (141-212)||(47235623-47235694)
chr7 (425-515)||(27893598-27893688)
chr7 (255-329)||(27893769-27893843)
chr7 (266-372)||(35713693-35713799)
chr7 (263-333)||(38920789-38920859)
chr7 (429-470)||(40415168-40415209)
chr7 (411-515)||(22174143-22174247)
chr7 (201-265)||(27021993-27022057)
chr7 (303-488)||(48202764-48202949)
chr7 (435-553)||(25731470-25731589)
chr7 (315-374)||(30144822-30144881)
chr7 (439-510)||(31859046-31859117)
chr7 (399-470)||(32368417-32368488)
chr7 (440-515)||(42969870-42969945)
chr7 (258-336)||(27021906-27021984)
chr7 (425-503)||(28355322-28355400)
chr7 (421-515)||(31681055-31681149)
chr7 (201-336)||(36101979-36102116)
chr7 (412-513)||(15682318-15682419)
chr7 (402-463)||(30664702-30664763)
chr7 (263-344)||(30914674-30914755)
chr7 (419-512)||(40138986-40139079)
chr7 (259-336)||(40169640-40169717)
chr7 (399-473)||(42103598-42103674)
chr7 (257-290)||(45558351-45558384)
chr7 (145-229)||(1740673-1740756)
chr7 (258-374)||(1740791-1740907)
chr7 (260-383)||(5418071-5418195)
chr7 (258-354)||(9797900-9797995)
chr7 (414-458)||(24549780-24549824)
chr7 (161-261)||(24549978-24550078)
chr7 (402-458)||(30144909-30144965)
chr7 (411-515)||(33103069-33103173)
chr7 (411-503)||(38103661-38103752)
chr7 (439-515)||(38607163-38607239)
chr7 (419-515)||(47796187-47796283)
[»] chr1 (112 HSPs)
chr1 (24-515)||(1210499-1210992)
chr1 (24-515)||(9592488-9592981)
chr1 (24-515)||(43240414-43240909)
chr1 (30-515)||(30202165-30202652)
chr1 (28-512)||(9599432-9599918)
chr1 (24-515)||(51440800-51441292)
chr1 (24-486)||(8671674-8672136)
chr1 (24-515)||(49347428-49347921)
chr1 (24-513)||(51601812-51602301)
chr1 (24-515)||(22089848-22090343)
chr1 (85-515)||(37462911-37463334)
chr1 (70-470)||(696069-696471)
chr1 (65-515)||(39140309-39140762)
chr1 (150-511)||(18469121-18469482)
chr1 (24-383)||(32082912-32083273)
chr1 (181-515)||(9509229-9509565)
chr1 (66-383)||(15085730-15086049)
chr1 (147-467)||(32231037-32231359)
chr1 (135-515)||(34792384-34792765)
chr1 (29-290)||(8391529-8391794)
chr1 (24-230)||(34827424-34827630)
chr1 (300-515)||(52561624-52561839)
chr1 (24-338)||(19936276-19936584)
chr1 (24-230)||(46226604-46226810)
chr1 (269-515)||(32404561-32404807)
chr1 (199-513)||(4001492-4001808)
chr1 (201-515)||(27847835-27848155)
chr1 (425-515)||(19936617-19936707)
chr1 (121-515)||(38807706-38808101)
chr1 (267-447)||(48431509-48431689)
chr1 (258-489)||(40416361-40416592)
chr1 (394-515)||(39318255-39318376)
chr1 (394-515)||(41560355-41560476)
chr1 (145-282)||(26016312-26016451)
chr1 (199-458)||(43423646-43423909)
chr1 (397-515)||(8796338-8796456)
chr1 (109-336)||(40419478-40419707)
chr1 (49-503)||(52831837-52832280)
chr1 (313-503)||(7762484-7762674)
chr1 (394-487)||(8628156-8628249)
chr1 (258-371)||(51812515-51812628)
chr1 (258-515)||(2544589-2544840)
chr1 (419-515)||(52532651-52532747)
chr1 (213-318)||(52561843-52561950)
chr1 (159-265)||(4379894-4380000)
chr1 (411-489)||(29128926-29129004)
chr1 (394-515)||(25979266-25979387)
chr1 (258-515)||(3818891-3819148)
chr1 (411-511)||(16142019-16142119)
chr1 (394-458)||(26299211-26299275)
chr1 (411-511)||(27520246-27520346)
chr1 (269-489)||(41611807-41612027)
chr1 (419-513)||(52739547-52739642)
chr1 (62-172)||(41560228-41560338)
chr1 (162-271)||(16142165-16142274)
chr1 (311-473)||(30834054-30834216)
chr1 (258-515)||(4029112-4029369)
chr1 (262-374)||(37263325-37263437)
chr1 (425-513)||(48865744-48865832)
chr1 (338-458)||(478748-478868)
chr1 (426-513)||(43375635-43375722)
chr1 (258-336)||(1661420-1661498)
chr1 (419-513)||(12930348-12930442)
chr1 (24-110)||(27445652-27445738)
chr1 (422-515)||(37311790-37311883)
chr1 (419-500)||(51812660-51812741)
chr1 (394-515)||(52921206-52921327)
chr1 (439-515)||(4707256-4707331)
chr1 (437-515)||(15438831-15438906)
chr1 (240-470)||(36623964-36624178)
chr1 (145-273)||(52442781-52442911)
chr1 (397-515)||(6025734-6025852)
chr1 (421-515)||(10200341-10200435)
chr1 (419-515)||(8676897-8676996)
chr1 (145-266)||(41611047-41611168)
chr1 (394-515)||(42501234-42501355)
chr1 (360-458)||(52442620-52442718)
chr1 (394-458)||(8203226-8203290)
chr1 (160-228)||(10200486-10200554)
chr1 (85-181)||(11331435-11331531)
chr1 (85-181)||(11489456-11489552)
chr1 (394-458)||(15577544-15577608)
chr1 (443-515)||(34444531-34444603)
chr1 (399-470)||(34827183-34827255)
chr1 (199-374)||(14226005-14226180)
chr1 (463-510)||(19822083-19822130)
chr1 (397-484)||(19908450-19908537)
chr1 (460-515)||(28090729-28090784)
chr1 (394-489)||(29577204-29577298)
chr1 (258-293)||(40920782-40920817)
chr1 (156-368)||(52633355-52633567)
chr1 (435-513)||(5338880-5338958)
chr1 (395-441)||(7124268-7124314)
chr1 (452-510)||(10146763-10146821)
chr1 (439-513)||(15086093-15086167)
chr1 (184-230)||(16822341-16822387)
chr1 (397-515)||(28511836-28511954)
chr1 (394-512)||(36339842-36339959)
chr1 (401-515)||(38869015-38869129)
chr1 (312-374)||(39894826-39894888)
chr1 (422-515)||(4415503-4415596)
chr1 (398-511)||(11941619-11941732)
chr1 (255-336)||(13827931-13828012)
chr1 (401-458)||(19969304-19969361)
chr1 (430-515)||(27072522-27072607)
chr1 (401-515)||(40228039-40228155)
chr1 (165-230)||(52739874-52739939)
chr1 (118-230)||(7814312-7814424)
chr1 (419-503)||(11331251-11331335)
chr1 (419-503)||(11489272-11489356)
chr1 (436-515)||(32082791-32082871)
chr1 (394-458)||(46226381-46226445)
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (24-515)||(36565276-36565769)
chr8 (24-515)||(42854039-42854532)
chr8 (24-485)||(39946611-39947074)
chr8 (24-515)||(36544906-36545396)
chr8 (66-486)||(36395013-36395439)
chr8 (33-470)||(18124939-18125374)
chr8 (200-515)||(45419169-45419482)
chr8 (27-278)||(12492116-12492367)
chr8 (66-333)||(2796351-2796622)
chr8 (199-513)||(29520589-29520894)
chr8 (30-266)||(25288662-25288898)
chr8 (31-265)||(15215558-15215792)
chr8 (36-266)||(25300003-25300233)
chr8 (199-513)||(40813251-40813569)
chr8 (239-515)||(11523758-11524037)
chr8 (312-515)||(43904700-43904903)
chr8 (93-290)||(18752135-18752332)
chr8 (32-257)||(37077527-37077752)
chr8 (300-510)||(30559725-30559935)
chr8 (270-515)||(12491173-12491418)
chr8 (24-230)||(29735564-29735766)
chr8 (24-127)||(4032919-4033022)
chr8 (202-431)||(32043522-32043753)
chr8 (159-467)||(45512578-45512889)
chr8 (58-290)||(8879700-8879928)
chr8 (25-144)||(13984789-13984908)
chr8 (424-515)||(490491-490582)
chr8 (397-515)||(30783077-30783195)
chr8 (397-515)||(32931090-32931207)
chr8 (33-331)||(30113416-30113715)
chr8 (419-515)||(14459046-14459142)
chr8 (399-515)||(17491689-17491805)
chr8 (394-470)||(28169518-28169594)
chr8 (397-548)||(35914602-35914754)
chr8 (159-319)||(42493537-42493697)
chr8 (421-512)||(45041354-45041444)
chr8 (83-469)||(9904963-9905355)
chr8 (303-488)||(16917219-16917403)
chr8 (339-456)||(24558558-24558671)
chr8 (397-513)||(35362687-35362803)
chr8 (58-290)||(38328069-38328301)
chr8 (411-515)||(39967534-39967638)
chr8 (411-518)||(41444371-41444479)
chr8 (312-372)||(42584415-42584475)
chr8 (159-290)||(13986383-13986516)
chr8 (360-503)||(26904954-26905096)
chr8 (339-458)||(38178352-38178471)
chr8 (425-503)||(42584516-42584594)
chr8 (394-515)||(2216414-2216533)
chr8 (128-290)||(13171909-13172073)
chr8 (397-518)||(16994476-16994597)
chr8 (401-510)||(28269720-28269827)
chr8 (313-458)||(10079999-10080144)
chr8 (396-512)||(14903689-14903805)
chr8 (395-518)||(3802000-3802123)
chr8 (436-515)||(15215447-15215526)
chr8 (211-290)||(25985462-25985541)
chr8 (260-515)||(29700268-29700523)
chr8 (419-518)||(36069753-36069852)
chr8 (421-503)||(4955344-4955426)
chr8 (421-515)||(25473438-25473532)
chr8 (265-383)||(25985767-25985884)
chr8 (422-512)||(42469765-42469855)
chr8 (394-503)||(2027656-2027765)
chr8 (397-458)||(4011212-4011273)
chr8 (419-512)||(16035765-16035858)
chr8 (120-185)||(17491993-17492058)
chr8 (16-125)||(25439282-25439391)
chr8 (192-336)||(33511282-33511424)
chr8 (144-225)||(39953591-39953672)
chr8 (261-330)||(44373769-44373838)
chr8 (258-458)||(13589476-13589669)
chr8 (436-515)||(15174870-15174950)
chr8 (394-458)||(23023351-23023415)
chr8 (440-512)||(31715992-31716064)
chr8 (408-496)||(33827811-33827899)
chr8 (436-511)||(33076292-33076367)
chr8 (260-331)||(34196064-34196135)
chr8 (255-386)||(41971942-41972072)
chr8 (421-515)||(21121299-21121392)
chr8 (159-291)||(30783293-30783433)
chr8 (144-290)||(5908516-5908664)
chr8 (245-290)||(8932679-8932724)
chr8 (311-368)||(11733790-11733847)
chr8 (394-455)||(13986619-13986680)
chr8 (58-103)||(16916974-16917019)
chr8 (439-512)||(25300270-25300343)
chr8 (199-268)||(36069572-36069641)
chr8 (125-186)||(37256081-37256142)
chr8 (450-503)||(37768461-37768514)
chr8 (394-458)||(39388908-39388973)
chr8 (438-515)||(44529395-44529472)
chr8 (479-515)||(24558694-24558730)
[»] chr2 (95 HSPs)
chr2 (15-515)||(3865817-3866319)
chr2 (24-515)||(8180534-8181027)
chr2 (36-383)||(41763209-41763557)
chr2 (24-515)||(3243688-3244179)
chr2 (24-265)||(2610282-2610523)
chr2 (24-512)||(11992146-11992634)
chr2 (63-511)||(12734499-12734943)
chr2 (24-515)||(4807346-4807842)
chr2 (24-511)||(41197266-41197756)
chr2 (85-515)||(36183266-36183698)
chr2 (15-515)||(45367660-45368161)
chr2 (93-515)||(38429707-38430131)
chr2 (24-230)||(451944-452150)
chr2 (24-547)||(13149067-13149612)
chr2 (186-515)||(9556404-9556734)
chr2 (24-255)||(6238051-6238281)
chr2 (258-515)||(2610578-2610835)
chr2 (58-262)||(23997405-23997609)
chr2 (186-515)||(38434867-38435199)
chr2 (36-230)||(30743389-30743583)
chr2 (199-510)||(18424417-18424728)
chr2 (199-515)||(38452721-38453042)
chr2 (263-489)||(12141539-12141765)
chr2 (419-513)||(9496017-9496111)
chr2 (141-286)||(19337114-19337260)
chr2 (258-515)||(43751982-43752239)
chr2 (398-513)||(12882082-12882197)
chr2 (300-515)||(451683-451898)
chr2 (264-512)||(18958903-18959155)
chr2 (396-513)||(33287549-33287666)
chr2 (394-515)||(45543108-45543228)
chr2 (155-267)||(16097275-16097387)
chr2 (313-513)||(7326197-7326397)
chr2 (24-113)||(38453059-38453148)
chr2 (119-254)||(24583904-24584039)
chr2 (423-513)||(19336930-19337020)
chr2 (258-515)||(25834671-25834925)
chr2 (394-515)||(26670894-26671015)
chr2 (394-515)||(43573165-43573285)
chr2 (402-470)||(4682257-4682325)
chr2 (408-500)||(37282231-37282323)
chr2 (327-512)||(37470171-37470356)
chr2 (178-345)||(7825266-7825437)
chr2 (200-374)||(42092449-42092623)
chr2 (397-515)||(35755280-35755402)
chr2 (200-336)||(9578917-9579053)
chr2 (395-515)||(28508805-28508925)
chr2 (412-512)||(31959665-31959765)
chr2 (295-383)||(32443692-32443780)
chr2 (397-513)||(45436971-45437087)
chr2 (159-386)||(23714425-23714651)
chr2 (159-386)||(24102097-24102323)
chr2 (411-515)||(33504366-33504471)
chr2 (394-515)||(35643074-35643195)
chr2 (422-511)||(39029735-39029824)
chr2 (439-515)||(227360-227436)
chr2 (146-230)||(7292864-7292948)
chr2 (436-512)||(36650610-36650686)
chr2 (182-354)||(4598758-4598934)
chr2 (360-488)||(19235046-19235174)
chr2 (129-188)||(32443473-32443532)
chr2 (258-458)||(37481709-37481909)
chr2 (425-480)||(37529554-37529609)
chr2 (397-512)||(43832227-43832342)
chr2 (274-384)||(24583798-24583908)
chr2 (315-458)||(26784432-26784575)
chr2 (258-374)||(11412711-11412825)
chr2 (425-517)||(11412865-11412959)
chr2 (425-515)||(45077884-45077976)
chr2 (419-515)||(1626346-1626442)
chr2 (254-290)||(7615283-7615319)
chr2 (419-503)||(42149707-42149791)
chr2 (430-513)||(6219127-6219210)
chr2 (412-515)||(9996661-9996764)
chr2 (311-503)||(11744566-11744758)
chr2 (444-515)||(32443812-32443883)
chr2 (100-220)||(36039049-36039173)
chr2 (436-503)||(36616856-36616923)
chr2 (125-216)||(37281962-37282053)
chr2 (312-383)||(45077799-45077870)
chr2 (419-489)||(2377204-2377274)
chr2 (303-373)||(12026182-12026252)
chr2 (260-334)||(41330121-41330195)
chr2 (419-452)||(8491270-8491303)
chr2 (397-454)||(29548733-29548790)
chr2 (458-511)||(31415552-31415605)
chr2 (313-345)||(907725-907757)
chr2 (394-486)||(6237817-6237909)
chr2 (441-513)||(9394667-9394739)
chr2 (418-470)||(12443134-12443186)
chr2 (436-547)||(23997770-23997882)
chr2 (439-515)||(30306203-30306279)
chr2 (259-291)||(32402638-32402670)
chr2 (397-489)||(37452287-37452379)
chr2 (239-335)||(41545375-41545474)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (24-515)||(31222-31715)
scaffold0018 (161-336)||(44082-44262)
scaffold0018 (402-458)||(178512-178568)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (24-515)||(52138554-52139047)
chr3 (24-515)||(28245191-28245684)
chr3 (15-514)||(51447753-51448246)
chr3 (164-511)||(54128272-54128622)
chr3 (49-515)||(5168607-5169079)
chr3 (24-425)||(27917326-27917727)
chr3 (93-468)||(26490139-26490515)
chr3 (24-336)||(25191133-25191445)
chr3 (156-512)||(19676119-19676480)
chr3 (102-541)||(54278852-54279294)
chr3 (24-265)||(38849848-38850089)
chr3 (37-282)||(53519353-53519600)
chr3 (258-489)||(45289152-45289385)
chr3 (260-491)||(38430840-38431071)
chr3 (24-230)||(47542034-47542239)
chr3 (261-513)||(50960674-50960922)
chr3 (300-515)||(39235170-39235384)
chr3 (143-374)||(49503730-49503968)
chr3 (204-374)||(48734311-48734481)
chr3 (100-449)||(33272124-33272480)
chr3 (313-515)||(48508280-48508482)
chr3 (24-225)||(30345281-30345478)
chr3 (217-503)||(39600728-39601016)
chr3 (24-347)||(3186523-3186847)
chr3 (200-381)||(19736926-19737110)
chr3 (87-226)||(43695091-43695230)
chr3 (174-515)||(47233631-47233974)
chr3 (199-515)||(22002-22319)
chr3 (200-381)||(19757829-19758013)
chr3 (413-515)||(49042081-49042184)
chr3 (397-515)||(54365010-54365128)
chr3 (428-512)||(29601052-29601136)
chr3 (258-515)||(35033136-35033393)
chr3 (145-333)||(344928-345118)
chr3 (263-515)||(42510051-42510301)
chr3 (165-264)||(45236751-45236850)
chr3 (425-515)||(36304123-36304213)
chr3 (394-515)||(12096740-12096861)
chr3 (399-488)||(40116530-40116619)
chr3 (129-254)||(48953694-48953818)
chr3 (59-219)||(29817293-29817453)
chr3 (420-515)||(15296059-15296154)
chr3 (338-458)||(19162679-19162799)
chr3 (303-515)||(42026571-42026783)
chr3 (419-458)||(52678942-52678981)
chr3 (166-325)||(31337751-31337910)
chr3 (59-109)||(40674556-40674606)
chr3 (402-514)||(45486885-45487000)
chr3 (419-512)||(49841767-49841860)
chr3 (436-556)||(53519748-53519869)
chr3 (202-282)||(36820229-36820309)
chr3 (147-230)||(2341036-2341119)
chr3 (258-345)||(3987037-3987124)
chr3 (414-489)||(37779023-37779098)
chr3 (211-289)||(33307087-33307165)
chr3 (429-515)||(40116373-40116459)
chr3 (146-290)||(45728021-45728169)
chr3 (394-511)||(23534609-23534726)
chr3 (258-383)||(38060421-38060546)
chr3 (450-511)||(39208790-39208851)
chr3 (411-515)||(38060857-38060961)
chr3 (397-503)||(41482184-41482292)
chr3 (419-511)||(41842562-41842654)
chr3 (423-515)||(49503603-49503695)
chr3 (439-515)||(52156119-52156195)
chr3 (425-512)||(19758044-19758131)
chr3 (411-458)||(36820069-36820116)
chr3 (448-503)||(40106667-40106722)
chr3 (255-290)||(54365236-54365271)
chr3 (422-512)||(25191531-25191621)
chr3 (203-462)||(37227863-37228122)
chr3 (157-230)||(653859-653932)
chr3 (412-457)||(2340810-2340855)
chr3 (312-353)||(6987816-6987857)
chr3 (394-463)||(30294208-30294277)
chr3 (442-503)||(30797869-30797930)
chr3 (397-458)||(33755434-33755495)
chr3 (446-515)||(48953454-48953523)
chr3 (420-473)||(50621435-50621488)
chr3 (438-515)||(53262311-53262388)
chr3 (58-290)||(55244090-55244320)
chr3 (425-513)||(388299-388387)
chr3 (201-273)||(38054616-38054688)
chr3 (140-305)||(46227166-46227333)
chr3 (394-458)||(54920780-54920843)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (24-515)||(82475-82965)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (24-228)||(2594-2798)
scaffold0570 (239-512)||(986-1259)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (140-290)||(25705-25857)
scaffold0157 (396-512)||(25570-25686)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (60-265)||(86894-87101)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (29-338)||(11808-12121)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (140-384)||(4437-4684)
scaffold0036 (421-553)||(4276-4410)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (30-108)||(29-107)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (411-513)||(160361-160463)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (412-513)||(14727-14828)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (411-463)||(1606-1658)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (419-515)||(4787-4883)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (397-515)||(58261-58379)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (422-515)||(16732-16825)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (421-515)||(484-578)
[»] scaffold0373 (1 HSPs)
scaffold0373 (419-489)||(2362-2432)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (429-510)||(39480-39561)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (401-457)||(11930-11986)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 6056309 - 6055734
Alignment:
Q  13 aatatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6056309 aatatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaagagcttcaagtgttttatgcgataagaaaatatcatttaagttgaaaggataattctatcggac 6056210  T
Q  113 aacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttgg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6056209 aacggtcagaccgacaatgttatatgatacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtagaaatgcggatgttgcgttgg 6056110  T
Q  213 atgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaa-aaaattataggaaataggcttta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6056109 atgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaaattataggaaataggtttta 6056010  T
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctata 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||    
T  6056009 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaaggtagaggaagacctata 6055910  T
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6055909 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 6055810  T
Q  512 ccgaaccatttaataagataacacttggttattgttgatgttttttcataatctcattggagaactaattatatat 587  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6055809 ccgaaccatttaatgagataacacttggttattgttgatgttatttcataatctcattggagaactaattatatat 6055734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 551
Target Start/End: Original strand, 607913 - 608445
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||| |  | || ||||  |||||| | | |||||||||||| | |||||||    
T  607913 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagacatgaccacttaaactgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagac 608012  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || | ||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  608013 cggcaatgttgtattgtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaataaagtaagtgtagcggagatgaggatgttccgttggatgagtggtaa 608112  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||   |||||||  ||    
T  608113 gactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttggaca 608212  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatcta--ta--aaaacttt 419  Q
    |||||||||||||  ||||||||   | ||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||       ||| || ||||| |||  ||  |||||| |    
T  608213 tgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacctaattaagaaaactat 608312  T
Q  420 aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaacc- 518  Q
      ||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || | | |||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  608313 tcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccct 608412  T
Q  519 atttaataagataacacttggttattgttgatg 551  Q
    | ||| |  ||||| |||||||| |||||||||    
T  608413 acttagtgggataagacttggttgttgttgatg 608445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10100385 - 10100026
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||    
T  10100385 caagctgggtggttggaatggagaagagcctcatgtgttttgtgagataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagac 10100286  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10100285 cgacgatgttgtatggtacggagtgttgggaggttaagagccaagacgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaa 10100186  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| |  || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||  |  ||| ||||| ||||   |||||||  ||    
T  10100185 gactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggaca 10100086  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    ||||||||||||| | |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  10100085 tgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtca 10100026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 510
Target Start/End: Original strand, 5631572 - 5632064
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5631572 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagac 5631671  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | ||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5631672 cgacaatgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagccaacgcgagagtaaagtaagtgtagcgaagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaa 5631771  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt------agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtt 317  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||   |||||    
T  5631772 gactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtt 5631871  T
Q  318 tgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaact 417  Q
    ||  |||||||||||||||   |||||||   | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||       |  | |||||||  ||  |||||     
T  5631872 tggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaaggaagacttaagaaaacc 5631971  T
Q  418 ttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
     |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | ||| |||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  5631972 attcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9594080 - 9593769
Alignment:
Q  184 gcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--------ttggggtaac 275  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  9594080 gcgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagc 9593981  T
Q  276 acctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaa 375  Q
    |||  |||||||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||     
T  9593980 accattagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggag 9593881  T
Q  376 gagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgt 475  Q
    |||||||||||       |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || |    
T  9593880 gagagtcaaat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggttt 9593783  T
Q  476 ataatagaacatta 489  Q
    || |||||||||||    
T  9593782 atgatagaacatta 9593769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 515
Target Start/End: Original strand, 28085196 - 28085623
Alignment:
Q  90 ttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtag 189  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||  | || | |||| |||||||||||||| || |||||  ||||| || ||||||||||| ||||    
T  28085196 ttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggtgttgctgtatggtacggagtgttgggcggctaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtag 28085295  T
Q  190 tggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtaga 287  Q
      || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28085296 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 28085395  T
Q  288 aaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatn 387  Q
    |||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   ||| ||   || ||| ||| ||||||||| |||||  |||||||| |     
T  28085396 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagtt 28085495  T
Q  388 nnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 487  Q
          |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||     
T  28085496 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 28085595  T
Q  488 tacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || |  || ||||||| |||||||||||    
T  28085596 tatggtgtcatttgatccatgtagccga 28085623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5258678 - 5258315
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  5258678 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttttgcgatgagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagac 5258579  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |   ||||||| |||| |||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  5258578 cggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggcgaagagccaacacgagagcaaagtaagtgtagcggaggtgagaatgttgcgttggatgagtggtaa 5258479  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt----agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttg 319  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||| ||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||    
T  5258478 gactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 5258379  T
Q  320 agcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
      |||||||||||||||   ||||||   || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  5258378 gacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 5258315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 20428164 - 20427703
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||| ||||| | |||| ||    
T  20428164 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctattggacagcagtcaaac 20428065  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
      |  ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||     
T  20428064 taaaaatgttgtatagtacagagtgttgggtggttaagagccaacacgagagtcaaataagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtag 20427965  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||||     
T  20427964 gacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaa 20427865  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    | |||| ||||||||   |||||||  || ||| ||| |||| |||| || || | ||||||  |       ||| |||||||| |||  |||||| | |    
T  20427864 cgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactatta 20427765  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaa 484  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  20427764 gagaaaccatta-gaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaa 20427703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 9706530 - 9706771
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||| ||| | |||||||    
T  9706530 caagctgggtggttgaaatggagaagagcatcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagac 9706629  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || | ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  9706630 cggcaatgttgtatggtacgaagtgttaggtggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaa 9706729  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag 265  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9706730 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 9706771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28027250 - 28026877
Alignment:
Q  127 cgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac 226  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||  || | | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  28027250 cgatgttgtatggtatggagtgttgggaggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagcatagcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagac 28027151  T
Q  227 tagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag-ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatg 325  Q
    ||||  | ||  ||||| |||||||  | ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||||||| || ||||||||  ||||    
T  28027150 tagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatggggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggc-ttggtggtttggacatg 28027052  T
Q  326 tagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagaga 425  Q
    |||||| || |  ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||       |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  28027051 tagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaa 28026952  T
Q  426 aactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttga 502  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||| || ||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  28026951 aaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgat--aacattacggcgtaatttga 28026877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 515
Target Start/End: Original strand, 30031088 - 30031503
Alignment:
Q  102 ttctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcgga 201  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| || |||| ||| ||| ||     
T  30031088 ttctatcggacagcagtcagaccaatgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagttagtgtagcggagatgaggt 30031187  T
Q  202 tgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga--gagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||  |||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||  |  |||     
T  30031188 tgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 30031287  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||   ||  |||  |||||||||||||||    ||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |       ||||||    
T  30031288 aaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaga 30031387  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    || ||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| |||  |||||| || ||| |||||||| || | |||||||    
T  30031388 gggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatt 30031487  T
Q  500 tgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| |||||||||||    
T  30031488 tgatccatgtagccga 30031503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Original strand, 14030565 - 14030875
Alignment:
Q  29 tgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacg 128  Q
    ||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| ||   |     
T  14030565 tgggtggttgaaatggagaatagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaatgaaagttctatcggacaacagtcaaactagca 14030664  T
Q  129 atgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtgg-taagact 227  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||| | | ||||||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14030665 atgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagact 14030764  T
Q  228 agaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagag--agttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatg 325  Q
    ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||  |  |||  ||||||||| | |||||||  ||||    
T  14030765 agacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatg 14030864  T
Q  326 tagagagaaga 336  Q
    || ||||||||    
T  14030865 tatagagaaga 14030875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 515
Target Start/End: Original strand, 32755848 - 32756168
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt----agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaatt 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |     
T  32755848 ggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 32755947  T
Q  295 ataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnng 394  Q
     ||| ||||||||||   |||||||  ||||||||| |||||   | |||||| ||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |    
T  32755948 gtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 32756047  T
Q  395 gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacg 494  Q
    |||||| |||| |||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||    
T  32756048 gtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 32756147  T
Q  495 taatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  32756148 tcatttgatccatgtagccga 32756168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 256
Target Start/End: Original strand, 2689402 - 2689642
Alignment:
Q  16 atcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaac 115  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||| ||| | || ||| || |||| || |||||||||| |  | |||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  2689402 atcgtagtcaagctggatgattgaaatggagaagtgcctcatgtattttgtgtgataagaaagcactacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagc 2689501  T
Q  116 ggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatg 215  Q
     ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||| ||||||  |||||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  2689502 agtcagaccgtcgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaacagccaacgcgagaattaagtaaatgtagtggagatgaggatgttgtgatggatg 2689601  T
Q  216 agtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccat 256  Q
    ||  ||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||    
T  2689602 agcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 515
Target Start/End: Original strand, 5095927 - 5096081
Alignment:
Q  361 gtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttag 460  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||       |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  5095927 gtagatcagatggaagagagttagatcagaagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttgg 5096026  T
Q  461 atccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| |||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  5096027 atcaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtagccga 5096081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 30679219 - 30679393
Alignment:
Q  15 tatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaa 114  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  30679219 tatcgtattcaagttgggtggttgaaatagagaagaggctcaggtgttttgagcgataagaaagtaccacataagttgaaaggaaagttctatcagacaa 30679318  T
Q  115 cggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtag 189  Q
    | ||||||||||||||||| |||| | |  | ||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  30679319 cagtcagaccgacgatgttgtatggtgcataatgttggacagttaagaatcaacacgagaatcaagtaagtgtag 30679393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2065250 - 2065048
Alignment:
Q  58 gtgttttatgcgataagaaagtatcat-ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtgg 156  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | || | ||||||| |||| |||||| ||||||  ||    
T  2065250 gtgttttatttgataagaaagta-catcttaagttgaaaggaaacttctatcggacaaccgtaaaactggcgatgttgtatggtacggaatgttggacgg 2065152  T
Q  157 ttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccat 256  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||| | |  |||||||| |||||||||| | | |||  |||||  |||||||||||    
T  2065151 ttaagagccaacacgagaatcaagtacgtgtagcggagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccat 2065052  T
Q  257 taga 260  Q
    ||||    
T  2065051 taga 2065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Original strand, 31818664 - 31818778
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||| || ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  31818664 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaattt 31818763  T
Q  501 gatgcatgtagccga 515  Q
    ||| |||||||||||    
T  31818764 gatccatgtagccga 31818778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 35043853 - 35043479
Alignment:
Q  140 tacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtg 239  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||  |    
T  35043853 tacggagtgttggacggttaagagccaacatgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgatagg 35043754  T
Q  240 attaagaatgacaccattaga--gagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagag 337  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||| |||||||||  |  | | ||||||||||   | |||||  ||||||||||||| |     
T  35043753 attatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatac 35043654  T
Q  338 ttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaa 437  Q
      |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |        ||||| ||||| |||  |||||  | |||||||| ||||  ||    
T  35043653 ccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaa 35043554  T
Q  438 agatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || | | |||||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  35043553 ggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcaatgtagc 35043479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 12890701 - 12890822
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||| ||||| |||  |||||| |||||||||| ||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || | |    
T  12890701 ggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggc 12890800  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  12890801 gtaatttgatccatgtagccga 12890822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34658 - 34543
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||| |||  |||||| || ||| ||||||||||| | ||||    
T  34658 agaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 34559  T
Q  497 atttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||| ||||||||    
T  34558 atttgatccatgtagc 34543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 503
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666046
Alignment:
Q  276 acctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgtt-gtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| || |||||| | | ||||||||||||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  375 agagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtg 474  Q
      | ||||  ||       || ||||||||   || || ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||     
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  475 tataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgat 24666046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 381
Target Start/End: Original strand, 26291533 - 26291892
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcat-ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcaga 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | | ||| || ||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||| | |||| ||||| |||||  ||| |    
T  26291533 caagttggatggttgaaatgtagaataacctcatgtattttatgtgataagaaagca-catgttaagttggaagtaaaattatatcgaacaactatcata 26291631  T
Q  123 ccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggta 222  Q
    |  || ||||| |||| ||||||||||| || | | || |||||||| || ||| ||||||| ||| | || |||  ||||||| |||| ||| ||||||    
T  26291632 ctaacaatgttgtatggtacggagtgttaggcgttgaa-aaccaacatgagaataaagtaagtgtaattgagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggta 26291730  T
Q  223 agactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga----gagttggggta-acacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtt 317  Q
    || |||||   |||   |||| |||||| || ||||||||    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||  ||| |||||| |||  ||||||    
T  26291731 agtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatagaaaatatggtagaaaatagacttaggtggtt 26291830  T
Q  318 tgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagt 381  Q
    ||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  26291831 tg--catgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagt 26291892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 1748083 - 1747984
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| | |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  1748083 aaaactattagagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgtag 1747984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Original strand, 33496023 - 33496178
Alignment:
Q  109 ggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcg 208  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||  ||| |||  ||||||||     
T  33496023 ggacaacagtcagacctgcaatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaagtaagtgtaacggagatgatgatgttgca 33496122  T
Q  209 ttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga 264  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||  |||||  ||||||||||||| |||||    
T  33496123 ttggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagaga 33496178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3206573 - 3206455
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga-accatttaataagataaca 534  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| |  ||||| |    
T  3206573 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaga 3206474  T
Q  535 cttggttattgttgatgtt 553  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  3206473 cttggttattgttgttgtt 3206455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Original strand, 8364689 - 8364803
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||   ||| || || ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  8364689 gaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 8364788  T
Q  501 gatgcatgtagccga 515  Q
    ||| |||||||||||    
T  8364789 gatccatgtagccga 8364803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 423 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14389288 - 14389202
Alignment:
Q  423 agaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgt 509  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14389288 agaaactcttaagaaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 336
Target Start/End: Original strand, 33083957 - 33084126
Alignment:
Q  169 acgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagt 266  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||   ||||  ||||||   |||  |||||||||    
T  33083957 acgaacataaagtaagcgtagcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagt 33084056  T
Q  267 tggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| || ||| |||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  33084057 tggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaaga 33084126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 34143921 - 34143804
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |    
T  34143921 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 34143822  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtag 511  Q
    || ||||||| |||||||    
T  34143821 gtcatttgatccatgtag 34143804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 34156537 - 34156420
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |    
T  34156537 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 34156438  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtag 511  Q
    || ||||||| |||||||    
T  34156437 gtcatttgatccatgtag 34156420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 290
Target Start/End: Original strand, 5080766 - 5080877
Alignment:
Q  181 taagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga--gagttggggtaacacc 278  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||| |||| |  ||  ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  5080766 taagtgtagtggagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacc 5080865  T
Q  279 tatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||||||    
T  5080866 tatagtagaaaa 5080877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11295334 - 11295246
Alignment:
Q  118 tcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  11295334 tcagaccgatgatgttatatggtacaaagtgttaagggattaagaaccaacataaaaatcaagtaagcgtagtagagatgaggatgttg 11295246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21352051
Alignment:
Q  216 agtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtgg 315  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||| |||| ||| | ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||   ||     
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatga 21352072  T
Q  316 tttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  21352071 tttggacatgtagagagaaga 21352051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 515
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819078
Alignment:
Q  441 tttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 31819078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 396 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6293546 - 6293453
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| |||||    
T  6293546 tagaggaagatctagaaaaactaaaatagaaactattaggaaatatctagatattaatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcatta 6293453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25494249 - 25494181
Alignment:
Q  152 ggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggt 221  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25494249 ggtggttaagaaccaacaagagaataaagtaagtgt-gtggagatggggatgttgcgttggatgtgtggt 25494181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Original strand, 9706941 - 9707017
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | | | ||||||| |||||||||||    
T  9706941 gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccga 9707017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934865
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | | | ||||||| |||||||||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccga 34934865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 43185 - 43119
Alignment:
Q  417 tttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataataga 483  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||    
T  43185 tttaagagaaactattaataaagatctagagagtaatgagttggatcaaaatatagtttatgataga 43119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 512
Target Start/End: Original strand, 5897615 - 5897701
Alignment:
Q  426 aactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||| || |||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5897615 aactattagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagc 5897701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 446
Target Start/End: Original strand, 9568820 - 9568870
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttaga 446  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9568820 tagatgaagatctagaacaactataagagaaactattaggaaagatttaga 9568870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10099023 - 10098936
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||| ||||||    
T  10099023 agagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgta 10098936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21351966 - 21351872
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||  | | | |||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  21351966 agagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 35199749 - 35199684
Alignment:
Q  423 agaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||    
T  35199749 agaaactattaggaaagatctagagattaatgagttagatagaaatat-gtatatgatagaacatta 35199684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 354
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079426
Alignment:
Q  269 gggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagta 354  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||  | | |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtagattatgtagta 2079426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Original strand, 12890559 - 12890643
Alignment:
Q  245 gaatgacaccattag--agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgta 327  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |||||||    
T  12890559 gaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta 12890643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 1615304 - 1615224
Alignment:
Q  469 atagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaac-catttaataagataacacttggttattgttg 548  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  1615304 atagtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttg 1615224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 371
Target Start/End: Original strand, 2689647 - 2689743
Alignment:
Q  275 cacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagat 371  Q
    |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  || ||| ||||||||||||    
T  2689647 cacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagat 2689743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 455
Target Start/End: Original strand, 7080467 - 7080527
Alignment:
Q  395 gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatga 455  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || || |||||||    
T  7080467 gtagaggaaaacctataaaaactataagagaaactatcaagaaagatctaaagattaatga 7080527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 430 - 470
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492591
Alignment:
Q  430 attatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatat 7492591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Original strand, 7634531 - 7634607
Alignment:
Q  427 actattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||    
T  7634531 actattatgaaatacttacatgttaatgaattagatttaaatatagtttatgatagaacattatagcgtaatttgat 7634607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 31831998 - 31831942
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaa 467  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  31831998 aaaaactatcagagaaactattaagaaagatctagagattactgagttggatccaaa 31831942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Original strand, 33497085 - 33497161
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  |||  || |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  33497085 ggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatat 33497161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31960342 - 31959849
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  31960342 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 31960243  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31960242 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 31960143  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  31960142 gactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 31960043  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  31960042 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 31959943  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  31959942 gagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 31959849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 48174614 - 48174131
Alignment:
Q  31 ggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgat 130  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| || |    
T  48174614 ggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgtt 48174515  T
Q  131 gttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||| |||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174514 gttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 48174415  T
Q  231 aaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtag 328  Q
     | ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   || |||| ||||||||    
T  48174414 catgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtag 48174315  T
Q  329 agagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaac 428  Q
    ||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | ||||||||    
T  48174314 agagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaac 48174215  T
Q  429 tattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
     ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  48174214 cattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagc 48174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1777543 - 1777052
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  1777543 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 1777444  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1777443 cgacgttgttgtatgatacggagtgttgaaaggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 1777344  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||| ||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  ||    
T  1777343 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggaaatagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggaca 1777244  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    | ||||||||||| |  ||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||    
T  1777243 tctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 1777144  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  1777143 gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtatggcgtcatttgatccatgtagccga 1777052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 515
Target Start/End: Original strand, 435991 - 436476
Alignment:
Q  32 gtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatg 131  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||| || ||    
T  435991 gtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttg 436090  T
Q  132 ttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaa 231  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  436091 ttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagac 436190  T
Q  232 aggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtaga 329  Q
    | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   || |||| |||||||||    
T  436191 atgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtaga 436290  T
Q  330 gagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaact 429  Q
    |||||||  ||||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | ||||||||     
T  436291 gagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc 436390  T
Q  430 attatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||  || ||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||||||| || | | | ||||||| |||||||||||    
T  436391 actagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccga 436476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 33226963 - 33227456
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  33226963 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtacgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 33227062  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33227063 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaa 33227162  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   | ||||| |    
T  33227163 gactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttggg 33227262  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  ||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |       |||||| ||||| |||  |||||| | |    
T  33227263 catgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactatta 33227362  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || |||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  33227363 gaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 33227456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23906829 - 23906335
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  23906829 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 23906730  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  23906729 cggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaa 23906630  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--------agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtgg 315  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||        ||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||   |||    
T  23906629 gactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatgg 23906530  T
Q  316 tttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||| |       |||| | ||||| ||| |||||    
T  23906529 tttgagcatgtagagagaaga--cgtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaa 23906432  T
Q  416 ctttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    || | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||    
T  23906431 ctattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 23906335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 56375044 - 56375537
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |  ||||||||||| | |||||||    
