View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6668_high_4 (Length: 411)

Name: NF6668_high_4
Description: NF6668
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6668_high_4
NF6668_high_4
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (160-392)||(4501544-4501776)
chr7 (1-162)||(4501203-4501363)
chr7 (1-159)||(19277237-19277395)
chr7 (166-392)||(24527882-24528108)
chr7 (160-392)||(32585433-32585665)
chr7 (1-162)||(982893-983054)
chr7 (1-162)||(21326840-21327001)
chr7 (173-358)||(45613465-45613650)
chr7 (2-156)||(24527534-24527688)
chr7 (160-380)||(47679411-47679630)
chr7 (168-378)||(10905397-10905607)
chr7 (1-162)||(27521415-27521576)
chr7 (1-137)||(48539125-48539261)
chr7 (1-162)||(32584544-32584706)
chr7 (4-154)||(43856821-43856971)
chr7 (273-392)||(5827653-5827772)
chr7 (1-158)||(22197931-22198087)
chr7 (1-158)||(22239734-22239890)
chr7 (1-142)||(45613864-45614005)
chr7 (1-157)||(30216065-30216221)
chr7 (5-162)||(10905066-10905222)
chr7 (160-349)||(28516919-28517108)
chr7 (1-162)||(40726482-40726643)
chr7 (1-161)||(42295187-42295347)
chr7 (1-155)||(25186945-25187094)
chr7 (1-157)||(5825217-5825373)
chr7 (1-162)||(28517289-28517450)
chr7 (21-119)||(5972261-5972359)
chr7 (48-157)||(9281138-9281247)
chr7 (48-157)||(9292109-9292218)
chr7 (167-311)||(19277586-19277729)
chr7 (239-380)||(4175577-4175725)
chr7 (1-134)||(36558898-36559030)
chr7 (1-97)||(41117837-41117933)
chr7 (1-134)||(6634993-6635126)
chr7 (60-157)||(2904368-2904465)
chr7 (1-159)||(34772726-34772883)
chr7 (54-152)||(47679122-47679220)
chr7 (15-152)||(23792970-23793107)
chr7 (175-359)||(43857171-43857349)
chr7 (166-268)||(983241-983343)
chr7 (36-142)||(10032193-10032299)
chr7 (1-73)||(44525929-44526001)
chr7 (99-162)||(3676681-3676744)
chr7 (1-80)||(23037489-23037568)
chr7 (167-233)||(3676933-3676999)
chr7 (115-156)||(26770455-26770496)
chr7 (101-155)||(4879547-4879601)
chr7 (1-42)||(45003019-45003060)
chr7 (52-157)||(47251789-47251893)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (160-392)||(17344924-17345156)
chr2 (167-392)||(4412655-4412880)
chr2 (167-392)||(41867497-41867722)
chr2 (166-392)||(20142329-20142555)
chr2 (168-393)||(44686712-44686936)
chr2 (167-392)||(9685004-9685229)
chr2 (1-162)||(4413068-4413229)
chr2 (1-162)||(17344582-17344743)
chr2 (1-162)||(41867910-41868071)
chr2 (1-162)||(9685417-9685578)
chr2 (1-162)||(18744956-18745117)
chr2 (200-392)||(28225326-28225518)
chr2 (239-392)||(19161415-19161567)
chr2 (15-162)||(19161785-19161932)
chr2 (179-393)||(33612129-33612343)
chr2 (15-157)||(34814826-34814967)
chr2 (167-332)||(5532719-5532884)
chr2 (15-136)||(20142753-20142874)
chr2 (1-158)||(28224944-28225101)
chr2 (1-163)||(44686360-44686526)
chr2 (1-113)||(13413295-13413407)
chr2 (5-162)||(5532368-5532524)
chr2 (21-142)||(2886637-2886758)
chr2 (7-162)||(16351843-16352001)
chr2 (173-287)||(18744648-18744762)
chr2 (1-162)||(7760848-7761008)
chr2 (21-162)||(2888480-2888621)
chr2 (7-142)||(32029108-32029243)
chr2 (1-162)||(23484940-23485099)
chr2 (1-162)||(27502306-27502467)
chr2 (2-162)||(13147099-13147262)
chr2 (1-137)||(3825670-3825806)
chr2 (1-156)||(33612555-33612708)
chr2 (48-156)||(11921218-11921326)
chr2 (31-161)||(44720296-44720427)
chr2 (52-158)||(29808070-29808175)
chr2 (167-363)||(3826020-3826217)
chr2 (29-162)||(3968411-3968544)
chr2 (15-80)||(8036566-8036633)
chr2 (353-392)||(18744607-18744646)
chr2 (253-372)||(40856751-40856869)
chr2 (221-371)||(10579390-10579539)
chr2 (1-67)||(44684955-44685021)
chr2 (160-228)||(27502647-27502715)
chr2 (115-161)||(1296053-1296099)
chr2 (198-230)||(5679601-5679633)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (160-392)||(53785995-53786226)
chr3 (167-392)||(29862090-29862315)
chr3 (4-162)||(53785656-53785814)
chr3 (160-392)||(52411491-52411723)
chr3 (5-162)||(39583231-39583388)
chr3 (21-158)||(52741518-52741655)
chr3 (1-162)||(32546739-32546900)
chr3 (1-162)||(44198711-44198872)
chr3 (1-156)||(37133007-37133162)
chr3 (1-162)||(26772702-26772863)
chr3 (1-157)||(26856769-26856925)
chr3 (166-387)||(52741121-52741326)
chr3 (160-392)||(35236414-35236646)
chr3 (1-157)||(38670887-38671043)
chr3 (1-161)||(54508386-54508547)
chr3 (21-152)||(52411903-52412034)
chr3 (173-319)||(49018262-49018408)
chr3 (15-136)||(5338601-5338722)
chr3 (1-154)||(38978809-38978962)
chr3 (21-161)||(3443315-3443455)
chr3 (15-155)||(7900816-7900956)
chr3 (21-157)||(51234580-51234716)
chr3 (7-162)||(7502013-7502167)
chr3 (1-150)||(38146000-38146149)
chr3 (257-392)||(7501728-7501862)
chr3 (1-162)||(46940772-46940936)
chr3 (24-158)||(49017930-49018064)
chr3 (1-157)||(13582454-13582609)
chr3 (2-81)||(44781-44860)
chr3 (1-156)||(21552608-21552766)
chr3 (1-158)||(37992277-37992433)
chr3 (27-156)||(25324999-25325130)
chr3 (1-156)||(4473006-4473160)
chr3 (198-367)||(43123468-43123637)
chr3 (1-69)||(4763888-4763955)
chr3 (57-156)||(3376748-3376848)
chr3 (166-230)||(39582980-39583044)
chr3 (200-340)||(45676428-45676567)
chr3 (252-367)||(37992695-37992809)
chr3 (1-71)||(25094665-25094735)
chr3 (15-141)||(43123103-43123229)
chr3 (200-290)||(44199093-44199183)
chr3 (31-75)||(4669086-4669130)
chr3 (1-68)||(464977-465044)
chr3 (99-157)||(13772491-13772549)
chr3 (160-301)||(38146346-38146488)
chr3 (340-390)||(49018418-49018468)
chr3 (160-267)||(7901138-7901243)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (165-392)||(433583-433810)
chr5 (180-392)||(15291612-15291824)
chr5 (160-389)||(26212175-26212403)
chr5 (170-392)||(27336989-27337211)
chr5 (21-162)||(42921661-42921802)
chr5 (160-350)||(38446452-38446642)
chr5 (167-380)||(3113767-3113979)
chr5 (1-162)||(32269799-32269960)
chr5 (1-162)||(37873640-37873801)
chr5 (3-162)||(13166912-13167071)
chr5 (1-162)||(15292028-15292188)
chr5 (160-348)||(6534196-6534384)
chr5 (4-162)||(33692057-33692214)
chr5 (160-330)||(35310734-35310904)
chr5 (1-162)||(35310392-35310553)
chr5 (1-132)||(22188687-22188818)
chr5 (3-162)||(25663034-25663193)
chr5 (48-162)||(43129525-43129639)
chr5 (21-160)||(34335301-34335440)
chr5 (15-158)||(38875596-38875739)
chr5 (160-349)||(13166542-13166731)
chr5 (296-392)||(25662906-25663002)
chr5 (2-162)||(26212585-26212745)
chr5 (15-155)||(14423643-14423776)
chr5 (2-162)||(27336640-27336798)
chr5 (1-141)||(430546-430686)
chr5 (26-139)||(14723269-14723382)
chr5 (22-157)||(8100517-8100652)
chr5 (64-157)||(35455963-35456056)
chr5 (22-129)||(41343473-41343581)
chr5 (160-370)||(32269404-32269620)
chr5 (1-65)||(2566194-2566258)
chr5 (38-157)||(43115464-43115583)
chr5 (84-158)||(32230513-32230587)
chr5 (89-162)||(3114165-3114238)
chr5 (22-136)||(7716146-7716261)
chr5 (110-157)||(8858969-8859016)
chr5 (4-151)||(19260251-19260396)
chr5 (99-162)||(14436542-14436602)
chr5 (48-151)||(27294429-27294528)
chr5 (108-156)||(7143757-7143805)
chr5 (1-53)||(23023539-23023591)
chr5 (24-75)||(23423960-23424011)
chr5 (325-392)||(35456213-35456280)
chr5 (109-155)||(9829361-9829407)
chr5 (252-392)||(27355306-27355443)
chr5 (5-79)||(15809997-15810069)
chr5 (5-136)||(15833010-15833138)
chr5 (46-90)||(8087547-8087591)
chr5 (277-329)||(26009867-26009919)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (173-392)||(500526-500745)
chr8 (160-392)||(37517375-37517607)
chr8 (166-380)||(24125320-24125534)
chr8 (160-392)||(39434953-39435185)
chr8 (1-162)||(38815238-38815399)
chr8 (1-161)||(24124972-24125132)
chr8 (1-162)||(6592520-6592680)
chr8 (28-162)||(500199-500332)
chr8 (1-162)||(3187914-3188074)
chr8 (14-162)||(35739988-35740136)
chr8 (4-156)||(6618232-6618383)
chr8 (1-162)||(39434611-39434772)
chr8 (2-134)||(37514166-37514298)
chr8 (200-380)||(42921731-42921908)
chr8 (1-106)||(22589395-22589499)
chr8 (1-152)||(25021826-25021977)
chr8 (251-390)||(25021393-25021534)
chr8 (4-87)||(3821171-3821254)
chr8 (173-380)||(10189842-10190049)
chr8 (48-162)||(8882319-8882432)
chr8 (21-156)||(28196156-28196291)
chr8 (48-157)||(8619805-8619914)
chr8 (24-162)||(4073501-4073640)
chr8 (12-87)||(18804567-18804642)
chr8 (221-348)||(27715669-27715796)
chr8 (4-162)||(39671173-39671332)
chr8 (24-162)||(8115779-8115916)
chr8 (26-127)||(3863286-3863387)
chr8 (26-87)||(40223480-40223541)
chr8 (95-157)||(10189581-10189643)
chr8 (39-139)||(6120947-6121045)
chr8 (2-79)||(9259377-9259454)
chr8 (320-372)||(4007052-4007104)
chr8 (4-136)||(36004069-36004201)
chr8 (21-121)||(43823953-43824053)
chr8 (222-321)||(43134349-43134448)
chr8 (1-127)||(3825579-3825705)
chr8 (24-157)||(8540384-8540520)
chr8 (1-162)||(4699815-4699973)
chr8 (99-151)||(42922140-42922192)
chr8 (1-42)||(24451064-24451105)
chr8 (252-378)||(139681-139807)
chr8 (48-130)||(27715339-27715421)
chr8 (23-80)||(121805-121862)
chr8 (57-134)||(4097373-4097450)
chr8 (1-162)||(10556295-10556455)
chr8 (299-392)||(36005927-36006019)
chr8 (47-148)||(43421302-43421403)
chr8 (334-394)||(10556115-10556175)
chr8 (94-150)||(10950673-10950729)
chr8 (94-150)||(10958678-10958734)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (160-379)||(32115975-32116194)
chr6 (166-380)||(45270-45484)
chr6 (167-392)||(4206185-4206410)
chr6 (160-392)||(34304782-34305015)
chr6 (23-162)||(4165924-4166063)
chr6 (23-162)||(4206598-4206737)
chr6 (1-162)||(959525-959685)
chr6 (22-157)||(45684-45819)
chr6 (1-162)||(17249307-17249468)
chr6 (2-158)||(34304441-34304597)
chr6 (3-162)||(33220713-33220872)
chr6 (160-329)||(357369-357538)
chr6 (1-159)||(29338084-29338242)
chr6 (216-377)||(29337690-29337851)
chr6 (1-162)||(28625875-28626036)
chr6 (25-161)||(34415404-34415540)
chr6 (160-390)||(12401617-12401842)
chr6 (1-162)||(357719-357879)
chr6 (21-158)||(34554283-34554420)
chr6 (202-392)||(8374887-8375076)
chr6 (200-286)||(14538634-14538720)
chr6 (21-157)||(24016301-24016437)
chr6 (255-390)||(32120310-32120445)
chr6 (1-73)||(32115662-32115734)
chr6 (1-156)||(3714861-3715016)
chr6 (38-146)||(26225597-26225705)
chr6 (200-290)||(28008730-28008820)
chr6 (1-72)||(31703561-31703632)
chr6 (27-141)||(13398205-13398319)
chr6 (199-269)||(20693312-20693382)
chr6 (200-369)||(7200185-7200354)
chr6 (102-162)||(34168913-34168973)
chr6 (1-44)||(3137367-3137410)
chr6 (9-151)||(22985873-22986015)
chr6 (9-151)||(23802379-23802521)
chr6 (318-392)||(26225261-26225335)
chr6 (317-378)||(22986362-22986423)
chr6 (317-378)||(23801971-23802032)
chr6 (62-162)||(6225077-6225177)
chr6 (94-162)||(28543412-28543480)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (2-162)||(6279-6439)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (160-392)||(16957822-16958053)
chr4 (166-380)||(53170793-53171004)
chr4 (1-158)||(600698-600855)
chr4 (200-392)||(56461703-56461894)
chr4 (167-356)||(3330243-3330425)
chr4 (1-159)||(53170456-53170609)
chr4 (1-157)||(25504239-25504395)
chr4 (1-162)||(34107696-34107859)
chr4 (1-157)||(56462113-56462269)
chr4 (1-162)||(53619530-53619691)
chr4 (1-161)||(132329-132489)
chr4 (24-162)||(26521455-26521593)
chr4 (160-313)||(34952457-34952610)
chr4 (40-149)||(50483211-50483320)
chr4 (4-156)||(6865828-6865979)
chr4 (4-143)||(7536592-7536731)
chr4 (1-162)||(50000927-50001089)
chr4 (1-162)||(30940741-30940895)
chr4 (1-138)||(3329940-3330077)
chr4 (1-87)||(16955404-16955490)
chr4 (1-162)||(55933464-55933623)
chr4 (200-352)||(12917995-12918154)
chr4 (8-142)||(46440911-46441045)
chr4 (160-290)||(50000616-50000746)
chr4 (1-126)||(38535607-38535732)
chr4 (52-142)||(11562893-11562983)
chr4 (25-163)||(54190857-54190990)
chr4 (1-80)||(4419207-4419286)
chr4 (167-269)||(25504586-25504689)
chr4 (29-163)||(43849349-43849483)
chr4 (21-158)||(50462952-50463089)
chr4 (39-139)||(53098403-53098503)
chr4 (2-156)||(46391323-46391474)
chr4 (35-121)||(747812-747898)
chr4 (100-162)||(23255747-23255809)
chr4 (48-162)||(31847078-31847192)
chr4 (160-290)||(48506731-48506861)
chr4 (53-162)||(12918374-12918483)
chr4 (1-157)||(48656917-48657078)
chr4 (83-158)||(16957568-16957643)
chr4 (217-360)||(25706851-25706993)
chr4 (309-380)||(48505799-48505870)
chr4 (35-121)||(712636-712722)
chr4 (160-229)||(26521774-26521843)
chr4 (2-79)||(42455692-42455769)
chr4 (1-108)||(39001341-39001448)
chr4 (170-285)||(132682-132796)
chr4 (7-162)||(45386063-45386218)
chr4 (1-55)||(8738149-8738203)
chr4 (95-157)||(45760841-45760903)
chr4 (104-157)||(12053460-12053513)
chr4 (99-147)||(24719976-24720024)
chr4 (109-157)||(28883158-28883206)
chr4 (21-73)||(50464387-50464439)
chr4 (1-72)||(23255657-23255728)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (166-392)||(28040716-28040942)
chr1 (3-161)||(21472949-21473107)
chr1 (1-162)||(22346839-22347000)
chr1 (21-162)||(29169795-29169936)
chr1 (160-392)||(34644852-34645084)
chr1 (1-162)||(28041129-28041290)
chr1 (15-162)||(45659650-45659795)
chr1 (1-152)||(20259809-20259960)
chr1 (1-162)||(34644510-34644671)
chr1 (1-162)||(2898646-2898810)
chr1 (167-337)||(22347170-22347340)
chr1 (168-392)||(38731874-38732101)
chr1 (7-162)||(31737325-31737480)
chr1 (165-392)||(7794504-7794732)
chr1 (1-135)||(24177540-24177674)
chr1 (1-162)||(2764423-2764584)
chr1 (1-157)||(4861996-4862152)
chr1 (160-287)||(29169488-29169615)
chr1 (1-152)||(38731553-38731704)
chr1 (253-392)||(37200634-37200773)
chr1 (202-298)||(19035775-19035872)
chr1 (75-162)||(19035465-19035552)
chr1 (48-162)||(50314626-50314740)
chr1 (29-160)||(42919832-42919962)
chr1 (163-279)||(37931921-37932036)
chr1 (317-392)||(19035870-19035945)
chr1 (2-155)||(18616162-18616315)
chr1 (1-141)||(7213194-7213335)
chr1 (30-162)||(50161419-50161554)
chr1 (276-379)||(22375121-22375224)
chr1 (15-142)||(37932239-37932366)
chr1 (21-128)||(47459646-47459753)
chr1 (208-370)||(35386927-35387089)
chr1 (57-162)||(16500034-16500139)
chr1 (95-157)||(15584912-15584974)
chr1 (88-162)||(36486917-36486991)
chr1 (21-73)||(35387747-35387799)
chr1 (7-54)||(868513-868560)
chr1 (299-392)||(15585285-15585378)
chr1 (109-162)||(23043929-23043982)
chr1 (210-270)||(31575086-31575146)
chr1 (296-392)||(37917683-37917779)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (8-162)||(33201-33355)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-161)||(103050-103209)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (200-392)||(20047-20239)
scaffold0186 (25-161)||(10329-10468)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (4-156)||(7550-7701)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (21-162)||(186-327)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (29-160)||(18369-18499)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (5-151)||(49363-49505)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (48-155)||(8525-8632)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (93-161)||(47542-47610)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (115-161)||(16192-16238)
scaffold0119 (24-106)||(16073-16154)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 4501544 - 4501776
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4501544 cacaagcacctctttcttcattgatactcccgcctatctgaatatatcaaaaagtacatccctaataaagtcgtgtgtgtacttaaagtcgggaagctcc 4501643  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4501644 ttacaatgaacgacatggtccccaaaagtatccaggcacgccttacgacaaacatgacacacctcatcaatagaaaataatggaatcataagacgatatc 4501743  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4501744 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 4501776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 4501203 - 4501363
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  4501203 cacaacattcatgaatctaggagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctagaaaacc-aaagtg 4501301  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4501302 tcaaaagcaaattatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 4501363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 19277237 - 19277395
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  19277237 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtg 19277336  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19277337 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggc 19277395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Original strand, 24527882 - 24528108
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  24527882 cgcctccttcttcactgatattcctgccagtctgaatatatcaaaaagtacatccctcacaaagtcatgtctgtacttaaagccgaaaagctccttgcaa 24527981  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  24527982 tgaacggcatgctccccaaaagtatccaggtacgccttacgacaaacagggcacccctcaacaataagaaatagtggaatcataaggcgatatctaatga 24528081  T
Q  366 tagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24528082 tagtatgatactccactggtgacatat 24528108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 32585433 - 32585665
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||    | |||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  32585433 cacatgcgcctccttcttcacttatactcctgcccacctgaatatatcaaaaggcacacccctaacaaagtcatgcctgtacttaaagtcgagaagctcc 32585532  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  32585533 ttaccatgaacgacatgctccccaaaagtatccagacatgccttacgacaaatagggcacacctcattaataggaaatagtggaatcataagacgaaatc 32585632  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32585633 taaggatagtacggtacttcattggtgacatat 32585665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 982893 - 983054
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  982893 cacaacattcatggacatagaagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctagaaaaccgaaagta 982992  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  982993 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttggccac 983054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21327001 - 21326840
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  21327001 cacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtg 21326902  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21326901 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 21326840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45613650 - 45613465
Alignment:
Q  173 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatga 272  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||| |     
T  45613650 ttcttcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcgtgtctgtactgaaagccgggaagttccttacaatgaacgg 45613551  T
Q  273 catgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatat 358  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45613550 catgctccccaaaagtatccatacacgtcttacaataaacaggacacacctcatcaataggaaatagtggaatcataagacgatat 45613465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 24527534 - 24527688
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||| |||| |||    
T  24527534 acaacattcatggaccaaggagaaatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctcgtgctaggaaactgaaagtgt 24527633  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24527634 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 24527688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 380
Target Start/End: Original strand, 47679411 - 47679630
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| |    
T  47679411 cacacgcgactccttcttcactgatacccccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcgtga-tgtacttaaagtcgggaagcttc 47679509  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || | |||||    
T  47679510 ttacaataaacgacgtgctccccaaaagtatccaagcgcgccttacgacaaacagagcacacctcgtcaatagcaaatagtggaatcatgaggcaatatc 47679609  T
Q  360 taaggatagtacgatactcca 380  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  47679610 tatggatagtacgttactcca 47679630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 168 - 378
Target Start/End: Original strand, 10905397 - 10905607
Alignment:
Q  168 cctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatg 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| ||||| ||| |  |   | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10905397 cctccttcttcactgatactcccgccttcctggatatatcaaaaagtacattcctaaaaaactcatacttatacttaaacccgagaagctccttacaatg 10905496  T
Q  268 aatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggata 367  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10905497 aacaacatgctccccaaaagtatccaggcaagccttacgacaaatagggcacacctcatcaatgagaaatagtggaatcataagatgatatctaaggata 10905596  T
Q  368 gtacgatactc 378  Q
    |||||||||||    
T  10905597 gtacgatactc 10905607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 27521415 - 27521576
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||    
T  27521415 cacaacattcatagacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaaccaaaagtg 27521514  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27521515 tcaaaagtaaattgtataaatgcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccac 27521576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 48539125 - 48539261
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  48539125 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttggactctatgtagacgatcaacagcctctggtgctagaaaaccgaaagtg 48539224  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48539225 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag 48539261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 32584544 - 32584706
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttg-aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaat 99  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |    
T  32584544 cacaacattcatcgatctatgagacataacattgatatgcatgatcttttggaactctatctagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaacataaagt 32584643  T
Q  100 gtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32584644 gtcaaaagcaaatggtgtaaaagcatcttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccac 32584706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Original strand, 43856821 - 43856971
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  43856821 aacattcatggacctaggagtcatgacattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaaccaaaaatgtca 43856920  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgt 154  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43856921 aaagcaaattgtataaacgcatgttgattgtcaaaacacgctttctcatgt 43856971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Original strand, 5827653 - 5827772
Alignment:
Q  273 catgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacg 372  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5827653 catgctccccaaaagtatccagacacgccttacgacaaacagggcacacctcatcaataagaaatagtggaatcataagacgatatcgaaggatagtacg 5827752  T
Q  373 atactccattggtgacatat 392  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  5827753 gtactccactggtgacatat 5827772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 22197931 - 22198087
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||    
T  22197931 cacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaaccgaaagtg 22198029  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  22198030 acaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttgg 22198087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22239890 - 22239734
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||    
T  22239890 cacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaaccgaaagtg 22239792  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  22239791 acaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttgg 22239734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45614005 - 45613864
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || | ||||||||| ||    
T  45614005 cacaacattcatggacctaggagatttgacattgttatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggctaacagcctctggtgcttggaaaccgaaagtg 45613906  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 142  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45613905 tcaaaatcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacac 45613864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30216221 - 30216065
