View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6561_low_27 (Length: 277)

Name: NF6561_low_27
Description: NF6561
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6561_low_27
NF6561_low_27
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (15-277)||(4482428-4482690)
chr7 (15-277)||(21677269-21677537)
chr7 (97-277)||(28388597-28388777)
chr7 (15-277)||(39293898-39294165)
chr7 (97-274)||(14938870-14939045)
chr7 (97-274)||(15366463-15366638)
chr7 (15-212)||(14278648-14278853)
chr7 (15-127)||(28718336-28718448)
chr7 (97-264)||(9641216-9641381)
chr7 (97-277)||(31499397-31499576)
chr7 (91-274)||(48345747-48345929)
chr7 (97-274)||(20587478-20587655)
chr7 (118-276)||(18920958-18921105)
chr7 (99-274)||(9609403-9609577)
chr7 (99-274)||(9836975-9837149)
chr7 (99-189)||(9322903-9322993)
chr7 (99-274)||(9058462-9058633)
chr7 (15-125)||(4072746-4072856)
chr7 (16-277)||(15980284-15980539)
chr7 (91-269)||(13460493-13460674)
chr7 (97-277)||(4437032-4437211)
chr7 (15-125)||(12245989-12246101)
chr7 (99-187)||(16915896-16915984)
chr7 (99-274)||(5617616-5617790)
chr7 (97-274)||(34242979-34243155)
chr7 (99-187)||(13388232-13388321)
chr7 (48-184)||(19065486-19065623)
chr7 (97-277)||(4444433-4444612)
chr7 (99-187)||(15628930-15629017)
chr7 (99-187)||(17229946-17230034)
chr7 (99-187)||(49049710-49049797)
chr7 (91-212)||(13452409-13452532)
chr7 (108-187)||(15914267-15914345)
chr7 (99-185)||(16572040-16572125)
chr7 (99-185)||(16593537-16593622)
chr7 (19-86)||(3135495-3135563)
chr7 (99-187)||(12249930-12250017)
chr7 (99-187)||(12753098-12753185)
chr7 (99-187)||(15824358-15824445)
chr7 (19-80)||(14302613-14302675)
chr7 (99-149)||(16921787-16921837)
chr7 (99-200)||(10862761-10862861)
chr7 (107-168)||(13039108-13039169)
chr7 (135-187)||(13375930-13375982)
chr7 (91-165)||(3193870-3193943)
chr7 (118-168)||(11582845-11582895)
chr7 (27-81)||(16206387-16206441)
chr7 (98-184)||(16370201-16370286)
chr7 (123-168)||(141815-141860)
chr7 (99-168)||(45455568-45455636)
chr7 (99-147)||(16917835-16917883)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (16-277)||(29162665-29162927)
chr6 (19-239)||(21929637-21929859)
chr6 (18-277)||(16131418-16131681)
chr6 (98-277)||(22595494-22595674)
chr6 (97-277)||(31469375-31469555)
chr6 (99-274)||(19852426-19852600)
chr6 (100-277)||(22467942-22468120)
chr6 (99-274)||(12310843-12311017)
chr6 (99-274)||(34965095-34965273)
chr6 (97-230)||(33540069-33540202)
chr6 (161-277)||(19670669-19670785)
chr6 (99-274)||(22846282-22846455)
chr6 (98-230)||(17085393-17085523)
chr6 (97-277)||(15006485-15006654)
chr6 (90-223)||(17375554-17375688)
chr6 (15-122)||(23219619-23219728)
chr6 (96-211)||(14150798-14150911)
chr6 (15-168)||(4174466-4174627)
chr6 (15-168)||(4230095-4230256)
chr6 (99-184)||(21621355-21621440)
chr6 (99-187)||(940964-941052)
chr6 (98-228)||(6092729-6092857)
chr6 (15-88)||(31163070-31163144)
chr6 (91-184)||(17858218-17858311)
chr6 (99-168)||(25649517-25649586)
chr6 (99-187)||(7829751-7829838)
chr6 (99-187)||(18383510-18383598)
chr6 (97-168)||(17787691-17787761)
chr6 (99-185)||(25917909-25917994)
chr6 (48-81)||(14352652-14352685)
chr6 (99-184)||(16889644-16889728)
chr6 (123-187)||(15080708-15080772)
chr6 (194-274)||(29603733-29603812)
chr6 (108-187)||(22866334-22866413)
chr6 (97-168)||(25746145-25746215)
chr6 (97-188)||(29603805-29603895)
chr6 (48-88)||(6777774-6777815)
chr6 (99-188)||(25646773-25646861)
chr6 (99-168)||(32896227-32896295)
chr6 (99-187)||(16104776-16104863)
chr6 (99-187)||(25369282-25369369)
chr6 (123-187)||(33322967-33323031)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (96-277)||(23236241-23236422)
chr5 (97-274)||(3420666-3420842)
chr5 (91-277)||(19872074-19872261)
chr5 (15-277)||(11963757-11964025)
chr5 (97-274)||(6454867-6455042)
chr5 (18-274)||(24227689-24227953)
chr5 (99-274)||(24082276-24082450)
chr5 (97-274)||(26561621-26561797)
chr5 (15-239)||(14345412-14345644)
chr5 (15-187)||(5453053-5453231)
chr5 (61-184)||(16837555-16837678)
chr5 (97-274)||(29912209-29912385)
chr5 (15-124)||(20456319-20456429)
chr5 (97-200)||(5623263-5623366)
chr5 (99-274)||(37189952-37190126)
chr5 (99-187)||(7726845-7726932)
chr5 (99-187)||(13793384-13793472)
chr5 (15-87)||(11765500-11765573)
chr5 (91-184)||(21615259-21615351)
chr5 (99-187)||(11338789-11338876)
chr5 (99-189)||(23453108-23453197)
chr5 (99-189)||(23460352-23460441)
chr5 (99-189)||(23464613-23464702)
chr5 (99-277)||(33628106-33628287)
chr5 (99-187)||(21392358-21392445)
chr5 (99-187)||(24185124-24185211)
chr5 (97-168)||(4863496-4863566)
chr5 (97-168)||(28257726-28257796)
chr5 (99-168)||(24470500-24470568)
chr5 (99-167)||(21228219-21228287)
chr5 (123-168)||(20710717-20710762)
chr5 (107-168)||(27185693-27185754)
chr5 (143-188)||(28888134-28888179)
chr5 (48-80)||(10178960-10178992)
chr5 (136-188)||(11579841-11579893)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (27-277)||(15988685-15988938)
chr3 (15-183)||(8602532-8602700)
chr3 (97-273)||(14819681-14819856)
chr3 (15-189)||(6817387-6817567)
chr3 (97-277)||(17320410-17320591)
chr3 (97-269)||(6230494-6230665)
chr3 (15-239)||(14182155-14182383)
chr3 (15-185)||(15551649-15551826)
chr3 (96-277)||(43429369-43429551)
chr3 (100-274)||(4147531-4147704)
chr3 (97-274)||(4164081-4164256)
chr3 (15-173)||(17391243-17391402)
chr3 (15-277)||(17760557-17760816)
chr3 (15-277)||(19061877-19062136)
chr3 (15-184)||(25106101-25106270)
chr3 (69-277)||(5230414-5230624)
chr3 (19-274)||(12950728-12950987)
chr3 (15-133)||(31414399-31414517)
chr3 (15-125)||(38813159-38813269)
chr3 (99-274)||(41659778-41659941)
chr3 (97-239)||(33371202-33371344)
chr3 (15-178)||(37918661-37918826)
chr3 (97-200)||(21168550-21168653)
chr3 (97-274)||(18968238-18968413)
chr3 (97-181)||(11636762-11636846)
chr3 (15-178)||(38378035-38378194)
chr3 (99-187)||(17202884-17202972)
chr3 (99-274)||(34558027-34558201)
chr3 (99-187)||(12020169-12020257)
chr3 (91-168)||(10902725-10902802)
chr3 (119-187)||(11330846-11330914)
chr3 (99-187)||(14296656-14296743)
chr3 (99-187)||(14302283-14302370)
chr3 (99-187)||(15548754-15548841)
chr3 (99-187)||(17137625-17137712)
chr3 (43-184)||(40041356-40041500)
chr3 (99-187)||(47786722-47786809)
chr3 (108-187)||(12563392-12563471)
chr3 (108-187)||(40937869-40937948)
chr3 (99-168)||(6148710-6148778)
chr3 (99-188)||(14523265-14523353)
chr3 (99-188)||(30204621-30204709)
chr3 (99-168)||(39654108-39654176)
chr3 (99-187)||(11199402-11199489)
chr3 (123-187)||(53900472-53900536)
chr3 (124-187)||(25769460-25769523)
chr3 (141-200)||(31416132-31416191)
chr3 (118-168)||(19230263-19230313)
chr3 (96-173)||(11517295-11517371)
chr3 (141-274)||(15515766-15515898)
chr3 (119-168)||(45581046-45581095)
chr3 (99-187)||(14061097-14061184)
chr3 (99-187)||(14287249-14287336)
chr3 (123-187)||(15874434-15874497)
chr3 (136-187)||(12490701-12490752)
chr3 (118-168)||(2045539-2045589)
chr3 (149-191)||(8022068-8022110)
chr3 (118-168)||(10736769-10736819)
chr3 (122-188)||(17536933-17536999)
chr3 (129-187)||(18008985-18009043)
chr3 (118-168)||(35121866-35121916)
chr3 (118-183)||(11884089-11884153)
chr3 (99-168)||(22146132-22146200)
chr3 (99-168)||(50113978-50114046)
chr3 (221-277)||(6817589-6817645)
chr3 (16-80)||(8022184-8022248)
chr3 (99-183)||(55443735-55443818)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (97-277)||(3543-3723)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (97-277)||(24554408-24554588)
chr8 (97-277)||(20707948-20708128)
chr8 (15-277)||(17264658-17264928)
chr8 (15-239)||(19333780-19334012)
chr8 (97-274)||(24266156-24266332)
chr8 (15-184)||(24237270-24237440)
chr8 (97-277)||(22499136-22499317)
chr8 (15-239)||(45561445-45561680)
chr8 (97-277)||(21233864-21234044)
chr8 (99-277)||(33170411-33170590)
chr8 (15-188)||(25293774-25293952)
chr8 (15-188)||(25755763-25755941)
chr8 (98-277)||(17500015-17500181)
chr8 (15-136)||(23216953-23217074)
chr8 (18-173)||(11600314-11600470)
chr8 (15-127)||(22319927-22320040)
chr8 (101-230)||(37655485-37655614)
chr8 (96-274)||(18263247-18263413)
chr8 (97-265)||(7468476-7468633)
chr8 (15-239)||(25608102-25608329)
chr8 (99-277)||(23118685-23118853)
chr8 (99-276)||(24906087-24906268)
chr8 (15-125)||(23879265-23879376)
chr8 (15-147)||(23350437-23350574)
chr8 (106-239)||(29296071-29296203)
chr8 (99-271)||(15931487-15931658)
chr8 (98-230)||(23154446-23154576)
chr8 (99-274)||(23229136-23229308)
chr8 (56-239)||(22311240-22311433)
chr8 (97-274)||(5851660-5851835)
chr8 (99-187)||(20655930-20656017)
chr8 (99-274)||(26009591-26009766)
chr8 (90-187)||(23835471-23835568)
chr8 (99-187)||(21679360-21679446)
chr8 (99-187)||(25120671-25120758)
chr8 (99-274)||(17283394-17283567)
chr8 (108-187)||(38531808-38531887)
chr8 (129-187)||(21200024-21200082)
chr8 (99-185)||(21695827-21695912)
chr8 (91-184)||(22884016-22884109)
chr8 (99-187)||(17731374-17731461)
chr8 (48-88)||(23638161-23638201)
chr8 (97-168)||(20479838-20479908)
chr8 (99-186)||(39448633-39448719)
chr8 (99-185)||(28543079-28543164)
chr8 (118-168)||(29758504-29758554)
chr8 (107-184)||(11542225-11542301)
chr8 (15-56)||(11542327-11542368)
chr8 (118-187)||(21192587-21192656)
chr8 (208-273)||(23216820-23216885)
chr8 (119-168)||(24387599-24387648)
chr8 (136-188)||(269870-269922)
chr8 (136-188)||(645999-646051)
chr8 (136-188)||(831734-831786)
chr8 (108-168)||(22323409-22323469)
chr8 (99-187)||(22737821-22737907)
chr8 (99-187)||(41243874-41243961)
chr8 (136-188)||(41509151-41509203)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (90-277)||(10239267-10239454)
chr4 (97-277)||(13448875-13449054)
chr4 (97-276)||(19557492-19557671)
chr4 (15-181)||(54365835-54366002)
chr4 (69-239)||(12136103-12136275)
chr4 (99-274)||(41258187-41258360)
chr4 (97-274)||(5407307-5407484)
chr4 (62-277)||(41919044-41919261)
chr4 (97-264)||(13595864-13596029)
chr4 (98-274)||(7187767-7187941)
chr4 (15-125)||(5372874-5372985)
chr4 (97-266)||(38762944-38763112)
chr4 (99-277)||(50224001-50224169)
chr4 (15-122)||(15215994-15216101)
chr4 (99-277)||(47470176-47470346)
chr4 (97-274)||(7966435-7966611)
chr4 (99-230)||(42706909-42707039)
chr4 (15-136)||(15116051-15116171)
chr4 (99-218)||(17378031-17378152)
chr4 (16-132)||(9650147-9650265)
chr4 (158-274)||(18241083-18241198)
chr4 (98-188)||(17213707-17213797)
chr4 (107-168)||(13244551-13244612)
chr4 (99-188)||(30236398-30236486)
chr4 (99-168)||(44054113-44054181)
chr4 (99-167)||(12246079-12246147)
chr4 (99-183)||(12901618-12901701)
chr4 (99-187)||(34198012-34198099)
chr4 (108-187)||(13752154-13752233)
chr4 (91-166)||(19623874-19623949)
chr4 (129-187)||(21961456-21961514)
chr4 (90-168)||(24237156-24237234)
chr4 (129-187)||(41167785-41167843)
chr4 (99-188)||(14867622-14867709)
chr4 (118-187)||(15853145-15853214)
chr4 (118-187)||(18496339-18496408)
chr4 (99-168)||(20813877-20813945)
chr4 (48-88)||(21958105-21958145)
chr4 (99-166)||(53909737-53909803)
chr4 (118-168)||(109693-109743)
chr4 (99-168)||(12838179-12838247)
chr4 (96-132)||(14569707-14569743)
chr4 (48-80)||(20597752-20597784)
chr4 (136-188)||(34393304-34393356)
chr4 (99-187)||(37958885-37958972)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (99-277)||(25713-25891)
scaffold0004 (99-277)||(84580-84747)
scaffold0004 (141-187)||(331055-331101)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (97-277)||(36055-36235)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (15-277)||(6092613-6092864)
chr2 (15-274)||(43640510-43640773)
chr2 (99-274)||(24272211-24272385)
chr2 (15-239)||(29111959-29112186)
chr2 (97-277)||(30994827-30995007)
chr2 (15-167)||(18533604-18533757)
chr2 (15-200)||(19435684-19435875)
chr2 (97-230)||(24868744-24868877)
chr2 (15-181)||(20271159-20271326)
chr2 (18-133)||(24839664-24839779)
chr2 (97-277)||(25132379-25132546)
chr2 (119-274)||(32738626-32738780)
chr2 (15-136)||(19657762-19657882)
chr2 (91-184)||(25593402-25593495)
chr2 (123-239)||(22137681-22137795)
chr2 (99-187)||(22581845-22581932)
chr2 (152-274)||(24089320-24089440)
chr2 (99-168)||(19655207-19655275)
chr2 (99-187)||(28972198-28972285)
chr2 (15-184)||(23614339-23614505)
chr2 (109-187)||(720608-720685)
chr2 (99-168)||(9782741-9782810)
chr2 (120-168)||(269374-269422)
chr2 (99-187)||(4450158-4450245)
chr2 (99-187)||(40642173-40642261)
chr2 (97-168)||(36892613-36892683)
chr2 (177-274)||(19648243-19648339)
chr2 (99-168)||(24296406-24296474)
chr2 (119-168)||(25877888-25877937)
chr2 (48-124)||(45620229-45620305)
chr2 (99-187)||(5110-5196)
chr2 (99-187)||(7319644-7319731)
chr2 (129-187)||(32117-32175)
chr2 (99-187)||(23823338-23823424)
chr2 (99-187)||(23825282-23825368)
chr2 (99-187)||(25303820-25303908)
chr2 (123-187)||(25600100-25600164)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (21-174)||(22897-23050)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (97-274)||(5890-6066)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (97-274)||(6725-6901)
scaffold0327 (99-166)||(4274-4340)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (97-277)||(20278-20459)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (15-274)||(6886-7157)
scaffold0090 (15-184)||(36944-37113)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (15-184)||(20191979-20192148)
chr1 (97-277)||(40438121-40438303)
chr1 (15-277)||(20820586-20820842)
chr1 (99-274)||(5472231-5472404)
chr1 (99-274)||(21193322-21193495)
chr1 (97-274)||(52397821-52397997)
chr1 (15-173)||(78265-78424)
chr1 (15-149)||(33395150-33395285)
chr1 (98-277)||(5770042-5770209)
chr1 (99-277)||(40555535-40555702)
chr1 (97-237)||(49999184-49999324)
chr1 (98-277)||(21041952-21042119)
chr1 (97-201)||(29217326-29217431)
chr1 (99-188)||(41213506-41213594)
chr1 (97-274)||(46143940-46144101)
chr1 (142-277)||(33384083-33384220)
chr1 (97-188)||(18164419-18164511)
chr1 (99-274)||(37235797-37235971)
chr1 (99-274)||(20956873-20957046)
chr1 (99-188)||(22837247-22837335)
chr1 (99-188)||(22837450-22837538)
chr1 (91-184)||(25093090-25093183)
chr1 (99-167)||(5676522-5676589)
chr1 (99-187)||(17021801-17021889)
chr1 (99-183)||(17607174-17607257)
chr1 (99-187)||(36358161-36358248)
chr1 (16-88)||(15806999-15807072)
chr1 (123-168)||(18505592-18505637)
chr1 (123-188)||(27331113-27331178)
chr1 (99-187)||(51658242-51658330)
chr1 (135-187)||(22148263-22148315)
chr1 (99-187)||(22408149-22408236)
chr1 (120-168)||(35053086-35053134)
chr1 (118-168)||(37846371-37846421)
chr1 (123-168)||(9786324-9786369)
chr1 (107-168)||(20895681-20895742)
chr1 (123-187)||(35524359-35524423)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (97-274)||(25805-25980)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (19-173)||(13145-13300)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (119-274)||(18791-18945)
scaffold0138 (99-187)||(24267-24354)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (135-273)||(141152-141290)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (99-274)||(130042-130214)
scaffold0022 (99-187)||(106742-106829)
scaffold0022 (99-187)||(107835-107922)
scaffold0022 (120-187)||(114157-114224)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (97-274)||(104116-104293)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (97-274)||(737-913)
scaffold0174 (15-184)||(22329-22502)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (15-149)||(256550-256684)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (99-274)||(99031-99205)
scaffold0031 (118-187)||(68520-68589)
scaffold0031 (99-187)||(30240-30327)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (99-274)||(25450-25623)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (108-239)||(106461-106592)
scaffold0032 (15-184)||(121728-121898)
scaffold0032 (118-168)||(53876-53926)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (99-230)||(19652-19783)
scaffold0021 (99-230)||(29228-29359)
scaffold0021 (99-187)||(9802-9889)
scaffold0021 (99-167)||(138660-138727)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (15-132)||(15096-15214)
scaffold0231 (96-168)||(15705-15778)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (99-274)||(11597-11770)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (97-277)||(1813-1981)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (99-274)||(1958-2132)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (97-274)||(1409-1585)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (97-274)||(749-924)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (53-183)||(10514-10650)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (99-188)||(99374-99463)
scaffold0003 (207-272)||(99315-99379)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (99-198)||(29339-29438)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (107-188)||(9609-9690)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (98-227)||(4148-4280)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (100-200)||(2874-2974)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (15-121)||(19631-19739)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (27-113)||(3216-3303)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (100-274)||(51472-51645)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (108-185)||(5250-5327)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (98-187)||(12490-12578)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (117-274)||(70161-70316)
scaffold0028 (136-188)||(91047-91099)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (97-274)||(199208-199383)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (121-239)||(31508-31625)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (52-168)||(11586-11702)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (99-272)||(33639-33811)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (99-187)||(8313-8400)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (99-187)||(7225-7312)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (177-272)||(3106-3200)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (99-185)||(14141-14226)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (48-132)||(5636-5721)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (99-184)||(2836-2920)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (98-187)||(2920-3008)
scaffold0409 (98-187)||(11175-11263)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (99-184)||(55686-55771)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (97-168)||(1292-1362)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (108-187)||(5771-5850)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (108-187)||(31702-31781)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (90-173)||(45431-45514)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (21-81)||(18503-18564)
scaffold0338 (123-168)||(6927-6972)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (99-168)||(59810-59878)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (99-188)||(92177-92265)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (136-188)||(7364-7416)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (52-88)||(4303-4339)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (107-187)||(26799-26879)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (136-188)||(45841-45893)
scaffold0102 (99-168)||(37705-37773)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (123-187)||(144914-144978)
[»] scaffold0725 (2 HSPs)
scaffold0725 (192-239)||(7270-7317)
scaffold0725 (129-174)||(7318-7363)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (99-186)||(7476-7562)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (118-164)||(37576-37622)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (118-168)||(249399-249449)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (118-168)||(125303-125353)
scaffold0011 (99-168)||(256814-256882)
[»] scaffold0786 (1 HSPs)
scaffold0786 (123-168)||(5009-5054)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (99-188)||(4712-4800)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (123-168)||(4024-4069)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (15-56)||(8775-8816)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (118-167)||(36341-36390)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (99-168)||(21312-21380)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (129-169)||(6836-6876)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (152-188)||(4876-4912)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (99-187)||(13727-13814)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (21-80)||(24151-24211)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (152-188)||(49716-49752)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (135-187)||(1579-1631)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (99-187)||(26647-26734)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (136-188)||(77517-77569)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (99-163)||(20810-20873)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (96-132)||(247633-247669)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4482690 - 4482428
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  4482690 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgta 4482591  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttag 214  Q
    ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  4482590 aagcttacccccagtgatttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggtgattgcttgg 4482491  T
Q  215 atagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4482490 atagcgggagctatctccgttatcgtttcattagagtcttaggataggctttgatctaggatg 4482428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 21677269 - 21677537
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  21677269 atcatgtgatgctagtattctaggagga-tggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgattgatgtg 21677367  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc-tttcttgagttgctcggtgat 207  Q
    ||||||||||||| ||| |||      |||| |||||||||  ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  21677368 aagcttacccccattggatctgtaatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagactgcgtgcatgattagttgcttttggtgagttgcttggtgat 21677467  T
Q  208 tgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21677468 tgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtctccgtagagtcttaggatagactctgatctaggatg 21677537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28388777 - 28388597
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  28388777 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaggggttttgaccgcctacctgtttatatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgagt 28388678  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28388677 tgcccggtgattgcttggataacgggagctatctccgttatcggttcggtagagtcgtaggatagactatgatctaggatg 28388597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 39293898 - 39294165
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaa-tgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  39293898 atcatgcgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatacatgaaatccttgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 39293997  T
Q  113 taaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt--gctttcttgagttgctcggtgattgc 210  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||    |||  ||||||||| | |||||||    
T  39293998 tgaagcttagccccagtggttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggcagacgaagtgcatgattagtttgattttggtgagttgcttgatgattgc 39294097  T
Q  211 ttagatagtgggagctatcttcgttatcg-cttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||  |||  | ||||| || | |||||||||||||||||||    
T  39294098 ttggatagcgggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcttatggtaggctctgatctaggatg 39294165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14939045 - 14938870
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||    
T  14939045 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgtaggattagttgcttcggtgagt 14938947  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14938946 tgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggtttcttagagtc-taggataggctctgatctagg 14938870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15366638 - 15366463
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||    
T  15366638 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgtaggattagttgcttcggtgagt 15366540  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15366539 tgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggtttcttagagtc-taggataggctctgatctagg 15366463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Original strand, 14278648 - 14278853
