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Alignment Overview

Query: NF6665_high_10 (Length: 400)

Name: NF6665_high_10
Description: NF6665
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6665_high_10
NF6665_high_10
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-170)||(42850180-42850349)
chr1 (5-170)||(47123386-47123551)
chr1 (1-170)||(1199823-1199992)
chr1 (1-170)||(31223370-31223539)
chr1 (1-170)||(48510904-48511073)
chr1 (1-189)||(25230003-25230190)
chr1 (21-170)||(27801613-27801762)
chr1 (1-170)||(35569163-35569332)
chr1 (1-146)||(43728863-43729007)
chr1 (1-168)||(40229433-40229600)
chr1 (1-168)||(45710045-45710211)
chr1 (1-170)||(7826315-7826484)
chr1 (1-170)||(20800238-20800407)
chr1 (1-170)||(12247416-12247584)
chr1 (1-170)||(26058237-26058406)
chr1 (1-170)||(11023291-11023459)
chr1 (1-170)||(13055994-13056162)
chr1 (1-170)||(5410636-5410804)
chr1 (1-170)||(6166106-6166274)
chr1 (1-170)||(10470586-10470754)
chr1 (21-170)||(50406146-50406295)
chr1 (1-170)||(50977301-50977469)
chr1 (1-131)||(4369803-4369932)
chr1 (1-139)||(12468209-12468346)
chr1 (1-146)||(6464604-6464748)
chr1 (1-170)||(35536068-35536236)
chr1 (1-146)||(15884222-15884368)
chr1 (21-170)||(34718467-34718616)
chr1 (1-170)||(36205187-36205356)
chr1 (1-145)||(13931619-13931762)
chr1 (1-148)||(25061222-25061369)
chr1 (63-146)||(49242967-49243050)
chr1 (30-117)||(291731-291818)
chr1 (36-131)||(11561853-11561948)
chr1 (1-48)||(31933723-31933770)
chr1 (64-148)||(4347033-4347116)
chr1 (92-146)||(29441271-29441325)
chr1 (21-170)||(9447549-9447696)
chr1 (65-146)||(40352451-40352531)
chr1 (91-146)||(43134536-43134591)
chr1 (1-103)||(11051339-11051440)
chr1 (70-150)||(15576519-15576599)
chr1 (24-131)||(23628706-23628812)
chr1 (69-154)||(41989-42074)
chr1 (68-146)||(13344836-13344913)
chr1 (64-116)||(29759710-29759762)
chr1 (64-116)||(43730059-43730111)
chr1 (70-117)||(47085898-47085945)
chr1 (66-133)||(47978359-47978426)
chr1 (76-170)||(6061214-6061307)
chr1 (64-146)||(7765269-7765350)
chr1 (69-116)||(32365143-32365190)
chr1 (4-103)||(40821824-40821922)
chr1 (63-117)||(40709234-40709287)
chr1 (68-117)||(5930823-5930872)
chr1 (69-170)||(7335840-7335941)
chr1 (64-116)||(47981810-47981862)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (1-170)||(46830029-46830198)
chr4 (1-177)||(39636742-39636918)
chr4 (1-170)||(43781479-43781647)
chr4 (1-170)||(51922897-51923066)
chr4 (1-170)||(16566262-16566431)
chr4 (1-170)||(26651808-26651977)
chr4 (1-170)||(6138580-6138749)
chr4 (1-146)||(43772107-43772252)
chr4 (5-170)||(54150487-54150652)
chr4 (1-170)||(15603317-15603486)
chr4 (1-170)||(19592191-19592360)
chr4 (1-170)||(32238019-32238187)
chr4 (1-170)||(28986978-28987144)
chr4 (1-167)||(42944861-42945027)
chr4 (1-170)||(9893668-9893837)
chr4 (1-170)||(48550174-48550343)
chr4 (1-146)||(49136479-49136624)
chr4 (1-146)||(49519687-49519832)
chr4 (1-146)||(14564130-14564275)
chr4 (1-170)||(9889295-9889463)
chr4 (1-170)||(14072460-14072628)
chr4 (1-146)||(29149291-29149436)
chr4 (1-170)||(30842089-30842257)
chr4 (1-170)||(54153002-54153170)
chr4 (2-170)||(26426075-26426242)
chr4 (1-170)||(13183010-13183179)
chr4 (21-146)||(25312692-25312817)
chr4 (1-146)||(48407682-48407826)
chr4 (1-117)||(48550440-48550556)
chr4 (1-146)||(6505158-6505303)
chr4 (25-170)||(39187715-39187860)
chr4 (3-146)||(54735635-54735777)
chr4 (21-131)||(4954050-4954160)
chr4 (21-170)||(13167502-13167651)
chr4 (1-170)||(48908232-48908399)
chr4 (6-146)||(14075977-14076116)
chr4 (6-170)||(46926010-46926174)
chr4 (66-170)||(41866176-41866280)
chr4 (1-116)||(2175161-2175276)
chr4 (1-170)||(14054808-14054977)
chr4 (51-152)||(55638733-55638834)
chr4 (7-133)||(15619579-15619703)
chr4 (1-170)||(31520331-31520499)
chr4 (25-149)||(38263881-38264004)
chr4 (1-117)||(56241848-56241964)
chr4 (24-139)||(19599487-19599601)
chr4 (69-140)||(33574203-33574274)
chr4 (1-146)||(38305968-38306113)
chr4 (1-146)||(38694005-38694150)
chr4 (64-146)||(54488625-54488707)
chr4 (17-110)||(26402960-26403053)
chr4 (1-117)||(30887167-30887282)
chr4 (68-146)||(28947733-28947811)
chr4 (63-146)||(53531996-53532079)
chr4 (92-146)||(4649913-4649967)
chr4 (65-131)||(33843803-33843869)
chr4 (44-146)||(45779994-45780095)
chr4 (63-133)||(53914918-53914987)
chr4 (60-149)||(523166-523255)
chr4 (63-116)||(16492946-16492999)
chr4 (64-117)||(22699762-22699815)
chr4 (64-117)||(22980715-22980768)
chr4 (64-117)||(22994302-22994355)
chr4 (71-146)||(22694581-22694656)
chr4 (63-131)||(54487219-54487287)
chr4 (78-170)||(54655266-54655358)
chr4 (65-116)||(36150625-36150676)
chr4 (63-116)||(38740316-38740369)
chr4 (65-154)||(39993574-39993663)
chr4 (63-104)||(8754177-8754217)
chr4 (68-117)||(46958047-46958096)
chr4 (1-34)||(48908096-48908129)
chr4 (66-118)||(28752537-28752588)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (1-154)||(3348215-3348368)
chr3 (1-170)||(10334110-10334279)
chr3 (1-170)||(10853227-10853396)
chr3 (1-170)||(38172267-38172436)
chr3 (1-170)||(50664731-50664899)
chr3 (1-149)||(53074875-53075022)
chr3 (1-170)||(15511336-15511504)
chr3 (1-170)||(42318302-42318470)
chr3 (1-154)||(52966785-52966938)
chr3 (1-146)||(8424714-8424858)
chr3 (1-170)||(20813118-20813286)
chr3 (1-170)||(26519636-26519805)
chr3 (1-139)||(53179821-53179958)
chr3 (1-146)||(35425306-35425450)
chr3 (1-170)||(38125402-38125570)
chr3 (1-170)||(38340778-38340946)
chr3 (1-134)||(44224734-44224867)
chr3 (1-170)||(44939376-44939543)
chr3 (1-170)||(48189402-48189570)
chr3 (1-146)||(23496296-23496434)
chr3 (2-152)||(21224963-21225113)
chr3 (17-170)||(4984569-4984722)
chr3 (1-170)||(16246056-16246223)
chr3 (1-167)||(35930710-35930876)
chr3 (21-167)||(42475701-42475847)
chr3 (1-170)||(30811492-30811660)
chr3 (61-170)||(55154534-55154642)
chr3 (25-154)||(23207044-23207172)
chr3 (1-117)||(31084180-31084295)
chr3 (25-146)||(40415280-40415401)
chr3 (60-150)||(19877448-19877538)
chr3 (63-156)||(34561142-34561235)
chr3 (6-116)||(30809959-30810069)
chr3 (1-87)||(31618930-31619016)
chr3 (21-133)||(25848024-25848136)
chr3 (92-148)||(52813278-52813334)
chr3 (1-116)||(32357483-32357597)
chr3 (64-117)||(7012675-7012728)
chr3 (33-142)||(29716674-29716783)
chr3 (64-146)||(21023201-21023281)
chr3 (65-146)||(42644298-42644379)
chr3 (68-116)||(10852727-10852775)
chr3 (64-154)||(44225600-44225689)
chr3 (63-146)||(49526653-49526736)
chr3 (70-136)||(22737055-22737121)
chr3 (62-116)||(52931586-52931640)
chr3 (68-117)||(23918881-23918930)
chr3 (77-117)||(30736172-30736212)
chr3 (122-170)||(31618372-31618420)
chr3 (7-146)||(14651086-14651224)
chr3 (67-105)||(38626750-38626788)
chr3 (64-117)||(25181245-25181298)
chr3 (63-116)||(48089632-48089685)
chr3 (63-116)||(52836019-52836072)
chr3 (64-149)||(53567967-53568051)
chr3 (64-148)||(7899104-7899188)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (1-170)||(3622407-3622576)
chr7 (1-170)||(37562563-37562732)
chr7 (1-170)||(48459703-48459872)
chr7 (1-167)||(44967349-44967515)
chr7 (1-170)||(39391084-39391253)
chr7 (1-170)||(3342783-3342952)
chr7 (1-146)||(38230061-38230206)
chr7 (1-170)||(41715650-41715819)
chr7 (1-168)||(32186933-32187100)
chr7 (1-146)||(3375483-3375628)
chr7 (1-170)||(10371905-10372074)
chr7 (1-170)||(37639423-37639592)
chr7 (2-170)||(43631643-43631810)
chr7 (1-149)||(47217509-47217657)
chr7 (1-170)||(47021912-47022081)
chr7 (1-142)||(3750679-3750820)
chr7 (1-146)||(9456098-9456242)
chr7 (1-154)||(34010333-34010485)
chr7 (1-170)||(34365929-34366097)
chr7 (1-170)||(48134573-48134741)
chr7 (6-170)||(42904551-42904715)
chr7 (1-146)||(43737910-43738055)
chr7 (21-170)||(37008300-37008446)
chr7 (1-170)||(386428-386596)
chr7 (1-146)||(12632054-12632199)
chr7 (1-137)||(42740385-42740521)
chr7 (1-170)||(34010908-34011078)
chr7 (1-170)||(39977545-39977714)
chr7 (2-167)||(24770861-24771026)
chr7 (69-170)||(46541661-46541762)
chr7 (25-117)||(32205943-32206034)
chr7 (2-146)||(36920149-36920293)
chr7 (1-146)||(42752162-42752307)
chr7 (69-150)||(12964659-12964740)
chr7 (65-146)||(39634136-39634217)
chr7 (1-170)||(40903115-40903283)
chr7 (68-146)||(20088929-20089007)
chr7 (96-146)||(12212440-12212490)
chr7 (68-118)||(38494276-38494326)
chr7 (85-170)||(19097474-19097559)
chr7 (1-133)||(1766418-1766550)
chr7 (1-77)||(19095930-19096005)
chr7 (64-146)||(4228603-4228684)
chr7 (66-117)||(16079460-16079511)
chr7 (63-118)||(29829309-29829364)
chr7 (21-116)||(33746402-33746497)
chr7 (1-48)||(47301626-47301673)
chr7 (116-170)||(47301572-47301626)
chr7 (63-116)||(15311217-15311270)
chr7 (63-131)||(33853411-33853479)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (1-170)||(7472632-7472800)
chr2 (1-170)||(9988459-9988628)
chr2 (1-170)||(1944997-1945166)
chr2 (1-170)||(14821144-14821312)
chr2 (1-170)||(36548181-36548349)
chr2 (1-170)||(2213487-2213656)
chr2 (1-170)||(5916200-5916368)
chr2 (1-170)||(26207887-26208056)
chr2 (1-170)||(36312258-36312426)
chr2 (1-154)||(39141444-39141596)
chr2 (21-153)||(44619036-44619168)
chr2 (31-170)||(2213658-2213797)
chr2 (1-170)||(28127245-28127414)
chr2 (21-149)||(42089507-42089639)
chr2 (1-146)||(2215235-2215378)
chr2 (1-170)||(32501967-32502135)
chr2 (30-150)||(31224690-31224810)
chr2 (1-146)||(7296136-7296281)
chr2 (1-170)||(8170294-8170462)
chr2 (1-146)||(28261275-28261420)
chr2 (1-169)||(31562646-31562811)
chr2 (1-168)||(42515936-42516102)
chr2 (63-170)||(30007511-30007618)
chr2 (1-146)||(7295330-7295473)
chr2 (1-170)||(23358239-23358407)
chr2 (1-148)||(28641623-28641770)
chr2 (30-146)||(45714650-45714766)
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chr2 (16-146)||(41580692-41580822)
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[»] chr8 (55 HSPs)
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[»] chr6 (24 HSPs)
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[»] chr5 (47 HSPs)
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[»] scaffold0369 (1 HSPs)
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[»] scaffold0031 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42850349 - 42850180
Alignment:
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T  42850349 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 42850250  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  42850249 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 42850180  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 47123386 - 47123551
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47123386 caattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcacttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaa 47123485  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  47123486 tcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttgccaccgccataccaaacaca 47123551  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1199823 - 1199992
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1199823 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 1199922  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  1199923 ttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 1199992  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 31223370 - 31223539
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
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T  31223370 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 31223469  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||| | || ||||||||||    
T  31223470 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 31223539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 48510904 - 48511073
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48510904 aaatcaattttgatacatactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagcaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 48511003  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  48511004 ttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattcaatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacaca 48511073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 25230003 - 25230190
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25230003 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactaataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 25230101  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacacaaatagtaatatagataatt 189  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  25230102 ttaactaaaatcaattctctcaaactcagttctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacacatagtattatatataatt 25230190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27801762 - 27801613
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27801762 tatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaatcaaaatcaattctct 27801663  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27801662 taaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacaca 27801613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35569332 - 35569163
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35569332 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 35569233  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  35569232 ttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacaca 35569163  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43729007 - 43728863
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43729007 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcactt 43728909  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43728908 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 43728863  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40229600 - 40229433
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40229600 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcagaagaatcacctgtaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcactt 40229501  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40229500 ttaaccaaaatcaattccaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcatcaccgtcataccaaaca 40229433  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 45710045 - 45710211
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45710045 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtattcaaacataa-tcaattcacatacaactcactt 45710143  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  45710144 ttaatcaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaaca 45710211  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7826484 - 7826315
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7826484 aaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaagctcactt 7826385  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  7826384 ttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccaccgccaaaccaaacaca 7826315  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20800407 - 20800238
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20800407 aaatcaatattgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 20800308  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  20800307 ttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacaca 20800238  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 12247416 - 12247584
