View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6555_low_2 (Length: 566)

Name: NF6555_low_2
Description: NF6555
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6555_low_2
NF6555_low_2
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (18-556)||(40717882-40718405)
chr8 (23-556)||(14183130-14183648)
chr8 (166-359)||(14192208-14192401)
chr8 (253-445)||(14201295-14201487)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (148-558)||(19648845-19649252)
chr5 (24-556)||(34665878-34666398)
chr5 (28-556)||(34646188-34646704)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (32-555)||(45645388-45645899)
chr4 (262-425)||(1390492-1390655)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (169-358)||(34302984-34303173)
chr6 (30-120)||(34302848-34302938)
chr6 (262-301)||(33889226-33889265)
chr6 (262-301)||(33893731-33893770)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 481; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 40717882 - 40718405
Alignment:
Q  18 gtttaaaggtgcaagctctggtatagttggccttggaggtggtcccgtgtctcttataacacaacttggatcgtcaattggttcaaaattctcttattgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40717882 gtttaaaggtgcaagctctggtatagttggccttggaggtggtcccgtgtctcttataacacaacttggatcgtcaattggttcaaaattctcttattgt 40717981  T
Q  118 ttgcttccattgtctcttgagtcaaacccagttgagtcaaacaggacaagcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40717982 ttgcttccattgtctcttga---------------gtcaaacaggacaagcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgt 40718066  T
Q  218 caactcctatagtgaaaaaagaccccacagttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718067 caactcctatagtgaaaaaagaccccacagttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaa 40718166  T
Q  318 tggtagtgatgagggtaacatcataattgattcaggtacaaccttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718167 tggtagtgatgagggtaacatcataattgattcaggtacaacgttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatct 40718266  T
Q  418 gtgaaactagagcgtgttgatgatccaactcaacaattaaacctttgctatagtaccacatcagacagatataactttcctctaataacagcgcatttta 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718267 gtgaaactagagcgtgttgatgatccaactcaacaattaaacctttgctatagtaccacatcagacatatataactttcctctaataacagcgcatttta 40718366  T
Q  518 aaggtgcggatattaagttgcatcccattagtacctttg 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718367 aaggtgcggatattaagttgcatcccattagtacctttg 40718405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 556
Target Start/End: Original strand, 14183130 - 14183648
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagctctggtatagttggccttggaggtggtcccgtgtctcttataacacaacttggatcgtcaattggttcaaaattctcttattgtttgct 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  14183130 aaggtgcaagttctggtatagttggccttggaggtggaccagcatctcttattacacaattgggatcatcaattgatgcaaaattctcttattgtttgtt 14183229  T
Q  123 tccattgtctcttgagtcaaacccagttgagtcaaacaggacaagcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgtcaact 222  Q
     |||               ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| || || | |||| |||||||     
T  14183230 gcca---------------aacccggttgagtcaaacacgacaagcaaactcaattttggagacacggctgtggtttccggggatggtgttgtgtcaacc 14183314  T
Q  223 cctatagtgaaaaaagaccccacagttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaatggta 322  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||     
T  14183315 cctatagtgaaaaaggatcctatagttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggtaacaaaagaatagaatttgaagggtcttcaaatggtg 14183414  T
Q  323 gtgatgagggtaacatcataattgattcaggtacaaccttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatctgtgaa 422  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| || || |||||||||||||||||||||| |||   ||||  |||||    
T  14183415 gtcatgaaggtaacatcataattgattcaggtacaacgttgacggttattccaactgatgtttataataatttggaatcagcggtgttggaattggtgaa 14183514  T
Q  423 actagagcgtgttgatgatccaactcaacaattaaacctttgctatagtaccacatcagacagatataactttcctctaataacagcgcattttaaaggt 522  Q
