View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6630_low_3 (Length: 453)

Name: NF6630_low_3
Description: NF6630
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6630_low_3
NF6630_low_3
[»] chr4 (96 HSPs)
chr4 (13-435)||(109810-110235)
chr4 (190-435)||(10642438-10642684)
chr4 (190-435)||(9293776-9294022)
chr4 (13-288)||(15211814-15212096)
chr4 (13-257)||(16521294-16521543)
chr4 (190-435)||(54119889-54120133)
chr4 (13-368)||(19998929-19999283)
chr4 (13-267)||(8873897-8874164)
chr4 (14-380)||(14994590-14994951)
chr4 (187-424)||(15274341-15274585)
chr4 (13-280)||(5684306-5684578)
chr4 (13-368)||(26678446-26678799)
chr4 (190-417)||(53909430-53909665)
chr4 (266-435)||(16520866-16521035)
chr4 (13-368)||(47355727-47356081)
chr4 (277-425)||(19998591-19998739)
chr4 (190-371)||(18167116-18167291)
chr4 (13-268)||(12901175-12901444)
chr4 (277-425)||(18246252-18246400)
chr4 (189-371)||(18246589-18246764)
chr4 (26-262)||(21960984-21961234)
chr4 (13-152)||(25120525-25120667)
chr4 (285-423)||(15211591-15211729)
chr4 (205-368)||(8372876-8373031)
chr4 (323-435)||(13244668-13244780)
chr4 (13-283)||(14950500-14950774)
chr4 (126-283)||(15138077-15138236)
chr4 (13-283)||(22355966-22356240)
chr4 (13-283)||(10487151-10487425)
chr4 (13-283)||(16329326-16329600)
chr4 (285-421)||(53706605-53706750)
chr4 (115-330)||(14899902-14900122)
chr4 (13-107)||(34393714-34393808)
chr4 (323-435)||(16366442-16366561)
chr4 (115-235)||(34197692-34197813)
chr4 (13-283)||(26337965-26338240)
chr4 (13-107)||(9294185-9294279)
chr4 (190-288)||(16366360-16366457)
chr4 (13-283)||(13049566-13049841)
chr4 (13-107)||(33738925-33739020)
chr4 (13-107)||(53909173-53909268)
chr4 (115-235)||(12245779-12245900)
chr4 (115-235)||(15852843-15852964)
chr4 (266-418)||(18166958-18167117)
chr4 (115-235)||(37958584-37958705)
chr4 (13-107)||(7133852-7133947)
chr4 (13-107)||(44345487-44345582)
chr4 (116-228)||(27959560-27959673)
chr4 (272-404)||(34393485-34393624)
chr4 (183-288)||(12837914-12838020)
chr4 (212-288)||(44054331-44054406)
chr4 (13-107)||(10642847-10642942)
chr4 (115-233)||(41167461-41167580)
chr4 (13-107)||(45460360-45460455)
chr4 (190-283)||(15288611-15288704)
chr4 (190-283)||(15295778-15295871)
chr4 (13-106)||(44054583-44054677)
chr4 (191-288)||(33738635-33738731)
chr4 (189-265)||(44345259-44345335)
chr4 (13-107)||(53706193-53706288)
chr4 (13-107)||(54119664-54119759)
chr4 (207-288)||(13244765-13244845)
chr4 (13-77)||(8373044-8373108)
chr4 (323-371)||(16521169-16521217)
chr4 (218-285)||(7134088-7134154)
chr4 (13-107)||(13751697-13751792)
chr4 (13-107)||(18167454-18167548)
chr4 (123-234)||(5372229-5372341)
chr4 (325-424)||(8372685-8372791)
chr4 (13-104)||(13245115-13245207)
chr4 (272-338)||(55378466-55378532)
chr4 (211-268)||(7848845-7848902)
chr4 (266-319)||(15211729-15211782)
chr4 (123-231)||(47469868-47469977)
chr4 (325-424)||(7134319-7134425)
chr4 (323-418)||(19699420-19699522)
chr4 (323-418)||(19710005-19710107)
chr4 (189-294)||(43283041-43283148)
chr4 (316-371)||(15211781-15211836)
chr4 (122-267)||(41257882-41258033)
chr4 (13-104)||(15288412-15288503)
chr4 (13-104)||(15295522-15295613)
chr4 (266-317)||(7134188-7134239)
chr4 (266-317)||(8372823-8372874)
chr4 (323-370)||(12838005-12838052)
chr4 (325-368)||(19998802-19998845)
chr4 (13-63)||(30233947-30233998)
chr4 (221-288)||(53706515-53706581)
chr4 (275-317)||(19699348-19699390)
chr4 (275-317)||(19709933-19709975)
chr4 (266-320)||(19998746-19998800)
chr4 (189-264)||(30236145-30236222)
chr4 (189-260)||(52267123-52267196)
chr4 (369-418)||(18294613-18294662)
chr4 (225-257)||(16521233-16521265)
chr4 (323-371)||(33738602-33738650)
[»] chr3 (128 HSPs)
chr3 (13-427)||(2048395-2048815)
chr3 (13-418)||(10736903-10737311)
chr3 (13-426)||(23490841-23491261)
chr3 (13-386)||(33340220-33340598)
chr3 (13-435)||(19230380-19230815)
chr3 (192-435)||(19262602-19262845)
chr3 (13-309)||(5227171-5227470)
chr3 (13-294)||(19945098-19945381)
chr3 (13-283)||(14846063-14846337)
chr3 (215-435)||(45581163-45581382)
chr3 (13-426)||(15939862-15940274)
chr3 (190-435)||(25057099-25057345)
chr3 (13-288)||(51159881-51160164)
chr3 (190-435)||(15860807-15861051)
chr3 (13-380)||(15469869-15470228)
chr3 (13-267)||(319017-319284)
chr3 (13-267)||(16259541-16259796)
chr3 (13-288)||(7852275-7852563)
chr3 (189-421)||(17957994-17958224)
chr3 (13-368)||(16819310-16819664)
chr3 (13-266)||(8630336-8630602)
chr3 (199-380)||(18905348-18905522)
chr3 (266-425)||(18908753-18908912)
chr3 (13-371)||(18909090-18909445)
chr3 (183-371)||(22273445-22273626)
chr3 (13-262)||(12351248-12351511)
chr3 (13-283)||(15613545-15613816)
chr3 (13-290)||(17913654-17913935)
chr3 (25-288)||(50113543-50113819)
chr3 (277-425)||(22273108-22273256)
chr3 (13-283)||(44227906-44228182)
chr3 (277-425)||(49230320-49230468)
chr3 (183-371)||(2450902-2451083)
chr3 (277-425)||(2451220-2451368)
chr3 (13-283)||(12265892-12266165)
chr3 (13-283)||(16745572-16745846)
chr3 (122-283)||(23081681-23081840)
chr3 (13-283)||(15574526-15574797)
chr3 (13-280)||(27839189-27839462)
chr3 (13-267)||(49230709-49230969)
chr3 (299-426)||(33340108-33340234)
chr3 (190-330)||(11813265-11813404)
chr3 (13-283)||(30151815-30152090)
chr3 (189-283)||(30141365-30141458)
chr3 (183-283)||(1469228-1469328)
chr3 (13-283)||(8269803-8270078)
chr3 (13-283)||(8276914-8277189)
chr3 (13-283)||(8305723-8305998)
chr3 (13-107)||(25057508-25057602)
chr3 (115-235)||(12490256-12490377)
chr3 (13-153)||(18905200-18905343)
chr3 (323-435)||(19572511-19572630)
chr3 (13-283)||(53769139-53769414)
chr3 (13-107)||(19572174-19572269)
chr3 (13-103)||(17957738-17957828)
chr3 (190-288)||(19572429-19572526)
chr3 (115-235)||(15874685-15874806)
chr3 (115-235)||(48420192-48420313)
chr3 (292-398)||(9304638-9304742)
chr3 (294-371)||(11813067-11813145)
chr3 (190-288)||(17099085-17099182)
chr3 (115-235)||(18008656-18008777)
chr3 (55-288)||(47786317-47786564)
chr3 (13-283)||(45859498-45859773)
chr3 (188-283)||(13956385-13956480)
chr3 (188-283)||(13977218-13977313)
chr3 (13-260)||(41268743-41268995)
chr3 (116-235)||(55442286-55442409)
chr3 (123-234)||(5229608-5229720)
chr3 (190-288)||(6148456-6148551)
chr3 (115-234)||(38812515-38812634)
chr3 (188-260)||(55314883-55314955)
chr3 (13-107)||(13816173-13816268)
chr3 (13-107)||(15860549-15860644)
chr3 (13-107)||(17099374-17099469)
chr3 (13-107)||(22145676-22145770)
chr3 (13-107)||(30205114-30205209)
chr3 (115-265)||(14060760-14060913)
chr3 (190-288)||(16183664-16183761)
chr3 (334-404)||(54686623-54686693)
chr3 (115-235)||(11330527-11330648)
chr3 (272-329)||(11813136-11813193)
chr3 (190-283)||(22145881-22145973)
chr3 (13-104)||(14297161-14297253)
chr3 (13-104)||(14302788-14302880)
chr3 (13-104)||(35122350-35122442)
chr3 (190-288)||(30204867-30204962)
chr3 (122-234)||(9592280-9592393)
chr3 (124-234)||(47983419-47983531)
chr3 (124-234)||(47992706-47992818)
chr3 (124-234)||(48001993-48002105)
chr3 (124-234)||(48011279-48011391)
chr3 (323-371)||(49230656-49230704)
chr3 (13-104)||(16183413-16183509)
chr3 (13-107)||(17523812-17523907)
chr3 (323-417)||(30204781-30204882)
chr3 (325-418)||(19944889-19944989)
chr3 (325-417)||(11812886-11812985)
chr3 (325-424)||(12796802-12796908)
chr3 (13-104)||(53899924-53900016)
chr3 (297-418)||(30141068-30141196)
chr3 (13-105)||(1469054-1469146)
chr3 (13-77)||(6148244-6148309)
chr3 (240-337)||(15516051-15516150)
chr3 (323-371)||(16259488-16259536)
chr3 (325-424)||(16819119-16819225)
chr3 (13-107)||(17138126-17138222)
chr3 (289-337)||(38166467-38166515)
chr3 (323-418)||(51160149-51160251)
chr3 (13-107)||(40938391-40938486)
chr3 (294-371)||(11813198-11813275)
chr3 (368-417)||(18738059-18738108)
chr3 (55-107)||(11813526-11813578)
chr3 (13-107)||(14294088-14294184)
chr3 (13-107)||(14299715-14299811)
chr3 (13-103)||(11062439-11062530)
chr3 (312-371)||(13816015-13816074)
chr3 (26-107)||(14522723-14522806)
chr3 (335-418)||(44227774-44227857)
chr3 (266-320)||(49230475-49230529)
chr3 (272-317)||(11813017-11813062)
chr3 (56-105)||(13956248-13956297)
chr3 (189-234)||(14523004-14523049)
chr3 (272-317)||(54049606-54049651)
chr3 (323-371)||(11062774-11062822)
chr3 (13-107)||(11198975-11199071)
chr3 (323-371)||(17099052-17099100)
chr3 (323-371)||(47786549-47786597)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (13-435)||(144861-145287)
scaffold0025 (13-435)||(147120-147546)
[»] chr8 (106 HSPs)
chr8 (16-426)||(29758630-29759045)
chr8 (13-435)||(24387111-24387531)
chr8 (13-435)||(24930517-24930946)
chr8 (13-302)||(270202-270493)
chr8 (13-302)||(831162-831453)
chr8 (13-302)||(645427-645718)
chr8 (13-288)||(16203740-16204019)
chr8 (200-435)||(43375195-43375429)
chr8 (190-368)||(13664295-13664474)
chr8 (190-368)||(13723570-13723749)
chr8 (190-352)||(22008138-22008301)
chr8 (13-267)||(37605481-37605749)
chr8 (277-425)||(3433496-3433644)
chr8 (13-361)||(3432977-3433323)
chr8 (13-283)||(24547705-24547976)
chr8 (285-425)||(28836054-28836194)
chr8 (190-414)||(22323101-22323330)
chr8 (323-435)||(16204004-16204116)
chr8 (189-317)||(22909144-22909271)
chr8 (116-280)||(41244113-41244277)
chr8 (13-283)||(16874339-16874615)
chr8 (13-283)||(5236676-5236950)
chr8 (189-283)||(23509399-23509493)
chr8 (13-283)||(22089844-22090120)
chr8 (13-173)||(37609951-37610123)
chr8 (190-283)||(24108244-24108336)
chr8 (190-338)||(24719076-24719221)
chr8 (183-283)||(272778-272878)
chr8 (183-283)||(642971-643071)
chr8 (183-283)||(828777-828877)
chr8 (13-283)||(15320460-15320736)
chr8 (13-283)||(15500829-15501105)
chr8 (13-283)||(21845892-21846167)
chr8 (13-283)||(21853297-21853572)
chr8 (13-283)||(224563-224839)
chr8 (13-283)||(738186-738462)
chr8 (13-283)||(862081-862357)
chr8 (13-283)||(24662648-24662922)
chr8 (115-235)||(21192268-21192389)
chr8 (13-107)||(22908886-22908980)
chr8 (13-283)||(700976-701252)
chr8 (13-283)||(16675727-16676002)
chr8 (116-235)||(39448345-39448465)
chr8 (13-201)||(41245218-41245420)
chr8 (13-107)||(24718819-24718914)
chr8 (272-371)||(41508883-41508982)
chr8 (13-283)||(43684135-43684409)
chr8 (349-425)||(23631023-23631099)
chr8 (13-107)||(16416922-16417017)
chr8 (115-233)||(21199695-21199814)
chr8 (190-288)||(19994801-19994898)
chr8 (13-107)||(20480335-20480428)
chr8 (116-225)||(31195807-31195917)
chr8 (122-267)||(37655175-37655326)
chr8 (115-235)||(21696081-21696202)
chr8 (115-235)||(23835741-23835861)
chr8 (13-107)||(13664037-13664132)
chr8 (13-107)||(13723312-13723407)
chr8 (13-107)||(20655426-20655521)
chr8 (13-107)||(22007880-22007975)
chr8 (190-276)||(25120928-25121013)
chr8 (13-100)||(20568669-20568757)
chr8 (13-100)||(20574862-20574950)
chr8 (13-103)||(20648841-20648932)
chr8 (13-75)||(16195140-16195202)
chr8 (285-418)||(22909311-22909451)
chr8 (13-107)||(24107988-24108081)
chr8 (122-234)||(33612590-33612703)
chr8 (325-424)||(13664559-13664665)
chr8 (325-424)||(13723834-13723940)
chr8 (189-265)||(16416736-16416812)
chr8 (123-234)||(22498833-22498945)
chr8 (13-104)||(43374983-43375075)
chr8 (189-276)||(20480082-20480168)
chr8 (266-424)||(22008305-22008470)
chr8 (13-107)||(22322837-22322932)
chr8 (13-107)||(25121204-25121299)
chr8 (123-236)||(23116350-23116464)
chr8 (13-104)||(19994554-19994646)
chr8 (123-234)||(23153339-23153451)
chr8 (275-371)||(24108424-24108520)
chr8 (183-267)||(25294488-25294574)
chr8 (183-267)||(25756477-25756563)
chr8 (286-426)||(270022-270169)
chr8 (13-105)||(272604-272696)
chr8 (13-105)||(643153-643245)
chr8 (286-426)||(645751-645898)
chr8 (13-105)||(828959-829051)
chr8 (286-426)||(831486-831633)
chr8 (13-104)||(6775633-6775725)
chr8 (323-418)||(18610512-18610614)
chr8 (123-234)||(22312191-22312303)
chr8 (131-234)||(33170786-33170890)
chr8 (26-107)||(28543598-28543680)
chr8 (325-417)||(37605368-37605467)
chr8 (368-417)||(41244033-41244082)
chr8 (266-317)||(23509284-23509335)
chr8 (333-368)||(23509337-23509372)
chr8 (266-320)||(3433435-3433489)
chr8 (275-317)||(18610644-18610686)
chr8 (383-424)||(6776303-6776344)
chr8 (211-265)||(17731137-17731193)
chr8 (272-317)||(24719205-24719250)
chr8 (368-417)||(25120830-25120879)
chr8 (123-175)||(11543096-11543148)
chr8 (13-107)||(21679863-21679959)
[»] chr6 (104 HSPs)
chr6 (13-435)||(19984608-19985034)
chr6 (13-330)||(1554280-1554599)
chr6 (13-380)||(11214535-11214900)
chr6 (13-318)||(16238816-16239126)
chr6 (13-380)||(1659114-1659474)
chr6 (190-435)||(18740709-18740954)
chr6 (13-259)||(15861243-15861488)
chr6 (13-367)||(33315982-33316334)
chr6 (13-368)||(14628012-14628366)
chr6 (266-425)||(4989062-4989221)
chr6 (13-368)||(23975978-23976331)
chr6 (13-317)||(18128725-18129045)
chr6 (190-426)||(17343846-17344076)
chr6 (13-268)||(18775703-18775971)
chr6 (13-288)||(31626911-31627199)
chr6 (190-361)||(18004634-18004799)
chr6 (183-371)||(25173961-25174142)
chr6 (13-280)||(4989386-4989659)
chr6 (13-262)||(16105056-16105319)
chr6 (266-418)||(16827767-16827919)
chr6 (13-283)||(1651353-1651624)
chr6 (13-279)||(16827279-16827550)
chr6 (277-425)||(25173592-25173740)
chr6 (115-267)||(25745821-25745974)
chr6 (190-318)||(13622781-13622910)
chr6 (15-175)||(23151846-23152018)
chr6 (13-283)||(16650646-16650922)
chr6 (123-262)||(22428673-22428813)
chr6 (183-423)||(27655662-27655899)
chr6 (190-283)||(18825419-18825511)
chr6 (183-283)||(10487366-10487466)
chr6 (183-283)||(16377861-16377961)
chr6 (183-283)||(16385185-16385285)
chr6 (13-283)||(16557416-16557692)
chr6 (13-283)||(26088321-26088596)
chr6 (190-283)||(18843480-18843572)
chr6 (13-201)||(16083975-16084177)
chr6 (190-318)||(35017302-35017429)
chr6 (190-283)||(22227260-22227354)
chr6 (23-283)||(29870886-29871151)
chr6 (13-107)||(35017085-35017179)
chr6 (13-283)||(16230067-16230342)
chr6 (190-288)||(25646517-25646614)
chr6 (20-104)||(18741119-18741203)
chr6 (266-424)||(18004807-18004972)
chr6 (188-283)||(23993647-23993742)
chr6 (115-235)||(16889270-16889390)
chr6 (13-107)||(18004376-18004471)
chr6 (115-225)||(17790666-17790776)
chr6 (190-288)||(18422207-18422304)
chr6 (115-235)||(18383207-18383328)
chr6 (115-235)||(33323337-33323458)
chr6 (323-398)||(1554035-1554110)
chr6 (13-107)||(18397592-18397687)
chr6 (13-107)||(18431299-18431394)
chr6 (272-417)||(35017407-35017560)
chr6 (190-283)||(18088371-18088464)
chr6 (13-107)||(18825162-18825256)
chr6 (13-77)||(18569283-18569347)
chr6 (15-107)||(18843225-18843317)
chr6 (188-283)||(16642592-16642687)
chr6 (13-96)||(22430925-22431008)
chr6 (13-107)||(25646230-25646325)
chr6 (190-283)||(19608909-19609002)
chr6 (279-417)||(18843671-18843817)
chr6 (123-234)||(34965471-34965583)
chr6 (323-424)||(14628375-14628483)
chr6 (276-338)||(18128584-18128646)
chr6 (13-105)||(27655487-27655580)
chr6 (275-417)||(18825606-18825756)
chr6 (325-424)||(23975787-23975893)
chr6 (219-263)||(32896494-32896538)
chr6 (325-424)||(33316422-33316528)
chr6 (323-418)||(35011130-35011232)
chr6 (324-418)||(18775590-18775691)
chr6 (115-201)||(35137473-35137560)
chr6 (13-98)||(17343686-17343772)
chr6 (13-105)||(10487548-10487640)
chr6 (13-105)||(16377687-16377779)
chr6 (13-105)||(16385011-16385103)
chr6 (122-267)||(22846613-22846768)
chr6 (266-338)||(16827717-16827789)
chr6 (13-104)||(18088114-18088206)
chr6 (13-107)||(15736584-15736679)
chr6 (123-225)||(16134814-16134917)
chr6 (13-107)||(32897389-32897484)
chr6 (272-417)||(18128424-18128576)
chr6 (325-418)||(19627582-19627682)
chr6 (272-418)||(13622888-13623040)
chr6 (369-418)||(23151790-23151839)
chr6 (13-104)||(19609167-19609258)
chr6 (123-234)||(19852796-19852908)
chr6 (13-107)||(28196185-28196281)
chr6 (13-107)||(13016188-13016283)
chr6 (266-317)||(18128555-18128606)
chr6 (266-317)||(23975925-23975976)
chr6 (272-318)||(18128652-18128698)
chr6 (368-418)||(18578918-18578968)
chr6 (275-317)||(19627714-19627756)
chr6 (13-102)||(22227043-22227133)
chr6 (275-317)||(35011058-35011100)
chr6 (272-317)||(18579050-18579095)
chr6 (211-336)||(25369034-25369164)
chr6 (323-371)||(16238716-16238764)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (13-426)||(197508-197917)
scaffold0004 (123-234)||(26081-26193)
scaffold0004 (123-234)||(84943-85055)
[»] chr7 (109 HSPs)
chr7 (13-435)||(32495961-32496389)
chr7 (13-330)||(15761776-15762095)
chr7 (13-426)||(18255227-18255638)
chr7 (13-233)||(3058582-3058805)
chr7 (207-435)||(11582551-11582778)
chr7 (208-426)||(122841-123059)
chr7 (13-266)||(1938177-1938441)
chr7 (13-424)||(369221-369645)
chr7 (228-427)||(3055053-3055253)
chr7 (207-426)||(13038825-13039043)
chr7 (13-214)||(125378-125584)
chr7 (13-283)||(2436112-2436383)
chr7 (190-425)||(16210047-16210282)
chr7 (13-227)||(2027095-2027315)
chr7 (13-267)||(3893586-3893853)
chr7 (13-283)||(112703-112988)
chr7 (13-288)||(26071671-26071959)
chr7 (13-288)||(26095458-26095746)
chr7 (183-371)||(16416870-16417051)
chr7 (190-368)||(16480587-16480760)
chr7 (190-368)||(2192357-2192530)
chr7 (277-425)||(16416583-16416732)
chr7 (13-281)||(15952499-15952772)
chr7 (13-268)||(45453662-45453929)
chr7 (48-283)||(12753356-12753605)
chr7 (190-321)||(36051034-36051166)
chr7 (13-283)||(10988095-10988370)
chr7 (13-283)||(26010596-26010872)
chr7 (13-283)||(13757062-13757338)
chr7 (190-303)||(13867687-13867799)
chr7 (183-283)||(7821408-7821508)
chr7 (183-283)||(7828719-7828819)
chr7 (183-283)||(27103126-27103226)
chr7 (183-283)||(27110474-27110574)
chr7 (183-283)||(27175100-27175200)
chr7 (183-283)||(38785218-38785318)
chr7 (188-283)||(15518442-15518537)
chr7 (13-283)||(15442964-15443238)
chr7 (13-107)||(7291517-7291611)
chr7 (189-318)||(12545402-12545531)
chr7 (115-235)||(15913955-15914076)
chr7 (13-283)||(25293683-25293958)
chr7 (189-268)||(7291274-7291353)
chr7 (115-267)||(9058155-9058313)
chr7 (13-280)||(13912518-13912790)
chr7 (183-283)||(11514606-11514706)
chr7 (183-283)||(30263703-30263803)
chr7 (13-104)||(2192102-2192193)
chr7 (190-283)||(18981568-18981662)
chr7 (115-235)||(13376195-13376315)
chr7 (115-235)||(13388488-13388609)
chr7 (13-259)||(42057568-42057819)
chr7 (13-107)||(12545118-12545213)
chr7 (13-107)||(44863906-44864001)
chr7 (275-418)||(7290992-7291142)
chr7 (13-107)||(142290-142385)
chr7 (13-107)||(13867480-13867575)
chr7 (323-398)||(15762265-15762340)
chr7 (13-107)||(47288438-47288533)
chr7 (208-294)||(11285613-11285698)
chr7 (190-283)||(15925776-15925869)
chr7 (190-288)||(44863615-44863712)
chr7 (266-418)||(18305591-18305750)
chr7 (190-282)||(142046-142137)
chr7 (13-107)||(15823816-15823911)
chr7 (192-283)||(15824105-15824195)
chr7 (240-317)||(18305492-18305568)
chr7 (207-288)||(47288148-47288228)
chr7 (323-371)||(2024905-2024953)
chr7 (13-104)||(11582246-11582338)
chr7 (13-104)||(15926034-15926126)
chr7 (323-371)||(15952764-15952812)
chr7 (13-104)||(36051331-36051423)
chr7 (13-176)||(15525889-15526057)
chr7 (123-234)||(8565109-8565221)
chr7 (325-424)||(2192615-2192721)
chr7 (272-338)||(7286160-7286226)
chr7 (123-251)||(9322595-9322727)
chr7 (13-105)||(7821590-7821682)
chr7 (13-105)||(7828901-7828993)
chr7 (13-105)||(27102952-27103044)
chr7 (13-105)||(27110300-27110392)
chr7 (13-105)||(27175282-27175374)
chr7 (13-105)||(38785044-38785136)
chr7 (223-267)||(2024958-2025002)
chr7 (13-104)||(16210447-16210539)
chr7 (13-104)||(16480341-16480432)
chr7 (368-424)||(16480895-16480951)
chr7 (13-104)||(18981312-18981403)
chr7 (123-234)||(20587141-20587253)
chr7 (323-417)||(26071944-26072046)
chr7 (323-417)||(26095731-26095833)
chr7 (13-103)||(11285878-11285969)
chr7 (13-103)||(12249519-12249610)
chr7 (291-418)||(14253046-14253179)
chr7 (325-418)||(15952868-15952968)
chr7 (286-371)||(12545523-12545608)
chr7 (368-417)||(15824237-15824286)
chr7 (323-371)||(44863582-44863630)
chr7 (323-417)||(141954-142055)
chr7 (266-317)||(2192532-2192583)
chr7 (183-234)||(4483269-4483320)
chr7 (266-317)||(11285564-11285615)
chr7 (335-418)||(13912842-13912925)
chr7 (320-371)||(45453929-45453980)
chr7 (272-329)||(13867792-13867849)
chr7 (266-371)||(13867836-13867941)
chr7 (335-423)||(15518586-15518674)
chr7 (327-371)||(47288115-47288159)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (13-426)||(11440-11854)
[»] chr1 (87 HSPs)
chr1 (13-435)||(37845875-37846304)
chr1 (13-435)||(44036309-44036730)
chr1 (13-435)||(20444067-20444500)
chr1 (13-435)||(20929807-20930227)
chr1 (13-368)||(22352520-22352882)
chr1 (13-423)||(22226328-22226735)
chr1 (190-435)||(22365007-22365253)
chr1 (13-318)||(20529948-20530265)
chr1 (13-267)||(15862841-15863095)
chr1 (190-435)||(21857815-21858054)
chr1 (266-435)||(15863275-15863444)
chr1 (13-267)||(35053329-35053596)
chr1 (13-318)||(41217889-41218207)
chr1 (13-371)||(17147179-17147536)
chr1 (13-267)||(5676010-5676277)
chr1 (266-435)||(22352349-22352518)
chr1 (272-435)||(20529807-20529970)
chr1 (207-367)||(20895406-20895565)
chr1 (277-425)||(17146894-17147042)
chr1 (13-283)||(45050166-45050437)
chr1 (13-283)||(7642001-7642268)
chr1 (183-264)||(35935158-35935239)
chr1 (13-283)||(22034327-22034602)
chr1 (183-283)||(17003304-17003404)
chr1 (13-283)||(51451092-51451366)
chr1 (190-297)||(9785898-9786004)
chr1 (13-165)||(20526708-20526872)
chr1 (189-267)||(22250620-22250698)
chr1 (13-106)||(21858217-21858310)
chr1 (13-283)||(20826632-20826907)
chr1 (183-283)||(41392931-41393031)
chr1 (13-107)||(22250363-22250457)
chr1 (115-234)||(38035144-38035264)
chr1 (13-107)||(2422380-2422475)
chr1 (13-107)||(9785643-9785737)
chr1 (190-283)||(21651601-21651695)
chr1 (190-288)||(49966055-49966152)
chr1 (115-235)||(13378284-13378405)
chr1 (116-236)||(37235485-37235606)
chr1 (13-107)||(18506016-18506111)
chr1 (13-107)||(22407604-22407699)
chr1 (190-288)||(22407893-22407990)
chr1 (13-260)||(18602454-18602706)
chr1 (115-235)||(19601703-19601824)
chr1 (188-260)||(5073891-5073963)
chr1 (336-426)||(18505720-18505817)
chr1 (117-235)||(36357862-36357981)
chr1 (13-107)||(41210705-41210800)
chr1 (13-107)||(49966308-49966403)
chr1 (190-288)||(2422732-2422829)
chr1 (122-235)||(21193689-21193803)
chr1 (13-104)||(21716868-21716960)
chr1 (13-104)||(35523829-35523921)
chr1 (200-283)||(29137299-29137381)
chr1 (189-337)||(20956625-20956777)
chr1 (189-337)||(22836909-22837060)
chr1 (323-371)||(15863100-15863148)
chr1 (13-104)||(22365417-22365509)
chr1 (323-417)||(2422814-2422915)
chr1 (123-233)||(5769745-5769856)
chr1 (13-107)||(20895101-20895196)
chr1 (210-294)||(27673251-27673336)
chr1 (324-417)||(5676350-5676450)
chr1 (122-234)||(22144922-22145035)
chr1 (272-404)||(41217644-41217783)
chr1 (13-104)||(21651345-21651436)
chr1 (323-371)||(22250703-22250751)
chr1 (122-216)||(8539489-8539584)
chr1 (122-216)||(8604728-8604823)
chr1 (272-371)||(41217812-41217911)
chr1 (13-105)||(17003486-17003578)
chr1 (13-104)||(18061018-18061109)
chr1 (323-418)||(20252426-20252528)
chr1 (266-338)||(20589796-20589868)
chr1 (123-234)||(20821477-20821589)
chr1 (123-234)||(5471914-5472027)
chr1 (57-107)||(2422531-2422581)
chr1 (272-338)||(20589752-20589818)
chr1 (123-234)||(41213198-41213310)
chr1 (272-318)||(41217761-41217807)
chr1 (272-317)||(20252558-20252603)
chr1 (13-105)||(41393113-41393205)
chr1 (23-105)||(22029358-22029440)
chr1 (190-225)||(41210509-41210544)
chr1 (190-232)||(18505814-18505856)
chr1 (285-329)||(9786016-9786060)
chr1 (67-107)||(51657788-51657828)
[»] chr2 (98 HSPs)
chr2 (13-426)||(22282469-22282874)
chr2 (13-426)||(22273236-22273641)
chr2 (187-428)||(20629013-20629254)
chr2 (13-288)||(43644379-43644657)
chr2 (190-435)||(9654488-9654734)
chr2 (31-380)||(22697327-22697675)
chr2 (31-380)||(22692680-22693028)
chr2 (13-288)||(8886609-8886896)
chr2 (13-424)||(21140217-21140633)
chr2 (13-371)||(25600346-25600717)
chr2 (13-303)||(15631849-15632152)
chr2 (13-267)||(22861976-22862243)
chr2 (13-288)||(6877911-6878198)
chr2 (13-371)||(34822597-34822953)
chr2 (277-425)||(3801084-3801232)
chr2 (13-371)||(8942045-8942402)
chr2 (13-361)||(3800513-3800860)
chr2 (285-425)||(34822389-34822529)
chr2 (56-368)||(12637609-12637918)
chr2 (285-428)||(43644682-43644825)
chr2 (183-371)||(19888354-19888535)
chr2 (277-425)||(19888698-19888846)
chr2 (13-283)||(21275927-21276203)
chr2 (277-425)||(25210967-25211115)
chr2 (190-336)||(461091-461238)
chr2 (277-425)||(8941786-8941934)
chr2 (277-425)||(38706771-38706919)
chr2 (13-283)||(24827970-24828237)
chr2 (323-435)||(22861858-22861971)
chr2 (13-283)||(12726533-12726808)
chr2 (13-283)||(14907840-14908114)
chr2 (13-283)||(23773017-23773292)
chr2 (13-283)||(24687069-24687345)
chr2 (183-283)||(24832589-24832689)
chr2 (115-330)||(24088894-24089114)
chr2 (200-318)||(24966660-24966777)
chr2 (266-398)||(460979-461111)
chr2 (183-283)||(5889872-5889972)
chr2 (183-283)||(11232827-11232927)
chr2 (183-283)||(22514674-22514774)
chr2 (183-283)||(28777275-28777375)
chr2 (13-288)||(12643427-12643706)
chr2 (323-435)||(8886512-8886624)
chr2 (13-283)||(20013603-20013877)
chr2 (13-283)||(23818660-23818934)
chr2 (115-267)||(19434992-19435146)
chr2 (115-235)||(19670663-19670783)
chr2 (188-288)||(25877615-25877714)
chr2 (116-234)||(19658471-19658590)
chr2 (344-435)||(23806331-23806422)
chr2 (115-235)||(4809-4930)
chr2 (13-104)||(9654232-9654323)
chr2 (189-288)||(36892358-36892456)
chr2 (115-234)||(43641348-43641468)
chr2 (115-235)||(23823041-23823162)
chr2 (115-235)||(23824985-23825106)
chr2 (115-235)||(23832120-23832241)
chr2 (115-235)||(25304089-25304210)
chr2 (13-283)||(17397997-17398272)
chr2 (214-283)||(25211360-25211429)
chr2 (13-201)||(27260137-27260339)
chr2 (117-235)||(24296107-24296226)
chr2 (13-107)||(36892113-36892208)
chr2 (13-104)||(269851-269943)
chr2 (13-107)||(22691354-22691449)
chr2 (13-107)||(22696001-22696096)
chr2 (356-433)||(460896-460973)
chr2 (316-369)||(43644635-43644688)
chr2 (13-104)||(461402-461494)
chr2 (13-104)||(4449633-4449725)
chr2 (13-107)||(20628796-20628891)
chr2 (13-105)||(5889697-5889790)
chr2 (122-234)||(22137355-22137468)
chr2 (13-107)||(24966958-24967053)
chr2 (323-418)||(25877699-25877801)
chr2 (13-105)||(11232653-11232745)
chr2 (13-105)||(22514500-22514592)
chr2 (13-105)||(28777101-28777193)
chr2 (325-424)||(21276351-21276457)
chr2 (323-418)||(42180216-42180318)
chr2 (325-371)||(25211125-25211171)
chr2 (205-294)||(720829-720920)
chr2 (325-424)||(12638003-12638109)
chr2 (368-424)||(12643871-12643927)
chr2 (266-317)||(12637920-12637971)
chr2 (266-317)||(12643738-12643789)
chr2 (26-107)||(22581350-22581433)
chr2 (323-370)||(36892441-36892488)
chr2 (266-320)||(3801023-3801077)
chr2 (275-317)||(7513797-7513839)
chr2 (13-55)||(25877353-25877395)
chr2 (266-320)||(34822544-34822598)
chr2 (275-317)||(42180144-42180186)
chr2 (211-265)||(22581608-22581664)
chr2 (323-371)||(6877878-6877926)
chr2 (13-107)||(7320148-7320244)
chr2 (71-107)||(25877430-25877466)
chr2 (25-107)||(28972701-28972785)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (13-435)||(217154-217574)
scaffold0003 (183-371)||(5582-5763)
scaffold0003 (277-425)||(5295-5444)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (13-371)||(4154-4518)
scaffold0483 (379-418)||(4708-4747)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (13-371)||(48994-49358)
scaffold0109 (379-418)||(49548-49587)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (13-426)||(4186-4598)
[»] scaffold0184 (4 HSPs)
scaffold0184 (13-375)||(32596-32957)
scaffold0184 (189-283)||(33757-33850)
scaffold0184 (13-107)||(34014-34108)
scaffold0184 (285-417)||(33472-33611)
[»] scaffold0078 (4 HSPs)
scaffold0078 (13-375)||(39887-40248)
scaffold0078 (189-283)||(38994-39087)
scaffold0078 (13-107)||(38736-38830)
scaffold0078 (285-417)||(39233-39372)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (13-426)||(41051-41463)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (13-435)||(129604-130025)
scaffold0008 (190-288)||(21032-21129)
scaffold0008 (191-287)||(28623-28718)
scaffold0008 (13-103)||(21325-21416)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (13-294)||(54110-54394)
scaffold0032 (13-267)||(109485-109745)
scaffold0032 (272-390)||(109957-110075)
scaffold0032 (312-418)||(54010-54116)
scaffold0032 (323-371)||(109750-109798)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (13-375)||(14696-15055)
scaffold0225 (67-375)||(28217-28521)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (13-423)||(15791-16200)
scaffold0396 (13-371)||(13599-13969)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (13-426)||(106345-106757)
scaffold0026 (303-435)||(27233-27365)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (13-308)||(535-835)
scaffold0269 (190-308)||(3402-3519)
scaffold0269 (13-100)||(15004-15091)
scaffold0269 (272-317)||(3322-3367)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (13-288)||(270596-270877)
scaffold0009 (266-418)||(270413-270565)
scaffold0009 (13-267)||(236671-236938)
scaffold0009 (316-361)||(270573-270618)
[»] scaffold0597 (3 HSPs)
scaffold0597 (13-338)||(2536-2871)
scaffold0597 (266-426)||(2849-3010)
scaffold0597 (316-354)||(2796-2834)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (13-380)||(51423-51787)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (13-375)||(6552-6913)
scaffold0022 (115-375)||(58945-59200)
scaffold0022 (115-235)||(106443-106564)
scaffold0022 (122-234)||(130410-130523)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (13-283)||(37-312)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (13-380)||(1189-1556)
[»] scaffold0011 (11 HSPs)
scaffold0011 (190-435)||(124992-125236)
scaffold0011 (191-435)||(72012-72255)
scaffold0011 (191-435)||(76393-76636)
scaffold0011 (190-435)||(192830-193074)
scaffold0011 (189-288)||(256558-256656)
scaffold0011 (13-107)||(256312-256407)
scaffold0011 (13-107)||(124694-124789)
scaffold0011 (13-107)||(193276-193371)
scaffold0011 (13-103)||(76095-76186)
scaffold0011 (323-417)||(256641-256742)
scaffold0011 (13-64)||(262918-262970)
[»] scaffold0266 (4 HSPs)
scaffold0266 (13-280)||(5003-5274)
scaffold0266 (189-280)||(12786-12876)
scaffold0266 (325-436)||(12888-12999)
scaffold0266 (323-435)||(5284-5396)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (13-380)||(9329-9695)
[»] scaffold0498 (4 HSPs)
scaffold0498 (14-280)||(7465-7736)
scaffold0498 (325-435)||(12618-12728)
scaffold0498 (323-425)||(7353-7455)
scaffold0498 (224-270)||(7316-7362)
[»] scaffold0383 (8 HSPs)
scaffold0383 (13-267)||(867-1121)
scaffold0383 (13-371)||(5620-5990)
scaffold0383 (277-425)||(402-550)
scaffold0383 (323-371)||(814-862)
scaffold0383 (266-320)||(607-661)
scaffold0383 (272-318)||(5569-5615)
scaffold0383 (272-371)||(5492-5591)
scaffold0383 (325-371)||(660-706)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (190-435)||(1360-1604)
scaffold1140 (13-107)||(1846-1941)
[»] scaffold0447 (7 HSPs)
scaffold0447 (13-371)||(3012-3382)
scaffold0447 (272-371)||(2756-2855)
scaffold0447 (272-371)||(2884-2983)
scaffold0447 (272-318)||(2705-2751)
scaffold0447 (272-318)||(2833-2879)
scaffold0447 (272-318)||(2961-3007)
scaffold0447 (272-371)||(2628-2727)
[»] chr5 (117 HSPs)
chr5 (13-361)||(10779699-10780054)
chr5 (13-317)||(22368004-22368314)
chr5 (13-283)||(4863742-4864024)
chr5 (13-267)||(35792655-35792910)
chr5 (13-368)||(19498204-19498557)
chr5 (13-368)||(43445274-43445632)
chr5 (285-435)||(110959-111109)
chr5 (13-371)||(25425023-25425379)
chr5 (13-368)||(11341040-11341393)
chr5 (13-267)||(27185237-27185504)
chr5 (183-371)||(10752-10933)
chr5 (13-290)||(11213125-11213406)
chr5 (277-425)||(11340673-11340821)
chr5 (277-425)||(18780013-18780161)
chr5 (267-435)||(22368442-22368610)
chr5 (266-435)||(25944516-25944686)
chr5 (183-371)||(29192313-29192494)
chr5 (190-418)||(28257861-28258094)
chr5 (277-425)||(25424738-25424886)
chr5 (13-280)||(110504-110777)
chr5 (13-418)||(4201487-4201894)
chr5 (13-281)||(16534791-16535063)
chr5 (288-425)||(35793134-35793271)
chr5 (188-368)||(9732367-9732540)
chr5 (13-288)||(1221251-1221532)
chr5 (277-425)||(16534465-16534613)
chr5 (277-424)||(29192632-29192779)
chr5 (13-134)||(21649463-21649587)
chr5 (13-267)||(22884703-22884963)
chr5 (316-428)||(23510302-23510414)
chr5 (197-288)||(23510392-23510483)
chr5 (13-418)||(21075009-21075416)
chr5 (183-283)||(21933855-21933955)
chr5 (183-283)||(21940025-21940125)
chr5 (13-283)||(24594983-24595258)
chr5 (183-283)||(35580737-35580837)
chr5 (183-283)||(37010859-37010959)
chr5 (269-404)||(17907946-17908079)
chr5 (190-302)||(17473549-17473662)
chr5 (13-283)||(20615095-20615369)
chr5 (266-435)||(9732542-9732718)
chr5 (270-371)||(25944415-25944517)
chr5 (190-303)||(21653051-21653163)
chr5 (115-235)||(32967695-32967816)
chr5 (13-279)||(23327439-23327710)
chr5 (116-235)||(23492527-23492647)
chr5 (183-283)||(25902021-25902121)
chr5 (13-283)||(27008494-27008769)
chr5 (200-267)||(18779783-18779850)
chr5 (13-283)||(37051467-37051741)
chr5 (142-267)||(21661268-21661394)
chr5 (13-283)||(21234927-21235202)
chr5 (266-424)||(10780062-10780227)
chr5 (190-288)||(1170320-1170417)
chr5 (114-235)||(7727102-7727224)
chr5 (117-234)||(19860758-19860876)
chr5 (13-107)||(25192519-25192613)
chr5 (115-267)||(24226990-24227148)
chr5 (115-235)||(37189651-37189772)
chr5 (13-107)||(1170064-1170159)
chr5 (13-107)||(20710800-20710895)
chr5 (13-107)||(28258263-28258358)
chr5 (117-234)||(21615537-21615655)
chr5 (190-280)||(24470716-24470805)
chr5 (25-107)||(24470966-24471048)
chr5 (115-235)||(13793654-13793775)
chr5 (13-104)||(24184616-24184708)
chr5 (13-107)||(11582537-11582632)
chr5 (13-107)||(21392851-21392946)
chr5 (13-103)||(21652805-21652896)
chr5 (13-107)||(23510653-23510748)
chr5 (13-107)||(23513459-23513554)
chr5 (190-283)||(7424085-7424178)
chr5 (190-288)||(21392602-21392699)
chr5 (207-281)||(11582325-11582398)
chr5 (218-283)||(25211623-25211687)
chr5 (218-283)||(25275775-25275839)
chr5 (323-371)||(1170402-1170450)
chr5 (13-104)||(17473292-17473384)
chr5 (323-371)||(22884968-22885016)
chr5 (325-426)||(19498012-19498120)
chr5 (116-235)||(28888440-28888563)
chr5 (325-424)||(10385-10491)
chr5 (323-371)||(16534751-16534799)
chr5 (395-435)||(21647250-21647290)
chr5 (325-424)||(43445717-43445823)
chr5 (312-418)||(34937655-34937768)
chr5 (323-368)||(1221517-1221562)
chr5 (13-105)||(21933681-21933773)
chr5 (13-105)||(21939851-21939943)
chr5 (13-105)||(35580919-35581011)
chr5 (13-105)||(37010685-37010777)
chr5 (325-424)||(1221647-1221753)
chr5 (13-104)||(7424343-7424434)
chr5 (123-234)||(11964473-11964585)
chr5 (325-424)||(17473710-17473816)
chr5 (323-371)||(18779855-18779903)
chr5 (323-371)||(35792915-35792963)
chr5 (267-330)||(1171275-1171338)
chr5 (267-338)||(22368392-22368463)
chr5 (349-435)||(24470618-24470711)
chr5 (368-418)||(27185568-27185618)
chr5 (266-320)||(35793062-35793116)
chr5 (13-107)||(19404242-19404338)
chr5 (123-234)||(20455628-20455740)
chr5 (190-222)||(25192776-25192808)
chr5 (266-317)||(10523-10574)
chr5 (266-317)||(1221564-1221615)
chr5 (275-318)||(21653183-21653226)
chr5 (324-371)||(21661407-21661454)
chr5 (266-320)||(11340828-11340882)
chr5 (275-317)||(34937787-34937829)
chr5 (368-417)||(21392517-21392565)
chr5 (191-267)||(5452432-5452513)
chr5 (56-104)||(18779559-18779607)
chr5 (13-107)||(23453612-23453708)
chr5 (13-107)||(23465117-23465213)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (200-426)||(6819-7044)
scaffold0218 (13-104)||(6552-6644)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (13-225)||(1-218)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (13-368)||(155757-156107)
scaffold0023 (273-426)||(85923-86076)
scaffold0023 (13-283)||(34814-35090)
scaffold0023 (13-102)||(847-936)
scaffold0023 (269-362)||(58291-58384)
scaffold0023 (266-317)||(156109-156160)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (207-411)||(39879-40082)
scaffold0106 (13-106)||(40262-40355)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (13-371)||(3046-3417)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (13-169)||(52679-52838)
scaffold0018 (13-169)||(56631-56790)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (13-288)||(12668-12955)
[»] scaffold0195 (7 HSPs)
scaffold0195 (13-267)||(19879-20148)
scaffold0195 (13-267)||(17795-18064)
scaffold0195 (13-235)||(8058-8294)
scaffold0195 (13-235)||(13447-13683)
scaffold0195 (324-368)||(19822-19866)
scaffold0195 (368-418)||(17607-17657)
scaffold0195 (368-418)||(19637-19687)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (19-267)||(60064-60325)
scaffold0068 (19-77)||(46819-46877)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (13-288)||(248944-249234)
scaffold0012 (323-435)||(249219-249331)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (13-283)||(4603-4887)
scaffold0462 (324-418)||(4509-4605)
[»] scaffold0622 (4 HSPs)
scaffold0622 (13-262)||(7927-8190)
scaffold0622 (266-371)||(7704-7809)
scaffold0622 (272-371)||(7576-7675)
scaffold0622 (272-318)||(7653-7699)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (13-264)||(14171-14436)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (13-280)||(6024-6304)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (13-264)||(27067-27332)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (13-288)||(138215-138502)
scaffold0021 (189-295)||(76750-76855)
scaffold0021 (13-107)||(87104-87199)
scaffold0021 (323-418)||(76670-76772)
scaffold0021 (30-107)||(77046-77124)
scaffold0021 (323-417)||(138487-138588)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (115-267)||(56429-56582)
scaffold0051 (13-64)||(58904-58956)
[»] scaffold0039 (4 HSPs)
scaffold0039 (190-371)||(20905-21085)
scaffold0039 (272-404)||(21114-21246)
scaffold0039 (272-318)||(21090-21136)
scaffold0039 (55-107)||(20691-20743)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (277-425)||(31194-31342)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (13-280)||(128872-129143)
scaffold0028 (115-235)||(78207-78323)
scaffold0028 (190-281)||(90599-90689)
scaffold0028 (266-338)||(128678-128750)
scaffold0028 (272-317)||(90734-90779)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (305-425)||(878-998)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (192-283)||(1-92)
scaffold0384 (310-425)||(258-374)
[»] scaffold0234 (3 HSPs)
scaffold0234 (323-435)||(19313-19425)
scaffold0234 (200-288)||(19241-19328)
scaffold0234 (13-100)||(18982-19070)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (189-371)||(7120-7300)
scaffold0338 (13-103)||(7459-7550)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-283)||(17494-17769)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (13-262)||(8571-8836)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (13-283)||(29832-30108)
[»] scaffold0049 (4 HSPs)
scaffold0049 (291-426)||(44492-44627)
scaffold0049 (190-338)||(30946-31091)
scaffold0049 (196-252)||(44637-44693)
scaffold0049 (272-317)||(30917-30962)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (115-337)||(3818-4045)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (183-283)||(37770-37870)
scaffold0076 (13-105)||(37952-38044)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (13-107)||(27684-27778)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (190-303)||(18040-18152)
scaffold0292 (272-317)||(18002-18047)
scaffold0292 (266-371)||(17874-17979)
scaffold0292 (79-107)||(18344-18372)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (13-112)||(11330-11429)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (126-288)||(37932-38094)
scaffold0102 (323-371)||(37899-37947)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (190-308)||(77877-77995)
scaffold0034 (13-107)||(38873-38968)
scaffold0034 (13-107)||(78214-78309)
scaffold0034 (266-338)||(36142-36214)
scaffold0034 (13-56)||(44512-44555)
scaffold0034 (266-371)||(77738-77845)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (213-371)||(15833-15990)
scaffold0346 (123-234)||(14143-14255)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (189-267)||(17068-17146)
scaffold0315 (13-103)||(17314-17404)
[»] scaffold2147 (3 HSPs)
scaffold2147 (190-282)||(712-803)
scaffold2147 (368-418)||(619-669)
scaffold2147 (46-107)||(964-1026)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (13-283)||(25384-25658)
scaffold0141 (183-283)||(21129-21229)
scaffold0141 (13-105)||(21311-21403)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (266-404)||(44359-44495)
scaffold0066 (266-404)||(52528-52665)
[»] scaffold0692 (3 HSPs)
scaffold0692 (190-283)||(1045-1137)
scaffold0692 (13-107)||(799-894)
scaffold0692 (323-418)||(1127-1229)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (183-283)||(3152-3252)
scaffold0124 (13-103)||(23103-23194)
scaffold0124 (13-105)||(2978-3070)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (116-235)||(7188-7308)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (13-107)||(15266-15361)
scaffold0251 (190-283)||(15530-15623)
[»] scaffold0037 (5 HSPs)
scaffold0037 (189-288)||(26414-26512)
scaffold0037 (13-107)||(26128-26223)
scaffold0037 (13-202)||(70801-71004)
scaffold0037 (212-266)||(66337-66391)
scaffold0037 (323-371)||(26497-26545)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (190-288)||(31208-31305)
scaffold0171 (323-418)||(31122-31223)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (115-235)||(78356-78477)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (117-235)||(4878-4996)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (13-107)||(28547-28642)
scaffold0116 (190-265)||(28253-28328)
scaffold0116 (312-417)||(28035-28149)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (123-262)||(68820-68962)
scaffold0031 (13-103)||(69432-69523)
scaffold0031 (13-107)||(30738-30833)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (189-276)||(163817-163903)
scaffold0016 (115-235)||(118128-118249)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (335-423)||(15100-15195)
scaffold0138 (207-283)||(15022-15097)
scaffold0138 (115-178)||(23949-24012)
scaffold0138 (13-107)||(14667-14762)
scaffold0138 (323-418)||(26535-26636)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (115-235)||(71802-71923)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (13-104)||(2245-2337)
scaffold0673 (190-280)||(3706-3795)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (13-104)||(6765-6857)
scaffold0480 (191-288)||(7013-7109)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (207-294)||(6326-6412)
scaffold0407 (296-371)||(6390-6465)
scaffold0407 (13-107)||(6012-6106)
[»] scaffold0359 (3 HSPs)
scaffold0359 (13-107)||(13145-13240)
scaffold0359 (190-276)||(13433-13517)
scaffold0359 (315-417)||(13547-13655)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (354-425)||(15094-15165)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (13-107)||(32245-32340)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (122-234)||(212-325)
scaffold0786 (122-234)||(5267-5380)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (13-230)||(2030-2261)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (16-104)||(4507-4596)
scaffold0342 (368-418)||(2524-2574)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (115-235)||(33993-34114)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (243-368)||(25757-25875)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (227-318)||(94665-94755)
scaffold0044 (13-107)||(94983-95078)
scaffold0044 (13-232)||(66843-67067)
scaffold0044 (272-317)||(94570-94615)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (13-106)||(71856-71950)
scaffold0001 (189-262)||(72104-72177)
scaffold0001 (272-362)||(166144-166234)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (122-234)||(3800-3913)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (13-104)||(3095-3187)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (13-104)||(27915-28007)
[»] scaffold1610 (1 HSPs)
scaffold1610 (384-435)||(1-52)
[»] scaffold1605 (1 HSPs)
scaffold1605 (384-435)||(1527-1578)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (115-200)||(4587-4672)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (123-267)||(3242-3392)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (122-234)||(25142-25255)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (219-283)||(24878-24942)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (13-103)||(6740-6831)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (263-318)||(393-448)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (269-362)||(1244-1337)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (368-418)||(23124-23174)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (368-418)||(29721-29771)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (205-294)||(7039-7130)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (123-227)||(55920-56025)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (320-371)||(4525-4576)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (368-415)||(9989-10036)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (211-295)||(1816-1902)
scaffold0092 (13-107)||(2080-2176)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (13-107)||(20360-20456)
scaffold0150 (13-107)||(27189-27285)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 96)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 110235 - 109810
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110235 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 110136  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110135 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 110036  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgac 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  110035 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgac 109936  T
Q  310 tattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109935 tattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgat 109836  T
Q  410 gtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  109835 gtaagtattaatgtgtggttattatt 109810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10642684 - 10642438
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  10642684 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 10642585  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattga 388  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10642584 cgtgaaatgtaattaatgactattcatgaatatttgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaagtgataactgttcatgtgattgatgattattga 10642485  T
Q  389 tgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10642484 tgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 10642438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 9294022 - 9293776
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  9294022 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattgtt 9293923  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattga 388  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9293922 cgtgaaatgtgattaatgattattcatgaatatttgtgattggagattgtgaatgaaaatttgtgaaatgataactgttcatgtgattgatgattattga 9293823  T
Q  389 tgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9293822 tgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 9293776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15212096 - 15211814
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212096 aatataatcggatgttgtcctatatattgtggataaaattgtaattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 15211997  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgacc-ttttgg 205  Q
    |    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||  |||||||| || ||||||    
T  15211996 taaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgtcctttttgg 15211897  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15211896 atatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgt 15211814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16521543 - 16521294
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16521543 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgagttgttg 16521444  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt--gttttatcatcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||   ||||| |||||||||||||||| ||    
T  16521443 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttgtccatcggaggtgacgaccttttgaag 16521344  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16521343 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Original strand, 54119889 - 54120133
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||    
T  54119889 ggtgacgactctttggagatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgatcggtgattatt 54119987  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgat 389  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54119988 catgaaatgtaattaatgattgttcatgataaatatggttggtgattgtgattgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattattgat 54120087  T
Q  390 gtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  54120088 gtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 54120133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19999283 - 19998929
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  19999283 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 19999184  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcg-aaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    |  ||||| |||||||||||||| |     
T  19999183 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19999086  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  19999085 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 19998993  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19998992 atgattattgatgatattggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 19998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 8873897 - 8874164
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  8873897 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 8873996  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  8873997 ttgtagttgtaaatgggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 8874096  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||  || |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8874097 ttgaggtgatccggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 8874164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 14994951 - 14994590
Alignment:
Q  14 atataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14994951 atataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgttg 14994852  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    | ||   |||||||||||||||||||||||||| | |    ||| |||||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||||    
T  14994851 taaaagagtccggctcttttacttcggagattatgtaacgag----tgaccccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggag 14994756  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||       |||||||| ||| ||||    
T  14994755 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatg 14994663  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
    | |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  14994662 attattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaatggataattgctcatatgattgatg 14994590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 424
Target Start/End: Original strand, 15274341 - 15274585
Alignment:
Q  187 gaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgttt 286  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  15274341 gaaggtgacaaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgatt 15274440  T
Q  287 gttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgat 379  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||   | ||||||   |||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| | |    
T  15274441 gttcatgaaatatgattaatgattattcatgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggt 15274540  T
Q  380 gattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  15274541 gattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtg 15274585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 5684306 - 5684578
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5684306 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggacaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtggctg 5684405  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||    
T  5684406 taaaagagttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 5684504  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  5684505 gatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattg 5684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26678799 - 26678446
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  26678799 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 26678700  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaagg-tgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| | |||||||||| | |    
T  26678699 gtaaaagggatgat-tcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagatgacgaccttgttg 26678602  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| ||    
T  26678601 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaa 26678509  T
Q  306 tgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678508 tgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 26678446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 417
Target Start/End: Original strand, 53909430 - 53909665
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  53909430 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgaatgtt 53909528  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgat 382  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| | ||||    
T  53909529 catgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 53909628  T
Q  383 tattgatgtgagatatgggggtg--tgatgtaagtat 417  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  53909629 tattgatgtgagatattggggtgtttgatgtaagtat 53909665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16521035 - 16520866
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16521035 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattg 16520936  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16520935 ttcatatgattgatgaatatagatgtaagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 16520866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47356081 - 47355727
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  47356081 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 47355982  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  47355981 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 47355884  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| |    
T  47355883 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatga 47355791  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||| |||| |||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47355790 atgattattgatgatgtttgagattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 47355727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19998739 - 19998591
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  19998739 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 19998640  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19998639 gatgaatattgatgtgagatattggggtgtgatgtgagtattaatgtgt 19998591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18167291 - 18167116
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||         
T  18167291 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtg----- 18167197  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
      |||||||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18167196 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatg 18167116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 12901175 - 12901444
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg------- 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||             
T  12901175 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtaaagttgaa 12901274  T
Q  105 --tgtagttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
      |||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  12901275 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 12901374  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttga 268  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  12901375 cttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttga 12901444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18246400 - 18246252
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||     
T  18246400 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataatcgtaaattgataattgttcatatgatt 18246301  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18246300 gacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 18246252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18246764 - 18246589
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||         
T  18246764 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg----- 18246670  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
      ||||| || ||| ||||| |||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246669 --atgaattgagatgaatgattattgatgatgttcgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 18246589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 21960984 - 21961234
Alignment:
Q  26 gttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---------agttgtg- 114  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         ||||||      
T  21960984 gttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgagattgtagttgtaa 21961083  T
Q  115 --gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagattt 211  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||      
T  21961084 aagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatcc 21961183  T
Q  212 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21961184 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 21961234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 152
Target Start/End: Original strand, 25120525 - 25120667
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120525 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 25120624  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgg 152  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120625 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgg 25120667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 285 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15211729 - 15211591
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgatta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  15211729 ttgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgttaatgaatatttgcgaattgataattgttcatatgattgatgaata 15211630  T
Q  385 ttgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgt 423  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15211629 ttgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtatgaatgt 15211591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8373031 - 8372876
Alignment:
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  8373031 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 8372939  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8372938 atgattattgatgat-gttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 8372876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13244780 - 13244668
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatg 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13244780 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatg 13244681  T
Q  423 tgtggtaattatt 435  Q
    |||| | ||||||    
T  13244680 tgtgattattatt 13244668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14950774 - 14950500
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14950774 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgttgct 14950676  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | |    
T  14950675 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtatgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttg 14950578  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14950577 agatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattggtg 14950500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 15138077 - 15138236
