View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6594_low_7 (Length: 655)

Name: NF6594_low_7
Description: NF6594
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6594_low_7
NF6594_low_7
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (315-639)||(35317099-35317423)
chr1 (12-313)||(13497069-13497368)
chr1 (12-313)||(32050291-32050590)
chr1 (14-304)||(49005414-49005701)
chr1 (11-305)||(45537406-45537697)
chr1 (12-313)||(18410753-18411053)
chr1 (12-313)||(28645107-28645407)
chr1 (12-313)||(32523299-32523599)
chr1 (11-313)||(38983872-38984173)
chr1 (12-313)||(42436198-42436497)
chr1 (74-313)||(24775977-24776214)
chr1 (74-313)||(43642563-43642800)
chr1 (11-313)||(2023575-2023874)
chr1 (16-313)||(42807252-42807543)
chr1 (74-304)||(2840887-2841115)
chr1 (11-114)||(2841110-2841214)
chr1 (12-112)||(41402913-41403014)
chr1 (242-304)||(20274938-20275000)
chr1 (11-55)||(24776235-24776279)
chr1 (11-55)||(43642498-43642542)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (315-639)||(33310008-33310331)
chr5 (12-307)||(5811857-5812151)
chr5 (12-313)||(1211988-1212287)
chr5 (14-313)||(23106843-23107140)
chr5 (12-313)||(16478706-16479006)
chr5 (12-313)||(16476119-16476418)
chr5 (12-304)||(22496296-22496569)
chr5 (12-313)||(36788995-36789295)
chr5 (12-313)||(22720614-22720913)
chr5 (12-313)||(28968858-28969157)
chr5 (11-313)||(39564538-39564836)
chr5 (12-313)||(1597983-1598281)
chr5 (74-313)||(25336598-25336835)
chr5 (11-305)||(40831005-40831296)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (11-313)||(19295816-19296116)
chr7 (11-313)||(6613180-6613479)
chr7 (11-313)||(21953503-21953793)
chr7 (12-313)||(18783924-18784223)
chr7 (12-313)||(34643133-34643432)
chr7 (12-313)||(42047132-42047431)
chr7 (12-313)||(42049835-42050135)
chr7 (12-313)||(35505374-35505673)
chr7 (12-307)||(46805296-46805590)
chr7 (12-313)||(44044864-44045163)
chr7 (11-303)||(9178656-9178948)
chr7 (12-313)||(37315398-37315697)
chr7 (12-313)||(35113887-35114186)
chr7 (242-307)||(47400310-47400375)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (11-313)||(37965314-37965613)
chr3 (11-313)||(47333728-47334029)
chr3 (11-313)||(28417682-28417981)
chr3 (11-304)||(4066030-4066320)
chr3 (11-313)||(3344331-3344630)
chr3 (12-313)||(26705432-26705731)
chr3 (11-305)||(22398347-22398638)
chr3 (11-313)||(10121995-10122295)
chr3 (12-304)||(33956515-33956804)
chr3 (12-313)||(35350120-35350419)
chr3 (11-304)||(33955210-33955500)
chr3 (12-313)||(1002328-1002627)
chr3 (12-313)||(43845336-43845635)
chr3 (12-313)||(54610692-54610991)
chr3 (22-313)||(30107195-30107484)
chr3 (14-185)||(45579403-45579574)
chr3 (177-313)||(38189938-38190073)
chr3 (203-313)||(23303395-23303508)
chr3 (203-313)||(23302738-23302851)
chr3 (11-94)||(23303652-23303734)
chr3 (242-313)||(45579650-45579720)
chr3 (12-58)||(38189860-38189906)
chr3 (523-604)||(25731771-25731852)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (12-313)||(36352526-36352826)
chr4 (12-303)||(34802584-34802874)
chr4 (14-313)||(27023843-27024142)
chr4 (12-313)||(5944393-5944694)
chr4 (12-313)||(7509996-7510295)
chr4 (12-313)||(27071564-27071863)
chr4 (12-313)||(27151656-27151955)
chr4 (12-304)||(9767902-9768192)
chr4 (14-313)||(48945793-48946083)
chr4 (12-313)||(4943719-4944018)
chr4 (203-313)||(25887936-25888049)
[»] scaffold0088 (3 HSPs)
scaffold0088 (11-313)||(11321-11622)
scaffold0088 (13-313)||(659-956)
scaffold0088 (11-313)||(24549-24840)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (12-313)||(39121812-39122111)
chr2 (12-319)||(9616883-9617186)
chr2 (16-313)||(6904963-6905254)
chr2 (12-313)||(42842330-42842629)
chr2 (11-304)||(4650764-4651056)
chr2 (12-313)||(12255968-12256267)
chr2 (12-313)||(40263949-40264246)
chr2 (16-307)||(4720051-4720332)
chr2 (11-313)||(3554308-3554615)
chr2 (203-307)||(42224587-42224694)
[»] scaffold1289 (1 HSPs)
scaffold1289 (11-313)||(714-1015)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (12-313)||(198225-198524)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (12-313)||(6417111-6417410)
chr8 (12-313)||(22514360-22514659)
chr8 (12-313)||(40557943-40558242)
chr8 (12-313)||(12501001-12501300)
chr8 (12-313)||(16428694-16428993)
chr8 (12-313)||(36895871-36896170)
chr8 (12-307)||(39621430-39621724)
chr8 (12-313)||(18384928-18385228)
chr8 (12-313)||(13279060-13279359)
chr8 (11-313)||(33441866-33442166)
chr8 (242-313)||(16888155-16888226)
chr8 (107-304)||(29088562-29088760)
chr8 (11-52)||(16885799-16885840)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (12-313)||(11619-11918)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (12-313)||(4270928-4271227)
chr6 (12-313)||(22510790-22511090)
chr6 (12-313)||(18902448-18902748)
chr6 (12-313)||(14180488-14180787)
chr6 (12-313)||(14175952-14176251)
chr6 (11-313)||(19421121-19421411)
[»] scaffold1788 (1 HSPs)
scaffold1788 (12-304)||(728-1018)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 315 - 639
Target Start/End: Original strand, 35317099 - 35317423
Alignment:
Q  315 aacttcaaaacccgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattaccttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagttctttaactatg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35317099 aacttcaaaacccgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattaccttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagttctttaactatg 35317198  T
Q  415 cagatatggaacgagtcatccaacaaggaccttggttgtttgatagctactcgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagattcgttcactatgca 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  35317199 cagatatggaacgagtcacccaacaaggaccttggttgtttgatagctacccgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagatccgttcactatgcc 35317298  T
Q  515 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctcccctttgatttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35317299 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctccccttcggtttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 35317398  T
Q  615 gtgaaatacgatcatgataacaact 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35317399 gtgaaatacgatcatgataacaact 35317423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13497368 - 13497069
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  13497368 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 13497270  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  13497269 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 13497175  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13497174 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 13497075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32050590 - 32050291
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  32050590 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 32050492  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  32050491 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 32050397  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatattaat---gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32050396 tcaatttgaccgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaatgtacaaaaaatta 32050297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 49005701 - 49005414
Alignment:
Q  14 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  49005701 agatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaagaa 49005604  T
Q  113 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattatt 212  Q
     ||||||| |||||||||||| | |||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||| |||||    
T  49005603 gaactatattttgtaattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttttatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattacttatt 49005509  T
Q  213 aattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    ||||  |||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49005508 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgcgcattaaacgattatattatatttcatgtaacctacaaaaaa 49005414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45537697 - 45537406
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  45537697 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattagaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 45537600  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  45537599 gaagagctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 45537505  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 305  Q
    |||||||   ||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45537504 attaatttggccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgcaacctacaaaaaat 45537406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18411053 - 18410753
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||    
T  18411053 agagatgaagttgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatataatagaaaaag 18410954  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  18410953 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 18410859  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18410858 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 18410760  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  18410759 aacttca 18410753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 28645107 - 28645407
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  28645107 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 28645206  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  28645207 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 28645301  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28645302 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 28645400  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  28645401 aacttca 28645407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 32523299 - 32523599
