View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6660_low_15 (Length: 219)

Name: NF6660_low_15
Description: NF6660
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6660_low_15
NF6660_low_15
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (1-209)||(37775744-37775950)
chr4 (17-209)||(4598067-4598258)
chr4 (20-209)||(32592168-32592357)
chr4 (1-209)||(30002560-30002760)
chr4 (1-208)||(33341475-33341690)
chr4 (1-209)||(55241024-55241240)
chr4 (1-209)||(34948014-34948233)
chr4 (1-209)||(17173365-17173582)
chr4 (1-209)||(17167788-17168005)
chr4 (1-209)||(36493608-36493824)
chr4 (1-202)||(28002905-28003115)
chr4 (20-209)||(37663679-37663877)
chr4 (20-209)||(25700994-25701193)
chr4 (1-198)||(55477810-55478016)
chr4 (20-209)||(7703592-7703782)
chr4 (21-209)||(23761147-23761343)
chr4 (1-209)||(35020954-35021171)
chr4 (24-209)||(9139320-9139498)
chr4 (20-204)||(4934140-4934333)
chr4 (2-209)||(49376042-49376258)
chr4 (23-209)||(27396691-27396886)
chr4 (1-211)||(38011927-38012146)
chr4 (20-205)||(46888096-46888289)
chr4 (20-209)||(19089391-19089589)
chr4 (1-203)||(47253829-47254032)
chr4 (72-209)||(29584199-29584336)
chr4 (1-201)||(5047885-5048093)
chr4 (1-209)||(19440567-19440784)
chr4 (16-211)||(6864108-6864312)
chr4 (76-206)||(33816536-33816666)
chr4 (1-209)||(50764805-50765012)
chr4 (20-176)||(1815409-1815574)
chr4 (20-209)||(50697317-50697515)
chr4 (1-209)||(37287809-37288020)
chr4 (75-209)||(54499239-54499375)
chr4 (35-209)||(879501-879684)
chr4 (72-184)||(17272068-17272176)
chr4 (72-209)||(25184188-25184325)
chr4 (1-209)||(34361411-34361627)
chr4 (17-205)||(42199808-42200005)
chr4 (7-162)||(3042741-3042905)
chr4 (78-209)||(39397993-39398115)
chr4 (20-206)||(35025534-35025721)
chr4 (1-195)||(32579536-32579738)
chr4 (20-183)||(32912518-32912690)
chr4 (21-69)||(39400232-39400280)
chr4 (1-58)||(4205219-4205276)
chr4 (20-65)||(33816454-33816499)
chr4 (20-72)||(7152142-7152194)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (1-209)||(12165802-12166010)
chr7 (20-209)||(21991686-21991884)
chr7 (1-190)||(44598735-44598933)
chr7 (1-209)||(15612653-15612870)
chr7 (1-211)||(8861333-8861552)
chr7 (1-209)||(5657375-5657592)
chr7 (1-203)||(43686096-43686307)
chr7 (1-206)||(41764972-41765186)
chr7 (70-209)||(22687289-22687428)
chr7 (1-209)||(26980373-26980573)
chr7 (1-209)||(6546569-6546786)
chr7 (17-209)||(11071256-11071454)
chr7 (16-209)||(4582969-4583171)
chr7 (20-205)||(9355739-9355933)
chr7 (20-209)||(38258595-38258793)
chr7 (1-209)||(32820947-32821164)
chr7 (7-209)||(32432502-32432713)
chr7 (20-209)||(18797377-18797575)
chr7 (20-209)||(30055577-30055775)
chr7 (20-209)||(27283794-27283992)
chr7 (1-209)||(33688156-33688373)
chr7 (1-209)||(37347072-37347288)
chr7 (1-184)||(31578958-31579150)
chr7 (72-209)||(7334844-7334981)
chr7 (1-209)||(24211791-24212008)
chr7 (17-164)||(15672672-15672828)
chr7 (19-201)||(25691456-25691647)
chr7 (1-209)||(12390543-12390741)
chr7 (1-209)||(37109922-37110141)
chr7 (1-209)||(29173590-29173789)
chr7 (20-204)||(10481660-10481853)
chr7 (72-209)||(27421354-27421490)
chr7 (72-209)||(44413353-44413490)
chr7 (20-209)||(23111240-23111440)
chr7 (72-175)||(37704241-37704344)
chr7 (1-209)||(31520635-31520834)
chr7 (1-206)||(48928191-48928404)
chr7 (1-209)||(17842478-17842697)
chr7 (20-206)||(48928477-48928671)
chr7 (23-209)||(10359130-10359325)
chr7 (17-194)||(43925167-43925352)
chr7 (1-140)||(26587986-26588126)
chr7 (1-151)||(46481023-46481182)
chr7 (1-198)||(37703392-37703590)
chr7 (93-206)||(32593184-32593296)
chr7 (1-72)||(44411434-44411505)
chr7 (135-209)||(26524364-26524438)
chr7 (1-206)||(35353161-35353375)
chr7 (154-209)||(34362205-34362259)
chr7 (93-205)||(38053540-38053644)
chr7 (1-63)||(37704387-37704449)
chr7 (1-65)||(32593100-32593164)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (27-209)||(48620708-48620890)
chr1 (20-209)||(3535003-3535192)
chr1 (1-209)||(7078951-7079168)
chr1 (1-209)||(47279260-47279477)
chr1 (1-206)||(27227373-27227587)
chr1 (1-202)||(238401-238611)
chr1 (4-209)||(38823285-38823499)
chr1 (1-209)||(27532869-27533085)
chr1 (8-209)||(34012277-34012482)
chr1 (20-203)||(41926240-41926426)
chr1 (1-207)||(27267088-27267302)
chr1 (1-209)||(42721110-42721324)
chr1 (72-209)||(10181976-10182113)
chr1 (2-209)||(15752100-15752316)
chr1 (1-200)||(14758121-14758320)
chr1 (1-198)||(16415728-16415934)
chr1 (1-208)||(37618789-37618998)
chr1 (1-209)||(2959819-2960036)
chr1 (1-209)||(32216126-32216343)
chr1 (1-202)||(25160710-25160920)
chr1 (20-209)||(15383004-15383202)
chr1 (1-209)||(27563793-27564010)
chr1 (1-197)||(30326840-30327045)
chr1 (20-195)||(15168181-15168365)
chr1 (20-203)||(47682401-47682593)
chr1 (20-209)||(9902961-9903159)
chr1 (20-204)||(4330357-4330550)
chr1 (1-192)||(8222216-8222416)
chr1 (22-209)||(18422722-18422918)
chr1 (20-209)||(32267105-32267303)
chr1 (1-209)||(28564671-28564886)
chr1 (1-201)||(30254502-30254711)
chr1 (20-198)||(39393465-39393653)
chr1 (1-209)||(11742256-11742455)
chr1 (1-206)||(40884887-40885101)
chr1 (20-188)||(33725507-33725684)
chr1 (1-209)||(37451357-37451573)
chr1 (1-209)||(51128930-51129147)
chr1 (86-206)||(31621535-31621655)
chr1 (1-209)||(19899657-19899874)
chr1 (35-205)||(10922802-10922981)
chr1 (70-209)||(1547358-1547489)
chr1 (20-203)||(3309224-3309422)
chr1 (1-184)||(22170807-22170999)
chr1 (20-209)||(23999418-23999616)
chr1 (20-203)||(28769729-28769922)
chr1 (136-209)||(21289743-21289816)
chr1 (20-205)||(46931486-46931678)
chr1 (20-197)||(27763218-27763404)
chr1 (1-199)||(38759610-38759821)
chr1 (1-72)||(48353759-48353830)
chr1 (20-65)||(1359842-1359887)
chr1 (1-58)||(21289831-21289888)
chr1 (1-52)||(31962853-31962904)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (1-209)||(465916-466123)
chr8 (1-209)||(11727098-11727315)
chr8 (20-209)||(36694884-36695082)
chr8 (20-209)||(6098436-6098634)
chr8 (20-209)||(9864222-9864420)
chr8 (1-200)||(5299845-5300053)
chr8 (1-209)||(38644052-38644269)
chr8 (20-209)||(34895041-34895234)
chr8 (1-209)||(12876183-12876401)
chr8 (20-209)||(13307697-13307894)
chr8 (20-209)||(16446793-16446991)
chr8 (1-209)||(27082737-27082954)
chr8 (20-191)||(41910907-41911086)
chr8 (20-209)||(1149550-1149748)
chr8 (1-204)||(16222942-16223154)
chr8 (1-209)||(34951956-34952147)
chr8 (35-209)||(37970452-37970635)
chr8 (7-209)||(39099024-39099235)
chr8 (20-209)||(10555122-10555318)
chr8 (20-201)||(1205009-1205199)
chr8 (4-211)||(7890859-7891075)
chr8 (20-158)||(4132604-4132750)
chr8 (20-204)||(44869576-44869769)
chr8 (1-209)||(40862494-40862710)
chr8 (78-209)||(1150090-1150221)
chr8 (1-209)||(31933785-31934002)
chr8 (20-207)||(1953906-1954104)
chr8 (22-205)||(43025780-43025972)
chr8 (1-179)||(33906316-33906503)
chr8 (72-209)||(43643574-43643711)
chr8 (93-209)||(41362589-41362705)
chr8 (20-209)||(23854349-23854547)
chr8 (72-209)||(30654562-30654699)
chr8 (1-161)||(8803716-8803885)
chr8 (84-201)||(35459702-35459819)
chr8 (93-176)||(7998401-7998485)
chr8 (1-137)||(18259229-18259370)
chr8 (1-89)||(1149819-1149912)
chr8 (95-185)||(33197947-33198029)
chr8 (7-58)||(34463708-34463759)
chr8 (20-65)||(35859161-35859206)
chr8 (168-200)||(4133085-4133117)
chr8 (20-72)||(7998498-7998550)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (1-209)||(32563224-32563432)
chr5 (1-209)||(9200308-9200516)
chr5 (1-209)||(7693305-7693513)
chr5 (1-209)||(22019707-22019915)
chr5 (1-205)||(42342812-42343013)
chr5 (20-209)||(19119934-19120132)
chr5 (1-209)||(36866837-36867054)
chr5 (54-209)||(28416472-28416627)
chr5 (8-209)||(30969214-30969424)
chr5 (1-209)||(40133460-40133677)
chr5 (1-211)||(25500809-25501028)
chr5 (20-209)||(5837630-5837828)
chr5 (1-205)||(22980872-22981085)
chr5 (1-209)||(699225-699442)
chr5 (20-204)||(31786548-31786741)
chr5 (20-210)||(15992442-15992641)
chr5 (19-207)||(21088667-21088864)
chr5 (20-209)||(35511384-35511577)
chr5 (20-206)||(23116124-23116319)
chr5 (16-209)||(23954688-23954890)
chr5 (24-209)||(26268149-26268343)
chr5 (1-209)||(36860498-36860716)
chr5 (1-209)||(12910425-12910647)
chr5 (71-209)||(39572894-39573032)
chr5 (7-204)||(8741774-8741981)
chr5 (20-189)||(35933990-35934169)
chr5 (1-209)||(6824364-6824581)
chr5 (20-209)||(27318389-27318587)
chr5 (1-202)||(33908315-33908525)
chr5 (80-209)||(5112285-5112413)
chr5 (72-209)||(27330379-27330516)
chr5 (20-209)||(1429064-1429245)
chr5 (20-209)||(7208766-7208963)
chr5 (4-137)||(25669733-25669865)
chr5 (1-209)||(31705495-31705711)
chr5 (72-209)||(38528200-38528336)
chr5 (93-211)||(8466818-8466935)
chr5 (20-209)||(22255257-22255455)
chr5 (20-209)||(15724565-15724761)
chr5 (1-209)||(24886179-24886379)
chr5 (1-198)||(35826369-35826572)
chr5 (93-206)||(14409311-14409423)
chr5 (21-209)||(14919431-14919628)
chr5 (129-209)||(25668724-25668804)
chr5 (20-203)||(43308562-43308746)
chr5 (20-162)||(13956264-13956415)
chr5 (1-209)||(5829976-5830184)
chr5 (72-209)||(22974045-22974182)
chr5 (1-209)||(35504440-35504657)
chr5 (20-209)||(8437041-8437238)
chr5 (20-209)||(17157933-17158130)
chr5 (20-133)||(2888347-2888469)
chr5 (147-209)||(11898077-11898139)
chr5 (20-65)||(14409243-14409288)
chr5 (20-70)||(25889593-25889643)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-209)||(33660288-33660496)
chr2 (1-209)||(5881614-5881821)
chr2 (1-209)||(27349859-27350066)
chr2 (20-209)||(43770778-43770967)
chr2 (1-201)||(44286032-44286241)
chr2 (1-209)||(4166997-4167214)
chr2 (8-209)||(4263994-4264205)
chr2 (20-209)||(19313927-19314117)
chr2 (7-209)||(39167286-39167491)
chr2 (20-209)||(31570664-31570862)
chr2 (20-209)||(36642061-36642261)
chr2 (20-209)||(4763706-4763904)
chr2 (20-209)||(29242068-29242266)
chr2 (1-209)||(3177014-3177231)
chr2 (17-184)||(41960940-41961116)
chr2 (20-209)||(4478444-4478638)
chr2 (35-209)||(19424573-19424756)
chr2 (20-209)||(33709162-33709360)
chr2 (20-209)||(33550917-33551114)
chr2 (1-209)||(37905783-37906002)
chr2 (20-209)||(41463780-41463978)
chr2 (20-209)||(7006868-7007049)
chr2 (20-196)||(17071667-17071852)
chr2 (1-184)||(18494192-18494383)
chr2 (1-198)||(44913748-44913956)
chr2 (1-203)||(45327801-45328012)
chr2 (20-209)||(43648175-43648373)
chr2 (20-209)||(2325308-2325498)
chr2 (1-209)||(26357652-26357869)
chr2 (1-183)||(41465602-41465793)
chr2 (1-209)||(13711539-13711751)
chr2 (20-198)||(17054026-17054213)
chr2 (17-209)||(19289250-19289451)
chr2 (72-205)||(33902145-33902278)
chr2 (20-143)||(18258217-18258349)
chr2 (72-164)||(31861972-31862064)
chr2 (20-201)||(11366311-11366501)
chr2 (20-158)||(35959023-35959169)
chr2 (101-181)||(19501760-19501839)
chr2 (139-210)||(41051263-41051335)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (20-209)||(11466890-11467088)
chr3 (20-209)||(14586591-14586780)
chr3 (1-181)||(29163912-29164092)
chr3 (20-209)||(29099421-29099610)
chr3 (20-209)||(34133001-34133199)
chr3 (20-209)||(2007999-2008196)
chr3 (1-209)||(44186410-44186611)
chr3 (1-198)||(52040815-52041021)
chr3 (1-209)||(7327375-7327592)
chr3 (20-208)||(43348325-43348521)
chr3 (1-209)||(46297655-46297872)
chr3 (1-209)||(3655095-3655312)
chr3 (29-209)||(35844392-35844581)
chr3 (1-188)||(44891584-44891780)
chr3 (8-198)||(53229052-53229251)
chr3 (1-202)||(32373543-32373753)
chr3 (20-205)||(42505987-42506181)
chr3 (72-209)||(37203133-37203270)
chr3 (1-163)||(33698265-33698436)
chr3 (20-201)||(45174579-45174770)
chr3 (1-209)||(26941153-26941370)
chr3 (2-194)||(24708009-24708212)
chr3 (22-192)||(25579822-25580001)
chr3 (73-208)||(51212955-51213090)
chr3 (20-205)||(39282722-39282916)
chr3 (1-209)||(4015526-4015742)
chr3 (20-209)||(21193672-21193871)
chr3 (7-209)||(37157774-37157985)
chr3 (1-209)||(48355007-48355224)
chr3 (20-202)||(24488874-24489065)
chr3 (20-205)||(33378697-33378891)
chr3 (1-206)||(22451037-22451251)
chr3 (21-209)||(3362319-3362518)
chr3 (20-204)||(11357293-11357469)
chr3 (7-209)||(40552158-40552369)
chr3 (20-202)||(43975804-43975991)
chr3 (7-201)||(4761547-4761751)
chr3 (88-198)||(27480368-27480478)
chr3 (72-202)||(53176127-53176257)
chr3 (103-209)||(20373300-20373406)
chr3 (1-209)||(40936057-40936256)
chr3 (1-161)||(22622611-22622780)
chr3 (82-195)||(38591778-38591891)
chr3 (72-184)||(46994634-46994746)
chr3 (1-209)||(21009695-21009912)
chr3 (93-209)||(22446058-22446174)
chr3 (72-209)||(47481588-47481725)
chr3 (20-161)||(36012251-36012403)
chr3 (74-173)||(11835602-11835702)
chr3 (20-157)||(1089811-1089958)
chr3 (72-209)||(54828674-54828811)
chr3 (7-209)||(54505874-54506084)
chr3 (1-118)||(20373137-20373263)
chr3 (135-198)||(53811698-53811767)
chr3 (7-52)||(27480261-27480306)
chr3 (17-50)||(53811643-53811676)
chr3 (20-72)||(51212683-51212735)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-209)||(33892904-33893111)
chr6 (20-209)||(3879850-3880048)
chr6 (24-209)||(15491690-15491884)
chr6 (20-209)||(21017023-21017221)
chr6 (20-209)||(4318733-4318932)
chr6 (1-209)||(29182238-29182456)
chr6 (4-201)||(30353253-30353459)
chr6 (1-206)||(7234927-7235140)
chr6 (20-209)||(8513308-8513501)
chr6 (1-209)||(1945909-1946126)
chr6 (20-209)||(6091093-6091292)
chr6 (7-189)||(20768179-20768368)
chr6 (20-209)||(6088983-6089176)
chr6 (72-209)||(7055187-7055324)
chr6 (20-209)||(5627466-5627664)
chr6 (108-196)||(33618922-33619010)
chr6 (153-204)||(18498514-18498565)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (1-204)||(11988-12201)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (20-209)||(209-407)
scaffold0002 (72-209)||(94356-94493)
scaffold0002 (1-183)||(408322-408512)
scaffold0002 (20-64)||(94012-94056)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-209)||(7962-8179)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-196)||(267372-267577)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (7-209)||(44032-44242)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (7-209)||(154545-154755)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (20-209)||(145928-146126)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (26-81)||(100938-100994)
scaffold0009 (99-140)||(100894-100935)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37775950 - 37775744
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37775950 atcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacactt 37775851  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775850 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggg--ggaacttttgatgccactgtacaaacagt 37775753  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  37775752 ggggtgtta 37775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4598258 - 4598067
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaata 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||    
T  4598258 tattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggata 4598160  T
Q  117 aaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598159 aaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 4598067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32592357 - 32592168
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32592357 tattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 32592258  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  32592257 ttaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgtta 32592168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 30002560 - 30002760
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30002560 atcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacactt 30002659  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30002660 aaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 30002751  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    | |||||||    
T  30002752 gaggtgtta 30002760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33341690 - 33341475
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||| |||    
T  33341690 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggt 33341591  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33341590 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggactgaacttttgatgccactgt 33341492  T
Q  192 acaaacagtggggtgtt 208  Q
    |||||||||||||||||    
T  33341491 acaaacagtggggtgtt 33341475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 55241024 - 55241240
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||         ||||||||||||||| |||    
T  55241024 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggt 55241123  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55241124 gttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgt 55241222  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55241223 acaaacagtggggtgtta 55241240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 34948014 - 34948233
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gt--gttacactttgtggg 89  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||  |||||||||||||||    
T  34948014 atcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggg 34948113  T
Q  90 gtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact 189  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  34948114 gtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccact 34948213  T
Q  190 gtacaaacagtggggtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||    
T  34948214 ttacaaacagtggggtgtta 34948233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17173582 - 17173365
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  17173582 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 17173483  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| || |||    
T  17173482 gttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgt 17173383  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17173382 acaaacagtggggtgtta 17173365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17168005 - 17167788
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  17168005 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 17167906  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| || |||    
T  17167905 gttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgt 17167806  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17167805 acaaacagtggggtgtta 17167788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 36493608 - 36493824
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||| ||    
T  36493608 atcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt 36493707  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36493708 -ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgt 36493806  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  36493807 acaaacaatggggtgtta 36493824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 28002905 - 28003115
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||| ||||||    
T  28002905 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggt 28003004  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  28003005 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgt 28003104  T
Q  192 acaaacagtgg 202  Q
    |||||||||||    
T  28003105 acaaacagtgg 28003115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 37663679 - 37663877
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  37663679 tattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggt 37663778  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37663779 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 37663877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 25700994 - 25701193
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg-tattacacttaaaacaagg 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||         |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25700994 tattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaagg 25701093  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25701094 taggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgtta 25701193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 55477810 - 55478016
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||| |||||||||    
T  55477810 atcttggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggt 55477909  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  55477910 gttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgt 55478009  T
Q  192 acaaaca 198  Q
    |||||||    
T  55478010 acaaaca 55478016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7703782 - 7703592
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||         |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7703782 tattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggt 7703683  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7703682 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctg--------atgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgtta 7703592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23761343 - 23761147
Alignment:
Q  21 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggta 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||          ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  23761343 attttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta 23761244  T
Q  112 gaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  23761243 ga-taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgtta 23761147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 35020954 - 35021171
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  35020954 atcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 35021053  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||| |||    
T  35021054 gttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgt 35021153  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  35021154 acaaacagtggtgtgtta 35021171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9139498 - 9139320
Alignment:
Q  24 ttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||| |   ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9139498 ttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt-----tatctta--agtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattag 9139406  T
Q  124 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9139405 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgtta 9139320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 4934140 - 4934333
