View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6692_high_23 (Length: 219)

Name: NF6692_high_23
Description: NF6692
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6692_high_23
NF6692_high_23
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (1-219)||(112-330)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (1-219)||(27629658-27629876)
chr6 (13-219)||(4757796-4758002)
chr6 (43-219)||(26116368-26116544)
chr6 (13-219)||(3696113-3696319)
chr6 (13-219)||(4525318-4525524)
chr6 (13-219)||(4545733-4545939)
chr6 (13-219)||(4773038-4773244)
chr6 (13-219)||(29573045-29573251)
chr6 (43-219)||(16943985-16944161)
chr6 (28-219)||(30557974-30558165)
chr6 (13-219)||(4724092-4724298)
chr6 (13-219)||(28207486-28207692)
chr6 (43-219)||(26777573-26777749)
chr6 (43-219)||(27359950-27360126)
chr6 (43-219)||(27450293-27450469)
chr6 (43-219)||(29501477-29501653)
chr6 (43-219)||(29549537-29549713)
chr6 (28-219)||(16674186-16674377)
chr6 (16-219)||(16749889-16750092)
chr6 (43-219)||(17025339-17025515)
chr6 (28-219)||(27007774-27007965)
chr6 (28-219)||(27485176-27485367)
chr6 (16-219)||(34463304-34463507)
chr6 (13-219)||(15424275-15424481)
chr6 (13-219)||(24863749-24863955)
chr6 (13-219)||(26918412-26918618)
chr6 (13-219)||(27000105-27000311)
chr6 (16-219)||(24304576-24304779)
chr6 (16-219)||(26989036-26989239)
chr6 (28-219)||(27044434-27044626)
chr6 (16-185)||(20160736-20160905)
chr6 (16-185)||(22171926-22172095)
chr6 (16-219)||(13298909-13299112)
chr6 (115-219)||(22934838-22934942)
chr6 (115-219)||(23857283-23857387)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (13-219)||(37755024-37755230)
chr5 (13-219)||(28649279-28649485)
chr5 (13-219)||(37770899-37771105)
chr5 (28-219)||(13324741-13324932)
chr5 (16-219)||(24681487-24681690)
chr5 (16-219)||(24724014-24724217)
chr5 (16-219)||(40473461-40473664)
chr5 (13-219)||(31431484-31431690)
chr5 (13-219)||(34616562-34616768)
chr5 (43-219)||(29966978-29967154)
chr5 (43-219)||(30029489-30029665)
chr5 (43-219)||(31826319-31826495)
chr5 (16-219)||(2511098-2511301)
chr5 (16-219)||(5637957-5638160)
chr5 (16-219)||(8665387-8665590)
chr5 (16-219)||(9317498-9317701)
chr5 (16-219)||(9548455-9548658)
chr5 (16-219)||(12132202-12132405)
chr5 (16-219)||(15658672-15658875)
chr5 (16-219)||(15758769-15758972)
chr5 (16-219)||(18500642-18500845)
chr5 (28-219)||(33516415-33516606)
chr5 (13-219)||(18375324-18375530)
chr5 (13-219)||(37671395-37671601)
chr5 (43-219)||(28959698-28959874)
chr5 (43-219)||(37358555-37358731)
chr5 (43-219)||(43078326-43078502)
chr5 (28-219)||(3789600-3789791)
chr5 (28-219)||(6874364-6874555)
chr5 (16-219)||(26480439-26480642)
chr5 (16-219)||(30152065-30152268)
chr5 (16-219)||(30168516-30168719)
chr5 (16-219)||(41674756-41674959)
chr5 (13-219)||(22999026-22999232)
chr5 (28-219)||(32599384-32599575)
chr5 (28-219)||(33292584-33292775)
chr5 (16-219)||(11549401-11549604)
chr5 (16-219)||(23717900-23718103)
chr5 (112-219)||(30934776-30934883)
chr5 (13-219)||(24970062-24970268)
chr5 (13-219)||(33777531-33777737)
chr5 (16-219)||(23752362-23752565)
chr5 (67-219)||(25199127-25199279)
chr5 (13-219)||(24688069-24688275)
chr5 (67-219)||(22888568-22888720)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (16-219)||(19674479-19674682)
chr8 (43-219)||(33258788-33258964)
chr8 (16-219)||(28361929-28362132)
chr8 (13-219)||(3329481-3329687)
chr8 (13-219)||(18710621-18710827)
chr8 (43-219)||(12092698-12092874)
chr8 (16-219)||(19208334-19208537)
chr8 (28-219)||(29829372-29829563)
chr8 (16-219)||(31489724-31489927)
chr8 (28-219)||(31354574-31354765)
chr8 (16-219)||(14557662-14557865)
chr8 (28-219)||(19286512-19286703)
chr8 (13-219)||(2137233-2137439)
chr8 (13-219)||(27608879-27609085)
chr8 (16-219)||(16277592-16277795)
chr8 (13-219)||(19688133-19688339)
chr8 (143-219)||(189259-189335)
chr8 (143-219)||(16283614-16283690)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (16-219)||(4416918-4417121)
chr3 (43-219)||(8211764-8211940)
chr3 (43-219)||(22870912-22871088)
chr3 (43-219)||(22885971-22886147)
chr3 (16-219)||(5713226-5713429)
chr3 (16-219)||(5724136-5724339)
chr3 (16-219)||(5757138-5757341)
chr3 (16-219)||(5768029-5768232)
chr3 (16-219)||(20576903-20577106)
chr3 (43-219)||(36997133-36997309)
chr3 (16-219)||(7073211-7073414)
chr3 (28-219)||(11110405-11110596)
chr3 (16-219)||(29665026-29665229)
chr3 (13-219)||(6542518-6542724)
chr3 (43-219)||(5596413-5596589)
chr3 (43-219)||(18225217-18225393)
chr3 (43-219)||(28021301-28021477)
chr3 (28-219)||(4346743-4346934)
chr3 (16-219)||(47023452-47023655)
chr3 (28-219)||(48465938-48466129)
chr3 (13-219)||(29148811-29149017)
chr3 (46-219)||(21674722-21674895)
chr3 (43-219)||(5467011-5467187)
chr3 (43-219)||(51782049-51782225)
chr3 (16-219)||(7996561-7996764)
chr3 (16-219)||(10643069-10643272)
chr3 (28-219)||(18242750-18242941)
chr3 (16-219)||(18277108-18277311)
chr3 (16-219)||(18292409-18292612)
chr3 (16-219)||(18307710-18307913)
chr3 (16-215)||(28116014-28116213)
chr3 (16-219)||(31964529-31964732)
chr3 (16-219)||(50134127-50134330)
chr3 (13-219)||(22387634-22387840)
chr3 (43-219)||(5013738-5013914)
chr3 (43-219)||(24328185-24328361)
chr3 (16-219)||(5609378-5609581)
chr3 (16-219)||(28339301-28339504)
chr3 (28-219)||(32439165-32439356)
chr3 (13-219)||(4796709-4796915)
chr3 (43-219)||(51797138-51797315)
chr3 (28-215)||(10396144-10396331)
chr3 (28-219)||(20066054-20066245)
chr3 (13-219)||(8301323-8301529)
chr3 (43-219)||(17985012-17985188)
chr3 (16-219)||(18330668-18330871)
chr3 (13-219)||(15892762-15892968)
chr3 (112-219)||(8296067-8296174)
chr3 (16-219)||(15741150-15741353)
chr3 (115-219)||(6192414-6192518)
chr3 (28-179)||(4893221-4893372)
chr3 (112-219)||(18051357-18051464)
chr3 (112-219)||(35880861-35880968)
chr3 (16-219)||(4721630-4721833)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (16-219)||(10962707-10962910)
chr1 (43-219)||(51638282-51638458)
chr1 (16-219)||(28585018-28585221)
chr1 (16-219)||(41793323-41793526)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (13-219)||(31564291-31564497)
chr7 (16-219)||(16736361-16736564)
chr7 (16-219)||(16751415-16751618)
chr7 (16-219)||(17523571-17523774)
chr7 (16-219)||(17529441-17529644)
chr7 (43-219)||(3445372-3445548)
chr7 (16-219)||(4145024-4145227)
chr7 (16-219)||(5147241-5147444)
chr7 (16-219)||(9618690-9618893)
chr7 (16-219)||(26319770-26319973)
chr7 (43-219)||(24592442-24592618)
chr7 (43-219)||(26435323-26435499)
chr7 (16-219)||(26274995-26275198)
chr7 (16-219)||(26537771-26537974)
chr7 (16-219)||(26669815-26670018)
chr7 (16-219)||(45387382-45387585)
chr7 (43-219)||(11441638-11441814)
chr7 (28-219)||(31124971-31125162)
chr7 (13-219)||(10916769-10916975)
chr7 (28-219)||(5159570-5159761)
chr7 (16-219)||(11424677-11424880)
chr7 (13-219)||(5128028-5128234)
chr7 (13-219)||(2154609-2154815)
chr7 (13-219)||(16503281-16503487)
chr7 (13-219)||(16518317-16518523)
chr7 (67-219)||(18540889-18541041)
chr7 (67-219)||(16449899-16450051)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (16-219)||(11635190-11635393)
chr2 (16-219)||(11641379-11641582)
chr2 (16-219)||(12716606-12716809)
chr2 (16-219)||(27777256-27777459)
chr2 (16-219)||(27817014-27817217)
chr2 (16-218)||(34286388-34286590)
chr2 (16-218)||(34291448-34291650)
chr2 (16-219)||(9349986-9350189)
chr2 (16-219)||(13936548-13936751)
chr2 (28-219)||(16829342-16829533)
chr2 (28-219)||(16891948-16892139)
chr2 (16-219)||(21677186-21677389)
chr2 (16-219)||(27803741-27803944)
chr2 (16-219)||(34279483-34279686)
chr2 (16-219)||(39051826-39052029)
chr2 (43-219)||(31876342-31876518)
chr2 (16-219)||(34861714-34861917)
chr2 (16-219)||(37685913-37686116)
chr2 (16-219)||(37701178-37701381)
chr2 (28-219)||(39890120-39890311)
chr2 (28-219)||(260757-260948)
chr2 (28-219)||(12586856-12587047)
chr2 (16-219)||(22926032-22926235)
chr2 (16-219)||(32049832-32050035)
chr2 (28-219)||(37375207-37375398)
chr2 (16-219)||(37925527-37925730)
chr2 (13-219)||(23128570-23128776)
chr2 (43-219)||(19416503-19416679)
chr2 (16-219)||(12655576-12655779)
chr2 (16-219)||(28882248-28882451)
chr2 (13-219)||(40233542-40233748)
chr2 (115-219)||(27434448-27434552)
chr2 (16-219)||(20837952-20838155)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (13-219)||(18800628-18800834)
chr4 (13-219)||(33673813-33674019)
chr4 (43-219)||(21969781-21969957)
chr4 (43-219)||(14098621-14098797)
chr4 (43-219)||(31126533-31126709)
chr4 (16-219)||(14763319-14763522)
chr4 (16-219)||(39850691-39850894)
chr4 (28-219)||(40105653-40105844)
chr4 (43-219)||(6569933-6570109)
chr4 (43-219)||(30753834-30754010)
chr4 (16-219)||(27163332-27163535)
chr4 (13-219)||(14665068-14665274)
chr4 (16-219)||(5005926-5006129)
chr4 (28-219)||(24112727-24112918)
chr4 (28-219)||(34188975-34189166)
chr4 (28-219)||(54833452-54833643)
chr4 (13-219)||(24592329-24592535)
chr4 (28-219)||(36344530-36344721)
chr4 (13-219)||(17014050-17014256)
chr4 (46-210)||(15227953-15228117)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (43-219)||(9631-9807)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (16-219)||(7254-7457)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (28-219)||(30502-30693)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (13-219)||(14945-15151)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (13-219)||(7984-8190)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (16-219)||(9081-9284)
scaffold0159 (16-219)||(20053-20256)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (16-219)||(27330-27533)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (43-219)||(26216-26393)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-219)||(29798-30004)
scaffold0089 (13-219)||(47000-47206)
scaffold0089 (13-219)||(40084-40290)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (46-219)||(6080-6255)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (112-219)||(144-251)


Alignment Details
Target: scaffold2173 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 112 - 330
Alignment:
Q  1 ccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaa 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112 ccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaa 211  T
Q  101 ggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 ggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattga 311  T
Q  201 tcaaggaaagctgactttt 219  Q
     ||||||||||||||||||    
T  312 ccaaggaaagctgactttt 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27629876 - 27629658
Alignment:
Q  1 ccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaa 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27629876 ccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaggcctccgccagatccattaccaccaa 27629777  T
Q  101 ggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27629776 ggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattga 27629677  T
Q  201 tcaaggaaagctgactttt 219  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27629676 ccaaggaaagctgactttt 27629658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 4757796 - 4758002
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  4757796 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 4757895  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  4757896 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 4757995  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  4757996 gactttt 4758002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26116544 - 26116368
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  26116544 cagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 26116445  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26116444 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 26116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 3696113 - 3696319
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  3696113 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 3696212  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  3696213 atctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagct 3696312  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  3696313 gactttt 3696319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 4525318 - 4525524
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  4525318 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 4525417  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  4525418 atcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 4525517  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  4525518 gactttt 4525524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4545939 - 4545733
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  4545939 ttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 4545840  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  4545839 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 4545740  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  4545739 gactttt 4545733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 4773038 - 4773244
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  4773038 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 4773137  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  4773138 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 4773237  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  4773238 gactttt 4773244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 29573045 - 29573251
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  29573045 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 29573144  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||    