Alignment:
Q  126 ttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatg 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    |  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  15138077 ttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatg 15138175  T
Q  223 catttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15138176 catttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg 15138236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 22355966 - 22356240
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgat-tgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||  |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  22355966 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaactgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 22356064  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  22356065 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22356162  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22356163 gagatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 22356240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10487425 - 10487151
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  10487425 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 10487326  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  10487325 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 10487229  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  10487228 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 10487151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 16329326 - 16329600
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  16329326 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 16329425  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  16329426 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 16329522  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  16329523 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 16329600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 285 - 421
Target Start/End: Original strand, 53706605 - 53706750
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcat-gataattgtgatt-ggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgat 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||    
T  53706605 ttgttcatgaaatgtgattaatgattgttcattgatatatgtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtgat 53706704  T
Q  376 cgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaat 421  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53706705 tgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtactaat 53706750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14900122 - 14899902
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  14900122 gggttgaactcttttacttcggtgattttgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcggaggtgacgaccttgaggtgatttgg 14900023  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatg--aaatgtgattaatgac 309  Q
    || ||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| || || ||||||  |||||||| | ||||     
T  14900022 tatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattattcatgataaatgtgagtgatgat 14899923  T
Q  310 tattcatgataattgtgattg 330  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  14899922 tattcatgataaatgtgattg 14899902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34393808 - 34393714
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34393808 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 34393714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 16366442 - 16366561
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16366442 tgtgattagtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatgattattgatgtgagatattagggtgtgatgtaagt 16366541  T
Q  416 attaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  16366542 attaatgtgtgattattatt 16366561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 34197692 - 34197813
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  34197692 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 34197791  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  34197792 taccacatgcatttatgcgtca 34197813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26338240 - 26337965
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  26338240 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 26338142  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  | ||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  26338141 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26338044  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  26338043 gagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagttctatgtgaattatgtgattggtg 26337965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9294279 - 9294185
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9294279 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 9294185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 16366360 - 16366457
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16366360 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattagtgattgt 16366457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 13049566 - 13049841
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  13049566 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 13049664  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  13049665 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 13049762  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  13049763 gagatttggtaccgcatgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 13049841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 33739020 - 33738925
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33739020 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 33738925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 53909173 - 53909268
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53909173 aatataattgggtgttgtcctgtatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 53909268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 12245779 - 12245900
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  12245779 gggtttagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 12245878  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12245879 taccacatgcatttatgtgtca 12245900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 15852843 - 15852964
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  15852843 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactttggtgaaatcttacatacgatgttttttttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 15852942  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15852943 taccacatgcatttatgtgtca 15852964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18167117 - 18166958
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  18167117 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttg 18167018  T
Q  366 tt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||       |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18167017 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 18166958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 37958584 - 37958705
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||| ||||||  || |||| ||    
T  37958584 gggttgagctcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgattcgg 37958683  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  37958684 taccacatgcatttatgcgtca 37958705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 7133852 - 7133947
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7133852 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaaatgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 7133947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 44345582 - 44345487
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44345582 aatataattgggtgttgtcccatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 44345487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27959673 - 27959560
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  27959673 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggt 27959574  T
Q  215 accacatgcattta 228  Q
    ||||||||||||||    
T  27959573 accacatgcattta 27959560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34393624 - 34393485
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc--- 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||       
T  34393624 atgtgattggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 34393525  T
Q  369 ----atgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
        ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  34393524 acagatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggt 34393485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 288
Target Start/End: Original strand, 12837914 - 12838020
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12837914 catcgaaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctt-tttgatatatgtgattg 12838012  T
Q  281 gtgtttgt 288  Q
    ||| ||||    
T  12838013 gtgattgt 12838020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44054406 - 44054331
Alignment:
Q  212 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  44054406 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgattgt 44054331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10642942 - 10642847
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10642942 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 10642847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 41167461 - 41167580
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  41167461 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatctcacatacgatgtttttgttacatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 41167560  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgt 233  Q
    ||||||||| |||| |||||    
T  41167561 taccacatgtatttgtgtgt 41167580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 45460360 - 45460455
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45460360 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgtcgtcgcattattgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 45460455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 15288611 - 15288704
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  15288611 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 15288704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 15295778 - 15295871
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  15295778 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 15295871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 44054677 - 44054583
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtg 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44054677 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtg 44054583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33738731 - 33738635
Alignment:
Q  191 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  33738731 gtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtgattggtgattgt 33738635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44345335 - 44345259
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatt 265  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44345335 aggtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 44345259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 53706193 - 53706288
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  53706193 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattattattgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 53706288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 54119664 - 54119759
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  54119664 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgtatcatagtcgtgt 54119759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13244845 - 13244765
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13244845 gatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 13244765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8373108 - 8373044
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtc 77  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8373108 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtc 8373044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16521217 - 16521169
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16521217 tgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 16521169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134154
Alignment:
Q  218 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-gaaatgtgattggtgtt 7134154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 13751697 - 13751792
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13751697 aatataattgggagttgtgttatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 13751792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18167548 - 18167454
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18167548 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 18167454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 5372229 - 5372341
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   |||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  5372229 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaagtcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacat 5372328  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  5372329 gcatatatgtgtc 5372341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8372791 - 8372685
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8372791 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 8372692  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  8372691 tgatgtg 8372685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13245207 - 13245115
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  13245207 aatataattgggtttcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 13245115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Original strand, 55378466 - 55378532
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  55378466 atgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgt 55378532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848845
Alignment:
Q  211 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttga 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttga 7848845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15211782 - 15211729
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgat 319  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15211782 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgat 15211729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 47469868 - 47469977
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  47469868 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttggggttatttggtaccacat 47469967  T
Q  222 gcatttatgt 231  Q
    |||| |||||    
T  47469968 gcatatatgt 47469977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 7134319 - 7134425
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  7134319 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgggatattggggtttgatgtaattat 7134418  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  7134419 tgatgtg 7134425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Original strand, 19699420 - 19699522
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  19699420 tgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgatgtaagt 19699519  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  19699520 att 19699522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Original strand, 19710005 - 19710107
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  19710005 tgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgatgtaagt 19710104  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  19710105 att 19710107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 294
Target Start/End: Original strand, 43283041 - 43283148
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgttt 286  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| ||  |    
T  43283041 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgaat 43283140  T
Q  287 gttcatga 294  Q
    ||||||||    
T  43283141 gttcatga 43283148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15211836 - 15211781
Alignment:
Q  316 tgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  15211836 tgatatttgtgattggtgattgtgaatgagtatttttgaattgatatttgttcatg 15211781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 267
Target Start/End: Original strand, 41257882 - 41258033
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||  | ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  41257882 gctcttctacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 41257981  T
Q  221 tgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---taacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  41257982 tgcatatatgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 41258033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 15288412 - 15288503
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||   |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15288412 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgagt-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 15288503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 15295522 - 15295613
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||   |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15295522 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgagt-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 15295613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 7134188 - 7134239
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  7134188 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 7134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8372874 - 8372823
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  8372874 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 8372823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 370
Target Start/End: Original strand, 12838005 - 12838052
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat 370  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12838005 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcat 12838052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19998845 - 19998802
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19998845 tgattggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttc 19998802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 30233947 - 30233998
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  30233947 aatataattgggtgttgtcctatatatcgaggtgaaaattgtggattgttgt 30233998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 288
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706581
Alignment:
Q  221 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatttgtgtttggtgattgt 53706581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Original strand, 19699348 - 19699390
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19699348 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 19699390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Original strand, 19709933 - 19709975
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19709933 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 19709975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19998800 - 19998746
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19998800 tgatacatgtaattggtgatttttcatgaaatgtgattagtgattattcatgata 19998746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 264
Target Start/End: Original strand, 30236145 - 30236222
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcataacatgagtcttat 264  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30236145 aggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttat 30236222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Original strand, 52267123 - 52267196
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtc 260  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| |||||||||    
T  52267123 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Original strand, 18294613 - 18294662
Alignment:
Q  369 atgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  18294613 atgtgatcggtgattattgatgtgagatattgggatttaatgtaagtatt 18294662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16521265 - 16521233
Alignment:
Q  225 tttatgtgtcaataagtgcatatcataacatga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16521265 tttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33738650 - 33738602
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  33738650 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgctcatg 33738602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 128)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2048815 - 2048395
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2048815 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 2048716  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  2048715 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgaccttttgaag 2048616  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2048615 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatg 2048516  T
Q  308 actattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2048515 actattcatgaatatttgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 2048416  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtgg 427  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  2048415 gatataagtgttaatgtgtgg 2048395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 10737311 - 10736903
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10737311 aatacaattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgttattgttgtcgcattatcgagtcttgtgacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 10737212  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10737211 taaaagggttgagctcttctacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcgaaggtggcgaccttttggagat 10737112  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgac 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  10737111 ttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattattgat 10737012  T
Q  310 tattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgat 409  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||     
T  10737011 tattcatgataaatgtgatttgtgatagtgaatggataattgtgaattgattgttgttcatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagtgtgac 10736912  T
Q  410 gtaagtatt 418  Q
    |||||||||    
T  10736911 gtaagtatt 10736903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23491261 - 23490841
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23491261 aatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatctagtttttttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 23491162  T
Q  113 tgg---ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  23491161 taaaaaggttgtgctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 23491062  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23491061 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgttcgtgaaatgtgattaat 23490962  T
Q  307 gactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtg 405  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  23490961 gactattcatgaatatttgtgtttggagattgtgaatgaatatttgtgaattgttaactgtttatgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatg 23490862  T
Q  406 tgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23490861 tgatgtaagtattaatgtgtg 23490841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 33340598 - 33340220
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33340598 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtacatgcatcatagtcgtgtagttg 33340499  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33340498 taaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 33340399  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33340398 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtggttaat 33340299  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattatt 386  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||    
T  33340298 gattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaata-ttgtgaattggaaattgttcatatgattaatgattatt 33340220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19230815 - 19230380
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||         
T  19230815 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagttatgttgaaa 19230716  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaa-ggtgacgac 198  Q
        ||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  19230715 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttgattcatcgaaaggtgacgac 19230616  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatg 298  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  19230615 gttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gataaatgtgattggtgaatattcatgaaatg 19230517  T
Q  299 tgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatat 398  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19230516 tgattaatgattattcatgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatatgattgatgattattgatgtgagatat 19230417  T
Q  399 gggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19230416 tggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggttattatt 19230380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 192 - 435
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262845
Alignment:
Q  192 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttca 19262701  T
Q  292 tgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19262702 tgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattattgatgt 19262801  T
Q  392 gagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19262802 gagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggttattatt 19262845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5227470 - 5227171
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227470 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 5227371  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgacctttt-ggaga 208  Q
    |    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5227370 taaaagggttg-gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgttttatcatcgaatgtgacgacctttttggaga 5227272  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatga 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||||    
T  5227271 ttcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgattagtgatgattgatgaaatgtgattaatga 5227172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19945381 - 19945098
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945381 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 19945282  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19945281 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggtggttttgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggagat 19945182  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  19945181 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgattgtttatga 19945098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 14846063 - 14846337
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14846063 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 14846162  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14846163 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggggggggtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggaga 14846262  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14846263 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtg 14846337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 215 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581163
Alignment:
Q  215 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgactattc 45581284  T
Q  315 atgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaag 414  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581283 atgataattgtgattggcaattatgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgagattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaag 45581184  T
Q  415 tattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  45581183 tattaatgtgtggttattatt 45581163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Original strand, 15939862 - 15940274
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15939862 aatataattgggtgttgtcatatacattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtccttatacatgcccatgcatcatagtcgtgttgtt 15939961  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  15939962 gtaaaagggctgaacttttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtctatcggaggtgacgaccttttgga 15940061  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       |||||||||| | |||    
T  15940062 gatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtg-------atgaaatgtggtgaat 15940154  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  15940155 gattattaataatgattgtgattggcgattgtgaatgaatattcgtgacttgttaattattcatatgattgatgattattggtgtgagatattggaatat 15940254  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  15940255 gatgtaagtatcaatatgtg 15940274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25057345 - 25057099
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  25057345 ggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 25057246  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattga 388  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  25057245 cgtgaaatgtgactaatgactattcatgaatatttgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaactgataactgctcatgtgattgatgattattga 25057146  T
Q  389 tgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25057145 tgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 25057099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 51159881 - 51160164
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159881 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattggtgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 51159980  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaac----ccttacatatgatgt--gttttatcatcgaaggtgacgacctttt 203  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  51159981 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacctttt 51160080  T
Q  204 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  51160081 ggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctca-ttgatatatgtgattggtgattgt 51160164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Original strand, 15860807 - 15861051
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  15860807 ggtgacgaccctttggagatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattatt 15860905  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgat 389  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15860906 catgaaatgtaattaatgagtgttcatgataaatgtggttggtgattgtgattgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattgttgat 15861005  T
Q  390 gtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15861006 gtgagatatggtggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 15861051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Original strand, 15469869 - 15470228
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15469869 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaaa-ttgtgattattgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgttg 15469967  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||| ||||| |  || || |||| || ||||||||||||||||    
T  15469968 taaaagagtccggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatacgatgttgacttgtccatcggagatgacgaccttttggag 15470063  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||       |||||||| ||| ||||    
T  15470064 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatg 15470156  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
    | |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  15470157 attattgatgat-gttgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgattgatg 15470228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 319017 - 319284
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtag--- 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |       
T  319017 aatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgtatcatagtcgtgttgaga 319116  T
Q  110 ttgtgg---------ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
    |||| |         |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  319117 ttgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 319216  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  319217 ttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 319284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16259796 - 16259541
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16259796 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgagttgttg 16259697  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||||    
T  16259696 taaaagagtccggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggag 16259601  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16259600 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttatttg 16259541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7852563 - 7852275
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  7852563 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 7852464  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatc-atcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||    
T  7852463 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttggatcgaaggtgacgacc 7852364  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||   | |||||||||||| ||||    
T  7852363 ttgaggtgatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattggtgattgt 7852275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 421
Target Start/End: Original strand, 17957994 - 17958224
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  17957994 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgattgt 17958093  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattga 388  Q
    ||||||||| |||||||||| | || | ||||  ||||||||   |||    ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||    
T  17958094 tcatgaaatatgattaatgattgtttaagatatatgtgattgataatt----atgaacaactgtgaattgatgatggttcatgtgattggtgattattga 17958189  T
Q  389 tgtgagatat--gggggtgtgatgtaagtattaat 421  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  17958190 tgtgagatattgggggatatgatgtaagtattaat 17958224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16819664 - 16819310
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| || |     
T  16819664 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgttcatgcatcatagtcgttgttgc 16819566  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||| ||| |||||||||||| |     
T  16819565 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgcaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16819467  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| |    
T  16819466 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatga 16819374  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||| || | |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16819373 atgattactgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 16819310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8630602 - 8630336
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||         
T  8630602 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgttgcattatcgagtcttgttacatatccatgcatcatagtcgtgttgaga 8630503  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||     |  |||||||||||||||||    
T  8630502 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagtggcatcgaaggtgacgacc 8630403  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttattt 266  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8630402 tggaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattt 8630336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 380
Target Start/End: Original strand, 18905348 - 18905522
Alignment:
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||    
T  18905348 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatg 18905440  T
Q  299 tgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
     ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  18905441 agatgaatgattattgatgatgattgtgattgatgtttgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgattgatg 18905522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18908912 - 18908753
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18908912 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattg 18908813  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18908812 ttcatatgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 18908753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18909445 - 18909090
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||| |||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||| |     
T  18909445 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 18909347  T
Q  111 tgt---ggggttgagctcttttacttcggagatta-tgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatg-tgttttat-catcgaaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| | ||||||||  |||| ||  || | ||||| ||||||||||||| |     
T  18909346 tgtaaaagggatga-ctcttttacttc-gagattattgtaaggcagaggtg-agccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgtt 18909250  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| |    
T  18909249 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatga 18909157  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909156 atgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 18909090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22273626 - 22273445
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22273626 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 22273527  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273526 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 22273445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 12351248 - 12351511
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcat-catagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||        
T  12351248 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgaattatcgagtcttgttacatgtccatgcattcatagtggtgttgag 12351347  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  12351348 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 12351447  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    |||  || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12351448 cttgaggtgatccagtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtctt 12351511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15613816 - 15613545
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgatt-gttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  15613816 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 15613718  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  15613717 gtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 15613622  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  15613621 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 15613545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 17913654 - 17913935
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |  || |||||||||||| |||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17913654 aatataattggatgtcgtcctatatattgtgttgacaattgtgattgt-gtcgcattatctagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtggctg 17913752  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||    
T  17913753 taaaagggttaagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacgtacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 17913851  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttc 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  17913852 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgattgttc 17913935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 288
Target Start/End: Original strand, 50113543 - 50113819
Alignment:
Q  25 tgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---------agttgtg 114  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||   ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||         ||||||     
T  50113543 tgttgtcctatatattgaggtgaaa-ttgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtacatgcccatgcatcatagtcgtgttgagattgtagttgta 50113641  T
Q  115 ---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
       ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||  || |||    
T  50113642 aaagggttgaactcttttacttcggagattatgcaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgt-ttttattgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgat 50113740  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50113741 ccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 50113819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22273256 - 22273108
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  22273256 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 22273157  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22273156 gacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 22273108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44228182 - 44227906
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  44228182 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 44228084  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  44228083 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 44227985  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  44227984 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 44227906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 49230468 - 49230320
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  49230468 attggtgattgttcatgaaatgtgattattgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 49230369  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49230368 gatgaagattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtactaatgtgt 49230320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 2450902 - 2451083
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2450902 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 2451001  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2451002 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgatgtttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 2451083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Original strand, 2451220 - 2451368
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||     
T  2451220 attggtgattgttcatgaaatatgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataagtgtaaattgataattgttcatatgatt 2451319  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2451320 gacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 2451368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 12265892 - 12266165
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  12265892 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgaatcatagtcgatgttgt 12265991  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    | |    | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||    
T  12265992 tttaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgg 12266087  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  12266088 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtg 12266165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 16745572 - 16745846
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| ||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16745572 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgtgatggttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgtgttgctg 16745671  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||| ||| |||||||||||| | ||    
T  16745672 taaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgttga 16745769  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16745770 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtg 16745846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 283
Target Start/End: Original strand, 23081681 - 23081840
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081681 gctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 23081776  T
Q  220 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  23081777 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 23081840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15574797 - 15574526
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgatt-gttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  15574797 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 15574699  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatga-tgtgttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    | ||   |||||||||||||| | ||||||||||| |    ||| |||||||||  || | |   || || |||| ||||||||||||||||||    
T  15574698 gtaaaagagtccggctcttttacttcgaaaattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgactttaacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 15574603  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  15574602 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 15574526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27839462 - 27839189
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  27839462 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 27839363  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  27839362 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 27839265  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27839264 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 27839189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49230969 - 49230709
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  49230969 aatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 49230870  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| ||||||||| || |     
T  49230869 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacgttgtt 49230772  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49230771 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 49230709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 299 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33340234 - 33340108
Alignment:
Q  299 tgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatat 398  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  33340234 tgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatt-gtgaattggaaattgttcatatgattaatgattattgatgttagatat 33340136  T
Q  399 gggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  33340135 tggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 33340108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11813404 - 11813265
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||    
T  11813404 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtgattgctgattgtt 11813306  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattg 330  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  11813305 catgaaatttgattaataattattcatgataaatgtgattg 11813265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30152090 - 30151815
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  30152090 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 30151992  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  30151991 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 30151894  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  30151893 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 30151815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30141458 - 30141365
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  30141458 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 30141365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 1469228 - 1469328
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  1469228 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 1469327  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  1469328 g 1469328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 8269803 - 8270078
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  8269803 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 8269901  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  | ||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  8269902 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 8269999  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  8270000 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 8270078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 8276914 - 8277189
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  8276914 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 8277012  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  | ||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  8277013 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 8277110  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  8277111 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 8277189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 8305723 - 8305998
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  8305723 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 8305821  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  | ||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  8305822 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 8305919  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  8305920 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 8305998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25057602 - 25057508
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25057602 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 25057508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 12490256 - 12490377
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |  |||| ||    
T  12490256 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgagatgattcgg 12490355  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12490356 taccacatgcatttatgtgtca 12490377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Original strand, 18905200 - 18905343
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||  ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18905200 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgattgttttcgcattattgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgttg 18905299  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggg 153  Q
    |    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18905300 taaaagggttgggctcttttactttggagattatgtaaggcggg 18905343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 19572511 - 19572630
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19572511 tgtgagtggtgattgtgaatgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagt 19572610  T
Q  416 attaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  19572611 attaatgtgtgattattatt 19572630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53769414 - 53769139
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  53769414 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 53769316  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  53769315 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 53769218  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  53769217 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 53769139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 19572174 - 19572269
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19572174 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcacattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 19572269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 17957738 - 17957828
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17957738 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 17957828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 19572429 - 19572526
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  19572429 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgagtggtgattgt 19572526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15874806 - 15874685
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  15874806 gggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 15874707  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15874706 taccacatgcatttatgtgtca 15874685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48420313 - 48420192
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  48420313 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 48420214  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48420213 taccacatgcatttatgtgtca 48420192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 398
Target Start/End: Original strand, 9304638 - 9304742
Alignment:
Q  292 tgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgt 391  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||  |||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9304638 tgaaatatgattaatgattgttcatgata--tgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcatatgatcgatgattattgatgt 9304735  T
Q  392 gagatat 398  Q
    |||||||    
T  9304736 gagatat 9304742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11813145 - 11813067
Alignment:
Q  294 aaatgtgattaatgactattcatga-taattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11813145 aaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatg 11813067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17099182 - 17099085
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17099182 ggtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 17099085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 18008656 - 18008777
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||  || ||||  |    
T  18008656 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtgattcag 18008755  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  18008756 taccacatgcatttatgcgtca 18008777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 288
Target Start/End: Original strand, 47786317 - 47786564
Alignment:
Q  55 gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt--------agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat 143  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||        ||||||    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47786317 gattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcatgttgagttgtagttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattat 47786416  T
Q  144 gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataag 240  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||| | ||| ||||||||| ||||||||  | || |    
T  47786417 gtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgcatatatgtgtcgaactagg 47786516  T
Q  241 tgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||    
T  47786517 tgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgt 47786564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45859773 - 45859498
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  45859773 aatataattggatgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 45859675  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  45859674 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 45859577  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  45859576 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 45859498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Original strand, 13956385 - 13956480
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  13956385 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 13956480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Original strand, 13977218 - 13977313
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  13977218 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 13977313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41268995 - 41268743
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgat-tgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  || | ||| ||  |||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  41268995 aatataattgggtgttgtcctatgtattgagttgaga-ttgagaaatgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 41268897  T
Q  111 tgt---ggggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||   |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  41268896 tgtaaaggggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 41268799  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtc 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41268798 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 41268743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 55442286 - 55442409
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggt---gacgaccttttggagattt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||| ||||||   |||||||||  || ||| |    
T  55442286 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgacgaccttgaggtgatct 55442385  T
Q  212 ggtaccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  55442386 ggtaccacatgcatttatgtgtca 55442409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 5229608 - 5229720
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5229608 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 5229707  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  5229708 gcatatatgtgtc 5229720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 6148456 - 6148551
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  6148456 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatgtgattggtgattgt 6148551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 38812515 - 38812634
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  38812515 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacggg-gtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgg 38812613  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc 234  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  38812614 tacgacatgcatatatgtgtc 38812634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55314955 - 55314883
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtc 260  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55314955 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 55314883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13816268 - 13816173
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13816268 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgagaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgttcatgcatcatagtcgtgt 13816173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 15860549 - 15860644
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15860549 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 15860644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17099469 - 17099374
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17099469 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgctgacgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 17099374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22145676 - 22145770
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22145676 aatataattgggtgt-gtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttatcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22145770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 30205209 - 30205114
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30205209 aatataattgggtgttgtccaatatattcaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 30205114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Original strand, 14060760 - 14060913
