View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6641_low_3 (Length: 698)

Name: NF6641_low_3
Description: NF6641
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6641_low_3
NF6641_low_3
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (202-698)||(43137334-43137839)
chr2 (15-165)||(43137877-43138027)
chr2 (563-698)||(18808978-18809113)
chr2 (563-698)||(23709524-23709659)
chr2 (563-698)||(23712005-23712140)
chr2 (563-698)||(24367809-24367944)
chr2 (563-698)||(39682348-39682483)
chr2 (550-698)||(32039477-32039625)
chr2 (563-698)||(571432-571567)
chr2 (563-698)||(6726030-6726165)
chr2 (563-698)||(21155052-21155187)
chr2 (563-698)||(23130897-23131032)
chr2 (563-698)||(23133364-23133499)
chr2 (563-698)||(26505414-26505549)
chr2 (563-698)||(26507892-26508027)
chr2 (563-698)||(32214913-32215048)
chr2 (563-698)||(34402514-34402649)
chr2 (563-697)||(24898187-24898321)
chr2 (563-697)||(24900670-24900804)
chr2 (563-697)||(24903147-24903281)
chr2 (563-697)||(24905624-24905758)
chr2 (563-697)||(24908099-24908233)
chr2 (563-698)||(23135625-23135760)
chr2 (563-698)||(28577134-28577269)
chr2 (563-698)||(22105447-22105583)
chr2 (563-698)||(45029846-45029981)
chr2 (563-696)||(24529520-24529654)
chr2 (566-698)||(38967409-38967542)
chr2 (550-648)||(24642835-24642933)
chr2 (571-698)||(22337153-22337281)
chr2 (571-698)||(23076480-23076608)
chr2 (571-698)||(23060551-23060679)
chr2 (563-698)||(19671868-19672003)
chr2 (571-698)||(22731189-22731317)
chr2 (550-610)||(22173808-22173868)
chr2 (571-662)||(7688-7779)
chr2 (565-641)||(22459511-22459587)
chr2 (571-698)||(23660061-23660188)
chr2 (571-698)||(22738135-22738262)
chr2 (565-698)||(23708568-23708702)
chr2 (571-698)||(23285903-23286027)
chr2 (655-698)||(24643034-24643077)
chr2 (637-698)||(38136-38197)
chr2 (571-698)||(298769-298898)
chr2 (571-698)||(23654341-23654469)
chr2 (571-649)||(23791363-23791440)
chr2 (588-698)||(23103369-23103478)
chr2 (571-606)||(20520148-20520183)
chr2 (571-649)||(24697561-24697638)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (550-698)||(18215253-18215401)
chr4 (563-698)||(12299-12434)
chr4 (563-698)||(15118344-15118479)
chr4 (563-698)||(52312545-52312680)
chr4 (563-698)||(44773079-44773214)
chr4 (563-698)||(3515042-3515177)
chr4 (563-698)||(19618164-19618299)
chr4 (555-698)||(44102249-44102392)
chr4 (563-698)||(44615323-44615458)
chr4 (563-698)||(50222331-50222466)
chr4 (565-698)||(19242734-19242867)
chr4 (563-698)||(15355316-15355452)
chr4 (550-698)||(51463847-51463995)
chr4 (563-698)||(1837501-1837636)
chr4 (563-698)||(14970699-14970834)
chr4 (563-698)||(18239411-18239546)
chr4 (563-698)||(23803257-23803392)
chr4 (563-698)||(21815577-21815712)
chr4 (565-698)||(44928873-44929007)
chr4 (563-698)||(15367728-15367864)
chr4 (563-698)||(15402741-15402877)
chr4 (563-698)||(15371240-15371376)
chr4 (563-698)||(15373521-15373657)
chr4 (563-691)||(20149871-20150000)
chr4 (563-698)||(15370056-15370191)
chr4 (563-698)||(16223570-16223706)
chr4 (550-698)||(12610985-12611126)
chr4 (563-665)||(7641184-7641286)
chr4 (571-698)||(14038686-14038814)
chr4 (563-660)||(22353910-22354007)
chr4 (571-698)||(16377478-16377604)
chr4 (622-698)||(14280351-14280427)
chr4 (591-698)||(54798729-54798837)
chr4 (565-698)||(7798812-7798946)
chr4 (571-698)||(7088915-7089043)
chr4 (571-698)||(7893741-7893869)
chr4 (571-698)||(12902795-12902923)
chr4 (571-698)||(22636473-22636601)
chr4 (624-698)||(52873375-52873450)
chr4 (565-662)||(13800-13897)
chr4 (562-698)||(6899929-6900065)
chr4 (571-698)||(16270191-16270318)
chr4 (571-695)||(44052870-44052995)
chr4 (591-698)||(8574844-8574950)
chr4 (573-698)||(16239927-16240052)
chr4 (565-643)||(43198502-43198580)
chr4 (573-662)||(15464888-15464977)
chr4 (571-698)||(23374314-23374442)
chr4 (565-649)||(52243143-52243227)
chr4 (652-698)||(3096331-3096378)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (563-698)||(14409436-14409571)
chr8 (563-698)||(1484437-1484572)
chr8 (563-698)||(5853284-5853419)
chr8 (563-698)||(16413308-16413443)
chr8 (563-698)||(20403262-20403397)
chr8 (563-698)||(15203223-15203358)
chr8 (563-698)||(22001788-22001923)
chr8 (563-698)||(41598223-41598358)
chr8 (563-695)||(14823811-14823943)
chr8 (563-698)||(20046187-20046322)
chr8 (563-690)||(4483323-4483450)
chr8 (563-698)||(19896300-19896438)
chr8 (563-698)||(4542365-4542500)
chr8 (563-698)||(19801374-19801508)
chr8 (555-698)||(45290678-45290822)
chr8 (563-698)||(26223954-26224089)
chr8 (565-670)||(25484269-25484374)
chr8 (563-698)||(19936997-19937133)
chr8 (565-698)||(15070593-15070727)
chr8 (571-698)||(16092297-16092425)
chr8 (571-698)||(6759296-6759421)
chr8 (565-698)||(18818358-18818492)
chr8 (571-698)||(28648999-28649127)
chr8 (584-698)||(7372816-7372931)
chr8 (571-698)||(21918955-21919083)
chr8 (565-649)||(13508034-13508118)
chr8 (571-698)||(20536246-20536374)
chr8 (571-698)||(22875103-22875230)
chr8 (563-618)||(24486036-24486091)
chr8 (591-698)||(26219752-26219858)
chr8 (565-662)||(13597566-13597663)
chr8 (570-698)||(23406417-23406548)
chr8 (588-698)||(21923900-21924011)
chr8 (565-662)||(20498637-20498734)
chr8 (571-698)||(22626774-22626901)
chr8 (591-698)||(26225268-26225374)
chr8 (563-610)||(32810054-32810101)
chr8 (565-662)||(17612059-17612156)
chr8 (571-698)||(18879191-18879314)
chr8 (571-698)||(31971295-31971421)
chr8 (571-649)||(17439461-17439538)
chr8 (571-649)||(37116437-37116514)
chr8 (637-698)||(45131019-45131079)
chr8 (571-649)||(17266948-17267025)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (550-698)||(22782262-22782410)
chr6 (563-698)||(12742352-12742487)
chr6 (563-698)||(19005081-19005216)
chr6 (563-698)||(19858911-19859046)
chr6 (563-698)||(24422582-24422717)
chr6 (563-698)||(33861829-33861964)
chr6 (563-698)||(33864313-33864448)
chr6 (543-698)||(3851989-3852144)
chr6 (563-698)||(8055064-8055199)
chr6 (563-698)||(18334584-18334719)
chr6 (563-698)||(18456754-18456889)
chr6 (563-698)||(30676702-30676837)
chr6 (563-698)||(34963408-34963543)
chr6 (550-698)||(20556873-20557019)
chr6 (550-698)||(25754844-25754992)
chr6 (563-698)||(1540903-1541038)
chr6 (563-698)||(2291172-2291307)
chr6 (563-698)||(26924632-26924767)
chr6 (563-698)||(16448518-16448654)
chr6 (563-698)||(1595584-1595719)
chr6 (563-698)||(25688537-25688672)
chr6 (581-698)||(18461914-18462031)
chr6 (565-698)||(25656664-25656797)
chr6 (574-698)||(29060578-29060703)
chr6 (571-698)||(25629310-25629438)
chr6 (571-695)||(18409782-18409907)
chr6 (571-695)||(20593814-20593939)
chr6 (571-698)||(20360915-20361043)
chr6 (571-698)||(25644358-25644487)
chr6 (571-698)||(18821801-18821927)
chr6 (571-698)||(16496282-16496410)
chr6 (571-698)||(19303496-19303623)
chr6 (588-698)||(17287768-17287879)
chr6 (565-662)||(8227460-8227557)
chr6 (563-698)||(19847941-19848078)
chr6 (624-698)||(20076738-20076812)
chr6 (565-649)||(20109226-20109312)
chr6 (588-698)||(22780199-22780310)
chr6 (631-698)||(20638298-20638366)
chr6 (575-662)||(23019481-23019567)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (550-698)||(8899129-8899277)
chr3 (563-698)||(9707599-9707734)
chr3 (563-698)||(17463213-17463348)
chr3 (563-698)||(38961883-38962018)
chr3 (563-698)||(45606899-45607034)
chr3 (568-698)||(29172580-29172710)
chr3 (563-698)||(7781339-7781474)
chr3 (563-698)||(10247715-10247850)
chr3 (563-698)||(16454273-16454408)
chr3 (563-698)||(17446647-17446782)
chr3 (563-698)||(34159361-34159496)
chr3 (563-698)||(55476526-55476661)
chr3 (563-697)||(13151782-13151916)
chr3 (563-697)||(13154247-13154381)
chr3 (563-698)||(6469126-6469261)
chr3 (563-698)||(12567595-12567730)
chr3 (563-698)||(13544060-13544195)
chr3 (563-698)||(16282803-16282938)
chr3 (563-698)||(28848603-28848738)
chr3 (550-698)||(50242857-50243005)
chr3 (555-698)||(17672661-17672804)
chr3 (563-698)||(41123925-41124057)
chr3 (563-698)||(53070645-53070780)
chr3 (550-698)||(43550457-43550606)
chr3 (563-694)||(12119716-12119848)
chr3 (565-698)||(8499553-8499687)
chr3 (565-698)||(15412464-15412598)
chr3 (602-698)||(15977550-15977646)
chr3 (571-698)||(14972892-14973020)
chr3 (571-698)||(40213676-40213803)
chr3 (571-697)||(42386449-42386576)
chr3 (622-698)||(55500977-55501053)
chr3 (571-698)||(25476340-25476468)
chr3 (591-698)||(36166633-36166739)
chr3 (565-698)||(43840970-43841104)
chr3 (571-698)||(14576788-14576915)
chr3 (571-698)||(17487894-17488022)
chr3 (571-698)||(17499376-17499504)
chr3 (591-698)||(21618484-21618590)
chr3 (565-698)||(26686925-26687059)
chr3 (622-698)||(18438572-18438649)
chr3 (565-649)||(24340672-24340756)
chr3 (622-698)||(12399247-12399324)
chr3 (565-649)||(2051148-2051232)
chr3 (571-698)||(13442312-13442440)
chr3 (571-698)||(20698391-20698518)
chr3 (571-698)||(23083316-23083444)
chr3 (634-698)||(44494844-44494908)
chr3 (563-617)||(17248233-17248287)
chr3 (630-698)||(10557020-10557088)
chr3 (565-649)||(52523676-52523760)
chr3 (565-698)||(23274725-23274859)
chr3 (565-662)||(22147474-22147571)
chr3 (565-662)||(37642214-37642311)
chr3 (571-698)||(24153164-24153291)
chr3 (565-698)||(53301499-53301634)
chr3 (565-644)||(27165340-27165419)
chr3 (571-698)||(11424718-11424842)
chr3 (622-698)||(14572627-14572703)
chr3 (635-698)||(17737271-17737337)
chr3 (565-649)||(16097416-16097499)
chr3 (573-649)||(43926048-43926123)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (563-698)||(20782-20917)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (563-698)||(37856-37991)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (563-698)||(94446-94581)
scaffold0023 (563-698)||(17432-17567)
scaffold0023 (574-698)||(44489-44614)
scaffold0023 (575-698)||(100412-100534)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (563-698)||(158442-158577)
scaffold0003 (571-698)||(339905-340030)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (563-698)||(456356-456491)
chr7 (543-698)||(3386368-3386523)
chr7 (563-698)||(11393279-11393414)
chr7 (563-698)||(11972531-11972666)
chr7 (563-698)||(15376705-15376840)
chr7 (563-698)||(16232555-16232690)
chr7 (563-698)||(18640307-18640442)
chr7 (563-698)||(20385115-20385250)
chr7 (563-698)||(21189587-21189722)
chr7 (563-698)||(27216895-27217030)
chr7 (563-698)||(32125526-32125661)
chr7 (563-698)||(41522952-41523087)
chr7 (563-698)||(41525414-41525549)
chr7 (563-698)||(14949114-14949249)
chr7 (563-698)||(24702273-24702408)
chr7 (563-694)||(44116548-44116679)
chr7 (550-698)||(13647363-13647512)
chr7 (563-698)||(16410094-16410229)
chr7 (563-698)||(16213719-16213854)
chr7 (563-698)||(18430747-18430882)
chr7 (563-697)||(12756663-12756797)
chr7 (584-698)||(24275206-24275320)
chr7 (563-698)||(24704723-24704855)
chr7 (563-678)||(26355975-26356090)
chr7 (563-678)||(26358427-26358542)
chr7 (563-698)||(17061907-17062042)
chr7 (555-698)||(38898360-38898504)
chr7 (563-668)||(20110611-20110716)
chr7 (565-698)||(13869381-13869515)
chr7 (622-698)||(48273427-48273504)
chr7 (571-698)||(3564319-3564447)
chr7 (607-698)||(13831408-13831499)
chr7 (550-640)||(15081928-15082019)
chr7 (565-698)||(26212034-26212168)
chr7 (565-662)||(2280068-2280165)
chr7 (571-698)||(12698869-12698998)
chr7 (571-698)||(18456368-18456495)
chr7 (571-698)||(38227519-38227646)
chr7 (571-698)||(9509227-9509355)
chr7 (622-698)||(10589077-10589154)
chr7 (565-649)||(15113031-15113114)
chr7 (565-662)||(19486693-19486790)
chr7 (565-649)||(12255740-12255824)
chr7 (565-649)||(15116568-15116651)
chr7 (571-698)||(15143993-15144120)
chr7 (571-606)||(15008454-15008489)
chr7 (571-606)||(20220145-20220180)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (563-698)||(264760-264895)
chr5 (563-698)||(29329969-29330104)
chr5 (563-698)||(29346015-29346150)
chr5 (563-698)||(39363419-39363554)
chr5 (563-698)||(42245357-42245492)
chr5 (555-698)||(36154767-36154907)
chr5 (563-698)||(10732932-10733067)
chr5 (563-698)||(20909047-20909182)
chr5 (563-698)||(29348488-29348623)
chr5 (563-698)||(29350961-29351096)
chr5 (563-698)||(32027428-32027563)
chr5 (563-698)||(18319025-18319161)
chr5 (563-698)||(20902000-20902136)
chr5 (563-698)||(39245171-39245306)
chr5 (563-698)||(11581191-11581326)
chr5 (563-698)||(2154605-2154741)
chr5 (566-698)||(10775670-10775803)
chr5 (563-694)||(24067146-24067278)
chr5 (563-698)||(31061103-31061239)
chr5 (563-698)||(20917944-20918075)
chr5 (565-698)||(23064546-23064680)
chr5 (565-698)||(38619469-38619603)
chr5 (571-698)||(9077990-9078118)
chr5 (571-698)||(25431432-25431560)
chr5 (571-698)||(1096505-1096633)
chr5 (571-698)||(23390451-23390579)
chr5 (571-698)||(25421570-25421698)
chr5 (571-698)||(21729019-21729147)
chr5 (571-698)||(21808344-21808472)
chr5 (571-698)||(24529258-24529386)
chr5 (629-698)||(21997547-21997617)
chr5 (571-694)||(24493611-24493734)
chr5 (571-662)||(22144124-22144215)
chr5 (571-698)||(8286797-8286926)
chr5 (571-698)||(22075057-22075185)
chr5 (591-698)||(22412222-22412329)
chr5 (565-649)||(40725941-40726025)
chr5 (591-678)||(20766095-20766181)
chr5 (571-696)||(13025351-13025476)
chr5 (571-696)||(13095535-13095660)
chr5 (571-644)||(22178175-22178247)
chr5 (565-649)||(21565630-21565713)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (563-698)||(13988901-13989036)
chr1 (563-698)||(21475079-21475214)
chr1 (563-698)||(21923283-21923418)
chr1 (565-698)||(23593729-23593862)
chr1 (563-698)||(21840802-21840937)
chr1 (563-698)||(29776723-29776858)
chr1 (565-698)||(29298172-29298304)
chr1 (563-698)||(31612348-31612483)
chr1 (565-698)||(45574836-45574970)
chr1 (565-698)||(16361952-16362085)
chr1 (563-698)||(22123059-22123195)
chr1 (563-694)||(40389193-40389325)
chr1 (555-698)||(21707202-21707345)
chr1 (555-698)||(21711744-21711887)
chr1 (563-698)||(13212853-13212989)
chr1 (563-698)||(21346996-21347132)
chr1 (563-698)||(16275355-16275491)
chr1 (563-698)||(21342131-21342267)
chr1 (565-680)||(433062-433178)
chr1 (563-698)||(15860000-15860136)
chr1 (571-698)||(50210168-50210296)
chr1 (571-698)||(27250684-27250812)
chr1 (571-698)||(34509818-34509946)
chr1 (571-697)||(22532308-22532435)
chr1 (565-662)||(21861519-21861616)
chr1 (565-684)||(21896205-21896324)
chr1 (571-698)||(22468651-22468779)
chr1 (565-612)||(16758775-16758822)
chr1 (549-649)||(41049968-41050067)
chr1 (571-662)||(35261036-35261124)
chr1 (571-698)||(21026718-21026846)
chr1 (565-649)||(12271642-12271725)
chr1 (635-698)||(20847173-20847237)
chr1 (571-649)||(50686701-50686778)
chr1 (571-660)||(22354527-22354616)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (563-698)||(4729-4864)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (563-698)||(13982-14117)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (555-698)||(16819-16962)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (563-698)||(11323-11458)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (550-698)||(82107-82255)
scaffold0037 (565-649)||(22620-22703)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (563-698)||(10808-10943)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (563-698)||(13427-13562)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (563-698)||(134246-134381)
scaffold0028 (563-698)||(136715-136850)
scaffold0028 (563-698)||(139184-139319)
scaffold0028 (563-698)||(141653-141788)
scaffold0028 (563-698)||(144122-144257)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (563-698)||(501119-501254)
scaffold0001 (563-698)||(85571-85707)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (563-698)||(12241-12376)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (563-698)||(40435-40570)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (550-684)||(12107-12241)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (565-698)||(20373-20505)
scaffold0031 (571-698)||(128789-128916)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (550-698)||(141-289)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (555-698)||(4332-4475)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (563-698)||(9277-9412)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (563-698)||(29967-30102)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (563-698)||(79276-79411)
scaffold0056 (571-698)||(17170-17300)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (563-698)||(9784-9920)
scaffold0145 (571-698)||(32980-33107)
scaffold0145 (571-698)||(38799-38926)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (566-698)||(4249-4382)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (563-698)||(2120-2256)
scaffold0247 (565-649)||(17976-18060)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (550-694)||(1259-1404)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (563-698)||(161081-161217)
scaffold0007 (563-650)||(164582-164670)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (571-698)||(22921-23048)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (571-698)||(4545-4673)
scaffold0228 (571-698)||(12127-12255)
scaffold0228 (571-698)||(22079-22207)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (591-698)||(44682-44790)
scaffold0122 (571-698)||(26020-26148)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (571-672)||(3485-3586)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (571-698)||(3106-3233)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (571-698)||(16555-16683)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (571-698)||(13249-13377)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (565-698)||(51951-52085)
scaffold0011 (571-698)||(167934-168061)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (576-649)||(13092-13165)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (571-698)||(39515-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (571-698)||(75170-75297)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (571-698)||(1004-1131)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (571-698)||(3141-3269)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (571-698)||(1889-2017)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (571-697)||(4888-5015)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (591-698)||(116465-116571)
scaffold0022 (571-649)||(128925-129002)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (564-662)||(27697-27795)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (565-662)||(53498-53595)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (565-662)||(225482-225578)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (563-627)||(12039-12103)
scaffold0503 (657-698)||(12001-12042)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (571-698)||(3508-3636)
scaffold0292 (571-698)||(381-508)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (565-684)||(13144-13264)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (571-698)||(25934-26061)
scaffold0026 (571-698)||(39896-40023)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (565-698)||(38651-38785)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (565-698)||(8504-8640)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (571-698)||(24257-24386)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (571-698)||(32913-33039)
scaffold0120 (571-698)||(45966-46092)
scaffold0120 (572-698)||(16151-16278)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (565-698)||(11502-11636)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (564-662)||(13203-13302)
