View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6658_low_10 (Length: 205)

Name: NF6658_low_10
Description: NF6658
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6658_low_10
NF6658_low_10
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (1-197)||(41283595-41283791)
chr7 (1-126)||(11394811-11394936)
chr7 (2-147)||(16185524-16185669)
chr7 (78-197)||(14420737-14420856)
chr7 (78-197)||(18871247-18871366)
chr7 (68-197)||(11660232-11660361)
chr7 (68-197)||(13891580-13891709)
chr7 (78-197)||(146450-146569)
chr7 (78-197)||(10897906-10898025)
chr7 (78-197)||(16004954-16005073)
chr7 (68-197)||(10607320-10607449)
chr7 (78-197)||(18606285-18606407)
chr7 (1-192)||(15213003-15213194)
chr7 (83-197)||(838148-838262)
chr7 (83-197)||(1203328-1203442)
chr7 (83-197)||(16109990-16110104)
chr7 (68-197)||(13891963-13892092)
chr7 (83-197)||(834060-834174)
chr7 (83-197)||(1199240-1199354)
chr7 (68-197)||(7520215-7520345)
chr7 (68-197)||(16582371-16582500)
chr7 (68-197)||(39268313-39268442)
chr7 (68-197)||(9752507-9752636)
chr7 (104-197)||(15166200-15166293)
chr7 (68-197)||(39721145-39721275)
chr7 (68-197)||(18424185-18424314)
chr7 (68-197)||(15083175-15083305)
chr7 (68-197)||(31675-31804)
chr7 (68-197)||(12706122-12706251)
chr7 (68-197)||(12713490-12713619)
chr7 (68-197)||(12722148-12722277)
chr7 (68-197)||(16908509-16908638)
chr7 (68-197)||(18281908-18282037)
chr7 (68-187)||(26291116-26291236)
chr7 (83-197)||(18277944-18278058)
chr7 (68-197)||(2833481-2833610)
chr7 (68-197)||(12717237-12717366)
chr7 (68-156)||(20486733-20486821)
chr7 (104-187)||(11302267-11302350)
chr7 (83-197)||(72386-72500)
chr7 (83-197)||(76495-76609)
chr7 (68-157)||(25928371-25928460)
chr7 (83-183)||(45171515-45171615)
chr7 (83-197)||(2531347-2531460)
chr7 (84-166)||(1860037-1860119)
chr7 (84-157)||(13919428-13919501)
chr7 (121-197)||(9752644-9752720)
chr7 (68-125)||(18301373-18301430)
chr7 (78-156)||(23666462-23666539)
chr7 (121-157)||(9752728-9752764)
chr7 (121-157)||(39268450-39268486)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (1-197)||(41084-41280)
chr3 (1-184)||(16325974-16326158)
chr3 (43-197)||(10834915-10835070)
chr3 (1-126)||(5841187-5841312)
chr3 (1-125)||(45220895-45221019)
chr3 (78-197)||(14764805-14764924)
chr3 (78-197)||(3801920-3802039)
chr3 (78-197)||(54519547-54519666)
chr3 (68-197)||(13435768-13435897)
chr3 (84-197)||(23372559-23372672)
chr3 (84-197)||(51299483-51299596)
chr3 (78-197)||(9532208-9532327)
chr3 (3-125)||(2249151-2249273)
chr3 (68-197)||(12853363-12853492)
chr3 (78-197)||(18899400-18899522)
chr3 (1-192)||(11912382-11912573)
chr3 (78-197)||(20249859-20249978)
chr3 (78-197)||(29545948-29546067)
chr3 (68-197)||(16795453-16795582)
chr3 (1-192)||(16840136-16840327)
chr3 (72-197)||(8928871-8928996)
chr3 (83-197)||(11301680-11301794)
chr3 (68-197)||(5219797-5219926)
chr3 (78-184)||(12304136-12304243)
chr3 (86-197)||(19774148-19774259)
chr3 (68-197)||(30064334-30064464)
chr3 (68-197)||(7108188-7108317)
chr3 (68-197)||(7112123-7112252)
chr3 (68-197)||(11068563-11068692)
chr3 (68-197)||(22320079-22320208)
chr3 (68-197)||(22335134-22335263)
chr3 (68-197)||(55021326-55021455)
chr3 (78-197)||(38312867-38312985)
chr3 (68-187)||(11853666-11853785)
chr3 (68-197)||(11167093-11167222)
chr3 (68-197)||(15616127-15616256)
chr3 (68-197)||(16751901-16752030)
chr3 (68-197)||(28948411-28948540)
chr3 (68-156)||(14670017-14670105)
chr3 (68-187)||(18933355-18933475)
chr3 (83-197)||(14664375-14664489)
chr3 (83-197)||(14667539-14667653)
chr3 (68-197)||(14497898-14498026)
chr3 (83-197)||(4108803-4108918)
chr3 (83-197)||(4112652-4112767)
chr3 (84-197)||(12337206-12337319)
chr3 (86-156)||(14681541-14681611)
chr3 (83-183)||(15963461-15963561)
chr3 (83-183)||(15967385-15967485)
chr3 (83-183)||(15971309-15971409)
chr3 (68-147)||(4590160-4590239)
chr3 (68-147)||(8491732-8491811)
chr3 (84-157)||(15463868-15463941)
chr3 (70-147)||(17318511-17318588)
chr3 (83-157)||(23173287-23173361)
chr3 (68-147)||(14068062-14068141)
chr3 (115-197)||(15564801-15564883)
chr3 (115-183)||(15555602-15555670)
chr3 (147-197)||(17348806-17348856)
chr3 (73-125)||(14648275-14648327)
chr3 (68-119)||(37440680-37440731)
chr3 (1-76)||(8928765-8928840)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-197)||(37378986-37379182)
chr2 (78-197)||(19663567-19663686)
chr2 (78-197)||(20260207-20260326)
chr2 (78-197)||(9240624-9240743)
chr2 (78-197)||(6481734-6481853)
chr2 (78-197)||(6485201-6485320)
chr2 (71-197)||(21074510-21074636)
chr2 (94-197)||(10686272-10686375)
chr2 (68-197)||(24630047-24630176)
chr2 (68-197)||(24645101-24645230)
chr2 (68-197)||(24647877-24648006)
chr2 (68-197)||(30346657-30346786)
chr2 (68-187)||(27380993-27381112)
chr2 (68-187)||(27384963-27385082)
chr2 (83-197)||(10103311-10103425)
chr2 (83-197)||(12902621-12902735)
chr2 (83-197)||(24647044-24647158)
chr2 (68-197)||(27600321-27600450)
chr2 (68-157)||(9783984-9784073)
chr2 (68-197)||(31343867-31343996)
chr2 (83-183)||(41532457-41532557)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (1-197)||(11774246-11774442)
chr8 (1-197)||(8414909-8415105)
chr8 (1-147)||(21967925-21968071)
chr8 (1-147)||(21980765-21980911)
chr8 (1-147)||(21985748-21985894)
chr8 (1-147)||(22009129-22009275)
chr8 (1-186)||(21328527-21328712)
chr8 (1-125)||(44494156-44494280)
chr8 (68-197)||(23427776-23427905)
chr8 (1-147)||(22000716-22000857)
chr8 (83-197)||(27942700-27942814)
chr8 (88-197)||(363218-363327)
chr8 (1-192)||(42560814-42561005)
chr8 (104-197)||(8729645-8729738)
chr8 (1-109)||(34950124-34950232)
chr8 (68-182)||(44385833-44385947)
chr8 (1-125)||(11252020-11252138)
chr8 (68-197)||(21409850-21409980)
chr8 (68-197)||(21804342-21804472)
chr8 (68-197)||(14399092-14399221)
chr8 (68-197)||(21974183-21974312)
chr8 (68-197)||(43250152-43250281)
chr8 (83-197)||(21829475-21829589)
chr8 (68-197)||(21978293-21978422)
chr8 (83-197)||(22110551-22110665)
chr8 (68-157)||(23913255-23913344)
chr8 (83-183)||(18864119-18864219)
chr8 (83-183)||(30941579-30941679)
chr8 (68-147)||(21386159-21386238)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (1-197)||(23955319-23955515)
chr6 (1-126)||(28707880-28708005)
chr6 (78-197)||(12941171-12941290)
chr6 (84-197)||(4475745-4475858)
chr6 (78-197)||(27222782-27222901)
chr6 (78-197)||(28290904-28291023)
chr6 (1-192)||(34297705-34297896)
chr6 (2-197)||(25737842-25738037)
chr6 (68-197)||(23537931-23538060)
chr6 (83-197)||(22075405-22075519)
chr6 (68-197)||(23400627-23400757)
chr6 (68-197)||(31479462-31479591)
chr6 (1-125)||(9622846-9622969)
chr6 (83-197)||(27416542-27416656)
chr6 (68-197)||(8242362-8242491)
chr6 (68-197)||(11565351-11565480)
chr6 (68-197)||(11716940-11717069)
chr6 (68-197)||(12620333-12620462)
chr6 (68-197)||(23988253-23988382)
chr6 (68-197)||(27555490-27555618)
chr6 (84-197)||(14470831-14470944)
chr6 (83-197)||(22947617-22947731)
chr6 (83-197)||(22951573-22951687)
chr6 (83-197)||(23870061-23870175)
chr6 (83-197)||(23874017-23874131)
chr6 (68-197)||(22861705-22861834)
chr6 (83-183)||(23393605-23393705)
chr6 (83-183)||(23413513-23413613)
chr6 (83-197)||(16758665-16758779)
chr6 (83-192)||(1254114-1254223)
chr6 (83-174)||(19869160-19869251)
chr6 (68-157)||(2076276-2076365)
chr6 (68-187)||(16622797-16622914)
chr6 (68-147)||(18918580-18918659)
chr6 (68-147)||(18953483-18953562)
chr6 (73-125)||(14594666-14594718)
chr6 (121-157)||(23537887-23537923)
chr6 (78-125)||(7429449-7429496)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-197)||(33473864-33474060)
chr5 (1-125)||(19075911-19076035)
chr5 (78-198)||(28372091-28372211)
chr5 (78-197)||(37600018-37600137)
chr5 (1-125)||(31253143-31253267)
chr5 (78-197)||(38146428-38146547)
chr5 (78-197)||(19510412-19510531)
chr5 (78-197)||(22338962-22339081)
chr5 (68-197)||(22120591-22120720)
chr5 (78-197)||(22335432-22335551)
chr5 (78-197)||(23113412-23113531)
chr5 (78-197)||(41878661-41878780)
chr5 (1-192)||(36459503-36459694)
chr5 (68-197)||(15238117-15238246)
chr5 (68-197)||(10751767-10751896)
chr5 (68-197)||(20294464-20294593)
chr5 (68-197)||(20912252-20912381)
chr5 (68-197)||(22108449-22108577)
chr5 (68-197)||(24768562-24768691)
chr5 (68-184)||(18354760-18354876)
chr5 (68-187)||(19474172-19474291)
chr5 (83-197)||(11219505-11219619)
chr5 (83-197)||(11224091-11224205)
chr5 (83-197)||(11227913-11228027)
chr5 (68-187)||(40727399-40727517)
chr5 (83-197)||(11226107-11226221)
chr5 (83-197)||(11229903-11230017)
chr5 (78-156)||(22749152-22749230)
chr5 (73-125)||(43243764-43243816)
chr5 (73-156)||(9774932-9775014)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (1-197)||(28384801-28384997)
chr4 (68-197)||(24048384-24048513)
chr4 (78-197)||(15533169-15533288)
chr4 (78-197)||(18211554-18211673)
chr4 (78-197)||(36036902-36037021)
chr4 (1-125)||(37839124-37839248)
chr4 (83-197)||(30145733-30145847)
chr4 (68-197)||(17052445-17052574)
chr4 (68-197)||(22634926-22635055)
chr4 (78-197)||(49549092-49549212)
chr4 (1-125)||(42597853-42597977)
chr4 (68-197)||(13813832-13813961)
chr4 (68-197)||(13818320-13818449)
chr4 (68-182)||(12422908-12423022)
chr4 (68-197)||(20158447-20158576)
chr4 (68-197)||(20163898-20164027)
chr4 (68-197)||(15223496-15223625)
chr4 (68-197)||(23996966-23997094)
chr4 (68-197)||(4562773-4562902)
chr4 (68-197)||(5758455-5758584)
chr4 (68-197)||(9555019-9555148)
chr4 (68-197)||(14758991-14759120)
chr4 (68-197)||(14955759-14955888)
chr4 (68-197)||(20161123-20161252)
chr4 (68-197)||(33740786-33740915)
chr4 (68-197)||(12486221-12486350)
chr4 (68-197)||(25688392-25688521)
chr4 (68-184)||(17807017-17807133)
chr4 (57-197)||(38106897-38107037)
chr4 (68-157)||(631747-631836)
chr4 (121-197)||(24048521-24048597)
chr4 (68-147)||(10711825-10711904)
chr4 (68-147)||(10925595-10925674)
chr4 (68-147)||(27532752-27532831)
chr4 (121-197)||(13818457-13818533)
chr4 (115-183)||(40906323-40906391)
chr4 (104-157)||(14047308-14047361)
chr4 (115-183)||(38106798-38106866)
chr4 (121-157)||(22635063-22635099)
chr4 (121-166)||(13813969-13814014)
chr4 (121-166)||(13818541-13818586)
chr4 (19-76)||(49548998-49549055)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-125)||(11945016-11945140)
chr1 (1-125)||(43630925-43631049)
chr1 (43-197)||(29533837-29533992)
chr1 (2-144)||(11809883-11810025)
chr1 (84-197)||(32649017-32649130)
chr1 (78-197)||(16370875-16370994)
chr1 (68-197)||(22132098-22132227)
chr1 (68-197)||(33795983-33796112)
chr1 (104-197)||(20439188-20439281)
chr1 (68-187)||(20230138-20230258)
chr1 (68-197)||(1009212-1009341)
chr1 (68-197)||(1926795-1926924)
chr1 (68-197)||(16376815-16376944)
chr1 (68-197)||(20925809-20925938)
chr1 (68-197)||(41389664-41389793)
chr1 (68-197)||(39245170-39245297)
chr1 (68-197)||(39248725-39248852)
chr1 (68-157)||(41801278-41801367)
chr1 (68-197)||(52634218-52634347)
chr1 (1-101)||(636503-636596)
chr1 (68-147)||(21406253-21406332)
chr1 (73-125)||(20032180-20032232)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (78-197)||(109551-109670)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (78-197)||(224152-224271)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (1-122)||(35-156)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (1-118)||(3198-3315)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (78-197)||(150-269)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (78-192)||(10831-10945)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (84-197)||(3532-3645)
scaffold0544 (137-197)||(1-61)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (68-197)||(33887-34016)
scaffold0080 (68-151)||(28468-28551)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-192)||(4076-4267)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (70-197)||(25569-25696)
scaffold0124 (104-197)||(37568-37661)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (78-197)||(5192-5311)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (68-197)||(8739-8868)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-121)||(173158-173278)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (68-187)||(14804-14923)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (83-197)||(835-949)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (78-197)||(18773-18892)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (83-197)||(70705-70819)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (68-197)||(11001-11130)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (68-197)||(11059-11188)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (68-197)||(60325-60454)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (83-197)||(11727-11841)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (68-157)||(6960-7049)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (68-197)||(34127-34256)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (68-197)||(68555-68684)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (68-157)||(74331-74420)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (84-197)||(5546-5659)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (68-184)||(8540-8656)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (83-183)||(15589-15689)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (68-148)||(37202-37282)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (84-197)||(5775-5888)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (68-197)||(6320-6448)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-88)||(175425-175512)
scaffold0001 (89-192)||(163588-163691)
scaffold0001 (1-63)||(163532-163594)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (68-147)||(3974-4053)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (68-147)||(23937-24016)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (68-147)||(62839-62918)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (68-147)||(37197-37276)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (87-149)||(10765-10827)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (68-157)||(21339-21420)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (113-197)||(115390-115473)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (138-197)||(641-700)
scaffold1873 (121-149)||(605-633)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (73-125)||(444-496)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-34)||(208655-208688)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (1-32)||(34123-34154)
scaffold0098 (73-125)||(34076-34128)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41283791 - 41283595
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283791 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 41283692  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41283691 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 41283595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 11394811 - 11394936