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  32523299 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 32523398  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  32523399 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 32523493  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32523494 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 32523592  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  32523593 aacttca 32523599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 38983872 - 38984173
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  38983872 cagagatgaagttgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 38983971  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||  || || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||     
T  38983972 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttctacccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatc 38984066  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  38984067 attaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctaaaaaaaatt 38984166  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  38984167 aacttca 38984173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42436497 - 42436198
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  42436497 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 42436399  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  42436398 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 42436304  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42436303 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 42436204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24776214 - 24775977
Alignment:
Q  74 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||||||||||||    
T  24776214 agaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaagaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaa 24776116  T
Q  174 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaat---attaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 270  Q
    |||| ||||||||||||| ||    ||  ||||||||||||||  ||| |||| |||| |||   || || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  24776115 aatattaccataacggttaat----atctattaattattaatttgaccattttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaa 24776020  T
Q  271 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 313  Q
     | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24776019 cgtttagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaacttca 24775977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Original strand, 43642563 - 43642800
Alignment:
Q  74 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||  | |||||| | |||||||||||||    
T  43642563 agaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaagaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccataagcgctact-atttatatagaaa 43642661  T
Q  174 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaat---attaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 270  Q
    |||| || |||||||||| ||    ||  ||||||||||||||  |||||||| |||| |||   || || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  43642662 aatattatcataacggttaat----atctattaattattaatttgaccgttttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaa 43642757  T
Q  271 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 313  Q
     | ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43642758 cgtttagattttatttcatgtaacctacaaaaaattaacttca 43642800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2023874 - 2023575
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |     | |||||||| ||||||| | | |||| | ||||    
T  2023874 cagagataaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaattgaaaaaattacagaaattatttata-atagatattagagaaccatagaacaaaaaaag 2023776  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || || |||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  2023775 aagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatta 2023681  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2023680 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 2023581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42807543 - 42807252
Alignment:
Q  16 atgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaata 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||||||||||||  || ||     ||| || |    
T  42807543 atgaagttgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaatatagatatcagagaacagaagaa-----aaaaaaga 42807449  T
Q  115 actataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaa 214  Q
    | ||||  |||| |||||| | ||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||  |||    |||||||||    
T  42807448 attatatattgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctacta-tttataaagaaaaatagtaccgtaaaagttaatatctatt----aattattaa 42807354  T
Q  215 ttgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagctt 311  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  42807353 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatctt 42807254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2841115 - 2840887
Alignment:
Q  74 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 173  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| ||| |  || | |||| | |||||| ||||||    
T  2841115 agaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaagaagaactatattttgtgattgttgtgtacttgtaccaaaaagtgctact-atttatgtagaaa 2841017  T
Q  174 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 270  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||  |||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||  ||||||||| |||||||||    
T  2841016 aatagtaccataacggttaat----atctattaatcattaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaa 2840921  T
Q  271 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
     ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2840920 cgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaa 2840887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2841214 - 2841110
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  2841214 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 2841115  T
Q  110 gaata 114  Q
    |||||    
T  2841114 gaata 2841110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 41402913 - 41403014
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  41402913 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaacaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaag 41403012  T
Q  111 aa 112  Q
    ||    
T  41403013 aa 41403014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20275000 - 20274938
Alignment:
Q  242 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20275000 gtctttaatattataaaatgtacattaaaaaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaa 20274938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 24776279 - 24776235
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaa 55  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24776279 cagagatgaagtcgtatttcgtagacatttttctttgcaatagaa 24776235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Original strand, 43642498 - 43642542
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaa 55  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43642498 cagagatgaagtcgtatttcgtagacatttttctttgcaatagaa 43642542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 315 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 33310331 - 33310008
Alignment:
Q  315 aacttcaaaacccgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattaccttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagttctttaactatg 414  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310331 aacttcaaaacctgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattac-ttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagttctttaactatg 33310233  T
Q  415 cagatatggaacgagtcatccaacaaggaccttggttgtttgatagctactcgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagattcgttcactatgca 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  33310232 cagatatggaacgagtcacccaacaaggaccttggttgtttgatagctacccgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagatccgttcactatgcc 33310133  T
Q  515 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctcccctttgatttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310132 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctccccttcggtttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 33310033  T
Q  615 gtgaaatacgatcatgataacaact 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33310032 gtgaaatacgatcatgataacaact 33310008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 307
Target Start/End: Original strand, 5811857 - 5812151
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | | ||    
T  5811857 agagatgaagtcgtgtttgatagacgtttttctttgcaatagaaaaaaataaaaaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacaaaaatag 5811956  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  5811957 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 5812051  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5812052 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 5812151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 1211988 - 1212287