scaffold0357 (564-662)||(16048-16146)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (565-698)||(38205-38339)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (571-656)||(27911-27996)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (622-698)||(28452-28529)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (565-684)||(8482-8601)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (571-698)||(6076-6207)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (622-694)||(8521-8594)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (586-698)||(1990-2103)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (565-662)||(12643-12739)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (571-660)||(918-1006)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (565-649)||(8008-8092)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (563-610)||(6070-6117)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (571-637)||(60670-60736)
scaffold0010 (575-698)||(129943-130066)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (549-644)||(18170-18265)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (571-698)||(39951-40078)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (571-647)||(124675-124751)
scaffold0021 (588-698)||(174804-174913)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (575-662)||(8090-8176)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (637-698)||(11464-11526)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (571-649)||(97095-97172)
scaffold0006 (571-649)||(106373-106450)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (571-644)||(6238-6310)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (646-698)||(4750-4803)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (565-698)||(10491-10624)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (637-698)||(13535-13596)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (586-672)||(6675-6761)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (637-698)||(15485-15546)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (622-698)||(20948-21026)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (545-606)||(267791-267853)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (571-644)||(38411-38483)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 202 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 43137839 - 43137334
Alignment:
Q  202 aagttagcatatgcatatatttggcttgaatttagggatcgcttgctgcataactaaagggacatgatatcaagaattgttaattatccattagctgtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43137839 aagttagcatatgcatatatttggcttgaatttagggatcacttgctgcataactaaagggacatgatatcaagaattgttaactatccattagctgtaa 43137740  T
Q  302 aggatcgatttgtttgtggcttatgaattttaattttatttcggaaagcagtactggtgcatatctcaaagatgtcaatatagtgannnnnnnnag-aac 400  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || ||     
T  43137739 atgatcgatttggttgtggcttatgaattttaattttatttcggaaagcagtactggtgcatatctcaaagatgtcaatatagtgattttttttaggaat 43137640  T
Q  401 gtcaatat--------tttaaacttctcaatttcatatatgaaccttaaaaatgcaaattacagagtataattgatttcttttgagattcgaatgtttga 492  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137639 gtcaatatagtgatattttaaacttctcaatttcatatatgaaccttaaaaatgcaaattacagagtataattgatttcttttgagattcgaatgtttga 43137540  T
Q  493 attattttaaaataattttggtaactaatgatgtgtagcggtaaattaaattgatgatatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcat 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137539 attattttaaaataattttggtaactaatgatgtgtagcggtaaattaaattgatgatatgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcat 43137440  T
Q  593 tacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 692  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43137439 tacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttattta 43137340  T
Q  693 actaag 698  Q
    ||||||    
T  43137339 actaag 43137334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43138027 - 43137877
Alignment:
Q  15 ctttgtttgtcatgttttagttctctgacctttcattatttctacctaattgccgaactaaaccccatgtatgtttatcgatttaagaataggatacaat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43138027 ctttgtttgtcatgttttagttctctgacctttcattatttctacctaaatgccgaactaaaccccatgtatgtttatcgatttaagaataggatacaat 43137928  T
Q  115 tgatgttctttttgttttattgaatatgatctgattgataaacatgctaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137927 tgatgttctttttgttttattgaatatgatctgattgataaacatgctaca 43137877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 18809113 - 18808978
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18809113 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 18809014  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18809013 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18808978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 23709524 - 23709659
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23709524 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 23709623  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23709624 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23709659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 23712005 - 23712140
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23712005 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 23712104  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23712105 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23712140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24367944 - 24367809
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24367944 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 24367845  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24367844 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 24367809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 39682483 - 39682348
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39682483 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 39682384  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39682383 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 39682348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039625
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039477 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 32039576  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32039577 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaag 32039625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 571567 - 571432
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  571567 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 571468  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  571467 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 571432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 6726165 - 6726030
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6726165 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttt 6726066  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6726065 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 6726030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 21155052 - 21155187
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21155052 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 21155151  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21155152 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21155187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23131032 - 23130897
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23131032 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 23130933  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23130932 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23130897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23133499 - 23133364
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23133499 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 23133400  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23133399 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23133364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 26505549 - 26505414
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26505549 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt 26505450  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505449 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 26505414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 26508027 - 26507892
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26508027 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt 26507928  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507927 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 26507892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 32214913 - 32215048
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32214913 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 32215012  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32215013 tgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 32215048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 34402514 - 34402649
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34402514 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 34402613  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34402614 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 34402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 24898187 - 24898321
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24898187 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 24898286  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24898287 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 24898321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 24900670 - 24900804
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24900670 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 24900769  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24900770 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 24900804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 24903147 - 24903281
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24903147 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 24903246  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24903247 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 24903281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 24905624 - 24905758
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24905624 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 24905723  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24905724 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 24905758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 24908099 - 24908233
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24908099 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 24908198  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24908199 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 24908233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23135760 - 23135625
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23135760 tgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 23135661  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23135660 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23135625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 28577269 - 28577134
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28577269 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttt 28577170  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28577169 tgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaag 28577134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22105583 - 22105447
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22105583 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 22105484  T
Q  663 tgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22105483 tgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 22105447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 45029846 - 45029981
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45029846 tgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 45029945  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45029946 tgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaag 45029981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 563 - 696
Target Start/End: Original strand, 24529520 - 24529654
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24529520 tgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgttt 24529619  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaacta 696  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529620 ttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaacta 24529654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 566 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 38967542 - 38967409
Alignment:
Q  566 tatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  38967542 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttg 38967443  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  38967442 tatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaag 38967409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 550 - 648
Target Start/End: Original strand, 24642835 - 24642933
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattatta 648  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642835 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337153
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaag 22337153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076480
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 23076480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060551
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 23060551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 19672003 - 19671868
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| || |||||||||||  |||| || |||    
T  19672003 tgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttt 19671906  T
Q  663 tgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
    || |||||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  19671905 tgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaag 19671868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731317
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 22731317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 550 - 610
Target Start/End: Original strand, 22173808 - 22173868
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 610  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173808 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 662
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7779
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 565 - 641
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgat 641  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660061
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatact 23660090  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaag 23660061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738262
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  671 gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||    ||  ||||||||||||||||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaag 22738262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 23708568 - 23708702
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | || | ||| ||||| |||||||| ||||  |||| || |||||    
T  23708568 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttg 23708666  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaag 698  Q
     |||||| || ||||||| | |||||||||||||||    
T  23708667 catactgcctatgttgctatctgttatttaactaag 23708702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285903
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || | | |||| ||| ||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg----tctgtttttgtatact 23285932  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 23285903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 655 - 698
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643077
Alignment:
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaag 24643077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 637 - 698
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38197
Alignment:
Q  637 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 38197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298898
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  671 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaag 298898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654469
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || || || ||||||||||||||||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaag 23654469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 23791440 - 23791363
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23791440 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttat 23791363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 698
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103478
Alignment:
Q  588 tgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 686  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  687 tatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||    
T  23103467 tatttaactaag 23103478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 606
Target Start/End: Original strand, 20520148 - 20520183
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20520148 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 20520183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Original strand, 24697561 - 24697638
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||   |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24697561 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaa-gtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttat 24697638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215401
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215253 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 18215352  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215353 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 18215401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 12299 - 12434
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12299 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 12398  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12399 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 12434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 15118344 - 15118479
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15118344 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 15118443  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15118444 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 15118479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 52312680 - 52312545
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52312680 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 52312581  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52312580 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 52312545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 44773079 - 44773214
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44773079 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 44773178  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44773179 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 44773214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 3515177 - 3515042
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3515177 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttt 3515078  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515077 tgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaag 3515042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 19618164 - 19618299
