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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6596_low_7 (Length: 316)

Name: NF6596_low_7
Description: NF6596
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6596_low_7
NF6596_low_7
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (2-316)||(37874-38187)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (2-316)||(35217514-35217827)
chr8 (2-316)||(32741022-32741336)
chr8 (2-316)||(42990050-42990366)
chr8 (2-316)||(9312366-9312679)
chr8 (2-316)||(23716043-23716357)
chr8 (2-316)||(44501296-44501613)
chr8 (2-316)||(16726997-16727309)
chr8 (16-316)||(38224284-38224575)
chr8 (229-316)||(12773510-12773596)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (2-316)||(3523770-3524083)
chr7 (2-316)||(10268012-10268325)
chr7 (2-316)||(32592192-32592505)
chr7 (16-316)||(25519571-25519870)
chr7 (2-316)||(336626-336940)
chr7 (16-316)||(11806073-11806370)
chr7 (130-316)||(43311216-43311401)
chr7 (126-316)||(4122131-4122319)
chr7 (229-316)||(10902322-10902409)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (2-316)||(30702910-30703223)
chr6 (2-316)||(14220071-14220384)
chr6 (16-316)||(5309146-5309443)
chr6 (229-310)||(21351178-21351264)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (2-316)||(16640629-16640942)
chr1 (2-316)||(41775011-41775324)
chr1 (2-316)||(22146519-22146832)
chr1 (16-316)||(8363525-8363827)
chr1 (2-316)||(29650654-29650951)
chr1 (90-316)||(7391002-7391229)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (16-316)||(21398351-21398650)
chr4 (2-316)||(1084397-1084710)
chr4 (2-316)||(49545476-49545789)
chr4 (2-316)||(10489465-10489778)
chr4 (2-316)||(45107997-45108313)
chr4 (16-316)||(5926961-5927259)
chr4 (16-316)||(27181859-27182160)
chr4 (2-316)||(14678178-14678491)
chr4 (2-316)||(17194740-17195050)
chr4 (16-316)||(54072353-54072652)
chr4 (16-316)||(15056065-15056359)
chr4 (256-316)||(45117960-45118020)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (2-316)||(37037579-37037893)
chr5 (2-316)||(3616387-3616700)
chr5 (2-316)||(2027547-2027860)
chr5 (2-316)||(43489171-43489484)
chr5 (2-316)||(23416764-23417076)
chr5 (2-316)||(37827377-37827692)
chr5 (231-316)||(18003475-18003560)
chr5 (233-316)||(33336240-33336323)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (2-316)||(12534059-12534372)
chr2 (2-316)||(2273683-2273996)
chr2 (16-316)||(7355318-7355620)
chr2 (2-316)||(3535997-3536311)
chr2 (16-316)||(43379971-43380268)
chr2 (167-316)||(30111994-30112142)
chr2 (167-316)||(30123281-30123429)
chr2 (278-316)||(30877332-30877370)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (2-316)||(34946626-34946939)
chr3 (2-316)||(44552105-44552418)
chr3 (16-316)||(38516967-38517266)
chr3 (98-316)||(3863610-3863827)
chr3 (153-316)||(27644343-27644505)
chr3 (191-316)||(20394979-20395103)
chr3 (169-313)||(28392693-28392838)
chr3 (230-316)||(49529790-49529876)


Alignment Details
Target: scaffold0129 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38187 - 37874
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38187 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 38088  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38087 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 37988  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37987 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 37889  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  37888 atcttattattttat 37874  T