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||  ||| | ||| |  |||| ||||||||||||||  || |||||||    
T  14060760 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagatgggggtgaactcttacattcgatatttttgttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgatttgg 14060859  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatt 265  Q
    || ||||||||| || |||||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14060860 tatcacatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatt 14060913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 16183664 - 16183761
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  16183664 ggtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgtttggtgattgt 16183761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 54686693 - 54686623
Alignment:
Q  334 attgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54686693 attgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcatatgatcgatgattattgatgtgagatattggggt 54686623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 11330527 - 11330648
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||| |||||||| |||||  || || | ||    
T  11330527 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcaaaggtgacaaccttgaggtgactcgg 11330626  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11330627 taccacatgcatttatgtgtca 11330648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11813193 - 11813136
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgatt 329  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11813193 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataaatgtgatt 11813136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 22145881 - 22145973
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22145881 ggtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtctta-ttgatatatgtgattggtg 22145973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14297253 - 14297161
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14297253 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcg 14297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14302880 - 14302788
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14302880 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcg 14302788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35122442 - 35122350
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35122442 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcg 35122350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30204962 - 30204867
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  30204962 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcattt--gtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgattgt 30204867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 9592280 - 9592393
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9592280 gctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacacatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 9592379  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  9592380 tgcatatatgtgtc 9592393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47983531 - 47983419
Alignment:
Q  124 tcttttacttcggagattatgtaaggc-gggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  47983531 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47983432  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  47983431 gcatatatgtgtc 47983419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47992818 - 47992706
Alignment:
Q  124 tcttttacttcggagattatgtaaggc-gggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  47992818 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47992719  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  47992718 gcatatatgtgtc 47992706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48002105 - 48001993
Alignment:
Q  124 tcttttacttcggagattatgtaaggc-gggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  48002105 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48002006  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  48002005 gcatatatgtgtc 48001993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48011391 - 48011279
Alignment:
Q  124 tcttttacttcggagattatgtaaggc-gggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  48011391 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48011292  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  48011291 gcatatatgtgtc 48011279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 49230704 - 49230656
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49230704 tgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 49230656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 16183413 - 16183509
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctata----gattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16183413 aatataattgggtgttgtcctatatattgattgaggtgtaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcg 16183509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 17523812 - 17523907
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||  ||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17523812 aatataattgggagttgtcctatatattggggtgaaaaccgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 17523907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30204882 - 30204781
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30204882 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 30204783  T
Q  416 at 417  Q
    ||    
T  30204782 at 30204781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19944989 - 19944889
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19944989 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 19944890  T
Q  418 t 418  Q
    |    
T  19944889 t 19944889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11812985 - 11812886
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11812985 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 11812886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12796908 - 12796802
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12796908 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 12796809  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  12796808 tgatgtg 12796802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 53899924 - 53900016
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  53899924 aatataattgggagttgtcctatataatgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcg 53900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30141196 - 30141068
Alignment:
Q  297 tgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgat 389  Q
    |||||||||||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||    
T  30141196 tgtgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaat 30141097  T
Q  390 gtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  30141096 gtgagatattgggatttgatgtaagtatt 30141068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 1469054 - 1469146
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  1469054 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 1469146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 6148244 - 6148309
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtc 77  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  6148244 aatataattgggtgttgtcctacatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 6148309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15516150 - 15516051
Alignment:
Q  240 gtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatg--aaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattg 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||| |||||    
T  15516150 gtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgttcatgataaatgtgattgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattg 15516051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16259536 - 16259488
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16259536 tgtgattagagattgtgaatgaatatttgtcaattgataattgttcatg 16259488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16819225 - 16819119
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16819225 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 16819126  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  16819125 tgatgtg 16819119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17138222 - 17138126
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgat-tgttgtcatattatcgagtcgt-attacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |  || ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17138222 aatatagttgggagttgtcctttatattgaggtgaaaattgtaaagtgatgtcgcattatcgagtctttattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 17138126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38166515 - 38166467
Alignment:
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattg 337  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38166515 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattg 38166467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Original strand, 51160149 - 51160251
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  51160149 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggtttgatgtaagt 51160248  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  51160249 att 51160251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40938486 - 40938391
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || ||||||||| | ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40938486 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtaaattggtgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 40938391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11813275 - 11813198
Alignment:
Q  294 aaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11813275 aaatgtgattgatgattattcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 11813198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18738108 - 18738059
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18738108 catgtgattgaagattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 18738059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11813578 - 11813526
Alignment:
Q  55 gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11813578 gattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 11813526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14294184 - 14294088
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14294184 aatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 14294088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14299811 - 14299715
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14299811 aatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 14299715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 11062439 - 11062530
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11062439 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 11062530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13816074 - 13816015
Alignment:
Q  312 ttcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13816074 ttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 13816015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Original strand, 14522723 - 14522806
Alignment:
Q  26 gttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcg-tattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14522723 gttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctctgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 14522806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44227857 - 44227774
Alignment:
Q  335 ttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||| |||   | |||||||||||||||    
T  44227857 ttgtgaatgaatatttatgattggataattattcatgtgattgatgtatattgatatgagctatcaagttgtgatgtaagtatt 44227774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 49230529 - 49230475
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  49230529 tgatacatgtaattggtgatttttcatgaaatgtgattagtgattattcatgata 49230475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11813062 - 11813017
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11813062 atgtaattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattattcatg 11813017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 105
Target Start/End: Original strand, 13956248 - 13956297
Alignment:
Q  56 attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  13956248 attgttgtcgcattatcgagtcgttacacatgtccatgcatcatagtcgt 13956297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 234
Target Start/End: Original strand, 14523004 - 14523049
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 234  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14523004 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 14523049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 54049606 - 54049651
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  54049606 atgtgattggtgattgtttatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 54049651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 11062774 - 11062822
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11062774 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 11062822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 11198975 - 11199071
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||| ||||  |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11198975 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcaagtctttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 11199071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17099100 - 17099052
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17099100 tgtgattggtgattgtgtgtgaataattgtgaattgatatttgttcatg 17099052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 47786549 - 47786597
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  47786549 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 47786597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 145287 - 144861
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145287 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 145188  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||    
T  145187 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgaccttttggag 145088  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  145087 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgactgttcatgaaatgtgattaatg 144989  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtg 407  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  144988 attattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatatgattgatgattattgatgtgggaaattggggtgtg 144889  T
Q  408 atgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  144888 atggaagtattaatgtgtgattattatt 144861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 147546 - 147120
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  147546 aatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttattacatatccatgcatcatagtcgtgtagttg 147447  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  147446 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgatgaccttttggag 147347  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  147346 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgactgttcatgaaatgtgattaatg 147248  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtg 407  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  147247 attattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatatgattgatgattattgatgtgggaaattggggtgtg 147148  T
Q  408 atgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  147147 atggaagtattaatgtgtgattattatt 147120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 106)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 29759045 - 29758630
Alignment:
Q  16 ataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttgtg- 114  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  29759045 ataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcgtgtagttgtaa 29758946  T
Q  115 --gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggagatt 210  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29758945 aagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggagatt 29758846  T
Q  211 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgact 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  29758845 tggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgagtaatgatt 29758746  T
Q  311 attcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatg 410  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29758745 attcatgataaatgtaattggtgattgtgaatgaatagttgtgaattgataattgttaatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatg 29758646  T
Q  411 taagtattaatgtgtg 426  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29758645 taattattaatgtgtg 29758630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 24387111 - 24387531
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24387111 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 24387210  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||   ||| |  ||||  ||||||||||||||| ||    
T  24387211 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgacctttt-ga 24387309  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||    
T  24387310 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatga-------ttgttcatgaaatgtgattaat 24387402  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  24387403 gattattcatgatacatgtgagtggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattgttcatatgattgatgaatattgatgtgaaatatcggggtat 24387502  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24387503 gatgtaagtattaatgtgtgattattatt 24387531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 24930517 - 24930946
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24930517 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatactcgtgttgtt 24930616  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  24930617 gtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgg 24930716  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  24930717 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgatatgtgattgttcatggaatgtgattaa 24930816  T
Q  306 tgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtg 405  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||     
T  24930817 tgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattattcatatgattgatgaatattgatgtgaaatattggggta 24930916  T
Q  406 tgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  24930917 tgatgtaagttttaatgtgtgattattatt 24930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 270493 - 270202
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270493 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 270394  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270393 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 270295  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtga-ttggtgtttgttcatgaaatgtgat 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  270294 ttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtttta-ttgatatatgtgatttggtgattgttcatgaaatgtgat 270202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 831162 - 831453
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831162 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 831261  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831262 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 831360  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtga-ttggtgtttgttcatgaaatgtgat 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  831361 ttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtttta-ttgatatatgtgatttggtgattgttcatgaaatgtgat 831453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 645427 - 645718
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  645427 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 645526  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  645527 taaaagggttgatctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 645625  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtga-ttggtgtttgttcatgaaatgtgat 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  645626 ttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtttta-ttgatatatgtgatttggtgattgttcatgaaatgtgat 645718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 16203740 - 16204019
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16203740 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 16203839  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtg-ttttat-catcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16203840 taaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgaattgatccatcgaaggtgacgaccttttggag 16203939  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16203940 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 16204019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 200 - 435
Target Start/End: Original strand, 43375195 - 43375429
Alignment:
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43375195 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgactgttcatgaaatgt 43375293  T
Q  300 gattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatg 399  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||     
T  43375294 gattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatatgattgatgattattgatgtgggatatt 43375393  T
Q  400 ggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43375394 ggggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 43375429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 368
Target Start/End: Original strand, 13664295 - 13664474
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  13664295 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 13664394  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13664395 cgtgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 13664474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 368
Target Start/End: Original strand, 13723570 - 13723749
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  13723570 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 13723669  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13723670 cgtgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 13723749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Original strand, 22008138 - 22008301
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22008138 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgtt 22008237  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22008238 catgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaattgatatttgt 22008301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37605749 - 37605481
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  37605749 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 37605650  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgac-gac 198  Q
        ||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||  | ||||||||||||| |||    
T  37605649 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcgaaggtgacagac 37605550  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37605549 cttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 37605481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Original strand, 3433496 - 3433644
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  3433496 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 3433595  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3433596 gatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 3433644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 3432977 - 3433323
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  3432977 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 3433075  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  3433076 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3433173  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  3433174 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 3433266  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 361  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433267 atgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 3433323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24547976 - 24547705
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgatt-gttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  24547976 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 24547878  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  24547877 gtaaaagagtccggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 24547782  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  24547781 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 24547705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 285 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28836194 - 28836054
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgatta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || || ||    
T  28836194 ttgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgattgacgaata 28836095  T
Q  385 ttgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28836094 ttgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 28836054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 414
Target Start/End: Original strand, 22323101 - 22323330
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  22323101 ggtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttatt-gataaatgtgtttggtgattgtt 22323198  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgat 382  Q
    | |||||| ||||| | || | ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| |||||     
T  22323199 cttgaaatatgattgaggattgttcatgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaa 22323298  T
Q  383 tattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaag 414  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22323299 tattgatgtgagatattggggtgtgatgtaag 22323330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 16204004 - 16204116
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatg 422  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16204004 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattaatgattattgatgtgagatattggagtgtgatgcaagtattaatg 16204103  T
Q  423 tgtggtaattatt 435  Q
    |||||| ||||||    
T  16204104 tgtggttattatt 16204116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 22909144 - 22909271
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||| || ||||    
T  22909144 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttga-aaatgtgattgatgattgt 22909242  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22909243 ccatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 22909271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41244277 - 41244113
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||  | |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  41244277 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggt 41244178  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41244177 accacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatctta-ttgatatatgtgattg 41244113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 16874339 - 16874615
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  16874339 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 16874438  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  16874439 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16874536  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  16874537 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 16874615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5236950 - 5236676
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  5236950 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 5236851  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  5236850 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 5236754  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5236753 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 5236676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23509493 - 23509399
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23509493 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg 23509399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 22089844 - 22090120
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||       
T  22089844 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgtttc 22089942  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  22089943 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22090041  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  22090042 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 22090120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37610123 - 37609951
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-------- 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||            
T  37610123 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 37610024  T
Q  105 -tgtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgat 173  Q
     |||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  37610023 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgat 37609951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 24108244 - 24108336
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  24108244 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 24108336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Original strand, 24719076 - 24719221
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  24719076 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatatgattggtgaatgtt 24719174  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||||||| ||||||    
T  24719175 catgaaatgtgattaatgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 24719221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 272778 - 272878
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  272778 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 272877  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  272878 g 272878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 643071 - 642971
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  643071 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 642972  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  642971 g 642971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 828877 - 828777
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  828877 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 828778  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  828777 g 828777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 15320460 - 15320736
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  15320460 aatacaattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 15320558  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  15320559 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15320657  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  15320658 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 15320736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 15500829 - 15501105
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  15500829 aatacaattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 15500927  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  15500928 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15501026  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  15501027 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 15501105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 21845892 - 21846167
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21845892 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 21845990  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  21845991 tgtaaaagggatgat-tcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 21846088  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21846089 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 21846167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 21853297 - 21853572
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||| ||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21853297 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgctgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 21853395  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  21853396 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 21853493  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21853494 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 21853572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 224563 - 224839
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  224563 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 224662  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  224663 tgtaaaagggatga-ctcttttgcttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 224760  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  224761 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 224839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 738186 - 738462
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  738186 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 738285  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  738286 tgtaaaagggatga-ctcttttgcttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 738383  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  738384 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 738462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 862081 - 862357
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  862081 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 862180  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  862181 tgtaaaagggatga-ctcttttgcttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 862278  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  862279 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 862357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 24662648 - 24662922
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  24662648 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 24662747  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  24662748 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 24662844  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  24662845 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 24662922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 21192268 - 21192389
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  21192268 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgattcgg 21192367  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21192368 taccacatgcatttatgtgtca 21192389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22908886 - 22908980
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  22908886 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttgtatatgtccatgcatcatagtcgtgt 22908980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 700976 - 701252
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  700976 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 701075  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  701076 tgtaaaagggatga-ctcttttgcttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 701173  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  701174 gagatttggtaccgcatgcatttttttgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 701252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 16675727 - 16676002
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  16675727 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 16675825  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  16675826 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16675923  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  16675924 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 16676002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 39448345 - 39448465
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| | ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  39448345 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggt 39448444  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39448445 accacatgcatttatgtgtca 39448465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41245420 - 41245218
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg------- 104  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||           
T  41245420 aatataattgggagtagtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaa 41245321  T
Q  105 --tgtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
      |||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  41245320 attgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgac 41245221  T
Q  199 ctt 201  Q
    |||    
T  41245220 ctt 41245218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 24718819 - 24718914
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24718819 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcacattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 24718914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Original strand, 41508883 - 41508982
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41508883 atgtgcttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatg 41508982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43684409 - 43684135
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  43684409 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 43684310  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  43684309 gtaaaagagatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 43684213  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  43684212 agatttggtactgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 43684135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 425
Target Start/End: Original strand, 23631023 - 23631099
Alignment:
Q  349 ttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23631023 ttgtaaattgataattgttcatatgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 23631099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16417017 - 16416922
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16417017 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggataattgtcacattatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 16416922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 21199695 - 21199814
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||| |||  || |||| ||    
T  21199695 gggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgattcgg 21199794  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21199795 taccacatgcatttatgtgt 21199814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 19994801 - 19994898
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19994801 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgtttggtgattgt 19994898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20480428 - 20480335
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20480428 aatataattaggtgttgtcctatatattgtggtgaaaat-gtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 20480335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 225
Target Start/End: Original strand, 31195807 - 31195917
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  31195807 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgatttggt 31195906  T
Q  215 accacatgcat 225  Q
    |||||||||||    
T  31195907 accacatgcat 31195917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 267
Target Start/End: Original strand, 37655175 - 37655326
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  37655175 gctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggcaccaca 37655274  T
Q  221 tgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---taacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  37655275 tgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 37655326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21696202 - 21696081
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||  ||    
T  21696202 gggttgaactcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgg 21696103  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21696102 taccacatgcatttatgtgtca 21696081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23835861 - 23835741
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || | || ||    
T  23835861 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtg-ttcgg 23835763  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23835762 taccacatgcatttatgtgtca 23835741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 13664037 - 13664132
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13664037 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 13664132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 13723312 - 13723407
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13723312 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 13723407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 20655426 - 20655521
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20655426 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 20655521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22007880 - 22007975
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22007880 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22007975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25121013 - 25120928
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtg 276  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25121013 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtg 25120928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 20568669 - 20568757
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20568669 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcata 20568757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 20574862 - 20574950
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20574862 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcata 20574950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 20648841 - 20648932
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20648841 aatataattgggagttgttctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 20648932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 16195140 - 16195202
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgag 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16195140 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgag 16195202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 418
Target Start/End: Original strand, 22909311 - 22909451
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| |    
T  22909311 ttgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 22909410  T
Q  378 atgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  22909411 atgattattaatttgagatattgggatttgatgtaagtatt 22909451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 24107988 - 24108081
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24107988 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtg-gtgttgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 24108081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 33612590 - 33612703
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  33612590 gctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 33612689  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||| ||||    
T  33612690 tgcatatatatgtc 33612703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 13664559 - 13664665
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13664559 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 13664658  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  13664659 tgatgtg 13664665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 13723834 - 13723940
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13723834 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 13723933  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  13723934 tgatgtg 13723940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16416812 - 16416736
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatt 265  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16416812 aggtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 16416736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 22498833 - 22498945
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22498833 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 22498932  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  22498933 gcatatatgtgtc 22498945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 43374983 - 43375075
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  43374983 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 43375075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20480168 - 20480082
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtg 276  Q
    |||||||||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20480168 aggtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtg 20480082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 424
Target Start/End: Original strand, 22008305 - 22008470
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||   | | ||||  ||||||| |||||||  | |||| ||||| |||    
T  22008305 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatgatgtatataattgatgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttg 22008404  T
Q  366 ttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    ||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22008405 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtg 22008470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22322837 - 22322932
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22322837 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattatggattattgtcgcattatcaagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22322932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25121299 - 25121204
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25121299 aatataattggaagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtacatgttcatgcatcatagtcgtgt 25121204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 23116350 - 23116464
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  23116350 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacat 23116449  T
Q  222 gcatttatgtgtcaa 236  Q
    |||| ||||||||||    
T  23116450 gcatatatgtgtcaa 23116464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 19994554 - 19994646
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  19994554 aatatagttgtgtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtacatgtccatgcattatagtcg 19994646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 23153339 - 23153451
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  || |   |||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  23153339 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacaccatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacat 23153438  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  23153439 gcatatatgtgtc 23153451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 371
Target Start/End: Original strand, 24108424 - 24108520
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  24108424 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 24108520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25294574 - 25294488
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| |||  | ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25294574 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatttg 25294488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25756563 - 25756477
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| |||  | ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25756563 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatttg 25756477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 270169 - 270022
Alignment:
Q  286 tgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcga 378  Q
    |||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||  ||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||  |    
T  270169 tgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaa 270070  T
Q  379 tgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  270069 tgattattgatgtgagatatttgggtttgatgtaagtattgatgtgtg 270022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 272604 - 272696
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  272604 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 272696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 643245 - 643153
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  643245 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 643153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 426
Target Start/End: Original strand, 645751 - 645898
Alignment:
Q  286 tgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcga 378  Q
    |||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||  ||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||  |    
T  645751 tgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaa 645850  T
Q  379 tgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  645851 tgattattgatgtgagatatttgggtttgatgtaagtattgatgtgtg 645898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 829051 - 828959
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  829051 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 828959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 426
Target Start/End: Original strand, 831486 - 831633
Alignment:
Q  286 tgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcga 378  Q
    |||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||  ||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||  |    
T  831486 tgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaa 831585  T
Q  379 tgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  831586 tgattattgatgtgagatatttgggtttgatgtaagtattgatgtgtg 831633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 6775633 - 6775725
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| |||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  6775633 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 6775725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18610614 - 18610512
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18610614 tgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgatgtaagt 18610515  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  18610514 att 18610512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22312303 - 22312191
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||| ||| ||  || |||||||||||||||    
T  22312303 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgactttgaggtgatttggtaccacat 22312204  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  22312203 gcatatatgtgtc 22312191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33170890 - 33170786
Alignment:
Q  131 cttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttat 229  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  | ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||    
T  33170890 cttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 33170791  T
Q  230 gtgtc 234  Q
    |||||    
T  33170790 gtgtc 33170786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28543680 - 28543598
Alignment:
Q  26 gttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||| || |||| || || |||||||| ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28543680 gttgtcctctatattgtggtgataattgtgaattgatgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 28543598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37605467 - 37605368
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  37605467 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgaaatattggggtttgatgtaagtat 37605368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41244082 - 41244033
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41244082 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 41244033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23509335 - 23509284
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  23509335 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 23509284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23509372 - 23509337
Alignment:
Q  333 gattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23509372 gattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 23509337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Original strand, 3433435 - 3433489
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3433435 tgatacatgtaattggtgatttttcatgaaatgtgattagtgattattcatgata 3433489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18610686 - 18610644
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18610686 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 18610644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 424
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776344
Alignment:
Q  383 tattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtg 6776344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Original strand, 17731137 - 17731193
Alignment:
Q  211 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcataacatgagtcttatt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17731137 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 17731193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 24719205 - 24719250
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  24719205 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgatttatgaatgttcatg 24719250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25120879 - 25120830
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25120879 catgtgattggtgattatttatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 25120830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11543148 - 11543096
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt 175  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  11543148 ctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgt 11543096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21679959 - 21679863
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||| | || |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21679959 aatatatttggaagttgtcatctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgttacatgtccatgcatcatagccgtgt 21679863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 104)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 19984608 - 19985034
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19984608 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaa-ttgtgattgttgtcgaattatctagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 19984706  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  19984707 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggat 19984806  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19984807 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgagattaatg 19984906  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtg 407  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  19984907 attattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaatcgataattgttcacatgattgatgacgattgatgtgagatattgaggtgtg 19985006  T
Q  408 atgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||    
T  19985007 atataagtattaatgtgtgattattatt 19985034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1554599 - 1554280
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554599 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaa-ttgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 1554501  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554500 taaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 1554401  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgac 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||| |||||  |||     
T  1554400 ttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgattattcatggaatatgattggtgat 1554301  T
Q  310 tattcatgataattgtgattg 330  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  1554300 tattcatgataaatgtgattg 1554280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11214900 - 11214535
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11214900 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatagagtacttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 11214801  T
Q  112 gtgg---ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgacctttt-ggag 207  Q
    ||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11214800 gtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgacctttttggag 11214701  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||||| ||||||||    
T  11214700 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatg-------atgaaatgagattaatg 11214608  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
    | |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  11214607 attattgatgatgattgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaatgaataattgttcatatgattgatg 11214535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16239126 - 16238816
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga--ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||   ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16239126 aatataatttggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgt 16239027  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgacc-ttttgga 206  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16239026 tgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgacctttttgga 16238927  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||    
T  16238926 gattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattattcctgaaatatgactaat 16238828  T
Q  307 gactattcatga 318  Q
    || | |||||||    
T  16238827 gattgttcatga 16238816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Original strand, 1659114 - 1659474
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1659114 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcacattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgt 1659213  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |||    | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1659214 tgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggag 1659309  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| ||||    
T  1659310 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatgaatg 1659402  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
      |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| ||||    
T  1659403 cttattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaacggataa-tgttcatatgattgatg 1659474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18740954 - 18740709
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  18740954 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattggtaactg 18740856  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattg 387  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18740855 ttcatgaaatgtgat-aatgattattcatgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttttgaattgataattgttcatatgattgatgattattg 18740757  T
Q  388 atgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18740756 atgtgagatatctggatgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 18740709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15861488 - 15861243