T  29573145 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagct 29573244  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  29573245 gactttt 29573251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16944161 - 16943985
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  16944161 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 16944062  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  16944061 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 16943985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30558165 - 30557974
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||| || |||||||    
T  30558165 cttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgact 30558066  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30558065 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 30557974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4724298 - 4724092
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  4724298 ttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 4724199  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||    
T  4724198 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagct 4724099  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  4724098 gactttt 4724092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 28207486 - 28207692
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  28207486 ttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 28207585  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||| |||||    
T  28207586 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagct 28207685  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  28207686 gactttt 28207692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26777749 - 26777573
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  26777749 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 26777650  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  26777649 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 26777573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27360126 - 27359950
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27360126 cagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 27360027  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27360026 taggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 27359950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27450469 - 27450293
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27450469 cagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 27450370  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27450369 taggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 27450293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 29501477 - 29501653
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  29501477 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 29501576  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  29501577 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 29501653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 29549537 - 29549713
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || |||     
T  29549537 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccc 29549636  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29549637 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttt 29549713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 16674186 - 16674377
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  16674186 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 16674285  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16674286 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 16674377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 16749889 - 16750092
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  16749889 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 16749988  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16749989 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 16750088  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  16750089 tttt 16750092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 17025339 - 17025515
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  17025339 cagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgcct 17025438  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17025439 taggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 17025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 27007774 - 27007965
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  27007774 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 27007873  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27007874 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgactttt 27007965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 27485176 - 27485367
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||    
T  27485176 cttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 27485275  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  27485276 ttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 27485367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34463507 - 34463304
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| || || ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  34463507 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 34463408  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  34463407 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 34463308  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  34463307 tttt 34463304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15424481 - 15424275
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  15424481 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 15424382  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  15424381 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagct 15424282  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  15424281 gactttt 15424275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 24863749 - 24863955
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  24863749 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 24863848  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  24863849 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 24863948  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  24863949 gactttt 24863955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 26918412 - 26918618
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  26918412 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 26918511  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||    
T  26918512 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagct 26918611  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  26918612 gactttt 26918618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 27000105 - 27000311
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  27000105 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 27000204  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  27000205 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagct 27000304  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  27000305 gactttt 27000311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24304779 - 24304576
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  24304779 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 24304680  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24304679 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 24304580  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  24304579 tttt 24304576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 26989036 - 26989239
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  26989036 tatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 26989135  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26989136 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 26989235  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  26989236 tttt 26989239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 27044434 - 27044626
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  27044434 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 27044533  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtg-ttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  27044534 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 27044626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 20160736 - 20160905
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || |||||  || | ||||    
T  20160736 tatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatc 20160835  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgt 185  Q
    |||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  20160836 tcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgt 20160905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22172095 - 22171926
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || |||||  || | ||||    
T  22172095 tatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatc 22171996  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgt 185  Q
    |||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  22171995 tcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgt 22171926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13299112 - 13298909
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  13299112 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 13299013  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| || || ||| | || ||  |||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13299012 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 13298913  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  13298912 tttt 13298909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22934942 - 22934838
Alignment:
Q  115 ctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctga 214  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  22934942 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaa 22934843  T
Q  215 ctttt 219  Q
    |||||    
T  22934842 ctttt 22934838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23857387 - 23857283
Alignment:
Q  115 ctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctga 214  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  23857387 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaa 23857288  T
Q  215 ctttt 219  Q
    |||||    
T  23857287 ctttt 23857283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 37755024 - 37755230
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  37755024 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 37755123  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  37755124 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 37755223  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  37755224 gactttt 37755230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 28649279 - 28649485
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  28649279 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 28649378  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28649379 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagct 28649478  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  28649479 gactttt 28649485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37771105 - 37770899
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  37771105 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 37771006  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  37771005 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagct 37770906  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  37770905 gactttt 37770899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13324932 - 13324741
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  13324932 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgact 13324833  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13324832 ttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 13324741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 24681487 - 24681690
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  24681487 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 24681586  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  24681587 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 24681686  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  24681687 tttt 24681690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 24724014 - 24724217
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  24724014 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 24724113  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  24724114 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 24724213  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  24724214 tttt 24724217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40473664 - 40473461
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  40473664 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 40473565  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  40473564 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 40473465  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  40473464 tttt 40473461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 31431484 - 31431690
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  31431484 ttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 31431583  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  31431584 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 31431683  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  31431684 gactttt 31431690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 34616562 - 34616768