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Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 35217514 - 35217827
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35217514 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 35217613  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35217614 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 35217713  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35217714 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 35217812  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  35217813 atcttattattttat 35217827  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32741336 - 32741022
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741336 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 32741237  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741236 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctctaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 32741137  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741136 tcaacaaagtgtaatatatttttttttcagtttttatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 32741037  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  32741036 atcttattattttat 32741022  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 42990050 - 42990366
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990050 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 42990149  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990150 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 42990249  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatata--nnnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaatta 299  Q
    ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990250 tcaacaaagtgtaatatatttttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaatta 42990349  T
Q  300 ttatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  42990350 ttatcttattattttat 42990366  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9312679 - 9312366
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9312679 ggatgacgacgaagatgatacagtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 9312580  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9312579 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 9312480  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9312479 tcaacaaagtgtaatat-tttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 9312381  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  9312380 atcttattattttat 9312366  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23716357 - 23716043
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23716357 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 23716258  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23716257 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacaaacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 23716158  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    |||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23716157 tcaacaaagtgtaatatttttttttttcagtttctatgaattactaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 23716058  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  23716057 atcttattattttat 23716043  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44501613 - 44501296
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44501613 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 44501514  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44501513 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 44501414  T
Q  202 tcaacaaagtgt---aatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaatt 298  Q
    ||||||||||||   |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44501413 tcaacaaagtgtaataatattttttttcttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcctaaaaaatt 44501314  T
Q  299 attatcttattattttat 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44501313 attatcttattattttat 44501296  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16727309 - 16726997
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16727309 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaagaaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 16727210  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16727209 aatacaacacctcagctatttgatgcaataagaaaagttaaagatgagctccaaacagacttgaactttaaa-gaaaacaaacaactattgaatcatatt 16727111  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16727110 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaaggaatctcccaaaaaattatt 16727012  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  16727011 atcttattattttat 16726997  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 38224284 - 38224575
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38224284 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 38224383  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38224384 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactt--------aacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 38224475  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38224476 tata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 38224574  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 12773510 - 12773596
Alignment:
Q  229 cagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12773510 cagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaaggaatctccc-aaaaattattatcttattattttat 12773596  T

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Target: chr7 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 3523770 - 3524083
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3523770 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 3523869  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3523870 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 3523969  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3523970 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 3524068  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  3524069 atcttattattttat 3524083  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10268325 - 10268012
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268325 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 10268226  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268225 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 10268126  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268125 tcaacaaagtgtaatat-tttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 10268027  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  10268026 atcttattattttat 10268012  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 32592192 - 32592505
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592192 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 32592291  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592292 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 32592391  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592392 tcaacaaagtgtaatat-tttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 32592490  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  32592491 atcttattattttat 32592505  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 25519571 - 25519870
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25519571 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 25519670  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25519671 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattaaatcatatttcaacaaagtgtaa 25519770  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25519771 tat-tttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 25519869  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 336626 - 336940
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  336626 ggatgacgacgaagatgatacagtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 336725  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  336726 aatacaa-acctcaactattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 336824  T
Q  202 tcaacaaagtgtaata-tannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattat 300  Q
    |||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  336825 tcaacaaagtgtaatatttttttttcttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattat 336924  T
Q  301 tatcttattattttat 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  336925 tatcttattattttat 336940  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 11806073 - 11806370
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11806073 atgatacggtgtctttggagcctgttacacgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaatacctga 11806172  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  11806173 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacagacaactattgaatcatatttca--atagtgtaa 11806270  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11806271 tata-atttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatcttccgaaaaattattatcttattatttta 11806369  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 130 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43311401 - 43311216
Alignment:
Q  130 taagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnnc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |    
T  43311401 taagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatatttttttt-c 43311303  T
Q  230 agtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43311302 agtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 43311216  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 126 - 316
Target Start/End: Original strand, 4122131 - 4122319
Alignment:
Q  126 gcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnn 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||           
T  4122131 gcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacagacaactattgaatcatatttcaata--gtgtaatatttttttt 4122228  T
Q  226 nnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4122229 tttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccaaaaattataaagggatctcccgaaaaattattatcttattattttat 4122319  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 10902322 - 10902409
Alignment:
Q  229 cagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10902322 cagtttctatgaataattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatcttccaaaaaattattatcttattattttat 10902409  T