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15861488 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaaa-ttgtgattgttgtcgcattatcgagtctttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgtt 15861390  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    ||    |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15861389 gtaaaagaattcggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggaga 15861294  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861293 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 33315982 - 33316334
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  33315982 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 33316081  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||||||||||||||||| |     
T  33316082 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgtt 33316179  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  33316180 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 33316272  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt 367  Q
    |||| |||| |||||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33316273 atgattattgatgat-gttatgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgtt 33316334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 14628012 - 14628366
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  14628012 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 14628110  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  14628111 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 14628208  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  14628209 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 14628301  T
Q  305 atgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14628302 atgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 14628366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4989221 - 4989062
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4989221 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattg 4989122  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4989121 ttcatatgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 4989062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23976331 - 23975978
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| |||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  23976331 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgccgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 23976232  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  23976231 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23976134  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  23976133 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 23976041  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23976040 atgattattgatgat-gttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 23975978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18129045 - 18128725
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  18129045 aatataatcgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 18128946  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt----gttttatc--atcgaaggtga 194  Q
        ||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||    ||   |||  |||||||||||    
T  18128945 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcgaagattatgtaagacaggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagtggcatcgaatcgaaggtga 18128846  T
Q  195 cgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    ||| ||   || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||    
T  18128845 cgaactggaggtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatg--aaatgtgattggtgattgttcatga 18128748  T
Q  295 aatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||| | ||||||    
T  18128747 aatgtgattgatgattgttcatg 18128725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 426
Target Start/End: Original strand, 17343846 - 17344076
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||         
T  17343846 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtg----- 17343940  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattga 388  Q
      |||||||||| || |||| |||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||    
T  17343941 --atgaaatgtggttgatgattattaataatgattgtgattggtgaatgtgaatgaatatttgtgaattgatagttattcatatgattgatggttattga 17344038  T
Q  389 tgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    |||||||||| ||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  17344039 tgtgagatattggaatatgatgtatgtatcaatgtgtg 17344076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18775971 - 18775703
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||         
T  18775971 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcattatagttgtgttgaga 18775872  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatc-atcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  |  |||||||||||||||     
T  18775871 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtctttgttgtatcgaaggtgacgact 18775772  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttga 268  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18775771 ttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttga 18775703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31627199 - 31626911
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||        
T  31627199 aatataattggggattgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgag 31627100  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||| ||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  31627099 aatgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 31627000  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31626999 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 31626911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 361
Target Start/End: Original strand, 18004634 - 18004799
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  18004634 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattgtt 18004733  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 361  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||  |||    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18004734 cgtgaaatgtgattaacgattattcatg--aat----atttgtgattgtgaatgaatagttgtgaattgata 18004799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25174142 - 25173961
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25174142 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 25174043  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174042 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgacgtttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 25173961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4989659 - 4989386
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||| | ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4989659 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgt 4989560  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  4989559 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 4989462  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  4989461 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattg 4989386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16105319 - 16105056
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||        
T  16105319 aatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgtcgcgttatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcttgttgag 16105220  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  16105219 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 16105120  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    |||  ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16105119 cttgaggttatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtctt 16105056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 16827767 - 16827919
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16827767 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgactggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataactg 16827866  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16827867 ttcatatgattgatgattattgatgtgagataatggggtttgatgtaagtatt 16827919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 1651353 - 1651624
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgatt-gttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  1651353 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 1651451  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  1651452 gtaaaagagtccggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 1651547  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  1651548 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 1651624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Original strand, 16827279 - 16827550
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  16827279 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgct 16827378  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  16827379 gtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgttgggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 16827476  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgatt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  16827477 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtcttaaatgatgtatgtgatt 16827550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25173740 - 25173592
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||     
T  25173740 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaactgataattattcatatgatt 25173641  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25173640 gacaaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 25173592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Original strand, 25745821 - 25745974
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||| ||||||||||||  || |||||||    
T  25745821 gggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgagggtgacgaccttgaggtgatttgg 25745920  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25745921 taccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttg 25745974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 318
Target Start/End: Original strand, 13622781 - 13622910
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  13622781 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgatta 13622879  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13622880 ttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 13622910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23152018 - 23151846
Alignment:
Q  15 tataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg---------t 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||         |    
T  23152018 tataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattattgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgagatt 23151919  T
Q  106 gtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt 175  Q
    ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23151918 gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgt 23151846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 16650646 - 16650922
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  16650646 aatatacttgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgtattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 16650744  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  16650745 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16650843  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  16650844 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 16650922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22428813 - 22428673
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||    
T  22428813 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacat 22428714  T
Q  222 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22428713 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 22428673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 423
Target Start/End: Original strand, 27655662 - 27655899
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27655662 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 27655761  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattg-----tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcg 377  Q
    |       |||||||| ||| ||||| | || || || ||||     ||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| |    
T  27655762 g-------atgaaatgagatgaatgaatgttgataatgattgttcaatgattggtg-ttgtgaatgaatatttatgattgggtaattattcatgtgattg 27655853  T
Q  378 atgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgt 423  Q
    |||  | ||||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||    
T  27655854 atgtatgttgatatgagatatcgagttgtgatgtaagtatttatgt 27655899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 18825419 - 18825511
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  18825419 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 18825511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10487466 - 10487366
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  10487466 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 10487367  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  10487366 g 10487366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 16377861 - 16377961
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16377861 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 16377960  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  16377961 g 16377961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 16385185 - 16385285
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16385185 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 16385284  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  16385285 g 16385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 16557416 - 16557692
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  16557416 aatatacttgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgtattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 16557514  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  16557515 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16557613  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  16557614 gagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 16557692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26088596 - 26088321
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || |||||||   ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  26088596 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgttgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 26088498  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  26088497 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26088400  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  26088399 gagatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 26088321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 18843480 - 18843572
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  18843480 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttga-aaatgtgattggtg 18843572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16084177 - 16083975
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc-------- 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||            
T  16084177 aatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttttcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcttgttgag 16084078  T
Q  104 -gtgtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
      |||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  16084077 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 16083978  T
Q  199 ctt 201  Q
    |||    
T  16083977 ctt 16083975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 318
Target Start/End: Original strand, 35017302 - 35017429
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  35017302 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtggttgtt 35017400  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  35017401 cataaaatgtgattaatgattgttcatga 35017429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 22227260 - 22227354
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22227260 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 22227354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 29870886 - 29871151
Alignment:
Q  23 ggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagttgtg---ggg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || | |||    |||    
T  29870886 ggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgctgtaaaaggg 29870984  T
Q  118 ttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29870985 atga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggt 29871082  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  29871083 accgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 29871151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 35017085 - 35017179
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35017085 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 35017179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16230342 - 16230067
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  16230342 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 16230244  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  16230243 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16230146  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  16230145 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 16230067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 25646517 - 25646614
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25646517 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatttgattggtgattgt 25646614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18741203 - 18741119
Alignment:
Q  20 ttgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18741203 ttgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcg 18741119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 424
Target Start/End: Original strand, 18004807 - 18004972
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| |||    
T  18004807 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttg 18004906  T
Q  366 tt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    ||       |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  18004907 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtg 18004972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23993742 - 23993647
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  23993742 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 23993647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 16889270 - 16889390
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||   || |||| |||    
T  16889270 gggttgagcgattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtgttgatgcatcgaaggtgacgacctggaggtgattcggt 16889369  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16889370 accacatgcacttatgtgtca 16889390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 18004376 - 18004471
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18004376 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 18004471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 225
Target Start/End: Original strand, 17790666 - 17790776
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||    ||||||||||||||||||   || |||| |||    
T  17790666 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttatatacgatgtgttgatgcatcgaaggtgacgacctagaggtgattcggt 17790765  T
Q  215 accacatgcat 225  Q
    |||||||||||    
T  17790766 accacatgcat 17790776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18422304 - 18422207
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18422304 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtgattggtgattgt 18422207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 18383207 - 18383328
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  18383207 gggtttagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 18383306  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18383307 taccacatgcatttatgtgtca 18383328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33323458 - 33323337
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  33323458 gggttgagcttttttactacggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 33323359  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  33323358 taccaaatgcatttatgtgtca 33323337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1554110 - 1554035
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatat 398  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1554110 tgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcatatgatcgatgattattgatgtgagatat 1554035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18397687 - 18397592
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18397687 aatataattgggagttgccctatatattgtggtgaaaattgtagattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 18397592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18431394 - 18431299
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  18431394 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgtatcatagttgtgt 18431299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 417
Target Start/End: Original strand, 35017407 - 35017560
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt---- 367  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||        
T  35017407 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatg 35017506  T
Q  368 ---catgtgatcgatgattattgatgtgagata-tgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  35017507 acacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtat 35017560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 18088371 - 18088464
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  18088371 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 18088464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 18825162 - 18825256
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18825162 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgtttgttgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagttgtgt 18825256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18569347 - 18569283
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtc 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18569347 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtc 18569283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Original strand, 18843225 - 18843317
Alignment:
Q  15 tataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18843225 tataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgtttgtcgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 18843317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Original strand, 16642592 - 16642687
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  16642592 aaggtgacgacctggttgagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 16642687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22431008 - 22430925
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22431008 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtttaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcat 22430925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 25646230 - 25646325
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25646230 aataaaattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcaagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 25646325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19609002 - 19608909
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  19609002 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgtatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 19608909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 417
Target Start/End: Original strand, 18843671 - 18843817
Alignment:
Q  279 tggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       ||||    
T  18843671 tggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatg 18843770  T
Q  372 tgatcgatgattattgatgtgagata-tgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18843771 tgattgatgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtat 18843817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34965583 - 34965471
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  |||||||| ||| | |||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  34965583 ctcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 34965484  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  34965483 gcatatatgtgtc 34965471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Original strand, 14628375 - 14628483
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14628375 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 14628474  T
Q  416 attaatgtg 424  Q
    ||| |||||    
T  14628475 attgatgtg 14628483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18128646 - 18128584
Alignment:
Q  276 gattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18128646 gattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgattgt 18128584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 27655487 - 27655580
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||| |||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  27655487 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 27655580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 417
Target Start/End: Original strand, 18825606 - 18825756
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt------- 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||   | ||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||           
T  18825606 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgaca 18825705  T
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagata-tgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18825706 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtat 18825756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23975893 - 23975787
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23975893 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 23975794  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  23975793 tgatgtg 23975787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  219 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctta 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 33316422 - 33316528
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33316422 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 33316521  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  33316522 tgatgtg 33316528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Original strand, 35011130 - 35011232
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35011130 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagt 35011229  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  35011230 att 35011232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18775691 - 18775590
Alignment:
Q  324 gtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagta 416  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||       |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18775691 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtttatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagta 18775592  T
Q  417 tt 418  Q
    ||    
T  18775591 tt 18775590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 201
Target Start/End: Original strand, 35137473 - 35137560
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacctt 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  35137473 gggttgagctcttttactacgaagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctt 35137560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 17343686 - 17343772
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  17343686 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatca 17343772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10487640 - 10487548
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  10487640 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 10487548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 16377687 - 16377779
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  16377687 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 16377779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 16385011 - 16385103
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  16385011 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 16385103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22846768 - 22846613
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatg--tgttttat---catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtac 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||   ||||||     |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22846768 gctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatcgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgcggtgatttggtac 22846669  T
Q  217 cacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---taacatgagtcttatttg 267  Q
     |||||||| ||||||||  | || ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  22846668 tacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 22846613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Original strand, 16827717 - 16827789
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  16827717 tgatacatgtaattggtaattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgatacatgtaattggtgattgt 16827789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 18088114 - 18088206
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| |||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18088114 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 18088206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 15736584 - 15736679
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||| |||  |||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15736584 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtccgtgtacatgtccatgcataatagttgtgt 15736679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16134917 - 16134814
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  16134917 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgaagaccttgaggtgatttggtaccacat 16134818  T
Q  222 gcat 225  Q
    ||||    
T  16134817 gcat 16134814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 32897484 - 32897389
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32897484 aataaaattgagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccgtgcatcatagttgtgt 32897389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18128576 - 18128424
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| |||||   || | |||||||||  |||||||||  |||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  18128576 atgtgattgatgattgttcatggaatatgattggggattgttcatgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatg 18128477  T
Q  372 -------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
           |||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18128476 acacatatgattggagattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 18128424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19627682 - 19627582
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19627682 tgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgatgtaagtat 19627583  T
Q  418 t 418  Q
    |    
T  19627582 t 19627582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 418
Target Start/End: Original strand, 13622888 - 13623040
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgacta-ttcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat 370  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| |  ||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  13622888 atgtgattaatgattgttcatgaaatgtgattggtgatttgttcatgaaa--tgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcat 13622985  T
Q  371 g-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |       |||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13622986 gacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 13623040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23151839 - 23151790
Alignment:
Q  369 atgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23151839 atgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 23151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19609258 - 19609167
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  19609258 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtcgatgcatcatagtcg 19609167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19852908 - 19852796
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||  | ||||   ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  19852908 ctcttttatttcgatgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 19852809  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  19852808 gcatatatgtgtc 19852796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 28196185 - 28196281
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| | |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28196185 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggagtgttgtcgcattatcgagtctttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 28196281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 13016188 - 13016283
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||| | | | |||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13016188 aatataattggatatagacctatatattgaggtgaaaattatggattgtagtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtagtgt 13016283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18128606 - 18128555
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  18128606 tgataaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattgatgattgttcatg 18128555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23975976 - 23975925
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  23975976 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 23975925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18128698 - 18128652
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  18128698 atgtgattggtgattgttcatgaattgtgattaatgattgttcatga 18128652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18578968 - 18578918
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18578968 catgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 18578918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19627756 - 19627714
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19627756 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 19627714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Original strand, 22227043 - 22227133
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagt 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    | |||||| |||||||||  ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  22227043 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattttcgagtccttatacatgtccatgcatcatagt 22227133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Original strand, 35011058 - 35011100
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35011058 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 35011100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18579095 - 18579050
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  18579095 atgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 18579050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 336
Target Start/End: Original strand, 25369034 - 25369164
Alignment:
Q  211 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatg---aaatgtgattaa 305  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| || |||| ||||   |||||||||| |    
T  25369034 tggtaccacatgcatatatgcgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgaataaatgtgattga 25369133  T
Q  306 tgactattcatgataattgtgattggcgatt 336  Q
    ||| | ||||||| | |||||||||| ||||    
T  25369134 tgattgttcatgacacttgtgattggtgatt 25369164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16238764 - 16238716
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16238764 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 16238716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Original strand, 197508 - 197917
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  197508 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgtatcatagttgtgtagttg 197607  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197608 taaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtcttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 197707  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgac 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||     
T  197708 ttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtgattaatgat 197800  T
Q  310 tattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgat 409  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  197801 tatccatgataaatgtgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaatcgataattgttcatataattgatgagtattgatgtgaaatatcggggtgtgat 197900  T
Q  410 gtaagtattaatgtgtg 426  Q
    |||||||||||||||||    
T  197901 gtaagtattaatgtgtg 197917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26193 - 26081
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||  | ||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26193 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacctttaggtgatttggtaccacat 26094  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  26093 gcatatatgtgtc 26081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 85055 - 84943
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  85055 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 84956  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  84955 gcatatatgtgtc 84943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 109)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 32495961 - 32496389
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32495961 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 32496060  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32496061 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaacgcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 32496160  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32496161 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaat 32496260  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcga-tgattattgatgtgagatatgggggtg 405  Q
    || |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||    
T  32496261 gattattcatgataaatgtgattggtgtttgtg-atgaataattatgaattgataattgttcatatgattgattgattattgatgtgagatatcggagtg 32496359  T
Q  406 tgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  32496360 tgatgtaagtatttatgtgtgattattatt 32496389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 15761776 - 15762095
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15761776 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaa-ttgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 15761874  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15761875 taaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 15761974  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgac 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||| |||||  |||     
T  15761975 ttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgattattcatggaatatgattggtgat 15762074  T
Q  310 tattcatgataattgtgattg 330  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  15762075 tattcatgataaatgtgattg 15762095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Original strand, 18255227 - 18255638
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18255227 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgttgtt 18255326  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  18255327 gtaaaagggctaagcgcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 18255426  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||  ||||    
T  18255427 gatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgtg-gtaat 18255518  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||| |||||||||| ||  | |    
T  18255519 gattattaataatgattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattattcatataattgatggttattggtgtgagatattggaatat 18255618  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18255619 gatgtaagtatcaatgtgtg 18255638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3058805 - 3058582
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058805 aatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 3058706  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058705 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatataaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 3058606  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3058605 ttggtaccacatgcatttatgtgt 3058582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 207 - 435
Target Start/End: Original strand, 11582551 - 11582778
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11582551 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaat 11582649  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11582650 gattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtccatgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgt 11582749  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11582750 gatgtaagtattaatgtgtgattattatt 11582778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 208 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122841
Alignment:
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatg 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggggattgttcatgaaatgtgagtaatg 122960  T
Q  308 actattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtg 407  Q
    | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  122959 attattcatgataaatgtaattggtgattgtgaattaatagttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtg 122860  T
Q  408 atgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  122859 atgtaattattaatgtgtg 122841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 1938177 - 1938441
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         
T  1938177 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattga-attgttgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcttgttgaga 1938275  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgacct 200  Q
        ||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1938276 ttgtagttgtaaaagagttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcaaaggtgacgacct 1938375  T
Q  201 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttattt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1938376 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattt 1938441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 369645 - 369221
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  369645 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 369546  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||| ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  369545 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 369448  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  369447 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgttcatgaaatatgatta 369348  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagata 397  Q
    |||| ||||||||||   | ||||||   |||||| |||||||  ||||||||||||||||||       |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  369347 atgattattcatgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtgatgattgatgtgagata 369248  T
Q  398 tgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  369247 ttggggtttgatgtaagtattgatgtg 369221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 228 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3055253 - 3055053
Alignment:
Q  228 atgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga-taattgtg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  3055253 atgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgttcataaaatgtgactaatgactattcatgaatatttgtg 3055154  T
Q  327 attggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3055153 attggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatataattattaatgtgtg 3055054  T
Q  427 g 427  Q
    |    
T  3055053 g 3055053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 207 - 426
Target Start/End: Original strand, 13038825 - 13039043
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13038825 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttatt-gatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaat 13038923  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || | ||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13038924 gattgttcatgacaaatgtgatcggtgattgtgaatgaacatttgtgaattgataattgttcatatgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgt 13039023  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13039024 gatgtaagtattaatgtgtg 13039043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 125584 - 125378
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125584 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 125485  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  125484 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtaaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggag 125385  T
Q  208 atttggt 214  Q
    |||||||    
T  125384 atttggt 125378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2436383 - 2436112
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2436383 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgt 2436284  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |||    | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  2436283 tgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgtgatgtgttttatcatcaaaggtgacgacctttttgag 2436188  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  2436187 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 2436112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16210282 - 16210047
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  16210282 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcatt-gatatatgtgatttgtgattg 16210184  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattg 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||     
T  16210183 ttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaata-ttgtgaattggtaattgttcatatgtttaatgattatta 16210085  T
Q  388 atgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  16210084 atgtgagatattgtggtgagatgtaagtattgatgtgt 16210047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2027315 - 2027095
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaatt-gtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2027315 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaatttgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccacgcatcatagtcgtgtagtt 2027216  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt--gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||| |  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  2027215 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcggaggtgacgaccttttcga 2027116  T
Q  207 gatttggtaccacatgcattt 227  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2027115 gatttggtaccacatgcattt 2027095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3893853 - 3893586
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  3893853 aatataaatgggtgttgtcatatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 3893754  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  3893753 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 3893654  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3893653 ttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 3893586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 112703 - 112988
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||         
T  112703 aatataattgggtgatgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcgtgttgaga 112802  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac- 198  Q
        ||||||    || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||     
T  112803 ttgtagttgtaaaaggattgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacg 112902  T
Q  199 --cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
      |||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  112903 accttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga-aaatgtgattggtg 112988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 26071671 - 26071959
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||        
T  26071671 aatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgttgag 26071770  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26071771 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 26071870  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||  || |||  | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26071871 cttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 26071959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 26095458 - 26095746
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||        
T  26095458 aatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgttgag 26095557  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26095558 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 26095657  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||  || |||  | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26095658 cttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 26095746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16417051 - 16416870
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16417051 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggt 16416952  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16416951 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 16416870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 368
Target Start/End: Original strand, 16480587 - 16480760
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||         
T  16480587 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtg----- 16480681  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
      |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16480682 --atgaaatgagatgaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttc 16480760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 368
Target Start/End: Original strand, 2192357 - 2192530
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||         
T  2192357 ggtgacgacctttttggaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtg----- 2192451  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
      |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2192452 --atgaaatgagatgaatgactattcatgaatatttgttattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttc 2192530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16416732 - 16416583
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga-taattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgat 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16416732 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgaataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgat 16416633  T
Q  376 cgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
     || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16416632 tgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 16416583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Original strand, 15952499 - 15952772
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15952499 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgt 15952598  T
Q  111 tgtgg--ggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttgg 205  Q
    |||    |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||| |||||||||||| | |    
T  15952599 tgtaaaaggttgaactcttttactttg-agattattgtaaggcagatgtgagcccttacatttgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttg 15952697  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattgg 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15952698 agacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga-aaatgtgattgg 15952772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 45453662 - 45453929
Alignment:
Q  13 aatataattgggt-gttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt--- 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||       
T  45453662 aatataattgggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcatgttga 45453761  T
Q  108 ------agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgac 198  Q
          ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||| |  ||   |||||||||||| |||    
T  45453762 gattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgattttgttg--catcgaaggtgatgac 45453859  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttga 268  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45453860 cttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 45453929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12753605 - 12753356
Alignment:
Q  48 aaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---------agttgtg---gggttgagctcttttacttc 134  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||         ||||||    ||||||| ||||||||||||    
T  12753605 aaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttc 12753506  T
Q  135 ggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgt 233  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12753505 ggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgt 12753406  T
Q  234 caataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   | ||||||||||||    
T  12753405 caataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattggtg 12753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36051166 - 36051034
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  36051166 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgactg 36051068  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataa 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36051067 ttcatgaaatgtgattaatgattattcacgataa 36051034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10988370 - 10988095
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  10988370 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 10988272  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  10988271 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 10988174  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10988173 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 10988095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 26010596 - 26010872
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  26010596 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 26010694  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  26010695 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26010793  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  26010794 gagatttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 26010872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13757338 - 13757062
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  13757338 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 13757239  T
Q  111 tgtgg---ggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||     || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  13757238 tgtaaaatggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 13757141  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  13757140 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 13757062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Original strand, 13867687 - 13867799
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13867687 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtggttggtgattgtt 13867785  T
Q  290 catgaaatgtgatt 303  Q
    ||||||||||||||    
T  13867786 catgaaatgtgatt 13867799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7821508 - 7821408
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7821508 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 7821409  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  7821408 g 7821408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7828819 - 7828719
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7828819 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 7828720  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  7828719 g 7828719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 27103126 - 27103226
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  27103126 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 27103225  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  27103226 g 27103226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 27110474 - 27110574
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  27110474 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 27110573  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  27110574 g 27110574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27175200 - 27175100
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  27175200 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 27175101  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  27175100 g 27175100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 38785218 - 38785318
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  38785218 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 38785317  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  38785318 g 38785318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Original strand, 15518442 - 15518537
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15518442 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 15518537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 15442964 - 15443238
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  15442964 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 15443063  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  15443064 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 15443160  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  15443161 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 15443238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7291611 - 7291517
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7291611 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 7291517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 318
Target Start/End: Original strand, 12545402 - 12545531
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagattt-ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  12545402 aggtgacgaccttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttatt-gataaatgtggttggtgattg 12545500  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12545501 ttcatgaaatgtgattaatgactgttcatga 12545531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 15913955 - 15914076
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  15913955 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 15914054  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  15914055 taccacatgcatttatgcgtca 15914076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 25293683 - 25293958
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  25293683 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 25293781  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  25293782 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 25293879  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  25293880 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 25293958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7291353 - 7291274