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||    
T  30216221 cacaacattcatagacctaggagatatgacattgctatgcatgaccatttgaactttatgtggaagatcaacaaactctgatgctaggaaaccgaaagtg 30216122  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  30216121 tcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgctttctcatatttg 30216065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 10905066 - 10905222
Alignment:
Q  5 acattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaa 104  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| ||| ||||||    
T  10905066 acattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatggctctttgaactctatgtagaaggtcaacatactctggtgctaggcaaccaaaagtgtcaa 10905165  T
Q  105 aagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10905166 aagcaaatggtat-aaagcatgttgagtgtcagaacactttttctcatatttggccac 10905222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28517108 - 28516919
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||  ||||||||||    
T  28517108 cacaggcgcctccttcttcaccgatgctcccgctcgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgcttgtacttaaagctgagaagctcc 28517009  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcata 349  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  28517008 ttacaatgaacgacatgcttcataaaagtatccaaacatgccttacgacaaacagggcacacctcatcaataaaaaaaagtggaatcata 28516919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40726643 - 40726482
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||  ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||| ||    
T  40726643 cacaacattcatggatctaggagacatagcattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctatgaagccgaaagtg 40726544  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  40726543 tcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacattttattatgtttggccac 40726482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42295347 - 42295187
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |     
T  42295347 cacaagattcatggacctaggagacatgacaatgttatgcatgatattttgaacgctatgtagaaggtcaacaacccctggtgttaggaaaccgaaagta 42295248  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  42295247 taaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaagaagctttcttatgtttggcca 42295187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25187094 - 25186945
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||         
T  25187094 cacaacattcatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatatagaaggtcaacaacctctagtgttcggaaaccga----- 25187000  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 155  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  25186999 tcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattatcggaacacgctttctcatgtt 25186945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 5825217 - 5825373
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||    
T  5825217 cacaacatccatagacctaggagacataacattgctatgcataaccctttcgactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggatgccgaaagtg 5825316  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  5825317 tcaaaagtaaatggtataaaaacatgttgattgtcataacacgcattgtcatgtttg 5825373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28517450 - 28517289
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||   ||||| | |||| ||  | ||| ||    
T  28517450 cacaacattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgtctctgatgctaggaagtcaaaagtg 28517351  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  28517350 tcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtctaaacacgctttctcatgtttggccac 28517289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5972359 - 5972261
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataa 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  5972359 gagaaatgacattactatgcatgacattttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatactagaaaaatgaaaatgtcaaaaacaaatggtataa 5972261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9281247 - 9281138
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |  |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9281247 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgcttt 9281148  T
Q  148 ctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||    
T  9281147 ctcatgtttg 9281138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9292218 - 9292109
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |  |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9292218 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgcttt 9292119  T
Q  148 ctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||    
T  9292118 ctcatgtttg 9292109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 19277586 - 19277729
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| || | | ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||  || || ||||||||    
T  19277586 gcctccttcttcactgatattcctgcccgtctgagtatataaaaaagaacatccctaacaaagtcatgtatgt-cttaaagtcggaaaactacttacaat 19277684  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaa 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19277685 gaacgacatgctccccaaaagtatccagacacgccttacgacaaa 19277729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 380
Target Start/End: Original strand, 4175577 - 4175725
Alignment:
Q  239 tacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatag----ta 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||    ||    
T  4175577 tacttaaagtcgagaagctccttacaataaactgcatgctacccaaaagtatttaggcacgccttaggaaaaacagggcacaccacatcaatagccaata 4175676  T
Q  335 ---aataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactcca 380  Q
       |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  4175677 gggaatagtggaatcataaggcactatctaaggatagtacggtactcca 4175725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36559030 - 36558898
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||    
T  36559030 cacaacattcatggacctataagacatgatatttatatgcatgaccattt-aactctatggagaaagtcaacgacttttggtgctagaaaaccaaaaatg 36558932  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 134  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36558931 tcaaatgcaaattatataaaaacatgttgattgt 36558898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41117933 - 41117837
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||    
T  41117933 cacaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgatcttttaaactctatgtagaaggttaacaacatctggtgttaggaaaccgaaa 41117837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6635126 - 6634993
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||   ||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||    
T  6635126 cacaacatttatggatctaggagacatgacattgttatgcaagattattttaattttacgtagaaggtcaacaacctctgatgctaaaaaatcgaaactg 6635027  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 134  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6635026 tcaaaagcaaatgatataaaaatatgttgattgt 6634993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 2904368 - 2904465
Alignment:
Q  60 gtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || || || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2904368 gtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaagccaaacatgtcacaaacaaatgatataaaatcatgttgattgtcggaacatgctttctcatgtttg 2904465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 34772726 - 34772883
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||| ||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||  |||  |||| |     
T  34772726 cacaatattcatggacctagaaaacatgacattgatatgcatgactttttgaagtttatgtagaaggtcaacaacctctaat-ctaagaaattgaaagtt 34772824  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 159  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  34772825 tcaaaagcaaatggtataaaaacatattaattgtccgaacacactttctcatatttggc 34772883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 47679122 - 47679220
Alignment:
Q  54 ctctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  47679122 ctctatttagaaggtcaacaacctgtgatgctaggaaaccgaaaatgtcaaacgcaaatagtataaaagtatattgattgtgagaacacactttctcat 47679220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 23792970 - 23793107
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||| | ||| |||||||   || |||    
T  23792970 acctaggagacattacattactatgtatgatcctttgaactgtatttagaaggtcaacaacctgtggtgctaagaaaacaaaagtgtcaaacataattga 23793069  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 152  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23793070 tatagaagcatgttgattgtcaaaacatattttctcat 23793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 359
Target Start/End: Original strand, 43857171 - 43857349
Alignment:
Q  175 cttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgaca 274  Q
    ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||| | ||     ||||  ||| ||||||||||||||   ||    
T  43857171 cttcactaatactcctgcccgcttgaatatatcaaaaaggacaaccctaataaagtcatgtttata-----agtcaggaaactccttacaatgaactgca 43857265  T
Q  275 tgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    ||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  43857266 tgctccc-aaaagtatctagacacaccttacgacaaacaagaaacacctcatcaatagaaaacagtggaatcataacacgatatc 43857349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 268
Target Start/End: Original strand, 983241 - 983343
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  983241 cgcctccttcttcactgataatcccgtcagtctgaatatatctaaaagtaaatccctaacaaagtcaggtctgtacttaaaggcgggaagctccttataa 983340  T
Q  266 tga 268  Q
    |||    
T  983341 tga 983343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10032299 - 10032193
Alignment:
Q  36 tatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtc 135  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||  || | |||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  10032299 tatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggttaacaacatctaatgctaagaagctgaaaatatcaaaagcaaatagtataaaaacatattgattgtc 10032200  T
Q  136 agaacac 142  Q
    |||||||    
T  10032199 agaacac 10032193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 44525929 - 44526001
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 73  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44525929 cacaacattcatggatataggagacatgacattgttatgcatattcttttgaactccatgtagaaggtcaaca 44526001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 162
Target Start/End: Original strand, 3676681 - 3676744
Alignment:
Q  99 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  3676681 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatattgatagtaagaacacgctttctgatgtttgaccac 3676744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 23037489 - 23037568
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 80  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  23037489 cacaaaattcatagacctaagagaaatgacattgctatgcataaccctttgaaccctacgtagatggtcaacaacctctg 23037568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 233
Target Start/End: Original strand, 3676933 - 3676999
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgt 233  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3676933 gcctccttcttcattgatattcccgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatctcaaacaaagttgt 3676999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 26770455 - 26770496
Alignment:
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26770455 tataaaagcatatagattgtcagaacacgttttctcatgttt 26770496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4879601 - 4879547
Alignment:
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 155  Q
    ||||| |||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4879601 tcaaacgcaaatgacataaaaatattttgattgttagaacacgttttctcatgtt 4879547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 45003060 - 45003019
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcat 42  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45003060 cacaacattcatggtcctatgagacataacattgctatgcat 45003019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 47251893 - 47251789
Alignment:
Q  52 aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 151  Q
    ||||||||||| || ||||||   ||||| | |||| ||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  47251893 aactctatgtaaaatgtcaaccgtctctgatgctaggaagtcgaaaatgtcaaaaacaaatt-tataaaagcatgaggattgtgagaacatgttttctca 47251795  T
Q  152 tgtttg 157  Q
    | ||||    
T  47251794 tatttg 47251789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 17344924 - 17345156
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||| |||    
T  17344924 cacaggcgcctccttcttcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcgtgtctgtacttaaagccaggaagttcc 17345023  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  17345024 ttacaatgaacgacatgctccccaaaagtatccaggcacgccttacgacaaacagggcacacctcatcaataggaaatagtggattcataaggcgatatc 17345123  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17345124 taaggatagtacgatactccactagtgacatat 17345156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4412880 - 4412655
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  4412880 gcctccttcttcactgatattcccgcccgtttgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgtctgcacttaaagccggaaagctccttacaat 4412781  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggat 366  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4412780 gaacgacatgctccccaaaagtatccagacacgccttacgaccaacaaggcacacctcatcaataggaaatagtggaatcataagacgatatctaaggat 4412681  T
Q  367 agtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  4412680 agtacgatactccactggtgacatat 4412655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41867722 - 41867497
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41867722 gcctccttcttcactgatattcccgcccgtatgaatatatcaaaaagaacatccctaacaaagtcacgtctgtacttaaagccgggaagctccttacaat 41867623  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggat 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41867622 gaatggcatgctccccaaaagtatccagacacgacttacgacaaacagagcacacctcatcaataggaaatagtggaatcataagacgatatctaaggat 41867523  T
Q  367 agtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  41867522 agtacgatactccactggtgacatat 41867497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20142555 - 20142329
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20142555 cgcctccttcttcactgatattcccgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgtctgtacttaaagcctggaagctccttacaa 20142456  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20142455 tgaacgacatgctccccaaaagtatccagacacgccttacgacaaacagggcacacctcatcattaggaaatagtggaatcataaggcgatatctaagga 20142356  T
Q  366 tagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  20142355 tagtacaatactccactgttgacatat 20142329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 393
Target Start/End: Original strand, 44686712 - 44686936
Alignment:
Q  168 cctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatg 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||| |  ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44686712 cctccttcttcactgatactcccgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatatctaacaaaatgatgcatgtacttaaagccgggaagctccttacaatg 44686811  T
Q  268 aatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggata 367  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44686812 aatgacatgctccc-aaaagtatccagacacatcttacgacaaacaggacacacctcatcaataggacatagtggaatcataagacgatatcgaaggata 44686910  T
Q  368 gtacgatactccattggtgacatata 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44686911 gtacgatactccattggtgacatata 44686936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9685229 - 9685004
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9685229 gcctccttcttcactaatacttccgcccgtctgaatatatcgaaaagtacatccctaacaaagtcatgtctgtacttaaagccgggaagctccttacaat 9685130  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggat 366  Q
    ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9685129 gaacgacgcgctccccaaaagtatccagacacgccttacgacaaacagggcacgcctcatcaataggaaatagtggaatcgtaaggcgatatctaaggat 9685030  T
Q  367 agtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  9685029 agtacgatactccactggtgacatat 9685004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4413229 - 4413068
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  4413229 cacaacattcatggacctaggagacatgactttgctatgcatgaccttttgaaccctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaaccgaaagtg 4413130  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4413129 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 4413068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 17344582 - 17344743
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| |||| ||    
T  17344582 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctatggtgctaggaaactgaaagtg 17344681  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  17344682 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtgaaaacacgttttctcgtgtttggccac 17344743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41868071 - 41867910
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||    
T  41868071 cacaacattcatggacctgggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaacccgaaagtg 41867972  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  41867971 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttgaccac 41867910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9685578 - 9685417
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||| | ||| ||    
T  9685578 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatccatgaccttttgaactctatatagaaggtccacagcctctagtgctagaaaatcaaaagtg 9685479  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9685478 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttggccac 9685417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18745117 - 18744956
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  18745117 cacaacattcatagacctaggaaatatgacattgctatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggccaacagcctatggtgctagaaaatcgaaaatg 18745018  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18745017 tcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 18744956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 28225326 - 28225518
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||    
T  28225326 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgcctgtacttaaagccggaaaactccttacaatgaacggcatgctccccaaaagtatctagacacg 28225425  T
Q  300 ccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  28225426 tcttacgacaaacatggcacacctcatcaatggaaaataatggaatcataagatgatatcgacggatagtacggtactccgctggtgacatat 28225518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19161567 - 19161415
Alignment:
Q  239 tacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaata 338  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||  |||| |||||    
T  19161567 tacttatagccgggaagctccttacaatgaacgacatgctccccaaaagtatccaggcgcgccttacgacaaacagagca-acctcattgataggaaata 19161469  T
Q  339 atggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19161468 gtgcaatcataagacgatatctaatgatagtacgatactccactgatgacatat 19161415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19161932 - 19161785
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||     
T  19161932 acctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtaagcagcctctagtgttacaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatgg 19161833  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  19161832 tataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttgcccac 19161785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33612343 - 33612129
Alignment:
Q  179 actgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgct 278  Q
    ||||||||||||||  |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |   |||||    
T  33612343 actgatactcccgctcgcctgaatatatcaaaaagaacatccctgacaaagtcatgtatgtacttaaaatctggaagctccttacaatgagttgtatgct 33612244  T
Q  279 ccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactc 378  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||  |||||||| |||||||  |||| |     
T  33612243 ccccaaaagtatccagacacactttacgacaaacatgacacacctcatcaatatgaaatagtgaaatcataaggtgatatctagggatagtgtgatattt 33612144  T
Q  379 cattggtgacatata 393  Q
    || ||||||||||||    
T  33612143 caatggtgacatata 33612129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34814967 - 34814826
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| || |||||| |||| ||||||||||     
T  34814967 acctaagagacataacattgttatgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctggtgttaggaa-ccgaaagtgtcgaaagcaaatgg 34814869  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34814868 tataaaagcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 34814826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Original strand, 5532719 - 5532884
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  5532719 gcctccttcttcactgatactcccgctcgtctgaatatattaaaaatgacatctctaacaaatttatgtttgtacttaaagccatgaagctccttacaat 5532818  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatag 332  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  5532819 gaactgcatgctccccaaaagtattcaggcacgtcttacaacaaacagggcacaccttttcaatag 5532884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20142874 - 20142753
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| |||||     
T  20142874 acctaggagacatgacattgttatgtatgaccttttgaactctatgtataaggtcaacaacctttgatgctagaaaaccaaaagtgtcaaaagaaaatgg 20142775  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20142774 tataaaagcatgttgattgtca 20142753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 28224944 - 28225101
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||  |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||| ||    
T  28224944 cacaacattcattgacctaggagacataatattgtcatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgaagctaggaagccgaaagtg 28225043  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  28225044 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaatacgctttctcatatttgg 28225101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 44686360 - 44686526
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| ||    
T  44686360 cacaacattcacggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaaactctgatgctaggaagccgaaagtg 44686459  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccaca 163  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44686460 tcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccaca 44686526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 13413295 - 13413407
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||    
T  13413295 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgctgcttgaaaaccgaaagtg 13413394  T
Q  101 tcaaaagcaaatg 113  Q
    |||||| ||||||    
T  13413395 tcaaaaacaaatg 13413407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 5532368 - 5532524
Alignment:
Q  5 acattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaa 104  Q
    |||||||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |  ||| ||||||    
T  5532368 acattcatgaacttaggagtcatggcattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaagctcaacaacctatggtgctaggaagct-aaagtgtcaa 5532466  T
Q  105 aagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5532467 aagtaaatagtataaaagcatgttgattgtcacaacacgttttctcatgtttgaccac 5532524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2886758 - 2886637
