View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6602_low_2 (Length: 344)

Name: NF6602_low_2
Description: NF6602
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6602_low_2
NF6602_low_2
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (15-310)||(4482384-4482690)
chr7 (15-325)||(21677269-21677596)
chr7 (99-321)||(9322903-9323126)
chr7 (118-326)||(18920958-18921166)
chr7 (15-311)||(39293898-39294211)
chr7 (97-326)||(28388537-28388777)
chr7 (15-231)||(28718224-28718448)
chr7 (91-202)||(48345818-48345929)
chr7 (15-307)||(4072746-4073048)
chr7 (97-313)||(14938822-14939045)
chr7 (97-313)||(15366415-15366638)
chr7 (97-321)||(9641157-9641381)
chr7 (99-202)||(9609474-9609577)
chr7 (99-202)||(9837046-9837149)
chr7 (15-200)||(14278648-14278841)
chr7 (91-203)||(13460560-13460674)
chr7 (223-321)||(17947996-17948094)
chr7 (97-203)||(20587478-20587584)
chr7 (97-203)||(31499471-31499576)
chr7 (99-202)||(5617687-5617790)
chr7 (99-197)||(16915886-16915984)
chr7 (97-275)||(4437023-4437211)
chr7 (97-275)||(4444424-4444612)
chr7 (99-198)||(49049710-49049808)
chr7 (99-198)||(13388221-13388321)
chr7 (99-198)||(15628919-15629017)
chr7 (99-198)||(17229946-17230045)
chr7 (99-196)||(9058462-9058557)
chr7 (91-203)||(13452418-13452532)
chr7 (48-184)||(19065486-19065623)
chr7 (97-198)||(34242979-34243080)
chr7 (108-198)||(15914267-15914356)
chr7 (15-125)||(12245989-12246101)
chr7 (99-202)||(10862761-10862863)
chr7 (99-197)||(12249930-12250027)
chr7 (99-196)||(16572040-16572136)
chr7 (99-196)||(16593526-16593622)
chr7 (99-187)||(12753098-12753185)
chr7 (133-203)||(13375914-13375984)
chr7 (107-167)||(13039108-13039168)
chr7 (99-187)||(15824358-15824445)
chr7 (16-274)||(15980284-15980547)
chr7 (91-165)||(3193870-3193943)
chr7 (98-184)||(16370201-16370286)
chr7 (123-188)||(141795-141860)
chr7 (118-167)||(11582845-11582894)
chr7 (99-196)||(45455568-45455664)
chr7 (118-167)||(3054928-3054977)
chr7 (118-166)||(1938634-1938682)
chr7 (19-86)||(3135495-3135563)
chr7 (99-167)||(3893327-3893394)
chr7 (99-147)||(16917835-16917883)
chr7 (146-232)||(18081206-18081293)
chr7 (108-167)||(44863389-44863448)
chr7 (19-80)||(14302613-14302675)
chr7 (99-149)||(16921787-16921837)
chr7 (143-197)||(16929846-16929900)
chr7 (143-197)||(16935229-16935283)
chr7 (97-167)||(48624219-48624288)
chr7 (118-167)||(122716-122765)
chr7 (136-197)||(11285259-11285319)
chr7 (140-197)||(13868113-13868169)
chr7 (140-197)||(18305864-18305920)
chr7 (118-167)||(32496456-32496505)
chr7 (99-167)||(113155-113222)
chr7 (99-187)||(26072118-26072205)
chr7 (99-187)||(26095905-26095992)
chr7 (136-167)||(12545830-12545861)
chr7 (27-81)||(16206387-16206441)
chr7 (118-164)||(16209924-16209970)
chr7 (136-197)||(369055-369115)
chr7 (136-197)||(2192827-2192887)
chr7 (110-167)||(10987839-10987896)
chr7 (110-167)||(11514351-11514408)
chr7 (110-167)||(13756806-13756863)
chr7 (110-167)||(13912992-13913049)
chr7 (110-167)||(15443436-15443493)
chr7 (136-197)||(16416420-16416480)
chr7 (110-167)||(27103424-27103481)
chr7 (110-167)||(27110772-27110829)
chr7 (110-167)||(27174844-27174901)
chr7 (110-167)||(30264001-30264058)
chr7 (110-167)||(38785516-38785573)
chr7 (196-326)||(20587588-20587718)
chr7 (97-197)||(47482779-47482877)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (15-321)||(6092557-6092864)
chr2 (97-321)||(25132324-25132546)
chr2 (99-314)||(24272161-24272385)
chr2 (15-213)||(18533557-18533757)
chr2 (15-203)||(29111996-29112186)
chr2 (15-202)||(19435684-19435877)
chr2 (15-200)||(43640582-43640773)
chr2 (97-203)||(30994827-30994933)
chr2 (97-200)||(24868774-24868877)
chr2 (15-181)||(20271159-20271326)
chr2 (15-216)||(23614339-23614539)
chr2 (18-250)||(24839553-24839779)
chr2 (91-232)||(25593352-25593495)
chr2 (99-197)||(22581845-22581942)
chr2 (119-202)||(32738697-32738780)
chr2 (99-196)||(28972189-28972285)
chr2 (99-167)||(19655208-19655275)
chr2 (99-198)||(5110-5207)
chr2 (99-198)||(7319633-7319731)
chr2 (99-198)||(40642173-40642272)
chr2 (129-198)||(32117-32186)
chr2 (123-200)||(22137681-22137757)
chr2 (48-307)||(45620229-45620498)
chr2 (99-187)||(4450158-4450245)
chr2 (99-167)||(9782741-9782809)
chr2 (15-127)||(19657771-19657882)
chr2 (120-167)||(269375-269422)
chr2 (99-197)||(23823338-23823434)
chr2 (99-197)||(23825282-23825378)
chr2 (97-167)||(36892613-36892682)
chr2 (109-198)||(720597-720685)
chr2 (99-167)||(24296406-24296473)
chr2 (119-167)||(25877888-25877936)
chr2 (123-198)||(19812932-19813007)
chr2 (136-203)||(24089304-24089371)
chr2 (123-197)||(22691919-22691992)
chr2 (123-197)||(22696566-22696639)
chr2 (99-196)||(25303811-25303908)
chr2 (123-187)||(25600100-25600164)
chr2 (118-167)||(9654797-9654846)
chr2 (118-167)||(23806489-23806538)
chr2 (118-167)||(43644899-43644948)
chr2 (123-167)||(22861742-22861786)
chr2 (118-167)||(8886395-8886445)
chr2 (121-167)||(23837282-23837328)
chr2 (118-167)||(460778-460827)
chr2 (118-167)||(6877667-6877716)
chr2 (110-167)||(12726277-12726334)
chr2 (196-268)||(30994937-30995009)
chr2 (110-157)||(17398470-17398517)
chr2 (97-188)||(23779786-23779876)
chr2 (136-197)||(3801335-3801395)
chr2 (110-167)||(5890171-5890228)
chr2 (110-167)||(8941658-8941715)
chr2 (110-167)||(11233125-11233182)
chr2 (110-167)||(14908312-14908369)
chr2 (195-236)||(19648269-19648310)
chr2 (136-197)||(19888949-19889009)
chr2 (110-167)||(22514972-22515029)
chr2 (110-167)||(23772762-23772819)
chr2 (110-167)||(23818405-23818462)
chr2 (110-167)||(24687543-24687600)
chr2 (110-167)||(28777574-28777631)
chr2 (136-188)||(12638216-12638268)
chr2 (134-190)||(27401937-27401993)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (16-320)||(29162665-29162982)
chr6 (97-297)||(15006485-15006685)
chr6 (18-321)||(16131362-16131681)
chr6 (98-321)||(22595494-22595728)
chr6 (100-321)||(22467942-22468176)
chr6 (99-321)||(34965037-34965273)
chr6 (19-305)||(21929558-21929859)
chr6 (97-326)||(31469375-31469614)
chr6 (97-314)||(33540069-33540294)
chr6 (99-321)||(19852371-19852600)
chr6 (99-200)||(12310843-12310944)
chr6 (90-203)||(17375554-17375668)
chr6 (116-305)||(23219098-23219288)
chr6 (99-200)||(22846354-22846455)
chr6 (96-200)||(14150809-14150911)
chr6 (99-198)||(940964-941063)
chr6 (99-202)||(25649483-25649586)
chr6 (98-200)||(17085393-17085494)
chr6 (15-184)||(4174466-4174643)
chr6 (15-167)||(4230095-4230255)
chr6 (99-184)||(21621355-21621440)
chr6 (15-122)||(23219619-23219728)
chr6 (99-194)||(7829751-7829845)
chr6 (99-198)||(18383510-18383609)
chr6 (161-337)||(19670598-19670785)
chr6 (91-184)||(17858218-17858311)
chr6 (99-198)||(17790995-17791094)
chr6 (98-200)||(6092756-6092857)
chr6 (123-197)||(15080708-15080782)
chr6 (97-167)||(17787692-17787761)
chr6 (99-196)||(25917898-25917994)
chr6 (99-198)||(16889644-16889742)
chr6 (99-196)||(25369282-25369378)
chr6 (108-196)||(22866325-22866413)
chr6 (97-221)||(29603774-29603895)
chr6 (99-198)||(22364074-22364173)
chr6 (256-317)||(15295493-15295555)
chr6 (99-197)||(25646773-25646869)
chr6 (97-167)||(25746145-25746214)
chr6 (15-88)||(31163070-31163144)
chr6 (99-187)||(16104776-16104863)
chr6 (108-188)||(18422040-18422120)
chr6 (99-167)||(32896228-32896295)
chr6 (123-197)||(33322957-33323031)
chr6 (118-167)||(19985101-19985150)
chr6 (123-188)||(22428399-22428464)
chr6 (129-188)||(18775432-18775491)
chr6 (108-187)||(31626665-31626744)
chr6 (129-167)||(18740591-18740629)
chr6 (48-81)||(14352652-14352685)
chr6 (99-164)||(23151655-23151719)
chr6 (194-314)||(12310949-12311066)
chr6 (110-167)||(1651864-1651921)
chr6 (48-88)||(6777774-6777815)
chr6 (110-167)||(10487111-10487168)
chr6 (136-197)||(14628590-14628650)
chr6 (110-167)||(16229812-16229869)
chr6 (136-197)||(16235679-16235739)
chr6 (110-167)||(16378159-16378216)
chr6 (110-167)||(16385483-16385540)
chr6 (110-167)||(16645754-16645811)
chr6 (110-167)||(16651120-16651177)
chr6 (136-197)||(16828032-16828092)
chr6 (136-197)||(18005079-18005139)
chr6 (110-167)||(18088664-18088721)
chr6 (99-188)||(18128265-18128353)
chr6 (110-167)||(27655960-27656017)
chr6 (136-197)||(33316635-33316695)
chr6 (123-167)||(13016711-13016755)
chr6 (136-164)||(18397107-18397135)
chr6 (149-197)||(18578745-18578792)
chr6 (136-188)||(23975627-23975679)
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (15-317)||(6817387-6817697)
chr3 (132-337)||(31416123-31416328)
chr3 (99-321)||(41659721-41659941)
chr3 (15-321)||(15551649-15551964)
chr3 (15-321)||(17760557-17760872)
chr3 (15-321)||(19061877-19062192)
chr3 (15-232)||(8602484-8602700)
chr3 (69-321)||(5230414-5230680)
chr3 (27-305)||(15988645-15988938)
chr3 (96-321)||(43429369-43429606)
chr3 (97-321)||(17320410-17320646)
chr3 (15-307)||(25106101-25106394)
chr3 (97-321)||(21168550-21168772)
chr3 (15-203)||(14182155-14182346)
chr3 (97-202)||(6230494-6230599)
chr3 (97-262)||(14819681-14819856)
chr3 (15-184)||(17391232-17391402)
chr3 (100-203)||(4147531-4147634)
chr3 (19-203)||(12950797-12950987)
chr3 (97-203)||(4164081-4164186)
chr3 (15-178)||(37918661-37918826)
chr3 (15-232)||(38378035-38378250)
chr3 (15-135)||(31414399-31414519)
chr3 (15-198)||(38813159-38813348)
chr3 (97-313)||(18968190-18968413)
chr3 (96-271)||(11517295-11517469)
chr3 (91-232)||(10902659-10902802)
chr3 (97-181)||(11636762-11636846)
chr3 (99-198)||(12020158-12020257)
chr3 (99-198)||(17202873-17202972)
chr3 (97-200)||(33371202-33371305)
chr3 (99-198)||(15548743-15548841)
chr3 (99-202)||(34558098-34558201)
chr3 (99-188)||(30204621-30204709)
chr3 (43-184)||(40041356-40041500)
chr3 (99-198)||(17137614-17137712)
chr3 (99-197)||(14287239-14287336)
chr3 (129-202)||(15515837-15515910)
chr3 (119-187)||(11330846-11330914)
chr3 (99-187)||(14296656-14296743)
chr3 (99-187)||(14302283-14302370)
chr3 (99-198)||(39654077-39654176)
chr3 (108-196)||(40937860-40937948)
chr3 (99-187)||(47786722-47786809)
chr3 (108-187)||(12563392-12563471)
chr3 (122-197)||(17536933-17537007)
chr3 (99-197)||(11199402-11199499)
chr3 (99-197)||(14523265-14523361)
chr3 (124-198)||(25769449-25769523)
chr3 (99-167)||(6148710-6148777)
chr3 (123-187)||(53900472-53900536)
chr3 (99-198)||(14061097-14061195)
chr3 (118-196)||(35121838-35121916)
chr3 (119-167)||(45581047-45581095)
chr3 (123-198)||(15874423-15874497)
chr3 (129-187)||(18008985-18009043)
chr3 (118-167)||(2045540-2045589)
chr3 (133-198)||(11884103-11884168)
chr3 (99-188)||(50113978-50114066)
chr3 (99-167)||(22146132-22146199)
chr3 (99-183)||(55443735-55443818)
chr3 (136-198)||(12490701-12490763)
chr3 (97-167)||(13815802-13815871)
chr3 (90-167)||(14968090-14968168)
chr3 (129-167)||(17098859-17098897)
chr3 (136-198)||(48419875-48419937)
chr3 (136-197)||(7851594-7851654)
chr3 (99-197)||(11063007-11063100)
chr3 (118-167)||(19230264-19230313)
chr3 (118-167)||(19262912-19262961)
chr3 (119-183)||(8629987-8630051)
chr3 (129-167)||(319501-319539)
chr3 (129-167)||(12351724-12351762)
chr3 (118-167)||(2048269-2048318)
chr3 (118-167)||(10736770-10736819)
chr3 (195-290)||(4164189-4164281)
chr3 (195-290)||(6230603-6230695)
chr3 (137-167)||(15861110-15861140)
chr3 (129-167)||(23490715-23490753)
chr3 (110-167)||(1469526-1469583)
chr3 (110-167)||(2451439-2451496)
chr3 (110-167)||(8270277-8270334)
chr3 (110-167)||(8277388-8277445)
chr3 (110-167)||(8306197-8306254)
chr3 (136-197)||(12796634-12796694)
chr3 (110-167)||(15574229-15574286)
chr3 (110-167)||(15613248-15613305)
chr3 (110-167)||(16746045-16746102)
chr3 (136-197)||(16818954-16819014)
chr3 (136-197)||(18908590-18908650)
chr3 (136-197)||(22272945-22273005)
chr3 (110-167)||(30151560-30151617)
chr3 (110-167)||(41268465-41268522)
chr3 (110-167)||(44227650-44227707)
chr3 (110-167)||(53768884-53768941)
chr3 (16-80)||(8022184-8022248)
chr3 (99-167)||(19572680-19572747)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (98-321)||(5770042-5770264)
chr1 (99-321)||(41213506-41213727)
chr1 (99-321)||(40555480-40555702)
chr1 (98-321)||(21041898-21042119)
chr1 (15-231)||(20191930-20192148)
chr1 (97-290)||(46143915-46144101)
chr1 (15-232)||(78265-78486)
chr1 (99-314)||(5472231-5472454)
chr1 (97-326)||(18164282-18164511)
chr1 (15-290)||(20820561-20820842)
chr1 (142-314)||(33384034-33384220)
chr1 (15-149)||(33395150-33395285)
chr1 (97-268)||(40438121-40438305)
chr1 (97-321)||(52397766-52397997)
chr1 (97-200)||(29217327-29217431)
chr1 (97-203)||(49999184-49999290)
chr1 (99-290)||(21193297-21193495)
chr1 (99-198)||(37235797-37235896)
chr1 (91-232)||(25093040-25093183)
chr1 (99-202)||(22837247-22837349)
chr1 (99-202)||(22837450-22837552)
chr1 (99-187)||(17021801-17021889)
chr1 (99-198)||(20956873-20956971)
chr1 (226-321)||(40438304-40438399)
chr1 (123-197)||(27331113-27331186)
chr1 (99-197)||(36358161-36358258)
chr1 (99-188)||(5676522-5676610)
chr1 (99-198)||(51658242-51658341)
chr1 (99-202)||(17607156-17607257)
chr1 (131-221)||(22148259-22148346)
chr1 (99-187)||(22408149-22408236)
chr1 (120-167)||(35053087-35053134)
chr1 (123-197)||(9786324-9786397)
chr1 (118-167)||(37846371-37846420)
chr1 (123-187)||(35524359-35524423)
chr1 (118-167)||(20443952-20444001)
chr1 (118-167)||(20529692-20529741)
chr1 (118-167)||(44036796-44036845)
chr1 (123-167)||(18505593-18505637)
chr1 (107-167)||(20895681-20895741)
chr1 (99-187)||(21716358-21716443)
chr1 (99-198)||(19601428-19601524)
chr1 (123-166)||(27673055-27673098)
chr1 (99-198)||(38035445-38035543)
chr1 (129-167)||(20929693-20929731)
chr1 (16-88)||(15806999-15807072)
chr1 (118-167)||(21857699-21857748)
chr1 (136-197)||(22080101-22080161)
chr1 (136-167)||(41217483-41217514)
chr1 (223-313)||(50001918-50002005)
chr1 (110-167)||(5074184-5074241)
chr1 (110-167)||(7642465-7642522)
chr1 (110-167)||(17003049-17003106)
chr1 (110-167)||(17146766-17146823)
chr1 (136-197)||(20252253-20252313)
chr1 (110-167)||(20827105-20827162)
chr1 (110-167)||(22034071-22034128)
chr1 (136-197)||(22352196-22352256)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (97-321)||(1813-2036)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (99-321)||(50224001-50224224)
chr4 (99-321)||(47470176-47470401)
chr4 (15-305)||(54365835-54366130)
chr4 (90-321)||(10239267-10239509)
chr4 (62-319)||(41919044-41919315)
chr4 (97-321)||(19557436-19557671)
chr4 (15-321)||(15215994-15216309)
chr4 (97-203)||(38763006-38763112)
chr4 (69-203)||(12136103-12136239)
chr4 (90-321)||(24237013-24237234)
chr4 (97-321)||(13595864-13596088)
chr4 (97-326)||(13448875-13449114)
chr4 (97-203)||(5407378-5407484)
chr4 (99-290)||(41258187-41258385)
chr4 (15-125)||(5372874-5372985)
chr4 (98-200)||(7187767-7187869)
chr4 (97-202)||(7966435-7966540)
chr4 (99-200)||(42706939-42707039)
chr4 (15-198)||(15116051-15116239)
chr4 (98-188)||(17213707-17213797)
chr4 (91-307)||(19623874-19624090)
chr4 (99-198)||(34198012-34198110)
chr4 (99-203)||(17378031-17378137)
chr4 (99-196)||(12246079-12246175)
chr4 (99-197)||(30236398-30236494)
chr4 (129-198)||(41167785-41167854)
chr4 (99-232)||(12732375-12732509)
chr4 (99-183)||(12901618-12901701)
chr4 (99-167)||(44054114-44054181)
chr4 (108-187)||(13752154-13752233)
chr4 (100-202)||(18275042-18275142)
chr4 (118-197)||(18496339-18496418)
chr4 (129-187)||(21961456-21961514)
chr4 (99-196)||(14867614-14867709)
chr4 (99-167)||(20813877-20813944)
chr4 (127-198)||(27959286-27959357)
chr4 (99-198)||(37958885-37958983)
chr4 (99-166)||(53909737-53909803)
chr4 (16-132)||(9650147-9650265)
chr4 (136-198)||(43283322-43283384)
chr4 (118-167)||(109694-109743)
chr4 (99-196)||(19824315-19824411)
chr4 (99-167)||(12838179-12838246)
chr4 (107-167)||(13244552-13244612)
chr4 (118-187)||(15853145-15853214)
chr4 (136-197)||(34393296-34393356)
chr4 (119-167)||(8874352-8874400)
chr4 (107-167)||(54120189-54120249)
chr4 (108-187)||(45460889-45460972)
chr4 (141-198)||(13814725-13814782)
chr4 (96-304)||(14569525-14569743)
chr4 (99-167)||(16366611-16366678)
chr4 (48-88)||(21958105-21958145)
chr4 (98-157)||(33240609-33240667)
chr4 (120-187)||(33738404-33738471)
chr4 (124-167)||(53706837-53706880)
chr4 (136-197)||(7134533-7134593)
chr4 (136-197)||(8372518-8372578)
chr4 (110-167)||(10486896-10486953)
chr4 (136-197)||(15211426-15211486)
chr4 (136-197)||(15274692-15274752)
chr4 (110-167)||(15296071-15296128)
chr4 (136-197)||(18166785-18166845)
chr4 (158-203)||(18241083-18241128)
chr4 (136-197)||(18246089-18246149)
chr4 (110-167)||(26337710-26337767)
chr4 (136-197)||(26678090-26678150)
chr4 (213-307)||(17378153-17378249)
chr4 (48-80)||(20597752-20597784)
chr4 (123-187)||(23272058-23272122)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (96-321)||(23236241-23236477)
chr5 (97-321)||(3420666-3420899)
chr5 (91-321)||(19872018-19872261)
chr5 (97-321)||(5623263-5623485)
chr5 (97-324)||(26561621-26561857)
chr5 (15-321)||(11963701-11964025)
chr5 (61-232)||(16837555-16837728)
chr5 (15-311)||(14345412-14345728)
chr5 (99-290)||(24082251-24082450)
chr5 (18-202)||(24227689-24227882)
chr5 (15-198)||(5453053-5453242)
chr5 (97-308)||(6454824-6455042)
chr5 (15-124)||(20456319-20456429)
chr5 (99-198)||(7726834-7726932)
chr5 (99-198)||(13793373-13793472)
chr5 (99-198)||(37189952-37190051)
chr5 (97-203)||(29912279-29912385)
chr5 (99-197)||(23453100-23453197)
chr5 (99-197)||(23460344-23460441)
chr5 (99-197)||(23464605-23464702)
chr5 (99-305)||(33628106-33628327)
chr5 (91-198)||(21615245-21615351)
chr5 (110-307)||(11765570-11765769)
chr5 (99-196)||(24185124-24185220)
chr5 (99-187)||(11338789-11338876)
chr5 (99-187)||(21392358-21392445)
chr5 (97-197)||(28257698-28257796)
chr5 (52-187)||(3671669-3671810)
chr5 (97-167)||(4863497-4863566)
chr5 (99-167)||(24470501-24470568)
chr5 (15-87)||(11765500-11765573)
chr5 (123-167)||(20710718-20710762)
chr5 (99-183)||(21228219-21228303)
chr5 (107-167)||(27185693-27185753)
chr5 (129-167)||(21661608-21661646)
chr5 (136-198)||(23492145-23492207)
chr5 (136-198)||(28888124-28888186)
chr5 (136-197)||(11579833-11579893)
chr5 (123-196)||(19403732-19403804)
chr5 (110-167)||(20614840-20614897)
chr5 (136-197)||(10218-10278)
chr5 (136-197)||(1221855-1221915)
chr5 (110-167)||(4201961-4202018)
chr5 (136-197)||(9732811-9732871)
chr5 (136-197)||(10780334-10780394)
chr5 (136-197)||(11340510-11340570)
chr5 (110-167)||(16534337-16534394)
chr5 (136-197)||(17473921-17473981)
chr5 (136-197)||(17907726-17907786)
chr5 (136-197)||(18780264-18780324)
chr5 (110-167)||(21934153-21934210)
chr5 (110-167)||(21940323-21940380)
chr5 (110-167)||(22368671-22368728)
chr5 (146-232)||(23412165-23412253)
chr5 (136-197)||(25212011-25212071)
chr5 (136-197)||(25276163-25276223)
chr5 (110-167)||(25902319-25902376)
chr5 (136-197)||(29192886-29192946)
chr5 (133-187)||(32968027-32968083)
chr5 (110-167)||(35580482-35580539)
chr5 (110-167)||(37011157-37011214)
chr5 (110-167)||(37051212-37051269)
chr5 (48-80)||(10178960-10178992)
[»] chr8 (86 HSPs)
chr8 (97-321)||(7468404-7468633)
chr8 (99-321)||(23118685-23118909)
chr8 (15-316)||(23216765-23217074)
chr8 (15-321)||(17264602-17264928)
chr8 (97-321)||(20707893-20708128)
chr8 (97-321)||(24554408-24554643)
chr8 (98-321)||(17499963-17500181)
chr8 (96-290)||(18263247-18263438)
chr8 (99-321)||(33170356-33170590)
chr8 (15-307)||(24237146-24237440)
chr8 (97-321)||(22499136-22499373)
chr8 (15-326)||(19333780-19334110)
chr8 (15-320)||(45561445-45561773)
chr8 (97-326)||(21233864-21234104)
chr8 (18-232)||(11600253-11600470)
chr8 (15-232)||(22319816-22320040)
chr8 (15-201)||(25293761-25293952)
chr8 (15-201)||(25755750-25755941)
chr8 (15-302)||(23879075-23879376)
chr8 (97-321)||(24266101-24266332)
chr8 (15-269)||(23350317-23350574)
chr8 (101-200)||(37655485-37655584)
chr8 (99-305)||(24906046-24906268)
chr8 (99-202)||(15931555-15931658)
chr8 (15-124)||(25608220-25608329)
chr8 (98-202)||(23154446-23154549)
chr8 (99-202)||(26009662-26009766)
chr8 (91-245)||(22883954-22884109)
chr8 (97-202)||(5851731-5851835)
chr8 (252-321)||(18043151-18043220)
chr8 (99-187)||(20655930-20656017)
chr8 (90-198)||(23835460-23835568)
chr8 (99-198)||(17283469-17283567)
chr8 (106-200)||(29296110-29296203)
chr8 (108-198)||(38531797-38531887)
chr8 (99-196)||(21679351-21679446)
chr8 (99-200)||(23229136-23229236)
chr8 (99-197)||(17731374-17731471)
chr8 (107-184)||(11542225-11542301)
chr8 (129-197)||(21200024-21200092)
chr8 (99-187)||(25120671-25120758)
chr8 (99-198)||(21695814-21695912)
chr8 (99-198)||(22737821-22737918)
chr8 (99-198)||(39448633-39448731)
chr8 (99-197)||(28543068-28543164)
chr8 (118-198)||(21192587-21192667)
chr8 (97-167)||(20479839-20479908)
chr8 (118-167)||(29758505-29758554)
chr8 (119-167)||(24387599-24387647)
chr8 (99-187)||(41243874-41243961)
chr8 (56-126)||(22311362-22311433)
chr8 (108-167)||(22323409-22323468)
chr8 (96-230)||(16000360-16000496)
chr8 (136-197)||(269862-269922)
chr8 (136-197)||(645999-646059)
chr8 (136-197)||(831734-831794)
chr8 (118-167)||(18769996-18770045)
chr8 (123-188)||(37605209-37605274)
chr8 (136-197)||(41509151-41509211)
chr8 (118-167)||(43375498-43375547)
chr8 (118-166)||(16204184-16204232)
chr8 (129-200)||(33612877-33612948)
chr8 (97-183)||(16416467-16416552)
chr8 (110-167)||(17148105-17148162)
chr8 (196-232)||(22311236-22311272)
chr8 (48-88)||(23638161-23638201)
chr8 (196-231)||(25608099-25608134)
chr8 (97-167)||(19995063-19995132)
chr8 (110-167)||(273076-273133)
chr8 (110-167)||(642716-642773)
chr8 (110-167)||(828522-828579)
chr8 (136-197)||(3433747-3433807)
chr8 (110-167)||(5236421-5236478)
chr8 (15-56)||(11542327-11542368)
chr8 (110-167)||(16874800-16874857)
chr8 (110-167)||(21846365-21846422)
chr8 (110-167)||(21853770-21853827)
chr8 (110-167)||(22090318-22090375)
chr8 (136-197)||(23508979-23509039)
chr8 (110-167)||(24663120-24663177)
chr8 (136-197)||(24719543-24719603)
chr8 (153-190)||(25261551-25261588)
chr8 (136-197)||(28835891-28835951)
chr8 (110-167)||(43683880-43683937)
chr8 (136-188)||(16041598-16041650)
chr8 (136-188)||(16043274-16043326)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (99-321)||(84529-84747)
scaffold0004 (99-321)||(25658-25891)
scaffold0004 (140-187)||(331054-331101)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (21-231)||(22897-23101)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (97-326)||(3543-3783)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (97-308)||(5847-6066)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (97-326)||(35995-36235)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (15-200)||(6886-7080)
scaffold0090 (15-184)||(36944-37113)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (100-290)||(2874-3061)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (15-307)||(256550-256847)
scaffold0009 (96-230)||(98798-98934)
scaffold0009 (108-188)||(236337-236417)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (99-321)||(129985-130214)
scaffold0022 (99-198)||(106742-106840)
scaffold0022 (99-198)||(107824-107922)
scaffold0022 (120-196)||(114157-114233)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (19-173)||(13145-13300)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (97-326)||(20218-20459)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (99-321)||(99253-99463)
scaffold0003 (118-167)||(217640-217689)
scaffold0003 (136-197)||(5132-5192)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (97-290)||(25805-26005)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (97-326)||(104053-104293)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (97-263)||(6725-6901)
scaffold0327 (99-166)||(4274-4340)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (15-290)||(121728-122005)
scaffold0032 (108-200)||(106461-106553)
scaffold0032 (118-167)||(53877-53926)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (99-202)||(11668-11770)
scaffold0107 (110-167)||(29577-29634)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (99-202)||(99031-99134)
scaffold0031 (99-197)||(30230-30327)
scaffold0031 (118-196)||(68511-68589)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (97-203)||(807-913)
scaffold0174 (15-184)||(22329-22502)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (99-200)||(19652-19753)
scaffold0021 (99-200)||(29228-29329)
scaffold0021 (99-196)||(9793-9889)
scaffold0021 (99-177)||(138660-138737)
scaffold0021 (99-187)||(76514-76602)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (99-202)||(1958-2061)
scaffold0047 (151-232)||(73197-73279)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (97-202)||(1480-1585)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (53-232)||(10463-10650)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (119-308)||(18748-18945)
scaffold0138 (99-198)||(24267-24365)
scaffold0138 (136-197)||(26362-26422)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (99-197)||(25450-25548)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (131-326)||(141148-141354)
scaffold0001 (143-197)||(78251-78304)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (107-194)||(9603-9690)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (15-132)||(15096-15214)
scaffold0231 (96-167)||(15705-15777)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (15-232)||(19519-19739)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (97-202)||(199208-199312)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (90-232)||(45431-45574)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (99-198)||(29339-29438)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (108-198)||(5250-5340)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (98-196)||(12490-12587)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (99-197)||(7215-7312)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (97-202)||(820-924)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (99-196)||(8304-8400)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (99-216)||(55653-55771)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (99-198)||(33712-33811)
scaffold0013 (260-317)||(16689-16747)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (100-198)||(51547-51645)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (52-167)||(11587-11702)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (117-201)||(70161-70244)
scaffold0028 (99-198)||(77932-78030)
scaffold0028 (136-197)||(91047-91107)
scaffold0028 (195-263)||(70249-70316)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (99-197)||(2824-2920)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (98-196)||(2920-3017)
scaffold0409 (98-196)||(11175-11272)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (99-185)||(14141-14226)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (98-203)||(4172-4280)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (123-196)||(144905-144978)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (27-113)||(3216-3303)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (99-198)||(6017-6115)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (108-187)||(5771-5850)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (121-200)||(31508-31586)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (99-198)||(7476-7574)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (131-198)||(1568-1635)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (97-167)||(1292-1361)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (99-197)||(92169-92265)
scaffold0023 (110-167)||(11138-11195)
scaffold0023 (136-197)||(86178-86238)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (99-188)||(59790-59878)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (107-187)||(26799-26879)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (129-196)||(6809-6876)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (99-197)||(2498-2595)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (97-232)||(4600-4736)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (99-197)||(4712-4808)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (123-197)||(6899-6972)
scaffold0338 (21-81)||(18503-18564)
[»] scaffold0725 (1 HSPs)
scaffold0725 (129-231)||(7267-7363)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (136-197)||(7356-7416)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (129-198)||(3513-3581)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (136-197)||(45841-45901)
scaffold0102 (99-167)||(37706-37773)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (118-167)||(249399-249448)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (118-167)||(125303-125352)
scaffold0011 (99-183)||(72304-72387)
scaffold0011 (99-183)||(76685-76768)
scaffold0011 (99-167)||(256814-256881)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (118-198)||(3400-3479)
scaffold0808 (48-184)||(5579-5721)
[»] scaffold0786 (1 HSPs)
scaffold0786 (123-167)||(5010-5054)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (99-187)||(13727-13814)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (123-183)||(12419-12479)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (99-167)||(21313-21380)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (99-187)||(26647-26734)
scaffold0037 (129-188)||(66607-66666)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (99-163)||(20810-20873)
scaffold0008 (99-167)||(28396-28463)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (108-187)||(31702-31781)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (99-166)||(78668-78734)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (97-167)||(7272-7341)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (124-166)||(4373-4415)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (121-167)||(19497-19543)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (136-197)||(2386-2446)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (136-197)||(5250-5310)
scaffold0383 (136-197)||(239-299)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (98-187)||(7027-7114)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (118-183)||(36325-36390)
scaffold0078 (110-167)||(39446-39503)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (136-197)||(77509-77569)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (123-167)||(7124-7168)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (129-167)||(17473-17511)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (97-167)||(40925-40994)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (136-194)||(27864-27921)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (118-164)||(37576-37622)
[»] scaffold1610 (1 HSPs)
scaffold1610 (118-167)||(119-168)
[»] scaffold1605 (1 HSPs)
scaffold1605 (118-167)||(1411-1460)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (136-197)||(5313-5373)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (123-196)||(3996-4069)
scaffold0342 (136-197)||(2687-2747)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (136-197)||(10151-10211)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (136-197)||(17646-17706)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (136-197)||(712-772)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (110-167)||(25484-25541)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (136-197)||(24604-24664)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (136-197)||(94178-94238)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (96-304)||(247633-247851)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (52-88)||(4303-4339)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (97-197)||(3652-3750)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (108-167)||(4009-4068)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (107-166)||(113-172)
scaffold0407 (107-166)||(6577-6636)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (195-314)||(3055-3171)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (136-167)||(30978-31009)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (188-235)||(12007-12053)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (136-167)||(56146-56177)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (129-167)||(13911-13949)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (97-167)||(17943-18012)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (136-197)||(2967-3027)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (110-167)||(15823-15880)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (136-197)||(28493-28553)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (110-167)||(33341-33398)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (15-56)||(8775-8816)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (110-167)||(20874-20931)
scaffold0141 (110-167)||(25129-25186)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (110-167)||(3450-3507)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (110-167)||(37515-37572)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (136-197)||(30561-30621)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (21-80)||(24151-24211)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4482690 - 4482384
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  4482690 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgta 4482591  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgc-----------ttgg 203  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  4482590 aagcttacccccagtgatttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggtgattgcttgg 4482491  T
Q  204 atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctggat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4482490 atagcgggagctatctccgttatcgtttcattagagtcttaggataggctttgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattgtttattttggat 4482391  T
Q  304 ttattta 310  Q
    |||||||    
T  4482390 ttattta 4482384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 21677269 - 21677596
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  21677269 atcatgtgatgctagtattctaggagga-tggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgattgatgtg 21677367  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgc-tttggtgag-----------t 196  Q
    ||||||||||||| ||| |      | |||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||           |    
T  21677368 aagcttacccccattggatctgtaatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagactgcgtgcatgattagttgcttttggtgagttgcttggtgat 21677467  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||    
T  21677468 tgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtctccgtagagtcttaggatagactctgatctaggatgcctgtctgatgattattctatattgtttat 21677567  T
Q  297 tctggatttatttatgttgtggagaattt 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21677568 tctggatttatttatgttgaggagaattt 21677596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Original strand, 9322903 - 9323126
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9322903 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatcgatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttttggtgagtt 9323002  T
Q  198 gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttatt 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9323003 gcttggatatcgggagctatctccgttatagtttccttagagtcttagggtaggctctgctttaggatgtttgtcttatgattattctagattttttatt 9323102  T
Q  298 ctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9323103 gtggatttatttatgttgtggaga 9323126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 326
Target Start/End: Original strand, 18920958 - 18921166
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagctat 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18920958 cttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagcaat 18921057  T
Q  218 ctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtctta-taattattctagattgtttattctggatttatttatgttgt 316  Q
    |||  |||||| |||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  18921058 ctctgttatcggttccgtagagtcgtaggataggctctgatctaggat-tttgtcttacgatttattatagattgtctatcctggatttatttatgtttt 18921156  T
Q  317 ggagaatttt 326  Q
    |||| |||||    
T  18921157 ggaggatttt 18921166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 39293898 - 39294211
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaa-tgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  39293898 atcatgcgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatacatgaaatccttgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 39293997  T
Q  113 taaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt--gctttggtgag-----------ttgc 199  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    |||||||||           ||||    
T  39293998 tgaagcttagccccagtggttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggcagacgaagtgcatgattagtttgattttggtgagttgcttgatgattgc 39294097  T
Q  200 ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| | || ||||| |||||||||| || || |||| |||||||||||||| || |     
