View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF6662_high_7 (Length: 241)
Name: NF6662_high_7
Description: NF6662
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6662_high_7 |
 | |
|
| [»] scaffold0055 (7 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0052 (9 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0021 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: scaffold0055 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 7)
Name: scaffold0055
Description:
Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 42284 - 42489
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42284 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
42383 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42384 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
42483 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
42484 |
ctacct |
42489 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 51532 - 51737
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51532 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
51631 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51632 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
51731 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
51732 |
ctacct |
51737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 67067 - 67272
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67067 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
67166 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67167 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
67266 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
67267 |
ctacct |
67272 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 69987 - 70192
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69987 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
70086 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70087 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
70186 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
70187 |
ctacct |
70192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4237 - 4032
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4237 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
4138 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4137 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcattaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
4038 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
4037 |
ctacct |
4032 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 32976 - 33181
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32976 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggcagct |
33075 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33076 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccgatattgttatttattgtca |
33175 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
33176 |
ctacct |
33181 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 80533 - 80592
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaac |
76 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80533 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaac |
80592 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 9)
Name: scaffold0052
Description:
Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 26057 - 26262
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26057 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
26156 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26157 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
26256 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
26257 |
ctacct |
26262 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 27831 - 28036
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27831 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
27930 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27931 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
28030 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
28031 |
ctacct |
28036 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 48439 - 48644
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48439 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
48538 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48539 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
48638 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
48639 |
ctacct |
48644 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 51031 - 51236
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51031 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
51130 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51131 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
51230 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
51231 |
ctacct |
51236 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 80298 - 80503
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80298 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
80397 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80398 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcattaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
80497 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
80498 |
ctacct |
80503 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 63089 - 62884
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
63089 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggcagct |
62990 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
62989 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccgatattgttatttattgtca |
62890 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
62889 |
ctacct |
62884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 18559 - 18764
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18559 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaatgtccaactactagctttttaactgcaacaacttacatatacgctattggagctggaatgaccgcggctgct |
18658 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18659 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
18758 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
18759 |
ctacct |
18764 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 6887 - 7033
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6887 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
6986 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagatt |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6987 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagatt |
7033 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Original strand, 4168 - 4284
Alignment:
| Q |
106 |
ccgcggctgctggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgtt |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4168 |
ccgcggctgctggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgtt |
4267 |
T |
|
| Q |
206 |
atttattgtcactacct |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4268 |
atttattgtcactacct |
4284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 46701 - 46906
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46701 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
46800 |
T |
|
| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
46801 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
46900 |
T |
|
| Q |
217 |
ctacct |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
46901 |
ctacct |
46906 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13700938 - 13700809
Alignment:
| Q |
17 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
116 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
13700938 |
cataggcggaccgatcgacctaacccgaggtccaactacaagctttttaactacaacaacttaaatatacgctattggagctgtaattatcgcggctgct |
13700839 |
T |
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| Q |
117 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctc |
146 |
Q |
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|||||||||||| ||||||||||| |||| |
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| T |
13700838 |
agcaccagacttgtcctccaatggagcctc |
13700809 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8125686 - 8125518
Alignment:
| Q |
49 |
caactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgctggcaccagacttgccctccaatggatcctcgt |
148 |
Q |
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| T |
8125686 |
caactacgagctttttaattgcaacaatttaaatatacgctattgaagctaaaattaccgcagctgctgacaccaaatttatccttcaataaatcctcgt |
8125587 |
T |
|
| Q |
149 |
taagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtcac |
217 |
Q |
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| T |
8125586 |
taaagaatttatattgtactcatttcaattaccagactcaatgagtctactattgttatttattatcac |
8125518 |
T |
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