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11394811 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 11394910  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttga 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11394911 acttgatgagggttatgttaagttga 11394936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16185669 - 16185524
Alignment:
Q  2 ttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16185669 ttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgta 16185570  T
Q  102 cttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16185569 cttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcatga 16185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14420856 - 14420737
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420856 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 14420757  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14420756 ttattatgaaatgatgatgt 14420737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18871366 - 18871247
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871366 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 18871267  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18871266 ttattatgaaatgatgatgt 18871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11660361 - 11660232
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11660361 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttga 11660262  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11660261 tgaataattattattatgaaattatgatgt 11660232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13891709 - 13891580
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13891709 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttga 13891610  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13891609 tgaataattattattatgaattgatgatgt 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 146569 - 146450
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146569 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 146470  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  146469 ttattatgaaatgatgatgt 146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 10897906 - 10898025
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10897906 gttatctatgagtcgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttatgaataatta 10898005  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10898006 ttattatgaaatgatgatgt 10898025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16005073 - 16004954
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16005073 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataacta 16004974  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16004973 ttattatgaaatgatgatgt 16004954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 10607320 - 10607449
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||    
T  10607320 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatgtttga 10607419  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10607420 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 10607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18606407 - 18606285
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606407 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 18606308  T
Q  178 tta---ttatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||   |||||||||||||||||    
T  18606307 ttattattatgaaatgatgatgt 18606285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15213194 - 15213003
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  15213194 tttatgttgatgattatcacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggctgttttgatgttacatgatgttatccatgagttgttaaatgt 15213095  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15213094 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 15213003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 838148 - 838262
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  838148 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattatt 838247  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  838248 atgaattgatgatgt 838262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 1203328 - 1203442
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1203328 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattatt 1203427  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  1203428 atgaattgatgatgt 1203442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 16109990 - 16110104
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16109990 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt 16110089  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  16110090 atgaattgatgatgt 16110104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13892092 - 13891963
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||    
T  13892092 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatgtttga 13891993  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13891992 tgaataattattattatgaattgatgatgt 13891963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 834060 - 834174
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  834060 ctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt 834159  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  834160 atgaattgatgatgt 834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 1199240 - 1199354
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1199240 ctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt 1199339  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  1199340 atgaattgatgatgt 1199354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 7520215 - 7520345
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  7520215 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 7520314  T
Q  168 tgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7520315 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 7520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16582500 - 16582371
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  16582500 attacatgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatgtttga 16582401  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582400 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 39268313 - 39268442
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  39268313 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttga 39268412  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39268413 tgaataattattattatgaattgatgatgt 39268442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 9752507 - 9752636
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  9752507 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttga 9752606  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752607 tgaataattattattatgaattgatgatgt 9752636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166200
Alignment:
Q  104 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39721275 - 39721145
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  39721275 attacatgatgatatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttg 39721176  T
Q  167 atgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39721175 atgaataattattattatgaattaatgatgt 39721145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18424314 - 18424185
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||    
T  18424314 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttga 18424215  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18424214 tgaataattattattatgaattaatgatgt 18424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15083305 - 15083175
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaag-ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  15083305 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttg 15083206  T
Q  167 atgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15083205 atgaataattattattatgaattaatgatgt 15083175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31804 - 31675
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  31804 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 31705  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31704 tgaataattattattatgaattaatgatgt 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 12706122 - 12706251
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  12706122 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 12706221  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12706222 tgaataattattattatgaattaatgatgt 12706251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12713619 - 12713490
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  12713619 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 12713520  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12713519 tgaataattattattatgaattaatgatgt 12713490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12722277 - 12722148
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  12722277 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 12722178  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12722177 tgaataattattattatgaattaatgatgt 12722148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 16908509 - 16908638
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  16908509 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 16908608  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16908609 tgaataattattattatgaattaatgatgt 16908638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18282037 - 18281908
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  18282037 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttga 18281938  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18281937 tgaataattattattatgaattaatgatgt 18281908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26291236 - 26291116
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  26291236 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttg 26291137  T
Q  167 atgaataattattattatgaa 187  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  26291136 acgaataattattattatgaa 26291116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18278058 - 18277944
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18278058 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 18277959  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  18277958 atgaattaatgatgt 18277944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 2833481 - 2833610
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||  |    
T  2833481 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgttcaa 2833580  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2833581 tgaataattattattatgaattaatgatgt 2833610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12717366 - 12717237
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  12717366 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 12717267  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12717266 tgaataattattattatgaattaatgatgt 12717237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20486821 - 20486733
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20486821 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302267
Alignment:
Q  104 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 72386 - 72500
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  72386 ctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 72485  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  72486 atgaattaatgatgt 72500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 76495 - 76609
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  76495 ctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 76594  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  76595 atgaattaatgatgt 76609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 25928371 - 25928460
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25928371 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtactttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatg 25928460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 45171515 - 45171615
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  45171515 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 45171614  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  45171615 a 45171615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 2531347 - 2531460
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  2531347 ctatgagttgttaggtgtacttgatgatg-ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgttttatgaataattattatt 2531445  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  2531446 atgaattaatgatgt 2531460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 166
Target Start/End: Original strand, 1860037 - 1860119
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  1860037 tatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttg 1860119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Original strand, 13919428 - 13919501
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919428 tatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 13919501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 9752644 - 9752720
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752644 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18301430 - 18301373
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301430 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 18301373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 156
Target Start/End: Original strand, 23666462 - 23666539
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  23666462 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat-gttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaat 23666539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 157
Target Start/End: Original strand, 9752728 - 9752764
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9752728 agttgataagttatcttttattcatgaattgataatg 9752764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 157
Target Start/End: Original strand, 39268450 - 39268486
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39268450 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatg 39268486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41280 - 41084
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41280 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 41181  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 41084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 16325974 - 16326158