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  14278648 atcatatgatgctagtattctgggagggatggttatgtaaatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 14278747  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttcttgagttgctcggtga 206  Q
     ||||||||||| | ||| |||      |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||  |||    
T  14278748 gaagcttacccctagtggatctgtgatggaccacctacctgtctttatggatgggtagacgaagtgcaggactagtttgcttttgggagttgctctatga 14278847  T
Q  207 ttgctt 212  Q
    ||||||    
T  14278848 ttgctt 14278853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28718448 - 28718336
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||     
T  28718448 atcatgtgatgctagaattctagaagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattaatgtg 28718349  T
Q  115 aagcttaccccca 127  Q
    |||||||||||||    
T  28718348 aagcttaccccca 28718336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9641381 - 9641216
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt-gctttct-tga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  9641381 ttgattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctacctgt----atggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgcttttggtga 9641286  T
Q  195 gttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggct 264  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| ||||||    
T  9641285 gttgcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggct 9641216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31499576 - 31499397
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||    
T  31499576 ttgattacgatcgatgtaaagcttacccc-agtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgcttcggtgagt 31499478  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| |||| ||| || ||||  ||||||||||  || ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31499477 tgcttggtgcttgtttggatatcgggagctatcgccgatatcggtttcttagagttgtaggataggctctgatctaggatg 31499397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48345929 - 48345747
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttc 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  48345929 tttacgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatgattttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttg 48345830  T
Q  191 ttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     ||||||||| | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  48345829 gtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggtttcgtaaagtc-taggatagactctgatctagg 48345747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 20587478 - 20587655
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||   |||||    
T  20587478 ttgattttgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgacatgcaggattagttgattcggtgagt 20587577  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatc-gcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | |||| |||||| ||||  |||||||||||||  |||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20587578 tgtttggtgcttgcttggatatcgggagctatcttcaatatcagtttccttagagtc-taggatagactctgatctagg 20587655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 276
Target Start/End: Original strand, 18920958 - 18921105
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagata 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||           |||||| ||||    
T  18920958 cttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgag-----------ttgcttggata 18921046  T
Q  218 gtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggat 276  Q
    | |||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18921047 gcgggagcaatctctgttatcggttccgtagagtcgtaggataggctctgatctaggat 18921105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9609577 - 9609403
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||   |||||||    
T  9609577 gattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttacttcggtgagttg 9609478  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9609477 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcgattttgtagagtc-taggataggctctgatctagg 9609403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9837149 - 9836975
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||   |||||||    
T  9837149 gattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttacttcggtgagttg 9837050  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9837049 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcgattttgtagagtc-taggataggctctgatctagg 9836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 9322903 - 9322993
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgcttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9322903 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatcgatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttt 9322993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 9058462 - 9058633
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| |    
T  9058462 gattatgattgatgtaatgcttaccct--agtgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagtgg 9058559  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9058560 ctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg-tgtcttagagtc-taggataggctttgatctagg 9058633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 4072746 - 4072856
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4072746 atcatgtgatgttagtattttaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaacccttgaatgcttatgttg-tttatgttgattatgattgatgt 4072844  T
Q  114 aaagcttacccc 125  Q
     ||||| |||||    
T  4072845 gaagctaacccc 4072856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 15980284 - 15980539
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||           |||| |||||| |||||||||||     
T  15980284 tcatgtaatgttaaaattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgatatccttgaatt----------tttatgttgataatgattgatgtg 15980373  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtgattgctt 212  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |  |||   |||||||||||   || |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  15980374 aagcttacccccagtggtttcgaccgcctacctctttgtaaaaatgggtagacgttttgtaggattagattgctttcggtgagttgcttggtgattgctt 15980473  T
Q  213 agatagtgggagct-atcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
     ||||| ||||||| |||| |||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15980474 ggatagcgggagctaatctccgttatcggttctttagagtcttagagtaggctctgatctaggatg 15980539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13460674 - 13460493
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgcttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||  |||| |||| ||| |||||||    
T  13460674 tttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtttgcttt 13460575  T
Q  190 c-ttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagct-atcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgat 269  Q
    |  |||||| || ||||||| ||| || || ||||||| |||| |||||||| |||  ||||||| |||  |||||| ||||    
T  13460574 cggtgagtttcttggtgattccttggacagcgggagctaatctccgttatcggttctttagagtcttagattaggctatgat 13460493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4437211 - 4437032
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || ||| | ||||||| || |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||   |||||    
T  4437211 ttgattttgattgatgtaaatcttacccctagtgattttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagacaacgtgtaggattagttgcttcagtgagt 4437112  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| | || ||| || ||||   |||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4437111 tgcttgatgcttg-tttgatatcaggagctatctccggtatcgatttcttagagtcttaggattggctctgatctaggatg 4437032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12246101 - 12245989
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacg-ttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  12246101 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgtgtatgtatatgtgttatgcatgagatccttgaatgtttatgattatttatgtttgattatgattgatg 12246002  T
Q  113 taaagcttacccc 125  Q
    | ||||| |||||    
T  12246001 tcaagctaacccc 12245989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16915984 - 16915896
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16915984 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 16915896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5617790 - 5617616
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||   |||||||    
T  5617790 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgatgagttgcttcagtgagttg 5617691  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || ||| |  ||||  |||||||||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5617690 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctcaggtatcggtttcgtagggtc-taggataagctctgatctagg 5617616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 34242979 - 34243155
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||   |||||    
T  34242979 ttgattatgattgatgtaatgtttaccccgagtggttttgactgcctacctgtttgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgcttcagtgagt 34243078  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | | || ||| || ||||  ||||||||||  |  ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34243079 tgtttgatgcttggttggatatcgggagctatccccagtatcggtttcgtagagtc-taggataggctctgatctagg 34243155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13388321 - 13388232
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttct-gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  13388321 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 13388232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19065623 - 19065486
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacc 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||| |||||     
T  19065623 tatgtatatgtgatatgcatgaaatccttaaatgcttatgtttgtttatgatgattatgattgatgtgaagctaacccacagtggttttgaccgcctact 19065524  T
Q  147 tgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  19065523 tgtttgtattaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 19065486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4444612 - 4444433
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| | ||||| |||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||    
T  4444612 ttgattttgattgatgtaaatcttacccctagtggttttgatcgcctacatgtgtgtatagatgggtagacgacgtgcaggattagttgcttcggtgagt 4444513  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| |||| ||| || ||||  ||||||||||  |  | ||| || | |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  4444512 tgcttggtgcttg-ttggatatcgggagctatcaccagtttcgttttcttagaatcttaggattggctctgatctaggatg 4444433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15629017 - 15628930
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15629017 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgatgtgtaggattagttgct 15628930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 17229946 - 17230034
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  17229946 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgagtagacgctgtgcaggattagttgct 17230034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 49049710 - 49049797
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  49049710 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 49049797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13452532 - 13452409
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgcttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||| |||| | | |||||||    
T  13452532 tttatgttgattatgattgatgtaaagtttatccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaattggtagacaaagtgcaggagtggtttgcttt 13452433  T
Q  190 c-ttgagttgctcggtgattgctt 212  Q
    |  ||||||||| |||||||||||    
T  13452432 cggtgagttgcttggtgattgctt 13452409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 15914267 - 15914345
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  15914267 tgatgtaatacttacccccagtggtt-tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 15914345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 16572040 - 16572125
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16572040 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacgttgtgaaggattagttg 16572125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16593622 - 16593537
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16593622 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacgttgtgaaggattagttg 16593537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3135563 - 3135495
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  3135563 tgtgatgttagtattctaggagggatgtgtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttaaatgcttatg 3135495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 12249930 - 12250017
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  12249930 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 12250017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12753185 - 12753098
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  12753185 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgct 12753098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 15824358 - 15824445
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  15824358 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgaaggattagttgct 15824445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 14302613 - 14302675
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatg 80  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14302613 tgtgatgttaatattctaagagggatggttatgtatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatg 14302675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Original strand, 16921787 - 16921837
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  16921787 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacatacctgt 16921837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 10862761 - 10862861
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||  |||  |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  10862761 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggtttcgactgcctacctgtctgtatggattggtagacgttgtgcaggattagttgctttgatgagttg 10862859  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  10862860 ct 10862861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 13039108 - 13039169
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  13039108 ttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacg 13039169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13375982 - 13375930
Alignment:
Q  135 tgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  13375982 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 13375930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 3193870 - 3193943
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  3193870 tttatgttgattatgattgatgtgaagctta-ccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtag 3193943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Original strand, 11582845 - 11582895
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11582845 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 11582895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16206441 - 16206387
Alignment:
Q  27 tagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgc 81  Q
    |||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16206441 tagtattctaggaatattgagtatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgc 16206387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Original strand, 16370201 - 16370286
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  16370201 tgattatgattgatgtgaagctaatccc-agtgggtttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacggagtgcaggagtagtt 16370286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 141860 - 141815
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  141860 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 141815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 45455568 - 45455636
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45455568 gattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 45455636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16917883 - 16917835
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacct 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16917883 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacct 16917835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 29162665 - 29162927
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaa 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||    
T  29162665 tcatgtgatgatagtattctaggagggatgactatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattaggactgatgtaa 29162764  T
Q  116 agcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc-tttcttgagttgctcggtgattgcttag 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  29162765 agcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtggacgaagtgcaggactagttgcttttggtgagttgcttggtgattgcttgg 29162864  T
Q  215 atagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29162865 atatcgggagctatctccgttatcgtatccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatg 29162927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21929859 - 21929637
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21929859 tgtgatgatagtattctaggagagatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatgtttgcttatgttgattatgattgatgtaaacc 21929760  T
Q  119 ttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtgattgcttagat 216  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||    
T  21929759 ttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaaatgcatgattagtttgctttcggtgagttgcttggtgattgcttggat 21929660  T
Q  217 agtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  21929659 agtgggagctatctccgttatcg 21929637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16131681 - 16131418
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||    
T  16131681 atgtgatgttagtattctaggagggatggatatgtatatgttttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaa 16131582  T
Q  117 gcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgc-tttcttgagttgctcggtgattgcttag 214  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| || |    
T  16131581 gcttatccccagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgcttttggtgagttgcttggtgattgtttgg 16131482  T
Q  215 atagtgggagctatcttcgttatcg-cttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||   |||||||||| ||||||||  |||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16131481 ataacaggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcttagggtaggctctgatctaggatg 16131418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Original strand, 22595494 - 22595674
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc-tttcttgagt 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||    
T  22595494 tgattatgtttgatgtcaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttttgatgagt 22595593  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22595594 tgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatg 22595674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 31469375 - 31469555
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  31469375 ttgattatgattgatgtaaagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtctctatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 31469474  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    | || |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31469475 tacttggtgtttgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcgtaggatgggcactgatctaggatg 31469555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19852600 - 19852426
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||   |||||||    
T  19852600 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgacatgcaagattagttgcttgggtgagttg 19852501  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19852500 cttggtgattgcttggatagcgggagctatcttcgttatcatttcattagagtc-taggataggctctgatctagg 19852426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 277
Target Start/End: Original strand, 22467942 - 22468120
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg-ctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||  |||||||    
T  22467942 attatgattgatgtaaagcttaccctcagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgattttggtgagttg 22468041  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  |||| |||||||| ||| ||||||    
T  22468042 cttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttccttagagttttagggtaggctctaatcaaggatg 22468120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 12310843 - 12311017
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  12310843 gattatgattgatgtaaaacttaccctcagtggttttgaccgcctacctgtcggtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttctttggtgagttg 12310942  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12310943 ctcggtagttgcttggatagtgggagctatctccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatatagg 12311017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34965273 - 34965095
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt-gctttct-tgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||   ||||    
T  34965273 gattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgacgtgcaagattagtttgcttttggtgag 34965174  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34965173 ttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggctctgatctagg 34965095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 230
Target Start/End: Original strand, 33540069 - 33540202
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||  |||||    
T  33540069 ttgattatgattgatgtaaagcttacgcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgatttggtgagt 33540168  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  33540169 tgctcggtggttgcttggatagcgggagctatct 33540202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19670785 - 19670669
Alignment:
Q  161 ggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggata 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19670785 ggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttgctcggtgattgcttggatagagggagttatctccgttatcggttctgtagagtcgtaggata 19670686  T
Q  261 ggctctgatctaggatg 277  Q
    | |||||||||||||||    
T  19670685 gactctgatctaggatg 19670669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22846455 - 22846282
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||  |||||||    
T  22846455 gattatgattgatgtaaagcttatcccaagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcgttggtgagttg 22846356  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22846355 ctcggtggttgcttggatagcggtagctatctccgttatcg-tgtcttagagtc-taggataagctctgatctagg 22846282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Original strand, 17085393 - 17085523
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |   ||||||    
T  17085393 tgattatgtttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-tcggtgagtt 17085491  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17085492 gctc-gtggttgcttggatagtgggagctatct 17085523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 15006485 - 15006654
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||     
T  15006485 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagaggttttgaccgcctacatgtctgtacggatgagtagacgaagtgcatgattagttgcttttgtgag- 15006583  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
              |||||| ||||| |||| |||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15006584 ----------ttgcttggatagcgggacctatctccattatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatg 15006654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 223
Target Start/End: Original strand, 17375554 - 17375688
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctt 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17375554 atttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctt 17375652  T
Q  189 tc-ttgagttgctcggtgattgcttagatagtggga 223  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17375653 tcggtgagttgcttggtgattgcttggatagcggga 17375688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23219728 - 23219619