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  34616562 ttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 34616661  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| |||||    
T  34616662 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagct 34616761  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  34616762 gactttt 34616768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29967154 - 29966978
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  29967154 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 29967055  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29967054 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 29966978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 30029489 - 30029665
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  30029489 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 30029588  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30029589 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 30029665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31826495 - 31826319
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  31826495 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 31826396  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31826395 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 31826319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 2511098 - 2511301
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  2511098 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 2511197  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  2511198 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 2511297  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  2511298 tttt 2511301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 5637957 - 5638160
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5637957 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5638056  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  5638057 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 5638156  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5638157 tttt 5638160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8665590 - 8665387
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  8665590 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 8665491  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  8665490 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 8665391  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  8665390 tttt 8665387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 9317498 - 9317701
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  9317498 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 9317597  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  9317598 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 9317697  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  9317698 tttt 9317701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9548658 - 9548455
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  9548658 tatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 9548559  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9548558 tcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 9548459  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  9548458 tttt 9548455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 12132202 - 12132405
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  12132202 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 12132301  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  12132302 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 12132401  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  12132402 tttt 12132405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15658875 - 15658672
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  15658875 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 15658776  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15658775 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 15658676  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  15658675 tttt 15658672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15758972 - 15758769
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  15758972 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 15758873  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  15758872 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 15758773  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  15758772 tttt 15758769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18500845 - 18500642
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  18500845 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 18500746  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  18500745 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 18500646  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  18500645 tttt 18500642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 33516415 - 33516606
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||| || |||||||    
T  33516415 cttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgact 33516514  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33516515 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 33516606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18375530 - 18375324
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  18375530 ttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 18375431  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||    
T  18375430 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagct 18375331  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  18375330 gactttt 18375324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37671601 - 37671395
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  37671601 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 37671502  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  37671501 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 37671402  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  37671401 gactttt 37671395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28959874 - 28959698
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  28959874 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 28959775  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  28959774 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 28959698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37358731 - 37358555
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  37358731 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 37358632  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  37358631 taggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 37358555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 43078326 - 43078502
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  43078326 cagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 43078425  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  43078426 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgactttt 43078502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 3789600 - 3789791
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||    
T  3789600 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 3789699  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  3789700 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 3789791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 6874364 - 6874555
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  6874364 cttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 6874463  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6874464 ttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgactttt 6874555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 26480439 - 26480642
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  26480439 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 26480538  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  26480539 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 26480638  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  26480639 tttt 26480642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 30152065 - 30152268
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  30152065 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 30152164  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  30152165 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 30152264  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  30152265 tttt 30152268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 30168516 - 30168719
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  30168516 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 30168615  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||| ||    
T  30168616 tcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcac 30168715  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  30168716 tttt 30168719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 41674756 - 41674959
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  41674756 tatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatc 41674855  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  41674856 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgac 41674955  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  41674956 tttt 41674959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22999232 - 22999026
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  22999232 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 22999133  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  22999132 atctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 22999033  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  22999032 gactttt 22999026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32599575 - 32599384
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  32599575 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 32599476  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || || || ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32599475 ttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 32599384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 33292584 - 33292775
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  33292584 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 33292683  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  33292684 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaactttt 33292775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 11549401 - 11549604
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  11549401 tatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 11549500  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11549501 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 11549600  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  11549601 tttt 11549604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23718103 - 23717900
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  23718103 tatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 23718004  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23718003 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 23717904  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  23717903 tttt 23717900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 219
Target Start/End: Original strand, 30934776 - 30934883
Alignment:
Q  112 gatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagc 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  30934776 gatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 30934875  T
Q  212 tgactttt 219  Q
    ||||||||    
T  30934876 tgactttt 30934883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 24970062 - 24970268
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  24970062 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 24970161  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||     
T  24970162 atctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcg 24970261  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  24970262 gactttt 24970268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 33777531 - 33777737
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  33777531 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 33777630  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  33777631 acctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagct 33777730  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  33777731 gactttt 33777737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23752565 - 23752362
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | || |    
T  23752565 tatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacc 23752466  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23752465 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 23752366  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  23752365 tttt 23752362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 25199127 - 25199279
Alignment:
Q  67 cagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 166  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  25199127 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 25199226  T
Q  167 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  25199227 acgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaactttt 25199279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24688275 - 24688069