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16325974 tttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatgatgttgaatatgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 16326073  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataat-tattattat 184  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16326074 acttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaattatatattattat 16326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Original strand, 10834915 - 10835070
Alignment:
Q  43 gtgttgaatgcgaggttgttatgat-attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttat 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834915 gtgttgaatatgaggttgttatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttat 10835014  T
Q  142 tcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10835015 tcatgaatttctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10835070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5841312 - 5841187
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5841312 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 5841213  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttga 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5841212 acttgatgagggttatgttaagttga 5841187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 45220895 - 45221019
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45220895 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 45220994  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  45220995 acttgatgagggttatgttaagttg 45221019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 14764805 - 14764924
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764805 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 14764904  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14764905 ttattatgaaatgatgatgt 14764924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3802039 - 3801920
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802039 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 3801940  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  3801939 ttattatggaatgatgatgt 3801920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54519666 - 54519547
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54519666 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 54519567  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  54519566 ttattatggaatgatgatgt 54519547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13435897 - 13435768
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435897 attacatgatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttga 13435798  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435797 tgaataattattattatgaattgatgatgt 13435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Original strand, 23372559 - 23372672
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372559 tatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 23372658  T
Q  184 tgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||    
T  23372659 tgaaatgatgatgt 23372672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51299596 - 51299483
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51299596 tatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 51299497  T
Q  184 tgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||    
T  51299496 tgaaatgatgatgt 51299483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9532327 - 9532208
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9532327 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataatta 9532228  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9532227 ttattatgaaatgatgatgt 9532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 2249151 - 2249273
Alignment:
Q  3 tatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgtac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2249151 tatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttattaaatgtac 2249250  T
Q  103 ttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  2249251 ttgatgagggttatgttaagttg 2249273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 12853363 - 12853492
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  12853363 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 12853462  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12853463 tgaataattattattatgaattgatgatgt 12853492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18899522 - 18899400
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgc---taatggaatgtttgatgaataa 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  18899522 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataatggaatgtttgatgaataa 18899423  T
Q  175 ttattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18899422 ttattattatgaaatgatgatgt 18899400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11912573 - 11912382
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||| | || |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11912573 tttatgttgatgattatgatgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggcttttttgatgttacatgatgttatctatgagttgttaaatgt 11912474  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11912473 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 11912382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 20249859 - 20249978
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  20249859 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatattcgatgaataacta 20249958  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20249959 ttattatgaaatgatgatgt 20249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 29545948 - 29546067
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29545948 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatggaaggtttgatgaataatta 29546047  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29546048 ttattatgaaatgatgatgt 29546067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16795582 - 16795453
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||    
T  16795582 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttga 16795483  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16795482 tgaataattattattatgaattgatgatgt 16795453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16840136 - 16840327
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16840136 tttatgttgatgattatgatgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgtgaggttgttatgatgttacatgattttatctatgagttgttaaatgt 16840235  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16840236 atttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagattcttgctgaataattattgttatgaattgat 16840327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 197
Target Start/End: Original strand, 8928871 - 8928996
Alignment:
Q  72 catgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaa 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  8928871 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgagatgtttgatgaa 8928970  T
Q  172 taattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  8928971 taattattattatgaattgatgatgt 8928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 11301680 - 11301794
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  11301680 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 11301779  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  11301780 atgaattgatgatgt 11301794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5219926 - 5219797
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||    
T  5219926 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttga 5219827  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5219826 tgaataattattattatgaattaatgatgt 5219797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12304243 - 12304136
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataat-t 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  12304243 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaattatat 12304144  T
Q  177 attattat 184  Q
    ||||||||    
T  12304143 attattat 12304136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19774259 - 19774148
Alignment:
Q  86 tgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19774259 tgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatg 19774160  T
Q  186 aaatgatgatgt 197  Q
    || | |||||||    
T  19774159 aattaatgatgt 19774148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30064464 - 30064334
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  30064464 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttg 30064365  T
Q  167 atgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30064364 acgaataattattattatgaattaatgatgt 30064334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7108317 - 7108188
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  7108317 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 7108218  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7108217 tgaataattattattatgaattaatgatgt 7108188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7112252 - 7112123
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  7112252 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 7112153  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7112152 tgaataattattattatgaattaatgatgt 7112123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11068692 - 11068563
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  11068692 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 11068593  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11068592 tgaataattattattatgaattaatgatgt 11068563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22320208 - 22320079
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  22320208 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 22320109  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22320108 tgaataattattattatgaattaatgatgt 22320079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22335263 - 22335134
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  22335263 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 22335164  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22335163 tgaataattattattatgaattaatgatgt 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55021455 - 55021326
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  55021455 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 55021356  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55021355 tgaataattattattatgaattaatgatgt 55021326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 38312867 - 38312985
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat-ggaatgtttgatgaataatt 176  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  38312867 gttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaa-tgctaatgggaatgttcgatgaat-att 38312964  T
Q  177 attattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38312965 attattatgaaatgatgatgt 38312985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11853785 - 11853666
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  11853785 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatgtttga 11853686  T
Q  168 tgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  11853685 tgaataagtattattatgaa 11853666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 11167093 - 11167222
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  11167093 attacatgatgatatctatgagttgttaagtttacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 11167192  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11167193 tgaataattattattatgaattaatgatgt 11167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15616256 - 15616127
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  15616256 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 15616157  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15616156 tgaataattattattatgaattaatgatgt 15616127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 16751901 - 16752030
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||| ||||    
T  16751901 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataatgagatggttga 16752000  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16752001 tgaataattattattatgaattaatgatgt 16752030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28948540 - 28948411
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  28948540 attacatgatgatatctataagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 28948441  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28948440 tgaataattattattatgaattaatgatgt 28948411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14670105 - 14670017
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14670105 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 18933355 - 18933475
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  18933355 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgagatgtttg 18933454  T
Q  167 atgaataattattattatgaa 187  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  18933455 acgaataattattattatgaa 18933475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14664489 - 14664375
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  14664489 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatattt 14664390  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  14664389 atgaattaatgatgt 14664375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14667653 - 14667539
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  14667653 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatattt 14667554  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  14667553 atgaattaatgatgt 14667539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14498026 - 14497898
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||    
T  14498026 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttga 14497928  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14497927 tgaataattattattatgaattaatgatgt 14497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 4108803 - 4108918
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaa-tgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattat 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  4108803 ctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattat 4108902  T
Q  182 tatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||| | |||||||    
T  4108903 tatgaattaatgatgt 4108918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 4112652 - 4112767
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaa-tgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattat 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  4112652 ctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattat 4112751  T