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||         ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  4934140 tattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggt 4934239  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4934240 agaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggg 4934333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49376258 - 49376042
Alignment:
Q  2 tcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggta 92  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||         ||||||||| |||||||||     
T  49376258 tcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtg 49376159  T
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
    |   ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  49376158 tataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgta 49376059  T
Q  193 caaacagtggggtgtta 209  Q
    ||| |||||||||||||    
T  49376058 caagcagtggggtgtta 49376042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27396886 - 27396691
Alignment:
Q  23 tttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaga 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||         |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  27396886 tttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaga 27396787  T
Q  114 ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  27396786 ataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgtta 27396691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38012146 - 38011927
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||         | |||||||||| |||| |    
T  38012146 atcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttctgggat 38012047  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38012046 gttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgt 38011947  T
Q  192 acaaacagtggggtgttatt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  38011946 acaaacagtggggtgctatt 38011927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 46888096 - 46888289
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga--------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||        |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  46888096 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtctaagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggta 46888195  T
Q  112 gaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46888196 ggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggt 46888289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 19089391 - 19089589
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||| | || | ||||||    
T  19089391 tattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggt 19089490  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  19089491 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgtta 19089589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47254032 - 47253829
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  47254032 atcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 47253933  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  47253932 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctg--------atgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgt 47253841  T
Q  192 acaaacagtggg 203  Q
    | ||||| ||||    
T  47253840 ataaacaatggg 47253829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 29584199 - 29584336
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  29584199 agtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagac 29584298  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29584299 tgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgtta 29584336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5047885 - 5048093
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||         |||||||| |||| ||| |    
T  5047885 atcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcggg-t 5047983  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||  ||    
T  5047984 attacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgt 5048083  T
Q  192 acaaacagtg 201  Q
    ||||||||||    
T  5048084 acaaacagtg 5048093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19440567 - 19440784
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |         | ||||||| |||||||||    
T  19440567 atcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggt 19440666  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||    
T  19440667 gttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgt 19440766  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  19440767 acaaacggtggagtgtta 19440784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6864312 - 6864108
Alignment:
Q  16 atattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaaca 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||         || |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  6864312 atattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataaca 6864213  T
Q  107 aggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg 206  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  6864212 aggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatg 6864113  T
Q  207 ttatt 211  Q
    |||||    
T  6864112 ttatt 6864108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 33816536 - 33816666
Alignment:
Q  76 ttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaa 175  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  33816536 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaa 33816635  T
Q  176 cttttgatgccactgtacaaacagtggggtg 206  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  33816636 cttttgatgccaccgtataaatagtgaggtg 33816666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50765012 - 50764805
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||         ||||| |||||||||||||    
T  50765012 atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggt 50764913  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||          |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||    
T  50764912 gttacac----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgt 50764823  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50764822 acaaacagtggggtgtta 50764805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1815574 - 1815409
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1815574 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggt 1815475  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaac 176  Q
    || ||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1815474 aggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50697515 - 50697317
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacat-gcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaagg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  50697515 tattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaagg 50697416  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  50697415 taggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-agagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgtta 50697317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37288020 - 37287809
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-gggg 90  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||| ||||| ||||    
T  37288020 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtggggg 37287921  T
Q  91 tattacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact 189  Q
      ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  37287920 cgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------ttatgatattatgaggattgaacttttgatgccact 37287829  T
Q  190 gtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37287828 gtacaaacagtggggtgtta 37287809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 54499239 - 54499375
Alignment:
Q  75 gttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactg 173  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||    
T  54499239 gttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactg 54499338  T
Q  174 aacttttgatgccact-gtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  54499339 aacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgtta 54499375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Original strand, 879501 - 879684
Alignment:
Q  35 atctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||          |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  879501 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagat 879600  T
Q  126 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  879601 tatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgtta 879684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17272176 - 17272068
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||    
T  17272176 agtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gac 17272081  T
Q  172 tgaacttttgatg 184  Q
    |||||||||||||    
T  17272080 tgaacttttgatg 17272068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25184325 - 25184188
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||     
T  25184325 agtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagat 25184226  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||    
T  25184225 tgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgtta 25184188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 34361411 - 34361627
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| ||||    
T  34361411 atcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggt 34361510  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||| ||| || | |    
T  34361511 gttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattct 34361609  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34361610 acaaacagtggggtgtta 34361627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42200005 - 42199808
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaa 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||  |||| |||||    
T  42200005 tattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaa 42199906  T
Q  108 ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| || | |||||| | ||||||    
T  42199905 ggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggt 42199808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3042905 - 3042741
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattaca 97  Q
    |||||| || || |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||     
T  3042905 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 3042806  T
Q  98 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac 162  Q
    |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042805 cttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397993
Alignment:
Q  78 acactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaact 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgtt---------aattgatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  178 tttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgtta 39397993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 35025534 - 35025721
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||         |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  35025534 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagat 35025633  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg 206  Q
    || ||||||||| ||||| || | |||||||||||        ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  35025634 aggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatc--------tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtg 35025721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32579738 - 32579536
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||         | |||||||||| || |||    
T  32579738 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggt 32579639  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||| ||| ||    
T  32579638 cttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatact-atgagactaaacttttgatggcaccgt 32579540  T
Q  192 acaa 195  Q
    ||||    
T  32579539 acaa 32579536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 32912518 - 32912690
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  32912518 tattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggt 32912617  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgat 183  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || | |  |||||||||||||    
T  32912618 atgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgat 32912690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 39400280 - 39400232
Alignment:
Q  21 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatg 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39400280 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg 39400232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 4205276 - 4205219
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttg 58  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4205276 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 4205219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Original strand, 33816454 - 33816499
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatat 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33816454 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 33816499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Original strand, 7152142 - 7152194
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga 72  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  7152142 tattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtga 7152194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12166010 - 12165802
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12166010 atcttagacttacagatactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgagtgttacactttgtggggtgttacactt 12165911  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12165910 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagt 12165811  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  12165810 ggggtgtta 12165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21991884 - 21991686
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21991884 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 21991785  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21991784 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgtta 21991686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44598933 - 44598735
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  44598933 atcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggt 44598834  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactg 190  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  44598833 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgccactg 44598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15612653 - 15612870
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  15612653 atcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 15612752  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  15612753 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactct 15612852  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  15612853 acaaacactggggtgtta 15612870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8861552 - 8861333
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||         ||||||||||||| |||||    
T  8861552 atcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggt 8861453  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8861452 gttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgt 8861353  T
Q  192 acaaacagtggggtgttatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8861352 acaaacagtggggtgttatt 8861333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5657375 - 5657592
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||         || |||||||||||||| |    
T  5657375 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggct 5657474  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  5657475 gttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgt 5657574  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5657575 acaaacagtggggtgtta 5657592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43686307 - 43686096
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  43686307 atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 43686208  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  43686207 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgt 43686108  T
Q  192 acaaacagtggg 203  Q
    ||||||||||||    
T  43686107 acaaacagtggg 43686096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 41764972 - 41765186
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||| ||||||    
T  41764972 atcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggt 41765071  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||    
T  41765072 gttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgt 41765171  T
Q  192 acaaacagtggggtg 206  Q
    |||||||||||||||    
T  41765172 acaaacagtggggtg 41765186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22687428 - 22687289
Alignment:
Q  70 tgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggg 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22687428 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 22687329  T
Q  170 actgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  22687328 actgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgtta 22687289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26980573 - 26980373
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||    |||      || ||||||||    
T  26980573 atcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagt----cttaa----gtgttacactt 26980482  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26980481 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgt 26980382  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  26980381 ggggtgtta 26980373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6546786 - 6546569
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||         |||||| ||||||||||||    
T  6546786 atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggt 6546687  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||  |||||    
T  6546686 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgt 6546587  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  6546586 acaaatagtggggtgtta 6546569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11071454 - 11071256
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaa 107  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11071454 tattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaa 11071358  T
Q  108 ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgt 207  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11071357 ggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgt 11071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4583171 - 4582969
Alignment:
Q  16 atattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaaca 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4583171 atattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaca 4583072  T
Q  107 aggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg 206  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4583071 aagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtg 4582972  T
Q  207 tta 209  Q
    |||    
T  4582971 tta 4582969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 9355739 - 9355933
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9355739 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 9355838  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9355839 aggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 9355933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38258793 - 38258595
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  38258793 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggt 38258694  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||    
T  38258693 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgtta 38258595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 32820947 - 32821164
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||         |||||||||||| ||||||    
T  32820947 atcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggt 32821046  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  32821047 gttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgt 32821146  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  32821147 acaaacagtggtgtgtta 32821164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32432713 - 32432502
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattaca 97  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||||||         |||||||| |||||||||| |||||    
T  32432713 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 32432614  T
Q  98 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 197  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||    
T  32432613 cttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaac 32432514  T
Q  198 agtggggtgtta 209  Q
    | ||||||||||    
T  32432513 aatggggtgtta 32432502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18797575 - 18797377
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  18797575 tattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggt 18797476  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18797475 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 18797377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30055775 - 30055577
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  30055775 tattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggt 30055676  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30055675 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 30055577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27283992 - 27283794