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  1211988 agagatgaagttgtgtttcgttgagattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 1212086  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  1212087 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 1212181  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1212182 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaatgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 1212281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Original strand, 23106843 - 23107140
Alignment:
Q  14 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |||    
T  23106843 agatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacgaa 23106941  T
Q  113 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattatt 212  Q
     ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||||||     
T  23106942 gaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aattatc 23107036  T
Q  213 aattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagc 309  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23107037 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 23107136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16479006 - 16478706
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  16479006 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 16478907  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  16478906 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 16478812  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16478811 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 16478713  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  16478712 aacttca 16478706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16476418 - 16476119
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  16476418 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 16476320  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  16476319 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatatctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 16476225  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16476224 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 16476125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Original strand, 22496296 - 22496569
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  22496296 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaacaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaag 22496395  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  22496396 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatta 22496490  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatattaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    ||||||  |||||||| |||               ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22496491 ttaatttgaccgttttaaaa---------------ttaatattataaaatgtgtattaaatgattatattatatttcatgtaacctacaaaaaa 22496569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 36788995 - 36789295
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  36788995 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 36789093  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||||||||| ||||| ||| || | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||    
T  36789094 aataactatattttgtgattattgtatactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaa---attaatta 36789189  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36789190 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatattttatgtaacgtacaaaaaatta 36789289  T
Q  308 gcttca 313  Q
     |||||    
T  36789290 acttca 36789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 22720614 - 22720913
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||| ||||| || ||| |||||| || |    
T  22720614 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccaaagaacagaaaacg 22720712  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||||||| | ||||| |||||| ||||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  22720713 aataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 22720807  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22720808 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 22720907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 28968858 - 28969157
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  28968858 agagatgaagttgtgttttgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 28968956  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  28968957 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 28969051  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| || |||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28969052 tcaatttaatcgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 28969151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 39564538 - 39564836
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  39564538 cagagatgaaatagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcatagaaccaaagaacagaaaaa 39564635  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatat-taattgattaat 208  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||    
T  39564636 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcg-acccaaaaacgctacta-tttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctaat-----aat 39564728  T
Q  209 tattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 305  Q
    ||||||||  |||||||| |||| || ||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39564729 tattaatttgaccgttttaaaattaacattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaat 39564828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 1597983 - 1598281
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |   |||||| |  ||| ||||||| | | |||||| ||||    
T  1597983 agagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaattgaaaaaattacagaaattatttagaataaa--tattagagaaccagagaacagaaaaag 1598080  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || || |||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  1598081 aagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatta 1598175  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1598176 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 1598275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25336835 - 25336598
Alignment:
Q  74 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 173  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| |||||| || |||  |||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||    
T  25336835 agaatatagatattagagcaccaaagaacagaaaacgaagtactatattttgtgattgttgtatactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaa 25336737  T
Q  174 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25336736 aatagtaccataacggttaatat--at--attaattatcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaa 25336641  T
Q  271 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 313  Q
      |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25336640 caattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttca 25336598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40831296 - 40831005
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |   ||||||  ||||| ||||||| | | |||| | |||    
T  40831296 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaattgaaaaaattacagaaattatttagaata--gatattagagaaccagagaacataaaaa 40831199  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| || |||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    ||||    
T  40831198 gaagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatt 40831104  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 305  Q
    |||||||   ||||||| |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40831103 attaatttggccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaat 40831005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 19295816 - 19296116
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19295816 cagagatgaagtcgtgttgcataggcatctttctttgcaatagaaaaa-ttatagaaacaaccagaatatagatatcagagaaccagataacagataaag 19295914  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  19295915 aatagctataatttgtgattgttgtttactcgtatcccaagacgctactaatt-atatagaaaaatagtaccataacagttaatattaattaattaatta 19296013  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatattaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagct 310  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19296014 ttaatttaaccgttttaaaatcaatattaacgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatactaaaaactagct 19296113  T
Q  311 tca 313  Q
    |||    
T  19296114 tca 19296116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6613479 - 6613180
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  6613479 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 6613382  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  6613381 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 6613287  T
Q  210 atta-attgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 305  Q
    |||| |||| |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6613286 attacattg-accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaat 6613188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 21953503 - 21953793
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||    
T  21953503 cagagatgaagtcgtgtttcgtagatatttttctttgcaatagaaaaaatta----------cagaatatagatattagagaaccagagaacagaaaaag 21953592  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||    
T  21953593 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaata--act--attaatta 21953687  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21953688 ttaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtacactaaacgattagattatatttcatttaacctacaaaaaatta 21953787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 18783924 - 18784223
