View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6576_low_1 (Length: 956)

Name: NF6576_low_1
Description: NF6576
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6576_low_1
NF6576_low_1
[»] chr6 (86 HSPs)
chr6 (11-839)||(16554420-16555253)
chr6 (11-839)||(16630976-16631809)
chr6 (45-839)||(16578302-16579101)
chr6 (45-839)||(16616279-16617078)
chr6 (11-839)||(16652682-16653496)
chr6 (11-814)||(34166632-34167443)
chr6 (43-814)||(6026832-6027609)
chr6 (152-814)||(25421000-25421669)
chr6 (45-814)||(33341908-33342688)
chr6 (53-814)||(34164452-34165221)
chr6 (357-839)||(27647755-27648232)
chr6 (53-721)||(411694-412369)
chr6 (53-806)||(3072580-3073334)
chr6 (444-814)||(13153893-13154278)
chr6 (45-281)||(25420797-25421034)
chr6 (45-327)||(6136263-6136547)
chr6 (53-264)||(13150857-13151070)
chr6 (53-263)||(27647476-27647687)
chr6 (357-790)||(6097285-6097717)
chr6 (357-630)||(2171534-2171814)
chr6 (9-282)||(11857330-11857603)
chr6 (57-324)||(5674242-5674512)
chr6 (9-224)||(14741890-14742106)
chr6 (357-630)||(31404677-31404957)
chr6 (357-630)||(5406202-5406481)
chr6 (357-630)||(5410527-5410806)
chr6 (374-631)||(30834537-30834801)
chr6 (357-625)||(5413401-5413675)
chr6 (374-630)||(16452331-16452594)
chr6 (45-211)||(30125018-30125185)
chr6 (58-262)||(2171883-2172090)
chr6 (57-323)||(22709362-22709632)
chr6 (44-261)||(22010188-22010405)
chr6 (107-263)||(5266453-5266610)
chr6 (708-814)||(6136108-6136216)
chr6 (464-630)||(21588931-21589096)
chr6 (464-630)||(21593664-21593829)
chr6 (45-228)||(6438899-6439083)
chr6 (9-228)||(33335393-33335614)
chr6 (464-630)||(33160354-33160521)
chr6 (53-169)||(6097860-6097977)
chr6 (464-630)||(3808710-3808877)
chr6 (467-630)||(17758026-17758189)
chr6 (464-630)||(2972942-2973107)
chr6 (464-630)||(17762990-17763156)
chr6 (464-627)||(9183037-9183199)
chr6 (771-839)||(16552976-16553044)
chr6 (771-839)||(16629532-16629600)
chr6 (466-630)||(26830126-26830289)
chr6 (464-630)||(22424828-22424995)
chr6 (464-630)||(28137411-28137576)
chr6 (381-627)||(16568953-16569184)
chr6 (467-630)||(5043630-5043793)
chr6 (535-625)||(5409076-5409164)
chr6 (53-139)||(34151836-34151922)
chr6 (53-168)||(26253598-26253714)
chr6 (50-282)||(16839092-16839325)
chr6 (467-623)||(26954296-26954450)
chr6 (464-627)||(33211191-33211353)
chr6 (45-228)||(5343880-5344064)
chr6 (50-228)||(33329938-33330117)
chr6 (107-224)||(14737128-14737246)
chr6 (107-228)||(28155133-28155255)
chr6 (464-609)||(3038926-3039071)
chr6 (733-814)||(13159051-13159134)
chr6 (518-630)||(26800642-26800753)
chr6 (44-121)||(23896880-23896958)
chr6 (45-102)||(5266596-5266653)
chr6 (45-102)||(14737085-14737142)
chr6 (50-228)||(6005822-6006001)
chr6 (192-262)||(6097786-6097858)
chr6 (464-582)||(4045423-4045542)
chr6 (498-627)||(603094-603222)
chr6 (45-100)||(28155090-28155145)
chr6 (696-806)||(2171350-2171456)
chr6 (745-809)||(412374-412437)
chr6 (51-102)||(5016975-5017026)
chr6 (51-102)||(31085952-31086003)
chr6 (11-65)||(16568599-16568652)
chr6 (45-102)||(5571749-5571806)
chr6 (42-102)||(24714938-24715000)
chr6 (173-268)||(26253698-26253795)
chr6 (289-334)||(6097732-6097776)
chr6 (150-187)||(13020087-13020124)
chr6 (450-531)||(16567185-16567265)
chr6 (52-97)||(21272469-21272514)
[»] chr5 (91 HSPs)
chr5 (45-814)||(10592844-10593621)
chr5 (11-814)||(40381855-40382665)
chr5 (45-814)||(40379678-40380454)
chr5 (11-814)||(16546182-16546996)
chr5 (44-814)||(25077705-25078484)
chr5 (44-814)||(25135674-25136453)
chr5 (44-814)||(16543993-16544774)
chr5 (53-813)||(29750969-29751715)
chr5 (357-812)||(29720256-29720721)
chr5 (357-812)||(29722416-29722881)
chr5 (357-814)||(22536103-22536563)
chr5 (53-809)||(9789042-9789800)
chr5 (53-809)||(18441462-18442224)
chr5 (357-806)||(16409367-16409824)
chr5 (357-809)||(26177775-26178234)
chr5 (45-262)||(22536634-22536852)
chr5 (9-283)||(27445328-27445602)
chr5 (9-260)||(26177430-26177685)
chr5 (11-222)||(29722118-29722332)
chr5 (53-262)||(29719974-29720187)
chr5 (58-261)||(24136266-24136470)
chr5 (45-283)||(43599079-43599318)
chr5 (45-283)||(43604571-43604810)
chr5 (45-283)||(43610063-43610302)
chr5 (45-283)||(27450171-27450409)
chr5 (357-630)||(25412647-25412926)
chr5 (357-809)||(26170666-26171114)
chr5 (9-228)||(28807040-28807260)
chr5 (45-228)||(30631764-30631948)
chr5 (9-262)||(16409041-16409298)
chr5 (57-260)||(26170370-26170576)
chr5 (9-283)||(43592634-43592890)
chr5 (357-630)||(13342946-13343226)
chr5 (44-259)||(1456637-1456852)
chr5 (357-806)||(30182474-30182933)
chr5 (357-630)||(36074045-36074327)
chr5 (57-262)||(16407654-16407862)
chr5 (9-227)||(37560911-37561130)
chr5 (464-630)||(213465-213631)
chr5 (464-630)||(13239751-13239917)
chr5 (483-630)||(37439161-37439307)
chr5 (45-228)||(15045096-15045279)
chr5 (53-167)||(29752266-29752381)
chr5 (45-222)||(29402550-29402728)
chr5 (9-228)||(33768587-33768808)
chr5 (464-630)||(40147261-40147426)
chr5 (464-627)||(32636824-32636986)
chr5 (464-630)||(28278316-28278481)
chr5 (57-168)||(15465000-15465112)
chr5 (464-627)||(13488203-13488365)
chr5 (464-627)||(42428436-42428598)
chr5 (9-88)||(43625605-43625684)
chr5 (464-630)||(5058047-5058210)
chr5 (464-631)||(27637614-27637781)
chr5 (9-228)||(31401310-31401531)
chr5 (467-627)||(33831683-33831842)
chr5 (357-627)||(16451966-16452242)
chr5 (57-168)||(36931856-36931968)
chr5 (464-609)||(13695713-13695859)
chr5 (381-625)||(30682930-30683178)
chr5 (357-627)||(31182858-31183133)
chr5 (45-227)||(37556125-37556308)
chr5 (464-627)||(533769-533931)
chr5 (464-627)||(28750661-28750823)
chr5 (40-228)||(33791719-33791909)
chr5 (173-323)||(35388016-35388169)
chr5 (126-268)||(38219803-38219947)
chr5 (57-208)||(9352820-9352972)
chr5 (50-228)||(2785778-2785957)
chr5 (467-623)||(8565956-8566111)
chr5 (467-627)||(39468555-39468714)
chr5 (464-612)||(42426255-42426403)
chr5 (467-625)||(538028-538185)
chr5 (107-257)||(31180637-31180787)
chr5 (478-611)||(16640961-16641091)
chr5 (464-630)||(27015531-27015688)
chr5 (44-102)||(31180773-31180831)
chr5 (467-621)||(9049354-9049506)
chr5 (468-627)||(38747009-38747167)
chr5 (50-102)||(14520796-14520848)
chr5 (22-66)||(28832772-28832816)
chr5 (470-623)||(316769-316922)
chr5 (564-627)||(19806463-19806525)
chr5 (50-228)||(31396495-31396674)
chr5 (467-630)||(3075661-3075823)
chr5 (57-94)||(35388196-35388233)
chr5 (567-627)||(4160702-4160762)
chr5 (52-102)||(12083658-12083708)
chr5 (518-627)||(33906035-33906144)
chr5 (57-102)||(11916457-11916502)
chr5 (518-614)||(42309953-42310048)
[»] chr1 (92 HSPs)
chr1 (44-841)||(9036002-9036801)
chr1 (45-814)||(44203218-44203995)
chr1 (53-809)||(40281967-40282730)
chr1 (45-813)||(21053540-21054314)
chr1 (53-789)||(20622072-20622812)
chr1 (53-813)||(9986794-9987558)
chr1 (357-809)||(51765280-51765747)
chr1 (9-262)||(19360876-19361133)
chr1 (9-228)||(44023341-44023561)
chr1 (9-228)||(41391002-41391221)
chr1 (9-228)||(25444556-25444776)
chr1 (463-630)||(13316354-13316521)
chr1 (45-228)||(39445898-39446082)
chr1 (57-323)||(19365781-19366051)
chr1 (467-630)||(8550789-8550952)
chr1 (357-629)||(20762557-20762837)
chr1 (61-262)||(51765007-51765211)
chr1 (45-228)||(25439399-25439583)
chr1 (464-630)||(37168297-37168463)
chr1 (44-228)||(1054513-1054698)
chr1 (464-630)||(3189330-3189496)
chr1 (464-630)||(3198147-3198313)
chr1 (464-630)||(3206986-3207152)
chr1 (107-261)||(24793709-24793864)
chr1 (464-630)||(13547092-13547257)
chr1 (464-630)||(42297977-42298143)
chr1 (464-630)||(13549003-13549168)
chr1 (464-630)||(29136247-29136413)
chr1 (464-630)||(47255342-47255508)
chr1 (57-168)||(24202264-24202376)
chr1 (464-627)||(28220232-28220394)
chr1 (464-627)||(44455160-44455322)
chr1 (464-630)||(11348698-11348863)
chr1 (41-269)||(13604091-13604322)
chr1 (124-261)||(24786905-24787042)
chr1 (357-627)||(3156751-3157027)
chr1 (467-627)||(834173-834332)
chr1 (464-630)||(7482233-7482399)
chr1 (464-627)||(28265560-28265722)
chr1 (464-630)||(31925710-31925875)
chr1 (464-628)||(34603576-34603740)
chr1 (464-625)||(50169218-50169378)
chr1 (464-630)||(37033074-37033241)
chr1 (464-630)||(47115171-47115338)
chr1 (464-627)||(4552643-4552805)
chr1 (464-623)||(49918350-49918508)
chr1 (464-612)||(37503577-37503722)
chr1 (464-627)||(28223427-28223589)
chr1 (464-627)||(45644360-45644523)
chr1 (464-630)||(193611-193776)
chr1 (464-627)||(19754494-19754657)
chr1 (464-612)||(23555286-23555433)
chr1 (464-627)||(31659238-31659400)
chr1 (464-609)||(1833522-1833667)
chr1 (9-102)||(13598967-13599059)
chr1 (464-623)||(50167185-50167343)
chr1 (107-228)||(41398657-41398778)
chr1 (482-612)||(15820326-15820455)
chr1 (467-623)||(3847131-3847286)
chr1 (467-627)||(13659342-13659501)
chr1 (192-323)||(24202379-24202513)
chr1 (464-608)||(41360914-41361058)
chr1 (467-627)||(46064921-46065080)
chr1 (549-630)||(28242391-28242470)
chr1 (469-608)||(22079322-22079461)
chr1 (45-102)||(24793666-24793723)
chr1 (464-623)||(37559877-37560037)
chr1 (9-66)||(47102298-47102354)
chr1 (464-627)||(13137982-13138142)
chr1 (464-623)||(19752685-19752844)
chr1 (149-228)||(43988054-43988133)
chr1 (40-102)||(41398764-41398826)
chr1 (57-102)||(21536125-21536170)
chr1 (549-630)||(37876769-37876848)
chr1 (485-627)||(927982-928123)
chr1 (58-102)||(37070334-37070378)
chr1 (50-121)||(26644379-26644450)
chr1 (11-65)||(28220796-28220850)
chr1 (549-612)||(36683766-36683828)
chr1 (464-537)||(37879005-37879079)
chr1 (467-536)||(8871143-8871213)
chr1 (464-627)||(30476452-30476614)
chr1 (469-564)||(12318589-12318685)
chr1 (486-550)||(48382441-48382505)
chr1 (478-544)||(3460710-3460778)
chr1 (482-545)||(32736952-32737015)
chr1 (482-545)||(35109493-35109556)
chr1 (478-623)||(37282701-37282846)
chr1 (45-102)||(3282273-3282331)
chr1 (44-102)||(13659840-13659898)
chr1 (467-623)||(40122206-40122363)
chr1 (61-102)||(16124197-16124238)
[»] chr7 (105 HSPs)
chr7 (11-814)||(6592145-6592955)
chr7 (45-814)||(18392001-18392780)
chr7 (45-814)||(6594363-6595137)
chr7 (142-814)||(18388565-18389246)
chr7 (45-814)||(32060127-32060888)
chr7 (357-815)||(20343789-20344256)
chr7 (53-687)||(24789435-24790074)
chr7 (45-534)||(1562103-1562587)
chr7 (541-814)||(1560470-1560757)
chr7 (357-806)||(43503975-43504431)
chr7 (357-741)||(39731261-39731656)
chr7 (9-263)||(21640204-21640459)
chr7 (45-262)||(20343500-20343718)
chr7 (57-630)||(25766962-25767527)
chr7 (45-326)||(2058321-2058604)
chr7 (9-323)||(18409116-18409435)
chr7 (45-263)||(20357028-20357247)
chr7 (57-323)||(21646360-21646630)
chr7 (374-630)||(35853818-35854080)
chr7 (57-262)||(43504500-43504708)
chr7 (357-630)||(29990940-29991219)
chr7 (357-630)||(48408687-48408970)
chr7 (9-282)||(12397267-12397528)
chr7 (57-261)||(39730946-39731153)
chr7 (45-282)||(12406619-12406857)
chr7 (57-323)||(18413992-18414262)
chr7 (88-261)||(1532947-1533121)
chr7 (45-261)||(4873505-4873721)
chr7 (464-630)||(34310718-34310884)
chr7 (464-630)||(23555039-23555206)
chr7 (44-228)||(21811738-21811923)
chr7 (57-262)||(48408411-48408619)
chr7 (9-228)||(24265641-24265861)
chr7 (394-626)||(25615785-25616015)
chr7 (374-630)||(4178678-4178939)
chr7 (464-630)||(22269973-22270138)
chr7 (44-228)||(24023818-24024003)
chr7 (464-627)||(14069839-14070001)
chr7 (464-627)||(14379867-14380029)
chr7 (11-101)||(18390506-18390596)
chr7 (41-261)||(31109066-31109287)
chr7 (464-627)||(41317440-41317602)
chr7 (376-630)||(19502083-19502344)
chr7 (9-228)||(16880476-16880696)
chr7 (464-630)||(8359318-8359485)
chr7 (464-627)||(27347817-27347979)
chr7 (464-631)||(29608737-29608903)
chr7 (464-625)||(30024740-30024900)
chr7 (22-121)||(21983790-21983890)
chr7 (464-628)||(6431971-6432134)
chr7 (464-612)||(48491579-48491727)
chr7 (467-627)||(41649017-41649175)
chr7 (464-630)||(3258995-3259160)
chr7 (518-630)||(32358057-32358167)
chr7 (464-630)||(48599337-48599502)
chr7 (482-631)||(2390301-2390448)
chr7 (464-627)||(2360978-2361140)
chr7 (464-627)||(8153342-8153504)
chr7 (464-627)||(18126644-18126806)
chr7 (464-623)||(4253538-4253697)
chr7 (464-630)||(4508709-4508874)
chr7 (683-806)||(24790230-24790349)
chr7 (357-627)||(38671228-38671505)
chr7 (464-624)||(47673953-47674111)
chr7 (464-627)||(4586161-4586323)
chr7 (464-627)||(31732975-31733137)
chr7 (464-627)||(48489431-48489593)
chr7 (45-208)||(2479795-2479960)
chr7 (464-625)||(47676144-47676304)
chr7 (464-623)||(36146418-36146576)
chr7 (464-627)||(43864244-43864406)
chr7 (464-630)||(4510551-4510716)
chr7 (464-630)||(4512393-4512558)
chr7 (45-121)||(47264190-47264267)
chr7 (483-625)||(23565069-23565210)
chr7 (45-228)||(24260821-24261005)
chr7 (42-228)||(16885331-16885518)
chr7 (467-627)||(31105399-31105558)
chr7 (464-627)||(26417316-26417477)
chr7 (45-121)||(44847619-44847696)
chr7 (467-612)||(496003-496148)
chr7 (469-627)||(22328395-22328556)
chr7 (467-614)||(1113660-1113807)
chr7 (464-536)||(23343975-23344048)
chr7 (464-535)||(24525992-24526065)
chr7 (57-105)||(1532897-1532945)
chr7 (489-623)||(2759207-2759339)
chr7 (9-66)||(9189464-9189520)
chr7 (45-121)||(21989454-21989531)
chr7 (9-49)||(20000330-20000370)
chr7 (52-102)||(79955-80005)
chr7 (518-627)||(6359958-6360065)
chr7 (464-536)||(12097954-12098027)
chr7 (529-627)||(18396384-18396481)
chr7 (549-627)||(24525508-24525584)
chr7 (549-625)||(31518988-31519063)
chr7 (464-627)||(36574522-36574683)
chr7 (357-466)||(24514934-24515043)
chr7 (564-627)||(30814536-30814598)
chr7 (464-564)||(31518795-31518896)
chr7 (87-121)||(4509335-4509369)
chr7 (87-121)||(4511177-4511211)
chr7 (87-121)||(6431467-6431501)
chr7 (483-536)||(28617182-28617234)
chr7 (58-103)||(49092237-49092282)
[»] chr3 (127 HSPs)
chr3 (44-814)||(3617033-3617813)
chr3 (39-815)||(54634704-54635484)
chr3 (45-814)||(25637013-25637793)
chr3 (11-814)||(4598328-4599141)
chr3 (45-815)||(45282585-45283346)
chr3 (11-814)||(10057993-10058804)
chr3 (11-814)||(10060215-10061026)
chr3 (11-814)||(10062437-10063248)
chr3 (11-814)||(10064659-10065470)
chr3 (45-814)||(4600549-4601328)
chr3 (45-839)||(6716085-6716881)
chr3 (53-814)||(10055813-10056582)
chr3 (11-566)||(10066881-10067431)
chr3 (357-814)||(10211288-10211758)
chr3 (357-814)||(10209068-10209538)
chr3 (11-498)||(6718254-6718718)
chr3 (11-327)||(10210944-10211264)
chr3 (9-739)||(23197823-23198566)
chr3 (57-809)||(23199957-23200716)
chr3 (427-809)||(7779821-7780208)
chr3 (376-806)||(801003-801435)
chr3 (45-264)||(10208778-10208999)
chr3 (45-324)||(40372256-40372538)
chr3 (45-283)||(8477764-8478002)
chr3 (12-282)||(22172629-22172899)
chr3 (9-261)||(28503283-28503535)
chr3 (9-260)||(1306385-1306640)
chr3 (45-324)||(7167600-7167882)
chr3 (368-630)||(45095062-45095329)
chr3 (53-259)||(800694-800903)
chr3 (61-268)||(27352097-27352305)
chr3 (357-630)||(37408344-37408624)
chr3 (593-814)||(10067435-10067669)
chr3 (357-630)||(5260325-5260606)
chr3 (364-630)||(5258146-5258420)
chr3 (376-630)||(9636128-9636390)
chr3 (45-261)||(28501152-28501368)
chr3 (467-630)||(19683891-19684054)
chr3 (464-630)||(7762265-7762431)
chr3 (91-262)||(2671111-2671283)
chr3 (45-228)||(18656844-18657029)
chr3 (357-630)||(7764353-7764630)
chr3 (471-630)||(9581290-9581448)
chr3 (9-228)||(32475887-32476108)
chr3 (464-630)||(34491212-34491377)
chr3 (9-228)||(8512643-8512863)
chr3 (464-627)||(4569952-4570115)
chr3 (9-228)||(2676538-2676759)
chr3 (107-257)||(8738585-8738736)
chr3 (107-257)||(9090823-9090974)
chr3 (464-627)||(29196392-29196555)
chr3 (57-262)||(26928093-26928301)
chr3 (22-208)||(37408013-37408200)
chr3 (467-627)||(39153367-39153526)
chr3 (464-630)||(49199471-49199638)
chr3 (57-169)||(7782586-7782699)
chr3 (357-627)||(40735268-40735545)
chr3 (57-208)||(33386150-33386302)
chr3 (464-630)||(41819525-41819691)
chr3 (464-630)||(43401803-43401970)
chr3 (468-623)||(30236129-30236283)
chr3 (464-627)||(40734498-40734660)
chr3 (464-627)||(44331545-44331707)
chr3 (464-630)||(6095602-6095767)
chr3 (467-625)||(22835010-22835167)
chr3 (57-208)||(37726134-37726286)
chr3 (464-630)||(54593704-54593869)
chr3 (467-612)||(760850-760995)
chr3 (357-627)||(32744442-32744709)
chr3 (464-630)||(43403746-43403913)
chr3 (464-623)||(44700489-44700646)
chr3 (466-624)||(31314447-31314604)
chr3 (107-323)||(32143664-32143884)
chr3 (464-630)||(46860474-46860640)
chr3 (57-228)||(2672431-2672603)
chr3 (464-625)||(53921511-53921671)
chr3 (57-268)||(27453355-27453568)
chr3 (467-627)||(29682362-29682521)
chr3 (9-103)||(36029658-36029752)
chr3 (464-627)||(5236463-5236624)
chr3 (464-627)||(29813063-29813225)
chr3 (464-612)||(29810868-29811016)
chr3 (466-625)||(32891105-32891264)
chr3 (483-623)||(46173377-46173515)
chr3 (468-623)||(51398818-51398972)
chr3 (9-66)||(3327806-3327863)
chr3 (52-228)||(32480745-32480922)
chr3 (9-66)||(37466876-37466932)
chr3 (192-328)||(7782445-7782584)
chr3 (45-228)||(8517523-8517707)
chr3 (467-627)||(16499033-16499191)
chr3 (524-630)||(55301974-55302079)
chr3 (464-627)||(23391915-23392077)
chr3 (522-627)||(40913352-40913455)
chr3 (45-102)||(8738542-8738599)
chr3 (45-102)||(9090780-9090837)
chr3 (464-536)||(5433971-5434046)
chr3 (9-65)||(6794184-6794240)
chr3 (50-102)||(21711768-21711820)
chr3 (45-228)||(24968520-24968704)
chr3 (57-200)||(27027174-27027318)
chr3 (45-104)||(27974433-27974493)
chr3 (54-102)||(40734084-40734132)
chr3 (467-627)||(9666472-9666632)
chr3 (57-104)||(32143868-32143915)
chr3 (467-627)||(47304254-47304413)
chr3 (52-102)||(16264896-16264946)
chr3 (52-102)||(30709266-30709316)
chr3 (41-102)||(39032013-39032075)
chr3 (464-593)||(51352150-51352278)
chr3 (464-599)||(36018852-36018987)
chr3 (22-102)||(40734984-40735063)
chr3 (469-582)||(4055813-4055926)
chr3 (565-624)||(27305719-27305777)
chr3 (58-104)||(27985971-27986017)
chr3 (107-208)||(27986001-27986103)
chr3 (51-95)||(1730915-1730959)
chr3 (50-102)||(27038608-27038660)
chr3 (476-535)||(28253363-28253423)
chr3 (51-102)||(40592251-40592302)
chr3 (44-102)||(16498636-16498694)
chr3 (52-102)||(35926057-35926106)
chr3 (53-103)||(40845220-40845270)
chr3 (52-102)||(48438782-48438832)
chr3 (484-537)||(25517069-25517121)
chr3 (464-566)||(31340266-31340369)
chr3 (146-187)||(36536789-36536830)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (45-814)||(2409-3185)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (45-814)||(12647191-12647967)
chr2 (53-789)||(6266283-6267023)
chr2 (444-814)||(13655834-13656220)
chr2 (57-806)||(4484151-4484910)
chr2 (57-809)||(32289161-32289916)
chr2 (57-741)||(30832934-30833633)
chr2 (45-317)||(9295862-9296137)
chr2 (45-261)||(14291908-14292125)
chr2 (357-630)||(45099640-45099920)
chr2 (45-261)||(11098387-11098604)
chr2 (57-260)||(25410047-25410253)
chr2 (357-630)||(5723258-5723537)
chr2 (357-740)||(4503017-4503415)
chr2 (357-630)||(36205667-36205946)
chr2 (57-323)||(3492094-3492364)
chr2 (357-626)||(2334424-2334700)
chr2 (357-630)||(36988078-36988358)
chr2 (45-261)||(39811477-39811693)
chr2 (464-630)||(45726929-45727094)
chr2 (464-630)||(6595008-6595175)
chr2 (464-627)||(29867869-29868031)
chr2 (9-228)||(19344825-19345046)
chr2 (57-282)||(40739217-40739444)
chr2 (467-627)||(34139776-34139936)
chr2 (464-630)||(35446887-35447052)
chr2 (467-624)||(14633834-14633991)
chr2 (482-627)||(723750-723893)
chr2 (45-167)||(32247229-32247352)
chr2 (464-631)||(1631734-1631900)
chr2 (464-627)||(38312240-38312402)
chr2 (357-612)||(42362237-42362500)
chr2 (44-122)||(44310470-44310548)
chr2 (469-627)||(33648176-33648335)
chr2 (464-627)||(36773562-36773724)
chr2 (464-598)||(13121769-13121901)
chr2 (464-630)||(24398055-24398224)
chr2 (464-623)||(11067305-11067463)
chr2 (464-627)||(11151597-11151759)
chr2 (464-627)||(17057375-17057537)
chr2 (464-627)||(17085358-17085520)
chr2 (464-627)||(36318015-36318177)
chr2 (464-627)||(26353184-26353346)
chr2 (518-627)||(17490154-17490261)
chr2 (467-625)||(11690504-11690661)
chr2 (464-623)||(33162460-33162618)
chr2 (464-627)||(42288117-42288278)
chr2 (464-582)||(7815323-7815441)
chr2 (9-102)||(39483443-39483535)
chr2 (9-65)||(14634383-14634438)
chr2 (58-228)||(19349683-19349854)
chr2 (52-102)||(8389631-8389681)
chr2 (50-104)||(36757423-36757477)
chr2 (518-630)||(7451173-7451282)
chr2 (45-104)||(28258669-28258729)
chr2 (51-102)||(33528104-33528155)
chr2 (564-627)||(39284936-39284998)
chr2 (52-102)||(10706733-10706783)
chr2 (52-102)||(21630511-21630561)
chr2 (51-96)||(20522794-20522839)
chr2 (522-621)||(28671989-28672088)
chr2 (153-187)||(2334769-2334803)
chr2 (564-630)||(17450678-17450742)
chr2 (52-102)||(23077952-23078002)
chr2 (126-269)||(28258733-28258877)
chr2 (468-535)||(14202501-14202569)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (11-814)||(8395157-8395967)
chr4 (53-814)||(7122275-7123046)
chr4 (45-814)||(8392982-8393758)
chr4 (11-814)||(5137841-5138654)
chr4 (45-814)||(5135649-5136429)
chr4 (357-814)||(7124794-7125265)
chr4 (53-803)||(31495130-31495893)
chr4 (57-630)||(13992295-13992866)
chr4 (11-236)||(7124455-7124681)
chr4 (45-324)||(24742295-24742577)
chr4 (9-261)||(9228650-9228902)
chr4 (11-228)||(18856125-18856343)
chr4 (357-630)||(29999808-30000088)
chr4 (45-271)||(51520824-51521050)
chr4 (43-261)||(56141509-56141728)
chr4 (57-282)||(28467990-28468217)
chr4 (357-630)||(56178639-56178919)
chr4 (45-261)||(9223899-9224115)
chr4 (45-228)||(5733062-5733247)
chr4 (464-630)||(52095365-52095530)
chr4 (45-228)||(3814422-3814605)
chr4 (107-262)||(29761040-29761196)
chr4 (45-228)||(45347317-45347501)
chr4 (464-630)||(48143042-48143209)
chr4 (464-629)||(41964415-41964580)
chr4 (468-630)||(2209717-2209880)
chr4 (483-630)||(5370085-5370232)
chr4 (464-624)||(9927467-9927626)
chr4 (464-630)||(46703500-46703667)
chr4 (464-627)||(12739556-12739718)
chr4 (45-135)||(18860431-18860521)
chr4 (464-627)||(26364236-26364398)
chr4 (464-627)||(40632445-40632607)
chr4 (464-630)||(12073392-12073558)
chr4 (464-630)||(41639426-41639591)
chr4 (85-224)||(18712295-18712435)
chr4 (464-627)||(47038417-47038577)
chr4 (464-612)||(8665408-8665556)
chr4 (467-630)||(379383-379546)
chr4 (482-630)||(6655975-6656121)
chr4 (483-627)||(12743931-12744073)
chr4 (483-627)||(12745320-12745462)
chr4 (464-627)||(26175642-26175804)
chr4 (464-627)||(36463395-36463557)
chr4 (464-627)||(36994524-36994686)
chr4 (464-627)||(54883020-54883182)
chr4 (464-630)||(8648139-8648304)
chr4 (464-623)||(37229731-37229890)
chr4 (466-627)||(46147397-46147557)
chr4 (22-104)||(5143807-5143890)
chr4 (464-624)||(37740625-37740784)
chr4 (464-627)||(34570420-34570582)
chr4 (464-627)||(45687188-45687351)
chr4 (464-627)||(48893644-48893810)
chr4 (518-630)||(50673850-50673960)
chr4 (464-627)||(6542185-6542349)
chr4 (57-168)||(31985140-31985252)
chr4 (466-630)||(12119540-12119705)
chr4 (464-624)||(27416974-27417133)
chr4 (464-612)||(54199926-54200074)
chr4 (464-627)||(4587958-4588121)
chr4 (471-627)||(5207848-5208003)
chr4 (9-102)||(16628310-16628403)
chr4 (20-102)||(6742864-6742946)
chr4 (464-624)||(35662441-35662600)
chr4 (464-627)||(5429679-5429841)
chr4 (464-627)||(5871820-5871982)
chr4 (479-627)||(26699447-26699596)
chr4 (464-627)||(31474150-31474313)
chr4 (9-101)||(3778116-3778207)
chr4 (464-594)||(12747794-12747924)
chr4 (468-630)||(50262703-50262865)
chr4 (483-592)||(12744087-12744195)
chr4 (464-592)||(12745476-12745604)
chr4 (464-630)||(52082666-52082825)
chr4 (467-627)||(52467360-52467519)
chr4 (50-105)||(8689042-8689097)
chr4 (173-323)||(31985236-31985389)
chr4 (57-102)||(29761182-29761227)
chr4 (108-228)||(45356861-45356982)
chr4 (50-121)||(5148225-5148296)
chr4 (52-102)||(38151918-38151968)
chr4 (464-582)||(24969112-24969230)
chr4 (51-103)||(5268698-5268750)
chr4 (52-102)||(10047932-10047982)
chr4 (538-612)||(13009464-13009536)
chr4 (52-102)||(16622774-16622824)
chr4 (468-536)||(48142473-48142542)
chr4 (464-552)||(41639263-41639353)
chr4 (51-102)||(54867745-54867796)
chr4 (478-536)||(1983252-1983309)
chr4 (549-627)||(29254580-29254656)
chr4 (469-550)||(44967910-44967992)
chr4 (153-187)||(48142823-48142857)
chr4 (153-187)||(52083009-52083043)
chr4 (153-187)||(52094016-52094050)
chr4 (57-102)||(36314716-36314761)
chr4 (57-102)||(36328925-36328970)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (44-814)||(5858-6638)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (42-839)||(3439085-3439886)
chr8 (107-817)||(25689604-25690316)
chr8 (44-814)||(42575130-42575910)
chr8 (357-814)||(15290417-15290887)
chr8 (357-814)||(15470786-15471256)
chr8 (57-809)||(2627331-2628087)
chr8 (9-263)||(33037251-33037506)
chr8 (45-264)||(15290143-15290364)
chr8 (45-264)||(15470512-15470733)
chr8 (45-282)||(4759534-4759771)
chr8 (14-283)||(18869990-18870259)
chr8 (45-261)||(30656065-30656282)
chr8 (45-261)||(36979797-36980014)
chr8 (357-630)||(34254333-34254611)
chr8 (45-268)||(18852627-18852851)
chr8 (58-282)||(1261428-1261654)
chr8 (357-630)||(17982538-17982819)
chr8 (357-630)||(34256509-34256787)
chr8 (45-261)||(7289427-7289644)
chr8 (357-630)||(31218142-31218423)
chr8 (45-228)||(10683739-10683923)
chr8 (375-630)||(44303758-44304021)
chr8 (52-263)||(6311717-6311928)
chr8 (357-630)||(19945361-19945643)
chr8 (57-241)||(26288319-26288504)
chr8 (57-241)||(26301576-26301761)
chr8 (57-241)||(26313570-26313755)
chr8 (45-228)||(39784325-39784509)
chr8 (464-630)||(42498193-42498360)
chr8 (478-630)||(1746221-1746371)
chr8 (9-263)||(10688582-10688817)
chr8 (45-224)||(25327664-25327844)
chr8 (464-630)||(42434994-42435159)
chr8 (57-167)||(31042921-31043032)
chr8 (464-627)||(15212786-15212948)
chr8 (464-627)||(27811278-27811440)
chr8 (464-630)||(4283524-4283689)
chr8 (464-627)||(3303676-3303838)
chr8 (464-627)||(33352150-33352312)
chr8 (464-627)||(43036423-43036585)
chr8 (464-630)||(18655400-18655565)
chr8 (466-627)||(40321082-40321242)
chr8 (478-627)||(12702640-12702787)
chr8 (464-627)||(40221745-40221907)
chr8 (45-208)||(7412787-7412952)
chr8 (467-606)||(40328782-40328922)
chr8 (464-626)||(18141821-18141981)
chr8 (467-594)||(44353796-44353923)
chr8 (470-612)||(30143346-30143488)
chr8 (467-612)||(1345391-1345536)
chr8 (464-624)||(30291606-30291767)
chr8 (467-627)||(6598975-6599134)
chr8 (467-627)||(6674428-6674587)
chr8 (464-627)||(4731658-4731820)
chr8 (468-627)||(5689275-5689433)
chr8 (464-626)||(1292471-1292631)
chr8 (464-627)||(8965697-8965859)
chr8 (464-582)||(9765745-9765863)
chr8 (468-630)||(11383989-11384150)
chr8 (45-102)||(25689561-25689618)
chr8 (468-626)||(41366622-41366778)
chr8 (466-627)||(10930205-10930365)
chr8 (464-608)||(19491723-19491867)
chr8 (50-228)||(35745794-35745973)
chr8 (539-627)||(4743220-4743306)
chr8 (482-627)||(4162516-4162658)
chr8 (51-102)||(5701958-5702009)
chr8 (9-66)||(19751853-19751909)
chr8 (518-632)||(18106082-18106191)
chr8 (518-627)||(10015136-10015241)
chr8 (549-627)||(4733792-4733868)
chr8 (57-102)||(4456575-4456620)
chr8 (469-536)||(1822297-1822365)
chr8 (469-536)||(1856742-1856810)
chr8 (488-608)||(11712024-11712145)
chr8 (660-740)||(31218459-31218541)
chr8 (9-43)||(35741124-35741158)
chr8 (468-550)||(41364927-41365011)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (17-793)||(3554-4338)
[»] scaffold0491 (3 HSPs)
scaffold0491 (57-741)||(11042-11740)
scaffold0491 (9-262)||(9088-9344)
scaffold0491 (462-741)||(8616-8907)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (636-793)||(49-205)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (357-630)||(434418-434699)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (57-262)||(17444-17652)
[»] scaffold1519 (2 HSPs)
scaffold1519 (357-630)||(802-1081)
scaffold1519 (85-323)||(523-765)
[»] scaffold0286 (4 HSPs)
scaffold0286 (58-262)||(21953-22160)
scaffold0286 (464-630)||(11557-11723)
scaffold0286 (357-414)||(22229-22286)
scaffold0286 (696-806)||(11804-11911)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (45-228)||(761-945)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (464-630)||(114602-114768)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (45-282)||(3337-3575)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (9-228)||(13748-13968)
scaffold0197 (9-261)||(18627-18880)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (9-282)||(1703-1977)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (45-261)||(34554-34770)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (464-630)||(18006-18171)
[»] scaffold0006 (5 HSPs)
scaffold0006 (41-269)||(132748-132979)
scaffold0006 (9-102)||(6252-6344)
scaffold0006 (467-627)||(149103-149262)
scaffold0006 (51-102)||(3060-3111)
scaffold0006 (44-102)||(149601-149659)
[»] scaffold1455 (1 HSPs)
scaffold1455 (45-120)||(1709-1784)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (464-630)||(7327-7492)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (57-168)||(7924-8036)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (464-627)||(20421-20583)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (488-627)||(10515-10651)
[»] scaffold0665 (2 HSPs)
scaffold0665 (107-224)||(8112-8230)
scaffold0665 (45-102)||(8216-8273)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (44-282)||(148443-148682)
[»] scaffold0510 (1 HSPs)
scaffold0510 (44-121)||(1082-1160)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (52-228)||(176457-176634)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (57-121)||(43447-43511)
scaffold0087 (50-104)||(36330-36384)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (57-104)||(45744-45791)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (468-563)||(80351-80447)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (149-187)||(25245-25283)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (31-102)||(86153-86225)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 585; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 839
Target Start/End: Original strand, 16554420 - 16555253
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16554420 catcatcgccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgattttggtatcg 16554519  T
Q  111 tgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554520 tgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttacagggtgcaaaattgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 16554619  T
Q  210 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||   |||||||   |      
T  16554620 tccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagtata--aat 16554717  T
Q  307 tgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagag 406  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554718 tgttcttgtgcagatttgaagagaagagttggaagtgagagaga------cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagag 16554811  T
Q  407 tatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatt 506  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554812 tatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatt 16554911  T
Q  507 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  16554912 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggt 16555011  T
Q  607 caagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttg 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555012 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttg 16555111  T
Q  695 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattt 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555112 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattt 16555208  T
Q  795 tgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 839  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555209 agtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 16555253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 839
Target Start/End: Original strand, 16630976 - 16631809
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16630976 catcatcgccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgattttggtatcg 16631075  T
Q  111 tgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631076 tgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttacagggtgcaaaattgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 16631175  T
Q  210 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||   |||||||   |      
T  16631176 tccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagtata--aat 16631273  T
Q  307 tgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagag 406  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631274 tgttcttgtgcagatttgaagagaagagttggaagtgagagaga------cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagag 16631367  T
Q  407 tatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatt 506  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631368 tatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatt 16631467  T
Q  507 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  16631468 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggt 16631567  T
Q  607 caagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttg 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631568 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttg 16631667  T
Q  695 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattt 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631668 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattt 16631764  T
Q  795 tgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 839  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631765 agtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 16631809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 16579101 - 16578302
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16579101 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttgc 16579002  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  16579001 agggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggta 16578902  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaagactagtattttatgt-gttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannn 342  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||   ||| | ||  | |||||||||||||||||||| |  ||||||||       
T  16578901 cgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagtataaattgttcttgtgcagatttgaagagaggagttggaagt 16578802  T
Q  343 nnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgta 442  Q
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16578801 gagagaga------cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgta 16578708  T
Q  443 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578707 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 16578608  T
Q  543 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------ 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  16578607 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 16578508  T
Q  631 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578507 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 16578408  T
Q  731 gttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaa 830  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578407 gttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatttagtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaa 16578311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 839
Target Start/End: Original strand, 16616279 - 16617078
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16616279 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttgc 16616378  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  16616379 agggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggta 16616478  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaagactagtattttatgt-gttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannn 342  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||   ||| | ||  | |||||||||||||||||||| |  ||||||||       
T  16616479 cgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagtataaattgttcttgtgcagatttgaagagaggagttggaagt 16616578  T
Q  343 nnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgta 442  Q
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16616579 gagagaga------cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgta 16616672  T
Q  443 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616673 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 16616772  T
Q  543 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------ 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  16616773 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 16616872  T
Q  631 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616873 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 16616972  T
Q  731 gttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaa 830  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616973 gttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatttagtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaa 16617069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 839
Target Start/End: Original strand, 16652682 - 16653496
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                    
T  16652682 catcatcaccaaatttgaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagggaaatcgtga---------------- 16652765  T
Q  111 tgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 209  Q
       |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16652766 ---cacgatttcggggtgccgtgagctaggttgtagggtgcaaagtcgtggaacgatttgggaaaatcgtgacacaatcgtgaaacttgctcgttaagta 16652862  T
Q  210 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||   |||||||   |      
T  16652863 tccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagtata--aat 16652960  T
Q  307 tgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagag 406  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||                 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652961 tgttcttgtgcagatttgaagagaagagttggaagtgagagaga------cttggagaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagag 16653054  T
Q  407 tatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatt 506  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16653055 tatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcatt 16653154  T
Q  507 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16653155 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggt 16653254  T
Q  607 caagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttg 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653255 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttg 16653354  T
Q  695 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattt 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653355 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattt 16653451  T
Q  795 tgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 839  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653452 agtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 16653496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 34166632 - 34167443
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34166632 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 34166731  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacga-tttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34166732 tgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc-aaatcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 34166830  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  34166831 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 34166929  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |                 |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34166930 agtgttcttgtgcagatttgaa-gagagggttgaa--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattag 34167020  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34167021 agtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttca 34167118  T
Q  505 ttgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagt 602  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34167119 tagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaacttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 34167218  T
Q  603 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcac 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34167219 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcac 34167316  T
Q  690 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat 789  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34167317 acttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgctcaatattttttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 34167416  T
Q  790 tat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  34167417 tattctttgtattggtgtggttcgatc 34167443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 814
Target Start/End: Original strand, 6026832 - 6027609
Alignment:
Q  43 aatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctagg-t 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||| | |||||||| |    
T  6026832 aatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaatagggaaatcgtgacacgattgcggcattgtgacacgatttcgaggtgc-gagagctagggt 6026930  T
Q  141 tgcagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 239  Q
    ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6026931 tgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttggga 6027029  T
Q  240 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag-t 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  6027030 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-agaggt 6027127  T
Q  336 tggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaaca 435  Q
    ||||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6027128 tggaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaaca 6027219  T
Q  436 ccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaac 535  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027220 ccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaac 6027317  T
Q  536 cttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---- 630  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        
T  6027318 ctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 6027417  T
Q  631 -----tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 721  Q
         ||| |   |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6027418 ctctttgtgtttattgttttcttcttccctc-cat--tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 6027514  T
Q  722 ttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6027515 ttgttgtttcttgcttgcacaatacaccttgttaggtggttacccctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 6027609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 814
Target Start/End: Original strand, 25421000 - 25421669
Alignment:
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 251  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421000 aaatcgtgacatgatt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 25421098  T
Q  252 gtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag-ttggannnnnnnn 347  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||   |||| |||||            
T  25421099 gtgacatgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagaa-agaggttggaagagagag 25421196  T
Q  348 nnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 447  Q
             |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421197 a--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 25421288  T
Q  448 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25421289 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccc 25421388  T
Q  548 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------tgtat-- 635  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |      
T  25421389 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgttt 25421488  T
Q  636 -ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgtt 733  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25421489 attgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 25421586  T
Q  734 gcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25421587 gcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 25421669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 33342688 - 33341908
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33342688 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacatggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacgcgatttcggatgccgtgagctagggttgc 33342589  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttg-ggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342588 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 33342490  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |   | ||||    
T  33342489 gacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagagagaatttgg 33342391  T
Q  339 annnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacct 438  Q
    |                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33342390 aagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacct 33342299  T
Q  439 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacct 537  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33342298 tgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacct 33342201  T
Q  538 tttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgt 633  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |    
T  33342200 cttgtactccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 33342101  T
Q  634 at---------ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 721  Q
     |         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342100 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 33342003  T
Q  722 ttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33342002 ttgttgtttcttgcttgcacaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 33341908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 814
Target Start/End: Original strand, 34164452 - 34165221
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgc 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||    
T  34164452 ttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattctgggatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc 34164551  T
Q  151 aaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 249  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164552 aaa-tcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 34164650  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | || |||| |           
T  34164651 tcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-agggttgaaagagaga 34164748  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 446  Q
              |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  34164749 ga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--ga 34164838  T
Q  447 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatc 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34164839 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatt 34164938  T
Q  546 ccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat------ 635  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |          
T  34164939 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 34165038  T
Q  636 ---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 730  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34165039 ttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgttt 34165135  T
Q  731 gttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
     |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34165136 cttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 34165221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 357 - 839
Target Start/End: Original strand, 27647755 - 27648232
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27647755 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgta--gagagaatcat 27647852  T
Q  456 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647853 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 27647952  T
Q  556 gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtatttgttttct 644  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||  ||||||||||    
T  27647953 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 27648051  T
Q  645 tcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaat 744  Q
    |||||||||||||  ||||||      |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  27648052 tcttccctctcct--tttatc------ttgtgtattgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ac 27648142  T
Q  745 acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 839  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||    
T  27648143 acactttgttcggtggttaccactctcctttgctccacacatcat--tcttgtattggtgtggttcgatc---taggtgatcggaattcacaaca 27648232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 53 - 721
Target Start/End: Original strand, 411694 - 412369
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||     
T  411694 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaatagggaaatcgtgacacgaatttggcattgtgacacaatttcgtggtgccgtgagctagtctgcagggtgcc 411793  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 248  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |    
T  411794 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacca 411893  T
Q  249 atcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacag---aagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnn 345  Q
    |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||  | |||   ||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||          
T  411894 atcgtgacacaatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggg---agttggaagagag 411988  T
Q  346 nnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaa 444  Q
               |||| | |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  411989 agaaa------cttgagaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaaga 412081  T
Q  445 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttg 541  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||    
T  412082 gagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttg 412180  T
Q  542 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------- 630  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  412181 tatctcttttgtaagaactca-ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttg 412279  T
Q  631 -tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 721  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  412280 gtgtatttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 53 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 3073334 - 3072580
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |  | ||| ||||     
T  3073334 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacaggaaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtctacagggtgcc 3073235  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aa 249  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||  ||    
T  3073234 aaatcgtgacacgattgttggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggatggatgcactaa 3073135  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    |||| |||||||  ||||| || ||||||||||  | |||  ||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  |||||||||           
T  3073134 tcgttacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttggaag--agagttggaagagaga 3073039  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaa 444  Q
              |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |    
T  3073038 aa--------cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaaga 3072948  T
Q  445 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttg 541  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||    
T  3072947 gagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttg 3072849  T
Q  542 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------- 630  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  3072848 tatctcttttgtaagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttgg 3072750  T
Q  631 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggt-gttttgttgtt 729  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |    
T  3072749 tgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctatgtgctatttttgttgat 3072652  T
Q  730 tgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtg 806  Q
    | ||||||||||   |||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3072651 tattgcttgcac---acactttg-ttagtggttactactttcctttgctccacacatca-tatttcgtattggtgtg 3072580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 444 - 814
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154278
Alignment:
Q  444 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13153893 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 13153992  T
Q  543 atcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat--- 635  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |       
T  13153993 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 13154092  T
Q  636 ------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 728  Q
          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13154093 tgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgt 13154190  T
Q  729 ttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13154191 ttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 13154278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 45 - 281
Target Start/End: Original strand, 25420797 - 25421034
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25420797 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacaattttgggaccgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 25420896  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25420897 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 25420995  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgat 281  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25420996 acgcaaatcgtgacatgattgggaaaatcgtgacacgat 25421034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 45 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6136547 - 6136263
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6136547 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggaatcgagacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 6136448  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    || |   ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136447 aggggtgaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 6136348  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaag 327  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  6136347 agcaaatcgtgacacaattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-tttaagt-ttcttgtgcagatttgaag 6136263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 264
Target Start/End: Original strand, 13150857 - 13151070
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgc 150  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||    
T  13150857 ttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc 13150956  T
Q  151 aaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 249  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150957 aaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 13151055  T
Q  250 tcgtgacacgattgg 264  Q
    |||||||||||||||    
T  13151056 tcgtgacacgattgg 13151070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 263
Target Start/End: Original strand, 27647476 - 27647687
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27647476 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttgcagggtgca 27647575  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 251  Q
    |||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  | ||||| |||    
T  27647576 aaatcgtggcacgattgtgagaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgatattgactggtcgtttcttgggtggtacgcagatc 27647675  T
Q  252 gtgacacgattg 263  Q
    ||||||||||||    
T  27647676 gtgacacgattg 27647687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 357 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 6097717 - 6097285
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctc-ttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  6097717 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 6097618  T
Q  455 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt 553  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||          | |||||||    
T  6097617 ttgagtgttttggtgagattggaaaaatggtagaaatta-ggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa----------ctcttttgt 6097529  T
Q  554 aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgttt 641  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||    
T  6097528 aagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttt 6097430  T