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  12247416 aaatcaattttgattcaaattctccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataatt-aatttacatccaactcactt 12247514  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  12247515 ttaaccagaatcaattctcttaaactcaattctattaaaatcaattttcatcaccgctataccaaacaca 12247584  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 26058237 - 26058406
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  26058237 aaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaattcactt 26058336  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  26058337 ttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 26058406  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11023459 - 11023291
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  11023459 aaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattgaatgtatccaaacataa-tcaattcacctaaaactcactt 11023361  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  11023360 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacaca 11023291  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 13055994 - 13056162
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13055994 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaat-aagcgtattcaaacataaatcaattcacactcaactcactt 13056092  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  13056093 ttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacaca 13056162  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 5410636 - 5410804
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5410636 aaatcaattatgattcaaactatccaaacaacatcaagtcataagaatcacttttaagta-gtgtattcaaacataaatcaatttacatccaactcactt 5410734  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||    
T  5410735 ttaatcaaaatcaattctttcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgccgccgccaaaccaaacaca 5410804  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 6166106 - 6166274
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  6166106 aaatcaattttgattcaaactacccaaacaacatcaactcctaagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaattcagatcaaactcactt 6166204  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  6166205 ctaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgcgataccaaacaca 6166274  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10470586 - 10470754
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  10470586 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacataa-tcaatttacattcaactcactt 10470684  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  10470685 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccctaccaaacaca 10470754  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 50406146 - 50406295
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  50406146 tatccaaacaacaacaacttataagaatcatttttaacgaagtgcatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaatcaaaatcaaatcttt 50406245  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  50406246 caaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccgctataccaaacaca 50406295  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50977469 - 50977301
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  50977469 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaat-aagcgtatccaaacataaaacaattcacaccaaactcactt 50977371  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  50977370 ttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 50977301  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4369932 - 4369803
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4369932 aaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacat-caactcactt 4369834  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaatt 131  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4369833 ttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaatt 4369803  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 12468209 - 12468346
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12468209 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaatataaatcaatttacatcaaactcactt 12468307  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaa 139  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  12468308 ttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaa 12468346  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 6464604 - 6464748
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  6464604 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtataaaaacataa-tcaattcacattaaactcactt 6464702  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6464703 ttaaccaaaatgaactcactcaaactcaattatatcaaaatcaatt 6464748  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 35536068 - 35536236
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||| || |||||||| || || ||||||    
T  35536068 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacgagtgtatctaaacat-aaccaattcacgtcaaagtcactt 35536166  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| | |||||||||||||    
T  35536167 ttaatcaaaattaattctctcaaactcaattctattaaaattaattttcatcaccgccataccaaacaca 35536236  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 15884222 - 15884368
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaagga-agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || | |||| ||| |||||| |    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884222 aaatcaattttgatccaaactatccaaacaacatgaatttataaaaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 15884321  T
Q  100 tttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  15884322 tttaaccaaaatcaattctgtcaaactcaactctatcaaaatcaatt 15884368  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 34718467 - 34718616
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    ||||||||||||   || |||||||||| ||||||    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  34718467 tatccaaacaactataattcataagaatcacttttgtacaagtgtattcaaacataaatcaatttatatcaaactcacttttaaccaaaattaattatct 34718566  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  34718567 caaactcaattctatcaaaatcaattttttccaccgtcaaaccaaacaca 34718616  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 36205187 - 36205356
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  36205187 aaatcaattttgattcaaactatccaagcaacattcactcgtaagaatcacttttaaataagtttatccaatcaaaaaccaattcatatctaacccactt 36205286  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  36205287 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattccgttaaaatcaattctcaccaccgtcataccaaacaca 36205356  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13931619 - 13931762
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  13931619 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttgtaagaatcatgtttaagtgagtatatccaaacat-aatcaattcacatcaaactcattt 13931717  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaat 145  Q
    |||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  13931718 ttaaacaaaatcaatttttggaaactcaattctatcaaaatcaat 13931762  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 25061222 - 25061369
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |  |  ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||    
T  25061222 aaatcaattttgattcaaattatccaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaacataaatcaatttatgttcaactcactt 25061321  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||| || |||||||||||||    
T  25061322 ttaaccaaaatcaattcaaccaaaatcaattttaacaaaatcaatttt 25061369  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 49243050 - 49242967
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  49243050 tgtattcaaacataaatcaattcacatccaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaattaatt 49242967  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 291818 - 291731
Alignment:
Q  30 aacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  291818 aacaacaactcataacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaaccaattcatctcaaactcacttttaatcaaaatcaattc 291731  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Original strand, 11561853 - 11561948
Alignment:
Q  36 aactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaatt 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  11561853 aactcataagaatcacttttaaaatagtatattcaaatataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctttcaaactcaatt 11561948  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 31933723 - 31933770
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaat 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31933723 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaat 31933770  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Original strand, 4347033 - 4347116
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4347033 gtatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctac--aaaatcaattctaccaaaatcaatttt 4347116  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Original strand, 29441271 - 29441325
Alignment:
Q  92 aactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29441271 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 29441325  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 9447549 - 9447696
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||   ||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||    
T  9447549 tatccaaacaacatcaactcgaaagaatcacttttaaatgagtatatctaaacat-aatccattcacatcaaactcacttttaacc-aaaccatttctct 9447646  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     ||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||| | |||||||||||||    
T  9447647 caaattcaattttattaaaatcaattctcttcaccgccataccaaacaca 9447696  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 40352451 - 40352531
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40352451 tatccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaaccaaaatcaattc-cacaaaatcaattctatcaaaatcaatt 40352531  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 146
Target Start/End: Original strand, 43134536 - 43134591
Alignment:
Q  91 caactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43134536 caactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattctatccaaataaatt 43134591  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11051440 - 11051339
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11051440 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaacat-aactcttaagaaccatttttaagtgtgtgtattcaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 11051342  T
Q  101 tta 103  Q
    |||    
T  11051341 tta 11051339  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Original strand, 15576519 - 15576599
Alignment:
Q  70 aaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15576519 aaacataaaacaattaatatctaactcacttttaattaaaatcaattctcttaaactcaatttaattaaaatcaattttcg 15576599  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23628812 - 23628706
Alignment:
Q  24 ccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaa 123  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||  || ||    
T  23628812 ccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttagtcaaaatcaattatctcaa 23628714  T
Q  124 actcaatt 131  Q
    ||||||||    
T  23628713 actcaatt 23628706  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 154
Target Start/End: Original strand, 41989 - 42074
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41989 caaacataaatcaattcacgttcaactcaccttttactaaaatcaattctaacaaaatcaattttatcaaaatcaattttctccac 42074  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Original strand, 13344836 - 13344913
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13344836 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctac--aaaatcaattcaatcaaaatcaatt 13344913  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 116
Target Start/End: Original strand, 29759710 - 29759762
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29759710 gtatccaaacataaatcattttacattcaactcacttttaaccataatcaatt 29759762  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 43730111 - 43730059
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43730111 gtatccaaacacaaatcaattgacactcaactcacttttaaccaaaatcaatt 43730059  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 117
Target Start/End: Original strand, 47085898 - 47085945
Alignment:
Q  70 aaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  47085898 aaacataaatcaattcacattcaactcacttttaattaaaatcaattc 47085945  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 47978426 - 47978359
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattct 133  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  47978426 atccaaccataaatcactttacattcaactcacttttacccaaaatcaattcactcaaaatgaattct 47978359  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Original strand, 6061214 - 6061307
Alignment:
Q  76 aaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| | | | ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  6061214 aaatcaactcatatccaattcacttt-acctataatcaattatctcaaattcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgtcaaaccaaacaca 6061307  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7765350 - 7765269
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||  || |||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  7765350 gtatccaaacaaaaatcacttttcatccaactcacttttattcataatcaatt-atgtaaaatcaattctatcaaaatcaatt 7765269  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
Target Start/End: Original strand, 32365143 - 32365190
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  32365143 caaacataaatcaatttacattcaactcacttttgactaaaatcaatt 32365190  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 40821824 - 40821922
Alignment:
Q  4 tcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactttta 103  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||| |    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40821824 tcaattttgattcaaattatccaaataacatcaacaaataagaatcacttatgttaaagtgtatcctaacat-aatcaattcacattcaactcattttta 40821922  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 117
Target Start/End: Original strand, 40709234 - 40709287
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40709234 tgtatccaaacataaatcaatt-acactcaactcactattaatcaaaatcaattc 40709287  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 117
Target Start/End: Original strand, 5930823 - 5930872
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  5930823 ccaaacataaatcactttacattcaatttacttttaaccaaaatcaattc 5930872  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7335941 - 7335840
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaa--atcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaa 166  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||  ||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  7335941 caaacataaatcactttacattcaactcacttttaactaaaatatcaatttac--aaaatcatttttattaaaatcaattttcgtcactgtggaaccaaa 7335844  T
Q  167 caca 170  Q
    ||||    
T  7335843 caca 7335840  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 47981862 - 47981810
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  47981862 gtatccaaacataaatcactttaaattcaactcaattttaaccaaaattaatt 47981810  T