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Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30703223 - 30702910
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30703223 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 30703124  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30703123 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctctaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 30703024  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30703023 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 30702925  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  30702924 atcttattattttat 30702910  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 14220071 - 14220384
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14220071 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttgaagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaaaactcttcaaaactttataatacaatacaaa 14220170  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14220171 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 14220270  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14220271 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctaccaaaaaattatt 14220369  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  14220370 atcttattattttat 14220384  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5309443 - 5309146
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5309443 atgatacggtgtctttggagcctgttacacgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatataatacaaaaatacaacacctga 5309344  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  5309343 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacagacaactattgaatcatatttca--atagtgtaa 5309246  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5309245 tata-atttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatcttccgaaaaattattatcttattatttta 5309147  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21351264 - 21351178
Alignment:
Q  229 cagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattat-----aaagggatctcccaaaaaattattatcttatta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21351264 cagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaatcaaagggatctcccgaataattattatcttatta 21351178  T

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Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16640942 - 16640629
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640942 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 16640843  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640842 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 16640743  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640742 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 16640644  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  16640643 atcttattattttat 16640629  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 41775011 - 41775324
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775011 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 41775110  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775111 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 41775210  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775211 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 41775309  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  41775310 atcttattattttat 41775324  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22146832 - 22146519
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146832 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 22146733  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146732 aatatgacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 22146633  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    |||||||||| |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146632 tcaacaaagtataatatattttttttt-agtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 22146534  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  22146533 atcttattattttat 22146519  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 8363525 - 8363827
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8363525 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 8363624  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8363625 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagcttcaaacaaacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 8363724  T
Q  216 tata--nnnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattt 313  Q
    ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8363725 tatatttttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaaggaatctcccaaaaaattattatcttattattt 8363824  T
Q  314 tat 316  Q
    |||    
T  8363825 tat 8363827  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 29650654 - 29650951
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29650654 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 29650753  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29650754 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacatacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 29650853  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||    
T  29650854 tcaacaaagtgtaatatatttttttt-cagtttctatgaattattaatttatgattttcttg----------------agggatctcccaaaaaattatt 29650936  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 7391002 - 7391229
Alignment:
Q  90 atacaatacaaaaatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaacta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7391002 atacaatacaaaaatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaacta 7391101  T
Q  190 ttgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttggga-ccgaaaattataaagggatct- 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7391102 ttgaatcatatttcaacaaagtgtaatat-tttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggacccgaaaattataaagggatctc 7391200  T
Q  288 cccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7391201 cccaaaaaattattatcttattattttat 7391229  T

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Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 21398351 - 21398650
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21398351 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 21398450  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21398451 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 21398550  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21398551 tata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 21398649  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1084710 - 1084397
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1084710 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 1084611  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1084610 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 1084511  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1084510 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 1084412  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||| ||||||||    
T  1084411 atcttactattttat 1084397  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49545789 - 49545476
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49545789 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 49545690  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49545689 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattggatcatatt 49545590  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49545589 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 49545491  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  49545490 atcttattattttat 49545476  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 10489465 - 10489778
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10489465 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaagactcttcaaaactttatgatacaatacaaa 10489564  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10489565 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 10489664  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10489665 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 10489763  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  10489764 atcttattattttat 10489778  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 45107997 - 45108313
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45107997 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 45108096  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45108097 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 45108196  T
Q  202 tcaacaaagtgtaata--tannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaatta 299  Q
    ||||||||||||||||  |          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45108197 tcaacaaagtgtaatatttttttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaatta 45108296  T
Q  300 ttatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  45108297 ttatcttattattttat 45108313  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 5926961 - 5927259
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926961 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 5927060  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927061 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaattttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 5927160  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927161 tat--ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 5927258  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27182160 - 27181859
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182160 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 27182061  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182060 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagcttcaaacaaacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 27181961  T
Q  216 tata-nnnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttt 314  Q
    ||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27181960 tatattttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaaggaatctcccaaaaaattattatcttattatttt 27181861  T
Q  315 at 316  Q
    ||    
T  27181860 at 27181859  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 14678178 - 14678491
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14678178 ggatgacgacgaagatgatacagtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 14678277  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14678278 aatacaacatctcggctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacatacttgaactttaaaggaaaacaaacagctattgaatcatatt 14678377  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14678378 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 14678476  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  14678477 atcttattattttat 14678491  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17195050 - 17194740
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17195050 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 17194951  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17194950 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacatacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 17194851  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  17194850 tcaacaaagtgtaatata-tattttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatcttccaaaaa---att 17194755  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  17194754 atcttattattttat 17194740  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 54072353 - 54072652
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54072353 atgatacagtgtctttggagcctattacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctga 54072452  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  54072453 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctcaaaacagacttgaactttaaaggaaaacagacaactattgaatcatatttcaatagagtgtaa 54072552  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54072553 tata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgatttttttgggaccgaaaattataaagggatctcccgaaaaattattatcttattatttta 54072651  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 15056065 - 15056359
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15056065 atgatacggtgtctttggagtctgttacacgaaaggaagcacttatggcgtcgaat--tcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctga 15056162  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  15056163 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacagacaactattgaatcatatttca--atagtgtaa 15056260  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15056261 tat--ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccaaaaattataaagggatctcccgaaaaattattatcttattatttta 15056358  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 316
Target Start/End: Original strand, 45117960 - 45118020
Alignment:
Q  256 ttttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45117960 ttttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 45118020  T