T  56375044 caagctgggtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaatttgaaaggaaagatctatcggacagcagtcagac 56375143  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |  || | || |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||  ||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56375144 cagcgttattgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaacaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 56375243  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |  ||| ||| ||||||   ||||||| |    
T  56375244 gactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttggg 56375343  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  56375344 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactatta 56375443  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  56375444 gagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 56375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 511
Target Start/End: Original strand, 43433672 - 43434167
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||    
T  43433672 caagctgggtgattgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtgtcacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatcagac 43433771  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43433772 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaa 43433871  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--------agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtgg 315  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||        ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||    
T  43433872 gactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg 43433971  T
Q  316 tttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  ||||    
T  43433972 tttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 43434071  T
Q  416 ctttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    || | |||||||| |||   || ||||||||||| |||||||  ||||||||| |  ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  43434072 ctattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcgtcatttgatccatgtag 43434167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 120 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 45205280 - 45204877
Alignment:
Q  120 agaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtg 219  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  45205280 agaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgagtg 45205181  T
Q  220 gtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta--gagagagtt-ggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggcttt--agtg 314  Q
    |||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||   |||    
T  45205180 gtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtg 45205081  T
Q  315 gtttgagcatgtagagagaaga---gt----tgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatc 407  Q
    ||||| ||| ||||||||||||   ||    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||       ||| |||||||| |    
T  45205080 gtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagag-cagatcaaaagaggtggaggaagacc 45204982  T
Q  408 tataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcat 507  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||  ||    
T  45204981 tagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctat 45204883  T
Q  508 gtagcc 513  Q
    ||||||    
T  45204882 gtagcc 45204877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 486
Target Start/End: Original strand, 50286725 - 50287180
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||   || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||     
T  50286725 caagctgggtggttgaaatgaagaagagtcacatgtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaccgtcagat 50286824  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50286825 cgacgttgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaa 50286924  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||     |||||||||||||||  |  ||| |||||| |||   ||||||| |||    
T  50286925 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--ggg-----acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggca 50287017  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||| |       |||||| ||||| |||| |||||| | |||    
T  50287018 tgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattaga 50287117  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaaca 486  Q
    | ||  ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||| |  ||||| ||||||||    
T  50287118 gtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaaca 50287180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27450701 - 27450355
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  27450701 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagac 27450602  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27450601 cgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaa 27450502  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | |||      || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||   ||    
T  27450501 gactagacatgat----agaataatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgaca 27450406  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    |||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| |||||    
T  27450405 tgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgga 27450355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52569992 - 52569550
Alignment:
Q  75 aaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaa 174  Q
    |||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  | |||| |||| ||||||||||||   ||||||||  ||||| || |    
T  52569992 aaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctattggacaacagtcagaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgttcggttaagagtcaacatgaga 52569893  T
Q  175 atcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggt 272  Q
    |||||||||| ||||  || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  52569892 atcaagtaagtgtagcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggt 52569793  T
Q  273 aacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatg 372  Q
    | ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| |||    
T  52569792 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatg 52569693  T
Q  373 gaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatag 472  Q
    || ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | | |||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  52569692 gaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg 52569593  T
Q  473 tgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  52569592 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 52569550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 515
Target Start/End: Original strand, 4440688 - 4441100
Alignment:
Q  102 ttctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcgga 201  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||  |||    
T  4440688 ttctatcggacagcagtcagaccaacgttgttgtatgatacggggtgttggc-ggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattagga 4440786  T
Q  202 tgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaa 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |  ||| ||    
T  4440787 tgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 4440886  T
Q  302 ataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagagg 401  Q
    ||||||||   ||||||| |||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       ||||||||    
T  4440887 ataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 4440986  T
Q  402 aagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttg 501  Q
    |||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| |||||    
T  4440987 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 4441086  T
Q  502 atgcatgtagccga 515  Q
    || |||||||||||    
T  4441087 atccatgtagccga 4441100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 46583352 - 46582827
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||| | ||||||     
T  46583352 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtattttgtgcgataagaaagtatcacttaatttgaaaggaaagttctattggacagcagtcagat 46583253  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||| || ||  ||||||||    
T  46583252 cggcgctgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaa 46583153  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| || ||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||| ||| |    
T  46583152 gactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttggg 46583053  T
Q  322 catgtagagagaaga-gttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaacttta 420  Q
    |||||  ||||||||    |||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||| |||||| |     
T  46583052 catgt--agagaagaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactatt 46582955  T
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaaccat 520  Q
    |||||||| |||   || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||  || | ||| ||||||| ||||||||| | |||     
T  46582954 agagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagcctacccac 46582855  T
Q  521 ttaataagataacacttggttattgttg 548  Q
    ||| || |||||  ||||||| ||||||    
T  46582854 ttagtaggataaggcttggttgttgttg 46582827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 204 - 513
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51421975
Alignment:
Q  204 ttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaat 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | || |||| ||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaat 51421765  T
Q  304 aggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaa 403  Q
    ||||||  |||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |   |||| ||       ||||||||||    
T  51421766 aggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaa 51421865  T
Q  404 gatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51421866 gatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 51421965  T
Q  504 gcatgtagcc 513  Q
     |||||||||    
T  51421966 ccatgtagcc 51421975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7092680 - 7092301
Alignment:
Q  91 tgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagt 190  Q
    |||||||| ||||||||  |||| | || ||| || ||||||| |||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||     
T  7092680 tgaaaggaaaattctattagacagcagttagatcggcgatgttgtatggtacggagttttaggcagttaagaaccaacacgagaagcaagtaagtgtagc 7092581  T
Q  191 ggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga--gagttggggtaacacctatagtagaa 288  Q
     || ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||  |||||||  || ||||||||||||||    
T  7092580 agagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgatta-gaatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagtagaa 7092482  T
Q  289 aaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnn 388  Q
    || || |||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |       
T  7092481 aatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcagaaca 7092382  T
Q  389 nnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
         ||| |||||||| ||| | ||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7092381 taagaggtggaggaagacctagagaaa-tataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagatctaaatat 7092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 503
Target Start/End: Original strand, 53707548 - 53708029
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  |||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || |  || |||    
T  53707548 caagctgggtggttgaaatggagaagagactcagatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggccagcattccgac 53707647  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || || | |||| ||  |||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  53707648 cggcgttgatgtatggtagagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaa 53707747  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattag--agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  || || |||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  53707748 gactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 53707847  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| |||| |||| ||||| || |||||| |       |||||||||||| | |  |||||| | |    
T  53707848 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactatta 53707947  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  53707948 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgat 53708029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48623055 - 48622578
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  48623055 caagctgggtggttgaaatggagaaaagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 48622956  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || | || ||||              ||||||| ||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48622955 cggcgttattgtatg--------------gtggttaggagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaa 48622870  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |||    
T  48622869 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 48622770  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   ||| |||  || ||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||    
T  48622769 tgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 48622670  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| |||| || |||||||||||    
T  48622669 gaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgtagccga 48622578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 35690059 - 35690326
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |  |||||||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||    
T  35690059 caagttgggtggttgaaatggagaagag-tgcgggtgttttatgtgataagaaagtgccgtttaagttgagaggaaaattctatcagacaacagttagac 35690157  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  35690158 cgacgatgttgtatgatatggaatgttgtgtggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagtgtagccgagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaa 35690257  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||   |||  ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35690258 gactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 35690326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1211918 - 1211566
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||| |  ||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  1211918 caagttaggtagttgaaatggagaagagcctcaaatgttttgtatgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagac 1211819  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||  |||||| | || ||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  1211818 cggtgatgttgtgtggtacagagtgttggacggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcactggatgagtggtaa 1211719  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaa--ataggctttagtggtttgag 321  Q
     |||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||| | ||  |  ||||||  ||| |||| | ||||||| |    
T  1211718 aactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatatgcttaaatggtttggg 1211619  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
     ||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  1211618 aatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatgga 1211566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39100929 - 39100571
Alignment:
Q  156 gttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacacca 255  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  39100929 gttaagagccaacacgagagtcatgtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacacca 39100830  T
Q  256 ttagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtac 355  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||   |||||||  || |||     
T  39100829 ttagagagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatg-cgttgtaa 39100731  T
Q  356 gaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatga 455  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||  |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||| ||||| |||||    
T  39100730 gaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatga 39100631  T
Q  456 gttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||| | || |||||||||||    
T  39100630 gttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccga 39100571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33191260 - 33190883
Alignment:
Q  140 tacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtg 239  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  33191260 tacggagtgttgggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggatagg 33191161  T
Q  240 attaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagag 337  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||     
T  33191160 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagac 33191061  T
Q  338 ttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaa 437  Q
      |||||||  ||  || |||  |||||||| |||||  |||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  ||    
T  33191060 ccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 33190961  T
Q  438 agatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||    
T  33190960 ggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgacccatgtagccga 33190883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 338
Target Start/End: Original strand, 31458875 - 31459100
Alignment:
Q  117 gtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatga 216  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| |||||||||||||| |||    
T  31458875 gtcagaccggcgatgttttatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgaaaataaagtaagtgtagcacagatgaggatgttgcgttggttga 31458974  T
Q  217 gtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga----gttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag 312  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||| |||||| |||||||||||||    || | |||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  |    
T  31458975 gtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttagg 31459074  T
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagt 338  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31459075 tggtttgggcatgtaaagagaagagt 31459100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 458
Target Start/End: Original strand, 55578846 - 55579222
Alignment:
Q  85 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 184  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  55578846 ttaagttggaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccaacaatgttgtatggtatgaagtgttgggcggttaagaaccaacacgagaatcaattaag 55578945  T
Q  185 cgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccat----tagagagagttggggtaacaccta 280  Q
     ||||   | ||| |||||||| |||| || ||||||||||  | |   |||  ||||| ||||||||| ||    |||||||||||||  |||||||||    
T  55578946 tgtagcatatatgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactattttatagagagagttggaataacaccta 55579045  T
Q  281 tagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagag 380  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||| ||||  |||||| | ||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||| ||  |||||| |||||    
T  55579046 tagt-gaaaaaatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagag 55579144  T
Q  381 tcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||       |||||| ||||| ||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  55579145 tcaaatcaaaagaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagtt 55579222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47265733 - 47265416
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtat---catttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtca 120  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||    || ||||||||||| || | ||||||| |||||| ||||    
T  47265733 caagctgggtgattgaaatgaagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtagtaccacttaagttgaaatgaaagttctatctgacaacagtca 47265634  T
Q  121 gaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtgg 220  Q
    ||||  ||||||| |||| |||  ||| ||||  ||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||   | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  47265633 gaccagcgatgttgtatggtacaaagtattggacggttaagagtcaacacgagaatcaagtaggtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtgg 47265534  T
Q  221 taagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccat--tagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag-tggtt 317  Q
    |||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||| || ||    
T  47265533 taagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaatagg-tttagatgatt 47265435  T
Q  318 tgagcatgtagagagaaga 336  Q
    || ||||||||||||||||    
T  47265434 tgggcatgtagagagaaga 47265416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 515
Target Start/End: Original strand, 1793319 - 1793709
Alignment:
Q  129 atgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 228  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||     
T  1793319 atgttgtatgatacagagtgtttggcggttaagagccaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagactt 1793418  T
Q  229 gaaaggatgtgattaagaatgacaccatta--gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgt 326  Q
     |  ||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| ||||  |  ||| ||||| ||||   |||||||  |||||    
T  1793419 aacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgt 1793518  T
Q  327 agagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaa 426  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||   |||||  ||       ||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||    
T  1793519 agagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatgga--ggagtcgtatcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaa 1793616  T
Q  427 ac----tattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||     ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||    
T  1793617 accattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 1793709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 509
Target Start/End: Original strand, 56224995 - 56225309
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagact---agaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    ||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  |    
T  56224995 gatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaagttgggataatacctatagtataaaagatggt 56225094  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggt 396  Q
    || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||||| |||       | |    
T  56225095 agaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtctaatcaagaaagtt 56225194  T
Q  397 agaggaagatctataa--aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacg 494  Q
    |||| |||||||| ||  ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| || | | |||||||| || || |    
T  56225195 agagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatg 56225294  T
Q  495 taatttgatgcatgt 509  Q
    ||||||||| |||||    
T  56225295 taatttgatccatgt 56225309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Original strand, 39708248 - 39708414
Alignment:
Q  60 gttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggtta 159  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  39708248 gttttttgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcaacagtccgatcgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggtta 39708347  T
Q  160 agaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac 226  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  39708348 agaggcaacacgagaatcaagtaagtgtagtgcagatgaggatgttgcgttggatgagcagtaagac 39708414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 290
Target Start/End: Original strand, 12494620 - 12494772
Alignment:
Q  140 tacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |    
T  12494620 tacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatagg 12494719  T
Q  240 attaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12494720 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 12494772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 515
Target Start/End: Original strand, 28236115 - 28236429
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  | |     
T  28236115 gatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtgga 28236214  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||| ||||| ||||  |||| |||| |       ||||||    
T  28236215 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagt-taaaatggtaga 28236313  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    |||||| |||  |||||| | |||||||   |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||||| |||| |  ||||||    
T  28236314 ggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatt 28236413  T
Q  500 tgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||  ||||||||||    
T  28236414 tgatctatgtagccga 28236429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 555
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798139
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||  ||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||  |  |||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtag 398  Q
     ||||||||||   |||||||  ||||||||||||||| | |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |         |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||  ||||  || |||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||| |||||||| || ||||| ||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  499 ttgatgcatgtagccga-accatttaataagataacacttggttattgttgatgtttt 555  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||| |  |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttgtttt 37798139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 300 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 53518570 - 53518365
Alignment:
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||       ||||||    
T  53518570 aaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatgga---gagtcaaatcagaagaggtaga 53518474  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    |||||  ||| ||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||| || | |||||||    
T  53518473 ggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatt 53518374  T
Q  500 tgatgcatg 508  Q
    |||| ||||    
T  53518373 tgatccatg 53518365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 336
Target Start/End: Original strand, 54470081 - 54470275
Alignment:
Q  144 gagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgatta 243  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||| |||| || |||||||| | || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||     
T  54470081 gagtgttgggttgtcatgaaccaacacgtaaataaattaagcgtaatagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgattt 54470180  T
Q  244 agaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
      ||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | || ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  54470181 gaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaaga 54470275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 35690397 - 35690518
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |  || ||| ||||||||||| | |    
T  35690397 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacattatggc 35690496  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  35690497 gtaatttgatccatgtagccga 35690518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037540
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||||   | |||||||||||  |||| |||  || ||| ||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaaga 26037698  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||  |       || ||||||| | |||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26037697 agagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgagt 26037598  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||    
T  26037597 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccga 26037540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 41009800 - 41009413
Alignment:
Q  102 ttctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcgga 201  Q
    |||||| |||||||  |||||||  ||||||| |||  |||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  41009800 ttctattggacaacaatcagaccagcgatgttgtatagtacggagtgttgggcgattaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggaaatgagga 41009701  T
Q  202 tgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta--gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattat-ag 298  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | | |  |||||  ||||||| |||||  |||| | | |||||| ||||||||||||||||  |  | |     
T  41009700 tgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaa 41009601  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtag 398  Q
     |||||| |||   ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||  || ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  |       |||||    
T  41009600 aaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtag 41009501  T
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 487  Q
    ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||  || |||||||| || |||||| | ||| ||||||| || ||| ||| |||||    
T  41009500 aggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataacat 41009413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 300 - 511
Target Start/End: Original strand, 39708465 - 39708676
Alignment:
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    ||||||  || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |       ||||||    
T  39708465 aaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtaga 39708564  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    |||||| |||  |||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | |||||||    
T  39708565 ggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatt 39708664  T
Q  500 tgatgcatgtag 511  Q
    |||| |||||||    
T  39708665 tgatccatgtag 39708676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 326 - 515
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351806
Alignment:
Q  326 tagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagaga 425  Q
    |||||||||||  ||||||   ||||||| | | ||||||||||||||| || ||||| ||       ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  426 aactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |   | ||||||| |||||||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccga 28351806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497595
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |     
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgt-ggaaaaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 28497578  T
Q  358 atagtagatcagatgga 374  Q
    | |||||||||||||||    
T  28497579 agagtagatcagatgga 28497595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 263
Target Start/End: Original strand, 16002690 - 16002920
Alignment:
Q  32 gtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatg 131  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| | | || |||| |||| | || |||||  |||||    
T  16002690 gtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttcaaagaaaagttttatcagacatcagttagaccagcgatg 16002789  T
Q  132 ttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaa 231  Q
    || ||||  ||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| | | |  ||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  16002790 ttgtatga-acgaagtgttgggaggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagtgaagacgatgatgttgtgctggatgagtggtaagactagac 16002888  T
Q  232 aggatgtgattaagaatgacaccattagagag 263  Q
       ||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16002889 gaaataggattaggaatgacaccattatagag 16002920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Original strand, 17900377 - 17900502
Alignment:
Q  167 acacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga--ga 264  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||   ||||  ||||||  |||||||||  ||    
T  17900377 acacgaacataaagtaagcgtagcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacgga 17900476  T
Q  265 gttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17900477 gttggggtagcacctatagtagaaaa 17900502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 345
Target Start/End: Original strand, 50662263 - 50662465
Alignment:
Q  144 gagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgatta 243  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  | ||||||||| ||| | | |||||||| || ||||| |||||||||||| |   |||  ||||     
T  50662263 gagtgttgagtggtgaagaaccaacacataaatataataagcgtagcggagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattg 50662362  T
Q  244 agaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtgg-tttgagcatgtagagagaagagttgta 342  Q
      ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | | || |||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  50662363 gaaatgacagcattagagagagtttgggcaacacctatagtagaaaagatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgta 50662462  T
Q  343 gat 345  Q
    |||    
T  50662463 gat 50662465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20591653 - 20591353
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattag--agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||  | ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |  |    
T  20591653 ggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggt 20591554  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggt 396  Q
    || ||||| | ||   ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| || ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |       |||    
T  20591553 agaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggt 20591459  T
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||||||  | ||||  || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||  | ||||||    
T  20591458 agaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacacaatgacgta 20591360  T
Q  497 atttgat 503  Q
    |||||||    
T  20591359 atttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 55809146 - 55809070
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  55809146 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatat 55809070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 458
Target Start/End: Original strand, 26356625 - 26356809
Alignment:
Q  274 acacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgg 373  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||  |||||||| |||  |||||||||||  ||| | | |||||||| | | |||||||| |||||    
T  26356625 acacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgg 26356724  T
Q  374 aagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    | | |||||||||       ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  26356725 aggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagtt 26356809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 503
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192268
Alignment:
Q  260 agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaat 359  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||| ||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||| |||     
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtta 459  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||| |       ||||| |||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| | || |||     
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat 20192268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 37773801 - 37773498
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagt-tggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||     |||     
T  37773801 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaaggggtagcacctatagtagaaaagtcggtaga 37773702  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||| ||| ||   ||| || | || ||| | | ||||||||| ||||| ||||||||| |       ||||||    
T  37773701 aaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaaaagaggtaga 37773602  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
     ||| | |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||| || | || ||| |||||||| || ||| |||||    
T  37773601 tgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacactatgacataatt 37773502  T
Q  500 tgat 503  Q
    ||||    
T  37773501 tgat 37773498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 514
Target Start/End: Original strand, 8286565 - 8286685
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || |||    
T  8286565 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatgac 8286664  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccg 514  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  8286665 gtcatttgatccatgtagccg 8286685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 513
Target Start/End: Original strand, 37488135 - 37488336
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctata 411  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||  |||| ||       || ||||| ||| ||| |    
T  37488135 gtggttcgggcatgtagatagaagaccggtagatgttgtagtagggagagtagatcagatgcatgattgtcagatcaccataggcagaggtagacctaga 37488234  T
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||| |||||| ||  || ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  37488235 aaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtag 37488334  T
Q  512 cc 513  Q
    ||    
T  37488335 cc 37488336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 396 - 515
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957845
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 495  Q
    |||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||| || |||||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  496 aatttgatgcatgtagccga 515  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccga 6957845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28550586 - 28550535
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28550586 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatat 28550535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 49739203 - 49739116
Alignment:
Q  143 ggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49739203 ggagtgttgggcgataaagaaccaacaagagagtaaaataagcgtagtggaaatggggatgttgcgttagatgtgtggtaagactaga 49739116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10775887 - 10775682
Alignment:
Q  87 aagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcg 186  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||  |  |||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| || ||||||    
T  10775887 aagttgaagggaaaattttattggacaacggtaagaccaatgatgttgtatgggaaagagtgttgggcggtaaagaactaatgcaaaaataaattaagcg 10775788  T
Q  187 tagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagt--tggggtaacacctatagt 284  Q
    |||  || |||  ||||||| |||||||| |||| | ||| ||| ||||    ||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10775787 tagcagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagt 10775688  T
Q  285 agaaaa 290  Q
    ||||||    
T  10775687 agaaaa 10775682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 515
Target Start/End: Original strand, 55007907 - 55007993
Alignment:
Q  429 tattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  55007907 tattaagaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccga 55007993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2557828 - 2557708
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta-cga 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |  || |||| ||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||  |     
T  2557828 ggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattattgg 2557729  T
Q  493 cgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  2557728 tgtaatttgatccatgtagcc 2557708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 512
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494907
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 495  Q
    |||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  496 aatttgatgcatgtagc 512  Q
     |||| || ||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagc 12494907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25257929 - 25257757
Alignment:
Q  202 tgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaa 301  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | |||   ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||  ||| |     
T  25257929 tgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttgaggtaacacctacaatataaaagatggtagaag 25257830  T
Q  302 ataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
     ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||| ||| | | |||||||||||||||    
T  25257829 ctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatgga 25257757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 230
Target Start/End: Original strand, 11389545 - 11389680
Alignment:
Q  95 aggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaa 194  Q
    |||| |||| |||||||||   || |||||||| ||||| ||||  | | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||     
T  11389545 aggaaaattttatcggacagttgtaagaccgacaatgttgtatggaaagtagtgttgggcggttaagaaccaactcgagaataaagtaagcgtagcagag 11389644  T
Q  195 atgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  11389645 atgaggatgttggattggatgtgtggtaaaactaga 11389680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 513
Target Start/End: Original strand, 21236984 - 21237103
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || | |    
T  21236984 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtatatgatagaacactatggc 21237083  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  21237084 gtcatttgatacatgtagcc 21237103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 458
Target Start/End: Original strand, 46372018 - 46372214
Alignment:
Q  262 agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatag 361  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||  |||| || ||| ||    
T  46372018 agagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagag 46372117  T
Q  362 tagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
     ||||||||| || | ||| || ||       ||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||    
T  46372118 cagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagtt 46372214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 430 - 512
Target Start/End: Original strand, 28486083 - 28486165
Alignment:
Q  430 attatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  | || ||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  28486083 attatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 470
Target Start/End: Original strand, 31043224 - 31043274
Alignment:
Q  420 aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31043224 aagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatat 31043274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 368
Target Start/End: Original strand, 31339527 - 31339636
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |  | | || || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |     
T  31339527 agagagagttggggtagaacctatggtagaaaaa-tggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 31339625  T
Q  358 atagtagatca 368  Q
    |||||||||||    
T  31339626 atagtagatca 31339636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20602024 - 20601692
Alignment:
Q  174 aatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattag--agagagttgggg 271  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||| | |||||| | | | |||   ||| |||||||||||| |||  ||||||| | |     
T  20602024 aatccagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggaga 20601925  T
Q  272 taacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagat 371  Q
    |||||| ||||||||||||  |  ||| ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||| |||| || ||||    
T  20601924 taacacttatagtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagat 20601825  T
Q  372 ggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatata 471  Q
    ||| ||||||||  |       |||||| ||||| || | |||||| |||||||||| |||| |||||      |||| |||||||| ||| |||||||     
T  20601824 ggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccatta-gaaag----tcaggtcaatgagttggattcaaatatg 20601731  T
Q  472 gtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
     | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20601730 atttatgatagaacattatgacgtaatttgattcatgta 20601692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 485
Target Start/End: Original strand, 21107124 - 21107209
Alignment:
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaac 485  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  21107124 ggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgatagaac 21107209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27991893 - 27991737
Alignment:
Q  74 gaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaa 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||   || ||||| ||||||||||| |  || | ||||| ||  || || ||||||||||||    
T  27991893 gaaagtatcgtttaagttgaagggataattttatcgaacattagtaagaccaacgatgttatacgggacagggtgttaggcagtgaataaccaacacgaa 27991794  T
Q  174 aatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
     || || |||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  27991793 cataaaataagtgtagcagaaatgaagatgttgtgttggatgtgtggtaagattaga 27991737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 513
Target Start/End: Original strand, 53540419 - 53540535
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||| ||   |||||| || ||| ||||||||||| | | ||    
T  53540419 agaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattatggcata 53540518  T
Q  497 atttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  53540519 atttgatccatatagcc 53540535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 412 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024885
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| | | || || ||| ||||||||||| |  ||||||| || |||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  512 ccga 515  Q
    ||||    
T  26024888 ccga 26024885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 290
Target Start/End: Original strand, 27983108 - 27983222
Alignment:
Q  178 aagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaac 275  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||| ||| | | ||||||||||||||||| | | |||  ||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  27983108 aagtaagtgtagcggagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagc 27983207  T
Q  276 acctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||||||||||    
T  27983208 acctatagtagaaaa 27983222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40420343 - 40420255
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgt 509  Q
    |||||||||||||||  ||| ||  |||| ||||||||||  |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40420343 taagagaaactattaaaaaaaat--agagattaatgagttgaatcctaatatggtttatgatagaacattacgacgtaatttgatacatgt 40420255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 42639176 - 42639081
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||  |||||| || | | |||||||||||    
T  42639176 ggtagaggaatatctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacatta 42639081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8599090 - 8598976
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||   |||||  || | | ||||||||||| | |||  |||    
T  8599090 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaatgttaatgagttagaaagaaataaggtatttgatagaacattatggcgtcgttt 8598991  T
Q  501 gatgcatgtagccga 515  Q
    ||| |||||||||||    
T  8598990 gattcatgtagccga 8598976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26037904 - 26037850
Alignment:
Q  130 tgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 184  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26037904 tgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaagtaag 26037850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 515
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459241
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| | || || ||||| |||||| ||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccga 31459241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 33225964 - 33225873
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||  | ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  33225964 taagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtgatttgatcaatgtagc 33225873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 290
Target Start/End: Original strand, 33709849 - 33709946
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaa-----ggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |     ||||  |||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709849 gatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 33709946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 34208390 - 34208309
Alignment:
Q  428 ctattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||    
T  34208390 ctattaggaaag-tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgta 34208309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34233177 - 34233059
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||    ||||    
T  34233177 agaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgta 34233078  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  34233077 atttgatccatgtagccga 34233059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Original strand, 44860672 - 44860814
Alignment:
Q  88 agttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgt 187  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||  || ||| || ||||||| ||||  || ||||||||||  || |||||||||   |||||| || |||| ||    
T  44860672 agttgaaaggaaaattttattggtcaatagtaagatcggcgatgttgtatgggactgagtgttgggctgtgaagaaccaaggagaaaataaattaagtgt 44860771  T
Q  188 agtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44860772 agcagaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactaga 44860814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45184287 - 45184168
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||  |   || || ||||||| ||||||| |||    
T  45184287 ggtagaggaagacctagaaaaactataaga--aactattatgaaagataaagagattaatgagttgaatttactcatggtttataataaaacattatgac 45184190  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  45184189 gtaattcgattcatgtagccga 45184168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51252757 - 51252675
Alignment:
Q  254 cattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  | | || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  51252757 cattagagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaaga 51252675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 56439710 - 56439632
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  56439710 aaaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacatta 56439632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 371
Target Start/End: Original strand, 1380357 - 1380470
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |||| || | |||||  |||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| |||||||| |     
T  1380357 agagagagttgggataacacctaccgtagaaaacatgatagaaactcggcttaggtggtttgggcacgtagagagaaaacctgtagattttgtagtaagg 1380456  T
Q  358 atagtagatcagat 371  Q
    | ||||||| ||||    
T  1380457 acagtagattagat 1380470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 30621330 - 30621241
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| || ||| ||||||||||| | | ||| ||||| ||||||    
T  30621330 agagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31961504 - 31961358
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctata 411  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||  | | ||| ||| |||||||   |||||||||       ||||| || ||| ||| |    
T  31961504 gtggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctaga 31961405  T
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  31961404 aaaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagtt 31961358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Original strand, 32479192 - 32479285
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  32479192 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 32479285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 411 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 42293404 - 42293323
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacga 492  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||  | |||| || ||| ||||| ||||||||    
T  42293404 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacga 42293323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 259
Target Start/End: Original strand, 2588910 - 2588970
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattag 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||    
T  2588910 ggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattag 2588970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7544655 - 7544603
Alignment:
Q  418 ttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7544655 ttaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatcgaaatat 7544603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31403186 - 31403126
Alignment:
Q  398 gaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  31403186 gaggaagatctagagaaactataagaaaaactattatgaaagatctagagattaattagtt 31403126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 354
Target Start/End: Original strand, 45175997 - 45176092
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagta 354  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||| ||  |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  45175997 agagagagttggggtagtgcctattgtagaaaagattctaa-aaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgaagta 45176092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 54914683 - 54914631
Alignment:
Q  58 gtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcgg 110  Q
    |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  54914683 gtgttttatgtgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaaattctatcgg 54914631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Original strand, 3273176 - 3273267
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaac 115  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||  |||| |||| ||||||    
T  3273176 caagttggatggttgaaatggagatgagcctcatttgttttatgtgatacgaaagtatcattgatgttgaaggggaaattttatcagacaac 3273267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38903957 - 38903902
Alignment:
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatca 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||    
T  38903957 tggtttgagcatgtggagagaagacttgtagattttgtagtatggagagtagatca 38903902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 500
Target Start/End: Original strand, 49987537 - 49987640
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| | ||||||| ||| ||  || ||||| ||||| | ||||    
T  49987537 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagcattatggcgta 49987636  T
Q  497 attt 500  Q
    ||||    
T  49987637 attt 49987640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 489
Target Start/End: Original strand, 6843766 - 6843836
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||  | |||||||||||||||    
T  6843766 taagagagactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatagaaatatgttatataatagaacatta 6843836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 503
Target Start/End: Original strand, 20918267 - 20918305
Alignment:
Q  465 aaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20918267 aaatattgtgtatgatagaacattacgacgtaatttgat 20918305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35555939 - 35555861