Q  642 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtg-tttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgtttgttgcttgc 739  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||||    
T  6097429 tcctcttccctctccttg--tatcttgtgattgtgtattgtgtttttccacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttttgttgattatagcttgc 6097332  T
Q  740 acaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcatt 790  Q
    ||   |||||||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  6097331 ac---acactttg-ttagtggttactactttccgttgctccacacatcatt 6097285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 2171814 - 2171534
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  2171814 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 2171716  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2171715 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatc 2171617  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171616 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 2171534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11857603 - 11857330
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11857603 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcat 11857504  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11857503 cgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaag 11857404  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    || |  ||||||||||| |||   ||||||| | |  |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  11857403 taacactgataaggacttgtc-aaccttgggtccgttgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgatt 11857330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 324
Target Start/End: Original strand, 5674242 - 5674512
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  5674242 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 5674341  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtga 255  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  5674342 cgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacgattttgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtga 5674441  T
Q  256 cacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttg 324  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| | ||   |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5674442 cacgatctgg-aaatcgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgcagatttg 5674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 14741890 - 14742106
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14741890 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcat 14741989  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14741990 cgtgacacgatttcaagtggtcgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaag 14742089  T
Q  208 tatccttgataaggact 224  Q
    ||||  |||||||||||    
T  14742090 tatcactgataaggact 14742106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 31404957 - 31404677
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtag-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  31404957 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 31404859  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31404858 ttgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 31404760  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31404759 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaa 31404677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 5406481 - 5406202
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  5406481 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5406384  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5406383 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 5406285  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5406284 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaa 5406202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 5410806 - 5410527
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  5410806 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5410709  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5410708 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 5410610  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5410609 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaa 5410527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 374 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 30834801 - 30834537
Alignment:
Q  374 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 466  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||| |   || || |||||||||||||||||          
T  30834801 gcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 30834704  T
Q  467 -gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  30834703 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactc 30834606  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaat 631  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834605 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaat 30834537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 5413675 - 5413401
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| | |||||| |||   || || |||||    
T  5413675 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatca 5413578  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5413577 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 5413479  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413478 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 374 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 16452594 - 16452331
Alignment:
Q  374 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 466  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  16452594 gcaactttagagtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 16452497  T
Q  467 -gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttg-tatcccttttgtaagaactc 561  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||    
T  16452496 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttgg-aagaactc 16452399  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452398 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 16452331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Original strand, 30125018 - 30125185
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30125018 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgc 30125117  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatc 211  Q
    ||   || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  30125118 aggacgccaaatcgtggcacgattttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatc 30125185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2172090 - 2171883
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  2172090 ttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgggacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatc 2171991  T
Q  157 gtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtg 254  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||||    
T  2171990 gtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtttccaagataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtg 2171891  T
Q  255 acacgatt 262  Q
    ||||||||    
T  2171890 acacgatt 2171883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22709632 - 22709362
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| | | |||| |||||| | |||||| |||| ||||    
T  22709632 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgaatttggcaacgtgacacgattttgtgatgccatgagctggtttgcagggtgccaaat 22709533  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac--gcaaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||    
T  22709532 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacatacaaatcgt 22709433  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||||  |  |   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22709432 gacacgacttgg-aaatcgtgacacgattttattagtggaagactagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 22709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 22010188 - 22010405
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttg 142  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| || ||| |||    
T  22010188 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtaagttagtttg 22010287  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    |||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  22010288 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccg 22010386  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgat 261  Q
      |||||||||||||||||    
T  22010387 ttgcaaatcgtgacacgat 22010405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5266610 - 5266453
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  5266610 atcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcatta 5266511  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5266510 agtatccttgataaggactggtcataccttgaaacggacgcaaatcgtgacacgattg 5266453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 708 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136108
Alignment:
Q  708 atctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgt 805  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccgttgctccacacatcattattctttgtattggtat 6136117  T
Q  806 ggttcgatc 814  Q
    |||||||||    
T  6136116 ggttcgatc 6136108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589096
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21589029 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 21589096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593829
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21593762 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 21593829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6439083 - 6438899
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | || ||||    
T  6439083 tgttgaaattggcttcaaatttatggtctggaagaacatagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgc 6438984  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     |  |||| ||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6438983 tggatgcataatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtc 6438899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 33335393 - 33335614
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg-aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  | |||||| |  |    
T  33335393 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtttcgcgatttggcaa 33335492  T
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||    | ||||||||| | || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  33335493 tcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 33335592  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  33335593 gtatctctgataaggactggtc 33335614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 33160521 - 33160354
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  33160521 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaac 33160424  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  33160423 tcatt-gatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaa 33160354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6097977 - 6097860
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||||     
T  6097977 ttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcctgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgct 6097878  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttg 169  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6097877 aaatcgtgacacgatttg 6097860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808710
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3808779 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaa 3808710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 467 - 630
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758189
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17758124 t-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaa 17758189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972942
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  2973009 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtgaa 2972942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763156
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17763088 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaa 17763156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9183037
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9183102  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  9183101 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggt 9183037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 771 - 839
Target Start/End: Original strand, 16552976 - 16553044
Alignment:
Q  771 ccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 839  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16552976 ccttggctccacacatcattatttagtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 16553044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 771 - 839
Target Start/End: Original strand, 16629532 - 16629600
Alignment:
Q  771 ccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 839  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16629532 ccttggctccacacatcattatttagtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcggaattcacaaca 16629600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 466 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830126
Alignment:
Q  466 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26830191 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtgaa 26830126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424828
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---ttttgtatcccttttgtaagaa 558  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  559 ctcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  22424897 ctcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaa 22424828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137411
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 28137479  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  28137478 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtgtgaa 28137411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 627
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569184
Alignment:
Q  381 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggta-gaaaacatgggaaacaccttgta-aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 478  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  479 aaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 576  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||| |||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccttt------------gtaagaactcatt-gatagtggatt 16569134  T
Q  577 gaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16569135 ggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 16569184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 467 - 630
Target Start/End: Original strand, 5043630 - 5043793
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  5043630 gtgagattgagaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5043727  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  5043728 t-gatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 5043793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 535 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 5409164 - 5409076
Alignment:
Q  535 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409164 ccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Original strand, 34151836 - 34151922
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg 139  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34151836 ttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattctgggatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagg 34151922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Original strand, 26253598 - 26253714
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | | ||||||| ||| | |||| ||||     
T  26253598 ttgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacaagattttgtgataccgtgagatagttagcagggtgcc 26253697  T
Q  152 aaatcgtgacacgattt 168  Q
    |||||||||||||||||    
T  26253698 aaatcgtgacacgattt 26253714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16839325 - 16839092
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||    | |||||||||| | ||| || |       
T  16839325 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaa 16839226  T
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaa 248  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |  |||     
T  16839225 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc-aaccttgggaccgttgcag 16839127  T
Q  249 atcgtgacacgat-tgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  16839126 atcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 16839092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 467 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954296
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctcttt-gtaagaactcatt 26954353  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
     |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26954352 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaact 26954296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211191
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctcttt-gtaagaact 33211256  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33211255 cattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 33211191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5344064 - 5343880
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggt-tgc 143  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||   ||  |  |||||| | || | |    
T  5344064 tgttggaattggcttcaaatttgtggtttgggagaacagagaaatcgtgtcacgatttggtcatcgtgacacgatcagggaggaagtgagccaagtcttc 5343965  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     ||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5343964 tgaaagcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 5343880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 33329938 - 33330117
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||    | |||||||||| | ||| || |       
T  33329938 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaa 33330037  T
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33330038 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33330117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 14737128 - 14737246
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcgggtg-ccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  14737128 atcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtta 14737227  T
Q  206 agtatccttgataaggact 224  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  14737228 agtatcactgataaggact 14737246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Original strand, 28155133 - 28155255
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  28155133 atcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagtttgcagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggtta 28155232  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  28155233 agtatctctgataaggactggtc 28155255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 464 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038926
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 3038974  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 609  Q
    | ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3038973 c-tttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 733 - 814
Target Start/End: Original strand, 13159051 - 13159134
Alignment:
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13159051 tgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 13159134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 630
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800753
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 615  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgg 26800738  T
Q  616 accgaactgggtgaa 630  Q
    |||||||||| ||||    
T  26800739 accgaactggatgaa 26800753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23896958 - 23896880
Alignment:
Q  44 atgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23896958 atgttgaaatttgccttcaaatttgtggtttgaaagaacagaaaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattt 23896880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 5266653 - 5266596
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5266653 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 5266596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 14737085 - 14737142
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14737085 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 14737142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6006001 - 6005822
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||    | |||| ||||| | ||| || |       
T  6006001 aaattggcttcaaatttgtggtttggaaaaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccatgagccaagtttgctggaa 6005902  T
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6005901 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 6005822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6097858 - 6097786
Alignment:
Q  192 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgatt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  6097858 aaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacctggggacgtacgcaccaatcgtgacacgatt 6097786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 582
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  562 atttgatagtggattgaagag 582  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  4045523 a-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 603222 - 603094
Alignment:
Q  498 ttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 595  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||   ||||||||||     
T  603222 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggagaaatcaatctctccc 603125  T
Q  596 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  603124 caagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 603094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Original strand, 28155090 - 28155145
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgat 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28155090 tgttggaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgat 28155145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 696 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 2171456 - 2171350
Alignment:
Q  696 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattt 794  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||   |||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||    
T  2171456 ttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcac---acactttg-ttagtggttactactttcctttgctccacacatca-tagtt 2171362  T
Q  795 tgtattggtgtg 806  Q
     |||||||||||    
T  2171361 cgtattggtgtg 2171350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 745 - 809
Target Start/End: Original strand, 412374 - 412437
Alignment:
Q  745 acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  412374 acactttgtttggtggttactactttcctttgctccacacatca-tacttggtattggtgtggtt 412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Original strand, 5016975 - 5017026
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5016975 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaaaaatcgtgacacgattt 5017026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Original strand, 31085952 - 31086003
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31085952 aattggcttcaaatttgtggtttagaagaacagagaaatcgtgacacgattt 31086003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 16568599 - 16568652
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatt 65  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  16568599 catcatcaccaa-ttagaagtcaaggcggagaaatgttgaaactgccttcaaatt 16568652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 5571749 - 5571806
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  5571749 tgttgaatttgtcttcaaatttgtgttttgggagaatagagaaatcgtgacacgattt 5571806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24715000 - 24714938
Alignment:
Q  42 aaatgttgaaa-ttgtcttcaaattt-gtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24715000 aaatgttgaaaattggcttcaaattttgtggtttggaaaaacagagaaatcgtgacacgattt 24714938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Original strand, 26253698 - 26253795
Alignment:
Q  173 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaa 268  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  26253698 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggactggtcgtactttgtgacgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaa 26253795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6097776 - 6097732
Alignment:
Q  289 gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag 334  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6097776 gaagactagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggtgagag 6097732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13020124 - 13020087
Alignment:
Q  150 caaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgat 187  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13020124 caaaatcgtgacacgatttgggtacatcgtgacacgat 13020087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 531
Target Start/End: Original strand, 16567185 - 16567265
Alignment:
Q  450 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttg 531  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  16567185 aatcattgagtgtct---tgagattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgtttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Original strand, 21272469 - 21272514
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacac 97  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  21272469 attggcttcaaatttgtgttttggaggaacagggaaatcgtgacac 21272514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 539; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Original strand, 10592844 - 10593621
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgca 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10592844 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattccgggtgccgtgagataggttgca 10592943  T
Q  145 gagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 244  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  | ||    
T  10592944 gggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcgtttcttcggtggtac 10593043  T
Q  245 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggann 341  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||||   |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||      
T  10593044 gcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtatgtaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-agagttggaag 10593141  T
Q  342 nnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgt 441  Q
                   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593142 agagagaga------cttgggaaatcaaagggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgt 10593235  T
Q  442 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttg 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593236 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttg 10593335  T
Q  542 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------- 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  10593336 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttgg 10593435  T
Q  631 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 730  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593436 tgtatttgttttctacttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 10593535  T
Q  731 gttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10593536 gttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 10593621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 40381855 - 40382665
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40381855 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcg 40381954  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 209  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40381955 tgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 40382054  T
Q  210 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  ||| |    
T  40382055 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-cttaag 40382153  T
Q  307 tgttcttgtgcagatttgaag-gggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattaga 405  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382154 tgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttgga--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattaga 40382244  T
Q  406 gtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcat 505  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40382245 gtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcat 40382342  T
Q  506 tgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtag 604  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40382343 agtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtag 40382442  T
Q  605 gtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacac 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40382443 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac 40382540  T
Q  692 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcatta 791  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  40382541 ttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgccgctccacacatcatta 40382640  T
Q  792 t--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  40382641 ttctttgtattggtgtggttcgatc 40382665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Original strand, 40379678 - 40380454
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  40379678 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgc 40379777  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379778 agggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 40379877  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaag-gggagagttgga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  40379878 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-cttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttgga 40379975  T
Q  340 nnnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacctt 439  Q
                     |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40379976 --------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacacctt 40380067  T
Q  440 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 539  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  40380068 gt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctct 40380165  T
Q  540 tgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  40380166 tgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 40380265  T
Q  631 -tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 725  Q
     ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380266 ttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 40380363  T
Q  726 tgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40380364 tgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 40380454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 16546182 - 16546996
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16546182 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcg 16546281  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 209  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546282 tgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 16546381  T
Q  210 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  ||| |    
T  16546382 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-cttaag 16546480  T
Q  307 tgttcttgtgcagatttgaaggggaga-gttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattaga 405  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546481 tgttcttgtgcagatttgaaggcaagaggttgga--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattaga 16546572  T
Q  406 gtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcat 505  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16546573 gtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcat 16546670  T
Q  506 tgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagta 603  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16546671 agtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagta 16546770  T
Q  604 ggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||  |||||||    
T  16546771 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttca 16546868  T
Q  689 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatca 788  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16546869 cacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttatcactctccgtcgctccacacatca 16546968  T
Q  789 ttat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16546969 ttattctttgtattggtgtggttcgatc 16546996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 814
Target Start/End: Original strand, 25077705 - 25078484
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttg 142  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||| |||    
T  25077705 atgttgagtttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacgcgattggaggtgccgtgagctagggttg 25077804  T
Q  143 cagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
     || | |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25077805 taggggtgcaaa-tcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 25077903  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag-ttg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25077904 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggg-agaggttg 25078001  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacc 437  Q
    ||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25078002 gaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 25078093  T
Q  438 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078094 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 25078193  T
Q  538 tttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------ 630  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  25078194 cttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25078293  T
Q  631 ---tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 723  Q
       ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078294 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 25078391  T
Q  724 gttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  25078392 gttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgatc 25078484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 814
Target Start/End: Original strand, 25135674 - 25136453
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttg 142  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||| |||    
T  25135674 atgttgagtttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacgcgattggaggtgccgtgagctagggttg 25135773  T
Q  143 cagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
     || | |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135774 taggggtgcaaa-tcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 25135872  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag-ttg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25135873 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggg-agaggttg 25135970  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacc 437  Q
    ||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25135971 gaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 25136062  T
Q  438 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136063 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 25136162  T
Q  538 tttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------ 630  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  25136163 cttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25136262  T
Q  631 ---tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 723  Q
       ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136263 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 25136360  T
Q  724 gttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  25136361 gttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgatc 25136453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 814
Target Start/End: Original strand, 16543993 - 16544774
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||     
T  16543993 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgctgtgagctagggtta 16544092  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544093 cagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 16544192  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag-ttgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  16544193 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggcaagaggttgg 16544291  T
Q  339 annnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacct 438  Q
    |                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16544292 aagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacct 16544383  T
Q  439 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacct 537  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  16544384 tgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacct 16544481  T
Q  538 tttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgt 633  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |    
T  16544482 cttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 16544581  T
Q  634 at---------ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 721  Q
     |         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16544582 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtt 16544679  T
Q  722 ttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16544680 ttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 16544774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 29751715 - 29750969
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  29751715 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgaatttggcatcacgacacgatttcgtggtgccgtgagctaggttgcagggtgcc 29751616  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 251  Q
    |||                     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||    
T  29751615 aaa---------------------tcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatc 29751537  T
Q  252 gtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnn 348  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    ||| ||   ||||||| | | |||||||||||||  ||||||||  |||||||||             
T  29751536 gtgacacgatttggaaaatcgtgacacgattgctttagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaagg--agagttggaagagagaga 29751439  T
Q  349 nnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 447  Q
            |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29751438 ga------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag 29751345  T
Q  448 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29751344 aaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcc 29751245  T
Q  547 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgt-a 634  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||      
T  29751244 cttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct 29751146  T
Q  635 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttg 734  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  29751145 tttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgattattg 29751048  T
Q  735 cttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat-tattttgtattggtgtggttcgat 813  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  29751047 cttgcac-acacacattgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcatatttcttgtattggtgtggttcgat 29750969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 357 - 812
Target Start/End: Original strand, 29720256 - 29720721
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29720256 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 29720355  T
Q  456 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720356 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 29720455  T
Q  555 agaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtatttgttttc 643  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||    
T  29720456 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttc 29720554  T
Q  644 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaa 743  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |    
T  29720555 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtac-a 29720651  T
Q  744 tacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat-tattttgtattggtgtggttcga 812  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  29720652 cacactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacaacatatttcttgtattggtgtggttcga 29720721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 357 - 812
Target Start/End: Original strand, 29722416 - 29722881
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29722416 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 29722515  T
Q  456 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722516 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 29722615  T
Q  555 agaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtatttgttttc 643  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||| |||||||||    
T  29722616 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttc 29722714  T
Q  644 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaa 743  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |    
T  29722715 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtac-a 29722811  T
Q  744 tacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat-tattttgtattggtgtggttcga 812  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  29722812 cacactttgtttggtggttaccactctactttgctccacacaccatatttcttgtattggtgtggttcga 29722881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 357 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 22536563 - 22536103
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggggcaa-ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  22536563 cttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgca--gagagaatcat 22536466  T
Q  456 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536465 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 22536366  T
Q  556 gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtatttgttttct 644  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||  ||||||||||    
T  22536365 gaactc-tttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 22536267  T
Q  645 tcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaat 744  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||   ||    
T  22536266 tcttccctcccct--tttatcttgtgattgtgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattgttgcttgc---at 22536173  T
Q  745 acactttg-tttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22536172 acactttgctttggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcatt-ctttgtattggtgtggttcgatc 22536103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 53 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 9789800 - 9789042
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||||     
T  9789800 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgcc 9789701  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aa 249  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  |     
T  9789700 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgcgacgaacgcaccat 9789601  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    |||||||||||   | |||||| ||||||||||  | |||  ||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||           
T  9789600 tcgtgacacgacctg-aaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagg--agagttggaagagaga 9789505  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaa 444  Q
              |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||   |    
T  9789504 gaaa------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtga 9789412  T
Q  445 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgt 542  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  9789411 gtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgt 9789313  T
Q  543 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------ 630  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  9789312 atctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 9789214  T
Q  631 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 730  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9789213 tgtctttgttttcctcttccctctcc--gtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgatt 9789116  T
Q  731 gttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
     ||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9789115 tttgcttgcac---acactttg-ttggtggttactactttcctttgctccacacatca-tactttgtattggtgtggtt 9789042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 53 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 18442224 - 18441462
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||| ||||     
T  18442224 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagctggtttgcagggtgcc 18442125  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aa 249  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  18442124 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacgaacgcaccaa 18442025  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||||||  | |||  ||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||           
T  18442024 tcgtgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagg--agagttggaagagaga 18441929  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaa 444  Q
              |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||   |    
T  18441928 gaaa------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtga 18441836  T
Q  445 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgt 542  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  18441835 gtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgt 18441737  T
Q  543 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------ 630  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  18441736 atctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 18441638  T
Q  631 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtg----tttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 726  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||    |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18441637 tgtctttgttttcctcttccctctcc--gtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgtt 18441540  T
Q  727 gtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    | || ||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18441539 gattattgcttgcac---acactttg-ttggtggttactactttcctttgctccacacatc-ttactttgtattggtgtggtt 18441462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 357 - 806
Target Start/End: Original strand, 16409367 - 16409824
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  16409367 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 16409465  T
Q  455 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16409466 ttgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 16409564  T
Q  553 taagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgtt 640  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| ||||||    
T  16409565 taagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 16409663  T
Q  641 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttg 738  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  16409664 ttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 16409761  T
Q  739 cacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtg 806  Q
    |||    ||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16409762 cac---ccactttg-ttagtggttactactttcctttgctccacacatca-tactttgtattggtgtg 16409824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 357 - 809
Target Start/End: Original strand, 26177775 - 26178234
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  26177775 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 26177873  T
Q  455 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26177874 ttgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 26177971  T
Q  553 taagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgtt 640  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| ||||||    
T  26177972 taagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 26178070  T
Q  641 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttg 738  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || |||||||    
T  26178071 ttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttatcattgattattgcttg 26178168  T
Q  739 cacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    |||   |||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26178169 cac---acactttg-ttagtggttactactttcctttgctccacacatc-ttacttcgtattggtgtggtt 26178234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22536852 - 22536634
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22536852 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttgc 22536753  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    || ||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  22536752 agggtgcaaaatcgtggcacaattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggta 22536653  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgatt 262  Q
    | || ||||||||||||||    
T  22536652 cacagatcgtgacacgatt 22536634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27445602 - 27445328
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27445602 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctagaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcat 27445503  T
Q  109 cgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27445502 cgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaag 27445403  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  27445402 tatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgattg 27445328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 26177430 - 26177685
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26177430 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggca 26177529  T
Q  108 tcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||   || |||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  26177530 tcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcatgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaa 26177629  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacga 260  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26177630 gtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacggacgcaccaatcgtgacacga 26177685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 29722118 - 29722332
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29722118 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatc 29722217  T
Q  110 gtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaag 207  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29722218 gtgacacgatttcgtggtgctgtgagctagtctgcatggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaag 29722317  T
Q  208 tatccttgataagga 222  Q
    | ||| |||||||||    
T  29722318 tttccatgataagga 29722332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 262
Target Start/End: Original strand, 29719974 - 29720187
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||     
T  29719974 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagtctgcagggtgcc 29720073  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 248  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |    
T  29720074 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacca 29720173  T
Q  249 atcgtgacacgatt 262  Q
    ||||||||||||||    
T  29720174 atcgtgacacgatt 29720187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24136470 - 24136266
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  24136470 ttcaaatttgtggtctggaagaacacagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacaatttcgtgatgccgtgagctagtttgcagggtgccaaatc 24136371  T
Q  157 gtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 256  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  24136370 gtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtgac 24136271  T
Q  257 acgat 261  Q
    |||||    
T  24136270 acgat 24136266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43599318 - 43599079
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc--gggtgccgtgagctaggttg 142  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  43599318 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagtttg 43599219  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    |||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  43599218 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcag 43599120  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  43599119 acgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattg 43599079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43604810 - 43604571
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc--gggtgccgtgagctaggttg 142  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  43604810 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagtttg 43604711  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    |||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  43604710 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcag 43604612  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  43604611 acgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattg 43604571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43610302 - 43610063
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc--gggtgccgtgagctaggttg 142  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  43610302 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagtttg 43610203  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    |||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  43610202 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcag 43610104  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  43610103 acgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattg 43610063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27450409 - 27450171
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  27450409 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagtttgc 27450310  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||    
T  27450309 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcaga 27450211  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  27450210 cgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgattg 27450171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 25412647 - 25412926
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  25412647 cttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 25412744  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25412745 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 25412843  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25412844 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaa 25412926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 357 - 809
Target Start/End: Original strand, 26170666 - 26171114
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  26170666 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 26170764  T
Q  455 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt 553  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||    
T  26170765 ttgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgt 26170852  T
Q  554 aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgttt 641  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||    
T  26170853 aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttt 26170951  T
Q  642 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcaca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttgc 739  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  | | || ||||||||    
T  26170952 tcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcattttgattcctagattagatctaggtgttgttatcatcgattattgcttgc 26171049  T