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27283992 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggt 27283893  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  27283892 aggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgtta 27283794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33688156 - 33688373
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||          ||||||||||| ||| ||    
T  33688156 atcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagt 33688255  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||     
T  33688256 gttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactgg 33688355  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||| || |||||    
T  33688356 acaaacagtaggatgtta 33688373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37347288 - 37347072
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||| ||    
T  37347288 atcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt 37347189  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  37347188 -ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgt 37347090  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  37347089 acaaacaatggggtgtta 37347072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 31578958 - 31579150
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||         |||||||||||| | ||||    
T  31578958 atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggt 31579057  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatg 184  Q
     ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31579058 gttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 31579150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7334981 - 7334844
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||    
T  7334981 agtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaac 7334882  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7334881 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 7334844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24212008 - 24211791
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| || |    
T  24212008 atcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggat 24211909  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |    
T  24211908 gttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattct 24211809  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  24211808 ataaacagtagggtgtta 24211791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 15672672 - 15672828
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15672672 tattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaa 15672771  T
Q  108 ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15672772 ggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatacta 15672828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Original strand, 25691456 - 25691647
Alignment:
Q  19 ttattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaagg 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||         |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25691456 ttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataagg 25691555  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtg 201  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25691556 taggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtg 25691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 12390543 - 12390741
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||| |||           || ||||||||    
T  12390543 atcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtgagtcttaa----------gtgttacactt 12390632  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12390633 aaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagt 12390732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37110141 - 37109922
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||||||    
T  37110141 atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggt 37110042  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtaga--ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact 189  Q
     |||| |||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| || |    
T  37110041 gttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcatt 37109942  T
Q  190 gtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  37109941 gtacaaacggtggggtgtta 37109922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29173789 - 29173590
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      || | ||||||    
T  29173789 atcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtaacactt 29173699  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29173698 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 29173599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10481853 - 10481660
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10481853 tattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggt 10481754  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 204  Q
    |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  10481753 aagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 10481660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 27421354 - 27421490
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  ||||    
T  27421354 agtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgata-ttataggac 27421452  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  27421453 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgtta 27421490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 44413353 - 44413490
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||    
T  44413353 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagac 44413452  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
     |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  44413453 cgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgtta 44413490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23111440 - 23111240
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  23111440 tattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagt 23111341  T
Q  111 a-ga-ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 208  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23111340 atgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgtt 23111241  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  23111240 a 23111240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37704344 - 37704241
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37704344 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggac 37704245  T
Q  172 tgaa 175  Q
    ||||    
T  37704244 tgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 31520635 - 31520834
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  ||    |||      || ||||||||    
T  31520635 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacactt 31520726  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31520727 aaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatact-atgggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaat 31520825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 48928191 - 48928404
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||  ||         |||||||| || |||    
T  48928191 atcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggt 48928290  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||    
T  48928291 gttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatact-atgggactgaacttttgatggcaccgt 48928389  T
Q  192 acaaacagtggggtg 206  Q
    ||||| |||||||||    
T  48928390 acaaatagtggggtg 48928404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17842478 - 17842697
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         |||||||||||||||||| |    
T  17842478 atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggat 17842577  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtaga--ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact 189  Q
     |||| |||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| ||||||||| || |    
T  17842578 gttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcatt 17842677  T
Q  190 gtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  17842678 gtacaaacggtggggtgtta 17842697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 48928477 - 48928671
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||  ||         |||||||| || ||| |||||||||||| || ||    
T  48928477 tattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgt 48928576  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg 206  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  48928577 aggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatact-atgggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtg 48928671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 10359130 - 10359325
Alignment:
Q  23 tttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaga 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  10359130 tttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatg 10359229  T
Q  114 ataaaattaga-ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||    
T  10359230 ataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatact-atcagactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgtta 10359325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43925352 - 43925167
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtattacacttaaaacaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||         || || ||||| ||| || ||||||||||||    
T  43925352 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaa 43925253  T
Q  108 ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtaca 194  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||    
T  43925252 ggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 26587986 - 26588126
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  26587986 atcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacag--------agttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggt 26588077  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgt 140  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26588078 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 46481023 - 46481182
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||         ||||||||||||| || | |    
T  46481023 atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagat 46481122  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 151  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  46481123 gttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37703392 - 37703590
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||| ||||||||||||| |    
T  37703392 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggat 37703491  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||        ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |    
T  37703492 gttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatc--------tgatgatactatggagactgaacttttgatgtcactat 37703583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 32593184 - 32593296
Alignment:
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||  ||    
T  32593184 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatact-gtgagactgaacttttgataccaccata 32593282  T
Q  193 caaacagtggggtg 206  Q
     |||||||||||||    
T  32593283 taaacagtggggtg 32593296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 44411434 - 44411505
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga 72  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44411434 atcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 44411505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524438
Alignment:
Q  135 tcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgtta 26524438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35353375 - 35353161
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||         |||||||| ||| ||||||    
T  35353375 atcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggt 35353276  T
Q  92 attacacttaaaacaaggta-gaataaaat-tagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactg-aacttttgatgccac 188  Q
     ||||||||||||||||||| |  | | || |||  ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||     
T  35353275 gttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctag--taa-tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccat 35353179  T
Q  189 tgtacaaacagtggggtg 206  Q
     ||||||||| |||||||    
T  35353178 cgtacaaacaatggggtg 35353161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362259
Alignment:
Q  154 tgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgtta 34362259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38053644 - 38053540
Alignment:
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||| |||| | | ||||||||||||||| || ||||    
T  38053644 ttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgta 38053553  T
Q  193 caaacagtggggt 205  Q
    |||||||| ||||    
T  38053552 caaacagtagggt 38053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 37704449 - 37704387
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgat 63  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  37704449 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 32593100 - 32593164
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatat 65  Q
    ||||| |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32593100 atcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 32593164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48620890 - 48620708
Alignment:
Q  27 tcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48620890 tcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagatt 48620791  T
Q  127 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48620790 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 48620708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3535192 - 3535003
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  3535192 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaa 3535093  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  3535092 ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgtta 3535003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 7078951 - 7079168
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         || ||| ||||||||||||    
T  7078951 atcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggt 7079050  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||    
T  7079051 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgt 7079150  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||| |||||||    
T  7079151 acaaacagtgaggtgtta 7079168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47279477 - 47279260
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||| |||| |    
T  47279477 atcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggat 47279378  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  47279377 gttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgt 47279278  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47279277 acaaacagtggggtgtta 47279260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27227373 - 27227587
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         ||||| |||||||||||||    
T  27227373 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggt 27227472  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27227473 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgt 27227572  T
Q  192 acaaacagtggggtg 206  Q
    |||||||||| ||||    
T  27227573 acaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 238401 - 238611
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  238401 atcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 238500  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  238501 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgt 238600  T
Q  192 acaaacagtgg 202  Q
    |||||||||||    
T  238601 acaaacagtgg 238611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38823499 - 38823285
Alignment:
Q  4 ttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtatt 94  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||||| |||| ||    
T  38823499 ttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgtt 38823400  T
Q  95 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtaca 194  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38823399 acacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtaca 38823300  T
Q  195 aacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||    
T  38823299 aatagtggggtgtta 38823285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27532869 - 27533085
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||         ||||||||||||||| |||    
T  27532869 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggt 27532968  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27532969 gttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgt 27533067  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  27533068 acaaagagtgggttgtta 27533085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 34012277 - 34012482
Alignment:
Q  8 acttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga----gtgttacactttgtggggtattacacttaaa 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    |||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  34012277 acttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtggggtgttacacttgaa 34012376  T
Q  104 acaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 203  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  34012377 acaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtgga 34012476  T
Q  204 gtgtta 209  Q
    ||||||    
T  34012477 gtgtta 34012482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41926426 - 41926240
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaata 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |   |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||    
T  41926426 tattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaataagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggata 41926327  T
Q  117 aaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41926326 aaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtggg 41926240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 27267088 - 27267302
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||| |||||||||||||    
T  27267088 atcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggt 27267187  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27267188 gttacactcaaaacaaggtagattaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgt 27267286  T
Q  192 acaaacagtggggtgt 207  Q
    ||||||||||||||||    
T  27267287 acaaacagtggggtgt 27267302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42721324 - 42721110
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||         |||||| ||||||||||||    
T  42721324 atcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggt 42721228  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  42721227 attacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgt 42721128  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42721127 acaaacagtggggtgtta 42721110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 10181976 - 10182113
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  10181976 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggac 10182075  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10182076 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgtta 10182113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15752316 - 15752100
Alignment:
Q  2 tcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggta 92  Q
    |||| |||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||         |||||||||||| ||||||     
T  15752316 tcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtg 15752217  T
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  15752216 ttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgta 15752117  T
Q  193 caaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||| |||||||    
T  15752116 caaacagtgaggtgtta 15752100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14758320 - 14758121
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||  ||   | ||| |||||| ||||||||    
T  14758320 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaatttctggggtgttacactt 14758221  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14758220 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt 14758121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16415934 - 16415728
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         || ||||| | ||||||||    
T  16415934 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggt 16415835  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  16415834 attacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgt 16415735  T
Q  192 acaaaca 198  Q
    |||||||    
T  16415734 acaaaca 16415728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 37618789 - 37618998
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| | |||  |||    
T  37618789 atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgagtgttacactttatgggatgttatgctt 37618888  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg--atactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  37618889 ataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaaca 37618988  T
Q  199 gtggggtgtt 208  Q
    ||||||||||    
T  37618989 gtggggtgtt 37618998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2960036 - 2959819
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||         |||||||| |||||||| |    
T  2960036 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggat 2959937  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  2959936 gttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgt 2959837  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||| |||||    
T  2959836 acaaacagtgggatgtta 2959819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32216343 - 32216126
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  32216343 atcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 32216244  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  32216243 gttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgt 32216144  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  32216143 acaaacagtggtgtgtta 32216126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25160920 - 25160710