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||| |||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  35555939 agagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaaga 35555861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47265351 - 47265230
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaag-atttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacga 492  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |  | ||| |||||||| ||       
T  47265351 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta-gaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatag 47265253  T
Q  493 cgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  47265252 tgtaatttgatccatgtagccga 47265230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 468
Target Start/End: Original strand, 50679630 - 50679704
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaat 468  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50679630 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 50679704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 230
Target Start/End: Original strand, 21106856 - 21106944
Alignment:
Q  144 gagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagta--agcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||  || |||||||  ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21106856 gagtgttgggcggttaagaaccaacatgacaataaaataagagtgtagtggtgatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactaga 21106944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25967638 - 25967589
Alignment:
Q  181 taagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25967638 taagcgtagtggaggtgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactaga 25967589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 345
Target Start/End: Original strand, 41192763 - 41192913
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt----agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaatt 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||   ||||  ||||||| | ||    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||     
T  41192763 ggatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatg 41192862  T
Q  295 ataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagat 345  Q
     | | || ||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  41192863 gtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43070115 - 43070029
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaa 289  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||| | |||||||||||||    
T  43070115 atgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag--ttgaggtagcgcctatagtagaaa 43070029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 458
Target Start/End: Original strand, 47147502 - 47147563
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  47147502 agaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtt 47147563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 383
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611842
Alignment:
Q  282 agtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagt 381  Q
    ||||||||| || || | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |  |||| ||||| || | | |||| |||||||||| ||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctagagattttgtaataaggagagtaaatcagatggaggagagt 47611840  T
Q  382 ca 383  Q
    ||    
T  47611841 ca 47611842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 336
Target Start/End: Original strand, 50471505 - 50471594
Alignment:
Q  247 atgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||| ||  | | || |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50471505 atgacaacattagagagactcggggtagcactaatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaaga 50471594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 55388333 - 55388252
Alignment:
Q  428 ctattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgt 509  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||  |  |||||||||| |||||    
T  55388333 ctattaagaaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgt 55388252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 513
Target Start/End: Original strand, 3979121 - 3979165
Alignment:
Q  469 atagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3979121 atagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 3979165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 512
Target Start/End: Original strand, 5306452 - 5306540
Alignment:
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| | | ||||||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  5306452 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagc 5306540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 7682063 - 7681971
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| | |||| || || || ||||||||||||||  |||||| || ||| |||| ||||||    
T  7682063 agaggaagacctggaaaaactataagagaaactatcaagaaaaatctatagattaatgagttagatagaaatatggtatatgataggacatta 7681971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 515
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947184
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaag-atttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacg 494  Q
    |||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |  | ||| |||||||| ||  | |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatt-tgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatg 7947163  T
Q  495 taatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  7947164 taatttgatccatgtagccga 7947184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13805418 - 13805302
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||  |||| |||| ||   |||||| || ||| ||||||||||| |   ||    
T  13805418 agaggaaaacctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggata 13805319  T
Q  497 atttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13805318 atttgatccatgtagcc 13805302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 402 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 20131137 - 20131025
Alignment:
Q  402 aagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttg 501  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||  | ||| ||||||||| |  |  |||||||    
T  20131137 aagatctagaaaaactataagataaattattataaaataattaaaggttaatgagtttaatctaaatatgatttatgatagaacataataagataatttg 20131038  T
Q  502 atgcatgtagccg 514  Q
    || ||||||||||    
T  20131037 attcatgtagccg 20131025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 430 - 510
Target Start/End: Original strand, 28485844 - 28485924
Alignment:
Q  430 attatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  || |  ||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  28485844 attaggaaagattttgagattaatgagttggatccaaatacggtcttcaatagaacattattgcgtaatttgatccatgta 28485924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 512
Target Start/End: Original strand, 36198983 - 36199059
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |  |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  36198983 aaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatccatgtagc 36199059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44047640 - 44047608
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44047640 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 44047608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 290
Target Start/End: Original strand, 44360077 - 44360109
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44360077 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaa 44360109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 451 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 51811377 - 51811313
Alignment:
Q  451 aatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  51811377 aatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 51811313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 9e-90; HSPs: 83)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 1275019 - 1275511
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  1275019 caagctgggtggttgaaatgaagaagagcctaaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 1275118  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| || |||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1275119 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttacgagtcaacatgagaatcaagtaagcatagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 1275218  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag-ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagc 322  Q
    ||||||| | | |  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||    
T  1275219 gactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggc 1275318  T
Q  323 atgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaag 422  Q
    ||||||||||||||   ||| |||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  1275319 atgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattag 1275418  T
Q  423 agaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  1275419 agaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccga 1275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28977385 - 28976894
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||     
T  28977385 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtccgaa 28977286  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  28977285 cgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaa 28977186  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
     |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |||    
T  28977185 aactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgca 28977086  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   ||| |||  || ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||    
T  28977085 tgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 28976986  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  28976985 gaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccga 28976894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12492915 - 12492419
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  12492915 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 12492816  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || |  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12492815 cggctttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaa 12492716  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacac---ctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggttt 318  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||    
T  12492715 gactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 12492616  T
Q  319 gagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactt 418  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||  ||  || ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  ||||||     
T  12492615 gggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 12492516  T
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  12492515 ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatgcatgtagccga 12492419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2076002 - 2075510
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  2076002 caagttgggtggttgaaatgaagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 2075903  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||| ||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2075902 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaa 2075803  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  |  |||  |||||||||   ||||||| |    
T  2075802 gactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagacaataggcttagatggtttggg 2075703  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  | |||| | |    
T  2075702 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactatta 2075603  T
Q  422 gagaaactattatgaaa-gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||| | || | ||| ||||||| |||||||||    
T  2075602 gagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatttgattcatgtagcc 2075510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1288117 - 1287614
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| ||     
T  1288117 caagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgat 1288018  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1288017 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 1287918  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag------------agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggcttta 311  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||| ||||||||            ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||      
T  1287917 gactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 1287818  T
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctata 411  Q
     ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||      
T  1287817 atggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 1287718  T
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||| || | ||| | ||||| |||||||    
T  1287717 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtag 1287618  T
Q  512 ccga 515  Q
    ||||    
T  1287617 ccga 1287614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 548
Target Start/End: Original strand, 27648 - 28163
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||  || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||    
T  27648 caagttgggtggtggaaatagagaagagtctcgagtgttttacgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaattctatctgacaatagtcggac 27747  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  27748 agacgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaattaagtaagcataacggagatgaggatgttgcattagatgagtggtaa 27847  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
     |||| | | ||| |||||| |||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||  ||||||||||    
T  27848 aacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgag 27946  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |  ||||        || | |||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||       ||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  27947 c--gtag--------gtaggagat-ttgtagtacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataa 28035  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga-accat 520  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | | | |||||||| || | | ||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  28036 gagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacactatggcataatttgatacatgtagctgaccccat 28135  T
Q  521 ttaataagataacacttggttattgttg 548  Q
    ||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  28136 ttagttagataagacttggtttttgttg 28163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 24178278 - 24178757
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||    
T  24178278 caagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcagcagtcagac 24178377  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| ||||              |||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24178378 cgacgttgtt--------------gttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 24178463  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||| | | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  24178464 gactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 24178563  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    ||||| |||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  24178564 catgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 24178663  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | | | |||||||  ||||||||||    
T  24178664 gagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcatttgatctatgtagccga 24178757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 10639051 - 10639549
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| |||    
T  10639051 caagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgac 10639150  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10639151 cgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggtgaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 10639250  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacac-------ctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtg 314  Q
    ||||||| || ||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| || |||       |||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||    
T  10639251 gactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 10639350  T
Q  315 gtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaa 414  Q
      ||| ||||||||||||||||  ||||||||   | ||| ||| |||||| || |||||   ||||||| |       |||||||||||| |||  |||    
T  10639351 aattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatgga--ggagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 10639448  T
Q  415 actttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccg 514  Q
    ||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||    
T  10639449 actattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 10639548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 3301603 - 3302091
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||   |||||||    
T  3301603 caagctgggtggttgaaatagagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagac 3301702  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     ||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||     ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  3301703 tgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagccaacacga-----aagtaagtgtagcggagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaa 3301797  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||  ||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||      
T  3301798 gactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgga 3301897  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||  ||| | |  |||| ||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||||  | |    
T  3301898 catgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccatta 3301997  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  3301998 gagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagccga 3302091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16347860 - 16347415
Alignment:
Q  70 ataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaaca 169  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16347860 ataagaaattaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacactcagaccgacgatattgtatggtacggagtgttgagcggttaagagccaaca 16347761  T
Q  170 cgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagtt 267  Q
    ||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||      
T  16347760 cgagagttaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcg 16347661  T
Q  268 ggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatc 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||   | | | ||| ||||||||    
T  16347660 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatc 16347561  T
Q  368 agatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaa 467  Q
    | ||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||||| | | |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  16347560 aaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaa 16347461  T
Q  468 tatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| || ||| |||||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||    
T  16347460 tatggtttatgatagaacact--ggcgtcatttgatccatgtagccga 16347415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 34272776 - 34273012
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| | ||| | |    
T  34272776 caagttgggtggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtccggc 34272875  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34272876 cgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaa 34272975  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag 265  Q
    ||||||| ||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34272976 gactagacag-----gattaggaatgacaccattagagagag 34273012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 515
Target Start/End: Original strand, 4496311 - 4496631
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaa--ggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaatt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |     
T  4496311 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctg 4496410  T
Q  295 ataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnng 394  Q
     ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |    
T  4496411 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 4496510  T
Q  395 gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacg 494  Q
    ||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |     
T  4496511 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggca 4496610  T
Q  495 taatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  4496611 tcatttgatccatgtagccga 4496631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884724
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattaga--gagagttggggtaacacctatagtagaaaaaatta-ta 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||| |||| |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| || |||| ||  ||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 26884941  T
Q  298 ggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggta 397  Q
    | ||||||||||  | ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||   |       ||||    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  398 gaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatcc-aaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||| || |||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  | ||| |||||||| ||||||| |    
T  26884840 gaggatgagctaggaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgca 26884743  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  26884742 atttgatccatgtagccga 26884724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 17340790 - 17340497
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacct-atagtagaaaaaatta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||| | |||||||||| | |      
T  17340790 ggatgttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtagaaacattat 17340691  T
Q  296 taggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnngg 395  Q
    ||| ||||||||||  |||||||   |||||  |||||| | | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |       ||    
T  17340690 tagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaaaggg 17340591  T
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    |||| |||||  || ||||| | |||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  17340590 tagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataacatta 17340497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 36200537 - 36200764
Alignment:
Q  25 aagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagacc 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||| ||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||     
T  36200537 aagttgggtggttgaaatggagaagagactcatgtgttttatgtgataagaaaatgctgtttaagttgaaaggaaaattctaccggacaacagtcaaact 36200636  T
Q  125 gacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaag 224  Q
    | | ||||| |||| |||  |||| | || ||||||||||||||  || |||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36200637 ggcaatgttgtatgatacaaagtggtaggcggttaagaaccaacgtgagaatcaagtaagcgtatcagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaag 36200736  T
Q  225 actagaaaggatgtgattaagaatgaca 252  Q
    |||| | |||||  ||||| ||||||||    
T  36200737 actaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 515
Target Start/End: Original strand, 38684936 - 38685214
Alignment:
Q  239 gattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||    
T  38684936 gattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 38685035  T
Q  337 gttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatga 436  Q
       |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  |    
T  38685036 cccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 38685135  T
Q  437 aagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  38685136 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccga 38685214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 262
Target Start/End: Original strand, 20318745 - 20318974
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||    || || |||||||||||||| | || ||||||| | | ||| |||    
T  20318745 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataag----taccacttaagttgaaaggaaagttatatcggatagcagtccgac 20318840  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20318841 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgcgcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 20318940  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga 262  Q
    ||||     ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  20318941 gact-----ggataggattaggaatgacaccattagaga 20318974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 539
Target Start/End: Original strand, 32516488 - 32516826
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  | |     
T  32516488 gatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtgga 32516587  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||  |||||||   | |||| ||| || |  |||||||  ||||||| | | |||||||| |||| | || | ||| ||       ||||||    
T  32516588 aaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtaga 32516687  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||| ||||  |||| ||| ||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||    
T  32516688 ggaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatt 32516786  T
Q  500 tgatgcatgtagccgaaccatttaataagataacacttgg 539  Q
    ||||  || || |||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  32516787 tgatcgatataaccgatccacttaatgagataaaacttgg 32516826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31636319 - 31636012
Alignment:
Q  147 tgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaaga 246  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || || ||||||  || |||  ||||||    |||||  ||||||||||||||  ||||   ||||  |    
T  31636319 tgttgggcggtaaagaaccaacacaaaaataaattatgcgtagcagagatgatgatgtt----tggatttgtggtaagactagactggatagaattataa 31636224  T
Q  247 atgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatg 346  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||   || ||||    
T  31636223 atgacagcattagagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggatg 31636124  T
Q  347 ttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttaga 446  Q
    |||||||| | | ||||||| ||||||  | |||||||||       | ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  31636123 ttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatataga 31636024  T
Q  447 ggttaatgagtt 458  Q
    | | ||||||||    
T  31636023 gatcaatgagtt 31636012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 517
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889242
Alignment:
Q  208 gttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga--gagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaatag 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||  |||||||  |||| |||  ||||||||||| ||| |||||  ||||| ||  | | ||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  306 gctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaaga 405  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||| ||| | | | || || ||||||| || |||||||        || ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  406 tctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgc 505  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  | |||||| || ||| ||||||||||| | |||||||| || |    
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 6889230  T
Q  506 atgtagccgaac 517  Q
    ||||||| ||||    
T  6889231 atgtagctgaac 6889242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7359551 - 7359299
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |     
T  7359551 agagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttg-gcatgtagagagaagatatgtagattctgtagtaagg 7359453  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| ||       || |||||||   ||| ||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||    
T  7359452 agagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaaatctagagattaataagt 7359353  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    | |||| |||||| || ||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7359352 tggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagc 7359299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 515
Target Start/End: Original strand, 2090557 - 2090660
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||||||||| ||||||     
T  2090557 aaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtac 2090656  T
Q  512 ccga 515  Q
    ||||    
T  2090657 ccga 2090660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17341000 - 17340841
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |  | |||||||| |||||   ||||| | || |  ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||    
T  17341000 caagttaggtggttgaaatggagaaggacatcaagtgtcttatgttgtaagagaataccgcttaagttgaaaagaaaattgtatcggacaatagtcagac 17340901  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaa 183  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  17340900 cgacaatgttatatgatacaaagtgttgggtggttaataactaacacgagaatcaagtaa 17340841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 515
Target Start/End: Original strand, 20456780 - 20457020
Alignment:
Q  275 cacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| |||||    
T  20456780 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgga 20456879  T
Q  375 agagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtg 474  Q
     ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |  ||    
T  20456880 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaatttgatg 20456979  T
Q  475 tataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||    
T  20456980 tatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccga 20457020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 515
Target Start/End: Original strand, 30588578 - 30588694
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||    
T  30588578 aggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgat 30588677  T
Q  499 ttgatgcatgtagccga 515  Q
     |||| |||||||||||    
T  30588678 atgatccatgtagccga 30588694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Original strand, 9235178 - 9235294
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||| || ||| ||||||||||| | | ||    
T  9235178 agaggaagacctagaaaaact--aagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcata 9235275  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  9235276 atttgatccatgtagccga 9235294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 418158 - 418069
Alignment:
Q  426 aactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  418158 aacttttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 418069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Original strand, 11675658 - 11675777
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttaga-tccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 495  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || |  |||||| || ||| ||||||||||| | |||    
T  11675658 agaggaagacctgtaaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 11675757  T
Q  496 aatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||| || |||||||||||    
T  11675758 agtttaatccatgtagccga 11675777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 513
Target Start/End: Original strand, 29922410 - 29922529
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||   |||  | || ||  ||||||||||| | |    
T  29922410 ggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatggc 29922509  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  29922510 gtaatttgatccatgtagcc 29922529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 513
Target Start/End: Original strand, 34273139 - 34273258
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || |||    
T  34273139 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgac 34273238  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    || ||| ||| |||||||||    
T  34273239 gtcattcgatccatgtagcc 34273258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Original strand, 7678607 - 7678724
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||  || ||||||| ||||||| || |||    
T  7678607 agaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattatgaggta 7678705  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
     |||||| |||||||||||    
T  7678706 gtttgatccatgtagccga 7678724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 485
Target Start/End: Original strand, 14665704 - 14665931
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||    
T  14665704 agagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 14665803  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||| |||||  |||||||  |       |||||||| ||| |||  |||||| | |||||||| |||| |||  ||||||| || |||||||    
T  14665804 agagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagt 14665903  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaac 485  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||||    
T  14665904 tggatccaaatatggtttatgatagaac 14665931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 148
Target Start/End: Original strand, 3394464 - 3394591
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataa---ttctatcggacaacggtca 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |   |||||||||||| | ||||    
T  3394464 caagctgggtggttgaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaggaaagttctatcggacagcagtca 3394563  T
Q  121 gaccgacgatgttatatgttacggagtg 148  Q
    ||||| | ||||| |||  |||||||||    
T  3394564 gaccggcaatgttgtatagtacggagtg 3394591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 499
Target Start/End: Original strand, 14725644 - 14725749
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  14725644 ggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaacaatacgac 14725743  T
Q  494 gtaatt 499  Q
     |||||    
T  14725744 ataatt 14725749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 21093663 - 21093736
Alignment:
Q  157 ttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21093663 ttaagaaccaacacgagaataaaataagtgtagtggatatgaggatgttgcgttgtatgtgtggtaagactaga 21093736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Original strand, 14667914 - 14668018
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  14667914 aaaaactataagagaagctactaagaaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgta 14668013  T
Q  511 gccga 515  Q
     ||||    
T  14668014 accga 14668018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 503
Target Start/End: Original strand, 14749297 - 14749542
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||| || ||| |||   |||||||  |||||||||||||||  ||| |||  ||| ||| |     
T  14749297 agagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaagg 14749396  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||| ||||||||||| | |||||||||       || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||| ||||    
T  14749397 agagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacgagt 14749496  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    | |||  |||||| || | | |||||||| || | ||| |||||||    
T  14749497 tggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 515
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816629
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    ||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  499 ttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| |||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccga 29816629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 261
Target Start/End: Original strand, 7678338 - 7678471
Alignment:
Q  127 cgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac 226  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||  |  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||    
T  7678338 cgatgttgtatggaacggagtgttgggcg-tgaagaaccaacacgagaatagaacaagtgtagtggagatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagac 7678436  T
Q  227 tagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag 261  Q
    |||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  7678437 tagataggataggattagaaatgacaacattagag 7678471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 336
Target Start/End: Original strand, 33667194 - 33667284
Alignment:
Q  246 aatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  33667194 aatgacaacattaacgagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 33667284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10083141 - 10082935
Alignment:
Q  148 gttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaa 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | |  |||||||||  |  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||   ||||  ||    
T  10083141 gttgggtggtaaagaaccaacacgaatgt-agttaagcgtagcagggatgaggatgttgctttg-atgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaa 10083044  T
Q  248 tgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagat 345  Q
    ||| | |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  10083043 tgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggat 10082944  T
Q  346 gttgtagta 354  Q
      |||||||    
T  10082943 tctgtagta 10082935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11002774 - 11002645
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||   ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||  |||    
T  11002774 ggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagagttcgggtagcacctacagtagaaaacatggtag 11002675  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtag 328  Q
     || ||| |||  |||||||| ||||||||    
T  11002674 aaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15489729 - 15489587
Alignment:
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataa 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || | | ||||||| ||||||| || |||  |||       || ||||||||| ||| ||    
T  15489729 tggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtattaaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaa 15489630  T
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatga 455  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||    
T  15489629 aaacaataagagaaactattaagaaagacttatagattaatga 15489587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32516270 - 32516165
Alignment:
Q  100 aattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcg 199  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||  |  |||||||||| || | ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |    
T  32516270 aattctaccggacagctgttagaccgacgatgttgtatggaatagagtgttgggcggcttagaactaacacgagaataaagtaagcgtagtggagatgag 32516171  T
Q  200 gatgtt 205  Q
    ||||||    
T  32516170 gatgtt 32516165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 523
Target Start/End: Original strand, 35615437 - 35615538
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaaccatt 521  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  35615437 gagaaactattcataaaaatttagagattaatgagttggataaaaatatagtttatgatagaacattatgacctaacttgattcatatagccgacccatt 35615536  T
Q  522 ta 523  Q
    ||    
T  35615537 ta 35615538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 308
Target Start/End: Original strand, 15168761 - 15168832
Alignment:
Q  239 gattaagaatgacaccattagagagagtt--ggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  15168761 gattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggct 15168832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 462
Target Start/End: Original strand, 27998567 - 27998635
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagat 462  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||    
T  27998567 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttagat 27998635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28186919 - 28186867
Alignment:
Q  407 ctataaaaact-ttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28186919 ctataaaaactattaagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagtt 28186867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 462
Target Start/End: Original strand, 28676721 - 28676789
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagat 462  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  28676721 ggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaattatgaaagaattagatattaacgagttagat 28676789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 42504358 - 42504294
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42504358 gatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42504294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Original strand, 1525457 - 1525597
Alignment:
Q  85 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 184  Q
    |||||||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| || || ||||    
T  1525457 ttaagttgaagggaaatttttatcgaacaacggtaagaccggcgatgttgtatgggac--agtgttgggcggtgaagaaccaacatgaacataaaataag 1525554  T
Q  185 cgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagact 227  Q
    | | |  |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1525555 ctttgctgaaatgaggatgttacgtcggatgtgtggtaagact 1525597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34194849 - 34194766
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctata 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||  ||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34194849 ggatgttgtgttggatgtgtggtaaaactagacaggataggattagaaatgtaaacattagagagagttgggataacacctata 34194766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2915685 - 2915531
Alignment:
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtta 459  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  | |||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||     
T  2915685 agtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 2915586  T
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| | || ||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  2915585 gatccaaatttggt-tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 2915531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 3096930 - 3097195
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||| | | |||||||||| |||  |||| || |  |||||||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||    
T  3096930 caagttgggtggttgaaatggatgagagccttaggtgttttatgtgatgtgaaaataccgcttaagttgaa-ggaaatttttatcgaacaacggtaagac 3097028  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||||||||| || |  ||  | ||||||  ||| || |||||||||||| || ||||||| ||    || | | ||||||| ||||||||| ||  |||    
T  3097029 cgacgatgttgtacgggacaaaatgttggacggtaaataaccaacacgaacattaagtaagtgtgacagagacgaggatgttacgttggatgtgttataa 3097128  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
     ||||||   |||   ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3097129 aactagatgagataaaattaaaaatgacgacattatagagagttggggtaacacctatattagaaaa 3097195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 484
Target Start/End: Original strand, 15168897 - 15168987
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaa 484  Q
    |||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||| ||||||    
T  15168897 ggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagatatggtttatgatagaa 15168987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Original strand, 1174549 - 1174622
Alignment:
Q  217 gtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1174549 gtggtaagattagatgggatatgattataaatgacagcatcagagagagttggggtaacagccatagtagaaaa 1174622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13561514 - 13561421
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  13561514 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 13561421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Original strand, 14911326 - 14911419
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | | |||||| | || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  14911326 gagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccga 14911419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 513
Target Start/End: Original strand, 20367049 - 20367138
Alignment:
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| | | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  20367049 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagcc 20367138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 27799896 - 27799949
Alignment:
Q  321 gcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||    
T  27799896 gcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatgga 27799949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 425 - 470
Target Start/End: Original strand, 36200886 - 36200931
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36200886 aaactattataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatat 36200931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 418291 - 418247
Alignment:
Q  246 aatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  418291 aatgacaacattagagagagttggggtagcacctatggtagaaaa 418247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16914022 - 16913918
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||  | | ||| ||||||| ||||||    
T  16914022 aaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgta 16913923  T
Q  511 gccga 515  Q
    |||||    
T  16913922 gccga 16913918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Original strand, 32759424 - 32759476
Alignment:
Q  117 gtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaaca 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||    
T  32759424 gtcagaccgacgatgttttatgcaacagagtgttgggtgtttaagaaccaaca 32759476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 383
Target Start/End: Original strand, 43475247 - 43475355
Alignment:
Q  275 cacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    |||||||||||||||| ||  | | || |||||||  |||||||| | ||  ||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  43475247 cacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcagatgga 43475346  T
Q  375 agagagtca 383  Q
     || |||||    
T  43475347 ggatagtca 43475355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 444
Target Start/End: Original strand, 6859510 - 6859557
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagattta 444  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6859510 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagattta 6859557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 515
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558388
Alignment:
Q  441 tttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||| |||||||| || | | ||||||||| |||||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccga 5558388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12577013 - 12576895
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||  |||||| || ||| ||||| ||||| |  ||     
T  12577013 agaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtc 12576914  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| || |||||||||||    
T  12576913 attttatacatgtagccga 12576895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15986624 - 15986578
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatcca 465  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15986624 taagagaaactagtaggaaagatttagagattaatgagtttgatcca 15986578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18351194 - 18351112
Alignment:
Q  264 agttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca-tgtagagagaagagttgtagat 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||    
T  18351194 agttggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 458
Target Start/End: Original strand, 27553842 - 27554020
Alignment:
Q  279 tatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagag 378  Q
    |||||||||||| || |||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||| || | |||||| | | ||||| ||| | |||    
T  27553842 tatagtagaaaatatgatataaaataagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagatcgatagatggtgcaatacgaagaatggatcacatgaatgag 27553941  T
Q  379 agtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||| | ||       |||||||||| |  || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27553942 agttagattaaacaaggtagaggaa-acttagaaaaacaataaaagaaactattatgaaagatgtagaggctaatgagtt 27554020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32442226 - 32442160
Alignment:
Q  449 ttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |   ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  32442226 ttaatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 32442160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 230
Target Start/End: Original strand, 21952226 - 21952311
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | || |||| ||||   | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21952226 agtgttgggcgcttaagaaccaacacgaacttaaattaagtgtagaaaagatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactaga 21952311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 230
Target Start/End: Original strand, 27998298 - 27998383
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||| | || ||||| ||   || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27998298 agtgttgggatgtaaaaaaccaacacgaaagtgaattaagcatatcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 27998383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43558119 - 43558006
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||  | | || || ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||| ||    
T  43558119 agagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaaga 43558020  T
Q  358 atagtagatcagat 371  Q
    | ||||||| ||||    
T  43558019 agagtagattagat 43558006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43558221 - 43558136
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |  || |||||| |   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43558221 agtgtagggcggtgaagaaccaacacgagaataagatatgcgtagagatgatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 43558136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 219804 - 219713
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||   |||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  219804 atgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgttgaaaa 219713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Original strand, 2393045 - 2393093
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaa 484  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  2393045 aaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaa 2393093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 471
Target Start/End: Original strand, 5303587 - 5303647
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatata 471  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  5303587 aaaaactgtaagagaaactattgaaaaagatttagagtttaatgagttggatagaaatata 5303647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 290
Target Start/End: Original strand, 14667753 - 14667785
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14667753 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 14667785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 451 - 515
Target Start/End: Original strand, 30213758 - 30213822
Alignment:
Q  451 aatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  30213758 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 30213822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 399 - 511
Target Start/End: Original strand, 38684611 - 38684723
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    ||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||  |||||| ||   | ||||||||||| | ||| ||    
T  38684611 aggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttat 38684710  T
Q  499 ttgatgcatgtag 511  Q
    ||||| |||||||    
T  38684711 ttgattcatgtag 38684723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41109978 - 41109906
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaa 384  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   | ||||| |||||||| | |||||||||| |||||| || ||||||    
T  41109978 gtggtttgaacatgtagagagaaggcctatagattttgtagtaaggatagtagatcggatggaggatagtcaa 41109906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 107)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35906729 - 35906236
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  35906729 caagctgggtggttgaaatggagaagatcttcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 35906630  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35906629 cggcgttgttgtatgatacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 35906530  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  35906529 gactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 35906430  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  35906429 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 35906330  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  35906329 gagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 35906236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33350334 - 33349841
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  33350334 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgacaggaaagttctatcggacagcagtccgac 33350235  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33350234 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaa 33350135  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  33350134 gactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttggg 33350035  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  33350034 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 33349935  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  33349934 gagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccga 33349841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 34869174 - 34869667
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  34869174 caagctgggtggttgaattggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 34869273  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34869274 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 34869373  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  34869374 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 34869473  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   ||| |||  || ||| ||| ||||||||  ||||  ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  34869474 catgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 34869573  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  34869574 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 34869667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 11593714 - 11594207
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||    
T  11593714 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagttcgac 11593813  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11593814 cggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 11593913  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||| | ||   ||||||| |    
T  11593914 gactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttggg 11594013  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||   | ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  11594014 catgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 11594113  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  11594114 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 11594207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 36651748 - 36652239