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  18783924 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 18784022  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  18784023 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 18784117  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18784118 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 18784217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 34643133 - 34643432
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  34643133 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 34643232  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||| ||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||  | ||||||    
T  34643233 aagaactatattttgtgattgttgtgtacttgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatta 34643327  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34643328 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatta 34643426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42047431 - 42047132
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  42047431 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 42047333  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  42047332 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 42047238  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42047237 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 42047138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42050135 - 42049835
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  42050135 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 42050036  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  42050035 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 42049941  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42049940 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 42049842  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  42049841 aacttca 42049835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35505673 - 35505374
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  35505673 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 35505575  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  35505574 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 35505480  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35505479 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 35505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46805590 - 46805296
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| || | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | | ||    
T  46805590 agagatgaagtcgtgtttggtagacgtttttctttgcaatagaaaaaaataaaaaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacaaaaatag 46805491  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| ||| || | |||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  46805490 aagaactatattttgtgattattgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 46805396  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46805395 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 46805296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 44044864 - 44045163
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||| ||||| || ||| |||||| || |    
T  44044864 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccaaagaacagaaaacg 44044962  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||||||| | ||||| |||||| ||||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  44044963 aataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 44045057  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44045058 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 44045157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 9178656 - 9178948
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||||||||||| | | |||||| |||    
T  9178656 cagagatgaagtcttgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttaaaatatagatatcagagaaccagagaacagacaaa 9178755  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||    ||  |||||||    
T  9178756 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtaccgaaaagtgctact-atttatataaaaaaatagttccataatggttaat----atctattaatt 9178850  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatg-taacatacaaaaa 303  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9178851 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgcattaaaagattagattatatttcatgttaacctacaaaaa 9178948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 37315398 - 37315697
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  37315398 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 37315496  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  37315497 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 37315591  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37315592 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 37315691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35114186 - 35113887
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  35114186 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 35114088  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  35114087 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttagatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 35113993  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35113992 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 35113893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 307
Target Start/End: Original strand, 47400310 - 47400375
Alignment:
Q  242 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  47400310 gtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaattaaaaaaaatta 47400375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37965613 - 37965314
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  37965613 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 37965516  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  37965515 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 37965421  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37965420 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatt 37965321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 47333728 - 47334029
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | |||    
T  47333728 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacataaaaa 47333827  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  47333828 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 47333922  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| || |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47333923 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattttaaaatatgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaagaatt 47334022  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  47334023 aacttca 47334029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 28417682 - 28417981
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  28417682 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattataaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 28417779  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  28417780 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 28417874  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28417875 attaatttgaccgttttaaaattaatattataaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatt 28417974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 4066030 - 4066320
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  4066030 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 4066127  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  4066128 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 4066222  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4066223 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaa 4066320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 3344331 - 3344630
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||   ||  |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||    
T  3344331 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaagttacaaaaattactggaatatagatattagagaaccagagaacagaaaaag 3344430  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  3344431 aagaactata-tttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tatatatagaaaaataataccataacggttaatatctatt----aatta 3344524  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    |||| |  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3344525 ttaagttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 3344624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 26705432 - 26705731
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  26705432 agagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 26705530  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  26705531 aagaactatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 26705625  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26705626 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 26705725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22398638 - 22398347
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  22398638 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagataacagaaaaa 22398541  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  22398540 gaagagctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 22398446  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 305  Q
    |||||||   ||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22398445 attaatttggccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgtaacctacaaaaaat 22398347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 10121995 - 10122295