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |  | |    
T  24688275 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccg 24688176  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  24688175 atctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagct 24688076  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  24688075 gactttt 24688069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 22888568 - 22888720
Alignment:
Q  67 cagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 166  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  22888568 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 22888667  T
Q  167 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  22888668 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaactttt 22888720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 19674479 - 19674682
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  19674479 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 19674578  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  19674579 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 19674678  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  19674679 tttt 19674682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 33258788 - 33258964
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  33258788 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 33258887  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  33258888 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 33258964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28362132 - 28361929
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  28362132 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 28362033  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  28362032 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 28361933  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  28361932 tttt 28361929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3329687 - 3329481
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  3329687 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 3329588  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |||||    
T  3329587 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagct 3329488  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  3329487 gactttt 3329481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 18710621 - 18710827
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || |||||  | || ||||||||  |  |||    
T  18710621 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctg 18710720  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  18710721 atctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 18710820  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  18710821 gactttt 18710827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12092874 - 12092698
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  12092874 cagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctt 12092775  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12092774 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 12092698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19208537 - 19208334
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  19208537 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 19208438  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  19208437 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 19208338  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  19208337 tttt 19208334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 29829372 - 29829563
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || ||||| |    
T  29829372 cttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgatt 29829471  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29829472 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 29829563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31489927 - 31489724
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  31489927 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 31489828  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  31489827 tcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 31489728  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  31489727 tttt 31489724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 31354574 - 31354765
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  31354574 cttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 31354673  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31354674 ttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 31354765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 14557662 - 14557865
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  14557662 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 14557761  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14557762 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 14557861  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  14557862 tttt 14557865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 19286512 - 19286703
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  19286512 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 19286611  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19286612 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 19286703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2137439 - 2137233
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  2137439 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 2137340  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  2137339 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagct 2137240  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  2137239 gactttt 2137233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27609085 - 27608879
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  27609085 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 27608986  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  27608985 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 27608886  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  27608885 gactttt 27608879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 16277592 - 16277795
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |  | ||||    
T  16277592 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatc 16277691  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16277692 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 16277791  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  16277792 tttt 16277795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 19688133 - 19688339
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  19688133 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 19688232  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||| |    
T  19688233 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagtt 19688332  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  19688333 gactttt 19688339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 219
Target Start/End: Original strand, 189259 - 189335
Alignment:
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189259 tgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgactttt 189335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 219
Target Start/End: Original strand, 16283614 - 16283690
Alignment:
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16283614 tgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttt 16283690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 4416918 - 4417121
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  4416918 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 4417017  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4417018 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 4417117  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  4417118 tttt 4417121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 8211764 - 8211940
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  8211764 cagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 8211863  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8211864 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 8211940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22871088 - 22870912
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  22871088 cagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 22870989  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22870988 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 22870912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22886147 - 22885971
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  22886147 cagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 22886048  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22886047 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 22885971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 5713226 - 5713429
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5713226 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5713325  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5713326 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 5713425  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5713426 tttt 5713429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 5724136 - 5724339
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5724136 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5724235  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5724236 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 5724335  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5724336 tttt 5724339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5757341 - 5757138
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5757341 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5757242  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5757241 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 5757142  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5757141 tttt 5757138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5768232 - 5768029
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5768232 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5768133  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5768132 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 5768033  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5768032 tttt 5768029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20577106 - 20576903
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  20577106 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 20577007  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20577006 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 20576907  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  20576906 tttt 20576903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36997309 - 36997133
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  36997309 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 36997210  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36997209 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 36997133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 7073211 - 7073414
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  7073211 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 7073310  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  7073311 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaac 7073410  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  7073411 tttt 7073414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11110596 - 11110405
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  11110596 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 11110497  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11110496 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 11110405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29665229 - 29665026
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  29665229 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 29665130  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  29665129 ttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 29665030  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  29665029 tttt 29665026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6542724 - 6542518
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  6542724 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 6542625  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  6542624 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 6542525  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  6542524 gactttt 6542518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5596589 - 5596413
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  5596589 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 5596490  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  5596489 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 5596413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 18225217 - 18225393
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  18225217 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 18225316  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18225317 taggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 18225393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 28021301 - 28021477