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2886758 gagatatgatattgctatgcatgctcttttgaactctatgtaaaagatcaacagcctctgatgcttggaaaccgaaaatatcaaaaacaaatgatataaa 2886659  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacac 142  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  2886658 aacatgttgattgtcagaacac 2886637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16352001 - 16351843
Alignment:
Q  7 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc---gaaaatgtca 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | | ||    |||||||||    
T  16352001 attcatgtacctaagagacatgacattgttgtgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgataaagagccaaacaaaatgtca 16351902  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16351901 aaagcaaacaatataaaattatgttgattgtgagaacacattttctcatgtttgaccac 16351843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18744762 - 18744648
Alignment:
Q  173 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatga 272  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||    
T  18744762 ttctttactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtatatccctaacaaagtcgtgtatgtacttaaaggcaggaagttccttacaatgaacga 18744663  T
Q  273 catgctccccaaaag 287  Q
    |||||||||||||||    
T  18744662 catgctccccaaaag 18744648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7761008 - 7760848
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||    
T  7761008 cacatcattcttgaacttatgagacatcacattgctacgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgatagaaaaccaaaggtg 7760909  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    || || ||||||  ||  |||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7760908 tctaatgcaaatcgtaagaaaatatg-tgattgttagatcacgttttctcatgattggccac 7760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 2888480 - 2888621
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||| ||||| || | |||| ||||||    
T  2888480 gagatatgacattgttgtgcatgacattttgaaccttgtgtagaaggtcaacaacctcttgtgttaggaagccaaaagtgtcataaacgaatggtataaa 2888579  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2888580 aacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgtccac 2888621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32029243 - 32029108
Alignment:
Q  7 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    | | || | |||| ||||||||    
T  32029243 attcatgatcctataagacatgacattgttatggatgactctttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgaagttgggaagctgaaagtgtcaaaa 32029144  T
Q  107 gcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 142  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32029143 acaaatgatatgaaagcatgttgattgtctgaacac 32029108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23485099 - 23484940
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||    | |||||| |||| |||| |||  ||    
T  23485099 cacaacgttcatggacctaggagacatagcattgttatgcatgatcttttgaactctatgtaagaagtcattgtc-tctggtgctaggaaacagaag-tg 23485002  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  23485001 tcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatatttggccac 23484940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 27502306 - 27502467
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||||   | || | |||| ||  ||||| ||    
T  27502306 cacaacattcatagatctaggagacatgatattgctatgcataaccctttggattctatgtagaaggtcaacagtatatgatgctaggaagtcgaaagtg 27502405  T
Q  101 tcaaaa-gcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27502406 tcaaaaagcaattg-tataaaagcatgttgtttgtcggaacacgttttctcatgtttgaccac 27502467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13147262 - 13147099
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||| || | |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  13147262 acaatattcatgaacttagaagacaagacattgttgtgcacgaccctttgtactatatgaagaaggtcaacaatctctggtgttagaaaaccaaaagtgt 13147163  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagc---atgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||| |||||| |||||||     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13147162 caaaatcaaatggtataaaaagtatatgctgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccac 13147099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 3825670 - 3825806
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||  |||| ||    
T  3825670 cacaacatttatggtcctagaagacatgacattgctatgcatgattctttgaactcgatgttgaaggtcaacaacctttgatgctaggaaattgaaagtg 3825769  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 137  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3825770 tctgaagcaaatgaaataaaaacatgtagattgtcag 3825806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33612708 - 33612555
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||   || | | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||  ||| || || ||| ||    
T  33612708 cacaacattcatggacctaggggacaagacattgctatgagcgaccctctgaactc--tgtagaatgtcaacaacctccggtgttaggaagccaaaagtg 33612611  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    |||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33612610 tcaaatacaaattgtataaaatcatgttgattgtcaaaacacgttttctcatgttt 33612555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11921326 - 11921218
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||||  |||| | | |||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11921326 tttgaactctatgtagaaggtcaacagtctatgataccagaaaattgaaagtataaaaaacaaacggtataaaaatatgttgattgtcagaacacgtttt 11921227  T
Q  148 ctcatgttt 156  Q
    || ||||||    
T  11921226 ctaatgttt 11921218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 44720296 - 44720427
Alignment:
Q  31 attgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa-tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttg 129  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| || || |||||||||||||  ||| || |  |||| ||| |||  |||| | ||||||| |||||||    
T  44720296 attgttatgcatgatcctttgaactttatgtaaaaagtgaacaacctctggtgttaggaagcaaaaaaatgttaaattcaaacggtataaaaacatgttg 44720395  T
Q  130 attgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44720396 attgtcataacacgttttttcatgtttggcca 44720427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Original strand, 29808070 - 29808175
Alignment:
Q  52 aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||   | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| | |||||    
T  29808070 aactctatgtaaaaggtcaacaacctccgatgctaggaaataaataatgtgaaaagcaaatggtataaaa-catgttgattgttataacacgctgtctca 29808168  T
Q  152 tgtttgg 158  Q
    |||||||    
T  29808169 tgtttgg 29808175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 363
Target Start/End: Original strand, 3826020 - 3826217
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgt----gtgtacttaaagtcgagaagctcctta 262  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||     ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3826020 gcctctttcttaactgacacttccgctcgtttaaatatatcaaaaatgacatctctaacaaaggcatgtataaatgtacttaaagtcggaaagctcctta 3826119  T
Q  263 caatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaa 362  Q
    |||| || ||||| ||| |||||| | ||    || | |||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  3826120 caataaacgacatactctccaaaaatgtt---acatgtcttacgacaaacaacacacacgttatcaacagaaaatagtgaaattataaaacgatatctaa 3826216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3968544 - 3968411
Alignment:
Q  29 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 128  Q
    |||||| ||||| ||| | |||||||| | | |||||||| ||||| ||| | |||||  ||  | ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  3968544 acattgttatgcgtgatcctttgaactttttatagaaggttaacaaactcagatactatgaagtcaaaaatgtcaaacgcaaattgtataaaagcatatt 3968445  T
Q  129 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||    
T  3968444 gattgtcaaaacatgttttctcatatttgaccac 3968411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8036633 - 8036566
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctat--gcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 80  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8036633 acctaggagacatgacattgatatatgcataaacctttgaactctatgtaaaaggtcaacaacctctg 8036566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18744646 - 18744607
Alignment:
Q  353 cgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18744646 cgatatctaaggatagtacgatactccactggtgacatat 18744607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 372
Target Start/End: Original strand, 40856751 - 40856869
Alignment:
Q  253 aagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataaga 352  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||  |||||||||||||   ||||| | || ||||||| ||||  |||||| |||| ||| |||    
T  40856751 aagctccttacaatgaattgtgtgctccccaaa-gtatataggcacgccttactgaaaacatgtcatacctcattaataagaaataagggaaccatgaga 40856849  T
Q  353 cgatatctaaggatagtacg 372  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  40856850 caatatctaaggatagtacg 40856869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10579539 - 10579390
Alignment:
Q  221 ctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacaca 320  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||||| |  |||||||||||||| | |  ||||||| ||||| |||| |||||||| |||  |  |||| || ||||    
T  10579539 ctaacaaagttatgcatgtatttaaagttggaaagctccttacaataagtttcatgctctccaaaggtatccaggcacgtcttttggtaaacggg-caca 10579441  T
Q  321 cctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtac 371  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  10579440 cctcatcaataaaaaataatgaaatcatgagatgatatatgaggatagtac 10579390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 44685021 - 44684955
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaagg 67  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44685021 cacaacattcatggacttataagacataatattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaagg 44684955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 27502647 - 27502715
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaa 228  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27502647 cacaggcgcctccttcttcagtgatactcccgctcacttgaatatatcaaaaagtacatctctaacaaa 27502715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1296099 - 1296053
Alignment:
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1296099 tataaaaacatgtttattgtcagaacatattttctcatgtttggcca 1296053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 230
Target Start/End: Original strand, 5679601 - 5679633
Alignment:
Q  198 taaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5679601 taaatatatcaaaaagaacatccctaacaaagt 5679633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 53785995 - 53786226
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  53785995 cacatgcgcttccttcttcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcgtgtctgtacttaaagccg-gaagctcc 53786093  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  53786094 ttacaatgaacgacatgctccccaaaagtatccaggcacgccttacgacaaacaaggtacacctcatcaataggaaatagttgaatcataaggcgatatc 53786193  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  53786194 taaggataatacgatactccactggtgacatat 53786226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 29862090 - 29862315
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  29862090 gcctctttcttcactaatactcccgcctgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgcctgtacttaaaactcagaagctccttacaat 29862189  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggat 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29862190 gaacgacatgctccccaaaagtatctaggcacgccttacgataaatagagaacacctcatcaataggaaataatggaatcataaggcgatatctaaggat 29862289  T
Q  367 agtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||| |||| || |||||||||||    
T  29862290 agtacgctacttcactggtgacatat 29862315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 53785656 - 53785814
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  53785656 aacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtca 53785755  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  53785756 aaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 53785814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52411723 - 52411491
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||  | | | || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||   |||||||||  ||||||||||    
T  52411723 cacaaacgtctccttcttcactgatactcttgtccgcttgaatatattaaaaaggacatccctaataaagtcatgtcaatacttaaagctgagaagctcc 52411624  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  52411623 ttacaatgaacgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacaccttatcaataggaaacaatggaatcacaaggcgatatc 52411524  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  52411523 taaggatagcacgatactccactcgtgacatat 52411491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39583388 - 39583231
Alignment:
Q  5 acattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||| |    
T  39583388 acattcatgaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgcagaaggtcaacaacctatgatgctaggaaaccgaaagtgtcga 39583289  T
Q  105 aagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39583288 aaacaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 39583231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52741655 - 52741518
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52741655 gagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 52741556  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52741555 agcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgg 52741518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 32546739 - 32546900
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| |||| ||    
T  32546739 cacaacattcatggacctaggagacatgacattactatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctttggtgctaggaaactgaaagtg 32546838  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32546839 tcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtccgaacacgctttctcatgtttggccac 32546900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 44198711 - 44198872
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||||||| ||    
T  44198711 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcataaccttctgaactctatgtagaaggtcaacagcctcgggtgttaagaaaccgaaagtg 44198810  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44198811 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattctcagaacacgctttctcatgtttggccac 44198872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37133162 - 37133007
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  37133162 cacaacattcattaacttaggagacatgacattgctatgcatgacctttagaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtg 37133063  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37133062 taaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgttt 37133007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 26772702 - 26772863
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||||| | |||| || || ||| ||    
T  26772702 cacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataatcctttgtactctatatagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtg 26772801  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26772802 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctgatgtttggccac 26772863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26856925 - 26856769
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||| |||||  |    
T  26856925 cacaacattcataaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctagtgctaggaaatcgaaagcg 26856826  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  26856825 tcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgtcacaacacgctttatcatatttg 26856769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 52741326 - 52741121
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52741326 cgcctccttcttcactgatattcccgcccgtctgaatatatcaaaaattacatccctaacaaagtcatgtctgtacttaaagtcgggaagctccttacaa 52741227  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||                ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  52741226 tgaacgacatactccccaaaagtatccaagaacgcctt----------------acctcatcaatatgaaatagtggaatcataagatggtatctaagga 52741143  T
Q  366 tagtacgatactccattggtga 387  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    
T  52741142 tagtatgatactccactggtga 52741121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 35236414 - 35236646
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||  ||| |||||||||  |||| |||    
T  35236414 cacatgcgcctccttcttcactcatactcccgcccgcctaaatatataaaaaagtacatccttaacaaagtcatgcatgtgcttaaagtcaggaagatcc 35236513  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    ||||||| ||  ||||||| || |||||||| ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||   |||||||  |||||||    
T  35236514 ttacaataaacaacatgcttcctaaaagtatccagacacatgttacgacagacggagcacacctcatcaataggaaataataacatcataaagcgatatc 35236613  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  35236614 taaggatagtatggtactccactggtgacatat 35236646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38671043 - 38670887
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttga-actctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaat 99  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||| || ||| |    
T  38671043 cacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcat-aactctttagactctatgtagaaggtcatccgcctctgatgctagaaagccaaaagt 38670945  T
Q  100 gtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38670944 gtcaaaaacaaattgtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 38670887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 54508547 - 54508386
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||| |||| || |||||| | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  54508547 cacaacattcatggacctagcagatatgatattgttacgcatgatcctttgtaccttatgcagaaggtcaacaacctctggtgctagaaaatcaaaaatg 54508448  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacg-ttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  54508447 tcaaaagcaaatgatataaaaacatgttaattgtcagaacaagtttttctcatgtttagcca 54508386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 52412034 - 52411903
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||| | |||| |||||||||||||||  |||||    
T  52412034 gagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacgacatctagtgttagaaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaa 52411935  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52411934 agcatgttgattgtcagaacacgctctctcat 52411903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 319
Target Start/End: Original strand, 49018262 - 49018408
Alignment:
Q  173 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatga 272  Q
    |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||| | ||||||||||| ||    
T  49018262 ttcttcaccgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagcacatccctaacaaagtcatgtatgtacttaaaatcaggaagtttcttacaatgaacga 49018361  T
Q  273 catgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacac 319  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49018362 catgctcccaaaaagtatataggcacgtcttacgacaaacaggacac 49018408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 5338601 - 5338722
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| || |||||| ||||||||||||||      
T  5338601 acctatgagacaagacattgctacgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaacaatctctagtgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaattg 5338700  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtca 136  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5338701 tataaaagcatgttgactgtca 5338722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38978962 - 38978809
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||| ||    
T  38978962 cacaacattgataaacctatgagacatgacattgttatgcatcaccttttgaactatatgtagaaggtcaacggcctcaggtgctaggaaaccaaaagtg 38978863  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgt 154  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  38978862 tcaaaaacaaatagtataaaaacatattgattgtcaaaatacgttttcacatgt 38978809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3443455 - 3443315
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||| || ||||| ||||||    
T  3443455 gagacaagacattcctacgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaactgaaagtgtcaacagaaaatggtataaa 3443356  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||    
T  3443355 agcatgttgattgttagaatacactttttcatgtttggcca 3443315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 7900816 - 7900956
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| || | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| |||||||| ||||||     
T  7900816 acctaggaaacataacattgctatgtataatccttcaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatgg 7900915  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7900916 tataaaagcatgttgattgtcagaaaacgctttctcatgtt 7900956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Original strand, 51234580 - 51234716
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  51234580 gagacataacattgttatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagaaagtcgaaagtgtcaaaaataaatggtataaa 51234679  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||| |||||| |||| | ||| |||||||||    
T  51234680 agcatgttggttgtcataacatgctttttcatgtttg 51234716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7502167 - 7502013
Alignment:
Q  7 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa 106  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  7502167 attcatggatctatgagtcatgacattgttgtgcatgaccctttaaactct--gtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaaatgtcaaaa 7502070  T
Q  107 gcaaatgatat-aaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    | ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7502069 gaaaatggtataaaaaacatgttgattgttcgaacacgctttctcatgtttgaccac 7502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 38146000 - 38146149
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||  | ||| ||    
T  38146000 cacaacgttcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctaagtagaatgtaaacaacctctggtgctaggaagtcaaaagtg 38146099  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctc 150  Q
    ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38146100 tcaaatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgttgtctc 38146149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7501862 - 7501728
Alignment:
Q  257 tccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgat 356  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||| ||||    
T  7501862 tccttacaatgaactgcatgctccccaaaagtatccagacacgcattacgacaaacaa-acacacctcatcaatatgaaatagaggaattataaggcgat 7501764  T
Q  357 atctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  7501763 atctaaggatagtacggtactccactgatgacatat 7501728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 46940936 - 46940772
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaag---gtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||   ||||| |  || |||| |||| |   | |||    
T  46940936 cacaacattcatgaacctatgagtcatgacattgtcgtgcatgatcctttgaactctatgtagaagctggtcaatagtctatggtgctaggacgtcaaaa 46940837  T
Q  98 atgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46940836 gtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcggaacatgttttctaatgtttggccac 46940772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 158
Target Start/End: Original strand, 49017930 - 49018064
Alignment:
Q  24 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagc 123  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||| |    
T  49017930 acatgacatttatatgcatgaccttttgaactttacgtagaagatcaacaacctcgggtgctaggaaaccgaaagtgtaaaaaaaaaatggtataaaaac 49018029  T