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||         |||||| ||||||||||||    
T  25160920 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggt 25160821  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  25160820 gttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgt 25160721  T
Q  192 acaaacagtgg 202  Q
    |||||| ||||    
T  25160720 acaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15383202 - 15383004
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  15383202 tattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggt 15383103  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  15383102 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgtta 15383004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27563793 - 27564010
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || || |||         ||||| | |||||||||||    
T  27563793 atcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggt 27563892  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||| |    
T  27563893 attatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactat 27563992  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  27563993 acaaacagtggagtgtta 27564010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 30326840 - 30327045
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  30326840 atcttggacttaaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 30326939  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||    
T  30326940 gttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgt 30327039  T
Q  192 acaaac 197  Q
    ||||||    
T  30327040 acaaac 30327045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15168365 - 15168181
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||         |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15168365 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggt 15168266  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaa 195  Q
    || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15168265 aggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaa 15168181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 47682401 - 47682593
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||         ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  47682401 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggc 47682500  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 203  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47682501 agaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtggg 47682593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 9902961 - 9903159
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||         |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  9902961 tattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgt 9903060  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9903061 aagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgtta 9903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4330550 - 4330357
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4330550 tattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 4330451  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 204  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4330450 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggg 4330357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8222416 - 8222216
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  8222416 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 8222317  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||    
T  8222316 gttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt 8222217  T
Q  192 a 192  Q
    |    
T  8222216 a 8222216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18422918 - 18422722
Alignment:
Q  22 ttttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtag 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  18422918 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtag 18422819  T
Q  113 aataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  18422818 gataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgtta 18422722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32267303 - 32267105
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  32267303 tattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggt 32267204  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32267203 aggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 32267105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 28564671 - 28564886
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga-------gtgttacactttgtggggtat 93  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||       ||||||||||||  ||||| |    
T  28564671 atcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttaagtgttacactttacggggtgt 28564770  T
Q  94 tacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtac 193  Q
    ||  |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  28564771 tatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtac 28564870  T
Q  194 aaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||  |||||||    
T  28564871 aaacagtaaggtgtta 28564886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30254711 - 30254502
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||         |||||||||||| | ||||    
T  30254711 atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggt 30254612  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||    
T  30254611 gttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgt 30254512  T
Q  192 acaaacagtg 201  Q
    ||||||||||    
T  30254511 acaaacagtg 30254502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39393653 - 39393465
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||         |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  39393653 tattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggt 39393554  T
Q  111 agaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39393553 aggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaaca 39393465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11742256 - 11742455
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||  ||    |||  | |    ||||||||    
T  11742256 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagt----cttaattg----ttacactt 11742347  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11742348 aaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgata-ttatgggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 11742446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40885101 - 40884887
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||         ||||||||||||  ||  |    
T  40885101 atcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaat 40885002  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  40885001 gttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgt 40884902  T
Q  192 acaaacagtggggtg 206  Q
    |||||||||||||||    
T  40884901 acaaacagtggggtg 40884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 33725507 - 33725684
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||          ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33725507 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggt 33725606  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccac 188  Q
    ||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33725607 agggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 33725684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37451573 - 37451357
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||| || |||    
T  37451573 atcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggt 37451474  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  37451473 gttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatact-agaggactgaacttttgatgtcattgt 37451375  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| || ||||||||    
T  37451374 acaaacggtagggtgtta 37451357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51129147 - 51128930
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||          ||||||||||||||||||    
T  51129147 atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggt 51129048  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||| || |||    
T  51129047 gttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgt 51128948  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  51128947 acaaacggtggagtgtta 51128930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Original strand, 31621535 - 31621655
Alignment:
Q  86 tggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgc 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31621535 tggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgc 31621634  T
Q  186 cactgtacaaacagtggggtg 206  Q
    ||| ||||||| || ||||||    
T  31621635 caccgtacaaatagcggggtg 31621655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19899657 - 19899874
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| ||||    
T  19899657 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggt 19899756  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| | |    
T  19899757 gttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattct 19899856  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||| |||||||    
T  19899857 acaaacagtgaggtgtta 19899874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10922981 - 10922802
Alignment:
Q  35 atctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagat 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  10922981 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagat 10922882  T
Q  126 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10922881 taagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 10922802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1547489 - 1547358
Alignment:
Q  70 tgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggg 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||| | |     
T  1547489 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctg--------atgatactatgaga 1547398  T
Q  170 actgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1547397 actgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgtta 1547358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3309422 - 3309224
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgg-----ggtattacacttaaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||         ||||||||||| |||      ||| ||||| |||||||    
T  3309422 tattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaac 3309323  T
Q  106 aaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 203  Q
    || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3309322 aaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagtggg 3309224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22170999 - 22170807
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  22170999 atcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 22170900  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatg 184  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  22170899 gttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23999616 - 23999418
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||    
T  23999616 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggt 23999517  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||    
T  23999516 atgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgtta 23999418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28769922 - 28769729
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg-tattacacttaaaacaagg 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||         | |||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||    
T  28769922 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaagg 28769823  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 203  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  28769822 tatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggtggg 28769729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289743
Alignment:
Q  136 cttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 21289743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 46931678 - 46931486
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||| || ||  ||||||    
T  46931678 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgctgaa--caaggt 46931581  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  46931580 atgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggt 46931486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 27763218 - 27763404
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||         || ||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||    
T  27763218 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggt 27763317  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 197  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| || | |||||||    
T  27763318 atgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaac 27763404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38759821 - 38759610
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||         |||||||||||||||||||    
T  38759821 atcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatagtctcaagtgttacactttgtggggt 38759722  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga----ctgaacttttgatgcca 187  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||| |||| | || ||||| |||||||||||||||| || |  ||    |||||||||||||| ||    
T  38759721 gttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacgaagactggctgaacttttgatgtca 38759622  T
Q  188 ctgtacaaacag 199  Q
    ||||||||||||    
T  38759621 ctgtacaaacag 38759610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 48353830 - 48353759
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga 72  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48353830 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 48353759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Original strand, 1359842 - 1359887
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatat 65  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1359842 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 1359887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 21289888 - 21289831
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttg 58  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21289888 atcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagttg 21289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 31962904 - 31962853
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 52  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  31962904 atcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 466123 - 465916
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  466123 atcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atgtgagtgttacactttgtggggtgttacactt 466025  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  466024 aaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagt 465925  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  465924 ggggtgtta 465916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11727315 - 11727098
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||    
T  11727315 atcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggt 11727216  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |    
T  11727215 gttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactat 11727116  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  11727115 acaaatagtggggtgtta 11727098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 36694884 - 36695082
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36694884 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgt 36694983  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36694984 aggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 36695082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 6098436 - 6098634
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6098436 tattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagat 6098535  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6098536 aggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 6098634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9864420 - 9864222
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9864420 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 9864321  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9864320 aggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 9864222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 5299845 - 5300053
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||         |||||||||||||||||||    
T  5299845 atcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggt 5299944  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5299945 gttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgt 5300044  T
Q  192 acaaacagt 200  Q
    |||||||||    
T  5300045 acaaacagt 5300053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38644269 - 38644052
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||         |||||||||||| ||| ||    
T  38644269 atcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagt 38644170  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  38644169 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactag 38644070  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38644069 acaaacagtggggtgtta 38644052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34895234 - 34895041
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga----gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaat 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||    
T  34895234 tattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggat 34895135  T
Q  116 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34895134 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgtta 34895041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12876401 - 12876183
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga----------gtgttacactttgtgggg 90  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||          ||||||||||||||||||    
T  12876401 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggg 12876302  T
Q  91 tattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactg 190  Q
    | |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||    
T  12876301 tgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattg 12876202  T
Q  191 tacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  12876201 tacaaacagttgggtgtta 12876183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13307894 - 13307697
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  13307894 tattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagt 13307796  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  13307795 aggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgtta 13307697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 16446793 - 16446991
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||         ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16446793 tattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggt 16446892  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16446893 aggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgtta 16446991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27082737 - 27082954
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||         ||||||||||||| |||||    
T  27082737 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggt 27082836  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  27082837 gttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgc 27082936  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27082937 acaaacagtggggtgtta 27082954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 41910907 - 41911086
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41910907 tattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 41911005  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||    
T  41911006 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgt 41911086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 1149550 - 1149748
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  1149550 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggt 1149649  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  1149650 aagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgtta 1149748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16223154 - 16222942
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||         |||||||||||| ||||||    
T  16223154 atcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggt 16223055  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  16223054 gttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgt 16222955  T
Q  192 acaaacagtgggg 204  Q
    |||||| ||||||    
T  16222954 acaaactgtgggg 16222942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 34951956 - 34952147
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||                 ||||    
T  34951956 atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgagtgttac-----------------actt 34952038  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34952039 aaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 34952138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Original strand, 37970452 - 37970635
Alignment:
Q  35 atctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagat 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37970452 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagat 37970551  T
Q  126 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37970552 taagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgtta 37970635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 39099024 - 39099235