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttg-aatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  23219728 atcatgtgatgcttgtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 23219629  T
Q  113 taaagcttac 122  Q
    | ||||||||    
T  23219628 tgaagcttac 23219619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14150911 - 14150798
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgag 195  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||||    
T  14150911 gttgattatg-ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgag 14150814  T
Q  196 ttgctcggtgattgct 211  Q
    ||||||||||||||||    
T  14150813 ttgctcggtgattgct 14150798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 4174466 - 4174627
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttga------tttacgttgattatgat 107  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| || |      |||| ||||||||||||    
T  4174466 atcatgtgatgttagttttatagaagggatgagtatgtatatgtgatatacatgaaatccttgaatgcttatctttaaaattgtttatgttgattatgat 4174565  T
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggt-tctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  4174566 tgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 4174627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 4230095 - 4230256
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttga------tttacgttgattatgat 107  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| || |      |||| ||||||||||||    
T  4230095 atcatgtgatgttagttttatagaagggatgagtatgtatatgtgatatacatgaaatccttgaatgcttatctttaaaattgtttatgttgattatgat 4230194  T
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggt-tctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  4230195 tgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 4230256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21621440 - 21621355
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  21621440 gattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtt 21621355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 940964 - 941052
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  940964 gattatgaatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 941052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6092857 - 6092729
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| |   ||||||    
T  6092857 tgattatgtatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattacttgc-tcggtgagtt 6092759  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctat 228  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  6092758 gctc-gtggttgcttggatagtgggagctat 6092729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Original strand, 31163070 - 31163144
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcat-gaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  31163070 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgagttatgcataaaatccttgaatgcttatgtt 31163144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Original strand, 17858218 - 17858311
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  17858218 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 17858311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25649586 - 25649517
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  25649586 gattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtttggatgggtagacg 25649517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 7829751 - 7829838
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7829751 gattatgat-gatgtaatacttacccctaatggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 7829838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 18383510 - 18383598
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18383510 gattatgattgatgtaatacttaacccgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 18383598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17787761 - 17787691
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17787761 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 17787691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25917994 - 25917909
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  25917994 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggagtagttg 25917909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14352685 - 14352652
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgc 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352685 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgc 14352652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Original strand, 16889644 - 16889728
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16889644 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagtt 16889728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 15080708 - 15080772
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  15080708 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 15080772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29603812 - 29603733
Alignment:
Q  194 agttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29603812 agttgcttggtgcttgctcagatatcgggagctatctccggtattggttacatagagtc-taggataggctctgatctagg 29603733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22866413 - 22866334
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  22866413 tgatgtaatacttacccctagtggttttgacctcctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgcatgattagttgct 22866334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Original strand, 25746145 - 25746215
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25746145 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 25746215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29603895 - 29603805
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||    
T  29603895 ttgattatgattgatgtaaagttta-ccgcagtggttttgactgcctacatgtctgtatggacgggtagacgacgtgcatgtttagttgctt 29603805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6777815 - 6777774
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6777815 tatgtatatgtgctatgcatgaaatccttgaatgcttatgtt 6777774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 25646773 - 25646861
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||| |||||    
T  25646773 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagatgctt 25646861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32896295 - 32896227
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32896295 gattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 32896227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16104863 - 16104776
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  16104863 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 16104776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 25369282 - 25369369
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||   |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25369282 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctatctaaatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 25369369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33323031 - 33322967
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  33323031 ccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtaaacgctgtgtaggattagttgct 33322967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 277
Target Start/End: Original strand, 23236241 - 23236422
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||    
T  23236241 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttagccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgag 23236340  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23236341 ttgcttggtgattgcttagatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatg 23236422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 3420666 - 3420842
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  3420666 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagt 3420765  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3420766 tgtttggtgattgcttggatagcggaagctatctccgttatcgtttccttagagtc-taggataggttctgatctagg 3420842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19872261 - 19872074
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc-ttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  19872261 tttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagttgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttt 19872162  T
Q  190 cttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
      ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| | |||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19872161 ggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccattattgtttctttagagtcttagggtaggctctgatctacgatg 19872074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11964025 - 11963757
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  11964025 atcatgtgatgctagtagtctaggagggatgattatgtatatatgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtg 11963926  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgc-tttcttgagttgctcggtga 206  Q
    ||||||||||||| ||| |||      |||| |||||||||  |||||  |  |||||||  ||| |||||||| |||| |||  ||||||||| |||||    
T  11963925 aagcttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtttgtatgacttagtagacggggtgcaggattagtttgcttttggtgagttgcttggtga 11963826  T
Q  207 ttgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  11963825 ttgcttggatagcgggagctatcttcgttatcgtttcc--tgagtctgagggtagactctgatctaggatg 11963757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6455042 - 6454867
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||    
T  6455042 ttgattatgattg-tataaagcttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacggagtgcagggttagttgctttggtgagt 6454944  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  6454943 tgcttggtggttgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtgtccttaaagtc-taggataggctctgatctagg 6454867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 24227689 - 24227953
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgattta---cgttgattatgattgatgta 114  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     |||||||||||||||||     
T  24227689 atgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcatatgtttgtttattttattgattatgattgatgtg 24227788  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgatt 208  Q
    ||||||||||||| || || |      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||   ||||||||| | || ||    
T  24227789 aagcttacccccagtgtttatgtgatggaccacctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtgcaggattagttgattcggtgagttgcttgatgttt 24227888  T
Q  209 gcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| ||||| || | ||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  24227889 gctcggatatcgggagctatcttcggtatcgatttcgtagagtc-tttgatagactctgatctagg 24227953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24082450 - 24082276
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  24082450 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgactgcctacctatctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 24082351  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  24082350 cttgatggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccgtagagtc-tacgataagctctgatctagg 24082276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 26561621 - 26561797
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||    
T  26561621 ttgattatgattgatgtaaagcttaccctcagtggatttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattaattgctttggtgagt 26561720  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||  |    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26561721 tgcttggtgattggttggatagcgggagctatctccattatcattcgtttagagtc-taggataggctctgatctagg 26561797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 14345412 - 14345644
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||     
T  14345412 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaatcctttaatgtctatgtttgtttatgttgattatgattaatgtg 14345511  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtga 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||      |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||   ||| | |||||| ||||||||  ||||||| | |||||    
T  14345512 aagcttaccccaaatggatctgtgatggaccgcctacttgtttgtatgaatgggtagacagcgtgcaagattagtttgctttcggtgagttgtttggtga 14345611  T
Q  207 ttgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14345612 ttgcgtggatagcgggagctatctccgttatcg 14345644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 5453053 - 5453231
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  5453053 atcatgtgatgctagtattctcggagggatggttatgtatatgtcttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 5453152  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctg------accacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |  |||||||| ||||| ||||      ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  5453153 atacttaccccaaatggatctgtgatgaaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgct 5453231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 16837555 - 16837678
Alignment:
Q  61 tatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16837555 tatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattataattgatgtaaagtttactcccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatg 16837654  T
Q  161 ggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||||||||||||| |||| |||||    
T  16837655 ggtagacgaagtgcaggagtagtt 16837678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29912385 - 29912209
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  29912385 ttgattatgattgatgtaaagcttacccctagtggtttggaccatctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtacagggttagtcgcttttgtgagt 29912286  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||   ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29912285 tgcttggtggttgcttggatagcggaagccatctccgttatcaagtccttagagtc-taggataggctttgatctagg 29912209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 20456319 - 20456429
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20456319 atcatgtgatgctagtattataggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 20456418  T
Q  114 aaagcttaccc 124  Q
     ||||||||||    
T  20456419 gaagcttaccc 20456429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 5623263 - 5623366
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||    
T  5623263 ttgattatgattgatgtaaagcttacacctaatggttctgaccacctacttgtcagtatggatgggtaaacgaagtgcatgattagtttctttggtgagt 5623362  T
Q  197 tgct 200  Q
    ||||    
T  5623363 tgct 5623366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 37189952 - 37190126
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    |||||||    
T  37189952 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgttccggtgagttg 37190051  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     | | || ||| || ||||  ||||||||||| || ||||| ||   ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37190052 attgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtagggtc-taggataggctctgatctagg 37190126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7726932 - 7726845
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7726932 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatagatgggtagacgatgtgcaggattagttgct 7726845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13793472 - 13793384
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||    
T  13793472 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggataaacgctgtgcaggattagttgct 13793384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 11765500 - 11765573
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgt 87  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11765500 atcatgtgatgctagtattataggagggattgttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgt 11765573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21615351 - 21615259
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  21615351 tttatgttgattatgattgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtt 21615259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 11338789 - 11338876
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  11338789 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 11338876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23453197 - 23453108
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgcttt 189  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  23453197 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttccttt 23453108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23460441 - 23460352
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgcttt 189  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  23460441 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttccttt 23460352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23464702 - 23464613
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgcttt 189  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  23464702 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttccttt 23464613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Original strand, 33628106 - 33628287
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttct--tgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||  |||||| |  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |  ||| |    
T  33628106 gattatgattgatgtaaagcttatcttcagtggttttgaccgtctacctatttgtataaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgtttttggtgaat 33628205  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttcc-atagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||  | ||||| || | |||||||||||||| ||||    
T  33628206 tgtttggtgattgcttggatagcgggagttatctccgttattggttccttttgagtcttatggtaggctctgatctaagatg 33628287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21392445 - 21392358
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  21392445 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 21392358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 24185124 - 24185211
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  24185124 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgct 24185211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4863566 - 4863496
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4863566 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 4863496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28257796 - 28257726
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28257796 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 28257726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24470568 - 24470500
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24470568 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 24470500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 21228219 - 21228287
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21228219 gattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtcaaccaacctgtctgtatggatgggtagac 21228287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20710762 - 20710717
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20710762 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 20710717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 27185693 - 27185754
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||  |||||||||| || || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27185693 ttgatgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 27185754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28888179 - 28888134
Alignment:
Q  143 tacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  28888179 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 28888134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 80
Target Start/End: Original strand, 10178960 - 10178992
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatg 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10178960 tatgtatatgtgctatgcatgaatctttgaatg 10178992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11579893 - 11579841
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  11579893 gaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 11579841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15988938 - 15988685
Alignment:
Q  27 tagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttaccccc 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15988938 tagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgtttatatttgcttatgttgattatgattgatgtaaagcttaccccc 15988839  T
Q  127 aatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggag 224  Q
    | ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15988838 agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctttcggtgagtttcttggtgattgcttggatagtgggag 15988739  T
Q  225 ctatcttcgttatcg-cttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| ||||||||  |||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15988738 ctatctccgttatcgttttcttttgagtcatagggtaggctctgatctaggatg 15988685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8602700 - 8602532
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  8602700 atcatatgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgta 8602601  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagt 183  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8602600 aagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagt 8602532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 273
Target Start/End: Original strand, 14819681 - 14819856
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  14819681 ttgattatgattgatgtaaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 14819780  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctag 273  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14819781 tgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctag 14819856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 6817387 - 6817567
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  6817387 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgctatgcataaatccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgattgatgtg 6817486  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgcttt 189  Q
    ||||||||||| | ||| |||      |||| |||||||||  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  6817487 aagcttacccctagtggatctttgatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagttgcttt 6817567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 17320410 - 17320591
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg-ctttcttgag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | ||    
T  17320410 ttgattatgattgatgtaaagcttaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgtttttgataag 17320509  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17320510 ttgcttgatgattgcttggatattgggagctatctccgttgtcgtttccttagagtcctagggtaggctctgatctaggatg 17320591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 269
Target Start/End: Original strand, 6230494 - 6230665
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  6230494 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 6230593  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgat 269  Q
    |||| | || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6230594 tgcttgctggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtctgtagagtc-taggataggctctgat 6230665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 14182155 - 14182383
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  14182155 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgagtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 14182254  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtgattgct 211  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||  ||| |||| || |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  14182255 gaagctaacccccaatggttttgaccgcctatctgtttgtatgaatgggtagacgaagtatagggttagtttcctttcggtgagttgcttggtgattgct 14182354  T
Q  212 tagatagtgggagct-atcttcgttatcg 239  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  14182355 tggatagcaggagctaatctccgttatcg 14182383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Original strand, 15551649 - 15551826
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15551649 atcatgtgatgttattattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 15551748  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