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Target: chr5 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37037893 - 37037579
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37037893 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcatgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 37037794  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37037793 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaagaaaacaaacaactattgaatcatatt 37037694  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37037693 tcaacaaagtgtaatatatttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 37037594  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  37037593 atcttattattttat 37037579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 3616387 - 3616700
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
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T  3616387 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 3616486  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3616487 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 3616586  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3616587 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgatttccttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 3616685  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  3616686 atcttattattttat 3616700  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 2027547 - 2027860
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027547 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 2027646  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2027647 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaatagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactactgaatcatatt 2027746  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027747 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 2027845  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  2027846 atcttattattttat 2027860  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 43489171 - 43489484
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43489171 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttgaagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 43489270  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43489271 aatacaacaccttagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 43489370  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43489371 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 43489469  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  43489470 atcttattattttat 43489484  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 23416764 - 23417076
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23416764 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaagaaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 23416863  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23416864 aatacaacacctcagctattggatgcaataagcaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 23416963  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23416964 tcaacaaagtgtaatat--tttttttttagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 23417061  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  23417062 atcttattattttat 23417076  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37827692 - 37827377
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37827692 ggatgacgatgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 37827593  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37827592 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaatagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 37827493  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatata-nnnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattat 300  Q
    ||||||||  ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37827492 tcaacaaaaggtaatatattttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggactgaaaattataaagagatctcccaaaaaattat 37827393  T
Q  301 tatcttattattttat 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  37827392 tatcttattattttat 37827377  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18003560 - 18003475
Alignment:
Q  231 gtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18003560 gtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccgaaaaattattatcttattattttat 18003475  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 316
Target Start/End: Original strand, 33336240 - 33336323
Alignment:
Q  233 ttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336240 ttctatgaattattaaattatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 33336323  T

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Target: chr2 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 12534059 - 12534372
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12534059 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 12534158  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12534159 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 12534258  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||| ||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12534259 tcatcaaagtgtaatatatttttttta-agtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 12534357  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  12534358 atcttattattttat 12534372  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 2273683 - 2273996
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273683 ggatggcgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 2273782  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273783 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaactgacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 2273882  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2273883 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcctaaaaaattatt 2273981  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  2273982 atcttattattttat 2273996  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7355620 - 7355318
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7355620 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 7355521  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7355520 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 7355421  T
Q  216 tata--nnnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattt 313  Q
    ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7355420 tatatttttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaaggaatctcccaaaaaattattatcttattattt 7355321  T
Q  314 tat 316  Q
    |||    
T  7355320 tat 7355318  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 3535997 - 3536311
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535997 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaaacacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 3536096  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagaga-tgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3536097 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagattgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatat 3536196  T
Q  201 ttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3536197 ttcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttggaaccgaaaattataaaggaatctcccaaaaaattat 3536295  T
Q  301 tatcttattattttat 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  3536296 tatcttattattttat 3536311  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43380268 - 43379971
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43380268 atgatacggtgtctttggagcctgttacacgaaaggaaacacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctga 43380169  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  43380168 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacagacaactattgaatcatatttca--gtagtgtaa 43380071  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43380070 tataatttttttt-agtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaaaggatctcccgaaaaattattatcttattatttta 43379972  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30112142 - 30111994
Alignment:
Q  167 ctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttggga 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30112142 ctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatatttttttt-cagtttctatgaattattaatttatgattttcttggga 30112044  T
Q  267 ccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30112043 ccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 30111994  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30123429 - 30123281
Alignment:
Q  167 ctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttggga 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30123429 ctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatatttttttt-cagtttctatgaattattaatttatgattttcttggga 30123331  T
Q  267 ccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30123330 ccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 30123281  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30877370 - 30877332
Alignment:
Q  278 aaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30877370 aaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 30877332  T