T  39294098 ttggatagcgggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcttatggtaggctctgatctaggatgcctatctttatgattattctagattggttttg 39294197  T
Q  298 ctggatttatttat 311  Q
    ||||||||||||||    
T  39294198 ctggatttatttat 39294211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28388777 - 28388537
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag- 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  28388777 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaggggttttgaccgcctacctgtttatatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgagt 28388678  T
Q  196 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattattc 284  Q
              ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  || |||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| | |||||     
T  28388677 tgcccggtgattgcttggataacgggagctatctccgttatcggttcggtagagtcgtaggatagactatgatctaggatgt-tgtcttatgacttatta 28388579  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28388578 tagattgtctatcctggatttatttatgtattggagaatttt 28388537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28718448 - 28718224
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||     
T  28718448 atcatgtgatgctagaattctagaagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattaatgtg 28718349  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgagttgcttggata 206  Q
    ||||||||||||| ||| |      | |||||||||||| | |||||| ||||||||||   ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  28718348 aagcttacccccagtggatctatgatggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcatgattagtttgctttcagtgagttgcttggata 28718249  T
Q  207 gcgggagctatctccattatcgttt 231  Q
    |  ||||||||| || |||||||||    
T  28718248 gtaggagctatccccgttatcgttt 28718224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48345929 - 48345818
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttg 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  48345929 tttacgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatgattttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttg 48345830  T
Q  191 gtgagttgcttg 202  Q
    ||||||||||||    
T  48345829 gtgagttgcttg 48345818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 4072746 - 4073048
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4072746 atcatgtgatgttagtattttaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaacccttgaatgcttatgttg-tttatgttgattatgattgatgt 4072844  T
Q  114 aaagcttacccccaatggt-----tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct------ttggtgagttgcttg 202  Q
     ||||| ||||| | ||||      | |||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||| |||||| |      |||||||| ||||||    
T  4072845 gaagctaacccctagtggtctgtggtggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggagtagttgttgatttcttggtgag-tgcttg 4072943  T
Q  203 gatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctgg 301  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||  || ||  ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  4072944 gatagtgggagctttctccgttatcg-gtctttggagtcttagagtaggctctgatctaggatgtatgtctttatgattattttagattgtctatgctgg 4073042  T
Q  302 atttat 307  Q
    ||||||    
T  4073043 atttat 4073048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14939045 - 14938822
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  14939045 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgtaggattagttgcttcggtgagt 14938947  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           ||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  14938946 tgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggtttcttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgactattct 14938850  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgt 313  Q
    ||||| | | || |||||||||||||||    
T  14938849 agattatctgttgtggatttatttatgt 14938822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15366638 - 15366415
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  15366638 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgtaggattagttgcttcggtgagt 15366540  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           ||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  15366539 tgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggtttcttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgactattct 15366443  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgt 313  Q
    ||||| | | || |||||||||||||||    
T  15366442 agattatctgttgtggatttatttatgt 15366415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9641381 - 9641157
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  9641381 ttgattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctac----ctgtatggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgcttttggtga 9641286  T
Q  195 g-----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattat 282  Q
    |           |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||          ||||||||| |||| |||||    
T  9641285 gttgcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggct----------atgtctgtctttatgattat 9641196  T
Q  283 tctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9641195 tctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 9641157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9609577 - 9609474
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9609577 gattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttacttcggtgagttg 9609478  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  9609477 cttg 9609474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9837149 - 9837046
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9837149 gattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttacttcggtgagttg 9837050  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  9837049 cttg 9837046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 14278648 - 14278841
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  14278648 atcatatgatgctagtattctgggagggatggttatgtaaatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 14278747  T
Q  114 aaagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgctttggtgagttgct 200  Q
     ||||||||||| | ||| |      | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  14278748 gaagcttacccctagtggatctgtgatggaccacctacctgtctttatggatgggtagacgaagtgcaggactagtttgcttttgggagttgct 14278841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13460674 - 13460560
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  13460674 tttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtttgcttt 13460575  T
Q  190 -ggtgagttgcttgg 203  Q
     |||||||| |||||    
T  13460574 cggtgagtttcttgg 13460560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 321
Target Start/End: Original strand, 17947996 - 17948094
Alignment:
Q  223 ttatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17947996 ttatcgtttcctttgagtcttagggtaggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattgtttattctggatttatttatgttgttgaga 17948094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 20587478 - 20587584
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||    
T  20587478 ttgattttgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgacatgcaggattagttgattcggtgagt 20587577  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    || ||||    
T  20587578 tgtttgg 20587584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31499576 - 31499471
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31499576 ttgattacgatcgatgtaaagcttacccc-agtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgcttcggtgagt 31499478  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  31499477 tgcttgg 31499471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5617790 - 5617687
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  5617790 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgatgagttgcttcagtgagttg 5617691  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  5617690 cttg 5617687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16915984 - 16915886
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16915984 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagtt 16915886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4437211 - 4437023
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||    
T  4437211 ttgattttgattgatgtaaatcttacccctagtgattttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagacaacgtgtaggattagttgcttcagtgagt 4437112  T
Q  197 tgcttg----------gatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtctta 275  Q
    ||||||          |||| | ||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4437111 tgcttgatgcttgtttgatatcaggagctatctccggtatcgatttcttagagtcttaggattggctctgatctaggatgtttgtctta 4437023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4444612 - 4444424
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  4444612 ttgattttgattgatgtaaatcttacccctagtggttttgatcgcctacatgtgtgtatagatgggtagacgacgtgcaggattagttgcttcggtgagt 4444513  T
Q  197 tgc----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtctta 275  Q
    |||          ||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||| | |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4444512 tgcttggtgcttgttggatatcgggagctatcaccagtttcgttttcttagaatcttaggattggctctgatctaggatgtttgtctta 4444424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 49049710 - 49049808
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49049710 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttg 49049808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13388321 - 13388221
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  13388321 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagtt 13388222  T
Q  198 g 198  Q
    |    
T  13388221 g 13388221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15629017 - 15628919
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15629017 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgatgtgtaggattagttgctctggtgagttg 15628919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 17229946 - 17230045
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  17229946 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgagtagacgctgtgcaggattagttgctccggtgagttg 17230045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 9058462 - 9058557
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  9058462 gattatgattgatgtaatgcttaccct--agtgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagt 9058557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13452532 - 13452418
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||    
T  13452532 tttatgttgattatgattgatgtaaagtttatccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaattggtagacaaagtgcaggagtggtttgcttt 13452433  T
Q  190 -ggtgagttgcttgg 203  Q
     ||||||||||||||    
T  13452432 cggtgagttgcttgg 13452418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19065623 - 19065486
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacc 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||     
T  19065623 tatgtatatgtgatatgcatgaaatccttaaatgcttatgtttgtttatgatgattatgattgatgtgaagctaacccacagtggttttgaccgcctact 19065524  T
Q  147 tgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    ||| |||||  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  19065523 tgtttgtattaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 19065486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Original strand, 34242979 - 34243080
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  34242979 ttgattatgattgatgtaatgtttaccccgagtggttttgactgcctacctgtttgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgcttcagtgagt 34243078  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  34243079 tg 34243080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Original strand, 15914267 - 15914356
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15914267 tgatgtaatacttacccccagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttg 15914356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12246101 - 12245989
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacg-ttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  12246101 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgtgtatgtatatgtgttatgcatgagatccttgaatgtttatgattatttatgtttgattatgattgatg 12246002  T
Q  113 taaagcttacccc 125  Q
    | ||||| |||||    
T  12246001 tcaagctaacccc 12245989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 10862761 - 10862863
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10862761 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggtttcgactgcctacctgtctgtatggattggtagacgttgtgcaggattagttgctttgatgagttg 10862859  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  10862860 cttg 10862863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 12249930 - 12250027
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12249930 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagtt 12250027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 16572040 - 16572136
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16572040 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacgttgtgaaggattagttgatctggtgagt 16572136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16593622 - 16593526
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16593622 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacgttgtgaaggattagttgatctggtgagt 16593526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12753185 - 12753098
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  12753185 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgct 12753098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13375984 - 13375914
Alignment:
Q  133 tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttgg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13375984 tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgg 13375914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 13039108 - 13039168
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13039108 ttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccgcctacctgcctgtatggatgggtagac 13039168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 15824358 - 15824445
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  15824358 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgaaggattagttgct 15824445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Original strand, 15980284 - 15980547
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||           |||| |||||| |||||||||||     
T  15980284 tcatgtaatgttaaaattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgatatccttgaatt----------tttatgttgataatgattgatgtg 15980373  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgag-----------ttgctt 201  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||||||||||    || |||||||| ||||||| ||||||           ||||||    
T  15980374 aagcttacccccagtggtttcgaccgcctacctctttgtaaaaatgggtagacgttttgtaggattagattgctttcggtgagttgcttggtgattgctt 15980473  T
Q  202 ggatagcgggagct-atctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtctt 274  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15980474 ggatagcgggagctaatctccgttatcggttctttagagtcttagagtaggctctgatctaggatgtctatctt 15980547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 3193870 - 3193943
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3193870 tttatgttgattatgattgatgtgaagctta-ccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtag 3193943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Original strand, 16370201 - 16370286
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16370201 tgattatgattgatgtgaagctaatccc-agtgggtttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacggagtgcaggagtagtt 16370286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 141860 - 141795
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  141860 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 141795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 11582845 - 11582894
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582845 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 11582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 45455568 - 45455664
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| | |||||||| ||||||||    
T  45455568 gattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtacagaagtagttgctctggtgagt 45455664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3054977 - 3054928
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3054977 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtttgtatggatgggtagac 3054928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Original strand, 1938634 - 1938682
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938634 cttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 1938682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3135563 - 3135495
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  3135563 tgtgatgttagtattctaggagggatgtgtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttaaatgcttatg 3135495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3893394 - 3893327
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3893394 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgtctacctgtctgtatgggtgggtagac 3893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16917883 - 16917835
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacct 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16917883 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacct 16917835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 232
Target Start/End: Original strand, 18081206 - 18081293
Alignment:
Q  146 ctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  18081206 ctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagttgcttttggtgagt-gcttggatagtgggagctaatctccgttatcgtttc 18081293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44863448 - 44863389
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44863448 tgatgtaatacttacccccagtggttttgacagcatacctgtctgtgtggatgggtagac 44863389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 14302613 - 14302675
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatg 80  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14302613 tgtgatgttaatattctaagagggatggttatgtatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatg 14302675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Original strand, 16921787 - 16921837
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  16921787 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacatacctgt 16921837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 16929846 - 16929900
Alignment:
Q  143 tacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16929846 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttcttcggtgagtt 16929900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 16935229 - 16935283
Alignment:
Q  143 tacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16935229 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttcttcggtgagtt 16935283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 48624219 - 48624288
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  48624219 ttgattatg-ttgatgtaatgctcacccccaatggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 48624288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 122765 - 122716
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  122765 cttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgagtagac 122716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11285319 - 11285259
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11285319 gaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 11285259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 13868113 - 13868169
Alignment:
Q  140 gcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13868113 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttttgcaggattagttgc-ttggtgagtt 13868169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 18305864 - 18305920
Alignment:
Q  140 gcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18305864 gcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 18305920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 32496456 - 32496505
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32496456 cttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatggatagac 32496505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 113155 - 113222
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  113155 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgtctacctatctatatggatgggtagac 113222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 26072118 - 26072205
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || | ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  26072118 gattatgat-gatgtaatacttacccacagtcgttttaatcgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 26072205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 26095905 - 26095992
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || | ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  26095905 gattatgat-gatgtaatacttacccacagtcgttttaatcgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 26095992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 167
Target Start/End: Original strand, 12545830 - 12545861
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545830 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 12545861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16206441 - 16206387
Alignment:
Q  27 tagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgc 81  Q
    |||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16206441 tagtattctaggaatattgagtatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgc 16206387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16209970 - 16209924
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 164  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16209970 cttatccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggta 16209924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 369115 - 369055
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  369115 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 369055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 2192827 - 2192887
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2192827 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 2192887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10987896 - 10987839
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  10987896 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 10987839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11514408 - 11514351
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  11514408 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 11514351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13756863 - 13756806
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  13756863 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 13756806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 13912992 - 13913049
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  13912992 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 13913049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 15443436 - 15443493
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  15443436 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 15443493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16416480 - 16416420
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16416480 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 16416420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 27103424 - 27103481
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  27103424 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 27103481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 27110772 - 27110829
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  27110772 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 27110829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27174901 - 27174844
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  27174901 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 27174844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 30264001 - 30264058
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  30264001 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 30264058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 38785516 - 38785573
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  38785516 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 38785573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 326
Target Start/End: Original strand, 20587588 - 20587718
Alignment:
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatc-gtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataat-tattctagattgtt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||| |||| ||||||| || |||  |||||| |     
T  20587588 ttgcttggatatcgggagctatcttcaatatcagtttccttagagtc-taggatagactctgatctagg-tgtcggtcttatgatatatcttagattttc 20587685  T
Q  294 tattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    ||| ||  || |||||||||| |||||||||||    
T  20587686 tatcctaaatgtatttatgttttggagaatttt 20587718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 47482779 - 47482877
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||   |||||||| |||| || |||||||||    
T  47482779 ttgattatg-ttgatgtaatactcacccccagtggttttaactgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgcaggagtagtagc-ttggtgagt 47482876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6092864 - 6092557
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  6092864 atcatgtgatgctagtattataggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctgtgtttgtttatgttgattatgattgatgta 6092765  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgcttggatagcggga 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6092764 aagctta-ccccattggttttgaccgcctatctgtctatatggatgggtagacgaagtgcatgattagtttgcttttggtgagttgcttggatagcggga 6092666  T
Q  213 gctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatttatttat 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6092665 gctatctccgttatcgtttccttagagtc-tagggtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgtttattctggatttatttat 6092567  T
Q  312 gttgtggaga 321  Q
    |||| |||||    
T  6092566 gttgcggaga 6092557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25132546 - 25132324
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||     
T  25132546 ttgattatcattgatgtaaagcttacccc-agtggtttttgatcgcctacctgtctgtatggaagggtagacgaagtgcaggattagttactt-ggtga- 25132450  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgttta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25132449 ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttacagtcttaggataggctccgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattgttta 25132350  T
Q  296 ttctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  25132349 ttttggatttatttatattgtggaga 25132324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24272385 - 24272161
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24272385 gattatgattgatgtaaagcttacccctaatggttttgactgcctacttgtctgtattgatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 24272286  T
Q  199 c-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
    |           |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  24272285 cttggtgattgcttggatagcgggtgctatctccgttatcgtttccttagagtc-taggatagactctgatctagg-tgtttgtcttatgattactctag 24272188  T
Q  288 attgtttattctggatttatttatgtt 314  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  24272187 atcgtttattttggatttatttatgtt 24272161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18533757 - 18533557
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  18533757 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgattatgttgattatgattgatgt 18533658  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggatta-gttgc-tttggtgagttgcttggatagcggg 211  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18533657 gaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtattttgcttttggtga-ttgcttggatagcggg 18533559  T
Q  212 ag 213  Q
    ||    
T  18533558 ag 18533557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29112186 - 29111996
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||     
T  29112186 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatcgttgaatgtctatgtttgtttatgttgattgtgattgatgtg 29112087  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgagttgcttgg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29112086 aagcttacccccagtggttttgacagcctgcctgtttgtatgaatgcgtagacgaagtgcatgattagtttgctttcggtgagttgcttgg 29111996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Original strand, 19435684 - 19435877
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||| |||||    
T  19435684 atcatgtgatgctagtattctaggagaggtggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttttgttgattatgatttatgta 19435783  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttg 202  Q
    |  |||||||||||||| |      | |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19435784 atacttacccccaatggatctatgatggaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgcttg 19435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43640773 - 43640582
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgattta---cgttgattatgattgat 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||    
T  43640773 atcatgtgatgctagtatt-taggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttattttattgattatgattgat 43640675  T
Q  112 gtaaagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    || |||||||  |||| ||| |      | |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43640674 gtgaagctta--cccagtggatctgtgatggaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgct 43640582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 30994827 - 30994933
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30994827 ttgattatgattgatgtaaagcttagccccagtggttttgaccgcctacctgactgtatggatggatagacgaagtgcaggattagttgcttcggtgaat 30994926  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  30994927 tgcttgg 30994933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24868877 - 24868774
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24868877 ttgattatgattgatgtaaagcttacctctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaattgctttggtgagt 24868778  T
Q  197 tgct 200  Q
    ||||    
T  24868777 tgct 24868774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20271326 - 20271159
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||    ||    |||||||||||||||||    
T  20271326 atcatgtgatgttagtactctaggagggatgggtatgtatatgtatcatgcatgaaatccttgaatgcttatgcctgttatgtttgattatgattgatgt 20271227  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggatta 181  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20271226 gaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgttggtatgaataggtagacaaagtgcaggatta 20271159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 23614339 - 23614539
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  23614339 atcatctgatgctagtat-ctaggagggatggttaggtatgtgt--tatgcatgaaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgacgt 23614435  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgctt-tggtgagttgcttggatagcggg 211  Q
     || |||||||  | | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23614436 gaatcttaccct-agttgttttgaccgcctacctttttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgattagtttgcttccggtgagttgcttggatagcggg 23614534  T
Q  212 agcta 216  Q
    |||||    
T  23614535 agcta 23614539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24839779 - 24839553
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaag 117  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||    || ||||||||||||||||||||||    
T  24839779 atgtgatgttagtattctgggaaggatgggtatttatatgtaatatgtatgaatccttgaatgcttgtgttttcatatgttgattatgattgatgtaaag 24839680  T
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgctttggtgagttgcttggatagcgggagct- 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||        |||||||||| |||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||     
T  24839679 cttacccccaatggtttcgaccgcctacttgt-------tatgggtagacgaagtgcaatactagtttgcttcggtgagttgtttggat-gtgggagcta 24839588  T
Q  216 atctccattatcgtttccttatagtcttaggatat 250  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  24839587 atctccgttatcggttctttagagtcttatgatat 24839553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25593495 - 25593352
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tt 188  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||| ||| |||| ||    
T  25593495 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgtaggagtagtttgcttt 25593396  T
Q  189 tggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  25593395 tggtgag-tgcttggatagcaggagctaatctctgttatcgtttc 25593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 22581845 - 22581942
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22581845 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagtt 22581942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32738780 - 32738697
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttg 202  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32738780 ttaccccctgtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgcttg 32738697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28972285 - 28972189
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28972285 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagt 28972189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19655275 - 19655208
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655275 gattatgat-gatgtaatgcttacccccaatggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagac 19655208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 5110 - 5207
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5110 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc-tacctgcctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttg 5207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7319731 - 7319633
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7319731 gattatgat-gatgtaatacttaccctcagtgattttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttg 7319633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 40642173 - 40642272
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  40642173 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttttccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctccggtgagttg 40642272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Original strand, 32117 - 32186
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32117 tggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttg 32186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Original strand, 22137681 - 22137757
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22137681 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttg-tttggtgagttgct 22137757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 307
Target Start/End: Original strand, 45620229 - 45620498
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt-----tttgaccgc 141  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||      | ||||||    
T  45620229 tatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttat-ttgattatgattgatgtgaagctaaccctcagtggtctgtggtggaccgc 45620327  T
Q  142 ctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct------ttggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttcctt 235  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||   |||||||| |||||| |      |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||    
T  45620328 ctacctatttgtatgaatgggtagacggtgtgcaggagtagttgttgattgcttggggag-tgctcagatagcgggagctatctccgttatcg-atcttt 45620425  T
Q  236 atagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatttat 307  Q
      |||||||   || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45620426 tgagtcttaaagtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgattatgctggatttat 45620498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 4450158 - 4450245
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4450158 gattatgat-gatgtaatacttacctctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 4450245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 9782741 - 9782809