    |||  |||||||| |||||||||| | |  ||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||| | |||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  14183515 actgaagcgtgttaatgatccaacccgattatttaacctttgctatagcgtcacatcagatggatatgattttcctataataacgacacattttaaaggt 14183614  T
Q  523 gcggatattaagttgcatcccattagtacctttg 556  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14183615 gcggatgttaagttgcatcctattagtacatttg 14183648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 359
Target Start/End: Original strand, 14192208 - 14192401
Alignment:
Q  166 agcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgtcaactcctatagtgaaaaaagaccccacagttttctactatttgacat 265  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||| || |  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |   || |||||||||||||    
T  14192208 agcaagctcaattttggagatgcggctacggtatctggagacggggttgtgacaactcctatattgaaaaaagaccccgaaaccttttactatttgacat 14192307  T
Q  266 tggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaatggtagtgatgagggtaacatcataattgattcaggtacaac 359  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||  ||  | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14192308 tggaagcatttagtgttggaaatagaagagtagaaattggaggagttccaaatggtgataatgagggtaacatcataattgattcgggtacaac 14192401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 445
Target Start/End: Original strand, 14201295 - 14201487
Alignment:
Q  253 tactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaatggtagtgatgagggtaacatcataattgattcag 352  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  || || || ||||| || |||||||||||||  |||||||||| |    
T  14201295 tactacttgacattagaagcatttagtgtgggaaacaaattaatagaatttggaggacctacatatggtggtaatgagggtaacattttaattgattctg 14201394  T
Q  353 gtacaaccttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatctgtgaaactagagcgtgttgatgatccaa 445  Q
    ||||||| || ||  ||||||| | | || ||||| |||  || |||||||| || ||||||| | | || || |||| |||||| |||||||    
T  14201395 gtacaacattcacatttttgccctatgatgtttattatagatttgaatcagctgtagcagaatatattaatctggagcatgttgaggatccaa 14201487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 148 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 19649252 - 19648845
Alignment:
Q  148 gttgagtcaaacaggacaagcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgtcaactcctatagtgaaaaaagaccccacag 247  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||    
T  19649252 gttgactcgaacaagacgagcaaactcaattttggagatgccgctgtggtttctggtgacggtgttgtgtcaactccttttgtgaaaaaagaccctcaag 19649153  T
Q  248 ttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaatggtagtgatgagggtaacatcataattga 347  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | |||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19649152 ctttctactatttgacgttagaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttg--aagtgtt-agatgacagtgaggagggtaacatcatacttga 19649056  T
Q  348 ttcaggtacaaccttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatctgtgaaactagagcgtgttgatgatccaact 447  Q
    ||| |||||||| |||||  |||| || ||| || |||||| |||||||||||| || || ||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  19649055 ttctggtacaacattgactcttttaccgtctcatgtttatactaatttggaatcggcggtagcacaactggtgaaactagatcgtgttgatgatcctaat 19648956  T
Q  448 caacaattaaacctttgctatagtaccacatcagacagatataactttcctctaataacagcgcattttaaaggtgcggatattaagttgcatcccatta 547  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  19648955 caactattaaacctttgttatagtatcacatcagaccaatatgattttcctataatcactgcacattttaaaggtgcagatattaagttgaacccaatta 19648856  T
Q  548 gtacctttgct 558  Q
    |||||||||||    
T  19648855 gtacctttgct 19648845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 556
Target Start/End: Original strand, 34665878 - 34666398
Alignment:
Q  24 aggtgcaagctctggtatagttggccttggaggtggtcccgtgtctcttataacacaacttggatcgtcaattggttcaaaattctcttattgtttgctt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |     
T  34665878 aggtgcaagctctggtatagttggccttggaggcgggccggtgtctctcataacacaattgggatcatcaattggtggtaaattctcttattgtttggtg 34665977  T