Q  124 atgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49018030 atgttgattgttagaacacactttctcatgtttgg 49018064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13582454 - 13582609
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||| ||| | ||| ||    
T  13582454 cacaacattcatggtcctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctctgtagaaggtcaacaattgttggtgctaggaaatcaaaagtg 13582553  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    | |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13582554 t-aaaaacaaatggtataaaaacacgttgattgtcagaacacactttcttatgtttg 13582609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 81
Target Start/End: Original strand, 44781 - 44860
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgg 81  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44781 acaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgg 44860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21552608 - 21552766
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacat----tgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 96  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||| |||    
T  21552608 cacaacattcatggacctaggagatatgatattacgtactatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaaactgaa 21552707  T
Q  97 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  21552708 aatgtcaaaaataaatggtat-aaagcatgttgattgtcataatacattttcccatgttt 21552766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 37992277 - 37992433
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  || || |||       
T  37992277 cacaacattcatgcacgtacgagtcatgacattactgtgcatgaccctt-gaactctttgtagaaggtcaacaacctctagtgctatgaagccaaaacca 37992375  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  37992376 tcaaaagtaaatgatataaaatcatgttgattgtcagaacatgcttcctcatgtttgg 37992433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 25324999 - 25325130
Alignment:
Q  27 tgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagc--a 124  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||| |||  |||||||||| ||||||| |  |    
T  25324999 tgacattgctatgcatgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaatctatggtgctaggaaatcgaaagtgttgaaagcaaatggtataaaaacata 25325098  T
Q  125 tgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    ||||||||| || || ||||||| | ||||||    
T  25325099 tgttgattgccaaaatacgttttataatgttt 25325130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 4473006 - 4473160
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| || ||  |||||| |||| || |||||| ||    
T  4473006 cacaatattcatagacctaggagacatgaaattgctatgcatgattctttgaactttatgtagaaggttaagaa-ttctggtgctaggaagccgaaagtg 4473104  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  4473105 tcaaaaacaaatagtataaaaacatattgatggttagaacacgctttttcatgttt 4473160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 367
Target Start/End: Original strand, 43123468 - 43123637
Alignment:
Q  198 taaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggca 297  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||  |||| || || | |  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||   ||||  || ||    
T  43123468 taaatatataaaaaaggacatccctaacaaagtcatgcatgtatttgaaattggaaagcttcttacaatgaattgcttgcttcccagtggtatctagaca 43123567  T
Q  298 cgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggata 367  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  43123568 tgccttacgacaaacaagacacgcctcatcaatagaaaataatggaataatgagacgatatatgaggata 43123637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4763955 - 4763888
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtc 69  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4763955 cacaacattcatggacc-aggagacatgacattgctatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtc 4763888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3376848 - 3376748
Alignment:
Q  57 tatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatata-aaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||| | || |||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  3376848 tatgtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaaccaaaaaagtcaaaagcaaatggtctataaaatatgttgattgtgagaatatgttttatcatgtt 3376749  T
Q  156 t 156  Q
    |    
T  3376748 t 3376748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39583044 - 39582980
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39583044 cgcctccttcttcactgatactcccgccttattaagtatataaaaaattacatccctaacaaagt 39582980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45676567 - 45676428
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacg 299  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||  |||| || |||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||| ||||| ||||  || ||||    
T  45676567 aatatatcaaaaaggacatccataacaaagtcatgcatgtatttgaagtcgggaagctgattacaatgaattgcatactctccaaacgtatctagacacg 45676468  T
Q  300 ccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataat 340  Q
    || |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  45676467 ccatacgacaaac-ggacacactttatcaatagaaaataat 45676428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Original strand, 37992695 - 37992809
Alignment:
Q  252 gaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataag 351  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||| || |||||||||    
T  37992695 gaagctctttacaatgaaccacatgc-ccccaaaagtacccagatacgtcttacgacaaacagagcacacctcatcaattagatatattgaaatcataag 37992793  T
Q  352 acgatatctaaggata 367  Q
     |||||||||||||||    
T  37992794 gcgatatctaaggata 37992809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25094735 - 25094665
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaa 71  Q
    ||||||||||||| || ||  ||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  25094735 cacaacattcatggacttaaaagatattacattgctatgcatgaccatttgaactatatgtagaaggtcaa 25094665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 43123103 - 43123229
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    |||||| |||||| | ||| ||||||| || | |||||||| | ||||||| |||||||| || |||| |||||||| | ||| ||||||  | ||||      
T  43123103 acctataagacataatatttctatgcacgaccctttgaactttttgtagaaagtcaacaaactatggtgctagaaaatcaaaagtgtcaatcgtaaatag 43123202  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaaca 141  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43123203 tataacaacatgttgattgtcagaaca 43123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 290
Target Start/End: Original strand, 44199093 - 44199183
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtat 290  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  44199093 aatatataaaaaaatacatctgtaacaaagtcatgtctgtacttaaagtcggaaaactccttacaataaataatgtgctccccaaaagtat 44199183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4669130 - 4669086
Alignment:
Q  31 attgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaac 75  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4669130 attgttatgcatgatcttctgaactctatgtagaaggtcaacaac 4669086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 465044 - 464977
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggt 68  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  465044 cacaacattcatgaatctatgaaacataatattgttatgcatgactttatgaactatatgtagaaggt 464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Original strand, 13772491 - 13772549
Alignment:
Q  99 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  13772491 tgtcaaacgcaaatggtataaaagtgtgttgattgatggaacacgttttctcatgtttg 13772549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 301
Target Start/End: Original strand, 38146346 - 38146488
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaa-gttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctc 258  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||| |||| | ||| ||| ||  ||||  ||||||||||||   |||||    
T  38146346 cacaagcacctcattcttcacttatactcctgcccacctaaatatatcaaaaaggacattcttaaaaaaagtcatgtgcatacttaaagtcggatagctc 38146445  T
Q  259 cttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgcc 301  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  38146446 cttacgatgaacaacatactccctaaaagtatccaagcacgcc 38146488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 390
Target Start/End: Original strand, 49018418 - 49018468
Alignment:
Q  340 tggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacat 390  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  49018418 tggaatcataaggcgatatctaatgatagttcgatactccacttgtgacat 49018468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 7901138 - 7901243
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||| ||| |||||||  |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||  ||||||||||| ||| ||||||     
T  7901138 cacaggcgtctccttcttcatcgatacttccgcccgcctaaatatatcaaaaagtacat--ctaacaaggtcatgcttgtacttaaagccgaaaagctcg 7901235  T
Q  260 ttacaatg 267  Q
    ||||||||    
T  7901236 ttacaatg 7901243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Original strand, 433583 - 433810
Alignment:
Q  165 gcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttaca 264  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  433583 gcgcctctttcttcaccgatattcccgcccgtctgaatatatcaaatagtacatccctaacaaagtcatgcctgtacttaaagttgggaagctccttaca 433682  T
Q  265 atgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  433683 atgaacgacatgctccccaaaagtatccagacacgccttacgacaaacagtgcacacctcatcaataggaaaaagtggaatcataagacgatatcgaagg 433782  T
Q  365 atagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  433783 atagtccgatactcaattggtgacatat 433810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 180 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15291824 - 15291612
Alignment:
Q  180 ctgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctc 279  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15291824 ctgatactcccgcccatctgaatatatcaaaaagtacgtccctaacaaagtcatgtttgtacttaaagccgggaagctccttacaatgaacaacatgctc 15291725  T
Q  280 cccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactcc 379  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15291724 cccaaaagtatccagacacgccttacgataaacatgacacacctcatcaatagaaaatagtggaatcatacgacgatatctaaggatagtacgatactcc 15291625  T
Q  380 attggtgacatat 392  Q
    | |||||||||||    
T  15291624 actggtgacatat 15291612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26212403 - 26212175
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26212403 cacaggcgcctccttcttcactgatattcccaccc-tctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaaatcatgtatgtacttaaagccgagaagctcc 26212305  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  26212304 ttacaataaacgacatgctccccaaaagtatccaggcacgccttacgacaaacaggacacacttcatcaataggaaataatgaaatcataaagcgatatc 26212205  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgaca 389  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  26212204 taaggtcagtacgatacttcactggtgaca 26212175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 392
Target Start/End: Original strand, 27336989 - 27337211
Alignment:
Q  170 tctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaa 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  27336989 tctttcttcactgatactcctgctcgcctgaatatatcaaaaagtatgtccctaacaaagtcaagtatgtacttaaagccgggaagttccttacaatgaa 27337088  T
Q  270 tgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagt 369  Q
     | ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27337089 cggcatgctccctaaaagtatccagacatgccttacgacaaacagggcacacctcatcaataggaaaaagtggaatcataagacgatatcgaaggatagt 27337188  T
Q  370 acgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||| ||||| | |||||||||||    
T  27337189 acggtactcaactggtgacatat 27337211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 42921661 - 42921802
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  42921661 gagacatgacattgttatgcatgaccttctgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcataagcaaatggtataaa 42921760  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42921761 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttgaccac 42921802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 38446452 - 38446642
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  38446452 cacatgcgcctccttcttcactgatactcccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgcatgtacttaaagttgggaagctcc 38446551  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataa 350  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38446552 ttacaatgaacggcacgctccctaaaagtatctagatacgccttacgacaaaccgggcacacctcatcaatggaaaataatggaatcataa 38446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3113979 - 3113767
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  3113979 gcctccttcttcactgatactcccgcccagctgaatatatcaaaaaggacatccctaacaaagtcatgtttgtacttaaagccagaaagctccttacaat 3113880  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggat 366  Q
    |||   ||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  3113879 gaactgcatgctccc-aaaagtatccaggtacgccttgtgacaaatagggcacacctcatcaataggagatagtggaatcataaggcaatatctaaggat 3113781  T
Q  367 agtacgatactcca 380  Q
    ||||||||||||||    
T  3113780 agtacgatactcca 3113767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32269960 - 32269799
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |     
T  32269960 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaacttcatgcagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaatcgaaagta 32269861  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  32269860 tcaaaagcaaatggtataaaagcgtgttgattgtcagaacacactttctcatgtttgaccac 32269799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37873801 - 37873640
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  |||||  || |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||    
T  37873801 cacaacattcatagacctagaagtcatgacattgttctgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccaaaagtg 37873702  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37873701 tcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 37873640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13167071 - 13166912
Alignment:
Q  3 caacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtc 102  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |||| || |||||| ||||    
T  13167071 caacattcatggacctaggagacataccattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaagccgaaagtgtc 13166972  T
Q  103 aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13166971 aaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 13166912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15292188 - 15292028
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||||  ||| ||    
T  15292188 cacaacattcatggacctaggagatgtgacattgctatgcatgaccttttgaacttt-tgtagaagatcaataacctctagtgctagaaaactaaaagtg 15292090  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    | |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15292089 taaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 15292028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6534384 - 6534196
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||| |    
T  6534384 cacatgcgtctctttcttcattgatactcccgcccacctaaatatatcaaaaagtatatccttaacaaagttatatgtgtacttaaaaccggaaagcttc 6534285  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcat 348  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  6534284 ttacaatgaatagcatgctccataaaagtatccagacatgccttacgacaaacatgacacacctcatcaataagaaataatagaatcat 6534196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33692214 - 33692057
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||  ||||| | |||  || |||||| |||||    
T  33692214 aacattcatgaacctatgagacataacattgttatgcat-accctttggacactatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaagaagccgaaagtgtca 33692116  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33692115 aaagcaaatggtacaaaagcatgttgattgtcataacacgttttgtcatgtttggccac 33692057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 330
Target Start/End: Original strand, 35310734 - 35310904
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |  |||||||    
T  35310734 cacaggcgcctccttcttcactgatactctcgctcgcccgaatatatcaaaaaggacatccctaacaaagtcatgtctgtacttaaagctggaaagctcc 35310833  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaat 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35310834 ttacaatgaacaacatactccccaaaagtattcagacacgccttacaacaaacagggcacacctcatcaat 35310904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 35310392 - 35310553
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||  | | |||| |||||||||||||||| |||| |||||| | | || || |||||| ||    
T  35310392 cacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcaaaaccctttggactctatgtagaaggttaacagcctctgatgccaggaagccgaaagtg 35310491  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35310492 tcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttggccac 35310553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22188818 - 22188687
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22188818 cacaacattcatgaatctaggagacatgatattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaaaaaatcgaaagtg 22188719  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgatt 132  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  22188718 tcaaaaacaaatagtataaaatcatgttgatt 22188687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25663193 - 25663034
Alignment:
Q  3 caacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtc 102  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| || | |||| ||||    
T  25663193 caacattcatggacctaggggacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaacaacttctgatgctaggaagctgaaagtgtc 25663094  T
Q  103 aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25663093 aaaagcaaatggtataaaaacatgttgattatcagaacacgctttctcatgtttggccac 25663034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Original strand, 43129525 - 43129639
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43129525 tttgaactctctgtagaaggtcaaaaacatctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattgtcagaacacgtttt 43129624  T
Q  148 ctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||| ||||    
T  43129625 ctcatgtttgaccac 43129639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 34335301 - 34335440
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  34335301 gagacatgagattgttacgcatgatccgttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgtcagaaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaa 34335400  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcc 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34335401 agcatgttgattgtcaggacacgctttctcatgtttggcc 34335440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 38875596 - 38875739
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| || | |||| |||||||| ||||||     
T  38875596 acctaggagacaagacattgttatgcatgaccttttgaactctacgtagaaggtcagcagcctctggtgctaggaagctgaaagtgtcaaaaacaaatgg 38875695  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38875696 tacaaaaacatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttgg 38875739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13166731 - 13166542
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||| ||||||     |||||||    
T  13166731 cacaggcgcttccttcttcactgatacttccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatcccttacaaagtcatgcttgtatttaaagctacaaagctcc 13166632  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcata 349  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  13166631 ttacaatgaacgacatgctccccgaaagtatccagacacgccttacaacaaacagagcacacctcatcaatcagaaatagtggaatcata 13166542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25663002 - 25662906
Alignment:
Q  296 cacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  25663002 cacgccttacgacaaacaaggcacacctcatcaataggaaatagtggaatcataagacgatatcgaaggatagtacggtattccactggtgacatat 25662906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26212745 - 26212585
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||||||||||| || || ||||||| | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||  |||| ||||  ||    
T  26212745 acaacattcatggacttaggagacataatattgccatacatgacattttgaactctatgtagaaggttaatagcctctggtgctaagaaactgaaagggt 26212646  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26212645 aaaaaacaaatggtataaaagcatgttgatcgtcagaatacgctttctcatgtttggccac 26212585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 14423643 - 14423776
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || | |||   |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    |||| |||||||||||||||     
T  14423643 acctaagagacatgacattgttatgaattacctt---aactctatgtagaaggtcaacagcctctgatgctagga----gaaagtgtcaaaagcaaatgg 14423735  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14423736 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtt 14423776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 27336640 - 27336798
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||| | | |||   |||||||||||||||||||  |||||| | |||| || ||  || |||    
T  27336640 acaacattcatggacttaggagacataacattgctatacataaccatttt--ctctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccacaagtgt 27336737  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27336738 caaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttgaccac 27336798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 430546 - 430686
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||  |||||| | |||  ||  | ||| ||    
T  430546 cacaacattcatggacctaggagacataacattactatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctatgaagacaaaagtg 430645  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaaca 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  430646 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 430686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14723382 - 14723269
Alignment:
Q  26 atgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcat 125  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14723382 atgatattgttatgcatgacattttgaactttaagtataaggtcaacaacctctgatgctaaaaaaccaaaagtgtaaaaaacaaatgatataaaagcat 14723283  T
Q  126 gttgattgtcagaa 139  Q
    ||||||||||||||    
T  14723282 gttgattgtcagaa 14723269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Original strand, 8100517 - 8100652
Alignment:
Q  22 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||   || ||   |||| ||||| || |||||| |||||||    
T  8100517 agacatgacattgatatgcatgaatctttaaactctacgtagaaggtcaacaacctctagtggaaggaagttgaaagtgtcacaaacaaatggtataaaa 8100616  T
Q  122 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8100617 gcatgtaaattgtcacaacacgttttctcatgtttg 8100652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Original strand, 35455963 - 35456056
Alignment:
Q  64 aaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35455963 aaggtcaacatcctctggtgctaggaagccaaaattgtcaaaagcaaaaggtataaaagcatgttgattgttagaacacgctttctcatgtttg 35456056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41343581 - 41343473
Alignment:
Q  22 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactct-atgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  41343581 agacatgatattgttatgcatgatcctttgaactattatgtagaaggccaacaacctctggtgctagaaaaccgaatatgtcgaaaacaaatggtataaa 41343482  T
Q  121 agcatgttg 129  Q
    |||| ||||    
T  41343481 agcacgttg 41343473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32269620 - 32269404
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtc-gagaagctc 258  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||  | | ||| ||     
T  32269620 cacatgcgccttcttcttcactgctactcccgctcgtctgaatatataaaaaattacatccctaacaaagtcatgattgtacttaaaagctgggaaactt 32269521  T