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9782741 gattatgattgatgtaatacttacccccactggttttgaccgcctgcctgtctgtatggataggtagac 9782809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19657882 - 19657771
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    |||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||| |||||||    
T  19657882 atcatgtgttgctagtattctaggatagatggttatgtataattgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtctgtttatgtggattatga-tgatgta 19657784  T
Q  115 aagcttaccccca 127  Q
    | |||||||||||    
T  19657783 atgcttaccccca 19657771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 269422 - 269375
Alignment:
Q  120 tacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  269422 tacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 269375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 23823338 - 23823434
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23823338 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgac-gcctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaattgctctggtgagtt 23823434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 23825282 - 23825378
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23825282 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgac-gcctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaattgctctggtgagtt 23825378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 36892613 - 36892682
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892613 ttgattatgat-gatgtaatacttacccgcagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 36892682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 720685 - 720597
Alignment:
Q  109 gatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  720685 gatgtaatacttacccccagtggttt-gacctcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccggtgagttg 720597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 24296406 - 24296473
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24296406 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 24296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Original strand, 25877888 - 25877936
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877888 ttacccccaatggtttttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 25877936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 19812932 - 19813007
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19812932 ccccagtggttttgactgcctagctgtctgtatggatggatagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttg 19813007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 203
Target Start/End: Original strand, 24089304 - 24089371
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttgg 203  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24089304 gaccgcctacatgtatgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgcttgg 24089371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 22691919 - 22691992
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||    
T  22691919 ccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgcgtagacgctgtgcaggaatagttg-tttggtgagtt 22691992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 22696566 - 22696639
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||    
T  22696566 ccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgcgtagacgctgtgcaggaatagttg-tttggtgagtt 22696639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25303908 - 25303811
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25303908 gattatgatttatgtaatacttacctctagtggttttgaccgcttacctgtcaatatggatgggtagatgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 25303811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25600164 - 25600100
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25600164 ccccagtggttttggccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 25600100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 9654797 - 9654846
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9654797 cttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 9654846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 23806489 - 23806538
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23806489 cttacccccagtggttttaaccgcatacctgtctgtatggatgggtagac 23806538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 43644899 - 43644948
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43644899 cttacccccagtggttttaaccgtctacctgtctgtatggatgggtagac 43644948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22861786 - 22861742
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22861786 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 22861742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8886445 - 8886395
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttga-ccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8886445 cttacccccagtggttttaaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 8886395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 167
Target Start/End: Original strand, 23837282 - 23837328
Alignment:
Q  121 acccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23837282 acccccagtggttttaaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagac 23837328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 460827 - 460778
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  460827 cttacccccagttgttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagac 460778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6877716 - 6877667
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6877716 cttacccccagaggtgttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagac 6877667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12726334 - 12726277
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  12726334 atgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 12726277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 268
Target Start/End: Original strand, 30994937 - 30995009
Alignment:
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtc 268  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30994937 ttgcttggatatcgggagttatctccgatatcggtttcttagagtcgtaggataggctctgatctaggatgtc 30995009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Original strand, 17398470 - 17398517
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatgg 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17398470 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgg 17398517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Original strand, 23779786 - 23779876
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||   |||||||| |||| ||||    
T  23779786 ttgattatg-ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgcaggactagtagctt 23779876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 3801335 - 3801395
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3801335 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 3801395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 5890171 - 5890228
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  5890171 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 5890228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8941715 - 8941658
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  8941715 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 8941658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 11233125 - 11233182
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  11233125 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 11233182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 14908312 - 14908369
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  14908312 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 14908369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19648310 - 19648269
Alignment:
Q  195 gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttcctta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  19648310 gttgcttggatagcgggagctatctccgctatcgtgtcctta 19648269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 19888949 - 19889009
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19888949 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 19889009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 22514972 - 22515029
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  22514972 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 22515029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23772819 - 23772762
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  23772819 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 23772762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23818462 - 23818405
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  23818462 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 23818405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 24687543 - 24687600
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  24687543 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 24687600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 28777574 - 28777631
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  28777574 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 28777631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 12638216 - 12638268
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  12638216 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgctt 12638268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27401993 - 27401937
Alignment:
Q  134 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttg 190  Q
    |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27401993 ttgaccgcctgcctatttgtatgaatgggtagacagcttgcaggattagttgctttg 27401937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 29162665 - 29162982
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaa 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||    
T  29162665 tcatgtgatgatagtattctaggagggatgactatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattaggactgatgtaa 29162764  T
Q  116 agcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgc-tttggtgag-----------ttgcttgg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||           ||||||||    
T  29162765 agcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtggacgaagtgcaggactagttgcttttggtgagttgcttggtgattgcttgg 29162864  T
Q  204 atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctgga 302  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29162865 atatcgggagctatctccgttatcgtatccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgtttattctgga 29162964  T
Q  303 tttatttatgttgtggag 320  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29162965 tttatttatgttgtggag 29162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 97 - 297
Target Start/End: Original strand, 15006485 - 15006685
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15006485 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagaggttttgaccgcctacatgtctgtacggatgagtagacgaagtgcatgattagttgcttttgtgagt 15006584  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttat 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15006585 tgcttggatagcgggacctatctccattatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattatttat 15006684  T
Q  297 t 297  Q
    |    
T  15006685 t 15006685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16131681 - 16131362
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||    
T  16131681 atgtgatgttagtattctaggagggatggatatgtatatgttttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaa 16131582  T
Q  117 gcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgc-----------ttgg 203  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||           ||||    
T  16131581 gcttatccccagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgcttttggtgagttgcttggtgattgtttgg 16131482  T
Q  204 atagcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctgg 301  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  16131481 ataacaggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcttagggtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgattaatctgg 16131382  T
Q  302 atttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16131381 atttgtttatgttgtggaga 16131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 321
Target Start/End: Original strand, 22595494 - 22595728
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttgg-tgagt 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22595494 tgattatgtttgatgtcaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttttgatgagt 22595593  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22595594 tgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatgtctatcttatgattattct 22595693  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  22595694 agattgtttattct-tacttatttatgttttggaga 22595728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 321
Target Start/End: Original strand, 22467942 - 22468176
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  22467942 attatgattgatgtaaagcttaccctcagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgattttggtgagttg 22468041  T
Q  199 c-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctg-tcttataattattcta 286  Q
    |           |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  22468042 cttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttccttagagttttagggtaggctctaatcaaggatgtctgtttttatgattattcta 22468141  T
Q  287 gattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468142 gattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 22468176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34965273 - 34965037
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt-gcttt-ggtgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  34965273 gattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgacgtgcaagattagtttgcttttggtgag 34965174  T
Q  196 ttgcttgg-----------atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattc 284  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| | |||||    
T  34965173 ttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggctctgatctaggttttctgtcttatgactattc 34965074  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965073 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 34965037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21929859 - 21929558
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21929859 tgtgatgatagtattctaggagagatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatgtttgcttatgttgattatgattgatgtaaacc 21929760  T
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgag-----------ttgcttggat 205  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||||||           ||||||||||    
T  21929759 ttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaaatgcatgattagtttgctttcggtgagttgcttggtgattgcttggat 21929660  T
Q  206 agcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggat 303  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| || | || ||| | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  21929659 agtgggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcataaggtaggctatgatctaggatgtttgtctttatgattgttctagattgtttatgttggat 21929560  T
Q  304 tt 305  Q
    ||    
T  21929559 tt 21929558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Original strand, 31469375 - 31469614
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag- 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  31469375 ttgattatgattgatgtaaagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtctctatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 31469474  T
Q  196 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
              |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||  || || ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  31469475 tacttggtgtttgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcgtaggatgggcactgatctaggatgt-tgccttatgattattat 31469573  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31469574 aaattgtctatcctggatttatttatgttttggagaatttt 31469614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 314
Target Start/End: Original strand, 33540069 - 33540294
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga-- 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||      
T  33540069 ttgattatgattgatgtaaagcttacgcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgatttggtgagt 33540168  T
Q  195 ---------gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  33540169 tgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccactatcgtgtctttagagtc-taggatagactcttatctagg-tgtctgt-ttatgattactct 33540265  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgtt 314  Q
    ||||| | | || |||||||||| |||||    
T  33540266 agattatctgttttggatttattcatgtt 33540294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19852600 - 19852371
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  19852600 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgacatgcaagattagttgcttgggtgagttg 19852501  T
Q  199 c-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
    |           |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||  ||  ||||      
T  19852500 cttggtgattgcttggatagcgggagctatcttcgttatcatttcattagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtcggtcttacgat--ttctct 19852405  T
Q  288 attgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  19852404 attgtttattttggatttatttatattttggaga 19852371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 12310843 - 12310944
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310843 gattatgattgatgtaaaacttaccctcagtggttttgaccgcctacctgtcggtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttctttggtgagttg 12310942  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  12310943 ct 12310944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 203
Target Start/End: Original strand, 17375554 - 17375668
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgctt 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17375554 atttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctt 17375652  T
Q  189 t-ggtgagttgcttgg 203  Q
    | ||||||||||||||    
T  17375653 tcggtgagttgcttgg 17375668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23219288 - 23219098
Alignment:
Q  116 agcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagct 215  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |  |    
T  23219288 agcttacccccagcggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtttgcttggtgag-tgcttggatagcggaattt 23219190  T
Q  216 atctccattatcgtttcct-tatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattt 305  Q
    |||||| |||||| ||||| |  |||| |||  || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  23219189 atctccgttatcggttcctcttgagtcgtagagtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattatttatgttggattt 23219098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22846455 - 22846354
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22846455 gattatgattgatgtaaagcttatcccaagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcgttggtgagttg 22846356  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  22846355 ct 22846354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14150911 - 14150809
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  14150911 gttgattatg-ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgag 14150814  T
Q  196 ttgct 200  Q
    |||||    
T  14150813 ttgct 14150809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 940964 - 941063
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  940964 gattatgaatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 941063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25649586 - 25649483
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  25649586 gattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtttggatgggtagacgttgtgcagggttagtttcttcggtgagttg 25649487  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  25649486 cttg 25649483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Original strand, 17085393 - 17085494
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17085393 tgattatgtttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-tcggtgagtt 17085491  T
Q  198 gct 200  Q
    |||    
T  17085492 gct 17085494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 4174466 - 4174643
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttga------tttacgttgattatgat 107  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| || |      |||| ||||||||||||    
T  4174466 atcatgtgatgttagttttatagaagggatgagtatgtatatgtgatatacatgaaatccttgaatgcttatctttaaaattgtttatgttgattatgat 4174565  T
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggt-tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  4174566 tgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacggcgtgcaggagtagtt 4174643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 4230095 - 4230255
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttga------tttacgttgattatgat 107  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| || |      |||| ||||||||||||    
T  4230095 atcatgtgatgttagttttatagaagggatgagtatgtatatgtgatatacatgaaatccttgaatgcttatctttaaaattgtttatgttgattatgat 4230194  T
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggt-tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4230195 tgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagac 4230255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21621440 - 21621355
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  21621440 gattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtt 21621355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23219728 - 23219619
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttg-aatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  23219728 atcatgtgatgcttgtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 23219629  T
Q  113 taaagcttac 122  Q
    | ||||||||    
T  23219628 tgaagcttac 23219619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 7829751 - 7829845
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga 194  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  7829751 gattatgat-gatgtaatacttacccctaatggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtga 7829845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 18383510 - 18383609
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  18383510 gattatgattgatgtaatacttaacccgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccggtgagttg 18383609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19670785 - 19670598
Alignment:
Q  161 ggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct-----------tggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggata 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  || |||| |||||||    
T  19670785 ggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttgctcggtgattgcttggatagagggagttatctccgttatcggttctgtagagtcgtaggata 19670686  T
Q  250 tgctctaatctaggatgtctgtcttataatt-attctagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaattttcgtgatgatgt 337  Q
      |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  19670685 gactctgatctaggatgt-tgtcttatgatttattatagattgtctatcctggatctatttatgttttggagaatttttatgatgatgt 19670598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Original strand, 17858218 - 17858311
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  17858218 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 17858311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 17790995 - 17791094
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17790995 gattatgat-gatgtaacgcttaaccccagtggtttttgaccgcctccctgtctgtacggatgggtagacactgtgcaggattagttgctctggtgagtt 17791093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6092857 - 6092756
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  6092857 tgattatgtatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattacttgc-tcggtgagtt 6092759  T
Q  198 gct 200  Q
    |||    
T  6092758 gct 6092756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 15080708 - 15080782
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15080708 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagtt 15080782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17787761 - 17787692
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17787761 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 17787692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25917994 - 25917898
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || |||||||    
T  25917994 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggagtagttgtttcggtgagt 25917898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 16889644 - 16889742
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16889644 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagtttctcttgtgagttg 16889742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 25369282 - 25369378
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25369282 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctatctaaatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 25369378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22866413 - 22866325
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22866413 tgatgtaatacttacccctagtggttttgacctcctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 22866325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29603895 - 29603774
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||| ||||||  |    
T  29603895 ttgattatgattgatgtaaagtttaccgc-agtggttttgactgcctacatgtctgtatggacgggtagacgacgtgcatgtttagttgc-ttggtg-ct 29603799  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctcc 221  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||    
T  29603798 tgctcagatatcgggagctatctcc 29603774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 22364074 - 22364173
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||   || || ||||||||||| ||||||||||    
T  22364074 gattatgattgatgtaatacttaccccctgtggttttgaccgcctacctatctgtgtggaagggtatacgttgtacaagattagttgctctggtgagttg 22364173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 317
Target Start/End: Original strand, 15295493 - 15295555
Alignment:
Q  256 aatctaggatgtctgtct-tataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtg 317  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15295493 aatctaggatgtctgtatgtatgattattctagattgattattctggatttatttatgttgtg 15295555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 25646773 - 25646869
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25646773 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 25646869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 25746145 - 25746214
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25746145 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagac 25746214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Original strand, 31163070 - 31163144
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcat-gaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  31163070 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgagttatgcataaaatccttgaatgcttatgtt 31163144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16104863 - 16104776
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  16104863 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 16104776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18422120 - 18422040
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18422120 tgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgactacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagggatagttgctt 18422040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32896295 - 32896228
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896295 gattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 32896228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33323031 - 33322957
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33323031 ccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtaaacgctgtgtaggattagttgctctagtgagtt 33322957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 19985101 - 19985150
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19985101 cttacccccagtggttttaaccgcctacccgtctgtatggatgggtagac 19985150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22428464 - 22428399
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  22428464 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagggatagttgctt 22428399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18775491 - 18775432
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  18775491 tggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgctt 18775432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31626744 - 31626665
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  31626744 tgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgtttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 31626665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18740629 - 18740591
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18740629 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 18740591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14352685 - 14352652
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgc 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352685 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgc 14352652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23151719 - 23151655
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 164  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23151719 gattatgat-gatgtaatacatacccccagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggta 23151655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 314
Target Start/End: Original strand, 12310949 - 12311066
Alignment:
Q  194 agttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtt 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| ||||| || |||| ||||| | |||| |||| |||||||| |     
T  12310949 agttgcttggatagtgggagctatctccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatatagg-tgtctat-ttatgattactctagattatc 12311045  T
Q  294 tattctggatttatttatgtt 314  Q
    | || |||||||||| |||||    
T  12311046 tgttttggatttattcatgtt 12311066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 1651864 - 1651921
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  1651864 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 1651921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6777815 - 6777774
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6777815 tatgtatatgtgctatgcatgaaatccttgaatgcttatgtt 6777774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10487168 - 10487111
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  10487168 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 10487111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 14628590 - 14628650
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14628590 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 14628650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16229869 - 16229812
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16229869 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16229812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16235739 - 16235679
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16235739 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 16235679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 16378159 - 16378216
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16378159 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16378216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 16385483 - 16385540
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16385483 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16385540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 16645754 - 16645811
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16645754 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16645811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 16651120 - 16651177
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16651120 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16651177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 16828032 - 16828092
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16828032 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg-tttggtgagtt 16828092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 18005079 - 18005139
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18005079 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 18005139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 18088664 - 18088721
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  18088664 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 18088721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18128353 - 18128265
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||  | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  18128353 gattatgat-gatgtaatacttacccaaagtggttttaaccgcctacatgtatgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 18128265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 27655960 - 27656017
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  27655960 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 27656017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 33316635 - 33316695
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33316635 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 33316695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Original strand, 13016711 - 13016755
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13016711 ccccagtggttttaaccgtttacctgtctgtatggatgggtagac 13016755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18397135 - 18397107
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18397135 gaccgcctacctgtctgtatggatgggta 18397107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18578792 - 18578745
Alignment:
Q  149 tctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18578792 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 18578745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23975679 - 23975627
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  23975679 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgctt 23975627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 6817387 - 6817697
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  6817387 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgctatgcataaatccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgattgatgtg 6817486  T
Q  115 aagcttacccccaatggtttt------gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagttgcttggatag 207  Q
    ||||||||||| | ||| | |      |||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6817487 aagcttacccctagtggatctttgatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagttgcttttggtgagtttcttggatag 6817586  T
Q  208 cgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattta 306  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6817587 ctggagctatctccattatcgtttgcttagagtcttagggtaggctctgatctaggatgtcagtctttatgattattctagattgtttattttggattta 6817686  T
Q  307 tttatgttgtg 317  Q
    |||||||||||    
T  6817687 tttatgttgtg 6817697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 132 - 337
Target Start/End: Original strand, 31416123 - 31416328
Alignment:
Q  132 ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcgttt 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  31416123 ttttgactgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagctatctctgttatcattt 31416222  T
Q  232 ccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaattttcgtga 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31416223 ccttagagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctagatttatttatgttgtggagaattttcgtga 31416322  T
Q  332 tgatgt 337  Q
     |||||    
T  31416323 cgatgt 31416328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41659941 - 41659721
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41659941 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattaatcgctttggtgagttg 41659842  T
Q  199 cttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||     
T  41659841 cttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtc-taggatagactctgatctagg-tgtctgttttatgattactctagattgtttattt 41659744  T
Q  299 tggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  41659743 tggatttatttatattttggaga 41659721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Original strand, 15551649 - 15551964