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Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46830198 - 46830029
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46830198 aaatcaattttgatgtagaatatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 46830099  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  46830098 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 46830029  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 39636742 - 39636918
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39636742 aaatcaattttgattcatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 39636841  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacacaaatagta 177  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39636842 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacacatagta 39636918  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43781647 - 43781479
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  43781647 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 43781549  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  43781548 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 43781479  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 51922897 - 51923066
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51922897 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcagattcaactcactt 51922996  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  51922997 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaacaaaatcaattctcgtcgccgccataccaaacaca 51923066  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 16566262 - 16566431
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16566262 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 16566361  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  16566362 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccctgctgccataccaaacaca 16566431  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26651977 - 26651808
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26651977 aaatcaattttgattcaaactatccaaataacatcgactcataagaattacttttagtaaagtgtatctaaacataaatcaattcacattcaactcactt 26651878  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  26651877 ttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacaca 26651808  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6138749 - 6138580
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6138749 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcatttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 6138650  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||    
T  6138649 ttaaccaaaatcaattatttcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 6138580  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43772252 - 43772107
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43772252 aaatcaattttgattcatattatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttctaaaaaagtgtatccaaacataaatcgattcacatccaactcactt 43772153  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43772152 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 43772107  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 54150487 - 54150652
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54150487 caattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcatttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaa 54150586  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  54150587 tcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattcttgccaccgccataccaaacaca 54150652  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 15603317 - 15603486
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15603317 aaatcaattttgacttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaagcaagtatatctaaacacaaatcaattcacatcaaactcactt 15603416  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  15603417 tttaccataatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgtcaaaccaaacaca 15603486  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19592360 - 19592191
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||| || ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19592360 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacgtcaattcgtaagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcactt 19592261  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||||    
T  19592260 ttaaccaaaatcaattctctaaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccatatcaaacaca 19592191  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32238187 - 32238019
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  32238187 aaatcagttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttctaatatagtgtatccaaacataac-caattcacattcaactcactt 32238089  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  32238088 ttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacaca 32238019  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 28986978 - 28987144
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||  ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  28986978 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcactt--aagtgagtgtattcaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 28987074  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  28987075 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacaca 28987144  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42945027 - 42944861
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42945027 aaatcaattttgatacatactatccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaagtaagtatatctaaacataaatcaattcacattcaactcactt 42944928  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaac 167  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||    
T  42944927 ttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaataaattcttgccaccgccgtaccaaac 42944861  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 9893668 - 9893837
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  9893668 aaatcaattttaatttaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttcaagtgggtgtatccaaacatatatcaattcatatctaactcactt 9893767  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  9893768 ttgacaaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9893837  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 48550174 - 48550343
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48550174 aaatcaattttaatccaatctatccaaacaatatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcactt 48550273  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  48550274 ttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 48550343  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 49136479 - 49136624
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49136479 aaatcaattttgattaaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 49136578  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||| || || ||||||||    
T  49136579 ttaaccataatcaattctctcaaactcaattataccagaatcaatt 49136624  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 49519687 - 49519832
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  | | ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49519687 aaatcaattttaatacatactatccaaacaatatcaattcataagaatcatttttaagcaagtgtatccaaacataaataaattcacatccaactcactt 49519786  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  49519787 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaaccaatt 49519832  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14564275 - 14564130
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaag-gaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 99  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14564275 aaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaag-gtatccaaacataaatcaattcatatccaactcaca 14564177  T
Q  100 tttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14564176 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 14564130  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9889463 - 9889295
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  9889463 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatccaaacatata-caattcatatctaactcactt 9889365  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  9889364 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9889295  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 14072460 - 14072628
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  14072460 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcattagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaatttaccttcaactcactt 14072558  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  14072559 ttaaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 14072628  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29149436 - 29149291
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29149436 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 29149337  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29149336 tttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 29149291  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 30842089 - 30842257
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  30842089 aaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 30842187  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  30842188 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccataccaaacaca 30842257  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 54153002 - 54153170
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54153002 aaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcatgagaatcacttctagtaaagtgtattcaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 54153100  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  54153101 ttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattatattaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacaca 54153170  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26426242 - 26426075
Alignment:
Q  2 aatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttt 101  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  26426242 aatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataa-tcaatttatatctaactcacttt 26426144  T
Q  102 taaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  26426143 taaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgtcataccaaacaca 26426075  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13183179 - 13183010
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||    
T  13183179 aaatcaattttgatttaaattatccaaaaaacatcaacttataaaaatcatttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcaccttaaacttgctt 13183080  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  13183079 ttaaccaaaatcaattatctcagactcaattttatcaaaatcaattatcgtcaccgtcataccaaacaca 13183010  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 25312692 - 25312817
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25312692 tatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaatcaaaatcaattctct 25312791  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  25312792 caaactcaattctatcaaaatcaatt 25312817  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48407826 - 48407682
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Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  48407826 aaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 48407728  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  48407727 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 48407682  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 48550556 - 48550440
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Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48550556 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtttatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 48550457  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  48550456 ttaaccaaaatcaattc 48550440  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 6505158 - 6505303
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Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6505158 aaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatctaaacataaatcaattcacatcaaactcattt 6505257  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  6505258 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaagtcaatt 6505303  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Original strand, 39187715 - 39187860
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Q  25 caaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaa 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||    
T  39187715 caaacaacatcaactaacaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaaattacttttaaccaaaatcaattctctcaaa 39187814  T
Q  125 ctcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||    
T  39187815 ctcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaacaca 39187860  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54735777 - 54735635
Alignment:
Q  3 atcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactttt 102  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||    
T  54735777 atcaattttgatttaaaatactcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacataaaccaatttacatcaaactca-attt 54735679  T
Q  103 aaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  54735678 aaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 54735635  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4954160 - 4954050
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4954160 tatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctct 4954061  T
Q  121 taaactcaatt 131  Q
     ||| ||||||    
T  4954060 caaaatcaatt 4954050  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 13167502 - 13167651
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13167502 tatccaaacatcattaatacataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaatataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctct 13167601  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||  | || | |||||||||||||    
T  13167602 caaactcaattatatcaaaatcaatttttcctaccgccataccaaacaca 13167651  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 48908232 - 48908399
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  48908232 aaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatcaacttatatgaattacttttaagcgag-gtatccaaacataac-caattcacatcaaactcactt 48908329  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  48908330 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaataatattaaaatcaattttcaccgccgccaaaccaaacaca 48908399  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Original strand, 14075977 - 14076116
Alignment:
Q  6 aattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaac 105  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14075977 aattttgatttaaagtactcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacataaatcaatttacatcaaactcac-tttaac 14076075  T
Q  106 caaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  14076076 caaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 14076116  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Original strand, 46926010 - 46926174
Alignment:
Q  6 aattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaac 105  Q
    |||||||||  |||||||  ||| || || || |||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46926010 aattttgattcaaaatatataaataaaattaattcataaaaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaac 46926109  T
Q  106 caaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||    
T  46926110 caaaaacaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccgtcgtacgaaacaca 46926174  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 170
Target Start/End: Original strand, 41866176 - 41866280
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  41866176 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaactcaattccctcaaactcaattttatcaaaatcaattatcgccaccgccaaaccaa 41866275  T
Q  166 acaca 170  Q
    |||||    
T  41866276 acaca 41866280  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2175276 - 2175161
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2175276 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcgagtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 2175177  T
Q  101 ttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||| |||||||||||    
T  2175176 ttaatcaaaatcaatt 2175161  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 14054808 - 14054977
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||   || ||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14054808 aaatcaattttaatttaaagtattcaaacaacatcaacttgaaataatcacttttatataagtttatccaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 14054907  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || || ||| |||||||  | |||||||||| | ||||||||||||  || ||||| | |||||||||||    
T  14054908 ttgactaaactcaattctttcaaactcaattatgtcaaaatcaattcccgtcactgccgtaccaaacaca 14054977  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 55638834 - 55638733
Alignment:
Q  51 cttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55638834 cttttaaataagtgtatctaaacataaatcaatttacatttaactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcg 55638735  T
Q  151 cc 152  Q
    ||    
T  55638734 cc 55638733  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 15619579 - 15619703
Alignment:
Q  7 attttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaacc 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| |||| ||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15619579 attttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttata--gtaatgtatccaaacatacatcaattcacatccaactcactttttacc 15619676  T
Q  107 aaaatcaattcacttaaactcaattct 133  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  15619677 aaaatcaattctctcaaactcaattct 15619703  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31520499 - 31520331
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31520499 aaatcaatttttattcaaactacccaaaaaacatcaactcataaaaatcacttttaat-aagcatatctaaacataaatccattcacacccaactcactt 31520401  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||  |||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||    
T  31520400 ttaaccaaaattaattctttcaaacttcattctaccaaaatcaattctcgccatcgctataccaaacaca 31520331  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Original strand, 38263881 - 38264004
Alignment:
Q  25 caaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaa 124  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||  || |||    
T  38263881 caaacaacat-aactcataagtatcacttttaagtgagtatattcaaacataaattaattcacatcaaactcaattttaagcaaaattaattttctcaaa 38263979  T
Q  125 ctcaattctatcaaaatcaattttc 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  38263980 ctcaattatatcaaaatcaattttc 38264004  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 56241964 - 56241848
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  56241964 aaatcaattttgatttaaatcatctaaacattatcaactcataagaatcacttttacattaatgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcactt 56241865  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  56241864 ttaatcaaaatcaattc 56241848  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19599601 - 19599487
Alignment:
Q  24 ccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaa 123  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||    
T  19599601 ccaaacaacataaattgataagaatcaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttattcaaaatcaattctctcaa 19599503  T
Q  124 actcaattctatcaaa 139  Q
    ||||||||||||||||    
T  19599502 actcaattctatcaaa 19599487  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 140
Target Start/End: Original strand, 33574203 - 33574274
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  33574203 caaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaa 33574274  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 38305968 - 38306113
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||| || | |||||||| ||||||     |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38305968 aaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcgcattcaactcactt 38306067  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  38306068 ttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 38306113  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 38694005 - 38694150
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  38694005 aaattaattttgatttaaattattcaagcaagatcaacccataagaatcacttttaagcgagtgtatccaaacataaactaatttgcactcaacttactt 38694104  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  38694105 ttagacaaaatcaattcttttaaactcaatcatatcaaaattaatt 38694150  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 54488625 - 54488707
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  54488625 gtattcaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 54488707  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26403053 - 26402960
Alignment:
Q  17 aaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaa 110  Q
    ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||    
T  26403053 aaaatatacaaacaaaattaattcataagaattacttttaaagaaatggattcaaacataaatcaattcatatctaaatcacttctaatcaaaa 26402960  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30887282 - 30887167
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |    
T  30887282 aaatcaattttgatacaaaccatccaaacatcattaactcataagaatcacttttatattggtgtatccaaacataaatcaatt-tcatcaaactcacgt 30887184  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  30887183 ttaactaaaataaattc 30887167  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28947811 - 28947733
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt-cacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  28947811 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattccacttaaa-tcaattccaccaaaatcaatt 28947733  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 53531996 - 53532079
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||    
T  53531996 tgtagccaaacataaaccacgttacatccaactcacttttaactaaaatcaattatgtcaaactcaattttatcaaaatcaatt 53532079  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4649967 - 4649913
Alignment:
Q  92 aactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4649967 aactcgcttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattttatcaaaatcaatt 4649913  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Original strand, 33843803 - 33843869
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaatt 131  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  33843803 tatccaaacataaatcactttacatccaactcacttttagccagaatcaattcaatcaaaatcaatt 33843869  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45780095 - 45779994
Alignment:
Q  44 agaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatca 143  Q
    ||||| |||||||||  | |||||| ||||| |||| |||||| | | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  45780095 agaatcacttttaagtgaatgtatctaaacaaaaattaattcataccaaactcactttttaccaaaatcaatt-tctcaaactcaattctatcgaaatca 45779997  T
Q  144 att 146  Q
    |||    
T  45779996 att 45779994  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 133
Target Start/End: Original strand, 53914918 - 53914987
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattct 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  53914918 tgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttagtcaaaatcgattctctgaaactcaattct 53914987  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 149
Target Start/End: Original strand, 523166 - 523255
Alignment:
Q  60 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||   | || |||||||  ||||||||||||||||    
T  523166 aagtgaatccaaacataaatcaattcatattgaactcactttttcccaaaatcaattttgtcaagctcaattaaatcaaaatcaattttc 523255  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Original strand, 16492946 - 16492999
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  16492946 tgtatccaaacataaataaattcacattcaactcacttttaatcaaactcaatt 16492999  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 22699762 - 22699815
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22699762 gtatccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattc 22699815  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22980768 - 22980715
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22980768 gtatccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattc 22980715  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22994355 - 22994302
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22994355 gtatccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattc 22994302  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22694656 - 22694581
Alignment:
Q  71 aacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22694656 aacataaatcactttatgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctacttaaa-tcaattctaccaaaatcaatt 22694581  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54487287 - 54487219
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaatt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||  | ||||||||||    
T  54487287 tgtatccaaacataaatcaatttacattcaactcacttttgatcgaaatcaattctatcaaactcaatt 54487219  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Original strand, 54655266 - 54655358
Alignment:
Q  78 atcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||    
T  54655266 atcaattcacatcaaacacacttttgactaaaatcaattattttaaactcaattatgtcaaaatcaattatcgtcaccgccgtaccaaacaca 54655358  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 116
Target Start/End: Original strand, 36150625 - 36150676
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36150625 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaatt 36150676  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 38740369 - 38740316
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38740369 tgtatccaaacataaatcacttcaacttcaactcacttttatccaaaatcaatt 38740316  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Original strand, 39993574 - 39993663
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||  | ||| |||||||| | |  |||||||||| ||||    
T  39993574 tatctaaacataaatcaattcacatttaactcatttttaatcaaaatcaattctatgaaaatcaattctcttatgatcaattttctccac 39993663  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Original strand, 8754177 - 8754217
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8754177 tgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttaa 8754217  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 117
Target Start/End: Original strand, 46958047 - 46958096
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||| | || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46958047 ccaaacataaattactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattc 46958096  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 48908096 - 48908129
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacat 34  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48908096 aaatcaattttgatgtaaattatccaaacaacat 48908129  T