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19618164 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 19618263  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618264 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 19618299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 44102392 - 44102249
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  44102392 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcat 44102293  T
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  44102292 gctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaag 44102249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 44615458 - 44615323
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  44615458 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatt 44615359  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44615358 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 44615323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 50222331 - 50222466
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50222331 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 50222430  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50222431 tgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaag 50222466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 19242867 - 19242734
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19242867 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19242768  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19242767 tatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 19242734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 15355316 - 15355452
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15355316 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 15355415  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15355416 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaag 15355452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51463995
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51463847 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 51463946  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51463947 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaag 51463995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 1837501 - 1837636
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1837501 tgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttt 1837600  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1837601 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 1837636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 14970699 - 14970834
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14970699 tgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 14970798  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14970799 tgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaag 14970834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 18239411 - 18239546
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18239411 tgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 18239510  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18239511 tgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaag 18239546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 23803257 - 23803392
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23803257 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 23803356  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23803357 tgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaag 23803392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 21815577 - 21815712
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21815577 tgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttt 21815676  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815677 tgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaag 21815712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929007
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  665 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaag 44929007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15367864 - 15367728
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15367864 tgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 15367765  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15367764 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 15367728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15402877 - 15402741
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15402877 tgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 15402778  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15402777 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 15402741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15371376 - 15371240
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15371376 tgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 15371277  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15371276 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 15371240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15373657 - 15373521
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15373657 tgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 15373558  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15373557 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 15373521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 563 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20150000 - 20149871
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20150000 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 20149901  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 691  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20149900 ttgtatactgatgtgtcgctgttgttattt 20149871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15370191 - 15370056
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15370191 tgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 15370093  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15370092 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 15370056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16223706 - 16223570
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16223706 tgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgttt 16223607  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16223606 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 16223570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12611126 - 12610985
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12611126 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 12611027  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  12611026 gtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaag 12610985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 563 - 665
Target Start/End: Original strand, 7641184 - 7641286
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7641184 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 7641283  T
Q  663 tgt 665  Q
    |||    
T  7641284 tgt 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038686
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaag 14038686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 563 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 22354007 - 22353910
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||| ||||    
T  22354007 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgtt 22353910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377604
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 16377604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 14280427 - 14280351
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14280427 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaag 14280351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798837
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 689  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  690 ttaactaag 698  Q
    | |||||||    
T  54798829 tcaactaag 54798837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 7798946 - 7798812
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798946 ttatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 7798847  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7798846 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 7798812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088915
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 7088915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893741
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaag 7893741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902795
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || | | |||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 12902795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636473
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaag 22636473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 624 - 698
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873450
Alignment:
Q  624 tgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 52873450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13897
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt 13897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 562 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 6900065 - 6899929
Alignment:
Q  562 atgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||  |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  6900065 atgttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-tt 6899967  T
Q  662 ttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  6899966 ttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaag 6899929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270318
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaag 16270318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052870
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaact 695  Q
    | || ||||| |||||||||||||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaact 44052870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574950
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 690  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  691 taactaag 698  Q
    ||||||||    
T  8574943 taactaag 8574950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 573 - 698
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240052
Alignment:
Q  573 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg- 671  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  672 ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || | ||||| ||||||||||| ||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaag 16240052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 643
Target Start/End: Original strand, 43198502 - 43198580
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatat 643  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  43198502 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatat 43198580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 573 - 662
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  573 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374442
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 23374442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 52243143 - 52243227
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| | |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  52243143 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttat 52243227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 652 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 3096378 - 3096331
Alignment:
Q  652 catgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3096378 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 3096331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 14409436 - 14409571
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14409436 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 14409535  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409536 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 14409571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 1484572 - 1484437
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1484572 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 1484473  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1484472 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 1484437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 5853284 - 5853419
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5853284 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 5853383  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5853384 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 5853419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 16413308 - 16413443
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16413308 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 16413407  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413408 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 16413443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 20403397 - 20403262
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20403397 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20403298  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20403297 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20403262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 15203223 - 15203358
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15203223 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttt 15203322  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15203323 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 15203358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22001923 - 22001788
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22001923 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 22001824  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22001823 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 22001788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 41598358 - 41598223
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41598358 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 41598259  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41598258 tgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaag 41598223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 563 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 14823943 - 14823811
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14823943 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 14823844  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact 695  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14823843 tgtatactgttgtgttgttgttgttatttaact 14823811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 20046187 - 20046322
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20046187 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 20046286  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20046287 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20046322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4483450 - 4483323
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4483450 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 4483351  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatt 690  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4483350 tgtatactgttgtgttgctgttgttatt 4483323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 19896438 - 19896300
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatatta---ttatgccatgctgt 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  19896438 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgt 19896339  T
Q  660 ttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19896338 ttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaag 19896300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 4542365 - 4542500
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4542365 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 4542464  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4542465 tgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaag 4542500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 19801374 - 19801508
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19801374 tgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttt 19801472  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19801473 tgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaag 19801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Original strand, 45290678 - 45290822
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgcca 653  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  45290678 tttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtca 45290777  T
Q  654 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45290778 tgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 45290822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 26224089 - 26223954
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26224089 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt 26223990  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  26223989 tgtatattgctttattgctgttgttatttaattaag 26223954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 565 - 670
Target Start/End: Original strand, 25484269 - 25484374
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25484269 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 25484368  T
Q  665 tatact 670  Q
    ||||||    
T  25484369 tatact 25484374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 19936997 - 19937133
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19936997 tgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgttt 19937096  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19937097 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 19937133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15070727 - 15070593
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttttt 663  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15070727 ttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 15070628  T
Q  664 gtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15070627 gtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15070593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092425
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaag 16092425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759296
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaag 6759296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 18818358 - 18818492
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18818358 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 18818457  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18818458 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 18818492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649127
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaag 28649127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 584 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 7372931 - 7372816
Alignment:
Q  584 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 682  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7372931 tataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 7372832  T
Q  683 ttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||    
T  7372831 ttgttatttaactaag 7372816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 21918955 - 21919083
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattat-atgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatac 669  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || || |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21918955 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 21919053  T
Q  670 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  21919054 tgcctatgttgctgttgttatttaactaag 21919083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508118
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| || |||||||||||    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 13508118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536246
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaag 20536246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875103
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaag 22875103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 563 - 618
Target Start/End: Original strand, 24486036 - 24486091
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486036 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 24486091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219752
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 690  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  691 taactaag 698  Q
    ||||||||    
T  26219759 taactaag 26219752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 13597566 - 13597663
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||||| || |||||||||||  |||| ||||||    
T  13597566 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt 13597663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406417
Alignment:
Q  570 ttgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgtt--gttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtat 667  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |  ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  668 actg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaag 23406417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 588 - 698
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924011
Alignment:
Q  588 tgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 686  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || | | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  687 tatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||    
T  21924000 tatttaactaag 21924011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20498734 - 20498637
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  20498734 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 20498637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626774
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22626803  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 22626774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225374
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 690  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactg-ttttgtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  691 taactaag 698  Q
    ||||||||    
T  26225367 taactaag 26225374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 563 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 32810101 - 32810054
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810101 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612156
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||  |||| ||||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 17612156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879314
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 18879314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 31971421 - 31971295
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | | | |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  31971421 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 31971324  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||    
T  31971323 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 31971295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439538
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 17439538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 37116514 - 37116437
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37116514 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 37116437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 698
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131079
Alignment:
Q  637 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 45131079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Original strand, 17266948 - 17267025
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17266948 tgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 17267025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22782410 - 22782262
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782410 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 22782311  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782310 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 22782262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12742487 - 12742352
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12742487 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 12742388  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12742387 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 12742352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 19005216 - 19005081
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19005216 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 19005117  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19005116 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 19005081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 19858911 - 19859046
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19858911 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 19859010  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19859011 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 19859046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24422717 - 24422582
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24422717 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 24422618  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24422617 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 24422582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 33861964 - 33861829
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33861964 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 33861865  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33861864 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 33861829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 33864448 - 33864313
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33864448 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 33864349  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33864348 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 33864313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 543 - 698
Target Start/End: Original strand, 3851989 - 3852144
Alignment:
Q  543 ttgatgatatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgata 642  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3851989 ttgatgatgtgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttata 3852088  T
Q  643 ttattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  3852089 ttatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaag 3852144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 8055199 - 8055064
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8055199 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 8055100  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8055099 tgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaag 8055064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 18334584 - 18334719
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18334584 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 18334683  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18334684 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18334719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 18456889 - 18456754
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18456889 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 18456790  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18456789 tgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 18456754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 30676702 - 30676837
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30676702 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttt 30676801  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676802 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 30676837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 34963543 - 34963408
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34963543 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 34963444  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34963443 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 34963408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20557019
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 20556970  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20556971 gccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20557019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 25754992 - 25754844
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25754992 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 25754893  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25754892 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaag 25754844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 1540903 - 1541038
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1540903 tgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttt 1541002  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1541003 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 1541038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 2291172 - 2291307
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2291172 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 2291271  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2291272 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 2291307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 26924632 - 26924767
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26924632 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 26924731  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26924732 tgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 26924767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 16448518 - 16448654
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16448518 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 16448617  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16448618 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaag 16448654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 1595719 - 1595584
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1595719 tgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 1595620  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1595619 tgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaag 1595584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 25688672 - 25688537
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25688672 tgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttt 25688573  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25688572 tgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaag 25688537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 581 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461914
Alignment:
Q  581 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgc 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgc 18461932  T
Q  681 tgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18461931 tgttgttatttaactaag 18461914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 25656797 - 25656664
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 25656698  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656697 tatactgctatgttgctgttgttatttaactaag 25656664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 574 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060578
Alignment:
Q  574 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-c 672  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  673 tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaag 29060578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629438
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaag 25629438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409907
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaact 695  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaact 18409907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 20593939 - 20593814
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20593939 tgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 20593840  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaact 695  Q
    || |||||||||||| ||||||||||    
T  20593839 gcatgtgttgctgtttttatttaact 20593814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361043
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 20361043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644358
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  671 g-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaag 25644358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821927
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatac 669  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||| | | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  670 tgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18821927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496282
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 16496282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 19303496 - 19303623
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatac- 669  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||     
T  19303496 tgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 19303594  T
Q  670 tgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303595 tcctgtgttgttgttgttatttaactaag 19303623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 588 - 698
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287879
Alignment:
Q  588 tgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgt 686  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  687 tatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaag 17287879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 8227460 - 8227557
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||  |||| ||||||    
T  8227460 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 8227557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 19847941 - 19848078
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |  ||||||| ||||| |||||||| |||||   |||||||     
T  19847941 tgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttg 19848040  T
Q  662 ttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
     ||||  ||| || || |||| ||||||||||||||||    
T  19848041 atgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 19848078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 624 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076738
Alignment:
Q  624 tgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 20076738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 20109312 - 20109226
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataat--tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20109312 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 20109226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 698
Target Start/End: Original strand, 22780199 - 22780310
Alignment:
Q  588 tgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 686  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||  ||||||    
T  22780199 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgt 22780298  T
Q  687 tatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||    
T  22780299 tatttaactaag 22780310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 631 - 698
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638366
Alignment:
Q  631 ttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaag 20638366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019481
Alignment:
Q  575 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt 23019481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899129
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899277 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 8899178  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8899177 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 8899129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 9707599 - 9707734
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9707599 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttt 9707698  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707699 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 9707734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17463348 - 17463213
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17463348 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 17463249  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17463248 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 17463213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 38961883 - 38962018
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38961883 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 38961982  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38961983 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 38962018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 45606899 - 45607034
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45606899 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 45606998  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45606999 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 45607034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 568 - 698
Target Start/End: Original strand, 29172580 - 29172710
Alignment:
Q  568 tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtat 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29172580 tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 29172679  T
Q  668 actgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172680 actgctgtgttgctgttgttatttaactaag 29172710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 7781339 - 7781474
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7781339 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 7781438  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7781439 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 7781474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 10247715 - 10247850