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Target: chr3 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 34946626 - 34946939
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34946626 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 34946725  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34946726 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 34946825  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34946826 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcatgggatcgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 34946924  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  34946925 atcttattattttat 34946939  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44552418 - 44552105
Alignment:
Q  2 ggatgtcgaagaatatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44552418 ggatgacgacgaagatgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaa 44552319  T
Q  102 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatt 201  Q
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T  44552318 aatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatttt 44552219  T
Q  202 tcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattatt 301  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44552218 tcaacaaagtgtaatata-ttttttttcagtttctataaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggttctcccaaaaaattatt 44552120  T
Q  302 atcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  44552119 atcttattattttat 44552105  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38517266 - 38516967
Alignment:
Q  16 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcatttatggtgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38517266 atgatacggtgtctttggagcctgttacgcgaaaggaagcacttatggcgtcgaacactcttcacaactttatgatacaatacaaaaatacaacacctta 38517167  T
Q  116 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 215  Q
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T  38517166 gctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacggacttgaactttaaaggaaaacaaacaattattgaatcatatttcaacaaagtgtaa 38517067  T
Q  216 tatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 315  Q
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T  38517066 tata-ttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattatttta 38516968  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 3863610 - 3863827
Alignment:
Q  98 caaaaatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagctccaaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3863610 caaaaatacaacacctcagctattggatgcaataagaaaagttagagatgagtttcaaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatca 3863709  T
Q  198 tatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaat 297  Q
    |||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3863710 tatttcaacaaagtgtaatat-tttttttttcagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctctcaaaaaat 3863808  T
Q  298 tattatcttattattttat 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3863809 tattatcttattattttat 3863827  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27644505 - 27644343
Alignment:
Q  153 caaacagacttgagctttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaattta 252  Q
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T  27644505 caaacagacttgaactttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatat-tttttttttcagtttctatgaattattaattta 27644407  T
Q  253 tgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27644406 tgatttttttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 27644343  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 316
Target Start/End: Original strand, 20394979 - 20395103
Alignment:
Q  191 tgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnncagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctccc 290  Q
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T  20394979 tgaatcatatttcaacaaagtgtaatatatttttttt-cagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatcttcc 20395077  T
Q  291 aaaaaattattatcttattattttat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20395078 aaaaaattattatcttattattttat 20395103  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28392838 - 28392693
Alignment:
Q  169 ttaaaggaaaacaaacaactattgaatcatatttcaacaaagtgtaatatannnnnnnnn-cagtttctatgaattattaatttatgattttcttgggac 267  Q
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T  28392838 ttaaaggaaaacagacaactattgaatcatatttcaatagagtgtaatatttttttttcttcagtttctatgaattattaatttatgattttattgggac 28392739  T
Q  268 cgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattt 313  Q
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T  28392738 caaaaattataaagggatctctcgaaaaattattatcttattattt 28392693  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 316
Target Start/End: Original strand, 49529790 - 49529876
Alignment:
Q  230 agtttctatgaattattaatttatgattttcttgggaccgaaaattataaagggatctcccaaaaaattattatcttattattttat 316  Q
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T  49529790 agtttctatgaattattaatttatgattttcttgggatcaaaaattataaagggatctcccgaaaaattattatcttattattttat 49529876  T

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