Q  740 acaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    ||   |||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26171050 ac---acactttg-ttagtgcttactactttcctttgctccacacatc-ttacttcgtattggtgtggtt 26171114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 28807040 - 28807260
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||    
T  28807040 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttggaattggcttcaaatttatggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcaat 28807139  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  28807140 cgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagtttgcagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaag 28807239  T
Q  208 tatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  28807240 tatctctgataaggactggtc 28807260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30631948 - 30631764
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  30631948 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagccagtttgc 30631849  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||   || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30631848 aggacgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtc 30631764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 16409041 - 16409298
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  16409041 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggca 16409140  T
Q  108 tcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||| | | || |||||||| | |||||  |||| |||| |||||||||| | |   ||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  16409141 tcgtgacacgattttgtgatgtcgtgagctggtttgcaaggtgccaaattgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaa 16409240  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgatt 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  16409241 gtttccatgataaggactggtcgtacattgggacgtacgctccaatcgtgacacgatt 16409298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Original strand, 26170370 - 26170576
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  26170370 cttcaaatttatggtatggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 26170469  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    |||||||||||   || |||||||||||  ||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  26170470 cgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacataatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacggacgcaccaatcgt 26170569  T
Q  254 gacacga 260  Q
    |||||||    
T  26170570 gacacga 26170576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43592890 - 43592634
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                  
T  43592890 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtga-------------- 43592805  T
Q  109 cgtgacacgatttc--gggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
         |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43592804 -----cacgatttcaagggggccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaa 43592710  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  43592709 gtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattg 43592634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 13342946 - 13343226
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  13342946 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 13343043  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgta 543  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13343044 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgta 13343142  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13343143 tctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaa 13343226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 259
Target Start/End: Original strand, 1456637 - 1456852
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttg 142  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||     
T  1456637 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagttta 1456736  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    |||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  1456737 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgcttgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttgggtcag 1456835  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacg 259  Q
    | |||||||||||||||    
T  1456836 atgcaaatcgtgacacg 1456852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 357 - 806
Target Start/End: Original strand, 30182474 - 30182933
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  30182474 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatca 30182571  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 544  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  30182572 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctat 30182670  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------tgta 634  Q
    | |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||          |||     
T  30182671 ctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtg 30182768  T
Q  635 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgt 732  Q
    |||||||   ||||  |||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  30182769 tttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattat 30182864  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtg 806  Q
    || ||||   || ||||||| ||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  30182865 tgtttgc---attcactttg-ttattggttactactttcctttgctccacacatca-tagtttgttttggtgtg 30182933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 36074327 - 36074045
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  36074327 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 36074230  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa----gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttg 541  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36074229 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttg 36074131  T
Q  542 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36074130 tatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaa 36074045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Original strand, 16407654 - 16407862
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  16407654 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 16407753  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | |   ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  | ||||||    
T  16407754 cgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaccggtcgtaccttgggacgtacgctccaatcgt 16407853  T
Q  254 gacacgatt 262  Q
    |||||||||    
T  16407854 gacacgatt 16407862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Original strand, 37560911 - 37561130
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||    
T  37560911 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagtaatcgtgacacgatttgataat 37561010  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||| | || ||  |  | |  |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  37561011 cgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagttttgatggaggcaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaag 37561110  T
Q  208 tatccttgataaggactggt 227  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  37561111 tatctctgataaggactggt 37561130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213631
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213563 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 213631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 13239751 - 13239917
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  13239751 ttggtgagattggaaaaaatggtagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaact 13239848  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13239849 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaa 13239917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 483 - 630
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439307
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 580  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 37439257  T
Q  581 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439258 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 37439307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15045279 - 15045096
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgca 144  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| || |||||    
T  15045279 tgttgatattggcttcaaatttgtagtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccagtttgca 15045180  T
Q  145 gagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  15045179 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtc 15045096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29752381 - 29752266
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||     
T  29752381 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgctgccgtgagctaggttgcagggtgcc 29752282  T
Q  152 aaatcgtgacacgatt 167  Q
    |||||||| |||||||    
T  29752281 aaatcgtggcacgatt 29752266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 222
Target Start/End: Original strand, 29402550 - 29402728
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||| |||||||| ||||    
T  29402550 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtggcacgatttcaagtggccatgagctagtttgc 29402649  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataagga 222  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29402650 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataagga 29402728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33768808 - 33768587
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg-aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |    
T  33768808 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaa 33768709  T
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||    | ||||||||| | || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  33768708 tcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 33768609  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  33768608 gtatctctgataaggactggtc 33768587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147426
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40147359 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 40147426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32636986
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 32636921  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32636922 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 32636986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278481
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28278414 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 28278481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15465112 - 15465000
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  15465112 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 15465013  T
Q  156 cgtgacacgattt 168  Q
    |||||||||||||    
T  15465012 cgtgacacgattt 15465000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 13488203 - 13488365
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13488203 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13488300  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488301 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428436
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42428501  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42428500 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42428436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 43625684 - 43625605
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43625684 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaa 43625605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058210
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||| ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttc--tgtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5058143 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 5058210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637614
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaat 631  Q
    |||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27637683 tcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaat 27637614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 31401310 - 31401531
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg-aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| || | ||||||| |||||||| |  |    
T  31401310 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttgggagaatagaggaatcgtgtcacgatttggcaa 31401409  T
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgagct-aggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||    |  || ||||||| || |||| |   ||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||   ||||||||||  ||||    
T  31401410 tcgtgacacgatcggagaggcagtgagctaagtttgctggaagcaaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctgcttaa 31401509  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    || ||  |||||||||||||||    
T  31401510 gtttctctgataaggactggtc 31401531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Original strand, 33831683 - 33831842
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  33831683 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 33831780  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  33831781 t-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggt 33831842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 357 - 627
Target Start/End: Original strand, 16451966 - 16452242
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggta-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||||  ||| || |||||    
T  16451966 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatca 16452063  T
Q  455 ttgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 544  Q
    |||||||||||| |       |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  16452064 ttgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 16452162  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16452163 ctcttt-gtaagaactcattc-atagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 16452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 36931856 - 36931968
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | | || |||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36931856 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtggcacgattttgtgatgtcgtgagctggtttgcagggtgccaaat 36931955  T
Q  156 cgtgacacgattt 168  Q
    |||||||||||||    
T  36931956 cgtgacacgattt 36931968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 609  Q
    | || ||||||||||  ||||   | ||||||||||| ||||||||||    
T  13695759 a-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 30683178 - 30682930
Alignment:
Q  381 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 472  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  30683178 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaga 30683081  T
Q  473 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaa--ctcatttga 567  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  |||||| ||    
T  30683080 ttgggaaaaagggtagaaattagggtt----ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-ga 30682987  T
Q  568 tagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30682986 tagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 357 - 627
Target Start/End: Original strand, 31182858 - 31183133
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatc 453  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||| |   || || ||||    
T  31182858 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatc 31182955  T
Q  454 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatc 545  Q
    |||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31182956 attgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgtatc 31183054  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  | |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31183055 cc-tttgtaagaactca-ttgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 31183133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 227
Target Start/End: Original strand, 37556125 - 37556308
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  | ||||||||| | || ||      
T  37556125 tgttgaatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagtaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagttttg 37556224  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggt 227  Q
    |  | |  |||||||| |||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37556225 atggaggcaaatcgtggcacgatcttgggaaattgtgacacgatctagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggt 37556308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533931
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 533866  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| | ||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  533867 catt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 533931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 28750823 - 28750661
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  28750823 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaact 28750726  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28750725 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33791909 - 33791719
Alignment:
Q  40 agaaatgttgaaa-ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctag 138  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||    | |||||||||| |     
T  33791909 agaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaa 33791810  T
Q  139 gtt-gcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||| || |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33791809 gtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33791719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35388169 - 35388016
Alignment:
Q  173 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaat 270  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  35388169 aaattgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgttcaaatcgtgacacgatctgg-aaat 35388071  T
Q  271 catgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    | ||||||||||  | ||   |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35388070 cgtgacacgattttatcagaggaaggctagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 35388016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38219947 - 38219803
Alignment:
Q  126 tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactg 225  Q
    ||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  38219947 tgccgtgagctggtttgtagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaattgtgacacgattttcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactg 38219848  T
Q  226 gtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaa 268  Q
    ||||| ||||| |||| |||  | ||||||||||||||| |||||    
T  38219847 gtcgtaccttgtgacgtacgttccaatcgtgacacgatttggaaa 38219803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 9352820 - 9352972
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | |||||| |||  ||||    
T  9352820 cttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtgacgcgattgtggcatcgtgacacgattttgtaatgccgtgagctggtttgcagggtgtcaaat 9352919  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    |||| |||||||  |  |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  9352920 cgtggcacgattctgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagt 9352972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2785957 - 2785778
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||    | |||||||||| | ||| || |       
T  2785957 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaa 2785858  T
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2785857 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 2785778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 467 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 8566111 - 8565956
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8566111 gtgagattgagaaaatgggtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct-gtaagaactcat 8566014  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8566013 t-gatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaact 8565956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 39468714 - 39468555
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||     
T  39468714 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca- 39468618  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||| ||  |||||| |||||||||    
T  39468617 ttgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaa-attggactgaactgggt 39468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426255
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42426306  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| || || |||||||||||    
T  42426305 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaagtt 42426255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 467 - 625
Target Start/End: Original strand, 538028 - 538185
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  538028 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 538125  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  538126 t-gatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31180787 - 31180637
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   || |||| |||||||    
T  31180787 atcgtgacacgatttcaaggtgtcgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagagactttctcgtta 31180688  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgaca 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||    
T  31180687 agtatcactgataaggactggtc-aaccttgggtcagacgcaaatcgtgaca 31180637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 16641091 - 16640961
Alignment:
Q  478 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 575  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||    
T  16641091 aaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact----tgatagtggat 16640997  T
Q  576 tgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagt 611  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16640996 tggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 27015531 - 27015688
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||       | || |||||||| |||| ||||||||||    
T  27015531 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaat-------acccatttgtatctcttt-gtaagaactc 27015621  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27015622 att-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 27015688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 31180831 - 31180773
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31180831 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 31180773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 467 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 9049506 - 9049354
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  9049506 gtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgttt-ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctc-tttgtaagaactca-t 9049410  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 621  Q
    ||| ||||||||| ||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  9049409 tgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 627
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747167
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | |||| || |||||| |    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttggaaaaactca-t 38747105  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  38747106 tgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaag-ttggaccaaactgggt 38747167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 14520848 - 14520796
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14520848 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 14520796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 28832816 - 28832772
Alignment:
Q  22 aattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaattt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28832816 aattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgacttcaaattt 28832772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 470 - 623
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316922
Alignment:
Q  470 agattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 567  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| ||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcatt-ga 316866  T
Q  568 tagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    || ||||| | || |  |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||    
T  316867 taatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaact 316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 564 - 627
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806525
Alignment:
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 19806525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 31396495 - 31396674
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagct-aggttgcagagt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||    |  || ||||||| || |||| |       
T  31396495 aaattggcttcaaatttgtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggagaggcagtgagctaagtttgctggaa 31396594  T
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   || ||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  31396595 gcaaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagacacttgttggttaagtttctctgataaggactggtc 31396674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 3075823 - 3075661
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |    
T  3075823 gtgagattgagaaaataggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaattcgt 3075726  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | ||||||| |||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  3075725 t-gatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaa 3075661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 35388233 - 35388196
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtga 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35388233 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtga 35388196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 567 - 627
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  567 atagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 12083658 - 12083708
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12083658 attggctttaaatttatggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 12083708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 33906144 - 33906035
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| ||||| | ||  |||||||| | | ||||||||||||  |||||    
T  33906144 aagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcatt-gatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttgga 33906046  T
Q  617 ccgaactgggt 627  Q
    |||| ||||||    
T  33906045 ccgagctgggt 33906035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 102
Target Start/End: Original strand, 11916457 - 11916502
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11916457 cttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtgacacaattt 11916502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 518 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 42310048 - 42309953
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 614  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||   |||  |||||||||| ||| ||||| | |||||||    
T  42310048 aagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactta-ttgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagtttg 42309953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 527; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 841
Target Start/End: Original strand, 9036002 - 9036801
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9036002 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttg 9036101  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        
T  9036102 cagggtgcaaattcgtgtcactattttgttaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtgtt 9036201  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttgga 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  9036202 acgcagatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtata--aagtgttcttgtgcagatttgaagaggag--tttga 9036297  T
Q  340 nnnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacctt 439  Q
                     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9036298 aagagagagaga-----cttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacctt 9036392  T
Q  440 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036393 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 9036492  T
Q  540 tgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa--------- 630  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  9036493 tgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 9036591  T
Q  631 --tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 728  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036592 ggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 9036691  T
Q  729 ttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatcttgtgggggatcgg 828  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9036692 ttgttgcttgcacaa-acactttgtttggtggttaccactctccttagctccacacatca-tcctttgcattggtgtggttcgatctagt-ggggatcgg 9036788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Original strand, 44203218 - 44203995
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  44203218 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgc 44203317  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203318 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 44203416  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggg-gagagttgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44203417 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagggtgagagttgg 44203515  T
Q  339 annnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacct 438  Q
    |                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44203516 aagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacct 44203607  T
Q  439 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctt 538  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44203608 tgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctc 44203705  T
Q  539 ttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------- 630  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  44203706 ttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc 44203805  T
Q  631 --tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 724  Q
      ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203806 tttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 44203903  T
Q  725 ttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44203904 ttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 44203995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 809
Target Start/End: Original strand, 40281967 - 40282730
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||     
T  40281967 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaatagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttagtggtgccgtgagctaggttgcagggtgcc 40282066  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 248  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |    
T  40282067 aaatcgtgacacgattgtggtaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacca 40282166  T
Q  249 atcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacag---aagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnn 345  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||||||||||  | |||   ||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||          
T  40282167 atcgtgacacgatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-agagttggaagagag 40282263  T
Q  346 nnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaa 444  Q
               |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40282264 agaaa------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaga 40282357  T
Q  445 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgta 543  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40282358 gagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgta 40282457  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tg 632  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  40282458 tcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 40282556  T
Q  633 tatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgt 732  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40282557 tctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattat 40282654  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttg-tttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  40282655 tgcttgcac-acacactttgttttggtggttaccactctcctttgctccacacatca-tagtttgcattggtgtggtt 40282730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 813
Target Start/End: Original strand, 21053540 - 21054314
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||    
T  21053540 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgcagtgagctagaatgc 21053639  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    |  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  21053640 aaggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgagacgg 21053739  T
Q  243 acgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacag---aagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttg 337  Q
    | |||  ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||  | |||   ||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21053740 atgcaccaatcgtgacacgatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagtg-agagttg 21053836  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacac 436  Q
    ||                 |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21053837 gaagagagagaga------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacac 21053930  T
Q  437 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 535  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  21053931 cttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaac 21054030  T
Q  536 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga------ 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  21054031 cttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 21054129  T
Q  630 -----atgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 724  Q
          |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054130 tcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 21054227  T
Q  725 ttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat-tattttgtattggtgtggttcgat 813  Q
    ||| || ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  21054228 ttgattattgcttgcac---acacttagtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcatatttcttgtattggtgtggttcgat 21054314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 20622812 - 20622072
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||     
T  20622812 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagtctgcagggtgcc 20622713  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 251  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||    
T  20622712 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtggtacgcaaatc 20622613  T
Q  252 gtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnn 348  Q
    ||| || |||| |||||||| |||||| ||||   |||| ||   ||||||| | | |||||||||||||  |||||||||| |  |||||             
T  20622612 gtggcatgatttggaaaatcgtgacacaattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaagggggg--ttggaagagagaga 20622515  T
Q  349 nnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 447  Q
            |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  20622514 --------cttgggaaatcaaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagaggg 20622423  T
Q  448 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 546  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20622422 aaaatcattgactgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcc 20622324  T
Q  547 c--ttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgt 633  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  20622323 cttttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 20622225  T
Q  634 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgtt 733  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20622224 ctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattatt 20622127  T
Q  734 gcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat 789  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  20622126 gcttgcac-acacactttgtttggtggttactactttcctttgctccacacatcat 20622072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 813
Target Start/End: Original strand, 9986794 - 9987558
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||     
T  9986794 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttgacatcgtaacacgatttcgtggtgccgtgagctggtctgcagtgtgcc 9986893  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aa 249  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||    
T  9986894 aaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccataataaggactggtcataccttgggacggatgcaccaa 9986993  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||| |||  | |||  ||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |||||           
T  9986994 tcgtgacacgatctggaaa-tcgtgacacaattttatcagtggagggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggtgag--ttggaagagaga 9987089  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaag 445  Q
              |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9987090 taga------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagag 9987183  T
Q  446 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtat 544  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9987184 agaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtat 9987282  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgt 633  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  9987283 cccttttgcaagaactca-ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 9987381  T
Q  634 -atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgt 732  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9987382 cttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattat 9987479  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat-tattttgtattggtgtggttcgat 813  Q
    |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9987480 tgcttgcac---acactttgattggtggttaccactctcctttgctccacacatcatatttttcgtattggtgtggttcgat 9987558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 357 - 809
Target Start/End: Original strand, 51765280 - 51765747
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||   || |  ||||||    
T  51765280 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcat 51765378  T
Q  456 tgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtat 544  Q
    |||||||||||      ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  51765379 tgagtgtcttgttcttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtat 51765478  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------tgta 634  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||     
T  51765479 ctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtc 51765577  T
Q  635 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgt 732  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51765578 tttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattat 51765675  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    |||||||||    ||| ||  || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51765676 tgcttgcac---tcac-ttaattagtggttactactttcctttgctccacacatca-tatttcgtattggtgtggtt 51765747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 19360876 - 19361133
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19360876 gacatcaccaccaaattataagtcaaggtggagaaatgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggta 19360975  T
Q  108 tcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  19360976 tcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaa 19361075  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgatt 262  Q
    || |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||||||||||||    
T  19361076 gtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgatt 19361133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 44023341 - 44023561
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  44023341 gacatcaccaccaaattagaattcaaggtggagaaatgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaat 44023440  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| | || |||| |  |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  44023441 cgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgctggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaag 44023540  T
Q  208 tatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  44023541 tatcactgataaggactggtc 44023561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41391221 - 41391002
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41391221 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgattttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaat 41391122  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| || ||||||   || |||||||| |||||| | || ||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||    
T  41391121 cgtgacacgatttgagatgccgtgagccagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcattaagt 41391022  T
Q  209 atccttgataaggactggtc 228  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  41391021 atcactgataaggactggtc 41391002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 25444556 - 25444776
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||    
T  25444556 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttggaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaat 25444655  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  25444656 cgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgtaggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaag 25444755  T
Q  208 tatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  25444756 tatctctgataaggactggtc 25444776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 463 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316354
Alignment:
Q  463 cttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316423 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 13316354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39446082 - 39445898
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| | || ||||    
T  39446082 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgc 39445983  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39445982 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcatgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtc 39445898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Original strand, 19365781 - 19366051
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  19365781 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 19365880  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||| | ||| |||| |||  | ||||||    
T  19365881 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaattttccaggataaggacaggtcgtacattgtgacgtacgtaccaatcgt 19365980  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||||  | ||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19365981 gacacgacttgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 19366051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 467 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550789
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 8550855  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550854 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 8550789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 629
Target Start/End: Original strand, 20762557 - 20762837
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  20762557 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 20762654  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 543  Q
    |||||| |||||       ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20762655 ttgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 20762753  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 629  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20762754 tctcttc-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 20762837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 262
Target Start/End: Original strand, 51765007 - 51765211
Alignment:
Q  61 aaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  51765007 aaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatcgtg 51765106  T
Q  160 acacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgaca 257  Q
    ||||||| | |   ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||  | ||||||||||    
T  51765107 acacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgtgacgtacgtaccaatcgtgaca 51765206  T
Q  258 cgatt 262  Q
    |||||    
T  51765207 cgatt 51765211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 25439399 - 25439583
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  | ||||||||| | || ||||    
T  25439399 tgttggaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgc 25439498  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||  |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  25439499 aggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 25439583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168463
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37168395 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 37168463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 1054513 - 1054698
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttg 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||| | || |||    
T  1054513 atgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgtcacgattttggaatcgtgatacgattggaggtgccgtgagccaagtttg 1054612  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1054613 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtc 1054698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 3189330 - 3189496
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3189330 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3189427  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189428 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 3189496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 3198147 - 3198313
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3198147 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3198244  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 3198313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 3206986 - 3207152
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3206986 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3207083  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3207084 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 3207152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 261
Target Start/End: Original strand, 24793709 - 24793864
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24793709 atcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtta 24793808  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24793809 agtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgat 24793864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547092
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13547159 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 13547092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297977
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42298045 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaa 42297977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549003
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13549070 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 13549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136413
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29136345 catt-gatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaa 29136413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255342
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  47255410 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 47255342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 24202264 - 24202376
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24202264 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 24202363  T
Q  156 cgtgacacgattt 168  Q
    |||||||||||||    
T  24202364 cgtgacacgattt 24202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220232
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28220297  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28220296 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 28220232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455322
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaagaact 44455257  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455258 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348863
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11348796 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 11348863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 269
Target Start/End: Original strand, 13604091 - 13604322
Alignment:
Q  41 gaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | || |||||||| |    
T  13604091 gaaatgttgagatttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggtatcgtggcacgattttgtgatgtcgtgagctgg 13604190  T
Q  139 gttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 238  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||||| |   |||||||||| |||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||||| |||||||    
T  13604191 tttgcagtgtgtcaaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacatgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtaccttggg 13604289  T
Q  239 acggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaa 269  Q
     || ||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  13604290 tcgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaaa 13604322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Original strand, 24786905 - 24787042
Alignment:
Q  124 ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggac 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24786905 ggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggac 24787004  T
Q  224 tggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    |||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24787005 tggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgat 24787042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 357 - 627
Target Start/End: Original strand, 3156751 - 3157027
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggta-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||| ||   || || |||||    
T  3156751 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatca 3156848  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 544  Q
    ||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  3156849 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 3156947  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3156948 ctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 3157027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834173
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 834235  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  834234 t-gatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 834173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482233
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7482301 tcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaa 7482233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 28265722 - 28265560
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28265722 ttggcgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28265625  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28265624 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 28265560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 31925875 - 31925710
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31925875 ttggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31925778  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31925777 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaa 31925710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 628
Target Start/End: Original strand, 34603576 - 34603740
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||    
T  34603576 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaac 34603673  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 628  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603674 tcatt-gatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169218
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50169280 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 50169218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033074
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37033143 tcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaa 37033074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115338
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  47115269 ccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 47115338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552643
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaagaact 4552708  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4552707 catt-gataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4552643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918508
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  49918448 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaact 49918508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 464 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503577
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacctt--gtatctcttt-gtaagaactc 37503627  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  37503626 att-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagtt 37503577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223427
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28223492  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28223491 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 28223427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644360
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45644424 catt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 45644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 193611 - 193776
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  193611 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 193708  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  193709 catt-gatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 193776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754657
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  19754592 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggt 19754657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23555335 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 31659238 - 31659400
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31659238 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31659335  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
     ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31659336 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 31659400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 464 - 609
Target Start/End: Original strand, 1833522 - 1833667
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  | ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1833522 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1833619  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 609  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13599059 - 13598967
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttga-aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13599059 gacatcaccaccaa-ttagaagtcaaggtggagaa-tgttgttaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 13598967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167185