     ||||||||||||  ||| |||      |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15551749 gaagcttaccccctgtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgtatgattagttg 15551826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 277
Target Start/End: Original strand, 43429369 - 43429551
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc-tttcttga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||    
T  43429369 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatagatgggtagacgaagtacaggattagttgcttttggtga 43429468  T
Q  195 gttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43429469 gttgcttggtgattgcttggatatcgggagatatctccgttattgtttccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatg 43429551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 4147531 - 4147704
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgc 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  4147531 attatgattcttgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttgc 4147630  T
Q  200 tcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4147631 ttggtggttgcttagatagcgggagctatctccgttatcgtgtcagtagagtc-taggatagactctgatctagg 4147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 4164081 - 4164256
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||||    
T  4164081 ttgattttgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaaggttagttgctttggtgagt 4164179  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4164180 tgcttggtggttgcttggatagtgggaactatctccgttatcgtgtccgtagagtc-taggatagactctgatctagg 4164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17391402 - 17391243
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  17391402 atcatgtgatgttagtattctaggaaggatgagtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgttaatgttgattatgattgatgt 17391303  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtg 173  Q
     ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  17391302 gaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtg 17391243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 17760557 - 17760816
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||     
T  17760557 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgttcatgttgattatgattgatgtg 17760656  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtga-t 207  Q
    ||||||||||| | ||| |||      ||||   ||||| |  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||  |||          | ||||| |    
T  17760657 aagcttacccctagtggatctgtgatggaccggttacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttgttt----------ttggtgagt 17760746  T
Q  208 tgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17760747 tgcttgcatagcgggagctatcttcgttatcgcttccttagagtcttaggctaggctctgatctaggatg 17760816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 19061877 - 19062136
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||     
T  19061877 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgttcatgttgattatgattgatgtg 19061976  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtga-t 207  Q
    ||||||||||| | ||| |||      ||||   ||||| |  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||  |||          | ||||| |    
T  19061977 aagcttacccctagtggatctgtgatggaccggttacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttgttt----------ttggtgagt 19062066  T
Q  208 tgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19062067 tgcttgcatagcgggagctatcttcgttatcgcttccttagagtcttaggctaggctctgatctaggatg 19062136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 25106101 - 25106270
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||     
T  25106101 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgtg 25106200  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||  || || ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  25106201 aagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtttgtgtgaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 25106270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 277
Target Start/End: Original strand, 5230414 - 5230624
Alignment:
Q  69 aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||     
T  5230414 aatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttacccgtagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggaagggtagaca 5230513  T
Q  169 aagtggaggattag-ttgc-tttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctct 266  Q
    ||||| |||||||| |||| |||  ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| |||| | ||||| |||| ||||||||    
T  5230514 aagtgcaggattagtttgcttttggtgagtggcttgatgattgcttggataacgggagctatctccattatcgtttcctttgagtcttagggtaggctct 5230613  T
Q  267 gatctaggatg 277  Q
    |||||||||||    
T  5230614 gatctaggatg 5230624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12950987 - 12950728
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  12950987 tgtgatgctagtattctaggatggatggttatgtatatgggttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgtaatac 12950888  T
Q  119 ttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgctt 212  Q
    ||||||||| ||| |||      |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||| |||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  12950887 ttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatagatgggtaaacgttgtgcaggattaattgctttggtcagttgcttggtggttgctt 12950788  T
Q  213 agatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     |||||   ||||||||| || ||| | |  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12950787 ggatagcaagagctatctccgctattg-tgtcttagagtc-taggataggctctgatctagg 12950728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 31414399 - 31414517
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  31414399 atcatgtgatgctagtattctacgagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaattcttgcatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatgta 31414498  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt 133  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31414499 aagcttacccccaatggtt 31414517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 38813159 - 38813269
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  38813159 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 38813258  T
Q  115 aagcttacccc 125  Q
    |  ||||||||    
T  38813259 atacttacccc 38813269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41659941 - 41659778
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||       
T  41659941 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattaatcgctttggtgag--- 41659845  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
            |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41659844 --------ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtc-taggatagactctgatctagg 41659778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 239
Target Start/End: Original strand, 33371202 - 33371344
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||| |  |||||    
T  33371202 ttgattatgattgatgtaaagcttaccaccagtggttttgaccgcctaccggtctgtatggatgagtagacgtcgtgtatgattagttgctctggtgagt 33371301  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  33371302 tgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 33371344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 37918661 - 37918826
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaa-tgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  37918661 atcatgtgatgctggtattttaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaattattgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 37918760  T
Q  113 taaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggagga 178  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37918761 taaagcttacccccagtggtttcgaccgcctaccagtttgtatgaatgggtaaacgaagtgcagga 37918826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 21168550 - 21168653
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||    
T  21168550 ttgattatgattgatgtaaagcttacacctaatggttctgaccacctacttgtcagtatggatgggtaaacgaagtgcatgattagtttctttggtgagt 21168649  T
Q  197 tgct 200  Q
    ||||    
T  21168650 tgct 21168653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18968413 - 18968238
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | || || ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||  |||||    
T  18968413 ttgattatgattgatgtgaatcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatga-tagacgacgtgcatgattagttgctttggtgagt 18968315  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| | || |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18968314 tgctcggtggttgcttagacaacgggagctatctccattgtcgtgtccttagagtc-taggatatgctctgatctagg 18968238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11636846 - 11636762
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggatta 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||||    
T  11636846 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatggttatacgaagtgcaggatta 11636762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 38378035 - 38378194
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |        
T  38378035 atcatgtcatgttagtattgtaggagggatgtttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgatag---- 38378130  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggagga 178  Q
     ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  38378131 -aagcttatccccagtggttttgaccgcctacccgtttgtatgaatgagtagacggagtgcagga 38378194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17202972 - 17202884
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  17202972 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 17202884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34558201 - 34558027
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||| || |||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||   |||||||    
T  34558201 gattatgattgatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcccacctttctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttcggtgagttg 34558102  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34558101 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcagtttcatagagtc-taggataggctctgatatagg 34558027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12020257 - 12020169
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  12020257 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 12020169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10902802 - 10902725
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10902802 tttatgttgattatgattgatatgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 10902725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 187
Target Start/End: Original strand, 11330846 - 11330914
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  11330846 ttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 11330914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14296743 - 14296656
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  14296743 gattatgat-gatgtaacacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgct 14296656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14302370 - 14302283
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  14302370 gattatgat-gatgtaacacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgct 14302283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15548841 - 15548754
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  15548841 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 15548754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17137712 - 17137625
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  17137712 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 17137625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 184
Target Start/End: Original strand, 40041356 - 40041500
Alignment:
Q  43 atggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaa-tgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagctta-cccccaatggttctgacc 139  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  40041356 atggttatgtatgtgtgttatgcatgaaatccttgaaatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccccccagtggttttgagc 40041455  T
Q  140 acctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
     ||||| |||  ||||| ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  40041456 gcctacttgtttgtatgaatgggtagaccgagtgcaggagtagtt 40041500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 47786722 - 47786809
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  || ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47786722 gattatgat-gatgtaatactaacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 47786809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 12563392 - 12563471
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  12563392 tgatgtaatacttaccccaagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 12563471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40937948 - 40937869
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40937948 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgtaggattagttgct 40937869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 6148710 - 6148778
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6148710 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 6148778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 14523265 - 14523353
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  14523265 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgctt 14523353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30204709 - 30204621
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  30204709 gattatgat-gatgtaatacttactcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgctt 30204621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39654176 - 39654108
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  39654176 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 39654108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 11199402 - 11199489
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||    
T  11199402 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcatgattagttgct 11199489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 53900472 - 53900536
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  53900472 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 53900536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25769523 - 25769460
Alignment:
Q  124 cccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25769523 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 25769460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 200
Target Start/End: Original strand, 31416132 - 31416191
Alignment:
Q  141 cctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgct 200  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  31416132 cctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgagttgct 31416191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19230313 - 19230263
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19230313 cttacccccagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacg 19230263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 11517295 - 11517371
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtg 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11517295 gttgattatgattgatgtgaagctaacccc-aatgattttgaccgcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtg 11517371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15515898 - 15515766
Alignment:
Q  141 cctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgc 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| | || ||| |  ||||  ||||||||||| || |||||     
T  15515898 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcgg 15515799  T
Q  241 ttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |    ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15515798 tgttgtagagtc-taggatagactctgatctagg 15515766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45581095 - 45581046
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45581095 ttacccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 45581046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 14061097 - 14061184
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  14061097 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgactacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgct 14061184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14287336 - 14287249
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  14287336 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctttatggatgggtagactttgtgcaggattagttgct 14287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15874497 - 15874434
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  15874497 ccccaatggtt-tgaccgccaacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 15874434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 12490701 - 12490752
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  12490701 gaccacctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 12490752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2045589 - 2045539
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2045589 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 2045539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8022110 - 8022068
Alignment:
Q  149 tccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttct 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8022110 tccgtatggatgggtagacgacgtgcaagattagttgctttct 8022068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10736819 - 10736769
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10736819 cttacccccagtggttttaaccacctatctgtctgtatggatgggtagacg 10736769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 188
Target Start/End: Original strand, 17536933 - 17536999
Alignment:
Q  122 cccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  17536933 cccccagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgctt 17536999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 18008985 - 18009043
Alignment:
Q  129 tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18008985 tggttttgaccgcctacctgtctgtatgtatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 18009043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35121916 - 35121866
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35121916 cttaccccaagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 35121866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 183
Target Start/End: Original strand, 11884089 - 11884153
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagt 183  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  11884089 cttacccctagtggtt-tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagt 11884153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 22146132 - 22146200
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22146132 gattatgat-gatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 22146200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 50113978 - 50114046
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50113978 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgactgtctacctgtctgtatggatgggtagacg 50114046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 277
Target Start/End: Original strand, 6817589 - 6817645
Alignment:
Q  221 ggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||||||| | |||||| || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6817589 ggagctatctccattatcgtttgcttagagtcttagggtaggctctgatctaggatg 6817645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8022248 - 8022184
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatg 80  Q
    |||||||| |||||||||||||||    ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  8022248 tcatgtgaagttagtattctaggaatgttgggtatgtatattcgatatgcatgaatccttgaatg 8022184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 55443735 - 55443818
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagt 183  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  55443735 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgctgtgcaggattagt 55443818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 3543 - 3723
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  3543 ttgattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagaattagttgctttggtgagt 3642  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3643 tgctcggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 3723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 24554408 - 24554588
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  24554408 ttgattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttaaccgcttacctttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagt 24554507  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24554508 tgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatg 24554588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20708128 - 20707948
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||    
T  20708128 ttgattatgattgatgtagagcttactcccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagaattagtttctttggtgagt 20708029  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20708028 tgcttggtgattgtttggatagcgggagctctctccgttatcgtttccttagtgtcttaggataggctctgatctaggatg 20707948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17264928 - 17264658
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  17264928 atcatatgatgctagtattctaggaggggtgattatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgattgatgtg 17264829  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgc-tttcttgagttgctcggtga 206  Q
    ||||||||| ||| ||| |||      |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||  | || ||| |||| |||  |||||| || | |||    
T  17264828 aagcttacctccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacaaagtacatgactagtttgcttttggtgagtttcttgatga 17264729  T
Q  207 ttgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17264728 ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggctctgatctaggatg 17264658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 19333780 - 19334012
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |     
T  19333780 atcatgtgatgctaggattttaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgcttgtttatgttgattatgattgatatg 19333879  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtga 206  Q
    ||| ||||||| | ||| |||      || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  19333880 aagtttacccctagtggatctgtgatggatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctttcggtgagttgcttggtga 19333979  T
Q  207 ttgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  19333980 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcg 19334012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24266332 - 24266156
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  24266332 ttgactatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatggatagacgaagtgcagggttagatgctttcgtgagt 24266233  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24266232 tgcttggtggttgctttgatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctttgatctagg 24266156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24237440 - 24237270
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24237440 atcatgtgatgttagtattataggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatctttgaatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 24237341  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  24237340 gaatcttacccccaatggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 24237270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 22499136 - 22499317
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt-gctttct-tga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||   | |    
T  22499136 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgg-tagacgaagtgcaggattagtttgcttttggtta 22499234  T
Q  195 gttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  22499235 gttgcttggtgattgcttggatagagggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtagactctgatctaggatg 22499317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 45561445 - 45561680
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgattta---cgttgattatgattgat 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     |||||||||||| ||    
T  45561445 atcatgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcttatgtttgtttattttattgattatgattaat 45561544  T