Q  182 tatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||| | |||||||    
T  4112752 tatgaattaatgatgt 4112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12337319 - 12337206
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgga-atgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  12337319 tatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat-agttgtcttttattcatgaattgataattgagatgtttgatgaataagtattatt 12337221  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  12337220 atgaattgatgatgt 12337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14681611 - 14681541
Alignment:
Q  86 tgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681611 tgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15963561 - 15963461
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  15963561 ctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 15963462  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  15963461 a 15963461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15967485 - 15967385
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  15967485 ctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 15967386  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  15967385 a 15967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15971409 - 15971309
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  15971409 ctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 15971310  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  15971309 a 15971309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 4590160 - 4590239
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4590160 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 4590239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 8491732 - 8491811
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8491732 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 8491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15463941 - 15463868
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15463941 tatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 15463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 17318511 - 17318588
Alignment:
Q  70 tacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318511 tacatgaagttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 17318588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23173361 - 23173287
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23173361 ctatgagttgttaaatatacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatg 23173287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 14068062 - 14068141
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14068062 attacatgatgttatctaggagttgctaaatgtatttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 14068141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15564883 - 15564801
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15564883 atgttaagttgatgtgttgtcttctgttcatgagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattattatgaattgatgatgt 15564801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15555670 - 15555602
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15555670 atgttaagttgttaagttgtcttatattcatgagttgctaatgagatgtttgatgaagaattattatta 15555602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Original strand, 17348806 - 17348856
Alignment:
Q  147 aattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17348806 aattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 17348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 14648275 - 14648327
Alignment:
Q  73 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  14648275 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 14648327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 37440680 - 37440731
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtt 119  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37440680 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgtt 37440731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 8928765 - 8928840
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatga 76  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  8928765 tttatgttgttgattatgacgatgttatgatgactttttatggagttgaatatgaggttgttatgatgttacatga 8928840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37379182 - 37378986
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37379182 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 37379083  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37379082 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 37378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 19663567 - 19663686
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663567 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 19663666  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19663667 ttattatgaaatgatgatgt 19663686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20260326 - 20260207
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260326 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 20260227  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20260226 ttattatgaaatgatgatgt 20260207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9240743 - 9240624
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240743 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 9240644  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9240643 ttattatgaaatgatgatgt 9240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6481853 - 6481734
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6481853 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataatta 6481754  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6481753 ttattatgaaatgatgatgt 6481734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6485320 - 6485201
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6485320 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataatta 6485221  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6485220 ttattatgaaatgatgatgt 6485201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 197
Target Start/End: Original strand, 21074510 - 21074636
Alignment:
Q  71 acatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatga 170  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21074510 acatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaaaatgtttgatga 21074609  T
Q  171 ataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21074610 ataattattattatgaaatgatgatgt 21074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 197
Target Start/End: Original strand, 10686272 - 10686375
Alignment:
Q  94 taaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686272 taaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatg 10686371  T
Q  194 atgt 197  Q
    ||||    
T  10686372 atgt 10686375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 24630047 - 24630176
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  24630047 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 24630146  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24630147 tgaataattattattatgaattaatgatgt 24630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24645230 - 24645101
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  24645230 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttga 24645131  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24645130 tgaataattattattatgaattaatgatgt 24645101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24648006 - 24647877
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  24648006 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttga 24647907  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24647906 tgaataattattattatgaattaatgatgt 24647877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 30346657 - 30346786
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  30346657 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 30346756  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30346757 tgaataattattattatgaattaatgatgt 30346786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 27380993 - 27381112
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  27380993 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 27381092  T
Q  168 tgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27381093 tgaataattattattatgaa 27381112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 27384963 - 27385082
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  27384963 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 27385062  T
Q  168 tgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27385063 tgaataattattattatgaa 27385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 10103311 - 10103425
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10103311 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 10103410  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  10103411 atgaattaatgatgt 10103425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 12902621 - 12902735
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12902621 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 12902720  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  12902721 atgaattaatgatgt 12902735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24647158 - 24647044
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24647158 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattatt 24647059  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  24647058 atgaattaatgatgt 24647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27600450 - 27600321
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  27600450 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 27600351  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27600350 tgaataattattgttatgaattaatgatgt 27600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9784073 - 9783984
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9784073 attacatgatgttatctatgagttgtttaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 9783984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31343996 - 31343867
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  31343996 attacatgaagatatctatgagttgttaggtgtacttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttga 31343897  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31343896 tgaataattattattatgaattaatgatgt 31343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 41532457 - 41532557
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  41532457 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 41532556  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  41532557 a 41532557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11774442 - 11774246
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11774442 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacccatgagttgttaaatgt 11774343  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11774342 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 11774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 8414909 - 8415105
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414909 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttaaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 8415008  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8415009 acttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8415105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 21967925 - 21968071
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21967925 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgt 21968024  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21968025 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 21980765 - 21980911
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21980765 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgattttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgt 21980864  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21980865 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21980911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 21985748 - 21985894
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21985748 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatattttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgt 21985847  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985848 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 22009129 - 22009275
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22009129 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgt 22009228  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22009229 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 22009275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21328712 - 21328527
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21328712 tttatgttgatgattatgacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgtgaggttgttatgatgttacatgatgttatctatgagttgttaaatgt 21328613  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatga 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21328612 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatgcttgttgaataattattgttatga 21328527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 44494156 - 44494280
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44494156 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgaattgttaaatgt 44494255  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44494256 acttgatgatggttatgttaagttg 44494280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23427905 - 23427776
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23427905 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatgtttga 23427806  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23427805 tgaataattattattataaattgatgatgt 23427776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 22000716 - 22000857
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||      ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22000716 tttatgttgatgagtatgactaggttatgatgatcttttatagg-----atgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgt 22000810  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22000811 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 22000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 27942700 - 27942814
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27942700 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt 27942799  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  27942800 atgaattgatgatgt 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 363327 - 363218