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttga 268  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7291353 aggtggcggccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 7291274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Original strand, 9058155 - 9058313
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  9058155 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgg 9058254  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---taacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  9058255 taccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 9058313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 13912518 - 13912790
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  13912518 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattatacatgtccatgcatcatagtcggtgttgc 13912616  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  13912617 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 13912714  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13912715 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13912790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11514706 - 11514606
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  11514706 catcggaggtgacgaccttgtagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggt 11514607  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  11514606 g 11514606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 30263703 - 30263803
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  30263703 catcggaggtgacaaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 30263802  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  30263803 g 30263803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 2192102 - 2192193
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  2192102 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgctgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 2192193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 18981568 - 18981662
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  18981568 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 18981662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13376315 - 13376195
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  13376315 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgg-tgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 13376217  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13376216 taccatatgcatttatgtgtca 13376195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13388609 - 13388488
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  13388609 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaatacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttctgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 13388510  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13388509 taccacatgcatttatgtgtca 13388488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 42057568 - 42057819
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  42057568 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 42057666  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  42057667 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 42057764  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42057765 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 12545118 - 12545213
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12545118 aatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 12545213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 44864001 - 44863906
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  44864001 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtatatgtccatgcatcatagtcgtgt 44863906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7291142 - 7290992
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt------- 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||           
T  7291142 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcttgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgaca 7291043  T
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  7291042 catgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttgatgtaagtatt 7290992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 142385 - 142290
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  142385 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagccgtgt 142290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 13867480 - 13867575
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13867480 aatataattgggtgttgttctatatattgaagtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 13867575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 398
Target Start/End: Original strand, 15762265 - 15762340
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatat 398  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15762265 tgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcatatgatcgatgattattgatgtgagatat 15762340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 47288533 - 47288438
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47288533 aatataattgggtgttgtcctatattttgaggtgaaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 47288438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11285698 - 11285613
Alignment:
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  11285698 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtgattaatgattgttcatga 11285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15925869 - 15925776
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  15925869 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 15925776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44863712 - 44863615
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  44863712 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtgattggtgattgt 44863615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 18305591 - 18305750
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  18305591 tgataaatgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattgacgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttg 18305690  T
Q  366 tt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  18305691 ttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttggtgtaagtatt 18305750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 142137 - 142046
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  142137 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtgattggt 142046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 15823816 - 15823911
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15823816 aatataattgggtgttgtcctttatattgaggtgaagattgttaattgttgtcgcattatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 15823911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 283
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824195
Alignment:
Q  192 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtgtttggtg 15824195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Original strand, 18305492 - 18305568
Alignment:
Q  240 gtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18305492 gtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtggttggtgattgtttatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 18305568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47288228 - 47288148
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  47288228 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtaattggtgattgt 47288148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2024953 - 2024905
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2024953 tgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 2024905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 11582246 - 11582338
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  11582246 aatataattgagtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtctttatacatgtccatgcatcatagtcg 11582338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15926126 - 15926034
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15926126 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 15926034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 15952764 - 15952812
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952764 tgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 15952812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 36051423 - 36051331
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  36051423 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 36051331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 15525889 - 15526057
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||| || ||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  15525889 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaatcgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 15525988  T
Q  111 tgt---ggggttgagctcttttacttcggagatta-tgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtg 176  Q
    |||     |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  15525989 tgtaaaaaggttaaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtg 15526057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 8565109 - 8565221
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8565109 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgt-ttttattgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 8565207  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||| ||||    
T  8565208 tgcatatatttgtc 8565221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 2192615 - 2192721
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2192615 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 2192714  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  2192715 tgatgtg 2192721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Original strand, 7286160 - 7286226
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  7286160 atgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgt 7286226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 9322595 - 9322727
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  9322595 ctcttttacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacat 9322694  T
Q  222 gcatttatgtgtc---aataagtgcatatcata 251  Q
    |||| ||||||||   | |||||||||||||||    
T  9322695 gcatatatgtgtccggattaagtgcatatcata 9322727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7821682 - 7821590
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  7821682 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 7821590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7828993 - 7828901
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  7828993 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 7828901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 27102952 - 27103044
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  27102952 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 27103044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 27110300 - 27110392
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  27110300 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 27110392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27175374 - 27175282
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  27175374 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 27175282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 38785044 - 38785136
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  38785044 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 38785136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2025002 - 2024958
Alignment:
Q  223 catttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2025002 catttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttg 2024958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16210539 - 16210447
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16210539 aatataattaggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 16210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 16480341 - 16480432
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16480341 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 16480432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 424
Target Start/End: Original strand, 16480895 - 16480951
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  16480895 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtg 16480951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 18981312 - 18981403
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18981312 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 18981403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 20587141 - 20587253
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||    |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  20587141 ctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 20587240  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  20587241 gcatatatgtgtc 20587253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Original strand, 26071944 - 26072046
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt-gtgatgtaag 414  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  26071944 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaag 26072043  T
Q  415 tat 417  Q
    |||    
T  26072044 tat 26072046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Original strand, 26095731 - 26095833
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt-gtgatgtaag 414  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  26095731 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaag 26095830  T
Q  415 tat 417  Q
    |||    
T  26095831 tat 26095833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11285969 - 11285878
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||| ||||  ||| |||| || |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11285969 aatatatttggaagttctcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 11285878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 12249519 - 12249610
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12249519 aatatatttggtagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 12249610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 418
Target Start/End: Original strand, 14253046 - 14253179
Alignment:
Q  291 atgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt------catgtgatcgatgatta 384  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||       |||||||| | | ||||    
T  14253046 atgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtcatgacacatgtgattggttatta 14253145  T
Q  385 ttgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14253146 ttgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 14253179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 418
Target Start/End: Original strand, 15952868 - 15952968
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15952868 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 15952967  T
Q  418 t 418  Q
    |    
T  15952968 t 15952968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 371
Target Start/End: Original strand, 12545523 - 12545608
Alignment:
Q  286 tgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||||||||||| ||||| | || | |||||||||  || |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12545523 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgggattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 12545608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 417
Target Start/End: Original strand, 15824237 - 15824286
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15824237 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 15824286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44863630 - 44863582
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44863630 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatg 44863582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 142055 - 141954
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgt-------gatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||        ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  142055 tgtgattggttattgtgtatgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 141956  T
Q  416 at 417  Q
    ||    
T  141955 at 141954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 2192532 - 2192583
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  2192532 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 2192583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4483320 - 4483269
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4483320 catcgaaggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 4483269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11285615 - 11285564
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11285615 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatg 11285564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Original strand, 13912842 - 13912925
Alignment:
Q  335 ttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| ||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||||||||    
T  13912842 ttgtgaatgaatatttatgattgggtaattattcatgtgattgatgtatgttgatatgagatatcgagttgtgatgtaagtatt 13912925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 45453929 - 45453980
Alignment:
Q  320 aattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  45453929 aattgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatg 45453980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Original strand, 13867792 - 13867849
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgatt 329  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  13867792 atgtgattgctgattgttcatgaaatatgattgatgattgttcatgataaatgtgatt 13867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 371
Target Start/End: Original strand, 13867836 - 13867941
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||| |||    
T  13867836 tgataaatgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttg 13867935  T
Q  366 ttcatg 371  Q
    ||||||    
T  13867936 ttcatg 13867941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 15518586 - 15518674
Alignment:
Q  335 ttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgt 423  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||  | ||||| |||| |||   | ||||||||||||||| ||||    
T  15518586 ttgtgaatgaatatttatgattggataattattcatgtgattgatgtatgttgatatgagctatcaagttgtgatgtaagtatttatgt 15518674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47288159 - 47288115
Alignment:
Q  327 attggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47288159 attggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatg 47288115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Original strand, 11440 - 11854
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11440 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgttgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 11539  T
Q  113 tgg--ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagatt 210  Q
    |    || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11540 taaaagggtg-gttcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagatt 11638  T
Q  211 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgact 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |    
T  11639 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgattgttcatgaaaggtgattaatggtt 11738  T
Q  311 attcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatg 410  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  11739 attcatgataaatgtaattggtgattgcgaatgaatagttgtgcattgataattgctcatgtgattgatgattattgatgagaaatattggggtgtgatg 11838  T
Q  411 taagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||| ||||||    
T  11839 taagtattattgtgtg 11854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 87)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 37845875 - 37846304
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||         
T  37845875 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcatgttgaaa 37845974  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37845975 ttgtagttgtaaaagggctgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttgattcatcgaaggtgacgacc 37846074  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37846075 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgt 37846173  T
Q  300 gattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatg 399  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||     
T  37846174 gattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaata-----aaattgataattgttcatatgattgatgatcattgatgtgagatatt 37846268  T
Q  400 ggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37846269 ggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggttattatt 37846304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 44036309 - 44036730
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44036309 aatataattgggtgttgtcctatacattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtctatgcatcatagtcgtgtagttg 44036408  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||   ||| |  ||||  ||||||||||||||||||    
T  44036409 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgaccttttgga 44036508  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  44036509 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtgattaat 44036601  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44036602 gattattcatgatgaatgtaattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatatgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgt 44036701  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||    
T  44036702 gatgtaagtatttatatgtgattattatt 44036730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20444500 - 20444067
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||  || | | |||||||||||||||||||||||||||         
T  20444500 aatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattatgattgttgtcgcattataaag-cttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 20444402  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20444401 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttgattcatcgaaggtgacgacc 20444302  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20444301 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgt 20444203  T
Q  300 gattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatg 399  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||     
T  20444202 gattaatgattattcatgataaatgtgattggtgactatgaatgaataattgtgaattgataattgttcatataattaatgattattgatgtgagatatt 20444103  T
Q  400 ggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20444102 ggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggttattatt 20444067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20930227 - 20929807
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20930227 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgttg 20930128  T
Q  113 tgg---ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  20930127 taaaatggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttacatcggaggtgacgaccttttgga 20930028  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||||||||    
T  20930027 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtga-------ttgtccatgaaatgtgattaat 20929936  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |  |||    
T  20929935 gattattcatgaaaaatgtgattggtgattttgaatgaatatttgttaattgataattgttcatatgattgatgaatattgatgtgagatatcagaatgt 20929836  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||| |||||||| | ||||| | ||||||    
T  20929835 gatttaagtatttaagtgtgattattatt 20929807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22352882 - 22352520
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| | ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22352882 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgttgtttgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgttgtt 22352783  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  22352782 gtaaaagggttgagctctcttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 22352683  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22352682 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaat 22352583  T
Q  307 gactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22352582 gactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 22352520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22226735 - 22226328
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22226735 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 22226636  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22226635 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggaga 22226536  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatga 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| ||| |||||    
T  22226535 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatga 22226443  T
Q  309 ctattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtga 408  Q
     |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||| |||   | |||||    
T  22226442 ttattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgattgatgtatgttgatatgagctatcaagttgtga 22226343  T
Q  409 tgtaagtattaatgt 423  Q
    |||||||||| ||||    
T  22226342 tgtaagtatttatgt 22226328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22365253 - 22365007
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  22365253 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 22365154  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattga 388  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22365153 cgtgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtgaattgataactgttcatgtgatggatgattattga 22365054  T
Q  389 tgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22365053 cgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 22365007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20530265 - 20529948
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||  || | | |||||||||||||||||||||||||||         
T  20530265 aatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattatgattgttgtcgcattataaag-cttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 20530167  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgtttta-tcatcgaa-ggtgacgac 198  Q
        ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  20530166 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttgattcatcgaagggggacgac 20530067  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatg 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20530066 gttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatg 20529968  T
Q  299 tgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  20529967 tgattaatgattgttcatga 20529948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 15862841 - 15863095
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15862841 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgtt 15862940  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    ||    | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15862941 gtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggaga 15863036  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15863037 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 15863095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21858054 - 21857815
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || | ||      
T  21858054 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gacatatgtgactgttttt-- 21857958  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattg 387  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21857957 -----gaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattatgaatgaatatttgtgcattgataattgttcacatgattgatgattattg 21857863  T
Q  388 atgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21857862 atgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 21857815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 435
Target Start/End: Original strand, 15863275 - 15863444
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15863275 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattg 15863374  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15863375 ttcatatgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 15863444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35053596 - 35053329
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  35053596 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattattgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 35053497  T
Q  108 ----agttgtgg---ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        |||||| |   |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  35053496 ttgtagttgtagaagggttgaactcttttacttatgagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 35053397  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35053396 ttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 35053329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41218207 - 41217889
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||         
T  41218207 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttgcatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 41218108  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  41218107 ttgtagttgtaaaagggttgaactattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 41218008  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    ||  || |||  ||||||||||| || ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||   | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41218007 ttgaggtgatccggtaccacatgtatatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattggtgattgttcatgaaatgt 41217908  T
Q  300 gattaatgactattcatga 318  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  41217907 gattaatgattgttcatga 41217889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17147536 - 17147179
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  17147536 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 17147437  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  17147436 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 17147339  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| |    
T  17147338 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatga 17147246  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||| |||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147245 atgattattgatgatgtgtgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 17147179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 5676010 - 5676277
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||         
T  5676010 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcgtgttgaga 5676109  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | ||| |||||||||||||    
T  5676110 ttgtagttgtaaaagggttgaactctcttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgacc 5676209  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5676210 ttgaggtgatacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 5676277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22352518 - 22352349
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22352518 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattgatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgaaaattg 22352419  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  22352418 ttcatatgattgatgaatattgatatgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgcgtgattattatt 22352349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 272 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20529970 - 20529807
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20529970 atgtgattaatgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgactatgaatgaataattgtgaattgataattgttcata 20529871  T
Q  372 tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20529870 taattaatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggttattatt 20529807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 207 - 367
Target Start/End: Original strand, 20895406 - 20895565
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20895406 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaat 20895504  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt 367  Q
    || | |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  | |||||||||| |||||    
T  20895505 gattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtt 20895565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17147042 - 17146894
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  17147042 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgatatacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 17146943  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17146942 gacgaatattgatgtgaaatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 17146894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45050437 - 45050166
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgatt-gttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  45050437 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 45050339  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| |||||| |||||||||||    
T  45050338 gtaaaagagtccggctcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgatgaccttttgga 45050243  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  45050242 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 45050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 7642001 - 7642268
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    |     
T  7642001 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgt----tg 7642095  T
Q  112 gtggggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 208  Q
     || || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  7642096 ttgcggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 7642193  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  7642194 tttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtg 7642268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 35935158 - 35935239
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35935158 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 35935239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22034602 - 22034327
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  22034602 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 22034504  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  22034503 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22034406  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  22034405 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 22034327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17003404 - 17003304
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  17003404 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 17003305  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  17003304 g 17003304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51451366 - 51451092
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  51451366 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 51451267  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  51451266 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 51451170  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  51451169 agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 51451092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 297
Target Start/End: Original strand, 9785898 - 9786004
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  9785898 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgtt 9785996  T
Q  290 catgaaat 297  Q
    ||||||||    
T  9785997 catgaaat 9786004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20526872 - 20526708
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-------- 104  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||            
T  20526872 aatataactgggtggtgtcctatatattgtggagaaagttgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 20526773  T
Q  105 -tgtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaccctta 165  Q
     |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20526772 ttgtagttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgaatgtgaaccctta 20526708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 22250620 - 22250698
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22250620 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttg 22250698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21858310 - 21858217
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21858310 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgttgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtg 21858217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 20826632 - 20826907
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  20826632 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 20826730  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  20826731 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 20826828  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  20826829 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 20826907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41393031 - 41392931
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  41393031 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 41392932  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  41392931 g 41392931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22250363 - 22250457
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22250363 aatataattgggtgtagtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22250457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 38035144 - 38035264
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||  || |||| ||    
T  38035144 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgattcgg 38035243  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38035244 taccacatgcatttatgtgtc 38035264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 2422380 - 2422475
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2422380 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaagttgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 2422475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 9785643 - 9785737
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||    
T  9785643 aatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgtcacatgtccatacatcatagtcgtgt 9785737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 21651601 - 21651695
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  21651601 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 21651695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49966152 - 49966055
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49966152 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 49966055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 13378284 - 13378405
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  13378284 gggttaagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 13378383  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  13378384 taccacatgcatttaggtgtca 13378405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 236
Target Start/End: Original strand, 37235485 - 37235606
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  37235485 ggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggt 37235584  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtcaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  37235585 accacatgcatatatgtgtcaa 37235606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18506111 - 18506016
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18506111 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagttgtgt 18506016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22407604 - 22407699
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22407604 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatccagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22407699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 22407893 - 22407990
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22407893 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 22407990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 18602454 - 18602706
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  18602454 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 18602552  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    |||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  18602553 tgtaaaagggacga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 18602650  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtc 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18602651 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 18602706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19601824 - 19601703
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  19601824 gggttgagctcttttacttcgttgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 19601725  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19601724 taccacatgcatttatatgtca 19601703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Original strand, 5073891 - 5073963
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtc 260  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5073891 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 5073963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505720
Alignment:
Q  336 tgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatttgggtgtgatgtaagtattaatatgtg 18505720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Original strand, 36357862 - 36357981
Alignment:
Q  117 gttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggta 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||| ||||||||||  || |||| ||||    
T  36357862 gttgagctcttttacttcagagattatgtaagactggagtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgattcggta 36357961  T
Q  216 ccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36357962 ccacatgcatttatgtgtca 36357981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 41210800 - 41210705
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41210800 aatataattaggtgttgtcctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 41210705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 49966403 - 49966308
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49966403 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtagtgt 49966308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 2422732 - 2422829
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  2422732 ggtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgattgt 2422829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21193803 - 21193689
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  21193803 gctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgatttggtaccaca 21193704  T
Q  221 tgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||| |||||||||    
T  21193703 tgcatatatgtgtca 21193689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21716960 - 21716868
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  21716960 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcttgttgcatgtccatgcatcatagtcg 21716868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 35523829 - 35523921
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  35523829 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcttgttgcatgtccatgcatcatagtcg 35523921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29137381 - 29137299
Alignment:
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  29137381 ttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 29137299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Original strand, 20956625 - 20956777
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgttt 286  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| || ||    
T  20956625 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 20956724  T
Q  287 gttcatga--aatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattg 337  Q
    ||||||||  | ||||||| |||| | |||||||||  ||||||||| |||||    
T  20956725 gttcatgattattgtgattgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattg 20956777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Original strand, 22836909 - 22837060
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgttt 286  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || ||    
T  22836909 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtgattgatgatt 22837007  T
Q  287 gttcatg--aaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattg 337  Q
    |||||||  |||||||||| | || | ||||||| |  ||||||||| |||||    
T  22837008 gttcatgataaatgtgattgaagattgttcatgacacatgtgattggtgattg 22837060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 15863100 - 15863148
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15863100 tgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 15863148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22365509 - 22365417
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22365509 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 22365417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Original strand, 2422814 - 2422915
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2422814 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 2422913  T
Q  416 at 417  Q
    ||    
T  2422914 at 2422915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Original strand, 5769745 - 5769856
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5769745 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 5769844  T
Q  222 gcatttatgtgt 233  Q
    |||| |||||||    
T  5769845 gcatatatgtgt 5769856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 20895101 - 20895196
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20895101 aatataattgtgtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtggcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 20895196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27673336 - 27673251
Alignment:
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  27673336 ttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtc-tatttgataaatgtgattgatgattgttcatga 27673251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Original strand, 5676350 - 5676450
Alignment:
Q  324 gtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagta 416  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5676350 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagta 5676449  T
Q  417 t 417  Q
    |    
T  5676450 t 5676450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22144922 - 22145035
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||   ||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22144922 gctcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaattttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 22145021  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  22145022 tgcatatatgtgtc 22145035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41217783 - 41217644
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt---- 367  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||        
T  41217783 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 41217684  T
Q  368 ---catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
       |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  41217683 acacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggt 41217644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 21651345 - 21651436
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21651345 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgtattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 21651436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 22250703 - 22250751
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22250703 tgtgattggagactgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 22250751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 8539489 - 8539584
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtac 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  8539489 gctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8539584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 8604728 - 8604823
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtac 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  8604728 gctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41217911 - 41217812
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  41217911 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatg 41217812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17003578 - 17003486
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  17003578 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 17003486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 18061018 - 18061109
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18061018 aatataattgggtgtagtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 18061109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20252528 - 20252426
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||       |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20252528 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagt 20252429  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  20252428 att 20252426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Original strand, 20589796 - 20589868
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  20589796 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatggtaaatgtggttggtgattgt 20589868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20821589 - 20821477
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  20821589 ctcttttacttcggcgataatgtaagacgggcgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgataccacat 20821490  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  20821489 gcatatatgtgtc 20821477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 5471914 - 5472027
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatg----tgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtacca 218  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||    ||||  ||||| |  ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  5471914 ctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgg--ggtgacgaccttgaggtgatttggtacca 5472011  T
Q  219 catgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5472012 catgcatatatgtgtc 5472027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 107
Target Start/End: Original strand, 2422531 - 2422581
Alignment:
Q  57 ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2422531 ttgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 2422581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Original strand, 20589752 - 20589818
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  20589752 atgtggttggtgattgttcatgaaatgtgactaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgt 20589818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 41213198 - 41213310
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatc--atcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||   |||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  41213198 ctcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatat-ttttattgtatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 41213296  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  41213297 tgcatatatgtgtc 41213310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41217807 - 41217761
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41217807 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 41217761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20252603 - 20252558
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20252603 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 20252558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41393205 - 41393113
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||  | | |||||| |||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  41393205 aatataattgggtgttgtcctatatactgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 41393113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22029440 - 22029358
Alignment:
Q  23 ggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22029440 ggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgt 22029358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41210544 - 41210509
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41210544 ggtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcat 41210509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18505856 - 18505814
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtg 232  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18505856 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtg 18505814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 329
Target Start/End: Original strand, 9786016 - 9786060
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgatt 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  9786016 ttgttcatgaattgtgattaatgattgttcatgataaatgtgatt 9786060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 51657788 - 51657828
Alignment:
Q  67 attatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  51657788 attatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 51657828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 98)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22282874 - 22282469
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22282874 aatataattaggtgctgtcctatatattatggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 22282775  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  22282774 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 22282675  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  22282674 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtgattaat 22282582  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||||||||||| |||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22282581 gattattcatgataaatgt-------gattgtgaacgaatatttgtgaattgataattgttcatatgattgatgagtattgatgtgaaatatcggggtgt 22282489  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22282488 gatgtaagtattaatgtgtg 22282469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22273641 - 22273236
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22273641 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtatagttg 22273542  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  22273541 taaaagagttgagctcttttacttaagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 22273442  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  22273441 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtgattaat 22273349  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||||||||||| |||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | || ||| |||    
T  22273348 gattattcatgataaatgt-------gattgtgaacgaatatttgtgaattgataattgttcatatgattgatgagtattgatgtgaaacatcgggatgt 22273256  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22273255 gatgtaagtattaatgtgtg 22273236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 187 - 428
Target Start/End: Original strand, 20629013 - 20629254
Alignment:
Q  187 gaaggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtt 285  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20629013 gaaggtgacgatctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttatt-gatatatgtgattggtgat 20629111  T
Q  286 tgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20629112 tgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgtgattgataattat 20629211  T
Q  386 tgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggt 428  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629212 tgatgtgagataatggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggt 20629254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 43644379 - 43644657
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43644379 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagttttgttacaagtccatgcatcatagtcgtgtagttg 43644478  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgtttta-tcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43644479 taaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtgaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgcttgattcaacgaaggtgacgatcttttggaga 43644578  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  43644579 tttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtgattggtgattgt 43644657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Original strand, 9654488 - 9654734
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  9654488 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgactg 9654586  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattg 387  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9654587 ttcatgaaatgttattaatgattattcatgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatatgattgatgattattg 9654686  T
Q  388 atgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  9654687 atgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatatgtgattattatt 9654734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22697675 - 22697327
Alignment:
Q  31 cctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttgtg---gggttgagctct 126  Q
    |||||| |||||||   |||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||    ||||||||||||    
T  22697675 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgttgtaaaagggttgagctct 22697576  T
Q  127 tttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgca 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22697575 tttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgca 22697476  T
Q  225 tttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  22697475 tttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatgattattgatgattattg 22697383  T
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
    ||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22697382 tgattgatgtttgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgattgatg 22697327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22693028 - 22692680
Alignment:
Q  31 cctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttgtg---gggttgagctct 126  Q
    |||||| |||||||   |||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||    ||||||||||||    
T  22693028 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgttgtaaaagggttgagctct 22692929  T
Q  127 tttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgca 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22692928 tttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgca 22692829  T
Q  225 tttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  22692828 tttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatgattattgatgattattg 22692736  T
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
     |||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22692735 cgattgatgtttgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgattgatg 22692680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8886896 - 8886609
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||         
T  8886896 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttatcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgtatcatagtcgtgttgaga 8886797  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  8886796 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 8886697  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8886696 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatgtgtgattggtgattgt 8886609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21140633 - 21140217