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  50167245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaact 50167185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41398778 - 41398657
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| || ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  41398778 atcgtgacacgatttgagatgccgtgagccagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaa 41398679  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  41398678 gtatcattgataaggactggtc 41398657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 612
Target Start/End: Original strand, 15820326 - 15820455
Alignment:
Q  482 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 579  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15820326 gggtaaaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttt-taagaactcatt-gatagtgcattgaa 15820422  T
Q  580 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    |||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15820423 gagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 3847286 - 3847131
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  ||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847286 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 3847189  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    | |||||||||||| ||||  | |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3847188 t-gatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 3847131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 13659501 - 13659342
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13659501 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 13659404  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13659403 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggt 13659342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 323
Target Start/End: Original strand, 24202379 - 24202513
Alignment:
Q  192 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca- 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| | ||     
T  24202379 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatatcttgggacgcacgttcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgattgtatcag 24202477  T
Q  289 --gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
      |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24202478 aggaaggctagta-tttaagtgttcttgtgcatattt 24202513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 464 - 608
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361058
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 41361011  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtca 608  Q
    | || ||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| |||||||||    
T  41361012 cgtt-gatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtca 41361058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Original strand, 46064921 - 46065080
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||    
T  46064921 gtgagattgggaaaatggataaaaattagg-tttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt-gtaagaactcat 46065018  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |  ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  46065019 tc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggt 46065080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 549 - 630
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242470
Alignment:
Q  549 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 28242470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 469 - 608
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  469 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 566  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactca-ttg 22079419  T
Q  567 atagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtca 608  Q
    ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  22079420 atattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 24793666 - 24793723
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24793666 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 24793723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 37560037 - 37559877
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  37560037 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaac 37559940  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc-agagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37559939 tc-gttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaact 37559877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 47102298 - 47102354
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaattt 66  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47102298 gacatcatcaccaa-ttagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgacttcaaattt 47102354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 13138142 - 13137982
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||  | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||| |    
T  13138142 ttggtgagattgaaaaatggatagaaattagg--tcgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaacac 13138046  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13138045 att-gatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattggaccgaactgggt 13137982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752844
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctc-tttgtaagaac 19752782  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19752783 tca-ttgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaact 19752844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Original strand, 43988054 - 43988133
Alignment:
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  43988054 gcaaaatcgtgccacgatcttggtaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 43988133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 41398826 - 41398764
Alignment:
Q  40 agaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41398826 agaactgttgattttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgattt 41398764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 102
Target Start/End: Original strand, 21536125 - 21536170
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21536125 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 21536170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 549 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 37876848 - 37876769
Alignment:
Q  549 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  37876848 tttgtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaa 37876769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 927982
Alignment:
Q  485 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagag 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||| || ||||||||||  ||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaactca-ttaatagtggattagagag 928026  T
Q  583 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
      ||| |||| | |||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  928025 accaacctcttccccaaggtaggtcaag-ttagaccgaactgggt 927982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 37070378 - 37070334
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37070378 ttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 37070334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Original strand, 26644379 - 26644450
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  26644379 aaattggctttaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgatacgattttgtcatcgtaacacgattt 26644450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 28220850 - 28220796
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg-aaattgtcttcaaatt 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28220850 catcatcaccaa-ttagaagtcaaggtggagaaatgttgaaaattgacttcaaatt 28220796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 549 - 612
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683828
Alignment:
Q  549 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36683766 tttgtaagaactcatt-gatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 36683828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37879079 - 37879005
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 537  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37879079 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacct 37879005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 8871213 - 8871143
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||||||||||||||    
T  8871213 gtgagatttggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaacc 8871143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 30476614 - 30476452
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||| | ||| |||||| |||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  30476614 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattaggg-ttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 30476517  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||| ||||||| | ||  |||||||| | ||| |  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  30476516 ca-ttgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggt 30476452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318589
Alignment:
Q  469 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcatt 12318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 550
Target Start/End: Original strand, 48382441 - 48382505
Alignment:
Q  486 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttt 550  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48382441 agaaattagggtttgatctttgtgaacttgt-aagttaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 48382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 478 - 544
Target Start/End: Original strand, 3460710 - 3460778
Alignment:
Q  478 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtat 544  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3460710 aaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtat 3460778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 545
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737015
Alignment:
Q  482 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 545  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctttgtatc 32737015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 545
Target Start/End: Original strand, 35109493 - 35109556
Alignment:
Q  482 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 545  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35109493 gggtagaaattaaggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacctatttgtatc 35109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 37282846 - 37282701
Alignment:
Q  478 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 575  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||   ||||||||||| | ||||||||    
T  37282846 aaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattag-tagtggat 37282748  T
Q  576 tgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    || ||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||    
T  37282747 tggagagataaatctctcctttggagtaggtcaa-tttggactgaact 37282701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3282331 - 3282273
Alignment:
Q  45 tgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3282331 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggttaggaagaacagaaaaatcgtgacacgattt 3282273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13659898 - 13659840
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  13659898 atgttgatattggcttcaaatttgtggtttggagaaacagagaaatcgtgacatgattt 13659840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 467 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 40122363 - 40122206
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  40122363 gtgagattggaaaaatgggtcgaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcacttt-gtaagaactc-t 40122267  T
Q  564 ttgata--gtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    ||||||  |||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  40122266 ttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaact 40122206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 16124197 - 16124238
Alignment:
Q  61 aaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16124197 aaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgatacgattt 16124238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 505; Significance: 0; HSPs: 105)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 6592955 - 6592145
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6592955 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcg 6592856  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6592855 tgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagt 6592757  T
Q  209 atccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||     
T  6592756 atccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-cttaa 6592658  T
Q  306 gtgttcttgtgcagatttgaag-gggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||                 |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6592657 gtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttgga--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattag 6592567  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6592566 agtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttca 6592469  T
Q  505 ttgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagta 603  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6592468 tagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagta 6592369  T
Q  604 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcaca 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         ||| |   |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6592368 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttcaca 6592271  T
Q  691 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcatt 790  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6592270 cttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcatt 6592171  T
Q  791 at--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  6592170 attctttgtattggtgtggttcgatc 6592145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 18392780 - 18392001
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  18392780 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgc 18392681  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392680 agggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 18392581  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaagggga---gagttg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||||| || | |   ||||||    
T  18392580 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagttg 18392482  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacc 437  Q
    ||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18392481 gaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 18392390  T
Q  438 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 537  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392389 ttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 18392292  T
Q  538 tttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------ 630  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  18392291 cttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 18392192  T
Q  631 ---tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 723  Q
       ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392191 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 18392094  T
Q  724 gttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18392093 gttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctctgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 18392001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 6595137 - 6594363
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6595137 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaaaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 6595038  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595037 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 6594939  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  6594938 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-ag-gttgga 6594842  T
Q  340 nnnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacctt 439  Q
                     |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6594841 agagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacctt 6594750  T
Q  440 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 539  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6594749 gta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctct 6594652  T
Q  540 tgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  6594651 tgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 6594552  T
Q  631 -tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 725  Q
     ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594551 ttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 6594454  T
Q  726 tgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6594453 tgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 6594363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 142 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 18389246 - 18388565
Alignment:
Q  142 gcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389246 gcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 18389147  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaagggga---gagt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||||| || | |   ||||    
T  18389146 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagt 18389048  T
Q  336 tggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaaca 435  Q
    ||||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18389047 tggaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaaca 18388956  T
Q  436 ccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaac 535  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388955 ccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaac 18388858  T
Q  536 cttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---- 630  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  18388857 ctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 18388758  T
Q  631 -----tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 721  Q
         ||| |   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388757 ctctttgtgtttattgttttcttcttccctctctttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 18388660  T
Q  722 ttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18388659 ttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 18388565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 32060888 - 32060127
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32060888 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 32060789  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060788 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 32060690  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggaga-gttgg 338  Q
    |||||||||||||                    |||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32060689 acgcaaatcgtga--------------------cacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagggaagaggttgg 32060611  T
Q  339 annnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacct 438  Q
    |                 |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32060610 a--------agagagagacttgggaaatcaaagggtaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacct 32060519  T
Q  439 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctt 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32060518 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctc 32060419  T
Q  539 ttgtatccc--ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----- 630  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         
T  32060418 ttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatc 32060319  T
Q  631 ----tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 722  Q
        ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32060318 tctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 32060221  T
Q  723 tgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  32060220 tgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgatc 32060127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 357 - 815
Target Start/End: Original strand, 20343789 - 20344256
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343789 cttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 20343888  T
Q  456 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343889 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 20343988  T
Q  556 gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtatttgttttc 643  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||  |||||||||    
T  20343989 gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 20344087  T
Q  644 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctagg---tggtgttttgttgtttgttgcttgca 740  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| | ||||||||||||    
T  20344088 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtgctggttttttgtcgattgttgcttgca 20344185  T
Q  741 caatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatct 815  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20344186 c---acactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcatt-ctttgcattggtgtggttcgatct 20344256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 53 - 687
Target Start/End: Original strand, 24789435 - 24790074
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||     
T  24789435 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagtttgcagggtgcc 24789534  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 251  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||    
T  24789535 aaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatc 24789634  T
Q  252 gtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnn 348  Q
     |||||||||| ||||| || |||||||||||   |||| ||   ||||||| | | |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||             
T  24789635 ttgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaaggagag-gttggaagagagaga 24789732  T
Q  349 nnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 447  Q
            |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24789733 --------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag 24789824  T
Q  448 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 546  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24789825 aaaatcattgagtgtcttggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcc 24789924  T
Q  547 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtat 635  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |    
T  24789925 cttttgtaaaaactc-tttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct 24790023  T
Q  636 ttg-ttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttc 687  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24790024 ttgtttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgcattgtgtttc 24790074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 45 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1562587 - 1562103
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgca 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    |  |||       
T  1562587 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgtgtttctttttttttgttttt 1562488  T
Q  145 -gagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
     | ||   |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1562487 tgggttttaaatcgtgtcacgattttggtaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgtgacgga 1562388  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggan 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1562387 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtattt-atgtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttggaa 1562289  T
Q  341 nnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttg 440  Q
                    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1562288 gagagagaga------cttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 1562195  T
Q  441 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 534  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562194 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 541 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560470
Alignment:
Q  541 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------- 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttg 1560658  T
Q  631 -tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 728  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560657 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 1560558  T
Q  729 ttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1560557 ttcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 1560470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 357 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 43504431 - 43503975
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  43504431 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatca 43504333  T
Q  455 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccctttt 551  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  43504332 tcgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctctttt 43504234  T
Q  552 gtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtatttgtt 640  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||           ||| ||||||    
T  43504233 gtaagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 43504135  T
Q  641 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 739  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||   |||||||| || ||||||||    
T  43504134 ttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctagctg--tttttgttgattattgcttgc 43504039  T
Q  740 acaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtg 806  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43504038 ac-acacactttg-ttggtggttaccactctcctttgctccacacatca-tatttcgtattggtgtg 43503975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 357 - 741
Target Start/End: Original strand, 39731261 - 39731656
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  39731261 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 39731359  T
Q  455 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39731360 ttgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 39731458  T
Q  553 taagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------tgtatttgtttt 642  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||    
T  39731459 taagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtttt 39731557  T
Q  643 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttgca 740  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  39731558 cctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgca 39731655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21640459 - 21640204
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21640459 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcat 21640360  T
Q  109 cgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  21640359 cgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaag 21640260  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattg 263  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21640259 tatcactgataaggactggtcatgccttggaacggacgcaaatcgtgacacgattg 21640204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 262
Target Start/End: Original strand, 20343500 - 20343718
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20343500 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacgcgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttgc 20343599  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
     |  |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  20343600 cggatgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggta 20343699  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgatt 262  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  20343700 cgcagatcgtgacacgatt 20343718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 25767527 - 25766962
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  25767527 cttcaaatttgtggtctggaaa------gaaatcgtgacacaaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 25767434  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||    
T  25767433 cgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggacaggtcgtgccttgtgacgtacgtaccaatcgt 25767334  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt-gaaggggagagttggannnnnnnnnn 349  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||||  | ||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| || |              
T  25767333 gacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcaatggaagactagtatttaa-gtgttcttgtgcagattttgaagg--agagctgaagagagagaaa 25767238  T
Q  350 nnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 448  Q
           |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   | | |||||| | ||||||||||   || ||    
T  25767237 -------cttgagaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt---tgggaaacattgtaaacaccttggtgagtga 25767149  T
Q  449 gaatcattgagtgtcttg----gtgagattgg-gaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--cctttt 540  Q
     |||||||||||||||||     |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  25767148 aaatcattgagtgtcttgttcattgagattggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccctttt 25767050  T
Q  541 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767049 gtatctcttttg-aagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaa 25766962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2058604 - 2058321
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgca 144  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  2058604 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttgaggtgccgtgagctagtttgca 2058505  T
Q  145 gagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 244  Q
    |   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||    
T  2058504 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtac 2058405  T
Q  245 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaa 326  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||   ||   |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  2058404 gcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagtatatattgtgttcttgtgcagatttgaa 2058321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18409435 - 18409116
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |    
T  18409435 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtagagaaatgttgagatttggcttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtaacacgaatttggca 18409336  T
Q  108 tcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  18409335 tcgtgacacgattttgtggtgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatcatgacacgatcttgagaaatcgtgacacgattctcaaacttgcttgttaa 18409236  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatt 301  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||  | ||   ||||||||||| |    
T  18409235 gtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgacttgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagta-t 18409138  T
Q  302 ttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    ||| ||||||| ||||||||||    
T  18409137 ttaagtgttctcgtgcagattt 18409116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 263
Target Start/End: Original strand, 20357028 - 20357247
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  20357028 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagtttgc 20357127  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | ||    
T  20357128 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcaaaccttgggtcaga 20357227  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattg 263  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20357228 cgcaaatcgtggcacgattg 20357247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21646630 - 21646360
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  21646630 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacaaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 21646531  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||    
T  21646530 cgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataagaactggtcataccttgggacgtacgttcaaatcgt 21646431  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    | ||||||  || ||||| ||||||||||  | ||   |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21646430 gccacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 21646360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 630
Target Start/End: Original strand, 35853818 - 35854080
Alignment:
Q  374 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 466  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  35853818 gcaactttagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 35853915  T
Q  467 -gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  35853916 ggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 35854013  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35854014 tt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 35854080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43504708 - 43504500
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  43504708 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 43504609  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||    
T  43504608 cgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacagatgcaccaatcgt 43504509  T
Q  254 gacacgatt 262  Q
    |||||||||    
T  43504508 gacacgatt 43504500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 29990940 - 29991219
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagggg-caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  29990940 cttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 29991037  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29991038 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 29991136  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     ||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991137 tctttc-taataactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 29991219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 48408687 - 48408970
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  48408687 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 48408785  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgta 543  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  48408786 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgta 48408884  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||||| || |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408885 tctcttttgaaataactcatt-gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaa 48408970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12397528 - 12397267
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12397528 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgcgacacgattttggtat 12397429  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||             | || ||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12397428 cgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttgcag-------------gccatgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaag 12397342  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacga-ttgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    ||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  12397341 tatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgttgcaaatcgtgacacgatttggggaaatcgtggcacgatt 12397267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 261
Target Start/End: Original strand, 39730946 - 39731153
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  39730946 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 39731045  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | |   ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||    
T  39731046 cgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgtaccaatcgt 39731145  T
Q  254 gacacgat 261  Q
    ||||||||    
T  39731146 gacacgat 39731153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12406857 - 12406619
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  12406857 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttgc 12406758  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    |    || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |     
T  12406757 aagacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgt 12406659  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacga-ttgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  12406658 tgcaaatcgtgacacgatttggggaaatcgtggcacgatt 12406619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18414262 - 18413992
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| | || ||||    
T  18414262 cttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtggcacgattttgtggtgccgtgagctggtttgcagggcgccaaat 18414163  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | || ||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||||||    
T  18414162 cgtgacacgatcttgggaaatcgtaacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgt 18414063  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| |||  | ||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18414062 gacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcattggaagactagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 18413992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 261
Target Start/End: Original strand, 1532947 - 1533121
Alignment:
Q  88 atcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacga 186  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1532947 atcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgaggtgccatgagctagtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacga 1533046  T
Q  187 tcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1533047 ttgtgaaacttactcgttaagtatccttgataaggactggttataccttgggacatacacaaatcgtgacacgat 1533121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4873721 - 4873505
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| || ||| ||||    
T  4873721 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtaagatagtttgc 4873622  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | |     
T  4873621 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-ttccttgggtccgt 4873523  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
     |||||||||||||||||    
T  4873522 tgcaaatcgtgacacgat 4873505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310718
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310786 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 34310718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 23555039 - 23555206
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  23555039 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctcttt-gtaagaac 23555136  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555137 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 23555206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 21811738 - 21811923
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-g 142  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  | |||||||||| | ||| |    
T  21811738 atgttgtatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgccatcgtgacacgatctgagatgccgtgagcaatgtttg 21811837  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21811838 cagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctagttaagtatctctgataaggactggtc 21811923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Original strand, 48408411 - 48408619
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  48408411 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 48408510  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||  ||| |||  | ||||||    
T  48408511 cgtgacacgatcttgagaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggactggtcgtaccttgtaacgtacgtaccaatcgt 48408610  T
Q  254 gacacgatt 262  Q
    |||||||||    
T  48408611 gacacgatt 48408619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 24265641 - 24265861
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||   |    
T  24265641 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttggaattgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagt 24265740  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgagct-aggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||||||||||   ||  || ||||||| || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  24265741 cgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaag 24265840  T
Q  208 tatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  24265841 tatctctgataaggactggtc 24265861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 394 - 626
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616015
Alignment:
Q  394 tctttgattagagtatctcttgggtag-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaa 490  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  491 ttagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaat 588  Q
    ||||| |||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaat 25615977  T
Q  589 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25615978 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 25616015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 630
Target Start/End: Original strand, 4178678 - 4178939
Alignment:
Q  374 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 466  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  4178678 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 4178775  T
Q  467 -gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||    
T  4178776 ggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactca 4178872  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4178873 tt-gatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaa 4178939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270138
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22270071 gatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 22270138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 24023818 - 24024003
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttg 142  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || || | ||||||| |||    
T  24023818 atgttgatattagcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtggcacgatttcaagtggcagagagctagtttg 24023917  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24023918 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtc 24024003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069839
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14069904  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14069903 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 14069839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379867
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14379932  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14379931 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 14379867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18390596 - 18390506
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18390596 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttagaagaacagggaaatcgtgccacgatt 18390506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Original strand, 31109066 - 31109287
Alignment:
Q  41 gaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgcc-gtgagct-ag 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| || |||| ||    
T  31109066 gaaatgttgaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtggcacgatttcaagtgcctgtaagctaag 31109165  T
Q  139 gttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 238  Q
     ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||| | |||||||    
T  31109166 tttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtataactgataaggacttgtc-tgccttggg 31109264  T
Q  239 acggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
     | |  ||| |||||||||||||    
T  31109265 gccgttgcagatcgtgacacgat 31109287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317440
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41317504 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 41317440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 630
Target Start/End: Original strand, 19502083 - 19502344
Alignment:
Q  376 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------g 467  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||       |    
T  19502083 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtgg 19502180  T
Q  468 tgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    |||||||| |||||  || ||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19502181 tgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19502278  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19502279 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaa 19502344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16880696 - 16880476
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||  ||    
T  16880696 gacatcaccaccaatttagaagtcaaggtggagaaatgttggaattgacttcaaattagtggtttggaagagcagaggaatcgtgtcacgattttgccat 16880597  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||||||||||   ||  || ||||| |||| |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  16880596 cgtgacacgatcagggaggcagtgagcctagtttgctggaagcaaaatcgtgtcacgatcttgggaaattgtgacacgattcagaaacttgctggttaag 16880497  T
Q  208 tatccttgataaggactggtc 228  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  16880496 tttctctgataaggactggtc 16880476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359318
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8359387 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 8359318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27347979
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27347915 catt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 27347979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 631
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608903
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaat 631  Q
    |||| |||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29608835 catt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaat 29608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 464 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024740
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30024803  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    | ||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024802 c-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21983890 - 21983790
Alignment:
Q  22 aattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaa-ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  21983890 aattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcatcgtgacacgatt 21983791  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  21983790 t 21983790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 628
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 628  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432069 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 612
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gaaagaact 48491676  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48491677 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 41649175 - 41649017
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |    
T  41649175 gtgagattggaaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca-t 41649079  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41649078 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 41649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259160
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3259093 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtgaa 3259160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 518 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358057
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 32358071  T
Q  617 ccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||||||||||||    
T  32358070 ccgaactgggtgaa 32358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599337
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  48599404 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtgaa 48599337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 482 - 631
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390448
Alignment:
Q  482 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 579  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||| |    
T  2390301 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatat-atagtggattgga 2390397  T
Q  580 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaat 631  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2390398 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaat 2390448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 2361043  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||  |||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361042 catt-gatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153504
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  8153440 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggt 8153504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126806
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18126741  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  18126742 catt-gatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggt 18126806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253538
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    | |||||| ||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4253597 a-ttgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaact 4253538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508709
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4508777  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| || ||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4508776 catt-gagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaagtt-ggaccgaactgggtgaa 4508709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 683 - 806
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790349
Alignment:
Q  683 gtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccac 782  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattacttgcac---gcactttgtttggtggttaccactttccgttgctccac 24790326  T
Q  783 acatcattattttgtattggtgtg 806  Q
    |||||| || |||| |||||||||    
T  24790327 acatca-tactttgcattggtgtg 24790349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 357 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 38671505 - 38671228
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatc 453  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||    || || ||||    
T  38671505 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatc 38671408  T
Q  454 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 543  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38671407 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgta 38671309  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38671308 tcacttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggt 38671228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 47674111 - 47673953
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47674111 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47674014  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47674013 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586323
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctcttt-gtaagaact 4586258  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||    
T  4586259 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 31733137 - 31732975
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31733137 ttggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31733040  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31733039 catt-gatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 31732975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 48489431 - 48489593
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||    
T  48489431 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gcaataact 48489528  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||  ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48489529 cattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 48489593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2479960 - 2479795
Alignment:
Q  45 tgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacga-tttcgggtgccgtgagctaggttg 142  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||    
T  2479960 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttgtaagaacagagaaattgtgacacgattttggcatcgtgacacgattttctaatgccgtgagctggtttg 2479861  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    ||| |||  |||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||  | ||||||| | |||||||    
T  2479860 cagggtgtcaaatcgtgtcacgattttgtgaaatcgttacacgattttcaaacttgttggttaagt 2479795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 464 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 47676304 - 47676144
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47676304 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47676207  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    || | ||||||||| || ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  47676206 caat-gatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 47676144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146418
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36146479  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    |||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  36146478 catt-gatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaact 36146418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864406
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 43864341  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
     ||| |||||||||||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43864342 aatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 43864406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 4510716 - 4510551
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4510716 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4510619  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4510618 catt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaa 4510551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 4512558 - 4512393
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4512558 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4512461  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4512460 catt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaa 4512393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47264267 - 47264190
Alignment:
Q  45 tgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47264267 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattt 47264190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 483 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 580  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 23565113  T
Q  581 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    ||  |||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23565112 agatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 24260821 - 24261005
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttg-c 143  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||   ||  || |||||| | ||   |    
T  24260821 tgttggaattggcttcaaatttgtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgatttggccatcgtgacacgatcagggaggcagtgagccaagtaatc 24260920  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     ||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24260921 tgaaagcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 24261005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16885518 - 16885331
Alignment:
Q  42 aaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggt 140  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||   ||  || ||||| |||| |    