Alignment:
Q  88 agttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  363327 agttgttaaatgtacttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgga 363228  T
Q  188 atgatgatgt 197  Q
    ||||||||||    
T  363227 atgatgatgt 363218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 42560814 - 42561005
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||  | |||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42560814 tttatgttgatgattatgacgatgctatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggctgttttgatgttacatgatgttatctatgagttgttaaatgt 42560913  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 192  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42560914 acgtgatggtggttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 42561005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729738
Alignment:
Q  104 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8729738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 34950232 - 34950124
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34950232 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttatatagtgttgaatgtgaggttgttctgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgt 34950133  T
Q  101 acttgatga 109  Q
    |||||||||    
T  34950132 acttgatga 34950124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Original strand, 44385833 - 44385947
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  44385833 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 44385932  T
Q  168 tgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||||    
T  44385933 tgaataattattatt 44385947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 11252020 - 11252138
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     || |||||||||||||||||||||||    
T  11252020 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggtggttatgatat-----gatgttacctatgagttgttaaatgt 11252114  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  11252115 acttgatga-ggttatgttaagttg 11252138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21409980 - 21409850
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  21409980 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttg 21409881  T
Q  167 atgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21409880 atgaataattattattatgaattaatgatgt 21409850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21804472 - 21804342
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  21804472 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttg 21804373  T
Q  167 atgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21804372 atgaataattattattatgaattaatgatgt 21804342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 14399092 - 14399221
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  14399092 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 14399191  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  14399192 tgaataagtattattacgaattaatgatgt 14399221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 21974183 - 21974312
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  21974183 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 21974282  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21974283 tgaataattattattatgaattaatgatgt 21974312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43250281 - 43250152
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  43250281 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 43250182  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43250181 tgaataattattattatgaattaatgatgt 43250152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 21829475 - 21829589
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21829475 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 21829574  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  21829575 atgaattaatgatgt 21829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 21978293 - 21978422
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  21978293 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 21978392  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21978393 tgaataattattattatgaattaatgatgt 21978422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22110665 - 22110551
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22110665 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 22110566  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  22110565 atgaattaatgatgt 22110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23913344 - 23913255
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23913344 attacatgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 23913255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 18864119 - 18864219
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  18864119 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 18864218  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  18864219 a 18864219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 30941579 - 30941679
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  30941579 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 30941678  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  30941679 a 30941679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21386238 - 21386159
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21386238 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23955515 - 23955319
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23955515 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacccatgagttgttaaatgt 23955416  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955415 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23955319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28708005 - 28707880
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28708005 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 28707906  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttga 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28707905 acttgatgagggttatgttaagttga 28707880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12941290 - 12941171
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12941290 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaataatta 12941191  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12941190 ttattatgaaatgatgatgt 12941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4475858 - 4475745
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4475858 tatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 4475759  T
Q  184 tgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||    
T  4475758 tgaaatgatgatgt 4475745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27222901 - 27222782
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27222901 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataacta 27222802  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27222801 ttattatgaaatgatgatgt 27222782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 28290904 - 28291023
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28290904 gttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattgaatgtttgatgaataatta 28291003  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28291004 ttattatgaaatgatgatgt 28291023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 34297705 - 34297896
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34297705 tttatgttgatgattatgacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgaaaggctgttttgatgttacatgatgttatctatgagttgttaaatgt 34297804  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34297805 acttgctgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 34297896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25738037 - 25737842
Alignment:
Q  2 ttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgta 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  25738037 ttatgttgatgattatgacgaggttatgatgattgtttatagtgttgagtgtgaggtttttatgatgttacatgatgttatctatgagttggtaaatgta 25737938  T
Q  102 cttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  25737937 cttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgagatgcttgctgaataattactgttatgaattgataatgt 25737842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23538060 - 23537931
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  23538060 attacatgatgttgtctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgagatgtttga 23537961  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23537960 tgaataattattattatgaattgatgatgt 23537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 22075405 - 22075519
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22075405 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 22075504  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  22075505 atgaattgatgatgt 22075519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23400757 - 23400627
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  23400757 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgagatgtttg 23400658  T
Q  167 atgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||    
T  23400657 atgaataattattattataaagtaatgatgt 23400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 31479462 - 31479591
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  31479462 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttga 31479561  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31479562 tgaataattattattatgaattaatgatgt 31479591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 9622846 - 9622969
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9622846 tttatgttgatgagtatgacgagcttatgatgattctctataatgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgtt-aatgt 9622944  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||    
T  9622945 acttgatgagggttatgtaaagttg 9622969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 27416542 - 27416656
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  27416542 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 27416641  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  27416642 atgaattgatgatgt 27416656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8242491 - 8242362
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  8242491 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 8242392  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8242391 tgaataattattattatgaattaatgatgt 8242362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11565480 - 11565351
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  11565480 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 11565381  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11565380 tgaataattattattatgaattaatgatgt 11565351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 11716940 - 11717069
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  11716940 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 11717039  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11717040 tgaataattattattatgaattaatgatgt 11717069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 12620333 - 12620462
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  12620333 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 12620432  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12620433 tgaataattattattatgaattaatgatgt 12620462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23988382 - 23988253
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  23988382 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttga 23988283  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23988282 tgaataattattattatgaattaatgatgt 23988253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27555618 - 27555490
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  27555618 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 27555520  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27555519 tgaataagtattattatgaattgatgatgt 27555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14470944 - 14470831
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14470944 tatgagttgttaggtgtacttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatta 14470845  T
Q  184 tgaaatgatgatgt 197  Q
    |||| | |||||||    
T  14470844 tgaattaatgatgt 14470831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22947731 - 22947617
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22947731 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 22947632  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  22947631 atgaattaatgatgt 22947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22951687 - 22951573
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22951687 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 22951588  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  22951587 atgaattaatgatgt 22951573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23870175 - 23870061
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23870175 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 23870076  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  23870075 atgaattaatgatgt 23870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23874131 - 23874017
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23874131 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 23874032  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  23874031 atgaattaatgatgt 23874017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22861834 - 22861705
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  22861834 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 22861735  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22861734 tgaataattatgattatgaattaatgatgt 22861705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23393705 - 23393605
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23393705 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 23393606  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  23393605 a 23393605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23413613 - 23413513
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23413613 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 23413514  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  23413513 a 23413513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16758779 - 16758665
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16758779 ctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgagatgtttgatgaataattattatt 16758680  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| | |||||||    