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Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Original strand, 28752537 - 28752588
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattca 118  Q
    ||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28752537 atccaaacataaatcaaattatgt-caactcacttttaaccaaaatcaattca 28752588  T

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Target: chr3 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 3348215 - 3348368
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3348215 aaatcaattttgatataaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaatttacatccaactcactt 3348314  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3348315 ctaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccac 3348368  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10334110 - 10334279
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  10334110 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcatattcaactgactt 10334209  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||    
T  10334210 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccatatcaaacaca 10334279  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10853396 - 10853227
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  10853396 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaatttatattaaactcactt 10853297  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  10853296 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgctataccaaacaca 10853227  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38172436 - 38172267
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38172436 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcccactcactt 38172337  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||| | || ||||||||||    
T  38172336 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 38172267  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 50664731 - 50664899
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50664731 aaatcaattttaatttaaactatctaaacaacat-aactcttaagaatcacttctaagtgtgtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 50664829  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  50664830 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 50664899  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 53074875 - 53075022
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  53074875 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 53074973  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttc 149  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  53074974 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttc 53075022  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15511504 - 15511336
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15511504 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaat-aagcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactcactt 15511406  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  15511405 ttaaccaaaatcaattctttcaaactccgttctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacaca 15511336  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 42318302 - 42318470
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  42318302 aaatcaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 42318400  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||    
T  42318401 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgtcaccgctataccaaacaca 42318470  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52966938 - 52966785
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52966938 aaatcaattttgattcaacctatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaagtcactt 52966839  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52966838 ttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccac 52966785  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8424858 - 8424714
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Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  8424858 aaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaacataa-tcaattcacgttcaactcactt 8424760  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  8424759 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaattcaatt 8424714  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 20813118 - 20813286
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20813118 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttgaataagtatatccaaacaaaaatcaattcaaatccaactcactt 20813217  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  20813218 ttaaccaaacacaattctctcaaactc-attctatcaaaatcaattctctccaccgatataccaaacaca 20813286  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 26519636 - 26519805
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26519636 aaatcaattttgtttcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 26519735  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  26519736 tttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacaca 26519805  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 53179821 - 53179958
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  53179821 aaatcaattttgatttaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcactt 53179919  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaa 139  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  53179920 ttaaccaaaatcaattatataaaactcaattctatcaaa 53179958  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 35425306 - 35425450
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35425306 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 35425404  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35425405 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 35425450  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38125570 - 38125402
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||    
T  38125570 aaattaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaacccactt 38125472  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  38125471 ttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccataccaaacaca 38125402  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 38340778 - 38340946
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38340778 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaacgtcaacttataaaaattacttttaat-aagcatatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 38340876  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||||    
T  38340877 ttaaccaaaatcaattctttcaaacttcattctatcaaaatcaattctcaccaacgccataccaaacaca 38340946  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 44224734 - 44224867
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44224734 aaatcaattttgactaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcactt 44224833  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattcta 134  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  44224834 ttaaccataatcaattatctcaaactcaattcta 44224867  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44939543 - 44939376
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  44939543 aaattaattttgattaaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttata-gtaaatgtatccaaacataa-tcaattcatattcaactcactt 44939446  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  44939445 ttaatcaaaatcaattcactcaaattcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacaca 44939376  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48189570 - 48189402
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  48189570 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacataa-tcaatttacattcaactcactt 48189472  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  48189471 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccctaccaaacaca 48189402  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 23496296 - 23496434
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23496296 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccgcaagaatcactttta-------gtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 23496388  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23496389 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 23496434  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 152
Target Start/End: Original strand, 21224963 - 21225113
Alignment:
Q  2 aatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttt 101  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21224963 aatcaattttgattcaaactatcaaaacgacatcaactcgtaagaatcgcttttaagaaagtgtatccaaacatatatcaatttacatcaaactcacttt 21225062  T
Q  102 taaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgcc 152  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  21225063 taaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatagagatcaattctcgcc 21225113  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 4984569 - 4984722
Alignment:
Q  17 aaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||| ||||||| || ||  ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4984569 aaaatatacaaacaaaattaatgcataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaatcaatt 4984668  T
Q  117 cacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
      || ||| |||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  4984669 ttctcaaattcaattatatcaaaatcaattctccccaccgccataccaaacaca 4984722  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16246223 - 16246056
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||   |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16246223 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcctaagaatcacttctattaaagtgtttccaaacataaatcaatttacatctaactcactt 16246124  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||| |||| || | || ||||||||||    
T  16246123 ttaactaaaatcaatt--ctcaaactcaattctattaatatcaattctcgctaccgccaaaccaaacaca 16246056  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 35930710 - 35930876
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35930710 aaatcaattttgatttaaaccatccaaacattatcaactcataagaatgacttatacattagtgtatccaagcataaatcaattcatatcaaactcactt 35930809  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaac 167  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||    
T  35930810 ttaataaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgatataccaaac 35930876  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 42475701 - 42475847
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  42475701 tatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtattcaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaatcaaaatcaattctct 42475800  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaac 167  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | || |||||||    
T  42475801 caaactcaattctataaaaatcaattctcgtcaccgccaaaccaaac 42475847  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30811660 - 30811492
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30811660 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaagtcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 30811562  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||    
T  30811561 ttaatcaaaatcaattctctcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccgccctaccaaacaca 30811492  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 55154534 - 55154642
Alignment:
Q  61 agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcat 160  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  55154534 agtgtatctaaacataa-tcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccactgccat 55154632  T
Q  161 accaaacaca 170  Q
    ||||||||||    
T  55154633 accaaacaca 55154642  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23207172 - 23207044
Alignment:
Q  25 caaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||    
T  23207172 caaacaacatcaactcataa-aatcacttgtaaaaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattataacaaa 23207074  T
Q  125 ctcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23207073 atcaattatatcaaaatcaattttcgccac 23207044  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 31084180 - 31084295
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31084180 aaatcaattatgattcaaactatccaaataatatcaagtcataagaatcacttttaag-aagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 31084278  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31084279 ttaatcaaaatcaattc 31084295  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40415401 - 40415280
Alignment:
Q  25 caaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaa 124  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||   || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  40415401 caaacaaaatcaacttataagaattatctttaagtgggtatatccaaacataaattaatttacatccaactcacttttaactaaaatcgattcctttaaa 40415302  T
Q  125 ctcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40415301 ctcaattctatcaaaatcaatt 40415280  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 150
Target Start/End: Original strand, 19877448 - 19877538
Alignment:
Q  60 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19877448 aagtatatctaaacataaatcaatttacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaataaattttcg 19877538  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 156
Target Start/End: Original strand, 34561142 - 34561235
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34561142 tgtatccaaacataaatcaattcgcattcaactcacttttaaccaaaatcaattttatcaaacttaattctatcaaaatcaattttctccactg 34561235  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 30810069 - 30809959
Alignment:
Q  6 aattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaac 105  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30810069 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaatttataagaatcacttttaagtaagcgtaatcaatcataaatcaattcacatttaactcacttttaac 30809970  T
Q  106 caaaatcaatt 116  Q
    |||| ||||||    
T  30809969 caaactcaatt 30809959  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31619016 - 31618930
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcac 87  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31619016 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctaagtgagagtatccaaacataaatcaattcac 31618930  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 25848024 - 25848136
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaag-gaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcac 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  25848024 tatccaaacaacacaaactcataagaatcatttttaagtgaag-gtatccaaacataaatcaattcatattaaactcactttttaccaaaattaattttc 25848122  T
Q  120 ttaaactcaattct 133  Q
    | ||||||||||||    
T  25848123 tcaaactcaattct 25848136  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 148
Target Start/End: Original strand, 52813278 - 52813334
Alignment:
Q  92 aactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52813278 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatttt 52813334  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 32357483 - 32357597
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| | |||||||||||||||| ||||| || |||| |    
T  32357483 aaatcaattttaattcaaagtacccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaaatgagtgttttcaaacataaatcaatttacatcaaattcac-t 32357581  T
Q  101 ttaaccaaaatcaatt 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  32357582 tcaaccaaaatcaatt 32357597  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 7012675 - 7012728
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7012675 gtatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 7012728  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29716783 - 29716674
Alignment:
Q  33 atcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattc 132  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||  ||  || || | | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||     
T  29716783 atcaattcataagaatcacttttaattaaacgtgtctataaataaatcaattcatatttaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattt 29716684  T
Q  133 tatcaaaatc 142  Q
    ||||||||||    
T  29716683 tatcaaaatc 29716674  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21023281 - 21023201
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcactta-aactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||    
T  21023281 gtatctaaacataaatcacttcaaattcaactcacatttaaccaaaatcaatt---ttacaaatcaattctatcaaaatcaatt 21023201  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 42644298 - 42644379
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||    |||| |||||||  ||||||||||||    
T  42644298 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaactaaaatcaatttttataaaatcaattcactcaaaatcaatt 42644379  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10852775 - 10852727
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10852775 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 10852727  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 154
Target Start/End: Original strand, 44225600 - 44225689
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  44225600 gtatccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaacgaaaatcaattctac--aaaatcaattatattaaaatcaattttctccac 44225689  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 49526736 - 49526653
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||  |||||| ||||||    
T  49526736 tgtatccaaacataaatcaatttacaatcaattcacttttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaatttcatcaaactcaatt 49526653  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 22737055 - 22737121
Alignment:
Q  70 aaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatc 136  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  22737055 aaacataaatcaatttacattctacttacttttaaccaaaatcaattttttcaaactcaattctatc 22737121  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 52931640 - 52931586
Alignment:
Q  62 gtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  52931640 gtgtatccaaacataaatcaatttacactaaactcacttttaactaaaatcaatt 52931586  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 117
Target Start/End: Original strand, 23918881 - 23918930
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23918881 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaattaattc 23918930  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 117
Target Start/End: Original strand, 30736172 - 30736212
Alignment:
Q  77 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30736172 aatcaattcacatacaactcacttttaactaaaatcaattc 30736212  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31618420 - 31618372
Alignment:
Q  122 aaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  31618420 aaactcaattctatcaaaatcaattcttcccaccgtcataccaaacaca 31618372  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14651224 - 14651086
Alignment:
Q  7 attttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaacc 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| | || |  ||| ||| |||| || | |||| |||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  14651224 attttgattcaaattatccaaacaacttgaattggtaaaaatcacttctatgtaagtatatcaaaacacaaatcaatt-atattcaactcacttttaatc 14651126  T
Q  107 aaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14651125 aaaatcaattctatcaaaatcaattttattaaaatcaatt 14651086  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 38626750 - 38626788
Alignment:
Q  67 tccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaac 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38626750 tccaaacataaatcatttcacattcaactcacttttaac 38626788  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 25181245 - 25181298
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25181245 gtatccaaacataaataattttacattaaactcacttttaatcaaaatcaattc 25181298  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 48089685 - 48089632
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  48089685 tgtatccaatcataaatcattttacattcaactcacttttaactagaatcaatt 48089632  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Original strand, 52836019 - 52836072
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  52836019 tgtatcccaatataaatcaattcacattcaacatacttttaactaaaatcaatt 52836072  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 53567967 - 53568051
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttc 149  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||    |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  53567967 gtatccaaacataaattacttttcattcaactcacttttaatcaaaatcaatt-ttgtaaaatcaattcactcaaaatcaattttc 53568051  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7899188 - 7899104
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    |||||||||||||||||  || |||| |||||  |||||||| |||||||||||| |  || |||||||  ||| ||||||||||    
T  7899188 gtatccaaacataaatcgttttacattcaactatcttttaactaaaatcaattcattccaaatcaattcagtcagaatcaatttt 7899104  T