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||| ||| |     
T  21140633 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagttcttatacatgttcatgcatcatagtcgatgttgc 21140534  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcg-aaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    |  ||||| |||||||||||||| |     
T  21140533 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21140436  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  21140435 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 21140343  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagata 397  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21140342 atgattattgatgat-gttgtgattgatgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtgattattgatgtgagata 21140244  T
Q  398 tgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  21140243 ttggggtttgatgtaagtattgatgtg 21140217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25600717 - 25600346
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg------- 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||            
T  25600717 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtaaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtctcgttgag 25600618  T
Q  105 --tgtagttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
      |||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  25600617 tttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 25600518  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatg 298  Q
    |||  ||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||     
T  25600517 cttgaggtaatatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctta-ttgataaatgtggttggtgattattcatgaaata 25600419  T
Q  299 tgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25600418 tgattgaagattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 25600346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15632152 - 15631849
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  15632152 aatataattgggtgttgtcctatatattgtgttgagaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgttgtat 15632053  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||     |  |||| ||||||||||||    
T  15632052 ttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgttcaagaggcatcaaaggtgacgacc 15631953  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    |   || |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15631952 tggaggtgattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattggtgattgttcatcaaatgt 15631853  T
Q  300 gatt 303  Q
    ||||    
T  15631852 gatt 15631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22862243 - 22861976
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||         
T  22862243 aatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcattatagttgtgttgaga 22862144  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  22862143 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 22862044  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22862043 ttgaggtgatctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttg 22861976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6878198 - 6877911
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||         
T  6878198 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgtggtcgcattatcgagtcttgttacttgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 6878099  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||     
T  6878098 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgact 6877999  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||  || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  6877998 ttgaggtgatccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgattgt 6877911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34822953 - 34822597
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  34822953 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 34822855  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  34822854 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 34822757  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  34822756 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 34822664  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34822663 atgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcatg 34822597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Original strand, 3801084 - 3801232
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  3801084 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 3801183  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3801184 gatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 3801232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8942402 - 8942045
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  8942402 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 8942303  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  8942302 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 8942205  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| |    
T  8942204 gagatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatga 8942112  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942111 atgattattgatgatgtttgtgattgacggttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 8942045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 3800513 - 3800860
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || || |     
T  3800513 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagttgttgttgc 3800612  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  3800613 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3800710  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  3800711 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 3800803  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 361  Q
    |||  |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3800804 atggttattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 3800860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34822529 - 34822389
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgatta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  34822529 ttgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgattgatgaata 34822430  T
Q  385 ttgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34822429 ttgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 34822389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 368
Target Start/End: Original strand, 12637609 - 12637918
Alignment:
Q  56 attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggc 150  Q
    |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || | |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12637609 attgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgctgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggc 12637706  T
Q  151 gggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatc 248  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637707 aggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatc 12637806  T
Q  249 ataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatat 348  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  12637807 ataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatgattattgatgat-gttgtgattgatgattgtgaatgaatat 12637898  T
Q  349 ttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  12637899 ttgtgaattgatatttgttc 12637918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 285 - 428
Target Start/End: Original strand, 43644682 - 43644825
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgatta 384  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43644682 ttgttcacgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgcgaattgataattgttcatatgattgatgatta 43644781  T
Q  385 ttgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggt 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43644782 ttgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattattgtgtggt 43644825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 19888354 - 19888535
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19888354 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 19888453  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888454 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 19888535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Original strand, 19888698 - 19888846
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  19888698 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattatgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 19888797  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19888798 gacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 19888846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 21275927 - 21276203
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  || |     
T  21275927 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgacgttgc 21276026  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcg-aaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    |  ||||| |||||||||||||| |     
T  21276027 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21276124  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  21276125 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtg 21276203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25211115 - 25210967
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  25211115 attggtgactgttcatgaaatgtgattaataattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 25211016  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25211015 gatgaatactgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 25210967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 461238 - 461091
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  461238 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattg 461140  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgatt 336  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  461139 ttcatgagatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgatt 461091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8941934 - 8941786
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  8941934 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 8941835  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8941834 gacgaatattgatgtgaaacatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 8941786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Original strand, 38706771 - 38706919
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  38706771 attggtgattgttcctgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 38706870  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  38706871 gatgaatattgatgtgagatattggtgtgtgatgtaagtactaatgtgt 38706919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 24827970 - 24828237
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||| |||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  24827970 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtggattgttgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagtcgagttctt 24828069  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||| ||||||||||    
T  24828070 gtataagagtccggctcttttacttcggagattatgtaaggag---------ccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacaaccttttgga 24828160  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  24828161 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 24828237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22861971 - 22861858
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatat-gggggtgtgatgtaagtattaat 421  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22861971 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataatcgttcatgtgattaatgattattgatgtgagatatcgggggtgtgatgtaagtattaat 22861872  T
Q  422 gtgtggtaattatt 435  Q
    ||||| | ||||||    
T  22861871 gtgtgattattatt 22861858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12726808 - 12726533
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  12726808 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 12726710  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  12726709 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12726612  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  12726611 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 12726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 14907840 - 14908114
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  14907840 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 14907939  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  14907940 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 14908036  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  14908037 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 14908114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23773292 - 23773017
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  23773292 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 23773194  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  23773193 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23773096  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  23773095 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 23773017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 24687069 - 24687345
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24687069 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgt 24687167  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggt-gacgaccttttg 204  Q
    |||    | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| || ||||||||| |     
T  24687168 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagttgacgaccttgtt 24687266  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  24687267 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 24687345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 24832589 - 24832689
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  24832589 catcggaggtgacaaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggt 24832688  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  24832689 g 24832689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 330
Target Start/End: Original strand, 24088894 - 24089114
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||| ||||||||||  || |||||||    
T  24088894 gggttgagctcttttacgtcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgatttgg 24088993  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatg--aaatgtgattaatgac 309  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||| |  | ||||||||| || |||| ||||  |||||||||| ||||     
T  24088994 taccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgataaatgtgattgatgat 24089093  T
Q  310 tattcatgataattgtgattg 330  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  24089094 tgttcatgataaatgtgattg 24089114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24966777 - 24966660
Alignment:
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24966777 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatctta-ttgatatatgtgattggtgattattcatgaaatgt 24966679  T
Q  300 gattaatgactattcatga 318  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24966678 gattaatgattgttcatga 24966660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 266 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 461111 - 460979
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  461111 tgataaatgtgattggtgattcttcatgagatgtgattaatgattatttacgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgacttgataattg 461012  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatat 398  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  461011 ttcatatgattgatgactattgatgtgaaatat 460979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 5889872 - 5889972
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  5889872 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 5889971  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  5889972 g 5889972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 11232827 - 11232927
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11232827 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 11232926  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  11232927 g 11232927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 22514674 - 22514774
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  22514674 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 22514773  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  22514774 g 22514774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 28777275 - 28777375
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  28777275 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 28777374  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  28777375 g 28777375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 12643427 - 12643706
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  12643427 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 12643525  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  12643526 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgcgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12643623  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||    
T  12643624 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-gaaatgtgattggtgattgt 12643706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8886624 - 8886512
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatg 422  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||    
T  8886624 tgtgattggtgattgtgagtgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattaatgattattgatgcgagatattggagtgtgatgtaggtattgatg 8886525  T
Q  423 tgtggtaattatt 435  Q
    |||| | ||||||    
T  8886524 tgtgattattatt 8886512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20013877 - 20013603
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  20013877 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 20013778  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  20013777 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 20013681  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  20013680 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 20013603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23818934 - 23818660
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  23818934 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 23818835  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  23818834 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 23818738  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  23818737 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 23818660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Original strand, 19434992 - 19435146
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || ||||||     
T  19434992 gggttgagctcttt-acttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacgtacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttga 19435090  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19435091 taccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatttg 19435146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 19670663 - 19670783
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  19670663 gggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtcttgatgcatcgaaggtgacgaccttgaggagattcggc 19670762  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19670763 accacatgcatttatgtgtca 19670783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 288
Target Start/End: Original strand, 25877615 - 25877714
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25877615 aaggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattg 25877713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19658590 - 19658471
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  19658590 ggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggt 19658491  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  19658490 accacatgcatatatgtgtc 19658471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 344 - 435
Target Start/End: Original strand, 23806331 - 23806422
Alignment:
Q  344 aatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23806331 aataattgtgaattgataattgttcatatgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtagttattatt 23806422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 4809 - 4930
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  4809 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 4908  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4909 taccacatgcatttatgtgtca 4930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 9654232 - 9654323
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9654232 aatataattgggtgttgctctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcg 9654323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 288
Target Start/End: Original strand, 36892358 - 36892456
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36892358 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 36892456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43641468 - 43641348
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggagatttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||  || |||| |    
T  43641468 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgt-ttttattgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcg 43641370  T
Q  213 gtaccacatgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  43641369 gtaccacatgcatatatgtgtc 43641348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 23823041 - 23823162
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  23823041 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 23823140  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23823141 taccacatgcatttatgtgtca 23823162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 23824985 - 23825106
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  23824985 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 23825084  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23825085 taccacatgcatttatgtgtca 23825106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 23832120 - 23832241
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  23832120 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 23832219  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23832220 taccacatgcatttatgtgtca 23832241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25304210 - 25304089
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  25304210 gggttaagctattttacttcggagattatgtaagaagggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 25304111  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25304110 taccacatgcatttatgtgtca 25304089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 17397997 - 17398272
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17397997 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 17398095  T
Q  111 tgtgg---ggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||     || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  17398096 tgtaaaatggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 17398193  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  17398194 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtg 17398272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211360
Alignment:
Q  214 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtg 25211360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27260339 - 27260137
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc-------- 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||            
T  27260339 aatataattgggagttgtcctatatattatggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcatgttgtg 27260240  T
Q  104 -gtgtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
      |||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||| |||||||||||    
T  27260239 tttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcaaaggtgacgac 27260140  T
Q  199 ctt 201  Q
    |||    
T  27260139 ctt 27260137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Original strand, 24296107 - 24296226
Alignment:
Q  117 gttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||  |||||||| ||||| ||   | |||||||||||||||||||  || |||| ||||    
T  24296107 gttgagctcttttacttcggagattatgtaagacttgggtgaaatcttacatacgatgttttagttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggta 24296206  T
Q  216 ccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24296207 ccacatgcatttatgtgtca 24296226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 36892113 - 36892208
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36892113 aatataattgggagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagttgtgt 36892208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 269943 - 269851
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  269943 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgtggtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcg 269851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22691354 - 22691449
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22691354 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22691449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 22696001 - 22696096
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22696001 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22696096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 460973 - 460896
Alignment:
Q  356 ttgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaatta 433  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  460973 ttgataattgttcatatgattgatgactattgatgtgaaatattgaggtatgatgtaagtattaatgtgtggttatta 460896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Original strand, 43644635 - 43644688
Alignment:
Q  316 tgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644635 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 43644688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 461494 - 461402
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  461494 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 461402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 4449633 - 4449725
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4449633 aatataattggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtctcgttacatgtccatgcatcatagtcg 4449725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 20628796 - 20628891
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20628796 aatataattgggtatcgtcctatatattgaggttgaaatagtggattgttgtcacattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 20628891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 5889697 - 5889790
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||| |||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  5889697 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 5889790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22137355 - 22137468
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22137355 gctcttttatttcggtgataatgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 22137454  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  22137455 tgcatatatgtgtc 22137468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24967053 - 24966958
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagt-cgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24967053 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtccgta-tacatgtccatgaatcatagtcgtgt 24966958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Original strand, 25877699 - 25877801
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  25877699 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgcgagatattggggattgatgtaagt 25877798  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  25877799 att 25877801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 11232653 - 11232745
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  11232653 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 11232745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 22514500 - 22514592
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  22514500 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 22514592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 28777101 - 28777193
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  28777101 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 28777193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 21276351 - 21276457
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21276351 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatcgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 21276450  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  21276451 tgatgtg 21276457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Original strand, 42180216 - 42180318
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  42180216 tgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgatgtaagt 42180315  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  42180316 att 42180318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25211171 - 25211125
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25211171 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatg 25211125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 720920 - 720829
Alignment:
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||  || |||||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||    
T  720920 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgttcatga 720829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 12638003 - 12638109
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       ||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  12638003 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtgattattgatgtgagacattggggtttgatgtaagtat 12638102  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  12638103 tgatgtg 12638109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 424
Target Start/End: Original strand, 12643871 - 12643927
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||    
T  12643871 catgtgattggtgattattgatgtgagacattggggtttgatgtaagtattgatgtg 12643927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 12637920 - 12637971
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  12637920 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 12637971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 12643738 - 12643789
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  12643738 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 12643789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Original strand, 22581350 - 22581433
Alignment:
Q  26 gttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcg-tattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22581350 gttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctctgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 22581433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 370
Target Start/End: Original strand, 36892441 - 36892488
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat 370  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36892441 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcat 36892488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Original strand, 3801023 - 3801077
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3801023 tgatacatgtaattggtgatttttcatgaaatgtgattagtgattattcatgata 3801077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Original strand, 7513797 - 7513839
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7513797 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 7513839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Original strand, 25877353 - 25877395
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg 55  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25877353 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 25877395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34822598 - 34822544
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34822598 tgatacatgtaattggtgatttttcatgaaatgtgattagtgattattcatgata 34822544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Original strand, 42180144 - 42180186
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42180144 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 42180186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Original strand, 22581608 - 22581664
Alignment:
Q  211 tggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22581608 tggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttatt 22581664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6877926 - 6877878
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  6877926 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatg 6877878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7320244 - 7320148
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7320244 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtctttgttacatgtccatgtatcatagtcgtgt 7320148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 107
Target Start/End: Original strand, 25877430 - 25877466
Alignment:
Q  71 tcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25877430 tcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 25877466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28972785 - 28972701
Alignment:
Q  25 tgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||| || |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28972785 tgttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattggtgtcgcattatcgagtctttgttacatgtctatgcatcatagtcgtgt 28972701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 217154 - 217574
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  217154 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattatgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatatccatacatcatagtcgtgtaattg 217253  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  217254 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggg-gtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 217352  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||    
T  217353 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtaattaat 217445  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  217446 gattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattattcatatgattgatgaatattgatgtgaaatattggggtat 217545  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  217546 gatgtaagttttaatgtgtgattattatt 217574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5763 - 5582
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  5763 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggt 5664  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5663 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 5582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5444 - 5295
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga-taattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgat 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5444 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgaataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgat 5345  T
Q  376 cgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
     || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5344 tgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Original strand, 4154 - 4518
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4154 aatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaattgtgattcttgtcgcattatcgagtcttgttacatatccatgcatcatagtcgtgttgttg 4253  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  4254 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 4353  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4354 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaat 4453  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4454 gattattcataataaatgtgattggtgattgtgaatgcataattgtgaatttataattgttcatg 4518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 418
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4747
Alignment:
Q  379 tgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4708 tgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 4747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Original strand, 48994 - 49358
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48994 aatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaattgtgattcttgtcgcattatcgagtcttgttacatatccatgcatcatagtcgtgttgttg 49093  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  49094 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 49193  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49194 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaat 49293  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49294 gattattcataataaatgtgattggtgattgtgaatgcataattgtgaatttataattgttcatg 49358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 418
Target Start/End: Original strand, 49548 - 49587
Alignment:
Q  379 tgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49548 tgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 49587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4598 - 4186
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4598 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 4499  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  4498 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 4399  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| |||||||    
T  4398 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagattaat 4306  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |    
T  4305 gattattgatgatgattgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaattgataattgtacatatgattgatgattattgaagtgaggtattggggtat 4206  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4205 gatgtaagtattaatgtgtg 4186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 4)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 32596 - 32957
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32596 aatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgctacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 32695  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32696 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 32795  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  32796 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtgattaat 32888  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgat 375  Q
    || |||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32889 gattattcatgatgaaagtgattggtgattgtgaataaatatttgtgaattgataattgttcatatgat 32957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33850 - 33757
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  33850 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 33757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34108 - 34014
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34108 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgttcatgcatcatagtcgtgt 34014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33611 - 33472
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| |    
T  33611 ttgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 33512  T
Q  378 atgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  33511 atgattattaatgtgagatattgggatttgatgtaagtat 33472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 4)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40248 - 39887
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40248 aatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgctacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 40149  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  40148 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 40049  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  40048 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtgattaat 39956  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgat 375  Q
    || |||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39955 gattattcatgatgaaagtgattggtgattgtgaataaatatttgtgaattgataattgttcatatgat 39887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 283
Target Start/End: Original strand, 38994 - 39087
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  38994 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 39087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 38736 - 38830
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38736 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgttcatgcatcatagtcgtgt 38830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 417
Target Start/End: Original strand, 39233 - 39372
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| |    
T  39233 ttgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 39332  T
Q  378 atgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  39333 atgattattaatgtgagatattgggatttgatgtaagtat 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41463 - 41051
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41463 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtctttttacatttctatgcatcatagtcgtgtagttg 41364  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||   | | |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  41363 taaaagggttgagctcttttacttcgtagattatgtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcggaggtgacgaccttttgga 41264  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||    
T  41263 gatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttttatatatgtga-------ttgttcatgaaatgtcattaat 41171  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  41170 gattattcatgataattttgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattgttcatatgattgatggatattgatgtgaaatattggggtgt 41071  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41070 gatgtaagtattaatgtgtg 41051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 129604 - 130025
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  129604 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtattgttg 129703  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   ||| |  ||||| |||||| ||| |||||||    
T  129704 taaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacaatgttgagttgttccatcggaggtgaagacgttttgga 129803  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||||    
T  129804 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtga-------ttgtctatgaaatgtgattaat 129896  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||| |||||||| ||| |||    
T  129897 ggttattcatgataaatgtgattggtggttgtgaatgaatatctatgaattaataattgttcatatgactgatgaatgttgatatgagatattgggatgt 129996  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  129997 gatgtaagtatttatgtgtgattattatt 130025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21129 - 21032
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21129 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtgattggtgtttgt 21032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28718 - 28623
Alignment:
Q  191 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28718 gtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatgtatgtgattggtgtttg 28623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21416 - 21325
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgatt-gttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21416 aatataattcggtgttgtcctatatactgaagtgaaaattgtggtttgttgtcgtattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 21325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 54394 - 54110
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54394 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttactacatgtccatgcatcatagtcgtatagttg 54295  T
Q  113 tgg---ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagat 209  Q
    |     ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54294 taaaaaggttgagctcttttacttcagagattatgtaagctgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcgaaagtgacgaccttttggagat 54195  T
Q  210 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  54194 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattcttcatga 54110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 109485 - 109745
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| || |||    
T  109485 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtttatgcatcatagtcgagttgtt 109584  T
Q  112 gtgg---ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  109585 gtaaaatggttgatctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 109684  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  109685 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttg 109745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 272 - 390
Target Start/End: Original strand, 109957 - 110075
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  109957 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattgatgattattcaagatatatgtgattagtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata 110056  T
Q  372 tgatcgatgattattgatg 390  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  110057 tgattgatgaatattgatg 110075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 312 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54116 - 54010
Alignment:
Q  312 ttcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgt 411  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  54116 ttcatgataaatgtgattggtgatagtgaattaataattgtgaattgataattgttcatgtgattggtgattattgatgtgagatattggagtgtgacgt 54017  T
Q  412 aagtatt 418  Q
    |||||||    
T  54016 aagtatt 54010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 109750 - 109798
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109750 tgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 109798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15055 - 14696
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15055 aatataattgggtgttgtcctatatattgaagttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 14956  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    ||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14955 gtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggtgggggtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggaga 14856  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatga 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| ||| |||||    
T  14855 tttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatga 14763  T
Q  309 ctattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgat 375  Q
     |||| ||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  14762 ttattgatgatgattgtgattgatgtttgcgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgat 14696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 67 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28521 - 28217
Alignment:
Q  67 attatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaccct 163  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28521 attatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgttgtaaaagggttgagctcttttaattcggagattatgtaaggcgggggtgaaccct 28422  T
Q  164 tacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctta 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  28421 tacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtctta 28322  T
Q  264 tttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataat 363  Q
    | ||||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||| | ||| ||||||    
T  28321 tgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatgattattgatgatgattgtgattgatgtttgcgaatgaatatttataaatggataat 28229  T
Q  364 tgttcatgtgat 375  Q
    ||||||| ||||    
T  28228 tgttcatatgat 28217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16200 - 15791
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  16200 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 16101  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  16100 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 16001  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| ||| |||    
T  16000 gatttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaat 15908  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||| |||   | |||    
T  15907 gattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaacatttatgaatggataattgttcatatgattgatgtatgttgatatgagctatcaagttgt 15808  T
Q  407 gatgtaagtattaatgt 423  Q
    |||||||||||| ||||    
T  15807 gatgtaagtatttatgt 15791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Original strand, 13599 - 13969
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||         
T  13599 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgaatcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 13698  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  13699 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 13798  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||| |    
T  13799 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatctta-ttgataaatgtggttggtgatttttcatgaaatat 13897  T
Q  300 gattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  13898 gattgaagattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatg 13969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106345
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||| |||| ||| |||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  106757 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaactgtggatttttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 106658  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  106657 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 106558  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||       |||||||||| | |||    
T  106557 gatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtg-------atgaaatgtggtgaat 106465  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || | ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||  | |    
T  106464 gattgttattaatgattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgacttgttaattattcatatgattgatgactattggtgtgagatattggaatat 106365  T
Q  407 gatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  106364 gatgtaagtatcaatgtgtg 106345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27365 - 27233
Alignment:
Q  303 taatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggg 402  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27365 taatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgctcatatgatcgatgaatattgatgtgagatatcggg 27266  T
Q  403 gtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27265 gtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 27233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 535
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  835 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttccatctccatgcatcatagtcgtgtggttg 736  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  735 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttgga 636  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  635 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgatcattcatgaaatatgattaat 537  T
Q  307 ga 308  Q
    ||    
T  536 ga 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3519 - 3402
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  3519 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgaatgtt 3421  T
Q  290 catgaaatgtgattaatga 308  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3420 catgaaatgtgattaatga 3402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15091 - 15004
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  15091 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttccatctccatgcatcata 15004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3367 - 3322
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3367 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 3322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 270877 - 270596
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270877 aatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcgtgtagttg 270778  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  270777 taaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgatcttttgga 270678  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  270677 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgt 270596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 270565 - 270413
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270565 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggttattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 270466  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  270465 ttcatatgattgatgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 270413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 236938 - 236671
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-------- 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||            
T  236938 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtggaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 236839  T
Q  105 -tgtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatg-tgttttatcatcgaaggtgacgacc 199  Q
     |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||| |||| |    || |||||||||||||||||    
T  236838 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagaaaggtgtgaaatcttacatacgatgttaaagtagcatcgaaggtgacgacc 236739  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |   || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  236738 tagaggtgataaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 236671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 270618 - 270573
Alignment:
Q  316 tgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 361  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  270618 tgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 270573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 2536 - 2871
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2536 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcatta-cgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 2634  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt---gttttatcatcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||| |  ||||  ||||||||||||||||||    
T  2635 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgaccttttgga 2734  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtg--catatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaa---atgtga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||    |||||    
T  2735 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtga 2834  T
Q  302 ttaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  2835 ttaatgattattcatgatacatgtaattggtgattgt 2871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 426
Target Start/End: Original strand, 2849 - 3010
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2849 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattg 2948  T
Q  366 ttcatgtgatcga-tgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2949 ttcatatgattgattgattattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 3010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 354
Target Start/End: Original strand, 2796 - 2834
Alignment:
Q  316 tgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtga 354  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2796 tgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtga 2834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51423
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||| || || |  ||||| | ||||||||||| ||| || |||    
T  51787 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgattccttatacattttcatgcatcatattcgagttgtt 51688  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51687 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtcaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgatgaccttttggaga 51588  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatga 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| ||| |||||    
T  51587 tttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaatga 51495  T
Q  309 ctattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
     |||| ||||| | ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  51494 ttattgatgatgactgtgattgatgtttgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgattgatg 51423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 6552 - 6913
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  6552 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgagtccttatacatttccatgcatcatagtcgagttgtt 6651  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  6652 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 6751  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| ||| | |    
T  6752 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgatt 6844  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgat 375  Q
     |||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  6845 aactattgatgatgattgtgattgatgtttgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgat 6913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Original strand, 58945 - 59200
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||  | |||||    
T  58945 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttgtccatcggaggtgacgacctttttaaaatttg 59044  T
Q  213 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| ||| | |||||||    
T  59045 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgattgactat 59137  T
Q  313 tcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgat 375  Q
    | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  59138 tgatgatgattgtgattgatgtttgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgat 59200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 106443 - 106564
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  106443 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 106542  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  106543 taccacatgcatttatgtgtca 106564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 130523 - 130410
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||  | ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  130523 gctcttttacttcggtgataacgtaagaccggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 130424  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  130423 tgcatatatgtgtc 130410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 37
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  312 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 213  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgacc-ttttggag 207  Q
    ||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  212 gtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgacctttttggag 113  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  112 aattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtg 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Original strand, 1189 - 1556
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgag---gaga---aaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||   ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||     
T  1189 aatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgaaattgtgaattgtggtcgcattatcgagtccttatatatgttcatgcatcatagtcga 1288  T
Q  106 gtagttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttt 202  Q