T  16758679 atgaattaatgatgt 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1254223 - 1254114
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  1254223 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatggttgatgaataattattgtt 1254124  T
Q  183 atgaaatgat 192  Q
    ||||| ||||    
T  1254123 atgaattgat 1254114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19869251 - 19869160
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataa 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19869251 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 19869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2076365 - 2076276
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2076365 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatg 2076276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16622914 - 16622797
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  16622914 attacatgatattatctatgaattgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgagatgtttga 16622817  T
Q  168 tgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  16622816 tgaatgattatcattatgaa 16622797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 18918580 - 18918659
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18918580 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 18918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 18953483 - 18953562
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18953483 attacatgatgtcatctaggagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 18953562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 14594666 - 14594718
Alignment:
Q  73 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  14594666 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 14594718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23537923 - 23537887
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23537923 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatg 23537887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7429496 - 7429449
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  7429496 gttacctatgagttgttaaatgtactcgaggggggttatgttaagttg 7429449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 33473864 - 33474060
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33473864 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacccatgagttgttaaatgt 33473963  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473964 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 33474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19076035 - 19075911
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19076035 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 19075936  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  19075935 acttgatgagggttatgttaagttg 19075911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 198
Target Start/End: Original strand, 28372091 - 28372211
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28372091 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 28372190  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28372191 ttattatgaaatgatgatgtc 28372211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 37600018 - 37600137
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37600018 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 37600117  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37600118 ttattatgaaatgatgatgt 37600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 31253143 - 31253267
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31253143 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctacaagttgttaaatgt 31253242  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  31253243 acttgatgagggttatgttaagttg 31253267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 38146428 - 38146547
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38146428 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 38146527  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38146528 ttattatgaaatgatgatgt 38146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19510531 - 19510412
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19510531 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataatta 19510432  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19510431 ttattatgaaatgatgatgt 19510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22339081 - 22338962
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339081 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 22338982  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  22338981 ttattatgaaataatgatgt 22338962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 22120591 - 22120720
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22120591 attatatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 22120690  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120691 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 22120720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22335551 - 22335432
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22335551 gttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 22335452  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  22335451 ttattatgaaataatgatgt 22335432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 23113412 - 23113531
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113412 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 23113511  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  23113512 ttattatggaatgatgatgt 23113531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 41878661 - 41878780
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878661 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 41878760  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  41878761 ttattatggaatgatgatgt 41878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36459694 - 36459503
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36459694 tttatgttgatgattatgacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggctgttttgatgttacatgatgttatctatgagttgttaaatgt 36459595  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 192  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36459594 acttaatgatgattatgttaagttgataagttgttccttattcatgttttgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 36459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 15238117 - 15238246
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  15238117 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttga 15238216  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15238217 tgaataattattattatgaattaatgatgt 15238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10751896 - 10751767
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||||    
T  10751896 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgagatggttga 10751797  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10751796 tgaataattattattatgaattaatgatgt 10751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20294593 - 20294464
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  20294593 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 20294494  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20294493 tgaataattattattatgaattaatgatgt 20294464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 20912252 - 20912381
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  20912252 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttga 20912351  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20912352 tgaataattattgttatgaattaatgatgt 20912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 22108449 - 22108577
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22108449 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg-ttacgtataattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 22108547  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108548 tgaataattattattatgaattgatgatgt 22108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 24768562 - 24768691
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  24768562 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 24768661  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  24768662 tgaataattaatattatgaattaatgatgt 24768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18354876 - 18354760
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  18354876 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 18354777  T
Q  168 tgaataattattattat 184  Q
    |||||||||||||||||    
T  18354776 tgaataattattattat 18354760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 19474172 - 19474291
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  19474172 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 19474271  T
Q  168 tgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19474272 tgaataattattattatgaa 19474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11219619 - 11219505
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  11219619 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactatt 11219520  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    | ||| | |||||||    
T  11219519 acgaattaatgatgt 11219505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11224205 - 11224091
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  11224205 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactatt 11224106  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    | ||| | |||||||    
T  11224105 acgaattaatgatgt 11224091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11228027 - 11227913
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  11228027 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactatt 11227928  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    | ||| | |||||||    
T  11227927 acgaattaatgatgt 11227913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 40727399 - 40727517
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  40727399 attacatgaagatatctataagttgtttggtgtacttgatgatg-ttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataaagagatgtttga 40727497  T
Q  168 tgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40727498 tgaataattattattatgaa 40727517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11226221 - 11226107
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||||    
T  11226221 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactatt 11226122  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    | ||| | |||||||    
T  11226121 acgaattaatgatgt 11226107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11230017 - 11229903
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||||    
T  11230017 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactatt 11229918  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    | ||| | |||||||    
T  11229917 acgaattaatgatgt 11229903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22749230 - 22749152
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  22749230 gttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatgagttgttaat 22749152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 43243764 - 43243816
Alignment:
Q  73 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  43243764 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 43243816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9775014 - 9774932
Alignment:
Q  73 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  9775014 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat-gttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaat 9774932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28384997 - 28384801
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384997 tttatgttgatgagtatgacgatgttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 28384898  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384897 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 28384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 24048384 - 24048513
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24048384 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttga 24048483  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048484 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15533288 - 15533169
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533288 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 15533189  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15533188 ttattatgaaatgatgatgt 15533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18211673 - 18211554
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211673 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 18211574  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18211573 ttattatgaaatgatgatgt 18211554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36037021 - 36036902
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36037021 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttcatgaataatta 36036922  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36036921 ttattatgaaatgatgatgt 36036902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 37839124 - 37839248
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  37839124 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacacgaggttacctacaagttgttaaatgt 37839223  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  37839224 acttgatgagggttatgttaagttg 37839248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30145847 - 30145733
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30145847 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt 30145748  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  30145747 atgaattgatgatgt 30145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 17052445 - 17052574
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  17052445 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 17052544  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17052545 tgaataattattattatgaattgatgatgt 17052574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 22634926 - 22635055
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22634926 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgagatgtttga 22635025  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22635026 tgaataattattattatgaattgatgatgt 22635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 49549092 - 49549212
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataa-gttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49549092 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatt 49549191  T