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||    
T  36651748 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatccgac 36651847  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| |||   || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36651848 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtaacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 36651947  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||  || | |||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  36651948 gactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagggtaggggtggcatccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagca 36652047  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| || || || |||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||    
T  36652048 tgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattaga 36652147  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| ||||  || |||| |||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  36652148 gaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 36652239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 468
Target Start/End: Original strand, 31004977 - 31005423
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  31004977 caagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 31005076  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| ||||||||||| || ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31005077 cggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 31005176  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag-tggtttga 320  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||| |||||||     
T  31005177 gactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg-tttagatggtttgg 31005275  T
Q  321 gcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaacttta 420  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| |     
T  31005276 gcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt 31005375  T
Q  421 agagaaactattatgaaa-gatttagaggttaatgagttagatccaaat 468  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||    
T  31005376 agagaaaccatt-tgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaat 31005423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 384
Target Start/End: Original strand, 33072708 - 33073068
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||    
T  33072708 caagttggatggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttaaaaggaaagttctatcggacaacagttagac 33072807  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||| || |||||| |||| ||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33072808 cggcgttgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaataagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaa 33072907  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   || |||| |||    
T  33072908 gactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggca 33073007  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaa 384  Q
    |||||||||||||   |||||||| || ||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  33073008 tgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaa 33073068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 43281430 - 43281921
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| | |||| ||    
T  43281430 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaaac 43281529  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| | | | | ||||||| |||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  43281530 cggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagccaacgcaagagtaaagtaagtgtagcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaa 43281629  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| |  ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  ||    
T  43281630 gactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggaca 43281729  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||||  |  ||    
T  43281730 tgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcga 43281829  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  43281830 gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 43281921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 46356379 - 46355891
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||    
T  46356379 caagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagac 46356280  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || |  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||    ||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  46356279 cggcattgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagt----gtagcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaa 46356185  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag-tggtttga 320  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||| |||||||     
T  46356184 gactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg-tttagatggtttgg 46356086  T
Q  321 gcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaacttta 420  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||| | |||  |||||| |     
T  46356085 gcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactatt 46355986  T
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | |||||| ||||  || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | | | ||||||| |||||||||||    
T  46355985 aaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttgatccatgtagccga 46355891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12841774 - 12841310
Alignment:
Q  53 ttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgg 152  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||    
T  12841774 ttcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgtacagcagtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgg 12841675  T
Q  153 gtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgaca 252  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||  ||||| |||||||     
T  12841674 gtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgacc 12841575  T
Q  253 ccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgt 350  Q
    |||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  ||    
T  12841574 ccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgt 12841475  T
Q  351 agtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggtt 450  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || |||||||||||     
T  12841474 ggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtc 12841375  T
Q  451 aatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||  |||||||| | || ||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  12841374 aatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 12841310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39906894 - 39906407
Alignment:
Q  33 tggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgt 132  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  39906894 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgt 39906795  T
Q  133 tatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgt-----agtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagact 227  Q
    | |||| ||||||||||| || | ||||||  ||||| || ||||||||||| ||     ||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39906794 tgtatggtacggagtgttaggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagact 39906695  T
Q  228 agaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatg 325  Q
    ||| |||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   || |||| |||||    
T  39906694 agacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatg 39906595  T
Q  326 tagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagaga 425  Q
    |||||||||||    ||||||| || ||| ||| ||||||||| |||||   ||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||    
T  39906594 tagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgga--ggagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 39906497  T
Q  426 aactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  39906496 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 39906407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 513
Target Start/End: Original strand, 49029044 - 49029521
Alignment:
Q  33 tggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgt 132  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| || || ||     ||||||| | |||||||||||| | |||  ||||  | |||    
T  49029044 tggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaaataccactt-----gaaaggaaagttctatcggacagcagtccaaccggtgttgt 49029138  T
Q  133 tatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaa 232  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  49029139 tgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagaca 49029238  T
Q  233 ggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagag 330  Q
     |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  49029239 tgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 49029338  T
Q  331 agaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaacta 430  Q
    ||||||   |||||||  || ||| ||  | ||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| |    
T  49029339 agaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacca 49029438  T
Q  431 ttatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||    
T  49029439 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 49029521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 383
Target Start/End: Original strand, 38606759 - 38607119
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  38606759 caagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagac 38606858  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||| |||| ||| |||   |||||||| ||||||||||||||    
T  38606859 cggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgataatgttgcgctggatgagtggtaa 38606958  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt-agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagc 322  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||   |  ||| ||||||||||   |||||||  |    
T  38606959 gactagacatgataggattaggaatgacaacattaagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggac 38607058  T
Q  323 atgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    ||||||||||||||   |||||||  || ||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  38607059 atgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtca 38607119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Original strand, 23404181 - 23404440
Alignment:
Q  33 tggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgt 132  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23404181 tggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttctgagataagaaaggaccacttaagttgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacgatat 23404280  T
Q  133 tatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaa 232  Q
    | |||| |||| ||| ||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  23404281 tgtatggtacgaagttttgggcggttaaaagccagcacgagaatcaagtaagtgtattggaaatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactataca 23404380  T
Q  233 ggatgtgattaagaatgacaccatta--gagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
     |||  ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23404381 tgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaa 23404440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 489
Target Start/End: Original strand, 36136695 - 36136985
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||    
T  36136695 atgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtag 36136794  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtag 398  Q
     |||||| |||  || ||||| |||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||        ||||    
T  36136795 aaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtag 36136894  T
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  36136895 aggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacatta 36136985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 32630349 - 32630616
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||    
T  32630349 caagctgggtagttgaaatggagaagagcctcgagtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcggacatcaatcagac 32630448  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  32630449 cgacaatgttgtatggtacggagtgctgggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgagctggatgagtggtaa 32630548  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||| | |||  |||| || |||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32630549 gactagacatgataggatt-aggatgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 32630616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 515
Target Start/End: Original strand, 37617814 - 37618192
Alignment:
Q  140 tacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtg 239  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |    
T  37617814 tacggagtcttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagcaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatagg 37617913  T
Q  240 attaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag-gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  |||  ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  37617914 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 37618013  T
Q  337 gttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatga 436  Q
       |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  |    
T  37618014 cccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 37618113  T
Q  437 aagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| || |  || ||||||| |||||||||||    
T  37618114 aggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccga 37618192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13859473 - 13859072
Alignment:
Q  85 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 184  Q
    |||||||||||||| | |||||| | ||| | || |||||| |  |||| | || |||||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  13859473 ttaagttgaaaggaaagttctattgaacagcagttagaccggcagtgttgtttggtacggaatgttgggcggttaagagttaacacgagaatcaagtaag 13859374  T
Q  185 cgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctata 282  Q
      |||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  13859373 --tagcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctata 13859276  T
Q  283 gtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtc 382  Q
    ||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  13859275 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 13859176  T
Q  383 aaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatag 482  Q
    || |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||  |||||||| ||||||||| | || ||| ||||    
T  13859175 aagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatag 13859076  T
Q  483 aaca 486  Q
    ||||    
T  13859075 aaca 13859072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36869817 - 36869576
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |    
T  36869817 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggggttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcaggc 36869718  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || ||||||| |||| |||||| ||||| | |  |||||  |||||||  ||||||||||| ||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36869717 cggcgatgttgtatggtacggaatgttgagcgactaagagtcaacacgtgaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaa 36869618  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag 265  Q
    |||| || | |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36869617 gactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 36869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28628337 - 28627968
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaa 244  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||    ||||||| |||||||  ||||||||| | |  ||||| |||||     
T  28628337 agtgttgggcggttgagaaccaacacgagaataaagtaagcgtagcagagatt---atgttgccttggatgtatggtaagaccatacgggatgggattag 28628241  T
Q  245 gaatgacaccattagagag--agttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgta 342  Q
     ||| ||| ||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||  ||  | | |||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| |  ||||    
T  28628240 aaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgta 28628141  T
Q  343 gatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatt 442  Q
    |||  ||||||| | | |||||||| |||||| || ||||||||       |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28628140 gattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatt 28628041  T
Q  443 tagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| | || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  28628040 tagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 28627968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25579536 - 25579241
Alignment:
Q  87 aagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcg 186  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  25579536 aagttgaagggaaaattctatcggacagctgtaagaccggcgatgttgtatggaacggaatgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcg 25579437  T
Q  187 tagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggg-gtaacacctatagta 285  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     |||||  ||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |    
T  25579436 tagaggagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatactagatag-----gattagaaatgaccacattagagagagtggggagtagcacccatagca 25579342  T
Q  286 gaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaa 385  Q
    ||||||||  | | ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||  |||||||  ||| ||| ||| ||||||| ||||||| || |||||||    
T  25579341 gaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaa 25579242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 489
Target Start/End: Original strand, 47848547 - 47848894
Alignment:
Q  143 ggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgatt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||  |||     
T  47848547 ggagtgttgggtggttaagaaccaacacgagaataaaataagtctaggggagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatc 47848646  T
Q  243 aagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttg 340  Q
    |  | ||| | ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  47848647 agaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttg 47848746  T
Q  341 tagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaaga 440  Q
    || ||  |||| || | | ||||||||||||||| || ||||  ||       || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  47848747 taaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactatt-ggaaaga 47848845  T
Q  441 tttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||| | | |||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  47848846 tttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacatta 47848894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 7189757 - 7189311
Alignment:
Q  27 gttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccga 126  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||  ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||   |||| ||| | |||   ||||||||||    
T  7189757 gttgagtggttgaaatggagaaaagtctcaggtgttttatttgataagaaagtattacttaaattgaaagagaaattttatag-acagtagtcagaccga 7189659  T
Q  127 cgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac 226  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||  |||||||     
T  7189658 cgatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaaaaatcaagtaagcatagtggagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagat 7189559  T
Q  227 tagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt----------agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggt 316  Q
    ||||   |||  || || |||||||||||||          |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||  |||||    
T  7189558 tagacgagatagga-tatgaatgacaccattagagagagaaagagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggt 7189460  T
Q  317 ttgagcatgtagagaga------agagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctat 410  Q
    ||| |||||||||||||      | || ||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||        ||||||||||| |||     
T  7189459 ttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagatgtagaggaagacctag 7189360  T
Q  411 aaaaactttaagagaaact-attatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  7189359 aaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggttaaggagtt 7189311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 515
Target Start/End: Original strand, 43491212 - 43491555
Alignment:
Q  174 aatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattag--agagagttgggg 271  Q
    |||| |||||| ||||  || ||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||    
T  43491212 aatctagtaagtgtagccgagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtagggg 43491311  T
Q  272 taacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||| ||||||||    
T  43491312 taacacctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagat 43491411  T
Q  372 ggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaag-atttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    ||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  43491412 ggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccatta-gaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatat 43491510  T
Q  471 agtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
      | ||| |||||||| || || ||||||| || |||||||||||    
T  43491511 gatttatgatagaacactatgatgtaatttcatccatgtagccga 43491555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45836868 - 45836517
Alignment:
Q  164 ccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag-- 261  Q
    ||||||||| | ||||||||| | || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||      
T  45836868 ccaacacgagagtcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagag 45836769  T
Q  262 agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatag 361  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||    
T  45836768 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagag 45836669  T
Q  362 tagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttaga 461  Q
    ||||||| ||||| |||||| |  |       |||||||| ||| |||  | |||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  45836668 tagatcaaatggaggagagttaggt--tatgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 45836571  T
Q  462 tccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  45836570 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 45836517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 239 - 515
Target Start/End: Original strand, 6374837 - 6375115
Alignment:
Q  239 gattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  6374837 gattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaaga 6374936  T
Q  337 gttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatga 436  Q
       ||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||| | |||| |||| |       ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| ||    
T  6374937 ccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatta-ga 6375035  T
Q  437 aag-atttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  6375036 aagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 6375115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 380
Target Start/End: Original strand, 7272838 - 7273151
Alignment:
Q  69 gataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaac 168  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||| | || |||||| || | |||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||    
T  7272838 gataagaaagtaccacttaagttgagaggaaagttgtatcggtcagcagtcaaaccgacaatgttgtatgatacagagtgttgggcggttgagagccaac 7272937  T
Q  169 acgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttg 268  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||| |||| |||||       
T  7272938 acgagaatcaagtaagtgtaccggagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaac 7273037  T
Q  269 ggg--taacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagat 366  Q
    |||  || ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  |  ||| ||| |||||||    
T  7273038 gggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagat 7273137  T
Q  367 cagatggaagagag 380  Q
    |||||||| |||||    
T  7273138 cagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492409
Alignment:
Q  205 tgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaa 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| |||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  303 taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    ||||||   ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatgga 8492409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 35559372 - 35558990
Alignment:
Q  174 aatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttgggg 271  Q
    ||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||   |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  35559372 aatcaagtaagtgtagtaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtggggg 35559273  T
Q  272 taacacct-atagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcaga 370  Q
    || ||||| |||||||||||  |  ||| ||||||||||   || ||||  ||| ||| |||||||    ||||||| || ||| ||| ||||||||| |    
T  35559272 tagcaccttatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 35559173  T
Q  371 tggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  35559172 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 35559073  T
Q  471 agtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaac-catttaataagataacacttggttattgttgatgt 552  Q
    ||| |||  ||||||||||   | | ||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  35559072 agtttatggtagaacattatagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttgatgt 35558990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36514603 - 36514373
Alignment:
Q  154 tggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacac 253  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||  || ||||     
T  36514603 tggtaaagaaccaacacgaaaataaattaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaa 36514504  T
Q  254 cattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagt 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||| |||  |||||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||    
T  36514503 cattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagt 36514404  T
Q  354 acgaatagtagatcagatggaagagagtcaa 384  Q
    | | | |||||||||||| || | |||||||    
T  36514403 atggagagtagatcagatagaggggagtcaa 36514373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 259 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885757
Alignment:
Q  259 gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaa 358  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || |||||||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  359 tagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
     ||||||||||||||| ||||||||  |       |||||| ||||| |||  |||||| |||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  459 agatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     || |||||||| || ||| |||||||| || |  |||||||||| |||||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccga 2885757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44855525 - 44855254
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| ||  |||||||||||||||  |  |    
T  44855525 ggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggt 44855426  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggt 396  Q
    || ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  ||  || ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |        ||    
T  44855425 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagt 44855326  T
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaat 468  Q
    ||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44855325 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaat 44855254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 503
Target Start/End: Original strand, 1569063 - 1569251
Alignment:
Q  315 gtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaa 414  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | | | ||||||||||||||| || ||||| ||       || ||||| ||  ||| ||||    
T  1569063 gtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaa 1569162  T
Q  415 actttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1569163 actataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgat 1569251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40980084 - 40979963
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | |    
T  40980084 ggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggc 40979985  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  40979984 gtaatttgatccatgtagccga 40979963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19262737 - 19262610
Alignment:
Q  246 aatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagat 345  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19262737 aatgacaatattagagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat 19262638  T
Q  346 gttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19262637 -ttgtagtaagaagagtagatcagatgga 19262610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9210856 - 9210742
Alignment:
Q  398 gaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaa 497  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||| | |||||    
T  9210856 gaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacattatggcgtaa 9210757  T
Q  498 tttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||| ||||||||    
T  9210756 tttgatccatgtagc 9210742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24426048 - 24425846
Alignment:
Q  25 aagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagacc 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  24426048 aagttgagtggttgaaatatagaagagttttaagtgttttatgtgatatgtaagtaccacttaagttgaagggaaaattctattggacaactgttagacc 24425949  T
Q  125 gacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaag 224  Q
    || |||||| ||||  ||  | ||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||| |||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  24425948 gatgatgttgtatgaaacaaaatgttgagtggttaataaccaacac--aaataaagtaagtttagcggaaatgatgatg-tgcgttgaatgtgtggtaag 24425852  T
Q  225 actaga 230  Q
    | ||||    
T  24425851 attaga 24425846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 515
Target Start/End: Original strand, 29650353 - 29650631
Alignment:
Q  239 gattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||    
T  29650353 gattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 29650452  T
Q  337 gttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatga 436  Q
       |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |       |||| ||||| | |||  |||||  |  ||||||| ||||  |    
T  29650453 cccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaa 29650552  T
Q  437 aagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  29650553 aagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccga 29650631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531441
Alignment:
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||       |||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
     ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatat 1531441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Original strand, 37616670 - 37616790
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||| || | |||||||    
T  37616670 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggccagcagtcagac 37616769  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacgg 144  Q
    ||||  |||| |||| |||||    
T  37616770 cgacattgttgtatggtacgg 37616790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 515
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011293
Alignment:
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||       |||||||||||| ||| ||||| | | |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||| || ||  ||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatcc-aatatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccga 1011293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Original strand, 14057629 - 14057723
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14057629 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcc 14057723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Original strand, 14367657 - 14367751
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14367657 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcc 14367751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 36239935 - 36239833
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  36239935 aaaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgta 36239836  T
Q  511 gcc 513  Q
    |||    
T  36239835 gcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 401 - 489
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976456
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta 37976456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 517
Target Start/End: Original strand, 45601602 - 45601725
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||  | ||| |||||||| || |      
T  45601602 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactatggt 45601701  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccgaac 517  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  45601702 gtaatttgatccatgtagctgaac 45601725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Original strand, 21078070 - 21078164
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||    
T  21078070 agagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccga 21078164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 36101898 - 36101816
Alignment:
Q  429 tattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36101898 tattatgaaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtag 36101816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 7273226 - 7273347
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || ||| ||| | || || |||    
T  7273226 ggtagaggaagacctatgaaaactataagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgac 7273325  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  7273326 gtaatttgatccatgtagccga 7273347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 398 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 44401277 - 44401164
Alignment:
Q  398 gaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaa 497  Q
    ||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||  | ||| ||||||||||| |||||||    
T  44401277 gaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaa 44401180  T
Q  498 tttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||||| |||||||||    
T  44401179 tttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 386
Target Start/End: Original strand, 5335851 - 5336038
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||  ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||  | |    
T  5335851 ggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattagagagagttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcg 5335950  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaat 386  Q
     || ||| |||  |||||||| |||| |||||||||||  ||| |||  ||||||  | | ||||||| ||||||| | |||||||||    
T  5335951 aaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaaat 5336038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 553
Target Start/End: Original strand, 38900083 - 38900242
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| || ||||| || | |    
T  38900083 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaacactatggc 38900182  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccgaaccatttaataagataacacttggttattgttgatgtt 553  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||| ||| |  |||||  ||||||| |||||| ||||    
T  38900183 gtcatttgatccatgtagccgacccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtt 38900242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 374
Target Start/End: Original strand, 39811869 - 39812063
Alignment:
Q  182 aagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacct 279  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||  |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  39811869 aagcgtagcggatatgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacct 39811968  T
Q  280 atagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    ||  ||||||||||  |   || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||||| | | |||||||||||||||    
T  39811969 atcatagaaaaaatggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatgga 39812063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517427
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||  | ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  501 gat 503  Q
    |||    
T  21517429 gat 21517427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682637
Alignment:
Q  269 gggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatca 368  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||   |||||||  ||  || ||| |||||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  369 gatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaat 468  Q
     ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || |||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  469 atagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     | || ||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 31682637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 503
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922488
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  | ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgat 35922488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 515
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852334
Alignment:
Q  446 aggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 47852334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28562522 - 28562446
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    ||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  28562522 ggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaatat 28562446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30200312 - 30200223
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  30200312 ggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagag--ttagggtaacacctatagtagaaaa 30200223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38135462 - 38135251
Alignment:
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||   |||||| |||||||| | | | ||||||||||||| || ||||| ||       || |||    
T  38135462 aaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcagatcattagaggcaga 38135364  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
     ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || | |||||| |  ||| |||||| |||| | |||||||    
T  38135363 tgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaatt 38135264  T
Q  500 tgatgcatgtagc 512  Q
    |||| ||| ||||    
T  38135263 tgatccatctagc 38135251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Original strand, 42187380 - 42187537
Alignment:
Q  179 agtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattag--agagagttggggtaaca 276  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||  |||| | ||||  |||| || ||||||  ||||||| |||||| ||    
T  42187380 agtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagca 42187478  T
Q  277 cctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaag 335  Q
    |||||| ||||||| ||  | | ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  42187479 cctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 515
Target Start/End: Original strand, 42187572 - 42187688
Alignment:
Q  398 gaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaaca-ttacgacgta 496  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| | || ||| |||||||| ||| | ||||    
T  42187572 gaggaagaccta-aaaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgta 42187669  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  42187670 atttgatccatgtagccga 42187688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Original strand, 48919142 - 48919236
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggt 118  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  48919142 caagctgggtagttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccccttaagttgaaaggaaggttatatcggacaacggt 48919236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6420737 - 6420607
Alignment:
Q  303 taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagagga 402  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||||||||||| | || ||||| ||       || |||||     
T  6420737 taggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcactagaggcagaggt 6420638  T
Q  403 agatctataaaaactttaagagaaactatta 433  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6420637 agacctataaaaactataagagatactatta 6420607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 485
Target Start/End: Original strand, 43282334 - 43282626
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt-----agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaat 293  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| ||||||  ||||||| ||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  43282334 ggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtc 43282433  T
Q  294 tataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnn 393  Q
      | | || |||||||  |||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||| | | | ||||||| ||||||| || ||||| ||           
T  43282434 ggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcacaaga 43282532  T
Q  394 g--gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaac 485  Q
    |  |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||||    
T  43282533 ggtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaaactattaagtaagttcttgaggttattgagttggatcgaaatatggtttattatagaac 43282626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 12966144 - 12966203
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatga 455  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  12966144 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatga 12966203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 515
Target Start/End: Original strand, 27648948 - 27649027
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||    
T  27648948 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccga 27649027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29653685 - 29653634
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagat 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29653685 aaaaactgtaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttagat 29653634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 515
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073176
Alignment:
Q  444 agaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccga 33073176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40139321 - 40139179
Alignment:
Q  147 tgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaaga 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||| |  || | | |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||  |    
T  40139321 tgttgggttgttaagaaccaacacggaaataaattcagcgttgcagagacgaggatgttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaa 40139222  T
Q  247 atgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    | |||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  40139221 aagacaacattagagagag-tcgggtttcacctatagtagaaaa 40139179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 386
Target Start/End: Original strand, 44681206 - 44681385
Alignment:
Q  207 cgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaatagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |    || |||| |  ||||||| |||||||| |||||| || || || |||  || |||||||  ||  ||| |||    
T  44681206 cgttggatgagtggtaagactaaacgatatatgatcagaaatgacatcattagagggagttgcggcaatacatatcatataaaaaatggtaaaaaaaagg 44681305  T
Q  307 ctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaat 386  Q
    ||| ||||||||| |||| |||| |||| |  || | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44681306 cttaagtggtttgtgcatctagatagaaaacctgcaaatgttgtagtacgaaaagtatatcagatgaaagatagtcaaat 44681385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Original strand, 47235623 - 47235694
Alignment:
Q  141 acggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttgg 212  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  47235623 acggagtgttgagcggtaaagaaccaacacgtgaataaagtaagcgtagtggaaatgatgatgttacgttgg 47235694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27893688 - 27893598
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || | ||||||  | ||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  27893688 aaactattaagaaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccga 27893598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27893843 - 27893769
Alignment:
Q  255 attagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtaga 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  27893843 attagagagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 372
Target Start/End: Original strand, 35713693 - 35713799
Alignment:
Q  266 ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtaga 365  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||  | | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| | | ||||||    
T  35713693 ttggggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtaga 35713792  T
Q  366 tcagatg 372  Q
    || ||||    
T  35713793 tctgatg 35713799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 333
Target Start/End: Original strand, 38920789 - 38920859
Alignment:
Q  263 gagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagaga 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38920789 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 429 - 470
Target Start/End: Original strand, 40415168 - 40415209
Alignment:
Q  429 tattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40415168 tattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatat 40415209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Original strand, 22174143 - 22174247
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| || | | ||||||||||| | |||  |||||| ||||||    
T  22174143 aaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaacattatggcgttgtttgatccatgta 22174242  T
Q  511 gccga 515  Q
    |||||    
T  22174243 gccga 22174247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27022057 - 27021993
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag 265  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27022057 atgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagag 27021993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202764
Alignment:
Q  303 taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagagga 402  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||||||| ||||  || ||||||||       || ||||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  403 agatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatt 488  Q
    ||  ||| ||||||| ||||||| |   ||| ||||| | ||||| |||||||||| |||  |||||| || |||  |||||||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagagagatcgttaagaaagttgtagagtttaatgagttggattgaaatatggtttatgttagaacatt 48202764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25731589 - 25731470
Alignment:
Q  435 gaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaac-catttaataagataac 533  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||||||||||| || |  |||||||||||| | |||||||||||  ||||||| || | | ||||||  |||||     
T  25731589 gaaagatttacaggttaataaattggatccaaatatggtttcgaatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagcagacctcgtttaatgggataag 25731490  T
Q  534 acttggttattgttgatgtt 553  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  25731489 acttggttgttgttgttgtt 25731470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 374
Target Start/End: Original strand, 30144822 - 30144881
Alignment:
Q  315 gtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  30144822 gtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatgga 30144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 510
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| || | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32368488 - 32368417
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  32368488 aggaagatctagaaaatctataagagaagctattaaggaagatttagagattagtgagttggatcgaaatat 32368417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 515
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969945
Alignment:
Q  440 atttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccga 42969945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |   || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 503
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355400
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || ||| ||| ||||||| | || ||||||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgat 28355400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31681149 - 31681055
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||  || ||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  31681149 agagaaaccattagaaaggatttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccga 31681055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36102116 - 36101979
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||| |||| |||  |||||   |||| |||||||| ||||||| ||  | |    
T  36102116 atgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataatagaaaagatgttgg 36102017  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
     ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  36102016 aaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaaga 36101979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 513
Target Start/End: Original strand, 15682318 - 15682419
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| |||||||||  ||||  || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | ||| |||||||| || | |||| |||||| |||||||    
T  15682318 aaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatggcgtactttgatccatgtag 15682417  T
Q  512 cc 513  Q
    ||    
T  15682418 cc 15682419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 463
Target Start/End: Original strand, 30664702 - 30664763
Alignment:
Q  402 aagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatc 463  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  30664702 aagatctagaaagactataaaagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatc 30664763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30914755 - 30914674
Alignment:
Q  263 gagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtaga 344  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| || | |||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  30914755 gagttggggtagtacctattgtagaaaaaatggtagaaactcggctttggtggtttgggcatgtaacgagaagacttgtaga 30914674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40139079 - 40138986
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||  ||||||    ||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  40139079 taagagaaactattaagaaagatctagagattaatgcgtttgatagaaatatgacatatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagc 40138986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 336
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169717
Alignment:
Q  259 gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataaga 40169717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42103674 - 42103598
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactt--taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagt 473  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  42103674 aggaagacctagaaaaacttattaagagaaactgttaagaaagatcaagaggttaatgagttggatagaaatatagt 42103598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 290
Target Start/End: Original strand, 45558351 - 45558384
Alignment:
Q  257 tagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45558351 tagagagagttggggtaccacctatagtagaaaa 45558384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 229
Target Start/End: Original strand, 1740673 - 1740756
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 229  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1740673 agtgttgggttgtaaagaacccacatggaaat-aagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactag 1740756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 1740791 - 1740907
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||  | | || |||||||  |||||||| | ||||||| || ||| |||| ||| |||||||| |     
T  1740791 agagagagtttgggtagcatctacagtagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaagg 1740890  T
Q  358 atagtagatcagatgga 374  Q
    | |||||||||||||||    
T  1740891 agagtagatcagatgga 1740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 383
Target Start/End: Original strand, 5418071 - 5418195
Alignment:
Q  260 agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag-tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaa 358  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||  | | ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||  ||||||| | |    
T  5418071 agagagttggggtagcacctcttgtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagta 5418170  T
Q  359 tagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
     |||||||||| |||| || |||||    
T  5418171 gagtagatcaggtggaggatagtca 5418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9797995 - 9797900
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagta 354  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||| | | |||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  9797995 agagagagttggggtagtgcctattgtagaaaagattct-gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagattttgaagta 9797900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24549824 - 24549780
Alignment:
Q  414 aactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  24549824 aactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtt 24549780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24550078 - 24549978
Alignment:
Q  161 gaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattaga 260  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||  || ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||  ||||| | |||||||    
T  24550078 gaaccaacacaaaaataaattatgcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgttgtaagactagatagaatatgattagaaatgataacattaga 24549979  T
Q  261 g 261  Q
    |    
T  24549978 g 24549978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 402 - 458
Target Start/End: Original strand, 30144909 - 30144965
Alignment:
Q  402 aagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  30144909 aagacctataaaaactattcgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtt 30144965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Original strand, 33103069 - 33103173
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||  |||  ||||| || ||| ||||||||  |   ||||||||||| ||||||    
T  33103069 aaaaactatacgagaaattattttgaaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgta 33103168  T
Q  511 gccga 515  Q
    |||||    
T  33103169 gccga 33103173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38103752 - 38103661
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| | | |||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  38103752 aaaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaatttgat 38103661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Original strand, 38607163 - 38607239