Q  112 gtaaagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggatt-agttgc-tttcttgagttgctcgg 203  Q
    |  ||||||||||||| ||| |||      |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||  ||||||||| ||    
T  45561545 gcgaagcttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattaatttgcttttggtgagttgcttgg 45561644  T
Q  204 tgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  45561645 tgatcgcttggatagcgggagctatctctgttatcg 45561680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 21233864 - 21234044
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtcc-gtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgag 195  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||||    
T  21233864 ttgattacgattgatgtaaaacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttttgtatggatgggtagatgaagtgcatgattagttgctttggtgag 21233962  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  21233963 ttgctcagtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcgtatgataagctctaatctaggatg 21234044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33170590 - 33170411
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc-tttcttgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||    
T  33170590 gattatgattgatgtaaagcttacgccaagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattaattgcttttggtgagtt 33170491  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||| | |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  33170490 gcttggtgattgcttggatatcgggagctatctccattattgtttccttagagtcttagggtagactctgatctaggatg 33170411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25293952 - 25293774
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  25293952 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatacttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 25293853  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |  |||||||||| ||| |||      |||| |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  25293852 atacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtat-gatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 25293774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25755941 - 25755763
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  25755941 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatacttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 25755842  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |  |||||||||| ||| |||      |||| |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  25755841 atacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtat-gatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 25755763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17500181 - 17500015
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             
T  17500181 tgattatgtttgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt--------- 17500091  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
        |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17500090 ----ggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagaatcttaggataggctctgatctaggatg 17500015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23217074 - 23216953
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  23217074 atcatgtgatactagtattttaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtg 23216975  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctg 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  23216974 aagcttacccccagtggatctg 23216953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11600470 - 11600314
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaa 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || |||| |||||||||| ||    
T  11600470 atgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgtggattgtgattgatgtgaa 11600371  T
Q  117 gcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtg 173  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  11600370 gcttactcccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtg 11600314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22320040 - 22319927
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22320040 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 22319941  T
Q  114 aaagcttaccccca 127  Q
    ||| ||||||||||    
T  22319940 aaaacttaccccca 22319927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 230
Target Start/End: Original strand, 37655485 - 37655614
Alignment:
Q  101 ttatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgct 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  37655485 ttatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgaccgccaacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagtattagttgctttggtgagttgct 37655584  T
Q  201 cggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    ||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  37655585 cggtggttgcttggataacgggagctatct 37655614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 18263247 - 18263413
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgag 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  18263247 gttgattatgattgatgtatagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgag 18263346  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||| ||           |||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18263347 ttgcttgg-----------atagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggatagactctgatctagg 18263413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7468633 - 7468476
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||     
T  7468633 ttgattatgattgatgtaaagcttacctcccatggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaagattagttgctttggtgag- 7468535  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctc 265  Q
              |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  7468534 ----------ttgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttctttagagtcttaggataggctc 7468476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25608329 - 25608102
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  25608329 atcatgtgatgctagtattataggagggatgtttatgtatatgtgctatgcatgaattcttaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtg 25608230  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttcttgagttgctcggtgat 207  Q
    |||||||  |||| ||| |||      |||| |||||||||  ||||| |||||||||||  ||| | |||||| ||||||  |||   |||| ||||||    
T  25608229 aagctta--cccagtggatctgtcatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcaagattagtttgctt--ttggtgtgcttggtgat 25608134  T
Q  208 tgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25608133 tgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 25608102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Original strand, 23118685 - 23118853
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||              
T  23118685 gattatgattgatgtaaaagttacccccagtggttttgaccgcctacttgtccgtatggatgagtagacgaagtgcaggattagttgctt---------- 23118774  T
Q  199 ctcggtga-ttgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  23118775 -ttggtgagttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttacttagagtcttagggtaagctctgatctaggatg 23118853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24906268 - 24906087
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttct-gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt-gc-tttcttgag 195  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||    
T  24906268 gattctgattgatgtaaatcttacccccagtggtttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgcatttggtgag 24906169  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttcc-atagagtcgtaggataggctctgatctaggat 276  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  | ||||| | || ||||||||||||||||||    
T  24906168 ttgcttggggattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttcctcttgagtcttggggtaggctctgatctaggat 24906087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23879376 - 23879265
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  23879376 atcatgagatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgtatgaaagccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 23879277  T
Q  114 aaagcttacccc 125  Q
     ||||| |||||    
T  23879276 gaagctaacccc 23879265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23350574 - 23350437
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatt----tacgttgattatgattg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||    || ||||||||||||||    
T  23350574 atcatgtgatgttagtattttaggagggatgtgtatgtatatgtgttatccatgaagtccttgaatgcttatgtttgttttcatatgttgattatgattg 23350475  T
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacct 147  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  23350474 atgtgaagcttacccccaatgcttttgagcgcctacct 23350437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29296203 - 29296071
Alignment:
Q  106 attgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtg 205  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  29296203 attgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgc-ttggtgagttgctcgatg 29296105  T
Q  206 attgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  29296104 gttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 29296071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15931658 - 15931487
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15931658 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctatatggatcagtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttg 15931559  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatct 271  Q
    || | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||| || | || |||| |||||| |||||||||||    
T  15931558 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggtttcgtaaagtc-taggattggctctgatct 15931487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Original strand, 23154446 - 23154576
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  23154446 tgattatgtttgatgtaatgcttatccctagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 23154544  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23154545 gct-tgtggttgcttggatagtgggagctatct 23154576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 23229136 - 23229308
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    |||||||    
T  23229136 gattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtgtgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccagtgagttg 23229234  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||| |||||| || ||||   ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23229235 ctcggtggttgc-tggatagcgggaactatctccgctatcatgtctttagggtc-taggataggctctgatctagg 23229308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22311433 - 22311240
Alignment:
Q  56 tgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttaccccc-aatggttctg------accacctacct 147  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||      |||  ||||||    
T  22311433 tgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattaatgtaaagcttacccccgagtggatctgtgatgaaccggctacct 22311334  T
Q  148 gtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    ||  ||||| |||||||||||  ||| | |||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22311333 gtttgtatgaatgggtagacggcgtgcatgattagttttctttcggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 22311240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5851835 - 5851660
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||   |||||    
T  5851835 ttgattatgattgatgtaatgcttacccc-agtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagatgacgtgcagggatagttgcttcggtgagt 5851737  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    | || | || ||| |   |||  |||||||||||||| ||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||    
T  5851736 tacttgatgcttggtggaatatcgggagctatcttcggtatcggtttcgtacagtc-taggataggctctgatctagg 5851660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 20655930 - 20656017
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  20655930 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 20656017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26009766 - 26009591
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  26009766 gattatgattgatgtaatgcttagcccctagtggttttgactgcctacctgtctctatggatgggtaaacgttgtgcaggattagttgctttggtgagtt 26009667  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||| | |||||| |  ||||  |||||||||||  | ||||  || | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26009666 gcttgatgattggtcggatatcgggagctatctctggtatcagtttcgtagagtc-taggataggctcagatctagg 26009591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23835568 - 23835471
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  23835568 atttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 23835471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21679446 - 21679360
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21679446 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggtt-tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 21679360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25120758 - 25120671
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  25120758 gattatgat-gatgtaatacttaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 25120671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17283567 - 17283394
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||    |||||||    
T  17283567 gattatgattgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacactgtgctggattagttgctccggtgagttg 17283469  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     | | || ||| || ||||  ||||||||||| || ||||| ||   ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17283468 attgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggttttgtagggtc-taggataggctctgatctagg 17283394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38531887 - 38531808
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  38531887 tgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgatgtgcatgattagttgct 38531808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 21200024 - 21200082
Alignment:
Q  129 tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  21200024 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgatgtgcaagattagttgct 21200082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21695912 - 21695827
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  21695912 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgctgtgcaggattagttg 21695827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22884109 - 22884016
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  22884109 tttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggttttgactgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtt 22884016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 17731374 - 17731461
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||  |||||| || ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  17731374 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgactacctatctgtatggatgtgtagacgctgtgcaggattagttgct 17731461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23638201 - 23638161
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23638201 tatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcttatgtt 23638161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20479908 - 20479838
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20479908 ttgattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 20479838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 186
Target Start/End: Original strand, 39448633 - 39448719
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc 186  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||| | |||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  39448633 gattatgat-gatgtaatacttaccctcaatggttttgatcgcctacctgtttgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgc 39448719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28543164 - 28543079
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  28543164 gattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggatttgttg 28543079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29758554 - 29758504
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29758554 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 29758504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11542301 - 11542225
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  11542301 ttgatgtgaagcttacccc-agtggtttcgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacaaagtgcatgattagtt 11542225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 11542368 - 11542327
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatat 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11542368 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatat 11542327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 21192587 - 21192656
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||| | ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  21192587 cttacccctagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 21192656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23216885 - 23216820
Alignment:
Q  208 tgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctag 273  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  23216885 tgcttggatagcgggagctatctctgttatcgtttccttagagtcttagggtaggctttgatctag 23216820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Original strand, 24387599 - 24387648
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24387599 ttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 24387648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 269922 - 269870
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  269922 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctt 269870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 645999 - 646051
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  645999 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctt 646051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 831734 - 831786
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  831734 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctt 831786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 168
Target Start/End: Original strand, 22323409 - 22323469
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22323409 tgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacg 22323469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 22737821 - 22737907
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | || || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22737821 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgg-tgggtagacgttgtgcaggattagttgct 22737907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41243961 - 41243874
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  41243961 gattatgat-gatgtaatacttaacccaagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 41243874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 41509151 - 41509203
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  41509151 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctt 41509203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 277
Target Start/End: Original strand, 10239267 - 10239454
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgcttt 189  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  10239267 atttatgtggattatgattgttgtaaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacgaagtgcaagattagtcgcttt 10239366  T
Q  190 cttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10239367 ggtgagttgcttggtgattgcttagatagagggagttatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatg 10239454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 13448875 - 13449054
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  13448875 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-attgattttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 13448973  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||   || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13448974 tgctcggtgattgcttggatagcgggagctatctatgttattagtttcgtagagtcgtaagataggctctgatctaggatg 13449054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19557671 - 19557492
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttct-tgag 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||    
T  19557671 ttgattatgtttgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtcagtatggatgg-tagacgaagtgcaggattagttgtttttgatgag 19557573  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggat 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19557572 ttgcttggtgattccttggatagcgagagctatctccgttaccgtttccttagagtcttaggataggctctgatataggat 19557492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 181
Target Start/End: Original strand, 54365835 - 54366002
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  54365835 atcatgtgatgttagtattctaggaggggtgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgaatgatgt 54365934  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggatta 181  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||  | |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  54365935 gaagcttaccccaagtggttttgacagcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggatta 54366002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Original strand, 12136103 - 12136275
Alignment:
Q  69 aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12136103 aatcctagaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaaggttaccaccaatggtttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 12136202  T
Q  169 aagtggaggattag-ttgc-tttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  12136203 aagtgcaggattagtttgcttttggtgagttgcttggtgattgcttggatagcggaagctatctccgttatcg 12136275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 41258187 - 41258360
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||  ||||||     
T  41258187 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtaaacgttgtgcaggattagttactttggtgagttt 41258285  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41258286 ctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg 41258360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5407484 - 5407307
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||  |||||    
T  5407484 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgagtagacgacgtgcatgattagttgttttgatgagt 5407385  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatc-gcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||   |||||||||| || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5407384 tgcttggtgcttgcttggatatcaggagctatctccggtatcggtttccttagagtc-taggataggctctgatctagg 5407307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 41919044 - 41919261
Alignment:
Q  62 atgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  41919044 atgcatgatatccttgaatgcttgtgtttgtttatgttgattttgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatg 41919142  T
Q  161 ggtagacgaagtggaggatt-agttgc-tttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtagga 258  Q
     |||||||||||| |||||| | |||| |||  |||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||| | ||||| ||||     
T  41919143 agtagacgaagtgcaggattaatttgcttttggtgagttgtctggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttattgtttcctttgagtcttaggg 41919242  T
Q  259 taggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  41919243 taggctctgatctaagatg 41919261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 13595864 - 13596029
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt-gctttct-tga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  13595864 ttgattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctacctgt----atggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgcttttggtga 13595959  T
Q  195 gttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggct 264  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| ||||||    
T  13595960 gttgcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggct 13596029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 274
Target Start/End: Original strand, 7187767 - 7187941
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||   ||||||    