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15551649 atcatgtgatgttattattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 15551748  T
Q  114 aaagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct-ttggtgagttgcttggata 206  Q
     ||||||||||||  ||| |      | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15551749 gaagcttaccccctgtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgtatgattagttgttgttggtgagttgcttggata 15551848  T
Q  207 gcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttag-gatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatt 304  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||   || ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  15551849 ccgggagctatctccgttatcgttt-cttggagtcttagatttaggctctgatctaggatgtttgtctttatgattattctagattgtttattctagact 15551947  T
Q  305 tatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||    
T  15551948 tatttatgttgtggaga 15551964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Original strand, 17760557 - 17760872
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||     
T  17760557 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgttcatgttgattatgattgatgtg 17760656  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt--ggtgagttgcttggata 206  Q
    ||||||||||| | ||| | ||      ||||  ||||| | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||    
T  17760657 aagcttacccctagtggatctgtgatggaccggttacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttgtttttggtgagttgcttgcata 17760756  T
Q  207 gcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattt 305  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17760757 gcgggagctatcttcgttatcgcttccttagagtcttaggctaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgtttattatggattt 17760856  T
Q  306 atttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||| ||||    
T  17760857 atttatgttgttgaga 17760872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Original strand, 19061877 - 19062192
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||     
T  19061877 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgttcatgttgattatgattgatgtg 19061976  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt--ggtgagttgcttggata 206  Q
    ||||||||||| | ||| | ||      ||||  ||||| | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||    
T  19061977 aagcttacccctagtggatctgtgatggaccggttacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttgtttttggtgagttgcttgcata 19062076  T
Q  207 gcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattt 305  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19062077 gcgggagctatcttcgttatcgcttccttagagtcttaggctaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgtttattatggattt 19062176  T
Q  306 atttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||| ||||    
T  19062177 atttatgttgttgaga 19062192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8602700 - 8602484
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  8602700 atcatatgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgta 8602601  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt-tgctttggtgagttgcttggatagcgggag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8602600 aagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtctgc-ttggtga-ttgcttttatagcgggag 8602503  T
Q  214 ctatctccattatcgtttc 232  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  8602502 ctatctccgttatcgtttc 8602484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 5230414 - 5230680
Alignment:
Q  69 aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagaca 168  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5230414 aatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttacccgtagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggaagggtagaca 5230513  T
Q  169 aagtgcaggattagtt-gcttt-ggtgagt-----------tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctct 255  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  5230514 aagtgcaggattagtttgcttttggtgagtggcttgatgattgcttggataacgggagctatctccattatcgtttcctttgagtcttagggtaggctct 5230613  T
Q  256 aatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5230614 gatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgtttattctatatttatttatgttgtggaga 5230680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15988938 - 15988645
Alignment:
Q  27 tagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttaccccc 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15988938 tagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgtttatatttgcttatgttgattatgattgatgtaaagcttaccccc 15988839  T
Q  127 aatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgag-----------ttgcttggatagcgggag 213  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||           |||||||||||| |||||    
T  15988838 agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctttcggtgagtttcttggtgattgcttggatagtgggag 15988739  T
Q  214 ctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattt 305  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15988738 ctatctccgttatcgttttcttttgagtcatagggtaggctctgatctaggatgtctgcctttatgattattctagattgtttatgctggattt 15988645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 321
Target Start/End: Original strand, 43429369 - 43429606
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  43429369 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatagatgggtagacgaagtacaggattagttgcttttggtga 43429468  T
Q  195 gttgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattatt 283  Q
    |||||           ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  43429469 gttgcttggtgattgcttggatatcgggagatatctccgttattgtttccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatgtatgtcttaagattatt 43429568  T
Q  284 ctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43429569 ctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 43429606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 17320410 - 17320646
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttgg----- 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |         
T  17320410 ttgattatgattgatgtaaagcttaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgtttttgataag 17320509  T
Q  192 -----tgag--ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattc 284  Q
         |||   |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17320510 ttgcttgatgattgcttggatattgggagctatctccgttgtcgtttccttagagtcctagggtaggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattc 17320609  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17320610 tagattgtttattttggatttatttatgttgtggaga 17320646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 25106101 - 25106394
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||     
T  25106101 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgtg 25106200  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagc 214  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||| |||| |    
T  25106201 aagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtttgtgtgaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgcttggtgag-tgcttggatagagggatc 25106299  T
Q  215 tatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatttat 307  Q
    ||||| | ||||||||| ||| | ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25106300 tatcttcgttatcgttttcttttgagtcttagagtaggctctgatctaggatgtttgtctttgtgattattctagattgattatgctggatttat 25106394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 21168550 - 21168772
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21168550 ttgattatgattgatgtaaagcttacacctaatggttctgaccacctacttgtcagtatggatgggtaaacgaagtgcatgattagtttctttggtgagt 21168649  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  21168650 tgcttggatagcgggagttatctccgttatcgtttccttaaagtc-taggatagactccgatctagg-tgtctgtcttatgattactctaggttgtttat 21168747  T
Q  297 tctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  21168748 tgtggatttatttatgttttggaga 21168772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 14182155 - 14182346
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  14182155 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgagtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 14182254  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgc--tttggtgagttgcttgg 203  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||    
T  14182255 gaagctaacccccaatggttttgaccgcctatctgtttgtatgaatgggtagacgaagtatagggttagtttcctttcggtgagttgcttgg 14182346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 6230494 - 6230599
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6230494 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 6230593  T
Q  197 tgcttg 202  Q
    ||||||    
T  6230594 tgcttg 6230599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Original strand, 14819681 - 14819856
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag- 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  14819681 ttgattatgattgatgtaaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 14819780  T
Q  196 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctag 262  Q
              |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  14819781 tgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctag 14819856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17391402 - 17391232
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  17391402 atcatgtgatgttagtattctaggaaggatgagtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgttaatgttgattatgattgatgt 17391303  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
     ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  17391302 gaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgagtagtt 17391232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Original strand, 4147531 - 4147634
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgc 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4147531 attatgattcttgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttgc 4147630  T
Q  200 ttgg 203  Q
    ||||    
T  4147631 ttgg 4147634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12950987 - 12950797
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  12950987 tgtgatgctagtattctaggatggatggttatgtatatgggttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgtaatac 12950888  T
Q  119 ttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttgg 203  Q
    ||||||||| ||| |      | |||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12950887 ttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatagatgggtaaacgttgtgcaggattaattgctttggtcagttgcttgg 12950797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 4164081 - 4164186
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4164081 ttgattttgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaaggttagttgctttggtgagt 4164179  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  4164180 tgcttgg 4164186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 37918661 - 37918826
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaa-tgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  37918661 atcatgtgatgctggtattttaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaattattgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 37918760  T
Q  113 taaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcagga 178  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  37918761 taaagcttacccccagtggtttcgaccgcctaccagtttgtatgaatgggtaaacgaagtgcagga 37918826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 38378035 - 38378250
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |        
T  38378035 atcatgtcatgttagtattgtaggagggatgtttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgatag---- 38378130  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt-gc-tttggtgagttgcttggatagcggg 211  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||  ||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  38378131 -aagcttatccccagtggttttgaccgcctacccgtttgtatgaatgagtagacggagtgcaggagtggttagcttttggtgag-tgcttggatagcggg 38378228  T
Q  212 agct-atctccattatcgtttc 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  38378229 agctaatctccgttatcgtttc 38378250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 31414399 - 31414519
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  31414399 atcatgtgatgctagtattctacgagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaattcttgcatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatgta 31414498  T
Q  115 aagcttacccccaatggtttt 135  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31414499 aagcttacccccaatggtttt 31414519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 38813159 - 38813348
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  38813159 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 38813258  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |  |||||||| | ||| |      | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  ||||||||||  |||||||||    
T  38813259 atacttacccctagtggatctatgatggactgcctacctgtctgtatgtatgggtagacgttgtgcaaaattagttgctccggtgagttg 38813348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18968413 - 18968190
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga-- 194  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||      
T  18968413 ttgattatgattgatgtgaatcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggat-gatagacgacgtgcatgattagttgctttggtgagt 18968315  T
Q  195 ---------gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
             ||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  18968314 tgctcggtggttgcttagacaacgggagctatctccattgtcgtgtccttagagtc-taggatatgctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattactct 18968218  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgt 313  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  18968217 agattatttgttgtggatttatttatgt 18968190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Original strand, 11517295 - 11517469
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||    
T  11517295 gttgattatgattgatgtgaagctaacccc-aatgattttgaccgcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgagtagttttcttggtgag 11517393  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgt 271  Q
    | |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  11517394 t-gcttggatggtgggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcttagggtaggctctcatctaggatgtctgt 11517469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10902802 - 10902659
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tt 188  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||| ||| |||| ||    
T  10902802 tttatgttgattatgattgatatgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggaatgcaggagtagtttgcttt 10902703  T
Q  189 tggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10902702 tggtgag-tgcttggatagcgggagctaatctccgttatcgtttc 10902659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11636846 - 11636762
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggatta 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  11636846 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatggttatacgaagtgcaggatta 11636762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12020257 - 12020158
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12020257 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 12020158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17202972 - 17202873
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  17202972 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttg 17202873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 33371202 - 33371305
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  33371202 ttgattatgattgatgtaaagcttaccaccagtggttttgaccgcctaccggtctgtatggatgagtagacgtcgtgtatgattagttgctctggtgagt 33371301  T
Q  197 tgct 200  Q
    ||||    
T  33371302 tgct 33371305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15548841 - 15548743
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15548841 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 15548743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34558201 - 34558098
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34558201 gattatgattgatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcccacctttctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttcggtgagttg 34558102  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  34558101 cttg 34558098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30204709 - 30204621
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30204709 gattatgat-gatgtaatacttactcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgctt 30204621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 184
Target Start/End: Original strand, 40041356 - 40041500
Alignment:
Q  43 atggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaa-tgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagctta-cccccaatggttttgacc 139  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |    
T  40041356 atggttatgtatgtgtgttatgcatgaaatccttgaaatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccccccagtggttttgagc 40041455  T
Q  140 gcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  40041456 gcctacttgtttgtatgaatgggtagaccgagtgcaggagtagtt 40041500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17137712 - 17137614
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17137712 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctagtgagttg 17137614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14287336 - 14287239
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14287336 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctttatggatgggtagactttgtgcaggattagttgctctggtgagtt 14287239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15515910 - 15515837
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15515910 tggttttgcccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgcttg 15515837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 187
Target Start/End: Original strand, 11330846 - 11330914
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11330846 ttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 11330914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14296743 - 14296656
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  14296743 gattatgat-gatgtaacacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgct 14296656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14302370 - 14302283
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  14302370 gattatgat-gatgtaacacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgct 14302283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39654176 - 39654077
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  39654176 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagtttgctctggtgagtt 39654078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40937948 - 40937860
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40937948 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgtaggattagttgctctggtgagt 40937860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 47786722 - 47786809
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47786722 gattatgat-gatgtaatactaacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 47786809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 12563392 - 12563471
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12563392 tgatgtaatacttaccccaagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 12563471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 197
Target Start/End: Original strand, 17536933 - 17537007
Alignment:
Q  122 cccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17536933 cccccagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 17537007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 11199402 - 11199499
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  11199402 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcatgattagttgctcttgtgagtt 11199499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 14523265 - 14523361
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14523265 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 14523361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25769523 - 25769449
Alignment:
Q  124 cccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  25769523 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccggtgagttg 25769449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 6148710 - 6148777
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6148710 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 6148777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 53900472 - 53900536
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  53900472 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 53900536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 14061097 - 14061195
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  14061097 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgactacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgctctagtgagttg 14061195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35121916 - 35121838
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||| ||||||||    
T  35121916 cttaccccaagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgagtagttgctctggtgagt 35121838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45581095 - 45581047
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581095 ttacccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 45581047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15874497 - 15874423
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15874497 ccccaatggttt-gaccgccaacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccggtgagttg 15874423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 18008985 - 18009043
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18008985 tggttttgaccgcctacctgtctgtatgtatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 18009043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2045589 - 2045540
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045589 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 2045540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Original strand, 11884103 - 11884168
Alignment:
Q  133 tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  11884103 tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtagctccggtgagttg 11884168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 50113978 - 50114066
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  50113978 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgactgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 50114066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 22146132 - 22146199
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22146132 gattatgat-gatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagac 22146199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 55443735 - 55443818
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  55443735 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgctgtgcaggattagt 55443818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Original strand, 12490701 - 12490763
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12490701 gaccacctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttg 12490763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13815871 - 13815802
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815871 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagaagttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 13815802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14968168 - 14968090
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt-tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  14968168 atttatgttgattatgattgatgtgaaactaacccccagtggtctttgaccgtctacctgtttgtatgaatgggtagac 14968090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17098897 - 17098859
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17098897 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 17098859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48419937 - 48419875
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48419937 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattaattgctctggtgagttg 48419875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7851654 - 7851594
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  7851654 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcattattagttgc-ttggtgagtt 7851594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 11063007 - 11063100
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||    
T  11063007 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccg----tctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagctgctctggtgagtt 11063100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19230313 - 19230264
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19230313 cttacccccagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagac 19230264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 19262912 - 19262961
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19262912 cttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 19262961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8630051 - 8629987
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  8630051 ttacccccagcggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgtagtgcaggagtagt 8629987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 319501 - 319539
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  319501 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 319539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 12351724 - 12351762
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351724 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 12351762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2048318 - 2048269
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2048318 cttacccccagtggttttaacctcctacttgtctgtatggatgggtagac 2048269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10736819 - 10736770
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10736819 cttacccccagtggttttaaccacctatctgtctgtatggatgggtagac 10736770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 290
Target Start/End: Original strand, 4164189 - 4164281
Alignment:
Q  195 gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagatt 290  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  4164189 gttgcttggatagtgggaactatctccgttatcgtgtccgtagagtc-taggatagactctgatctagg-tgtctgt-ttatgattattctagatt 4164281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 290
Target Start/End: Original strand, 6230603 - 6230695
Alignment:
Q  195 gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||| ||||||| ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||    
T  6230603 gttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtctgtagagtc-taggataggctctgatatatg-tgtctgt-ttatgattattctagatt 6230695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Original strand, 15861110 - 15861140
Alignment:
Q  137 accgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861110 accgcctacctgtctgtatggatgggtagac 15861140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23490753 - 23490715
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23490753 tggttttaaccgcctacctatctgtatggatgggtagac 23490715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 1469526 - 1469583
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  1469526 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 1469583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 2451439 - 2451496
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  2451439 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 2451496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 8270277 - 8270334
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  8270277 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 8270334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 8277388 - 8277445
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  8277388 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 8277445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 8306197 - 8306254
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  8306197 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 8306254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12796694 - 12796634
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12796694 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 12796634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15574286 - 15574229
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  15574286 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 15574229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15613305 - 15613248
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  15613305 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 15613248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 16746045 - 16746102
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16746045 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16746102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16819014 - 16818954
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16819014 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 16818954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18908650 - 18908590
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18908650 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 18908590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22273005 - 22272945
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22273005 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 22272945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30151617 - 30151560
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  30151617 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 30151560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41268522 - 41268465
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  41268522 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 41268465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44227707 - 44227650
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  44227707 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 44227650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53768941 - 53768884
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  53768941 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 53768884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8022248 - 8022184
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatg 80  Q
    |||||||| |||||||||||||||    ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  8022248 tcatgtgaagttagtattctaggaatgttgggtatgtatattcgatatgcatgaatccttgaatg 8022184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 19572680 - 19572747
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19572680 gattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttatccgtctgcctgtctgtatggatgggtagac 19572747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 98 - 321
Target Start/End: Original strand, 5770042 - 5770264
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5770042 tgattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 5770140  T
Q  198 gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttatt 297  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  5770141 gcttggatagcaagagctatctccgttatcatttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatgtttgtcttatgattattctagattgtttatc 5770240  T
Q  298 ctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5770241 ctggatttatttatgttgtggaga 5770264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Original strand, 41213506 - 41213727
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41213506 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggtttggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttcagtgagttg 41213604  T
Q  199 cttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattc 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41213605 cttggatagcgagagctatctccgttatcgtttactttgagtcttagggtaggctctgatctaggatgtctgtcttacgattattctagattgtttattc 41213704  T
Q  299 tggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  41213705 tggatttatttatgttatggaga 41213727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40555702 - 40555480
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  40555702 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgtatgattagttgcttttggtga-tt 40555604  T
Q  198 gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttatt 297  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40555603 gctcggatatcgggaactatcttcgttatcgtttccttagagtctcagggtaggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattgtttatt 40555504  T
Q  298 ctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  40555503 ttggatttatttatgttgtggaga 40555480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21042119 - 21041898
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagt 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21042119 tgattatgtttgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgaagtgcaggattagttgcttttggtga-t 21042022  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttat 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21042021 tgcttggatagcgggaactatctccgttatcgtttccttagagtcttagggtaggctcggatctaggatgtctgtcttatgattattctagatcgtttat 21041922  T
Q  297 tctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  21041921 tct-gacttatttatgttgtggaga 21041898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20192148 - 20191930
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  |||| |||||| |||||||||||     
T  20192148 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgttatgcatgaatctttgaatgcttatatttgtttatgttgatcatgattgatgtg 20192049  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgcttggatagcggga 212  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20192048 aagcttacccccagtggtttcgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgtaggagtagtttgctttttgtgag-tgcttggatagcggga 20191950  T
Q  213 gct-atctccattatcgttt 231  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  20191949 gctaatctccattatcgttt 20191930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 46144101 - 46143915
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46144101 ttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgt----atggatgggtagacgaggtgcagggttagttgctttggtgagt 46144006  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  46144005 tgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtatgt-ttatgattattctagatt 46143915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 78265 - 78486
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  78265 atcatgtgagtttagtattctaggagggatggttatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 78364  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgcttggatagcggg 211  Q
    |||| ||| ||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  78365 aaagtttatccctagtgttttcggccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgactagtttgcttttggtgagttgcttggatagcgga 78464  T
Q  212 agct-atctccattatcgtttc 232  Q
    || | |||||| ||||||||||    
T  78465 agataatctccgttatcgtttc 78486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 314
Target Start/End: Original strand, 5472231 - 5472454
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag--- 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||       
T  5472231 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggatagacgaagtgcgtgattagttgctttggtgagttg 5472329  T
Q  196 --------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
            ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  5472330 cttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggttccttagagtc-tagggtaggctctgatctagg-tgtctgtcttatgattactctag 5472427  T
Q  288 attgtttattctggatttatttatgtt 314  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||    
T  5472428 attgtctgttttggatttatttatgtt 5472454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18164511 - 18164282
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  18164511 ttgattatgattgatgtaaaacttaccccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcatgattagttgcttcggtgag 18164412  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatc-gtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattattctagattgtt 293  Q