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Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3622576 - 3622407
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3622576 aaatcaattttgatttatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 3622477  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  3622476 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataacaaacaca 3622407  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 37562563 - 37562732
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37562563 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 37562662  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||    
T  37562663 ttaacaaaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 37562732  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 48459703 - 48459872
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48459703 aaatcaattttaatacatactatccaaacaacatccattcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 48459802  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  48459803 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaacgtcataccaaacaca 48459872  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44967515 - 44967349
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44967515 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtattcaaacataaatcaattcacattcaactcactt 44967416  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaac 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  44967415 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgctaccgtcataccaaac 44967349  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39391253 - 39391084
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  39391253 aaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttgtaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcactt 39391154  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39391153 ttaaccaaaatcaattctaaaaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccaccgccataccaaacaca 39391084  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 3342783 - 3342952
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3342783 aaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcatatccaactcactt 3342882  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||| | || ||||||||||    
T  3342883 ttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctccccaccgccaaaccaaacaca 3342952  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 38230061 - 38230206
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38230061 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 38230160  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38230161 ttaaccaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaatt 38230206  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 41715650 - 41715819
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Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41715650 aaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcactt 41715749  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  41715750 ttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 41715819  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 32186933 - 32187100
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32186933 aaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcactt 32187032  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32187033 ttaatcaaaatcaattctcttaaaattaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaaca 32187100  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 3375483 - 3375628
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Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  3375483 aaatcaattttgatccaaatcatccaaacaacatcgactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacacaaatcaattcacaccaaactcactt 3375582  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3375583 ttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 3375628  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10372074 - 10371905
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10372074 aaatcaattttgattcaaactatccgaacaacatcaacccacaagaatcacttctaataaactgtaaccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 10371975  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||    
T  10371974 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgttttaccaaacaca 10371905  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 37639423 - 37639592
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37639423 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataaagtttctccaaacataaatcaattcacattcaattcactt 37639522  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  37639523 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacaca 37639592  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43631810 - 43631643
Alignment:
Q  2 aatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttt 101  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  43631810 aatcaattttgattcaatatatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcatatccaaacataa-tcaattcatatctaactcacttt 43631712  T
Q  102 taaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  43631711 taaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccgccataccaaacaca 43631643  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 47217657 - 47217509
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47217657 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcgagtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 47217558  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttc 149  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47217557 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttc 47217509  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 47021912 - 47022081
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||| || | ||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  47021912 aaatcaattttcattcaaattatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacatctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcactttcaacttactt 47022011  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  47022012 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccatcataccaaacaca 47022081  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 3750679 - 3750820
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3750679 aaattaattttgatttaaactatccaaacaacatcaattcataagattcaattatattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 3750778  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatc 142  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  3750779 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttattaaaatc 3750820  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 9456098 - 9456242
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  9456098 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaagatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacat-aatcaatttacctcaaactcactt 9456196  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  9456197 ttaaccaaaatcaattctctcgaacttaattctatcaaaatcaatt 9456242  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 34010333 - 34010485
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  34010333 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaaccacttttaaatgagtgtattcaaacataa-tcagttcatatccaactcactt 34010431  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34010432 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccac 34010485  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34366097 - 34365929
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34366097 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaat-aagcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactaactt 34365999  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  34365998 ttaactaaaatcaattctttcaaactccattatatcaaaatcaattctagccaccgccataccaaacaca 34365929  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 48134573 - 48134741
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||    
T  48134573 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttataaaaatcacttttaaacaagtttatccaaacataa-tcaattctcctcaaacccactt 48134671  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  48134672 ttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattttcgcaaccgccataccaaacaca 48134741  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Original strand, 42904551 - 42904715
Alignment:
Q  6 aattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaac 105  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  42904551 aattttgatttaaaatatacaaacaaaattaattcataagaatcacttttaaacgagtgtatcaaaacataaatcaattcacatctaactcatttttatc 42904650  T
Q  106 caaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||    
T  42904651 caaaaacaattctctcaaactcaattctatcaaaattcatttttcccactgccataccaaacaca 42904715  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43738055 - 43737910
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  43738055 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacaaaaatcaattcatatctaactaactt 43737956  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||    
T  43737955 ttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattatgttaaaatcaatt 43737910  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37008446 - 37008300
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||       
T  37008446 tatccaaacaacatcaactcataagaatcacttataagaaagtgtctccaaacataaatcaa-tcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattccaa 37008348  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  37008347 caaaatcaattctataaaaatcagttttcgccaccg--ataccaaacaca 37008300  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 386596 - 386428
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  386596 aaatcaattttgattcaatctatccaaacaacatcaa-tcataagaatcacttttcggttagtatatccaaacataaatcaattcacattcagctaactt 386498  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||    
T  386497 ttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaacaca 386428  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12632199 - 12632054
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12632199 aaatcaattttgattcaaacaattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagcgagtacactcaaacataaatcaattcacatctaactcactt 12632100  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  12632099 ttaaccaaaatctattctctcaaacaaaattctatcaaaatcaatt 12632054  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 42740385 - 42740521
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  42740385 aaatcaattttgatacatactatccaaacaatatcaacacataagaatcacttttaagtaagtatatctaaacataaatcaattaacattcaacttactt 42740484  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatca 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  42740485 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatca 42740521  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34011078 - 34010908
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatcc-aaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcaca-tccaactcac 98  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  34011078 aaatcaattttgatttaaagtaccccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgaatgtttccaaacataaattaatttacactcaaactcac 34010979  T
Q  99 ttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||    
T  34010978 ttt-aaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcaccgctgccaaaccaaacaca 34010908  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 39977545 - 39977714
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||   || ||| |||||||    ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39977545 aaatcaattttaatttaaagtatccaaacaacatcaacttgaaataataacttttatatgagtttatccaaaaataaatcaattcatatcaaactcactt 39977644  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  39977645 ttgactaaaatcaattctttcaaactaaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacaca 39977714  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24771026 - 24770861
Alignment:
Q  2 aatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttt 101  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||     || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24771026 aatcaattttgacaaaaattatccaaacaacataaattgataaaaatcacttttagttttgtatatctaaatataaatcaatttacatccaactcacttt 24770927  T
Q  102 taaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaac 167  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  24770926 taaccaaaatcaattatctcaaacttaattctatcaaaattaattctcgtcaccgtcataccaaac 24770861  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Original strand, 46541661 - 46541762
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||    
T  46541661 caaacataaaccaattcacattcaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaaca 46541760  T
Q  169 ca 170  Q
    ||    
T  46541761 ca 46541762  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 32205943 - 32206034
Alignment:
Q  25 caaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  32205943 caaacaacat-aactcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaacccacttttaattaaaatcaattc 32206034  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36920293 - 36920149
Alignment:
Q  2 aatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttt 101  Q
    |||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||| |||||| || |||||  ||  |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  36920293 aatcaattttgattcaatgtacccaaacaacatcaactcaaaagaatcacctttaattaaacgtattcaaacataaatcaatttatatctaactcacttt 36920194  T
Q  102 taaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  36920193 taaccaaaatcaattctttcaaactcaattttatcaaaattaatt 36920149  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42752307 - 42752162
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||| ||||     |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42752307 aaatcaattttgatctaagttatccaaacaacatgaatttataagaattatttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 42752208  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  42752207 ttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 42752162  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 12964659 - 12964740
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12964659 caaacataaatcaatctacattcaactcacttataacgaaaatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 12964740  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39634217 - 39634136
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| || |||||||||    
T  39634217 tatccaaacataaatcaattcatattcaactcacttttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtccaaatcaatt 39634136  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40903283 - 40903115
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||    | | |||||||||||||| ||||| |  || |||||||||    
T  40903283 aaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttc-aactcactt 40903185  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||  ||||||||||||  | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  40903184 ttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaattttcgccactggaaaaccaaacaca 40903115  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Original strand, 20088929 - 20089007
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt-cacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20088929 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattatacttaaa-tcaattctatcaaaatcaatt 20089007  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12212490 - 12212440
Alignment:
Q  96 cacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12212490 cacttctaaccaaaatcaattcactcaagctcaattctatcaaaatcaatt 12212440  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 38494276 - 38494326
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattca 118  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38494276 ccaaacataaaccacttcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattca 38494326  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Original strand, 19097474 - 19097559
Alignment:
Q  85 cacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| || || | | |||||||||||||    
T  19097474 cacatctagctcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccgccgccataccaaacaca 19097559  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 1766418 - 1766550
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| |  |  ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||    
T  1766418 aaatcaattttaattcaaattattcaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaatataaatcaatttaggttcaactcactt 1766517  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattct 133  Q
    |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  1766518 ttaatcaaaatcaatttaatcaaaatcaattct 1766550  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 19095930 - 19096005
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataa 77  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||    
T  19095930 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaacat-aactcataagaatcatttttaaacgagtgtatccaaacataa 19096005  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 4228603 - 4228684
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| | |||||||||||    
T  4228603 gtatccaaacataaatcacttttcattcaactcacttttaatcaaaatcaatt-atgtaaaatcaattcaaccaaaatcaatt 4228684  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 117
Target Start/End: Original strand, 16079460 - 16079511
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16079460 atccaaacataaatcacttttcattcaactcactttaaaccaaaatcaattc 16079511  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 29829364 - 29829309
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattca 118  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  29829364 tgtatccaaacataaatcactttacattcaactcatttttagccagaatcaattca 29829309  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 33746402 - 33746497
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||| || || | |||||||| ||  |||||  | |||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  33746402 tatccaaacaaaatgaatttataagaatcacggttaagttaatgtaaccaaacaaaaatcaatttatattcaactcacttttaatcaaaatcaatt 33746497  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 47301673 - 47301626
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaat 48  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47301673 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaat 47301626  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47301626 - 47301572
Alignment:
Q  116 tcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  47301626 tcactgaaactcaattatatcaaaattaattctagccactgccataccaaacaca 47301572  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15311270 - 15311217
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  15311270 tgtatccaaacataaatcactatacattcaactcacttttaaccatattcaatt 15311217  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33853479 - 33853411
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaatt 131  Q
    ||||||||||||||||||| || |  | ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  33853479 tgtatccaaacataaatcactttagcttcaactcactcttagccagaatcaattcactaaaaatcaatt 33853411  T