T  16885518 aaatgttggaattgacttcaaattagtggtttggaagagcagaggaatcgtgtcacgattttgccatcgtgacacgatcagggaggcagtgagcctagtt 16885419  T
Q  141 tgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||| |   ||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16885418 tgctggaagcaaaatcgtgtcacgatcttgggaaattgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc 16885331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 31105558 - 31105399
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||     
T  31105558 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaactca- 31105462  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31105461 ttgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggt 31105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 26417316 - 26417477
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26417413  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | || |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26417414 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggt 26417477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Original strand, 44847619 - 44847696
Alignment:
Q  45 tgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44847619 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttaaaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattt 44847696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 467 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 496003
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| | | |||||||||||||    
T  496050 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaagtt 496003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 469 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 22328556 - 22328395
Alignment:
Q  469 gagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||| ||| |    
T  22328556 gagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtca-t 22328458  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||||  ||||  |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22328457 taatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 614
Target Start/End: Original strand, 1113660 - 1113807
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  1113660 gtgagattgagaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 1113757  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 614  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  1113758 t-gatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtttg 1113807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 536
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344048
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 23344048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 535  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 105
Target Start/End: Original strand, 1532897 - 1532945
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1532897 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgg 1532945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759207
Alignment:
Q  489 aattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtaca 586  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||   ||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagatatca 2759243  T
Q  587 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2759242 atctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 2759207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 9189464 - 9189520
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaattt 66  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9189464 gacatcatcatcaa-ttagaagtcaaggtggagaaatgttgtaattgacttcaaattt 9189520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21989531 - 21989454
Alignment:
Q  45 tgttgaaa-ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  21989531 tgttgaaagttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacaagatttcatcatcgtgacacgattt 21989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 20000370 - 20000330
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg 49  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000370 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg 20000330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 80005 - 79955
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  80005 attggcttcaaatttgtgatttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 79955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 518 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359958
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| | ||| | ||||||||| |||||    
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttgga 6359969  T
Q  617 ccgaactgggt 627  Q
     ||||||||||    
T  6359968 tcgaactgggt 6359958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 12098027 - 12097954
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||    
T  12098027 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacc 12097954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 627
Target Start/End: Original strand, 18396384 - 18396481
Alignment:
Q  529 ttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18396384 ttgtaacattttgtatctctttataaagaattcatt-gatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggt 18396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 549 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525508
Alignment:
Q  549 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24525584 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggt 24525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 549 - 625
Target Start/End: Original strand, 31518988 - 31519063
Alignment:
Q  549 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518988 tttgtaagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 36574683 - 36574522
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||    
T  36574683 ttggagagattggggaaagg-tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactc 36574585  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||| ||| ||||  |||||  ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36574584 a-ttgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttggaccaaactgggt 36574522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24515043 - 24514934
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  24515043 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 24514946  T
Q  455 ttgagtgtcttg 466  Q
    ||||||||||||    
T  24514945 ttgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 627
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814598
Alignment:
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 30814598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 564
Target Start/End: Original strand, 31518795 - 31518896
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31518795 ttggtgagattgggaaaataggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31518892  T
Q  561 catt 564  Q
    ||||    
T  31518893 catt 31518896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4509369 - 4509335
Alignment:
Q  87 aatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4509369 aatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgattt 4509335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4511211 - 4511177
Alignment:
Q  87 aatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4511211 aatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgattt 4511177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 121
Target Start/End: Original strand, 6431467 - 6431501
Alignment:
Q  87 aatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6431467 aatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgattt 6431501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 536
Target Start/End: Original strand, 28617182 - 28617234
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  28617182 ggtagaaattaggttttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacc 28617234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 49092282 - 49092237
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatttt 103  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49092282 ttcaaatttgtagtttggaagaacagagaaattgtgacacgatttt 49092237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 495; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 814
Target Start/End: Original strand, 3617033 - 3617813
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttg 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3617033 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttg 3617132  T
Q  143 cagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3617133 caggggtgcaaa-tcgtgtcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataacggctggtcgttccttgggacg 3617231  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag-ttg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  3617232 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagagtagaggttg 3617330  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacc 437  Q
    ||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3617331 gaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 3617422  T
Q  438 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617423 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 3617522  T
Q  538 tttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------ 630  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  3617523 cttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3617622  T
Q  631 ---tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 723  Q
       ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617623 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 3617720  T
Q  724 gttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3617721 gttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttatttgtattggtgtggttcgatc 3617813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 815
Target Start/End: Original strand, 54634704 - 54635484
Alignment:
Q  39 gagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagcta 137  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54634704 gagaagtgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggcattgtgacacgatttcggggtgccgtgagcta 54634803  T
Q  138 ggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgg 237  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  54634804 agttgcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcttttcttgg 54634903  T
Q  238 gacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag 334  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||   |||||||   | |||||||||||||||||||||| || |||    
T  54634904 gtggtacgcaaatcatgacacgattgggaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagtata--aagtgttcttgtgcagatttgaagagg-gag 54635000  T
Q  335 ttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaa 433  Q
    |||||                 |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54635001 ttggaagagagagaga------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaa 54635094  T
Q  434 caccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgta 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635095 caccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgta 54635194  T
Q  534 accttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa--- 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  54635195 accttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 54635293  T
Q  631 ---------tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 721  Q
             ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635294 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 54635391  T
Q  722 ttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatct 815  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  54635392 ttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattatttagtattggtgtgactcgatct 54635484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Original strand, 25637013 - 25637793
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctagg-ttg 142  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||    
T  25637013 tgttgagattgtctttaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcgaggtgc-gagagctagggttg 25637111  T
Q  143 cagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637112 caggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 25637210  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25637211 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttgg 25637308  T
Q  339 annnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacct 438  Q
    |                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25637309 aagagagagaga------cttgggaaatcaaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacct 25637402  T
Q  439 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctt 538  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25637403 tgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctc 25637500  T
Q  539 ttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga-------- 629  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  25637501 ttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc 25637600  T
Q  630 ----atgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg--tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 723  Q
         ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637601 tttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 25637700  T
Q  724 gttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25637701 gttgtttcctgcttgcacaatacactttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 25637793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 4599141 - 4598328
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4599141 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcg 4599042  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4599041 cgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcaggggtgc-aaatcgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 4598943  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||  |||    
T  4598942 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattgaaacagaggaagactagta-ctta 4598844  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttg-aaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgatta 403  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||                 |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4598843 agtgttcttgtgcagatttgaaaggagagagttgga--------agagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgatta 4598752  T
Q  404 gagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttc 503  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4598751 gagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttc 4598654  T
Q  504 attgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagag 601  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4598653 atagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagag 4598554  T
Q  602 taggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  4598553 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttca 4598456  T
Q  689 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatca 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4598455 cacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 4598356  T
Q  789 ttat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4598355 ttattctttgtattggtgtggttcgatc 4598328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 815
Target Start/End: Original strand, 45282585 - 45283346
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgca 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  ||||||||||||||||||||||    
T  45282585 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatttcg------------------gggtgccgtgagctaggttgca 45282666  T
Q  145 gagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 244  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  45282667 gggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 45282766  T
Q  245 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggann 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||   |||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||      
T  45282767 gcagatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta--taaagtgttcttgtgcagatttgaa-gagagagttgga-- 45282861  T
Q  342 nnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttg 440  Q
                   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45282862 --agagagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 45282959  T
Q  441 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctttt 540  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282960 caaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctttt 45283059  T
Q  541 gtatccc---ttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------- 630  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           
T  45283060 gtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctc 45283159  T
Q  631 ----tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 726  Q
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283160 ttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 45283259  T
Q  727 gtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatct 815  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45283260 gattattgcttgcacaa-acactttgtttggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcatt-ctttgtattggtgtggttcgatct 45283346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 10057993 - 10058804
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10057993 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 10058092  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacga-tttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10058093 tgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc-aaatcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 10058191  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  10058192 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 10058290  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |                 |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10058291 agtgttcttgtgcagatttgaa-gagagggttgaa--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattag 10058381  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10058382 agtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttca 10058479  T
Q  505 ttgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagt 602  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10058480 tagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 10058579  T
Q  603 aggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||||||    
T  10058580 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttca 10058677  T
Q  689 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatca 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10058678 cacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 10058776  T
Q  789 ttat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10058777 ttattctttgtattggtgtggttcgatc 10058804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 10060215 - 10061026
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060215 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 10060314  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacga-tttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10060315 tgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc-aaatcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 10060413  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  10060414 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 10060512  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |                 |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10060513 agtgttcttgtgcagatttgaa-gagagggttgaa--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattag 10060603  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10060604 agtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttca 10060701  T
Q  505 ttgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagt 602  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10060702 tagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 10060801  T
Q  603 aggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||||||    
T  10060802 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttca 10060899  T
Q  689 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatca 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10060900 cacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 10060998  T
Q  789 ttat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10060999 ttattctttgtattggtgtggttcgatc 10061026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 10062437 - 10063248
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062437 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 10062536  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacga-tttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10062537 tgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc-aaatcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 10062635  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  10062636 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 10062734  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |                 |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10062735 agtgttcttgtgcagatttgaa-gagagggttgaa--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattag 10062825  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10062826 agtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttca 10062923  T
Q  505 ttgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagt 602  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10062924 tagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 10063023  T
Q  603 aggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||||||    
T  10063024 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttca 10063121  T
Q  689 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatca 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10063122 cacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 10063220  T
Q  789 ttat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10063221 ttattctttgtattggtgtggttcgatc 10063248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 10064659 - 10065470
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10064659 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 10064758  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacga-tttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10064759 tgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc-aaatcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 10064857  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  10064858 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 10064956  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |                 |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10064957 agtgttcttgtgcagatttgaa-gagagggttgaa--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattag 10065047  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10065048 agtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttca 10065145  T
Q  505 ttgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagt 602  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10065146 tagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 10065245  T
Q  603 aggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||||||    
T  10065246 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttca 10065343  T
Q  689 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatca 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10065344 cacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 10065442  T
Q  789 ttat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10065443 ttattctttgtattggtgtggttcgatc 10065470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 4601328 - 4600549
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4601328 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 4601229  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttg-ggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601228 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 4601130  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaagggga-gagttg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  4601129 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaaggaaagagttg 4601031  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacc 437  Q
    ||                 |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4601030 gaagagagaga--------cttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 4600939  T
Q  438 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4600938 ttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc 4600841  T
Q  537 ttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatg 632  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  4600840 ttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 4600741  T
Q  633 tat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 723  Q
    | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4600740 tctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgatt-tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 4600642  T
Q  724 gttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4600641 gttgtttctggcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 4600549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 839
Target Start/End: Original strand, 6716085 - 6716881
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6716085 tgttgagattgtcttgaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttgc 6716184  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    || ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  6716185 agggtgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggta 6716284  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggan 340  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||   ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   || ||||||     
T  6716285 cgcggatcgtgacacgatttggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtata--aagtgttcttgtgcagatttgaagaa-agggttggaa 6716381  T
Q  341 nnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacctt 439  Q
                    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6716382 gagagagaga------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacctt 6716475  T
Q  440 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716476 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 6716575  T
Q  540 tgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa--------- 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  6716576 tgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 6716674  T
Q  631 ---tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt-gt 725  Q
       ||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6716675 tggtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttggt 6716772  T
Q  726 tgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggttcgatcttgtgggggat 825  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||   | || |||    
T  6716773 tgattattgcttgcac-acacactttgtttggtggttaccgctttccgttgctccacacatcact-ctttgcattggtgtggttcgatc---taggtgat 6716867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 814
Target Start/End: Original strand, 10055813 - 10056582
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgc 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||    
T  10055813 ttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc 10055912  T
Q  151 aaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 249  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055913 aaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 10056011  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | || |||| |           
T  10056012 tcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-agggttgaaagagaga 10056109  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 446  Q
              |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  10056110 ga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--ga 10056199  T
Q  447 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatc 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10056200 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatt 10056299  T
Q  546 ccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat------ 635  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |          
T  10056300 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 10056399  T
Q  636 ---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 730  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10056400 ttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgttt 10056496  T
Q  731 gttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
     |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10056497 cttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 10056582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 566
Target Start/End: Original strand, 10066881 - 10067431
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10066881 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 10066980  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10066981 tgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 10067079  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  10067080 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 10067178  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |                 |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10067179 agtgttcttgtgcagatttgaa-gagagggttgaa--------agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattag 10067269  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10067270 agtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttca 10067367  T
Q  505 ttgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttg 566  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10067368 tagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 357 - 814
Target Start/End: Original strand, 10211288 - 10211758
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 456  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10211288 cttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcatt 10211385  T
Q  457 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10211386 gagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 10211485  T
Q  556 -gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgtttt 642  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         |||||||    
T  10211486 agaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgtttt 10211585  T
Q  643 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac 741  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10211586 catcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctc 10211683  T
Q  742 aatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  10211684 aataagctttgattggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgatc 10211758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 357 - 814
Target Start/End: Original strand, 10209068 - 10209538
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 456  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10209068 cttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcatt 10209165  T
Q  457 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 554  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    
T  10209166 gagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgtaa 10209265  T
Q  555 agaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgtttt 642  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| | |         |||||||    
T  10209266 agaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgtttt 10209365  T
Q  643 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac 741  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10209366 catcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctc 10209463  T
Q  742 aatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  10209464 aataagctttgattggtggttaccactctccgtcactccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgatc 10209538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 498
Target Start/End: Original strand, 6718254 - 6718718
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
T  6718254 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtga---------------- 6718337  T
Q  111 tgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 209  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718338 ---cacgatttcggggtgccgtgagctaggttgcagggtgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 6718434  T
Q  210 tccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||   ||||||||||   | |    
T  6718435 tccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcggatcgtgacacgatttgaaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtata--aag 6718532  T
Q  307 tgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattaga 405  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||                 |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718533 tgttcttgtgcagatttgaagaa-agggttggaagagagagaga------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattaga 6718625  T
Q  406 gtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718626 gtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Original strand, 10210944 - 10211264
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10210944 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtctttaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 10211043  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10211044 tgacgcgatttaggatgccgtgagttagggttgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgattttgggaaaatcatgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 10211142  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  10211143 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 10211241  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaag 327  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  10211242 agtgttcttgtgcagatttgaag 10211264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 23198566 - 23197823
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  23198566 gacatcaccaacaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgaca 23198467  T
Q  108 tcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  23198466 tcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaa 23198367  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatt 301  Q
    || |||  |||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||   ||||||||||| |    
T  23198366 gtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgatttgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagta-t 23198269  T
Q  302 ttatgtgttcttgtgcaga-tttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttg 399  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||                 |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23198268 ttaagtgttcttgtgcagattttgaa---gagagttgga------agagagagaaacttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttg 23198179  T
Q  400 attagagtatctcttggg-tagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtg------tcttggtgagattggg-aaaagggtagaaat 491  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||      |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23198178 attagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaat 23198079  T
Q  492 tagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatc 589  Q
    ||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  23198078 tagag-ttgttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgtaagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatc 23197982  T
Q  590 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctt 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  23197981 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctcttctctctcct--tttatcttgtgcttgtggtt 23197884  T
Q  680 tgtgtttcaca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 739  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  23197883 tgtgtttttcattttgtttcctagattagatctatgtgttttattgttgattattgcttgc 23197823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 57 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 23200716 - 23199957
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  23200716 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgctgtgagctggtttgcagggtgccaaat 23200617  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||  ||| |  ||||||    
T  23200616 cgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgacttacgtaccaatcgt 23200517  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacag---aagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt-gaaggggagagttggannnnnnnnnn 349  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||  | |||   |||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||   |||||||||              
T  23200516 gacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactggtatttaa-gtgtttttgtgcagattttgaag---agagttggaagagagagaa 23200422  T
Q  350 nnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagag 447  Q
           |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || |    
T  23200421 a------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtg 23200329  T
Q  448 agaatcattgagtgtcttg------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tt 538  Q
    | |||||||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23200328 aaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctt 23200230  T
Q  539 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  23200229 ttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatcttt 23200132  T
Q  631 --tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcaca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 727  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  23200131 ggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttatgcttgtggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtgttttattgttg 23200034  T
Q  728 tttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
     || ||||||||||    ||||||| ||  ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  23200033 attattgcttgcac---tcactttg-ttattggttactactttcctttgctccacatatca-tactttgtattggtgtggtt 23199957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 427 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779821
Alignment:
Q  427 tgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaat 525  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  526 ttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7780109 ttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgg 7780011  T
Q  626 gtgaa-----------tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtg-tttcacacttgtttcctagattagatctag 713  Q
    |||||           ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7780010 gtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatctag 7779913  T
Q  714 gtggtg-ttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  7779912 gtgctgtttttgttgattattgcttgcac---acactttg-ttggtggttaccactctcctttgctccacacatc-ttacttcgtattggtgtggtt 7779821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 376 - 806
Target Start/End: Original strand, 801003 - 801435
Alignment:
Q  376 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 474  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  801003 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 801101  T
Q  475 gggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 571  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  801102 gggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca-ttgatagt 801199  T
Q  572 ggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtatttgttttcttcttccctctccttgt 660  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  801200 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--t 801297  T
Q  661 ttatcttgtg-attgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtg--gtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttgg 757  Q
    |||||||||| ||||     ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||   |||||||  || |    
T  801298 ttatcttgtgtattg-----tgtttttc-cacttgtttcctagattagatctaggtgctgttttttgttgattattgcttgcac---acacttt-attag 801387  T
Q  758 tggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtg 806  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  801388 tggttactactttcctttgctccacacatca-tatttcgtattggtgtg 801435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Original strand, 10208778 - 10208999
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  10208778 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcatgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgc 10208877  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10208878 aggggtgcaaa-tcgtggcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaaatatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 10208976  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgg 264  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10208977 gacgcaaatcgtgacacgattgg 10208999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Original strand, 40372256 - 40372538
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40372256 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgc 40372355  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||    
T  40372356 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacgga 40372455  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttg 324  Q
    ||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||    ||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  40372456 cgcaaatcgtgccacgatctgg-aaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 40372538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8478002 - 8477764
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8478002 tgttgacattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaattgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgc 8477903  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
     |  ||| |||||||| |||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |    
T  8477902 tggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgta 8477803  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  8477802 cgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgattg 8477764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 22172629 - 22172899
Alignment:
Q  12 atcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgt 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22172629 atcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgt 22172728  T
Q  112 gacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtat 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  22172729 gacacgatttcgaggtgccgtgagccagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaaggat 22172828  T
Q  211 ccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    |  |||||||||||||||   ||||||  | |  |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  22172829 ctctgataaggactggtc-aaccttggttccgttgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgatt 22172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Original strand, 28503283 - 28503535
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28503283 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcat 28503382  T
Q  109 cgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |   || |||||||| |||||| | || |||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  28503383 cgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagtttgctggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaag 28503482  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    ||||| ||||||||||| |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28503483 tatccctgataaggacttgtc-aaccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgat 28503535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1306640 - 1306385
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |    
T  1306640 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagatttggcttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggca 1306541  T
Q  108 tcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1306540 tcgtgacacgatttcgtggtgtcgtgagctggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctcaaacttgctcgttaa 1306441  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacga 260  Q
    || |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||||||||||    
T  1306440 gtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacga 1306385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7167882 - 7167600
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  7167882 tgttgatattggcttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacaatttcaaggtgccgtgagctagtttgc 7167783  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| | ||    
T  7167782 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcaga 7167683  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttg 324  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    ||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  7167682 cgcaaatcgtgacacgatt-tgaaaatcatggcacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 7167600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 368 - 630
Target Start/End: Original strand, 45095062 - 45095329
Alignment:
Q  368 aaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 466  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  45095062 aaagaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 45095159  T
Q  467 -------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaaga 557  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  45095160 ttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaaga 45095257  T
Q  558 actcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095258 actcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 45095329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Original strand, 800694 - 800903
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| | ||||     
T  800694 ttgtcttcgaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcggggtgcc 800793  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aa 249  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  800794 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttcttgggacgaacgcaccaa 800893  T
Q  250 tcgtgacacg 259  Q
    ||||||||||    
T  800894 tcgtgacacg 800903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Original strand, 27352097 - 27352305
Alignment:
Q  61 aaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtg 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||   | ||||||||    
T  27352097 aaatttgtggtctcgaagaacagaaaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagcttgtttgcagaacaccaaatcgtg 27352196  T
Q  160 acacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacg 259  Q
     |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27352197 gcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaattatcactgataaggactggtcataccttgggacggacgcaaatcgtgacacg 27352296  T
Q  260 attgggaaa 268  Q
    ||| |||||    
T  27352297 atttggaaa 27352305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 37408344 - 37408624
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||    || || ||| |    
T  37408344 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaatta 37408441  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 544  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37408442 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat 37408540  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37408541 ctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaa 37408624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 593 - 814
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067669
Alignment:
Q  593 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtgct 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgct 10067534  T
Q  679 ttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggct 778  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  10067535 t--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgct 10067631  T
Q  779 ccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10067632 ccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 10067669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 5260606 - 5260325
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  5260606 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5260509  T
Q  455 ttgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 543  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5260508 ttgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 5260410  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5260409 tctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaa 5260325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 364 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 5258420 - 5258146
Alignment:
Q  364 aatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtg 461  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||    
T  5258420 aatcaaagggagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtg 5258323  T
Q  462 tcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttt 550  Q
    |||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5258322 tcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 5258224  T
Q  551 tgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5258223 gg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaa 5258146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 376 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 9636390 - 9636128
Alignment:
Q  376 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt------ 468  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||| || | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||          
T  9636390 aactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattgg 9636292  T
Q  469 -gagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  9636291 tgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcat 9636194  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9636193 t-gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaa 9636128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Original strand, 28501152 - 28501368
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  28501152 tgttgatattggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagtttgc 28501251  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||    | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | ||    
T  28501252 aggacaccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-aaccttgggtcaga 28501350  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    |||||||| |||||||||    
T  28501351 cgcaaatcatgacacgat 28501368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683891
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19683957  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19683956 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 19683891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 7762265 - 7762431
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  7762265 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaact 7762362  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762363 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 7762431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 262
Target Start/End: Original strand, 2671111 - 2671283
Alignment:
Q  91 gtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcg 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||      
T  2671111 gtgacacgattttggcatcgtgacatgatttcaaggtgccgtgagctagtttgcaggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattt 2671210  T
Q  190 tgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgatt 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  2671211 agaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacacgatt 2671283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18657029 - 18656844
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtg-agctaggttg 142  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||    
T  18657029 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgaagcaagtttg 18656930  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||   || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18656929 caggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 18656844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 7764353 - 7764630
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggt-agaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| || |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  7764353 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattagatt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 7764450  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7764451 ttgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatc 7764547  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7764548 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaa 7764630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 471 - 630
Target Start/End: Original strand, 9581290 - 9581448
Alignment:
Q  471 gattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 568  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  9581290 gattcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gat 9581386  T
Q  569 agtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581387 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 9581448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32476108 - 32475887
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaa-attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||| |  |    
T  32476108 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaagattggcttcaaatttgtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgatttggcca 32476009  T
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||   ||  || |||||| | |||  | ||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  32476008 tcgtgacacgatcagggaggcagtgagccaagttctctgaaagcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 32475909  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  32475908 gtatctctgataaggactggtc 32475887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491377
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34491310 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 34491377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8512863 - 8512643
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||   |    
T  8512863 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttggaattgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagt 8512764  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgagct-aggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||||||||||   ||  || ||||||| || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  8512763 cgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaag 8512664  T
Q  208 tatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  8512663 tatctctgataaggactggtc 8512643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570115
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570050 catt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggt 4570115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 2676538 - 2676759
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |    
T  2676538 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttggaatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgtaa 2676637  T
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||    | || || ||| | || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  2676638 tcgtgacacgatcggagatgtcgggagccaagtttgctggaagcaaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 2676737  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    | |||  |||||||||||||||    
T  2676738 gaatctctgataaggactggtc 2676759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 257
Target Start/End: Original strand, 8738585 - 8738736