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattaca 97  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||         |||| | |||||||||| | |||||    
T  39099024 gacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttaca 39099123  T
Q  98 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 197  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||     
T  39099124 cttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaag 39099223  T
Q  198 agtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||    
T  39099224 agtggggtgtta 39099235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 10555122 - 10555318
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga-------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtag 112  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       |||||||  |||||| ||| || | |||| ||||||||||    
T  10555122 tattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcaagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtag 10555221  T
Q  113 aataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  10555222 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgtta 10555318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1205199 - 1205009
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||         ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1205199 tattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggt 1205100  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtg 201  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1205099 aagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg 1205009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 7890859 - 7891075
Alignment:
Q  4 ttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtatt 94  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||         ||||||||| ||||||||| ||    
T  7890859 ttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgtt 7890958  T
Q  95 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtaca 194  Q
    || |||| ||||| |||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7890959 acgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtaca 7891058  T
Q  195 aacagtggggtgttatt 211  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  7891059 aacggtggagtgttatt 7891075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 4132604 - 4132750
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4132604 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacacttaaa-caaggt 4132702  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4132703 agaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44869769 - 44869576
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||         |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  44869769 tattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggt 44869671  T
Q  111 agaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 204  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44869670 aggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40862710 - 40862494
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||         |||||||||||||||| ||    
T  40862710 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagt 40862611  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||    
T  40862610 gttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgatac-catgagactgaacttttgatgccattgt 40862512  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40862511 acaaacagtggggtgtta 40862494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150221
Alignment:
Q  78 acactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaact 177  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  178 tttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgtta 1150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 31933785 - 31934002
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||| |||    
T  31933785 atcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggt 31933884  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    ||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||| || |||    
T  31933885 attatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgt 31933984  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  31933985 ataaagagtggggtgtta 31934002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 1953906 - 1954104
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg-tattacacttaaaacaagg 109  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||         |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1953906 tattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaagg 1954005  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat-gatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgt 207  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  1954006 tatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025780
Alignment:
Q  22 ttttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtag 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||         |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtag 43025873  T
Q  113 aataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||   | ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  43025872 gataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggt 43025780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33906503 - 33906316
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||         |||||||||||| |||  |    
T  33906503 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaat 33906404  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttt 179  Q
     |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  33906403 gttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 43643574 - 43643711
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||     
T  43643574 agtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagat 43643673  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||    
T  43643674 tgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgtta 43643711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41362705 - 41362589
Alignment:
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||    
T  41362705 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactata 41362606  T
Q  193 caaacagtggggtgtta 209  Q
    |||| ||||||||||||    
T  41362605 caaatagtggggtgtta 41362589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 23854349 - 23854547
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||         |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||    
T  23854349 tattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggt 23854448  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  23854449 aagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgtta 23854547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 30654562 - 30654699
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |  | |    
T  30654562 agtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggc 30654661  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  30654662 tgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgtta 30654699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 8803716 - 8803885
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||| | ||||    
T  8803716 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggt 8803815  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 161  Q
     |||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8803816 gttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata 8803885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 35459702 - 35459819
Alignment:
Q  84 tgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgat 183  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| ||    
T  35459702 tgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaat 35459801  T
Q  184 gccactgtacaaacagtg 201  Q
    | || ||||||| |||||    
T  35459802 gtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7998485 - 7998401
Alignment:
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaac 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  7998485 ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18259370 - 18259229
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga-----gtgttacactttgtggggtatta 95  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||  || ||| ||||||| |||||     ||||||||||||||||| | |||    
T  18259370 atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtgacttaggtgttacactttgtgggatgtta 18259271  T
Q  96 cacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattct 137  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  18259270 cacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 1149819 - 1149912
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg-----agtgttacactttgtggg 89  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     ||||||||||||||||||    
T  1149819 atcttagacttacaagtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgtcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33198029 - 33197947
Alignment:
Q  95 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgc 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  33198029 acacttaaaacaaggtaggataaaat--------gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 34463759 - 34463708
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttg 58  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34463759 gacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttg 34463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 35859206 - 35859161
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatat 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  35859206 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 35859161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 200
Target Start/End: Original strand, 4133085 - 4133117
Alignment:
Q  168 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4133085 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 4133117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7998550 - 7998498
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  7998550 tattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtga 7998498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32563432 - 32563224
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32563432 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgggctgttacactt 32563333  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32563332 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagt 32563233  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    || ||||||    
T  32563232 ggagtgtta 32563224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9200516 - 9200308
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  9200516 atcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggaatgttacactt 9200417  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9200416 aaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgt 9200317  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  9200316 ggggtgtta 9200308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7693513 - 7693305
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7693513 atcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacactt 7693414  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7693413 aaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt 7693314  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    ||| |||||    
T  7693313 gggatgtta 7693305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22019915 - 22019707
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22019915 atcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgagtgttatactttgtggggtgttacactt 22019816  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |    
T  22019815 aaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaat 22019716  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  22019715 ggggtgtta 22019707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42343013 - 42342812
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42343013 atcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacactttgtggtgtattacactt 42342914  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||| |||||||    
T  42342913 aaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga--aattttttgatgtcactgtataaacagt 42342817  T
Q  201 ggggt 205  Q
    |||||    
T  42342816 ggggt 42342812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19120132 - 19119934
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19120132 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggt 19120033  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19120032 aggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 19119934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36867054 - 36866837
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  36867054 atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 36866955  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  36866954 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgt 36866855  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36866854 acaaacagtggggtgtta 36866837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 28416472 - 28416627
Alignment:
Q  54 agttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaat 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28416472 agttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaat 28416571  T
Q  154 tgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28416572 tgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgtta 28416627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 30969214 - 30969424
Alignment:
Q  8 acttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacac 98  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30969214 acttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacac 30969313  T
Q  99 ttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  30969314 ttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaata 30969413  T
Q  199 gtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||    
T  30969414 gtggggtgtta 30969424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40133677 - 40133460
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  40133677 atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 40133578  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  40133577 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgt 40133478  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  40133477 acaaatagtggggtgtta 40133460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 25500809 - 25501028
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  25500809 atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggt 25500908  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||    
T  25500909 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgt 25501008  T
Q  192 acaaacagtggggtgttatt 211  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  25501009 acaaacagtgaggtgttatt 25501028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5837828 - 5837630
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5837828 tattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgt 5837729  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5837728 aggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 5837630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22981085 - 22980872
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||         |||||||| |||||| |||    
T  22981085 atcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggt 22980986  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||     
T  22980985 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgc 22980886  T
Q  192 acaaacagtggggt 205  Q
     |||||||||||||    
T  22980885 tcaaacagtggggt 22980872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 699442 - 699225
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         || ||||||||||||| ||    
T  699442 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagt 699343  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  699342 gttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgt 699243  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  699242 acaaacagtggggtgtta 699225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 31786548 - 31786741
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  31786548 tattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagat 31786647  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 204  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786648 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 31786741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 15992442 - 15992641
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||         |||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  15992442 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggt 15992541  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttat 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15992542 agaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattat 15992641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 21088667 - 21088864
Alignment:
Q  19 ttattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaagg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21088667 ttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaagg 21088766  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgt 207  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21088767 taggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgt 21088864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 35511384 - 35511577
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga----gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||    
T  35511384 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggat 35511483  T
Q  116 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  35511484 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgtta 35511577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 23116124 - 23116319
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23116124 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggt 23116223  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg 206  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23116224 aggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtg 23116319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 23954688 - 23954890
Alignment:
Q  16 atattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaaca 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  23954688 atattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaaca 23954786  T
Q  107 aggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact-gtacaaacagtggggt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23954787 aggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggt 23954886  T
Q  206 gtta 209  Q
    ||||    
T  23954887 gtta 23954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26268343 - 26268149
Alignment:
Q  24 ttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaa 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |    
T  26268343 ttatccttgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatga 26268244  T
Q  115 taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26268243 taaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgtta 26268149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36860716 - 36860498
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  36860716 atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 36860617  T
Q  92 attacacttaaaacaa-ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactg 190  Q
     |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  36860616 gttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattg 36860517  T
Q  191 tacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36860516 tacaaacagtggggtgtta 36860498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12910647 - 12910425
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  12910647 atcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggt 12910548  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgcc----- 186  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |         
T  12910547 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgt 12910448  T
Q  187 actgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12910447 actgtacaaacagtggggtgtta 12910425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39573032 - 39572894
Alignment:
Q  71 gagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga 170  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |    
T  39573032 gagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaa 39572933  T
Q  171 ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  39572932 ctgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgtta 39572894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 8741774 - 8741981
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgata-tcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattac 96  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||         |||||||||||||| |||| ||||    
T  8741774 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 8741873  T
Q  97 acttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaa 196  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8741874 acttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaa 8741973  T
Q  197 cagtgggg 204  Q
    || |||||    
T  8741974 caatgggg 8741981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35934169 - 35933990
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35934169 tattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggt 35934070  T
Q  111 agaataaaat-tagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact 189  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  35934069 aggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccact 35933990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 6824364 - 6824581