Q  259 cttacaatgaatgacatgctccccaa--aagtatt---caggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagac 353  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||    ||| ||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32269520 cttacaatgaacgacatattccccaataaagtatatcccagacatatcttacgacacacaagacatacctcatcaatagaaaatagtggaatcataagac 32269421  T
Q  354 gatatctaaggatagta 370  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32269420 aatatccaaggatagta 32269404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2566258 - 2566194
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaa 65  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2566258 cacaacattgatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaa 2566194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43115583 - 43115464
Alignment:
Q  38 tgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 137  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  ||  |  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  43115583 tgcatgatcatttaaactctacgtagaaggtcaacaatctctggtgttacgaagtcagaagtgtcaaaagcaaatgctatgaaagcatgttgattgtcaa 43115484  T
Q  138 aacacgttttctcatgtttg 157  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  43115483 aacacgctttctcatatttg 43115464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32230587 - 32230513
Alignment:
Q  84 ctagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32230587 ctagaaaaccaaaagtgtcgaacgcagatggtataaaagcttgttgattgtcagaacacattttctcatgtttgg 32230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3114238 - 3114165
Alignment:
Q  89 aaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3114238 aaaccaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgactgtcagaacatgctttctcatgtttggccac 3114165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 7716146 - 7716261
Alignment:
Q  22 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa-gcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||| |||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |    
T  7716146 agacatgatattgttatgcataatcctttgaactttatgtaaaagaccaacaacctctggtgctagaaaaccaaaagtgtcaaaacgcaaatggtataga 7716245  T
Q  121 agcatgttgattgtca 136  Q
    | ||| |||| |||||    
T  7716246 aacatattgaatgtca 7716261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Original strand, 8858969 - 8859016
Alignment:
Q  110 aatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8858969 aatgatataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 8859016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 19260251 - 19260396
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||   | | |||    
T  19260251 aacattcatgaatatataagacattacattgttatgtatgaccctttgaactctaagtagaaggtcaataacctttagtactaagaaacc---actatca 19260347  T
Q  104 aa-agcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 151  Q
    || |  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  19260348 aacacaaaatgatataaaaacatgttgattgttcgaacacgctttctca 19260396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 162
Target Start/End: Original strand, 14436542 - 14436602
Alignment:
Q  99 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14436542 tgtcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgatt---agaacacgttttttcatgtttggccac 14436602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 151
Target Start/End: Original strand, 27294429 - 27294528
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||  || ||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  27294429 tttgaactatatgtagaaggtcaacaacctctggtgctagaaagac--aaatgtgcaacgcaaatagtataaaagc--gttgattgtcacaacacgtttc 27294524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Original strand, 7143757 - 7143805
Alignment:
Q  108 caaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7143757 caaatcatataaaaacatgttgattgttaaaacacgttttctcatgttt 7143805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 23023539 - 23023591
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaa 53  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23023539 cacaacattcatcgacctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttgaa 23023591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23424011 - 23423960
Alignment:
Q  24 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaac 75  Q
    |||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23424011 acatgacattgcaatgaatgatcctttgaaatctatgtagaaggtcaacaac 23423960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 392
Target Start/End: Original strand, 35456213 - 35456280
Alignment:
Q  325 atcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35456213 atcaatataaaatagtggaatcataaggtgatatctaaggatagtatggtactccgtttgtgacatat 35456280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9829407 - 9829361
Alignment:
Q  109 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  9829407 aaatggtataaaagcatgttgattgtcaaaacacattttatcatgtt 9829361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27355443 - 27355306
Alignment:
Q  252 gaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataag 351  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||| |||| |||| | |  ||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |     
T  27355443 gaagctccttataatgaa---catgttccccaaaggtatccaggtatgttttacatcaaatagggcacacctcatcaatagaaaataatgaaatcatgat 27355347  T
Q  352 acgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
      ||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  27355346 gtgatatctgaggttagtacagtactctattggtgaaatat 27355306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 15809997 - 15810069
Alignment:
Q  5 acattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaac-ttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 79  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  15809997 acattcatgggcctaggagacatgacattgctatacatgaccattttgaactctatat---aggtcaacaacctct 15810069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 15833010 - 15833138
Alignment:
Q  5 acattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaa 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||| ||  | ||| ||||||    
T  15833010 acattcatgaatctaggagacgtgacattgttatacatgaccatttgaactctatataga---tcaacaacatctggtgctaggaagtcaaaagtgtcaa 15833106  T
Q  105 aagcaaatgatataaaagcatgttgattgtca 136  Q
    | | |||||  ||||||  || ||||||||||    
T  15833107 acgtaaatggaataaaaatatcttgattgtca 15833138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8087591 - 8087547
Alignment:
Q  46 cttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 90  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  8087591 cttttgaactctttgtagaaggtcaacaaccgctgataatagaaa 8087547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26009919 - 26009867
Alignment:
Q  277 ctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaa 329  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26009919 ctccccaaaggtattctggcatgcctcacggcaaacagggcacacctcatcaa 26009867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 173 - 392
Target Start/End: Original strand, 500526 - 500745
Alignment:
Q  173 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatga 272  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  500526 ttcttcactgatactctcgcatgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaaatcatgcatgtacttaaagtcgggatgctccttacaatgaacga 500625  T
Q  273 catgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacg 372  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  500626 catgctccccaaaagtatctaggcatgccttacaacaaacaggtcacacctcatcaataggaaatattggaatcgtaaggcaatatctaaggatagtacg 500725  T
Q  373 atactccattggtgacatat 392  Q
     |||||||||||||||||||    
T  500726 gtactccattggtgacatat 500745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 37517375 - 37517607
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37517375 cacaggcgcctccttcttcgctgatatttccgcctgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgtctgtacttaaagtcgggaagctcc 37517474  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| || ||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  37517475 ttacaatgaacggcatgctccccagaagaatccacacacgtcttacgataaacagggcacacctcatcaataggaaatagtggaatcataaggcgatatc 37517574  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  37517575 taaggatattatgatactccactggtgacatat 37517607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 166 - 380
Target Start/End: Original strand, 24125320 - 24125534
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||| | ||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24125320 cgcctcctacttcactaatgctcctgcccgtctaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgtttgtacttaaagtcgggaagctccttaaaa 24125419  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  24125420 tgaacggcatgctccccaaaagtatccagacacgccttacgacaaacagggcacacctcatcaataggaaatagtggaatcataatgcgatatttaagga 24125519  T
Q  366 tagtacgatactcca 380  Q
    ||||||| |||||||    
T  24125520 tagtacggtactcca 24125534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 39434953 - 39435185
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| || |||| ||     
T  39434953 cacaggcgcctccttcttcactgatactcccgctcgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgcctgtacttaaagccgggaagttct 39435052  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  39435053 ttacaatgaacggcatgctccccaaaagtatccagacacgccttacgacaaacagggcacacctcatcaataggaaaaagtggaatcataagacgatatc 39435152  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
     |||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  39435153 gaaggatagtacggtactcaactagtgacatat 39435185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 38815238 - 38815399
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||| ||    
T  38815238 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaccctctggtgctaggaagcggaaagtg 38815337  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38815338 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 38815399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 24124972 - 24125132
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||    
T  24124972 cacaacattcatggacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactttatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaatcaaaattg 24125071  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24125072 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagagcacgctttctcatgtttggcca 24125132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 6592520 - 6592680
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||    
T  6592520 cacaacattcatgaacctatgagacatgacatta-tatgcatgaccttttgaactctatgcagaaggtcaacaacctctggagctaggaaactgaaagtg 6592618  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6592619 tcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttggccac 6592680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 500199 - 500332
Alignment:
Q  28 gacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgt 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  500199 gacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaaca-cctctcatactaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgt 500297  T
Q  128 tgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  500298 tgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 500332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 3187914 - 3188074
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||||| |     
T  3187914 cacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttga-ctctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtt 3188012  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3188013 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgcttcctcatgttttgccac 3188074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35740136 - 35739988
Alignment:
Q  14 aacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatg 113  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||| |||     
T  35740136 aacctaggggacatgacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagctaatt 35740037  T
Q  114 atataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35740036 gtataaaaacatgttgattgtcagaacccgctttctcatgtttggccac 35739988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 6618232 - 6618383
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||    
T  6618232 aacattcatggacctatgagacatgacatta-tatgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatctctggagctaggaaactgaaagtgtca 6618330  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6618331 aaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 6618383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 39434611 - 39434772
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||   |||||| | |||| ||  | ||| ||    
T  39434611 cacaacattcatggatctaagagacattacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaaatgcctctgatgctaggaagtcaaaagtg 39434710  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39434711 tcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 39434772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 37514166 - 37514298
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||  |||| |||    
T  37514166 acaacattcatggacctaagagacgtaacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggcgctaggaaattgaaagtgt 37514265  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 134  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  37514266 caaaagcaaatagtataaacgcatgttgattgt 37514298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 42921908 - 42921731
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| | |||| || |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||   ||     
T  42921908 aatatatcaaaaagaacatccctaacgaagtcatgtatgtacttaaagccaagaaacttcttacaatgaactacatgctctccaaaaatattca---aca 42921812  T
Q  300 ccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactcca 380  Q
     ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  42921811 tcttacgacaaacgaggcgcacctcatcaataagaaataatggaatcataagacgatatcgaataatagtatgatactcca 42921731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22589499 - 22589395
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22589499 cacaacattcatagacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgta-aaagtcaacagcctctggtgctaggaaaccgaaagtg 22589401  T
Q  101 tcaaaa 106  Q
    ||||||    
T  22589400 tcaaaa 22589395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25021977 - 25021826
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| | ||||||| | |||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  25021977 cacaacattcctggacctaggagatatgacattgttgtgcatgaccctttgaactttgtgtggatggtcaacaacctctggtgctaggaagccaaaaatg 25021878  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 152  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  25021877 tcaaaagaaaatggtataaaaacatgttgattgtgagaacacactttctcat 25021826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25021534 - 25021393
Alignment:
Q  251 agaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataa 350  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  25021534 agaagctccttacaatgaactacatgcttcccaaaagtatcaaggcacgccttacgataaatatggcacacctcatcaatatgaaatagtggaatcatga 25021435  T
Q  351 gacgatatctaagg--atagtacgatactccattggtgacat 390  Q
    | ||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||    
T  25021434 ggcgatatctaaggatatagtactatacttcactggtgacat 25021393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Original strand, 3821171 - 3821254
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 87  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3821171 aacatttatgaacctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggttctag 3821254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 380
Target Start/End: Original strand, 10189842 - 10190049
Alignment:
Q  173 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatga 272  Q
    |||||||||||||||| | || | ||  ||||||||||||  |||| | |||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||       
T  10189842 ttcttcactgatactctcacccgcttggatatatcaaaaatgacattcttaacaaagtcatgtttgtacttaaagccgtgaagctccttacaatgaactg 10189941  T
Q  273 catgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacg 372  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||   ||  |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||||    
T  10189942 catgctccttaaaagtatccaggcacaccttacggcaaacggggtgcatgtcatcaatatgaaataatagaatcataagacaatatctgcagatattacg 10190041  T
Q  373 atactcca 380  Q
    ||||||||    
T  10190042 atactcca 10190049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Original strand, 8882319 - 8882432
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8882319 tttgaactctatgtgaatgttcaacaacctctggtgctagaaaactgaaagt-tcaaaaacaaatggtttaaaagcatattgattgtcagaacacgcttt 8882417  T
Q  148 ctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||||||    
T  8882418 ctcatgtttggccac 8882432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 28196156 - 28196291
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||  | ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  28196156 gagacatgacattgttgtgcatgatcctttgaactctacgtagatggtcaacaacctatggtgctaggaagacaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaa 28196255  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    | |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  28196256 aacatgtttattatcataacacactttctcatgttt 28196291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Original strand, 8619805 - 8619914
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  8619805 tttgagctctatgtcgaaagtcaacaacctctggtgttagaaagccaaaaatgttaaaaacaaatggtataaaagcacgttgattgtcaaaatacgcttt 8619904  T
Q  148 ctcatgtttg 157  Q
     |||||||||    
T  8619905 ttcatgtttg 8619914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 162
Target Start/End: Original strand, 4073501 - 4073640
Alignment:
Q  24 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa-accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaag 122  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  4073501 acatgacattgctatgcatgactcattgatttctctgtagaaggtcaacaacctctggtactaaaaatggcaaaagtgtcaaatgcaaattgtataaaat 4073600  T
Q  123 catgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  4073601 catgttgattggtaaaacacgttttctcttgtttgaccac 4073640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 18804567 - 18804642
Alignment:
Q  12 tgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 87  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18804567 tgaacctaggagtcatgacattgttatgcatgaccttttgaaatctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctag 18804642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 348
Target Start/End: Original strand, 27715669 - 27715796
Alignment:
Q  221 ctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacaca 320  Q
    |||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||  ||||| ||||||||| |||||  |||||    
T  27715669 ctaacaaagtcgtgcatgtatttgaagtcgagaagctccttacaatgaattgcatgctccccagatatatcgaggcatgccttacgataaacaaaacaca 27715768  T
Q  321 cctcatcaatagtaaataatggaatcat 348  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  27715769 cctcaacaataaaaaataatgaaatcat 27715796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39671332 - 39671173
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt-c 102  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||      
T  39671332 aacattcatggatctaggagacatgacatttttattcatgacccttttaactctacgtaaaaggttaacaacctctggtgctaggaagccgaaaatgtaa 39671233  T
Q  103 aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||  ||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  39671232 aaaaataaattgtataaaaacatgttaattgtcaaaacacgctttctctggtttggccac 39671173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 162
Target Start/End: Original strand, 8115779 - 8115916
Alignment:
Q  24 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagc 123  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |  || |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  8115779 acatgacattgcaatgcatgatcctttgaactttatgtagaaggtcaacaacctctcat-ttaaaaaaccaaaagtgtcaaatgcaaatggtataaaagt 8115877  T
Q  124 atgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    || |||||| | |||||| | ||||| | ||||| ||||    
T  8115878 atattgattattagaacaagatttcttacgtttgaccac 8115916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Original strand, 3863286 - 3863387
Alignment:
Q  26 atgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcat 125  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||| ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  3863286 atgacattgctatgcactaccctttgaactctatgtagaaggtcaataacctctggtcctaggaagccaaaagtgtcacatgcaaatggaataaaagcat 3863385  T
Q  126 gt 127  Q
    ||    
T  3863386 gt 3863387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 40223541 - 40223480
Alignment:
Q  26 atgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 87  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40223541 atgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctccggtgctag 40223480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Original strand, 10189581 - 10189643
Alignment:
Q  95 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  10189581 aaaatgtcaaatgcaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacatgctttctcttgtttg 10189643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 139
Target Start/End: Original strand, 6120947 - 6121045
Alignment:
Q  39 gcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga 138  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  6120947 gcatgaccttttgaactctttgtaggagatcaacgacctttggtactagaaaaccaaaagtgtcaaa--cacatgctataaaaacatgttgattgtgaga 6121044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9259454 - 9259377
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 79  Q
    |||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9259454 acaacattcatggacttaggatatatgacattgctatgcatgagtctgtgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 9259377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4007104 - 4007052
Alignment:
Q  320 acctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacg 372  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4007104 acctcatcaatagaaaatagtggaatcataagacgatatctaaggataatacg 4007052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 36004069 - 36004201
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||| | ||  |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||    
T  36004069 aacattcatggacctatgagacataatgttgttatccatgacccttgaaactctttttagatggtcaacaacctctggtgataggaagtcaaaaatgtca 36004168  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtca 136  Q
    || | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36004169 aatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtca 36004201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Original strand, 43823953 - 43824053
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| | |||||  | | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43823953 gagacatgacattgctatgcatgaccatttgaactctatgtgaaaggtcaatagcctctaatgcaaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 43824052  T
Q  121 a 121  Q
    |    
T  43824053 a 43824053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Original strand, 43134349 - 43134448
Alignment:
Q  222 taacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacac 321  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| | | ||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43134349 taacaaagtcatgtttgtacttaaaattgggaaactccttataatgaatttaatgttccccaaaagttttcagacacgccttacgacaaacaagacacac 43134448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 3825579 - 3825705