Q  177 attattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  49549192 attattatggaatgatgatgt 49549212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 42597853 - 42597977
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  42597853 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttatataatgttgaatgagaggttgttatgatattacaagaggttacctaaaagttgttaaatgt 42597952  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  42597953 acttgatgagggttatgttaagttg 42597977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 13813832 - 13813961
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  ||||||||    
T  13813832 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgagatgtttga 13813931  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13813932 tgaataattattattatgaattgatgatgt 13813961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 13818320 - 13818449
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  13818320 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgagatgtttga 13818419  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818420 tgaataattattattatgaattgatgatgt 13818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12423022 - 12422908
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  12423022 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 12422923  T
Q  168 tgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||||    
T  12422922 tgaataattattatt 12422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 20158447 - 20158576
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20158447 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 20158546  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20158547 tgaataagtattattatgaattgatgatgt 20158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 20163898 - 20164027
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20163898 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 20163997  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20163998 tgaataagtattattatgaattgatgatgt 20164027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15223625 - 15223496
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||    
T  15223625 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttga 15223526  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15223525 tgaataattattattatgaattaatgatgt 15223496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 23996966 - 23997094
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  23996966 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgt-aagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 23997064  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23997065 tgaataatcattattatgaattaatgatgt 23997094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 4562773 - 4562902
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  4562773 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 4562872  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4562873 tgaataattattattatgaattaatgatgt 4562902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 5758455 - 5758584
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  5758455 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 5758554  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5758555 tgaataattattattatgaattaatgatgt 5758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9555148 - 9555019
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  9555148 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 9555049  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9555048 tgaataattattattatgaattaatgatgt 9555019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 14758991 - 14759120
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  14758991 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 14759090  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14759091 tgaataattattattatgaattaatgatgt 14759120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 14955759 - 14955888
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  14955759 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 14955858  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14955859 tgaataattattattatgaattaatgatgt 14955888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 20161123 - 20161252
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  20161123 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatgtttga 20161222  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20161223 tgaataagtattattatgaattgatgatgt 20161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33740915 - 33740786
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  33740915 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 33740816  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33740815 tgaataattattattatgaattaatgatgt 33740786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12486350 - 12486221
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||    
T  12486350 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttga 12486251  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12486250 tgaataattattattatgaattaatgatgt 12486221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25688521 - 25688392
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  25688521 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttga 25688422  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25688421 tgaataattattattatgaattaatgatgt 25688392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17807133 - 17807017
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  17807133 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 17807034  T
Q  168 tgaataattattattat 184  Q
    |||||||||||||||||    
T  17807033 tgaataattattattat 17807017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38107037 - 38106897
Alignment:
Q  57 gttgttatgat-attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaa 155  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  38107037 gttgttatgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgagttgctaa 38106938  T
Q  156 tggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  38106937 t-gaatgtttgatgaagaattattattatgaattaatgatgt 38106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 631747 - 631836
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  631747 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgagttgctaatg 631836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 24048521 - 24048597
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048521 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10711904 - 10711825
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10711904 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10925674 - 10925595
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10925674 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10925595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27532831 - 27532752
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27532831 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttctattcatga 27532752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 13818457 - 13818533
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818457 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40906391 - 40906323
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40906391 atgttaagttgttaagttgtcttctattcataagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattatta 40906323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14047361 - 14047308
Alignment:
Q  104 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  14047361 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtattttattcatgagttgttaatg 14047308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38106866 - 38106798
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  38106866 atgttaagttgttaagttgtcttctatttatgagttgctaatgagatgttttatgaagaattattatta 38106798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 157
Target Start/End: Original strand, 22635063 - 22635099
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22635063 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 22635099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 166
Target Start/End: Original strand, 13813969 - 13814014
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  13813969 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttg 13814014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 166
Target Start/End: Original strand, 13818541 - 13818586
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  13818541 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttg 13818586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Original strand, 49548998 - 49549055
Alignment:
Q  19 acgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatga 76  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  49548998 acgaagttatgatgattgtttatagtgttgaatatgaggttgttatgatgttacatga 49549055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11945140 - 11945016
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11945140 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctacgagttgttaaatgt 11945041  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  11945040 acttgatgagggttatgttaagttg 11945016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 43630925 - 43631049
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43630925 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctacgagttgttaaatgt 43631024  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  43631025 acttgatgagggttatgttaagttg 43631049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29533992 - 29533837
Alignment:
Q  43 gtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttac-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttat 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29533992 gtgttgaatatgaggttgttatgatattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtgtttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttat 29533893  T
Q  142 tcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29533892 tcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 29533837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 11809883 - 11810025
Alignment:
Q  2 ttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11809883 ttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcatctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttgttaaatgta 11809982  T
Q  102 cttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattca 144  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11809983 cttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattca 11810025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32649130 - 32649017
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649130 tatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 32649031  T
Q  184 tgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||    
T  32649030 tgaaatgatgatgt 32649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16370994 - 16370875
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16370994 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataacta 16370895  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16370894 ttattatgaaatgatgatgt 16370875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 22132098 - 22132227
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22132098 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 22132197  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22132198 tgaataattattattatgaattgatgatgt 22132227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33796112 - 33795983
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  33796112 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttga 33796013  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33796012 tgaataattattattatgaattaatgatgt 33795983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439281
Alignment:
Q  104 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 20439281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 20230138 - 20230258
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 166  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  20230138 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttg 20230237  T
Q  167 atgaataattattattatgaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20230238 atgaataattattattatgaa 20230258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1009341 - 1009212
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  1009341 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 1009242  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1009241 tgaataattattattatgaattaatgatgt 1009212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 1926795 - 1926924
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  1926795 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 1926894  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1926895 tgaataattattattatgaattaatgatgt 1926924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 16376815 - 16376944
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  16376815 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 16376914  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16376915 tgaataattattattatgaattaatgatgt 16376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 20925809 - 20925938
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  20925809 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 20925908  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20925909 tgaataattattattatgaattaatgatgt 20925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 41389664 - 41389793
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||| ||||    
T  41389664 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgagatggttga 41389763  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41389764 tgaataattattattatgaattaatgatgt 41389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 39245170 - 39245297
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  39245170 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgagatgtttga 39245267  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39245268 tgaataattattattatgaattaatgatgt 39245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 39248725 - 39248852
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  39248725 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgagatgtttga 39248822  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39248823 tgaataattattattatgaattaatgatgt 39248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 41801278 - 41801367