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10247715 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 10247814  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10247815 tgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaag 10247850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 16454273 - 16454408
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16454273 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 16454372  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454373 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16454408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 17446647 - 17446782
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17446647 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 17446746  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17446747 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 17446782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 34159496 - 34159361
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34159496 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 34159397  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34159396 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 34159361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 55476661 - 55476526
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55476661 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 55476562  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55476561 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 55476526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 13151782 - 13151916
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13151782 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 13151881  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13151882 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 13151916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 13154247 - 13154381
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13154247 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 13154346  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13154347 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 13154381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 6469126 - 6469261
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6469126 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 6469225  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6469226 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 6469261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12567730 - 12567595
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12567730 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 12567631  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567630 tgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaag 12567595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13544195 - 13544060
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13544195 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 13544096  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544095 tgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaag 13544060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 16282803 - 16282938
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16282803 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttt 16282902  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16282903 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16282938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 28848603 - 28848738
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28848603 tgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 28848702  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28848703 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 28848738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 50243005 - 50242857
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50243005 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 50242906  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50242905 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaag 50242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17672804 - 17672661
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17672804 tttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 17672705  T
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17672704 gctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaag 17672661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 41124057 - 41123925
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41124057 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 41123958  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  41123957 tgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaag 41123925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 53070645 - 53070780
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  53070645 tgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttt 53070744  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53070745 tgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaag 53070780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Original strand, 43550457 - 43550606
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550457 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 43550556  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||| |||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  43550557 gtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaag 43550606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 694
Target Start/End: Original strand, 12119716 - 12119848
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12119716 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 12119815  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 694  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12119816 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaac 12119848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 8499687 - 8499553
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttttt 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8499687 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 8499588  T
Q  664 gtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8499587 gtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 8499553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15412598 - 15412464
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttttt 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15412598 ttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 15412499  T
Q  664 gtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15412498 gtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15412464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 602 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977550
Alignment:
Q  602 tatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 15977550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972892
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaag 14972892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213803
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  671 gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaag 40213803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 42386576 - 42386449
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42386576 tgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatact 42386477  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  42386476 gcctatgttgctgttgttatttaactaa 42386449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500977
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 55500977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476468
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  671 -gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaag 25476468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166633
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 690  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  691 taactaag 698  Q
    ||||||||    
T  36166640 taactaag 36166633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 43841104 - 43840970
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  43841104 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 43841005  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43841004 tatactgtctatgttgttgttgttatttaactaag 43840970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576915
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaag 14576915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487894
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaag 17487894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499376
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaag 17499376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618484
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 690  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  691 taactaag 698  Q
    ||||||||    
T  21618491 taactaag 21618484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 26687059 - 26686925
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26687059 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 26686960  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26686959 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaag 26686925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438572
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 18438572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340756
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| || |||||||||||    
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 24340756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12399324 - 12399247
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12399324 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 12399247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 2051148 - 2051232
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2051148 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 2051232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442312
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaag 13442312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 20698391 - 20698518
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||  | | | |||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20698391 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatact 20698489  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  20698490 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 20698518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083444
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaag 23083444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 634 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494844
Alignment:
Q  634 catttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaag 44494844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 563 - 617
Target Start/End: Original strand, 17248233 - 17248287
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248233 tgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 630 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10557020
Alignment:
Q  630 cttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaag 10557020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 52523676 - 52523760
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  52523676 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttat 52523760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23274859 - 23274725
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| || |||||||||||  |||| || |||||    
T  23274859 ttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 23274761  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
     |||||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  23274760 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaag 23274725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||  |||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 37642214 - 37642311
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||  |||| ||||||    
T  37642214 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 37642311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153291
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  671 -gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
      || ||||||| | ||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaag 24153291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 53301499 - 53301634
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttttt 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  53301499 ttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttt 53301597  T
Q  664 gtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  53301598 gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaag 53301634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 27165419 - 27165340
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatatt 644  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  27165419 ttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatt 27165340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424842
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||| |   |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 11424842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 14572703 - 14572627
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14572703 gttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaag 14572627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 635 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737271
Alignment:
Q  635 atttgatattattatgccatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaag 17737271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16097499 - 16097416
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16097499 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 16097416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43926048
Alignment:
Q  573 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 43926048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 20917 - 20782
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20917 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20818  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20817 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 37991 - 37856
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37991 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 37892  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37891 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 37856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 94581 - 94446
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94581 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 94482  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  94481 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 94446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 17432 - 17567
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17432 tgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 17531  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17532 tgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaag 17567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 574 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44489
Alignment:
Q  574 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgt-ttttgtatactgc 672  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  673 tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaag 44489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 575 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100412
Alignment:
Q  575 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ct 673  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  || |||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| |||||| ||    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatg-atttgcatactgcct 100438  T
Q  674 gtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaag 100412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 158442 - 158577
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  158442 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 158541  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  158542 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 158577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340030
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 340002  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttg-tgttatttaactaag 340030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 456491 - 456356
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  456491 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 456392  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  456391 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 456356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 543 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 3386523 - 3386368
Alignment:
Q  543 ttgatgatatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgata 642  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386523 ttgatgatgtgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgata 3386424  T
Q  643 ttattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386423 ttatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 3386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 11393279 - 11393414
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11393279 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 11393378  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11393379 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 11393414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 11972666 - 11972531
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11972666 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 11972567  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11972566 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 11972531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 15376705 - 15376840
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15376705 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 15376804  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15376805 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 15376840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16232690 - 16232555
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16232690 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 16232591  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16232590 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16232555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 18640442 - 18640307
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18640442 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 18640343  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18640342 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18640307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 20385115 - 20385250