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | |||  |||||| |||||||||||    
T  38607163 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccga 38607239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47796283 - 47796187
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||   |||||| || ||| |||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  47796283 taagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgcagccga 47796187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 112)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 1210499 - 1210992
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||  |||    
T  1210499 caagctgggtggttgaaatgaagaagagcctgaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagttcgac 1210598  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1210599 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 1210698  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  1210699 gactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 1210798  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  1210799 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 1210898  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  1210899 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 1210992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 9592488 - 9592981
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||    
T  9592488 caagttgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaatagtcagac 9592587  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9592588 tgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaatcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 9592687  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||   ||| ||| |    
T  9592688 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttggg 9592787  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  ||| || | |    
T  9592788 catgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctatta 9592887  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||| |||||||| ||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  9592888 gagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccga 9592981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43240909 - 43240414
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  43240909 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 43240810  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43240809 cggcgttgttgtatgatacggagtgttgggaggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 43240710  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag----agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttg 319  Q
    ||||||| | |||  ||||| ||||||| |||||||||    ||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||   | |||||    
T  43240709 gactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttg 43240610  T
Q  320 agcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaacttt 419  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| || |       |||||||||||| |||  |||||| |    
T  43240609 agcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactat 43240510  T
Q  420 aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     |||||||| ||||  || |||||| | || |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  43240509 tagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccga 43240414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30202652 - 30202165
Alignment:
Q  30 gggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacga 129  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||     
T  30202652 gggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgt 30202553  T
Q  130 tgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 229  Q
    |||| | || ||| |||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202552 tgttgtgtggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 30202453  T
Q  230 aaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgta 327  Q
    | | |||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||   |  ||| ||||||||||   |||||||  ||||||    
T  30202452 acatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgta 30202353  T
Q  328 gagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaa 427  Q
    |||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||    
T  30202352 gagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 30202253  T
Q  428 ctattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  30202252 ccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 30202165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9599918 - 9599432
Alignment:
Q  28 ttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgac 127  Q
    |||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||| |||  | ||||||||  |    
T  9599918 ttgggtggtttaaatggataagagcctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttcagttgaaatgaaaattctatcagaccgcagtcagaccagc 9599819  T
Q  128 gatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagact 227  Q
    |||||  |||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9599818 gatgtggtatgatacaaagtgttgtgcggttgagaaccaacacaataatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagact 9599719  T
Q  228 agaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatg 325  Q
    |||  |||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  |||||| | ||||     
T  9599718 agacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcata 9599619  T
Q  326 tagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagaga 425  Q
    || | ||| ||  || ||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||       |||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  9599618 taaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagaga 9599519  T
Q  426 aactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  9599518 aactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 51441292 - 51440800
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  51441292 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtttt-tgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 51441194  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||| || ||||  || ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  51441193 cgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtgagtgtagcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaa 51441094  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  51441093 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 51440994  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   | |||||  || ||| ||| |||||| || ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  51440993 catgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactatta 51440894  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  51440893 gagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattcatgtaaccga 51440800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 486
Target Start/End: Original strand, 8671674 - 8672136
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  8671674 caagctgggtggttaaaatggagaagagactcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagac 8671773  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||| | ||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8671774 cggcgttgttgtatggtacgaaatgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaa 8671873  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |||    
T  8671874 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 8671973  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||    
T  8671974 tgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 8672073  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaaca 486  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8672074 gaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 8672136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 49347921 - 49347428
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||    
T  49347921 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaaatctatcggacagcagtccgac 49347822  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    | ||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49347821 caaccttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 49347722  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||      
T  49347721 gactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggt 49347622  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||| ||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  49347621 catgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 49347522  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  49347521 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 49347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 513
Target Start/End: Original strand, 51601812 - 51602301
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| |||  ||| ||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||| || | ||||||||||||   ||| |||    
T  51601812 caagctgggtggtggaaatagagaagagtctcaggtgttttgttcgataagaaagtaccccttaagttgaaatgaaagttctatcggacagtagtccgac 51601911  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  51601912 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagatatgaggatgttgcgttagatgagtggtaa 51602011  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |||    
T  51602012 gactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 51602111  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   |||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||    
T  51602112 tgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 51602211  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
     |||| ||||  |  ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||    
T  51602212 aaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtagcc 51602301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 22089848 - 22090343
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  |||  |||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  22089848 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgcaataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 22089947  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| | || |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22089948 cggcgttgttgtgtggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaa 22090047  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt----agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttg 319  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||    
T  22090048 gactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 22090147  T
Q  320 agcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaacttt 419  Q
     |||||||| |||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| |    
T  22090148 ggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactat 22090247  T
Q  420 aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22090248 tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 22090343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37463334 - 37462911
Alignment:
Q  85 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||   | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||       
T  37463334 ttaagttgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagactagcaatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaagaatcaagt--- 37463238  T
Q  185 cgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagt 284  Q
     |||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37463237 -gtagaggagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagagagttggggtagcacctatagt 37463139  T
Q  285 agaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaa 384  Q
    |||||| |   ||| ||||||||||  |||||||| ||   || |||| |||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||      
T  37463138 agaaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcgg 37463042  T
Q  385 at-nnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataataga 483  Q
    ||        |||||||||  | ||| ||||||| |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||    
T  37463041 atcaaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcataga 37462943  T
Q  484 acattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  37462942 acattatggcgtaatttgatccatgtagccga 37462911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 470
Target Start/End: Original strand, 696069 - 696471
Alignment:
Q  70 ataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaaca 169  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  696069 ataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagccaaca 696168  T
Q  170 cgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagtt 267  Q
    ||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  696169 cgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtg 696268  T
Q  268 ggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatc 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||| |||  |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||    
T  696269 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatc 696368  T
Q  368 agatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaa 467  Q
    | ||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  696369 atatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaa 696468  T
Q  468 tat 470  Q
    |||    
T  696469 tat 696471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 515
Target Start/End: Original strand, 39140309 - 39140762
Alignment:
Q  65 atgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaac 164  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  39140309 atgcgataagaaagtaccgcttaaattgaaaggcaaattctatcggacagcagtcagaccggtgatgttgtatggtacg-agtgttgggcagttaagaac 39140407  T
Q  165 caacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgag-------tggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt 257  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||   |||  ||||| |||||| ||||||    
T  39140408 catcatgaaaatcaagtaagcgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaactggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccatt 39140507  T
Q  258 --agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtac 355  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||   |  |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||||    
T  39140508 acagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtac 39140607  T
Q  356 gaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatga 455  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||       ||||||||||      ||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  39140608 gaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa-----ctaaaaaagttatgagaaactattaggaaaaatttagaggttaatta 39140702  T
Q  456 gttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| ||||||||||| || |   ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  39140703 gttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccga 39140762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18469482 - 18469121
Alignment:
Q  150 tgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatg 249  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  18469482 tgggcggttaagaaccaacacgagaatcaagtaaacgtagcggagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatg 18469383  T
Q  250 acaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttg 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||  || |||||  ||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  18469382 acacaattagagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttg 18469283  T
Q  350 tagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggt 449  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||       |||||| |||||  || ||||| | ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  18469282 tagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggt 18469183  T
Q  450 taatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
     |||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||| |  |||||||| | |||||||    
T  18469182 caatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtag 18469121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 32083273 - 32082912
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  32083273 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttctatgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagac 32083174  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||| | | ||||| | |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32083173 cgacaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtatgtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaa 32083074  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||      
T  32083073 gactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgga 32082974  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    |||| |||||| |||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  32082973 catgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 32082912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 515
Target Start/End: Original strand, 9509229 - 9509565
Alignment:
Q  181 taagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacc 278  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9509229 taagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacc 9509328  T
Q  279 tatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagag 378  Q
    |||||||||||| ||  ||  ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||   ||| ||| | ||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  9509329 tatagtagaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggag 9509428  T
Q  379 agtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtata 478  Q
    ||||| ||       |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| || |||     
T  9509429 agtcatattagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatg 9509528  T
Q  479 atagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  9509529 attgaacattatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 383
Target Start/End: Original strand, 15085730 - 15086049
Alignment:
Q  66 tgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaacc 165  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| | ||||||| |||| | |||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15085730 tgcgataagaaagcaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagcc 15085829  T
Q  166 aacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagag 263  Q
    ||||||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  15085830 aacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagag 15085929  T
Q  264 agttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagta 363  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||  || ||  ||| ||||    
T  15085930 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagta 15086029  T
Q  364 gatcagatggaagagagtca 383  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  15086030 gatcaaatggaggagagtca 15086049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 32231359 - 32231037
Alignment:
Q  147 tgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaaga 246  Q
    ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||    
T  32231359 tgttgggcggttaagggtcaacacgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattagga 32231260  T
Q  247 atgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtaga 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32231259 atgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtaga 32231160  T
Q  345 tgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagattta 444  Q
    ||  ||  || ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||    
T  32231159 tgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggattta 32231060  T
Q  445 gaggttaatgagttagatccaaa 467  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  32231059 gaggtcaatgagttggatccaaa 32231037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34792765 - 34792384
Alignment:
Q  135 tatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaagg 234  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  34792765 tatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaag-aagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatg 34792667  T
Q  235 atgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagag 332  Q
    ||  ||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| || |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  34792666 ataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagag 34792567  T
Q  333 aagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactatt 432  Q
    ||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| |||    
T  34792566 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 34792467  T
Q  433 atgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |  || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  34792466 agaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 34792384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 290
Target Start/End: Original strand, 8391529 - 8391794
Alignment:
Q  29 tgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacg 128  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||||||   || ||||||||| | ||||||||| |     
T  8391529 tgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagcttaaaggaatgttttatcggacagcagtcagaccggca 8391628  T
Q  129 atgt--tatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac 226  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||| | | ||||||| |||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8391629 atgtcgtatatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagac 8391728  T
Q  227 tagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    || | | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8391729 tacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 8391794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34827630 - 34827424
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||     
T  34827630 caagttgaatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttatgtgataagaaagtactgcttaaattgaaaggaaaattatattggacaacagtcagat 34827531  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    | |||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||   || ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34827530 caacgatgttgtatggtacagagtgttgttcggttaagaaccaacacgaaaaacaaataagtgtaactgagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaa 34827431  T
Q  224 gactaga 230  Q
    |||||||    
T  34827430 gactaga 34827424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 300 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52561839 - 52561624
Alignment:
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||       ||||||    
T  52561839 aaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggtaga 52561740  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    |||||||||| | || ||||    
T  52561739 ggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaatt 52561640  T
Q  500 tgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| |||||||||||    
T  52561639 tgatccatgtagccga 52561624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Original strand, 19936276 - 19936584
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| | | || | |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||| |||| ||||||||| | || ||||    
T  19936276 caagctgggtggttgaaatggataagaacctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttaaaatgaaaggaaaattatatcggacagcagttagac 19936375  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |  | |||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  19936376 cagcaatgttatagggtatagagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaatcaaataagcatagcggagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaa 19936475  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    |||||||  ||||  || || ||||||||||      ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||  ||| ||||||| ||  |||||||| |||    
T  19936476 gactagatgggataggaataggaatgacacc------gagagttagggtagcacctatagcaaaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgggca 19936569  T
Q  324 tgtagagagaagagt 338  Q
    || ||  ||||||||    
T  19936570 tgaagtaagaagagt 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46226810 - 46226604
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |     
T  46226810 caagttggatggttgaaatggagaagagcatcaagtgttttatgtgctaagaaagtagtgcttaagttgaaagaaaaattctatcagacaactgtcatag 46226711  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     ||||||||| |||| |||| | ||||| |   |||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  46226710 tgacgatgttgtatggtacgaaatgttgagcaattaacaaccaacacgagaatcaagtaagtttagcggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtga 46226611  T
Q  224 gactaga 230  Q
    |||||||    
T  46226610 gactaga 46226604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404561
Alignment:
Q  269 gggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatca 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  | | ||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||  |||||||  | ||||| | | ||||||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  369 gatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaat 468  Q
    |||||| || ||||| ||       |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  469 atagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || || ||| ||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccga 32404561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4001808 - 4001492
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |  |    
T  4001808 ggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 4001709  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggt 396  Q
    || ||||||||||   |||||||  ||||||||||| |||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |       |||    
T  4001708 agaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggt 4001609  T
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||  || ||| |     
T  4001608 agaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatc 4001509  T
Q  497 atttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| |||||||||    
T  4001508 atttgatccatgtagcc 4001492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847835
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga--gttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||| | |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||||||| ||  |||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtag 398  Q
     ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  |       |||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  399 aggaagatctat-aaaaactttaagagaaactatt----atgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    ||||||| || | ||||| | |||||||||||| |    | || ||||||||||||||||||||| | |  |||||| || ||| || |||||||| | |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccga 27847835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 425 - 515
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936707
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccga 19936707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38808101 - 38807706
Alignment:
Q  121 gaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtgg 220  Q
    ||||| ||||||| || | ||| |||||||||| |||||||| |    |||| ||| |||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  38808101 gaccggcgatgttgtacggtacagagtgttgggaggttaagagc----acgagaattaagtaagcgtggcggatatgaggatgttgtgttggat-agtgg 38808007  T
Q  221 taagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag------ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtg 314  Q
    |||||| |||  ||||   ||||  ||||||||||||||||||||      | |||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||||| |||   ||    
T  38808006 taagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatg 38807907  T
Q  315 gtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaa 414  Q
    ||||  ||||||| ||||||||    ||||||  || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||       | ||| |||||| |||  |||    
T  38807906 gtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaa 38807807  T
Q  415 actttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccg 514  Q
    ||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | ||||||||| | ||||||||||    
T  38807806 actataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccg 38807707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 48431689 - 48431509
Alignment:
Q  267 tggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagat 366  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||   | ||| |||    
T  48431689 tggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgat 48431590  T
Q  367 cagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagag 447  Q
    |||||||| || ||||  ||       |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48431589 cagatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagag 48431509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 489
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416592
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  | | ||  ||||||  |||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |     
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaagg 40416460  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||||||| | || ||||| ||       |  ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  40416461 agagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatgagt 40416560  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    | |||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  40416561 tggatcgaaatatggtttatgatagaacatta 40416592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 39318255 - 39318376
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | |    
T  39318255 ggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggc 39318354  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  39318355 gtaatttgatccatgtagccga 39318376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 41560355 - 41560476
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||| | |    
T  41560355 ggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggc 41560454  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  41560455 gtaatttgatccatgtagccga 41560476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 282
Target Start/End: Original strand, 26016312 - 26016451
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaa 244  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||     
T  26016312 agtgttgggcggtaaagaaccaacaagaacataaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattat 26016411  T
Q  245 gaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctata 282  Q
     ||| |   ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26016412 aaataatggcattagagagagagttggggtaacacctata 26016451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 458
Target Start/End: Original strand, 43423646 - 43423909
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggt--aagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaatt 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  43423646 ggatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatg 43423745  T
Q  295 ataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnng 394  Q
     | | || |||||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||||  |||||||    ||||||||       |    
T  43423746 gtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactagag 43423845  T
Q  395 gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |  |||||| || |||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  43423846 gtagaggaagacctagaaaaattacaagagagaccattaagaaagatctagagattagtgagtt 43423909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Original strand, 8796338 - 8796456
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| || |||  |||||| || ||| ||||||||||| | ||||    
T  8796338 agaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 8796437  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| || |||||||||||    
T  8796438 atttaatccatgtagccga 8796456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 336
Target Start/End: Original strand, 40419478 - 40419707
Alignment:
Q  109 ggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcg 208  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||  || ||| ||||| ||||    
T  40419478 ggacatcggtaagatcgacgatgttgtacggaacagagtgttgggtggtaaagaaccaacacgaacataaagtaagtgtagcagagatgaggatggtgcg 40419577  T
Q  209 ttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaatagg 306  Q
    ||| |||  |||||| ||||||   |||   ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||| | ||  ||| || |||     
T  40419578 ttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagtagaatagatggtagtaactaga 40419677  T
Q  307 ctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40419678 cttaagtggtttgggcatgtagagagaaga 40419707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 503
Target Start/End: Original strand, 52831837 - 52832280
Alignment:
Q  49 gagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtg 148  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  52831837 gagcctcatgtgttttatgcgataagaaagtgtcatttaaattgaaagaaaaattgtatcggacgacagttagaccgacaatgttgtatgatacgaagtg 52831936  T
Q  149 ttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaat 248  Q
    |||||          | || ||||||||  ||||||||||  ||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |  |   |||  |||| | ||     
T  52831937 ttggg----------ctaatacgaaaatttagtaagcgtatcggagatgaggatg-tgtgttgaatgagtggtaagatttaatgagataggattcaaaaa 52832025  T
Q  249 gacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgtt 348  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| || |||  |||||   ||  |||||||| ||||||  ||||||||    ||||||||    
T  52832026 gacatcattaaagagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgtt 52832125  T
Q  349 gtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagagg 448  Q
    || ||||  | ||||||| ||||||| |||||||  ||       |||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  52832126 gttgtacagagagtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagagg 52832225  T
Q  449 ttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    || || ||||  || ||||||| || |   ||||||||||| |||||||||||||    
T  52832226 ttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgat 52832280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7762674 - 7762484
Alignment:
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataa 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| ||||| || | ||       | || |    || ||| ||    
T  7762674 tggtttgggcatgtagagagaagaattgtagatgttatagtatgaaaagtaaatcatatgaaagagtgttagatcaaaagagataaaaagggacctagaa 7762575  T
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7762574 aaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgat 7762484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 487
Target Start/End: Original strand, 8628156 - 8628249
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 487  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  8628156 ggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaacat 8628249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 371
Target Start/End: Original strand, 51812515 - 51812628
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | | || |||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||    
T  51812515 agagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtagtaaga 51812614  T
Q  358 atagtagatcagat 371  Q
    | ||||||||||||    
T  51812615 aaagtagatcagat 51812628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544840
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | ||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||  | |||||  | ||||| |     
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagg 2544688  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||        |||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||     ||||||| ||  | |||||||    
T  2544689 agagtagatcagatggaggatagtcaaa-cactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagt 2544782  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | || | |||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  2544783 tggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga 2544840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52532747 - 52532651
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  52532747 taagagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccga 52532651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  213 atgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggcttt 310  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||  || |||| ||||||||||     
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  311 agtggttt 318  Q
     |||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 265
Target Start/End: Original strand, 4379894 - 4380000
Alignment:
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta 258  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||  || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||    
T  4379894 aagaaccaacacgaaaataaataaagcttagctgagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacatta 4379993  T
Q  259 gagagag 265  Q
    |||||||    
T  4379994 gagagag 4380000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 411 - 489
Target Start/End: Original strand, 29128926 - 29129004
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  29128926 aaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta 29129004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25979387 - 25979266
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| | || |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | |    
T  25979387 ggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggc 25979288  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  25979287 gtcatttgatccatgtagccga 25979266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3819148 - 3818891
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||  | | || ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||  | |||||       
T  3819148 agagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaaag 3819049  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||||||||| |  | |||||        |  ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3819048 agagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagt 3818949  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |  ||  |||||| || ||| || |||||||| | ||  ||||||| |||||||||||    
T  3818948 tgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccga 3818891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 411 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16142119 - 16142019
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16142119 aaaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgta 16142020  T
Q  511 g 511  Q
    |    
T  16142019 g 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 458
Target Start/End: Original strand, 26299211 - 26299275
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299211 ggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 26299275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 411 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27520346 - 27520246
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  27520346 aaaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgta 27520247  T
Q  511 g 511  Q
    |    
T  27520246 g 27520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 489
Target Start/End: Original strand, 41611807 - 41612027
Alignment:
Q  269 gggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatca 368  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  41611807 gggtagcacttatattagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaagatatgtagatgatgtagtacgaaaagtagatta 41611906  T
Q  369 gatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaat 468  Q
     || || |   |||| |        |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | | |||  ||||||||||| |||||||||||  || |||||    
T  41611907 aatagaggtttgtcagagcaagagaggtagaggaaaatctataaaaaatataagagatattgttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaat 41612006  T
Q  469 atagtgtataatagaacatta 489  Q
    || || ||| |||||||||||    
T  41612007 atggtttatcatagaacatta 41612027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 52739642 - 52739547
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtat-aatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| | |||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  52739642 taagagaaactattaggaaagatttttaggttaatgagttgaatccaaatataatttatggatagaacattatgacttaatttgattcatgtagcc 52739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 172
Target Start/End: Original strand, 41560228 - 41560338
Alignment:
Q  62 tttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaag 161  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  41560228 tttatgtgataagaaagtaccgcttaagttgaaaggaaaattctatccgaacgctgtcagaccagcgatgttgtatgatacggagtattgggcggttaag 41560327  T
Q  162 aaccaacacga 172  Q
    || ||||||||    
T  41560328 aatcaacacga 41560338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16142274 - 16142165
Alignment:
Q  162 aaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag 261  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||  ||| | ||||| |||||||||||    
T  16142274 aaccaatacgagaatcaaataagcatagtggaaatgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagag 16142175  T
Q  262 agagttgggg 271  Q
    ||| ||||||    
T  16142174 agaattgggg 16142165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30834216 - 30834054
Alignment:
Q  311 agtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctat 410  Q
    |||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||  | || || | | |||||||||||||||||  ||||||||       || ||||||||| |||     
T  30834216 agtggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctag 30834117  T
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagt 473  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  30834116 aaaagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagt 30834054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029369
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||  |  ||| ||||||||||    ||||||  |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | | ||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || |||||| |||| |||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||||| | |||||| ||| |||| || | ||  ||||||| |||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccga 4029369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Original strand, 37263325 - 37263437
Alignment:
Q  262 agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatag 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||  ||| | | ||    
T  37263325 agagttggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagag 37263424  T
Q  362 tagatcagatgga 374  Q
    || ||||||||||    
T  37263425 taaatcagatgga 37263437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 425 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 48865832 - 48865744
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||| |||| |  |||||||||| |||||||||    
T  48865832 aaactatcaagaaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 458
Target Start/End: Original strand, 478748 - 478868
Alignment:
Q  338 ttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaa 437  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |  |       | |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||    
T  478748 ttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagttaggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaa 478847  T
Q  438 agatttagaggttaatgagtt 458  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  478848 agttttagaggttaatgagtt 478868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 43375722 - 43375635
Alignment:
Q  426 aactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||  || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  43375722 aactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagcc 43375635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 336
Target Start/End: Original strand, 1661420 - 1661498
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | |||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  1661420 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaaga 1661498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12930442 - 12930348
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12930442 taagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagcc 12930348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 27445652 - 27445738
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcgg 110  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||||    
T  27445652 caagttggttggttgaaatggagaagagttccgagtgttttatgtgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcgg 27445738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37311883 - 37311790
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  37311883 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 37311790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 500
Target Start/End: Original strand, 51812660 - 51812741
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  51812660 taagagaaacttttaagaaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaatattatgccgtaattt 51812741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 52921206 - 52921327
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||| ||   |    
T  52921206 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacactattgc 52921305  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  52921306 gtcatttgatccatgtagccga 52921327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4707331 - 4707256
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  4707331 gatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccga 4707256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438831
Alignment:
Q  437 aagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaaaat---gacgttatttgatgcatgtagccga 15438831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36624178 - 36623964
Alignment:
Q  240 attaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagag 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  || |  ||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||     
T  36624178 attaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggtttg-gcatgtcgagagaagac 36624080  T
Q  338 ttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaa 437  Q
    | |||     ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||       |||||||||||| |||            ||||||||||||  ||    
T  36624079 tggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagaccta------------gagaaactattagaaa 36623997  T
Q  438 agatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36623996 agatttagaggctaatgagttggatccaaatat 36623964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52442911 - 52442781
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaa 244  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||| ||||| || |||||||||  || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  |||||     
T  52442911 agtgtttggtggtaatgaaacaacacaaaaataaattaagcgtagcagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattag 52442812  T
Q  245 gaatgacaccatt--agagagagttggggta 273  Q
     ||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  52442811 aaatgagaacattggagagagagttggggta 52442781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Original strand, 6025734 - 6025852
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||| |||  |||||| || | | ||||||||| | | |||     
T  6025734 agaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtc 6025833  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  6025834 atttgatccatgtagccga 6025852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10200435 - 10200341
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||    
T  10200435 agagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccga 10200341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8676996 - 8676897
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtg---tataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||   ||| |||||| |||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  8676996 taagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 266
Target Start/End: Original strand, 41611047 - 41611168
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaa 244  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||  |  || | |||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||     
T  41611047 agtgttggacggttaagaactaacacgagaattaagtaagggtggtttaggtgagaatgttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattag 41611146  T
Q  245 gaatgacaccattagagagagt 266  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  41611147 gaatgacgctattagagagagt 41611168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 42501234 - 42501355
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||||| |||  |||||| |  ||| ||||||||||||  |    
T  42501234 ggtagaggaaaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagc 42501333  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||  ||| || |||||||||||    
T  42501334 gtcgtttaatccatgtagccga 42501355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 52442718 - 52442620
Alignment:
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||    
T  52442718 agtagatcagatggaagggagtcaaatctctagaggtagaggaagacctagaacaaatataagagaaactatcaagaaggatctagatgttaatgagtt 52442620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203226
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagtt 8203226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10200554 - 10200486
Alignment:
Q  160 agaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 228  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10200554 agaaccaacatgagaatgaagtaagcgtagcggagatgaggatattgcgttagatgagttgtaagacta 10200486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11331531 - 11331435
Alignment:
Q  85 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagt 181  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||  ||||||||| |||| ||| |||||||| | || || |||||||||| | ||||||||    
T  11331531 ttaagttgaaaggaaaattatatcagacaacaatcagattgacgatgttgtatggtacagagtgttgtgcggctaggaaccaacacaagaatcaagt 11331435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11489552 - 11489456
Alignment:
Q  85 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagt 181  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||  ||||||||| |||| ||| |||||||| | || || |||||||||| | ||||||||    
T  11489552 ttaagttgaaaggaaaattatatcagacaacaatcagattgacgatgttgtatggtacagagtgttgtgcggctaggaaccaacacaagaatcaagt 11489456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 458
Target Start/End: Original strand, 15577544 - 15577608
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  15577544 ggtagaggaagatctaaaaaaataataagagaaactattaagaaggatatagagattaatgagtt 15577608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 515
Target Start/End: Original strand, 34444531 - 34444603
Alignment:
Q  443 tagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||    
T  34444531 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccga 34444603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34827255 - 34827183
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagagg-ttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  34827255 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtttaatcagttgaatccaaatat 34827183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14226180 - 14226005
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | |||  |||||  |||| || |||| ||||||||||  ||| |||||||  ||||||| ||  | |    
T  14226180 ggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagagttgcagtagcacctatcatagaaaagatggtgg 14226081  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
     ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |    ||||||| |||||||| | | ||||||||| |||||    
T  14226080 aaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaggattcctgtagattttgtagtaaggagagtagatcacatgga 14226005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 510
Target Start/End: Original strand, 19822083 - 19822130
Alignment:
Q  463 ccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19822083 ccaaatatggtttatgatagaacattacgacgtaatttgatccatgta 19822130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 19908537 - 19908450
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaa 484  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  19908537 agaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaa 19908450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28090784 - 28090729
Alignment:
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  28090784 gatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 28090729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 29577298 - 29577204
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  || | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  29577298 ggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggt-tatgatagaacatta 29577204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40920817 - 40920782
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaat 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40920817 agagggagttggggtaacacctatagtagaaaaaat 40920782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 52633567 - 52633355
Alignment:
Q  156 gttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacacca 255  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||   |||  || ||  ||||||| ||    
T  52633567 gttaagaaccgacacgagaataaagtaagtgt-gtggagatgaggatgttgcgttgaatgtgcggtaagactagatgtgataagactagaaatgacaaca 52633469  T
Q  256 t--tagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagt 353  Q
    |  |||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| | | | | ||||| | || |||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||  | ||||    
T  52633468 ttgtagagatagttgagataacacctatagta-taaatactgttgaaaataagtttaagtgctttggacatgtagagagaaaacttgtagattctatagt 52633370  T
Q  354 acgaatagtagatca 368  Q
    |||||||||| ||||    
T  52633369 acgaatagtatatca 52633355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 513
Target Start/End: Original strand, 5338880 - 5338958
Alignment:
Q  435 gaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |  | ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  5338880 gaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 5338958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 441
Target Start/End: Original strand, 7124268 - 7124314
Alignment:
Q  395 gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagat 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  7124268 gtagaggaagatcaataaaaactataagagaaactattgagaaagat 7124314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 510
Target Start/End: Original strand, 10146763 - 10146821
Alignment:
Q  452 atgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10146763 atgagttggatcgaaatataggttataatataacattaagacgtaatttgatccatgta 10146821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 513
Target Start/End: Original strand, 15086093 - 15086167
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | | | |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  15086093 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 15086167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16822387 - 16822341