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||         |||||||||||||||||||    
T  6824364 atcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 6824461  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactga--acttttgatgccact 189  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| ||||    
T  6824462 gttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcact 6824561  T
Q  190 gtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  6824562 gtacaaacagtggagtgtta 6824581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 27318389 - 27318587
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  27318389 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggt 27318488  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  27318489 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgtta 27318587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33908525 - 33908315
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| ||         |||||||||||| ||||||    
T  33908525 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggt 33908426  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  33908425 gttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 33908326  T
Q  192 acaaacagtgg 202  Q
    |||||||||||    
T  33908325 acaaacagtgg 33908315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Original strand, 5112285 - 5112413
Alignment:
Q  80 actttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttt 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5112285 actttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttt 5112383  T
Q  180 tgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112384 tgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 5112413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27330516 - 27330379
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  27330516 agtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagac 27330417  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  27330416 tgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgtta 27330379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 1429064 - 1429245
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||  ||    |||      || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1429064 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 1429155  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1429156 ttagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgtta 1429245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 7208766 - 7208963
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||         ||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||    
T  7208766 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggt 7208865  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  7208866 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-agaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgtta 7208963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25669865 - 25669733
Alignment:
Q  4 ttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaa 103  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25669865 ttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaa 25669767  T
Q  104 acaaggtagaataaaattagattaagtgtattct 137  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25669766 acaaagtaggataaaattagattaagtgtattct 25669733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 31705495 - 31705711
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||| |||||| | |    
T  31705495 atcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagat 31705594  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||    
T  31705595 gttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-agaggactggacttttgatgtcattgt 31705693  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| || ||||||||    
T  31705694 acaaacggtagggtgtta 31705711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 38528200 - 38528336
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  38528200 agtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgagac 38528298  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  38528299 tgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgtta 38528336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8466935 - 8466818
Alignment:
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8466935 ttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgta 8466836  T
Q  193 caaacagtggggtgttatt 211  Q
    |||| || |||||||||||    
T  8466835 caaagag-ggggtgttatt 8466818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22255455 - 22255257
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |         ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||  |    
T  22255455 tattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaat 22255356  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22255355 aggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgtta 22255257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15724761 - 15724565
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||         ||||||||| || || ||| |||||||| |||||    
T  15724761 tattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggt 15724662  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  15724661 agaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgata-ttatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgtta 15724565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24886379 - 24886179
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||    |||      || ||||||||    
T  24886379 atcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacactt 24886288  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24886287 ataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 24886188  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  24886187 ggggtgtta 24886179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35826369 - 35826572
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatg-------tgagtgttacactttgtggggtat 93  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||       | || |||||||||||||| || |    
T  35826369 atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgataatcttaagggttacactttgtggagtgt 35826468  T
Q  94 tacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtac 193  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35826469 tacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtac 35826567  T
Q  194 aaaca 198  Q
    |||||    
T  35826568 aaaca 35826572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 14409311 - 14409423
Alignment:
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||    
T  14409311 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgagactgaacttttgatgccaccgta 14409409  T
Q  193 caaacagtggggtg 206  Q
      || |||||||||    
T  14409410 ttaagagtggggtg 14409423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 14919431 - 14919628
Alignment:
Q  21 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggta 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         || ||||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  14919431 attttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggta 14919530  T
Q  112 gaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    | |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||    
T  14919531 ggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgtta 14919628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668724
Alignment:
Q  129 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgtta 25668724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 43308562 - 43308746
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga-gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaa 118  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||  | ||||| ||||||  | | | ||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  43308562 tattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatatagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaa 43308661  T
Q  119 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 203  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43308662 attagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagtggg 43308746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 13956264 - 13956415
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||         ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |    
T  13956264 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagat 13956363  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac 162  Q
    | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13956364 aaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5830184 - 5829976
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  5830184 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 5830085  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||         |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||    
T  5830084 gttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgtt---------aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgt 5829994  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| || ||||||||    
T  5829993 acaaacggtagggtgtta 5829976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 22974045 - 22974182
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || | | |     
T  22974045 agtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaat 22974144  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  22974145 tgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgtta 22974182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35504657 - 35504440
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  35504657 atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 35504558  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| || | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||   |    
T  35504557 gttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcat 35504458  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  35504457 acaaacggtgaggtgtta 35504440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8437238 - 8437041
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||         ||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||     
T  8437238 tattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggc 8437139  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||  || | |||| |||||||||  |||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  8437138 aggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgtta 8437041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 17157933 - 17158130
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  17157933 tattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggt 17158032  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  17158033 aagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgtta 17158130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Original strand, 2888347 - 2888469
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||         |||||||||||| |||  | ||| |||| |||||||||    
T  2888347 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggt 2888446  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgta 133  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  2888447 aaaataaaattagattaagtgta 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898077
Alignment:
Q  147 gatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgtta 11898077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Original strand, 14409243 - 14409288
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatat 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14409243 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 14409288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 25889643 - 25889593
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgt 70  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  25889643 tattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 25889593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33660288 - 33660496
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33660288 atctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgggtgttacactttgtggggtgttacactt 33660387  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660388 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 33660487  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
     ||||||||    
T  33660488 tgggtgtta 33660496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5881821 - 5881614
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5881821 atcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggtattacactt 5881722  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5881721 aaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagt 5881623  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  5881622 ggggtgtta 5881614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27349859 - 27350066
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27349859 atcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacactt 27349958  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27349959 aaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaa-gggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 27350057  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    | |||||||    
T  27350058 gtggtgtta 27350066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 43770778 - 43770967
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  43770778 tattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaa 43770877  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43770878 ttaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgtta 43770967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44286241 - 44286032
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  44286241 atcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 44286142  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  44286141 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactat 44286042  T
Q  192 acaaacagtg 201  Q
    ||||||||||    
T  44286041 acaaacagtg 44286032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4167214 - 4166997
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  4167214 atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggt 4167115  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4167114 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgt 4167015  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4167014 acaaacagtggggtgtta 4166997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 4263994 - 4264205
Alignment:
Q  8 acttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtattaca 97  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||           |||||||||||||||||||| ||| |    
T  4263994 acttatatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaa 4264093  T
Q  98 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4264094 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaac 4264193  T
Q  198 agtggggtgtta 209  Q
    |||||| |||||    
T  4264194 agtgggatgtta 4264205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19314117 - 19313927
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga--gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataa 117  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  19314117 tattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaa 19314018  T
Q  118 aattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||    
T  19314017 aattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact-ataggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgtta 19313927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 39167286 - 39167491
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---tgttacactttgtggggtattacacttaaa 103  Q
    |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39167286 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagttgttacactttgtgggatgttacacttaaa 39167385  T
Q  104 acaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 203  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  39167386 acaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgag 39167485  T
Q  204 gtgtta 209  Q
    ||||||    
T  39167486 gtgtta 39167491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 31570664 - 31570862
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31570664 tattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgt 31570763  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  31570764 aagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgtta 31570862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36642261 - 36642061
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||         |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36642261 tattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggt 36642162  T
Q  111 agaataaaa--ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 208  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36642161 aggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgtt 36642062  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  36642061 a 36642061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4763904 - 4763706
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  4763904 tattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggt 4763805  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4763804 agaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 4763706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 29242068 - 29242266
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29242068 tattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 29242167  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29242168 aggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgtta 29242266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3177231 - 3177014
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  3177231 atcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 3177132  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  3177131 gttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgt 3177032  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  3177031 acaaacagttgcgtgtta 3177014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41961116 - 41960940
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41961116 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaa 41961017  T
Q  108 ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatg 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41961016 ggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4478638 - 4478444
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  4478638 tattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg-----ttacacttaaaacaaggt 4478544  T
Q  111 agaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4478543 aggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgtta 4478444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Original strand, 19424573 - 19424756
Alignment:
Q  35 atctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagat 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19424573 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagat 19424672  T
Q  126 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19424673 taagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgtta 19424756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 33709162 - 33709360
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||         |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33709162 tattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggt 33709261  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  33709262 aggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgtta 33709360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 33550917 - 33551114
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg--------agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggta 111  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |        |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  33550917 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgta 33551016  T
Q  112 gaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33551017 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 33551114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37906002 - 37905783
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg- 90  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||         ||||||||||||||||||     
T  37906002 atcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggg 37905903  T
Q  91 -tattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact 189  Q
     | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |    
T  37905902 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 37905803  T
Q  190 gtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  37905802 gtacaaacggtggggtgtta 37905783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 41463780 - 41463978
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||    
T  41463780 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagt 41463879  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41463880 atgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgtta 41463978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 7006868 - 7007049
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||  |||      || |||||||||||||||||||  ||||||    
T  7006868 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga----tattcttaa----gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa 7006959  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7006960 ttagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgtta 7007049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Original strand, 17071667 - 17071852
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  17071667 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggt 17071766  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaa 196  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||| || ||||||||    