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20385115 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20385214  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20385215 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20385250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 21189587 - 21189722
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21189587 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 21189686  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21189687 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21189722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 27217030 - 27216895
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27217030 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 27216931  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27216930 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 27216895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 32125661 - 32125526
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32125661 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 32125562  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32125561 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 32125526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 41523087 - 41522952
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41523087 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 41522988  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41522987 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 41522952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 41525549 - 41525414
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41525549 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 41525450  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41525449 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 41525414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 14949114 - 14949249
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14949114 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 14949213  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14949214 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 14949249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24702408 - 24702273
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24702408 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 24702309  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24702308 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 24702273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 44116679 - 44116548
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44116679 tgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 44116580  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116579 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 44116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647363
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647512 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13647413  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13647412 gtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 13647363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16410229 - 16410094
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16410229 tgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 16410130  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16410129 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16410094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16213854 - 16213719
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16213854 tgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttt 16213755  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213754 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 16213719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 18430882 - 18430747
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18430882 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 18430783  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18430782 tatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18430747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 563 - 697
Target Start/End: Original strand, 12756663 - 12756797
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12756663 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 12756762  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12756763 tgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 584 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275206
Alignment:
Q  584 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  684 tgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaag 24275206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24704855 - 24704723
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||    
T  24704855 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg---tcttgtttt 24704759  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24704758 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 24704723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Original strand, 26355975 - 26356090
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26355975 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttt 26356074  T
Q  663 tgtatactgctgtgtt 678  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26356075 tgtatactgttgtgtt 26356090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Original strand, 26358427 - 26358542
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26358427 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttt 26358526  T
Q  663 tgtatactgctgtgtt 678  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26358527 tgtatactgttgtgtt 26358542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 17061907 - 17062042
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  17061907 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgct-attt 17062005  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17062006 tgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaag 17062042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Original strand, 38898360 - 38898504
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgcca 653  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38898360 tttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 38898459  T
Q  654 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38898460 tgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaag 38898504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 563 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 20110716 - 20110611
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20110716 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20110617  T
Q  663 tgtata 668  Q
    ||||||    
T  20110616 tgtata 20110611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13869515 - 13869381
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttttt 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13869515 ttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 13869416  T
Q  664 gtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13869415 gtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 13869381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 48273504 - 48273427
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48273504 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaag 48273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564447
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 3564447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831408
Alignment:
Q  607 gtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaag 13831408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 550 - 640
Target Start/End: Original strand, 15081928 - 15082019
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttga 640  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  15081928 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212034
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 26212034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 2280068 - 2280165
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2280068 ttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgtttt 2280165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698869
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgt-ttttgtatac 669  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  670 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaag 12698869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456495
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| | ||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaag 18456495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227519
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaag 38227519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509227
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaag 9509227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589077
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaag 10589077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 19486693 - 19486790
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||  |||| ||||||    
T  19486693 ttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 19486790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 12255740 - 12255824
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  12255740 ttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttat 12255824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 15143993 - 15144120
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||| |||||    
T  15143993 tgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatact 15144092  T
Q  671 gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||    
T  15144093 gagatgttgctgttgttatttaactaag 15144120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 606
Target Start/End: Original strand, 15008454 - 15008489
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15008454 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 15008489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 606
Target Start/End: Original strand, 20220145 - 20220180
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20220145 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 20220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 264760 - 264895
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  264760 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 264859  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  264860 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 264895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29330104 - 29329969
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29330104 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 29330005  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29330004 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 29329969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29346150 - 29346015
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29346150 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 29346051  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  29346050 tgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaag 29346015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 39363554 - 39363419
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39363554 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 39363455  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39363454 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 39363419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 42245357 - 42245492
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42245357 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 42245456  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42245457 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 42245492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Original strand, 36154767 - 36154907
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36154767 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 36154866  T
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36154867 gctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaag 36154907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 10732932 - 10733067
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10732932 tgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 10733031  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10733032 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 10733067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 20909182 - 20909047
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20909182 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20909083  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20909082 tgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaag 20909047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29348623 - 29348488
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29348623 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 29348524  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  29348523 tgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaag 29348488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29351096 - 29350961
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29351096 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 29350997  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  29350996 tgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaag 29350961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 32027563 - 32027428
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32027563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttt 32027464  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32027463 tgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaag 32027428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 18319025 - 18319161
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18319025 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 18319124  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18319125 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaag 18319161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 20902000 - 20902136
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20902000 tgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttt 20902099  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902100 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 20902136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 39245306 - 39245171
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39245306 tgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 39245207  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39245206 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 39245171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 11581191 - 11581326
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11581191 tgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 11581290  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11581291 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 11581326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 2154605 - 2154741
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2154605 tgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgttt 2154704  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154705 ttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaag 2154741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 566 - 698
Target Start/End: Original strand, 10775670 - 10775803
Alignment:
Q  566 tatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  10775670 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggtttta 10775769  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10775770 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaag 10775803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 24067278 - 24067146
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24067278 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 24067179  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 694  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24067178 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 24067146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 31061239 - 31061103
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31061239 tgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 31061140  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31061139 ttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaag 31061103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 20917944 - 20918075
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    ||| |||||||| || |||||||||||    
T  20917944 tgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttt 20918039  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20918040 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20918075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23064680 - 23064546
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttttt 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23064680 ttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgttttt 23064581  T
Q  664 gtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23064580 gtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 23064546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 38619603 - 38619469
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttttt 663  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38619603 ttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 38619504  T
Q  664 gtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38619503 gtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 38619469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077990
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 9077990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431432
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 25431432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096505
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  671 -gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
      |||||||||||||||||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaag 1096505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390579
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaag 23390579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421570
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaag 25421570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729147
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 21729147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808472
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 21808472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24529386 - 24529258
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  24529386 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatact 24529287  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  24529286 gcctatgttgttgttgttatttaactaag 24529258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 629 - 698
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997617
Alignment:
Q  629 acttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 21997617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493611
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaac 694  Q
