View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6630_high_16 (Length: 247)

Name: NF6630_high_16
Description: NF6630
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6630_high_16
NF6630_high_16
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (1-231)||(7457935-7458165)
chr8 (1-231)||(7470337-7470567)
chr8 (11-231)||(6362079-6362299)
chr8 (11-231)||(6351194-6351414)
chr8 (3-221)||(6330756-6330974)
chr8 (11-215)||(6423127-6423331)
chr8 (3-215)||(6320300-6320512)
chr8 (11-230)||(6287657-6287876)
chr8 (11-230)||(6273406-6273625)
chr8 (13-231)||(6409085-6409303)
chr8 (19-220)||(6368865-6369063)
chr8 (19-231)||(6389836-6390045)
chr8 (122-230)||(6449644-6449752)
chr8 (122-215)||(6456126-6456219)
chr8 (134-194)||(6262233-6262293)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (128-216)||(9606270-9606358)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (134-179)||(42692174-42692219)
chr2 (118-183)||(42689613-42689678)
chr2 (11-65)||(42692288-42692342)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (136-183)||(46708222-46708269)
chr7 (136-183)||(46709187-46709234)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7458165 - 7457935
Alignment:
Q  1 gatgttgcgaaagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7458165 gatgttgtgaaagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaa 7458066  T
Q  101 accgtacggagttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7458065 accgtacggagttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatat 7457966  T
Q  201 ccttaaccgaccaacaaaaagtagaagattc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7457965 ccttaaccgaccaacaaaaagtagaagattc 7457935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7470567 - 7470337
Alignment:
Q  1 gatgttgcgaaagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7470567 gatgttgtgaaagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgccaa 7470468  T
Q  101 accgtacggagttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470467 accgtacggagttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatat 7470368  T
Q  201 ccttaaccgaccaacaaaaagtagaagattc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470367 ccttaaccgaccaacaaaaagtagaagattc 7470337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6362299 - 6362079
Alignment:
Q  11 aagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacgga 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||    
T  6362299 aagattctgaactccaagcattctggaaagaacttgtagaggtcggtcatggtgacttgaagaatgctacatggtggtttaagatgcaaactcgtgagga 6362200  T
Q  111 gttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccga 210  Q
    |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6362199 gttgattgaagcttgcaccaccctcatatggattgcttcagcacttcatgcagcagttaattttggacaatatccgtatggaggatatatcgttaaccga 6362100  T
Q  211 ccaacaaaaagtagaagattc 231  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6362099 ccaactaaaagtagaagattc 6362079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6351414 - 6351194
Alignment:
Q  11 aagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacgga 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  6351414 aagatgctgaactccaagcattctggaaggaacttgtagaggttggtcatggtgacctgaagaatgccacatggtggtttaagatgcaaacccgtgaaga 6351315  T
Q  111 gttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccga 210  Q
    |||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  6351314 gttgatcgaagcttccaccatccttatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaatttcggacaatatccatatggaggatatatccttaaccgg 6351215  T
Q  211 ccaacaaaaagtagaagattc 231  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  6351214 ccaacaaagagtagaagattc 6351194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6330974 - 6330756
Alignment:
Q  3 tgttgcgaaagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaac 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||      
T  6330974 tgttgcgcaagattctgaactgcaagcattttggagagaagttgtagaggtgggtcatggtgatttgaagaatgctacatggtggtttaagatgcaaact 6330875  T
Q  103 cgtacggagttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatcc 202  Q
     |||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  6330874 tgtacagagttgattgaagcttgcactatcctcatatggattgcttcagcacatcatgcagctgttaattttggtcaatatccatatggaggatatatac 6330775  T
Q  203 ttaaccgaccaacaaaaag 221  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  6330774 ttaaccgaccaactaaaag 6330756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6423331 - 6423127
Alignment:
Q  11 aagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacgga 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  6423331 aagatgctgaactccaagcattctggaaggaacttgtagaggtgggtcatggtgacttaaagagtgccacatggtggtttaagatgcaaactcgtgcgga 6423232  T
Q  111 gttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccga 210  Q
    |||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  6423231 gttgatcgaagcttccaccatccttatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatacccatatggaggatacatccttaaccga 6423132  T
Q  211 ccaac 215  Q
    |||||    
T  6423131 ccaac 6423127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6320512 - 6320300
Alignment:
Q  3 tgttgcgaaagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaac 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||      
T  6320512 tgttgcgcaagattctgaactgcaagcattttggagagaagttgtagaggtgggtcatggtgatttgaagaatgctacatggtggtttaagatgcaaact 6320413  T
Q  103 cgtacggagttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatcc 202  Q
     |||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |    
T  6320412 tgtacagagttgattgaagcttgcactatcctcatatggattgcttcagcacatcatgcagctgttaattttggtcaatacccatatggaggatatatac 6320313  T
Q  203 ttaaccgaccaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  6320312 ttaaccgaccaac 6320300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6287876 - 6287657
Alignment:
Q  11 aagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacgga 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |   |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6287876 aagattctgaactccaagcattctggaaagaacttgtagaggtaggtcacggtgacttgaaagatgctaaatggtggtttaagatgcaaacccgtaagga 6287777  T
