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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF6625_low_1 (Length: 818)
Name: NF6625_low_1
Description: NF6625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6625_low_1 |
 | |
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 748; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 748; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 808
Target Start/End: Original strand, 47136617 - 47137408
Alignment:
| Q |
18 |
accaatacccattctcttaaaaatttgtgatacacctgaaacaatgcttcaaaatattaagtcagatcagaattagacaattacccacaaggataaggga |
117 |
Q |
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| T |
47136617 |
accaatacccattctcttaaaaatttgtgatacacctgaaacaatgcttcaaaatattaagtcagatcagaattagacaattacccacaaggataaggga |
47136716 |
T |
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| Q |
118 |
tagtttgcttaaagtaaccatctgagttttctctatgtagatttttcaaaaacaaaatcataaaggttagaatccatataaagaggaaggacataccaaa |
217 |
Q |
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| T |
47136717 |
tggtttgcttaaagtaaccatctgagttttctctatgtagatttttcaaaaacaaaatcataaaggttagaatccatataaagaggaaggacataccaaa |
47136816 |
T |
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| Q |
218 |
agttatgatgctacaacttattaatgtaccaacagcaccaaacgacatgatagttatgaagttaacaaaaaaccgcttctttttaacctgaaacctgaaa |
317 |
Q |
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| T |
47136817 |
agttatgatgctacaacttattaatgtaccaacagcaccaaacgacatgatagttatgaagttaacaaaaaaccgcttctttttaacctgaaacctgaaa |
47136916 |
T |
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| Q |
318 |
taaattacatttatgtataagctatttctataatgaaaccagaacatagttaaactatttccacaacctatcatataaactttatattgaaatatactaa |
417 |
Q |
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| T |
47136917 |
taaattacagttatgtataagctatttctataatgaaaccagaacatagttaaactatttccacaacctatcatataaactttatattgaaatatactaa |
47137016 |
T |
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| Q |
418 |
aaacaaattcagaacacaccataaaccattttcataagattttaacaaagactttcaagtgttcctcaatcaaacaaacataaatagagcatggtac-aa |
516 |
Q |
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| T |
47137017 |
aaacaaattcagaacacaccataaaccattttcataagattttaacaaagactttcaagtgttcctcaatcaaacaaacataaatagagcatggtacaaa |
47137116 |
T |
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| Q |
517 |
aaaattacccggcattaaagatgatgggaggtagaagatatatnnnnnnnngatcttcactaaaaactagtagatgcgagcttttaccaccacttatcca |
616 |
Q |
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| T |
47137117 |
aaaattacccggcattaaagatgatgggaggtagaagatatataaaaaaaagatcttcactaaaaactagtagatgcgagcttttaccaccacttatcca |
47137216 |
T |
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| Q |
617 |
caaaataaccacaccggtgcatagaccctgatcaaagcaatccacatgaaatttagtcaccaccataccactcacacttcacaccaatgtttttaaaaac |
716 |
Q |
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| T |
47137217 |
caaaataaccacaccggtgcatagaccctgatcaaagcaatccacatgaaatttagtcaccaccataccactcacacttcacaccaatgtttttaaaaac |
47137316 |
T |
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| Q |
717 |
cgaacttaccagacgattcaaccggttgaaccgtgaattggcaccatttatgattcagatattttagtggctcaactataattttgcctatg |
808 |
Q |
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| T |
47137317 |
cgaacttaccagacgattcaaccggttgaaccgtgaattggcaccatttatgattcagatattttagtggctcaactataattttccctatg |
47137408 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36489351 - 36489261
Alignment:
| Q |
236 |
tattaatgtaccaacagcaccaaacgacatgatagttatgaagttaacaaaaaaccgcttctttttaacctgaaacctgaaataaattaca |
326 |
Q |
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| T |
36489351 |
tattaatgtgccaatagctccaaatgatgtgatagtcatgaagttgacaaaaaactgctttttctttacttgaaacctgaaatatattaca |
36489261 |
T |
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