     || ||| ||| |||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||     
T  18164411 -tgattgcatatcgggagctatcttcggtatcagtttccttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgtcttatgatttatcttagattgtc 18164315  T
Q  294 tattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  18164314 tatcctggatgtatttacgttttggagaatttt 18164282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20820842 - 20820561
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||          |||| ||||||||||||||||||    
T  20820842 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatg----------tttatgttgattatgattgatgt 20820753  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt--ggtgagttgcttgg-------- 203  Q
     ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||            
T  20820752 gaagctaacccctagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggttgacgaagtgcagaattagtttgtttttggtgagttgcttggtgattgct 20820653  T
Q  204 ---atagcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagatt 290  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  20820652 tggatagcgggagctatctccgttatcgttttcttttgagtcttaggataggctctgatctaggatgtctatctttatgattattctagatt 20820561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33384220 - 33384034
Alignment:
Q  142 ctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt-gcttt-ggtgagttgcttg-----------gatagcgggagctatctccattatcg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33384220 ctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaagactagtttgcttttggtgagttgcttgatgaccgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 33384121  T
Q  229 tttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatttatttatgtt 314  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33384120 tttccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgtttattctggatttatttatgtt 33384034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33395285 - 33395150
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  33395285 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatacatgtgttatgcatgaaatctttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 33395186  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgt 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33395185 aaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgt 33395150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 268
Target Start/End: Original strand, 40438121 - 40438305
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  40438121 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtccgtatggatgggtagacggagtgcatgattagtttgcttttggtga 40438220  T
Q  195 gttgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtc 268  Q
    |||||           |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  40438221 gttgcttggtgattgtttggatagcgggagctatctccgttatcgttttcttagagtcttagggtaggctctgatctaggatgtc 40438305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 52397997 - 52397766
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||    
T  52397997 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgccgacctgtctgtatggatgggtagacgaaatgcagagttagttgttttggtgagt 52397898  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || | |||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  52397897 tgcttggtggttgcttggatagcgggagctatctctgttatcgtgtccttagag-cctaggatagactctgatctagg-tgtctgt-ttatgattattct 52397801  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||| | | || |||||||| ||||||| ||||||    
T  52397800 agattatctcttgtggattta-ttatgttttggaga 52397766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29217431 - 29217327
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29217431 ttgattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttggtgag 29217332  T
Q  196 ttgct 200  Q
    |||||    
T  29217331 ttgct 29217327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 49999184 - 49999290
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  49999184 ttgattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgaagttcagggttagttgatttggtgagt 49999283  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  49999284 tgcttgg 49999290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21193495 - 21193297
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga---- 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||        
T  21193495 gattatgattgatgtaaagcttactcccagtggttttgaccgcctacctatctg-atggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttg 21193397  T
Q  195 -------gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
           ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  21193396 ctcggtggttgcttgggtagcgggagctatctccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattactctag 21193300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 37235797 - 37235896
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  37235797 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgctccggtgagttg 37235896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25093183 - 25093040
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tt 188  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||  ||||||||| ||| |||| ||    
T  25093183 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgccaacctgtttgtatgaatggatagacggagtgcaggagtagtttgcttt 25093084  T
Q  189 tggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  25093083 tggtgag-tgcttggatagcgggagctaatctccgttatcatttc 25093040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 22837247 - 22837349
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||     
T  22837247 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcaagattagttgcttcggtgagttt 22837345  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  22837346 cttg 22837349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 22837450 - 22837552
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||     
T  22837450 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcaagattagttgcttcggtgagttt 22837548  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  22837549 cttg 22837552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17021889 - 17021801
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17021889 gattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtctgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgct 17021801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 20956873 - 20956971
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20956873 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatggttagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttg 20956971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 321
Target Start/End: Original strand, 40438304 - 40438399
Alignment:
Q  226 tcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40438304 tcgttttcttagagacttagggtaggctctgatctaggatgtctgtattatgattattctagattgtttattctggttttatttatgttgcggaga 40438399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 27331113 - 27331186
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27331113 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 27331186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 36358161 - 36358258
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  36358161 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtcgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctagtgagtt 36358258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 5676522 - 5676610
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  5676522 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcagggatagttgctt 5676610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 51658242 - 51658341
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatgg-ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  51658242 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtgggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgctccggtgagtt 51658340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17607257 - 17607156
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  17607257 gattatgattgatgtaatgcttaccca-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgaaggattag-tgcttcggtaagttg 17607160  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  17607159 cttg 17607156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 22148259 - 22148346
Alignment:
Q  131 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagctatctcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22148259 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc--gtg-gttgcttggttagtgggagctatctcc 22148346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 22408149 - 22408236
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22408149 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 22408236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35053134 - 35053087
Alignment:
Q  120 tacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35053134 tacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 35053087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 9786324 - 9786397
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  9786324 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaaggttagttgc-ttggtgagtt 9786397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 37846371 - 37846420
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37846371 cttacccccaatggttttaaccgcatacctgtctgtatggatgggtagac 37846420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 35524359 - 35524423
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  35524359 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgct 35524423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20444001 - 20443952
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20444001 cttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 20443952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20529741 - 20529692
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20529741 cttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 20529692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 44036796 - 44036845
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036796 cttacccacagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 44036845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18505637 - 18505593
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18505637 ccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagac 18505593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 20895681 - 20895741
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20895681 ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtcggtatggatgggtagac 20895741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21716443 - 21716358
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21716443 gattatgat-gatgtaaaacttaccca-agtggttttgaccgcctaca-gtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 21716358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19601524 - 19601428
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  19601524 gattatgat-gatgtaatacttatccccaatggttt-gaccgc-tacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattaattgctccggtgagttg 19601428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27673098 - 27673055
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27673098 ccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtaga 27673055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 38035445 - 38035543
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  38035445 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgattgcctacctgtctgtatggttgggtagatgttgtgcatgattagttgctctgttgagttg 38035543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20929731 - 20929693
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20929731 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 20929693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 15806999 - 15807072
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15806999 tcatgtgatgttagttttctagtagtgatgaatatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtt 15807072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21857748 - 21857699
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21857748 cttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggaagggtagac 21857699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22080161 - 22080101
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22080161 gaccgcctacctttctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 22080101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41217514 - 41217483
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217514 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 41217483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 313
Target Start/End: Original strand, 50001918 - 50002005
Alignment:
Q  223 ttatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctggatttatttatgt 313  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  50001918 ttatcgtgtccttagagtct-aggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgactattctagattatttgttgtggatttatttatgt 50002005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 5074184 - 5074241
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  5074184 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 5074241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 7642465 - 7642522
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  7642465 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 7642522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17003106 - 17003049
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  17003106 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 17003049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17146823 - 17146766
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  17146823 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 17146766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20252313 - 20252253
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20252313 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 20252253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 20827105 - 20827162
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  20827105 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 20827162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22034128 - 22034071
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  22034128 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 22034071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22352256 - 22352196
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22352256 gaccgcctacctttctgtatggatggatagacgttgtgcaggtttagttg-tttggtgagtt 22352196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 1813 - 2036
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1813 ttgattatgattgatgtaaagtttaccccaga-ggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagt 1911  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1912 tgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggacaggctctaatctaggatgtctgtcttatgattattctagattgtttat 2011  T
Q  297 tctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    | |||||||||||||  ||||||||    
T  2012 tttggatttatttatactgtggaga 2036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Original strand, 50224001 - 50224224
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  50224001 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcacgattagttgcttttggtgaatt 50224100  T
Q  198 gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttatt 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50224101 gcttggatatcgggagctatctccgttatcgtttccttatagtcgtagggtagggtctgatctaggatgtttgtcttatgattattctagattgtttatt 50224200  T
Q  298 ctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  50224201 ctgaatttatttatgttgtggaga 50224224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Original strand, 47470176 - 47470401
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttaccccc--aatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47470176 gattatgattgatgtaaagcttacccccctagtggttttgaccacctacttgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgcttttggtgag 47470275  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgttta 295  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47470276 ttgcttggatatcggaagctatctccgttatcgtttccttagagtcttagggtaggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattgttta 47470375  T
Q  296 ttctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  47470376 ctctggatttatttatgttgtggaga 47470401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Original strand, 54365835 - 54366130
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  54365835 atcatgtgatgttagtattctaggaggggtgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgaatgatgt 54365934  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggatt-agttgc-tttggtgagttgcttggatagcggg 211  Q
     ||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  54365935 gaagcttaccccaagtggttttgacagcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattaatttgcttttggtgagttgcttggatagcagg 54366034  T
Q  212 agctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattt 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54366035 agctatctccgttatcgtttccttttgagtcttagggtagactctgatctaggatgtatgtctttatgattattctagattgtttatgctggattt 54366130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 10239267 - 10239509
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt 189  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  10239267 atttatgtggattatgattgttgtaaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacgaagtgcaagattagtcgcttt 10239366  T
Q  190 ggtgagttgcttgg-----------atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataa 278  Q
    ||||||||||||||           |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  10239367 ggtgagttgcttggtgattgcttagatagagggagttatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatgtatgtcttatga 10239466  T
Q  279 ttattctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10239467 ttattctagattgtttattttggatttatttgtgttgtggaga 10239509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 319
Target Start/End: Original strand, 41919044 - 41919315
Alignment:
Q  62 atgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41919044 atgcatgatatccttgaatgcttgtgtttgtttatgttgattttgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatg 41919142  T
Q  161 ggtagacaaagtgcaggattagtt-gcttt-ggtgagttg-----------cttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttagga 247  Q
     |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||     
T  41919143 agtagacgaagtgcaggattaatttgcttttggtgagttgtctggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttattgtttcctttgagtcttaggg 41919242  T
Q  248 tatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtgga 319  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41919243 taggctctgatctaagatgtatgtctttatgattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtgga 41919315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19557671 - 19557436
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttgg-tgag 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  19557671 ttgattatgtttgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtcagtatggatgg-tagacgaagtgcaggattagttgtttttgatgag 19557573  T
Q  196 ttgcttgg-----------atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattc 284  Q
    ||||||||           |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||| |||||||    
T  19557572 ttgcttggtgattccttggatagcgagagctatctccgttaccgtttccttagagtcttaggataggctctgatataggatttctgtcatatgattattc 19557473  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19557472 tagattgtttattctggatttatttctgatgtggaga 19557436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Original strand, 15215994 - 15216309
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15215994 atcatgtgatgctagtattttaggagggatgtttatgtatatgtgttatgtatgaaatccttgaatgcttatgttg-tttacgttgattatgattgatgt 15216092  T
Q  114 aaagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt--ggtgagttgcttggat 205  Q
     |||||||| || | ||| |      | ||| |||||||||| ||||||   |||| |||   ||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  15216093 gaagcttacacctagtggatctgtgatggactgcctacctgtttgtatgatagggttgacggcgtgcatgattagtttgttttcggtgagttgcttggat 15216192  T
Q  206 agcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttag-gatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggat 303  Q
    |||||||||||||| | ||||| | | |||  ||||||||   || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  15216193 agcgggagctatcttcgttatc-tcttcttggagtcttagatgtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattttttattctggac 15216291  T
Q  304 ttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15216292 ttatttatgttgtggaga 15216309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38763112 - 38763006
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  38763112 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgcttcggtgagt 38763013  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  38763012 tgcttgg 38763006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 203
Target Start/End: Original strand, 12136103 - 12136239
Alignment:
Q  69 aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagaca 168  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12136103 aatcctagaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaaggttaccaccaatggtttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 12136202  T
Q  169 aagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgcttgg 203  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12136203 aagtgcaggattagtttgcttttggtgagttgcttgg 12136239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24237234 - 24237013
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||   |||||| | |||||         
T  24237234 atttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagttgttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacgtggtgcagaagtagtt----- 24237140  T
Q  190 ggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtct-tataattattctag 287  Q
           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24237139 -------tgcttggatagcgggagctatctccgttatcgttttctgctgagtcttagagtaggctctgatctaggatgtctgtctgtatgattattctag 24237047  T
Q  288 attgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24237046 attgattattctgggtttatttatgttgtggaga 24237013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 13595864 - 13596088
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13595864 ttgattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctac----ctgtatggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgcttttggtga 13595959  T
Q  195 g-----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattat 282  Q
    |           |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||          ||||||||| |||| |||||    
T  13595960 gttgcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggct----------atgtctgtctttatgattat 13596049  T
Q  283 tctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13596050 tctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 13596088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Original strand, 13448875 - 13449114
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag- 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  13448875 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-attgattttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 13448973  T
Q  196 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattattc 284  Q
              ||||||||||||||||||||||||   ||||   || | || |||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||     
T  13448974 tgctcggtgattgcttggatagcgggagctatctatgttattagtttcgtagagtcgtaagataggctctgatctaggatgt-tgtcttatgatttatta 13449072  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  13449073 tagattgtctatcctgaattcatttatgttttggagaatttt 13449114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5407484 - 5407378
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  5407484 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgagtagacgacgtgcatgattagttgttttgatgagt 5407385  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  5407384 tgcttgg 5407378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 290
Target Start/End: Original strand, 41258187 - 41258385
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga---- 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||        
T  41258187 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtaaacgttgtgcaggattagttactttggtgagttt 41258285  T
Q  195 -------gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
           |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  41258286 ctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattactctag 41258382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 5372874 - 5372985
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  5372874 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 5372973  T
Q  114 aaagcttacccc 125  Q
     |||||||||||    
T  5372974 gaagcttacccc 5372985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Original strand, 7187767 - 7187869
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||    
T  7187767 tgattatgtttgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgattgggtgagtt 7187866  T
Q  198 gct 200  Q
    |||    
T  7187867 gct 7187869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 7966435 - 7966540
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||  ||||||    
T  7966435 ttgattatgattgatgtaatgattacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgattcagtgagt 7966534  T
Q  197 tgcttg 202  Q
    ||||||    
T  7966535 tgcttg 7966540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42707039 - 42706939
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42707039 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgactatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgc-ttggtgagttg 42706941  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  42706940 ct 42706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 15116051 - 15116239
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  15116051 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtttatgtgttatgcatgattccttgaatgcttatatt-tgttatgttgattatgattgatgta 15116149  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |  |||||||||| ||| |      | ||| |||| | |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15116150 atacttacccccagtggatctgtgatggactgcctgcatgtctgtatggatgtgtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttg 15116239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Original strand, 17213707 - 17213797
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17213707 tgattatgattgatgtgaagctaatccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatggatagacagagtgcaggattagttgctt 17213797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 19623874 - 19624090
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag--ttgctt 188  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||| ||| |||  |||| |    
T  19623874 tttatgttgattatgatttatgtgaagctaacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagatggagtgccggagtagttttgc-t 19623972  T
Q  189 tggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctag 287  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||  || ||  ||||||||  || ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19623973 tggtgag-tacttggatagagggagctatcttcgttatcg-gtctttcgagtcttagagtaggctttgatctaggatgtctgtctttatgattattctag 19624070  T
Q  288 attgtttattctggatttat 307  Q
    |||| |||| ||||||||||    
T  19624071 attgattatgctggatttat 19624090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 34198012 - 34198110
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34198012 gattatgat-gatgtaatacttacccgcagtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttg 34198110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Original strand, 17378031 - 17378137
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  17378031 gattatgattgatgtgaaacttacccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatcaatgggtagacgaagtgcgggattagtttgctttcggtgagt 17378130  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  17378131 tgcttgg 17378137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 12246079 - 12246175
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12246079 gattatgattgatgtaatacttaccctcggtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac-ctgtgcaggattagttgctctagtgagt 12246175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 30236398 - 30236494
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30236398 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 30236494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Original strand, 41167785 - 41167854
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  41167785 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttg 41167854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12732509 - 12732375
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||     
T  12732509 gattatgattgatgtgaaacttacccc-agtgattttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacggagtgcaggagtagtttgcttttggtgag- 12732412  T
Q  197 tgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12732411 tgcttggatagcgggagctaatctccgttatcatttc 12732375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 12901618 - 12901701
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  12901618 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagt 12901701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44054181 - 44054114
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44054181 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 44054114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 13752154 - 13752233
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  13752154 tgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 13752233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18275142 - 18275042
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgc 199  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||| ||| ||||||    
T  18275142 attatgattgatgtaatg--tacccccagtggttttgaccgcttaccagtctgtatgtatgggtagacaacgtgcagggatatttgcttcggttagttgc 18275045  T
Q  200 ttg 202  Q
    |||    
T  18275044 ttg 18275042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Original strand, 18496339 - 18496418
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||||    
T  18496339 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagtattagttgctctagtgagtt 18496418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 21961456 - 21961514
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21961456 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 21961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14867709 - 14867614
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  14867709 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttt-gaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagt 14867614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 20813877 - 20813944
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813877 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 20813944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27959357 - 27959286
Alignment:
Q  127 aatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27959357 aatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcaagattagttgctctggtgagttg 27959286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 37958885 - 37958983
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||  |||||||||    
T  37958885 gattatgat-gatgtaatacttacctccggtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgttcaggattagttgctccggtgagttg 37958983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 53909737 - 53909803
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909737 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 53909803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9650265 - 9650147
Alignment:
Q  16 tcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacg-ttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||  |||| |  |||| | |||||||||||||||||    
T  9650265 tcatgtgatgttaatattctaagagggatggttatgtatacgtgtcatgcatgaaatccttgagtgtttatgattgtttatgtttgattatgattgatgt 9650166  T
Q  114 aaagcttacccccaatggt 132  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  9650165 caagctaacccccaatggt 9650147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Original strand, 43283322 - 43283384
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43283322 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgctctggtgagttg 43283384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 109743 - 109694
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109743 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 109694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 19824315 - 19824411
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| || |||||||    
T  19824315 gattatgat-gatgtaatacttatctccaatggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagaagctgtgcaggagtagttgtttcggtgagt 19824411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 12838179 - 12838246
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12838179 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaacggcctacctgtctgtatggatgggtagac 12838246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13244612 - 13244552
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13244612 ttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccacctacctgtctgtatagatgggtagac 13244552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 15853145 - 15853214
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  15853145 cttacccccagtggttttgaccacatacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggatcagttgct 15853214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34393356 - 34393296
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34393356 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 34393296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Original strand, 8874352 - 8874400
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8874352 ttactcccattggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 8874400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 54120189 - 54120249
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54120189 ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgtctacctgtctgtatggatgggtagac 54120249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 45460889 - 45460972
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctac----ctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  45460889 tgatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtctgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgct 45460972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 13814725 - 13814782
Alignment:
Q  141 cctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13814725 cctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgctctgatgagttg 13814782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14569743 - 14569525
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt-----tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct--- 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      | |||||||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||| | |||| |       
T  14569743 gttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggtctgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggagttgttgttggt 14569644  T
Q  188 ---ttggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattatt 283  Q
       ||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||||  || ||  | ||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||    
T  14569643 tgcttggtaag-tgctcggatagcgggagctatcttcgttatcg-gtctttggaatcttagagtaggctctaatctaggatgtttgtctttatgattgtt 14569546  T
Q  284 ctagattgtttattctggatt 304  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  14569545 ctagattgattatgctggatt 14569525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 16366611 - 16366678
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16366611 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttatccgcctgcctgtctgtatggacgggtagac 16366678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21958145 - 21958105