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||||| || || ||| |||||| ||     
T  10121995 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcatttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcaaagcaccaaagaacagaaaac 10122093  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||    
T  10122094 gaaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatt 10122188  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    || |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10122189 atcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatt 10122288  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  10122289 aacttca 10122295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Original strand, 33956515 - 33956804
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||| ||||||| | |||||| |||     
T  33956515 agagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcaaagaactagagaacagaaaaaa 33956612  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaag-gcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| | |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    ||||    
T  33956613 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgta-ctcaagagctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatt 33956706  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    |||||||  ||||| || |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33956707 attaatttgaccgtgttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcatttaacgattaaattatatttcatgtaacatacaaaaaa 33956804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 35350120 - 35350419
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  35350120 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 35350218  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  35350219 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 35350313  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35350314 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 35350413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 33955210 - 33955500
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  33955210 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 33955307  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    ||  |||||||    
T  33955308 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttgtatagaaaaatagtactataacggttaat----atctattaatt 33955402  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33955403 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgtgcatttaactattagattatatttcatgtaacctacaaaaaa 33955500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 1002328 - 1002627
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  1002328 agagatgaagtcgtgtttcgtagatattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 1002426  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  1002427 aataactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 1002521  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||||| |   | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1002522 tcaatttgactgttttaaaattaatatcatcaacgtctttaatattataaaacatgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 1002621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43845635 - 43845336
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  43845635 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 43845537  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  43845536 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 43845442  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43845441 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 43845342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54610991 - 54610692
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  54610991 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 54610893  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  54610892 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 54610798  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54610797 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 54610698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30107484 - 30107195
Alignment:
Q  22 tcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactata 120  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| |||| | |||||| || ||| | |||||    
T  30107484 tcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcactagagaacagaaaacgaagagctata 30107386  T
Q  121 atttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaac 220  Q
     ||||| |||||| | ||||| || || || || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||| ||||  ||    
T  30107385 ttttgtgattgttgtatactcatacccaaaagctcaacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aattatcaatttgac 30107291  T
Q  221 cgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 313  Q
    |||||| |||| |||||||   |   ||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30107290 cgttttaaaattaatattataaacaactttaatattataaaaagtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttca 30107195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 45579403 - 45579574
Alignment:
Q  14 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  45579403 agatgaagtcgtgttacgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaataacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaagaa 45579502  T
Q  113 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccata 185  Q
     || |||| ||||| | |||| | |||||||| || || |||||| | |||||||| ||||  ||||||||||    
T  45579503 gaattatattttgtgagtgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatggaaaggtagtaccata 45579574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Original strand, 38189938 - 38190073
Alignment:
Q  177 agtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaatattaat---gtctttaattttataaaatgtgcattaaatga 273  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||    |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38189938 agtaccataacggttaatataaatt----aattatcaatttgaccgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacga 38190033  T
Q  274 ttgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 313  Q
    ||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  38190034 ttaaattatatttcatgtaatgtacaaaaaattaacttca 38190073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23303508 - 23303395
Alignment:
Q  203 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 299  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23303508 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 23303409  T
Q  300 aaaaattagcttca 313  Q
    |||||||| |||||    
T  23303408 aaaaattaacttca 23303395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23302851 - 23302738
Alignment:
Q  203 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 299  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23302851 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattattaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 23302752  T
Q  300 aaaaattagcttca 313  Q
    |||||||| |||||    
T  23302751 aaaaattaacttca 23302738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23303734 - 23303652
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||    
T  23303734 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacctttttctttgcaat--aaaaaattatagaaataacttagaatatagatatcaaagaac 23303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 313
Target Start/End: Original strand, 45579650 - 45579720
Alignment:
Q  242 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  45579650 gtctttaatattataaaatgtgcattaaatggatagattatatttcatgtaaccta-aaaaaattaacttca 45579720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 38189860 - 38189906
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaa 58  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  38189860 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa 38189906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 604
Target Start/End: Original strand, 25731771 - 25731852
Alignment:
Q  523 caattgaattatggatgcaagtccataatctcccctttgatttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgt 604  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |  || |||||||   | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  25731771 caattgaattataggtgcaagtccataatctccctttcggatttatgactgtatcaatgggaatcttgttgggcaatcatgt 25731852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 36352526 - 36352826
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  36352526 agagataaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcatagaaccaaagaacagaaaaag 36352625  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  36352626 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatta 36352720  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36352721 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 36352820  T
Q  308 gcttca 313  Q
     |||||    
T  36352821 acttca 36352826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34802874 - 34802584
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||    
T  34802874 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtgtttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatattagagaaccagagaacagaaaaag 34802775  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| || || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||| |    
T  34802774 aagaactatattttatgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatacagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaataa 34802680  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaa 303  Q