Q  124 ccattgtctcttgagtcaaacccagttgagtcaaacaggacaagcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgtcaactc 223  Q
    |||||||        | ||  | ||  |||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  34665978 ccattgt--------tgaa--caag--gagtcaaacgcatcaagtatactcagttttggagatgccgctgtggtttcgggtgacggtgttgtgtcaactc 34666065  T
Q  224 ctatagtgaaaaaagaccccacagttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttc---aaatgg 320  Q
    || || | ||||||||||||   |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||   |  |||    
T  34666066 ctctaataaaaaaagacccc---gttttctactttttgacattacaagcatttagtgttggaaacaaaagagtagaatttggaggctcttcggaaggtgg 34666162  T
Q  321 tagtgatgagggtaacatcataattgattcaggtacaaccttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatctgtg 420  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | || ||  |  | |||| ||| ||||||||||| ||||  || |  |||    
T  34666163 tgatgatgaaggtaacatcataattgattcaggtacaacattgacacttataccttccgacgtctatactaacttggaatcagctgtggtggatttggtg 34666262  T
Q  421 aaactagagcgtgttgatgatccaactcaacaattaaacctttgctatagtaccacatcagacagatataactttcctctaataacagcgcattttaaag 520  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||   | |||| |   |||| | |||||| |||| || || ||||||||||    
T  34666263 aaactagatcgtgttgatgatcctaatcaacaattcagcctatgctatagtttgaaatcaaatgaatatgattttcctataatcaccgcacattttaaag 34666362  T
Q  521 gtgcggatattaagttgcatcccattagtacctttg 556  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  34666363 gtgccgatattgagttgcattctattagtacctttg 34666398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 556
Target Start/End: Original strand, 34646188 - 34646704
Alignment:
Q  28 gcaagctctggtatagttggccttggaggtggtcccgtgtctcttataacacaacttggatcgtcaattggttcaaaattctcttattgtttgcttccat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| | ||||    
T  34646188 gcaagctctggtatagttggccttggaggcgggccggtgtctctcataacacaattgggatcatcaattggtggtaaattctcttattgtttggtgccat 34646287  T
Q  128 tgtctcttgagtcaaacccagttgagtcaaacaggacaagcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgtcaactcctat 227  Q
    |||        | ||  | ||  |||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |    
T  34646288 tgt--------tgaa--caag--gagtcaaacgcatcaagtatactcagttttggagatgccgctgtggtttcgggtgacggtgttgtgtcaactcctct 34646375  T
Q  228 agtgaaaaaagaccccacagttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttc---aaatggtagt 324  Q
    | | ||||||||||||   |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||   |  ||||  |    
T  34646376 aataaaaaaagacccc---gttttctactttttgacattacaagcatttagtgttggaaacaaaagagtagaatttggaggctcttcggaaggtggtgat 34646472  T
Q  325 gatgagggtaacatcataattgattcaggtacaaccttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatctgtgaaac 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | || ||  |  | |||| ||| ||||||||||| ||||  || |  |||||||    
T  34646473 gatgaaggtaacatcataattgattcaggtacaacattgacacttataccttccgacgtctatactaacttggaatcagctgtggtggatttggtgaaac 34646572  T
Q  425 tagagcgtgttgatgatccaactcaacaattaaacctttgctatagtaccacatcagacagatataactttcctctaataacagcgcattttaaaggtgc 524  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||   | |||| |   |||| | |||||| |||| || |  ||||||||||||||    
T  34646573 tagatcgtgttgatgatcctaatcaacaattcagcctatgctatagtttgaaatcaaatgaatatgattttcctataatcaccgtacattttaaaggtgc 34646672  T
Q  525 ggatattaagttgcatcccattagtacctttg 556  Q
     ||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  34646673 cgatgttgagttgcattctattagtacctttg 34646704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 555
Target Start/End: Original strand, 45645388 - 45645899
Alignment:
Q  32 gctctggtatagttggccttggaggtggtcccgtgtctcttataacacaacttggatcgtcaattggttcaaaattctcttattgtttgcttccattgtc 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| | ||||||      
T  45645388 gctctggtatagtgggccttggaggtggaccagtgtctctaataacacaattgggatcatcaattggtggtgaattctcttattgtttggtgccattgga 45645487  T