T  17071767 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaa 17071852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 18494192 - 18494383
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||         |||| || ||||||| |||    
T  18494192 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt 18494291  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatg 184  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18494292 -ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 18494383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44913956 - 44913748
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg- 90  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||     
T  44913956 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggg 44913857  T
Q  91 tattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aggggactgaacttttgatgccact 189  Q
    | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| || |    
T  44913856 tgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcatt 44913757  T
Q  190 gtacaaaca 198  Q
     ||||||||    
T  44913756 ttacaaaca 44913748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45328012 - 45327801
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||         |||||||||||| || |||    
T  45328012 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgttacactttctgaggt 45327913  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||    
T  45327912 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcaccgt 45327813  T
Q  192 acaaacagtggg 203  Q
    | ||||| ||||    
T  45327812 ataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 43648175 - 43648373
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||         |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  43648175 tattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggt 43648274  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  43648275 atgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgtta 43648373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 2325308 - 2325498
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  2325308 tattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggt 2325407  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2325408 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgtta 2325498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26357869 - 26357652
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||         |||||||| |||||||| |    
T  26357869 atcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggat 26357770  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  |||   | ||||||||||||||| ||||||    
T  26357769 gttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgt 26357670  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26357669 acaaacagtgggatgtta 26357652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41465793 - 41465602
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||         |||||||||||| || |||    
T  41465793 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggt 41465694  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgat 183  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  41465693 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13711751 - 13711539
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |  ||         || ||||| ||||||    
T  13711751 atcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggt 13711652  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||| |     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13711651 gttacacttaaaacatg-----ataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgt 13711557  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| |||||||||||    
T  13711556 acaaactgtggggtgtta 13711539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 17054026 - 17054213
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  17054026 tattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggt 17054125  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |   || | |||||||||| || ||||||||||    
T  17054126 aggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaaca 17054213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 19289250 - 19289451
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaa 107  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  19289250 tattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaa 19289349  T
Q  108 ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgt 207  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  | | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19289350 tgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgt 19289449  T
Q  208 ta 209  Q
    ||    
T  19289450 ta 19289451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33902278 - 33902145
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  33902278 agtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggac 33902179  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  33902178 tgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggt 33902145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 18258217 - 18258349
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||         |||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||    
T  18258217 tattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgt 18258316  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaa 143  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18258317 aggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31862064 - 31861972
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862064 agtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 31861972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 11366311 - 11366501
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||   ||| |||||| |    
T  11366311 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagat 11366410  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtg 201  Q
    |  ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  11366411 atgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtg 11366501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35959169 - 35959023
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||          |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  35959169 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggt 35959070  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 158  Q
    || || |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  35959069 aggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg 35959023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 181
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttg 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051335
Alignment:
Q  139 gttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact-gtacaaacagtggggtgttat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttat 41051335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11467088 - 11466890
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11467088 tattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 11466989  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11466988 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 11466890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 14586591 - 14586780
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  14586591 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaag 14586690  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  14586691 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgtta 14586780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29164092 - 29163912
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29164092 atcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacactt 29163993  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttg 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29163992 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29099610 - 29099421
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||    
T  29099610 tattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaa 29099511  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29099510 ttaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 29099421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34133199 - 34133001
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34133199 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 34133100  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34133099 aggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 34133001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2008196 - 2007999
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  2008196 tattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgt-acacttaaaacgaggt 2008098  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2008097 aggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 2007999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 44186410 - 44186611
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||       ||||||| ||||| ||    
T  44186410 atcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtt-------gtggggtgttacattt 44186502  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  44186503 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagc 44186602  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  44186603 ggggtgtta 44186611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 52040815 - 52041021
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||| ||||||||    
T  52040815 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggt 52040914  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  52040915 attacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactat 52041014  T
Q  192 acaaaca 198  Q
    |||||||    
T  52041015 acaaaca 52041021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 7327375 - 7327592
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  7327375 atcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 7327474  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||  ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7327475 gttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgt 7327574  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||| | ||| ||||||    
T  7327575 acaaataatggagtgtta 7327592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43348521 - 43348325
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||         |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  43348521 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggt 43348422  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43348421 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaa-aagactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgtt 43348325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 46297655 - 46297872
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  46297655 atcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 46297754  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  46297755 gttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgt 46297854  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  46297855 acaaacagtggtgtgtta 46297872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3655095 - 3655312
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||         |||||||| ||||||| ||    
T  3655095 atcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgt 3655194  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  3655195 gttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgt 3655294  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||||| |||||||||||    
T  3655295 acaaacggtggggtgtta 3655312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35844581 - 35844392
Alignment:
Q  29 gttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga--------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa- 119  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||        |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  35844581 gttgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgatatcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaa 35844482  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35844481 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgtta 35844392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44891780 - 44891584
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||||||| ||    
T  44891780 atcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagt 44891681  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccac 188  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  44891680 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgccac 44891584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 53229052 - 53229251
Alignment:
Q  8 acttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacac 98  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||         ||||||||||||||||||  ||||||    
T  53229052 acttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacac 53229151  T
Q  99 ttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53229152 ttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaaca 53229251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32373753 - 32373543
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||         |||| |||||||||||| |    
T  32373753 atcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggat 32373654  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||   |||||||||||||||||||    
T  32373653 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgt 32373554  T
Q  192 acaaacagtgg 202  Q
    |||||||||||    
T  32373553 acaaacagtgg 32373543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 42505987 - 42506181
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  42505987 tattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggt 42506086  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42506087 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 42506181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37203270 - 37203133
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  37203270 agtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggac 37203171  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203170 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 37203133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33698436 - 33698265
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||         |||||||||||||||||||    
T  33698436 atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 33698337  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 163  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698336 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45174770 - 45174579
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |         |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  45174770 tattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatattatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggt 45174671  T
Q  111 agaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtg 201  Q
    || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45174670 aggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtg 45174579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26941153 - 26941370
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||         |||||||||||| || |||    
T  26941153 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggt 26941252  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| || | |    
T  26941253 attacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattat 26941352  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26941353 acaaacagtggggtgtta 26941370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 24708009 - 24708212
Alignment:
Q  2 tcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggta 92  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||     
T  24708009 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtg 24708108  T
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaa--gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactg 190  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  24708109 ttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactg 24708208  T
Q  191 taca 194  Q
    ||||    
T  24708209 taca 24708212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25580001 - 25579822
Alignment:
Q  22 ttttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtag 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25580001 ttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtag 25579902  T
Q  113 aataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgta 192  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25579901 gataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgta 25579822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 208
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213090
Alignment:
Q  73 gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggact 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  173 gaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 208  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgtt 51213090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39282916 - 39282722
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39282916 tattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggt 39282817  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39282816 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggt 39282722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4015742 - 4015526
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||         |||| ||||||||||||||    
T  4015742 atcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaacaa-gttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggt 4015644  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |    
T  4015643 gttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactct 4015544  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  4015543 acaaacagttgggtgtta 4015526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21193871 - 21193672
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga----------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaagg 109  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||          ||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  21193871 tattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaagg 21193772  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21193771 taggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgtta 21193672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37157985 - 37157774
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaa-agttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattac 96  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||    
T  37157985 gacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37157886  T
Q  97 acttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaa 196  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37157885 acttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aa 37157787  T
Q  197 cagtggggtgtta 209  Q
    |||||||||||||    
T  37157786 cagtggggtgtta 37157774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48355224 - 48355007
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||  |    
T  48355224 atcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtat 48355125  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||    
T  48355124 gttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt 48355025  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  48355024 acaaacaatggggtgtta 48355007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Original strand, 24488874 - 24489065
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||         ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  24488874 tattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgt 24488973  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  24488974 aagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgg 24489065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 33378697 - 33378891
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||         || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  33378697 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggt 33378796  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 205  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  33378797 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggt 33378891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22451251 - 22451037
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcat------gtg---agtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||      |||   | ||||||||||  ||||||    
T  22451251 atcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggt 22451152  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  22451151 gttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccat 22451052  T
Q  192 acaaacagtggggtg 206  Q
    |||||||||| ||||    
T  22451051 acaaacagtgaggtg 22451037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3362518 - 3362319
Alignment:
Q  21 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||         ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  3362518 attttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggta 3362419  T
Q  112 gaataaaattagattaa--gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    | |||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3362418 ggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgtta 3362319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 11357293 - 11357469
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaa 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||    |||      || |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11357293 tattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 11357384  T