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  28021301 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 28021400  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28021401 taggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 28021477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4346934 - 4346743
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  4346934 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 4346835  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4346834 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 4346743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 47023452 - 47023655
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  47023452 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 47023551  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  47023552 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 47023651  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  47023652 tttt 47023655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 48465938 - 48466129
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  48465938 cttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 48466037  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48466038 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttt 48466129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29149017 - 29148811
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  29149017 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 29148918  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  29148917 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 29148818  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  29148817 gactttt 29148811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Original strand, 21674722 - 21674895
Alignment:
Q  46 agaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgg 145  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  21674722 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttag 21674821  T
Q  146 gtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21674822 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 21674895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 5467011 - 5467187
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  5467011 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 5467110  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5467111 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgactttt 5467187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 51782049 - 51782225
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  51782049 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 51782148  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  51782149 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgactttt 51782225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 7996561 - 7996764
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  7996561 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 7996660  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  7996661 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 7996760  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  7996761 tttt 7996764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 10643069 - 10643272
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  10643069 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 10643168  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  10643169 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 10643268  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  10643269 tttt 10643272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 18242750 - 18242941
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||    
T  18242750 cttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 18242849  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  18242850 ttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 18242941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18277311 - 18277108
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||  || || ||||||||  |  ||||||    
T  18277311 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatc 18277212  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  18277211 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 18277112  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  18277111 tttt 18277108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18292612 - 18292409
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||  || || ||||||||  |  ||||||    
T  18292612 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatc 18292513  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  18292512 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 18292413  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  18292412 tttt 18292409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18307913 - 18307710
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||  || || ||||||||  |  ||||||    
T  18307913 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatc 18307814  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  18307813 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 18307714  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  18307713 tttt 18307710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28116213 - 28116014
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  28116213 tatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 28116114  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28116113 tcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 28116014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31964732 - 31964529
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  31964732 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 31964633  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  31964632 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 31964533  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  31964532 tttt 31964529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50134330 - 50134127
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  50134330 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 50134231  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  50134230 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 50134131  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  50134130 tttt 50134127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22387840 - 22387634
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  22387840 ttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 22387741  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  22387740 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 22387641  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  22387640 gactttt 22387634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 5013738 - 5013914
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || |||     
T  5013738 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccc 5013837  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  5013838 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 5013914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 24328185 - 24328361
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || |||     
T  24328185 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccc 24328284  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24328285 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 24328361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5609581 - 5609378
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5609581 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5609482  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  5609481 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 5609382  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5609381 tttt 5609378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 28339301 - 28339504
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  28339301 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 28339400  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  28339401 tcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 28339500  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  28339501 tttt 28339504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 32439165 - 32439356
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  32439165 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 32439264  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  32439265 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaactttt 32439356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4796915 - 4796709
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  4796915 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 4796816  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  4796815 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagct 4796716  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  4796715 gactttt 4796709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 51797138 - 51797315
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccac-caaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcc 141  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || | |||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  51797138 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcc 51797237  T
Q  142 ttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  51797238 ttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgactttt 51797315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 215
Target Start/End: Original strand, 10396144 - 10396331
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  10396144 cttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 10396243  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10396244 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 10396331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 20066054 - 20066245
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  20066054 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 20066153  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  20066154 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaactttt 20066245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8301529 - 8301323
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  8301529 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 8301430  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  8301429 atctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 8301330  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  8301329 gactttt 8301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17985188 - 17985012
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  17985188 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgcct 17985089  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  17985088 taggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 17985012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 18330668 - 18330871
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  18330668 tatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 18330767  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18330768 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 18330867  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  18330868 tttt 18330871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15892968 - 15892762
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |  | |    
T  15892968 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccg 15892869  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  15892868 atctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 15892769  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  15892768 gactttt 15892762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 219
Target Start/End: Original strand, 8296067 - 8296174
Alignment:
Q  112 gatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagc 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||     
T  8296067 gatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 8296166  T
Q  212 tgactttt 219  Q
    ||||||||    
T  8296167 tgactttt 8296174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15741353 - 15741150
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||| | || || ||||||||  |  | ||||    
T  15741353 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatc 15741254  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| ||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15741253 tcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 15741154  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  15741153 tttt 15741150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Original strand, 6192414 - 6192518
Alignment:
Q  115 ctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctga 214  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6192414 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 6192513  T
Q  215 ctttt 219  Q
    |||||    
T  6192514 ctttt 6192518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 4893221 - 4893372
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  4893221 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgact 4893320  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagta 179  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  4893321 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 4893372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 219
Target Start/End: Original strand, 18051357 - 18051464
Alignment:
Q  112 gatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagc 211  Q
    |||||||| ||||| ||  |||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18051357 gatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 18051456  T
Q  212 tgactttt 219  Q
    ||||||||    
T  18051457 tgactttt 18051464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 219
Target Start/End: Original strand, 35880861 - 35880968
Alignment:
Q  112 gatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagc 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||    
T  35880861 gatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagc 35880960  T
Q  212 tgactttt 219  Q
    ||||||||    
T  35880961 tgactttt 35880968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 4721630 - 4721833
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || |||||  | || ||||||||  |  | || |    
T  4721630 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacc 4721729  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||  |||| |||||||| ||  | |  || ||||||||||||||||||||    
T  4721730 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgac 4721829  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  4721830 tttt 4721833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 10962707 - 10962910
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  10962707 tatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 10962806  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  10962807 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 10962906  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  10962907 tttt 10962910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 51638282 - 51638458
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  51638282 cagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 51638381  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51638382 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 51638458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 28585018 - 28585221
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  28585018 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 28585117  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  28585118 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 28585217  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  28585218 tttt 28585221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41793526 - 41793323
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  41793526 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 41793427  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  | |||||||| ||||||||    
T  41793426 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgac 41793327  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  41793326 tttt 41793323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31564497 - 31564291
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  31564497 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 31564398  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  31564397 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 31564298  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  31564297 gactttt 31564291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16736564 - 16736361
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |  ||||||    
T  16736564 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatc 16736465  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16736464 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 16736365  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  16736364 tttt 16736361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16751618 - 16751415
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |  ||||||    
T  16751618 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatc 16751519  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16751518 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 16751419  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  16751418 tttt 16751415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 17523571 - 17523774
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |  ||||||    
T  17523571 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatc 17523670  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17523671 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 17523770  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  17523771 tttt 17523774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17529644 - 17529441
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |  ||||||    
T  17529644 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatc 17529545  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17529544 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 17529445  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  17529444 tttt 17529441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 3445372 - 3445548
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  3445372 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 3445471  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3445472 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 3445548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4145227 - 4145024
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  4145227 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 4145128  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  4145127 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 4145028  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  4145027 tttt 4145024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5147444 - 5147241
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5147444 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5147345  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  5147344 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 5147245  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5147244 tttt 5147241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 9618690 - 9618893
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  9618690 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 9618789  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  9618790 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 9618889  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  9618890 tttt 9618893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26319973 - 26319770
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  26319973 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 26319874  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  26319873 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 26319774  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  26319773 tttt 26319770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24592618 - 24592442
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  24592618 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 24592519  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24592518 taggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 24592442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 26435323 - 26435499
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  26435323 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 26435422  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26435423 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 26435499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26275198 - 26274995
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  26275198 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 26275099  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  26275098 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 26274999  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  26274998 tttt 26274995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26537974 - 26537771
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  26537974 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 26537875  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26537874 tcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 26537775  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  26537774 tttt 26537771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26670018 - 26669815
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  26670018 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatc 26669919  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  26669918 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 26669819  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  26669818 tttt 26669815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 45387382 - 45387585
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  45387382 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 45387481  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  45387482 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 45387581  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  45387582 tttt 45387585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 11441638 - 11441814
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  11441638 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 11441737  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11441738 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 11441814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 31124971 - 31125162
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||    
T  31124971 cttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 31125070  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || || |||||||| ||||||||||||    
T  31125071 ttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgactttt 31125162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10916975 - 10916769
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  10916975 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 10916876  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  10916875 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 10916776  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  10916775 gactttt 10916769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 5159570 - 5159761
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  5159570 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 5159669  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || || || || |||||| || |||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  5159670 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaactttt 5159761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424677
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  11424880 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 11424781  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11424780 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 11424681  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  11424680 tttt 11424677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 5128028 - 5128234
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||  |||| || || ||||||||  |  |||    
T  5128028 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctg 5128127  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || || ||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  5128128 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 5128227  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  5128228 gactttt 5128234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 2154609 - 2154815
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  2154609 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 2154708  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || || ||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  2154709 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 2154808  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  2154809 gactttt 2154815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16503487 - 16503281
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  16503487 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 16503388  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16503387 atctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 16503288  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  16503287 gactttt 16503281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16518523 - 16518317
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  16518523 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 16518424  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  16518423 atctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagtt 16518324  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  16518323 gactttt 16518317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 18540889 - 18541041
Alignment:
Q  67 cagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 166  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |    
T  18540889 caggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 18540988  T
Q  167 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  18540989 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaactttt 18541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16450051 - 16449899
Alignment:
Q  67 cagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 166  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  16450051 cagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 16449952  T