T  7187767 tgattatgtttgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgattgggtgagtt 7187866  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7187867 gct-ggtgattgcttggatagcggcagctatctccgttatcgtgtctttagggtc-taggataggctctgatctagg 7187941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 5372874 - 5372985
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  5372874 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 5372973  T
Q  114 aaagcttacccc 125  Q
     |||||||||||    
T  5372974 gaagcttacccc 5372985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38763112 - 38762944
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||   |||||    
T  38763112 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgcttcggtgagt 38763013  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctct 266  Q
    |||| |||| ||| |   |||  ||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||| ||||    
T  38763012 tgcttggtgcttggtcgaatatcgggagctatctccggtatcggtttcttagagtc-taggatagactct 38762944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Original strand, 50224001 - 50224169
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||              
T  50224001 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcacgattagttgctt---------- 50224090  T
Q  199 ctcggtg-attgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
     | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50224091 -ttggtgaattgcttggatatcgggagctatctccgttatcgtttccttatagtcgtagggtagggtctgatctaggatg 50224169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 15215994 - 15216101
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15215994 atcatgtgatgctagtattttaggagggatgtttatgtatatgtgttatgtatgaaatccttgaatgcttatgttg-tttacgttgattatgattgatgt 15216092  T
Q  114 aaagcttac 122  Q
     ||||||||    
T  15216093 gaagcttac 15216101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Original strand, 47470176 - 47470346
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttaccccc--aatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||            
T  47470176 gattatgattgatgtaaagcttacccccctagtggttttgaccacctacttgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctt-------- 47470267  T
Q  197 tgctcggtga-ttgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
       | ||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47470268 ---ttggtgagttgcttggatatcggaagctatctccgttatcgtttccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatg 47470346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 7966435 - 7966611
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||   |||||    
T  7966435 ttgattatgattgatgtaatgattacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgattcagtgagt 7966534  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| | ||  || |  ||||  ||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7966535 tgcttgatgcctggtcggatatcgggagctatctccggtatcggtttcatagagtc-taggataggctctgatctagg 7966611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42707039 - 42706909
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||  |||||||    
T  42707039 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgactatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgc-ttggtgagttg 42706941  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  42706940 ctcggcggttgcttggatagcgggagctatct 42706909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 15116051 - 15116171
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  15116051 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtttatgtgttatgcatgattccttgaatgcttatatt-tgttatgttgattatgattgatgta 15116149  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctg 136  Q
    |  |||||||||| ||| ||||    
T  15116150 atacttacccccagtggatctg 15116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 17378031 - 17378152
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagt 196  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||    
T  17378031 gattatgattgatgtgaaacttacccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatcaatgggtagacgaagtgcgggattagtttgctttcggtgagt 17378130  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatag 218  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  17378131 tgcttggtgattgcttagatag 17378152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9650265 - 9650147
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacg-ttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||  |||| |  |||| | |||||||||||||||||    
T  9650265 tcatgtgatgttaatattctaagagggatggttatgtatacgtgtcatgcatgaaatccttgagtgtttatgattgtttatgtttgattatgattgatgt 9650166  T
Q  114 aaagcttacccccaatggt 132  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  9650165 caagctaacccccaatggt 9650147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 274
Target Start/End: Original strand, 18241083 - 18241198
Alignment:
Q  158 atgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtagg 257  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||   ||||||||||| || |    
T  18241083 atgggtaggcgaagtgcatggttagttgctttggtgagttgcttggtggttgcttggatagcaggagctatctccgttatcatgtccatagagtc-taag 18241181  T
Q  258 ataggctctgatctagg 274  Q
    |||||||||||| ||||    
T  18241182 ataggctctgatttagg 18241198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Original strand, 17213707 - 17213797
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  17213707 tgattatgattgatgtgaagctaatccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatggatagacagagtgcaggattagttgctt 17213797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13244612 - 13244551
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13244612 ttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccacctacctgtctgtatagatgggtagacg 13244551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 30236398 - 30236486
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  30236398 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgctt 30236486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44054181 - 44054113
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44054181 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 44054113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 12246079 - 12246147
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12246079 gattatgattgatgtaatacttaccctcggtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 12246147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 12901618 - 12901701
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagt 183  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  12901618 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagt 12901701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 34198012 - 34198099
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  34198012 gattatgat-gatgtaatacttacccgcagtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 34198099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 13752154 - 13752233
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  13752154 tgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 13752233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 166
Target Start/End: Original strand, 19623874 - 19623949
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtaga 166  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  19623874 tttatgttgattatgatttatgtgaagctaacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtaga 19623949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 21961456 - 21961514
Alignment:
Q  129 tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21961456 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 21961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24237234 - 24237156
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  24237234 atttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagttgttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacg 24237156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 41167785 - 41167843
Alignment:
Q  129 tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  41167785 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 41167843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14867709 - 14867622
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14867709 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggtt-tgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 14867622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 15853145 - 15853214
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  15853145 cttacccccagtggttttgaccacatacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggatcagttgct 15853214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 18496339 - 18496408
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  18496339 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagtattagttgct 18496408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 20813877 - 20813945
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20813877 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 20813945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21958145 - 21958105
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21958145 tatgtatatttgctatacatgaatccttgaatgcctatgtt 21958105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 53909737 - 53909803
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtaga 166  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  53909737 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 53909803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 109743 - 109693
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  109743 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 109693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 12838179 - 12838247
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12838179 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaacggcctacctgtctgtatggatgggtagacg 12838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14569743 - 14569707
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14569743 gttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggt 14569707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 80
Target Start/End: Original strand, 20597752 - 20597784
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatg 80  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20597752 tatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatg 20597784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34393356 - 34393304
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  34393356 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctt 34393304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 37958885 - 37958972
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||  ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  37958885 gattatgat-gatgtaatacttacctccggtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgttcaggattagttgct 37958972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25891 - 25713
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  25891 gattatgattgatataaatcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaggtgcaggattagttgctttggtgagttg 25792  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25791 cttggtgattccttggatagcgggagctatctccgttatcgcttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatg 25713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 84747 - 84580
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||       
T  84747 gattatgattgatgtaaagcttaccctaagtggttttgaccgcctacccgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgag--- 84651  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
            |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  84650 --------ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttagaataagctctgatctaggatg 84580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 187
Target Start/End: Original strand, 331055 - 331101
Alignment:
Q  141 cctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  331055 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 331101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36235 - 36055
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  36235 ttgattatgattgatgtaaagcttactctcagtggttttgaccgcctacatttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagt 36136  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  36135 tgctcggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcataggataagctctgaactaggatg 36055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6092864 - 6092613
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  6092864 atcatgtgatgctagtattataggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctgtgtttgtttatgttgattatgattgatgta 6092765  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtga-ttgctta 213  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||   || |||       | ||||| ||||||     
T  6092764 aagctta-ccccattggttttgaccgcctatctgtctatatggatgggtagacgaagtgcatgattagt---ttgctt-------ttggtgagttgcttg 6092676  T
Q  214 gatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6092675 gatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtc-tagggtaggctctgatctaggatg 6092613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43640773 - 43640510
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgtt---gattatgattgat 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||   |||||||||||||    
T  43640773 atcatgtgatgctagtatt-taggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttattttattgattatgattgat 43640675  T
Q  112 gtaaagcttacccccaatggttctg------accacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtg 205  Q
    || ||||||||||  | ||| ||||      ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43640674 gtgaagcttaccc--agtggatctgtgatggaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgctcggtg 43640577  T
Q  206 attgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43640576 gttgcttggatagcgggagctatcttcgctatcg-tgtcttagagtc-taggataggctatgatctagg 43640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24272385 - 24272211
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  24272385 gattatgattgatgtaaagcttacccctaatggttttgactgcctacttgtctgtattgatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 24272286  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24272285 cttggtgattgcttggatagcgggtgctatctccgttatcgtttccttagagtc-taggatagactctgatctagg 24272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29112186 - 29111959
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||     
T  29112186 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatcgttgaatgtctatgtttgtttatgttgattgtgattgatgtg 29112087  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgctttc-ttgagttgctcggtgattgctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  29112086 aagcttacccccagtggttttgacagcctgcctgtttgtatgaatgcgtagacgaagtgcatgattagtttgctttcggtgagttgcttggtgattgttt 29111987  T
Q  213 agatagtgggagct-atcttcgttatcg 239  Q
     |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  29111986 ggatagctggagctaatctccgttatcg 29111959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 30994827 - 30995007
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| |    
T  30994827 ttgattatgattgatgtaaagcttagccccagtggttttgaccgcctacctgactgtatggatggatagacgaagtgcaggattagttgcttcggtgaat 30994926  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||| |||| |||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30994927 tgcttggtgcttgcttggatatcgggagttatctccgatatcggtttcttagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 30995007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18533757 - 18533604
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  18533757 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgattatgttgattatgattgatgt 18533658  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagac 167  Q
     ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  18533657 gaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagac 18533604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 19435684 - 19435875
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||| |||||    
T  19435684 atcatgtgatgctagtattctaggagaggtggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttttgttgattatgatttatgta 19435783  T
Q  115 aagcttacccccaatggttct------gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgct 200  Q
    |  |||||||||||||| |||      |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19435784 atacttacccccaatggatctatgatggaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgct 19435875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24868877 - 24868744
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||  |||||    
T  24868877 ttgattatgattgatgtaaagcttacctctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaattgctttggtgagt 24868778  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  24868777 tgctcggcggttgcttggatagcgggagctatct 24868744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20271326 - 20271159
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||    ||    |||||||||||||||||    
T  20271326 atcatgtgatgttagtactctaggagggatgggtatgtatatgtatcatgcatgaaatccttgaatgcttatgcctgttatgtttgattatgattgatgt 20271227  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggatta 181  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  20271226 gaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgttggtatgaataggtagacaaagtgcaggatta 20271159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24839779 - 24839664
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaag 117  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||    || ||||||||||||||||||||||    
T  24839779 atgtgatgttagtattctgggaaggatgggtatttatatgtaatatgtatgaatccttgaatgcttgtgttttcatatgttgattatgattgatgtaaag 24839680  T
Q  118 cttacccccaatggtt 133  Q
    ||||||||||||||||    
T  24839679 cttacccccaatggtt 24839664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25132546 - 25132379
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttct-gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgag 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||           
T  25132546 ttgattatcattgatgtaaagcttacccc-agtggtttttgatcgcctacctgtctgtatggaagggtagacgaagtgcaggattagttactt------- 25132455  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
          ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25132454 ------ggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttacagtcttaggataggctccgatctaggatg 25132379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32738780 - 32738626
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatag 218  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| | || ||| |  ||||     
T  32738780 ttaccccctgtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgcttgatgtttggtcggatat 32738681  T
Q  219 tgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     ||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32738680 cgggagctatctccggtatcggtttcgtagagtc-taggataggctctgatctagg 32738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19657882 - 19657762
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    |||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||| |||||||    
T  19657882 atcatgtgttgctagtattctaggatagatggttatgtataattgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtctgtttatgtggattatga-tgatgta 19657784  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctg 136  Q
    | ||||||||||| ||| ||||    
T  19657783 atgcttacccccagtggatctg 19657762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25593495 - 25593402
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  25593495 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgtaggagtagtt 25593402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 22137681 - 22137795
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtggg 222  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  22137681 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttg-tttggtgagttgctc-gtggttgcttggatagtggg 22137778  T
Q  223 agctatcttcgttatcg 239  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22137779 agctatcttcgctatcg 22137795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 22581845 - 22581932
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22581845 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 22581932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 274
Target Start/End: Original strand, 24089320 - 24089440
Alignment:
Q  152 gtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagt 251  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||  |  | ||||||    
T  24089320 gtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatc-atgtcttagagt 24089418  T
Q  252 cgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  24089419 c-taggataggctctgatctagg 24089440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19655275 - 19655207
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19655275 gattatgat-gatgtaatgcttacccccaatggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 19655207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28972285 - 28972198
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  28972285 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 28972198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 23614339 - 23614505
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  23614339 atcatctgatgctagtat-ctaggagggatggttaggtatgtgt--tatgcatgaaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgacgt 23614435  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
     || |||| ||| | | ||| ||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  23614436 gaatctta-ccctagttgttttgaccgcctacctttttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgattagtt 23614505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 720685 - 720608
Alignment:
Q  109 gatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  720685 gatgtaatacttacccccagtggtt-tgacctcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 720608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 9782741 - 9782810
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  9782741 gattatgattgatgtaatacttacccccactggttttgaccgcctgcctgtctgtatggataggtagacg 9782810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 269422 - 269374
Alignment:
Q  120 tacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  269422 tacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 269374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 4450158 - 4450245
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| | | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  4450158 gattatgat-gatgtaatacttacctctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 4450245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 40642173 - 40642261
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  || |||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  40642173 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttttccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 40642261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Original strand, 36892613 - 36892683
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36892613 ttgattatgat-gatgtaatacttacccgcagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 36892683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19648339 - 19648243
Alignment:
Q  177 gattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  19648339 gattagttgcttcggtgagttgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcgtgtccttagggtc-taggatagactctgatatagg 19648243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 24296406 - 24296474
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24296406 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 24296474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Original strand, 25877888 - 25877937
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25877888 ttacccccaatggtttttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 25877937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Original strand, 45620229 - 45620305
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttaccc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45620229 tatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttat-ttgattatgattgatgtgaagctaaccc 45620305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 5110 - 5196