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |   |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||  ||    
T  3825579 cacaatattcatggatctatgaaacatgacgttgctatgcattactctttgaattctgtgtagaaggtcaacaacctatggttctaggaagccaaaggtg 3825678  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgt 127  Q
    ||| | |||||||  ||||||||||||    
T  3825679 tcacatgcaaatggaataaaagcatgt 3825705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8540520 - 8540384
Alignment:
Q  24 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctat---gtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||||||| |||   |||||| |||||||||||||| |  ||||||   |||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  8540520 acatgacattgttaagcatgaccctttgaactttattatgtagaaagtcaacaacctctgatgttagaaagttgaaagtgtcaaatgcagatgacataaa 8540421  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  8540420 aacatgtcgattgttagaacacattttctaatgtttg 8540384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 4699815 - 4699973
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || ||| ||    
T  4699815 cacaacattcatggacctaggtgacataatattgctattcatgaccttt-gaactttatatagaaggtcaacagcctctggtgctatgaagccaaaagtg 4699913  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    | || | |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  4699914 ttaaca-caaatggtgtaaaaacatgttaattgtgagaacacg-cttatcatgtttggccac 4699973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42922192 - 42922140
Alignment:
Q  99 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 151  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42922192 tgtcaaaggcaaatgatttaaaagcattttgattgtcaaaacacgttttctca 42922140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24451064 - 24451105
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcat 42  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24451064 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcat 24451105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 139681 - 139807
Alignment:
Q  252 gaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataag 351  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||||||||| |||| ||  || || ||| | |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  139681 gaagctccttatagtgaactacatgctccccaaaggtatccaaacatgctttagggcaaataggtcacacctcgtcaataggaaataatgaaatcatgag 139780  T
Q  352 acgatatctaaggatagtacgatactc 378  Q
    || | ||   ||||||||| |||||||    
T  139781 acaaaatacgaggatagtatgatactc 139807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 130
Target Start/End: Original strand, 27715339 - 27715421
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttga 130  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||| || |  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  27715339 tttgaactctttttagaaggtcaacaacttatgatactaggaagctaaaaatatcaaacgtaaatggtataaaagcatgttga 27715421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 121862 - 121805
Alignment:
Q  23 gacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 80  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  121862 gacatgacattgatatgcatgatcttttaaactttgtgtagaatgtcaacaatctctg 121805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4097450 - 4097373
Alignment:
Q  57 tatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||  |||||||||||    
T  4097450 tatgtagaaagtcaacaacctctgatgctagaaaggcaaaaatttcaaatgtaaatcatataaaaatatgttgattgt 4097373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10556455 - 10556295
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||    |||||||||||| ||||  |||||   |||| || |||| ||  |  || ||    
T  10556455 cacaacattcatgaac-tatgagccacgacattgttttgcatgactcattgaactctatgcagaatatcaactgtctctagtgctaggaagtcataagtg 10556357  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  10556356 tcaaatacaatttatataaaaacatgttgattttcagaatatgttttctcatgtttgaccac 10556295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 392
Target Start/End: Original strand, 36005927 - 36006019
Alignment:
Q  299 gccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||| | |||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  36005927 gccttacgacaaaaatg-cacatctcatcaataggaaataatagaatcataaagccatatttgaggatagtataatactctactggtgacatat 36006019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43421403 - 43421302
Alignment:
Q  47 ttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttt 146  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| || || | ||| ||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||    
T  43421403 ttttgagctctttttagaaggtcaataatctttagtattagaaaaccaaaagtgtcaaacaaaaatgatataaaaacatgttaattgtcggtgcacgttt 43421304  T
Q  147 tc 148  Q
    ||    
T  43421303 tc 43421302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10556175 - 10556115
Alignment:
Q  334 aaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatatat 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||  ||||||||||||    
T  10556175 aaatagtggaatcataagacgatatttaaggataatatgataattcaccggtgacatatat 10556115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10950729 - 10950673
Alignment:
Q  94 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctc 150  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10950729 gaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaagtatgttaattgttagaacacgttttctc 10950673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10958734 - 10958678
Alignment:
Q  94 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctc 150  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10958734 gaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaagtatgttaattgttagaacacgttttctc 10958678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 32115975 - 32116194
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  32115975 cacatgcgcctctttcttcactgatactcccgcccgtcaaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgtatgtacttaaagttgggaagctcc 32116074  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  32116075 tcacaatgagcgacatgctccccaaaagtatccaggcacaccttacgacaaacagggcacacatcatcaataggaaatagttgaatcataagacaatatc 32116174  T
Q  360 taaggatagtacgatactcc 379  Q
    || |||||||| | ||||||    
T  32116175 tagggatagtatggtactcc 32116194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45484 - 45270
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||     
T  45484 cgcctccttcttaactgatattcccgcccgtcagaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgtatgtacttaaacccgagaagctccttacac 45385  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  45384 cgaacgacatgctccccaaaagtatcaaggcacaccttacgacaaacagggcacacctcatcaataggaaatattggaatcataaggtgatatctaagga 45285  T
Q  366 tagtacgatactcca 380  Q
    ||||| |||||||||    
T  45284 tagtatgatactcca 45270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4206410 - 4206185
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaag-tcgagaagctccttacaa 265  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  4206410 gcctccttcttcactgatattcccacacgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgtatgtacttaaagctcg-gaaactccttacag 4206312  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  4206311 tgaacggcatgctccccaaaagtatccaggcacgccttacgacaaacagggcacgcctcatcaataggaaatagtggaatcgtaaggcgagatctaagga 4206212  T
Q  366 tagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4206211 tagtacggtactccactggtgacatat 4206185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 34304782 - 34305015
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaa-agtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctc 258  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  34304782 cacatgcgtctccttcttcactgatactcctgcctgcctgaatatataaaaaaagtacatccctaacaaagtcatgcatgtacttaaagccgagaagctc 34304881  T
Q  259 cttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatat 358  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||  ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||    
T  34304882 cttacagtgaacaacatgctccccaaaagtatccagacatgtcttacgacaagtagggcaaacctcatcaatatgaaataatggaatcataagacagtat 34304981  T
Q  359 ctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34304982 cgaaggatagtacggtactccactggtgacatat 34305015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4166063 - 4165924
Alignment:
Q  23 gacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaag 122  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4166063 gacatgacattgtcatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaag 4165964  T
Q  123 catgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4165963 catgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 4165924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4206737 - 4206598
Alignment:
Q  23 gacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaag 122  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4206737 gacatgacattgtcatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaag 4206638  T
Q  123 catgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4206637 catgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 4206598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 959525 - 959685
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  959525 cacaacattcatggacctaggagacacaacattgctatgcatgaccttttgaact-tacgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaaatg 959623  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  959624 tcaaaaacaaatggtataaagacatgttgattgtcagaacacgttttctcatggttagccac 959685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 45819 - 45684
Alignment:
Q  22 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||    
T  45819 agacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatggaataaaa 45720  T
Q  122 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45719 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 45684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17249468 - 17249307
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || || ||| ||    
T  17249468 cacaacattcatgaacttaggagacataacattgctatacataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtg 17249369  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17249368 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggccac 17249307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 34304441 - 34304597
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaact-tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || || ||| ||    
T  34304441 acaacattcatagacctatgagacatgatattgctatgcat-aactctttggactctatgtagaaggtcaacatcatctgatgctaggaagcccaaagtg 34304539  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34304540 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgg 34304597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33220872 - 33220713
Alignment:
Q  3 caacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtc 102  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||| ||||    
T  33220872 caacattcatggacctagaagacacaacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaacaacctcggatgctaggaagccgaaagtgtc 33220773  T
Q  103 aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33220772 aaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcaacacacgctttctcatgtttggccac 33220713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 357538 - 357369
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||| ||  |   || ||||    
T  357538 cacaagggcctccttcttcactgatactcccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaaggcatgcatgtactttaaaccagaaatctcc 357439  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaa 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  357438 ttacaatgaacgacatgctccccaaaagtatccagacacgccttacgtcaaaaaggacacacctcatcaa 357369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29338242 - 29338084
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||  |  || ||    
T  29338242 cacaacattcatggacctaggagtcatgacattgatgtgcatgaccctttgaaccatatgtagaaggtcaacgatctctggtgctaggaagtcagaagtg 29338143  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29338142 tcaaaagcaaatggtataagagcatgttgattgttagaacacgttttctcatgtttggc 29338084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29337851 - 29337690
Alignment:
Q  216 catccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacagg 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |    
T  29337851 catccctaacaaagttatgtgtgtacttaaagctaggaagctacttacaatgaactacatgctccccacaagtatccaggcatgccttacgagaaacatg 29337752  T
Q  316 acacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatact 377  Q
     ||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  29337751 gcacgcctcattaatagaaaatagaggaatcataaggcgatatctaaggataatatgatact 29337690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 28625875 - 28626036
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||    
T  28625875 cacaacattcatagacctatgagatatgacat-gttatgcatgaccttttgaactttatgtagaagctcaacaacctctggtgctaggaaattgaaagtg 28625973  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatat-aaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    | |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28625974 taaaaaacaaatggtataaaaaaaatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttagccac 28626036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 34415404 - 34415540
Alignment:
Q  25 catgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagca 124  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  | | ||||  ||| ||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  34415404 catgacattgctatgcatgaccatttgaactctatatagaaggtcaactgcatttggtgttaggaaacctaaagtgtcaaaaacaaatggcataaaagca 34415503  T
Q  125 tgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  34415504 tgttgattgtcagaacacactttctcatgtttcgcca 34415540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 12401617 - 12401842
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||| | ||||  | ||| ||||    
T  12401617 cacaggcgcctccttcttcactaatactctcgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatttctaacaaagtcatgtttgtattcaaagctgggaaactcc 12401716  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    ||||   |     ||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12401717 ttacgcgg-----catgctccccaaaagtattctaatacgccttacggcaaacagggcacaactcatcaatagaaaatagtgtaatcataagacaatatc 12401811  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacat 390  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12401812 taagcataatacggtactccactggtgacat 12401842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 357879 - 357719
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| | | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  ||| ||||  ||| ||    
T  357879 cacaacattcatggacctaggagagataacattgctatgcttaatcatttggactctatgtagaaggtcatcaacctctaatgttaggaaaca-aaagtg 357781  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    | |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  357780 ttaaaaacaaaggttataaaagcatgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 357719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34554420 - 34554283
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| || |||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  34554420 gagacatgatattgctatacatgaccttttaaactctatgtagaaagtcaatagcatctggtgctaggaagccgaatgtgtcaaaagtaaatggtataaa 34554321  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34554320 aacatcttgattatcagaacacgctttctcatgtttgg 34554283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8375076 - 8374887
Alignment:
Q  202 tatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgcc 301  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||  | || || |||  | ||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| ||| |||| |    
T  8375076 tatatcaaaaagaacatccataacaaatttgtgcctttatttgaagcagggaagctccttacaatgaactttatgctccccaaaggtatccagacacgtc 8374977  T
Q  302 ttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||   |||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8374976 ttattgcaaacagtg-acacctcatcaatagaaagtaatggaatcataatgcgatatatgaggatagtacgatactctattggtgacatat 8374887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14538720 - 14538634
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14538720 aatatatcaaaaaggacatctctaacaaagttatgtatgtacttaaagtcaagaagctccttacaacgaatgacatgctcccaaaaa 14538634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Original strand, 24016301 - 24016437
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||| |||||||| ||||||    
T  24016301 gagacatgacattcttgtgcatgaccctttgaactctatgtaaaaaatcaacaacatctggtgctaggaaaccaaaactatcaatagcaaatggtataaa 24016400  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  24016401 aacatgttgattgtgagaacaagctttctcatgtttg 24016437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 390
Target Start/End: Original strand, 32120310 - 32120445
Alignment:
Q  255 gctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacg 354  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  32120310 gctccttataatgaaaggaatgctccccaaaagtatccagacacaccttacgacaaatagggcacacctgatcaataggaaatattggaatcataaggcg 32120409  T
Q  355 atatctaaggatagtacgatactccattggtgacat 390  Q
    |||| ||| ||| ||| |  ||||||||||| ||||    
T  32120410 atatataaagattgtatggcactccattggtaacat 32120445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 32115662 - 32115734
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 73  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32115662 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctttgtagaaggtcaaca 32115734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 3714861 - 3715016
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| |||| |  || |||| |||  ||  | ||| ||    
T  3714861 cacaacattcatggatttatgagacatgacattgttgtgcatgattctttaaactctatgtagaagatcaagagtctttggtgctaagaagtcaaaagtg 3714960  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3714961 tcaaaaacagatgatataaaaacatgttaattgtgagaacacgttttctcatgttt 3715016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26225705 - 26225597
Alignment:
Q  38 tgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 137  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||   || || || ||||||||||||||||||||    
T  26225705 tgcatgagcctttgaactctatgttgaaggccaacaacatctagtgctagaaagccaaaaatgtcaaacataactggtaaaaaagcatgttgattgtcag 26225606  T
Q  138 aacacgttt 146  Q
    |||| ||||    
T  26225605 aacatgttt 26225597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28008820 - 28008730
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtat 290  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  28008820 aatatatcaagaaggacatccctaataaagtcatgtttgtacttaaagtcagaaagctccttacaataaattgcatgctccccaaaagtat 28008730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31703632 - 31703561
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaac 72  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  31703632 cacaatattcatgaaccaatgagacatgatattgatgtgcatgatcatttaaactctatgtagaaggtcaac 31703561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13398319 - 13398205
Alignment:
Q  27 tgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatg 126  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||  | ||||| ||||||| ||||  |||||||  |||    
T  13398319 tgacattgttatgcatcatcttttgaactctatgtagaatgtcaacaacttctgatgttaggaagtcaaaaatatcaaaagtaaatagtataaaaatatg 13398220  T
Q  127 ttgattgtcagaaca 141  Q
    ||||||||| |||||    
T  13398219 ttgattgtcggaaca 13398205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20693382 - 20693312
Alignment:
Q  199 aaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaa 269  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20693382 aaatatatcaaaaatgacaaccctaataaagtcatgtttgtacttaaagtcaagaagctccttacaatgaa 20693312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7200354 - 7200185
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || |||   | ||  | |||||||||||  |||||| | | ||||||||  || ||||    
T  7200354 aatatatcaaaaaggacatccctaacaaagttatgcatgtatttgaagcaaataaagttcttacaatgaactacatgccctcgaaaagtatctagacacg 7200255  T
Q  300 ccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagt 369  Q
    ||||| | |||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| |  ||||||| ||| |||||    
T  7200254 ccttatggcaaacagggcacatctcatcaataaaaagtaatggaatcattaagcgatatcgaagaatagt 7200185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Original strand, 34168913 - 34168973
Alignment:
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  34168913 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgcttgtccaaacatgctttctcatgtttggccac 34168973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 3137410 - 3137367
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatga 44  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3137410 cacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatga 3137367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Original strand, 22985873 - 22986015
Alignment:
Q  9 tcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagc 108  Q
    ||||||||||| |||| || |||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |  |||  | || |||||||||||  |    
T  22985873 tcatgaacctaagagatataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacac 22985972  T
Q  109 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 151  Q
    || |  |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||    
T  22985973 aagtagtataaaagtacgttgattgccataacatgttttctca 22986015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23802521 - 23802379
Alignment:
Q  9 tcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagc 108  Q
    ||||||||||| |||| || |||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |  |||  | || |||||||||||  |    
T  23802521 tcatgaacctaagagatataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacac 23802422  T
Q  109 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 151  Q
    || |  |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||    
T  23802421 aagtagtataaaagtacgttgattgccataacatgttttctca 23802379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26225335 - 26225261
Alignment:
Q  318 acacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  26225335 acacctcattaataagaaataatggaatcatggggtgatatctaaggatagtacggtactctacttgtgacatat 26225261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 378
Target Start/End: Original strand, 22986362 - 22986423
Alignment:
Q  317 cacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactc 378  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  22986362 cacacctcatcaataggatgtaatggaatcatgaggcgatatctgaggattgtatgatactc 22986423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23802032 - 23801971
Alignment:
Q  317 cacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactc 378  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  23802032 cacacctcatcaataggatgtaatggaatcatgaggcgatatctgaggattgtatgatactc 23801971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 6225077 - 6225177
Alignment:
Q  62 agaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    |||||||||| | | ||||||  ||||||  | ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||    
T  6225077 agaaggtcaagagcatctggtgatagaaaggcaaaagtgtcaaacacaaatgacatataagcatgttgattgtcacaacaaaatttctcatgtttgacca 6225176  T
Q  162 c 162  Q
    |    
T  6225177 c 6225177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 162
Target Start/End: Original strand, 28543412 - 28543480
Alignment:
Q  94 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||| |||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28543412 gaaagtgtcaaaatcaaatagtataagagcatagtgattttcaaaacacgatttctcatgtttggccac 28543480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 6279 - 6439