    ||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34802679 ttaatttgaacgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaa 34802584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Original strand, 27023843 - 27024142
Alignment:
Q  14 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaa-ttatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaaga 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||   ||  |||||||||| |||||||||| | | |||| | |||||    
T  27023843 agatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagaaatcagagaaccagagaacaaaaaaaga 27023942  T
Q  112 ataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattat 211  Q
    | ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||||    
T  27023943 agaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaattat 27024037  T
Q  212 taattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattag 308  Q
    |||||  ||| |||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  27024038 taatttgaccattttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatataacctacaaaaaattaa 27024137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5944694 - 5944393
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || | | ||||    
T  5944694 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaataaaaaaag 5944595  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatt-tatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| || || |||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  5944594 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 5944499  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5944498 attaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 5944400  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  5944399 aacttca 5944393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7510295 - 7509996
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || | | |||||| || |    
T  7510295 agagacgaagtcgtgtttcatagacattttcctttacaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccagagaacagaaaacg 7510197  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  7510196 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 7510102  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7510101 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 7510002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27071863 - 27071564
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  27071863 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 27071765  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  27071764 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 27071670  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27071669 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 27071570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27151955 - 27151656
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||| ||||||||| || ||| |||||| || |    
T  27151955 agagatgaagttgtgtttcattgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatataaatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 27151857  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||    
T  27151856 aataactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatat-aatt---taatta 27151762  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  || ||||| |||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27151761 tcaatttgacagttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgatttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 27151662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Original strand, 9767902 - 9768192
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    | |||||||||||||||| || | | |||||| || |    
T  9767902 agagttgaagtcgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttaaaatatagatatcagagcaccagagaacagaaaacg 9768000  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  9768001 aaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatcaatt----aatta 9768095  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  9768096 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaagttatatttcatgtaacgtacaaaaaa 9768192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48946083 - 48945793
Alignment:
Q  14 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||||||||        ||||||| ||||||    
T  48946083 agatgaagttgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaatatagatatcaga--------taacagaaaaagaa 48945992  T
Q  113 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattatt 212  Q
     ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||  |||    |||||||    
T  48945991 gaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctacta-tttatatagaaaagtagtaccataacgattaatatctatt----aattatt 48945897  T
Q  213 aattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagc 309  Q
    ||||  |||||||| | || |||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  48945896 aatttgaccgttttaatattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatc 48945797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4944018 - 4943719
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  4944018 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 4943920  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  4943919 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 4943825  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4943824 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 4943725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25888049 - 25887936
Alignment:
Q  203 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 299  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  25888049 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctaca 25887950  T
Q  300 aaaaattagcttca 313  Q
    |||||||| |||||    
T  25887949 aaaaattaacttca 25887936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11622 - 11321
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||    
T  11622 cagagatgaagtcgtgtttcatagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaa 11523  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || | |||||||| || || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  11522 gaataactatattttgtgatttttgtgtactcgtacccaaaagcgcgact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 11428  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11427 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgtgcattaaacacttagattatatttcatgtaacctacaaaaaatt 11328  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  11327 aacttca 11321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 313
Target Start/End: Original strand, 659 - 956
Alignment:
Q  13 gagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagca-accagaatatagatatcagagaactaaataacagataaaga 111  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    |  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  659 gagatgaagtagtgttttgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattgattagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaaga 756  T
Q  112 ataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattat 211  Q
    | ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    || ||||||||    
T  757 agaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacagttaatatc---tg-ttaattat 851  T
Q  212 taattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattag 308  Q
    |||||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  852 taatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtttttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaa 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 24549 - 24840
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    |  |||  |||||||||||||        |||||| |||    
T  24549 cagagatgaagtagtgttttgtagacatatttctttgcaatagaaaaaattacagaaattgcttaga--atagatatcagag--------aacagaaaaa 24638  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||   | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  24639 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 24733  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||   | ||||| |||| ||||||   || || |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24734 attaatttggcagttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctagaaaaaatt 24833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 39121812 - 39122111
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  39121812 agagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 39121910  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  39121911 aagaactatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 39122005  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39122006 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 39122105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9617186 - 9616883
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||  ||||||||||||| | |||||| | ||||    
T  9617186 agagatgaaatcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaata--gatatcagagaaccacataacataaaaag 9617089  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||    ||||     
T  9617088 aagaactatattttatgattgttgtgtactcgtatccaaaagcg-tacta-tttatacagaaaaatagtactataacggttaatatctatt----aattg 9616995  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| || | |||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9616994 ttaatttgaccgttttaaagttaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 9616895  T
Q  308 gcttcacaactt 319  Q
     ||||| |||||    
T  9616894 acttcataactt 9616883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6905254 - 6904963
Alignment:
Q  16 atgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaata 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||||||||||||  || ||     ||| || |    
T  6905254 atgaagttgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaatatagatatcagagaacagaagaa-----aaaaaaga 6905160  T
Q  115 actataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaa 214  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||    |||||||||    
T  6905159 actatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctacta-tttataaagaaaaatagtaccgtaacggttaatatctatt----aattattaa 6905065  T
Q  215 ttgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagctt 311  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  6905064 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatctt 6904965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 42842330 - 42842629
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||| |||| |  ||| |||||| || |    
T  42842330 agagatgaagtcgtgtttcgtagtcattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatattagagcatcaaagaacagaaaatg 42842428  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  42842429 aagaactatattttgtaattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 42842523  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42842524 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 42842623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 4650764 - 4651056
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  4650764 cagagatgaagttgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 4650863  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||  || || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||     
T  4650864 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttatacccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatc 4650958  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    |||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4650959 attaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaa 4651056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 12255968 - 12256267
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||| ||||| || ||| |||||| || |    
T  12255968 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccaaagaacagaaaacg 12256066  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||||||| | ||||| |||||| ||||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  12256067 aataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 12256161  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12256162 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 12256261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40264246 - 40263949
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||||| ||||   |   ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  40264246 agagatgaagtcgtgtttcgtatacgtttttctttgtaatagaaaaaattaaagaaattatttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 40264147  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || || ||||| ||||||| ||   |||||||| ||||  |||    |||||    
T  40264146 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-ttgatataaaaaaatacta---taacggttaatatctatt----aatta 40264055  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40264054 ttattttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 40263955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Original strand, 4720051 - 4720332
Alignment:
Q  16 atgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaata 114  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||  |||  |||||||||||||||||||||        ||| |||||| |    
T  4720051 atgaagttgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaatattacataaataacttagaatatagatatcagagaac--------agaaaaagaaga 4720142  T
Q  115 actataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaa 214  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||| | | || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||||||    
T  4720143 actatattttgtgattgttgtgtactcgttttcaaaagtgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aattattaa 4720237  T
Q  215 ttgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4720238 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaa-tgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaatta 4720332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 3554308 - 3554615
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||  |||  ||||||||||||||| ||||| | | |||| | |||    
T  3554308 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaata--aaaagttacagaaataacttagaatatagatatcaaagaaccagagaacaaaaaaa 3554405  T
Q  110 gaataa-----ctataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgat 204  Q
    ||| ||     ||||| ||||| |||||| | || || || |  || | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  ||  ||    
T  3554406 gaaaaaaaaaactatattttgtgattgttgtgtattcatacctaaaagtgctacta-tttatata-aaaaatagtactataacgattaatatatatatat 3554503  T
Q  205 taattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaa 301  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  3554504 taattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaa 3554603  T
Q  302 aaattagcttca 313  Q
    |||||| |||||    
T  3554604 aaattaacttca 3554615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 42224694 - 42224587
Alignment:
Q  203 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 299  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  42224694 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 42224595  T
Q  300 aaaaatta 307  Q
    ||||||||    
T  42224594 aaaaatta 42224587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1289 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1289
Description:

Target: scaffold1289; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 714
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  1015 cagagatgaagtagtgttttgtagacatatttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 916  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||   | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  915 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 821  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||   | ||||| |||| ||||||   || || |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  820 attaatttgtctgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaatt 721  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  720 aacttca 714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 198225 - 198524
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  198225 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 198324  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||  | ||||||    
T  198325 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatta 198419  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  198420 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatta 198518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6417410 - 6417111
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  6417410 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 6417311  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||  | ||||||    
T  6417310 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatta 6417216  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6417215 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatta 6417117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22514659 - 22514360
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  22514659 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 22514561  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  22514560 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 22514466  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22514465 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 22514366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40558242 - 40557943
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  40558242 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 40558144  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  40558143 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 40558049  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40558048 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 40557949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 12501001 - 12501300
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||| |||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |   ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  12501001 agagctgaagttgtgtttcgtaaacatttttctttgcaattgaaaaaattaaagaaattatttagaatatagatatcagagaaccatagaacagaaaaag 12501100  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  12501101 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgta-ccaaaaacgctacta-ttgatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatta 12501194  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12501195 ttattttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 12501294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16428993 - 16428694
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  16428993 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 16428895  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  16428894 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 16428800  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16428799 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 16428700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 36895871 - 36896170