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  8738585 atcgtgacatgatttcaaggtgccgtgagctagtttgcaggacgctaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtta 8738684  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  8738685 agtatccttgataaggactggtcataccttggaacggacgcaaatcgtgaca 8738736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 257
Target Start/End: Original strand, 9090823 - 9090974
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9090823 atcgtgacatgatttcaaggtgccgtgagctagtttgcaggacgctaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtta 9090922  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  9090923 agtatccttgataaggactggtcataccttggaacggacgcaaatcgtgaca 9090974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196392
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 29196457  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29196456 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 29196392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Original strand, 26928093 - 26928301
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  26928093 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 26928192  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    |||||||| || | |   ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||  ||| |  ||||||    
T  26928193 cgtgacacaatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataaggacaggtcgtaccttgtgacttacgtatcaatcgt 26928292  T
Q  254 gacacgatt 262  Q
    |||||||||    
T  26928293 gacacgatt 26928301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Original strand, 37408013 - 37408200
Alignment:
Q  22 aattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37408013 aatttgaagtcaaggtggagaaatgttgagatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacaaagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatt 37408112  T
Q  121 tcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    | |  |||||||||||| | |||||| |||  |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||  | ||||||| | |||||||    
T  37408113 ttgtagtgccgtgagctggtttgcagggtgtcaaatcgtggcacga-ttgtgtaaatcgtgacacgattttcaaacttgttggttaagt 37408200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 39153526 - 39153367
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  39153526 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttta-taagaactcat 39153429  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  39153428 t-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggt 39153367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199471
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49199540 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaa 49199471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7782699 - 7782586
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  7782699 cttcaaatttgtggtctagaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgcggtgagctggtttgcagggtgccaaat 7782600  T
Q  156 cgtgacacgatttg 169  Q
    ||||||||||||||    
T  7782599 cgtgacacgatttg 7782586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 357 - 627
Target Start/End: Original strand, 40735268 - 40735545
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggt-agaaaacatgggaaacaccttgtaaa-gagagaatc 453  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||| | |||||||||| ||| | || ||||    
T  40735268 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaaatc 40735365  T
Q  454 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 543  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  ||||||    
T  40735366 attgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgta 40735464  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40735465 tctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40735545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 33386150 - 33386302
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  33386150 cttcaaatttgtggtccgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 33386249  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  33386250 cgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagt 33386302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819525
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||||  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  41819593 tcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaa 41819525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401803
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43401872 tcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaa 43401803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 623
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236283
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
     |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30236227 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 30236283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734660
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt-gtaagaact 40734595  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40734596 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40734660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331707
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaact 44331642  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
     ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44331643 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 44331707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095602
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6095669 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtgaa 6095602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 467 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 22835070  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835069 t-gatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37726286 - 37726134
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||  ||||    
T  37726286 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgatatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgtcaaat 37726187  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||  | ||||||| | |||||||    
T  37726186 cgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgttggttaagt 37726134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593869
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  54593802 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtgaa 54593869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 467 - 612
Target Start/End: Original strand, 760850 - 760995
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  760850 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 760947  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  760948 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 357 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 32744709 - 32744442
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||| |||   || || |||||    
T  32744709 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatca 32744612  T
Q  455 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatccctttt 551  Q
    |||||| | ||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||     
T  32744611 ttgagtattttg-tgagattgaaaaaatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt- 32744516  T
Q  552 gtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32744515 gtaagaactc-tttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 32744442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403746
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||   | || |||| |||| ||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggctt-gttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctcttt-gtaagaac 43403816  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43403815 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaa 43403746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700489
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  44700548 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaact 44700489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 624
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314604
Alignment:
Q  466 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||     
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactc- 31314543  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31314544 tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 31314604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32143884 - 32143664
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |   ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  32143884 atcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctagtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgtta 32143785  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtat 300  Q
    ||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||   ||||||| |||     
T  32143784 agttttcaagataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcgtgacacgatttgg-aaatcgtgacacgattttatcagttgaagacttgta- 32143687  T
Q  301 tttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  32143686 tttaagtgttcttgtgcagattt 32143664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860640
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||    
T  46860572 catt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaa 46860640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Original strand, 2672431 - 2672603
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||    | ||||| ||| | || |||| |   |||||||    
T  2672431 cttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgtaatcgtgacacgatcggagatgccgggagccaagtttgctggaagcaaaat 2672530  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2672531 cgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 2672603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 464 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53921573 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27453568 - 27453355
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |||| ||||    
T  27453568 cttcaaatttgtggtctgaaagagcagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgtagggtgccaaat 27453469  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    ||||||| ||||  |   ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||    
T  27453468 cgtgacatgattgtgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcgt 27453370  T
Q  254 gacacgattgggaaa 268  Q
    ||||||||| |||||    
T  27453369 gacacgatttggaaa 27453355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Original strand, 29682362 - 29682521
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29682362 gtgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 29682459  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29682460 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggt 29682521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36029752 - 36029658
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaa-attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatttt 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36029752 gacatcaccaccaaattagaagttaaggtggagaa-tgttgtatattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttt 36029658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 5236624 - 5236463
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  5236624 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 5236527  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||| ||||||  ||||  |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  5236526 ca-ttgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggt 5236463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 29813063 - 29813225
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||    
T  29813063 ttggtgagattggaaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctc-tttgtaagaact 29813160  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  29813161 cattt-atagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggt 29813225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 612
Target Start/End: Original strand, 29810868 - 29811016
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29810868 ttggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29810965  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810966 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 466 - 625
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  466 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcg 32891203  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    || |||||||||||| ||||   ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32891204 tt-gatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 483 - 623
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173515
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 580  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggag 46173473  T
Q  581 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46173474 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 623
Target Start/End: Original strand, 51398818 - 51398972
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |    
T  51398818 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-t 51398914  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    ||||||||||||| ||||    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51398915 tgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 51398972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 3327806 - 3327863
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaattt 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3327806 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgacttcaaattt 3327863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32480922 - 32480745
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttg-cagagtgc 150  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||   ||  || |||||| | |||  | ||  ||    
T  32480922 attggcttcaaatttgtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgatttggccatcgtgacacgatcagggaggcagtgagccaagttctctgaaagc 32480823  T
Q  151 aaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  32480822 aaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 32480745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 37466932 - 37466876
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaattt 66  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37466932 gacatcatcaccaa-ttagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgacttcaaattt 37466876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7782584 - 7782445
Alignment:
Q  192 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca- 288  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  | ||     
T  7782584 aaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtgccttgggacgaacgtaccaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcag 7782486  T
Q  289 --gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaagg 328  Q
      || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7782485 tggagggctagta-tttaagtgttcttgtgcagatttgaagg 7782445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8517707 - 8517523
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gc 143  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||||||||   ||  || |||||||| ||| ||    
T  8517707 tgttggaattgacttcaaattagtggtttaggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagtcgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtttgc 8517608  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8517607 tggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 8517523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Original strand, 16499033 - 16499191
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16499033 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttt--ttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 16499129  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16499130 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggt 16499191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301974
Alignment:
Q  524 atttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 622  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaac 55301982  T
Q  623 tgggtgaa 630  Q
    | ||||||    
T  55301981 ttggtgaa 55301974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 23392077 - 23391915
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  23392077 ttggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gcaagaact 23391980  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23391979 c-tttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 23391915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 522 - 627
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913455
Alignment:
Q  522 taatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 620  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccga 40913448  T
Q  621 actgggt 627  Q
    |||||||    
T  40913449 actgggt 40913455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 8738542 - 8738599
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8738542 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgattt 8738599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 9090780 - 9090837
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9090780 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgattt 9090837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  464 ttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 6794184 - 6794240
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatt 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  6794184 gacatcatcaccacattagaagtcaaggtggagaaatgttgtaattgactttaaatt 6794240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21711820 - 21711768
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21711820 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 21711768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24968704 - 24968520
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gc 143  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||   ||  || |||||| | ||| ||    
T  24968704 tgttggaattgacttcaaattagtggtttggaagaacaaaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggggaggcagtgagccaagtttgc 24968605  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  24968604 tggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc 24968520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27027318 - 27027174
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagc-taggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||| ||||||||||    || |||||| | | |||||||||||  |||    
T  27027318 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtaacacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagagtgctcaat 27027219  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgct 200  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||||||||  | |||||||||    
T  27027218 cgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgct 27027174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Original strand, 27974433 - 27974493
Alignment:
Q  45 tgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27974433 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttg 27974493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Original strand, 40734084 - 40734132
Alignment:
Q  54 tgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40734084 tgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 40734132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 9666632 - 9666472
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| | ||| || ||  |||||||||| || |    
T  9666632 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttata-cctctttgtaagaattc-t 9666535  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||| ||||    |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9666534 ttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggt 9666472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 32143915 - 32143868
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32143915 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgattttg 32143868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Original strand, 47304254 - 47304413
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||  | |||||| |||  ||||||||||||    
T  47304254 gtgagattgagaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttc-gtaagaactcat 47304351  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47304352 t-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 47304413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16264946 - 16264896
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16264946 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagcgaaatcgtgacacgattt 16264896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 30709266 - 30709316
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30709266 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 30709316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 102
Target Start/End: Original strand, 39032013 - 39032075
Alignment:
Q  41 gaaatgttgaaa-ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39032013 gaaatgttgaaaattggcttcaaatttgttgtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 39032075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352150
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||    
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtatttc-tttgtaataactca 51352180  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctc 593  Q
     |||| ||||||||  ||||  |||||||||    
T  51352179 -ttgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 599
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018987
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaac 36018949  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccag 599  Q
    |||||  ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  36018950 tcatt--atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Original strand, 40734984 - 40735063
Alignment:
Q  22 aattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  40734984 aatttgaagtcaaggtggagaa-tgttgtgtatgtcttcaaatttgtggtttggatgaacagataaatcgtgacacgattt 40735063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 469 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055813
Alignment:
Q  469 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaac--cttttgtatcccttttgtaag-aactcatt 564  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactca-t 4055831  T
Q  565 tgatagtggattgaagag 582  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4055830 tgatagtggattgaagag 4055813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 565 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 104
Target Start/End: Original strand, 27985971 - 27986017
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27985971 ttcaaatttgtggtttggaataacagagaaatcgtgacacgattttg 27986017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 27986001 - 27986103
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  27986001 atcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggtta 27986100  T
Q  206 agt 208  Q
    |||    
T  27986101 agt 27986103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 95
Target Start/End: Original strand, 1730915 - 1730959
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgac 95  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1730915 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgac 1730959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27038660 - 27038608
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27038660 aaattggcttcaagtttgtggtttggaaaaacagagaaatcgtgacacgattt 27038608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253363
Alignment:
Q  476 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 535  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaac 28253363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Original strand, 40592251 - 40592302
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  40592251 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacggagaaatcgtgacatgattt 40592302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Original strand, 16498636 - 16498694
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  16498636 atgttgatattggcttcaaatttgtggtttggagaaacagagaaatcgtgacatgattt 16498694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 35926106 - 35926057
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35926106 attggcttcaaatttg-ggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 35926057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 40845270 - 40845220
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatttt 103  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40845270 ttgtcttcaaatttatgttttgggagaacagagaaatcgtgacacgatttt 40845220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 48438832 - 48438782
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48438832 attggctttaaatttgtggtttgtaagaacagagaaatcgtgacacgattt 48438782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25517121 - 25517069
Alignment:
Q  484 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 537  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  25517121 gtagaaattagggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttataacct 25517069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 31340369 - 31340266
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  31340369 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattgaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 31340272  T
Q  561 catttg 566  Q
    ||||||    
T  31340271 catttg 31340266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36536830 - 36536789
Alignment:
Q  146 agtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgat 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  36536830 agtgcaaaatcgtgacacgttttgggcaaaacgtgacacgat 36536789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 3185 - 2409
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3185 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 3086  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    || | |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3085 aggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtattcttgataaggactggtcgttccttgggacgg 2987  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2986 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttgga 2888  T
Q  340 nnnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacctt 439  Q
                     |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2887 agagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacctt 2796  T
Q  440 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 539  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2795 gta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctct 2698  T
Q  540 tgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  2697 tgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatcttt 2598  T
Q  631 -tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 725  Q
     ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2597 ttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 2500  T
Q  726 tgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2499 tgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 2409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 12647967 - 12647191
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12647967 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 12647868  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    || | |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647867 aggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccataaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 12647769  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12647768 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttgga 12647670  T
Q  340 nnnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacctt 439  Q
                     |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12647669 agagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacctt 12647578  T
Q  440 gtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttt 539  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12647577 gta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctct 12647480  T
Q  540 tgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  12647479 tgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 12647380  T
Q  631 -tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 725  Q
     ||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647379 ttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 12647282  T
Q  726 tgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12647281 tgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 12647191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 789
Target Start/End: Original strand, 6266283 - 6267023
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||| ||||     
T  6266283 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacatggaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacaatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgcc 6266382  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aa 249  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  6266383 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttactcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttcttgggacgaacgcaccaa 6266482  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||||||  | |||  ||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||           
T  6266483 tcgtgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagg--agagtgggaagagaga 6266578  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaag 445  Q
              |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6266579 gaga------cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagag 6266672  T
Q  446 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtat 544  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6266673 agaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtat 6266772  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgt 633  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  6266773 cccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 6266871  T
Q  634 -atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgt 732  Q
      ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  6266872 cttttgttttcttcttccctctcc--gtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatttt 6266969  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat 789  Q
    ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6266970 tgcttacac---acactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 6267023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 444 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655834
Alignment:
Q  444 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgta 13656121  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat----- 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         
T  13656120 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 13656021  T
Q  636 -----ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 729  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656020 gtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 13655921  T
Q  730 tgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    | |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13655920 tcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 13655834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 57 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 4484910 - 4484151
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4484910 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagctagtttgcagggtgccaaat 4484811  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    ||||||||||| |     ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||    
T  4484810 cgtgacacgatcttaaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgtaccaatcgt 4484711  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacag---aagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnn 350  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||  | |||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||               
T  4484710 gacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaag--agagttggaagagagagaaa 4484615  T
Q  351 nnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagaga 448  Q
          |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || |     
T  4484614 ------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgt 4484522  T
Q  449 gaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tt 538  Q
     |||||||||||||||||      |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4484521 aaatcattgagtgtcttgttcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctt 4484423  T
Q  539 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            
T  4484422 ttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatcttt 4484324  T
Q  631 --tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgtt 726  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4484323 ggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgtt 4484226  T
Q  727 gtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtg 806  Q
    | || ||||||||||    ||||||| ||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4484225 gattattgcttgcac---tcactttg-ttattggttactactttcctttgctccacacatca-tatttcgtattggtgtg 4484151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 57 - 809
Target Start/End: Original strand, 32289161 - 32289916
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  32289161 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 32289260  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    | ||||||||| | |   ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||    
T  32289261 cttgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgctccaatcgt 32289360  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnn 350  Q
    |||||||   ||||| || ||||||||||  | |||  ||   ||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||  ||||               
T  32289361 gacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagattttgaagggaga--tggaagagagagaaa 32289456  T
Q  351 nnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggta-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 448  Q
          |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||  | |||||||| ||||||||||   || ||    
T  32289457 ------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtga 32289549  T
Q  449 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcc 546  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||     
T  32289550 aaatcattgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatct 32289647  T
Q  547 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------tgta 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||     
T  32289648 cttttgtaagaactcatt-gatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtc 32289746  T
Q  635 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgt 732  Q
     |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  32289747 cttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattat 32289844  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    |||||||||    ||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32289845 tgcttgcac---ccactttg-ttagtggttactactttcctttgctccacacatc-ttactttgtattggtgtggtt 32289916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 57 - 741
Target Start/End: Original strand, 30832934 - 30833633
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  30832934 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 30833033  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||    
T  30833034 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgt 30833133  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacag---aagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnn 350  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||||  | |||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||   ||||               
T  30833134 gacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaaggtgagc--tggaagagaaagaaa 30833229  T
Q  351 nnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagaga 448  Q
          |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |  |||||| | |||||| |||   || |     
T  30833230 ------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgt 30833322  T
Q  449 gaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tt 538  Q
     |||||||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  30833323 aaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccctt 30833421  T
Q  539 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            
T  30833422 ttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatcttt 30833520  T
Q  631 --tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgtt 726  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30833521 ggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgtt 30833618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 9295862 - 9296137
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  9295862 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagtttgc 9295961  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||  ||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  9295962 aggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtcgga 9296061  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgc 317  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||   ||   |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9296062 cgcaaatcgtgacacga-tctgaaaatcgtgacacgattgcttcagaggaagactagtatttaaagtgttcttgtgc 9296137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14292125 - 14291908
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  14292125 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatctcgaggtgccgtgagctagtttgc 14292026  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||  | |    
T  14292025 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtaccactgataaggactggtcataccttgggttgta 14291926  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14291925 cgcaaatcgtgacacgat 14291908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 45099640 - 45099920
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  45099640 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 45099737  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgta 543  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45099738 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgta 45099836  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099837 tctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 45099920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Original strand, 11098387 - 11098604
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  11098387 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatagtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagtttgc 11098486  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||  | |    
T  11098487 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcaaaccttgggttgta 11098586  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11098587 cgcaaatcgtgacacgat 11098604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25410253 - 25410047
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| | | |||||| |||| ||||    
T  25410253 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagatggtttgcagggtgccaaat 25410154  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  | ||||||    
T  25410153 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaatggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgt 25410054  T
Q  254 gacacga 260  Q
    |||||||    
T  25410053 gacacga 25410047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 5723537 - 5723258
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  5723537 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5723440  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctttt-gtatc 545  Q
    ||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5723439 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatc 5723341  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5723340 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaa 5723258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 357 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 4503415 - 4503017
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  4503415 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 4503318  T
Q  455 ttgagtgtcttggt-------gagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgta 543  Q
    |||||||||||| |       |||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4503317 ttgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgta 4503219  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------tgt 633  Q
    || ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||    
T  4503218 tctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 4503122  T
Q  634 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttg 731  Q
     |||||||   ||||  |||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  4503121 gtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 4503026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 36205946 - 36205667
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  36205946 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 36205849  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtat 544  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36205848 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtat 36205750  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | ||||   ||||||||||| || || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205749 ctctttg--aagaactcatt-gacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 36205667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3492364 - 3492094
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  3492364 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 3492265  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | ||||||    
T  3492264 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctgaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgt 3492165  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| |||  | ||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3492164 gacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcagtggaagactagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 3492094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 2334700 - 2334424
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  2334700 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggta-tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 2334603  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtat 544  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2334602 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtat 2334504  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 626  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334503 ctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 2334424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 36988358 - 36988078
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  36988358 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatca 36988261  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtat 544  Q
    ||||||||||||       ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  36988260 ttgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtat 36988162  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988161 ctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 36988078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Original strand, 39811477 - 39811693
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtg-ccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| || ||||    
T  39811477 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtgaccgtaagcaagtttgc 39811576  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |     
T  39811577 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggacttgtc-tgccttggggccgt 39811675  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
     ||| |||||||||||||    
T  39811676 tgcagatcgtgacacgat 39811693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727094
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45727027 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 45727094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 6595175 - 6595008
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  6595175 ttggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaac 6595078  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6595077 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 6595008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868031
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29867966  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29867967 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 29868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19345046 - 19344825
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg-aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |    
T  19345046 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaa 19344947  T
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||| |||||    | ||||||||| | || |||| |   |||||||| || |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  19344946 tcgtgatacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagcaaaatcatggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 19344847  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  19344846 gtatctctgataaggactggtc 19344825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40739444 - 40739217
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  40739444 cttcaaatttgtggtctggaagaacagacaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 40739345  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    ||||||||||| | |   ||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||    
T  40739344 cgtgacacgatcttgtggaattgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcgt 40739245  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  40739244 gacacgatttgg-aaatcgtgacacgatt 40739217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 34139936 - 34139776
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  34139936 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcat 34139838  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34139837 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 34139776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446887
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 35446955  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35446954 catt-gatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 35446887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 467 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 14633991 - 14633834
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14633991 gtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcat 14633893  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
      |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14633892 a-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 14633834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 482 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 723893 - 723750
Alignment:
Q  482 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 579  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  723893 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 723797  T
Q  580 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  723796 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 723750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32247352 - 32247229
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| | || ||||    
T  32247352 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgc 32247253  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatt 167  Q
     |  |||||||||||| |||||||    
T  32247252 tggatgcaaaatcgtggcacgatt 32247229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631734
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaat 631  Q
    |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1631802 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaat 1631734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 38312240 - 38312402
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||    
T  38312240 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagatct 38312337  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  38312338 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggt 38312402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 357 - 612
Target Start/End: Original strand, 42362237 - 42362500
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatc 453  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||    || || ||||    
T  42362237 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 42362334  T
Q  454 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 543  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  42362335 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 42362433  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362434 tcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Original strand, 44310470 - 44310548
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc 122  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44310470 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttc 44310548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 469 - 627
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648335
Alignment:
Q  469 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 566  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||| |    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcatt-g 33648274  T
Q  567 atagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33648275 atagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 33648335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773724
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  36773660 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggt 36773724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 598
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121901
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc-tttgtatctc-tttgtagaaactca 13121866  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 598  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  13121867 -ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398224
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  24398155 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaa 24398224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Original strand, 11067305 - 11067463
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11067305 ttggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgtt-gtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 11067402  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11067403 cattt-ataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 11067463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151597
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 11151662  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11151661 c-ttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 11151597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 17057537 - 17057375
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17057537 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17057440  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17057439 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggt 17057375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 17085520 - 17085358
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17085520 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17085423  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17085422 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggt 17085358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36318015
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36318079 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 36318015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353346
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtat-ctttttgtaagtactc 26353282  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26353283 a-ttgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggt 26353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 518 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490154
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttgga 17490165  T
Q  617 ccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||    
T  17490164 ccgaactgggt 17490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 467 - 625
Target Start/End: Original strand, 11690504 - 11690661
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||      
T  11690504 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaaatc-g 11690600  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 625  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  11690601 ttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactgg 11690661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 33162618 - 33162460
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||    
T  33162618 ttggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct-gtaagaact 33162521  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    |||| |||||||||||  ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33162520 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaact 33162460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288117
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| || |||||||  | ||||||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttc-tttgtaagagct 42288181  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288180 ca-ttgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactc 7815343  T
Q  562 atttgatagtggattgaagag 582  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  7815342 attt-atagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 39483535 - 39483443
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaa-attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39483535 gacatcaccaccaa-ttagaagtcaaggtggagaa-tgttgtttattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaattgtgacacgattt 39483443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14634438 - 14634383
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatt 65  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14634438 gacatcatcgccaa-ttagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtctttaaatt 14634383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19349854 - 19349683
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagtgcaaaatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | | |||| |  |||||||||||||    | |||||||||| | ||| || |   ||||||||    
T  19349854 ttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcaatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagcaaaatc 19349755  T
Q  157 gtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19349754 gtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtc 19349683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 8389631 - 8389681
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8389631 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 8389681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Original strand, 36757423 - 36757477
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36757423 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaaaaatcgtgacacgattttg 36757477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 518 - 630
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451282
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga 7451269  T