Q  167 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  16449951 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaactttt 16449899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11635393 - 11635190
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  11635393 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 11635294  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  11635293 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgac 11635194  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  11635193 tttt 11635190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11641582 - 11641379
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  11641582 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 11641483  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  11641482 tcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgac 11641383  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  11641382 tttt 11641379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12716809 - 12716606
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  12716809 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 12716710  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  12716709 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 12716610  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  12716609 tttt 12716606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 27777256 - 27777459
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  27777256 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 27777355  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  27777356 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 27777455  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  27777456 tttt 27777459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 27817014 - 27817217
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  27817014 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 27817113  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  27817114 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 27817213  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  27817214 tttt 27817217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 34286388 - 34286590
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  34286388 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 34286487  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34286488 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 34286587  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  34286588 ttt 34286590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 34291448 - 34291650
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  34291448 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 34291547  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34291548 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 34291647  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  34291648 ttt 34291650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9350189 - 9349986
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  9350189 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 9350090  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9350089 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 9349990  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  9349989 tttt 9349986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13936751 - 13936548
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  13936751 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 13936652  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  13936651 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgac 13936552  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  13936551 tttt 13936548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16829533 - 16829342
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||| || |||||||    
T  16829533 cttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgact 16829434  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16829433 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 16829342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 16891948 - 16892139
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||| || |||||||    
T  16891948 cttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgact 16892047  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16892048 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 16892139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21677389 - 21677186
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  21677389 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 21677290  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  21677289 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 21677190  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  21677189 tttt 21677186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 27803741 - 27803944
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  27803741 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 27803840  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  27803841 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 27803940  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  27803941 tttt 27803944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 34279483 - 34279686
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  34279483 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 34279582  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34279583 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 34279682  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  34279683 tttt 34279686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39052029 - 39051826
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  39052029 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 39051930  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  39051929 ttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 39051830  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  39051829 tttt 39051826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 31876342 - 31876518
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  31876342 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 31876441  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31876442 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 31876518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 34861714 - 34861917
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  34861714 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 34861813  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  34861814 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 34861913  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  34861914 tttt 34861917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37686116 - 37685913
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  37686116 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 37686017  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  37686016 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 37685917  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  37685916 tttt 37685913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37701381 - 37701178
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  37701381 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 37701282  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  37701281 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 37701182  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  37701181 tttt 37701178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 39890120 - 39890311
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||    
T  39890120 cttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgact 39890219  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  39890220 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 39890311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 260948 - 260757
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||  || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  260948 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 260849  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  260848 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 260757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 12586856 - 12587047
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |    
T  12586856 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgatt 12586955  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12586956 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 12587047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22926235 - 22926032
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  22926235 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 22926136  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  22926135 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 22926036  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  22926035 tttt 22926032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 32049832 - 32050035
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || || || || || ||||||||  |  ||||||    
T  32049832 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 32049931  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  32049932 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 32050031  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  32050032 tttt 32050035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 37375207 - 37375398
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  37375207 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 37375306  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  37375307 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgactttt 37375398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 37925527 - 37925730
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||||||||  |  ||||||    
T  37925527 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 37925626  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  37925627 tcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 37925726  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  37925727 tttt 37925730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23128776 - 23128570
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  23128776 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 23128677  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  23128676 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 23128577  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  23128576 gactttt 23128570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19416679 - 19416503
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || |||     
T  19416679 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccc 19416580  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||  |||  || || |||||||| ||||||||||||    
T  19416579 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgactttt 19416503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 12655576 - 12655779
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  12655576 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 12655675  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12655676 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 12655775  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  12655776 tttt 12655779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 28882248 - 28882451
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |  | ||||    
T  28882248 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatc 28882347  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28882348 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 28882447  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  28882448 tttt 28882451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 40233542 - 40233748
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    |||||||||||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||  |||    
T  40233542 ttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccggtctg 40233641  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    | ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  40233642 acctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagct 40233741  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  40233742 gactttt 40233748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27434552 - 27434448
Alignment:
Q  115 ctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctga 214  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27434552 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 27434453  T
Q  215 ctttt 219  Q
    |||||    
T  27434452 ctttt 27434448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 20837952 - 20838155
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||  || || || |||||  |  | || |    
T  20837952 tatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgacc 20838051  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20838052 ttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgac 20838151  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  20838152 tttt 20838155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18800834 - 18800628
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  18800834 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 18800735  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18800734 atctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagct 18800635  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  18800634 gactttt 18800628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33674019 - 33673813