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Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7472800 - 7472632
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7472800 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataa-tcaattcacatcaaactcactt 7472702  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7472701 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacaca 7472632  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9988628 - 9988459
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9988628 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 9988529  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||    
T  9988528 ttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 9988459  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1945166 - 1944997
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1945166 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 1945067  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  1945066 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacaca 1944997  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 14821144 - 14821312
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  14821144 aaatcaattttgattcaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattaaactcactt 14821242  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||    
T  14821243 ttaactaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaattaattatcgtcaccgctataccaaacaca 14821312  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 36548181 - 36548349
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36548181 aaatcaattttaatttaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtgagagtatccaaacataaatcaattcacatcagactcactt 36548279  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  36548280 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacaca 36548349  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 2213487 - 2213656
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2213487 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 2213586  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  2213587 tttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacaca 2213656  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5916368 - 5916200
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5916368 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 5916270  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  5916269 ttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacaca 5916200  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26208056 - 26207887
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26208056 aaatcaattttgattcatataatccaaacaacatcaacttgtaagaatcaattttaattaagtgtatcaaaacataaatcaattcacatccaactgactt 26207957  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26207956 ttaaccaaaaccaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgtcataccaaacaca 26207887  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 36312258 - 36312426
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36312258 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 36312356  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  36312357 ttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacaca 36312426  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39141596 - 39141444
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39141596 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaattcatatccaactcactt 39141498  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39141497 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgccac 39141444  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44619168 - 44619036
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44619168 tatccaaacaacatcaactcataataatcatttttaaacaagtgtatccaaacataaatcaattcccctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctct 44619069  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgcca 153  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44619068 caaactcaattctatcaaaatcaattctcgcca 44619036  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 2213658 - 2213797
Alignment:
Q  31 acatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaat 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2213658 acatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaagacaaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaat 2213757  T
Q  131 tctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  2213758 tctatcaaaatcaattctctcatctgccataccaaacaca 2213797  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28127414 - 28127245
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28127414 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 28127315  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  28127314 tttagcaaaatcaattctctcaaactaaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacaca 28127245  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42089639 - 42089507
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatc----caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42089639 tatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatctatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaatt 42089540  T
Q  117 cacttaaactcaattctatcaaaatcaattttc 149  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42089539 ctcttgaacttaattctatcaaaatcaattttc 42089507  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2215235 - 2215378
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2215235 aaatcaattctaatttaaattatccaaacaacatcaactcaaaa--attatttttaaacaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcactt 2215332  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  2215333 ttaaccaaaatcaattctctcaagctcaattctatcaaaatcaatt 2215378  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 32501967 - 32502135
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  32501967 aaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattgaatgtatccaaacataa-tcaattcacctaaaactcactt 32502065  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  32502066 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcacgaccgccataccaaacaca 32502135  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 150
Target Start/End: Original strand, 31224690 - 31224810
Alignment:
Q  30 aacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  31224690 aacatcaactcataagaatcacttttagtaaaatatatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattctttcaaactcaa 31224789  T
Q  130 ttctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31224790 ttctatcaaaatcaattttcg 31224810  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 7296136 - 7296281
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7296136 aaatcaattttgacttaaactatccaaataacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcattt 7296235  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  7296236 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaagtcaatt 7296281  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 8170294 - 8170462
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |    | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  8170294 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacatctgttaacgtgtatccaaacataa-tcaatttacattcaactcactt 8170392  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||    
T  8170393 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcgccaccgccctaccaaacaca 8170462  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 28261275 - 28261420
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28261275 aaattaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctatgtgagagtatccaaatataaatcaattcacatccaactcactt 28261374  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  28261375 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattgtattaaaattaatt 28261420  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31562811 - 31562646
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||   |||||  |||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  31562811 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaatataaactcataagaatcacttttaaacgagtgt--ccaaacataa-tcaattcacctcaaattcactt 31562715  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacac 169  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  31562714 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccaccataccaaacac 31562646  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42516102 - 42515936
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |   ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42516102 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcattttttaatgagtatattcaaacataa-tcaattcacatcaaactcactt 42516004  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  42516003 ttaactaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttctccaccgccataccaaaca 42515936  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30007618 - 30007511
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcatac 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||    
T  30007618 tgtaaccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagccatac 30007519  T
Q  163 caaacaca 170  Q
    || |||||    
T  30007518 catacaca 30007511  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7295473 - 7295330
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||    
T  7295473 aaatcaagtttgacttaaactatccaaacaacatcaactcatgataatcacttttat--atgtgtatccaaacataaatcaatttacgtcaaactcattt 7295376  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  7295375 ttaaccagaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 7295330  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 23358239 - 23358407
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||  || |||||||||    
T  23358239 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacattaactcatcacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaactatttcatctcaaactcactt 23358338  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||    |||||||||||||    
T  23358339 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctat-taaatcaattctcgccaacaccataccaaacaca 23358407  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 28641623 - 28641770
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaag-gaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 99  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28641623 aaatcaattttaattcaacatatccaaacaacatcaacttataataatcacttttaaatgaagt-tacccaaatataaatcaattcacatccaactcaca 28641721  T
Q  100 tttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| || ||||||||||||    
T  28641722 tttaaccaaaatcaattctctcagaatcaattcaattaaaatcaatttt 28641770  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45714766 - 45714650
Alignment:
Q  30 aacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaa 129  Q
    |||||||| |||| | ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  45714766 aacatcaaatcatgataatcatttttaacggagtgtatccaaacataaatcaattcacatcgaactcatttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaa 45714667  T
Q  130 ttctatcaaaatcaatt 146  Q
    || ||||||||||||||    
T  45714666 ttatatcaaaatcaatt 45714650  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34433371 - 34433288
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  34433371 tgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctgtcaaactcaattctatcaaaatcaatt 34433288  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41580822 - 41580692
Alignment:
Q  16 taaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaat 115  Q
    |||||||||||||||||   || |||||||||| | ||||    | |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41580822 taaaatatccaaacaactataattcataagaatcatttttgtacatgtgtatccaaacataaattaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaat 41580723  T
Q  116 tcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  41580722 tctctcaaactcaattcgatcaaaatcaatt 41580692  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 16467067 - 16467212
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    |   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16467067 aaattaattttgatctaaactatccaaactacatcaacccataagaatcacttttacattatcatatccaaacataaatcaatttacatctaactcactt 16467166  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  16467167 ttaaccaaaatcaattatgccaaaatcaattctatcaaaatcaatt 16467212  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25748004 - 25747864
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||||| || | |||||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25748004 caattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttaa 25747906  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  25747905 tcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 25747864  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 27911387 - 27911503
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||   || ||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27911387 aaatcaattttaatttaaagtatccaaataacatcaacttgaaataatcacttttaaatgagtatatccaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 27911486  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||| |||||||    
T  27911487 ttaaccaaactcaattc 27911503  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38600511 - 38600425
Alignment:
Q  60 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  38600511 aagtgtattcaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattcgatcaaaattaatt 38600425  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 18511083 - 18511228
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| | |||||      |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  18511083 aaatcaattttgatttaaattatccaaacaacatcactttataagaatcatttttacattgatgtatccaaacataaatcaattaacatttaaatcactt 18511182  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||   | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  18511183 ttaaccaaaatcaattatatcaaaatcaattttatcaaaatcaatt 18511228  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 43436408 - 43436292
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  43436408 aaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatcaaaacataaatcaatttacatctaattcactt 43436309  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  43436308 ttaatcaaaatcaattc 43436292  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 3853885 - 3854031
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattactttta-aggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactttta 103  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||  | | |||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3853885 caattttgattcaaactatccaaacaacatagattgataagaatcaattttacatgaa-tgtatccaaacataaatcaatttacattcaactcactttta 3853983  T
Q  104 accaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgc 151  Q
    | ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  3853984 atcaaaatcaattctatcaaaatcaattccatcaaactcaattctcgc 3854031  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 148
Target Start/End: Original strand, 8041283 - 8041406
Alignment:
Q  24 ccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaa 123  Q
    ||||||||||| || | |||| ||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||| || ||    
T  8041283 ccaaacaacataaattgataaaaataaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaattcacttttattcaaaatcaattctctcaa 8041381  T
Q  124 actcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    
T  8041382 actcaattctatcaaacacaatttt 8041406  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23267400 - 23267346
Alignment:
Q  92 aactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23267400 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 23267346  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34997295 - 34997194
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||| || | | || ||||||||    
T  34997295 caaacataaatcaattcacatccaattcatttttaacaaaaatcaattttgtcaaactaaattttatcaaaatcaattttcaccgcagccaaaccaaaca 34997196  T
Q  169 ca 170  Q
    ||    
T  34997195 ca 34997194  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Original strand, 12110918 - 12111003
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12110918 gtatccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatttgac--aaaatcaattctatcaaaatcaattttcg 12111003  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25940368 - 25940264
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25940368 aaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacatcatctcataataatcacttctatacgagtgtattcaaatataaatcaattcacatcaaactcactt 25940269  T
Q  101 ttaac 105  Q
    |||||    
T  25940268 ttaac 25940264  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23359994 - 23359941
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23359994 gtatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 23359941  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43858274 - 43858194
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattca-catccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43858274 atccaaacataaatcaattattcatc-aactcacttttgcccaaaatcaattcaattaaaatcaattctatcaaaatcaatt 43858194  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18970394 - 18970248
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| || |||||||    |||| ||| |||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18970394 tatccaaactacttcaagtcataaggatcacttttatacgagtgcatcaaaacataagtcaatttacg-caaactcacttttaaccaaaatcaattatct 18970296  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||    
T  18970295 tc--ctcaattctatcaaaatcaatttccatcacagtcaaaccaaacaca 18970248  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30599968 - 30599915
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30599968 gtatccaaacacaaatcaattgacactcaactcacttttaaccaaaatcaattc 30599915  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Original strand, 10918649 - 10918701
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattca 118  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10918649 atccaaacataaatcactttacattcaactcacttttatccaaaatcaattca 10918701  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 116
Target Start/End: Original strand, 23377548 - 23377600
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23377548 gtatccaaacataaatcaacttacattcaactcacttttaaccaaaattaatt 23377600  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 39106795 - 39106680
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||| | || || || |||| |||||||||  | ||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||    
T  39106795 aaatcaattttgattcaaattatctaaacaacttaaattcgta-gaatcacttttaagtgaatgtatccaaacattaaacaatttatatcaaactcactt 39106697  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    || ||||||||||||||    
T  39106696 tttaccaaaatcaattc 39106680  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3476424 - 3476356
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaatt 131  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3476424 tgtatctaaacatatatcacttcactttcagctcacttttatccagaatcaattcacttaaaatcaatt 3476356  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 11240714 - 11240796
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||    
T  11240714 tgtattcaaacataaatcaattcacattcaactcgcttttttcc-aaatcaattttgttaaacccaattaaatcaaaatcaatt 11240796  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26806319 - 26806266
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26806319 gtatccaaacataaatcacttttcactcaactcacttttaatcaaaatcaattc 26806266  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 1763264 - 1763345
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1763264 gtatctaaacataaatcactttaaattcaactcaattttaaccaaaatcaattttac--aaaatcaattttatcaaaatcaatt 1763345  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11759857 - 11759801
Alignment:
Q  60 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  11759857 aagtgtatacaaacacaaaccaatttaccttcaactcacttttaatcaaaatcaatt 11759801  T

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Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Original strand, 42597489 - 42597533
Alignment:
Q  126 tcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  42597489 tcaattctatcaaaattaattttcaccgttgtcataccaaacaca 42597533  T