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41801278 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 41801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 52634347 - 52634218
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  52634347 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgagatgtttga 52634248  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  52634247 tgaataattattattatgaattaatgatgt 52634218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 636503 - 636596
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  636503 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatctt-------gttgaatgcgatgttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 636595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21406332 - 21406253
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21406332 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21406253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 20032180 - 20032232
Alignment:
Q  73 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  20032180 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 20032232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 109670 - 109551
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109670 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 109571  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  109570 ttattatgaaatgatgatgt 109551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 224152 - 224271
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224152 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 224251  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  224252 ttattatgaaatgatgatgt 224271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 35
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  156 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctttgagttgttaaatgt 57  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaag 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  56 acttgatgagggttatgttaag 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 3198 - 3315
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 3297  T
Q  101 acttgatgatggttatgt 118  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  3298 acttgatgagggttatgt 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 269 - 150
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  269 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 170  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  169 ttattatgtaatgatgatgt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Original strand, 10831 - 10945
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10831 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 10930  T
Q  178 ttattatgaaatgat 192  Q
    |||||||||||||||    
T  10931 ttattatgaaatgat 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Original strand, 3532 - 3645
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532 tatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 3631  T
Q  184 tgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||    
T  3632 tgaaatgatgatgt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Original strand, 1 - 61
Alignment:
Q  137 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34016 - 33887
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34016 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttga 33917  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33916 tgaataattattattatgaattgatgatgt 33887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28551 - 28468
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 151  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28551 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 28468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4267 - 4076
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||| | || |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4267 tttatgttgatgattatgatgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggcttttttgatgttacatgatgttatctatgagttgttaaatgt 4168  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4167 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Original strand, 25569 - 25696
Alignment:
Q  70 tacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatg 169  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  25569 tacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgtgatgtttgatg 25668  T
Q  170 aataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25669 aataattattattatgaattgatgatgt 25696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37661
Alignment:
Q  104 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 37661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5311 - 5192
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5311 gttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatggaatgtttgatgaataatta 5212  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  5211 ttatgatgaattgatgatgt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 8739 - 8868
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  8739 attacatgatgttatctacgagttgttaaatgtacatgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 8838  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8839 tgaataattattattataaaatgatgatgt 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 173158 - 173278
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatgagttgttaaatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  173158 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattatatgatgttacctattagttgttaaatgt 173257  T
Q  101 acttgatgatggttatgttaa 121  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  173258 acttgatgagggttatgttaa 173278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14923 - 14804
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  14923 attacatgaagatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 14824  T
Q  168 tgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14823 tgaataattattattatgaa 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 835 - 949
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  835 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 934  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  935 atgaattgatgatgt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18892 - 18773
Alignment:
Q  78 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataatta 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||     
T  18892 gttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattg 18793  T
Q  178 ttattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| || |||||||||    
T  18792 ttattataaattgatgatgt 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 70819 - 70705
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  70819 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 70720  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  70719 atgaattgatgatgt 70705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 82; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11130 - 11001
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  11130 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 11031  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11030 tgaataattattattatgaattaatgatgt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 82; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 11059 - 11188
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  11059 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttga 11158  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11159 tgaataattaatattatgaattaatgatgt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 82; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 60325 - 60454
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  60325 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 60424  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  60425 tgaataattattattatgaattaatgatgt 60454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11841 - 11727
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  11841 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 11742  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  11741 atgaattgatgatgt 11727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 6960 - 7049
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6960 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 34127 - 34256
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||    
T  34127 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttga 34226  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34227 tgaataattattattatgaattaatgatgt 34256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 68555 - 68684
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  68555 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttga 68654  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  68655 tgaataattattattatgaattaatgatgt 68684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 74331 - 74420
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74331 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatg 74420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Original strand, 5546 - 5659
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5546 tatgagttcttaggtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttatta 5645  T
Q  184 tgaaatgatgatgt 197  Q
    |||| | |||||||    
T  5646 tgaattaatgatgt 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8656 - 8540
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  8656 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttga 8557  T
Q  168 tgaataattattattat 184  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8556 tgaatgattattattat 8540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 15589 - 15689
Alignment:
Q  83 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  15589 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatt 15688  T
Q  183 a 183  Q
    |    
T  15689 a 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 148
Target Start/End: Original strand, 37202 - 37282
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 148  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37202 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 37282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5888 - 5775
Alignment:
Q  84 tatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgga-atgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||    
T  5888 tatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-agttgtcttttattcatgaattgataattgagacgtttgatgaataagtattatt 5790  T
Q  183 atgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||    
T  5789 atgaattgatgatgt 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 6320 - 6448
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 167  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||    
T  6320 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttga 6418  T
Q  168 tgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6419 tgaataactattattatgaattaatgatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 175512 - 175425
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatgaggttacctatga 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175512 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattacatgaggttacctatga 175425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 192
Target Start/End: Original strand, 163588 - 163691
Alignment:
Q  89 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||     
T  163588 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataacttgttccttattcatgttttggtaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaat 163687  T
Q  189 tgat 192  Q
    ||||    
T  163688 tgat 163691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 163532 - 163594
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgtta 63  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  163532 tttatgttgatgattatgacgatgttgtgacgattgtttatagtgttgaatgtgaggttgtta 163594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4053 - 3974
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4053 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 23937 - 24016
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23937 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 24016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 62839 - 62918
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62839 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 62918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 37197 - 37276
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37197 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 37276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10827 - 10765
Alignment:
Q  87 gagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaat 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10827 gagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaat 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 21339 - 21420
Alignment:
Q  68 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 157  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgt--------taagttgtcttttattcatgaattgctaatg 21420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115473
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtatttttatgaattgatgatgt 115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 641
Alignment:
Q  138 ttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 197  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  700 ttatccatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 605
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  633 agttgataagttgtcttttattcatgaat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 444 - 496
Alignment:
Q  73 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  444 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 208688 - 208655
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgat 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208688 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgat 208655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 34154 - 34123
Alignment:
Q  1 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154 tttatgttgatgagtatgacgaggttatgatg 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34128 - 34076
Alignment:
Q  73 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||    
T  34128 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagtgttatgttaggttg 34076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University