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || || || ||||||||  |  |||    
T  33674019 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctg 33673920  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  33673919 atctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagct 33673820  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  33673819 gactttt 33673813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 21969781 - 21969957
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  21969781 cagagaggacattgtacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgcct 21969880  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21969881 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 21969957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 14098621 - 14098797
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  14098621 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 14098720  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14098721 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 14098797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31126709 - 31126533
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  31126709 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 31126610  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31126609 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 31126533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14763522 - 14763319
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  14763522 tatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 14763423  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  14763422 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgac 14763323  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  14763322 tttt 14763319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 39850691 - 39850894
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  39850691 tatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatc 39850790  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    | || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  ||||||| |||||||||||    
T  39850791 ttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgac 39850890  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  39850891 tttt 39850894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40105844 - 40105653
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||    
T  40105844 cttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 40105745  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  40105744 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 40105653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 6569933 - 6570109
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  6569933 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctt 6570032  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6570033 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 6570109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 30753834 - 30754010
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  30753834 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 30753933  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  30753934 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 30754010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27163535 - 27163332
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  27163535 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 27163436  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||    
T  27163435 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgac 27163336  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  27163335 tttt 27163332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 14665068 - 14665274
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  14665068 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 14665167  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  14665168 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 14665267  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  14665268 gactttt 14665274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 5005926 - 5006129
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  5005926 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 5006025  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||    
T  5006026 tcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgac 5006125  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  5006126 tttt 5006129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 24112727 - 24112918
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  24112727 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 24112826  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  24112827 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaactttt 24112918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34189166 - 34188975
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  34189166 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 34189067  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  34189066 tccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaactttt 34188975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 54833452 - 54833643
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  54833452 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 54833551  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  54833552 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgactttt 54833643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24592535 - 24592329
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  24592535 ttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 24592436  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  24592435 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 24592336  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  24592335 gactttt 24592329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36344721 - 36344530
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || || |||||  |  |||||||||| ||||| |    
T  36344721 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 36344622  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  36344621 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgactttt 36344530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 17014050 - 17014256
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |  | |    
T  17014050 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccg 17014149  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  17014150 acctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 17014249  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  17014250 gactttt 17014256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 15227953 - 15228117
Alignment:
Q  46 agaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgg 145  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||    
T  15227953 agagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 15228052  T
Q  146 gtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaag 210  Q
    |||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  15228053 gtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaag 15228117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 9631 - 9807
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  9631 cagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 9730  T
Q  143 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9731 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgactttt 9807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7457 - 7254
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  7457 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 7358  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  7357 tcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 7258  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  7257 tttt 7254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 30502 - 30693
Alignment:
Q  28 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 127  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||| || |||||||    
T  30502 cttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgact 30601  T
Q  128 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30602 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 30693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15151 - 14945
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  15151 ttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 15052  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||    
T  15051 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagct 14952  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  14951 gactttt 14945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 7984 - 8190
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||    
T  7984 ttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctg 8083  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||| |||||    
T  8084 atctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagct 8183  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  8184 gactttt 8190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9284 - 9081
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  9284 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 9185  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  9184 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 9085  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  9084 tttt 9081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 20053 - 20256
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  ||||||    
T  20053 tatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatc 20152  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  20153 tcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgac 20252  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  20253 tttt 20256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 27330 - 27533
Alignment:
Q  16 tatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatc 115  Q
    |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | ||||    
T  27330 tatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 27429  T
Q  116 tcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgac 215  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27430 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgac 27529  T
Q  216 tttt 219  Q
    ||||    
T  27530 tttt 27533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26393 - 26216
Alignment:
Q  43 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttc-gtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcc 141  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || |||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  26393 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcc 26294  T
Q  142 ttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
     | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26293 ctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgactttt 26216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 29798 - 30004
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  29798 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 29897  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  29898 atctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 29997  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  29998 gactttt 30004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47206 - 47000
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  | |    
T  47206 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccg 47107  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  47106 atctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagct 47007  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  47006 gactttt 47000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 40084
Alignment:
Q  13 ttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactg 112  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |  | |    
T  40290 ttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccg 40191  T
Q  113 atctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagct 212  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||||||    
T  40190 atctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagct 40091  T
Q  213 gactttt 219  Q
    |||||||    
T  40090 gactttt 40084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6255
Alignment:
Q  46 agaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtga-ctttcatcagggggccttg 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| |||||  |||||||| || |||||     
T  6080 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgcctta 6179  T
Q  145 ggtcacgatgttgagaggtgttatgc-tttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgactttt 219  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6180 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgactttt 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 144
Alignment:
Q  112 gatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagc 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  251 gatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 152  T
Q  212 tgactttt 219  Q
    ||||||||    
T  151 tgactttt 144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University