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Target: chr8 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28425601 - 28425432
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28425601 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttgtaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcactt 28425502  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28425501 ttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccaccgtcataccaaacaca 28425432  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3097335 - 3097166
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3097335 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcactt 3097236  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||    
T  3097235 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccactgctataccaaacaca 3097166  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 3467513 - 3467682
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3467513 aaatcaattttgattcaaactatccaaccaacatcaattcataagaatcacttttaaataaatatatccaaacagaaatcaattcacattcaactcactt 3467612  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  3467613 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 3467682  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25698088 - 25697944
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25698088 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcactt 25697990  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25697989 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 25697944  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22936902 - 22936753
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22936902 tatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctct 22936803  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  22936802 caaacttaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 22936753  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6399237 - 6399092
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6399237 aaatcaattttgattaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgtatcgaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 6399138  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||    
T  6399137 ttaaccataatcaattctatcaaactcaattctaccagaatcaatt 6399092  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4941910 - 4941732
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4941910 aaatcaattttaattcaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcgcttttaaataattttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcactt 4941811  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacacaaatagtaat 179  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  4941810 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattatatcagaatcaattctagccaccgccataccaaacacacatagtaat 4941732  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 27649726 - 27649907
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  27649726 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatctaaacatat-tcaattcatatccaaatcactt 27649824  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacacaaatagtaatatag 183  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |  |||||||||| |||||| |||||    
T  27649825 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcccaaccaaacacacatagtactatag 27649907  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40742422 - 40742279
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40742422 aaatcaattttgatttaaaatatccaaacatcatcaactcataagaatcacttacatt--agtgtatccaaacataaatcaattcagatcaaactcactt 40742325  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40742324 ttaacgaaaatcaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaatt 40742279  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42143473 - 42143324
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  42143473 tatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaactaaaatcaattttct 42143374  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  42143373 caaactcaattatatcataatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 42143324  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 44926821 - 44926965
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  44926821 aaattaattttgattcaaactatccaaataacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 44926919  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  44926920 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 44926965  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41289187 - 41289036
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41289187 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacctataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacaatcaactcactt 41289088  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgcc 152  Q
    ||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41289087 ttaattaaaatcaattctctcaaactcaattctgtcaaaatcaattctcgcc 41289036  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36114169 - 36114001
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||| ||||    
T  36114169 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaatatcaactcataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataac-caatctacatcaaacttactt 36114071  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  36114070 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgtcataccaaacaca 36114001  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24897710 - 24897572
Alignment:
Q  7 attttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaacc 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24897710 attttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaaataaatgtatccaaacataattca-ttcatatccaactcacttttaacc 24897612  T
Q  107 aaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24897611 aaaatcaattctcataaactcaattttatcaaaatcaatt 24897572  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Original strand, 40742125 - 40742236
Alignment:
Q  22 atccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcactt 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40742125 atccaaacaatatcaactcataagaatcaattttattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctc 40742224  T
Q  122 aaactcaattct 133  Q
    ||||||||||||    
T  40742225 aaactcaattct 40742236  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 43550871 - 43550986
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43550871 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 43550970  T
Q  101 ttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  43550971 ttaaccaaaatcaatt 43550986  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 440298 - 440173
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  440298 tatccaaacaacgttaactcataagaatcatttttaactgaatgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacatttaaccaaaatcaattctct 440199  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  440198 cagactcaattctatcaaaatcaatt 440173  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33627163 - 33627018
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  33627163 aaatcgattttgattcaaactatccaaacaacattaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcttatccaactcagtt 33627064  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  33627063 ttaaataaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaatt 33627018  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Original strand, 26243129 - 26243249
Alignment:
Q  26 aaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaac 125  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26243129 aaacatcaccaactcataagaatcacttttaaacaattatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaac 26243228  T
Q  126 tcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26243229 tcaattctatcaaaatcaatt 26243249  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Original strand, 38114442 - 38114593
Alignment:
Q  18 aaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38114442 aaatattcaaacaacctcaactcataagaatcacttgaaaccgagtgtatccaaacataa-tcaattcacatccaacttacttttaaccaaaatcaattc 38114540  T
Q  118 acttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| || |||| | || ||||||||||    
T  38114541 tctcaaactcaattctatcaaaataaattctcaccaccgccaaaccaaacaca 38114593  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 8124951 - 8125095
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8124951 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacttcaactcctaagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaattcacatcaaactcactt 8125049  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     |||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||    
T  8125050 ctaaccaaaatcaattctctcaaactcgattcaaccaaaatcaatt 8125095  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38152303 - 38152159
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  38152303 aaatcaattttgatttaaagtatccaaaccacatcaactcataagaatcatttttaagtaaatatttccaaacataaatcaatttacatcaaactcac-t 38152205  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  38152204 ttaactaaaatcaattttctcaaacttaattctatcaaaatcaatt 38152159  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 42148985 - 42149100
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42148985 aaatcaattttgattcaaattatctaaacaacatcaactcatacgaatcacttttaaataagtctatccaaacataaatcaattcacctcaaactcactt 42149084  T
Q  101 ttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  42149085 ttaaccaaaatcaatt 42149100  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36121614 - 36121505
Alignment:
Q  60 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtca 159  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |       
T  36121614 aagtgtatccaaacataa-tctattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgacaccgctg 36121516  T
Q  160 taccaaacaca 170  Q
    |||||||||||    
T  36121515 taccaaacaca 36121505  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Original strand, 25497721 - 25497816
Alignment:
Q  50 acttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25497721 acttttaaataagtgtatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctcctaaactcaattttatcaaaatcaatt 25497816  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 15206696 - 15206821
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15206696 tatccaaacaacatgaatttttaagaatcacttctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttacccaaaatcaattttgt 15206795  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  15206796 caaactcaattctatcaaaattaatt 15206821  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 30759363 - 30759289
Alignment:
Q  72 acataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  30759363 acataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatattaaaatcaatt 30759289  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30081779 - 30081631
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |  ||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  30081779 aaatcaattttgaaacaaactatccaaacaacatcagcccataagaattgcttttgtgtcagcttatccaaacataaatcaattcacttt-aactcactt 30081681  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    ||||| ||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30081680 ttaactaaaatcaattttcacaaaatcaattttatcaaaatcaattttcg 30081631  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31246444 - 31246299
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||| || | |||||||| ||||||     |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31246444 aaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 31246345  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  31246344 ttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 31246299  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3465478 - 3465424
Alignment:
Q  92 aactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3465478 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 3465424  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 34342981 - 34342873
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  || | |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  34342981 aaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatccact-ataagaatcacttttaaataaatttatccaaacaaaaatcaattcatat-ctactcactt 34342884  T
Q  101 ttaaccaaaat 111  Q
    |||||||||||    
T  34342883 ttaaccaaaat 34342873  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 29023219 - 29023304
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattca 86  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29023219 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcaattttaaacaagtgtatccaaatataaaccaattca 29023304  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3619197 - 3619051
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  | | |||||||| ||||| |    | |||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||    
T  3619197 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatacattgataagaatcactttcatattaatgtatccaaacacaaatcaattt-cactcaactcactt 3619099  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    || | || |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3619098 ttgatcagaatcaattcattcaaaatcaattctatcaaaatcaatttt 3619051  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 30085674 - 30085623
Alignment:
Q  95 tcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30085674 tcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattatatcaaaatcaatt 30085623  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22552869 - 22552724
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||  |  ||| |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||    | || |||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  22552869 aaatcaattttagttgaaagtatccaaacaacatgaattgataataatcacttttacaataatgcatccaaacataaatcaattttccatcaactcactt 22552770  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22552769 ttatccaaaatcaattcaattaaaatcaattatgtcaaaatcaatt 22552724  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8702516 - 8702390
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaagga-agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  | || || ||| ||||||| ||||||||||       
T  8702516 tatccaaacaacatgaattgataagaatcacttt-aaggataatgtatccaaacataaatcaattatcttcaaa-tcatttttaactaaaatcaattttg 8702419  T
Q  120 ttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8702418 ctaaagtcaattctatcaaaatcaatttt 8702390  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 116
Target Start/End: Original strand, 19649229 - 19649281
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19649229 gtatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 19649281  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Original strand, 29023308 - 29023356
Alignment:
Q  106 caaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29023308 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 29023356  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 133
Target Start/End: Original strand, 32767479 - 32767547
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattct 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||| | ||||||    
T  32767479 tgtatccaaacataaatcaatttacatccaactcactttta--cataatcaattcactcaaaattaattct 32767547  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 35615751 - 35615834
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||    
T  35615751 tgtatctaaacataaatcaattcccattcaactcacttctttccaaaatcaatcttgtcaaactcaattctatcaaaatcaatt 35615834  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 41981137 - 41981192
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattactttta 56  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41981137 aaatcaattttgattcaaagtatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 41981192  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10552969 - 10552923
Alignment:
Q  70 aaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10552969 aaacataaatcaatttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 10552923  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 26490976 - 26491029
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26490976 gtatccaaacacaaatcaatttacactcaactcacttttaaccaaaatcaattc 26491029  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Original strand, 29970845 - 29970928
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    |||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29970845 gtatccaaacataaatcactttaaactcaactcacttttaactaaaatcaatt-atacaaattcaattctatcaaaatcaatttt 29970928  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 36779435 - 36779515
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  36779435 tatccaaacataaattactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctac--aaaatcaattatatcaaaatcaatt 36779515  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 131
Target Start/End: Original strand, 42600968 - 42601031
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaatt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  42600968 ccaaaaataaatcaattcacattcaactcactttgaacaaaaatcaattctgttaaaatcaatt 42601031  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 26125552 - 26125634
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaat 83  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  26125552 aaatcaattttgatttaaaccgtccaaacattatcaactcataagaatcatttttacattagtgtatccaaacataaatcaat 26125634  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Original strand, 1373081 - 1373134
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1373081 tgtatccaaacataaatcacttcaacttcaactcacttttatccaaaatcaatt 1373134  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 134
Target Start/End: Original strand, 23018137 - 23018209
Alignment:
Q  62 gtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattcta 134  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  23018137 gtgtatccaaacataaataaatttatactcaactcacttttgatcaaaatcaattcgatcaaactcaattcta 23018209  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Original strand, 26125842 - 26125882
Alignment:
Q  106 caaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26125842 caaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaattaatt 26125882  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 117
Target Start/End: Original strand, 39219765 - 39219817
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  39219765 tatccaaacataaatcacttcatattaaactcacttttaacgaaaatcaattc 39219817  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 45147379 - 45147271
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||   || || |||||||||||   ||||  ||| ||||||||||    
T  45147379 aaatcaattttgattcaagttattcaaacaatatcaacttataagaatcacttttaaatgagagtgtccaaacataaccaaatttgcattcaactcactt 45147280  T
Q  101 ttaaccaaa 109  Q
    |||||||||    
T  45147279 ttaaccaaa 45147271  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6876656 - 6876603
Alignment:
Q  97 acttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  6876656 acttttaatcaaaatcaattctgttaaactcaattctataaagattaattttcg 6876603  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 33588763 - 33588816
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33588763 gtatccaaacataaataattttacattaaactcacttttaatcaaaatcaattc 33588816  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40792264 - 40792184
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  40792264 caaatataaatcaattg-cattcaactcacttttaatcaaaatcaattatatcaaaatcaattttattaaaatcaattttcg 40792184  T

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Target: chr6 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 13739178 - 13739346
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  13739178 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 13739276  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  13739277 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 13739346  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 13744678 - 13744846
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  13744678 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcactt 13744776  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  13744777 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 13744846  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29409380 - 29409215
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29409380 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaaaaactgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 29409281  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaa 166  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29409280 ttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctattaaaatcaattttcgccaccgtcataccaaa 29409215  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6208191 - 6208023
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6208191 aaattaattttgattcaaactatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 6208093  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  6208092 ttaatcaaaatcaattcactcaaaatcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacaca 6208023  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17830127 - 17829958
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||  |||| |||  || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17830127 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaacgacttctaataaactgtaactaaacataaatcaattcacattcaactcactt 17830028  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  17830027 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagctataccaaacaca 17829958  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33899134 - 33898965
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||  || ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33899134 aaatcaattttgatttaaaccatccaaacattattaactcataagaatcacttttacattagtgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcactt 33899035  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  33899034 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgctataccaaacaca 33898965  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 10826063 - 10826208
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10826063 aaattaattttgattcaaactatccaaacaaaatcaactcataagaatcacttttaaataagtatatccaaacaaaaatcaattcaaattcaactcactt 10826162  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  10826163 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaattaatt 10826208  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 16548111 - 16548227
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16548111 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 16548210  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  16548211 ttaaccaaaatcaattc 16548227  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16442479 - 16442347
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16442479 aaatcaattttcattcaaattatccaaacaatatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 16442380  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattct 133  Q
     |||| ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  16442379 gtaactaaaatcaattctctcaaaatcaattct 16442347  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 31132436 - 31132580
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||| ||    
T  31132436 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcacttttaaataagtgtatccaaaaat-aacgaattaacatccaactcattt 31132534  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  31132535 ttagccaaaataaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 31132580  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 699530 - 699673
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  699530 aaatcgattttgattcaaactatccaa-caacattaacttataagaattacttttagtaaagtgcatccaaacataaatcaattcttatccaactcac-t 699627  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  699628 ttaactaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaatt 699673  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1312548 - 1312415
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||| | || ||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  1312548 tatccaaacaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccgaacataaatcaattcgcattcaactcacttttaaccaaaatcaattttat 1312449  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1312448 caaactcgattctatcaaaatcaattttctccac 1312415  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21255003 - 21254863
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    ||||||||||  ||| || | ||||||||| || | |||||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21255003 caattttgattcaaactaccgaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttaa 21254905  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  21254904 tcaaattcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 21254863  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 21455854 - 21455997
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||| || | | ||||||||||||| ||||    
T  21455854 aaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaactcatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaacttactt 21455951  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||    
T  21455952 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaattatatcaaaatcaatt 21455997  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32599501 - 32599422
Alignment:
Q  91 caactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||    
T  32599501 caactcacttttaatcaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaatgtcaaatcaaacaca 32599422  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15151543 - 15151489
Alignment:
Q  92 aactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15151543 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 15151489  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5584113 - 5584033
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  5584113 tatccaaacataaatcaatt-acattaaactcacttttagtcaaaatcaattctgtcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 5584033  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 7215571 - 7215690
Alignment:
Q  25 caaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaa 124  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    |||    
T  7215571 caaacaacattaactcatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacataattga-ttcacgtccaattcacttttaactaaaatcaagtcttaaaaa 7215668  T
Q  125 ctcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  7215669 ctcaattatatcaaaatcaatt 7215690  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16122126 - 16121985
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| || || | |||||||| |||| ||   ||  |||| |||||| ||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  16122126 caattttgatctcaactatccaaacaaaataaattaataagaatcacttatacataaaggtattcaaacacaaatcaacttacactcaaatcacttttaa 16122027  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16122026 ccaaaatcaattctatcaaaatcaattttatcaaaatcaatt 16121985  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29399846 - 29399755
Alignment:
Q  76 aaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||    
T  29399846 aaatcaattc-cattcaacttactctttaccaaaatcaattctatcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaaca 29399755  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 129
Target Start/End: Original strand, 882776 - 882842
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| || || | ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  882776 tgtatccaaacataaatcattttaccttcaactcaattttaactagaatcaattcactcaaactcaa 882842  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 29682202 - 29682255
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29682202 gtatccaaacacaaatcaatttacacgcaactcaattttaaccaaaatcaattc 29682255  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3605814 - 3605734
Alignment:
Q  67 tccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3605814 tccaaacataaatcacttttcactcaactcacttttaatcaaaatcaattctac--aaaatcaattatatcaaaatcaatttt 3605734  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Original strand, 1499990 - 1500043
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  1499990 tgtattcaaacataaatcaatttacactcaactcgcttttagccaaaatcaatt 1500043  T