Alignment:
Q  184 gcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  16822387 gcgtagtggaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaatactaga 16822341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28511954 - 28511836
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    |||| |||| ||| ||||||| | ||||||| || || |||||| || ||| |||||||||| || | ||| || || ||| ||||||||||| | ||||    
T  28511954 agagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattatggcgta 28511855  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  28511854 atttgatcaatgtagccga 28511836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36339959 - 36339842
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||   ||| || ||  || ||| ||||||| ||     
T  36339959 ggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagttggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaa 36339861  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  36339860 gtaatttgatccatgtagc 36339842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Original strand, 38869015 - 38869129
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||| ||| |||  | |||| || ||| ||||||||||| | |||  |||    
T  38869015 gaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgttt 38869114  T
Q  501 gatgcatgtagccga 515  Q
    ||| |||||||||||    
T  38869115 gatccatgtagccga 38869129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 374
Target Start/End: Original strand, 39894826 - 39894888
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  39894826 gtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaattagatgga 39894888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Original strand, 4415503 - 4415596
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  | | | ||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||    
T  4415503 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccga 4415596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941619
Alignment:
Q  398 gaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaa 497  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||  | ||| || ||| ||| ||||||| | ||||     
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  498 tttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| |||||||    
T  11941632 tttgatccatgtag 11941619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13828012 - 13827931
Alignment:
Q  255 attagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||  | | || |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  13828012 attagagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaaga 13827931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 19969361 - 19969304
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  19969361 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaacaaagatctagagattaatgagtt 19969304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27072607 - 27072522
Alignment:
Q  430 attatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||   |||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  27072607 attaggaaagatttagaaattaaagagttggacagaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 27072522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40228155 - 40228039
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt--tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  || || ||||| | || | | ||| || | |||||||||||    
T  40228155 gaagacctagaaaaactataagtgaaactattaggaaagatttgaaggttaatgagtggtatattcaaatgtggtttgtgataaaataatacgacgtaat 40228056  T
Q  499 ttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  40228055 ttgattcatatagccga 40228039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52739939 - 52739874
Alignment:
Q  165 caacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  52739939 caacacgagaatcaagttagcgtagtggggatgagaatattgtgttgaatgagtggtaagactaga 52739874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 7814312 - 7814424
Alignment:
Q  118 tcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgag 217  Q
    |||||| || |||||| ||||  || || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||  | ||| ||||||| ||||| ||| |    
T  7814312 tcagactgatgatgttgtatggaacagaatgttggatggttaagaaccaacacgagaataaagtaattgttgtatagatgaggatgttacgttgaatgtg 7814411  T
Q  218 tggtaagactaga 230  Q
    || ||||||||||    
T  7814412 tgataagactaga 7814424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11331335 - 11331251
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  ||||||| || ||||||||||    
T  11331335 taagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11331251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11489356 - 11489272
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  ||||||| || ||||||||||    
T  11489356 taagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11489272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32082871 - 32082791
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac-gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || | | |||||||| |||| | || ||||||| |||||||||||    
T  32082871 aaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatccatgtagccga 32082791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 46226445 - 46226381
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||| |||||  || ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  46226445 ggtagaagaagacttagaaaaaccataagtgaaactattatgaaatatttataggttaatgagtt 46226381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36565769 - 36565276
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  36565769 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 36565670  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||||||| ||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36565669 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaa 36565570  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  36565569 gactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 36565470  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    ||||||||||||| |   |||||||  || ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  36565469 catgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 36565370  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  36565369 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccga 36565276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42854532 - 42854039
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  42854532 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacagcagtcagac 42854433  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| || |||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  42854432 cgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggagatgacgatgttgcgctggataagtggtaa 42854333  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccat--tagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| || ||  ||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |  ||| ||||||||||   |||||||      
T  42854332 gactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttgga 42854233  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||||  |      
T  42854232 catgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattc 42854133  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | ||| |||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  42854132 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 42854039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 485
Target Start/End: Original strand, 39946611 - 39947074
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||| |    
T  39946611 caagctggatggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaggc 39946710  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39946711 cggcgatgttgtatggtacggaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 39946810  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccat--tagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||      
T  39946811 gactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgga 39946910  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||| |       ||||||||| || ||| ||||||| | |    
T  39946911 catgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactatta 39947010  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaac 485  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||| | || ||| |||||||    
T  39947011 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaac 39947074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 36544906 - 36545396
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||| | |   |||      
T  36544906 caagttgggtggttgaaatggataagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaagaaagttctatcggatagcaaccag-- 36545003  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
       || |||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36545004 ---cgttgttgtatggtaccgagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaa 36545100  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt----agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttg 319  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||    
T  36545101 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 36545200  T
Q  320 agcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaacttt 419  Q
     ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| || |||||| |        ||||||||||| |||  |||||| |    
T  36545201 ggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactat 36545300  T
Q  420 aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  36545301 tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 36545396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 36395439 - 36395013
Alignment:
Q  66 tgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaacc 165  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  36395439 tgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtc 36395340  T
Q  166 aacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaa---atgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag- 261  Q
    |||| || ||||||||||| || || | |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  36395339 aacatgagaatcaagtaagtgttgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaga 36395240  T
Q  262 -agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag-tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaat 359  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||| |||     
T  36395239 gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaag 36395140  T
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtta 459  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| |       |||| ||||||| |||  |||||| |  |||||||  |||  || ||||||||||| |||||||||    
T  36395139 agtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagtta 36395040  T
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaaca 486  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  36395039 gatccaaatttggtgtatgatagaaca 36395013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 470
Target Start/End: Original strand, 18124939 - 18125374
Alignment:
Q  33 tggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgt 132  Q
    ||||||||||| |||  | | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  18124939 tggttgaaatggagaaaaacctcaggtgttttatgtgataagaaagtaccactta-gttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccaacaatgt 18125037  T
Q  133 tatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaa 232  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |    
T  18125038 tgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagaca 18125137  T
Q  233 ggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagag 332  Q
     |||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  18125138 tgataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagag 18125237  T
Q  333 aagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactatt 432  Q
    ||||   |||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||   |       |||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||| |||    
T  18125238 aagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggt-taaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccatt 18125336  T
Q  433 atgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |  ||||||||| | || |||||||| |||||||||||    
T  18125337 agaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatat 18125374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 515
Target Start/End: Original strand, 45419169 - 45419482
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||      
T  45419169 gatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtata 45419268  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    |||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |   ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||       ||||||    
T  45419269 aaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagagg--ctagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtaga 45419366  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||| |  ||||||    
T  45419367 ggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaatt 45419466  T
Q  500 tgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| |||||||||||    
T  45419467 tgatccatgtagccga 45419482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12492367 - 12492116
Alignment:
Q  27 gttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccga 126  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||     
T  12492367 gttgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagatgaaaggaaagttctatcggacagccgtccgaccgg 12492268  T
Q  127 cgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac 226  Q
    || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492267 cgttgttgcatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcatgtaagtgtagcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac 12492168  T
Q  227 tagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacc 278  Q
    |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  12492167 tagacatgataggattatgaatgacaccattagagagaatgggggtagcacc 12492116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 333
Target Start/End: Original strand, 2796351 - 2796622
Alignment:
Q  66 tgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaacc 165  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |    
T  2796351 tgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatattggacaacagttagaccgacgttgttatatggtaccgagtcttgggtggttaagagtc 2796450  T
Q  166 aacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac--tagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agag 261  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||    
T  2796451 aacacgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 2796550  T
Q  262 agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagaga 333  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  2796551 agagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 2796622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 513
Target Start/End: Original strand, 29520589 - 29520894
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| || |      
T  29520589 ggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaataaatgg 29520688  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggt 396  Q
     ||||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||       |||    
T  29520689 tggaaat----------ggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcacaagaggt 29520778  T
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||    
T  29520779 agaggaagc-ctagaaaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 29520877  T
Q  497 atttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| |||||||||    
T  29520878 atttgatccatgtagcc 29520894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 25288662 - 25288898
Alignment:
Q  30 gggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacga 129  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||  ||||| |||    
T  25288662 gggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcga 25288761  T
Q  130 tgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 229  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  25288762 tgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactag 25288861  T
Q  230 aaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagt 266  Q
    |   |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25288862 atgagataggattaggaaggacaccattagagagagt 25288898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15215792 - 15215558
Alignment:
Q  31 ggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgat 130  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||   ||||||||||  ||    
T  15215792 ggtggttgaaatggagaagagcctccagtgtcttgtgcggtaagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagtagtcagaccgaaaat 15215693  T
Q  131 gttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||| | || ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  15215692 gttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgaagcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactata 15215593  T
Q  231 aaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag 265  Q
     |||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15215592 caggataggattagaaatgacaccattagagagag 15215558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Original strand, 25300003 - 25300233
Alignment:
Q  36 ttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttat 135  Q
    |||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||  ||||| ||||||| |    
T  25300003 ttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgt 25300102  T
Q  136 atgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaagga 235  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||    
T  25300103 atgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgaga 25300202  T
Q  236 tgtgattaagaatgacaccattagagagagt 266  Q
    |  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25300203 taggattaggaaggacaccattagagagagt 25300233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 513
Target Start/End: Original strand, 40813251 - 40813569
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag----ttggggtaacacctatagtagaaaaaatt 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||||||||||  |     
T  40813251 ggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 40813350  T
Q  295 ataggaaataggctttag-tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnn 393  Q
     ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |           
T  40813351 gtagaaaatagg-tttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 40813449  T
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| | |||||||| || |||    
T  40813450 ggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgac 40813549  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
     | ||||||| |||||||||    
T  40813550 atcatttgatccatgtagcc 40813569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 239 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11524037 - 11523758
Alignment:
Q  239 gattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag-tggtttgagcatgtagagagaag 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11524037 gattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaag 11523938  T
Q  336 agttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatg 435  Q
    |   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||      
T  11523937 acccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaga 11523838  T
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  11523837 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 11523758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43904903 - 43904700
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctata 411  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||       |||| ||||||| ||| |    
T  43904903 gtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctaga 43904804  T
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    || ||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  43904803 aatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 43904704  T
Q  512 ccga 515  Q
    ||||    
T  43904703 ccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18752332 - 18752135
Alignment:
Q  93 aaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtgg 192  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| | | ||||||| |||| ||    
T  18752332 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgctggacggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcgg 18752233  T
Q  193 aaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    | ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |  ||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18752232 agatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 18752135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 37077527 - 37077752
Alignment:
Q  32 gtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatg 131  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||  | || | || |||||| ||||||||| |||||    
T  37077527 gtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgtgataagtaagtaccacttaagttgaaagggaagttatgtcagacaacagtcagaccgtcgatg 37077626  T
Q  132 ttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaa 231  Q
     | |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  37077627 ctgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtggcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagac 37077726  T
Q  232 aggatgtgattaagaatgacaccatt 257  Q
      |||  ||||| |||||||||||||    
T  37077727 gagataggattaggaatgacaccatt 37077752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 510
Target Start/End: Original strand, 30559725 - 30559935
Alignment:
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||| || ||||  ||       | ||||    
T  30559725 aaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactagagataga 30559824  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
     |||||  || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  30559825 tgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatt 30559924  T
Q  500 tgatgcatgta 510  Q
    |||| ||||||    
T  30559925 tgatccatgta 30559935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491173
Alignment:
Q  270 ggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcag 369  Q
    |||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| |||||||||     
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  370 atggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaata 469  Q
    ||| | ||||||||| |       |||||| ||||| |||| |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  470 tagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 12491173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Original strand, 29735564 - 29735766
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||  | |||||||| |    ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||     
T  29735564 caagttgggtggttgaaatggagatgag-ttcatgtgtgttatctggtaagaaagcactgcttaagttgaaatgaaaattctatcggacagtagtcaga- 29735661  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
      |||||||| |||| ||  |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  29735662 --acgatgttgtatggtaaagagtgttgagtgattaaaaaccaacacgagaatgaaataagcgtagtggagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaa 29735759  T
Q  224 gactaga 230  Q
    |||||||    
T  29735760 gactaga 29735766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4033022 - 4032919
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  4033022 caagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagac 4032923  T
Q  124 cgac 127  Q
    ||||    
T  4032922 cgac 4032919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 431
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043753
Alignment:
Q  202 tgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||   ||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||     
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    || ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| | | |||||||       |||||     
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagg 32043721  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactat 431  Q
    |||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  32043722 ggaagacctaaaaaaactattagagaaactat 32043753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 45512889 - 45512578
Alignment:
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | | |||  ||||| |  ||||    
T  45512889 aagaaccaacacgaaaataaaataagcatagcggagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagataggtaggg-ttagaaatgaaaatatta 45512791  T
Q  259 gagagag----ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagta 354  Q
     ||||||    |||||||| |||||||||||||||| || || | ||||| ||||   ||||||| |||| || ||||||||  | |||||   ||||||    
T  45512790 aagagagggagttggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagta 45512691  T
Q  355 cgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatg 454  Q
     | | ||||||| |||||| ||| ||||||||       || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||    
T  45512690 agcagagtagattagatggcagatagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatg 45512591  T
Q  455 agttagatccaaa 467  Q
    |||| ||||||||    
T  45512590 agttcgatccaaa 45512578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8879928 - 8879700
Alignment:
Q  58 gtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggt 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||      |||||||| |||    
T  8879928 gtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagacctactatgttgtatgt------gtgttgggcggt 8879835  T
Q  158 taagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt 257  Q
     |||| ||| ||| | ||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||  | ||| |||||||||||| ||   |||  ||||| ||||||||| |||    
T  8879834 gaagagccagcacaagaatcaagtaagtgtagcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaatt 8879735  T
Q  258 agagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||    
T  8879734 agagagagaatgggggaagcacctatagtagaaaa 8879700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Original strand, 13984789 - 13984908
Alignment:
Q  25 aagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagacc 124  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  13984789 aagttggatggttgaaatgaagaagagcctcaagtgttttatgtgataagaaaatattgtttaagttaaaaggaaaattctattggacaaccgtaagacc 13984888  T
Q  125 gacgatgttatatgttacgg 144  Q
     || ||||| |||| |||||    
T  13984889 aacaatgttgtatggtacgg 13984908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 515
Target Start/End: Original strand, 490491 - 490582
Alignment:
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  490491 gaaactataaggaaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 490582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30783195 - 30783077
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||  || ||||||| ||||||| || |||    
T  30783195 agaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacattatgaggta 30783096  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
     |||||| |||||||||||    
T  30783095 gtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Original strand, 32931090 - 32931207
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||| | | ||    
T  32931090 agaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgtatgatagaacattatggcata 32931188  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  32931189 atttgatccatgtagccga 32931207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30113715 - 30113416
Alignment:
Q  33 tggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgt 132  Q
    ||||||||||| ||| |||   || |||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||| |  ||||||||    
T  30113715 tggttgaaatggagaagagtcgcaggtgttttatgtgataagaaa-taccgattaagttgaaagaaaaattatatcgaacaactatcaaattgacgatgt 30113617  T
Q  133 tatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaa 232  Q
    | |||| || ||| ||||  | ||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||| ||| | |||||| | | ||||  || ||||| |||| |    
T  30113616 tgtatgatatggaatgttatgcggttaagaaccaacatgagaataaaataagcgtagaggagatgagaatgttgtgctagatgtttgttaagaatagata 30113517  T
Q  233 ggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagag 330  Q
     |||  ||||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| || | ||||||| |||| |||||    
T  30113516 tgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagag 30113417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Original strand, 14459046 - 14459142
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| || ||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  14459046 taagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491689
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||| | ||||      
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatg 17491706  T
Q  499 ttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17491705 ttgatccatgtagccga 17491689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Original strand, 28169518 - 28169594
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  28169518 ggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatat 28169594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35914754 - 35914602
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  || |||||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||| | ||||    
T  35914754 agaggaagacatagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 35914655  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga-accatttaataagataacacttggttattgttg 548  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||| ||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  35914654 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttg 35914602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42493697 - 42493537
Alignment:
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta 258  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||   | ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||  | |||  ||||   ||||||| ||||     
T  42493697 aagaaccaacaagaaaataaattaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacattg 42493598  T
Q  259 gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||||||  ||||||||    
T  42493597 gagagagttggggtaacacctatagtagaaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttg 42493537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 45041444 - 45041354
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  45041444 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatcc-aatatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagc 45041354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9905355 - 9904963
Alignment:
Q  83 atttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagta 182  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||   |||| |||||| | | |||||| |||| |||  ||||||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  9905355 atttaagttgaaaagaaaattttatcaagcaactgtcagatcaaagatgttgtatggtacatagtgttggacggttaataaccaacacgagaataaagtt 9905256  T
Q  183 agcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacc---- 278  Q
    ||  ||  ||| ||| ||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||| | |||| ||||||| |  | | ||| || |||||||||| |        
T  9905255 agtataacggagatgaggatgttgcattggatgtctagtaagaatagaaaggatataattatgaatgaccctgtcatagatagatggggtaacaacgtct 9905156  T
Q  279 --tatagtagaaaaaattataggaaa-taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaa 375  Q
      ||| |||||||| ||  ||  ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||   | |     
T  9905155 tttatggtagaaaagatagtaaaaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagta-aaaaaatagatcacgggaag 9905057  T
Q  376 gagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaata 469  Q
    |||||||||||       |||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| || |||| |||||    
T  9905056 gagagtcaaatcaaaagaggtagatgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaata 9904963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 488
Target Start/End: Original strand, 16917219 - 16917403
Alignment:
Q  303 taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagagga 402  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | | |||||||||||| || || ||||||||       |||||| ||    
T  16917219 taggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaatcactacaggtagaaga 16917317  T
Q  403 agatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatt 488  Q
    ||| ||| |||| || || | |||||||| | | ||||||||||| |||||||||| |||  |||||| || ||| ||||||||||    
T  16917318 agacctagaaaagctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt 16917403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 456
Target Start/End: Original strand, 24558558 - 24558671
Alignment:
Q  339 tgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaa 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||||||| | | ||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  24558558 tgtagattttgtagtaagaatagtagatcagatggaggatagtcaaatcaaa----gtagaggaagaccgagaaaaacaataagagaaattattaagaaa 24558653  T
Q  439 gatttagaggttaatgag 456  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24558654 gatttagagattaatgag 24558671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362687
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||   |||||| |||||| ||||||||||| | ||||    
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgta 35362704  T
Q  497 atttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  35362703 atttgatccatgcagcc 35362687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38328301 - 38328069
Alignment:
Q  58 gtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggt 157  Q
    |||||||||| |||| |||| || | ||||||||||| ||| || | ||||| ||||| || ||||| || ||| | || |  |  ||| ||||||  ||    
T  38328301 gtgttttatgtgatatgaaaataccgtttaagttgaagggaaaaatttatcgaacaacagtaagaccaacaatggtgtacgagatagagagttgggcagt 38328202  T
Q  158 taagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt 257  Q
     |||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||  |||| |||||| | |||||   ||||  ||||||  ||||    
T  38328201 aaagaaccaacacaaacataaagtaagtgtagtggagatgacgatgttacgttggatgtatggtgagactaaagaggatagaattagaaatgacgacatt 38328102  T
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38328101 agaaagagttggggtaacaactacagtagaaaa 38328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39967638 - 39967534
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||  | ||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  39967638 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatccatgta 39967539  T
Q  511 gccga 515  Q
    |||||    
T  39967538 gccga 39967534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41444479 - 41444371
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaa-gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgt 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  41444479 aaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgt 41444380  T
Q  510 agccgaacc 518  Q
    |||| ||||    
T  41444379 agccaaacc 41444371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 372
Target Start/End: Original strand, 42584415 - 42584475
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatg 372  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42584415 gtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatg 42584475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 290
Target Start/End: Original strand, 13986383 - 13986516
Alignment:
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt- 257  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||||   ||| | |||| |||||||| ||||     
T  13986383 aagaaccaacacgagaatcaggtaagcatagcggagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcatta 13986482  T
Q  258 -agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
     |||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13986483 aagagggatttggggtagcacctatagtacaaaa 13986516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26905096 - 26904954
Alignment:
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtta 459  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||       |||||||| ||| |||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||     
T  26905096 agtagatcaaatggaagagagtcagataaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttg 26904997  T
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||    
T  26904996 ga-ccaaatatagtttataataaaacactatgtcgtaatttgat 26904954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 38178471 - 38178352
Alignment:
Q  339 tgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaa 438  Q
    ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||       |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  38178471 tgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaacaaa 38178372  T
Q  439 gatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||  ||||  ||||||||||    
T  38178371 gacctagacattaatgagtt 38178352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 425 - 503
Target Start/End: Original strand, 42584516 - 42584594
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||| | ||||||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42584516 aaactataaggaaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42584594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 2216414 - 2216533
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||        
T  2216414 ggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaag-aagatttagagatcaatgagttggatcctaatat-gtttatgatagaacattatagt 2216511  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  2216512 gtaatttgatccatgtagccga 2216533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13172073 - 13171909
Alignment:
Q  128 gatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagact 227  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||  |   || ||| | ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  13172073 gatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacataaaaataaattaagcacatcagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagact 13171974  T
Q  228 agaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||  ||||  |||||  |||||||  |||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  13171973 agacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtagaaaa 13171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16994597 - 16994476
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||  | ||||  ||||||||||||| ||| || ||     
T  16994597 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaatgatttagagattattgagttggattgagatatgatgtataatagaacgttatgatgtt 16994498  T
Q  497 atttgatgcatgtagccgaacc 518  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  16994497 gtttggtacatgtagccgaacc 16994476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 28269827 - 28269720
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||| ||| ||| ||| ||||||    
T  28269827 gaagacctagaaaaattataagagaaactatta-gcaagatttagaggttaatgagttggatccaaatttaat-tatgatataacgttatgacataattt 28269730  T
Q  501 gatgcatgta 510  Q
    ||| ||||||    
T  28269729 gatccatgta 28269720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 10080144 - 10079999
Alignment:
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataa 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| | | ||||||||| ||| | | |||||||||       |||||||||||| ||| |     
T  10080144 tggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacctagag 10080045  T
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  10080044 aaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagtt 10079999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 512
Target Start/End: Original strand, 14903689 - 14903805
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 495  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||||   |||||||||||| | |||||  || ||| |||| |||||| | |||    
T  14903689 tagaggaagacctagaaaaactataagagagactattgggaaatatttagaaagtaatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgt 14903788  T
Q  496 aatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||||| ||||||||    
T  14903789 aatttgatccatgtagc 14903805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 518
Target Start/End: Original strand, 3802000 - 3802123
Alignment:
Q  395 gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacg 494  Q
    |||||||||||  || ||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||| || ||||| || |  |    
T  3802000 gtagaggaagacatacaaaaacaacaagagagactattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacactatggag 3802099  T
Q  495 taatttgatgcatgtagccgaacc 518  Q
    |||||||||  |||||| ||||||    
T  3802100 taatttgattaatgtagtcgaacc 3802123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15215526 - 15215447
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || | |||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||    
T  15215526 aaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccga 15215447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 290
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985541
Alignment:
Q  211 ggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||   ||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 25985541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 515
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700523
Alignment:
Q  260 agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaa-taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaa 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| | |||||  |||||||| |||| |||||| ||||    | |||  ||||||| | |    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatgg-aggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaagga 29700366  T
Q  359 tagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| ||       |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| || |||||| || ||| | |||||||     
T  29700367 gagtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtc 29700466  T
Q  459 agatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     || | |||| | || ||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  29700467 ggaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 29700523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 518
Target Start/End: Original strand, 36069753 - 36069852
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaacc 518  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| | |  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  36069753 taagggaaactattaacaaatatttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacc 36069852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 503
Target Start/End: Original strand, 4955344 - 4955426
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |||  ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4955344 agagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgat 4955426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25473532 - 25473438
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  25473532 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccga 25473438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25985884 - 25985767
Alignment:
Q  265 gttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtag 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || ||| || ||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||  |||  || |||||||| | | |||||    
T  25985884 gttggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactt-attggtttgtgcatttagagagaagacctgtgaattttgtagtaaggagagtag 25985786  T
Q  365 atcagatggaagagagtca 383  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  25985785 atcagatggaagggagtca 25985767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 42469855 - 42469765
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||    
T  42469855 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 42469765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 503
Target Start/End: Original strand, 2027656 - 2027765
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||| |||||||| || |||    
T  2027656 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaatatggtttatgatagaacactatgac 2027755  T
Q  494 gtaatttgat 503  Q
    |  |||||||    
T  2027756 gccatttgat 2027765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 458
Target Start/End: Original strand, 4011212 - 4011273
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  4011212 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagtt 4011273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16035858 - 16035765
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||| ||| | |||| |||| |||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16035858 taagagaaactgttaagaaatatctagagattacttagttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagc 16035765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17492058 - 17491993
Alignment:
Q  120 agaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagc 185  Q
    |||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17492058 agaccggcgatgttgtatgcaatggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaagtaagc 17491993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 25439282 - 25439391
Alignment:
Q  16 atcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaac 115  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||| ||| |||  ||  ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||  |||||    
T  25439282 atcgtatgcaagcaggatggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcacacaac 25439381  T
Q  116 ggtcagaccg 125  Q
     |||||||||    
T  25439382 agtcagaccg 25439391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 336
Target Start/End: Original strand, 33511282 - 33511424
Alignment:
Q  192 gaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaa 291  Q
    |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| |   ||| ||||||  ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33511282 gaaatgaggatgttgcgcttgatgtgtggtaagactatatgagatatgattagaaatgaaaatatt--agagagttggggtaacacctatggtagaaaaa 33511379  T
Q  292 attataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    || ||   |||||| |||  |||||||||| ||  ||||||||||    
T  33511380 atgatgaaaaatagacttaggtggtttgagtatacagagagaaga 33511424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39953672 - 39953591
Alignment:
Q  144 gagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaaga 225  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||  || ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  39953672 gagtgttgagcggtaaagaaccaacacgaacataaagttagcgtagcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaaga 39953591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 261 - 330
Target Start/End: Original strand, 44373769 - 44373838
Alignment:
Q  261 gagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagag 330  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44373769 gagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagag 44373838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 458
Target Start/End: Original strand, 13589476 - 13589669
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||||| ||  ||| ||||| | ||  ||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||    
T  13589476 agagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtacga 13589575  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||| | ||||| || | | ||         |||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  13589576 agagtagattatatggaggacaatgaa-------gaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatgagt 13589668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15174950 - 15174870
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgt-ataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15174950 aaagatttaaagattaatgagttagattcatatatgttgttatgataaaacattacgacgtaatttgattcaggtagccga 15174870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 458
Target Start/End: Original strand, 23023351 - 23023415
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||    
T  23023351 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagtt 23023415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 512
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716064
Alignment:
Q  440 atttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 31716064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 33827899 - 33827811
Alignment:
Q  408 tataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||| || |||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||    
T  33827899 tataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacgta 33827811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 511
Target Start/End: Original strand, 33076292 - 33076367
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | | |||||| || |||||||||| |||| || |||||||||| |||||||    
T  33076292 aaagatttagagattaatgagttgtaccaaaatatggtttataatagaatattatgatgtaatttgatccatgtag 33076367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 331
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  260 agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagaga 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| || ||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41972072 - 41971942
Alignment:
Q  255 attagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagta 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  | | ||||| | ||  ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| || ||| |    
T  41972072 attagagagagttagggtaacaccta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagacgtgtagattttctagca 41971974  T
Q  355 cgaatagtagatcagatggaagagagtcaaat 386  Q
     | | |||||||||| |||| || ||||||||    
T  41971973 aggagagtagatcaggtggacgatagtcaaat 41971942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Original strand, 21121299 - 21121392
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||  || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  21121299 agagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccga 21121392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30783433 - 30783293
Alignment:
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt- 257  Q
    |||||||||||||| |||  | |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||     
T  30783433 aagaaccaacacgataatagaataagtgtagtggagatgaggatcttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacatta 30783334  T
Q  258 ------agagagagttggggtaac-acctatagtagaaaaa 291  Q
          ||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  30783333 gaggggagagagagttgggatagcaacctatagtagaaaaa 30783293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Original strand, 5908516 - 5908664
Alignment:
Q  144 gagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgatta 243  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| | |||||| || ||| || |||||| ||| || || ||| ||||||| ||   |||||||||  ||||  |||||    
T  5908516 gagtgttgactggtaaagaaccaataagaaaataaaataaacgcagtggagatgaggctgctgccttggatgtgtttcaagactagacgggataagatta 5908615  T
Q  244 agaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
      ||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5908616 gaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaaa 5908664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Original strand, 8932679 - 8932724
Alignment:
Q  245 gaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  8932679 gaatgacaccattagagagagtgggggtagcacatacagtagaaaa 8932724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 368
Target Start/End: Original strand, 11733790 - 11733847
Alignment:
Q  311 agtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatca 368  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  11733790 agtggtttgatcttgttgagagaagatttgtagatgttgtagtaaggagagtagatca 11733847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 455
Target Start/End: Original strand, 13986619 - 13986680
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatga 455  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13986619 ggtagagcaagacctagaaaaactatactagaaattattatgaaagatttagtggttaatga 13986680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 103
Target Start/End: Original strand, 16916974 - 16917019
Alignment:
Q  58 gtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataatt 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16916974 gtgttttatgtgatatgaaagtaccacttaagttgaaaggataatt 16917019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Original strand, 25300270 - 25300343
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||| || ||| |||||||||  |||||||    
T  25300270 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagc 25300343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Original strand, 36069572 - 36069641
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttg 268  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  36069572 ggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagagagttg 36069641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37256142 - 37256081
Alignment:
Q  125 gacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcg 186  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  37256142 gacgatgttgtatggtacagagtgttgagtagttaaaaacgaacaagaaaatcaagtaagcg 37256081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 503
Target Start/End: Original strand, 37768461 - 37768514
Alignment:
Q  450 taatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37768461 taatgagttttatccaaatataatttataatagaatattatgacgtaatttgat 37768514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 458
Target Start/End: Original strand, 39388908 - 39388973
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaa-gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  39388908 ggtagaggaggacctagaaaaactataaagagaaactattaggaaagatctagagattaatgagtt 39388973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 515
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529472
Alignment:
Q  438 agatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || | | | ||||||| |||||||||||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccga 44529472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 479 - 515
Target Start/End: Original strand, 24558694 - 24558730
Alignment:
Q  479 atagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24558694 atagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccga 24558730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 95)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 515
Target Start/End: Original strand, 3865817 - 3866319
Alignment:
Q  15 tatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaa 114  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3865817 tatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaa 3865916  T
Q  115 cggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggat 214  Q
    | |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || |||  |||||||||||||||    
T  3865917 cagtcagaccgacgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggat 3866016  T
Q  215 gagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttag 312  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |  ||| ||||||||||       
T  3866017 gagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttaga 3866116  T
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataa 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||       |||||||||| | |||  |    
T  3866117 tggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagaggaaaacctagga 3866216  T