    | || ||||||| |||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaac 24493611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144124
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||| ||||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt 22144124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286926
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctg-tttttgtatac 669  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  670 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaag 8286926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075057
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatac- 669  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||     
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  670 tgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaag 22075057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412222
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 689  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  690 ttaactaag 698  Q
    |||||||||    
T  22412230 ttaactaag 22412222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 40726025 - 40725941
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||    
T  40726025 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 40725941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 678
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgtt 678  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025351
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13025378  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaacta 696  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaacta 13025351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095535
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13095562  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaacta 696  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaacta 13095535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 644
Target Start/End: Original strand, 22178175 - 22178247
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatatt 644  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22178175 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 22178247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21565713 - 21565630
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  21565713 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttat 21565630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13989036 - 13988901
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13989036 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 13988937  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13988936 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 13988901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 21475079 - 21475214
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21475079 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 21475178  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21475179 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21475214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 21923283 - 21923418
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21923283 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 21923382  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21923383 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21923418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 23593729 - 23593862
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23593729 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23593828  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23593829 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23593862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21840937 - 21840802
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21840937 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 21840838  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840837 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 21840802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29776858 - 29776723
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  29776858 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttt 29776759  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29776758 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 29776723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29298304 - 29298172
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29298304 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttg 29298206  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29298205 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 29298172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 31612483 - 31612348
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31612483 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 31612384  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31612383 tgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 31612348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 45574836 - 45574970
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45574836 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 45574935  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45574936 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 45574970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16362085 - 16361952
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  16362085 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttta 16361986  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16361985 tatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaag 16361952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 22123059 - 22123195
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22123059 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt 22123158  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22123159 tgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaag 22123195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 563 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 40389325 - 40389193
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40389325 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 40389226  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 694  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40389225 ttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaac 40389193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21707345 - 21707202
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 654  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21707345 tttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcat 21707246  T
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21707245 gctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaag 21707202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21711887 - 21711744
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 654  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21711887 tttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcat 21711788  T
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21711787 gctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaag 21711744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 13212853 - 13212989
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13212853 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 13212952  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  13212953 ttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaag 13212989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21347132 - 21346996
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21347132 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 21347033  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21347032 ttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaag 21346996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 16275355 - 16275491
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16275355 tgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 16275454  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  16275455 ttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaag 16275491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21342267 - 21342131
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21342267 tgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 21342168  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21342167 ttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaag 21342131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 565 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 433178 - 433062
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  433178 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttg 433079  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgc 680  Q
    ||||||| |||||||||    
T  433078 tatactgcctgtgttgc 433062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 15860000 - 15860136
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15860000 tgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgttt 15860099  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15860100 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaag 15860136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210296
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 50210296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250812
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaag 27250812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 34509946 - 34509818
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34509946 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatact 34509847  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  34509846 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 34509818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 571 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532308
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || | | |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaa 22532308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861616
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21861519 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 21861616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 684
Target Start/End: Original strand, 21896205 - 21896324
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  21896205 ttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21896303  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgtt 684  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  21896304 tatactgcctatgttgctgtt 21896324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468779
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaag 22468779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758775
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat 612  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 16758775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 549 - 649
Target Start/End: Original strand, 41049968 - 41050067
Alignment:
Q  549 atatgttttgacgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattatt 647  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  41049968 atatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtt 41050065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 662
Target Start/End: Original strand, 35261036 - 35261124
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||   | |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35261036 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 35261124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026718
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||  ||| | ||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaag 21026718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| || ||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 635 - 698
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847237
Alignment:
Q  635 atttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 20847237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 50686778 - 50686701
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  50686778 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttat 50686701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 660
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtt 660  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 4864 - 4729
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4864 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 4765  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 14117 - 13982
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14117 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 14018  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14017 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaag 13982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16962 - 16819
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16962 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16863  T
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16862 gttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaag 16819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 11458 - 11323
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11458 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 11359  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11358 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 11323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 82255 - 82107
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  82255 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 82156  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  82155 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaag 82107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 22620 - 22703
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  22620 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 22703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 10943 - 10808
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10943 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 10844  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10843 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 10808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13562 - 13427
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13562 tgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 13463  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13462 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 13427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 134381 - 134246
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  134381 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatt 134282  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  134281 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 134246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 136850 - 136715
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  136850 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatt 136751  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  136750 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 136715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 139319 - 139184
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  139319 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatt 139220  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  139219 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 139184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 141788 - 141653
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  141788 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatt 141689  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  141688 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 141653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 144257 - 144122
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  144257 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatt 144158  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  144157 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 144122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 501254 - 501119
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  501254 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 501155  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  501154 tgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaag 501119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 85571 - 85707
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  85571 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 85670  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  85671 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 85707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 12241 - 12376
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12241 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttt 12340  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12341 tgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaag 12376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 40570 - 40435
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40570 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttt 40471  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40470 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 40435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 550 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12107
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12241 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 12142  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgtt 684  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12141 gtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctgtt 12107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20505
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttg 20471  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20472 tatactgatgtgttgctgttgttatttaactaag 20505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128789
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  671 gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
      | ||||||| ||||||||||||||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaag 128789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 550 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 141
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  289 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 190  T
Q  650 gccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  189 gtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 555 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 4475 - 4332
Alignment:
Q  555 tttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  4475 tttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcat 4376  T
Q  655 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4375 gttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaag 4332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 9412 - 9277
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9412 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 9313  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9312 tatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 30102 - 29967