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Target: chr5 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9193207 - 9193034
Alignment:
Q  217 aatttatataagaaaaggatattcttaaacatctaatcttcatnnnnnnnggttattattcttaaacatgacaactttgtctatcacaaacnnnnnnnca 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  9193207 aatttatataagaaaaggatattcttaaacatctaatcttcattaaaaaaggttattattcttaaacatgacaactttgtctatcacaaa--aaaaaaca 9193110  T
Q  317 taaactcttacaattaacgtcggtaactgcatttgagtttcatatagaagaaaatagataaaaattactgcaaaaa 392  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9193109 taacctctttcaatatacgtcggtaactgcatttgagtttcatatagaagaaaatagataaaaataactgcaaaaa 9193034  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 40885196 - 40885366
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatt-acttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 99  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885196 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaactcacttttaaacaagtgtgtccaaacataaatcaattcacatccaactcact 40885295  T
Q  100 tttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  40885296 tttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattctaacaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacaca 40885366  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39988088 - 39987948
Alignment:
Q  6 aattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaac 105  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39988088 aattttgatttaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaac 39987989  T
Q  106 caaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39987988 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 39987948  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 32454523 - 32454692
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  32454523 aaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacat-aatcaattcacctcaaactcactt 32454621  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattct-atcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32454622 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 32454692  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 22482175 - 22482344
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22482175 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 22482274  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  22482275 ttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacaca 22482344  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9275589 - 9275441
Alignment:
Q  22 atccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcactt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9275589 atccaaacaacatcaactcataagaatcaattttattaaagtgtatccaaacataaatcaattaacatctaactcacttttaaccaaaatcaattctctt 9275490  T
Q  122 aaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  9275489 aaactcaattttatcaaaatcaattttccccaccgccaaaccaaacaca 9275441  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8049173 - 8049032
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8049173 caattttgatttaaatcatccaaacaacaacaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattaacctcaaactcacttttaa 8049074  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8049073 ccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 8049032  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 41834878 - 41835047
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41834878 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcactt 41834977  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  41834978 ttaaccaaaatcaattctctcaaactgaattctatcaaaatcaattctccccaccgccataccaaacaca 41835047  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2430422 - 2430258
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  2430422 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaacataa-tcaattcatgttcaactcactt 2430324  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaa 166  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  2430323 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattccatcaaaatgaattctcgccaccgccataccaaa 2430258  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7386054 - 7385913
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  7386054 caattttgatttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatttaaacataaatcaattcacctcaaacccacttttaa 7385955  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7385954 ccaaaatcaattctctaaaacttaattctatcaaaatcaatt 7385913  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13253208 - 13253056
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13253208 aaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaattcatattcaactcactt 13253110  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13253109 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccac 13253056  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 3667840 - 3667985
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3667840 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 3667939  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3667940 tttaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 3667985  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 35760175 - 35760344
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35760175 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcagttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 35760274  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  35760275 tttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacaca 35760344  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40495483 - 40495339
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40495483 aaatcaattttgatttaaactattcaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcactt 40495385  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  40495384 ttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaatt 40495339  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Original strand, 42146295 - 42146462
Alignment:
Q  2 aatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttt 101  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  42146295 aatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataa-tcaattcatatctaactcacttt 42146393  T
Q  102 taaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  42146394 taaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtcataccaaacaca 42146462  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 7714926 - 7715095
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||  ||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  7714926 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacttataagaatcaatttcaagtgagtgtgtcaaaacatatatcaattcatatctaactcactt 7715025  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||    
T  7715026 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttaccaccgccatacaaaacaca 7715095  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10058060 - 10058229
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10058060 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcatttccaactcactt 10058159  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||    
T  10058160 ttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattctccccaccgccatactaaacaca 10058229  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 24045817 - 24045985
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24045817 aaatcaattttaattcaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtgagagcatccaaacataaatcaattcacatcagactcactt 24045915  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  24045916 ttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 24045985  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41740719 - 41740574
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||| |    
T  41740719 aaatcaattttgatttaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcacttttaaacaagtgtattcaaacataaaccaattcatctcaaactcacct 41740620  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41740619 ataatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 41740574  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40791194 - 40791027
Alignment:
Q  2 aatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttt 101  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  40791194 aatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataa-tcaattcatatctaactcacttt 40791096  T
Q  102 taaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || || | || ||||||||||||    
T  40791095 taaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtgataccaaacaca 40791027  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5710511 - 5710343
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  5710511 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaat-aagcgtatccaaacataaagcaattcacaccaaactcactt 5710413  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  5710412 ttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 5710343  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33954027 - 33953859
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  33954027 aaattaattttgattcaaactatccgaacaacatcaactcatcagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaatttacgttcaactcactt 33953929  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33953928 ttaaataaaatcaattctctcaaactcaattctaccaaaatcaattttcaccactgccataccaaacaca 33953859  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 32030702 - 32030845
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  32030702 aaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaac--ataagaatcacttttgaataagtatatcaaaacaaaaatcaattcacatctaacttactt 32030799  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32030800 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 32030845  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 34107049 - 34106926
Alignment:
Q  25 caaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaa 124  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||   | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  34107049 caaacaacattaattcataagaattacttttaaatgaatgtatttaaacattaatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaaacaattcttttaaa 34106950  T
Q  125 ctcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34106949 ctcaattctatcaaaatcaatttt 34106926  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3060348 - 3060205
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  3060348 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaatcacttt-aagtgagtatatccaaacataaattaattcatataaaactcactt 3060251  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3060250 ttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaatt 3060205  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 4292135 - 4292280
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||  | |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  4292135 aaattaattttgattcaaattatccaaacaatatcaaccaacaagaatcacttctaattaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaacttattt 4292234  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4292235 ttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaatt 4292280  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16158591 - 16158446
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  16158591 aaatcaattttgattcaaatcatccaaagaacatcaattcctaagaatcacttttaaaaaagtgcatccaaatataaattaattcacatcaaactcactt 16158492  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16158491 ttaatcaaaatcaattctttcaaactcaaatctataaaaatcaatt 16158446  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 27021135 - 27021256
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcact 120  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  27021135 tatccaaacaacatcaacttctaagaatcacttttaagtgagtata-ccaaacataaatcaattcacatttaactcatttttaaccaaaatcaattttct 27021233  T
Q  121 taaactcaattctatcaaaatca 143  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  27021234 caaactcaattatatcaaaatca 27021256  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28869609 - 28869530
Alignment:
Q  21 tatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28869609 tatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtaagtgtattcaaacataaatcaatccacatccaactaactt 28869530  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 7178768 - 7178908
Alignment:
Q  5 caattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaa 104  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||||| || | |||||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  7178768 caattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttag 7178866  T
Q  105 ccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
     |||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  7178867 tcaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 7178908  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23914341 - 23914235
Alignment:
Q  40 cataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaa 139  Q
    ||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  23914341 cataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaacgtaaatcaattcatatccaactcaattttaagtataatcaattctctcaaaatcaattctatcaaa 23914242  T
Q  140 atcaatt 146  Q
    |||||||    
T  23914241 atcaatt 23914235  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 19784864 - 19784944
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  19784864 atccaaacataaaccactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcaaataaaatcaattcaatcaaaatcaatt 19784944  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35847925 - 35847871
Alignment:
Q  92 aactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35847925 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 35847871  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2483776 - 2483687
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    ||| |||||| | || |||||||||||| ||||    
T  2483776 tatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattccaacaaaatcaattatgtccaaatcaattttctccac 2483687  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 22811075 - 22811128
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Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22811075 gtatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 22811128  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2694886 - 2694741
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Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaagg-aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 99  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| |  |||| |||| ||| |||||| |||| |    |||||||||    
T  2694886 aaatcaattttgattcaaattatacaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaagt-tatctaaaaataaattaatttatgatcaactcact 2694788  T
Q  100 tttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||    
T  2694787 tttaaccaaaatcaattcaatcaaaatcaattctgacaaaatcaatt 2694741  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 146
Target Start/End: Original strand, 16843599 - 16843660
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Q  85 cacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  16843599 cacatccaattcacttttaaccaaaatctattcgttcaaactcaattatatcaaaatcaatt 16843660  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 20068960 - 20069033
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Q  61 agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattcta 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  20068960 agtgtatccaaacataaataaatttaaactcaactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaaactcaattcta 20069033  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 116
Target Start/End: Original strand, 41959472 - 41959561
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Q  26 aaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |   |||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41959472 aaacaacattaactcataagaatcacttttatgtg-gtgtttccaaacataaattaattcacttttaactcacttttaactaaaattaatt 41959561  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33468055 - 33467951
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcatacc 163  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||| | | |||||||||| |  |||| |||| |||    
T  33468055 gtatccaaacacaaatcaatatacactcaactcacttttaaccaaaatcagttctatcaaaatcaattttgttaaaatcaattctaaccaccgtcaaacc 33467956  T
Q  164 aaaca 168  Q
    |||||    
T  33467955 aaaca 33467951  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2868414 - 2868363
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2868414 atccaaacttaaatcactttacattcaactcacttttaactaaaatcaattc 2868363  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 148
Target Start/End: Original strand, 9861131 - 9861214
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatttt 148  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |  ||||  |||||| || ||||||||||||    
T  9861131 tgtatccagacataaaccacttcacatccaactaaattttaactaaaatcaatttagctaaa--caattcaataaaaatcaatttt 9861214  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19204067 - 19203986
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||  || |||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  19204067 gtatccaaacaaaaatcacttttcatccaactcacttttattcataatcaatt-atgtaaaatcaattctaccaaaatcaatt 19203986  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Original strand, 29922990 - 29923043
Alignment:
Q  63 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||    
T  29922990 tgtatccaaacataaattacttcacattcaactcacttatagtcaaaatcaatt 29923043  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4569130 - 4569090
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Q  77 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4569130 aatcaattcacactcaactcacttttaatcaaaatcaattc 4569090  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5970005 - 5969957
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  5970005 caaacataaatcactttacattcaactcacttatatccaaaatcaattc 5969957  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 117
Target Start/End: Original strand, 24036627 - 24036675
Alignment:
Q  69 caaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  24036627 caaacataaatcattttacattcaactcacttttcatcaaaatcaattc 24036675  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 8421 - 8590
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8421 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcatttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcactt 8520  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  8521 ttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattattcccaccgccataccaaacaca 8590  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 253100 - 253245
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaag-gaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 99  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  253100 aaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaag-gtatccaaacataaatcaattcatatccaactcaca 253198  T
Q  100 tttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  253199 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 253245  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 9083 - 9251
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  9083 aaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatccaaacatata-caattcatatctaactcactt 9181  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  9182 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9251  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29251 - 29107
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29251 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaattcataagaataacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcactt 29153  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  29152 ttaaccaaaatcaattctttcaaacttaattctatcaaaatcaatt 29107  T

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Target: scaffold0983 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2397 - 2230
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2397 aaatcaattttgattcaaactatctaaacaacgtcaacttgtaaaaaccacttttaaacaagtgtgtccaaacataaatcaattcacctcaaactcactt 2298  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaaca 168  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2297 ttaaccaaaatcaattatgtcaaactcaattctgtcaaaatcaattttcgccaccgccataccaaaca 2230  T

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Target: scaffold0217 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2156 - 2011
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  2156 aaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagccatgataatcacttttatatgagtgcatccaaacataaatcaattcatatcaaactcattt 2057  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  2056 tgaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaatt 2011  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 118501 - 118394
Alignment:
Q  39 tcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaa 138  Q
    |||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||| |||||    
T  118501 tcataagaatcacttttgtacaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaacaaaaatctattctatcaaactcaattcgatcaa 118402  T
Q  139 aatcaatt 146  Q
    ||||||||    
T  118401 aatcaatt 118394  T

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Target: scaffold0394 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5940 - 5814
Alignment:
Q  16 taaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaat 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||  ||  |||  |||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5940 taaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttctaataaacggtaatcaaacat----caattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaat 5845  T
Q  116 tcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  5844 tctctcaaactcaattatatcaaaatcaatt 5814  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 46735 - 46903
Alignment:
Q  1 aaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 100  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||    | | |||||||||||||| ||||| |  || |||||||||    
T  46735 aaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttc-aactcactt 46833  T
Q  101 ttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccactgtcataccaaacaca 170  Q
    |||  ||||||||||||  | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  46834 ttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaattttcgccactggaaaaccaaacaca 46903  T

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Target: scaffold0172 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15323 - 15238
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc-acttaaactcaattctatcaaaatcaattttcg 150  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15323 gtatccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatttgac--aaaatcaattctatcaaaatcaattttcg 15238  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 199431 - 199382
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattc 117  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  199431 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattc 199382  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 301562 - 301630
Alignment:
Q  66 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattcta 134  Q
    |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  301562 atccaaacataaataaatttatactcaactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaaactcaattcta 301630  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 65536 - 65616
Alignment:
Q  65 tatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt-cacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  65536 tatccaaacataaatcactttacattaaactcatttttaaccaaaatcaatttcacagaa--tcaattctatcaaaattaatt 65616  T

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Target: scaffold0020 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 138574 - 138492
Alignment:
Q  64 gtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||   |||||||||||    
T  138574 gtatccaaacataaatcaatttatgttcagctcacttttaactaaaattaattcaactaaaatcaattcggacaaaatcaatt 138492  T

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Target: scaffold0128 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38369
Alignment:
Q  60 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||| ||||    
T  38425 aagtgtatccaatcataaatcaatttacatttaacttaattttaaccaaaattaatt 38369  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 116
Target Start/End: Original strand, 99701 - 99749
Alignment:
Q  68 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaatt 116  Q
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T  99701 ccaaacataaattaatttacattcaactcacttttaattaaaatcaatt 99749  T

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