Q  617 ccgaactgggtgaa 630  Q
     |||||||||||||    
T  7451270 -cgaactgggtgaa 7451282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Original strand, 28258669 - 28258729
Alignment:
Q  45 tgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28258669 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttggaaaaacagagaaatcgtgacacgattttg 28258729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Original strand, 33528104 - 33528155
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33528104 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacaattt 33528155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 564 - 627
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39284998
Alignment:
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 39284998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 10706733 - 10706783
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10706733 attggcttcaaatttgttgtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 10706783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21630561 - 21630511
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21630561 attggcttcaaatttgtagtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 21630511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20522839 - 20522794
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgaca 96  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20522839 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgaca 20522794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 522 - 621
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  522 taatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 620  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||| | || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcact-gacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccga 28672087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2334803 - 2334769
Alignment:
Q  153 aatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2334803 aatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgat 2334769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 564 - 630
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450742
Alignment:
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaa 17450742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 23077952 - 23078002
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23077952 attggcttcaaaattttggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 23078002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 269
Target Start/End: Original strand, 28258733 - 28258877
Alignment:
Q  126 tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactg 225  Q
    ||||||||||| | |||||| |||  |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||    
T  28258733 tgccgtgagctggtttgcagggtgtcaaatcgtggcacaattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttg 28258831  T
Q  226 gtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaa 269  Q
    ||||| ||||||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  28258832 gtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacgatttggaaaa 28258877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14202569 - 14202501
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 535  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14202569 tgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaac 14202501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 8395157 - 8395967
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395157 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 8395256  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  8395257 tgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcaggggtgcaaa-tcgtagcacgatttgggaaaatcgtgacacaatccagaaacttgctcgttaagt 8395355  T
Q  209 atccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||   |||||||   |     
T  8395356 atccgtgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagtata--aa 8395453  T
Q  306 gtgttcttgtgcagatttgaaggg-gagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattag 404  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||                 |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8395454 gtgttcttgtgcagatttgaagagagagggttggaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattag 8395545  T
Q  405 agtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 504  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395546 agtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca 8395643  T
Q  505 ttgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtag 604  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8395644 tagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtag 8395743  T
Q  605 gtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacac 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||| |   ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8395744 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac 8395842  T
Q  692 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcatta 791  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8395843 ttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcatta 8395942  T
Q  792 t--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  8395943 ttctttgtattggtgtggttcgatc 8395967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 814
Target Start/End: Original strand, 7122275 - 7123046
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgc 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||    
T  7122275 ttgtcttcaaatttgtggtgtggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcaggggtgc 7122374  T
Q  151 aaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 250  Q
    ||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122375 aaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 7122473  T
Q  251 cgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggg-gagagttggannnnnnn 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||  |||| |           
T  7122474 cgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagagagaaggttgaaagagaga 7122572  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 446  Q
              |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7122573 ga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 7122664  T
Q  447 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  7122665 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattc 7122764  T
Q  547 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------tgtat- 635  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||         ||| |     
T  7122765 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtt 7122864  T
Q  636 --ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgt 732  Q
      |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7122865 tattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 7122962  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7122963 tgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 7123046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Original strand, 8392982 - 8393758
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8392982 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 8393081  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |     
T  8393082 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcttttcttgggtggt 8393180  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggg-gagagttgg 338  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||   |||||||   | |||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  8393181 acgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagtata--aagtgttcttgtgcagatttgaagagagagggttgg 8393278  T
Q  339 annnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacct 438  Q
    |                 | |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8393279 aagagagaga--------cctgggaaatcaaaggggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacct 8393370  T
Q  439 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctt 538  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8393371 tgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctt 8393468  T
Q  539 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-------- 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  8393469 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 8393568  T
Q  631 -tgtat---ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 725  Q
     ||| |   ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393569 ttgtgtttattgttttcttcttccctctccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 8393667  T
Q  726 tgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8393668 tgtttcttgcttgcacaataaacttcgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 8393758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 814
Target Start/End: Original strand, 5137841 - 5138654
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137841 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 5137940  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacga-tttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5137941 tgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc-aaatcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaag 5138039  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtatttta 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  5138040 tatccttgataaggaccggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-ctta 5138138  T
Q  305 tgtgttcttgtgcagatttgaag-gggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgatta 403  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5138139 agtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttgga--------agagagaaacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgatta 5138229  T
Q  404 gagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttc 503  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5138230 gagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttc 5138327  T
Q  504 attgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagag 601  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5138328 atagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagag 5138427  T
Q  602 taggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctt--tgtgtttc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||    
T  5138428 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtg-ttttggttgctttgtttc 5138526  T
Q  688 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatc 787  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5138527 acacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgtctcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatc 5138625  T
Q  788 attat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5138626 attattctttgtattggtgtggttcgatc 5138654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 814
Target Start/End: Original strand, 5135649 - 5136429
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  5135649 tgttgagattgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgc 5135748  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5135749 aggggtgcaaa-tcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacg 5135847  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagag-ttg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  5135848 gacgcaaatcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-agaggttg 5135945  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaa-catgggaaacac 436  Q
    ||                 |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  5135946 gaagagagaaa--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaatac 5136037  T
Q  437 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaac 535  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5136038 cttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac 5136135  T
Q  536 cttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aat 631  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  5136136 ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 5136235  T
Q  632 gtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctt--tgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgt 720  Q
     | |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  5136236 ctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtg-ttttggttgctttgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgt 5136333  T
Q  721 tttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5136334 tttgttgtctcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 5136429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 357 - 814
Target Start/End: Original strand, 7124794 - 7125265
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 456  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124794 cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 7124893  T
Q  457 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aa 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  7124894 gagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaa 7124993  T
Q  556 gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa---------tgtat---ttgttttc 643  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||         ||| |   ||||||||    
T  7124994 gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttc 7125093  T
Q  644 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcaca 742  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7125094 ttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 7125191  T
Q  743 atacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7125192 ataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgatc 7125265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 53 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 31495893 - 31495130
Alignment:
Q  53 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||||     
T  31495893 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgcc 31495794  T
Q  152 aaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aa 249  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  31495793 aaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacgaacgcaccaa 31495694  T
Q  250 tcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnn 346  Q
    ||||||||| |   ||||| || ||||||||||  | |||  ||   ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||           
T  31495693 tcgtgacacaacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctaatatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagg--agagttggaagagaga 31495598  T
Q  347 nnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaa 444  Q
              |||||| |||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |    
T  31495597 gaaa------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaaga 31495505  T
Q  445 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttg 541  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||    
T  31495504 gagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatta-ggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttg 31495406  T
Q  542 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------- 630  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  31495405 tatctcttttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttgg 31495307  T
Q  631 tgtatttgttttcttcttccctctcctt------gtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 723  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31495306 tgtctttgttttcctcttccctctccttttatccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgtttt 31495207  T
Q  724 gttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggt 803  Q
    |||| || |||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31495206 gttgattattgcttgcac-acacactttg-ttgatggttactactttcctttgctccacacatca-tatttcgtattggt 31495130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 57 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 13992866 - 13992295
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||| |||| ||||    
T  13992866 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgtcgtgagctggtttgcagggtgccaaat 13992767  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |  ||||||    
T  13992766 cgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcatgataaggactggtcataccttgtgacgtacgtatcaatcgt 13992667  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacag---aagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnn 350  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||  | |||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||               
T  13992666 gacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttggaggg-agagcttgaagagagagaaa 13992570  T
Q  351 nnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagaga 448  Q
          |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || ||    
T  13992569 ------cttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtga 13992477  T
Q  449 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtat 544  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  13992476 aaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtat 13992378  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13992377 ctctt--gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaa 13992295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 7124455 - 7124681
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7124455 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtgtggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcg 7124554  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgagcta-ggttgca-gagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7124555 tgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcaggggtgc-aaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagt 7124653  T
Q  209 atccttgataaggactggtcgttccttg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124654 atccttgataaggactggtcgttccttg 7124681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24742577 - 24742295
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24742577 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgc 24742478  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||    
T  24742477 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacgga 24742378  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttg 324  Q
    ||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||    ||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  24742377 cgcaaatcgtgccacgatctgg-aaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 24742295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Original strand, 9228650 - 9228902
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9228650 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcat 9228749  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  9228750 cgtgacacgatttcaagtggccgtgagctcgtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaag 9228849  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    ||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |  ||| |||||||||||||    
T  9228850 tatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgttgcagatcgtgacacgat 9228902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18856343 - 18856125
Alignment:
Q  11 catcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18856343 catcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcg 18856244  T
Q  111 tgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagta 209  Q
    ||||||||||   ||||||||||| | || |||| |  |||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  18856243 tgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgctggatgcaaaatcgtggcaagatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagta 18856144  T
Q  210 tccttgataaggactggtc 228  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  18856143 tcactgataaggactggtc 18856125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 30000088 - 29999808
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagggg-caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggta-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||||   || || ||||     
T  30000088 cttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcg 29999991  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatc 545  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29999990 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatc 29999892  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999891 ttttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 29999808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51521050 - 51520824
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  51521050 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagtttgc 51520951  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| | ||    
T  51520950 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcatgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactgatc-taccttgggtcaga 51520852  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatc 271  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  51520851 cgcaaatcgtgacacgatttgggaaatc 51520824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 261
Target Start/End: Original strand, 56141509 - 56141728
Alignment:
Q  43 aatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggtt 141  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||| ||    
T  56141509 aatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttggaggggtcgtgagctagttt 56141608  T
Q  142 gca-gagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 240  Q
    ||| ||   |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |    
T  56141609 gcaggacgccaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtc 56141707  T
Q  241 ggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
     || |||||||||||||||||    
T  56141708 agatgcaaatcgtgacacgat 56141728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 282
Target Start/End: Original strand, 28467990 - 28468217
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  28467990 cttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtaacacgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 28468089  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||    
T  28468090 cgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtacaaatcgt 28468189  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  28468190 gacacgacttgg-aaatcgtgacacgatt 28468217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 56178919 - 56178639
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  56178919 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 56178822  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtat 544  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56178821 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat 56178723  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178722 ctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 56178639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Original strand, 9223899 - 9224115
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  9223899 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttgc 9223998  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |     
T  9223999 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgt 9224097  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
     ||| |||||||||||||    
T  9224098 tgcagatcgtgacacgat 9224115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5733247 - 5733062
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtg-agctaggttg 142  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||    
T  5733247 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgaagcaagtttg 5733148  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||   || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5733147 caggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 5733062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095365
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |    
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52095433  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52095432 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaa 52095365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3814605 - 3814422
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtg-ccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| || ||||    
T  3814605 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtgaccgtaagcaagtttgc 3814506  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3814505 aagacgccaaatcgtgtcacgatttggg-aaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 3814422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29761196 - 29761040
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  29761196 atcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtta 29761097  T
Q  206 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29761096 agtatccttgataaggactggtcataccttggtacggacgcaaatcgtggcacgatt 29761040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 45347317 - 45347501
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| | || ||||    
T  45347317 tgttaaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacaaagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattagagatgccgtgagccaagtttgc 45347416  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     |  |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  45347417 tggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 45347501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 48143042 - 48143209
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||    
T  48143042 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttca-taagaac 48143139  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48143140 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaa 48143209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 464 - 629
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 629  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964513 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 468 - 630
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209880
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2209815 t-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaa 2209880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 483 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 5370232 - 5370085
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 579  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |  |    
T  5370232 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggactaga 5370136  T
Q  580 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5370135 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 5370085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 464 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 9927626 - 9927467
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9927626 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9927529  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9927528 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 9927467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703667
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  46703598 tcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaa 46703667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739556
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12739621  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12739620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 12739556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18860521 - 18860431
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagc 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  18860521 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagc 18860431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364398
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||  ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26364334 catta-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggt 26364398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632607
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40632543 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggt 40632607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073558
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  12073490 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaa 12073558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639591
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41639524 catc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 41639591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 18712295 - 18712435
Alignment:
Q  85 gaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtg-ccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgaca 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  18712295 gaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgaca 18712394  T
Q  184 cgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 224  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18712395 cgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 18712435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038417
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| |||||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgttt-gtaaggactca 47038480  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47038479 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggt 47038417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 612
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665506 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 467 - 630
Target Start/End: Original strand, 379383 - 379546
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  379383 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaat 379480  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  379481 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaa 379546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 482 - 630
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656121
Alignment:
Q  482 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 579  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 6656071  T
Q  580 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6656072 gagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtgaa 6656121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 483 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743931
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 580  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12743977  T
Q  581 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12743976 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 12743931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 483 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745320
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 580  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12745366  T
Q  581 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12745365 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 12745320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175642
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26175707  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26175706 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 26175642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463395
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36463459 c-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 36463395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994686
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaact 36994621  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36994622 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggt 36994686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883182
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  54883118 catt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggt 54883182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648304
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8648237 catt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaa 8648304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229731
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactc 561  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||  || |||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactc 37229791  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 623  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  37229790 attt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 466 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147397
Alignment:
Q  466 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactc- 46147461  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46147460 tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 46147397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5143890 - 5143807
Alignment:
Q  22 aattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaa-ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5143890 aattagtagtcaaggtggagaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttg 5143807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 464 - 624
Target Start/End: Original strand, 37740625 - 37740784
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  37740625 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 37740722  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37740723 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 34570582 - 34570420
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctt-ttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||    
T  34570582 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaagaact 34570485  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  34570484 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggt 34570420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687188
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctattt-gtaagaact 45687253  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  45687252 catt-gatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggt 45687188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 48893810 - 48893644
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgt----gaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaag 556  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  48893810 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaag 48893713  T
Q  557 aactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48893712 aactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 48893644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 518 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673850
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 50673864  T
Q  617 ccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||||| ||||||    
T  50673863 ccgaactaggtgaa 50673850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 6542349 - 6542185
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6542349 ttggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaac 6542251  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || || |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6542250 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 6542185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 31985140 - 31985252
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  31985140 cttcaaatttgtgatctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgataccgtgagctagttagcagggtgccaaat 31985239  T
Q  156 cgtgacacgattt 168  Q
    |||||||||||||    
T  31985240 cgtgacacgattt 31985252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 466 - 630
Target Start/End: Original strand, 12119540 - 12119705
Alignment:
Q  466 ggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||    
T  12119540 ggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactca 12119639  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||| ||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  12119640 ttt-atagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaa 12119705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416974
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27417035 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 27416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199926
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 54199977  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    || ||||||||| |||  ||||  || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54199976 ca-ttgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 4587958 - 4588121
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  4587958 ttggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 4588056  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4588057 catt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-ttggaccaaactgggt 4588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 471 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207848
Alignment:
Q  471 gattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactcatttgat 568  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||  ||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgtaagaactca-ttgat 5207906  T
Q  569 agtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5207905 agtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggt 5207848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Original strand, 16628310 - 16628403
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaa-attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16628310 gacatcaccaccaaattagaagtcgaggtggagaa-tgttgtatattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 16628403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 6742864 - 6742946
Alignment:
Q  20 caaattagaagtcaaggtggagaaatgttg-aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6742864 caaattagaagtcaaggtggagaa-tgttgtaaattggcttcaaatttatggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 6742946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 624
Target Start/End: Original strand, 35662441 - 35662600
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  35662441 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 35662538  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35662539 catt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 5429679 - 5429841
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  5429679 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 5429776  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5429777 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggt 5429841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5871982
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt-gcaagaact 5871917  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5871918 c-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 5871982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 479 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26699596 - 26699447
Alignment:
Q  479 aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 576  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  26699596 aaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-ataatggatt 26699498  T
Q  577 gaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||  ||||||||   |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26699497 ggagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 31474150 - 31474313
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31474150 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31474248  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31474249 ca-ttgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactgggt 31474313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3778207 - 3778116
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaa-attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatt 101  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3778207 gacatcaccaccaa-ttagaagtcaaggtggagaa-tgttgtatattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatt 3778116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747794
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12747827  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 594  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  12747826 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 50262865 - 50262703
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  50262865 tgagattgggaaaatggatcgaaattacggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 50262768  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||||| ||||| |||   |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  50262767 -gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 50262703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 483 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  483 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 580  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggag 12744099  T
Q  581 agtacaatctct 592  Q
    ||  ||||||||    
T  12744098 agatcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 464 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 12745604 - 12745476
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  12745604 ttggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 12745507  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctct 592  Q
    || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12745506 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 52082825 - 52082666
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |    
T  52082825 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaaat 52082728  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | ||||||||||       |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52082727 c-tttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaa 52082666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 52467519 - 52467360
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||  |    
T  52467519 gtgaggttgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaataactt-t 52467423  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  52467422 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 52467360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 105
Target Start/End: Original strand, 8689042 - 8689097
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgg 105  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8689042 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttgg 8689097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Original strand, 31985236 - 31985389
Alignment:
Q  173 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaat 270  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  31985236 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgcatcaatcgtgacacgatttgg-aaat 31985334  T
Q  271 catgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    | || |||||||  | ||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31985335 cgtggcacgattttatcagttgaagactagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 31985389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 29761227 - 29761182
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29761227 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 29761182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Original strand, 45356861 - 45356982
Alignment:
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| | ||| || |  |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  45356861 tcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgctggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 45356960  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtc 228  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  45356961 gtatcactgataaggactggtc 45356982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5148296 - 5148225
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  5148296 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattttatcaccgtgacacgattt 5148225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 38151918 - 38151968
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38151918 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 38151968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 582
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 24969209  T
Q  561 catttgatagtggattgaagag 582  Q
     | |||||||||||||| ||||    
T  24969210 -aattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Original strand, 5268698 - 5268750
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatttt 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5268698 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacaggatttt 5268750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10047982 - 10047932
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10047982 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagataaatcgtgacacgattt 10047932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 538 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 13009536 - 13009464
Alignment:
Q  538 tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||| | |||||||||||    
T  13009536 tttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagtt 13009464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 16622774 - 16622824
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16622774 attggcttaaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 16622824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142473
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc 48142473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 552
Target Start/End: Original strand, 41639263 - 41639353
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttg 552  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  41639263 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttttg 41639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 54867796 - 54867745
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  54867796 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaatagagaagtcgtgacacgattt 54867745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 478 - 536
Target Start/End: Original strand, 1983252 - 1983309
Alignment:
Q  478 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1983252 aaaaggatagaaattatgttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacc 1983309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 549 - 627
Target Start/End: Original strand, 29254580 - 29254656
Alignment:
Q  549 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29254580 tttgtaagaactcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 29254656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 469 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967910
Alignment:
Q  469 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 550  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | | || |||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44967992 gagattgggaaaatggtagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaaccatttgtatctcttt 44967910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 187
Target Start/End: Original strand, 48142823 - 48142857
Alignment:
Q  153 aatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48142823 aatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgat 48142857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52083043 - 52083009
Alignment:
Q  153 aatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52083043 aatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgat 52083009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52094050 - 52094016
Alignment:
Q  153 aatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52094050 aatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgat 52094016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 102
Target Start/End: Original strand, 36314716 - 36314761
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  36314716 cttcaaatttgtggtttcgaagaatagagaaatcgtgacacgattt 36314761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 102
Target Start/End: Original strand, 36328925 - 36328970
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  36328925 cttcaaatttgtggtttcgaagaatagagaaatcgtgacacgattt 36328970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 814
Target Start/End: Original strand, 5858 - 6638
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||| |||    
T  5858 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggagtcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttg 5957  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatt-tgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5958 cagggtgcaaattcgtgtcacgattgtggcaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 6057  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  6058 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagag-ag-gttgg 6154  T
Q  339 annnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacacct 438  Q
    |                 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6155 aagagagagaga------cttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacct 6248  T
Q  439 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctt 538  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |      
T  6249 tgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagccc 6346  T
Q  539 ttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga-------- 629  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||            
T  6347 ttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc 6446  T
Q  630 ---atgtatttgttttcttcttccctctccttg-tttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 724  Q
        |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6447 tttgtgttattgttttcttcttccctctccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattg 6546  T
Q  725 ttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6547 ttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacatatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 6638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 839
Target Start/End: Original strand, 3439085 - 3439886
Alignment:
Q  42 aaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3439085 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggt 3439184  T
Q  141 tgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  3439185 tgcagggtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaa-tcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtg 3439283  T
Q  241 ggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttg 337  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3439284 gtacgcatatcgtggcacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtata--aagtgttcttgtgcagatttgaagag-agagttg 3439380  T
Q  338 gannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacac 436  Q
    ||                 |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3439381 gaagagagagagaga----cttgagaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacac 3439476  T
Q  437 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 536  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3439477 cttgtaaagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaacc 3439576  T
Q  537 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------ 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  3439577 ttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 3439675  T
Q  631 ------tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 724  Q
          ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439676 ctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 3439773  T
Q  725 ttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatttt-gtattggtgtggttcgatcttgtggggg 823  Q
    ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    || |    
T  3439774 ttgattgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcatttttttagtattggtgtggttcgatctaagtggtg 3439870  T
Q  824 atcggaattcacaaca 839  Q
    ||||||||||||||||    
T  3439871 atcggaattcacaaca 3439886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 817
Target Start/End: Original strand, 25689604 - 25690316
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25689604 atcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtcacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 25689703  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacagaaga---ctagtatttt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||   |||||||||     
T  25689704 gtatccttgataaggactggtcgttccttggtttgtacacaaatcgtgacacgattgagaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagtattta 25689803  T
Q  304 atgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaa-ctctagggtttagggttctttgatt 402  Q
    | |||||||||||||  |||||||  ||| ||||||                 |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  25689804 a-gtgttcttgtgcatctttgaagaagag-gttggaagagagaga--------cttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgatt 25689893  T
Q  403 agagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgtt 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25689894 agagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgtt 25689993  T
Q  503 cattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25689994 cattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 25690092  T
Q  603 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------------tgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcac 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||            ||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  25690093 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgagtgtgttttgtgtttctc 25690190  T
Q  690 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcat 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25690191 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattcttgcttgcac-acacactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 25690289  T
Q  790 tattttgtattggtgtggttcgatcttg 817  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  25690290 t-ctttgtattggtgtggttcgatcttg 25690316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 42575910 - 42575130
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  42575910 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttg 42575811  T
Q  143 cagag-tgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 240  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575810 caggggtgcaaa-tcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtctttccttgggac 42575712  T
Q  241 ggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggg-gag-agt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  42575711 ggacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagagagaggagt 42575613  T
Q  336 tggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaaca 435  Q
    ||||                 |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42575612 tggaagagagaga--------cttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaaca 42575521  T
Q  436 ccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaa 534  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42575520 ccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa 42575423  T
Q  535 ccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aa 630  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  42575422 cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 42575323  T
Q  631 tgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg--tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtg 719  Q
    | | |         ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42575322 tctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgtttggttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg 42575227  T
Q  720 ttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42575226 ttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatagtttgtattggtgtggttcgatc 42575130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 357 - 814
Target Start/End: Original strand, 15290417 - 15290887