Q  111 gttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccga 210  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || || || |||||||||    
T  6287776 gttgattgaggcttgcaccatcctcatatggattgcttcggcacttcatgcggctgttaattttggacaatatccgtacggtggttacattcttaaccga 6287677  T
Q  211 ccaacaaaaagtagaagatt 230  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  6287676 ccaacaaaaagcagaagatt 6287657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6273625 - 6273406
Alignment:
Q  11 aagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||||||||  || || ||    
T  6273625 aagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggttggtcacggtgacttgaaaaatgctaaatggtgggttaagatgcaaactcgcacaga 6273526  T
Q  111 gttgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccga 210  Q
    |||||  ||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || || |||||||||    
T  6273525 gttgattgactcttgcactaccctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatccgtacggtggttacattcttaaccga 6273426  T
Q  211 ccaacaaaaagtagaagatt 230  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  6273425 ccaactaaaagcagaagatt 6273406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6409303 - 6409085
Alignment:
Q  13 gattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacggagt 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||    
T  6409303 gattccgagctccaagcattctggaaagaacttgtagaagtgggccatggtgacttgaaggatgcaacatggtggtttaagatgaaaactcgtgcagagt 6409204  T
Q  113 tgaaagaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccgacc 212  Q
    |||  ||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||  ||||||||||    
T  6409203 tgattgaaacttgcaccaccctcatttggatggcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatccttacggtggatacattgttaaccgacc 6409104  T
Q  213 aacaaaaagtagaagattc 231  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  6409103 aactaaaagtagaagattc 6409085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6369063 - 6368865
Alignment:
Q  19 gaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacggagttgaaag 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||  |    |||| ||||  || |||  ||||| |||||||  |    
T  6369063 gaactcaaagcattttggaaagaacttgtagaagtaggtcatggtgacttgaagactgataa---gtgggttaaattggaaactcgtacagagttgattg 6368967  T
Q  119 aagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccgaccaacaaa 218  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  6368966 aaacttgcaccaccctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatcagtatggagggtacatccttaaccgaccaactaa 6368867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6390045 - 6389836
Alignment:
Q  19 gaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtgactttaggaatgcaacatggtggtttaagatgcaaaaccgtacggagttgaaag 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||  |    |||| ||||  || |||  ||||| |||||||  |    
T  6390045 gaactcaaagcattttggaaagaacttgtagaagtgggtcatggtgactcgaagactgataa---gtgggttaaattggaaactcgtacagagttgattg 6389949  T
Q  119 aagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccgaccaacaaa 218  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  6389948 aaacttgcaccaccctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatccgtacggtggatacattgttaaccgaccaactaa 6389849  T
Q  219 aagtagaagattc 231  Q
    ||| |||||||||    
T  6389848 aagcagaagattc 6389836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6449752 - 6449644
Alignment:
Q  122 cttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccgaccaacaaaaag 221  Q
    ||||| ||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||    
T  6449752 cttgctccattattatatggactgcttctgctcttcatgcagctgttaatttcggacaatatccttacggaggatatatcctgaaccgtccaacaattag 6449653  T
Q  222 tagaagatt 230  Q
    |||||||||    
T  6449652 tagaagatt 6449644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6456219 - 6456126
Alignment:
Q  122 cttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccgaccaac 215  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6456219 cttgctccattatcatatggactgcttcagctcttcatgcagcagttaactttggacagtatccttatggaggatatatcctgaaccgtccaac 6456126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6262293 - 6262233
Alignment:
Q  134 tcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggagg 194  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6262293 tcatatggactgcttcagctcttcatgcagctgttaattttggacaatatccgtatggagg 6262233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 216
Target Start/End: Original strand, 9606270 - 9606358
Alignment:
Q  128 ccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatatgcgtatggaggatatatccttaaccgaccaaca 216  Q
    ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  9606270 ccattatcatatggactgcttctgctcttcatgcagctgttaattttggacaatatccttatggaggttatattctaaaccgtccaaca 9606358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42692219 - 42692174
Alignment:
Q  134 tcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggaca 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42692219 tcatatggattgcttcagctcttcatgcagctgttaattttggaca 42692174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 183
Target Start/End: Original strand, 42689613 - 42689678
Alignment:
Q  118 gaagcttgcaccattctcatatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatat 183  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  42689613 gaagcttgcactatcatcatatggacggcttcagccctccacgcagctgttaattttggacaatat 42689678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 42692342 - 42692288
Alignment:
Q  11 aagattctgaactccaagcattttggaaagaacttgtagaggtgggtcatggtga 65  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  42692342 aagattctgaactccaagcttggtggaaagaactcgtagaggttggtcacggtga 42692288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 46708269 - 46708222
Alignment:
Q  136 atatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatat 183  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  46708269 atatggattgcttcagccctacatgcagctgtaaaatttggacaatat 46708222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 46709234 - 46709187
Alignment:
Q  136 atatggattgcttcagcacttcatgcagctgttaattttggacaatat 183  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  46709234 atatggattgcttcagctctacatgcagctgtaaactttggacaatat 46709187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University