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  5110 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc-tacctgcctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7319731 - 7319644
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || || || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7319731 gattatgat-gatgtaatacttaccctcagtgattttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 7319644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 32117 - 32175
Alignment:
Q  129 tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  32117 tggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 32175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 23823338 - 23823424
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  23823338 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgacg-cctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaattgct 23823424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 23825282 - 23825368
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  23825282 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgacg-cctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaattgct 23825368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25303908 - 25303820
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| | | ||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  25303908 gattatgatttatgtaatacttacctctagtggttttgaccgcttacctgtcaatatggatgggtagatgctgtgcaggattagttgct 25303820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25600164 - 25600100
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25600164 ccccagtggttttggccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 25600100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 22897 - 23050
Alignment:
Q  21 tgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagctt 120  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22897 tgatgctagtattctaggagagatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcatatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaagctt 22996  T
Q  121 acccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtgg 174  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22997 acccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatgaatgggtagacgaagtgg 23050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6066 - 5890
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  6066 ttgattatgattgatgtaaatcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 5967  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5966 tgcttggtggtttcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg 5890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6901
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  6725 ttgattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagctgctttgatgatt 6824  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6825 tgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggacaggctctgatctagg 6901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4340 - 4274
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtaga 166  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4340 gattatgat-gatgtaaagctcagccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20278
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||     
T  20459 ttgattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggattttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttgatgat 20360  T
Q  196 ttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20359 ttgctcagtgactgcttggatagcgggagctatctttgttatcggttccgtagagtcgtaggataggctctgacctaggatg 20278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 6886 - 7157
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgattta---cgttgattatgattgat 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   | |||||||||||||||    
T  6886 atcatgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatatactatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatttcattgattatgattgat 6985  T
Q  112 gtaaagcttacccccaatggttc------tgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtg 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||       |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6986 gtaaagcttaccaccagtggatcagtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgctcggtg 7085  T
Q  206 attgctt----agatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     ||||||     ||||   |||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7086 gttgcttggtcggatatcaggagctatctacggtatcggtttcgtagagtc-taggataggctctgatctagg 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 36944 - 37113
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   |||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36944 atcatgtgatgttagtattctagaaatgatgggtaggtatatgtgttatgcatgagatccttgaatgcttattttg-tttatgttgattatgattgatgt 37042  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
     ||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  37043 gaagcttacccccagtagttttgaccgcctgcctatttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 37113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20192148 - 20191979
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  |||| |||||| |||||||||||     
T  20192148 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgttatgcatgaatctttgaatgcttatatttgtttatgttgatcatgattgatgtg 20192049  T
Q  115 aagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  20192048 aagcttacccccagtggtttcgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgtaggagtagtt 20191979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 40438121 - 40438303
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag-ttgc-tttcttga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||  |||    
T  40438121 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtccgtatggatgggtagacggagtgcatgattagtttgcttttggtga 40438220  T
Q  195 gttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40438221 gttgcttggtgattgtttggatagcgggagctatctccgttatcgttttcttagagtcttagggtaggctctgatctaggatg 40438303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20820842 - 20820586
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||          |||| ||||||||||||||||||    
T  20820842 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatg----------tttatgttgattatgattgatgt 20820753  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttct--tgagttgctcggtgattgct 211  Q
     ||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||  ||||  |||||| ||||||||| || |||||||  ||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  20820752 gaagctaacccctagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggttgacgaagtgcagaattagtttgtttttggtgagttgcttggtgattgct 20820653  T
Q  212 tagatagtgggagctatcttcgttatcg-cttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||  |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20820652 tggatagcgggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcttaggataggctctgatctaggatg 20820586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 5472231 - 5472404
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||  |||||||    
T  5472231 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggatagacgaagtgcgtgattagttgctttggtgagttg 5472329  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || |||| |||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5472330 cttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggttccttagagtc-tagggtaggctctgatctagg 5472404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21193495 - 21193322
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21193495 gattatgattgatgtaaagcttactcccagtggttttgaccgcctacctatctg-atggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttg 21193397  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| || |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21193396 ctcggtggttgcttgggtagcgggagctatctccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg 21193322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52397997 - 52397821
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||  |||||    
T  52397997 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgccgacctgtctgtatggatgggtagacgaaatgcagagttagttgttttggtgagt 52397898  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  52397897 tgcttggtggttgcttggatagcgggagctatctctgttatcgtgtccttagag-cctaggatagactctgatctagg 52397821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 173
Target Start/End: Original strand, 78265 - 78424
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  78265 atcatgtgagtttagtattctaggagggatggttatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 78364  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtg 173  Q
    |||| ||| ||| | || ||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  78365 aaagtttatccctagtgttttcggccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtg 78424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33395285 - 33395150
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  33395285 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatacatgtgttatgcatgaaatctttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 33395186  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgt 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  33395185 aaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgt 33395150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Original strand, 5770042 - 5770209
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  5770042 tgattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgag-- 5770138  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
             |||||| |||||   ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5770139 ---------ttgcttggatagcaagagctatctccgttatcatttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatg 5770209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40555702 - 40555535
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||              
T  40555702 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgtatgattagttgctt---------- 40555613  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
     | ||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40555612 -ttggtgattgctcggatatcgggaactatcttcgttatcgtttccttagagtctcagggtaggctctgatctaggatg 40555535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 49999184 - 49999324
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||  |||||    
T  49999184 ttgattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgaagttcagggttagttgatttggtgagt 49999283  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttat 237  Q
    |||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  49999284 tgcttggtggttgcttggatagctggagctatctccgttat 49999324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21042119 - 21041952
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||             
T  21042119 tgattatgtttgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgaagtgcaggattagttgctt--------- 21042030  T
Q  198 gctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
      | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  21042029 --ttggtgattgcttggatagcgggaactatctccgttatcgtttccttagagtcttagggtaggctcggatctaggatg 21041952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29217431 - 29217326
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  29217431 ttgattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttggtgag 29217332  T
Q  196 ttgctc 201  Q
    ||||||    
T  29217331 ttgctc 29217326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 41213506 - 41213594
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41213506 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggtttggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 41213594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46144101 - 46143940
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||     
T  46144101 ttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacct----gtatggatgggtagacgaggtgcagggttagttgctttggtgag- 46144007  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
              |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46144006 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg 46143940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33384220 - 33384083
Alignment:
Q  142 ctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt-gctttct-tgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||   ||||||||| | |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33384220 ctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaagactagtttgcttttggtgagttgcttgatgaccgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 33384121  T
Q  240 cttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
     |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33384120 tttccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatg 33384083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18164511 - 18164419
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  18164511 ttgattatgattgatgtaaaacttaccccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcatgattagttgctt 18164419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 37235797 - 37235971
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    |||||||    
T  37235797 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgctccggtgagttg 37235896  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     | | || ||| |  |||| |||||||||||| || ||||| || | ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  37235897 attgatgcttggtcggatattgggagctatctccgatatcggtttcgtagggtc-taggataggctctgatatagg 37235971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 20956873 - 20957046
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  20956873 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatggttagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttg 20956971  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
     | | || ||| || ||||  ||||||||||| || ||||| ||   ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  20956972 attgatgtttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtagggtc-taggatgggctctgatctagg 20957046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 22837247 - 22837335
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||    
T  22837247 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcaagattagttgctt 22837335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 22837450 - 22837538
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||    
T  22837450 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcaagattagttgctt 22837538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25093183 - 25093090
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||  ||||| |||| |||||| |||| |||| |||||    
T  25093183 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgccaacctgtttgtatgaatggatagacggagtgcaggagtagtt 25093090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 5676522 - 5676589
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5676522 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 5676589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17021889 - 17021801
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  17021889 gattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtctgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgct 17021801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17607257 - 17607174
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagt 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  17607257 gattatgattgatgtaatgcttaccca-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgaaggattagt 17607174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 36358161 - 36358248
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  36358161 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtcgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 36358248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 15806999 - 15807072
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15806999 tcatgtgatgttagttttctagtagtgatgaatatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtt 15807072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18505637 - 18505592
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18505637 ccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacg 18505592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 188
Target Start/End: Original strand, 27331113 - 27331178
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  27331113 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgctt 27331178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 51658242 - 51658330
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatgg-ttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  51658242 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtgggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgct 51658330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 187
Target Start/End: Original strand, 22148263 - 22148315
Alignment:
Q  135 tgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22148263 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 22148315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 22408149 - 22408236
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  22408149 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 22408236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35053134 - 35053086
Alignment:
Q  120 tacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35053134 tacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 35053086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Original strand, 37846371 - 37846421
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  37846371 cttacccccaatggttttaaccgcatacctgtctgtatggatgggtagacg 37846421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Original strand, 9786324 - 9786369
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9786324 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 9786369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 20895681 - 20895742
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20895681 ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtcggtatggatgggtagacg 20895742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 35524359 - 35524423
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  35524359 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgct 35524423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 25805 - 25980
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||    
T  25805 ttgattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttggtatggatgggtagacgaagtgcagagttagttgttttggtgagt 25903  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25904 tgcttggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg 25980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Original strand, 13145 - 13300
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaag 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||    
T  13145 tgtgatgatagtattctaggaggcatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaag 13244  T
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtg 173  Q
    |||||||  | ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13245 cttacccatagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgaagtg 13300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18945 - 18791
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatag 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  18945 ttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttgatgagttgctcggtggttgcttggatag 18846  T
Q  219 tgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  18845 tgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-tatgatagactctgatctagg 18791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 24267 - 24354
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  24267 gattatgat-gatgtagtgctcacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 24354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Original strand, 141152 - 141290
Alignment:
Q  135 tgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgt 234  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  141152 tgaccacctacctgtttgtatggatgggcagacgaagtgcaggattagttgcttaggtgagttgctcggtgattgcttggatagggggagctatctccgt 141251  T
Q  235 tatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctag 273  Q
    ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  141252 tatcggtttcgtagaatcgtaggataggctctgatctag 141290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 130214 - 130042
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  130214 gattatgattgatgtaaagcttaccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcaggattaattgctttggtgagttg 130117  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || |||| |||||| ||||  ||||||||||| || |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  130116 cttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcgggtccttagagtc-taggataggctctgatctagg 130042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 106742 - 106829
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  106742 gattatgat-gatgtaatacttacccccaatgattttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 106829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 107922 - 107835
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  107922 gattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtattaatgggtagacgtggtgcatgattagttgct 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Original strand, 114157 - 114224
Alignment:
Q  120 tacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  114157 tacccccagtggttttgaccgcctacctatttgtatggatgggtagacgatgtgcaggagtagttgct 114224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 104293 - 104116
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||    
T  104293 ttgattatgattgatgtaaagcttacttccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgaaggattagttgcttcggtgagt 104194  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatc-gcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| || |||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  104193 tgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggtttccttagagtc-tagggtaggctctgatctagg 104116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 737
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||  |||||    
T  913 ttgattatgattgatgtaaagcttacacccagtggttttgaccgcctacctgtctttgtggatgggtagatgaggtgcagggttagttgctttggtgagt 814  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  813 tgcttggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcatgtccatagagtc-taagataggctctgatttagg 737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 22329 - 22502
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaa---tgcctatgttgatttacgttgattatgattga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| ||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  22329 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatgctgcttatgtttgtttatgttgattgtgattga 22428  T
Q  111 tgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| |||   |||||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||| |||||    
T  22429 tgtgaagcttacccctagtggttttgattgcctacctgtttgtatgaaagggtagacggagtgcaggagtagtt 22502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 256550 - 256684
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  256550 atcatgtgaagttagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgtatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 256649  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgt 149  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  256650 gaagcttacccctagtggtt-tgaccgcctacctgt 256684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 99031 - 99205
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   |||||||    
T  99031 gattatgattgatgtaatgtttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttg 99130  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || ||| || ||||  ||||||||| | || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  99131 cttgatgtttggttggatatcgggagctatatccggtatcggtttcgtagagtc-taggataggctctgatctagg 99205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 68589 - 68520