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  36895871 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcacttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 36895969  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||  | | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  36895970 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatatccaaaatctccacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 36896064  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36896065 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 36896164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 307
Target Start/End: Original strand, 39621430 - 39621724
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | | ||    
T  39621430 agagatgaagtcgtgtttggtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacaaaaatag 39621529  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  39621530 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 39621624  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39621625 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatattttatgtaacctacaaaaaatta 39621724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 18384928 - 18385228
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  18384928 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 18385027  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  18385028 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 18385122  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18385123 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 18385221  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  18385222 aacttca 18385228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 13279060 - 13279359
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||||| || || ||| |||||| || |    
T  13279060 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcaaagcaccaaagaacagaaaacg 13279158  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  13279159 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 13279253  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13279254 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 13279353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33442166 - 33441866
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || | | |||||| ||     
T  33442166 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttacaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccagagaacagaaaac 33442068  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || || ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||    
T  33442067 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctgcta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatt 33441973  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatattaatgtc---tttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    || ||||  |||||||| |||| ||||||| |  |   |||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33441972 atcaatttgaccgttttaaaattaatattattaacaactttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatt 33441873  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  33441872 aacttca 33441866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 313
Target Start/End: Original strand, 16888155 - 16888226
Alignment:
Q  242 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 313  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16888155 gtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaacttca 16888226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 304
Target Start/End: Original strand, 29088562 - 29088760
Alignment:
Q  107 aaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgatta 206  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || | |||| || ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||  ||  ||||    
T  29088562 aaagaaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgctacta-tttatatagaaaa-tagtactataacgattaatatatatatatta 29088659  T
Q  207 attattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaa 303  Q
    |||  |||||  |||||||| |||| |||||||   | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29088660 attgctaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacgtacaaaaa 29088759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 16885799 - 16885840
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaata 52  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16885799 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaata 16885840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11918 - 11619
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  11918 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 11820  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  11819 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 11725  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11724 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 11625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 4270928 - 4271227
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  4270928 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 4271026  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  4271027 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 4271121  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4271122 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 4271221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22511090 - 22510790
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||   ||  |||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||    
T  22511090 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttatttgcaatagaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagattacagagaaccagagaacagaaaaag 22510991  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| |  || ||   |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  22510990 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatgaccaaaaatgctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 22510896  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||   || || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22510895 ttaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgtattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 22510796  T
Q  308 gcttca 313  Q
     |||||    
T  22510795 acttca 22510790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Original strand, 18902448 - 18902748
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  18902448 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 18902547  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  18902548 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 18902642  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18902643 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 18902741  T
Q  307 agcttca 313  Q
    | |||||    
T  18902742 aacttca 18902748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14180787 - 14180488
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||||| || || ||| |||||| || |    
T  14180787 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcaaagcaccaaagaacagaaaacg 14180689  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  14180688 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 14180594  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14180593 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 14180494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14176251 - 14175952
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||| ||||| || | | ||| || || |    
T  14176251 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccatagaacggaaaacg 14176153  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    |||||    
T  14176152 aataactacattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatttatt----aatta 14176058  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 307  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14176057 tcaattttaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 14175958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19421411 - 19421121
Alignment:
Q  11 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  |||||||||||||||||||||        ||| |||    
T  19421411 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagatatcagagaac--------agaaaaa 19421320  T
Q  110 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 209  Q
    |||   ||||| ||| | |||||| | |||| ||| || || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||    ||||    
T  19421319 gaa---ctatattttatgattgttgtgtacttgtacccaaatgcgctacta-tttatatagaaaaatagtacgataacggttaatatctatt----aatt 19421228  T
Q  210 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 306  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19421227 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgtattaaatgattagattatatttcatgtaacttacaaaaaatt 19421128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1788 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1788
Description:

Target: scaffold1788; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Original strand, 728 - 1018
Alignment:
Q  12 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    | |||||||||||||||| || | | |||||| || |    
T  728 agagttgaagtcgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttaaaatatagatatcagagcaccagaaaacagaaaacg 826  T
Q  111 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 210  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  827 aaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 921  T
Q  211 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 304  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  922 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaa 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University