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||    
T  6279 acaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgaaagtgt 6378  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6379 caaaagcaaatggtatagaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 16957822 - 16958053
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  16957822 cacaggcgcctcctacctcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaaaaagtcatgtatgtacttaaagtcaggaagctcc 16957921  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  16957922 ttacaatgaacgatatgctccccaaaagtatctaggcacgccttacgacaaacaaggcacacctcatcaatagaaaatagtggaatcataaggc-atatc 16958020  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  16958021 taaggatagtacagtaatccactggtgacatat 16958053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 380
Target Start/End: Original strand, 53170793 - 53171004
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  53170793 cgcctctttcttcactgatattcctgcccgtctgaatat--caaaaagtacatcccta-caaagtcatgtctgtacttagagcggggaagctccttacaa 53170889  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  53170890 tgaacgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacagggcacacctcatcaatagaaaatagtggaatcgtaaggtgatatctaaaga 53170989  T
Q  366 tagtacgatactcca 380  Q
    |||||||||||||||    
T  53170990 tagtacgatactcca 53171004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 600855 - 600698
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  600855 cacagcattaatggacctaggagacatgacatagttatacatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaaccgaaagtg 600756  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  600755 acaaaagcaaatggtataaaagcatgttaattgttagaacacgttttctcatgtttgg 600698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 56461894 - 56461703
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||  |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||     
T  56461894 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcacacctatacttaaaaccaggaagctccttacagtgaacgacatgctccccaaaa-tatccaggcaca 56461796  T
Q  300 ccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  56461795 ccttacgaaaaacagggcacacctcatcaatagaaaatagtggaatcataaggttatatctaaggatggtacgatactccattggtgatatat 56461703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 3330243 - 3330425
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3330243 gcctccttcttcactgatactcccgctcgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatgcctgtacttaaagccgggaagctccttacaat 3330342  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||       ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3330343 gaatggcatgctccccaaaagtatacagacacgccttacgacaa-------acatctcatcaataggaaaaagtggaatcataagacgat 3330425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 53170456 - 53170609
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctat--gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa 98  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||     
T  53170456 cacaacattcatga-cctataggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctagcaaaccgaaag 53170554  T
Q  99 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 159  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53170555 tgtcaaaagcaaat------caagcatgttgactgtcagaacacgctttctcatgtttggc 53170609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 25504239 - 25504395
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  |||| || |||| ||||| ||||||    
T  25504239 cacaatattcatggacctatgagacatgacattactatgcatgaccttttaaactctatttaaaaggtcaacagtctctagtgctaggaaaccaaaaatg 25504338  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25504339 tcaaaagcaaacggtataaaaacatgtcgattgttagaacacgttttctcatgtttg 25504395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34107859 - 34107696
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  34107859 cacaacattcatggatctaggagacataacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtg 34107760  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga--acacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34107759 tcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattatctgaacacacgttttctcatgtttggccac 34107696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 56462269 - 56462113
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||    
T  56462269 cacaacatttatggacttaggagacatgacattgtcatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtg 56462170  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  56462169 tctaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttatcatgtttg 56462113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 53619530 - 53619691
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||  | ||| ||    
T  53619530 cacaacattcatggacctaagagacataacattgttatgcataaccctttagactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagtcaaaagtg 53619629  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53619630 tcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 53619691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 132329 - 132489
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||    
T  132329 cacaacaatcatgaacctaaaagacatgacattgttatgcttgaccctttaaactctgtgtagaatgtcaacaatctctgatattaggaaaccgaaagtg 132428  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  132429 taaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgttttgcca 132489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 162
Target Start/End: Original strand, 26521455 - 26521593
Alignment:
Q  24 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagc 123  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  26521455 acatgacattgctacgcatgaccctttgaactgtatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaaccaaaagtgttgaaagcatatgatataaaagc 26521554  T
Q  124 atgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  26521555 atgttgattgtcataacacgttttttcatgtttagccac 26521593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Original strand, 34952457 - 34952610
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34952457 cacatgcgcctccttcttcactgatactctcgcccgccttaatatatcaaaaatgacatccctaacaaagtcatgtatgtacttaaagtagagaagctcc 34952556  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaaca 313  Q
    ||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34952557 ttacattaaacggcatgctccccaaaagtattcagacacgtcttacgacaaaca 34952610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 50483320 - 50483211
Alignment:
Q  40 catgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaa 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  50483320 catgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaatcatgttgattgtcagaa 50483221  T
Q  140 cacgttttct 149  Q
     ||| |||||    
T  50483220 gacgctttct 50483211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6865979 - 6865828
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || |||  || |  ||| |||||    
T  6865979 aacattcatgatc-taggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtaaaaggttaacaacatctagtgctatgaagctcaaagtgtca 6865881  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6865880 aaagcaaatgatataaaagcatgttgatagtcagaacacgttttctcgtgttt 6865828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7536731 - 7536592
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||    
T  7536731 aacattcatggatctacgagacataaaattgctatgcacgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaactgaaattgtca 7536632  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacg 143  Q
    ||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7536631 aaaacaaattgtataaaaacatgttgattgtcaaaacacg 7536592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 50001089 - 50000927
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||| || ||| ||    
T  50001089 cacaacatttatggatctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagaaagccaaaagtg 50000990  T
Q  101 tcaaaagcaaatgata-taaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50000989 tcaaaagcaaattgtattaaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccac 50000927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30940895 - 30940741
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||      || |||| ||| |||| ||| ||||| ||    
T  30940895 cacaacattcatagacctaggatatatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaa------cagcctcaggtgctaggaaatcgaaagtg 30940802  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30940801 tcaaaagcaa-tggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccac 30940741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 3329940 - 3330077
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || || ||| ||    
T  3329940 cacagcattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtg 3330039  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga 138  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3330040 tcaaaagcaaatagtataaaagcatgttgattgtcaga 3330077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 16955404 - 16955490
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 87  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16955404 cacaacattcatgggcctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcagcaacctctggtgctag 16955490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 55933623 - 55933464
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |||| |||| || | | |||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||  ||||| ||    
T  55933623 cacaacattcacggacctaggagacataatattgttatgtataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtg 55933526  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  55933525 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccac 55933464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12918154 - 12917995
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaag-------ctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |    
T  12918154 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagtcatacatgtacttaaagtcgggaagtaggatgctccttacaatgaatgacatgtttctcaaaagtatcc 12918055  T
Q  293 aggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataaga 352  Q
    || ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  12918054 agacacaccttacgacaaacatggcacatctcatcaatagaaaatagtgaaatcataaga 12917995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 46441045 - 46440911
Alignment:
Q  8 ttcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||| || | |||| | |||| || |||||| |||||||||    
T  46441045 ttcatgaacctatgagacatagcattgctatgcacaaccctttggactctatgtagaaggtcagcagcttctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaag 46440946  T
Q  108 caaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 142  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  46440945 caaatgatataaaaacgtgttaattgttagaacac 46440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50000746 - 50000616
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||  |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  50000746 cacaggcgcctccttcttcattgatactcctgctcgcctgaatatatcaaaaagtacatccttaacaaagtcatgtctgtatttaaagtcgggaagctcc 50000647  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtat 290  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  50000646 ttacaatgaacggcatgcttcccaaaagtat 50000616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38535732 - 38535607
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||  | ||| ||    
T  38535732 cacaacatccatggacctataagacatgacattgctatgcatgactctttgaactctatgtagagggtgaacaacctctggtgctaggaagtcaaaagtg 38535633  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatg 126  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  38535632 tcaaatgcaaatggtataagagcatg 38535607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Original strand, 11562893 - 11562983
Alignment:
Q  52 aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 142  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11562893 aactcaatgtagaagatcaacaacctcgagtgttagaaaaccgaaaatgtctaaagtaaatgatataaaagcatgttgattgtccgaacac 11562983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 54190990 - 54190857
Alignment:
Q  25 catgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagca 124  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||     |||||| ||    
T  54190990 catgacattgttatgcatggccctttgaactctatgtggaaggtcaacaacctctgatactagaaagtcaaaagtgtcaaaagcaa-----ataaaaaca 54190896  T
Q  125 tgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccaca 163  Q
    |||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  54190895 tgtaaattgtcagaatatgttttctcatgtttgaccaca 54190857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 4419207 - 4419286
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 80  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419207 cacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 4419286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Original strand, 25504586 - 25504689
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaa-agtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25504586 gcctcgttcttcactgatgctctcgcccgtttgaatatatcaaaaaagtacatctctaacaaagtcatgtttgtacttaaagtcaggaagctccttacaa 25504685  T
Q  266 tgaa 269  Q
    ||||    
T  25504686 tgaa 25504689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43849483 - 43849349
Alignment:
Q  29 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 128  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||| || || ||| |||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  43849483 acattgttatgcatgaccatttgaactctttgtagaagatccacaacctttggttctaggaagccaaaagtgtcaaacacaaatagtataaaagcatgtt 43849384  T
Q  129 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggccaca 163  Q
    | || || ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43849383 ggttatctgaacacgctttctcgtgtttggccaca 43849349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 50463089 - 50462952
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||   || ||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  50463089 gagacatggcattgttatgcatggccctttaaactctacgtagaaggtcaacagtctctggtgtaaggaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtatgaa 50462990  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  50462989 agcatgttgattgtcggaagacactttctcatgtttgg 50462952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 139
Target Start/End: Original strand, 53098403 - 53098503
Alignment:
Q  39 gcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga 138  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||||||||||||    
T  53098403 gcatgaccatttgaactctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaaaccaaaaatgtcaaaaggaaacggttcaaaaacatgttgattgtcaga 53098502  T
Q  139 a 139  Q
    |    
T  53098503 a 53098503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46391474 - 46391323
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| ||| |||||||||    
T  46391474 acaacattcatggatttaggagacatgacattgtt--gcatgatcttttgaactttatgtagaaggtcaacaacctctactgataggaaatcgaaaatgt 46391377  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
     | |||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||| |||||    
T  46391376 tacaagc-aatggtataaaaacatgttggctgtgagaacatgttttctcgtgttt 46391323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 747898 - 747812
Alignment:
Q  35 ctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 121  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  747898 ctatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatattaagaaaccagaaatatcaaaagcaaatggtataaaa 747812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 162
Target Start/End: Original strand, 23255747 - 23255809
Alignment:
Q  100 gtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23255747 gtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttaattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 23255809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Original strand, 31847078 - 31847192
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||| | |||| || || ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| | |||    
T  31847078 tttggactctatgtagaaggtcaaccgcttctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtaaaaaaacatgttgactgtcagaacatggttt 31847177  T
Q  148 ctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||| ||||    
T  31847178 ctcatgtttgaccac 31847192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48506861 - 48506731
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||||| || | || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  48506861 cacaggcgcctccttctttaccgatactctcgtccgtctgagtatatcaaaaaatacatccgtaacaaagtcatgtatgtacttaaagtcaggaagctcc 48506762  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtat 290  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  48506761 taacaatgaaccacgtgctccccaaaagtat 48506731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12918483 - 12918374
Alignment:
Q  53 actctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 152  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12918483 actctatctagaaggtcaacaatctctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagtgtgttgattgtcagaacacgatttcttat 12918384  T
Q  153 gtttggccac 162  Q
    ||||| ||||    
T  12918383 gtttgaccac 12918374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 48657078 - 48656917
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtag----aaggtcaacaacctctggt-actagaaaaccga 95  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||    ||||||||||||||||  |  |||  ||  |||    
T  48657078 cacaacattcatagacctatgagacataacattgctatgcataatcatttggactctatgtagaaggaaggtcaacaacctctaatcgctaagaagtcga 48656979  T
Q  96 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  48656978 aagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacattttgattgacataacacactttctcatgtttg 48656917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Original strand, 16957568 - 16957643
Alignment:
Q  83 actagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  16957568 actagaaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtatataagcatgttgattatcagagcacactttctcatgtttgg 16957643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 360
Target Start/End: Original strand, 25706851 - 25706993
Alignment:
Q  217 atccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacagga 316  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||     
T  25706851 atccctaacaaagtcatgcatgtacttaaagtcgataagctccttacgatgaacaata-gctccccaaaagtatccatgcacaccttacgacaaataggg 25706949  T
Q  317 cacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatct 360  Q
     ||||   |||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25706950 tacactctatcagtaggtaataatagaatcataagacaatatct 25706993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48505870 - 48505799
Alignment:
Q  309 aaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactcca 380  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48505870 aaacagaacacacatcatcaatatgaaatagtggaatcataaggcgatatctaaggataatacgatactcca 48505799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 712722 - 712636
Alignment:
Q  35 ctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 121  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  712722 ctatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggacaacaacctctgatattaagaaaccagaaatatcaaaagcaaatggtataaaa 712636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 26521774 - 26521843
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaag 229  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26521774 cacatgcgcctcattcttcaatgatactctcgtccgtctaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaag 26521843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 42455769 - 42455692
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 79  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42455769 acaacattcatggacctagaaaacatgacattgttatccatgatcatttgaactctatgtagaaggttaacaacctct 42455692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 39001341 - 39001448
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || || ||| ||    
T  39001341 cacaacattcatggacctaggagacacaacattgttatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatcctaggaagccaaaagtg 39001440  T
Q  101 tcaaaagc 108  Q
    ||||||||    
T  39001441 tcaaaagc 39001448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 285
Target Start/End: Original strand, 132682 - 132796
Alignment:
Q  170 tctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaa 269  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  | ||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  132682 tcttttttcactaatactcctgcccgcctgaatatatcaaaa-gtacatccctaacaaagtcatgattatacttaaaaccggaaagctccttacaatgaa 132780  T
Q  270 tgacatgctccccaaa 285  Q
     ||||||||| |||||    
T  132781 cgacatgctctccaaa 132796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45386218 - 45386063
Alignment:
Q  7 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa 106  Q
    ||||||| || || ||||||  |||||| ||||||||| | |||||| | || ||||||||| ||  |||||| || ||||||| || ||| | |||||     
T  45386218 attcatggacttaagagacacaacattgttatgcatgaccctttgaattttaggtagaaggttaatgacctcttgtgctagaaagccaaaagtttcaaat 45386119  T
Q  107 gcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    | ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  45386118 gtaaatggtataaaaagaaattgattgtcagaacacgctttcttatgtttgaccac 45386063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 8738149 - 8738203
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaact 55  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  8738149 cacaacattcatgaacctaagagacatgacatttttatgcatgagcctttgaact 8738203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 45760903 - 45760841
Alignment:
Q  95 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  45760903 aaaatgtcaaatgcaaaagatataaaaatatgttgattgtcaaaacacgctttctcatctttg 45760841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Original strand, 12053460 - 12053513
Alignment:
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12053460 aaagcaaatgatataaaaacgttttgattgttagaacacgatttctcatgtttg 12053513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 24719976 - 24720024
Alignment:
Q  99 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24719976 tgtcaaacacaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacgcgtttt 24720024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28883206 - 28883158
Alignment:
Q  109 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  28883206 aaatgatataaaaacatgttggttgttcgaacacgttttctcatgtttg 28883158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 50464439 - 50464387
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50464439 gagacatgacattgttatgcatgaccctttaaactctacgtagaaggtcaaca 50464387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 23255657 - 23255728
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaac 72  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  23255657 cacaatattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaac 23255728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28040942 - 28040716
Alignment:
Q  166 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  || ||| ||| ||||||    
T  28040942 cgcctccttcttcactgatattctcgcacgtctaaatatatcaaaaggtacatccctaacaaagtcatgtatgtacttaaatccgggaaactcattacaa 28040843  T
Q  266 tgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagga 365  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28040842 tgaacgacatgctccctaaaagtattcagtcacacattacggcaaacagggcacaccacatcattaggaaataatggaatcataaggcgatatctaagga 28040743  T