Q  132 tcttgagtcaaacccagttgagtcaaacaggacaagcaaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgtcaactcctatagtg 231  Q
    |          | | ||  ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |     
T  45645488 t----------aacaag--gagtcaaacacaacgagtaaactcagttttggagatgccgctgtggtttcgggtgacaatgttgtgtcaactcctataata 45645575  T
Q  232 aaaaaagaccccacagttttctactatttgacattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaatggtagtgatgagg 331  Q
    |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | | ||||||| |    
T  45645576 aaaaaagacccttcagtttactacgttttgacattagaagcatttagtgttggaaacaaaagagtagaatttggagggtcttcagaggatggtgatgaag 45645675  T
Q  332 gtaacatcataattgattcaggtacaaccttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatctgtgaaactagagcg 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| || |  ||||||| |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||| | ||    
T  45645676 gtaacattataattgattcaggtacaacattgatggttttaccagctgacgtttataaaaatttggaatcagctgtggttgatttggtgaaactaaaacg 45645775  T
Q  432 tgttgatgatccaactcaacaattaaacctttgctatagtaccacatcagacagatataactttcctctaataacagcgcattttaaaggtgcggatatt 531  Q
    ||| ||||||||   | ||| |||   ||| ||||||||| | |||| |||   |||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||    
T  45645776 tgtggatgatccttataaactattcggcctatgctatagtgcgacattagatgaatatgattttcctctaatcaccgcacattttaaaggtgctgatgtt 45645875  T
Q  532 aagttgcatcccattagtaccttt 555  Q
     |||||||| | ||||||||||||    
T  45645876 gagttgcattctattagtaccttt 45645899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 425
Target Start/End: Original strand, 1390492 - 1390655
Alignment:
Q  262 acattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatc-ttcaaatggtagtgatgagggtaacatcataattgattcaggtacaacc 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |  ||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||  |     
T  1390492 acattgaaagcatttagtgttggaaacaaaagagtagaattt-tcaaagcaatcaaatggtagtgttgatggtaacatcgtggttgattcaggtacggca 1390590  T
Q  361 ttgacgattttgccatctaatatttataataatttggaatcagccgtggcagaatctgtgaaact 425  Q
     ||||  || | ||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| || |||||    
T  1390591 gtgacagttgtaccatctggtatttatcataatttgaaataagctgtggcaaaatcggttaaact 1390655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 358
Target Start/End: Original strand, 34302984 - 34303173
Alignment:
Q  169 aaactcagttttggagatgccgctgtggtttctggtgaggatgttttgtcaactcctatagtgaaaaaagaccccacagttttctactatttgacattgg 268  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||| | |    
T  34302984 aaactcaattttggagatgtcgcaattgtttctggtcacaatgtattgtcaactcctatagttaaaaaagaccattcatttttctactatttgacaatag 34303083  T
Q  269 aagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaatttggcagatcttcaaatggtagtgatgagggtaacatcataattgattcaggtacaa 358  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||   | || ||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34303084 aagcatttagcgttggagacaaaagagtagaatttgcagggtcctcaaaaggtgttgaagaaggtaacatcataattgattcaagtacaa 34303173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 120
Target Start/End: Original strand, 34302848 - 34302938
Alignment:
Q  30 aagctctggtatagttggccttggaggtggtcccgtgtctcttataacacaacttggatcgtcaattggttcaaaattctcttattgtttg 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34302848 aagctctggtgtagttggccttggaggtggacctgcatctctaataacacaattgggaccgtcaattggtggtaaattctcttattgtttg 34302938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33889265 - 33889226
Alignment:
Q  262 acattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaat 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33889265 acattggaagcatttagtgtgggaaacaatagaatagaat 33889226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 301
Target Start/End: Original strand, 33893731 - 33893770
Alignment:
Q  262 acattggaagcatttagtgttggaaacaaaagaatagaat 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33893731 acattggaagcatttagtgtgggaaacaatagaatagaat 33893770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University