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  30102 tgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttt 30003  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30002 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 29967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 79276 - 79411
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  79276 tgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttt 79375  T
Q  663 tgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  79376 tatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaag 79411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17300
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctg--tttttgtata 668  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  669 ctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaag 17300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 9920 - 9784
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9920 tgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgttt 9821  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9820 ttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 9784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32980
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaag 32980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38799
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaag 38799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 566 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 4382 - 4249
Alignment:
Q  566 tatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4382 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttg 4283  T
Q  665 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4282 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaag 4249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 2120 - 2256
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2120 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 2219  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2220 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaag 2256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18060
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| || |||||||||||    
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 18060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 550 - 694
Target Start/End: Original strand, 1259 - 1404
Alignment:
Q  550 tatgttttgacgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 648  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1259 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattatta 1358  T
Q  649 tgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 694  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  1359 tgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaac 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 563 - 698
Target Start/End: Original strand, 161081 - 161217
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgctgttt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  161081 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgttt 161180  T
Q  662 ttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  161181 ttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaag 161217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 563 - 650
Target Start/End: Original strand, 164582 - 164670
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttg-ttgacttgcatttgatattattatg 650  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  164582 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatg 164670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22921
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  671 gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaag 22921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4545
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12127
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag 12127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22079
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag 22079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44790
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 689  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  690 ttaactaag 698  Q
    |||||||||    
T  44782 ttaactaag 44790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26148
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 26148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 571 - 672
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  671 gc 672  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3233
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 3233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16683
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  671 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag 16683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13249
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 13249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51951
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaag 51951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 167934 - 168061
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  167934 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 168032  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  168033 gcctatgttgttgttgttatttaactaag 168061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 576 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  576 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39515
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaag 39515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75297
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaag 75297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1131
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1004 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 1102  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  1103 gcctatgttgttgttgttatttaactaag 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3269
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaag 3269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1889
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaag 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4888
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaa 697  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaa 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116465
Alignment:
Q  591 attacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 690  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  691 taactaag 698  Q
    ||||||||    
T  116472 taactaag 116465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Original strand, 128925 - 129002
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  128925 tgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 129002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 564 - 662
Target Start/End: Original strand, 27697 - 27795
Alignment:
Q  564 gttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27697 gttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgtttt 27795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53595
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt 53595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 225578 - 225482
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  225578 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 563 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 12039
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgtt 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12103 tgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 657 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 12001
Alignment:
Q  657 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 12001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3508
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| | ||||||||||||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaag 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 381
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || | | ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatact 410  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||  ||||||||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaag 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13264 - 13144
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13264 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 13165  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgtt 684  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  13164 tatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25934
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaag 25934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39896
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaag 39896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 38651 - 38785
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||| |  ||| |||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||    
T  38651 ttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttg 38749  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
     |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  38750 catactgtctatgttgctgtttgttatttaactaag 38785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 8640 - 8504
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataat--tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  8640 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttt 8542  T
Q  663 tgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
    || |||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  8541 tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 8504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24386
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgt-ttttgtatac 669  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  670 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaag 24386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33039
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33010  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaag 33039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45966
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 45995  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaag 45966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16151
Alignment:
Q  572 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg 671  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  672 -ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaag 16151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11502
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||  |||| || |||||    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 11538  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
     |||||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  11537 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaag 11502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 564 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 13302 - 13203
Alignment:
Q  564 gttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-aattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || | | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13302 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 13203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 662
Target Start/End: Original strand, 16048 - 16146
Alignment:
Q  564 gttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||| || ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  16048 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgtttt 16146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38339
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |  |||||||||||  |||| || |||||    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 38303  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
     |||||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  38304 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaag 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgc 656  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28452
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaag 28452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 565 - 684
Target Start/End: Original strand, 8482 - 8601
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8482 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 8581  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctgtt 684  Q
     |||||| || ||||||||||    
T  8582 -atactgcctatgttgctgtt 8601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6207
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  671 gc---tg-tgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
     |   || ||||| ||||||||||||||||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaag 6207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8521
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgttatttaac 694  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaac 8521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1990
Alignment:
Q  586 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 684  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || | | |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  685 gttatttaactaag 698  Q
    |||| |||||||||    
T  2003 gttaattaactaag 1990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 12739 - 12643
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | || |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12739 ttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 12643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 660
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtt 660  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 565 - 649
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8092
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8008 ttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattat 8092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 6070
Alignment:
Q  563 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 610  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6117 tgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 637
Target Start/End: Original strand, 60670 - 60736
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatt 637  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||    
T  60670 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatt 60736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129943
Alignment:
Q  575 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ct 673  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| ||  |||| |||||| ||    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 129969  T
Q  674 gtgttgctgt-tgttatttaactaag 698  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaag 129943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 644
Target Start/End: Original strand, 18170 - 18265
Alignment:
Q  549 atatgttttgacgatgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatatt 644  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  18170 atatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39951
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 670  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || | | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 39980  T
Q  671 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaag 39951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattatt 647  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174804
Alignment:
Q  588 tgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 685  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||   |||||||||| || |||||||| |||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  686 ttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaag 174804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 575 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  575 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttt 662  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 637 - 698
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11526
Alignment:
Q  637 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaag 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 97172 - 97095
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  97172 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 97095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 106450 - 106373
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattat 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  106450 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 106373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 644
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6310
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatatt 644  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  6238 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 6310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 646 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4750
Alignment:
Q  646 ttatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaag 4750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Original strand, 10491 - 10624
Alignment:
Q  565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 664  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| ||  ||||    
T  10491 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttg 10588  T
Q  665 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
     |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  10589 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 10624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 637 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13535
Alignment:
Q  637 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  586 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc 672  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || | | |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 637 - 698
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15546
Alignment:
Q  637 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaag 15546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 622 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20948
Alignment:
Q  622 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaag 698  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| || || |||||||| |||||| |||||||||    
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaag 20948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 545 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 267853 - 267791
Alignment:
Q  545 gatgatatgttttgacgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 606  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  267853 gatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 267791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38411
Alignment:
Q  571 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaaacgttgttgacttgcatttgatatt 644  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgaattgcatttgatatt 38411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University