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 456  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15290417 cttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcatt 15290514  T
Q  457 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15290515 gagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 15290614  T
Q  556 -gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgtttt 642  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         |||||||    
T  15290615 agaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgtttt 15290714  T
Q  643 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac 741  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  15290715 cttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctc 15290812  T
Q  742 aatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15290813 aataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 15290887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 357 - 814
Target Start/End: Original strand, 15470786 - 15471256
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 456  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15470786 cttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcatt 15470883  T
Q  457 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15470884 gagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 15470983  T
Q  556 -gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgtttt 642  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |         |||||||    
T  15470984 agaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgtttt 15471083  T
Q  643 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac 741  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  15471084 cttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctc 15471181  T
Q  742 aatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--tttgtattggtgtggttcgatc 814  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15471182 aataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 15471256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 57 - 809
Target Start/End: Original strand, 2627331 - 2628087
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| | |||||  |||| ||||    
T  2627331 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgattccgtgagctggtttgcatggtgccaaat 2627430  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  | | ||    
T  2627431 cgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggattggtcgtttcttgtgacgtacgcaccatttgt 2627530  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagatttgaaggggagagttggannnnnnnnnnn 350  Q
    ||||||||  | ||| || ||||||||||  | |    || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||               
T  2627531 gacacgatctgtaaa-tcgtgacacgattttatcgttggagggctagtatttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagg--agagttggaagagagagaaa 2627626  T
Q  351 nnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagaga 448  Q
          |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||    
T  2627627 ------cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagaga 2627719  T
Q  449 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatc 545  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||||||    
T  2627720 aaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatc 2627818  T
Q  546 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa-----------tgta 634  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||     
T  2627819 tcttgtgtaagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtc 2627917  T
Q  635 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttg-tttgt 732  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |    
T  2627918 tttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattttt 2628015  T
Q  733 tgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattattttgtattggtgtggtt 809  Q
    |||||||||    ||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2628016 tgcttgcac---ccactttg-ttagtggttactactttcctttgctccacacatc-ttactttgtattggtgtggtt 2628087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 33037251 - 33037506
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33037251 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcat 33037350  T
Q  109 cgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  33037351 cgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaag 33037450  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattg 263  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33037451 tatcactgataaggactggtcatgccttggaacggacgcaaatcgtgacacgattg 33037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Original strand, 15290143 - 15290364
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  15290143 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggattgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttgc 15290242  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15290243 aggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacg 15290341  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgg 264  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15290342 gacgcaaatcgtgacacgattgg 15290364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Original strand, 15470512 - 15470733
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  15470512 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggattgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttgc 15470611  T
Q  144 agag-tgcaaaatcgtgacacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15470612 aggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacg 15470710  T
Q  242 gacgcaaatcgtgacacgattgg 264  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15470711 gacgcaaatcgtgacacgattgg 15470733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 4759534 - 4759771
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4759534 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttgacatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgc 4759633  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4759634 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacgga 4759733  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  4759734 cgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgatt 4759771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 18869990 - 18870259
Alignment:
Q  14 catcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18869990 catcaccaaattagaagtcaatgtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtga 18870089  T
Q  114 cacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatcc 212  Q
    |||||||||  | || |||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  18870090 cacgatttcaagatgtcgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatca 18870189  T
Q  213 ttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattg 283  Q
     | ||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  18870190 ctaataaggactggtcataccttgggtcagacgcagatcgtgacacgatt-tgaaaatcgtggcacgattg 18870259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30656282 - 30656065
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  30656282 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagtttgc 30656183  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||    
T  30656182 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcaga 30656083  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30656082 cgcaaatcgtgacacgat 30656065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36980014 - 36979797
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36980014 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgc 36979915  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||  | |    
T  36979914 aggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtcataccttgggttgta 36979815  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36979814 cgcaaatcgtgacacgat 36979797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 34254611 - 34254333
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | |||| | ||||||||||   || || ||||||    
T  34254611 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 34254514  T
Q  456 tgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcc 546  Q
    |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||     
T  34254513 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatct 34254415  T
Q  547 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254414 cttt-gtaagaacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 34254333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 268
Target Start/End: Original strand, 18852627 - 18852851
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18852627 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgatacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagtttgc 18852726  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| | ||    
T  18852727 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcaga 18852826  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgattgggaaa 268  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  18852827 cgcagatcgtgacacgatttggaaa 18852851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 282
Target Start/End: Original strand, 1261428 - 1261654
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1261428 ttcaaatttgtggtttggaagaacacagaaatcgcgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctagtttgcagggtgccaaatc 1261527  T
Q  157 gtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtg 254  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||  |||||||||    
T  1261528 gtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacatacgttcaaatcgtg 1261627  T
Q  255 acacgattgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  1261628 acacgatctgg-aaatcgtgacacgatt 1261654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 17982538 - 17982819
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  17982538 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 17982635  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 543  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  17982636 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgta 17982734  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982735 tctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 17982819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 34256787 - 34256509
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 455  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||||| | ||||||||||    | || ||||||    
T  34256787 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcat 34256690  T
Q  456 tgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcc 546  Q
    |||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||     
T  34256689 tgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatct 34256591  T
Q  547 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256590 cttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 34256509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Original strand, 7289427 - 7289644
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc--gggtgccgtgagctaggttg 142  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||    
T  7289427 tgttgatattgacttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatagtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagggagccatgagctagtttg 7289526  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    |||   || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||  | |    
T  7289527 caggacgccaaatcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttggatcag 7289625  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    | |||||||||||||||||    
T  7289626 atgcaaatcgtgacacgat 7289644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 31218142 - 31218423
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  31218142 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 31218239  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 543  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31218240 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 31218338  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218339 tctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 31218423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 10683739 - 10683923
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  10683739 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagtttgc 10683838  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10683839 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtc 10683923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 375 - 630
Target Start/End: Original strand, 44303758 - 44304021
Alignment:
Q  375 caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------- 466  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||           
T  44303758 caactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 44303855  T
Q  467 gtgagattgggaaaa---gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44303856 gtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttt-taagaactc 44303953  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44303954 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaa 44304021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6311928 - 6311717
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgcagagtgc 150  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||   ||    
T  6311928 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagtttgcaggacgc 6311829  T
Q  151 aaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 250  Q
     |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||   ||||||| | || ||||||    
T  6311828 caaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggacttgtc-aaccttgggtcagatgcaaat 6311730  T
Q  251 cgtgacacgattg 263  Q
    |||||||||||||    
T  6311729 cgtgacacgattg 6311717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 19945643 - 19945361
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  19945643 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagagt-ctttgattagagt-tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 19945546  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgt 542  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  19945545 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgt 19945447  T
Q  543 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19945446 atctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaa 19945361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26288504 - 26288319
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  26288504 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 26288405  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    |||||||| || | || |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26288404 cgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacg 26288319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26301761 - 26301576
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  26301761 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 26301662  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    |||||||| || | || |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26301661 cgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacg 26301576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26313755 - 26313570
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  26313755 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 26313656  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 241  Q
    |||||||| || | || |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26313655 cgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacg 26313570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 39784325 - 39784509
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | || ||||    
T  39784325 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgc 39784424  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     |  |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  39784425 tggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatcactgataaggactggtc 39784509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 42498193 - 42498360
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 559  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  42498193 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaac 42498290  T
Q  560 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498291 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 42498360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 478 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 1746371 - 1746221
Alignment:
Q  478 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 575  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  1746371 aaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggat 1746276  T
Q  576 tgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746275 tggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 1746221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 10688582 - 10688817
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  10688582 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt------ 10688675  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
         ||        ||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10688676 -----ca-------aggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagt 10688763  T
Q  209 atccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattg 263  Q
    |||  | ||||||||| |||   ||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  10688764 atcactaataaggacttgtc-aaccttgggtcagatgcaaatcgtgacacgattg 10688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 25327664 - 25327844
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  || || ||||||||| ||||    
T  25327664 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcttcgtggcacgatttcaagtggctgtgagctagtttgc 25327763  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 224  Q
    ||   || ||||| || |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25327764 aggacgccaaatcatggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 25327844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434994
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42435061 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 42434994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 167
Target Start/End: Original strand, 31042921 - 31043032
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31042921 cttcaaatttgtggtctggaagaatagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 31043020  T
Q  156 cgtgacacgatt 167  Q
    ||||||||||||    
T  31043021 cgtgacacgatt 31043032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212948
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 15212883  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15212884 catt-gataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 15212948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811440
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||     
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacc 27811375  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27811376 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 27811440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283689
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4283622 catt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 4283689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303676
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 3303741  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3303740 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 3303676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352312
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 33352247  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33352248 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 33352312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 43036423 - 43036585
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  43036423 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 43036520  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43036521 catt-gatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 43036585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655565
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18655498 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 18655565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 466 - 627
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321242
Alignment:
Q  466 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||     
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactc- 40321178  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321179 tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40321242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 478 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12702787 - 12702640
Alignment:
Q  478 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 575  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  12702787 aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctcttt-gtaagaactcatt-gatattggat 12702691  T
Q  576 tgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12702690 tggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 12702640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221907
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | || |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221843 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7412952 - 7412787
Alignment:
Q  45 tgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatt-tcgggtgccgtgagctaggttg 142  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||||| | |||    
T  7412952 tgttgaaatttgacttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattctgtaatgccgtgagctggtttg 7412853  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 208  Q
    ||| |||  ||||||||  || |||| |  |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  7412852 cagggtgtcaaatcgtggtacaattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagt 7412787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 467 - 606
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggt 606  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40328880 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 626
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 626  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141918 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 467 - 594
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctcttt-gtaagaactcat 44353893  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 594  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  44353894 t-gatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 612
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143488
Alignment:
Q  470 agattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttg 566  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-g 30143442  T
Q  567 atagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30143443 atagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 1345536 - 1345391
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||    
T  1345536 gtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt-gaaagaactcat 1345439  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 612  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1345438 t-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 1345391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 464 - 624
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291767
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcac-tttgtaagaatt 30291704  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 624  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  30291705 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaag-ttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599134
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6599072  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6599073 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 6599134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674587
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6674525  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6674526 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 6674587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Original strand, 4731658 - 4731820
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4731658 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4731755  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  4731756 catt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggt 4731820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 627
Target Start/End: Original strand, 5689275 - 5689433
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||  || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  5689275 tgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtg-gtgctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 5689372  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
     |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  5689373 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggt 5689433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 1292534  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 626  Q
    || |||||||||||||  |||    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1292533 ca-ttgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965697
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 561  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||| | ||| ||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctc-tttgtaagaactc 8965761  T
Q  562 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||||| || | ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8965760 a-ttgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 8965697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 582
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 9765842  T
Q  561 catttgatagtggattgaagag 582  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  9765843 ca-ttgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 630
Target Start/End: Original strand, 11383989 - 11384150
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  11383989 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaacccatt 11384086  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
     |||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11384087 -gatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaa 11384150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 25689561 - 25689618
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25689561 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 25689618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 41366778 - 41366622
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatt 564  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41366778 tgagattgagaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaagaactcatt 41366681  T
Q  565 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 626  Q
    | ||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41366680 t-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttggaccgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 10930365 - 10930205
Alignment:
Q  466 ggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactca 562  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||    
T  10930365 ggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt-gtaagaacaca 10930268  T
Q  563 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10930267 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 10930205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 464 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491723
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 19491770  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtca 608  Q
    | || ||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| |||||||||    
T  19491769 cgtt-gatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtca 19491723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35745973 - 35745794
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||    | |||||||||| | ||| |  |       
T  35745973 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgttggaa 35745874  T
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35745873 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctatgataaggactggtc 35745794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 539 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 4743306 - 4743220
Alignment:
Q  539 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4743306 ttgtaacccatttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4743220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 627
Target Start/End: Original strand, 4162516 - 4162658
Alignment:
Q  482 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 579  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  4162516 gggtagaagttagg-tttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag-ggattgga 4162611  T
Q  580 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    ||   |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4162612 gatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggt 4162658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Original strand, 5701958 - 5702009
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701958 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 5702009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 19751853 - 19751909
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaattt 66  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19751853 gacatcgtcaccaa-ttagaagtcaaggtggagaaatgttgtaattgacttcaaattt 19751909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106082
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtatc--ttttgtaagaactca-ttgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttgga 18106098  T
Q  617 ccgaactgggtgaatg 632  Q
    ||||||||||| ||||    
T  18106097 ccgaactgggtcaatg 18106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 627
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015241
Alignment:
Q  518 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 616  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt--taggaactca-ttgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttgga 10015230  T
Q  617 ccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||    
T  10015231 ccgaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 549 - 627
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733868
Alignment:
Q  549 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4733792 tttgtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4733868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 4456620 - 4456575
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4456620 cttcaaatttgtggtttggaagaacaaagaaatcgtgacacgattt 4456575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 536
Target Start/End: Original strand, 1822297 - 1822365
Alignment:
Q  469 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 536  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1822297 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1822365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 536
Target Start/End: Original strand, 1856742 - 1856810
Alignment:
Q  469 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 536  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1856742 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1856810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 11712145 - 11712024
Alignment:
Q  488 aaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtac 585  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||   || |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  11712145 aaattaggttttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcatt-gatagtggattgaagagatc 11712047  T
Q  586 aatctctcctccagagtaggtca 608  Q
    |||||||||  || |||||||||    
T  11712046 aatctctccctcaaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 660 - 740
Target Start/End: Original strand, 31218459 - 31218541
Alignment:
Q  660 tttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttgca 740  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  31218459 tttatcttgtgcttatgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 31218541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 35741158 - 35741124
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 43  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35741158 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 35741124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 41365011 - 41364927
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttt 550  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41365011 tgagattgggaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt 41364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 451; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 4338 - 3554
Alignment:
Q  17 caccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacac 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4338 caccaaattagaagttaaggtggagaaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacac 4239  T
Q  117 gatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagag-tgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatcctt 214  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4238 gattttaggtgccgtgagctagggttgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatcctt 4140  T
Q  215 gataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgattggaacaga---agactagtattttatgtgttc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||    
T  4139 gataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacaattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttc 4041  T
Q  312 ttgtgcagatttgaaggg---gagagttggannnnnnnnnnnnnnnnncttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 408  Q
     ||||||||||||||| |   ||||||||||                 |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4040 ctgtgcagatttgaagtgagagagagttggaagagagaga--------cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagta 3949  T
Q  409 tctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgt 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  3948 tctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagt 3851  T
Q  509 gaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtc 607  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3850 gaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtc 3751  T
Q  608 aagtttggaccgaactgggtg---aatgtat---------ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttg 694  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| | |         ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3750 aagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttg 3653  T
Q  695 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3652 tttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 3554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 57 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 11740 - 11042
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttc-gggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  11740 cttcaaaattgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 11641  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgt 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||    
T  11640 cgtgacacgatttggg-aaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgcaccaatcgt 11542  T
Q  254 gacacgattgggaaaatcatgacacgattggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcaga-tttgaaggggagagttggannnnnnnnnn 349  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||  | ||   |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||              
T  11541 gacacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagta-tttaagtgttcttgtgcagattttgaa---gagagttgga------agag 11453  T
Q  350 nnnnnnncttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttggg-tagaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 447  Q
           |||||| |||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| | | |||||| | ||||||||||   || |    
T  11452 agagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatgg-tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtg 11354  T
Q  448 agaatcattgagtg------tcttggtgagattgg--gaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-cct 537  Q
      ||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||    
T  11353 taaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaaccct 11255  T
Q  538 tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa------- 630  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  11254 tttgtatctcttttgtaagaactc-gttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctt 11156  T
Q  631 ---tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgt 725  Q
       ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11155 tggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgt 11058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9344 - 9088
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  9344 gacatcaccatcaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggca 9245  T
Q  108 tcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  9244 tcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaatcgtgacatgatttggg-aaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaa 9146  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgatt 262  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  9145 gtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgcaccaatcgtgacacgatt 9088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 462 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 8907 - 8616
Alignment:
Q  462 tcttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaaga 557  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8907 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaaga 8809  T
Q  558 actcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa----------tgtatttgttttcttct 647  Q
    |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||| |||    
T  8808 actcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctct 8710  T
Q  648 tccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttgcac 741  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  8709 tccctcttct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 8616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 120; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 636 - 793
Target Start/End: Original strand, 49 - 205
Alignment:
Q  636 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttg 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49 ttgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 146  T
Q  735 cttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 793  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  147 cttgcacaataaactttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 434418 - 434699
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtag-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||   || || |||||    
T  434418 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatca 434515  T
Q  455 ttgagtgtcttg-------gtgagattggg--aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 543  Q
    ||||||||||||       |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  434516 ttgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 434614  T
Q  544 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434615 tctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 434699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17652
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggg-tgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  17444 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctggtttgcagggtgccaaat 17543  T
Q  156 cgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 253  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  | ||||||    
T  17544 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacatgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggattggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatcgt 17643  T
Q  254 gacacgatt 262  Q
    |||||||||    
T  17644 gacacgatt 17652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 357 - 630
Target Start/End: Original strand, 802 - 1081
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 454  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  802 cttgggaaatcaaaggcagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 899  T
Q  455 ttgagtgtcttg------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 544  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  900 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat 998  T
Q  545 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    | ||||   || |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  999 ctctttg--aacaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 1081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Original strand, 523 - 765
Alignment:
Q  85 gaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgaca 183  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |   ||||||||||    
T  523 gaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctagtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgaggaatcgtgaca 622  T
Q  184 cgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcatgacacgat 281  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  623 cgattttcaaatttgctcgttaagtttccaggatagggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaattgtgacacgatttgg-aaatcgtgacacgat 721  T
Q  282 tggaaca---gaagactagtattttatgtgttcttgtgcagattt 323  Q
    |  | ||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  722 tttatcagtggaagactagta-tttaagtgttcttgtgcagattt 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 262
Target Start/End: Original strand, 21953 - 22160
Alignment:
Q  58 ttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || |||||    
T  21953 ttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgggacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagtttgcaggacgccaaatc 22052  T
Q  157 gtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtg 254  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||||    
T  22053 gtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtg 22152  T
Q  255 acacgatt 262  Q
    ||||||||    
T  22153 acacgatt 22160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11723
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 11654  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11655 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 414
Target Start/End: Original strand, 22229 - 22286
Alignment:
Q  357 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 414  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22229 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 696 - 806
Target Start/End: Original strand, 11804 - 11911
Alignment:
Q  696 ttcctagattag-atctaggtggtgtt-ttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 793  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |    
T  11804 ttcctagattagtatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcaca---cactttgttag-tggttactactttcctttgctccacacatca-tagt 11898  T
Q  794 ttgtattggtgtg 806  Q
    | |||||||||||    
T  11899 tcgtattggtgtg 11911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 761
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgc 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | || ||||    
T  945 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgc 846  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
     |  |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  845 tggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114768
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaact 114699  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  114700 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaa 114768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 3337 - 3575
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||     
T  3337 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaaaagagaaatcgtgacacgattttgacatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttga 3436  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    ||   || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||   ||| ||||| |     
T  3437 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcaatgataaggactagtc-aacctggggaccgt 3535  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
     ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  3536 tgcagatcgtgacacgatctaggaaaatcgtgacacgatt 3575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 13748 - 13968
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||   |    
T  13748 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttggaattgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagt 13847  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgagct-aggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||||||||||   ||  || ||||||| || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  13848 cgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaag 13947  T
Q  208 tatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  13948 tatctctgataaggactggtc 13968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Original strand, 18627 - 18880
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttg-aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | |||||| |  |    
T  18627 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaa 18726  T
Q  108 tcgtgacacgatttcgggtgccgtgagct-aggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 206  Q
    ||||||||||||    |  || ||||||| || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  18727 tcgtgacacgatcggagaggcagtgagctaagtttgctggaagcaaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 18826  T
Q  207 gtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat 261  Q
    |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  18827 gtatctctgataaagactggtc-atcctggggaccgttgcaaatcgtgacacgat 18880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 1703 - 1977
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtat 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| |  ||    
T  1703 gacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttggaattgacttcaaattagtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcacgatttggcaat 1802  T
Q  109 cgtgacacgatttcgggtgccgtgag-ctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaag 207  Q
    |||||||||||   ||  || ||||| | || |||| |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  1803 cgtgacacgatcggggaggcagtgagccaagtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaag 1902  T
Q  208 tatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
    | ||  |||||||||||||||   ||||||||| |  ||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  1903 tttctctgataaggactggtc-aaccttgggaccgttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Original strand, 34554 - 34770
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggt-gccgtgagctaggttgc 143  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||| || | | ||||    
T  34554 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacactatttcaagtggccgttagtttgtttgc 34653  T
Q  144 agagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 243  Q
    |    || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |     
T  34654 atgacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgt 34752  T
Q  244 cgcaaatcgtgacacgat 261  Q
     ||| |||||||||||||    
T  34753 tgcagatcgtgacacgat 34770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 18171 - 18006
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  18171 ttggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aact 18075  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18074 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaa 18006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 269
Target Start/End: Original strand, 132748 - 132979
Alignment:
Q  41 gaaatgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | || |||||||| |    
T  132748 gaaatgttgagatttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggtatcgtggcacgattttgtgatgtcgtgagctgg 132847  T
Q  139 gttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 238  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||||| |   |||||||||| |||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||||| |||||||    
T  132848 tttgcagtgtgtcaaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacatgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtaccttggg 132946  T
Q  239 acggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaa 269  Q
     || ||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  132947 tcgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaaa 132979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6252
Alignment:
Q  9 gacatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaaatgttga-aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6344 gacatcaccaccaa-ttagaagtcaaggtggagaa-tgttgttaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 6252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 149262 - 149103
Alignment:
Q  467 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  149262 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 149165  T
Q  564 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  149164 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggt 149103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 3060
Alignment:
Q  51 aattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3111 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcatgacacgattt 3060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 149659 - 149601
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  149659 atgttgatattggcttcaaatttgtggtttggagaaacagagaaatcgtgacatgattt 149601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1455 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1455
Description:

Target: scaffold1455; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 1709 - 1784
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1709 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatt 1784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 630
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7492
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 7424  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 630  Q
    |||| |||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7425 catt-gatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaa 7492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 7924 - 8036
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcg-ggtgccgtgagctaggttgcagagtgcaaaat 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| | | |||||| |||| ||||    
T  7924 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagttggtttgcagggtgccaaat 8023  T
Q  156 cgtgacacgattt 168  Q
    |||||||||||||    
T  8024 cgtgacacgattt 8036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20421
Alignment:
Q  464 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 560  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  561 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    | ||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20485 c-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 20421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 627
Target Start/End: Original strand, 10515 - 10651
Alignment:
Q  488 aaattagggtttgttcattgtgaact--tgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagta 584  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  |||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||      
T  10515 aaattagggtttgttctttgtgagctcttgt---gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattgaagagat 10609  T
Q  585 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10610 caatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 10651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8230 - 8112
Alignment:
Q  107 atcgtgacacgatttcgggtg-ccgtgagctaggttgcagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtta 205  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  8230 atcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagtttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtta 8131  T
Q  206 agtatccttgataaggact 224  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  8130 agtatcactgataaggact 8112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8273 - 8216
Alignment:
Q  45 tgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8273 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 148443 - 148682
Alignment:
Q  44 atgttgaaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-g 142  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||   ||  || |||||| | ||| |    
T  148443 atgttggaattgacttcaaattagtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggggaggcagtgagccaagtttg 148542  T
Q  143 cagagtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 242  Q
    | |   ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||||| |    
T  148543 ctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc-aaccttgggaccg 148641  T
Q  243 acgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcatgacacgatt 282  Q
      ||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  148642 ttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 148682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Original strand, 1082 - 1160
Alignment:
Q  44 atgttgaaatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1082 atgttgaaatttgccttcaaatttgtggtttgaaagaacagaaaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattt 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 176457 - 176634
Alignment:
Q  52 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctaggtt-gcagagtgc 150  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||||||||   ||  || |||||||| ||| || |   ||    
T  176457 attgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagtcgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtttgctggaagc 176556  T
Q  151 aaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 228  Q
    ||||||||| |||||| | || |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  176557 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 176634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 121
Target Start/End: Original strand, 43447 - 43511
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattt 121  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  43447 cttcaaatttatggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgattt 43511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Original strand, 36330 - 36384
Alignment:
Q  50 aaattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  36330 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcatgatacgattttg 36384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 45791 - 45744
Alignment:
Q  57 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45791 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacaattttg 45744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 80447 - 80351
Alignment:
Q  468 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcat 563  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  80447 tgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtat-ctttttgtaagaactcat 80351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 187
Target Start/End: Original strand, 25245 - 25283
Alignment:
Q  149 gcaaaatcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25245 gcaaaatcgtgacacgatttgggcaaatcgtggcacgat 25283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 86225 - 86153
Alignment:
Q  31 tcaaggtggagaaatgttgaa-attgtcttcaaattt-gtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 102  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  86225 tcaaggtggagaa-tgttgtatattggcttcaaattttgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattt 86153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University