Q  366 tagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28040742 tagtatgatactccactggtgacatat 28040716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Original strand, 21472949 - 21473107
Alignment:
Q  3 caacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtc 102  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||    
T  21472949 caacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgcaagtgtc 21473048  T
Q  103 aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21473049 aaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 21473107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 22346839 - 22347000
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  22346839 cacaacattcataaacctaggagacatgacatttctatgcatgaccttttgaactctgtgtagaaggtcaacaacctctgctactaggaaaccgaaagtg 22346938  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22346939 tcaaaagcaaaaggtataaacgcatgttgattgtcagaacacgctttctcatatttggccac 22347000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29169936 - 29169795
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29169936 gagacatgacattgctgtgcatgaccttttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 29169837  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29169836 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttggccac 29169795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 34644852 - 34645084
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||| |||||||     
T  34644852 cacacgcgcttccttcttcactgatactcccgccctcctgaatatatcaaaaagtacatccctaataaagtcatgcctgtacttaaagtcgggaagctct 34644951  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatc 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34644952 ttacaatgaacgacatgctcgccaaaagtatccagacacgccttatgacaaacagggcactcctcatcactagaaaatagtggaatcataagacgatatc 34645051  T
Q  360 taaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
     ||||||| |||| |||| || | |||||||||    
T  34645052 gaaggataatacggtacttcactagtgacatat 34645084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28041290 - 28041129
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  28041290 cacaacattcatggacttagaggacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctggtgctaggaaaccgaaagtg 28041191  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28041190 tcaaaagcaaatggtataaaaacctgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggccac 28041129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45659795 - 45659650
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||     
T  45659795 acctaggagacatgacattgctatgcatgatcttttgaactctat--agaaggtcaacagcctctggtgataggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaatgg 45659698  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45659697 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 45659650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20259960 - 20259809
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  20259960 cacaacatttattaacttatgagacatgacattactatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtg 20259861  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 152  Q
    |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20259860 tcaacaataaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcat 20259809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 34644510 - 34644671
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||    
T  34644510 cacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtg 34644609  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34644610 tcaaaaacaaatggtataaaagcatgtaggttgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 34644671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 2898646 - 2898810
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |     
T  2898646 cacaacattcatgatcgtatgagacatgatattgttatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagta 2898745  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacg----ttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  2898746 tcaaaagcaaatggtataaaaac-tattgattgtcagaacacgctcactttctcatgtttggccac 2898810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 337
Target Start/End: Original strand, 22347170 - 22347340
Alignment:
Q  167 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaat 266  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22347170 gcctccttcttcactgatattcccgcccatctgaaaatgtcaaaaagtacatccctaacaaagttatgtctatacttaaagccggtaagctccttacaat 22347269  T
Q  267 gaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaat 337  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22347270 gaacgacatgctccccttaagtatccaggcatgccttacgacaaacagggcacacctcatcaatagaaaat 22347340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Original strand, 38731874 - 38732101
Alignment:
Q  168 cctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagta---catccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttaca 264  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||  |   |||||||||||||||  | | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38731874 cctccttcttcactgatactcccacctgcctaaatatataaaaaaaaatgacatccctaacaaagtcatatttgtacttaaagccaagaagctccttaca 38731973  T
Q  265 atgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaagg 364  Q
    |||||    ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38731974 atgaactgtatgcttcacaaaagtatccaggcacaccttacgaaaaacaaaacatacatcatcaacaggaaatagtggaatcataaggcgatatctaagg 38732073  T
Q  365 atagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  38732074 atagtacggtactccactgatgacatat 38732101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31737480 - 31737325
Alignment:
Q  7 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa 106  Q
    ||||||| | ||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  31737480 attcatggatctaggaaacataacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaatagcctctaatgctagaaaatcgaaagtgtcaaaa 31737381  T
Q  107 gcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31737380 acaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaatatgttttctcatgtttggccac 31737325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7794732 - 7794504
Alignment:
Q  165 gcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttaca 264  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||| |||||  |||||    
T  7794732 gcgcctccctcttcaatgatactcccgcccgcctgaatttatcaaaaaggacatccctagcaaaaccatgtttgtacttaaagtcgaaaagctttttaca 7794633  T
Q  265 atgaatgacatgctccccaaaa-gtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaag 363  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |   ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7794632 atgaactacatgctccccaaaaagtatccagacacgccttacgacaaacaaggtgcaccttatcaatatgaaataatggaatcataaggcgatatcaaag 7794533  T
Q  364 gatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||| | | ||||||| |||||| ||||    
T  7794532 gatagcatggtactccactggtgatatat 7794504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24177674 - 24177540
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||| ||    
T  24177674 cacaacattcatggacctaggagatatgacattgctatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtaaacagcctctgatgctaggaaaccgaaactg 24177575  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtc 135  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  24177574 tcaaaaacaaatggtataaaaatatgttgattgtc 24177540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 2764423 - 2764584
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| | ||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||| ||    
T  2764423 cacaacatttatggacctaagagacataacattgatttgcataaccctttggactttatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagctgaaagtg 2764522  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2764523 tcaaaagaaaatggcataaaagcatgttgattgtcggaacacgttttctcatgtttgaccac 2764584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4862152 - 4861996
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||| ||||| ||    
T  4862152 cacaacattcatggatctaagggacgtgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacttttggtgttaggaaatcgaaagtg 4862053  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4862052 tcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgcttgtcagaagacgctttctcatgtttg 4861996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29169615 - 29169488
Alignment:
Q  160 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  29169615 cacaggcgcctccttcttcactgatactcatgcccgtctgaatatatcaaaaaatacatcccttacaaagtcgtgtctgtacttaaagccgagaagttcc 29169516  T
Q  260 ttacaatgaatgacatgctccccaaaag 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29169515 ttacaatgaacgacatgctccccaaaag 29169488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 38731553 - 38731704
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || || ||| |     
T  38731553 cacaatattcatggacctaggagtcatgacattattgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaagaagccaaaagtt 38731652  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 152  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38731653 tcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgattgtcagaacacgctttctcat 38731704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 392
Target Start/End: Original strand, 37200634 - 37200773
Alignment:
Q  253 aagctccttacaatgaa-tgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataag 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37200634 aagctccttacaatgaaatga-atgatccccaaaagtatccaagcacgtcttacaacaagtagggcacacctcatcaataggaaatagtggaattataag 37200732  T
Q  352 acgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  37200733 gcgatatctaaggatagtatgatactccactagtgacatat 37200773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Original strand, 19035775 - 19035872
Alignment:
Q  202 tatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgct-ccccaaaagtattcaggcac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19035775 tatatcaaaaagtacatccctaacaaattcatgtctgtacttaaagtcgggaagctccttacaatgaacgacatgctcccccaaaagtatccaggcac 19035872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 162
Target Start/End: Original strand, 19035465 - 19035552
Alignment:
Q  75 cctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19035465 cctctggtgctaggaaaccgtaagtgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 19035552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 50314740 - 50314626
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50314740 tttgaactctatgtagaaagtcaacaacatcttgtgttaggaaataaaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtgagaacaagtttt 50314641  T
Q  148 ctcatgtttggccac 162  Q
     ||||||||| ||||    
T  50314640 gtcatgtttgaccac 50314626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Original strand, 42919832 - 42919962
Alignment:
Q  29 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 128  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  | || | ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  42919832 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgtt 42919931  T
Q  129 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggcc 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42919932 gattgtgagaacacg-tttctcatgtttggcc 42919962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37932036 - 37931921
Alignment:
Q  163 aagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctcctta 262  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||    
T  37932036 aagcgtctccttcttcacttatactcccgcccgcctaaatacatcaaaaaggatatccctaacaaagttcaca-tatacttaaagtcgagaagctcctta 37931938  T
Q  263 caatgaatgacatgctc 279  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37931937 caatgaacgacatgctc 37931921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 19035870 - 19035945
Alignment:
Q  317 cacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19035870 cacacctcatcaaaaggatatagtggaatcataaggcgatatctaaggatagtatgatactccactggtgacatat 19035945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18616315 - 18616162
Alignment:
Q  2 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 101  Q
    |||| ||| ||| ||||| || |||| | |||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||  ||||| |||    
T  18616315 acaatatttatggacctaagatacataatattgctatgcatgaccctttgaattatatgtagaatgtcaacagcctcgggtgctagaaagtcgaaagtgt 18616216  T
Q  102 caaaagcaaatgatataaaa-gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 155  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18616215 taaaaacaaatggtataaaacacatgttgattatc-gaacacgttttctcatgtt 18616162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 7213194 - 7213335
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||  | |||| ||||||||| ||    
T  7213194 cacaacattcatggacctagaagacatgacattattatgcatgacattttgaactttatgcagaagctcaacagtctctaatgctaggaaaccgaaagtg 7213293  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatat-aaaagcatgttgattgtcagaaca 141  Q
    ||||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  7213294 tcaaaaataaatgatataaaaaacatgttaattatcagaaca 7213335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 50161554 - 50161419
Alignment:
Q  30 cattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtc---aaaagcaaatgatataaaagcatg 126  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||  | || ||| | |    ||||  ||||||||||||||||||    
T  50161554 cattgctctgcatgatcctttgaactctatgtagaatgtcatcaacctttggtgctagggagccaaaagtatataaaaaaaaaaatgatataaaagcatg 50161455  T
Q  127 ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50161454 ttgattgtgagaacacgctttctcatgtttgtccac 50161419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 379
Target Start/End: Original strand, 22375121 - 22375224
Alignment:
Q  276 gctccccaaaagtattcaggcacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgata 375  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||| |  | ||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22375121 gctcccaaaaactatacaggcacgccttaagccaaacatggaaaacctcatcagtaggaaatagtagaatcataaggcgatatctaaggatagtacgtta 22375220  T
Q  376 ctcc 379  Q
    ||||    
T  22375221 ctcc 22375224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37932366 - 37932239
Alignment:
Q  15 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||| ||| ||||   ||| |    
T  37932366 acctatgagacatgacattactatgcacgaatgtttaaactcaatatagaatgtcaacatcctctggtgctaggaagccgaaagtgtaaaaaaataataa 37932267  T
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacac 142  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||    
T  37932266 tgtaaaaacacgttgattgtcagaacac 37932239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 47459646 - 47459753
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || || ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  47459646 gagacataacattgctatgcatattcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatactaggaagccaaaagtatcaaaagcaaatggtataaa 47459745  T
Q  121 agcatgtt 128  Q
    | ||||||    
T  47459746 aacatgtt 47459753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35387089 - 35386927
Alignment:
Q  208 aaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacgccttacga 307  Q
    |||||| ||||||||| | ||||  | | ||||||||||||   |||||||||||||| |||   ||||||||  | || ||| || |||| ||||||||    
T  35387089 aaaaaggacatccctagctaagtcatctatgtacttaaagttaggaagctccttacaacgaactgcatgctcctaacaaatatccaagcacaccttacga 35386990  T
Q  308 caaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagta 370  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  35386989 caaacaggacatgcctcatcaataaaaaatagtgaaattataagtcgatatctaagaatagta 35386927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 16500034 - 16500139
Alignment:
Q  57 tatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||| ||  | ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||    
T  16500034 tatgtagaaggtcaacagcctctaatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaggcatgttaattgttagaacatgttttcttatattt 16500133  T
Q  157 ggccac 162  Q
    ||||||    
T  16500134 ggccac 16500139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Original strand, 15584912 - 15584974
Alignment:
Q  95 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  15584912 aaaatgtcaaacgcaaatggtatagaaacatgttgattgtcagaatacgttttccaatgtttg 15584974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 36486917 - 36486991
Alignment:
Q  88 aaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  36486917 aaaaccaaaagtgtcaaaagcaaattatataaaaagatattgattgtcaaaacacgctttctcatatttgaccac 36486991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 35387799 - 35387747
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35387799 gagacatgacattgatatgcatgtccctttgaactctatgtagaagatcaaca 35387747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 868560 - 868513
Alignment:
Q  7 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaac 54  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868560 attcatggacttaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaac 868513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 392
Target Start/End: Original strand, 15585285 - 15585378
Alignment:
Q  299 gccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||  | | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  15585285 gccttacaacaaacagggcaaatctcatcaatggaaaataaagaaatcatgagacgatacttgatgatagtacaatactctactggtgacatat 15585378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 162
Target Start/End: Original strand, 23043929 - 23043982
Alignment:
Q  109 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  23043929 aaatggtataaaagcatgttgattgtgagtacttgttttctcatatttggccac 23043982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31575146 - 31575086
Alignment:
Q  210 aaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaat 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||  || ||||||||    
T  31575146 aaagaacatccctaacaaagttgtgtttgtagttgaaatcgagaagctattttcaatgaat 31575086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37917779 - 37917683
Alignment:
Q  296 cacgccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    ||||||||||| | || |||||||| || |||||||| ||||| | | |||||||||    
T  37917779 cacgctttacgacaaacagagcacacctcatcaacatgttataatggaatcttgaggcgatatctgagaatagtacggtactctactagtgacatat 37917683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 33201 - 33355
Alignment:
Q  8 ttcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaag 107  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  33201 ttcatggacctaggagacataaaattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaag 33300  T
Q  108 caaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33301 taaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 33355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 103050 - 103209
Alignment:
Q  1 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  103050 cacaacattcatggacctaggagacacgacattgttatgcatgaccttttgagctcgatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaaccgaaagtg 103149  T
Q  101 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  103150 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag-acacgctttctcgtgtttggcca 103209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 20047 - 20239
Alignment:
Q  200 aatatatcaaaaagtacatccctaacaaagttgtgtgtgtacttaaagtcgagaagctccttacaatgaatgacatgctccccaaaagtattcaggcacg 299  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||   || |||||||| ||    ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20047 aatatatcaaaaaggacattcctaacaaagtcaagtatgtacttatagctaggaagctccttacaatgaactgtatgctccccaatagtatccaggcacg 20146  T
Q  300 ccttacgacaaacaggacacacctcatcaatagtaaataatggaatcataagacgatatctaaggatagtacgatactccattggtgacatat 392  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  20147 ccttatgacaaaaagggcacacctcatcaataggaaataatgtaatcataaggtgatatctaaggatagcaccatactccaatgttgacatat 20239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 10329 - 10468
Alignment:
Q  25 catgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagca 124  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10329 catgacattgttatgcatggccctttcaactctat-tagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagca 10427  T
Q  125 tg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||    |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  10428 tgttgattgattgtcagaacacgcattatcatgtttggcca 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 7550 - 7701
Alignment:
Q  4 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||    
T  7550 aacattcatggacctatgagacatgacatta-tatgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatctctggagctaggaaactgaaagtgtca 7648  T
Q  104 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 156  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7649 aaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 327 - 186
Alignment:
Q  21 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||    
T  327 gagacatgacattgctatgtatgactttttgaactttatgcagaaggtcaacaacctttggtactagaaaaccaaaagtgtcaaacacaaatggtataaa 228  T
Q  121 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 162  Q
    ||||||||||| |||| ||| |  | ||||||||||||||||    
T  227 agcatgttgatggtcataacccactgtctcatgtttggccac 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18369
Alignment:
Q  29 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 128  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  | || | ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  18499 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgtt 18400  T
Q  129 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggcc 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18399 gattgtgagaacacg-tttctcatgtttggcc 18369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 49363 - 49505
Alignment:
Q  5 acattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaa 104  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    |  |||||| ||||  ||  ||  ||||| ||||||    
T  49363 acattcatggacataagagacatgacattgttatgcatgatcctttgaactctatgttga----cctcaacctttggtgttaagaagtcgaaagtgtcaa 49458  T
Q  105 aagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 151  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  49459 aagcaaatggtataaaagcacgttgattgtcagaacacgatttctca 49505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8632 - 8525
Alignment:
Q  48 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 147  Q
    |||||||||| || ||||| |  ||||||||| || |||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8632 tttgaactctttgcagaagattcacaacctctagtgctaggaaaccaaaagtgttaaacgcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacatgtttt 8533  T
Q  148 ctcatgtt 155  Q
    ||||||||    
T  8532 ctcatgtt 8525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47610 - 47542
Alignment:
Q  93 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47610 cgaaagtgttaaaagcaaatggtataaaaatatgttaactgtcagaacacattttctcatgtttggcca 47542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Original strand, 16192 - 16238
Alignment:
Q  115 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 161  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16192 tataaaaacatgtttattgtcagaacatgttttctcatgtttggcca 16238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 106
Target Start/End: Original strand, 16073 - 16154
Alignment:
Q  24 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa 106  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||| ||| ||||    
T  16073 acatgatattactatgcatgaccctttgaactctatgtagaaagtcaataacct-tggtgctaggaaaccaaaagtgtaaaaa 16154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University