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  68589 cttacccccagtggttttgactgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 68520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30327 - 30240
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  30327 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 30240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 25450 - 25623
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||  ||||||     
T  25450 gattatgattgatgtaatgcttacccccaattgttttgaccgcctacctatctgtatggatgcgtagacgttgtgcatgattagttgctttggtgagttt 25549  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||  ||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25550 ctcggtggtttcttggatagcgggagttatcttccctatcg-tgtcttagagtc-taggataggctctgatctagg 25623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Original strand, 106461 - 106592
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgat 207  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  106461 tgatgtaatgcttacccccagtagttttgaccgcctacctgtctgtattgatgggtagacgctgtgtaggattagttgctttggtgagttgctcggtggt 106560  T
Q  208 tgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  106561 tgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 106592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 121728 - 121898
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatg-ttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||| ||    ||||||||||||||||    
T  121728 atcatgtgatgttagtattctaggagggacgggtatgtatatgtgctatgtatgaaattcttgaatgcttatgattgtttatatttgattatgattgatg 121827  T
Q  113 taaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    | |||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||| | |||| |||| |||||    
T  121828 tgaagc-taacccaagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagaaggagtgcaggaatagtt 121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 53926 - 53876
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  53926 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 53876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Original strand, 19652 - 19783
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||   ||| || | ||||||||||  |||||||    
T  19652 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagaagtagttgctttggtgagttg 19751  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19752 ctcggtggttgcttggatagcgggagctatct 19783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Original strand, 29228 - 29359
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||   ||| || | ||||||||||  |||||||    
T  29228 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagaagtagttgctttggtgagttg 29327  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatct 230  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  29328 ctcggtggttgcttggatagcgggagctatct 29359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9889 - 9802
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9889 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttggccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 9802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 138660 - 138727
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  138660 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 138727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 15096 - 15214
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  15096 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgatttatgt 15195  T
Q  114 aaagcttacccccaatggt 132  Q
     ||||| ||||||| ||||    
T  15196 gaagctaacccccagtggt 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Original strand, 15705 - 15778
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt-tctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15705 gttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggtctttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacg 15778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11770 - 11597
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||   |||||||    
T  11770 gattatgattgat-taatgcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgcttctgtgagttg 11672  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11671 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggttttgtagagtc-taggataggctctgatctagg 11597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 1813 - 1981
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||     
T  1813 ttgattatgattgatgtaaagtttaccccaga-ggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgag- 1910  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctaggatg 277  Q
              |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1911 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggacaggctctaatctaggatg 1981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 1958 - 2132
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   |||||||    
T  1958 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgtctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttg 2057  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||  || | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  2058 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcattttcgtagaatc-taggataggctctgatctagg 2132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1585 - 1409
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| || | |||||||||   |||||    
T  1585 ttgattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaagtagttgcttcggtgagt 1486  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||  || | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1485 tgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcagtttcgtagagtc-tagaataggctctgatctagg 1409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 924 - 749
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||   |||||    
T  924 ttgattatgattaatgtaatgcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcaaggttagttgcttcagtgagt 826  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    | || | || ||| |  ||||  | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  825 ttcttgatgcttggtcggatatcgagagctatctccgatatcggttccgtagagtc-taggataggctctgatctagg 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10650 - 10514
Alignment:
Q  53 atatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctg------accacctacc 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||      ||| ||||||    
T  10650 atatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaaacttacccccagtggatctgtgatgaaccgcctacc 10551  T
Q  147 tgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagt 183  Q
    |||  ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  10550 tgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagt 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 99463 - 99374
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  99463 gattatgattgatgtaaagcttaatcccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgcatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 99374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 99379 - 99315
Alignment:
Q  207 ttgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatcta 272  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  99379 ttgcttggatagcgggagctatcttcattatcgtttccttagagtc-taggataggctctgatcta 99315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29438 - 29339
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  29438 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgttgtgtaggattagttgcttcgttgagttg 29339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9690 - 9609
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  9690 ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 9609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4280 - 4148
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattag--ttgctttc-ttga 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||  ||||||||  |||    
T  4280 tgattatgattgatgtaaagctaacccccagtggttctgactgcctacctgtttgtatgaatgggtaaacggagtgcaggagtagttttgctttcggtga 4181  T
Q  195 gttgctcggtgattgcttagatagtgggagcta 227  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  4180 gttgcttggtgattgtttggatagcgggagcta 4148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 2874 - 2974
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  2874 attatgattgatgtaaagcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtatggatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttgatgagttgc 2973  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  2974 t 2974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19739 - 19631
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttg-aatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  19739 atcatgtgatgctagtactctaggagggatggttatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaaatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 19640  T
Q  113 taaagctta 121  Q
    | |||||||    
T  19639 tgaagctta 19631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Original strand, 3216 - 3303
Alignment:
Q  27 tagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  3216 tagtattctaggagggatggttatgtatatttgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttattttgattatgattgatgt 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51645 - 51472
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgc 199  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    |||||||     
T  51645 attatgattgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttga 51546  T
Q  200 tcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    | | || ||| |  ||||  ||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51545 ttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggtttcgtagagtc-taggataggctctgatctagg 51472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 185
Target Start/End: Original strand, 5250 - 5327
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  5250 tgatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttg 5327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 187
Target Start/End: Original strand, 12490 - 12578
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  12490 tgattatgat-gatgtaatgcttacccccactggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 12578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 274
Target Start/End: Original strand, 70161 - 70316
Alignment:
Q  117 gcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagat 216  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||  |||||||||  ||| |||||| |||    
T  70161 gcttacccccattggttttgaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtcgc-ttggtgagttgcttcgtggttgcttggat 70259  T
Q  217 agtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    || ||||||||||| |  |||||  ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  70260 agcgggagctatctccactatcgtgtctttagggtc-taggataggctctgatctagg 70316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 91047 - 91099
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  91047 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaattagttgctt 91099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 199208 - 199383
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||   |||||    
T  199208 ttgattatgattgatgtaatgcttacccc-agtggttttgacatcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagggatagttgcttcggtgagt 199306  T
Q  197 tgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatctagg 274  Q
    |||| | || ||| |  ||||  | ||||||||| |  ||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  199307 tgcttgatgcttggtcggatatcgagagctatctccagtatcgatttcgcagagtc-taggataggctctgatctagg 199383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 31508 - 31625
Alignment:
Q  121 acccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtg 220  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  31508 acccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggagtagttgc-ttggtgagttgctcggtggttgcttggatagcg 31606  T
Q  221 ggagctatcttcgttatcg 239  Q
    |||| ||||| || |||||    
T  31607 ggagatatctccgctatcg 31625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11702 - 11586
Alignment:
Q  52 tatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtc 150  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||| |||||||||     
T  11702 tatatatgttatgcatgaaatccttgaatgt-tatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaaactaacccctagtggttttgaccgcctacctgtt 11604  T
Q  151 cgtatggatgggtagacg 168  Q
     ||||| |||||||||||    
T  11603 tgtatgaatgggtagacg 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33811 - 33639
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctttcttgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||    |||||||    
T  33811 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgactgcctacatgtctgtatggattggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttg 33712  T
Q  199 ctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatcta 272  Q
     | | || ||| || ||||  ||||||||||| || ||||| ||   ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33711 attgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtagggtc-taggataggctctgatcta 33639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8400 - 8313
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  8400 gattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgctgtgcaggagtagttgct 8313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7312 - 7225
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7312 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 7225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3200 - 3106
Alignment:
Q  177 gattagttgctttcttgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcgcttccatagagtcgtaggataggctctgatcta 272  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| | || |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3200 gattagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttggataacgggagctatatccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatcta 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 14141 - 14226
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  14141 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttg 14226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5721 - 5636
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt 132  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  5721 tatgtatatgtgttatgaatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagttaacccccagtggt 5636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2920 - 2836
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  2920 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtt 2836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 187
Target Start/End: Original strand, 2920 - 3008
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  2920 tgattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggaatagttgct 3008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 187
Target Start/End: Original strand, 11175 - 11263
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  11175 tgattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggaatagttgct 11263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 55771 - 55686
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagtt 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||   |||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  55771 gattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtttctatgaatgagtagacgaagtgcaggagtagtt 55686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1362
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1292 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 1362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5771
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  5850 tgatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 5771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31781 - 31702
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  31781 tgatgtaatgcttaccgcccgtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 31702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 173
Target Start/End: Original strand, 45431 - 45514
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtg 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||  ||||| || |||||||| ||||    
T  45431 atttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccggtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaataggtagacggagtg 45514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 18503 - 18564
Alignment:
Q  21 tgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgc 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||||    
T  18503 tgatgttagtattctaggagtaatgattatgtatatgtgctttacttgaaatccttgaatgc 18564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6972 - 6927
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6972 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 6927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 59878 - 59810
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  59878 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 59810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 92265 - 92177
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  92265 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggaatagttgctt 92177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7364
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  7416 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 88
Target Start/End: Original strand, 4303 - 4339
Alignment:
Q  52 tatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4303 tatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcttatgtt 4339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26879 - 26799
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  26879 ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 26799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45893
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  45841 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 45893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37773 - 37705
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37773 gattatgat-gatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 37705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 144978 - 144914
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  144978 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 144914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0725 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0725
Description:

Target: scaffold0725; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7317 - 7270
Alignment:
Q  192 tgagttgctcggtgattgcttagatagtgggagctatcttcgttatcg 239  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7317 tgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagttatcttcgttatcg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0725; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7363 - 7318
Alignment:
Q  129 tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtgg 174  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7363 tggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgg 7318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 186
Target Start/End: Original strand, 7476 - 7562
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgc 186  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||| | |||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  7476 gattatgat-gatgtaatacttaccctcaatggttttgatcgcctacctgtttgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgc 7562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37622 - 37576
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggta 164  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37622 cttacccccagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggta 37576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Original strand, 249399 - 249449
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  249399 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 249449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Original strand, 125303 - 125353
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  125303 cttacacccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 125353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 256814 - 256882
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  256814 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccacctacctatctgtatggatgggtagacg 256882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5054 - 5009
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5054 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 5009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4800
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  4712 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgctgtgcaggaatagttgctt 4800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4069 - 4024
Alignment:
Q  123 ccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4069 ccccagtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacg 4024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 8816 - 8775
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatat 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8816 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatat 8775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36390 - 36341
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36390 cttacccctagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagac 36341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21380 - 21312
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacg 168  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  21380 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgactgtatggatgggtagacg 21312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6876 - 6836
Alignment:
Q  129 tggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacga 169  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 6836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Original strand, 4876 - 4912
Alignment:
Q  152 gtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4876 gtatggatgggtagacgttgtggaggattagttgctt 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 13727 - 13814
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||    
T  13727 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtacacgttgtgcagggttagttgct 13814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Original strand, 24151 - 24211
Alignment:
Q  21 tgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatg 80  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  24151 tgatgttagtattctaggagtgatgaatatgtatatgtgctatacttgaaatccttgaatg 24211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Original strand, 49716 - 49752
Alignment:
Q  152 gtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  49716 gtatggatgggtagacgttgtggaggattagttgctt 49752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1579
Alignment:
Q  135 tgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  1631 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgct 1579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 26647 - 26734
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||  | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  26647 gattatgat-gatgtaatacttaccctgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 26734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 77569 - 77517
Alignment:
Q  136 gaccacctacctgtccgtatggatgggtagacgaagtggaggattagttgctt 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  77569 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagtcgttgtgcaggattagttgctt 77517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20873 - 20810
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttctgaccacctacctgtccgtatggatgggt 163  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20873 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtgcttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 20810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 247633 - 247669
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  247633 gttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggt 247669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University