    || |||||    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1289 gttgttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaaggag----tgaacccttacatacgatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttt 1384  T
Q  203 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |      ||||||| |||    
T  1385 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat------tgaaatgagat 1478  T
Q  303 taatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
     ||||| |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  1479 gaatgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaatggataattgttcatatgattgatg 1556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 11)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Original strand, 124992 - 125236
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  124992 ggtgacgacccttgggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattgtt 125090  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgat 389  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  125091 catgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttatgaattgataattgttcacttgattgatgattattgat 125190  T
Q  390 gtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  125191 gtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 125236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 435
Target Start/End: Original strand, 72012 - 72255
Alignment:
Q  191 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttc 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  72012 gtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattattc 72110  T
Q  291 atgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatg 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  72111 atgaaatgtgattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattgtgaatgaatatttgtgatttgataattgttcaagtgattgatgattattgatg 72210  T
Q  391 tgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  72211 tgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtgattattatt 72255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 435
Target Start/End: Original strand, 76393 - 76636
Alignment:
Q  191 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttc 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  76393 gtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattattc 76491  T
Q  291 atgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatg 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  76492 atgaaatgtgattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattgtgaatgaatatttgtgatttgataattgttcaagtgattgatgattattgatg 76591  T
Q  391 tgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  76592 tgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtgattattatt 76636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 193074 - 192830
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  193074 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggttattatt 192976  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgat 389  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  192975 catgaaatgtgattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattgtgaatgaacatttgtgaattgataattgttcatgtaattgatgattattgat 192876  T
Q  390 gtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  192875 gtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtgattattatt 192830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 288
Target Start/End: Original strand, 256558 - 256656
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  256558 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 256656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 256312 - 256407
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  256312 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 256407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 124694 - 124789
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  124694 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 124789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 193371 - 193276
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  193371 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 193276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 76095 - 76186
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  76095 aatataattgggtgtcatcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtc 76186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Original strand, 256641 - 256742
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  256641 tgtgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 256740  T
Q  416 at 417  Q
    ||    
T  256741 at 256742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 262918 - 262970
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtc 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  262918 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtc 262970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 5003 - 5274
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5003 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattattgtcgcattgtcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgttgtgg 5102  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgt--tttatcatcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  5103 taaaagggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcggcagtgaacccttacatacgatgtttacttgtccatcggaggtgacgaccttttggag 5202  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5203 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtttta-ttgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 280
Target Start/End: Original strand, 12786 - 12876
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12786 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 436
Target Start/End: Original strand, 12888 - 12999
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  12888 tgattggtgattgtgaatgaaaatttgtgaattaataattgttcatatgattgatgtatgttgatgtgagatatcgagatgtgatgtaagtatttatgtg 12987  T
Q  425 tggtaattattt 436  Q
    || | |||||||    
T  12988 tgattattattt 12999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 5284 - 5396
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatg 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||    
T  5284 tgtgattggtgattgtgaatgaaaatctgtgaattaataattgttcatatgattgatgtatgttgatgtgagatatcgagatgtgatgtaagtatttatg 5383  T
Q  423 tgtggtaattatt 435  Q
    |||| | ||||||    
T  5384 tgtgattattatt 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Original strand, 9329 - 9695
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9329 aatataattgggtgctgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtagcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 9428  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |   | || |||| |||||| |||||||||||    
T  9429 gtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggggttgaacccttacatatgatattgacatgtccatcggaggtgatgaccttttgga 9528  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| ||| |||    
T  9529 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaat 9621  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatg 380  Q
    || |||| ||||| | ||||||||  | |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  9622 gattattgatgatgaatgtgattgatgtttgtgaatgaatatttatgaatgaataattgttcatatgattgatg 9695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7736 - 7465
Alignment:
Q  14 atataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7736 atataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgtattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgttgt 7637  T
Q  114 ---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatg-tgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
        ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||  || | ||||  |||||| |||||||||||||    
T  7636 aaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaaggctggggtgaacccttatatacgatgttgacttgtccatcagaggtgatgaccttttggaga 7537  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7536 tttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 325 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12728 - 12618
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  12728 tgattggtgattgtgaatgaatatctgtgaattaataattgttcatatgattgatgaatgttgatgtgagatatcgggatgtgatgtaagtatttatgtg 12629  T
Q  425 tggtaattatt 435  Q
    || | ||||||    
T  12628 tgattattatt 12618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7353
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatg 422  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  7455 tgtgattggtgattgtgaatgaatatctgtgaattaataattgttcatatgattgatgaatgttgatgtgagatatcgggatgtaatgtaagtatttatg 7356  T
Q  423 tgt 425  Q
    |||    
T  7355 tgt 7353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7362 - 7316
Alignment:
Q  224 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgata 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7362 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgata 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 8)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1121 - 867
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1121 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgatgttgtt 1022  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgaccttttggaga 208  Q
    ||    | |||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1021 gtaaaagagttcggctcttttacttcggatattatgtaaggag----tgaccccttacatacaatgtgttttatcatcggaggtgacgaccttttggaga 926  T
Q  209 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  925 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5990 - 5620
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  5990 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgagattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 5891  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||| |    
T  5890 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgagc 5791  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5790 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttatt-gataaatgtgattggtgattgttcatgaaatgt 5692  T
Q  300 gattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  5691 gattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatg 5620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 550 - 402
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  550 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 451  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  450 gatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 862 - 814
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  862 tgtgattgaagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 661 - 607
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  661 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaattattattcatgata 607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5615 - 5569
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5615 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 5569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5591 - 5492
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  5591 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatg 5492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 706 - 660
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  706 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatg 660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1360
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  1604 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgattatt 1506  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgat 389  Q
     | |||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1505 tacgaaatgtgattaatgattgttcataacaaatgtgataggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataactgttcatgtgattgatgattattgat 1406  T
Q  390 gtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1405 gtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtgattattatt 1360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1941 - 1846
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1941 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 1846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 7)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3382 - 3012
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  3382 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgagattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 3283  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||| |    
T  3282 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgagc 3183  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3182 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttatt-gataaatgtgattggtgattgttcatgaaatgt 3084  T
Q  300 gattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  3083 gattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatg 3012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2855 - 2756
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  2855 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatg 2756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2983 - 2884
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  2983 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatg 2884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2751 - 2705
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2751 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 2705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2879 - 2833
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2879 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 2833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3007 - 2961
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3007 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 2961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2727 - 2628
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  2727 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatg 2628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 117)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 10779699 - 10780054
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  10779699 aatataattgggtgttatcatatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 10779798  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcg-aaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    |  ||||| |||||||||||||| |     
T  10779799 tgtaaaagggttgagctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 10779896  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10779897 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgttcatgaaatatgatta 10779996  T
Q  305 atgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 361  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779997 atgattattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgata 10780054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 317
Target Start/End: Original strand, 22368004 - 22368314
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  22368004 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 22368103  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| || ||||||| ||||| |  || || |||| ||||||||||||| |     
T  22368104 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggggtgagcc-ttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgtt 22368201  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22368202 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattgttcatgaaatatgatta 22368301  T
Q  305 atgactattcatg 317  Q
    |||| | ||||||    
T  22368302 atgattgttcatg 22368314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4864024 - 4863742
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||         
T  4864024 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattattgagttttattacatgtccatgcatcataatcgtgttgaga 4863925  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  4863924 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 4863825  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4863824 ttgaggtgatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtgattggtg 4863742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 35792655 - 35792910
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  35792655 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgagttgttg 35792754  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    | ||    ||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||||    
T  35792755 taaaagagtccgactcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggag 35792850  T
Q  208 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35792851 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 35792910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19498557 - 19498204
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||| || |     
T  19498557 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatacatcatagtcgttgttgc 19498459  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcg-aaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    |  ||||| |||||||||||||| |     
T  19498458 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19498361  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  19498360 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 19498268  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19498267 atgattattgatgatattggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 19498204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 43445274 - 43445632
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| || |     
T  43445274 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatatccatgcatcatagtcgttgttgc 43445373  T
Q  111 tgtg------gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgacctt 201  Q
    |||       ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    |  ||||||| ||||||||||||    
T  43445374 tgtaataaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacctt 43445471  T
Q  202 ttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtga 301  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||       |||||||| ||    
T  43445472 gttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtg-------atgaaatgaga 43445564  T
Q  302 ttaatgactattcatg-ataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43445565 tgaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 43445632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 285 - 435
Target Start/End: Original strand, 110959 - 111109
Alignment:
Q  285 ttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgatta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  110959 ttgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcatatgattgatgaata 111058  T
Q  385 ttgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  111059 ttgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 111109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25425379 - 25425023
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgatt-gttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  25425379 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 25425281  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  25425280 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 25425183  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| |    
T  25425182 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatga 25425090  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425089 atgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 25425023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11341393 - 11341040
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  11341393 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattattgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 11341295  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  11341294 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11341197  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  11341196 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 11341104  T
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11341103 atgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 11341040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 27185237 - 27185504
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||         
T  27185237 aatataattgggtattgtcctatatattgtggtgagaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcatgttgaga 27185336  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
        ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  27185337 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 27185436  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27185437 ttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 27185504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10933 - 10752
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10933 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 10834  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 10752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 11213125 - 11213406
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||  |||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11213125 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtgttgaaaattgtgattgt-gtcgcattatctagtattgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtggctg 11213223  T
Q  113 tg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttgga 206  Q
    |    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||    
T  11213224 taaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 11213322  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttc 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||    
T  11213323 gatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgattgttc 11213406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11340821 - 11340673
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||     
T  11340821 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataatcgttcatatgatt 11340722  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11340721 gatgaatatttatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 11340673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Original strand, 18780013 - 18780161
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  18780013 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 18780112  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18780113 gatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtgatgtaagtattaatgtgt 18780161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 267 - 435
Target Start/End: Original strand, 22368442 - 22368610
Alignment:
Q  267 gatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgt 366  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22368442 gatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtcattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgt 22368541  T
Q  367 tcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||| |||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22368542 tcatatgattgatggatatcgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaacgtgtgattattatt 22368610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 435
Target Start/End: Original strand, 25944516 - 25944686
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25944516 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaattattattcatgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattg 25944615  T
Q  366 ttcatgtgatcga-tgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||| |||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25944616 ttcatatgattgattgattattaatgtgagatattagggtgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 25944686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 29192313 - 29192494
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  29192313 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggt 29192412  T
Q  283 gtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192413 g-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgacgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 29192494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28258094 - 28257861
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||| |||||| |||||    
T  28258094 ggtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttatc-gataaatgtggttggtgattgtt 28257997  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgat 382  Q
    |||||||| ||||| | || | ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| ||||||    
T  28257996 catgaaatatgattgaggattgttcatgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgat 28257897  T
Q  383 tattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28257896 tattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtatt 28257861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25424886 - 25424738
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  25424886 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 25424787  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25424786 gacgaatattgatgtgaaatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 25424738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 110504 - 110777
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  110504 aatataattgggtgttgtcctgtatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 110603  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  110604 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 110701  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  110702 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattg 110777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 418
Target Start/End: Original strand, 4201487 - 4201894
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  4201487 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 4201586  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| | |    
T  4201587 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgacatcgaaaggtgacgaccttgttg 4201684  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| ||    
T  4201685 agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaa 4201777  T
Q  306 tgactattcatgataattg-----tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgg 400  Q
    ||| | || || || ||||     ||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| ||||  | ||||| |||||||| |    
T  4201778 tgaatgttgataatgattgttcaatgattggtg-ttgtgaatgaatatttatgattgggtaattattcatgtgattgatgtatgttgatatgagatatcg 4201876  T
Q  401 gggtgtgatgtaagtatt 418  Q
     | |||||||||||||||    
T  4201877 agttgtgatgtaagtatt 4201894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16535063 - 16534791
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  16535063 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcaagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 16534964  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  16534963 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 16534867  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattgg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  16534866 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattgg 16534791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 288 - 425
Target Start/End: Original strand, 35793134 - 35793271
Alignment:
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattg 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  35793134 ttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgattgatgaagattg 35793233  T
Q  388 atgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35793234 atgtgagatatcgaggtgtgatgtaagtattaatgtgt 35793271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 368
Target Start/End: Original strand, 9732367 - 9732540
Alignment:
Q  188 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||        
T  9732367 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattggtg---- 9732462  T
Q  288 ttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
       |||||||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9732463 ---atgaaatgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 9732540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 1221251 - 1221532
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  1221251 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaagttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 1221350  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||| ||| |     
T  1221351 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaacttgtt 1221449  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||    
T  1221450 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-gaaatgtgattggtgattgt 1221532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16534613 - 16534465
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  16534613 attggtgattttccatgaaacgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 16534514  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16534513 gatgaatattgatgtgagacttcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 16534465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 424
Target Start/End: Original strand, 29192632 - 29192779
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  29192632 attggtgattgttcatgaaatgtgatcaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgattgaataattgtaaattgataattgttcatatgatt 29192731  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  29192732 gatgaatattgatgcgagatatcggggtttgatgtaagtattgatgtg 29192779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21649587 - 21649463
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21649587 aatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 21649488  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttc 134  Q
    |    ||||||||||||||||||||    
T  21649487 taaaagggttgagctcttttacttc 21649463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 22884703 - 22884963
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  22884703 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 22884802  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  |||| || |||||||||||| |     
T  22884803 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcaaaaggtgacgaccttgtt 22884900  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22884901 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 22884963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 316 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23510414 - 23510302
Alignment:
Q  316 tgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  23510414 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcacatgattgatgactattgatgtgagatattggggtatgatgcaagt 23510315  T
Q  416 attaatgtgtggt 428  Q
    |||||||||||||    
T  23510314 attaatgtgtggt 23510302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23510483 - 23510392
Alignment:
Q  197 accttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  23510483 accttttggagatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattgt 23510392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 418
Target Start/End: Original strand, 21075009 - 21075416
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21075009 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 21075108  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| |     
T  21075109 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgtt 21075205  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgatta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |    
T  21075206 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatga 21075298  T
Q  305 atgactattcatgataattg-----tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatg 399  Q
    |||| | || || || ||||     ||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| ||||  | ||||| ||||||||     
T  21075299 atgaatgttgataatgattgttcaatgattggtg-ttgtgaatgaatatttatgattgggtaattattcatgtgattgatgtatgttgatatgagatatt 21075397  T
Q  400 ggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    | | |||||||||||||||    
T  21075398 gagttgtgatgtaagtatt 21075416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 21933855 - 21933955
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  21933855 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 21933954  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  21933955 g 21933955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 21940025 - 21940125
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  21940025 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 21940124  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  21940125 g 21940125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24595258 - 24594983
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || || |     
T  24595258 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagttgttgttgc 24595160  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  24595159 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 24595062  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  24595061 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 24594983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35580837 - 35580737
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35580837 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 35580738  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  35580737 g 35580737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 37010859 - 37010959
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  37010859 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 37010958  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  37010959 g 37010959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17908079 - 17907946
Alignment:
Q  269 tatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||  |||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17908079 tatatgtggttggtgattgttcatggagtatgattaatgattgttcatgata--tgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttc 17907982  T
Q  369 atgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17907981 atatgatcgatgattattgatgtgagatattggggt 17907946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Original strand, 17473549 - 17473662
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc--ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17473549 ggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattg 17473647  T
Q  288 ttcatgaaatgtgat 302  Q
    |||||||||| ||||    
T  17473648 ttcatgaaatatgat 17473662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20615369 - 20615095
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  20615369 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtctttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 20615270  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || |||||| |||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  20615269 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgtgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgtag 20615173  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  20615172 agatttggtagcgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 20615095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 435
Target Start/End: Original strand, 9732542 - 9732718
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  |||    
T  9732542 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgactgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttg 9732641  T
Q  366 tt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||       |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9732642 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgcgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtgattattatt 9732718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 371
Target Start/End: Original strand, 25944415 - 25944517
Alignment:
Q  270 atatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga-taattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25944415 atatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaatatttgcgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 25944514  T
Q  369 atg 371  Q
    |||    
T  25944515 atg 25944517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Original strand, 21653051 - 21653163
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  21653051 ggtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtctta-ttgataaatgtgattggtgattgtt 21653149  T
Q  290 catgaaatgtgatt 303  Q
    ||||||||||||||    
T  21653150 catgaaatgtgatt 21653163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 32967695 - 32967816
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  32967695 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 32967794  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  32967795 taccacatgcatttatgcgtca 32967816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23327710 - 23327439
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  23327710 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 23327612  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  23327611 tgtaaaagagatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23327514  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgatt 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||    
T  23327513 gagatttggtaccgcatgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatt 23327439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23492647 - 23492527
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  23492647 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggt 23492548  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23492547 accacatgcatttatgtgtca 23492527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 25902021 - 25902121
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  25902021 catcgaaggtgacgaccttatagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggt 25902120  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  25902121 g 25902121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27008769 - 27008494
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||       
T  27008769 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattacacatgtccatgcatcatagtcgttgttac 27008671  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  27008670 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 27008573  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  27008572 gagatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 27008494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Original strand, 18779783 - 18779850
Alignment:
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18779783 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 18779850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37051741 - 37051467
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  37051741 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtctttgcacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 37051642  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  37051641 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtgaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 37051545  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  37051544 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 37051467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 267
Target Start/End: Original strand, 21661268 - 21661394
Alignment:
Q  142 atgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataag 240  Q
    ||||||| | ||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661268 atgtaagactggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataag 21661367  T
Q  241 tgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21661368 tgcatatcatgacatgagtcttatttg 21661394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 21234927 - 21235202
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  21234927 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 21235026  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  21235027 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 21235123  T
Q  206 agattt-ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  21235124 agattttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcataacatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 21235202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 424
Target Start/End: Original strand, 10780062 - 10780227
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||   | ||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| |||    
T  10780062 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttg 10780161  T
Q  366 tt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtg 424  Q
    ||       |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  10780162 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtg 10780227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Original strand, 1170320 - 1170417
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1170320 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 1170417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7727224 - 7727102
Alignment:
Q  114 ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttg 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| |    
T  7727224 ggggttgagctattttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcg 7727125  T
Q  213 gtaccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  7727124 gtaccacatgcatttacgtgtca 7727102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19860876 - 19860758
Alignment:
Q  117 gttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggta 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  19860876 gttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgtatcgaaggtgacgaccttggggtgatttggta 19860777  T
Q  216 ccacatgcatttatgtgtc 234  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  19860776 ccacatgcatatatgtgtc 19860758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 25192519 - 25192613
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25192519 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgtttgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 25192613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Original strand, 24226990 - 24227148
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  24226990 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 24227089  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---taacatgagtcttatttg 267  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  24227090 tacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 24227148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 37189651 - 37189772
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  37189651 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 37189750  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  37189751 taccacttgcatttatgtgtca 37189772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 1170064 - 1170159
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170064 aatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattttggattgttgtcgcgttatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 1170159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20710895 - 20710800
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20710895 aatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 20710800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28258358 - 28258263
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28258358 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtcgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 28258263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21615655 - 21615537
Alignment:
Q  117 gttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggta 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  21615655 gttgaactcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggta 21615556  T
Q  216 ccacatgcatttatgtgtc 234  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  21615555 ccacatgcatatatgtgtc 21615537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24470805 - 24470716
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24470805 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ctgatatatgtgattg 24470716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24471048 - 24470966
Alignment:
Q  25 tgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24471048 tgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcgtgt 24470966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13793775 - 13793654
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||| ||| ||||| ||| |  |||| ||||||||||||||  || |||| ||    
T  13793775 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgagatcttatatacgatgtttttgttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgattcgg 13793676  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13793675 taccacatgcatttatgtgtca 13793654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 24184616 - 24184708
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24184616 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcg 24184708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11582632 - 11582537
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11582632 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgttcatgcatcatagtcgtgt 11582537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21392946 - 21392851
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21392946 aatataattgggttttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatggagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 21392851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 21652805 - 21652896
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  21652805 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcattatagtc 21652896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23510748 - 23510653
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23510748 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 23510653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23513554 - 23513459
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23513554 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 23513459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7424178 - 7424085
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  7424178 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 7424085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21392699 - 21392602
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21392699 ggtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgtttggtgattgt 21392602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11582398 - 11582325
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattgg 281  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11582398 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctta-ttgatgtatgtgattgg 11582325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 283
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211687
Alignment:
Q  218 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 25211687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 283
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275839
Alignment:
Q  218 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtg 25275839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 1170402 - 1170450
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170402 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 1170450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 17473292 - 17473384
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  17473292 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 17473384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 22884968 - 22885016
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22884968 tgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 22885016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19498120 - 19498012
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19498120 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 19498021  T
Q  418 taatgtgtg 426  Q
    | |||||||    
T  19498020 tgatgtgtg 19498012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28888563 - 28888440
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa---ggtgacgaccttttggagattt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||   | ||| ||||||  || ||||     
T  28888563 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgatgatgaccttgaggtgattc 28888464  T
Q  212 ggtaccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  28888463 ggtaccacatgcatttatgcgtca 28888440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 10491 - 10385
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10491 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 10392  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  10391 tgatgtg 10385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16534799 - 16534751
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16534799 tgtgattggagattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatg 16534751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21647290 - 21647250
Alignment:
Q  395 atatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647290 atatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 21647250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 43445717 - 43445823
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43445717 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 43445816  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  43445817 tgatgtg 43445823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34937768 - 34937655
Alignment:
Q  312 ttcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||    
T  34937768 ttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgttagatattggggt 34937669  T
Q  405 gtgatgtaagtatt 418  Q
     |||||||||||||    
T  34937668 ttgatgtaagtatt 34937655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Original strand, 1221517 - 1221562
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1221517 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 1221562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 21933681 - 21933773
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  21933681 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 21933773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 21939851 - 21939943
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  21939851 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 21939943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35581011 - 35580919
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  35581011 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 35580919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 37010685 - 37010777
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  37010685 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 37010777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 1221647 - 1221753
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  1221647 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttgatgtaagtat 1221746  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  1221747 tgatgtg 1221753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7424434 - 7424343
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  7424434 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 7424343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11964585 - 11964473
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||  |||||||| ||||| |||  | ||| |||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  11964585 ctcttttacttcggtgataatgtaatacgggtttgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtggtttggtaccacat 11964486  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  11964485 gcatgtatgtgtc 11964473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 17473710 - 17473816
Alignment:
Q  325 tgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  17473710 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttgatgtaagtat 17473809  T
Q  418 taatgtg 424  Q
    | |||||    
T  17473810 tgatgtg 17473816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 18779855 - 18779903
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18779855 tgtgattagagattgtgaatgaacatttgtgaattgataattgttcatg 18779903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 35792915 - 35792963
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35792915 tgtgattagagatcgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 35792963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 330
Target Start/End: Original strand, 1171275 - 1171338
Alignment:
Q  267 gatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattg 330  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1171275 gataaatgtggttggtgattgtttatgaaatgtgattgatgattattcatgataaatgtgattg 1171338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 338
Target Start/End: Original strand, 22368392 - 22368463
Alignment:
Q  267 gatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||||||    
T  22368392 gatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcaggatacatgtaattggtgattgt 22368463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24470711 - 24470618
Alignment:
Q  349 ttgtgaattgataattgttc-------atgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  24470711 ttgtgaattgataattgttcgtgacatatgtgattgattattattgttgtgagatattggggtgtgatgtaaatattattgtgtgattattatt 24470618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Original strand, 27185568 - 27185618
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27185568 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 27185618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Original strand, 35793062 - 35793116
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35793062 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaattattattcatgata 35793116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19404338 - 19404242
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19404338 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgttacatgtccgtgcatcatagtcgtgt 19404242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 20455628 - 20455740
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||   ||| |||| |||  || |||||||||||||||    
T  20455628 ctcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgatcttgaggtgatttggtaccacat 20455727  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  20455728 gcatatatgtgtc 20455740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 222
Target Start/End: Original strand, 25192776 - 25192808
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25192776 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatg 25192808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10574 - 10523
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  10574 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 10523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 1221564 - 1221615
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  1221564 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 1221615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 318
Target Start/End: Original strand, 21653183 - 21653226
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21653183 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 21653226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 21661407 - 21661454
Alignment:
Q  324 gtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21661407 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatg 21661454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11340882 - 11340828
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgata 320  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11340882 tgatacatgtaattggtgatttttcatgaaatgtgattagtgattattcatgata 11340828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34937829 - 34937787
Alignment:
Q  275 tgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34937829 tgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 34937787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21392565 - 21392517
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 417  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21392565 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggt-tgatgtaagtat 21392517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Original strand, 5452432 - 5452513
Alignment:
Q  191 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---taacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  5452432 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 5452513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 18779559 - 18779607
Alignment:
Q  56 attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18779559 attgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 18779607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23453708 - 23453612
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23453708 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 23453612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23465213 - 23465117
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23465213 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 23465117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 426
Target Start/End: Original strand, 6819 - 7044
Alignment:
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  6819 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatatgattggtgactgttcatgaaatgt 6917  T
Q  300 gattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatg 399  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||     
T  6918 gattaatgattattcatgataaatgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattggtcatatgattgatgactattgatgtgagatatt 7017  T
Q  400 ggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7018 gggatgtgaagtaagtattaatgtgtg 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 6552 - 6644
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||   |||||||| ||| |||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  6552 aatataattgggcgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattattgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 6644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 1
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218 aatataactgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 119  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat--catcgaaggtgacgaccttttggag 207  Q
    |    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  118 taaaagggttgagcttttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgagcttttggag 19  T
Q  208 atttggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18 atttggtaccacatgcat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 155757 - 156107
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  155757 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagttcttatacatgtccatgcatcatagtcgagttgtt 155856  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgga 206  Q
    ||    |  |   ||||||||||||| |||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  155857 gtaaaagaatccggctcttttacttcagagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttgga 155952  T
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||||||| ||| |||    
T  155953 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaat 156045  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    || |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  156046 gattattgatgatgtttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 156107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 273 - 426