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21958145 tatgtatatttgctatacatgaatccttgaatgcctatgtt 21958105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33240667 - 33240609
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatgg 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33240667 tgattatg-ttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgg 33240609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33738471 - 33738404
Alignment:
Q  120 tacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||    
T  33738471 tacccacagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcagggttagttgct 33738404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 167
Target Start/End: Original strand, 53706837 - 53706880
Alignment:
Q  124 cccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53706837 cccagtggttttaaccgcctacctgactgtatggatgggtagac 53706880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 7134533 - 7134593
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7134533 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 7134593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8372578 - 8372518
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8372578 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 8372518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10486953 - 10486896
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  10486953 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 10486896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15211486 - 15211426
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15211486 gaccgcctgcttatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 15211426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 15274692 - 15274752
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15274692 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 15274752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 15296071 - 15296128
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  15296071 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 15296128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18166845 - 18166785
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18166845 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 18166785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Original strand, 18241083 - 18241128
Alignment:
Q  158 atgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttgg 203  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18241083 atgggtaggcgaagtgcatggttagttgctttggtgagttgcttgg 18241128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18246149 - 18246089
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18246149 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 18246089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26337767 - 26337710
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  26337767 atgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtgagtagac 26337710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26678150 - 26678090
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26678150 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 26678090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Original strand, 17378153 - 17378249
Alignment:
Q  213 gctatctccattatcgtttccttatag-tcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtctt-ataattattctagattgtttattctggatttat 307  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||  || ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17378153 gctatctccgttatcgttttcttttgggtcttagagtaggctttgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgattatgctgaatttat 17378249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 80
Target Start/End: Original strand, 20597752 - 20597784
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatg 80  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20597752 tatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatg 20597784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 23272058 - 23272122
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||   ||||||| |||||||||    
T  23272058 ccccagtggttttgaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagggttagttgct 23272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 96 - 321
Target Start/End: Original strand, 23236241 - 23236477
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23236241 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttagccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgag 23236340  T
Q  196 ttgcttgg-----------atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattc 284  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23236341 ttgcttggtgattgcttagatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattc 23236440  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23236441 tagattgtttatcttggatttatttatgttgtggaga 23236477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 3420666 - 3420899
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag- 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3420666 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagt 3420765  T
Q  196 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
              ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||    
T  3420766 tgtttggtgattgcttggatagcggaagctatctccgttatcgtttccttagagtc-taggataggttctgatctagg-tgtctgtcgtatgattactct 3420863  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3420864 agattgtttattgtggatttatttatgttttggaga 3420899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19872261 - 19872018
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgc-ttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  19872261 tttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagttgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttt 19872162  T
Q  190 ggtgag-----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttata 277  Q
    ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||     
T  19872161 ggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccattattgtttctttagagtcttagggtaggctctgatctacgatgtctgtctttatg 19872062  T
Q  278 attattctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19872061 attattctatattgtttatttttgatttatttatgttgtggaga 19872018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 5623263 - 5623485
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5623263 ttgattatgattgatgtaaagcttacacctaatggttctgaccacctacttgtcagtatggatgggtaaacgaagtgcatgattagtttctttggtgagt 5623362  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5623363 tgcttggatagcgggagttatctccgttatcgtttccttaaagtc-taggatagactccgatctagg-tgtctgtcttatgattactctaggttgtttat 5623460  T
Q  297 tctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  5623461 tgtggatttatttatgttttggaga 5623485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Original strand, 26561621 - 26561857
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26561621 ttgattatgattgatgtaaagcttaccctcagtggatttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattaattgctttggtgagt 26561720  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||    
T  26561721 tgcttggtgattggttggatagcgggagctatctccattatcattcgtttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctatcttatgattactct 26561818  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatt 324  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  26561819 agattgtttattgtgaatttatttatgttttggagaatt 26561857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11964025 - 11963701
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  11964025 atcatgtgatgctagtagtctaggagggatgattatgtatatatgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtg 11963926  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgag----------- 195  Q
    ||||||||||||| ||| |      | |||||||||||||| ||||||  |  ||||||   |||||||||||| |||| |||||||||               
T  11963925 aagcttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtttgtatgacttagtagacggggtgcaggattagtttgcttttggtgagttgcttggtga 11963826  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  11963825 ttgcttggatagcgggagctatcttcgttatcgtttcct--gagtctgagggtagactctgatctaggatgtctgtctttatatctattctagattgttt 11963728  T
Q  295 attctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11963727 attctagatttatttatattgtggaga 11963701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 16837555 - 16837728
Alignment:
Q  61 tatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16837555 tatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattataattgatgtaaagtttactcccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatg 16837654  T
Q  161 ggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  16837655 ggtagacgaagtgcaggagtagtttgcttttggtgag-tgcttggatagcgggagctaatctccgttattgtttc 16837728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 14345412 - 14345728
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||     
T  14345412 atcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaatcctttaatgtctatgtttgtttatgttgattatgattaatgtg 14345511  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgag----------- 195  Q
    ||||||||||| ||||| |      | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||               
T  14345512 aagcttaccccaaatggatctgtgatggaccgcctacttgtttgtatgaatgggtagacagcgtgcaagattagtttgctttcggtgagttgtttggtga 14345611  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttag-gatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtt 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||   || ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  14345612 ttgcgtggatagcgggagctatctccgttatcgttt-cttggagtcttagatgtaggctttgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattggt 14345710  T
Q  294 tattctggatttatttat 311  Q
    | | ||||||||||||||    
T  14345711 tttgctggatttatttat 14345728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24082450 - 24082251
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24082450 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgactgcctacctatctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 24082351  T
Q  199 -----------cttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
               ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24082350 cttgatggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccgtagagtc-tacgataagctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattattctag 24082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Original strand, 24227689 - 24227882
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgattta---cgttgattatgattgatgta 114  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     |||||||||||||||||     
T  24227689 atgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcatatgtttgtttattttattgattatgattgatgtg 24227788  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttg 202  Q
    ||||||||||||| || ||      | |||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24227789 aagcttacccccagtgtttatgtgatggaccacctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtgcaggattagttgattcggtgagttgcttg 24227882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 5453053 - 5453242
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  5453053 atcatgtgatgctagtattctcggagggatggttatgtatatgtcttatgcatgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 5453152  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |  |||||||| ||||| | ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5453153 atacttaccccaaatggatctgtgatgaaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgctccggtgagttg 5453242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6455042 - 6454824
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6455042 ttgattatgattg-tataaagcttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacggagtgcagggttagttgctttggtgagt 6454944  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  6454943 tgcttggtggttgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtgtccttaaagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattactct 6454847  T
Q  286 agattgtttattctggatttatt 308  Q
    | ||| | | || ||||||||||    
T  6454846 aaattatctgttgtggatttatt 6454824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 20456319 - 20456429
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20456319 atcatgtgatgctagtattataggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 20456418  T
Q  114 aaagcttaccc 124  Q
     ||||||||||    
T  20456419 gaagcttaccc 20456429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7726932 - 7726834
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7726932 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatagatgggtagacgatgtgcaggattagttgctctggtgagttg 7726834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13793472 - 13793373
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13793472 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggataaacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttg 13793373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 37189952 - 37190051
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  37189952 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgttccggtgagttg 37190051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29912385 - 29912279
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  29912385 ttgattatgattgatgtaaagcttacccctagtggtttggaccatctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtacagggttagtcgcttttgtgagt 29912286  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  29912285 tgcttgg 29912279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23453197 - 23453100
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23453197 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttcctttggtgagtt 23453100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23460441 - 23460344
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23460441 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttcctttggtgagtt 23460344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23464702 - 23464605
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23464702 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttcctttggtgagtt 23464605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Original strand, 33628106 - 33628327
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt--ggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||| |    
T  33628106 gattatgattgatgtaaagcttatcttcagtggttttgaccgtctacctatttgtataaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgtttttggtgaat 33628205  T
Q  197 tg-----------cttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtctt-ataattatt 283  Q
    ||           ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| | ||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  33628206 tgtttggtgattgcttggatagcgggagttatctccgttattggttccttttgagtcttatggtaggctctgatctaagatgtctgtctttatgattatt 33628305  T
Q  284 ctagattgtttattctggattt 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  33628306 ctagattgtttatgctggattt 33628327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21615351 - 21615245
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttg 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |    
T  21615351 tttatgttgattatgattgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttactccg 21615253  T
Q  191 gtgagttg 198  Q
    ||||||||    
T  21615252 gtgagttg 21615245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 307
Target Start/End: Original strand, 11765570 - 11765769
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc--tttggtgagttgcttggata 206  Q
    |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||   ||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||    
T  11765570 atgtgaagctaatccccagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgggtagatggagtgcaggagtagtttgctttttggtgag-tgattggata 11765668  T
Q  207 gcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattt 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||  ||| ||||  || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  11765669 gcgggagctatctccgttatcg-gtctttggagttttagagtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgcttttgctggattt 11765767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 24185124 - 24185220
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24185124 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgctctggtgagt 24185220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 11338789 - 11338876
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11338789 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 11338876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21392445 - 21392358
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  21392445 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 21392358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28257796 - 28257698
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||| |||||||||    
T  28257796 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgc-ttggtgagt 28257699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3671810 - 3671669
Alignment:
Q  52 tatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttg------accgcctac 145  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||| |||||||||||| |||  |||||||| | ||| | ||      |||||||||    
T  3671810 tatatatgttatgcgtgaatccttgaatgcttatatttgtttatgttaattatgattgatataatacttacccctagtggatctgtgatggaccgcctac 3671711  T
Q  146 ctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3671710 ctgtctgtatggatgggtagacaatgtgcaagattagttgct 3671669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4863566 - 4863497
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4863566 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 4863497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24470568 - 24470501
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470568 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 24470501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 11765500 - 11765573
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgt 87  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11765500 atcatgtgatgctagtattataggagggattgttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgt 11765573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20710762 - 20710718
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20710762 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 20710718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 21228219 - 21228303
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  21228219 gattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtcaaccaacctgtctgtatggatgggtagacattgtgtaggattagt 21228303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 27185693 - 27185753
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185693 ttgatgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 27185753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 21661608 - 21661646
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661608 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 21661646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23492207 - 23492145
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23492207 gaccgcctacctgtctgtatggctgggtagacgttgtgcaggattagttgctctagtgagttg 23492145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28888186 - 28888124
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28888186 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcagtgagttg 28888124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11579893 - 11579833
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11579893 gaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 11579833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19403804 - 19403732
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19403804 ccccagtggttttgaccgc-tacctgtttgtatggatgagtagacgttgtgcaggattagttgctctagtgagt 19403732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20614897 - 20614840
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  20614897 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacctgcctgtatgggtgagtagac 20614840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10278 - 10218
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10278 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 10218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 1221855 - 1221915
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1221855 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 1221915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 4201961 - 4202018
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  4201961 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 4202018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 9732811 - 9732871
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9732811 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 9732871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 10780334 - 10780394
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10780334 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 10780394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11340570 - 11340510
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11340570 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 11340510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16534394 - 16534337
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16534394 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16534337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 17473921 - 17473981
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17473921 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 17473981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17907786 - 17907726
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||    
T  17907786 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtagc-ttggtgagtt 17907726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 18780264 - 18780324
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18780264 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 18780324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 21934153 - 21934210
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  21934153 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 21934210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 21940323 - 21940380
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  21940323 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 21940380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 22368671 - 22368728
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  22368671 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 22368728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23412253 - 23412165
Alignment:
Q  146 ctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt-gcttt-ggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23412253 ctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcagaagtagtttgcttttggtgagt-gcttggatagcgggagctaatctccattattgtttc 23412165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 25212011 - 25212071
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25212011 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 25212071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 25276163 - 25276223
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25276163 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 25276223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 25902319 - 25902376
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  25902319 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 25902376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 29192886 - 29192946
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29192886 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 29192946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 187
Target Start/End: Original strand, 32968027 - 32968083
Alignment:
Q  133 tttgaccgccta--cctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  32968027 tttgaccgcctatacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgct 32968083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35580539 - 35580482
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  35580539 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 35580482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 37011157 - 37011214
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  37011157 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 37011214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37051269 - 37051212
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  37051269 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttatctgtatgggtgagtagac 37051212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 80
Target Start/End: Original strand, 10178960 - 10178992
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatg 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10178960 tatgtatatgtgctatgcatgaatctttgaatg 10178992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7468633 - 7468404
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7468633 ttgattatgattgatgtaaagcttacctcccatggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaagattagttgctttggtgagt 7468534  T
Q  197 tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctc-----taatctaggatgtctgtcttataattattctagattg 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7468533 tgcttggatagtgggagctatctccgttatcgtttctttagagtcttaggataggctcggctttgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattg 7468434  T
Q  292 tttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7468433 tttattttggatttatttacattgtggaga 7468404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Original strand, 23118685 - 23118909
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgc-tttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23118685 gattatgattgatgtaaaagttacccccagtggttttgaccgcctacttgtccgtatggatgagtagacgaagtgcaggattagttgcttttggtgagtt 23118784  T
Q  198 gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  23118785 gcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttacttagagtcttagggtaagctctgatctaggatgtctttctttatgattattctagattgtttat 23118884  T
Q  297 tctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23118885 tctggatttatttatgttgtggaga 23118909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23217074 - 23216765
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  23217074 atcatgtgatactagtattttaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtg 23216975  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt-gcttt-ggtgagttgcttggata 206  Q
    ||||||||||||| ||| | ||      ||||||||||||| ||| || ||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  23216974 aagcttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtttgt-tgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttgctttcggtgagctgcttggata 23216876  T
Q  207 gcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattt 305  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23216875 gcgggagctatctctgttatcgtttccttagagtcttagggtaggctttgatctagtatgtctgtctttatgattattctagattgtttattctggattt 23216776  T
Q  306 atttatgttgt 316  Q
    |||||||||||    
T  23216775 atttatgttgt 23216765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17264928 - 17264602
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  17264928 atcatatgatgctagtattctaggaggggtgattatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgattgatgtg 17264829  T
Q  115 aagcttacccccaatggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt-gcttt-ggtgagtt--------- 197  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||             
T  17264828 aagcttacctccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacaaagtacatgactagtttgcttttggtgagtttcttgatga 17264729  T
Q  198 --gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgttt 294  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  17264728 ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgatt 17264629  T
Q  295 attctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17264628 attctggatttatttatgttgtggaga 17264602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20708128 - 20707893
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20708128 ttgattatgattgatgtagagcttactcccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagaattagtttctttggtgagt 20708029  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20708028 tgcttggtgattgtttggatagcgggagctctctccgttatcgtttccttagtgtcttaggataggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattct 20707929  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20707928 agattgtttatcttggatttatttatgttgtggaga 20707893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 24554408 - 24554643
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24554408 ttgattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttaaccgcttacctttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagt 24554507  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24554508 tgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatgtctgtcttatgattattct 24554607  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24554608 agattgttaattatagatttatttatgttgtggaga 24554643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17500181 - 17499963
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  17500181 tgattatgtttgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgc-ttggtg-gtt 17500084  T
Q  198 gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17500083 gcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagaatcttaggataggctctgatctaggatgtatg--ttatatttattctagattatttatt 17499986  T
Q  298 ctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    || || ||||||| ||||||||||    
T  17499985 ct-gacttatttacgttgtggaga 17499963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 18263247 - 18263438
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18263247 gttgattatgattgatgtatagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgag 18263346  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18263347 ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggatagactctgatctagg-tgtctgt-ttatgattattctagatt 18263438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33170590 - 33170356
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33170590 gattatgattgatgtaaagcttacgccaagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattaattgcttttggtgagtt 33170491  T
Q  198 gcttgg-----------atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattcta 286  Q
    ||||||           ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  33170490 gcttggtgattgcttggatatcgggagctatctccattattgtttccttagagtcttagggtagactctgatctaggatgtttgttttatgattattcta 33170391  T
Q  287 gattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33170390 gattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 33170356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24237440 - 24237146
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24237440 atcatgtgatgttagtattataggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatctttgaatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 24237341  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggag 213  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||   |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  24237340 gaatcttacccccaatggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgcttggtgag-tgcctggatagcgtgag 24237242  T
Q  214 ctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggatttat 307  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |  |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24237241 ctatctccgttatcgttttcttttgggtcttagagtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgactattctagattgattatgctggatttat 24237146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Original strand, 22499136 - 22499373
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt-gcttt-ggtga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  22499136 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgg-tagacgaagtgcaggattagtttgcttttggtta 22499234  T
Q  195 gttgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattat 282  Q
    |||||           |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  22499235 gttgcttggtgattgcttggatagagggagctatctccgttatcgtttcctttgagtcttagggtagactctgatctaggatgtctgtctttatgattat 22499334  T
Q  283 tctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22499335 tctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 22499373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 326
Target Start/End: Original strand, 19333780 - 19334110
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |     
T  19333780 atcatgtgatgctaggattttaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgcttgtttatgttgattatgattgatatg 19333879  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgag----------- 195  Q
    ||| ||||||| | ||| |      | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||               
T  19333880 aagtttacccctagtggatctgtgatggatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctttcggtgagttgcttggtga 19333979  T
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttag-gatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattattctagattgtt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   || ||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||     
T  19333980 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgttt-cttggagtcttagatttaggctctgatctaggatgt-tgttttatgatttattatagattgtc 19334077  T
Q  294 tattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19334078 tatcctggatttatttatgttttggagaatttt 19334110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Original strand, 45561445 - 45561773
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgattta---cgttgattatgattgat 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     |||||||||||| ||    
T  45561445 atcatgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcttatgtttgtttattttattgattatgattaat 45561544  T
Q  112 gtaaagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggatt-agttgc-tttggtgagtt------ 197  Q
    |  ||||||||||||| ||| |      | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||          
T  45561545 gcgaagcttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattaatttgcttttggtgagttgcttgg 45561644  T
Q  198 -----gcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttag-gatatgctctaatctaggatgtctgt-cttataattattctagatt 290  Q
         |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||   || ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  45561645 tgatcgcttggatagcgggagctatctctgttatcgttt-cttggagtcttagatttaggctctgatctaggatgtctgtgtttatgattattctaaatt 45561743  T
Q  291 gtttattctggatttatttatgttgtggag 320  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45561744 gtttactgtggatttatttatgttgtggag 45561773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Original strand, 21233864 - 21234104
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtct-gtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21233864 ttgattacgattgatgtaaaacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttttgtatggatgggtagatgaagtgcatgattagttgctttggtgag 21233962  T
Q  196 ttgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataa-ttatt 283  Q
    ||||           |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21233963 ttgctcagtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcgtatgataagctctaatctaggatgt-tgtcttataatttatt 21234061  T
Q  284 ctagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21234062 atagattgtctatcctggatttatttatgtcttggagaatttt 21234104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11600470 - 11600253
Alignment:
Q  18 atgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaa 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || |||| |||||||||| ||    
T  11600470 atgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgtggattgtgattgatgtgaa 11600371  T
Q  117 gcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgcttggatagcgggagc 214  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11600370 gcttactcccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcatgagtagtttgcttttggtgag-tgcttggatagcgagagc 11600272  T