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||    
T  3866217 aaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 3866316  T
Q  513 cga 515  Q
    |||    
T  3866317 cga 3866319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 8180534 - 8181027
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  8180534 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagagttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtcagac 8180633  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |  || |||| |||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8180634 cagcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaa 8180733  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||   ||||||| |    
T  8180734 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggg 8180833  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       ||||||||||||  ||  |||||| | |    
T  8180834 catgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactatta 8180933  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || |||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||    || ||||||| |||||||||||    
T  8180934 gataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccga 8181027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 41763557 - 41763209
Alignment:
Q  36 ttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttat 135  Q
    |||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||| | |||||||| | |||  |||||||| | ||||| |    
T  41763557 ttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctaaaaggaaagttctatcgaagaacaatcagaccggcaatgttgt 41763458  T
Q  136 atgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaagga 235  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  41763457 atggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaaga 41763358  T
Q  236 tgtgattaagaatgacaccattagagagag-ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaa 334  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||    
T  41763357 taggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaa 41763258  T
Q  335 gagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    ||  ||||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  41763257 gacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtca 41763209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3244179 - 3243688
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  3244179 caagctgggtggtagaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttatgttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 3244080  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || ||||  ||| |||||||||||||   |||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  3244079 cggcgttgttgaatggtacggagtgttggacagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaa 3243980  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||| | | |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  | || | ||||||||||   ||||||| | |    
T  3243979 gactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaa 3243880  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||||||||||   |||||||  || ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |       || ||||||||| |||  |||||| | |||    
T  3243879 tgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattaga 3243780  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| || ||||||||    
T  3243779 gaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccaggtagccga 3243688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 2610282 - 2610523
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  2610282 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttatgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagac 2610381  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     | || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2610382 tggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaa 2610481  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag 265  Q
    ||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2610482 gactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagag 2610523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11992634 - 11992146
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  11992634 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtctgac 11992535  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || | ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11992534 cggcaatgttgtatggtacggagtgatgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaa 11992435  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
     |||||| | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||   |||||||  ||    
T  11992434 tactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggaca 11992335  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    | |||||||||||   |||||||  || ||  ||| ||| ||||| ||||| |||||||   |       |||| ||||||| |||  |||||  | ||     
T  11992334 tatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagg 11992235  T
Q  424 gaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||  ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | | ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  11992234 gaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagc 11992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 511
Target Start/End: Original strand, 12734499 - 12734943
Alignment:
Q  63 ttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaaga 162  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| |||  ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||    
T  12734499 ttatgcgacaagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcg-acaacagtcaaaccatcgatgttgtatggtacagagtgttgggcggtttaga 12734597  T
Q  163 accaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagaga 262  Q
     |||||| || ||||||||    |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  12734598 gccaacatgagaatcaagt----gtagtggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagaga 12734693  T
Q  263 gagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagt 362  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||| ||||||||   |||||||  || ||| ||| |||    
T  12734694 gagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagt 12734793  T
Q  363 agatcagatggaagagagtca-aatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttaga 461  Q
    |||||| ||||| ||||||||   |       |||||||| ||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  12734794 agatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 12734893  T
Q  462 tccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| || |  |||||||||| |||||||    
T  12734894 tccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtag 12734943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 4807346 - 4807842
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  4807346 caagatgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 4807445  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| ||||  || |||||||| | ||||||||  ||||| || ||| ||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4807446 cgacgttgttgtatgacacagagtgttgagcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaa 4807545  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt------agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtt 317  Q
    || |||| | |||  ||||| |||||||| ||||      ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  || |||||||||||   | |||    
T  4807546 gaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggta-gaaataggcttagatagtt 4807644  T
Q  318 tgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaact 417  Q
    |  |||| ||||||||||| | |||||||| || ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||| |       |||||| ||||| |||  ||||||    
T  4807645 tcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaact 4807744  T
Q  418 ttaagagaaactattatgaaag-atttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||   |||||  |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  4807745 attagagaaaccatta-gaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 4807842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41197756 - 41197266
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  41197756 caagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacaacagtcagac 41197657  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |  | ||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  41197656 cagcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaa 41197557  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||      
T  41197556 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgga 41197457  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca-aatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaacttta 420  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||   |       ||||||| |||| |||  |||||  |     
T  41197456 catgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatt 41197357  T
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | | ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  41197356 tgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtag 41197266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 515
Target Start/End: Original strand, 36183266 - 36183698
Alignment:
Q  85 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  36183266 ttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaag 36183365  T
Q  185 cgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctata 282  Q
     ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  36183366 tgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctata 36183465  T
Q  283 gtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtc 382  Q
    ||||||||  |  ||| |||||  |||   ||||||  ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  36183466 gtagaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtc 36183565  T
Q  383 aaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatag 482  Q
    || |       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || |||||||| || |||||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  36183566 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatag 36183665  T
Q  483 aacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| || |  |  ||||||| |||||||||||    
T  36183666 aacactatggtgccatttgatccatgtagccga 36183698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45368161 - 45367660
Alignment:
Q  15 tatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaa 114  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  45368161 tatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttttatcggacaa 45368062  T
Q  115 cggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggat 214  Q
    | ||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||| | |||||| ||||||||| | | |||||||  ||  ||| |||  ||||||||| |||||    
T  45368061 cagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcgattaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgctggat 45367962  T
Q  215 gagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagt-tggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagt 313  Q
    || ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||||  |||   |    
T  45367961 gaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataaccttagat 45367862  T
Q  314 ggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaaga-tctataa 412  Q
    ||||||  |||||||||||||||   |||||||  || ||  |||  |||||||| ||||| ||||||| | |       |||||||||||| || | ||    
T  45367861 ggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagactcaagaa 45367762  T
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    || | || |||||||  ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | | | |||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||    
T  45367761 aaccatt-agagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgc 45367663  T
Q  513 cga 515  Q
    |||    
T  45367662 cga 45367660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 515
Target Start/End: Original strand, 38429707 - 38430131
Alignment:
Q  93 aaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtgg 192  Q
    |||||| | ||||||| |||| | |||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  |||||| |||| ||    
T  38429707 aaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtagagtaagtgtagcgg 38429806  T
Q  193 aaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  38429807 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaa 38429906  T
Q  291 aattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnn 390  Q
      |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||| ||||||||   ||| |||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |        
T  38429907 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 38430006  T
Q  391 nnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattac 490  Q
        ||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| ||     
T  38430007 agaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 38430106  T
Q  491 gacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||    
T  38430107 ggcgtcatttgatccatgtagccga 38430131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 452150 - 451944
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  452150 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 452051  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  452050 cgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaa 451951  T
Q  224 gactaga 230  Q
    |||||||    
T  451950 gactaga 451944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 547
Target Start/End: Original strand, 13149067 - 13149612
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||| || | ||||| |||||| |||| ||| |||||||   ||| |    
T  13149067 caagttggatggttgaaatgaagaagagcttcaggtgtttcatatgataagaaagtaccactcaagttaaaaggaaaattatattggacaacaaccaggc 13149166  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
      |||||||| || | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   || ||| || ||||| ||||||  ||||||||    
T  13149167 taacgatgttgtacggtacagagtgtcaggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagcaagtgtaacagagatgagggtgttgtgttggacaagtggtaa 13149266  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--------------------agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaat 303  Q
    ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||                    |||| ||||||||||| ||||||||   ||||| || |||| ||||    
T  13149267 gactaaaagggataagattaggaatgacaccatttgagagagagagagagagagagagtgagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaat 13149366  T
Q  304 aggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaat-nnnnnnnggtagagga 402  Q
    || |||  ||||| ||  |||||||||||||||  |||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||||| || ||||| ||        | |||||||    
T  13149367 agacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctcgaagagtagataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagagga 13149466  T
Q  403 agatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttga 502  Q
    |||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||  || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  13149467 agacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttga 13149566  T
Q  503 tgcatgtagccgaac-catttaataagataacacttggttattgtt 547  Q
    | ||| ||||||| | || ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  13149567 tccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9556734 - 9556404
Alignment:
Q  186 gtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga--gttggggtaacacctatag 283  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  9556734 gtagtggagttgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatag 9556635  T
Q  284 tagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    |||||||| |  | | ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||   ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||| || |||||    
T  9556634 tagaaaaa-tggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtca 9556536  T
Q  384 aatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataataga 483  Q
    ||        || | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||| | |||| || ||| |||||    
T  9556535 aactactagaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgataga 9556436  T
Q  484 acattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  9556435 acattagggtgtaatttgatacatgtagccga 9556404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6238281 - 6238051
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||||| ||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||    
T  6238281 caagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgtgataaaaaa-taccacttaagttgaaaagaaaattctatcggacaacagttagac 6238183  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||  | || | |  || |||||||||| |||||||| |||||    
T  6238182 tgacgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacacgagaatcaaataattgcagcgaatgtgaggatgttgcgctggatgagcggtaa 6238083  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacacca 255  Q
    ||||||| | |||   |||| |||||||||||    
T  6238082 gactagacatgatagaattaggaatgacacca 6238051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610835
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| || ||| ||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||    
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||| ||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccga 2610835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 262
Target Start/End: Original strand, 23997405 - 23997609
Alignment:
Q  58 gtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggt 157  Q
    ||||||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||  ||    
T  23997405 gtgttttgtgcgatgagaaaataccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtaagaccgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcagt 23997504  T
Q  158 taagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt 257  Q
    |||||  |||||||| |  |||||||| |||  ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||    
T  23997505 taagagtcaacacgagagccaagtaagtgtaacggagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccatt 23997604  T
Q  258 agaga 262  Q
    |||||    
T  23997605 agaga 23997609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 515
Target Start/End: Original strand, 38434867 - 38435199
Alignment:
Q  186 gtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatag 283  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||   ||   |||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  38434867 gtagcggagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatag 38434966  T
Q  284 tagaaaaaattataggaaataggctttag-tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtc 382  Q
    ||||||| ||  | | || ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| | | ||||||||| ||||| || ||||    
T  38434967 tagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtc 38435066  T
Q  383 aaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatag 482  Q
    | ||       || ||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||| | || ||| || |    
T  38435067 agatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattg 38435166  T
Q  483 aacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  38435167 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 38435199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Original strand, 30743389 - 30743583
Alignment:
Q  36 ttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttat 135  Q
    |||||||  ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| | || || |||| | ||||||||||||||||||| |    
T  30743389 ttgaaattgagaagagcctcatgtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttaccggatagcggtcagaccgacgatgttgt 30743488  T
Q  136 atgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||| ||||||| ||| || | |||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  30743489 atggtacggagagttaggcgattaaaagccaacacgagaatcaagtaagtgttgtggagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactaga 30743583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18424728 - 18424417
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatag 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||  |  |||    
T  18424728 ggatgttacgtcggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtag 18424629  T
Q  299 gaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtag 398  Q
     ||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||   |||||||  |  ||| ||| | |||||||  |||| ||||||||  |       |||||    
T  18424628 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtag 18424529  T
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    |||||||  ||  |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||| ||||| || ||| |||||||| || ||||| ||    
T  18424528 aggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcat 18424429  T
Q  499 ttgatgcatgta 510  Q
    ||||| ||||||    
T  18424428 ttgatccatgta 18424417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38453042 - 38452721
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt------agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |||||||||||||      ||||||||| |||||| || |||||||||||||      
T  38453042 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagt 38452943  T
Q  293 ttataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnn 392  Q
    |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| | ||||||| ||||| || |||||| |          
T  38452942 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaag 38452844  T
Q  393 nggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacga 492  Q
     |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || |     
T  38452843 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacactatgg 38452744  T
Q  493 cgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     || ||| ||| |||||||||||    
T  38452743 tgtcattcgatccatgtagccga 38452721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 489
Target Start/End: Original strand, 12141539 - 12141765
Alignment:
Q  263 gagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagt 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||  | ||||| | | |||    
T  12141539 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagt 12141638  T
Q  363 agatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagat 462  Q
    ||||||||| || || ||||||||       |||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||    
T  12141639 agatcagattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggat 12141738  T
Q  463 ccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||    
T  12141739 ccaaatatggtatatgatagaacatta 12141765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Original strand, 9496017 - 9496111
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  9496017 taagagaaactattcagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 9496111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19337260 - 19337114
Alignment:
Q  141 acggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac-tagaaaggatgtg 239  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||  |    
T  19337260 acggagtgttggcgagttaagaatcaacacgagaataaaataagcgtagtggagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggatagg 19337161  T
Q  240 attaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtag 286  Q
    ||||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19337160 attataaatgagaacattagagagagttggggtagcacctatagtag 19337114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43751982
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||  | |||||  ||||||| |     
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtaggg 43752140  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||||||||| || | ||| ||       || | ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  43752139 agagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 43752040  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | || | ||| || |||||| |||||||| || |  |||||||||| ||||| |||||    
T  43752039 tggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccga 43751982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12882197 - 12882082
Alignment:
Q  398 gaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaa 497  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||  | |||||    
T  12882197 gaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaa 12882098  T
Q  498 tttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||||| |||||||||    
T  12882097 tttgatccatgtagcc 12882082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 451898 - 451683
Alignment:
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |       ||||||    
T  451898 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtaga 451799  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    |||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | ||| |||    
T  451798 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatt 451699  T
Q  500 tgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| |||||||||||    
T  451698 tgatccatgtagccga 451683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 264 - 512
Target Start/End: Original strand, 18958903 - 18959155
Alignment:
Q  264 agttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttga----gcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaat 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  | | ||||||||||  ||||||||     ||||| ||||||||||  || || | |||||||| | |     
T  18958903 agttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggag 18959002  T
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtta 459  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||       || ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||     
T  18959003 agtagatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttg 18959102  T
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||| |||||| || ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  18959103 gatcaaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagc 18959155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 396 - 513
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287666
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 495  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| |    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  496 aatttgatgcatgtagcc 513  Q
    | |||||| | |||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagcc 33287666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45543228 - 45543108
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | |    
T  45543228 ggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagagg-taatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacattatggc 45543130  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||| ||||||  ||||||||||    
T  45543129 gtactttgatctatgtagccga 45543108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16097387 - 16097275
Alignment:
Q  155 ggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacacc 254  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||    
T  16097387 ggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacacc 16097288  T
Q  255 attagagagagtt 267  Q
     ||||||||||||    
T  16097287 gttagagagagtt 16097275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7326397 - 7326197
Alignment:
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataa 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||| |       ||||||||||||  ||  |    
T  7326397 tggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacatagga 7326298  T
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||    
T  7326297 aaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 7326198  T
Q  513 c 513  Q
    |    
T  7326197 c 7326197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38453148 - 38453059
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggaca 113  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38453148 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggaca 38453059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24584039 - 24583904
Alignment:
Q  119 cagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagt 218  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  || |||  ||||||| |  ||||||||    
T  24584039 cagaccgacgatgttgtatggtacaaaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaagatgttgtgcgggatgagt 24583940  T
Q  219 ggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacacc 254  Q
    |||||||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  24583939 ggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19337020 - 19336930
Alignment:
Q  423 agaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19337020 agaaactataaagaaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 19336930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Original strand, 25834671 - 25834925
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||  ||| ||||  || ||| ||    
T  25834671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaaga 25834770  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||| ||||| |||  | |  |       |||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||  || ||||||||||| |||||||    
T  25834771 agagtagatcaaatggaggag--ttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactttaa-agaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 25834867  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||    
T  25834868 tggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccga 25834925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 26670894 - 26671015
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||  | ||| |||||| || | |      
T  26670894 ggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataatggt 26670993  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  26670994 gtaatttgatccatgtagccga 26671015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43573285 - 43573165
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| || |||| ||| | |    
T  43573285 ggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatggc 43573187  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  43573186 gtaatttgatccatgtagccga 43573165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4682325 - 4682257
Alignment:
Q  402 aagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4682325 aagatctagaaaaactataagagaaattttcatgaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatat 4682257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 408 - 500
Target Start/End: Original strand, 37282231 - 37282323
Alignment:
Q  408 tataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  37282231 tataaaaactataagagaaactattacgaaagatttagctattagtgagttggattcaaatgtagtttataatagaacattattacgtaattt 37282323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 37470356 - 37470171
Alignment:
Q  327 agagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaa 426  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| || | | ||||||| |||||||||  ||||| ||       |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  37470356 agagagaagacttgtagattatgtattaaggagagtagattagatggaaggtagtcagatcactagtggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaa 37470257  T
Q  427 actattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||| |||||| |  ||| ||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||    
T  37470256 actattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggtgtagtttgatccatgtagc 37470171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 345
Target Start/End: Original strand, 7825266 - 7825437
Alignment:
Q  178 aagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga----gttggggta 273  Q
    ||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| ||||||||||    ||||| |||    
T  7825266 aagtaagcgtagcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagta 7825365  T
Q  274 acacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagat 345  Q
     |||||||||| | ||| ||  |   ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7825366 gcacctatagttgtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagat 7825437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 42092449 - 42092623
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||   |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||  |||     
T  42092449 gatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttagagagagttggggtagcgcctatactagaaaagatggtaga 42092548  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    || || | ||  ||| | || |||||||||||||||  |||||||| |||||||| | | ||||||| |||||||    
T  42092549 aactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatgga 42092623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35755402 - 35755280
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggt----taatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacga 492  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    ||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  |     
T  35755402 agaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgc 35755303  T
Q  493 cgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  35755302 cgtaatttgatccatgcagccga 35755280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9579053 - 9578917
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||   ||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||       
T  9579053 gatgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgacaatgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgta 9578954  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  9578953 aaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaaga 9578917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 515
Target Start/End: Original strand, 28508805 - 28508925
Alignment:
Q  395 gtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacg 494  Q
    ||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || | ||    
T  28508805 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcg 28508904  T
Q  495 taatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  28508905 tcatttgatccatgtagccga 28508925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 412 - 512
Target Start/End: Original strand, 31959665 - 31959765
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | | ||||||||| |||||||    
T  31959665 aaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtag 31959764  T
Q  512 c 512  Q
    |    
T  31959765 c 31959765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 383
Target Start/End: Original strand, 32443692 - 32443780
Alignment:
Q  295 ataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||    
T  32443692 atagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataagatggaggatagtca 32443780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 513
Target Start/End: Original strand, 45436971 - 45437087
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| || | | |||||||||||||  |||    
T  45436971 agaggaagacctataaaaattataagagaatctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatccaaatatggtatttgatagaacattacggtgta 45437070  T
Q  497 atttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||||||  ||||||||    
T  45437071 atttgatctatgtagcc 45437087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23714651 - 23714425
Alignment:
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||  || ||  | |||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||| ||||||  |||||    
T  23714651 aagaaccaacacgaaaataaattaagcatagcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacatta 23714552  T
Q  259 gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaa 358  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  | | || ||| |||  || ||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||| | |    
T  23714551 gatagagtt-gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaagga 23714453  T
Q  359 tagtagatcagatggaagagagtcaaat 386  Q
     ||||||||| ||||  | |||||||||    
T  23714452 gagtagatcaaatggtggggagtcaaat 23714425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24102323 - 24102097
Alignment:
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||  || ||  | |||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||| ||||||  |||||    
T  24102323 aagaaccaacacgaaaataaattaagcatagcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacatta 24102224  T
Q  259 gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaa 358  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  | | || ||| |||  || ||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||| | |    
T  24102223 gatagagtt-gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaagga 24102125  T
Q  359 tagtagatcagatggaagagagtcaaat 386  Q
     ||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24102124 gagtagatcaaatggtggggagtcaaat 24102097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Original strand, 33504366 - 33504471
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagag-gttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgt 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||| |||  |||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  33504366 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatct 33504465  T
Q  510 agccga 515  Q
    ||||||    
T  33504466 agccga 33504471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Original strand, 35643074 - 35643195
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    ||||||| |||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || |||    
T  35643074 ggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgac 35643173  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
     | |||| || |||||||||||    
T  35643174 atcatttaatacatgtagccga 35643195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Original strand, 39029735 - 39029824
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  39029735 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtag 39029824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227436
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 227436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 7292864 - 7292948
Alignment:
Q  146 gtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  7292864 gtgttgggtggtgaagaaccaacatgaacataaaataagcgtagtagaaataagaatgttgtgttggatgagttgtatgactaga 7292948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 512
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||| | ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4598934 - 4598758
Alignment:
Q  182 aagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt----agagagagttggggtaacac 277  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||   ||| | ||||||  ||||    |||||||||||||||| |||    
T  4598934 aagcgtagcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcac 4598835  T
Q  278 ctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagta 354  Q
    ||||||||| ||| ||  ||| || ||| |||| ||||||||  ||| |||| |||||| ||||  || ||||||||    
T  4598834 ctatagtagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgtgaattttgtagta 4598758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19235174 - 19235046
Alignment:
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtta 459  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||       | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||     
T  19235174 agtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaagatctagagattaatgatttg 19235075  T
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaacatt 488  Q
    |||  |||||| || | | ||||||||||    
T  19235074 gatagaaatatggtatttgatagaacatt 19235046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 188
Target Start/End: Original strand, 32443473 - 32443532
Alignment:
Q  129 atgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgta 188  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  32443473 atgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaatcaacacgagaatcaagtaaacgta 32443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 37481909 - 37481709
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||  | | |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |     
T  37481909 agagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtgaattttgtagttagg 37481810  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | ||||||||||||||| | |||| | ||       |||||| ||||| | | ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||    
T  37481809 agagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaagaaagatctagcgataaatgagt 37481710  T
Q  458 t 458  Q
    |    
T  37481709 t 37481709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 425 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37529609 - 37529554
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataat 480  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  37529609 aaactattataaaagatttaaaggttaataagtttgatccaaatatagtttataat 37529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 43832227 - 43832342
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||    ||||  ||||| ||||||||||| ||||      
T  43832227 agaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggataaggatatgatgtattatagaacattatgacggc 43832326  T
Q  497 atttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||| ||||||||    
T  43832327 atttgatccatgtagc 43832342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24583908 - 24583798
Alignment:
Q  274 acacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgg 373  Q
    ||||||||| |||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  24583908 acacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgg 24583809  T
Q  374 aagagagtcaa 384  Q
    | |||||||||    
T  24583808 aggagagtcaa 24583798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 26784575 - 26784432
Alignment:
Q  315 gtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaa 414  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| | |  |||||| ||||||| |  ||||||||       || |||| |||| ||| ||||    
T  26784575 gtttgtgcatttagagagaagatatgtggattttgtagtaaggagggtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggcagagaaagacctagaaaa 26784476  T
Q  415 actttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  26784475 actataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagtt 26784432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 11412711 - 11412825
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | ||||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||  |||||||  |||||||       
T  11412711 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtagattctgtagta--g 11412808  T
Q  358 atagtagatcagatgga 374  Q
    | |||||||||||||||    
T  11412809 agagtagatcagatgga 11412825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 425 - 517
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412959
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatag---aacattacgacgtaatttgatgcatgtagccgaac 517  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaac 11412959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 425 - 515
Target Start/End: Original strand, 45077884 - 45077976
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaat--gagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| | | | ||||||||| |||||| ||||    
T  45077884 aaactattaagaaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccga 45077976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Original strand, 1626346 - 1626442
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||  ||||||  | |||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||    
T  1626346 taagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttgtataaaaatatgatatataatagaacattgcaacgttgtttgatccatgtggccga 1626442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 290
Target Start/End: Original strand, 7615283 - 7615319
Alignment:
Q  254 cattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7615283 cattagagagacttggggtaacacctatagtagaaaa 7615319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 42149791 - 42149707
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| | |||  |||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  42149791 taagagaaactattaagaaagatctagagattattgagctggatagaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgat 42149707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 513
Target Start/End: Original strand, 6219127 - 6219210
Alignment:
Q  430 attatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  6219127 attaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcc 6219210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9996764 - 9996661
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| ||  |||| || | | ||||||||| |||||||    
T  9996764 aaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtag 9996665  T
Q  512 ccga 515  Q
    ||||    
T  9996664 ccga 9996661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 503
Target Start/End: Original strand, 11744566 - 11744758
Alignment:
Q  311 agtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctat 410  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||    ||| |||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||  ||       |||| |||||||  ||     
T  11744566 agtggtttgagcatgcatagaaaagaccgataggtgttgtagtacgaagagtagaccagcaggaggagagtcggatcaaaagcggtataggaagacatag 11744665  T
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  || ||| |||| | ||| || |||||||| || ||||||||||    
T  11744666 aaaaactataaaaaaaactattatgaaaaatttaaaggttaatgaattgaattcaattataatttatgatcgaacattatgatgtaatttgat 11744758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 515
Target Start/End: Original strand, 32443812 - 32443883
Alignment:
Q  444 agaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  32443812 agaggttaacgagtttgattcaaatatagtttataacaaaacattatggcataatttgatccatgtagccga 32443883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 220
Target Start/End: Original strand, 36039049 - 36039173
Alignment:
Q  100 aattctatcggacaacggtcagaccgacgatgtt----atatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaa 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    ||||| |||  ||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| |||||  || |    
T  36039049 aattctatcggacaactgtcagattgacgatgttgtatatatggtacaaagtgttgggtggttaagaaactaaacgagaataaagtaatcgtagcagaga 36039148  T
Q  196 tgcggatgttgcgttggatgagtgg 220  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||    
T  36039149 tgaagatgttgtgttggatgtgtgg 36039173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 503
Target Start/End: Original strand, 36616856 - 36616923
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  36616856 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataatgtaatttgat 36616923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 216
Target Start/End: Original strand, 37281962 - 37282053
Alignment:
Q  125 gacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatga 216  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  37281962 gacgatgttgtatgatacagagtgttaagcggttaagaatcaatacgagaatcaagtaagtatagttgagatgaggatgttgtgttggatga 37282053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 45077799 - 45077870
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| || |||||    
T  45077799 gtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtca 45077870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 489
Target Start/End: Original strand, 2377204 - 2377274
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  2377204 taagataaactattaaaaaagatttagagaataatgagttggatccaactatggtatatgatagaacatta 2377274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12026252 - 12026182
Alignment:
Q  303 taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgg 373  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| || | | ||||||||||||||    
T  12026252 taggcttaggtggtttgaccatgtagagagaagacctgtagattttgtactaaggagagtagatcagatgg 12026182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 334
Target Start/End: Original strand, 41330121 - 41330195
Alignment:
Q  260 agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaa 334  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  41330121 agagagttgaggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 452
Target Start/End: Original strand, 8491270 - 8491303
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaa 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8491270 taagagaaactattaagaaagatttagaggttaa 8491303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29548790 - 29548733
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatg 454  Q
    ||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29548790 agaggaagacctgaaaaaactataagagaaattattaagaaagatttagagattaatg 29548733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 511
Target Start/End: Original strand, 31415552 - 31415605
Alignment:
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  31415552 tagaaccaaatatggtttataatagaacattatgacgtagtttgattcatgtag 31415605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 345
Target Start/End: Original strand, 907725 - 907757
Alignment:
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagat 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  907725 tggtttgggcatgtagagagaagagttgtagat 907757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6237909 - 6237817
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaaca 486  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||  |||| |||| ||||  || ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  6237909 ggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaaca 6237817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 441 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394667
Alignment:
Q  441 tttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||| | | |||||| || |||||||||    
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagcc 9394667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 418 - 470
Target Start/End: Original strand, 12443134 - 12443186
Alignment:
Q  418 ttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatat 470  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  12443134 ttaagagaaactattaagatatatttagagattaatgagttggatcgaaatat 12443186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 547
Target Start/End: Original strand, 23997770 - 23997882
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga-accatttaataagataaca 534  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | ||| |||| || | ||| ||||||| |||||| ||||  ||| ||| | |||||| |    
T  23997770 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccacttattcagataaga 23997869  T
Q  535 cttggttattgtt 547  Q
    |||| ||||||||    
T  23997870 cttgattattgtt 23997882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Original strand, 30306203 - 30306279
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  30306203 gatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 30306279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 291
Target Start/End: Original strand, 32402638 - 32402670
Alignment:
Q  259 gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaa 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32402638 gagagagttgggataacacctatagtagaaaaa 32402670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 37452379 - 37452287
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||   |||||| || ||| |||||||||||    
T  37452379 agaggaagacctagaaaaattataagaggagctattaagaaagaattagagattaatgagttggacagaaatatggtttatgatagaacatta 37452287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 41545375 - 41545474
Alignment:
Q  239 gattaagaatgacaccatta--gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaatt-ataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaag 335  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||| || ||||| ||  ||| ||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  41545375 gattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaagaag 41545474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 31222 - 31715
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||| | |||||||    
T  31222 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagac 31321  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31322 cggcggtgttgtacggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaa 31421  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  31422 gactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 31521  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||   | ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |        ||||||||||| | |  |||||| | |    
T  31522 catgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactatta 31621  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |  || || ||||||| |||||||||||    
T  31622 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttgatccatgtagccga 31715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44262 - 44082
Alignment:
Q  161 gaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgac-----acca 255  Q
    |||| ||||||| ||| || |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||   ||||| ||||||     || |    
T  44262 gaacaaacacgagaataaaataagcgcagcggagatgaggatgttgcgttggatgtgcggtaagactagatggtatagtattaaaaatgacaattgacaa 44163  T
Q  256 ttagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    |   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  44162 tattagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 44082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 178568 - 178512
Alignment:
Q  402 aagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  178568 aagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagtt 178512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 52138554 - 52139047
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||| |||| || |||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||    
T  52138554 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtcttgtgcgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgac 52138653  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52138654 cggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaagatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 52138753  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  52138754 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 52138853  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||| | ||||| | ||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  52138854 catgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 52138953  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  52138954 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttatttgatccatgtagccga 52139047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 28245191 - 28245684
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  |||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  28245191 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagttgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 28245290  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| || | |||||||||||||| |||||| |  ||||| || ||| ||||||| ||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28245291 cggcgttgttgtacggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 28245390  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||   ||||  ||||| |||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||||| |||   ||||||| |    
T  28245391 gactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttggg 28245490  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    ||||||||||||| |   |||||||  || ||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||| |       |||||| ||||| |||  |||||| | |    