Target Start/End: Original strand, 85923 - 86076
Alignment:
Q  273 tgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgt 372  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  85923 tgtgattggtgactgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattgttgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatat 86022  T
Q  373 gatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  86023 gattgatgattattgatgtgggatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 86076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35090 - 34814
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  35090 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgttgc 34992  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    | |    || |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  34991 tataaaaggattgaactcttttacttcg-atattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 34893  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  34892 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 34814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Original strand, 847 - 936
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  847 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Original strand, 58291 - 58384
Alignment:
Q  269 tatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataa 362  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| | || | |||||||||  |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  58291 tatatgtggttggtgattgttcatgaagtatgattgaggattgttcatgatatatgtgatcggtgattgtgtatgaatctttgtgaattgataa 58384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 156109 - 156160
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  156109 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 156160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 207 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40082 - 39879
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  40082 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt-gatatatgtgattggtgactgttcatgaactgttattaat 39984  T
Q  307 gactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgt 406  Q
    || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39983 gattattcatgataaatgtgattggtggttgtgaatgaatatttgtgaattcataattatttatatgattgatgattattgatgtgacatattggggtgt 39884  T
Q  407 gatgt 411  Q
    |||||    
T  39883 gatgt 39879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 40355 - 40262
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40355 aatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtg 40262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3417 - 3046
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtag-- 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  3417 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattttgtattgttgttgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcttgttgag 3318  T
Q  110 -ttgtgg---------ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
     |||| |         |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  3317 tttgtagttgaaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 3218  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatg 298  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||     
T  3217 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgttcatgaaata 3119  T
Q  299 tgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||| |||| | |||||||||  |||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  3118 tgattgatgattgttcatgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatg 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 52679 - 52838
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52679 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcacattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 52778  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacata 169  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52779 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacata 52838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 56631 - 56790
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56631 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcacattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 56730  T
Q  113 t---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacata 169  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56731 taaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacata 56790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12955 - 12668
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtag--- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |       
T  12955 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 12856  T
Q  110 ttgtgg---------ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacc 199  Q
    |||| |         | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  12855 ttgtagtcataaaaggcttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 12756  T
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||    
T  12755 ttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttg-gaaatgtgattggtgattgt 12668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 7)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20148 - 19879
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  20148 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 20049  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaagg--tgacga 197  Q
        ||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||  ||||||    
T  20048 ttgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggcgtgacga 19949  T
Q  198 ccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19948 ccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttg 19879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18064 - 17795
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||         
T  18064 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcatgttgaga 17965  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaagg--tgacga 197  Q
        ||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||  ||||||    
T  17964 ttgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggcgtgacga 17865  T
Q  198 ccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17864 ccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttg 17795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 8058 - 8294
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtag-- 109  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||      
T  8058 aatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcatgtagag 8157  T
Q  110 ----ttgtgg------ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
        |||| |      |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  8158 tttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgac 8257  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8258 cttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 8294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 13447 - 13683
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtag-- 109  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||      
T  13447 aatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcatgtagag 13546  T
Q  110 ----ttgtgg------ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
        |||| |      |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  13547 tttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgac 13646  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13647 cttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 13683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19866 - 19822
Alignment:
Q  324 gtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19866 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttc 19822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17657 - 17607
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17657 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 17607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19687 - 19637
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19687 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 19637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 60325 - 60064
Alignment:
Q  19 attgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---------ag 109  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||         ||    
T  60325 attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtctttttacatgttcatgcatcatattcgtgttgatattgtag 60226  T
Q  110 ttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  ||    
T  60225 ttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgagg 60126  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60125 tgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 60064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 46877 - 46819
Alignment:
Q  19 attgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtc 77  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46877 attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtc 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 248944 - 249234
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt----- 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         
T  248944 aatataattgggtgttgtcttatatattgtggagaaaattgtgatttttgttgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgaga 249043  T
Q  108 ----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac- 198  Q
        ||||||    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||     
T  249044 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttaggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacg 249143  T
Q  199 --cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
      |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  249144 accttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgattgt 249234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 249219 - 249331
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatg 422  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  249219 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgattaatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatg 249318  T
Q  423 tgtggtaattatt 435  Q
    |||| | ||||||    
T  249319 tgtgattattatt 249331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4887 - 4603
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||        
T  4887 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgtgttatcgagttttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgttgag 4788  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  4787 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 4688  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||    
T  4687 cttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattggtg 4603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4509
Alignment:
Q  324 gtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgatt-attgatgtgagata-tgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| || |||| |||||||  | |||||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  4605 gtgattggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggagtatgatgtaagtatt 4509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8190 - 7927
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||        
T  8190 aatataattgggtgttgttctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtcaatgcatcatagtcgtgttgag 8091  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  8090 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 7991  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7990 cttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7809 - 7704
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||    
T  7809 tgatatatgtggttggtgaatgttcatgaaatgtgattaatgattgtttatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttg 7710  T
Q  366 ttcatg 371  Q
    ||||||    
T  7709 ttcatg 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7675 - 7576
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7675 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7699 - 7653
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7699 atgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 7653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14436 - 14171
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||        
T  14436 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattgtcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcttgttgag 14337  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| |||  | |||||||| |||||||    
T  14336 attgtagttgtaaaagggttgaattcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtcaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgac 14237  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 264  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14236 cttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttat 14171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6304 - 6024
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||        
T  6304 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgttcatgaatcatagtcgtgttgag 6205  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||  | ||||||||||||||||    
T  6204 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgac 6105  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6104 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtttta-ttgatatatgtgattg 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27332 - 27067
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||        
T  27332 aatataattgggttttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcttgttgag 27233  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  27232 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 27133  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 264  Q
    |||  || |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27132 cttgaggtgatccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttat 27067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 138215 - 138502
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||        
T  138215 aatataattaggtgttgtcctatatattgaagtgaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcgagtccctgtacatgtccatgcatcatagtcgtgttgag 138313  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  138314 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 138413  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  138414 cttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 138502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 76855 - 76750
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  76855 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 76757  T
Q  289 tcatgaa 295  Q
     ||||||    
T  76756 gcatgaa 76750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 87199 - 87104
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  87199 aatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 87104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 76772 - 76670
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||       |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  76772 tgtgattggtgattgtgcatgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 76673  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  76672 att 76670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 77124 - 77046
Alignment:
Q  30 tcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  77124 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 77046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Original strand, 138487 - 138588
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||       |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  138487 tgtgattggtgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 138586  T
Q  416 at 417  Q
    ||    
T  138587 at 138588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 56582 - 56429
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56582 gggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtttgaattcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgaccttttggtgatttgg 56483  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56482 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg 56429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 58956 - 58904
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtc 64  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  58956 aatataattgggtgtcgtcttatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtc 58904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 371
Target Start/End: Original strand, 20905 - 21085
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  20905 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaat-gatatatgtgattggtgattgtt 21003  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21004 catgaaatgtgattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 21085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 272 - 404
Target Start/End: Original strand, 21114 - 21246
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21114 atgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata 21213  T
Q  372 tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21214 tgattgatgattattgatgtgagatattggggt 21246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Original strand, 21090 - 21136
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21090 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 21136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Original strand, 20691 - 20743
Alignment:
Q  55 gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20691 gattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 20743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31342 - 31194
Alignment:
Q  277 attggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatc 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |     
T  31342 attggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgattattgttcatatgttt 31243  T
Q  377 gatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31242 gacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 31194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 129143 - 128872
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg-tgtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    | ||||| | ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  129143 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgatgtcgt 129044  T
Q  111 tgtg---gggttgagct-cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||||||    
T  129043 tgtaaaagagttcggcttcttttacttcggagattatgtaaggag----tgaccccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttg 128948  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  128947 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattg 128872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 78323 - 78207
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||     ||  ||     
T  78323 gggttcagctcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctt-----gaggtga 78229  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  78228 taccacatgcatttatgtgtca 78207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 281
Target Start/End: Original strand, 90599 - 90689
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattgg 281  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  90599 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctta-ttgatgtatgtgattgg 90689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 128750 - 128678
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  128750 tgatacatgtaattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgatacatgtaattggtgattgt 128678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 90734 - 90779
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  90734 atgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattattcatg 90779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 305 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 998 - 878
Alignment:
Q  305 atgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  998 atgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcatatgattgatgaatattgatgtgagatatcggggt 899  T
Q  405 gtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  898 gtgatgtaagtattaatgtgt 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 283
Target Start/End: Original strand, 1 - 92
Alignment:
Q  192 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 425
Target Start/End: Original strand, 258 - 374
Alignment:
Q  310 tattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatat-gggggtgtga 408  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  258 tattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattggtcatatgattgatgaatattgatgtgagatatcgggggtgtga 357  T
Q  409 tgtaagtattaatgtgt 425  Q
    |||||||||||||||||    
T  358 tgtaagtattaatgtgt 374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 19313 - 19425
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatg 422  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19313 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcatatgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatg 19412  T
Q  423 tgtggtaattatt 435  Q
    |||| | ||||||    
T  19413 tgtgattattatt 19425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Original strand, 19241 - 19328
Alignment:
Q  200 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19241 ttttggagatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtctt-tttgatatatgtgattggtgattgt 19328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 18982 - 19070
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  18982 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgtatcata 19070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7300 - 7120
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||    
T  7300 aggtgacgaccttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggtt-gtgattgt 7203  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7202 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 7120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 7550 - 7459
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7550 aatataattgggagtggtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 7459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 17494 - 17769
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17494 aatatcattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgt 17592  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  17593 tgtaaaagggatga-ctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 17690  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  17691 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg 17769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8836 - 8571
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt---- 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||        
T  8836 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcttgttgag 8737  T
Q  108 -----agttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
         ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |   |||| |||||||| |    
T  8736 tttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgaatcggaggtgacggc 8637  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||    
T  8636 cttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtctt 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30108 - 29832
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |     
T  30108 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 30010  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    |  ||||||| |||||||||||| |     
T  30009 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29911  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  29910 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtg 29832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44627 - 44492
Alignment:
Q  291 atgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatg 390  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  44627 atgaaatgtggttaatgattattaataatgattgtgatttgcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattattcatatgattgatggttattgatg 44528  T
Q  391 tgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg 426  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||    
T  44527 tgagatattggaatatgatgtaagtatcaatgtgtg 44492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31091 - 30946
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  31091 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgaatgtt 30993  T
Q  290 catgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||||||| ||||||    
T  30992 catgaaatgtgattaatgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 30946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44693 - 44637
Alignment:
Q  196 gaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44693 gaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataa 44637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30962 - 30917
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  30962 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattgatgaatgttcatg 30917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 337
Target Start/End: Original strand, 3818 - 4045
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  3818 gggttgagctcttttacttcggagattatataagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgg 3917  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatg--aaatgtgattaatgac 309  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  | ||||||||| || |||| ||||  |||||||||| ||||     
T  3918 taccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtattattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgataaatgtgattgatgat 4017  T
Q  310 tattcatgataattgtgattggcgattg 337  Q
    | ||||||| |  ||||||||| |||||    
T  4018 tgttcatgacacatgtgattggtgattg 4045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37870 - 37770
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  37870 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggt 37771  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  37770 g 37770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38044 - 37952
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  38044 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 37952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27778 - 27684
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27778 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 27684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18152 - 18040
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgtt 289  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18152 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgtt 18054  T
Q  290 catgaaatgtgatt 303  Q
    ||||||||||||||    
T  18053 catgaaatgtgatt 18040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18047 - 18002
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18047 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatg 18002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17979 - 17874
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||||  ||| |||||||| |||    
T  17979 tgataaatgtgattgatgattgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttg 17880  T
Q  366 ttcatg 371  Q
    ||||||    
T  17879 ttcatg 17874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18372 - 18344
Alignment:
Q  79 tattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372 tattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 18344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 11330 - 11429
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330 aatataattgggtcttgtcctatatattgtggagaaaattgtgatttttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgtagttg 11429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38094 - 37932
Alignment:
Q  126 ttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||    
T  38094 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgca 37995  T
Q  225 tttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    | || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  37994 tgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-gtgatgtatgtgattggtgattgt 37932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37947 - 37899
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37947 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatg 37899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 77995 - 77877
Alignment:
Q  190 ggtgacgacc-ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||| |  |    
T  77995 ggtgacgacccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatttg-gaaatgtgattggtgatctt 77897  T
Q  289 tcatgaaatgtgattaatga 308  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  77896 tcatgaaatatgattaatga 77877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 38968 - 38873
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38968 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 38873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 78309 - 78214
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  78309 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 78214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36214 - 36142
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgt 338  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  36214 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgactgttcatgataaatgtggttggtgattgt 36142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 44555 - 44512
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44555 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtga 44512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 77845 - 77738
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaa--atgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataat 363  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||   || ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  77845 tgatgtatatgattggtgattgttcatgatgtatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatt 77746  T
Q  364 tgttcatg 371  Q
    ||||||||    
T  77745 tgttcatg 77738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 371
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15990
Alignment:
Q  213 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactat 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | || | |    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattc-ataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgt 15931  T
Q  313 tcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  15932 tcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatg 15990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 14143 - 14255
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||| |  ||||   ||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  14143 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgaccttgaggtgatttggtaccacat 14242  T
Q  222 gcatttatgtgtc 234  Q
    |||| ||| ||||    
T  14243 gcatgtatctgtc 14255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17146 - 17068
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttg 267  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17146 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg 17068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 17404 - 17314
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17404 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgggattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 17314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 803 - 712
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  803 ggtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 619
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  669 catgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1026 - 964
Alignment:
Q  46 gaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1026 gaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcgtgt 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25658 - 25384
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  25658 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggtgattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgttgttgct 25559  T
Q  112 gtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttgg 205  Q
    ||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||  ||||| |  || || |||| ||||||||||||| | |    
T  25558 gtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttg 25462  T
Q  206 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  25461 agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtg 25384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21229 - 21129
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  21229 catcggaggtgacgaccttgttgagatatggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggt 21130  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  21129 g 21129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21403 - 21311
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtgattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    | || ||||||||| ||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  21403 aatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggtgattgttatcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 21311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44495 - 44359
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattg 365  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  | | |||||||||| | |||||||||  |||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  44495 tgatatatgtggttggtgattgttcatcgagtatgattaatgattgttcatgata--tgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattg 44398  T
Q  366 ttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44397 ttcatatgatcgatgtttattgatgtgagatattggggt 44359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 52665 - 52528
Alignment:
Q  266 tgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgatt-gtgaatgaatatttgtgaattgataatt 364  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||  |||||| || |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  52665 tgatatatgtggttggtgattgttcatggagtatgattaatgattgttcatgata--tgtgatcggtgatttgtgtatgaataattgtgagttgataatt 52568  T
Q  365 gttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  52567 gttcatatgattgatgactattgatctgagatattggggt 52528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 1045 - 1137
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1045 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtg 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 799 - 894
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  799 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgaatcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Original strand, 1127 - 1229
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||       |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1127 tgtgattggtgattgggtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagt 1226  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  1227 att 1229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 3152 - 3252
Alignment:
Q  183 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  3152 catcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggt 3251  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  3252 g 3252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 23103 - 23194
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23103 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 23194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 2978 - 3070
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||| ||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  2978 aatataattgggtgtcgtcctatatattgagttgaga-ttgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttacacatgtccatgcatcatagtcgt 3070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 7188 - 7308
Alignment:
Q  116 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| | ||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  7188 ggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggt 7287  T
Q  215 accacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7288 accacatgcatttatgtgtca 7308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 15266 - 15361
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15266 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 15361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Original strand, 15530 - 15623
Alignment:
Q  190 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||  ||||||||||    
T  15530 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtg 15623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 288
Target Start/End: Original strand, 26414 - 26512
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26414 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 26512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 26128 - 26223
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26128 aatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 26223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 70801 - 71004
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc-------- 103  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||            
T  70801 aatataaatgggtgttatcctatatattgaggagaaacttgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcatgttgag 70900  T
Q  104 -gtgtagttgt---ggggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
      |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  70901 attgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagataggtgtgaaatcttccatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgac 71000  T
Q  199 cttt 202  Q
    ||||    
T  71001 cttt 71004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 266
Target Start/End: Original strand, 66337 - 66391
Alignment:
Q  212 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttattt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  66337 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattt 66391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 371
Target Start/End: Original strand, 26497 - 26545
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  26497 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgagatttgttcatg 26545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31305 - 31208
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31305 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattggtgattgt 31208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31223 - 31122
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31223 tgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggt-tgatgtaagt 31125  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  31124 att 31122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 78356 - 78477
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||  || ||||  |    
T  78356 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgattcag 78455  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  78456 taccacatgcatttatgtgtca 78477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Original strand, 4878 - 4996
Alignment:
Q  117 gttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||||||||  || |||| ||||    
T  4878 gttgagctcttttacttcggagattatgtatgacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatc-aaggtgacgaccttgaggtgattcggta 4976  T
Q  216 ccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4977 ccacatgcatttatgtgtca 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28642 - 28547
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28642 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgttcatgcatcatagtcgtgt 28547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28328 - 28253
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatt 265  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28328 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 28253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28149 - 28035
Alignment:
Q  312 ttcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggt 404  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  28149 ttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggt 28050  T
Q  405 g--tgatgtaagtat 417  Q
    |  ||||||||||||    
T  28049 gtttgatgtaagtat 28035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 68962 - 68820
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  68962 ctcttttacttgggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacat 68863  T
Q  222 gcatttatgtgtc--aataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    |||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||    
T  68862 gcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtctt 68820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 69523 - 69432
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  69523 aatataattgggagttgtcctatatattgtggttaaaattgtgaattgttgtcgcactatcgagtcctgttacatgtccatgcatcatagtc 69432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 30833 - 30738
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30833 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtcttgctacatgtccatgcatcatagtcgtgt 30738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 163903 - 163817
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtg 276  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  163903 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtg 163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 118128 - 118249
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||  |||||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||  || ||||  |    
T  118128 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagatggctgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgaatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcag 118227  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  118228 taccacatgcatatatgtgtca 118249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 15100 - 15195
Alignment:
Q  335 ttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgt 423  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15100 ttgtgaatgaatattagtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgattattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgt 15195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 15022 - 15097
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  15022 gattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatacatgtgactggtg 15097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 178
Target Start/End: Original strand, 23949 - 24012
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  23949 gggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtgtt 24012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 14667 - 14762
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| |||| |||||  ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14667 aatataattaggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttttgtcgcattatcgagtccttatacttgtccatgcatcatagttgtgt 14762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26636 - 26535
Alignment:
Q  323 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26636 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattatgaatgtgagatattggggt-tgatgtaagt 26538  T
Q  416 att 418  Q
    |||    
T  26537 att 26535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 71802 - 71923
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||  || |||||||    
T  71802 gggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgatttgg 71901  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  71902 taccacaggcatttatgcgtca 71923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 2245 - 2337
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  2245 aatataagtgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcg 2337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 280
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3795
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattg 280  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3706 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagt-tttgttgatatatgtgattg 3795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 6765 - 6857
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  6765 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtagcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcg 6857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 7013 - 7109
Alignment:
Q  191 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgt 288  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  7013 gtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgtttggtgattgt 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 6326 - 6412
Alignment:
Q  207 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||    
T  6326 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattaatgattgttcatga 6412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 371
Target Start/End: Original strand, 6390 - 6465
Alignment:
Q  296 atgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  6390 atgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatg 6465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 6012 - 6106
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||  |||  |||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  6012 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt-gcgagtccttatacatgtccatggatcatactcgtgt 6106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 13145 - 13240
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgt-gattgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13145 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattatggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtagtgt 13240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 13433 - 13517
Alignment:
Q  190 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtg 276  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  13433 ggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtct--tttgatatatgtg 13517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 417
Target Start/End: Original strand, 13547 - 13655
Alignment:
Q  315 atgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtg 407  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||       ||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  13547 atgatatttgtgattggtgattgtgtataaataattgtgaattgat-attgttcatgacacatgtgattagtgaatattgatgtgagatattggggtttg 13645  T
Q  408 atgtaagtat 417  Q
    ||||||||||    
T  13646 atgtaagtat 13655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 425
Target Start/End: Original strand, 15094 - 15165
Alignment:
Q  354 aattgataattgttcatgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 425  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15094 aattgataattgttcatatgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtattaatgtgt 15165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 32340 - 32245
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32340 aatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 32245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 212
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  325 gctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 226  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  225 tgcatatatgtgtc 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5380 - 5267
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  5380 gctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5281  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  5280 tgcatatatgtgtc 5267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2261
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgtag-- 109  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||      
T  2030 aatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatagagtcttgttacatgttcatgcatcatagtcatgtagag 2129  T
Q  110 -------ttgtg---gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgac 198  Q
           ||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||     
T  2130 tttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgaatcgaaggtgacgat 2229  T
Q  199 cttttggagatttggtaccacatgcatttatg 230  Q
    |||  || |||  |||||||||||||||||||    
T  2230 cttgaggtgatccggtaccacatgcatttatg 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 4596 - 4507
Alignment:
Q  16 ataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  4596 ataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcacattatcgagtcttattacatgtccatccatcgtagtcg 4507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Original strand, 2524 - 2574
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2524 catgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 2574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34114 - 33993
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||   ||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| ||  || |||| ||    
T  34114 gggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacaggtgtgaaatgttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgactttgaggtgattcgg 34015  T
Q  214 taccacatgcatttatgtgtca 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  34014 taccacatgtatttatgtgtca 33993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25875 - 25757
Alignment:
Q  243 catatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaat 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| || ||| ||||| |||| |||||  ||| |||||  ||||||||||    
T  25875 catatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaattgagatgaatgattattgatgatgtttgagattgatgattgtgaat 25783  T
Q  343 gaatatttgtgaattgataattgttc 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25782 gaatatttgtgaattgatatttgttc 25757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 94755 - 94665
Alignment:
Q  227 tatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  94755 tatgggtcactaggtgcatatcatgacatgagtcttatat-ataaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 94665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 95078 - 94983
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  95078 aatataattgagtgttgttctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtacatgtccatgcatcatagtcgtgt 94983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 66843 - 67067
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgt-gtagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |     
T  66843 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttgaga-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtcattagacatgtccatgcatcatagtcgttgttgc 66941  T
Q  111 tgtg---gggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttg 204  Q
    |||    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||    |  || |||| |||||||||||| |     
T  66942 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcaacgaaaggtgacgaccttgtt 67039  T
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  67040 gagatttggtacctcatgcatttatgtg 67067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 94615 - 94570
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  94615 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatg 94570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 71856 - 71950
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcgtg 106  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||| || ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  71856 aatataattgggagttatcctatatattgtggtgaaaattgagaattgttgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtcgtg 71950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 262
Target Start/End: Original strand, 72104 - 72177
Alignment:
Q  189 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctt 262  Q
    |||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  72104 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 362
Target Start/End: Original strand, 166144 - 166234
Alignment:
Q  272 atgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataa 362  Q
    ||||||||  || ||||||||||| | ||||| | || | |||||||||  |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  166144 atgtgattaatgattgttcatgaagtatgattgaggattgttcatgatatatgtgatcggcgattgtgtataaatctttgtgaattgataa 166234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3913 - 3800
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  3913 gctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 3814  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  3813 tgcatatatgtgtc 3800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3187
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  3095 aatataattgagtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 3187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 27915 - 28007
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtg-attgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtcg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  27915 aatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcccattatcgagtccttatacatgtccatgcatcatagtcg 28007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1610 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1610
Description:

Target: scaffold1610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Original strand, 1 - 52
Alignment:
Q  384 attgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1 attgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggttattatt 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1605 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1605
Description:

Target: scaffold1605; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1578 - 1527
Alignment:
Q  384 attgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggtaattatt 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1578 attgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtggttattatt 1527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4672 - 4587
Alignment:
Q  115 gggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttatcatcgaaggtgacgacct 200  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||    
T  4672 gggttgggctcttttacttcagagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtgttgatgcatcgaaggtgacgacct 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3392 - 3242
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||  |||| |||  | ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  3392 ctcttatacttcggtgattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctagaggtgatttggtaccacat 3293  T
Q  222 gcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---taacatgagtcttatttg 267  Q
    |||| ||||||||  | || ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  3292 gcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatttg 3242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 25142 - 25255
Alignment:
Q  122 gctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  |||  ||||||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  25142 gctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatttaaggtgacgaccttgaggtgattttgtaccaca 25241  T
Q  221 tgcatttatgtgtc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  25242 tgcatatatgtgtc 25255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Original strand, 24878 - 24942
Alignment:
Q  219 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  24878 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 24942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 6740 - 6831
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtattacatgtccatgcatcatagtc 103  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6740 aatataattggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtcttgttacatgtccatgcatcatagtc 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 318
Target Start/End: Original strand, 393 - 448
Alignment:
Q  263 atttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatga 318  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  393 atttgatatatgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1337 - 1244
Alignment:
Q  269 tatatgtgattggtgtttgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataa 362  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| | || | |||||||||  |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1337 tatatgtggttggtgattgttcatgaagtatgattgaggattgttcatgatatatgtgatcggtgattgtgtatgaatctttgtgaattgataa 1244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23174 - 23124
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23174 catgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 23124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29771 - 29721
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtatt 418  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29771 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatt 29721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7130 - 7039
Alignment:
Q  205 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcataacatgagtcttatttgatat-atgtgattggtgtttgttcatga 294  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||    
T  7130 gagaattggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcataacatgagtc-tatttgatgtaatgtgattgatgaatgttcatga 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 56025 - 55920
Alignment:
Q  123 ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatatgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||| |  ||||   ||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  56025 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggggattttgtaccacat 55926  T
Q  222 gcattt 227  Q
    ||||||    
T  55925 gcattt 55920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 4525 - 4576
Alignment:
Q  320 aattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg 371  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  4525 aattgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatg 4576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 415
Target Start/End: Original strand, 9989 - 10036
Alignment:
Q  368 catgtgatcgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 415  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9989 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 10036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1902 - 1816
Alignment:
Q  211 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgtttgttcatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| || |||| ||||||    
T  1902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgaa 1816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 2176 - 2080
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgta-ttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2176 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgaatctttgttacatgtccatgcatcatagtcgtgt 2080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20456 - 20360
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtat-tacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  20456 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtctttgctacatgtccatgcatcatagtcgtgt 20360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27285 - 27189
Alignment:
Q  13 aatataattgggtgttgtcctatagattgaggagaaaattgtga-ttgttgtcatattatcgagtcgtat-tacatgtccatgcatcatagtcgtgt 107  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  27285 aatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtctttgctacatgtccatgcatcatagtcgtgt 27189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University