Q  215 t-atctccattatcgtttc 232  Q
    | |||| | ||||||||||    
T  11600271 taatcttcgttatcgtttc 11600253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22320040 - 22319816
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22320040 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 22319941  T
Q  114 aaagcttacccccaatgg-----ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgcttt-ggtgagttgcttggata 206  Q
    ||| |||||||||| |||     |  || |||||||||||| | |||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  22319940 aaaacttacccccagtggatctatgatggccgcctacctgtttatatgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttgctttcgctga-ttgcttggata 22319842  T
Q  207 gcgggagctatctccattatcgtttc 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22319841 gcgggagctatctccgttatcgtttc 22319816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25293952 - 25293761
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  25293952 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatacttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 25293853  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgctt 201  Q
    |  |||||||||| ||| |      | |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25293852 atacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtat-gatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgctt 25293761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25755941 - 25755750
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  25755941 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaatccttgaatacttatatttgtttatgttgattatgattgatgta 25755842  T
Q  115 aagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgctt 201  Q
    |  |||||||||| ||| |      | |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25755841 atacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtat-gatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgctt 25755750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23879376 - 23879075
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  23879376 atcatgagatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgtatgaaagccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 23879277  T
Q  114 aaagcttacccccaatggtt-----ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggatta----gttgct---ttggtgagttgctt 201  Q
     ||||| ||||| | |||||     | |||||||||||| | |||||| ||||||||||   ||||| |||||    ||||||   |||||||| |||||    
T  23879276 gaagctaacccctagtggtttgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacggtgtgcaagattagtttgttgcttgcttggtgag-tgctt 23879178  T
Q  202 ggatagcgggagctatctccattatcgtttccttat-agtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtct-tataattattctagattgtttattct 299  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  23879177 ggatagtgggagctatctacgttatcgttttcttttgggtcttagagtaggctctgatctaggatgtctgtctgtatgattattctagattgattattct 23879078  T
Q  300 gga 302  Q
    |||    
T  23879077 gga 23879075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24266332 - 24266101
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  24266332 ttgactatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatggatagacgaagtgcagggttagatgctttcgtgagt 24266233  T
Q  197 tgcttg-----------gatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    ||||||           ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||| | |||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  24266232 tgcttggtggttgctttgatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctttgatctagg-cgtctgt-ttatgattattct 24266136  T
Q  286 agattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||| | | || |||||||| ||||||| ||||||    
T  24266135 agattatctgttgtggattta-ttatgttttggaga 24266101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23350574 - 23350317
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttac----gttgattatgattg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||| |    ||||||||||||||    
T  23350574 atcatgtgatgttagtattttaggagggatgtgtatgtatatgtgttatccatgaagtccttgaatgcttatgtttgttttcatatgttgattatgattg 23350475  T
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcg 209  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||   |||||||| |||||   |||||||| |||||||||| ||    
T  23350474 atgtgaagcttacccccaatgcttttgagcgcctacct-tttttatgaatgggtagacggtgtgcaggagtagtttgcttggtgag-tgcttggataacg 23350377  T
Q  210 ggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtct 269  Q
    | |||||||||| ||||||||||  |  ||||||||  || ||||| || ||||||||||    
T  23350376 gaagctatctccgttatcgtttctgttgagtcttagagtaggctctgatttaggatgtct 23350317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Original strand, 37655485 - 37655584
Alignment:
Q  101 ttatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37655485 ttatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgaccgccaacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagtattagttgctttggtgagttgct 37655584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24906268 - 24906046
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgag 195  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24906268 gattctgattgatgtaaatcttacccccagtggtttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgcatttggtgag 24906169  T
Q  196 -----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttcct-tatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattat 282  Q
               |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| || || ||||| ||||||||| | |||| |||| |||||    
T  24906168 ttgcttggggattgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttcctcttgagtcttggggtaggctctgatctaggatatttgtctttatgattat 24906069  T
Q  283 tctagattgtttattctggattt 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  24906068 tctagattgtttatgctggattt 24906046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15931658 - 15931555
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15931658 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctatatggatcagtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttg 15931559  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  15931558 cttg 15931555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25608329 - 25608220
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  25608329 atcatgtgatgctagtattataggagggatgtttatgtatatgtgctatgcatgaattcttaaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtg 25608230  T
Q  115 aagcttaccc 124  Q
    ||||||||||    
T  25608229 aagcttaccc 25608220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 23154446 - 23154549
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23154446 tgattatgtttgatgtaatgcttatccctagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 23154544  T
Q  198 gcttg 202  Q
    |||||    
T  23154545 gcttg 23154549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26009766 - 26009662
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  26009766 gattatgattgatgtaatgcttagcccctagtggttttgactgcctacctgtctctatggatgggtaaacgttgtgcaggattagttgctttggtgagtt 26009667  T
Q  198 gcttg 202  Q
    |||||    
T  26009666 gcttg 26009662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22884109 - 22883954
Alignment:
Q  91 tttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt--gctt 188  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    ||    
T  22884109 tttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggttttgactgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtttacttt 22884010  T
Q  189 tggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttccttatagtcttag 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  22884009 tggtgag-tgcttggatagtgggagctaatctctgttatcgttt-cttagagtcttag 22883954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5851835 - 5851731
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||| |||||||    
T  5851835 ttgattatgattgatgtaatgcttacccc-agtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagatgacgtgcagggatagttgcttcggtgagt 5851737  T
Q  197 tgcttg 202  Q
    | ||||    
T  5851736 tacttg 5851731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 18043151 - 18043220
Alignment:
Q  252 ctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18043151 ctctgatctaggatgtctgtcttatgattattctagattgtttgttctggatttatttatgttgtggaga 18043220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 20655930 - 20656017
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20655930 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 20656017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23835568 - 23835460
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt 189  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||      
T  23835568 atttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctcc 23835469  T
Q  190 ggtgagttg 198  Q
    |||||||||    
T  23835468 ggtgagttg 23835460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17283567 - 17283469
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  17283567 gattatgattgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacactgtgctggattagttgctccggtgagttg 17283469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29296203 - 29296110
Alignment:
Q  106 attgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29296203 attgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgc-ttggtgagttgct 29296110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38531887 - 38531797
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38531887 tgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgatgtgcatgattagttgctctggtgagttg 38531797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21679446 - 21679351
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21679446 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagt 21679351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 23229136 - 23229236
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||    
T  23229136 gattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtgtgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccagtgagttg 23229234  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  23229235 ct 23229236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 17731374 - 17731471
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17731374 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgactacctatctgtatggatgtgtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagtt 17731471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11542301 - 11542225
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11542301 ttgatgtgaagcttacccc-agtggtttcgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacaaagtgcatgattagtt 11542225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Original strand, 21200024 - 21200092
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  21200024 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgatgtgcaagattagttgctccggtgagtt 21200092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25120758 - 25120671
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  25120758 gattatgat-gatgtaatacttaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 25120671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21695912 - 21695814
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  21695912 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgctgtgcaggattagttgttcttgtgagttg 21695814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 22737821 - 22737918
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22737821 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgg-tgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttg 22737918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 39448633 - 39448731
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39448633 gattatgat-gatgtaatacttaccctcaatggttttgatcgcctacctgtttgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgcgctggtgagttg 39448731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28543164 - 28543068
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||    
T  28543164 gattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggatttgttg-tttggtgagtt 28543068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 21192587 - 21192667
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  21192587 cttacccctagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctccggtgagttg 21192667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20479908 - 20479839
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20479908 ttgattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 20479839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29758554 - 29758505
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29758554 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 29758505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Original strand, 24387599 - 24387647
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24387599 ttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 24387647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41243961 - 41243874
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  41243961 gattatgat-gatgtaatacttaacccaagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 41243874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22311433 - 22311362
Alignment:
Q  56 tgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttaccccc 126  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22311433 tgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattaatgtaaagcttaccccc 22311362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 22323409 - 22323468
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22323409 tgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagac 22323468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16000496 - 16000360
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt--gctttggtg 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    |||| ||    
T  16000496 gttgattatgattgatgtgaagcttatttccagtggtttcaaccgcctacctgtttgtatgaatgtgtagacggagtgcaggagtagtttgtttttgatg 16000397  T
Q  194 agttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtt 230  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  16000396 ag-tgcttggatagcggaagctaatctccgttatcgtt 16000360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 269922 - 269862
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  269922 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 269862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 645999 - 646059
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  645999 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 831734 - 831794
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  831734 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 831794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 18769996 - 18770045
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18769996 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgtgtagac 18770045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37605274 - 37605209
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  37605274 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 37605209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 41509151 - 41509211
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41509151 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 41509211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 43375498 - 43375547
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43375498 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatggatagac 43375547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Original strand, 16204184 - 16204232
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16204184 cttacccccagtggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtaga 16204232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Original strand, 33612877 - 33612948
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   || ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  33612877 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggacagacgttgtacagaattagctgctttggttagttgct 33612948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16416552 - 16416467
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16416552 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagaggttttagctgtctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggagtagt 16416467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 17148105 - 17148162
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  17148105 atgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 17148162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22311272 - 22311236
Alignment:
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22311272 ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtttc 22311236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23638201 - 23638161
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23638201 tatgtatatgtgatatgcatgaatccttgaatgcttatgtt 23638161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25608134 - 25608099
Alignment:
Q  196 ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25608134 ttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgttt 25608099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 19995063 - 19995132
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19995063 ttgattatgat-gatgtaatacttaccccaagtggatgtaactgcctacctgtctgtatggatgggtagac 19995132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 273076 - 273133
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  273076 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 273133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 642773 - 642716
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  642773 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 642716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 828579 - 828522
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  828579 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 828522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 3433747 - 3433807
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3433747 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 3433807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5236478 - 5236421
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  5236478 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 5236421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 11542368 - 11542327
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatat 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11542368 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatat 11542327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 16874800 - 16874857
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16874800 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 16874857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 21846365 - 21846422
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  21846365 atgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 21846422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 21853770 - 21853827
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  21853770 atgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 21853827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 22090318 - 22090375
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  22090318 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 22090375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23509039 - 23508979
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23509039 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 23508979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 24663120 - 24663177
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  24663120 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 24663177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 24719543 - 24719603
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24719543 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 24719603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25261588 - 25261551
Alignment:
Q  153 tatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttg 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25261588 tatggatgggtagacaacgtgcatgattagttgctttg 25261551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28835951 - 28835891
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28835951 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 28835891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43683937 - 43683880
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  43683937 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 43683880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 16041598 - 16041650
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  16041598 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgctt 16041650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 16043274 - 16043326
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  16043274 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgctt 16043326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 84747 - 84529
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  84747 gattatgattgatgtaaagcttaccctaagtggttttgaccgcctacccgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 84648  T
Q  199 cttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  84647 cttggatagcgggagctatctccgttatcgtttccttagagtcttagaataagctctgatctaggat----gtcttatgattattctagattgtttattt 84552  T
Q  299 tggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    || |||||||||  |||||||||    
T  84551 tgaatttatttacattgtggaga 84529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25891 - 25658
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25891 gattatgattgatataaatcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaggtgcaggattagttgctttggtgagttg 25792  T
Q  199 cttgg-----------atagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
    |||||           |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  25791 cttggtgattccttggatagcgggagctatctccgttatcgcttccttagagtcttaggataggctctgatctaggatgtttgtcttatgattattttag 25692  T
Q  288 attgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25691 attgtttattctggatttatttacgttgtggaga 25658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Original strand, 331054 - 331101
Alignment:
Q  140 gcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  331054 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 331101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Original strand, 22897 - 23101
Alignment:
Q  21 tgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagctt 120  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22897 tgatgctagtattctaggagagatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcatatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaagctt 22996  T
Q  121 acccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagctatctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22997 acccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatgaatgggtagacgaagt----ggtgagttgc-ttggtga-ttgcttggatagcgggagctatctc 23090  T
Q  221 cattatcgttt 231  Q
    |||||||||||    
T  23091 cattatcgttt 23101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Original strand, 3543 - 3783
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag- 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  3543 ttgattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagaattagttgctttggtgagt 3642  T
Q  196 ----------ttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattattc 284  Q
              |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||     
T  3643 tgctcggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcgtaggataggctctgatctaggatgt-tgtcttatgatttatta 3741  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3742 tagattgtctatcctggatttatttatgttttggagaatttt 3783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6066 - 5847
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6066 ttgattatgattgatgtaaatcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagt 5967  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
    |||           |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  5966 tgcttggtggtttcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattactct 5870  T
Q  286 agattgtttattctggatttatt 308  Q
    ||||| | | || ||||||||||    
T  5869 agattatctgttgtggatttatt 5847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36235 - 35995
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36235 ttgattatgattgatgtaaagcttactctcagtggttttgaccgcctacatttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagt 36136  T
Q  197 -----------tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattattc 284  Q
               ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||| ||||| | ||||||||| | |||| | | |||||     
T  36135 tgctcggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggttccgtagagtcataggataagctctgaactaggatgt-tatcttttgatttatta 36037  T
Q  285 tagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36036 tagattgtctatcctgaatttatttatgttttggagaatttt 35995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 6886 - 7080
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgattta---cgttgattatgattgat 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   | |||||||||||||||    
T  6886 atcatgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatatactatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatttcattgattatgattgat 6985  T
Q  112 gtaaagcttacccccaatggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    |||||||||||| ||| ||| |      | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6986 gtaaagcttaccaccagtggatcagtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgct 7080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 36944 - 37113
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatga-atccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   |||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36944 atcatgtgatgttagtattctagaaatgatgggtaggtatatgtgttatgcatgagatccttgaatgcttattttg-tttatgttgattatgattgatgt 37042  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  37043 gaagcttacccccagtagttttgaccgcctgcctatttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtt 37113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 290
Target Start/End: Original strand, 2874 - 3061
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2874 attatgattgatgtaaagcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtatggatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttgatgagttgc 2973  T
Q  200 ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  2974 ttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtcctcagagtc-tataataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattattctagatt 3061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 256550 - 256847
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  256550 atcatgtgaagttagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgtatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 256649  T
Q  114 aaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct------ttggtgagttgcttggatag 207  Q
     ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||   ||||| || |||||| |      || ||||| ||||||||||     
T  256650 gaagcttacccctagtgg-tttgaccgcctacctgtttggattaatgggtagacggcgtgcatgagtagttgttgattgcttcgtgag-tgcttggataa 256747  T
Q  208 cgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattattctagattgtttattctggattta 306  Q
    |||||| ||||||| ||||||  || || | |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  256748 cgggagttatctccgttatcg-gtctttgttgtcttagagtaggctctgatctaggatgtctgtctttatgattattctagattgattatgctggattta 256846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 230
Target Start/End: Original strand, 98798 - 98934
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag--ttgctttggtg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | || |||  ||  |||||||    
T  98798 gttgattatgattgatgtgaagcttaacccctgtggtttcgaccgcctacttgtttgtatgaatgggtagacagagtagatgagtagttttcttttggtg 98897  T
Q  194 agttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtt 230  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  98898 ag-tgcttggatagcaggagctaatctccgttatcgtt 98934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 236417 - 236337
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  236417 tgatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacgctgtgcagggatagttgctt 236337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 130214 - 129985
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  130214 gattatgattgatgtaaagcttaccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcaggattaattgctttggtgagttg 130117  T
Q  199 c-----------ttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctag 287  Q
    |           ||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  130116 cttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcgggtccttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtttgtcttatgattactctag 130019  T
Q  288 attgtttattctggatttatttatgttgtggaga 321  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  130018 attctttattttggacttatttatgttttggaga 129985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 106742 - 106840
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  106742 gattatgat-gatgtaatacttacccccaatgattttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttg 106840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 107922 - 107824
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  107922 gattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtattaatgggtagacgtggtgcatgattagttgctctggtgagttg 107824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Original strand, 114157 - 114233
Alignment:
Q  120 tacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  114157 tacccccagtggttttgaccgcctacctatttgtatggatgggtagacgatgtgcaggagtagttgctctggtgagt 114233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Original strand, 13145 - 13300
Alignment:
Q  19 tgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaag 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||    
T  13145 tgtgatgatagtattctaggaggcatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaag 13244  T
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtg 173  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13245 cttacccatagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgaagtg 13300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20218
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||     
T  20459 ttgattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggattttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttgatgat 20360  T
Q  196 t-----------tgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataat-tatt 283  Q
    |           |||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || |||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||    
T  20359 ttgctcagtgactgcttggatagcgggagctatctttgttatcggttccgtagagtcgtaggataggctctgacctaggatgt-tgtcttatgatctatt 20261  T
Q  284 ctagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20260 atggattgtctatcctggatttatttatgttttggagaatttt 20218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 99463 - 99253
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||             |    
T  99463 gattatgattgatgtaaagcttaatcccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgcatgggtagacgaagtgcaggattagtt-------------g 99377  T
Q  199 cttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatcta-ggatgtctgtcttataattattctagattgtttatt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||  | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  99376 cttggatagcgggagctatcttcattatcgtttccttagagtc-taggataggctctgatctataggtgtctgtcttatgattactctagatcatttatt 99278  T
Q  298 ctggatt-tatttatgttgtggaga 321  Q
     |||||| |||||||||| ||||||    
T  99277 ttggattatatttatgttatggaga 99253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 217640 - 217689
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  217640 cttaccccccgtggttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagac 217689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5192 - 5132
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5192 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 290
Target Start/End: Original strand, 25805 - 26005
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga-- 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||      
T  25805 ttgattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttggtatggatgggtagacgaagtgcagagttagttgttttggtgagt 25903  T
Q  195 ---------gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattct 285  Q
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  25904 tgcttggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctagg-tgtctgt-ttatgattattct 26000  T
Q  286 agatt 290  Q
    |||||    
T  26001 agatt 26005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 104293 - 104053
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  104293 ttgattatgattgatgtaaagcttacttccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgaaggattagttgcttcggtgagt 104194  T
Q  197 tgc-----------ttggatagcgggagctatctccattatc-gtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattatt 283  Q
    |||           ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||     
T  104193 tgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggtttccttagagtc-tagggtaggctctgatctagg-tgtatgtcttatgatttatc 104096  T
Q  284 ctagattgtttattctggatttatttatgttgtggagaatttt 326  Q
     |||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  104095 ttagattgactatcctggatgtatttatgttttggagaatttt 104053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6901
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga-- 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||      
T  6725 ttgattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagctgctttgatgatt 6824  T
Q  195 ---------gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctagg 263  Q
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||    
T  6825 tgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-taggacaggctctgatctagg 6901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4340 - 4274
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340 gattatgat-gatgtaaagctcagccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Original strand, 121728 - 122005
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatg-ttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||| ||    ||||||||||||||||    
T  121728 atcatgtgatgttagtattctaggagggacgggtatgtatatgtgctatgtatgaaattcttgaatgcttatgattgtttatatttgattatgattgatg 121827  T
Q  113 taaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcggga 212  Q
    | |||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| |||||   ||||| || ||||||||||||||||    
T  121828 tgaagc-taacccaagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagaaggagtgcaggaatagtttgcttggttag-tgcttggatagcggga 121925  T
Q  213 gctatctccattatcg-tttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgt-cttataattattctagatt 290  Q
    ||| |||   |||||| |||| ||  ||||||||  || | ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  121926 gctttctttgttatcgttttctttcaagtcttagagtaggatctgatctaggatgtctgtccttatgattattctagatt 122005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 200
Target Start/End: Original strand, 106461 - 106553
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  106461 tgatgtaatgcttacccccagtagttttgaccgcctacctgtctgtattgatgggtagacgctgtgtaggattagttgctttggtgagttgct 106553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53926 - 53877
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53926 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 53877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11770 - 11668
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11770 gattatgattgat-taatgcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgcttctgtgagttg 11672  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  11671 cttg 11668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29634 - 29577
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  29634 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 29577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 99031 - 99134