T  28245491 catgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactatta 28245590  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  28245591 gagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 28245684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 51448246 - 51447753
Alignment:
Q  15 tatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaa 114  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||||     
T  51448246 tatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggacag 51448147  T
Q  115 cggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggat 214  Q
    | ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||  ||||| || |||||| |||| ||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  51448146 cagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaacatgagaatcaactaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggat 51448047  T
Q  215 gagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag-ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagt 313  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |    
T  51448046 gagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 51447947  T
Q  314 ggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaa 413  Q
     ||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |          ||| ||||| |||  ||    
T  51447946 agtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaa------aga-gaagacctaggaa 51447854  T
Q  414 aactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||    
T  51447853 aactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagcc 51447754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 511
Target Start/End: Original strand, 54128272 - 54128622
Alignment:
Q  164 ccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagag 263  Q
    |||||| || |||||||||||| |||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  54128272 ccaacatgagaatcaagtaagcttagcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagag 54128371  T
Q  264 agt--tggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatag 361  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| | ||    
T  54128372 agtgttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagag 54128471  T
Q  362 tagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaact-ttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttag 460  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||       |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |    
T  54128472 tagatcagatggaggttagtcagatcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttgg 54128571  T
Q  461 atccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    | |||||||| || ||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  54128572 acccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtag 54128622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 515
Target Start/End: Original strand, 5168607 - 5169079
Alignment:
Q  49 gagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtg 148  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  5168607 gagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtg 5168706  T
Q  149 ttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaat 248  Q
     |||| |||||||| |||||| || | | ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||  ||||| ||||    
T  5168707 ctgggcggttaagagccaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaat 5168806  T
Q  249 gacaccatt------agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgta 342  Q
    |||||||||      ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |  ||| ||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||   |||    
T  5168807 gacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgta 5168906  T
Q  343 gatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatt 442  Q
    ||||  || ||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| | |       |||||||||||| |||  |||||  | |||||||| ||||  || ||||    
T  5168907 gatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatt 5169006  T
Q  443 tagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  5169007 tataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 5169079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 425
Target Start/End: Original strand, 27917326 - 27917727
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||| | ||||||  ||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| | | |||||||||| ||| | |||| ||    
T  27917326 caagttgggtagctgaaatagagaagagcctcatgtgttttatgtgataaaaaagtaccacttaagttgaatgaaaaattctatcgaacatcagtcacac 27917425  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || ||||||| |||| |||  |||| || |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27917426 cggcgatgttgtatggtacaaagtgatgtgcagttaagaaccaaaacgagaatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaa 27917525  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    | |||||   ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||   |||||||  ||    
T  27917526 gcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggaca 27917625  T
Q  324 tgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaaga 423  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||  || | ||||||| ||||| || | ||| ||       |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27917626 tgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcagatcataataggtagacgaagacctataaaaactataaga 27917725  T
Q  424 ga 425  Q
    ||    
T  27917726 ga 27917727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 468
Target Start/End: Original strand, 26490139 - 26490515
Alignment:
Q  93 aaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttat--atgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagt 190  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| || | | ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||     
T  26490139 aaaggaaaattatatcggacaacagtcagaccggcgatgttgtgtatggtaagta-tgttgggcggttaagaaccaacaagagaatcaagtaagtgtagc 26490237  T
Q  191 ggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26490238 ggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagagttgaggtagcacctatagtagaaaa 26490337  T
Q  291 aattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnn 390  Q
     ||  ||| ||||||||||  ||||||||  |||||||| | ||||    | |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||        
T  26490338 gatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattaga 26490437  T
Q  391 nnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaat 468  Q
       || || ||||||| || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  26490438 tgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaat 26490515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 25191133 - 25191445
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||| ||||  |||||||    
T  25191133 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaggttctatcgaacaatagtcagac 25191232  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||   ||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||  |||||||| | | ||||||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25191233 cggaaatgttgtatggtacagagtgttgggctgttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaa 25191332  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagca 323  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |   || |||||| |||   |||||||  ||    
T  25191333 gactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggaca 25191432  T
Q  324 tgtagagagaaga 336  Q
    |||||||||||||    
T  25191433 tgtagagagaaga 25191445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19676480 - 19676119
Alignment:
Q  156 gttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacacca 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||  ||||| || ||||||||    
T  19676480 gttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcg------aaatgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacacca 19676387  T
Q  256 ttagagagag------------ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtag 343  Q
    ||||||||||            |||||||| ||||||||||| |||| || |||| |||| |||||  ||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  19676386 ttagagagagagagagagagtgttggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtag 19676287  T
Q  344 atgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagattt 443  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||| || |||||||| ||       |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  19676286 atgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaattt 19676188  T
Q  444 agaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  19676187 agaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagc 19676119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 541
Target Start/End: Original strand, 54278852 - 54279294
Alignment:
Q  102 ttctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcgga 201  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||  |||||||  |||||  | ||||| ||||| ||||  || ||| |||    
T  54278852 ttctatcggacagcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacataagaatcaggtaagtgtagcagagatgagga 54278951  T
Q  202 tgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattatagg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  |||     
T  54278952 tgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 54279051  T
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||    |||||| ||| ||||||||||||   |||||||  || |||  || ||||||||| ||||| ||||||||| |       ||||||    
T  54279052 aaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 54279151  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
     ||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| |||    
T  54279152 agaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 54279251  T
Q  500 tgatgcatgtagccga-accatttaataagataacacttggtt 541  Q
    ||||  ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  54279252 tgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt 54279294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 38849848 - 38850089
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| |   || ||||||||||| |||| ||    
T  38849848 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataacaaagtaccacttaagttgaaagaaattttttatcggacaacagtcacac 38849947  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  38849948 cgacgatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaa 38850047  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag 265  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  38850048 gactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagag 38850089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 53519353 - 53519600
Alignment:
Q  37 tgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttata 136  Q
    ||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||| | |||||| || | ||||| |     
T  53519353 tgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagcttaaaggaaaaatctatcggacagcagtcagatcggcaatgttgtg 53519452  T
Q  137 tgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggat 236  Q
    |  |||||||||||  | |||||||| ||||||||| | | |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53519453 ttgtacggagtgttaagcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggat 53519552  T
Q  237 gtgattaagaatgacaccattag--agagagttggggtaacacctata 282  Q
      |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  53519553 aggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctata 53519600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 258 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289152
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctat--agtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtac 355  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||  | | ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||||     
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  356 gaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatga 455  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||| | ||       | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  456 gttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||| ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaacatta 45289152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 260 - 491
Target Start/End: Original strand, 38430840 - 38431071
Alignment:
Q  260 agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaat 359  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  || | ||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||     
T  38430840 agagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaag 38430939  T
Q  360 agtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtta 459  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||     
T  38430940 agtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttg 38431039  T
Q  460 gatccaaatatagtgtataatagaacattacg 491  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  38431040 gatccaaatatggtttatgatagaacattacg 38431071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47542239 - 47542034
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  47542239 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcggtctgac 47542140  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||| ||| ||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47542139 cggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaat-aagaaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 47542041  T
Q  224 gactaga 230  Q
    |||||||    
T  47542040 gactaga 47542034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 50960922 - 50960674
Alignment:
Q  261 gagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaata 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |    ||||||||| | ||| |    
T  50960922 gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacct----atgttgtagaaagaaga 50960827  T
Q  361 gtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttag 460  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||       || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |    
T  50960826 gtagatcagatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttgg 50960727  T
Q  461 atccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||| |||||    
T  50960726 atccaaatatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagcc 50960674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 300 - 515
Target Start/End: Original strand, 39235170 - 39235384
Alignment:
Q  300 aaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtaga 399  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||       ||||||    
T  39235170 aaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtcagatcaaaagaggtaga 39235269  T
Q  400 ggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 499  Q
    |||||| | | ||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||  ||||||||||| | ||| | |    
T  39235270 ggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgatagaacattatgtcgtga-t 39235368  T
Q  500 tgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| |||||||||||    
T  39235369 tgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49503968 - 49503730
Alignment:
Q  143 ggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggat-----gagtggtaagactagaaaggatg 237  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||     ||||||||||||||||   |||     
T  49503968 ggagtgttggacggttaagaatcaacatgaaaatcaagtaagtgtagcggagataaggatgttgcgttggattggatgagtggtaagactagacgagata 49503869  T
Q  238 tgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaag 335  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  49503868 ggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaag 49503769  T
Q  336 agttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    |    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  49503768 accaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatgga 49503730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734311
Alignment:
Q  204 ttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaat 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | ||  ||| ||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaat 48734382  T
Q  304 aggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatgga 374  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48734381 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatgga 48734311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 33272480 - 33272124
Alignment:
Q  100 aattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcg 199  Q
    |||||||||| |||||  |  ||||| || |||| |||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| |    
T  33272480 aattctatcgaacaacacttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgag 33272381  T
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag----ttggggtaacacctata----gtagaaaaa 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||    ||||||||     
T  33272380 gatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaag 33272281  T
Q  292 attataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnn 391  Q
     |  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||| |||  ||| |||| ||||| ||||||||| |         
T  33272280 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctgtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 33272182  T
Q  392 nnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggt 449  Q
      |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || |||||||||||    
T  33272181 gaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggt 33272124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 515
Target Start/End: Original strand, 48508280 - 48508482
Alignment:
Q  313 tggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataa 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |    
T  48508280 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctagga 48508379  T
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  48508380 aaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagc 48508479  T
Q  513 cga 515  Q
    |||    
T  48508480 cga 48508482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 30345281 - 30345478
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| | ||| |   |||||     
T  30345281 caagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgcgataagaaagtaccgcttaaattgaaaggaaaattctaccagacgaaaatcagat 30345380  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    ||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  30345381 tgacgatgttatattgtacggagtgatgggcggttaagaaccaacatgaaaattaagta----tagcggagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaa 30345476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600728
Alignment:
Q  217 gtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtg 314  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||  | | ||| | ||||  |||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  315 gtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaa 414  Q
    ||||  ||||||| ||||||||  |||||||  |||||   | | |||||||||||| || || ||||| ||       |||||||||||| ||| ||||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  415 actttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgat 39600728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 347
Target Start/End: Original strand, 3186523 - 3186847
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||  ||    
T  3186523 caagttgggtggttgaaatgaagaatattttcatgtgttttaggtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaagttatatcggacaacagtcccac 3186622  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    | |||||||| |||| ||   ||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||  |||| | | ||| | || ||  |||||||||| |||||    
T  3186623 caacgatgttgtatgatatatagtgttgggcgattaagagtcaacacgagaatcaagtaaatgtagcgtagatgagaatcttatgttggatgagcggtaa 3186722  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta--gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    |||| |   ||||  ||||| ||||||||||||||  || ||||| | |||| |||||||||| | |||  |  ||| |||||||||  | || |||| |    
T  3186723 gacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggctaga-tgatttggg 3186821  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgt 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3186822 catgtagagagaagatttgtagatgt 3186847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 381
Target Start/End: Original strand, 19736926 - 19737110
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag---ttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||  | ||| | ||||||||||||   | |||| | |||||||||||||||| ||  |    
T  19736926 gatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19737025  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagt 381  Q
    || ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19737026 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt 19737110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43695230 - 43695091
Alignment:
Q  87 aagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcg 186  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |    
T  43695230 aagttgaaagaaaagttctatcggacagcagttagaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttgagaattaacacgagaatcaagtaagtg 43695131  T
Q  187 tagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagac 226  Q
    ||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43695130 taacagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagac 43695091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47233974 - 47233631
Alignment:
Q  174 aatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttgggg 271  Q
    |||| |||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||  ||||||||||||||||||||  | | ||    
T  47233974 aatctagtaagtgtagcgaagatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggagg 47233875  T
Q  272 taacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagat 371  Q
    || ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||  || ||  ||| ||||||||| ||    
T  47233874 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaat 47233775  T
Q  372 ggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatata 471  Q
    ||| ||||||||  |        || || ||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  47233774 ggaggagagtcaggttaaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatg 47233675  T
Q  472 gtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  47233674 gtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccga 47233631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 515
Target Start/End: Original strand, 22002 - 22319
Alignment:
Q  199 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  |    
T  22002 ggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 22101  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggt 396  Q
    | |||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||  || ||| ||| ||||||| | ||||| |||||||   |       |||    
T  22102 a-gaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggt 22200  T
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    |||||||||  ||  |||||  | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | |||     
T  22201 agaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtc 22300  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  22301 atttgatctatgtagccga 22319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 381
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758013
Alignment:
Q  200 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag---ttggggtaacacctatagtagaaaaaattat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||  |||||  | ||| | ||||||||||||   | |||| | |||||||||||||||| ||  |    
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19757928  T
Q  297 aggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagt 381  Q
    || ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19757929 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt 19758013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 413 - 515
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042184
Alignment:
Q  413 aaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatag-tgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  512 ccga 515  Q
    ||||    
T  49042181 ccga 49042184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 54365128 - 54365010
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||| | |||||| || ||| |||||||| || ||||||    
T  54365128 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgtgttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgta 54365029  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  54365028 atttgatccatgtagccga 54365010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 428 - 512
Target Start/End: Original strand, 29601052 - 29601136
Alignment:
Q  428 ctattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  29601052 ctattaagaaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagc 29601136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033393
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||   | ||| ||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||  |       |||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  458 tagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccga 35033393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 345118 - 344928
Alignment:
Q  145 agtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaa 244  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||||   |||  |||||     
T  345118 agtgttgagcggttaagaaccaacacaagaataaagtaagcatagcggaaattaggatgttatgttggatttgtggtaagactagacgagataggattag 345019  T
Q  245 gaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagaga 333  Q
     |||||   ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  345018 aaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagaga 344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42510301 - 42510051
Alignment:
Q  263 gagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagt 362  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||  | | ||||||||||  ||||||||  ||||||||||  |||  | ||||| |||| ||| | | |||    
T  42510301 gagttgggatagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagt 42510204  T
Q  363 agatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagat 462  Q
    |||||||||||| || ||||| ||       || | ||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||  | |||||||| ||     
T  42510203 agatcagatggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggac 42510104  T
Q  463 ccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    | |||||| || ||| || |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  42510103 caaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 42510051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Original strand, 45236751 - 45236850
Alignment:
Q  165 caacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga 264  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||  || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45236751 caacacgagaataaagtaagcctagccgagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 425 - 515
Target Start/End: Original strand, 36304123 - 36304213
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  36304123 aaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 36304213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12096861 - 12096740
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| |||  |||||| | ||| |||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |    
T  12096861 ggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 12096762  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  12096761 gtcatttgatccatgtagccga 12096740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 40116619 - 40116530
Alignment:
Q  399 aggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatt 488  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||    
T  40116619 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacatt 40116530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48953818 - 48953694
Alignment:
Q  129 atgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | || |||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  48953818 atgttgtatgttacggagtgttgggcgtttaagatccaacacaagaaacaagtaagtgt-gcggagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattg 48953720  T
Q  229 gaaaggatgtgattaagaatgacacc 254  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||    
T  48953719 gatgagataggattaagaatgacacc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 219
Target Start/End: Original strand, 29817293 - 29817453
Alignment:
Q  59 tgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggtt 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| | | ||||| |||||||| || |||||||  ||||| |||  || ||||||||  ||||||    
T  29817293 tgttttatgtgataagaaagtaacgcttaagttgaaagaaaatttctaccggacaacagttagaccgataatgttgtataatatggagtgttaagtggtt 29817392  T
Q  159 aagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtg 219  Q
    |||||| || || ||||||||  ||| ||||   | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  29817393 aagaactaatacaaaaatcaatcaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggataagtg 29817453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 515
Target Start/End: Original strand, 15296059 - 15296154
Alignment:
Q  420 aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |   ||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||    
T  15296059 aagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccga 15296154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 19162799 - 19162679
Alignment:
Q  338 ttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaa 437  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||  |       | |||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||| |||    
T  19162799 ttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaa 19162700  T
Q  438 agatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  19162699 agatttagagattaatgagtt 19162679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42026783 - 42026571
Alignment:
Q  303 taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagagga 402  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  | ||||| | | ||||||||||| ||| || | ||| ||       || ||||||    
T  42026783 taggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatcagacggaggataatcacatccctagaggcagagga 42026684  T
Q  403 agatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttga 502  Q
    ||| | || ||| || ||||||||||||||| ||  ||| ||| | ||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  42026683 agaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcgttatttga 42026584  T
Q  503 tgcatgtagccga 515  Q
    | ||| |||||||    
T  42026583 ttcatttagccga 42026571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 52678981 - 52678942
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52678981 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 52678942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31337910 - 31337751
Alignment:
Q  166 aacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagag-- 263  Q
    ||||||||||| || |||||||| | || ||  |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||| ||||||| ||||||||||      
T  31337910 aacacgaaaataaattaagcgtaattgagataaggatcttgtgttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaa 31337812  T
Q  264 agttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatg 325  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||  | | || ||||||| |||||||||||||||    
T  31337811 agtt-gggtagcacctatagtagaaaagatggttgaaactaggcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40674606 - 40674556
Alignment:
Q  59 tgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40674606 tgttttatgtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaaattctatcg 40674556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 45487000 - 45486885
Alignment:
Q  402 aagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatcca---aatatagtgtataatagaacattacgacgtaat 498  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || || |||   ||||| || ||| ||||||||||| | | ||||    
T  45487000 aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataat 45486901  T
Q  499 ttgatgcatgtagccg 514  Q
    ||||| ||||||||||    
T  45486900 ttgatccatgtagccg 45486885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Original strand, 49841767 - 49841860
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  49841767 taagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagc 49841860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 556
Target Start/End: Original strand, 53519748 - 53519869
Alignment:
Q  436 aaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga-accatttaataagataaca 534  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || | | |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| | ||||||      
T  53519748 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataagg 53519847  T
Q  535 cttggttattgttgatgttttt 556  Q
    ||||||| |||||| |||||||    
T  53519848 cttggttgttgttgttgttttt 53519869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36820309 - 36820229
Alignment:
Q  202 tgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctata 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36820309 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagagagttggggtagcacctata 36820229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2341119 - 2341036
Alignment:
Q  147 tgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2341119 tgttgggtggtaaagaatcaacgcgagaataaaataaggatagtggagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 2341036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987124
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagat 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||| |||  |||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagactggtagat 3987124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 489
Target Start/End: Original strand, 37779023 - 37779098
Alignment:
Q  414 aactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  37779023 aactataacagaaaatattttgaaagatttagagattaatgagctagatccgaatatggtttatgatagaacatta 37779098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 289
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  211 ggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaa 289  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||  |||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40116459 - 40116373
Alignment:
Q  429 tattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  40116459 tattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccga 40116373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 290
Target Start/End: Original strand, 45728021 - 45728169
Alignment:
Q  146 gtgttgggtggttaagaacc-aacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaa 244  Q
    |||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    ||  |||||     
T  45728021 gtgttgggcggttaagagcccaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattag 45728120  T
Q  245 gaatgacaccatt---agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
     ||||||| ||||   ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  45728121 aaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtagaaaa 45728169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23534726 - 23534609
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgac 493  Q
    |||||||||||| | | ||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||    |||||  | ||| ||||||||||| | |    
T  23534726 ggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacattatggc 23534627  T
Q  494 gtaatttgatgcatgtag 511  Q
    |||||||||| |||||||    
T  23534626 gtaatttgatccatgtag 23534609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 383
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060546
Alignment:
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacga 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  358 atagtagatcagatggaagagagtca 383  Q
    | ||||||| | ||||| ||||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtca 38060546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 511
Target Start/End: Original strand, 39208790 - 39208851
Alignment:
Q  450 taatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39208790 taatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtag 39208851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Original strand, 38060857 - 38060961
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||||| | |||||||| ||||  || | |||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  38060857 aaaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgta 38060956  T
Q  511 gccga 515  Q
    |||||    
T  38060957 gccga 38060961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41482292 - 41482184
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaacttt-aagagaaactattatgaaaga-tttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacg 494  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||  | | |||| | || ||| ||||||||||| | ||    
T  41482292 agaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatctggtttatgatagaacattatggcg 41482193  T
Q  495 taatttgat 503  Q
    |||||||||    
T  41482192 taatttgat 41482184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41842654 - 41842562
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    ||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||  |||||| || | | ||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  41842654 taagaaaaactataaagatagatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 49503695 - 49503603
Alignment:
Q  423 agaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| || |   ||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  49503695 agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccga 49503603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52156195 - 52156119
Alignment:
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| || |||| |||||||||||    
T  52156195 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatgtagccga 52156119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 512
Target Start/End: Original strand, 19758044 - 19758131
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||| || ||| ||||||||||| |   ||||||||| ||||||||    
T  19758044 aaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatccatgtagc 19758131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 36820116 - 36820069
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  36820116 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtt 36820069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 40106722 - 40106667
Alignment:
Q  448 gttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  40106722 gttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgat 40106667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54365271 - 54365236
Alignment:
Q  255 attagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54365271 attagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 54365236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 512
Target Start/End: Original strand, 25191531 - 25191621
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || | | |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||    
T  25191531 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 25191621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 462
Target Start/End: Original strand, 37227863 - 37228122
Alignment:
Q  203 gttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaa 302  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |  ||  |||||  ||||||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    | ||     
T  37227863 gttgtgttggttgtgtggtaagactagacaatataggattagaaatgaccacattagagagagttggagtagcagctatcgtagaaaaaatggcggaaac 37227962  T
Q  303 taggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagagga 402  Q
    | |||||  |||||||  ||||||||||| || || |||||||  ||||||| | | ||| ||  ||| ||| |  ||||||||       || |||| |    
T  37227963 tcggcttaggtggtttctgcatgtagagaaaatagatgtagattatgtagtaaggacagttgaatagacggagggtagtcaaatcaccagaggcagagaa 37228062  T
Q  403 agatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagat 462  Q
    ||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  37228063 agacctataaaaacgataagggaaactattaagaaagacttagaaattaatgagttagat 37228122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 653932 - 653859
Alignment:
Q  157 ttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 230  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  653932 ttaagaaccaacacgataataaagtacgcgtagcaaagatgaggattttgcgttggatgtgtggtaaaactaga 653859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 2340855 - 2340810
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  2340855 aaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagt 2340810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 353
Target Start/End: Original strand, 6987816 - 6987857
Alignment:
Q  312 gtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagt 353  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6987816 gtggtttgagcgtgtaaagagaagacttgtagatgttgtagt 6987857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30294277 - 30294208
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatc 463  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  30294277 ggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatc 30294208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30797930 - 30797869
Alignment:
Q  442 ttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgat 503  Q
    |||||| ||| | |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30797930 ttagagattattcagttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 30797869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 33755495 - 33755434
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  33755495 agaggaaaacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttagagattaatgagtt 33755434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48953523 - 48953454
Alignment:
Q  446 aggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  48953523 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50621488 - 50621435
Alignment:
Q  420 aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagt 473  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  50621488 aagagaaactattagtaaatatttaaagattaatgagttagattcaaatatagt 50621435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 515
Target Start/End: Original strand, 53262311 - 53262388
Alignment:
Q  438 agatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| |||||||  ||||||||||    
T  53262311 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccga 53262388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 290
Target Start/End: Original strand, 55244090 - 55244320
Alignment:
Q  58 gtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggt 157  Q
    |||||||||  ||||  |||||| || | |||||||| ||| |||| |||| |||| | || |||||||| ||||| |||   ||  ||||||||   ||    
T  55244090 gtgttttatttgatacaaaagtaccactcaagttgaagggaaaattttatctgacagctgtaagaccgacaatgttgtatcggacaaagtgttggactgt 55244189  T
Q  158 taagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt 257  Q
     ||||||||||| |||||| || ||||||||||    ||| |||||||  | || ||| ||||||||||| ||  ||||  |||||  ||||||| ||||    
T  55244190 caagaaccaacatgaaaataaattaagcgtagtattgatgaggatgttttgatgaatgtgtggtaagacttgacgggataagattagtaatgacaacatt 55244289  T
Q  258 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  55244290 agagag--ttggtgcaacacctatagtagaaaa 55244320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 388387 - 388299
Alignment:
Q  425 aaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagcc 513  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  388387 aaactatttagaaagttttagagattaatgagtaagatagaaatacggtatatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagcc 388299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38054688 - 38054616
Alignment:
Q  201 atgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggta 273  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||  |||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  38054688 atgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagagttgaggta 38054616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46227333 - 46227166
Alignment:
Q  140 tacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtg 239  Q
    ||||||||||| |  | |||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||| | | ||||  |||||  |||| ||    
T  46227333 tacggagtgttagacgattaaaaaccaacatgataatcaaataagcgtggtggagatgagaatgttgtgttagatcaatcgtaatgctagatgggatatg 46227234  T
Q  240 attaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaatag 305  Q
    ||||||||||||| ||||  | | |||||||  |||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||    
T  46227233 attaagaatgacatcattaaaaaaagagttgaagtaacacctatactaaaaaagattgtagaaaatag 46227166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 54920843 - 54920780
Alignment:
Q  394 ggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtt 458  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  54920843 ggtagaggaagatcta-aaaaattatacgagaaactattagaaaagatttagagattaataagtt 54920780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 515
Target Start/End: Original strand, 82475 - 82965
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||   | |||| ||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  82475 caagctgggtggttgcaatgggaaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtactccttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagac 82574  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| | || ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  82575 cgacgatcttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcactggatgagtagtaa 82674  T
Q  224 gactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatt--agagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgag 321  Q
    ||||||| | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||   || ||||      
T  82675 gactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggcttagatgatttgga 82774  T
Q  322 catgtagagagaagagttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaa 421  Q
    ||| |||||||||||    ||||||  || ||| |||  ||| |||| ||||| ||||||    |       |||||||||||| |||  |||||| | |    
T  82775 catatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagacctaggaaaactat-a 82871  T
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  82872 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 82965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2798 - 2594
Alignment:
Q  24 caagttgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagac 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  2798 caagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagac 2699  T
Q  124 cgacgatgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaa 223  Q
     |||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  2698 tgacgttgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagtcaacatgataatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaa 2599  T
Q  224 gacta 228  Q
    |||||    
T  2598 gacta 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1259 - 986
Alignment:
Q  239 gattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaagagt 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||      
T  1259 gattatgaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacc 1160  T
Q  339 tgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaaatnnnnnnnggtagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaa 438  Q
     |||||||  || ||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||       |||||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  |||    
T  1159 cgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaa 1060  T
Q  439 gatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagc 512  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||    
T  1059 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25857 - 25705
Alignment:
Q  140 tacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||  || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  |    
T  25857 tacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgatagg 25758  T
Q  240 attaagaatgacaccattagag--agagttggggtaacacctatagtagaaaa 290  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25757 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 25705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25570
Alignment:
Q  396 tagaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 495  Q
    |||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  496 aatttgatgcatgtagc 512  Q
     |||| || ||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagc 25570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 87101 - 86894
Alignment:
Q  60 gttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataat-----tctatcggacaacggtcagaccgacgatgttatatgttacggagtgttgggt 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||      ||||| ||||| | |||||||| ||||| || |||| |||  ||||||||      
T  87101 gttttatgcaataagaaagtatcacttaagttgaaaagaaaaaaaagctctattggacagcagtcagaccaacgattttgtatggtac--agtgttggc- 87005  T
Q  155 ggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacacc 254  Q
    |||||||| || ||| || | ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||    
T  87004 ggttaagagccgacatgagactcaagtaagtgtagaggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacacc 86905  T
Q  255 attagagagag 265  Q
    |||||||||||    
T  86904 attagagagag 86894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12121 - 11808
Alignment:
Q  29 tgggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacg 128  Q
    ||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||| | || |||||| || |  ||||| ||  |    
T  12121 tgggtcgttgaaatggagaagaacctcaagtgttttgtgcgataagaaagtacctcttaagttaaaaggaaagttttatcggtcagcaatcagaacggag 12022  T
Q  129 atgttatatgttacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 228  Q
     ||||  ||| |||  | ||||||| || |||||  ||||| || ||||||||| | ||||  || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12021 ttgttgcatggtacaaaatgttgggcgggtaagagtcaacatgagaatcaagtatgtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagacta 11922  T
Q  229 gaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagag----agttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcat 324  Q
    || |  ||  ||||| |||||||||||| ||||||    ||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||   || |||| ||||    
T  11921 gacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcat 11822  T
Q  325 gtagagagaagagt 338  Q
    ||||| ||||||||    
T  11821 gtagacagaagagt 11808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4684 - 4437
Alignment:
Q  140 tacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtggaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtg 239  Q
    |||||||||||||  ||||| ||  |||||||| ||||||||||   ||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |    
T  4684 tacggagtgttggacggttatgagtcaacacgagaatcaagtaaatttaacagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgatagg 4585  T
Q  240 attaagaatgacaccattagagagag---ttggggtaacacctatagtagaaaaaattataggaaataggctttagtggtttgagcatgtagagagaaga 336  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||||  |  ||  ||||||||||   | ||||| ||||||||| ||||||    
T  4584 attataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaaga 4485  T
Q  337 gttgtagatgttgtagtacgaatagtagatcagatggaagagagtcaa 384  Q
     | ||||| | ||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  4484 ctcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4410 - 4276
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga--acc 518  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| |||| |||| | || |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||   ||    
T  4410 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacactatgacgttatttgatccatgtaggcgaccccc 4311  T
Q  519 atttaataagataacacttggttattgttgatgtt 553  Q
    |||||||  |||||  ||||||| |||||| ||||    
T  4310 atttaatgggataaggcttggttcttgttgttgtt 4276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 29
Alignment:
Q  30 gggtggttgaaatgtagaggagcttcaagtgttttatgcgataagaaagtatcatttaagttgaaaggataattctatc 108  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  107 gggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatc 29  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 411 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 160463 - 160361
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||    
T  160463 aaaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgta 160364  T
Q  511 gcc 513  Q
    |||    
T  160363 gcc 160361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 513
Target Start/End: Original strand, 14727 - 14828
Alignment:
Q  412 aaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtag 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||| |||||||| ||| ||||||| || ||| || ||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  14727 aaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtag 14826  T
Q  512 cc 513  Q
    ||    
T  14827 cc 14828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1658 - 1606
Alignment:
Q  411 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatc 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1658 aaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatc 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Original strand, 4787 - 4883
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| || | ||||||||||| | |||||||||    
T  4787 taagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccga 4883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 58379 - 58261
Alignment:
Q  397 agaggaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 496  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | || ||| | |||||||| || | | |||| || ||| ||||||||||| | ||||    
T  58379 agaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattatgtcgta 58280  T
Q  497 atttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  58279 atttgatccatgtagccga 58261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Original strand, 16732 - 16825
Alignment:
Q  422 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || | ||| |||||||  ||||||||||    
T  16732 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccga 16825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Original strand, 484 - 578
Alignment:
Q  421 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 515  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||  | |||||| | |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||    
T  484 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0373
Description:

Target: scaffold0373; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 2432 - 2362
Alignment:
Q  419 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 489  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||  | |||||||||||||||    
T  2432 taagagagactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatagaaatatgttatataatagaacatta 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 510
Target Start/End: Original strand, 39480 - 39561
Alignment:
Q  429 tattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 510  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||| | | |||||||| || ||||||    
T  39480 tattaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 457
Target Start/End: Original strand, 11930 - 11986
Alignment:
Q  401 gaagatctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagt 457  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||    
T  11930 gaagaactagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagt 11986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University