Q  120 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 204  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11357385 ttagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggg 11357469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 40552158 - 40552369
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattaca 97  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||| ||||||| | ||||     
T  40552158 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacg 40552257  T
Q  98 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 197  Q
    |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40552258 cttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 40552357  T
Q  198 agtggggtgtta 209  Q
     |||| ||||||    
T  40552358 ggtggagtgtta 40552369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Original strand, 43975804 - 43975991
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaa---agttgttgatatcatgtga--gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  43975804 tattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataaga 43975903  T
Q  115 taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgg 202  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  43975904 taaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtgg 43975991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 4761547 - 4761751
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg-tattac 96  Q
    ||||||||  || |||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||| ||||||||||| | |||     
T  4761547 gacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttat 4761646  T
Q  97 acttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaa 196  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4761647 acttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 4761746  T
Q  197 cagtg 201  Q
    |||||    
T  4761747 cagtg 4761751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 198
Target Start/End: Original strand, 27480368 - 27480478
Alignment:
Q  88 gggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgcca 187  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27480368 gggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 27480467  T
Q  188 ctgtacaaaca 198  Q
    | |||||||||    
T  27480468 ccgtacaaaca 27480478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53176257 - 53176127
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||||  |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  53176257 agtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 53176158  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtgg 202  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  53176157 tgaacttttgatgttattgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373406
Alignment:
Q  103 aacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgg 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  203 ggtgtta 209  Q
    |||||||    
T  20373400 ggtgtta 20373406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40936256 - 40936057
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||  ||    |||      || ||||||||    
T  40936256 atcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagt----cttaa----gtgttacactt 40936165  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  40936164 aaaaaaagttgga-taaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaat 40936066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 22622611 - 22622780
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||         ||||||| |||||||||||    
T  22622611 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggt 22622710  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 161  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22622711 gttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38591891 - 38591778
Alignment:
Q  82 tttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttg 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||| ||||||||    
T  38591891 tttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttg 38591792  T
Q  182 atgccactgtacaa 195  Q
    |||||| |||||||    
T  38591791 atgccattgtacaa 38591778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 46994634 - 46994746
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||    
T  46994634 agtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggac 46994733  T
Q  172 tgaacttttgatg 184  Q
    |||||||||||||    
T  46994734 tgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21009695 - 21009912
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||         |||||||||||||| | ||    
T  21009695 atcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagt 21009794  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||  |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| || | |    
T  21009795 gttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattct 21009894  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  21009895 acaaatagtggggtgtta 21009912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Original strand, 22446058 - 22446174
Alignment:
Q  93 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-gggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  22446058 ttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgt 22446157  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  22446158 acaaa-agtggggtgtta 22446174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47481725 - 47481588
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | || |    
T  47481725 agtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggc 47481626  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    | ||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  47481625 taaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgtta 47481588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36012403 - 36012251
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaa-agttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaagg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||         |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  36012403 tattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaagg 36012304  T
Q  110 tagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 161  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36012303 taggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgata 36012251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 173
Target Start/End: Original strand, 11835602 - 11835702
Alignment:
Q  74 tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaa-attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggact 172  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  11835602 tgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatggggact 11835701  T
Q  173 g 173  Q
    |    
T  11835702 g 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1089958 - 1089811
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg-tattacacttaaaacaagg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||         |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1089958 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaagg 1089859  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat 157  Q
    ||| ||||||||||||| | |||| || |||| ||||||| |||||||    
T  1089858 taggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 54828674 - 54828811
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| |  ||     
T  54828674 agtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaa 54828773  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |||| |||||||| |  |||  |||| |||||||||||    
T  54828774 tgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgtta 54828811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 54506084 - 54505874
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattaca 97  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||         |||||||||||||| | || |||      
T  54506084 gacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatg 54505985  T
Q  98 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 197  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||| | || ||||| |||||||| || | || |||     
T  54505984 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcattctataaat 54505886  T
Q  198 agtggggtgtta 209  Q
    | ||||||||||    
T  54505885 aatggggtgtta 54505874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 20373137 - 20373263
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         ||||||||||||| |||| |    
T  20373137 atcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatgggat 20373236  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaa 118  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  20373237 attacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Original strand, 53811698 - 53811767
Alignment:
Q  135 tcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggg------actgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811698 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Original strand, 27480261 - 27480306
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 52  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27480261 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 27480306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 53811643 - 53811676
Alignment:
Q  17 tattattttatcgttggcatctttaacatgcaaa 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53811643 tattattttatcgttggtatctttaacatgcaaa 53811676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Original strand, 51212683 - 51212735
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga 72  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  51212683 tattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 51212735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33892904 - 33893111
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtattacactt 100  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  33892904 atcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttatacat 33893003  T
Q  101 aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||| |||    
T  33893004 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaa-gggactgaacttttaatatcattgtacaaatagt 33893102  T
Q  201 ggggtgtta 209  Q
    |||||||||    
T  33893103 ggggtgtta 33893111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 3879850 - 3880048
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3879850 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggt 3879949  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  3879950 aggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgtta 3880048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491690
Alignment:
Q  24 ttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaa 114  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||         |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtagga 15491785  T
Q  115 taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15491784 taaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgtta 15491690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 21017023 - 21017221
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  21017023 tattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgt 21017122  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  21017123 aggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgtta 21017221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 4318733 - 4318932
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  4318733 tatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggt 4318832  T
Q  111 agaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4318833 aggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 4318932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29182456 - 29182238
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg- 90  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||         |||||||||||| |||||     
T  29182456 atcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggg 29182357  T
Q  91 tattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactg 190  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  29182356 tgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactg 29182257  T
Q  191 tacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||||    
T  29182256 tataaacagtggggtgtta 29182238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 30353253 - 30353459
Alignment:
Q  4 ttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtatt 94  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||| | ||    
T  30353253 ttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgtt 30353352  T
Q  95 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtaca 194  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  30353353 acacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtaca 30353452  T
Q  195 aacagtg 201  Q
    |||||||    
T  30353453 aacagtg 30353459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 7234927 - 7235140
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||         | |||||||||| ||||||    
T  7234927 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggt 7235026  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||| ||    
T  7235027 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatact-atgagactgaacttttgatggcaccgt 7235125  T
Q  192 acaaacagtggggtg 206  Q
    |||||||||||||||    
T  7235126 acaaacagtggggtg 7235140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8513501 - 8513308
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||         |||||||||||||| |||| |||      |||||||||    
T  8513501 tattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtta------aaacaaggt 8513408  T
Q  111 agaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8513407 aggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgtta 8513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1946126 - 1945909
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| ||||    
T  1946126 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggt 1946027  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || | |    
T  1946026 gttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattct 1945927  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1945926 acaaacagtggggtgtta 1945909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 6091093 - 6091292
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga----------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaagg 109  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||          |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6091093 tattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaagg 6091192  T
Q  110 tagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  6091193 tatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgtta 6091292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20768368 - 20768179
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattaca 97  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||         |||||||||||| |||| | |||||    
T  20768368 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttaca 20768269  T
Q  98 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccact 189  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20768268 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccact 20768179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6089176 - 6088983
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||         |||||| || |||| | || |||      |||||||||    
T  6089176 tattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgtta------aaacaaggt 6089083  T
Q  111 agaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6089082 aggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgtta 6088983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 7055187 - 7055324
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || |    
T  7055187 agtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggc 7055286  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||    
T  7055287 tgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgtta 7055324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5627664 - 5627466
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         || ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||    
T  5627664 tattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggt 5627565  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||    
T  5627564 atgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgtta 5627466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618922
Alignment:
Q  108 ggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaa 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaa 33618922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498514
Alignment:
Q  153 ttgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 204  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggg 18498514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12201 - 11988
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||         |||| ||||||||||||||    
T  12201 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggt 12102  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactg- 190  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||     
T  12101 gttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactga 12002  T
Q  191 tacaaacagtgggg 204  Q
    |||||||| |||||    
T  12001 tacaaacaatgggg 11988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 407 - 209
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  407 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagat 308  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  307 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgtta 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 94356 - 94493
Alignment:
Q  72 agtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  94356 agtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggac 94455  T
Q  172 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94456 caaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 94493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 408322 - 408512
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||         ||||| ||||||||| |||    
T  408322 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggt 408421  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgat 183  Q
     |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  408422 gttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-agaggactgaacttttgat 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 94012 - 94056
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgata 64  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  94012 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8179 - 7962
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggt 91  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||    
T  8179 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 8080  T
Q  92 attacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgt 191  Q
     |||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  8079 gttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgt 7980  T
Q  192 acaaacagtggggtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7979 acaaacagtggggtgtta 7962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 267577 - 267372
Alignment:
Q  1 atcttagacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga----------gtgttacactttgtgggg 90  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||          |||||||||||||||||     
T  267577 atcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggga 267478  T
Q  91 tattacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactg 190  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||    
T  267477 tgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactg 267378  T
Q  191 tacaaa 196  Q
    ||||||    
T  267377 tacaaa 267372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44242 - 44032
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga--------gtgttacactttgtggggtattacac 98  Q
    |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||        ||||||||||||||||||| |||  |    
T  44242 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagcttaagtgttacactttgtggggtgttaagc 44143  T
Q  99 ttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44142 ttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaaca 44043  T
Q  199 gtggggtgtta 209  Q
      |||||||||    
T  44042 acggggtgtta 44032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 154545 - 154755
Alignment:
Q  7 gacttatatatattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga--------gtgttacactttgtggggtattacac 98  Q
    |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||        ||||||||||||||||||| |||  |    
T  154545 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagcttaagtgttacactttgtggggtgttaagc 154644  T
Q  99 ttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 198  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  154645 ttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaaca 154744  T
Q  199 gtggggtgtta 209  Q
      |||||||||    
T  154745 acggggtgtta 154755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 145928 - 146126
Alignment:
Q  20 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||    
T  145928 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggt 146027  T
Q  111 agaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 209  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| || | |||||| | ||||||||||    
T  146028 atgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgtta 146126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100938
Alignment:
Q  26 atcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtg-agtgttacac 81  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgaagtgttacac 100938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  99 ttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgt 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University