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  99031 gattatgattgatgtaatgtttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttg 99130  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  99131 cttg 99134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30327 - 30230
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30327 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 30230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 68589 - 68511
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  68589 cttacccccagtggttttgactgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagt 68511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 807
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  913 ttgattatgattgatgtaaagcttacacccagtggttttgaccgcctacctgtctttgtggatgggtagatgaggtgcagggttagttgctttggtgagt 814  T
Q  197 tgcttgg 203  Q
    |||||||    
T  813 tgcttgg 807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 22329 - 22502
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcc---tatgttgatttacgttgattatgattga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    ||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  22329 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatgctgcttatgtttgtttatgttgattgtgattga 22428  T
Q  111 tgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  22429 tgtgaagcttacccctagtggttttgattgcctacctgtttgtatgaaagggtagacggagtgcaggagtagtt 22502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 19652 - 19753
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  19652 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagaagtagttgctttggtgagttg 19751  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  19752 ct 19753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 29228 - 29329
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  29228 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagaagtagttgctttggtgagttg 29327  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  29328 ct 29329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9889 - 9793
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9889 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttggccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagt 9793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 177
Target Start/End: Original strand, 138660 - 138737
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcagg 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  138660 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagg 138737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 76602 - 76514
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaa-tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  76602 gattatgat-gatgtaatacttacccctaagtggttttaaccgcgtacctatctgtatggatgggtagacgatgtgcagggttagttgct 76514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 1958 - 2061
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1958 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgtctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttg 2057  T
Q  199 cttg 202  Q
    ||||    
T  2058 cttg 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 73197 - 73279
Alignment:
Q  151 tgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgcttt-ggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  73197 tgtatgaatgggtagacggagtgcaagagtagttgcttttggtgagt-gcttggatagcgggagctaatcttcgttatcgtttc 73279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1585 - 1480
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||| |||||||    
T  1585 ttgattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaagtagttgcttcggtgagt 1486  T
Q  197 tgcttg 202  Q
    ||||||    
T  1485 tgcttg 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10650 - 10463
Alignment:
Q  53 atatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttg------accgcctacc 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||      ||||||||||    
T  10650 atatgtgttatgcatgaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaaacttacccccagtggatctgtgatgaaccgcctacc 10551  T
Q  147 tgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt-tgc-tttggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  10550 tgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtatgcttttggtgag-tgcttggatagcgggagctaatctctgttatcgtttc 10463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18945 - 18748
Alignment:
Q  119 ttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga-----------gttgcttggatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||           |||||||||||||    
T  18945 ttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttgatgagttgctcggtggttgcttggatag 18846  T
Q  208 cgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgtttattctggatttat 307  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||| || |||| ||||    
T  18845 tgggagctatctccgttatcgtgtccttagagtc-tatgatagactctgatctagg-tgtctgt-ttctgattattctagattatttgttgtggacttat 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 24267 - 24365
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24267 gattatgat-gatgtagtgctcacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttg 24365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26422 - 26362
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26422 gaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgc-ttggtgagtt 26362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 25450 - 25548
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25450 gattatgattgatgtaatgcttacccccaattgttttgaccgcctacctatctgtatggatgcgtagacgttgtgcatgattagttgctttggtgagtt 25548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 326
Target Start/End: Original strand, 141148 - 141354
Alignment:
Q  131 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgag-----------ttgcttggatagcgggagctatct 219  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||           |||||||||||| |||||||||||    
T  141148 gttttgaccacctacctgtttgtatggatgggcagacgaagtgcaggattagttgcttaggtgagttgctcggtgattgcttggatagggggagctatct 141247  T
Q  220 ccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttat-aattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtgg 318  Q
    || |||||| || | || | || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||    
T  141248 ccgttatcggtttcgtagaatcgtaggataggctctgatctagaatgt-tgtcttatgatttattatagattgtctatcctagatttatttatgttttgg 141346  T
Q  319 agaatttt 326  Q
    ||||||||    
T  141347 agaatttt 141354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 78251 - 78304
Alignment:
Q  143 tacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  78251 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgc-ttggtgagtt 78304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9690 - 9603
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga 194  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  9690 ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtga 9603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 15096 - 15214
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  15096 atcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgatttatgt 15195  T
Q  114 aaagcttacccccaatggt 132  Q
     ||||| ||||||| ||||    
T  15196 gaagctaacccccagtggt 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Original strand, 15705 - 15777
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt-tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15705 gttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggtctttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagac 15777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19739 - 19519
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttg-aatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatg 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  19739 atcatgtgatgctagtactctaggagggatggttatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaaatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatg 19640  T
Q  113 taaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagttgcttggatagcgg 210  Q
    | |||||||  |  | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||     
T  19639 tgaagctta-acatagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgtgtagacggagtgcagtagtagtttgcttttggtgag-tgtttggatagcga 19542  T
Q  211 gagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||||| |||| | ||||||||||    
T  19541 gagctaatcttcgttatcgtttc 19519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 199208 - 199312
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||    
T  199208 ttgattatgattgatgtaatgcttacccc-agtggttttgacatcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagggatagttgcttcggtgagt 199306  T
Q  197 tgcttg 202  Q
    ||||||    
T  199307 tgcttg 199312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 232
Target Start/End: Original strand, 45431 - 45574
Alignment:
Q  90 atttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgctt 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  |||||| || ||| ||||||    
T  45431 atttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccggtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaataggtagacggagtgcatgagtagtttgctt 45530  T
Q  189 tggtgagttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  45531 tggcgag-tgcttggataacgggagctaatctccgttatcgtttc 45574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29438 - 29339
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||| | |||||||    
T  29438 gattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgttgtgtaggattagttgcttcgttgagttg 29339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Original strand, 5250 - 5340
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  5250 tgatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgttccggtgagttg 5340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 12490 - 12587
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||    
T  12490 tgattatgat-gatgtaatgcttacccccactggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagt 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7312 - 7215
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7312 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagtt 7215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 924 - 820
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||  ||||||    
T  924 ttgattatgattaatgtaatgcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcaaggttagttgcttcagtgagt 826  T
Q  197 tgcttg 202  Q
    | ||||    
T  825 ttcttg 820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8400 - 8304
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||||    
T  8400 gattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgctgtgcaggagtagttgctatggtgagt 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55771 - 55653
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||     
T  55771 gattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtttctatgaatgagtagacgaagtgcaggagtagtttgcttttggtgag- 55673  T
Q  197 tgcttggatagcgggagcta 216  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  55672 tgcttggattgcgggagcta 55653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33811 - 33712
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  33811 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgactgcctacatgtctgtatggattggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttg 33712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Original strand, 16689 - 16747
Alignment:
Q  260 taggatgtctgtctt-ataattattctagattgtttattctggatttatttatgttgtg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16689 taggatgtctgtctttatgattatactagattgattattctggatttatttatgttgtg 16747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51645 - 51547
Alignment:
Q  100 attatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  51645 attatgattgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttg 51547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11702 - 11587
Alignment:
Q  52 tatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtc 150  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||     
T  11702 tatatatgttatgcatgaaatccttgaatgt-tatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaaactaacccctagtggttttgaccgcctacctgtt 11604  T
Q  151 tgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||    
T  11603 tgtatgaatgggtagac 11587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Original strand, 70161 - 70244
Alignment:
Q  117 gcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgctt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  70161 gcttacccccattggttttgaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtcgc-ttggtgagttgctt 70244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 78030 - 77932
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  78030 gattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtattgatgagtagacgttgtgcagcattagttgctctggtgagttg 77932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 91047 - 91107
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  91047 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaattagttgc-ttggtgagtt 91107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 263
Target Start/End: Original strand, 70249 - 70316
Alignment:
Q  195 gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  70249 gttgcttggatagcgggagctatctccactatcgtgtctttagggtc-taggataggctctgatctagg 70316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2920 - 2824
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||    
T  2920 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttc-ttggtgagtt 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 2920 - 3017
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||||||    
T  2920 tgattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggaatagttgctccggtgagt 3017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 11175 - 11272
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||||||    
T  11175 tgattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggaatagttgctccggtgagt 11272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 14141 - 14226
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  14141 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttg 14226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4280 - 4172
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag--ttgcttt-ggtga 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  4280 tgattatgattgatgtaaagctaacccccagtggttctgactgcctacctgtttgtatgaatgggtaaacggagtgcaggagtagttttgctttcggtga 4181  T
Q  195 gttgcttgg 203  Q
    |||||||||    
T  4180 gttgcttgg 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 144978 - 144905
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  144978 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 144905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Original strand, 3216 - 3303
Alignment:
Q  27 tagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  3216 tagtattctaggagggatggttatgtatatttgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttattttgattatgattgatgt 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6115 - 6017
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6115 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctaactgtctgtatggatggttagacgctgtgtagaattagttgctctggtgagttg 6017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5771
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5850 tgatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 5771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 200
Target Start/End: Original strand, 31508 - 31586
Alignment:
Q  121 acccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgct 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31508 acccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggagtagttgc-ttggtgagttgct 31586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 7476 - 7574
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7476 gattatgat-gatgtaatacttaccctcaatggttttgatcgcctacctgtttgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgcgctggtgagttg 7574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1635 - 1568
Alignment:
Q  131 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1635 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgctctggtgagttg 1568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1361
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1292 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 92265 - 92169
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  92265 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggaatagttgc-ttggtgagtt 92169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 11138 - 11195
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  11138 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 11195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 86178 - 86238
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  86178 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 86238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 59878 - 59790
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  59878 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 59790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26879 - 26799
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  26879 ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 26799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6876 - 6809
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| || |||||||    
T  6876 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgatgtgcaggggtagttgtttcggtgagt 6809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 2498 - 2595
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2498 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaacagcctacctgactgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 2595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 4600 - 4736
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattag-ttgc-tttggtga 194  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  4600 ttgattatgatttatgtgaagcttacacc-agtggttttgaccacctacctatttgtatgaattggtagacagagtgcaggagtagtttgcttttggtga 4698  T
Q  195 gttgcttggatagcgggagct-atctccattatcgtttc 232  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  4699 g-tgcttggatagtgggagctaatctctgttatcgtttc 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4808
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4712 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgctgtgcaggaatagttgc-ttggtgagtt 4808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6972 - 6899
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||| ||||||||||    
T  6972 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtacaggtttagttgc-ttggtgagtt 6899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 18503 - 18564
Alignment:
Q  21 tgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgc 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||||    
T  18503 tgatgttagtattctaggagtaatgattatgtatatgtgctttacttgaaatccttgaatgc 18564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0725 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0725
Description:

Target: scaffold0725; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7363 - 7267
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  7363 tggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagt----ggtgagttgc-ttggtga-ttgcttggatagcgggagttatcttcgttatcg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7356
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7416 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3581 - 3513
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||| ||||||||||||    
T  3581 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtacatgattagttg-tttggtgagttg 3513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45901
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45841 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 45901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37773 - 37706
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37773 gattatgat-gatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 37706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 249399 - 249448
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  249399 cttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 249448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 125303 - 125352
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125303 cttacacccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 125352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 72304 - 72387
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  72304 gattatgat-gatgtaatacttacccctagttgttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggagtagt 72387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 76685 - 76768
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  76685 gattatgat-gatgtaatacttacccctagttgttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggagtagt 76768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 256814 - 256881
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  256814 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccacctacctatctgtatggatgggtagac 256881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 3400 - 3479
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 198  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||    
T  3400 cttacccccagtgattttgacggcctacctgt-tgtatggatgggtagacattgtacatgattagttgctctggtgagttg 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5721 - 5579
Alignment:
Q  48 tatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgttgatttacgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt-----tttgaccgc 141  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||      | ||||||    
T  5721 tatgtatatgtgttatgaatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagttaacccccagtggtgtatggtggaccgc 5622  T
Q  142 ctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagtt 184  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||   ||||| ||||||||    
T  5621 ctacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcatgattagtt 5579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5054 - 5010
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5054 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 5010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 13727 - 13814
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||    
T  13727 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtacacgttgtgcagggttagttgct 13814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12479 - 12419
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  12479 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacattgtgcaggagtagt 12419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21380 - 21313
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21380 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgactgtatggatgggtagac 21313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 26647 - 26734
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  26647 gattatgat-gatgtaatacttaccctgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct 26734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 188
Target Start/End: Original strand, 66607 - 66666
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctt 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  66607 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctt 66666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20873 - 20810
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 163  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20873 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtgcttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 20810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28463 - 28396
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28463 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgactgcctaactgtctgtatggattggtagac 28396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31781 - 31702
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  31781 tgatgtaatgcttaccgcccgtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct 31702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 78668 - 78734
Alignment:
Q  99 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  78668 gattatgattgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtacggatcggtaga 78734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 7272 - 7341
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7272 ttgattatgat-gatgtaatacttacccccggtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagac 7341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4373
Alignment:
Q  124 cccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4415 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 167
Target Start/End: Original strand, 19497 - 19543
Alignment:
Q  121 acccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497 acccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2446 - 2386
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2446 gaccgcctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgcaggattagttg-tttggtgagtt 2386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5310 - 5250
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5310 gaccgcctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgcaggattagttg-tttggtgagtt 5250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 299 - 239
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  299 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgc-ttggtgagtt 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 187
Target Start/End: Original strand, 7027 - 7114
Alignment:
Q  98 tgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct 187  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || |||||||||||    
T  7027 tgattatg-ttgatgtaatgcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtccatgattagttgct 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36390 - 36325
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagt 183  Q
    |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  36390 cttacccctagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggagtagt 36325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 39446 - 39503
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  39446 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 39503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 77569 - 77509
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  77569 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagtcgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 77509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Original strand, 7124 - 7168
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 7168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17511 - 17473
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17511 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 17473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40994 - 40925
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40994 ttgattatgata-atgtaatacttatccccagtggttttaaccgcctacctatctgtatggatgggtagac 40925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27921 - 27864
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  27921 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaattagttg-tttggtga 27864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37622 - 37576
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 164  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37622 cttacccccagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggta 37576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1610 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1610
Description:

Target: scaffold1610; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 119 - 168
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  119 cttacccctagtggttttaaccgcctacctctctgtatggatgggtagac 168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1605 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1605
Description:

Target: scaffold1605; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1460 - 1411
Alignment:
Q  118 cttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1460 cttacccctagtggttttaaccgcctacctctctgtatggatgggtagac 1411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5373 - 5313
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5373 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4069 - 3996
Alignment:
Q  123 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||| || | |||||||| ||||||||    
T  4069 ccccagtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgtagcagtagttgctctggtgagt 3996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2747
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||    
T  2687 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtagc-ttggtgagtt 2747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 10151 - 10211
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10151 gaccgcctacctatttgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgc-ttggtgagtt 10211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17706 - 17646
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||    
T  17706 gaccgcctacctctctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatg-tttggtgagtt 17646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 712 - 772
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  712 gaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgc-ttggtgagtt 772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25541 - 25484
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  25541 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagac 25484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 24604 - 24664
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||    
T  24604 gaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgc-ttggtgagtt 24664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 94238 - 94178
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  94238 gaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgc-ttggtgagtt 94178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 304
Target Start/End: Original strand, 247633 - 247851
Alignment:
Q  96 gttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggt-----tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgct--- 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      | |||||||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||| | |||| |       
T  247633 gttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggtctgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggagttgttgttggt 247732  T
Q  188 ---ttggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtc-ttataattatt 283  Q
       ||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||||  || ||  | ||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||    
T  247733 tgcttggtaag-tgctcggatagcgggagctatcttcgttatcg-gtctttggaatcttagagtaggctctaatctaggatgtttgtctttatgattgtt 247830  T
Q  284 ctagattgtttattctggatt 304  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  247831 ctagattgattatgctggatt 247851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 88
Target Start/End: Original strand, 4303 - 4339
Alignment:
Q  52 tatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcctatgtt 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4303 tatatgtgctatgcatgaatccttgaatgcttatgtt 4339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3750 - 3652
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagt 196  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||   |||||||| |||| || |||||||||    
T  3750 ttgattatg-ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggactagtagc-ttggtgagt 3653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 4009 - 4068
Alignment:
Q  108 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4009 tgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctctctgtatggttgggtagac 4068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Original strand, 113 - 172
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  113 ttgatgtaatacttacccccagtggtcttaaccccctacctgtctatatggatgggtaga 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6636
Alignment:
Q  107 ttgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 166  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6577 ttgatgtaatacttacccccagtggtcttaaccccctacctgtctatatggatgggtaga 6636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3171 - 3055
Alignment:
Q  195 gttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttccttatagtcttaggatatgctctaatctaggatgtctgtcttataattattctagattgttt 294  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| |||| |||||||| | |    
T  3171 gttgcttggataacgggagctatatccgctatcgtgtccttagagtc-taggataggctctgatctacg-tgtctgt-ttatgattactctagattatct 3075  T
Q  295 attctggatttatttatgtt 314  Q
     || |||||||||| |||||    
T  3074 gttttggatttattcatgtt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31009 - 30978
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31009 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 30978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12053 - 12007
Alignment:
Q  188 ttggtgagttgcttggatagcgggagctatctccattatcgtttcctt 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12053 ttggtgagt-gcttggatagcgggagctatctccgttgtcgtttcctt 12007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 56177 - 56146
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56177 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 56146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13949 - 13911
Alignment:
Q  129 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13949 tggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagac 13911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 17943 - 18012
Alignment:
Q  97 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  17943 ttgattatgata-atgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagac 18012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3027 - 2967
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3027 gaccgcctgcctgcctgtatggatgggtagacgttatgcaggattagttgc-ttggtgagtt 2967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 15823 - 15880
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  15823 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 15880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28553 - 28493
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28553 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgc-ttggtgagtt 28493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33398 - 33341
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  33398 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 33341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 8816 - 8775
Alignment:
Q  15 atcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatat 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8816 atcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatat 8775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20931 - 20874
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  20931 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25186 - 25129
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  25186 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3507
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  3450 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 3507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37572 - 37515
Alignment:
Q  110 atgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  37572 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagac 37515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30621 - 30561
Alignment:
Q  136 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaaagtgcaggattagttgctttggtgagtt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30621 gaccgcctgcctgtctgtatggattggtagacgttatgcaggattagttgc-ttggtgagtt 30561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Original strand, 24151 - 24211
Alignment:
Q  21 tgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatg 80  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  24151 tgatgttagtattctaggagtgatgaatatgtatatgtgctatacttgaaatccttgaatg 24211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University